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gi|66614                      :               TGTA-T-GT--GC---AATGTAGTTGTAAACAAA-TGTGGTCCTTTTGT-AAAAGATTTCCTTTA-------TCATAATAATAATTAAAAAA-T--C-CTC--A--AA----A-TT-T--T-TC-C---CG-A--A-A---------T-A-TTTT--CTTAG----G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------AT
gi|66615                      :                  A-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-ACA-TGTGATATTCTTGT-AGAAGACTACATTAA----A-CTTGTAATA----TAAAAAAA-T--C-TCC--A--AA----C-TT-T--T-CC-C---C--C--ATA---------T-A-TTTC--TTTTG----G--TTT--------C---AT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------ATA-G-------GGAA--TTT-T-----GTT----AC--T---TT--G-G--A-T-T--GG--GA---A--AAAAAA----G-ATACTA------TTT-------GCCTTTG-----GA--A--A--TGG--G-GG----GCAGAAT----A---T-CA-T--C-C-C-CA--------AAA-A-TGG--GC----CAATGAGAGCCCTG
gi|66617                      :                                                            TTGT-AGAACACTACATTAA----A-ATCATAATA----TTAAAAAA-T--C-TAC--A--AA----C-TT-T--T-CC-C---CC-A--A-A---------C-A-TTTC--TTTTG----G--CTT--------C---TT--TTTGC---A---TT-----TT-G--A-------A-------ATT-A-------GGAA--TTT-TGTTTTATT----AC--T---TT--G-G--A-T-T--GG--G----A--TAAAAA----G-ATACTA------TTT-------GCCATTG-----GG--A--A--T----G-GG----GTAGAAT----A---A-CG-A--C-C-C-CA--------AAA-A-TGG--GC----AAACAAGAAC
gi|66618                      :                                                                                         ATGATA----TTA-ACAA-T--C-TCC--A--AA----CATT-T--C-CC-C---C--A--A-A---------T-A-TTT---TTTTG----G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------ATT-A-------GAAA--TTG-T-----GTC----AC--T---TT--G-G--G-T-T--AG--G----A--AA--------T-TTACTA------TTT-------GCCATTA-----GG--A--A--T----G-AA----GTAAAAT----A---A-CG-G--C-C-C-CA--------AAA-G-TGG--GC----AAACGAGAGTCCT
gi|66616                      :                                                                                             TA----CTATAAAA-A--C-TTT--A--CA----A-TT-T--------------A--G-A---------T-G-GATG--TTTTG----G--GTT--------GGGGTT--A--GT---A---TT-----TT-G--A-------A-------CTT-G-------GAAA--TTT-T------TA----AC--T---TT--G-G--A-T-T--AG--G----C--GAAAAA----C-ACACTA------AGT-------GTCATTG-----GG--A--A--T----G-TA----GAGAAAT----A---A-CG-A--CAT-C-CA--------AAA-A-
gi|66620                      :                                                                                                      atgcagaaaaaatgtttggatgaaaaatT-T--T-CC-CG--C--A--A-A---------T-A-TTTC--TTTTG----G--TT---------A---TA--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------ATT-G-------GGGA--TTT-T-----TTT----AC--T---TT--G-G--A-T-T--GG--G----G--AAAAA-----T-ATATCA------TTT-------GCCATTG-----AG--A--A--T----G-GG----GCGTAAT----A---A-CG-G--C-C-C-CA--------AAA-AGTGG--CC----AAACGAGAGCCCTG
gi|66623                      :                                                                                                                                           -C---C--C--A-A---------T-T-TTTC--ATT-G----G--CTT------------TT--T--GC---G---TT-----TT-G--A-----------------T-T-------GGAAA-TTT-T-----GTT----AA--T---TT--G-G--A-T-T--GG--G----A--AAAAAA----T-ATGCTA------TTT-------GACATTG-----GT--A--A--TG---G-GA----ACA-AAT----A---A-AG-A--C-C-T-CA--------AAACA-T-G--GC----AAACAAGAACCCTG
gi|66622                      :                                                                                                                                           -C---C--A--A-A---------T-A-TTTT--CTTTG----A--TTT--------C---TT--T--TC---C---TT-----TA-G--A-------A-------ATT-A-------GGAA--TTT-T-----GTT----AC--T---TT--G-G--A-T-G--GG--G----A--AAGGAA----
gi|66624                      :                                                                                                                                         ct-C---C--A--A-A---------T-A-TTTT--CTTTG----G--TTT--------C---TT--T--TT---C---TT-----TT-G--T-------A-------ATT-A-------GGAA--TTT-T-----GTT----AC--T---TT--G-G--A---T--GG--G----A--AAA
gi|66621                      :                                                                                                                                           -C---C--A--A-A---------T-A-TTTT--CGTTA----G--TTT--------C---TC--T--GC---A---CT-----TT-G--C-------A-------ATT-G-------GGAT--TTG-T-----GTT----TC--T---TT--G-G--G-T-T--GG--G----G--GAAAAtgaaa
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Reference ( family-318 )      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGTGATGTTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TTAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-C--A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T--GG--G----A--AAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--GNGG----------CCGAAT----A-ACGG-----------C-CNT-A-AAA-A-TGGGC----GAACGAGAGCCCTG
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gi|66597                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTT-T--G-T-------C--C---TT--GGGGA-A-T--GG--G----CCCAAAAAT----GATACTA------TTC-------GTCGTAG-----GAAAT--GGGC----------CCG--------------------------------AAA-A-TGGGT----AAACAAGAGCCCTGgatactttttgtccttggggaatgggcccaaaaatgatactattcgtcgtaggaaatgggcccgaaaatgggtaaacaagagccctg
gi|66598                      : tgtaatgtatagtaaatgtctaaaacatgtgatgttcatgtagaagactacattaaaatcataatattaaaaaatctcagaacttcttcgccaaatatttcttttggtttctttgcattttgaaattaggaattttgttactttggattgagaaaaaagatactatttgtcatagagaatgggcccaaaaaagatactTGTAATGTT-T-AT--TA---AAT---------------ATGTGATGTTAT-------------C---A----TAA----T--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAT----T--C-TCT---------G--AA----C-CT-TT-CC-C-CA-A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T--GG--G----G--AAAAAA----TATACTA------TTT-------GGCATTA-----CGAAA--GGGG----------CAGAAT----A-AAAG-----------C-TCC-A-AAA-A-TGGAC----GAACAAGAGCCCTG
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gi|66600                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGT------------AGAAGACTAT---A---TTAT----A--A------TCA---TAA----------------AA----T--C----------------AA----C-TT-TT-CC-C-A--A--A-AA-T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------G---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGAATTT-T--G-TT-------------------------------------------------------TA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--GTGA----------TAGAAT----A-ACGG-----------C-CCC-A-AAA-A-TGGGC----AAACAAGAGCCCTGg
gi|66601                      :                                                                                                                                                                                                       TATAATATG-T-GT-------AATGTA----TTTT-G-AATGTGATGTTCTTCT-ATGGGACTAC---A---TTAC----A--A------ACA---TAATA----TTTAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-AT-TT-CC-C-C--A--A-AAGT---------A-TTTC--TT-TTGTG--TTG--------T---TT--T--CCTCTA---TT-----TT-G--A-------C-------A-TTA--GGAAATT-T--G-TT-----AT--T---GT--GG--A-C-T--GG--G----A--AAAA------GATATTA------TTT-------GCCATTT-----GGAAA--GGGG----------CCGAAT----A-ATGG-----------C-CAT-A-AAA-A-TGGGC----AAACGAGAGCACTG
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gi|66605                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTT-TTAT--AA---AATGTA----TAAA-A---TGTGATATTCTTGT-AGAAGACTGC---A---T------------------------------------A----AAA----T------------------------------TC-CT-C-C--A--A-A--T---------A-TTTC--TA-TTG-GGGTTT--------C---TT-----GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGATTTT-T--T-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T---G--G----A--AAAAAA----CAAACTA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--
gi|66606                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TTAA-A-A-TGTGATCCTTTTGC-AGAAGACTCC---C---TTTA----A--A------TCA---TAATA----TTAAA----ATA----T--C-CCA---------A--AA----C-AT-TA-CT-T-A--T--A-A--T---------A-TTTG--CT-TTG-G---TT--------C---AT--T--GC---G---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGA
gi|66606                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GG----------CAGAATG---A-ATGT-----------C-CCC-A-AAA-A-TAGG-----AAACAAGAGCCCTGctaagtaattgactaagtgggcagaatgaatgtccccaaaaataggaaacaagagccctg
gi|66607                      :                                                    tgtaatgtatattaaatgtattaaaatgtgatccttttgcagaagactccctttaaatcataatattaaaatatcccaaaacattacttataatatttgctttggttcattgcgttttgaaattgggactaagtaattgactaagtgTGTAATATA-T-AT--TA---AAAATA----TAAA-A-AATGTGATGTTCTTAT-AGAAGACT-----A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAA----G--C-TCC---------A--AA----C-TT-
gi|66608                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--TT---AATGTA----TAAA-A-AATGTAATCCTATTGC-AGAAGA-TGC---AGATTTAG----A--GAAGGGCTTA---T--TT----TTAAA----AAAAAAGT--T-TTCTTAATTGAGA--AT----C-TT-TT-CC-C-C--A--A-A------------A-TT
gi|66608                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -------A-------A-TTG--AGAATCT-T----TT-----CC--C---CA--AA--A-T-T--GG--G----A--AAAA------TATACTA------TTT-------GCGATTG-----GGAAT--GGGG----------CCTAAT----A-AC-----------------------------GGC----AAACAAGAGCCCTGgggaaaaatatactatttgcgattgggaatggggcctaataacggcaaacaagagccctg
gi|66609                      :                                                                                                            tgtaatgtatatttaatgtataaaaaatgtaatcctattgcagaagatgcagatttagagaagggcttatttttaaaaaaaaagttttcttTGAAATATA-T--T--TA---TATATT----TAAA-A-AA-GTG-TACACTT-T-ATCAGGCCATTTAA---TTAA----ATAA------TCAATGTCATA----CTAAATTCAGAA----T--G-GGG---------A--AA----A-CT-TT-CT-T------------T---------A-TTTT--AT-CAA-G--TTT--------CAA-TT--T--AC---A---TT-----TTTG--AGGCTTTCA-------A-TTG--GGAATTT-T----TA-----AC--CA--TT--CA--A-C-T--GG--G----A--AAAAAA----GATTCTA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--ATGA----------CGCAAT----A-ACGG-----------C-TAT-A-AAA-A-TGGCC----GAAAAAAAACACTG
gi|66610                      :                                                                                                                                                                                                       TGTTATGTA-T-AT--CA---AATGTA----TAAA-A--ATGTGATGTTCTTGT-AGAAAACTGC---C---TTAA----A--A------T
gi|66611                      :                                                                                                                                                                                                        GTAATGTT-T-TT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGCGATGTTTTTGT-TGAAGATGAC---A---TTAA----A--A------TGA---TAATA----TTAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-CTGA--A-A--T---------A-TTTG--TT-TTG-G---TT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-C--A-------A-------A-TTG--GGAA-TT-T--G-TT-----TC--T-------------T-T--GG--G----A--TAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCATTG-----G
gi|66612                      :                                                                                                                                                                                                           ATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGTGCTGTTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----C--A------TCA---TAATA----TTCAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-TC-CTC--A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--ATT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTT--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T--GG--G----A--AAAAAG----GATGTTA------TTT-------GTCATTG-----GAAAT--GGGG----------AAAAGC----A-ATGG-----------C-CCC-A-AAA-A-TGGGC----AAACGAGAGCCCTG
gi|66613                      :                                                                                                                                                                                                           ATGTAAT-AA--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGTGATGTTCTTGT-AAAAGACTAC---A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TTAA-----------------------------A--AA----C-TT-TC-CA-C-C--A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTGTA--TTT--------T---TTTCT--GC---A---TT-----T-----A-------A-------A-TTG--GTCATTT-T--T-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T--GG--G----T--AAAAAA----GGTACTA------TTT-------GCCATT------AGAAT--GGGG----------CAGAAT----A-ACAA-----------C-CCC-A-AAA-A-TGGGT----AAACAAGAGCCCTG
gi|66614                      :                                                                                                                                                                                                            TGTA-T-GT--GC---AATGTAGTTGTAAACA-AATGTGGTCCTTTTGT-AAAAGATTTC---C---TTTA--------------TCA---TAATAATAATTAAA----AAA----T--CCTCA---------A--AA----T-TT-TT-CC-C-G--A--A-A--T---------A-TTTT--CT-TAG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-T
gi|66615                      :                                                                                                                                                                                                               A-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-CATGTGATATTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----A--C------TTG---TAATA----TAAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-C--C--ATA--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---AT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TAG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T--GG--GA---A--AAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCTTTG-----GAAATGGGGGG----------CAGAAT----A-TCAT-----------C-CCC-A-AAA-A-TGGGC----CAATGAGAGCCCTG
gi|66616                      :                                                                                                                                                                                                                             ATGCA----GAAA-A-AATGT-------TTG---GATGA-------------AA----A--A------T-----TACTA----T-AAA----AAC----T--T-TAC---------A--A--------T-TT---------A--G-A--T---------G-GATG--TT-TTG-G--GTT--------GGGGTT--A--GT---A---TT-----TT-G--A-------A-------C-TTG--GAAATTT-T----TA-----AC--T---TT--GG--A-T-T--AG--G----C--GAAAAA----CACACTA------AGT-------GTCATTG-----GGAAT--GTAG----------AGAAAT----A-ACGA-----------CATCC-A-AAA-A-
gi|66617                      :                                                                                                                                                                                                                                                         TTGT-AGAACACTAC---A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TTAAA----AAA----T--C-TAC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-CC-A--A-A--C---------A-TTTC--TT-TTG-G--CTT--------C---TT--TTTGC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTA--GGAATTT-T--G-TTTTATTAC--T---TT--GG--A-T-T--GG--G----A--TAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--GGGG----------TAGAAT----A-ACGA-----------C-CCC-A-AAA-A-TGGGC----AAACAAGAAC
gi|66618                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A---TGATA----TTAAC----AA-----T--C-TCC---------A--AA----CATT-TC-CC-C-C--A--A-A--T---------A-TTT---TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTA--GAAATTG-T--G-TC-----AC--T---TT--GG--G-T-T--AG--G----------AAA----TTTACTA------TTT-------GCCATTA-----GGAAT--GAAG----------TAAAAT----A-ACGG-----------C-CCC-A-AAA-G-TGGGC----AAACGAGAGTCCT
gi|66619                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A----AAA----T--C-TGC---------A--------C-TTATT-CT-T-C--A--A-GG-C---------A-GTTT--CT-CTA-G--TTT----------------T--GA---A---AC-----TT-C--C-------A-------A-TTG--GGAATTT-T-----T-----AC--C---CC--TC--ACT-T--GG--G----G--AAAAAA----GATACTT------TTT-------GAGATTG-----GGAAT--ATGA----------CCGAAT----A-ACGG-----------C-TAT-A-AAA-A-TGGCC----GAA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|66628 ): ATTTTCCTTCCGATTTTATGTTTGTTTTCGAGGGGATTTTTTTCTTAGAAAGGGGTAAAAAACATATTATGTTAGGAGGGGAATCGGCCCCAAAATCGGCCAAACGAGTGCCCTG






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gi|66597                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTT-T--G-T-------C--C---TT--GGGGA-A-T----GG--G---CCCAAAAAT----GATACTA------TTC-------GTCGTAG-----GAAAT--G-GGCC-----------CG-----------------------------AAA-A-TGGGT----AAACAAGAGCCCTGagatactttttgtccttggggaatgggcccaaaaatgatactattcgtcgtaggaaatgggcccgaaaatgggtaaacaagagccctg
gi|66598                      : tgtaatgtatagtaaatgtctaaaacatgtgatgttcatgtagaagactacattaaaatcataatattaaaaaatctcagaacttcttcgccaaatatttcttttggtttctttgcattttgaaattaggaattttgttactttggattgagaaaaaagatactatttgtcatagagaatgggcccaaaaaagatactTGTAATGTT-T-AT--TA---AAT---------------ATGTGATGTTAT-------------C---A----TAA----T--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAT----T--C-TCT---------G--AA----C-CT-TT-CC-C-CA-A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T----GG--G---G--AAAAAA----TATACTA------TTT-------GGCATTA-----CGAAA--GGGGCAGAAT----A-AAAG-----------CTCC--A----------AAA-A-TGGAC----GAACAAGAGCCCTG
gi|66599                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TGAA-A-AAAGTGATGTTCTTGTTAAAAGACTAC---A---TTGA----A--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-CT-A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-T--A-------A-------A-TTA--GGAATTC-T--G-TA-----GC--T---TT--GG--A-T-T----GG--A---A--AAAAAA----GAAA-----------T-------GCCA--A-----CAAAT--GAG--CAAAC----A-AGAG-----------CC
gi|66600                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGT------------AGAAGACTAT---A---TTAT----A--A------TCA---TAA----------------AA----T--C----------------AA----C-TT-TT-CC-C-A--A--A-AA-T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------G---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGAATTT-T--G-TT--------------------------------------------------------TA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--GTGATAGAAT----A-ACGG-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----AAACAAGAGCCCTGctg
gi|66601                      :                                                                                                                                                                                                       TATAATATG-T-GT-------AATGTA----TTTT-G-AATGTGATGTTCTTCT-ATGGGACTAC---A---TTAC----A--A------ACA---TAATA----TTTAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-AT-TT-CC-C-C--A--A-AAGT---------A-TTTC--TT-TTGTG--TTG--------T---TT--T--CCTCTA---TT-----TT-G--A-------C-------A-TTA--GGAAATT-T--G-TT-----AT--T---GT--GG--A-C-T----GG--G---A--AAAA------GATATTA------TTT-------GCCATTT-----GGAAA--GGGGCCGAAT----A-ATGG-----------CCAT--A----------AAA-A-TGGGC----AAACGAGAGCACTG
gi|66602                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-TT--TG---AATTAA----TAAA-A-AATGATATGTTCTTCT-TGAAGTCAAC---A---TTAA----A--A------ACA---TTATA----TTAAA----AAA----T--C-TTC---------A--AA-------------------------------------------C--TT-TTG-A--TTT--------C---TT--T--GC---A---TC-----TT-A--A-------A-------A-TTG--GGAATTG-T--G-TT-----AT--T---TT--AG--A-T-TTG--GG--G---T--AAAAAA----AATA----------TT-------GCTA-TG-----GGAAT--GGGGCCGAAT----A-ACGG-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----AAACAAGAGCCCTG
gi|66603                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-TT--TG---AATGCA----TAAA-A-A-TATAATGTTCTTCT-AGAAGACTAC---A---TTAA----A----------CA---TAAT------TATA----ATA----T--T-TCC---------A--AA----C-GT-TT-CC-C-C--AG-A-A--T---------A-TTTA--TT-TTA-T--TAT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------C-------A-CTG--GGAATTT-T--A-CT-----AT--T---TC--GG--A-T-T----AG--G---A--AAAAAA----TGTCCTT------TTT-------ACCATTG-----GGAAT--GGGGCCGAGT----------------------------------------A-A-TGGGC----AAACGAGAG
gi|66604                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--CA---AATGTA----TAAA-A-AATGAGATCTTCTCG----AAAACTAC---C---TTAA--------------TCA---TAATA----TTAAA----TAA----T--C-CTCTA-------A--AA----C-TT-TT-C----------------------------------T-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GAACTTC-T--G-TT-----AC--C---TT--GG--A-C-T----GG--G---A--A---------------A------TTT-------GTTATTG-----CTAAT--ACGGCAGAAT----A-A-GGCACCCCACTCTCCAT--A----------AAC-A-AGGG-----AAATGTGAGCCCT
gi|66605                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTT-TTAT--AA---AATGTA----TAAA-A---TGTGATATTCTTGT-AGAAGACTGC---A---T------------------------------------A----AAA----T------------------------------TC-CT-C-C--A--A-A--T---------A-TTTC--TA-TTG-GGGTTT--------C---TT-----GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGATTTT-T--T-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T-----G--G---A--AAAAAA----CAAACTA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--
gi|66606                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TTAA-A-A-TGTGATCCTTTTGC-AGAAGACTCC---C---TTTA----A--A------TCA---TAATA----TTAAA----ATA----T--C-CCA---------A--AA----C-AT-TA-CT-T-A--T--A-A--T---------A-TTTG--CT-TTG-G---TT--------C---AT--T--GC---G---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGA
gi|66606                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGCAGAATG---A-ATGT-----------CCCC--A----------AAA-A-TAGG-----AAACAAGAGCCCTGctaagtaattgactaagtgggcagaatgaatgtccccaaaaataggaaacaagagccctg
gi|66607                      :                                                    tgtaatgtatattaaatgtattaaaatgtgatccttttgcagaagactccctttaaatcataatattaaaatatcccaaaacattacttataatatttgctttggttcattgcgttttgaaattgggactaagtaattgactaagtgTGTAATATA-T-AT--TA---AAAATA----TAAA-A-AATGTGATGTTCTTAT-AGAAGACT-----A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAA----G--C-TCC---------A--AA----C-TT-
gi|66608                      :                                                                                                                                                                                                       TGTAATGTA-T-AT--TT---AATGTA----TAAA-A-AATGTAATCCTATTGC-AGAAGA-TGC---AGATTTAG----A--GAAGGGCTTA---T--TT----TTAAA----AAAAAAGT--T-TTCTTAATTGAGA--AT----C-TT-TT-CC-C-C--A--A-A------------A-TT
gi|66608                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -------A-------A-TTG--AGAATCT-T----TT-----CC--C---CA--AA--A-T-T----GG--G---A--AAAA------TATACTA------TTT-------GCGATTG-----GGAAT--GGGGCCTAAT----A-AC--------------------------------------GGC----AAACAAGAGCCCTGgggaaaaatatactatttgcgattgggaatggggcctaataacggcaaacaagagccctg
gi|66609                      :                                                                                                            tgtaatgtatatttaatgtataaaaaatgtaatcctattgcagaagatgcagatttagagaagggcttatttttaaaaaaaaagttttcttTGAAATATA-T--T--TA---TATATT----TAAA-A-AA-GTG-TACACTT-T-ATCAGGCCATTTAA---TTAA----ATAA------TCAATGTCATA----CTAAATTCAGAA----T--G-GGG---------A--AA----A-CT-TT-CT-T------------T---------A-TTTT--AT-CAA-G--TTT--------CAA-TT--T--AC---A---TT-----TTTG--AGGCTTTCA-------A-TTG--GGAATTT-T----TA-----AC--CA--TT--CA--A-C-T----GG--G---A--AAAAAA----GATTCTA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--ATGACGCAAT----A-ACGG-----------CTAT--A----------AAA-A-TGGCC----GAAAAAAAACACTG
gi|66610                      :                                                                                                                                                                                                       TGTTATGTA-T-AT--CA---AATGTA----TAAA-A--ATGTGATGTTCTTGT-AGAAAACTGC---C---TTAA----A--A------T
gi|66611                      :                                                                                                                                                                                                        GTAATGTT-T-TT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGCGATGTTTTTGT-TGAAGATGAC---A---TTAA----A--A------TGA---TAATA----TTAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-CTGA--A-A--T---------A-TTTG--TT-TTG-G---TT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-C--A-------A-------A-TTG--GGAA-TT-T--G-TT-----TC--T-------------T-T----GG--G---A--TAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCATTG-----G
gi|66612                      :                                                                                                                                                                                                           ATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGTGCTGTTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----C--A------TCA---TAATA----TTCAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-TC-CTC--A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--ATT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTT--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T----GG--G---A--AAAAAG----GATGTTA------TTT-------GTCATTG-----GAAAT--GGGGAAAAGC----A-ATGG-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----AAACGAGAGCCCTG
gi|66613                      :                                                                                                                                                                                                           ATGTAAT-AA--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGTGATGTTCTTGT-AAAAGACTAC---A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TTAA-----------------------------A--AA----C-TT-TC-CA-C-C--A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTGTA--TTT--------T---TTTCT--GC---A---TT-----T-----A-------A-------A-TTG--GTCATTT-T--T-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T----GG--G---T--AAAAAA----GGTACTA------TTT-------GCCATT------AGAAT--GGGGCAGAAT----A-ACAA-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGT----AAACAAGAGCCCTG
gi|66614                      :                                                                                                                                                                                                            TGTA-T-GT--GC---AATGTAGTTGTAAACA-AATGTGGTCCTTTTGT-AAAAGATTTC---C---TTTA--------------TCA---TAATAATAATTAAA----AAA----T--CCTCA---------A--AA----T-TT-TT-CC-C-G--A--A-A--T---------A-TTTT--CT-TAG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-T
gi|66615                      :                                                                                                                                                                                                               A-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-CATGTGATATTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----A--C------TTG---TAATA----TAAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-C--C--ATA--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---AT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TAG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GG--A-T-T----GG--GA--A--AAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCTTTG-----GAAATGGGGGGCAGAAT----A-TCAT-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----CAATGAGAGCCCTG
gi|66616                      :                                                                                                                                                                                                                             ATGCA----GAAA-A-AATGT-------TTG---GATGA-------------AA----A--A------T-----TACTA----T-AAA----AAC----T--T-TAC---------A--A--------T-TT---------A--G-A--T---------G-GATG--TT-TTG-G--GTT--------GGGGTT--A--GT---A---TT-----TT-G--A-------A-------C-TTG--GAAATTT-T----TA-----AC--T---TT--GG--A-T-T----AG--G---C--GAAAAA----CACACTA------AGT-------GTCATTG-----GGAAT--GTAGAGAAAT----A-ACGA------------CATCCA----------AAA-A-
gi|66617                      :                                                                                                                                                                                                                                                         TTGT-AGAACACTAC---A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TTAAA----AAA----T--C-TAC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-CC-A--A-A--C---------A-TTTC--TT-TTG-G--CTT--------C---TT--TTTGC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTA--GGAATTT-T--G-TTTTATTAC--T---TT--GG--A-T-T----GG--G---A--TAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--GGGGTAGAAT----A-ACGA-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----AAACAAGAAC
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gi|66621                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   C-C-C--A--A-A--T---------A-TTTT--CG-TTA-G--TTT--------C---TC--T--GC---A---CT-----TT-G--C-------A-------A-TTG--GGATTTG-T--G-TT-----TC--T---TT--GG--G-T-T----GG--G---G--GAAAA
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gi|66677                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTA------TTT-------GCCATTG-----GGAAT--ATGACCCAAT----A-ACGG-----------CTAT--A----------AAA-A-TAGCC----GAAAAAAAACACTG
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gi|66603                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTAATGTA-T-TT--TG---AATGCA----TAAA-A-A-TATAATGTTCTTCT-AGAAGACTAC---A---TTAA----A----------CA---TAAT------TATA----ATA----T--T-TCC---------A--AA----C-GT-TT-CC-C-C--AG-A-A--T---------A-TTTA--TT-TTA-T--TAT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------C-------A-CTG--GGAATTT-T--A-CT-----AT--T---TC--GGA-T-T----AGG---AAAAAAA----TGTCCTT------TTT-------ACCATTGGGAAT--GGGG-CCGAGT----------------------------------------A-A-TGGGC----AAACGAGAG
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gi|66605                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTAATGTT-TTAT--AA---AATGTA----TAAA-A---TGTGATATTCTTGT-AGAAGACTGC---A---T------------------------------------A----AAA----T------------------------------TC-CT-C-C--A--A-A--T---------A-TTTC--TA-TTG-GGGTTT--------C---TT-----GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGATTTT-T--T-TT-----AC--T---TT--GGA-T-T-----GG---AAAAAAA----CAAACTA------TTT-------GCCATTGGGAAT--
gi|66606                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TTAA-A-A-TGTGATCCTTTTGC-AGAAGACTCC---C---TTTA----A--A------TCA---TAATA----TTAAA----ATA----T--C-CCA---------A--AA----C-AT-TA-CT-T-A--T--A-A--T---------A-TTTG--CT-TTG-G---TT--------C---AT--T--GC---G---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGA
gi|66606                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GG-CAGAATG---A-ATGT-----------CCCC--A----------AAA-A-TAGG-----AAACAAGAGCCCTGctaagtaattgactaagtgggcagaatgaatgtccccaaaaataggaaacaagagccctg
gi|66607                      :                                                                                                              tgtaatgtatattaaatgtattaaaatgtgatccttttgcagaagactccctttaaatcataatattaaaatatcccaaaacattacttataatatttgctttggttcattgcgttttgaaattgggactaagtaattgactaagtgTGTAATATA-T-AT--TA---AAAATA----TAAA-A-AATGTGATGTTCTTAT-AGAAGACT-----A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAA----G--C-TCC---------A--AA----C-TT-
gi|66608                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTAATGTA-T-AT--TT---AATGTA----TAAA-A-AATGTAATCCTATTGC-AGAAGA-TGC---AGATTTAG----A--GAAGGGCTTA---T--TT----TTAAA----AAAAAAGT--T-TTCTTAATTGAGA--AT----C-TT-TT-CC-C-C--A--A-A------------A-TT
gi|66608                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -------A-------A-TTG--AGAATCT-T----TT-----CC--C---CA--AAA-T-T----GGG---AAAAA------TATACTA------TTT-------GCGATTGGGAAT--GGGG-CCTAAT----A-AC--------------------------------------GGC----AAACAAGAGCCCTGgggaaaaatatactatttgcgattgggaatggggcctaataacggcaaacaagagccctg
gi|66609                      :                                                                                                                                                                      tgtaatgtatatttaatgtataaaaaatgtaatcctattgcagaagatgcagatttagagaagggcttatttttaaaaaaaaagttttcttTGAAATATA-T--T--TA---TATATT----TAAA-A-AA-GTG-TACACTT-T-ATCAGGCCATTTAA---TTAA----ATAA------TCAATGTCATA----CTAAATTCAGAA----T--G-GGG---------A--AA----A-CT-TT-CT-T------------T---------A-TTTT--AT-CAA-G--TTT--------CAA-TT--T--AC---A---TT-----TTTG--AGGCTTTCA-------A-TTG--GGAATTT-T----TA-----AC--CA--TT--CAA-C-T----GGG---AAAAAAA----GATTCTA------TTT-------GCCATTGGGAAT--ATGA-CGCAAT----A-ACGG-----------CTAT--A----------AAA-A-TGGCC----GAAAAAAAACACTG
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-318 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGTGATGTTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TTAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-C--A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GGA-T-T----GGG---AAAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCATTGGGAAT--GTGG-CCNAAT----A-ACGG-----------CCAT--A----------AAA-A-TGGGC----GAACGAGAGCCCTG
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gi|66614                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTA-T-GT--GC---AATGTAGTTGTAAACA-AATGTGGTCCTTTTGT-AAAAGATTTC---C---TTTA--------------TCA---TAATAATAATTAAA----AAA----T--CCTCA---------A--AA----T-TT-TT-CC-C-G--A--A-A--T---------A-TTTT--CT-TAG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-T
gi|66615                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         A-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-CATGTGATATTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----A--C------TTG---TAATA----TAAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-C--C--ATA--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---AT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TAG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GGA-T-T----GGGA--AAAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCTTTGGAAATGGGGGG-CAGAAT----A-TCAT-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----CAATGAGAGCCCTG
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gi|66617                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGT-AGAACACTAC---A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TTAAA----AAA----T--C-TAC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-CC-A--A-A--C---------A-TTTC--TT-TTG-G--CTT--------C---TT--TTTGC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTA--GGAATTT-T--G-TTTTATTAC--T---TT--GGA-T-T----GGG---ATAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCATTGGGAAT--GGGG-TAGAAT----A-ACGA-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----AAACAAGAAC
gi|66618                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A---TGATA----TTAAC----AA-----T--C-TCC---------A--AA----CATT-TC-CC-C-C--A--A-A--T---------A-TTT---TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTA--GAAATTG-T--G-TC-----AC--T---TT--GGG-T-T----AGG-------AAA----TTTACTA------TTT-------GCCATTAGGAAT--GAAG-TAAAAT----A-ACGG-----------CCCC--A----------AAA-G-TGGGC----AAACGAGAGTCCT
gi|66619                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A----AAA----T--C-TGC---------A--------C-TTATT-CT-T-C--A--A-GG-C---------A-GTTT--CT-CTA-G--TTT----------------T--GA---A---AC-----TT-C--C-------A-------A-TTG--GGAATTT-T-----T-----AC--C---CC--TCACT-T----GGG---GAAAAAA----GATACTT------TTT-------GAGATTGGGAAT--ATGA-CCGAAT----A-ACGG-----------CTAT--A----------AAA-A-TGGCC----GAA
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gi|66621                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-C-C--A--A-A--T---------A-TTTT--CG-TTA-G--TTT--------C---TC--T--GC---A---CT-----TT-G--C-------A-------A-TTG--GGATTTG-T--G-TT-----TC--T---TT--GGG-T-T----GGG---GGAAAA
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gi|66675                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A-T-T----GGG---GAAAAAA----GATACTACCGGTATTT-------GCCATTGGGAAT--ATGA-CCCAAT----A-ACGG-----------CTAT--A----------AAA-A-TGG
gi|66676                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACTA------TTT-------CCCATAGGGAAT--TGGG-CCGAAT----A-ACAG-----------CCCC--C----------AAA-A--GGGC----AAGCGAGAGCCCTGtagaaaaaaaaaacactg
gi|66677                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACTA------TTT-------GCCATTGGGAAT--ATGA-CCCAAT----A-ACGG-----------CTAT--A----------AAA-A-TAGCC----GAAAAAAAACACTG
gi|66678                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTA------TTT-------GCCACTGGGAAT--GTGG---GAAT----A-G-GGCA---------CCAT--AATGGCCCCCCAAA-A-AAGGC----CAACAAAAGCACTG
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gi|66680                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GG-CAGAAT----A-ACGG-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----AAAAGAGAGCCCTG


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . T              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . A  .    .  .              .       . .    TA                  C    .    .      GA           .                      AAC   .         A    A    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . T  .    .  .              .       . .    G                   C    .    .      GA           .                      TAC   .         A    G    .   .      .         .          .        .                  CA       A   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . C  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      TAC   .         A    T    .   .      .         .          .        .                  GG       T   .         .           CC .  .                  G C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . G              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      AT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           TC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      TA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GG           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           TC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      TA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      AT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       C   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GA    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GT       G   .         .           CA .  .                  A G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       C   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      TA           .                      AT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    A    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      AA    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  AC       G   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      AA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  AT       G   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    G                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    A    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      CA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    T                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    C    .   .      .         .          .        .                  GG       T   .         .           CA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GT       C   .         .           CC .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AC               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      CA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       A   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      AC    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GA       G   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . A              .          .   .      AA               .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  AT       G   .         .           CC .  .                  G C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . .              .          .   .      A                .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      TT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       A   .         .           CT .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . .              .          .   .      A                .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   T    .    .      GA           .                      GT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  GG       G   .         .           CC .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . .              .          .   .      A                .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         A    T    .   .      .         .          .        .                  GT       A   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . .              .          .   .      .                .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    T                   C    .    .      GA           .                      TT    .         A    G    .   .      .         .          .        .                  AT       G   .         .           CA .  .                  C A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          . .  .   .        .       . . .              .          .   .      .                .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   A    .    .      CC           .                      GT    .         .    G    .   .      .         .          .        .                  TG       T   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                            .       . . .              .          .   .      .                .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      GT    .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       A   .         .           TA .  .                  C A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .          .   .      .                .       .        .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GC           .                      GT    .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  A G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .      .    .  .   .         .   .    .  .  .  . . .  .    .  .              .       . .    C                   C    .    .      GA           .                      TT    .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       G   .         .           TA .  .                  A T    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .  .  . . .  .    .  .              .       . .    A                   C    .    .      GA           .                      GT    .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       A   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              . . .  .    .  .              .       . .    C                   T    .    .      GT           .                      GT    .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       G   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              . . .  .    .  .              .       . .    C                   T    .    .      CA           .                      GT    .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       A   .         .           TA .  .                  C A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              . . .  .    .  .              .       . .    C                   G    .    .      AA           .                      GT    .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .  .              .       . .    C                   T    .    .      TC           .                      TT    .         .    A    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .  .              .       . .    T                   C    .    .      GA           .                      GT    .         .    T    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .  .                      . .    T                   C    .    .      GA           .                      GT    .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    . .    T                   A    .    .      TC           .                      AC    .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      .    T                   A    .    .      TC           .                      GC    .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      AC    .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      AC    .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      AT    .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      GT    .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AG       C   .         .           CC .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      T     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  GG       C   .         .           TT .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      T     .         .    T    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      T     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      T     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      T     .         .    A    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       G   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      .     .         .    G    .   .      .         .          .        .                  TT       G   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      .     .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   C    .    .      TC           .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  TT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T                   A    .    .      TC           .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AC       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .                   A    .    .      TC           .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  T G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .                   A    .    .      TA           .                      .     .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  T G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .                   A    .    .      TC           .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A    .    .      A            .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A    .    .      .            .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       A   .         .           TT .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .    .    .      .            .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    .      .            .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       A   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           GA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AA       C   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    A    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  C G    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  G C    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    C    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                  G A    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    T    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           CT .  .                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    A    .   .      .         .          .        .                  GG       C   .         .           CC .  .                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           AA .  .                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    G    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    G    .   .      .         .          .        .                  TG       G   .         .           CC .  .                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    .    .   .      .         .          .        .                  AT       C   .         .           TA .  .                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    .    .   .      .         .          .        .                  GT       G   .         .           CA .  .                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .     .         .    .    .   .      .         .          .        .                  TA       A   .         .           CC .  .                         
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|66597                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----------AAA-A-TGGGT----AAACAAGAGCCCTGagatactttttgtccttggggaatgggcccaaaaatgatactattcgtcgtaggaaatgggcccgaaaatgggtaaacaagagccctg
gi|66598                      : tgtaatgtatagtaaatgtctaaaacatgtgatgttcatgtagaagactacattaaaatcataatattaaaaaatctcagaacttcttcgccaaatatttcttttggtttctttgcattttgaaattaggaattttgttactttggattgagaaaaaagatactatttgtcatagagaatgggcccaaaaaagatactttttgtccttggggaatgggcccaaaaatgatactattcgtcgtaggaaatgggcccgTGTAATGTT-T-AT--TA---AAT---------------ATGTGATGTTAT-------------C---A----TAA----T--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAT----T--C-TCT---------G--AA----C-CT-TT-CC-C-CA-A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GGA-T-T----GGG---GAAAAAA----TATACTA------TTT-------GGCATTACGAAA--GGGG-CAGAAT----A-AAAG-----------CTCC--A----------AAA-A-TGGAC----GAACAAGAGCCCTG
gi|66599                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTAATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TGAA-A-AAAGTGATGTTCTTGTTAAAAGACTAC---A---TTGA----A--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-CT-A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-T--A-------A-------A-TTA--GGAATTC-T--G-TA-----GC--T---TT--GGA-T-T----GGA---AAAAAAA----GA------------------------------AAT--G-----CCAAC----A-A-----------------------------------A-TGAGC----AAACAAGAGCCCTG
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gi|66607                      :                                                                                                              tgtaatgtatattaaatgtattaaaatgtgatccttttgcagaagactccctttaaatcataatattaaaatatcccaaaacattacttataatatttgctttggttcattgcgttttgaaattgggactaagtaattgactaagtgTGTAATATA-T-AT--TA---AAAATA----TAAA-A-AATGTGATGTTCTTAT-AGAAGACT-----A---TTAA----A--A------TCA---TAATA----TCAAA----AAA----G--C-TCC---------A--AA----C-TT-
gi|66608                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTAATGTA-T-AT--TT---AATGTA----TAAA-A-AATGTAATCCTATTGC-AGAAGA-TGC---AGATTTAG----A--GAAGGGCTTA---T--TT----TTAAA----AAAAAAGT--T-TTCTTAATTGAGA--AT----C-TT-TT-CC-C-C--A--A-A------------A-TT
gi|66608                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -------A-------A-TTG--AGAATCT-T----TT-----CC--C---CA--AAA-T-T----GGG---AAAAA------TATACTA------TTT-------GCGATTGGGAAT--GGGG-CCTAAT----A-AC--------------------------------------GGC----AAACAAGAGCCCTGgggaaaaatatactatttgcgattgggaatggggcctaataacggcaaacaagagccctg
gi|66609                      :                                                                                                                                                                      tgtaatgtatatttaatgtataaaaaatgtaatcctattgcagaagatgcagatttagagaagggcttatttttaaaaaaaaagttttcttTGAAATATA-T--T--TA---TATATT----TAAA-A-AA-GTG-TACACTT-T-ATCAGGCCATTTAA---TTAA----ATAA------TCAATGTCATA----CTAAATTCAGAA----T--G-GGG---------A--AA----A-CT-TT-CT-T------------T---------A-TTTT--AT-CAA-G--TTT--------CAA-TT--T--AC---A---TT-----TTTG--AGGCTTTCA-------A-TTG--GGAATTT-T----TA-----AC--CA--TT--CAA-C-T----GGG---AAAAAAA----GATTCTA------TTT-------GCCATTGGGAAT--ATGA-CGCAAT----A-ACGG-----------CTAT--A----------AAA-A-TGGCC----GAAAAAAAACACTG
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gi|66612                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGTA-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-AATGTGCTGTTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----C--A------TCA---TAATA----TTCAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-TC-CTC--A--A-A--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--ATT--------C---TT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TTT--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GGA-T-T----GGG---AAAAAAG----GATGTTA------TTT-------GTCATTGGAAAT--GGGG-AAAAGC----A-ATGG-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----AAACGAGAGCCCTG
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gi|66615                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         A-T-AT--TA---AATGTA----TAAA-A-CATGTGATATTCTTGT-AGAAGACTAC---A---TTAA----A--C------TTG---TAATA----TAAAA----AAA----T--C-TCC---------A--AA----C-TT-TT-CC-C-C--C--ATA--T---------A-TTTC--TT-TTG-G--TTT--------C---AT--T--GC---A---TT-----TT-G--A-------A-------A-TAG--GGAATTT-T--G-TT-----AC--T---TT--GGA-T-T----GGGA--AAAAAAA----GATACTA------TTT-------GCCTTTGGAAATGGGGGG-CAGAAT----A-TCAT-----------CCCC--A----------AAA-A-TGGGC----CAATGAGAGCCCTG
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gi|66619                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A----AAA----T--C-TGC---------A--------C-TTATT-CT-T-C--A--A-GG-C---------A-GTTT--CT-CTA-G--TTT----------------T--GA---A---AC-----TT-C--C-------A-------A-TTG--GGAATTT-T-----T-----AC--C---CC--TCACT-T----GGG---GAAAAAA----GATACTT------TTT-------GAGATTGGGAAT--ATGA-CCGAAT----A-ACGG-----------CTAT--A----------AAA-A-TGGCC----GAA
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gi|66673                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T---TT--GGA-T-T----GGG---AAAAATA----GATTCTA------TTT-------GTCATTGGGAAT--ATGG-CCAAATTTTAA-ACAG-----------CCCC--AG---------AAA-A-T-GGC----AAACGAGAGCCCCG
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|66626 ): ACATTTCTTTTTTTTTCCAATTTTGTTGGGAATTTTTTCTTACATTGGTAGAAAAAAATGTATGTTTTTGGGAGAGGAATGGGGCAAACTTTTGGTCCCAAAAAGGTTAAATAAAA
Unaligned ( gi|66628 ): ATTTTCCTTCCGATTTTATGTTTGTTTTCGAGGGGATTTTTTTCTTAGAAAGGGGTAAAAAACATATTATGTTAGGAGGGGAATCGGCCCCAAAATCGGCCAAACGAGTGCCCTG