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gi|122650                     : CATCTCAATCCATCTGTTACCTGAGCCTCTGTTAAGCATTCCTGAAATGTGTTGAATAGTTTCTTATTTTCATAATTCATGTCACAATTCTCTGTTTAACAG-GAAA-CACAGAACGTGACGTTGTATAAATTTATTTTATAACATT--TACTCAATGTAAGAATACTGTTCGAAT-C-C-C-C-GCC---CGGCA--------ACAGTCTCCAGGATGATAGATAT--ACGACATTATGTCTCTTTATCAATCGTCTCTCATCGCTGATTCAAGTGGG---AAAGCTATCAATTACTTGCGGATATGGGTTGTGCTCAAATACTGGTTTATTCCAGGAAAC------AGTGGTTAG-----G--------T-----GATCATCTGTTAGCC--CTCGA-TGGCATGAAAACAA-CGC--TAAA-TA-------TTCAAC--CAAT---CAATC-A--CTTG-TTA-T--A-GTTGTT-CATCT--C-TA---G-AAA--TC-ATAAAGTAAGTTAT---CATTT-T--ATGTGATACAT---CGATATTGATCAGTGAGTTATGATAAAGCGTCAACTAATC----TATACTCAATTGCTTTG---TGTTGATGTCAAATGATATTG-----GACTTTTC-----CTGTTAAATCGATGTGTCTTGTTTGTTT-CCACTGTTCTTATACTTCCACATATACAGTTTATGT-----ATAACATTGACCCATA--------------TAA-----G-----TGTCTTCCATAATGTCCTTCAA-----------TA-----------CCAAACTTTTACATGTATCAGGCCAGCTAAATGTC-GAAAT-TCAAGACTTATTTTTTTCTTGTCTCCATCCCGGTATGAATAATATTGTTTCAGGTAAATTTATTATCTATTCAGCGCTTT------GGAACAAATTCACAAATGATTCATATCC-AAAAATAAGTT-ATCCGAAAT-GTT--ACCACTAC---GAGTATTTGATTATAGTTTCGTAGTTGTTTC-TT-CGACTTCGTTATGTACAAGCGCTTCTGGTGGTTTAGAACGAAAAACAATATACCCTTCCATGCTTTTCGATATCTTCCTTGACAA----------A---------ATTCACATTTCTGACATCTCGAAATGAAAAT-ACTTCGCTTTGTAAATTTCCTAATGCGACTCAACT
gi|122651                     : CATCTCAATCCATCTGTAACCTGAGCCTCTGTTTAGCATTCCTGAAATGTGTTGAATAGTTTCTTATTTTCATAATTCATGTAACAATTTTCTGTTTAACAG-GAAA-CACAGAACGTGACGGTGTATAAATTTATTTT-TAACATT--TACTCAATGTAAGAATACTGTTCGAAT-C-C-T---GCC---CAGCA--------ACAGTCTCCAGGACGATAGATAT--ACAACATTGTGTCTCTTTATCTATCGTCTCTCACCATTGATTCCAGTGAG---AAAGCTGTCAGTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAAATACTGGTTAATTCCAGGAAAC------AGTGGTTAG-----G--------T-----GATCGTGTGTTAGCC--CTAGA-TGGCATGAATATGA-CGC--TAAA-TA-------TTCAAC--CAAT---CAATC-A--CTTT-TTA-T--A-GTTGTT-CATCT--C-TA---G-AAA--TC-ATAAAGTAAGTTAT---CATTT-T--AAGTGATACAT---GGATATTGATCAGTGAGTTATGATAAAGAATCAACTAACCT---TATACTCAATTGCTTTG---TGTTGATGCTAAATGATATTG-----GACTTTTC-----CTGTTCAATCGATGTGTCTTGTTTGTTT-CCATTGTTCTTATATTTCCACATATACAGTTTATGT-----ATTACATTGACCCATA--------------TAA-----G-----TGTCTTCCATAATGTCCTTCAA-----------TA-----------CCAAACTTTTAGATGCATCAGGTCAGCTTAATGTCAAAAAT-TAAAGACTTA-TTCTTCCTTGTCTCCATCCCGGTATGAATAATATTGTTTCAGGTAAATTCATTATGTATTCAGCGCTTT------GTAACAAATTCACAAATGATTCGTATCCG-AAAATGAGTTGATCCGAAATGGTT--ACCACTAC---GAGTG-TTGATTATA-TTTCGTAGTTGTTTC-TT-CGACTTCGTTATGTACAAGCACTTCTGGTGGTTTAGAACGAAAAACAA------------TGATTTTCGATCGCTTCCTTGACAA----------A---------ATTTACATTTCTGACATCTCGAAATGAAAAT-ACTTCGCTTTGTAAATATCCTAATGCGACTCGACT
gi|122649                     : CATCTCAATCCATCTGTAACCTGAGCCTCTGTTTAGCATTCCTGAAATGTGTTGAATAGTTTCTTATTTTCATAATTCATGTAACAATTTTCTGTTTAACAG-GAAA-CACAGAACATGACGGTGTTTAAATTTATTTT-TAACATT--TACTCAATGTTAGAATACTGTTCGAAT-C-C-C-C-GCC---TGGCA--------ACAGTCTCCAGGATGATAGATAT--CCAGCATTATGTCTCTTTATCAATCGTCTCTCACCGCTGATTCAAGTGGG---AAAGCTATAAGTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAAATACTGATTAATTCCAGGAAAC------AGTGGTTTG-----G--------T-----TATCGTCCGTTAGCC--CTCGA-TGGCATGAAAATTA-TG---TAAA-TA-------TTCAAC--CAAT---GAATC-A--CTTT-TTA-T--A-GTTGTT-CATCT--C-TA---G-AAA--TC-ATAAAGTAAGTTAT---CATTT---------------------TATTGATCAGTGAGTTATGATTAAGCATCAACTAACCT---TATACTCAATTGTTTTG---TGTTGATGTCAAATGATATTG-----GACTTTTC-----CTGTTTAATCGATGTGTCTTGTTTGTTT-CCACTGTTCTTATACTTCCACATAT
gi|122653                     : CATCTCAATCCATCTGTAACCTGAGCCTCTGTTTAGCATTCCTGAAATGTGTTGAACAGTTTCTAATTTTCATAATTCATGTAACAATTTTCTGTTTAAC-ATGAAA-TACAAAACTTGAAGGAGTATCCATTTGTATT-TAACATT--TACTCAATTAAAGAATACTGTTCGAAT-C-C-C-C-ACT---TGGCA--------ACAGTCTCCAGGATGATAGATAT--ATGAAATTATGTCTCTTAACCAATGGTGTCTCACCGCTGATTCAAAAAAG---AAAGTTATCAATTGCTTGCGGAGATGGAGTGTGCTCGAGTACTGGTTAATCCAAGGAAAC------AGTGGTTAG-----A--------T-----GATCGTCTGTTAGCCCTCTCGA-GGACATGAAAAAGACCC---TTAA-TA-------CACAAT--CAAT---CAATC-A--TTTT-TCA-T--A-GTTGTT-CATCT--C-TA---G-AAA--TC-ATAAAGTAAGTGAT---CATTT-T--ATGTGATGCATCGATATTATTGATCAGTGAGTTATGATAAAGCATCAATTTACCT---TGTTCTCAATTGCTTTG---TTTCGCTGTTAAATGATATTG-----GACTTTTC-----CTGTTTAATCGATGTGTCTTGTTTGTTT-CCACTGTTCTTCTACTTCCACATATAAAGTTTATGT-----ATAACATTGAgtcttgtttgtttccactgttcttatacttccacatatacagtttatgtataacattgacccatataagtgacttccatagtgtccttcaataccaaacttttacatgcatcaggtcagataaatgtcaaaattcaagatttattcttccttgtctccatcccggtatgcataatattgtttcaggtaaattcattatgtattcagcgctttgggacaaattcacaaatgatccatatccgaaaaatgagttatccgaaattttaccactacgagtattgattatattttcgtagttgtttcttccgacttcgttatgtacaagcacttctggtggtgaagaacgaaaaacaatatactcttccgtgcttttcgatcacttccttgacaaaatttacgtttctgacatctcgaaatgaaaatacttcgctttgtaaatatcctaatgcgactcgact
gi|122652                     : CATCTCAATCCATCTGTAACCTGAGCCTCTGTTTAGCATTCCTGAAATGTGTTGAATAGTTTCTTATTTTCATATTTCATGTAACAATTTTCTGTTTAACAG-GAAA-CACAGAACGTGACGGTGTATAAATTTATATT-TAACATT--TACTCAATGTAAGAATACTGTTCGAAT-C-C-C---GCC---CAGCA--------ACAGTCTCCAGGATGATAGATAT--ACAACATTATGTCTCTTTATCTATCGTCTCTCACCACTGATTCAAGTGGG---AAAGCTATCAGTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAAATACTGGTTAATTCTAGGAAAC------AGTGATTAG-----G--------T-----GATCGTGTGTTAGCC--CTTGA-TGGCATGAAAATGA-CGC--TAAA-TA-------TTCAAC--CAAT---CAATC-A--CTTT-TTA-T--A-GTTATT-CATCT--C-TA---G-AAA--TC-ATAAAGAAAGTTA
gi|122654                     :  ATCTCAATCCATCTATAACCTGAGCCTTTGTTTAGAATTCCTGAAATGTGTTGA-----------------T--TTCATGTAACAATTTTCTGTTTAAC-A-GAAAACACAGAAC------GTGTA-ACATTTAT-------CATT--TACTT--------ATT----TT---AC-C-C-C-T-GTCAAGTGGCAGAGATGGAATGATCTCCAGGATGATAGATAT--ATGACATTGTGTCTCTTTATCATTCGTCTCTCACCGCTGATTCAAGTTGG---AAAG-------TTACTAACGGAGATTGGGTGTGCTCGAGTACTGGTTAATCCCAGGAAAC------AATGGTAAG-----G--------T-----GATCGTCTGTTAGCC--CTTGA-TGGCATAAAAATGA-CG---CTAA-TA-------TTCAAT--C-------GATC-A--CTTT-TTA-T--A-GTTGTT-TATCT--C-TA---G-AAA--TA-ATA----GAGTTAT---TATTTAT--ATGTG-TACAT---AGGTATTGATCAGTGAGTTATGATAAAGCATCATTTTACCT---TATACTCAATTGCTTTG---TGTTGATGTCAAATGATATTGTACTTAA-----C-----CTGTTTAATCGAGGTG-CTTGTTTCTTT-CAACTGTTCTTATACTTCGACATATACAGTTTATGT-----ATAACACTGACCCATAACC-----------TGCCTATAG-----TGTTTTCCATAAGGTCCTTCAA-----------TA-----------CCAAACGTTAACATGCATCAGGTCAGCTAAATGTCAAAAAT-TGAAGAGTTA-TTCTTCCTTGTCTCCATCCCGGTATGAATAATATTGTTTCAGGTAAATTCATTATGTACTCAGCGCTTT------GGAACAAATTCACGAATTATTCATATCCG-AAAATGGGTT-ATCCGAAATGGTTCCACT---AC---GAGTA-TTGATAATATTTTCGTAGTTGTTTTATT-CGGCTTTATGATGTCCAAGCGATTCAGGCGGTTAAGAACGAAAAACAATATACTCTTCCATGCTTGTCGATCGCTTCCTTAACAAAAACATGTCTA---------ATTTACATTTCTGACATCTCGAAATAAAAAT-ACTTCGCTTAGCAAA
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gi|123383                     :                                                                                                                                                                                 -C-C-C-T-GCC---CGGCA--------ACAGTCTCCGTGAAGATTGATAT--ACGACATTGTGTCTCATTATCATTCGTCTCTCACCACTGATTCAAGTGGG---AAAGTTATCAGTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAAGTACTGGTTAATCCCAGGAAAC------AGTGGTTAG-----GTTAAC---T-----GATCATCTGTAAGCC--CTCGA-TGGCATAAAAATGA-TGC--TAAA-TA-------TTCAAT--CAAT---CAATC-A--
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gi|123608                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cacatgtTCGAGTAGCA-GAAAGGGAATG---TAAAATACTGTCCGTTCATC--GGTT---AAATC-A--CTTT-TTA-T--A-GTTGTT-TATCT--C-TA---G-ATA--TC-ATAAAGTAAGTTAT---TGTTT-TC-ATGTGATACAT---AGATATTGATCAGTGAATTATGATAAAACATCAATTTACCT---TATGCTCAATTGCTTTG---TGTTGATGTCAAATGATATTG-----GA-----CTTTTCCTGTTTACTGGATGTGTCTTGTTTGTTTTCCTCAGTTCTTATACTTACACATGTACAGTTTATGTTTTTGACAGCATTCCCCCATAACCA----------T-------GCCGATTTCCTTTCATAATGTCCTTCAA-----------TATGAGTGATTCACCAAACTTTTACACGCACCAGGTCAACTAAATGTC-AAAATATCAAGAATTA-TTCTTCCTTGTCTCC----CGGTATGAATACTATTGTTTCAGGTAAATTCATAATGTATTTAGCGCTTT------GGAACAAATTCACGAAAGATTCATATCCGAAAA-TGAGTT-ATCCGAAAT-GTT--ACC---ACTACGAGTA-TTGATGATATTTTCGTAGTTGTTTC-TT-CGACTTCGATATGTACGAGTACTTCTGGTGGTTGAGAACGAAAAACAATATACTCTTCCATGCTTGTCGATCGTTTCCTTGACAAAAACCTGTCTA---------ATTTACATTTCTGACATCTCAAAATGAAAAT-ACTTCGCTTTGTAAATATTCTAATGCGACTCcaataccaaacttttacatgcatcaggtcagctaaatgtcaaaattcaagacttattcttctttgtctccattccgatataaataatattgtttcaggtaaatttattatgtattcagcgctttaaaacaaattcacagatgattcatatccgaaaatgagttatacgaaatgttaccactacgagtattgattatattttcgtagttgtttctccaacttcgttatgtacaagcacttctggtggtttagaacgaacataatatactcttccgtgcttttcgatcacttccttgacaaatttacatttctgacatctcgaaatgaaaaacttcgctttgtaaatatcctaatgcgactcgact
gi|123609                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAT---AATTC-A--CCTT-TTA-T--A-GTTGTT-TATCT--C-TA---G-AAA--TC-ATAAAGTgcct
gi|123610                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGAAAGTTAT---CATTT-T--ATGTGATACAT---CGATATTGATCAGTGAGTTATGATAAAGCATCAACTAACCT---TATACTCAATTGCTTTG---TGTTGATGTTAAATGATACTG-----GA-----CTTTTACTGTTCAATCGATGTGTCTTGTTTGTTT-CCACTGTTCTTATACTTCCACATATACAGTTTATGT-----ATAACATTGACCCATA--------------TAA-----G-----TGTCTTCCATAATGTCCTTCAA-----------TA-----------CCAAACTTTTAGATGCATCAGGTCAGGTAAATGTC-AAAAT-TCAAGATTTA-TTCTTCCTTGTCTCCATCCCGGTATGAATAATATTGTTTCAGGTAAATTCATTATGTATTCAGCGCTTT------GGAACAAATTCACAAATAATCCGTATCCG-AAAATGAGTTGATCCGAAATGGTT--ACCACTAC---GAGTG-TTGATTATA-TTTCGTAGTTGTTTC-TT-CGACTTCGTTATGTTCAGGCACTTCTGGTGGTTAAGAACGAAAAACAATATAATCTTCCATGATTTTCGATCGCTTCCTTGACAA----------A---------ATTTACATTTCTGACATCTCGAAATGAAAATAACTTCGCTTTATAAATATCCTAATGCGACTCGACTtatgataaagcaccaatttaccttatactcatttgttaaaatgttgttgtcaaatgatattggacttttcctgtttactcaatgtgtcttgtttgtttccattgtattacacttccacgtgtaagttaatgtatagcaatgacccataacctggcttgaccatgcctattgtattccataatgtccttcaacaggagtgattcaccaaacttgtacatgcattaagccagccaaaagtcaaaattcaacaaatattctttctggtctcatcccagtattaataatattgtttcagatcaagtcataatgtattcagcgtttttttttcagaacaaatttacgaatgatacatatccgaaaatgagatatccgaaatgttaccactacgcgtattgatgatattttcgtagttgtttcttcgacttcattatgtacgagcacttctggtggttgaggacgaaatacacaatgctcttcgatgcttgtcgaccgcttccttaacaaaacctaccggatttacatttctgacatatccaaatgaaaaaacttcactttgtaaatatcctaaagcgactcgact
gi|123609                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTATGATAAAGCACCAATTTACCT---TATACTCATTTG--TTAAAATGTTGTTGTCAAATGATATTG-----GA-----CTTTTCCTGTTTACTCAATGTGTCTTGTTTGTTT-CCATTGT-ATTACACTTCCACGTGTA-AGTTAATGT-----ATAGCAATGACCCATAACCTGGCTTGACCAT-------GCCTATTGTATTCCATAATGTCCTTCAACAGGAGTGATTCA-----------CCAAACTTGTACATGCATTAAGCCAGCCAAAAGTC-AAAAT-TCAACAAATA-TTCTTTCTGGTCT-CATCCCAGTATTAATAATATTGTTTCAGATCAAGTCATAATGTATTCAGCGTTTTTTTTTCAGAACAAATTTACGAATGATACATATCCG-AAAATGAGAT-ATCCGAAAT-GTT--ACCACTAC---GCGTA-TTGATGATATTTTCGTAGTTGTTTC-TT-CGACTTCATTATGTACGAGCACTTCTGGTGGTTGAGGACGAAATACACAATGCTCTTCGATGCTTGTCGACCGCTTCCTTAACAA----------AACCTACCGGATTTACATTTCTGACATATCCAAATGAAAAA-ACTTCACTTTGTAAATATCCTAAAGCGACTCGACT
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Reference ( family-31 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CATCTCAATCCATCTGTAACCTGAGCCTCTGTTTAGCATTCCTGAAATGTGTTGAATAGTTTCTTATTTTCATAATTCATGTAACAATTTTCTGTTTAACAGGAAACACAGAACGTGACGGTGTATAA-ATTTATTTT-TAACATT--TACTCAATGTAAGAATACTGTTCGAATCCCCCGCC---CGGCA--------ACAGTCTCCGTGATGATTGATAT--ACGACATTGTGTCTCATTATCATTCGTCTCTCACCACTGATTCAAGTGGGA---AAGTTATCAGTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCGAGTACTGGTTAATCCCAGGAAAC------AGTGGTTAGGT---TAACTGATCGTCTGTTAGCC--CTCGA-TGGCATAAAAATGACGCTAAATA-------T---TCAAT--CAATC---AA-TC---A--NTTT-TTA-TA-GTTGTTCATCT--C-TAGAAA--TC-ATAAAGTAAGTTAT---CATTT-T-A--TGTGATACATCGA---TATTGATCAGTGAGTTATGATAAAGCATCAACTAACCTTA---TACTCAATTGCTTTG---TGTTGATGTCAAATGATATTGGACTTTTCCTGTTTAATCGATGTGTCTTGTTTG-TTTCCACTGTTCTTATACTTCCACATATACAGTTTATGT-----ATAA-CGTTGACCCATA--------T----A-A----G-----T-GTCTTCCATAGTGTCCTTCAA-----------T-----------ACCAAACTTTTACATGCATCAGGTCAGCTAAATGTC-AAAA-T-TCAAGATTTA-TTCTTCCTTGTCTCCATCCCGGTATGAATAATATTGTTTCAGGTAAATTCATTATGTATTCAGCGCTTT------GGAACAAATTCACAAATGATCCATATCCGAAAAATGAGTT-ATCCGAAA-T-G--TTACCACTACGAGTA-TTGATTATATTTTCGTAGTTGTTTC-TT-CGACTTCGTTATGTACAAGCACTTCTGGTGGTTNAGAACGAAAAACAATATACTCTTCCGTGCTTTTCGATCGCTTCCTTGACAA----------A---------ATTTACATTTCTGACATCTCGAAATGAAAAT-ACTTCGCTTTGTAAATATCCTAATGCGACTCGACT
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