lowQualScore : 11111 111111 1111 11111111 1 11
lowQualScore : 0 0 11 11111 11111 33 555555 333333 11 11 777 00 0 2222222 2222 777777 0 1 0 0000 2222222 0 66666666 555555 1 0 0 0 111 1 77 00 444444 0
lowQualScore : . . .. ..... ..... .. ...... ...... .. .. ... .. . ....... .... ...... . . . .... ....... . ........ ...... . . . . ... . .. .. ...... .
lowQualScore : 4 4 00 88888 55555 55 444444 888888 00 00 444 66 4 9999999 6666 777777 4 0 4 9999 2222222 4 88888888 333333 2 7 4 4 666 3 44 66 111111 4
consensus : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-N----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
Reference ( gi|154848 ) : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AGT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154844 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTAA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGGAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154847 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----TTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154856 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154853 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACATG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-TAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154873 : TCCTGCACTG-TTTTTC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ACTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154852 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CGAAGGGTTAA
gi|154881 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGAAA-CAAAGGGTTAA
gi|154855 : TCCTGCACTG-TTTTAC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CCT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154862 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CG--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAACAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154866 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAT-CAAAGGGTTAA
gi|154863 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-A----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TTTGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154876 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTATTTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154854 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTAAT--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACATG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CCTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154865 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AT--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----TTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154867 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTTTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTT-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAA-CAAAGGGTTAA
gi|154860 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTATC--AG--T-TTA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154851 : TTCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------TATA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154877 : TCCTTCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CGT-------TG----CTGA------T-ACGTA-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGTCCC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154850 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAT--C-CAT-------TG----CTGA------T-AAGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAGAGGGTTAA
gi|154832 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TTA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------GTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CT-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154849 : agtTCCTGCACTG-TTTTCC-ACT--GTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAT-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACATG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154870 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-AAT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----AGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAGAAAAAGGGTTAA
gi|154869 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGCC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CGT-------TG----CTGA------T-TCGTG-G----TGAATT-A-----A-C--------A------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-A--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154835 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----AA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------CG----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TAGGAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGCTTAA
gi|154884 : agtTCCTGTACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--C-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTG-------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTATC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGTG-CAAAGGGTTAA
gi|154882 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACATG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA--TTGGAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGTTTAA
gi|154890 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGATACATGT-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-ATGGAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----AATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154842 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTTAGTC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-AAGTG-G----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154885 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACATG-G----TGAACT-A-----A-A--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAAGGC-T----TATGGAG-CAATGGGATAA
gi|154872 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---GTTCAC--C-TAT-------TG----CTGA------T-ATATG-G----TGAACT-A-----A-T--------G------TTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-T-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154861 : TCCTGCATTG-TTTTCC-ACTCAATC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-AAGTG-G----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154879 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATT-AC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACATG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAA-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAACAC-T----AATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154880 : TCCTGCATTG-TTTTCC-ACTCTATC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAC-------TG----CTGA------T-ACATG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAATAGT-CC-A-A-G--A--AAATGA-T----TATGGAG-CAAAGAGTTAA
gi|154883 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AA--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTTA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------C------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TA---AG-CAAAGGGTTAA
gi|154888 : TCCTGCACTT-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TCAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-AAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-T----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGATA
gi|154874 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACCTG-G----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-G-G--A--AAATGC-T----TAAGAAG-TAAATGGTTAA
gi|154871 : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCACTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-AAGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------A------TTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--T--TAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154841 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----TA--T--G---ATTCAC--C-CAT-------TC----CTGA------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----T-T--------G------CTTTC-ATT-TTGGAAAATT-CC-A-A-G--A--AACTGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154859 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ACGTG-G----TGA---------------------G------CTTTC-AAG-TTGGAATAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGGG-CAAAGGGTTAA
gi|154858 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-AAA-----T--G------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-AAGTC-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGGGT-TC-C-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154845 : TCCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TAAATC-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-TC-A-A-G--A--AAATGC-A----AATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154868 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ACTCAC--C-CAT-------TA----CTGT------T-ACGTG-G----TGAATT-A-----A-G--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-TTTAATATGGAG-CAATGAGTTAA
gi|154857 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATATAC--A-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-A----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CCAA-A-G--A--CAATGC-T----TATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154846 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CGGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGC-CC-A-A----A--AAATGC-T----AATGGAG-CAAAGTGTAAA
gi|154843 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--C--A---GTTCAC--C-CAT-------TA----CTGA------T-ACGT-------TAAA-T-A-----G-T--------G------CTTCC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154887 : TCCTTCACTG-TTTTCC-ACCCTGTC--AT--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--T-CAT-------TG----CTGA------T-GCGGT-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CA-A-A-G--A--AAATGC-T----TACGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154864 : TTCTGCACTG-TTTTCA-ACTCTGTC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-GAT-------TT----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-TGAAAAGTTA
gi|154878 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--TG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-AATTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AAA-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G-----AAATGC-T----TATGGAG-TATAGGGTTAA
gi|154886 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTC------AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-AAGTA-G----TGTATT-A-----A-T--------A------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AACTGC-T----TATGGAG-CAAAGAGTTAA
gi|154875 : TCCTGCACCG-CTTTCC-ACCCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------AAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAA-----------------------------------T-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--TAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154889 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTTAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATG-----------------------T--------G------CTTTC-AATATTAGAGGTGT-CC-----------AAATGCGTTTA-TATGAAG-TAAAGGGTTAA
gi|154814 : TTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--T-CAT-------TGAAA-TTGA------TTATGTG------TGACTT---------------------------TTC-AGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATAC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154820 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AA--T-AAA-----C--AGT----TAAA-----CG--T--A----TCTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG------TGACTT---------------------------TTG-AGT-TTGGAACAGT-CC-A---GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154836 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T------------------CATG-G-----AAATT-G-----A-CTATGTTTGG------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154805 : gTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AG-----AA-----T--AAA----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------TC----ATGG--------ACAT-------TGACTT-T-----G-T--------GTGG---CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154800 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGT--G----TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAA-TAAAGAGTTAA
gi|154822 : aggTCCTGCACTA-TTTTCT-GCTTTATC--A------AA-----G--G------TAAA------A--T--GT--ATCTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGT-----------TT-A-----A-C---------------TTTTC-AGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154802 : aggTTCTGCACTG-TTTTCA-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154801 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GTTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T------------------CATG-G-----AAATT-G-----A-CTTTGTGTGG------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154823 : aggTCCTGCACTA-TTTTCT-GCTTTATC--A------AA-----G--G------TAA-------------A---ATGTAT--C-T------------------A------T-ACATG-G-----AAATT-G-----ACT--------GTTTGACTTTTC-AGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154837 : aggTTCTGCACTG-TTCTCT-GCTCCATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T------------------CATG-GAAATTGACTT-T-----G-T--------GTGA---CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154804 : gTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AGATTGGTAAA------A--T--GT--ATCTAT--T-TAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC-A----TATGGAA-TAAAGAGTTAA
gi|154809 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T------------------CGTG-G-----AAATT-GACTATA-T--------GTGA---CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AATTGC-A----CATGGAG-TAAAGCGTTAA
gi|154816 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AG--A-AAA-----A--A------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T------------------CATG-G-----AAATT-G-----A-CTTTGTTTGG------CTTTTGAGA-TTGGAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154812 : aggTTCTACACCGGTTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--AT--ATCTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG-----------C-A----------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-TT-A--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154803 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAATGGGTAAA------A--T--GT--ATCTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGT--G----TGACT---------------------------TTTG-AGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGT-A----TATGGAG-TAAAGAGTGAA
gi|154815 : aggTTCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--GG-----AA-----T--AAA----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-GAT-------T------------------CATG-G-----AAATT-A-----A-CTATGTGTGG------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC-A---G--TTTAAATGC-G----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154806 : agaTTCTGCACTG-TTTTTA-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGA------C-A-ATGTG----TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAATGTTA
gi|154810 : aggTTCTGCACTG-ATTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCGAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAG-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CA-ATA-T--A--AAATGC-A----CATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154811 : aggTTCTGCACTG-TTTTAT-GCTCTTAC--AGA-T-TAAA----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-C--G-A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTA
gi|154813 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG--A-AAA-----A--G------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T------------------CATG-G----AAAATG-ACT---A-T--------GTGTGG-CTTTTGAGT-TTGGAAGAAT-CC-A-T-TT-A--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTT
gi|154824 : aggTCCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA-----C-----------TGTAC--C-TAT-------T---------------T-A--TG-G-----AAATT-G-----A-CTATGTATGG------CTTTG-AGT-TTGGAAAAGT-CC-A-CTT--A--AAATAC-A----TATGAAG-TTAAGGATTAA
gi|154838 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GTTCTATC--AG-----A---------A------TAAA-----CAGGT--A---A--CAT--G-TAT-------------CT-A------T-TCATG-G-----AAATT-G-----A-TTCTGATTGG------CTTTTGAGT-TTGGACAAGT--C-A-G-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGATTTAA
gi|154818 : gTTCTGGACTG-TTTATT-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAAGTGTACA--T--A----TTCA---------------TGGAAATTGAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC-A-GTA--A--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154826 : aggTCCTACACTG-TTTTCT-GTTTTATC--AAA-T-TAG--------G------TAAA------A--T--GT--ATCTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTG-ACT-TCAGAAGAAT-CC-A-C-TT-A--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154827 : aggTCCCAGACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAA----TAAG-----TA--A--A---ATGTAC--C-TAT-------T-----CT-------------TG-G-----AAATT-G-----A-CTATGTATGG------CTTTG-AGT-T-ATAAGAGT-CC-A-CTT--A--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGGG
gi|154825 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTAT---AG--A-AAA--------A------TAGG-----TA--A--A---GTGTAT--C-TAT-------T------------------CATG-G----C-AATT-G-----A-TTATGTGTGG------CTTTTGAGT-ACAAAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAATGGGTTAA
gi|154829 : aggTTCTGAATTG-TTTTCT-GCTCTTTA--AG-----AA-----T--A------AATA-----GA--T--A---A----------ATG------TA----CTGA------T-ATATT-G-----AAATT-G-----A-CCATATATGG------CTTTTGAGT-TTGGAAAAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGTAG-TA----GTTAA
gi|154839 : aagTTCTGTATTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T------------------CATG-G----T-AATT-G-----A-----------------CTAT---GT-GTGG-CGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAA
gi|154821 : gTTCTGCACTT-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAATTGGTAAA------A--T--GT--ATCTTT--T-CATAGAAA--TG------GAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAACAGT-T---------A--AAATGC-A----AATGGAT-TAAAGAGTTAA
gi|154828 : aggTCCAACATTG-TTTTCT-GCTCTATCGAAA--T-AAA-----T--AGG----TAAAA----CG--T--A----TCTAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTT------------GAGT-CC-A-C-TT-A--AAATGC-A----TATGGAA-TAAAGGGTAAA
gi|154834 : aggTCCTGCACTG-ATTTCT-TCTCTGTC--AG-----AA-----T--A------AATA-----GG--T--A---AATCA
gi|154830 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTTTATC--AGAAT-AAA-----T--AGGT---TAAA-----TG--T--ATCTATTCAgttaaaatacatatggaggaaagagttaagaatgcata
gi|154892 : aggCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CG--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAAtggaaattgacaatgtgtggctttt
gi|154833 : CTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---GTTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGGAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATTGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154893 : agattaCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------CG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CATTC-AAT-TTGG-AGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC-T----TATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154807 : CTGCACTG-TTTTTCTGCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCGAT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC-A-G-GT-A--AAATGT-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154891 : aggctCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AA-----AA-----T--AAC----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T-----C--A------T-A-GAA-A----TTAACT-AT----A-T--------GTGG---CTTTG-ATT-TTGGAAGAGT-CC-ACA-T--A--AAATGC-A----TATTGAG-TAAAGGG
gi|154896 : TGCATTG-TCTTGG-ACTCTGTCA-AA--T-TGA----------------AAG-----CAT-T--A---ATTCAC--CACAT-------AT----CAGC------A-ATG-G-G----TGAATT-------A-T--------G------TTT
gi|154808 : actgttttccactctgtcagttaaataaatatTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--A------AAAA-----GG--TAAA---ATATAT--C-TAT-------T------------------CATG-G-----AAATTGA-----A-TATGTGTG-G------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGATTTAAtttggagcaaagggttaa
gi|154894 : aggtttTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAGA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--C-TAT-------T------------------CATG-G-----AAATT-G-----A-CTATGTGTGG------CTTTTGAGT-TTGGAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-C----TATGAAG-TAAAGAGTTGA
gi|154817 : TGCACTG-TTTTCT-GCTCTATA--AG--AATAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--T-CATGGAAATTTA----CT-A------T-ATGTG-G-----------------------------------CTTTTGAGT-TTGGAAGTGT-C--G-A-GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAATTAA
gi|154819 : aggtttGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AAG----TAAAG----TG--T--ATCTATTCATGGA-AAT-------TGA---CT-A------T-ATGTG-G----T-------------------------------TTTCGAGT-TTAGAACAGT-CC---A-GTTA--AAATGC-A----TTTGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154895 : aggctcgCACTG-TTTTCT-GCTCTATT--AAAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--TG-A---ATCTTT--T-CAT-------GGAAA-TTGAC-----T-ATGTG------TG----------------------G------CTTTG-ACT-TTGGAAGAGT-CC-A-C-TT-A--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154896 : ACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAAATAAAT--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--C-CAT-------TG----CTGA------T-ATGTG-G----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AAT-TTGACAGAGT-CC-A-A-G--A--CAATGC-A----TTTGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154898 : --------G------CTTTTGAGT-TTGGAAGTGT-CC-A---GTTA--AAATGC-A----TATGGAG-TAAAGAGTTAA
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|154831 ): AGGTTCTGCACTGTTTTCTTCAGTATCTATTCATGGAAATTGACTATGTGTGGCTTTTGAGTCCAGTTACAATGCATATGGATTAAAGAGTTAA
Unaligned ( gi|154897 ): ATAGGTAAAATGTATCTATTCATGCAAATTGACTATGTATTGCTTTGCCTTTTGAAGATTCCACTTAAAATGCATATGGATTGAA
Unaligned ( gi|154840 ): GTTCTGATTGCTCATTTCAGCTCTATCAGAATAAATAGGTAAAATGTATCTATTCATGGAAATAAACTATCTGGCTTCT
Alignments
lowQualScore : 11111 111111 1111 11111111 11
lowQualScore : 0 11 00 11111 11111 33 555555 333333 00 11 666 00 2222222 2222 777777 0 00 1111 0 0 22222 0 44444444 555555 4 6 0 0 0 0 0 111 77 00 22222 0
lowQualScore : . .. .. ..... ..... .. ...... ...... .. .. ... .. ....... .... ...... . .. .... . . ..... . ........ ...... . . . . . . . ... .. .. ..... .
lowQualScore : 4 66 66 88888 99999 55 444444 444444 66 00 999 66 9999999 6666 777777 4 99 8888 5 4 88888 4 55555555 333333 3 0 9 4 4 4 4 888 22 66 88888 4
consensus : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----NTATGGAG-CAAAGGGTTAA
Reference ( family-311 ) : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----NTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154800 : TTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT-G----TG----------------------G------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGAGTTAA
gi|154801 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GTTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTTTGTGTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154802 : aggTTCTGCACTG-TTTTCA-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154803 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAATGGGTAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT-G----TGACT---------------------------TTTG-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGT----ATATGGAG-TAAAGAGTGAA
gi|154804 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AGATTGGTAAA------A--T--GT--ATCTAT--TTAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGAGTTAA
gi|154805 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AG-----AA-----T--AAA----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------TC----ATGG--------A-CAT------TGACTT-T-----G-T--------GTGG---CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154806 : aggTTCTGCACTG-TTTTTA-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCAT-------GGAAA-TTGA------C-AATGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAATGTTA
gi|154807 : aggCTGCACTG-TTTTTCTGCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCGAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-G-GT-A--AAATGT----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154808 : aggctTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--A------AAAA-----GG--TAAA---ATATAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATTGA-----A-TATGTGTG-G------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGATTTAA
gi|154809 : aggtttTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CGTGG-----AAATT-GACTATA-T--------GTGA---CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AATTGC----ACATGGAG-TAAAGCGTTAA
gi|154810 : aggTTCTGCACTG-ATTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCGAT--TCAT-------GGAAA-TTGAG-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CA-ATA-T--A--AAATGC----ACATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154811 : aggTTCTGCACTG-TTTTAT-GCTCTTAC--AGA-T-TAAA----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-C--G-A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTA
gi|154812 : aggTTCTACACCGGTTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--AT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG----------C-A----------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154813 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG--A-AAA-----A--G------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----AAAATG-ACT---A-T--------GTGTGG-CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAAT-CC-A-T-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTT
gi|154814 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------TGAAA-TTGA------TTA-TGTG-----TGACTT---------------------------TTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATAC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154815 : aggTTCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--GG-----AA-----T--AAA----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CGAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-A-----A-CTATGTGTGG------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---G--TTTAAATGC----GTATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154816 : agaTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AG--A-AAA-----A--A------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGGAAATTGACTT-T-----G-TTTG-----G------CTTTT-GA-GAT-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154817 : aggTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATA--AG--AATAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCATGGAAATTTA----CT-A------T-A-TGTGG-----------------------------------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGTGT-C--G-A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAATTAA
gi|154818 : aggtttTTCTGGACTG-TTTATT-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAAGTGTACA--T--A----TTCA--------------TGGAAATTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-GTA--A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154819 : aggGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AAG----TAAAG----TG--T--ATCTATTCATGGAAAT-------TGA---CT-A------T-A-TGTGG----T-------------------------------TTTCGAG-T-T-TA-GAACAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATTTGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154820 : aggctcgTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AA--T-AAA-----C--AGT----TAAA-----CG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TGACTT---------------------------TTG-AG-T-T-TG-GAACAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154821 : aggTTCTGCACTT-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAATTGGTAAA------A--T--GT--ATCTTT--TCATAGAAA--TG------GAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAACAGT-T---------A--AAATGC----AAATGGAT-TAAAGAGTTAA
gi|154822 : aggTCCTGCACTA-TTTTCT-GCTTTATC--A------AA-----G--G------TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT----------TT-A-----A-C---------------TTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154823 : aggTCCTGCACTA-TTTTCT-GCTTTATC--A------AA-----G--G------TAA-------------A---ATGTAT--CT------------------A------T-A-CATGG-----AAATT-G-----ACT--------GTTTGACTTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154824 : aggTCCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA-----C-----------TGTAC--CTAT-------T---------------T-A---TGG-----AAATT-G-----A-CTATGTATGG------CTTTG-AG-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-CTT--A--AAATAC----ATATGAAG-TTAAGGATTAA
gi|154825 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTAT---AG--A-AAA--------A------TAGG-----TA--A--A---GTGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----C-AATT-G-----A-TTATGTGTGG------CTTTT-GA-G-TACA-AAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAATGGGTTAA
gi|154826 : aggTCCTACACTG-TTTTCT-GTTTTATC--AAA-T-TAGG----T--A-------AAA-----TG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTG-AC-T-T-CA-GAAGAAT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154827 : aggTCCCAGACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAA----TAAG-----TA--A--A---ATGTAC--CTAT-------TC----TTGG------A-A-ATTG--------ACT-ATGT--A-T--------G------GCTTT-GA-G-T-TA-TAAGAGT-CC-A-CTT--A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGG
gi|154828 : aggTCCAACATTG-TTTTCT-GCTCTATCGAAA--T-AAA-----T--AGG----TAAAA----CG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTT---------------GAGT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGGGTAAA
gi|154829 : aggTTCTGAATTG-TTTTCT-GCTCTTTA--AG-----AA-----T--A------AATA-----GA--T--A---A---------ATG------TA----CTGA------T-A-TATTG-----AAATT-G-----A-CCATATATGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAAAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGTAG-TA----GTTAA
gi|154830 : aagTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTTTATC--AGAAT-AAA-----T--AGGT---TAAA-----TG--T--ATCTATTCA
gi|154832 : aggTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TTA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------GTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CT-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAAtggaaattgacaatgtgtggctttt
gi|154833 : agtCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---GTTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATTGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154834 : agattaTCCTGCACTG-ATTTCT-TCTCTGTC--AG-----AA-----T--A------AATA-----GG--T--A---AATCA
gi|154835 : aggTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----AA--T--A---ATTCAC--CCAT-------CG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-AG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGCTTAAgttaaaatacatatggaggaaagagttaagaatgcata
gi|154836 : agtTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTATGTTTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154837 : gTTCTGCACTG-TTCTCT-GCTCCATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGGAAATTGACTT-T-----G-T--------GTGA---CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154838 : gTTCTGCACTG-TTTTCT-GTTCTATC--AG-----A---------A------TAAA-----CAGGT--A---A--CAT--GTAT-------------CT-A------T-T-CATGG-----AAATT-G-----A-TTCTGATTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GACAAGT--C-A-G-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGATTTAA
gi|154839 : gTTCTGTATTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----T-AATT-G-----A-----------------CT-----A-T-G-TGTGGCGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAA
gi|154841 : gTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----TA--T--G---ATTCAC--CCAT-------TC----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----T-T--------G------CTTTC-AT-T-T-TG-GAAAATT-CC-A-A-G--A--AACTGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154842 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTTAGTC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154843 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--C--A---GTTCAC--CCAT-------TA----CTGA------T-A-CGT------TAAA-T-A-----G-T--------G------CTTCC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154844 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTAA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GGAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154845 : TCCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TAAATC-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-TC-A-A-G--A--AAATGC----AAATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154846 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CGGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGC-CC-A-A----A--AAATGC----TAATGGAG-CAAAGTGTAAA
gi|154847 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----TTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154848 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154849 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACT--GTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAT-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154850 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAT--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAGAGGGTTAA
gi|154851 : TTCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------TATA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154852 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CGAAGGGTTAA
gi|154853 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-TA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154854 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTAAT--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CCTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154855 : TCCTGCACTG-TTTTAC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCCT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154856 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154857 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATATAC--ACAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGA----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CCAA-A-G--A--CAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154858 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-AAA-----T--G------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTCG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGGGT-TC-C-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154859 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGA---------------------G------CTTTC-AA-G-T-TG-GAATAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGGG-CAAAGGGTTAA
gi|154860 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTATC--AG--T-TTA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154861 : TCCTGCATTG-TTTTCC-ACTCAATC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154862 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CG--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAACAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154863 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGA----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTTTGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154864 : TTCTGCACTG-TTTTCA-ACTCTGTC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CGAT-------TT----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TGAAAAGTTA
gi|154865 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AT--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----TTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154866 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAT-CAAAGGGTTAA
gi|154867 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTTTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTT-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAA-CAAAGGGTTAA
gi|154868 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ACTCAC--CCAT-------TA----CTGT------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-G--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGCTTTAATATGGAG-CAATGAGTTAA
gi|154869 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGCC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCGT-------TG----CTGA------T-T-CGTGG----TGAATT-A-----A-C--------A------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-A--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154870 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CAAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----AGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAGAAAAAGGGTTAA
gi|154871 : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCACTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGAATT-A-----A-T--------A------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--T--TAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154872 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---GTTCAC--CTAT-------TG----CTGA------T-A-TATGG----TGAACT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-T-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154873 : TCCTGCACTG-TTTTTC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ACTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154874 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CCTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-G-G--A--AAATGC----TTAAGAAG-TAAATGGTTAA
gi|154875 : TCCTGCACCG-CTTTCC-ACCCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------AAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TG-----------------------------------AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--TAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154876 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTATTTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154877 : TCCTTCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCGT-------TG----CTGA------T-A-CGTAG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGTCCC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154878 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--TG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-ATTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-A-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G-----AAATGC----TTATGGAG-TATAGGGTTAA
gi|154879 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATT-AC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-A-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAACAC----TAATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154880 : TCCTGCATTG-TTTTCC-ACTCTATC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAC-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAATAGT-CC-A-A-G--A--AAATGA----TTATGGAG-CAAAGAGTTAA
gi|154881 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGAAA-CAAAGGGTTAA
gi|154882 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA---T-TG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGTTTAA
gi|154883 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AA--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTTA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------C------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTA---AG-CAAAGGGTTAA
gi|154884 : TCCTGTACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--C-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTG-------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTATC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGTG-CAAAGGGTTAA
gi|154885 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAACT-A-----A-A--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAAGGC----TTATGGAG-CAATGGGATAA
gi|154886 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTC------AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTAG----TGTATT-A-----A-T--------A------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AACTGC----TTATGGAG-CAAAGAGTTAA
gi|154887 : TCCTTCACTG-TTTTCC-ACCCTGTC--AT--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--TCAT-------TG----CTGA------T-G-CGGTG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CA-A-A-G--A--AAATGC----TTACGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154888 : TCCTGCACTT-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TCAA-----CA--T--A---ATTCAC--CAAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGT----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGATA
gi|154889 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTTAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TG----------------------T--------G------CTTTC-AA-TAT-TA-GAGGTGT-CC-----------AAATGCGTTTATATGAAG-TAAAGGGTTAA
gi|154890 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGATACATGT-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-A-TG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TAATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154891 : CTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AA-----AA-----T--AAC----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-----C--A------T-A--GAAA----TTAACT-AT----A-T--------GTGG---CTTTG-AT-T-T-TG-GAAGAGT-CC-ACA-T--A--AAATGC----ATATTGAG-TAAAGGG
gi|154892 : CTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CG--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154893 : CTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------CG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CATTC-AA-T-T-TG-G-AGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154894 : TGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAGA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTATGTGTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----CTATGAAG-TAAAGAGTTGA
gi|154895 : CACTG-TTTTCT-GCTCTATT--AAAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--TG-A---ATCTTT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTG-AC-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154896 : ACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAAATAAAT--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-ACAGAGT-CC-A-A-G--A--CAATGC----ATTTGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154898 : --------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGTGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|154831 ): AGGTTCTGCACTGTTTTCTTCAGTATCTATTCATGGAAATTGACTATGTGTGGCTTTTGAGTCCAGTTACAATGCATATGGATTAAAGAGTTAA
Unaligned ( gi|154897 ): ATAGGTAAAATGTATCTATTCATGCAAATTGACTATGTATTGCTTTGCCTTTTGAAGATTCCACTTAAAATGCATATGGATTGAA
Unaligned ( gi|154840 ): GTTCTGATTGCTCATTTCAGCTCTATCAGAATAAATAGGTAAAATGTATCTATTCATGGAAATAAACTATCTGGCTTCT
Alignments
lowQualScore : 11111 111111 1111 11111111 11
lowQualScore : 0 11 00 11111 11111 33 555555 333333 00 11 666 00 2222222 2222 777777 0 00 1111 0 0 22222 0 44444444 555555 4 6 0 0 0 0 0 111 77 00 22222 0
lowQualScore : . .. .. ..... ..... .. ...... ...... .. .. ... .. ....... .... ...... . .. .... . . ..... . ........ ...... . . . . . . . ... .. .. ..... .
lowQualScore : 4 66 66 88888 99999 55 444444 444444 66 00 999 66 9999999 6666 777777 4 99 8888 5 4 88888 4 55555555 333333 3 0 9 4 4 4 4 888 22 66 88888 4
consensus : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----NTATGGAG-CAAAGGGTTAA
Reference ( family-311 ) : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----NTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154800 : TTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT-G----TG----------------------G------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGAGTTAA
gi|154801 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GTTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTTTGTGTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154802 : aggTTCTGCACTG-TTTTCA-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154803 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAATGGGTAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT-G----TGACT---------------------------TTTG-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGT----ATATGGAG-TAAAGAGTGAA
gi|154804 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AGATTGGTAAA------A--T--GT--ATCTAT--TTAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGAGTTAA
gi|154805 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AG-----AA-----T--AAA----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------TC----ATGG--------A-CAT------TGACTT-T-----G-T--------GTGG---CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154806 : aggTTCTGCACTG-TTTTTA-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCAT-------GGAAA-TTGA------C-AATGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAATGTTA
gi|154807 : aggCTGCACTG-TTTTTCTGCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCGAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-G-GT-A--AAATGT----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154808 : aggctTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--A------AAAA-----GG--TAAA---ATATAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATTGA-----A-TATGTGTG-G------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGATTTAA
gi|154809 : aggtttTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CGTGG-----AAATT-GACTATA-T--------GTGA---CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AATTGC----ACATGGAG-TAAAGCGTTAA
gi|154810 : aggTTCTGCACTG-ATTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCGAT--TCAT-------GGAAA-TTGAG-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CA-ATA-T--A--AAATGC----ACATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154811 : aggTTCTGCACTG-TTTTAT-GCTCTTAC--AGA-T-TAAA----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-C--G-A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTA
gi|154812 : aggTTCTACACCGGTTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--AT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG----------C-A----------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154813 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG--A-AAA-----A--G------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----AAAATG-ACT---A-T--------GTGTGG-CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAAT-CC-A-T-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTT
gi|154814 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------TGAAA-TTGA------TTA-TGTG-----TGACTT---------------------------TTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATAC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154815 : aggTTCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--GG-----AA-----T--AAA----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CGAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-A-----A-CTATGTGTGG------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---G--TTTAAATGC----GTATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154816 : agaTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AG--A-AAA-----A--A------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGGAAATTGACTT-T-----G-TTTG-----G------CTTTT-GA-GAT-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154817 : aggTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATA--AG--AATAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCATGGAAATTTA----CT-A------T-A-TGTGG-----------------------------------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGTGT-C--G-A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAATTAA
gi|154818 : aggtttTTCTGGACTG-TTTATT-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAAGTGTACA--T--A----TTCA--------------TGGAAATTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-GTA--A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154819 : aggGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AAG----TAAAG----TG--T--ATCTATTCATGGAAAT-------TGA---CT-A------T-A-TGTGG----T-------------------------------TTTCGAG-T-T-TA-GAACAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATTTGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154820 : aggctcgTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AA--T-AAA-----C--AGT----TAAA-----CG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TGACTT---------------------------TTG-AG-T-T-TG-GAACAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154821 : aggTTCTGCACTT-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAATTGGTAAA------A--T--GT--ATCTTT--TCATAGAAA--TG------GAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAACAGT-T---------A--AAATGC----AAATGGAT-TAAAGAGTTAA
gi|154822 : aggTCCTGCACTA-TTTTCT-GCTTTATC--A------AA-----G--G------TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT----------TT-A-----A-C---------------TTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154823 : aggTCCTGCACTA-TTTTCT-GCTTTATC--A------AA-----G--G------TAA-------------A---ATGTAT--CT------------------A------T-A-CATGG-----AAATT-G-----ACT--------GTTTGACTTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154824 : aggTCCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA-----C-----------TGTAC--CTAT-------T---------------T-A---TGG-----AAATT-G-----A-CTATGTATGG------CTTTG-AG-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-CTT--A--AAATAC----ATATGAAG-TTAAGGATTAA
gi|154825 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTAT---AG--A-AAA--------A------TAGG-----TA--A--A---GTGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----C-AATT-G-----A-TTATGTGTGG------CTTTT-GA-G-TACA-AAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAATGGGTTAA
gi|154826 : aggTCCTACACTG-TTTTCT-GTTTTATC--AAA-T-TAGG----T--A-------AAA-----TG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTG-AC-T-T-CA-GAAGAAT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154827 : aggTCCCAGACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAA----TAAG-----TA--A--A---ATGTAC--CTAT-------TC----TTGG------A-A-ATTG--------ACT-ATGT--A-T--------G------GCTTT-GA-G-T-TA-TAAGAGT-CC-A-CTT--A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGG
gi|154828 : aggTCCAACATTG-TTTTCT-GCTCTATCGAAA--T-AAA-----T--AGG----TAAAA----CG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTT---------------GAGT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGGGTAAA
gi|154829 : aggTTCTGAATTG-TTTTCT-GCTCTTTA--AG-----AA-----T--A------AATA-----GA--T--A---A---------ATG------TA----CTGA------T-A-TATTG-----AAATT-G-----A-CCATATATGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAAAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGTAG-TA----GTTAA
gi|154830 : aagTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTTTATC--AGAAT-AAA-----T--AGGT---TAAA-----TG--T--ATCTATTCA
gi|154832 : aggTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TTA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------GTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CT-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAAtggaaattgacaatgtgtggctttt
gi|154833 : agtCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---GTTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATTGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154834 : agattaTCCTGCACTG-ATTTCT-TCTCTGTC--AG-----AA-----T--A------AATA-----GG--T--A---AATCA
gi|154835 : aggTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----AA--T--A---ATTCAC--CCAT-------CG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-AG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGCTTAAgttaaaatacatatggaggaaagagttaagaatgcata
gi|154836 : agtTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTATGTTTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154837 : gTTCTGCACTG-TTCTCT-GCTCCATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGGAAATTGACTT-T-----G-T--------GTGA---CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154838 : gTTCTGCACTG-TTTTCT-GTTCTATC--AG-----A---------A------TAAA-----CAGGT--A---A--CAT--GTAT-------------CT-A------T-T-CATGG-----AAATT-G-----A-TTCTGATTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GACAAGT--C-A-G-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGATTTAA
gi|154839 : gTTCTGTATTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----T-AATT-G-----A-----------------CT-----A-T-G-TGTGGCGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAA
gi|154841 : gTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----TA--T--G---ATTCAC--CCAT-------TC----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----T-T--------G------CTTTC-AT-T-T-TG-GAAAATT-CC-A-A-G--A--AACTGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154842 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTTAGTC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154843 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--C--A---GTTCAC--CCAT-------TA----CTGA------T-A-CGT------TAAA-T-A-----G-T--------G------CTTCC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154844 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTAA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GGAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154845 : TCCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TAAATC-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-TC-A-A-G--A--AAATGC----AAATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154846 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CGGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGC-CC-A-A----A--AAATGC----TAATGGAG-CAAAGTGTAAA
gi|154847 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----TTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154848 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154849 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACT--GTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAT-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154850 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAT--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAGAGGGTTAA
gi|154851 : TTCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------TATA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154852 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CGAAGGGTTAA
gi|154853 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-TA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154854 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTAAT--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CCTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154855 : TCCTGCACTG-TTTTAC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCCT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154856 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154857 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATATAC--ACAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGA----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CCAA-A-G--A--CAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154858 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-AAA-----T--G------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTCG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGGGT-TC-C-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154859 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGA---------------------G------CTTTC-AA-G-T-TG-GAATAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGGG-CAAAGGGTTAA
gi|154860 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTATC--AG--T-TTA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154861 : TCCTGCATTG-TTTTCC-ACTCAATC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154862 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CG--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAACAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154863 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGA----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTTTGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154864 : TTCTGCACTG-TTTTCA-ACTCTGTC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CGAT-------TT----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TGAAAAGTTA
gi|154865 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AT--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----TTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154866 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAT-CAAAGGGTTAA
gi|154867 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTTTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTT-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAA-CAAAGGGTTAA
gi|154868 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ACTCAC--CCAT-------TA----CTGT------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-G--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGCTTTAATATGGAG-CAATGAGTTAA
gi|154869 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGCC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCGT-------TG----CTGA------T-T-CGTGG----TGAATT-A-----A-C--------A------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-A--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154870 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CAAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----AGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAGAAAAAGGGTTAA
gi|154871 : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCACTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGAATT-A-----A-T--------A------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--T--TAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154872 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---GTTCAC--CTAT-------TG----CTGA------T-A-TATGG----TGAACT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-T-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154873 : TCCTGCACTG-TTTTTC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ACTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154874 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CCTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-G-G--A--AAATGC----TTAAGAAG-TAAATGGTTAA
gi|154875 : TCCTGCACCG-CTTTCC-ACCCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------AAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TG-----------------------------------AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--TAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154876 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTATTTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154877 : TCCTTCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCGT-------TG----CTGA------T-A-CGTAG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGTCCC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154878 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--TG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-ATTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-A-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G-----AAATGC----TTATGGAG-TATAGGGTTAA
gi|154879 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATT-AC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-A-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAACAC----TAATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154880 : TCCTGCATTG-TTTTCC-ACTCTATC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAC-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAATAGT-CC-A-A-G--A--AAATGA----TTATGGAG-CAAAGAGTTAA
gi|154881 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGAAA-CAAAGGGTTAA
gi|154882 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA---T-TG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGTTTAA
gi|154883 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AA--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTTA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------C------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTA---AG-CAAAGGGTTAA
gi|154884 : TCCTGTACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--C-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTG-------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTATC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGTG-CAAAGGGTTAA
gi|154885 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAACT-A-----A-A--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAAGGC----TTATGGAG-CAATGGGATAA
gi|154886 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTC------AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTAG----TGTATT-A-----A-T--------A------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AACTGC----TTATGGAG-CAAAGAGTTAA
gi|154887 : TCCTTCACTG-TTTTCC-ACCCTGTC--AT--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--TCAT-------TG----CTGA------T-G-CGGTG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CA-A-A-G--A--AAATGC----TTACGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154888 : TCCTGCACTT-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TCAA-----CA--T--A---ATTCAC--CAAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGT----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGATA
gi|154889 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTTAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TG----------------------T--------G------CTTTC-AA-TAT-TA-GAGGTGT-CC-----------AAATGCGTTTATATGAAG-TAAAGGGTTAA
gi|154890 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGATACATGT-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-A-TG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TAATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154891 : CTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AA-----AA-----T--AAC----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-----C--A------T-A--GAAA----TTAACT-AT----A-T--------GTGG---CTTTG-AT-T-T-TG-GAAGAGT-CC-ACA-T--A--AAATGC----ATATTGAG-TAAAGGG
gi|154892 : CTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CG--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154893 : CTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------CG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CATTC-AA-T-T-TG-G-AGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154894 : TGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAGA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTATGTGTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----CTATGAAG-TAAAGAGTTGA
gi|154895 : CACTG-TTTTCT-GCTCTATT--AAAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--TG-A---ATCTTT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTG-AC-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154896 : ACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAAATAAAT--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-ACAGAGT-CC-A-A-G--A--CAATGC----ATTTGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154898 : --------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGTGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
blockSeqs : TG AATA ATAAA AA AATGGG GTGTAC AA TCT GGAAATT GAAA TACATG AAAT ACTAT TTTGTGTG TTTGAC G G TA TT TTTAA
blockSeqs : G AATA A AA GATTGG GT G TCT AGAAA AAA C AAAT TGT TATGTGTG TGTGG G G GT TT GTTTA
blockSeqs : T AATA G AA AATTGG AC . T G AAA C . CT TATGTATG TGG G G CT TT A
blockSeqs : G AATA . AA GGT T . T . AAA C . T TATGTGTG TGA G G CT TT A
blockSeqs : G AATA . AA GG T . T . AAA C . . CATATATG TGA G G CA TT A
blockSeqs : T AATA . AG AA G . T . AAA G . . TATGTTTG TGG G G A TT A
blockSeqs : G AATA . . GG T . T . AAA C . . TCTGATTG . G G A TT A
blockSeqs : G AATA . . GG T . T . AAA C . . TATGTGTG . G G G TT A
blockSeqs : G AATA . . GG T . T . AAA C . . ATGTGTG . G G A TT A
blockSeqs : G AATA . . GG T . T . AAA C . . TTG . . G A TT A
blockSeqs : G AATA . . GG C . T . AAA C . . . . . G A TT A
blockSeqs : G ATT . . GG C . T . AAA C . . . . . G A TT A
blockSeqs : G AAT . . AA T . T . AAA C . . . . . G T TT A
blockSeqs : T ATT . . GG T . T . AAA C . . . . . G A TT A
blockSeqs : G AA . . GG T . . . AAA C . . . . . . A TT A
blockSeqs : T AA . . AG G . . . A . . . . . . . A TT A
blockSeqs : G TA . . GT T . . . . . . . . . . . C TT G
blockSeqs : T AA . . GG C . . . . . . . . . . . C TT A
blockSeqs : G TA . . AA C . . . . . . . . . . . A TT A
blockSeqs : T TT . . GG G . . . . . . . . . . . A TT A
blockSeqs : G TT . . AC A . . . . . . . . . . . A TT A
blockSeqs : G TT . . GG T . . . . . . . . . . . A TT A
blockSeqs : G TT . . . T . . . . . . . . . . . A TT A
blockSeqs : G TA . . . C . . . . . . . . . . . A TT A
blockSeqs : T TT . . . T . . . . . . . . . . . G T A
blockSeqs : G TT . . . T . . . . . . . . . . . A T A
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A T A
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A T A
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A T A
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A T A
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . A
blockSeqs : A TA . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : T TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A . A
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A . A
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A . A
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A . A
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TA . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : G TA . . . C . . . . . . . . . . . A . A
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . T . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TA . . . C . . . . . . . . . . . G . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A CT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TA . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : G TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A TT . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A . . . . T . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A . . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A . . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A . . . . T . . . . . . . . . . . C . T
blockSeqs : A . . . . C . . . . . . . . . . . A . T
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : A . . . . . . .
blockSeqCons : TT*** ****** C***** *** **** ****** **
originalCons : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----NTATGGAG-CAAAGGGTTAA
finalCons : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AGTT---AA-----T--A------TAAAC-----A--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----NTATGGAG-CAAAGGGTTAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|154831 ): AGGTTCTGCACTGTTTTCTTCAGTATCTATTCATGGAAATTGACTATGTGTGGCTTTTGAGTCCAGTTACAATGCATATGGATTAAAGAGTTAA
Unaligned ( gi|154897 ): ATAGGTAAAATGTATCTATTCATGCAAATTGACTATGTATTGCTTTGCCTTTTGAAGATTCCACTTAAAATGCATATGGATTGAA
Unaligned ( gi|154840 ): GTTCTGATTGCTCATTTCAGCTCTATCAGAATAAATAGGTAAAATGTATCTATTCATGGAAATAAACTATCTGGCTTCT
Alignments
lowQualScore : 11111 111111 1111 11111111 11
lowQualScore : 0 11 00 11111 11111 33 555555 333333 00 11 666 00 2222222 2222 777777 0 00 1111 0 0 22222 0 44444444 555555 4 6 0 0 0 0 0 111 77 00 22222 0
lowQualScore : . .. .. ..... ..... .. ...... ...... .. .. ... .. ....... .... ...... . .. .... . . ..... . ........ ...... . . . . . . . ... .. .. ..... .
lowQualScore : 4 66 66 88888 99999 55 444444 444444 66 00 999 66 9999999 6666 777777 4 99 8888 5 4 88888 4 55555555 333333 3 0 9 4 4 4 4 888 22 66 88888 4
consensus : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----NTATGGAG-CAAAGGGTTAA
Reference ( family-311 ) : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----NTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154800 : TTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT-G----TG----------------------G------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGAGTTAA
gi|154801 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GTTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTTTGTGTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154802 : aggTTCTGCACTG-TTTTCA-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154803 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAATGGGTAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT-G----TGACT---------------------------TTTG-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGT----ATATGGAG-TAAAGAGTGAA
gi|154804 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AGATTGGTAAA------A--T--GT--ATCTAT--TTAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGAGTTAA
gi|154805 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AG-----AA-----T--AAA----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------TC----ATGG--------A-CAT------TGACTT-T-----G-T--------GTGG---CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154806 : aggTTCTGCACTG-TTTTTA-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCAT-------GGAAA-TTGA------C-AATGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAATGTTA
gi|154807 : aggCTGCACTG-TTTTTCTGCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCGAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-G-GT-A--AAATGT----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154808 : aggctTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--A------AAAA-----GG--TAAA---ATATAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATTGA-----A-TATGTGTG-G------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGATTTAA
gi|154809 : aggtttTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CGTGG-----AAATT-GACTATA-T--------GTGA---CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AATTGC----ACATGGAG-TAAAGCGTTAA
gi|154810 : aggTTCTGCACTG-ATTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCGAT--TCAT-------GGAAA-TTGAG-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CA-ATA-T--A--AAATGC----ACATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154811 : aggTTCTGCACTG-TTTTAT-GCTCTTAC--AGA-T-TAAA----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-C--G-A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTA
gi|154812 : aggTTCTACACCGGTTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--AT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG----------C-A----------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154813 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG--A-AAA-----A--G------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----AAAATG-ACT---A-T--------GTGTGG-CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAAT-CC-A-T-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTT
gi|154814 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------TGAAA-TTGA------TTA-TGTG-----TGACTT---------------------------TTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATAC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154815 : aggTTCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--GG-----AA-----T--AAA----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CGAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-A-----A-CTATGTGTGG------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A---G--TTTAAATGC----GTATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154816 : agaTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AG--A-AAA-----A--A------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGGAAATTGACTT-T-----G-TTTG-----G------CTTTT-GA-GAT-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154817 : aggTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATA--AG--AATAA-----T--AGG----TAAA------A--T--GT--ATTTAT--TCATGGAAATTTA----CT-A------T-A-TGTGG-----------------------------------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGTGT-C--G-A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAATTAA
gi|154818 : aggtttTTCTGGACTG-TTTATT-TCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAAGTGTACA--T--A----TTCA--------------TGGAAATTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGAGT-CC-A-GTA--A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154819 : aggGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AAG----TAAAG----TG--T--ATCTATTCATGGAAAT-------TGA---CT-A------T-A-TGTGG----T-------------------------------TTTCGAG-T-T-TA-GAACAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATTTGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154820 : aggctcgTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTATC--AA--T-AAA-----C--AGT----TAAA-----CG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TGACTT---------------------------TTG-AG-T-T-TG-GAACAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154821 : aggTTCTGCACTT-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAATTGGTAAA------A--T--GT--ATCTTT--TCATAGAAA--TG------GAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAACAGT-T---------A--AAATGC----AAATGGAT-TAAAGAGTTAA
gi|154822 : aggTCCTGCACTA-TTTTCT-GCTTTATC--A------AA-----G--G------TAAA------A--T--GT--ATCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGT----------TT-A-----A-C---------------TTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154823 : aggTCCTGCACTA-TTTTCT-GCTTTATC--A------AA-----G--G------TAA-------------A---ATGTAT--CT------------------A------T-A-CATGG-----AAATT-G-----ACT--------GTTTGACTTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154824 : aggTCCTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AGAAT-AAA-----T--AGG----TAAA-----C-----------TGTAC--CTAT-------T---------------T-A---TGG-----AAATT-G-----A-CTATGTATGG------CTTTG-AG-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-CTT--A--AAATAC----ATATGAAG-TTAAGGATTAA
gi|154825 : aggTTCTGCACTG-TTTTCT-TCTCTAT---AG--A-AAA--------A------TAGG-----TA--A--A---GTGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----C-AATT-G-----A-TTATGTGTGG------CTTTT-GA-G-TACA-AAAGAGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAATGGGTTAA
gi|154826 : aggTCCTACACTG-TTTTCT-GTTTTATC--AAA-T-TAGG----T--A-------AAA-----TG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTG-AC-T-T-CA-GAAGAAT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154827 : aggTCCCAGACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----T--AAA----TAAG-----TA--A--A---ATGTAC--CTAT-------TC----TTGG------A-A-ATTG--------ACT-ATGT--A-T--------G------GCTTT-GA-G-T-TA-TAAGAGT-CC-A-CTT--A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGG
gi|154828 : aggTCCAACATTG-TTTTCT-GCTCTATCGAAA--T-AAA-----T--AGG----TAAAA----CG--T--A----TCTAT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTT---------------GAGT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAA-TAAAGGGTAAA
gi|154829 : aggTTCTGAATTG-TTTTCT-GCTCTTTA--AG-----AA-----T--A------AATA-----GA--T--A---A---------ATG------TA----CTGA------T-A-TATTG-----AAATT-G-----A-CCATATATGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAAAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGTAG-TA----GTTAA
gi|154830 : aagTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTTTATC--AGAAT-AAA-----T--AGGT---TAAA-----TG--T--ATCTATTCA
gi|154832 : aggTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TTA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------GTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CT-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAAtggaaattgacaatgtgtggctttt
gi|154833 : agtCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---GTTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATTGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154834 : agattaTCCTGCACTG-ATTTCT-TCTCTGTC--AG-----AA-----T--A------AATA-----GG--T--A---AATCA
gi|154835 : aggTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----AA--T--A---ATTCAC--CCAT-------CG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-AG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGCTTAAgttaaaatacatatggaggaaagagttaagaatgcata
gi|154836 : agtTTCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTATGTTTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154837 : gTTCTGCACTG-TTCTCT-GCTCCATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGGAAATTGACTT-T-----G-T--------GTGA---CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
gi|154838 : gTTCTGCACTG-TTTTCT-GTTCTATC--AG-----A---------A------TAAA-----CAGGT--A---A--CAT--GTAT-------------CT-A------T-T-CATGG-----AAATT-G-----A-TTCTGATTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GACAAGT--C-A-G-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGATTTAA
gi|154839 : gTTCTGTATTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAAA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG----T-AATT-G-----A-----------------CT-----A-T-G-TGTGGCGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAA
gi|154841 : gTCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----TA--T--G---ATTCAC--CCAT-------TC----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----T-T--------G------CTTTC-AT-T-T-TG-GAAAATT-CC-A-A-G--A--AACTGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154842 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTTAGTC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154843 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--C--A---GTTCAC--CCAT-------TA----CTGA------T-A-CGT------TAAA-T-A-----G-T--------G------CTTCC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154844 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTAA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GGAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154845 : TCCTGCACTG-TTTTCT-GCTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TAAATC-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-TC-A-A-G--A--AAATGC----AAATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154846 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CGGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGC-CC-A-A----A--AAATGC----TAATGGAG-CAAAGTGTAAA
gi|154847 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----TTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154848 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AG-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154849 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACT--GTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAT-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154850 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAT--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAGAGGGTTAA
gi|154851 : TTCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------TATA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154852 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CGAAGGGTTAA
gi|154853 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-TA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154854 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTAAT--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CCTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154855 : TCCTGCACTG-TTTTAC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCCT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154856 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154857 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATATAC--ACAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGA----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CCAA-A-G--A--CAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154858 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-AAA-----T--G------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTCG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGGGT-TC-C-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154859 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGA---------------------G------CTTTC-AA-G-T-TG-GAATAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGGG-CAAAGGGTTAA
gi|154860 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTATC--AG--T-TTA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154861 : TCCTGCATTG-TTTTCC-ACTCAATC--AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154862 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CG--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAACAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154863 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGA----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTTTGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154864 : TTCTGCACTG-TTTTCA-ACTCTGTC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CGAT-------TT----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-TGAAAAGTTA
gi|154865 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AT--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----TTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154866 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAT-CAAAGGGTTAA
gi|154867 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTTTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTT-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAA-CAAAGGGTTAA
gi|154868 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ACTCAC--CCAT-------TA----CTGT------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-G--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGCTTTAATATGGAG-CAATGAGTTAA
gi|154869 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGCC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCGT-------TG----CTGA------T-T-CGTGG----TGAATT-A-----A-C--------A------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-A--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154870 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CAAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----AGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAGAAAAAGGGTTAA
gi|154871 : TCCTGCACTG-TTTTCC-GCACTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTGG----TGAATT-A-----A-T--------A------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--T--TAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154872 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---GTTCAC--CTAT-------TG----CTGA------T-A-TATGG----TGAACT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-T-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154873 : TCCTGCACTG-TTTTTC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ACTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154874 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CCTGG----TGTATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-G-G--A--AAATGC----TTAAGAAG-TAAATGGTTAA
gi|154875 : TCCTGCACCG-CTTTCC-ACCCTGTT--AG--T-TAA-----T--A------AAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TG-----------------------------------AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--TAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154876 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTATTTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154877 : TCCTTCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCGT-------TG----CTGA------T-A-CGTAG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGTCCC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154878 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--TG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-ATTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------TTTTC-AA-A-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G-----AAATGC----TTATGGAG-TATAGGGTTAA
gi|154879 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATT-AC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-A-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAACAC----TAATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154880 : TCCTGCATTG-TTTTCC-ACTCTATC--AG--T-TGA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAC-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAATAGT-CC-A-A-G--A--AAATGA----TTATGGAG-CAAAGAGTTAA
gi|154881 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAAAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGAAA-CAAAGGGTTAA
gi|154882 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TTAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA---T-TG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGTTTAA
gi|154883 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AA--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTTA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------C------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTA---AG-CAAAGGGTTAA
gi|154884 : TCCTGTACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--C-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTG-------T-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTATC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGTG-CAAAGGGTTAA
gi|154885 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-CATGG----TGAACT-A-----A-A--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAAGGC----TTATGGAG-CAATGGGATAA
gi|154886 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTC------AG--T-AAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-AGTAG----TGTATT-A-----A-T--------A------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AACTGC----TTATGGAG-CAAAGAGTTAA
gi|154887 : TCCTTCACTG-TTTTCC-ACCCTGTC--AT--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--TCAT-------TG----CTGA------T-G-CGGTG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CA-A-A-G--A--AAATGC----TTACGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154888 : TCCTGCACTT-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TCAA-----CA--T--A---ATTCAC--CAAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGT----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGATA
gi|154889 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTTAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TG----------------------T--------G------CTTTC-AA-TAT-TA-GAGGTGT-CC-----------AAATGCGTTTATATGAAG-TAAAGGGTTAA
gi|154890 : TCCTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGATACATGT-A-CGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-A-TG-GAAGAAT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TAATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154891 : CTACACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AA-----AA-----T--AAC----TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-----C--A------T-A--GAAA----TTAACT-AT----A-T--------GTGG---CTTTG-AT-T-T-TG-GAAGAGT-CC-ACA-T--A--AAATGC----ATATTGAG-TAAAGGG
gi|154892 : CTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CG--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154893 : CTGCACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAA-----T--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------CG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CATTC-AA-T-T-TG-G-AGAGT-CC-A-A-G--A--AAATGC----TTATGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154894 : TGCACTG-TTTTCT-GCTCTATC--AG-----AA-----TAGA------TAGG-----TA--A--A---ATGTAT--CTAT-------T-------------------CATGG-----AAATT-G-----A-CTATGTGTGG------CTTTTGAG-T-T-TG-GAAGAGT-CC---A-GTTA--AAATGC----CTATGAAG-TAAAGAGTTGA
gi|154895 : CACTG-TTTTCT-GCTCTATT--AAAAT-AAA-----T--AGG----TAAA------A--TG-A---ATCTTT--TCAT-------GGAAA-TTGAC-----T-A-TGTG-----TG----------------------G------CTTTG-AC-T-T-TG-GAAGAGT-CC-A-C-TT-A--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGGGTTAA
gi|154896 : ACTG-TTTTCC-ACTCTGTC--AG--T-TAAATAAAT--A------TAAA-----CA--T--A---ATTCAC--CCAT-------TG----CTGA------T-A-TGTGG----TGAATT-A-----A-T--------G------CTTTC-AA-T-T-TG-ACAGAGT-CC-A-A-G--A--CAATGC----ATTTGGAG-CAAAGGGTTAA
gi|154898 : --------G------CTTTT-GAGT-T-TG-GAAGTGT-CC-A---GTTA--AAATGC----ATATGGAG-TAAAGAGTTAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|154831 ): AGGTTCTGCACTGTTTTCTTCAGTATCTATTCATGGAAATTGACTATGTGTGGCTTTTGAGTCCAGTTACAATGCATATGGATTAAAGAGTTAA
Unaligned ( gi|154897 ): ATAGGTAAAATGTATCTATTCATGCAAATTGACTATGTATTGCTTTGCCTTTTGAAGATTCCACTTAAAATGCATATGGATTGAA
Unaligned ( gi|154840 ): GTTCTGATTGCTCATTTCAGCTCTATCAGAATAAATAGGTAAAATGTATCTATTCATGGAAATAAACTATCTGGCTTCT