lowQualScore                  :                                                                                                                                                1     11   
lowQualScore                  :    0 2 00    0 222 0     22222222   7 1111         0   0 6  22222222222222 0000    0   00 111 0   1111111 0 11   000  00 00 00 0        1111   4     99   
lowQualScore                  :    . . ..    . ... .     ........   . ....         .   . .  .............. ....    .   .. ... .   ....... . ..   ...  .. .. .. .        ....   .     ..   
lowQualScore                  :    6 5 88    6 777 6     66666666   3 5555         4   4 2  44444444444444 9999    4   66 222 4   4444444 4 00   888  66 66 66 4        5555   1     66   
consensus                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TACTTGCGTTTTTA
Reference ( gi|104008 )       : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTCT----GTCTTGGTT-TAT-CGTT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TACATGCGTCGTTA
gi|104009                     : AAA-A-C--AAAG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--T--C-AATACCCA----TAC
gi|104013                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-ACAAA--------GTTCT----GTCTTGATT-TAT-CATT--------------C----AAGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--T-ATTACCCA----TACTTGCtattatttcta
gi|104010                     : AAA-A-C--AAGG-C---A-AGAAT--------GTTTT----GTCTCGGTT-TAT-CATT--------------T----ACGT-CAT--A---T-CCA-------G-A--CTT---GA--T--A--C-AATACTCA----TACTTGCGTTTTTAttt
gi|104014                     : AAA-A-C--ATGG-T---A-AAAAC--------GTTTT----GTCTTGGTG-TAT-CATT--------------A----ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----TACGTGCGT
gi|104020                     : AAA-A-C--AAGG-T---G-AGAAA--------GTTTT----GGTCTGGTA-AAT-TATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCTA----TACATGTGTTTTTAttcta
gi|104016                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-ACAAA--------GTTCT----GTCTTGATT-TAT-CATT--------------C----AAGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--T-ATTACCCA----TACTTGC
gi|104021                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTCT----GTCTTGTTT-TAT-CAAT--------------C----ATAC-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----AACTTGCGT-GTTttt
gi|104012                     : AAA-A-C--AAGG-C---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CAAT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GT--T--A--C-AATATCCA----Tta
gi|104026                     : AAA-A-T--AAGA-T---A-GGAAA--------GTTTT----TTCTTGATT-TAT-CGTT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GC--T--A--C-GATACCAG----TTCTTGCGTCTTTAgacttggatttt
gi|104011                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GCTTT----GTCTTGGAT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--AT--T-TTA-------A-A--TTT---GA--T--A--A-AGTACCCA----TACTTGCATTTTTA
gi|104017                     : AAA-A-C--AAAG-T---T-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTT-------A-T--TTT---GA--T--A--C-AATACCAA----TACTTG
gi|104015                     : AAA-A-C--AAAG-C---A-AGAAA--------CTTTT----GTCTTGGCT-TAT-CATT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GT--T--A--C-AATACTCA----TACggatttta
gi|104022                     : AAA-A-C--GAGA-T---A-AGAAA--------GTT------GTCATTGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--AAT---GA--T--A--C-AATACCCA----TATTTGCGTttttgttttta
gi|104019                     : AAA-A-C--AAGG-T---T-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGTTT-TAT-CTTT--------------C----ATTT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--A--A--C-AATACATA----TACttt
gi|104018                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAG--------ATTTT----ATCTTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAA--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATATA----TACTTGCGTTTTTAcagcattttta
gi|104024                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AGAAAT-------GTT-T----GTCTTGGTT-AAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--T--T-AATACACG----TAATTGCGTTTTTA
gi|104025                     : AAA-A-C--ATGG-T---A-AG-----------GTTTT----GTTTTAGTA-TAT-CATG--------------C----ATCT-CAT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----TACTTGCGTTTTTA
gi|104031                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATGT-CAT--T---T-C-A-------G-A--TTT---TA--T--A--C-AATAC
gi|104030                     : AAATA-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----AGTTTGATT-TAT-CAGT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--G--C-AATATCCA----Tttacgtttactcttt
gi|104035                     : AAA-G-C--AAGG-T---T-AAAAT--------GTTCT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---C-CTA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----TACTTGTGTtctt
gi|104029                     : AGA-A-T--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATGC-CTT--A---T-CTA-------T-ATTTTT---GG--T--A--C-ACTACCCA----TACttt
gi|104027                     : AAA-A-C--ATGT-A---A-AAAAA--------GTTTT----TTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ACAT-CAT--A---T-CTT-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TATTTGTGTTTTTAtctgtatt
gi|104034                     : AAA-G-C--AAGT-T---A-AGAAA--------TTTTG----GTCTTGGTT-CAC-CATT--------------C----ATAT-TAA--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TAC
gi|104039                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-ACAAA--------TTTTT----GTCTTGGTT-TAG-CATT--------------C----GTAT-CAT--A---T-TTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATAC
gi|104036                     : AAA-A-C--GGGG-TTTAATAGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CTTT--------------C----ACGT--GT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AAAACCCA----AACTTGTGTagacgttaagtattttt
gi|104023                     : AAA-A-CGAAAAG-T---A-AGAAA--------ATTTT----GTCATGACT-AAT-CATT--------------C----AGGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACACA----TATTTGCATTTTTAttt
gi|104028                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTAGTT-TAT-AATT--------------C----AAGTGC--------T-CCA-------G-A--TTT---GA--T--ACCC-AATATCTA----TGCTTGCGTTTTTA
gi|104040                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAT--------GTTGT----GTCTAGGTT-TAT-CATT--------------C----ACGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TCT---GA--T--C--C-AATATC
gi|104038                     : AAA-A-A--AAGG-T---A-AGAAC--------GCTTA----ATTTTGGTG-TAT-CATT--------------C----ACGT-CAC--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----
gi|104043                     : AAA-A-C--AAGA-T---A--GAAA--------GTTGT----GTATTAATT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-ATT-------G-A--TTT---CA--T--A--C-AATAACCAAATTTGCATGCGTTTTTA
gi|104037                     : AAA-A-C--AAGG-TAAAA-AGAAA--------A---T----GTTTTGGTT-TAT-CATT--------------T----GTGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--A--A-AATACCTA----AACTTCCGT
gi|104047                     : AAA-A-T--AAAG-A---A-AGAAC--------GTTTT----GTCTTGCTT-T-T-CATT--------------C----ATGA-TAT--A---T-CTA-------G-A--CTG---GA--T--G--C-AATAACCA----TACATGCtttt
gi|104042                     : AGA-A-T--AAGC-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------G----GAGT-CATAGA---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AACAC
gi|104045                     : AAA-A-C--AAAG-T---A-AGAAA--------GTTTC----GTATTGGTC-AAT-CATT--------------C----ATGT-CTT--A---G-CTA-------T-A--TTT---AA--T--A--C-AATACCttgcgttttca
gi|104033                     : AAA-A-A--AGGA-T---A-AAAAA--------GTTTT----GTATTGGTT-AAC-CATC--------------C----ATGT-CCT--A---T-CTA-------G-A--TTT---TA--T--A--C-AATATTAA----TAGGTGCGT
gi|104041                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGACA--------ATTTT----ATCTTGGTT-TAT-CATC--------------C----ATA---AT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GAGTT--A--T-AATG-CCA----TACTTACGT
gi|104046                     : AAG-A-A--AAGA-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTG-TGT-CATT--------------C----ATG---AT--A---TACTA-------ATA--TTT---GA--T--A--C-AATACCCttt
gi|104032                     : AGA-A-C--AAGT-T---A-ACAAA--------GATTT----GTCTTGATT-CAT-CATT--------------C----ATGT-CAA--AAATT-ATA-------G-AT-TTT---TA--T--A--C-AATACCCA----TACTCGCATTTTTAttgcctatgtttt
gi|104044                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGGAA--------GTTTT----GTCTTGGTTATAT-CATT--------------A----ATGT-CAT--A---T-C-A--------------T---AA--T--A--A-AATACCCT----TA
gi|104053                     : AAA-A-C--ATAA-T---A-AGAAA----------TCTA---GTCTTGGTT-AAT-CGTT--------------C----GAGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATA---A----T---TGCGTTTTTAttttca
gi|104050                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTG----GTGTTAGCA-CAT-CATT--------------C----ATGC-TAT--A---T-CTA-------G-G--TTT---GA--T--A--A-AA
gi|104048                     : AAA-G-A--AAGT-T---G-AGAA----------TTTT----TTTTTATTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TT--------------C-AATACCCA----TACTTGTGT
gi|104049                     : AAA-A-T--AGGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----AATTTGGTT-TAT-CACT--------------C----ATGT-C--------------------------------A--T--A--C-AATATCCA----TACTTCCGTTTTTAtttt
gi|104051                     : AAA-A-C--AAGG-T---G-AGAAA--------GTTTT----GTTTTGATT-AAT-CAT--------------------A----CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T-----C-AA
gi|104054                     : AAA-A-C--AAAT-C---A-AGAGA--------GTTTT----GTCTTATTT-TAT-CATG--------------C----TTGT-CAT--G---T-TTA-------G-A--TTT---GA--T--G--A-AAT
gi|104052                     : AAA-ATC--CAGG-T---A-GGAGA--------GTTTTTTTTATCCTGGTT-TAA-CATT--------------C----AAGT-CAC--G---T-CTA-------G-A--TTC---AA--T--A--C-AACACACA----TA
gi|104056                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------TTTTT----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------C----A
gi|104058                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-C--AA--------GTT-T----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------T----ATGT-CAT--A---T-C
gi|104055                     : AAA-A-C--AAGG-T---T-AGAA---------GTTTT----GTCT---------------------------------ATGT-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--A--CTATTACCCAT---TAT-TGCGTTTTTA
gi|104059                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GACTT----ATCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ACTT-CAT--A---
gi|104060                     : AAA-A-T--AAGG-TT--A-AAAAA--------GTGAT----GTAATGGTT-TAT-CAAA--------------C----ATGG-CAT--A---T-TTA-------G-A--TTT---GA--G--A--C-A
gi|104057                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AAAAC--------GTTTT----GTCATGGTT-CAT-CATT--------------T----GTGT-CAtgccatatggcat
gi|104061                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGACA--------GTTAA----GTCTTGGTA-TAT-CATT--------------T----ATGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATTCCCA----TGCTTGCAT
gi|104062                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CAGT--------------C----ATAT-CAT--A---C-ATG-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----CACtttca
gi|104063                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------A----ATTT-AAT--A---C-ATA-------C-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCG----TACtt
gi|104065                     :  AA-A-T--AAAG-T---G-TGAAAACAAATATGTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CACT--------------C----ATGT-AAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--T--G-AATACCCA----TACGCGCGTtt
gi|104064                     :  AA-G-C--ATGG-T---C-AGAAA--------GTTTT----GTCGTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CGT--A---T-CTC-------G-A--TTT---TA--T--A--T-AATACCAA----TATTTCCGTTTTTAt
gi|104066                     :  AA-A-G--AAGG-T---A-AGAAT--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------T-A--CTT---G
gi|104067                     :   A-A-C--AAGGAT---A-A-ATA--------GTTTT----GTCTTCGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CAA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-ATTACCCA----TACTTGCGT
gi|104069                     :   A-A-C--AAAA-T---A-AGACA--------ATTTT-----TACTGGTT-TAT-CATG--------------C----ATGA-CAT--A---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TACTTGCGTTATTAatt
gi|104068                     :   A-A-C--AAGA-T---A-AAAAT--------GTTTT----GTCATGGTT----------------------------ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--CTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TACTTGCGT
gi|104070                     :   A-A-C--A-GG-T---A-TGAAA--------GTTTT----TTCTTGGTT-TAC-CATT--------------CCCGTATGT-C-T--A---T-CTA-------G-A--TTT---GT--A--A--C-ACTATGCA----TGCCTGCGTtttt
gi|104071                     :   A-A-C--AGTG-T---A-GGAAA--------GTTTT----GACTTGGTT-AA-----------------------------------A---T-CAA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----TACTTGTGTCTTTAttt
gi|104073                     :      -C--AAGA-T---A-A-AAA--------GTTTT----GTCTTA-TT-TAT-CATT--------------C----ATAA-CGT--A---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCAA----TACTTGC
gi|104074                     :        --AAGA-A---A-AGGAA--------ATTAA----GTCTTGGTT-TAT-CATC--------------T----ATGT-CCT--A---T-TTA-------T-A--TTT---GA--C--A--C-AATTGTCA----TATTTGCGTctttgta
gi|104075                     :              -T---A-AAAAA--------GTT------AACTTGATT-TTT-CCTT--------------C----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-T--TTT---GA--T--A--C-GATAACGA----TATTTGCGTTTTTA
gi|104076                     :                       AAA--------GTTCC----ATTTTAATT-AAC-CATT--------------T----AGGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---TA--A--A--C-AACACCCA----TATTTGCATTTTTA
gi|104078                     :                        AA--------GCTTT----GTATCGGTT-TAT-CATT--------------G----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATACCCA----TACTTG
gi|104080                     :                          --------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATC--------------C----ATGT-CAT--A---T-CCA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----TACTTGTGT
gi|104081                     :                          --------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATNNNNNNNNNNTCATCC----ATGT-CAT--A---C-CCA-------T-A--CT----GA--T--A--C-ATAACCCA----TACTTGTGTTTTTAttt
gi|104082                     :                                   TTTT----GTCTTGGTT-TAT-CTTT--------------C----ATGT-CAA--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TTCTTGCATTTTTA
gi|104088                     :                                      T----GTACTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---AA--T--C--C-AATACCCA----TGCATGCGTTTTTA
gi|104085                     :                                     tT----GTCCTTGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----TGCATGCGTTTTTA
gi|104084                     :                                     tT----GTCCTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----TACTTG
gi|104089                     :                                     tT----GTCCTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTANNNNNNNN-N--NTT---GA--T--C--C-AATACCCA----TACTTG
gi|104083                     :                                     tT----GTCTTTGTT-TAT-CAAT--------------C----ATAC-CAT--G---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCTT----TTCTTGCGTTATTA
gi|104090                     :                                     tT----GTCCTGATT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAA--T---T-CTA-------A-G--TTT---GA--T--C--C-AATACCCA----TACTTG
gi|104091                     :                                     tT----GTCCTGGTT-TAC-CATT--------------C----GTGT-CAT--A---T-CAA-------T-G--TTT---GA--T--C--A-AATACCCA----TACTTGtactggttta
gi|104086                     :                                     tT----GTCCTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATAT-CAT--A---T-CTT-------T-T--TTT---TA--T--C--C-AATAACCA----TACTTGtactggttta
gi|104092                     :                                     tT----GTACTGGTT-TAT-AATT--------------C----ATGC-CAT--T---T-CTA-------T-A--GTT---TA--T--C--C-AATACCTA----TACTTG
gi|104093                     :                                      t----GTTTTGGTT-TAT-CATT--------------C----GTGC-CAT--A---T-CTA-------G-A----T---GA--T--A--C-TATA
gi|104094                     :                                           tcCTTGGTT-TAT-CATT--------------G----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----TACATG
gi|104095                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-ACAATCCA----TA
gi|104096                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--A--A--C-TATATCCA----TACTTGtttg
gi|104097                     :                                              TTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--A--C-AATATCCA----TACTTG
gi|104098                     :                                              TTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--TAAA--C-AAT--CCA----TA
gi|104099                     :                                              TTGGAC-TAC-CGCC--------------C----ATG---AT--A---T-CCA-------G-A--TTT---GA--A--A--C-AATACCCA----CACTTGTGTTTTTAtttg
gi|104100                     :                                               TGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-TATATCCA----TACTTG
gi|104101                     :                                               TGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-TGT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCC----TACTTG
gi|104077                     :                                                GGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTT-------T-T--TTT---TA--T--C--C-AATACCTA----TACTTG
gi|104102                     :                                     aagctttgaaacGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-ACTATCCA----TACGTG
gi|104079                     :                                                 GTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CCT--A---T-CTA-------G-A--TAT---GA--T--A--C-AATACCAA----TACGT
gi|104103                     :                                     aaatttgatttaaTT-CAT-CATT--------------T----ACGT-CTT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TACCTGCATtttta
gi|104104                     :                                                  TT-TATTCATT--------------T----GTGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTTCAGAA--A--A--T-AATACCCA----TACTTGCATTTTTAt
gi|104105                     :                                                   T-CAT-CATT--------------A----ATGT-TAT--A---T-CGG-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATAACCA----TATTTGCGTTTTTA
gi|104106                     :                                                      AT-CATT--------------C----ATGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--A--A-AATATCCA----TACTTGCGTTTTTA
gi|104107                     :                                                           TT--------------C----ATGT-CAT--A---T-ATA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----TATTTGCGT
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|104087 ): TTGTCCTGGATTATCATTCATGCCATACATATGTTTGATCCAATAACCATACTTG
Unaligned ( gi|104072 ): AACAAGATAAAAAAAAGTTTTGTCTTTGTATATGCATATCGTATCTAAATGTCATGCAAGACCCACAATGCGTT






Alignments
lowQualScore                  :    0 2 00    0 222 0     22222222     1111         0   0    22222222222222 0000    0   00 111 0   1111111 0 11   000  00 00 00 0        1111 0             
lowQualScore                  :    . . ..    . ... .     ........     ....         .   .    .............. ....    .   .. ... .   ....... . ..   ...  .. .. .. .        .... .             
lowQualScore                  :    6 4 88    6 666 6     77777777     0000         4   4    44444444444444 9999    4   66 111 4   4444444 4 00   777  66 66 66 4        0000 5             
consensus                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
Reference ( family-305 )      : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104008                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTCT----GTCTTGGTT-TAT-CGTT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACATGCGTCGTTA
gi|104009                     : AAA-A-C--AAAG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--T--C-AATACCCA----T-ACT
gi|104010                     : AAA-A-C--AAGG-C---A-AGAAT--------GTTTT----GTCTCGGTT-TAT-CATT--------------T----ACGT-CAT--A---T-CCA-------G-A--CTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGCGTTTTTAattatttcta
gi|104011                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GCTTT----GTCTTGGAT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--AT--T-TTA-------A-A--TTT---GA--T--A--A-AGTACCCA----T-ACTTGCATTTTTA
gi|104012                     : AAA-A-C--AAGG-C---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CAAT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GT--T--A--C-AATATCCA----TGACTTGGATTTT
gi|104013                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-ACAAA--------GTTCT----GTCTTGATT-TAT-CATT--------------C----AAGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--T-ATTACCCA----T-ACTTGCTTT
gi|104014                     : AAA-A-C--ATGG-T---A-AAAAC--------GTTTT----GTCTTGGTG-TAT-CATT--------------A----ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----T-ACGTGCGTTTCTA
gi|104015                     : AAA-A-C--AAAG-C---A-AGAAA--------CTTTT----GTCTTGGCT-TAT-CATT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GT--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTTTGTTTTTA
gi|104016                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-ACAAA--------GTTCT----GTCTTGATT-TAT-CATT--------------C----AAGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--T-ATTACCCA----T-ACTTGCTTT
gi|104017                     : AAA-A-C--AAAG-T---T-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTT-------A-T--TTT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-ACTTGGGATTTTA
gi|104018                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAG--------ATTTT----ATCTTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAA--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATATA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104019                     : AAA-A-C--AAGG-T---T-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGTTT-TAT-CTTT--------------C----ATTT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--A--A--C-AATACATA----T-ACCAGCATTTTTA
gi|104020                     : AAA-A-C--AAGG-T---G-AGAAA--------GTTTT----GGTCTGGTA-AAT-TATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCTA----T-ACATGTGTTTTTA
gi|104021                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTCT----GTCTTGTTT-TAT-CAAT--------------C----ATAC-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----A-ACTTGCGTGTTTA
gi|104022                     : AAA-A-C--GAGA-T---A-AGAAA--------GTT------GTCATTGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--AAT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGCGTTTT
gi|104023                     : AAA-A-CGAAAAG-T---A-AGAAA--------ATTTT----GTCATGACT-AAT-CATT--------------C----AGGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACACA----T-ATTTGCATTTTTA
gi|104024                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AGAAA--------TGTTT----GTCTTGGTT-AAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--T--T-AATACACG----T-AATTGCGTTTTTA
gi|104025                     : AAA-A-C--ATGG-T---A-AG-----------GTTTT----GTTTTAGTA-TAT-CATG--------------C----ATCT-CAT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104026                     : AAA-A-T--AAGA-T---A-GGAAA--------GTTTT----TTCTTGATT-TAT-CGTT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GC--T--A--C-GATACCAG----T-TCTTGCGTCTTTA
gi|104027                     : AAA-A-C--ATGT-A---A-AAAAA--------GTTTT----TTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ACAT-CAT--A---T-CTT-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGTGTTTTTA
gi|104028                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTAGTT-TAT-AATT--------------C----AAGTGC--------T-CCA-------G-A--TTT---GA--T--ACCC-AATATCTA----T-GCTTGCGTTTTTA
gi|104029                     : AGA-A-T--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATGC-CTT--A---T-CTA-------T-ATTTTT---GG--T--A--C-ACTACCCA----T-ACT
gi|104030                     : AAATA-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----AGTTTGATT-TAT-CAGT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--G--C-AATATCCA----T-TCTTctgtatt
gi|104031                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATGT-CAT--T---T-C-A-------G-A--TTT---TA--T--A--C-A------A----T-ACTTACGTTT
gi|104032                     : AGA-A-C--AAGT-T---A-ACAAA--------GATTT----GTCTTGATT-CAT-CATT--------------C----ATGT-CAA--AAATT-ATA-------G-AT-TTT---TA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTCGCATTTTTAactcttt
gi|104033                     : AAA-A-A--AGGA-T---A-AAAAA--------GTTTT----GTATTGGTT-AAC-CATC--------------C----ATGT-CCT--A---T-CTA-------G-A--TTT---TA--T--A--C-AATATTAA----T-AGGTGCGT
gi|104034                     : AAA-G-C--AAGT-T---A-AGAAA--------TTTTG----GTCTTGGTT-CAC-CATT--------------C----ATAT-TAA--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-AC
gi|104035                     : AAA-G-C--AAGG-T---T-AAAAT--------GTTCT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---C-CTA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTT
gi|104036                     : AAA-A-C--GGGG-TTTAATAGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CTTT--------------C----ACGT--GT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AAAACCCA----A-ACTTGTGTTTT
gi|104037                     : AAA-A-C--AAGG-TAAAA-AGAAA--------A---T----GTTTTGGTT-TAT-CATT--------------T----GTGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--A--A-AATACCTA----A-ACTTCCGTTTTT
gi|104038                     : AAA-A-A--AAGG-T---A-AGAAC--------GCTTA----ATTTTGGTG-TAT-CATT--------------C----ACGT-CAC--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----
gi|104039                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-ACAAA--------TTTTT----GTCTTGGTT-TAG-CATT--------------C----GTAT-CAT--A---T-TTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATAC
gi|104040                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAT--------GTTGT----GTCTAGGTT-TAT-CATT--------------C----ACGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TCT---GA--T--C--C-AATATCagacgttaagtattttt
gi|104041                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGACA--------ATTTT----ATCTTGGTT-TAT-CATC--------------C----ATA---AT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GAGTT--A--T-AATG-CCA----T-ACTTACGTTTT
gi|104042                     : AGA-A-T--AAGC-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------G----GAGT-CATAGA---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-A------A----C-ACTTGCGTTTTCA
gi|104043                     : AAA-A-C--AAGA-T---A--GAAA--------GTTGT----GTATTAATT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-ATT-------G-A--TTT---CA--T--A--C-AATAACCAAATTT-GCATGCGTTTTTA
gi|104044                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGGAA--------GTTTT----GTCTTGGTTATAT-CATT--------------A----ATGT-CAT--A---T-C-A--------------T---AA--T--A--A-AATACCCT----T-ATTT
gi|104045                     : AAA-A-C--AAAG-T---A-AGAAA--------GTTTC----GTATTGGTC-AAT-CATT--------------C----ATGT-CTT--A---G-CTA-------T-A--TTT---AA--T--A--C-AATACCtca
gi|104046                     : AAG-A-A--AAGA-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTG-TGT-CATT--------------C----ATG---AT--A---TACTA-------ATA--TTT---GA--T--A--C-AATACCCT----T-GCCTATGTTTT
gi|104047                     : AAA-A-T--AAAG-A---A-AGAAC--------GTTTT----GTCTTGCTT-T-T-CATT--------------C----ATGA-TAT--A---T-CTA-------G-A--CTG---GA--T--G--C-AATAACCA----T-ACATGC
gi|104048                     : AAA-G-A--AAGT-T---G-AGAA----------TTTT----TTTTTATTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TT--------------C-AATACCCA----T-ACTTGTGTTTTT
gi|104049                     : AAA-A-T--AGGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----AATTTGGTT-TAT-CACT--------------C----ATGT-CAT--A------------------------------------C-AATATCCA----T-ACTTCCGTTTTTA
gi|104050                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTG----GTGTTAGCA-CAT-CATT--------------C----ATGC-TAT--A---T-CTA-------G-G--TTT---GA--T--A--A-AA
gi|104051                     : AAA-A-C--AAGG-T---G-AGAAA--------GTTTT----GTTTTGATT-AAT-CAT--------------------A----CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T-----C-AA
gi|104052                     : AAA-ATC--CAGG-T---A-GGAGA--------GTTTTTTTTATCCTGGTT-TAA-CATT--------------C----AAGT-CAC--G---T-CTA-------G-A--TTC---AA--T--A--C-AACACACA----T-A
gi|104053                     : AAA-A-C--ATAA-T---A-AGAAA---------TCTA----GTCTTGGTT-AAT-CGTT--------------C----GAGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATA---A--------TTGCGTTTTTA
gi|104054                     : AAA-A-C--AAAT-C---A-AGAGA--------GTTTT----GTCTTATTT-TAT-CATG--------------C----TTGT-CAT--G---T-TTA-------G-A--TTT---GA--T--G--A-AAT
gi|104055                     : AAA-A-C--AAGG-T---T-AGAA---------GTTTT----GTCT---------------------------------ATGT-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--A--CTATTACCCA----T-TATTGCGTTTTTA
gi|104056                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------TTTTT----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------C----A
gi|104057                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AAAAC--------GTTTT----GTCATGGTT-CAT-CATT--------------T----GTGT-CA
gi|104058                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-C--AA--------GTTT-----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------T----ATGT-CAT--A---T-C
gi|104059                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GACTT----ATCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ACTT-CAT--A---
gi|104060                     : AAA-A-T--AAGG-TT--A-AAAAA--------GTGAT----GTAATGGTT-TAT-CAAA--------------C----ATGG-CAT--A---T-TTA-------G-A--TTT---GA--G--A--C-A
gi|104061                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGACA--------GTTAA----GTCTTGGTA-TAT-CATT--------------T----ATGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATTCCCA----T-GCTTGCATTTTCAtgccatatggcat
gi|104062                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CAGT--------------C----ATAT-CAT--A---C-ATG-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----C-ACTT
gi|104063                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------A----ATTT-AAT--A---C-ATA-------C-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCG----T-ACTT
gi|104064                     :  AA-G-C--ATGG-T---C-AGAAA--------GTTTT----GTCGTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CGT--A---T-CTC-------G-A--TTT---TA--T--A--T-AATACCAA----T-ATTTCCGTTTTTA
gi|104065                     :  AA-A-T--AAAG-T---G-TGAAAACAAATATGTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CACT--------------C----ATGT-AAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--T--G-AATACCCA----T-ACGCGCGTT
gi|104066                     :  AA-A-G--AAGG-T---A-AGAAT--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------T-A--CTT---G
gi|104067                     :   A-A-C--AAGGAT---A-A-ATA--------GTTTT----GTCTTCGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CAA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-ATTACCCA----T-ACTTGCGTATT
gi|104068                     :   A-A-C--AAGA-T---A-AAAAT--------GTTTT----GTCATGGTT----------------------------ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--CTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTT
gi|104069                     :   A-A-C--AAAA-T---A-AGACA--------ATTTT-----TACTGGTT-TAT-CATG--------------C----ATGA-CAT--A---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTATTA
gi|104070                     :   A-A-C--A-GG-T---A-TGAAA--------GTTTT----TTCTTGGTT-TAC-CATT--------------CCCGTATGT-C-T--A---T-CTA-------G-A--TTT---GT--A--A--C-ACTATGCA----T-GCCTGCGTTTT
gi|104071                     :   A-A-C--AGTG-T---A-GGAAA--------GTTTT----GACTTGGTT-AA-----------------------------------A---T-CAA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGTGTCTTTA
gi|104072                     :   A-A-C--AAGA-T---A-AAAAAAA------GTTTT----GTCTTTG---TAT--ATG--------------C----ATAT-CGT--A---T-CTA-------A-A--TGT---CA--T--G--C-AAGACCCA----C-AA-TGCGTT
gi|104073                     :      -C--AAGA-T---A-A-AAA--------GTTTT----GTCTTA-TT-TAT-CATT--------------C----ATAA-CGT--A---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-ACTTGCCTTTGTA
gi|104074                     :        --AAGA-A---A-AGGAA--------ATTAA----GTCTTGGTT-TAT-CATC--------------T----ATGT-CCT--A---T-TTA-------T-A--TTT---GA--C--A--C-AATTGTCA----T-ATTTGCGT
gi|104075                     :              -T---A-AAAAA--------GTT------AACTTGATT-TTT-CCTT--------------C----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-T--TTT---GA--T--A--C-GATAACGA----T-ATTTGCGTTTTTA
gi|104076                     :                       AAA--------GTTCC----ATTTTAATT-AAC-CATT--------------T----AGGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---TA--A--A--C-AACACCCA----T-ATTTGCATTTTTA
gi|104077                     :                        AA--------GCTTT----GAAACGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTT-------T-T--TTT---TA--T--C--C-AATACCTA----T-ACTTG
gi|104078                     :                        AA--------GCTTT----GTATCGGTT-TAT-CATT--------------G----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104079                     :                        AA--------ATTTG----ATTTAAGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CCT--A---T-CTA-------G-A--TAT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-A----CGTTTTTA
gi|104080                     :                          --------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATC--------------C----ATGT-CAT--A---T-CCA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTT
gi|104081                     :                          --------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATNNNNNNNNNNTCATCC----ATGT-CAT--A---C-CCA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTTTA
gi|104082                     :                                   TTTT----GTCTTGGTT-TAT-CTTT--------------C----ATGT-CAA--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-TCTTGCATTTTTA
gi|104083                     :                                     TT----GTCTTTGTT-TAT-CAAT--------------C----ATAC-CAT--G---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCTT----T-TCTTGCGTTATTA
gi|104084                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104085                     :                                     TT----GTCCTTGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-GCATGCGTTTTTA
gi|104086                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATAT-CAT--A---T-CTT-------T-T--TTT---TA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104087                     :                                     TT----GTCCTGGAT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---C-ATA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104088                     :                                     TT----GTACTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---AA--T--C--C-AATACCCA----T-GCATGCGTTTTTA
gi|104089                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTANNNNNNNN-N--NTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104090                     :                                     TT----GTCCTGATT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAA--T---T-CTA-------A-G--TTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104091                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAC-CATT--------------C----GTGT-CAT--A---T-CAA-------T-G--TTT---GA--T--C--A-AATACCCA----T-ACTTGtactggttta
gi|104092                     :                                     TT----GTACTGGTT-TAT-AATT--------------C----ATGC-CAT--T---T-CTA-------T-A--GTT---TA--T--C--C-AATACCTA----T-ACTTGtactggttta
gi|104093                     :                                     TC----GTTTTGGTT-TAT-CATT--------------C----GTGC-CAT--A---T-CTA-------G-A----T---GA--T--A--C-TATA
gi|104094                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------G----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----T-ACATG
gi|104095                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-ACAATCCA----T-ATTTG
gi|104096                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--A--A--C-TATATCCA----T-ACTTG
gi|104097                     :                                              TTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--A--C-AATATCCA----T-ACTTG
gi|104098                     :                                              TTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--TAAA--C-AAT--CCA----T-ATTTG
gi|104099                     :                                              TTGGAC-TAC-CGCC--------------C----ATG---AT--A---T-CCA-------G-A--TTT---GA--A--A--C-AATACCCA----C-ACTTGTGTTTTTA
gi|104100                     :                                               TGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-TATATCCA----T-ACTTG
gi|104101                     :                                               TGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-TGT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCC----T-ACTTG
gi|104102                     :                                                 GTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-ACTATCCA----T-ACGTG
gi|104103                     :                                                  TT-CAT-CATT--------------T----ACGT-CTT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACCTGCATT
gi|104104                     :                                                  TT-TATTCATT--------------T----GTGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTTCAGAA--A--A--T-AATACCCA----T-ACTTGCATTTTTA
gi|104105                     :                                                   T-CAT-CATT--------------A----ATGT-TAT--A---T-CGG-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATAACCA----T-ATTTGCGTTTTTA
gi|104106                     :                                                      AT-CATT--------------C----ATGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--A--A-AATATCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104107                     :                                                           TT--------------C----ATGT-CAT--A---T-ATA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGCGTTTATA





Alignments
lowQualScore                  :    0 2 00    0 222 0     22222222     1111         0   0    22222222222222 0000    0   00 111 0   1111111 0 11   000  00 00 00 0        1111 0             
lowQualScore                  :    . . ..    . ... .     ........     ....         .   .    .............. ....    .   .. ... .   ....... . ..   ...  .. .. .. .        .... .             
lowQualScore                  :    6 4 88    6 666 6     77777777     0000         4   4    44444444444444 9999    4   66 111 4   4444444 4 00   777  66 66 66 4        0000 5             
consensus                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
Reference ( family-305 )      : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104008                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTCT----GTCTTGGTT-TAT-CGTT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACATGCGTCGTTA
gi|104009                     : AAA-A-C--AAAG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--T--C-AATACCCA----T-ACT
gi|104010                     : AAA-A-C--AAGG-C---A-AGAAT--------GTTTT----GTCTCGGTT-TAT-CATT--------------T----ACGT-CAT--A---T-CCA-------G-A--CTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGCGTTTTTAattatttcta
gi|104011                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GCTTT----GTCTTGGAT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--AT--T-TTA-------A-A--TTT---GA--T--A--A-AGTACCCA----T-ACTTGCATTTTTA
gi|104012                     : AAA-A-C--AAGG-C---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CAAT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GT--T--A--C-AATATCCA----TGACTTGGATTTT
gi|104013                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-ACAAA--------GTTCT----GTCTTGATT-TAT-CATT--------------C----AAGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--T-ATTACCCA----T-ACTTGCTTT
gi|104014                     : AAA-A-C--ATGG-T---A-AAAAC--------GTTTT----GTCTTGGTG-TAT-CATT--------------A----ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----T-ACGTGCGTTTCTA
gi|104015                     : AAA-A-C--AAAG-C---A-AGAAA--------CTTTT----GTCTTGGCT-TAT-CATT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GT--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTTTGTTTTTA
gi|104016                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-ACAAA--------GTTCT----GTCTTGATT-TAT-CATT--------------C----AAGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--T-ATTACCCA----T-ACTTGCTTT
gi|104017                     : AAA-A-C--AAAG-T---T-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTT-------A-T--TTT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-ACTTGGGATTTTA
gi|104018                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAG--------ATTTT----ATCTTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAA--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATATA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104019                     : AAA-A-C--AAGG-T---T-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGTTT-TAT-CTTT--------------C----ATTT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--A--A--C-AATACATA----T-ACCAGCATTTTTA
gi|104020                     : AAA-A-C--AAGG-T---G-AGAAA--------GTTTT----GGTCTGGTA-AAT-TATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCTA----T-ACATGTGTTTTTA
gi|104021                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTCT----GTCTTGTTT-TAT-CAAT--------------C----ATAC-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----A-ACTTGCGTGTTTA
gi|104022                     : AAA-A-C--GAGA-T---A-AGAAA--------GTT------GTCATTGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--AAT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGCGTTTT
gi|104023                     : AAA-A-CGAAAAG-T---A-AGAAA--------ATTTT----GTCATGACT-AAT-CATT--------------C----AGGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACACA----T-ATTTGCATTTTTA
gi|104024                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AGAAA--------TGTTT----GTCTTGGTT-AAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--T--T-AATACACG----T-AATTGCGTTTTTA
gi|104025                     : AAA-A-C--ATGG-T---A-AG-----------GTTTT----GTTTTAGTA-TAT-CATG--------------C----ATCT-CAT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104026                     : AAA-A-T--AAGA-T---A-GGAAA--------GTTTT----TTCTTGATT-TAT-CGTT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GC--T--A--C-GATACCAG----T-TCTTGCGTCTTTA
gi|104027                     : AAA-A-C--ATGT-A---A-AAAAA--------GTTTT----TTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ACAT-CAT--A---T-CTT-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGTGTTTTTA
gi|104028                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTAGTT-TAT-AATT--------------C----AAGTGC--------T-CCA-------G-A--TTT---GA--T--ACCC-AATATCTA----T-GCTTGCGTTTTTA
gi|104029                     : AGA-A-T--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATGC-CTT--A---T-CTA-------T-ATTTTT---GG--T--A--C-ACTACCCA----T-ACT
gi|104030                     : AAATA-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----AGTTTGATT-TAT-CAGT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--G--C-AATATCCA----T-TCTTctgtatt
gi|104031                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATGT-CAT--T---T-C-A-------G-A--TTT---TA--T--A--C-A------A----T-ACTTACGTTT
gi|104032                     : AGA-A-C--AAGT-T---A-ACAAA--------GATTT----GTCTTGATT-CAT-CATT--------------C----ATGT-CAA--AAATT-ATA-------G-AT-TTT---TA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTCGCATTTTTAactcttt
gi|104033                     : AAA-A-A--AGGA-T---A-AAAAA--------GTTTT----GTATTGGTT-AAC-CATC--------------C----ATGT-CCT--A---T-CTA-------G-A--TTT---TA--T--A--C-AATATTAA----T-AGGTGCGT
gi|104034                     : AAA-G-C--AAGT-T---A-AGAAA--------TTTTG----GTCTTGGTT-CAC-CATT--------------C----ATAT-TAA--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-AC
gi|104035                     : AAA-G-C--AAGG-T---T-AAAAT--------GTTCT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---C-CTA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTT
gi|104036                     : AAA-A-C--GGGG-TTTAATAGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CTTT--------------C----ACGT--GT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AAAACCCA----A-ACTTGTGTTTT
gi|104037                     : AAA-A-C--AAGG-TAAAA-AGAAA--------A---T----GTTTTGGTT-TAT-CATT--------------T----GTGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--A--A-AATACCTA----A-ACTTCCGTTTTT
gi|104038                     : AAA-A-A--AAGG-T---A-AGAAC--------GCTTA----ATTTTGGTG-TAT-CATT--------------C----ACGT-CAC--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----
gi|104039                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-ACAAA--------TTTTT----GTCTTGGTT-TAG-CATT--------------C----GTAT-CAT--A---T-TTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATAC
gi|104040                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAT--------GTTGT----GTCTAGGTT-TAT-CATT--------------C----ACGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TCT---GA--T--C--C-AATATCagacgttaagtattttt
gi|104041                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGACA--------ATTTT----ATCTTGGTT-TAT-CATC--------------C----ATA---AT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GAGTT--A--T-AATG-CCA----T-ACTTACGTTTT
gi|104042                     : AGA-A-T--AAGC-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------G----GAGT-CATAGA---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-A------A----C-ACTTGCGTTTTCA
gi|104043                     : AAA-A-C--AAGA-T---A--GAAA--------GTTGT----GTATTAATT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-ATT-------G-A--TTT---CA--T--A--C-AATAACCAAATTT-GCATGCGTTTTTA
gi|104044                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGGAA--------GTTTT----GTCTTGGTTATAT-CATT--------------A----ATGT-CAT--A---T-C-A--------------T---AA--T--A--A-AATACCCT----T-ATTT
gi|104045                     : AAA-A-C--AAAG-T---A-AGAAA--------GTTTC----GTATTGGTC-AAT-CATT--------------C----ATGT-CTT--A---G-CTA-------T-A--TTT---AA--T--A--C-AATACCtca
gi|104046                     : AAG-A-A--AAGA-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTG-TGT-CATT--------------C----ATG---AT--A---TACTA-------ATA--TTT---GA--T--A--C-AATACCCT----T-GCCTATGTTTT
gi|104047                     : AAA-A-T--AAAG-A---A-AGAAC--------GTTTT----GTCTTGCTT-T-T-CATT--------------C----ATGA-TAT--A---T-CTA-------G-A--CTG---GA--T--G--C-AATAACCA----T-ACATGC
gi|104048                     : AAA-G-A--AAGT-T---G-AGAA----------TTTT----TTTTTATTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TT--------------C-AATACCCA----T-ACTTGTGTTTTT
gi|104049                     : AAA-A-T--AGGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----AATTTGGTT-TAT-CACT--------------C----ATGT-CAT--A------------------------------------C-AATATCCA----T-ACTTCCGTTTTTA
gi|104050                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTG----GTGTTAGCA-CAT-CATT--------------C----ATGC-TAT--A---T-CTA-------G-G--TTT---GA--T--A--A-AA
gi|104051                     : AAA-A-C--AAGG-T---G-AGAAA--------GTTTT----GTTTTGATT-AAT-CAT--------------------A----CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T-----C-AA
gi|104052                     : AAA-ATC--CAGG-T---A-GGAGA--------GTTTTTTTTATCCTGGTT-TAA-CATT--------------C----AAGT-CAC--G---T-CTA-------G-A--TTC---AA--T--A--C-AACACACA----T-A
gi|104053                     : AAA-A-C--ATAA-T---A-AGAAA---------TCTA----GTCTTGGTT-AAT-CGTT--------------C----GAGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATA---A--------TTGCGTTTTTA
gi|104054                     : AAA-A-C--AAAT-C---A-AGAGA--------GTTTT----GTCTTATTT-TAT-CATG--------------C----TTGT-CAT--G---T-TTA-------G-A--TTT---GA--T--G--A-AAT
gi|104055                     : AAA-A-C--AAGG-T---T-AGAA---------GTTTT----GTCT---------------------------------ATGT-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--A--CTATTACCCA----T-TATTGCGTTTTTA
gi|104056                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------TTTTT----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------C----A
gi|104057                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AAAAC--------GTTTT----GTCATGGTT-CAT-CATT--------------T----GTGT-CA
gi|104058                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-C--AA--------GTTT-----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------T----ATGT-CAT--A---T-C
gi|104059                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GACTT----ATCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ACTT-CAT--A---
gi|104060                     : AAA-A-T--AAGG-TT--A-AAAAA--------GTGAT----GTAATGGTT-TAT-CAAA--------------C----ATGG-CAT--A---T-TTA-------G-A--TTT---GA--G--A--C-A
gi|104061                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGACA--------GTTAA----GTCTTGGTA-TAT-CATT--------------T----ATGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATTCCCA----T-GCTTGCATTTTCAtgccatatggcat
gi|104062                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CAGT--------------C----ATAT-CAT--A---C-ATG-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----C-ACTT
gi|104063                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------A----ATTT-AAT--A---C-ATA-------C-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCG----T-ACTT
gi|104064                     :  AA-G-C--ATGG-T---C-AGAAA--------GTTTT----GTCGTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CGT--A---T-CTC-------G-A--TTT---TA--T--A--T-AATACCAA----T-ATTTCCGTTTTTA
gi|104065                     :  AA-A-T--AAAG-T---G-TGAAAACAAATATGTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CACT--------------C----ATGT-AAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--T--G-AATACCCA----T-ACGCGCGTT
gi|104066                     :  AA-A-G--AAGG-T---A-AGAAT--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------T-A--CTT---G
gi|104067                     :   A-A-C--AAGGAT---A-A-ATA--------GTTTT----GTCTTCGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CAA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-ATTACCCA----T-ACTTGCGTATT
gi|104068                     :   A-A-C--AAGA-T---A-AAAAT--------GTTTT----GTCATGGTT----------------------------ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--CTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTT
gi|104069                     :   A-A-C--AAAA-T---A-AGACA--------ATTTT-----TACTGGTT-TAT-CATG--------------C----ATGA-CAT--A---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTATTA
gi|104070                     :   A-A-C--A-GG-T---A-TGAAA--------GTTTT----TTCTTGGTT-TAC-CATT--------------CCCGTATGT-C-T--A---T-CTA-------G-A--TTT---GT--A--A--C-ACTATGCA----T-GCCTGCGTTTT
gi|104071                     :   A-A-C--AGTG-T---A-GGAAA--------GTTTT----GACTTGGTT-AA-----------------------------------A---T-CAA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGTGTCTTTA
gi|104072                     :   A-A-C--AAGA-T---A-AAAAAAA------GTTTT----GTCTTTG---TAT--ATG--------------C----ATAT-CGT--A---T-CTA-------A-A--TGT---CA--T--G--C-AAGACCCA----C-AA-TGCGTT
gi|104073                     :      -C--AAGA-T---A-A-AAA--------GTTTT----GTCTTA-TT-TAT-CATT--------------C----ATAA-CGT--A---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-ACTTGCCTTTGTA
gi|104074                     :        --AAGA-A---A-AGGAA--------ATTAA----GTCTTGGTT-TAT-CATC--------------T----ATGT-CCT--A---T-TTA-------T-A--TTT---GA--C--A--C-AATTGTCA----T-ATTTGCGT
gi|104075                     :              -T---A-AAAAA--------GTT------AACTTGATT-TTT-CCTT--------------C----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-T--TTT---GA--T--A--C-GATAACGA----T-ATTTGCGTTTTTA
gi|104076                     :                       AAA--------GTTCC----ATTTTAATT-AAC-CATT--------------T----AGGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---TA--A--A--C-AACACCCA----T-ATTTGCATTTTTA
gi|104077                     :                        AA--------GCTTT----GAAACGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTT-------T-T--TTT---TA--T--C--C-AATACCTA----T-ACTTG
gi|104078                     :                        AA--------GCTTT----GTATCGGTT-TAT-CATT--------------G----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104079                     :                        AA--------ATTTG----ATTTAAGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CCT--A---T-CTA-------G-A--TAT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-A----CGTTTTTA
gi|104080                     :                          --------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATC--------------C----ATGT-CAT--A---T-CCA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTT
gi|104081                     :                          --------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATNNNNNNNNNNTCATCC----ATGT-CAT--A---C-CCA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTTTA
gi|104082                     :                                   TTTT----GTCTTGGTT-TAT-CTTT--------------C----ATGT-CAA--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-TCTTGCATTTTTA
gi|104083                     :                                     TT----GTCTTTGTT-TAT-CAAT--------------C----ATAC-CAT--G---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCTT----T-TCTTGCGTTATTA
gi|104084                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104085                     :                                     TT----GTCCTTGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-GCATGCGTTTTTA
gi|104086                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATAT-CAT--A---T-CTT-------T-T--TTT---TA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104087                     :                                     TT----GTCCTGGAT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---C-ATA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104088                     :                                     TT----GTACTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---AA--T--C--C-AATACCCA----T-GCATGCGTTTTTA
gi|104089                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTANNNNNNNN-N--NTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104090                     :                                     TT----GTCCTGATT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAA--T---T-CTA-------A-G--TTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104091                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAC-CATT--------------C----GTGT-CAT--A---T-CAA-------T-G--TTT---GA--T--C--A-AATACCCA----T-ACTTGtactggttta
gi|104092                     :                                     TT----GTACTGGTT-TAT-AATT--------------C----ATGC-CAT--T---T-CTA-------T-A--GTT---TA--T--C--C-AATACCTA----T-ACTTGtactggttta
gi|104093                     :                                     TC----GTTTTGGTT-TAT-CATT--------------C----GTGC-CAT--A---T-CTA-------G-A----T---GA--T--A--C-TATA
gi|104094                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------G----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----T-ACATG
gi|104095                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-ACAATCCA----T-ATTTG
gi|104096                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--A--A--C-TATATCCA----T-ACTTG
gi|104097                     :                                              TTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--A--C-AATATCCA----T-ACTTG
gi|104098                     :                                              TTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--TAAA--C-AAT--CCA----T-ATTTG
gi|104099                     :                                              TTGGAC-TAC-CGCC--------------C----ATG---AT--A---T-CCA-------G-A--TTT---GA--A--A--C-AATACCCA----C-ACTTGTGTTTTTA
gi|104100                     :                                               TGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-TATATCCA----T-ACTTG
gi|104101                     :                                               TGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-TGT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCC----T-ACTTG
gi|104102                     :                                                 GTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-ACTATCCA----T-ACGTG
gi|104103                     :                                                  TT-CAT-CATT--------------T----ACGT-CTT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACCTGCATT
gi|104104                     :                                                  TT-TATTCATT--------------T----GTGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTTCAGAA--A--A--T-AATACCCA----T-ACTTGCATTTTTA
gi|104105                     :                                                   T-CAT-CATT--------------A----ATGT-TAT--A---T-CGG-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATAACCA----T-ATTTGCGTTTTTA
gi|104106                     :                                                      AT-CATT--------------C----ATGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--A--A-AATATCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104107                     :                                                           TT--------------C----ATGT-CAT--A---T-ATA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGCGTTTATA


blockSeqs                     :      T         TTA       ACAAATAT                           NNNNNNNNNTCATC                AAT     NNNNNNN
blockSeqs                     :      T         AAA       AA                                 .                             T       .      
blockSeqs                     :      T         T         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      T         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :      .         .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                .         .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                          .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                          .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                          .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                          .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                          .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                          .                                  .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .       .      
blockSeqs                     :                                                             .                             .              
blockSeqs                     :                                                             .                             .              
blockSeqs                     :                                                             .                                            
blockSeqs                     :                                                             .                                            


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
finalCons                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTTA





Alignments
lowQualScore                  :    0 2 00    0 222 0     22222222     1111         0   0    22222222222222 0000    0   00 111 0   1111111 0 11   000  00 00 00 0        1111 0             
lowQualScore                  :    . . ..    . ... .     ........     ....         .   .    .............. ....    .   .. ... .   ....... . ..   ...  .. .. .. .        .... .             
lowQualScore                  :    6 4 88    6 666 6     77777777     0000         4   4    44444444444444 9999    4   66 111 4   4444444 4 00   777  66 66 66 4        0000 5             
consensus                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
Reference ( family-305 )      : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104008                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTCT----GTCTTGGTT-TAT-CGTT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACATGCGTCGTTA
gi|104009                     : AAA-A-C--AAAG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--T--C-AATACCCA----T-ACT
gi|104010                     : AAA-A-C--AAGG-C---A-AGAAT--------GTTTT----GTCTCGGTT-TAT-CATT--------------T----ACGT-CAT--A---T-CCA-------G-A--CTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGCGTTTTTAattatttcta
gi|104011                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GCTTT----GTCTTGGAT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--AT--T-TTA-------A-A--TTT---GA--T--A--A-AGTACCCA----T-ACTTGCATTTTTA
gi|104012                     : AAA-A-C--AAGG-C---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CAAT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GT--T--A--C-AATATCCA----TGACTTGGATTTT
gi|104013                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-ACAAA--------GTTCT----GTCTTGATT-TAT-CATT--------------C----AAGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--T-ATTACCCA----T-ACTTGCTTT
gi|104014                     : AAA-A-C--ATGG-T---A-AAAAC--------GTTTT----GTCTTGGTG-TAT-CATT--------------A----ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----T-ACGTGCGTTTCTA
gi|104015                     : AAA-A-C--AAAG-C---A-AGAAA--------CTTTT----GTCTTGGCT-TAT-CATT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GT--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTTTGTTTTTA
gi|104016                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-ACAAA--------GTTCT----GTCTTGATT-TAT-CATT--------------C----AAGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--T-ATTACCCA----T-ACTTGCTTT
gi|104017                     : AAA-A-C--AAAG-T---T-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTT-------A-T--TTT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-ACTTGGGATTTTA
gi|104018                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAG--------ATTTT----ATCTTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAA--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATATA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104019                     : AAA-A-C--AAGG-T---T-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGTTT-TAT-CTTT--------------C----ATTT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--A--A--C-AATACATA----T-ACCAGCATTTTTA
gi|104020                     : AAA-A-C--AAGG-T---G-AGAAA--------GTTTT----GGTCTGGTA-AAT-TATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCTA----T-ACATGTGTTTTTA
gi|104021                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTCT----GTCTTGTTT-TAT-CAAT--------------C----ATAC-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----A-ACTTGCGTGTTTA
gi|104022                     : AAA-A-C--GAGA-T---A-AGAAA--------GTT------GTCATTGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--AAT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGCGTTTT
gi|104023                     : AAA-A-CGAAAAG-T---A-AGAAA--------ATTTT----GTCATGACT-AAT-CATT--------------C----AGGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACACA----T-ATTTGCATTTTTA
gi|104024                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AGAAA--------TGTTT----GTCTTGGTT-AAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--T--T-AATACACG----T-AATTGCGTTTTTA
gi|104025                     : AAA-A-C--ATGG-T---A-AG-----------GTTTT----GTTTTAGTA-TAT-CATG--------------C----ATCT-CAT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104026                     : AAA-A-T--AAGA-T---A-GGAAA--------GTTTT----TTCTTGATT-TAT-CGTT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GC--T--A--C-GATACCAG----T-TCTTGCGTCTTTA
gi|104027                     : AAA-A-C--ATGT-A---A-AAAAA--------GTTTT----TTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ACAT-CAT--A---T-CTT-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGTGTTTTTA
gi|104028                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTAGTT-TAT-AATT--------------C----AAGTGC--------T-CCA-------G-A--TTT---GA--T--ACCC-AATATCTA----T-GCTTGCGTTTTTA
gi|104029                     : AGA-A-T--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATGC-CTT--A---T-CTA-------T-ATTTTT---GG--T--A--C-ACTACCCA----T-ACT
gi|104030                     : AAATA-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----AGTTTGATT-TAT-CAGT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--G--C-AATATCCA----T-TCTTctgtatt
gi|104031                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATGT-CAT--T---T-C-A-------G-A--TTT---TA--T--A--C-A------A----T-ACTTACGTTT
gi|104032                     : AGA-A-C--AAGT-T---A-ACAAA--------GATTT----GTCTTGATT-CAT-CATT--------------C----ATGT-CAA--AAATT-ATA-------G-AT-TTT---TA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTCGCATTTTTAactcttt
gi|104033                     : AAA-A-A--AGGA-T---A-AAAAA--------GTTTT----GTATTGGTT-AAC-CATC--------------C----ATGT-CCT--A---T-CTA-------G-A--TTT---TA--T--A--C-AATATTAA----T-AGGTGCGT
gi|104034                     : AAA-G-C--AAGT-T---A-AGAAA--------TTTTG----GTCTTGGTT-CAC-CATT--------------C----ATAT-TAA--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-AC
gi|104035                     : AAA-G-C--AAGG-T---T-AAAAT--------GTTCT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---C-CTA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTT
gi|104036                     : AAA-A-C--GGGG-TTTAATAGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CTTT--------------C----ACGT--GT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AAAACCCA----A-ACTTGTGTTTT
gi|104037                     : AAA-A-C--AAGG-TAAAA-AGAAA--------A---T----GTTTTGGTT-TAT-CATT--------------T----GTGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--A--A-AATACCTA----A-ACTTCCGTTTTT
gi|104038                     : AAA-A-A--AAGG-T---A-AGAAC--------GCTTA----ATTTTGGTG-TAT-CATT--------------C----ACGT-CAC--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----
gi|104039                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-ACAAA--------TTTTT----GTCTTGGTT-TAG-CATT--------------C----GTAT-CAT--A---T-TTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATAC
gi|104040                     : AAA-ATC--AAGG-T---A-AGAAT--------GTTGT----GTCTAGGTT-TAT-CATT--------------C----ACGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TCT---GA--T--C--C-AATATCagacgttaagtattttt
gi|104041                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGACA--------ATTTT----ATCTTGGTT-TAT-CATC--------------C----ATA---AT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GAGTT--A--T-AATG-CCA----T-ACTTACGTTTT
gi|104042                     : AGA-A-T--AAGC-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATT--------------G----GAGT-CATAGA---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-A------A----C-ACTTGCGTTTTCA
gi|104043                     : AAA-A-C--AAGA-T---A--GAAA--------GTTGT----GTATTAATT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-ATT-------G-A--TTT---CA--T--A--C-AATAACCAAATTT-GCATGCGTTTTTA
gi|104044                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGGAA--------GTTTT----GTCTTGGTTATAT-CATT--------------A----ATGT-CAT--A---T-C-A--------------T---AA--T--A--A-AATACCCT----T-ATTT
gi|104045                     : AAA-A-C--AAAG-T---A-AGAAA--------GTTTC----GTATTGGTC-AAT-CATT--------------C----ATGT-CTT--A---G-CTA-------T-A--TTT---AA--T--A--C-AATACCtca
gi|104046                     : AAG-A-A--AAGA-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTG-TGT-CATT--------------C----ATG---AT--A---TACTA-------ATA--TTT---GA--T--A--C-AATACCCT----T-GCCTATGTTTT
gi|104047                     : AAA-A-T--AAAG-A---A-AGAAC--------GTTTT----GTCTTGCTT-T-T-CATT--------------C----ATGA-TAT--A---T-CTA-------G-A--CTG---GA--T--G--C-AATAACCA----T-ACATGC
gi|104048                     : AAA-G-A--AAGT-T---G-AGAA----------TTTT----TTTTTATTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TT--------------C-AATACCCA----T-ACTTGTGTTTTT
gi|104049                     : AAA-A-T--AGGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----AATTTGGTT-TAT-CACT--------------C----ATGT-CAT--A------------------------------------C-AATATCCA----T-ACTTCCGTTTTTA
gi|104050                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTG----GTGTTAGCA-CAT-CATT--------------C----ATGC-TAT--A---T-CTA-------G-G--TTT---GA--T--A--A-AA
gi|104051                     : AAA-A-C--AAGG-T---G-AGAAA--------GTTTT----GTTTTGATT-AAT-CAT--------------------A----CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T-----C-AA
gi|104052                     : AAA-ATC--CAGG-T---A-GGAGA--------GTTTTTTTTATCCTGGTT-TAA-CATT--------------C----AAGT-CAC--G---T-CTA-------G-A--TTC---AA--T--A--C-AACACACA----T-A
gi|104053                     : AAA-A-C--ATAA-T---A-AGAAA---------TCTA----GTCTTGGTT-AAT-CGTT--------------C----GAGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATA---A--------TTGCGTTTTTA
gi|104054                     : AAA-A-C--AAAT-C---A-AGAGA--------GTTTT----GTCTTATTT-TAT-CATG--------------C----TTGT-CAT--G---T-TTA-------G-A--TTT---GA--T--G--A-AAT
gi|104055                     : AAA-A-C--AAGG-T---T-AGAA---------GTTTT----GTCT---------------------------------ATGT-TAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--A--CTATTACCCA----T-TATTGCGTTTTTA
gi|104056                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------TTTTT----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------C----A
gi|104057                     : AAA-A-C--AAGA-T---A-AAAAC--------GTTTT----GTCATGGTT-CAT-CATT--------------T----GTGT-CA
gi|104058                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-C--AA--------GTTT-----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------T----ATGT-CAT--A---T-C
gi|104059                     : AAA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GACTT----ATCTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ACTT-CAT--A---
gi|104060                     : AAA-A-T--AAGG-TT--A-AAAAA--------GTGAT----GTAATGGTT-TAT-CAAA--------------C----ATGG-CAT--A---T-TTA-------G-A--TTT---GA--G--A--C-A
gi|104061                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGACA--------GTTAA----GTCTTGGTA-TAT-CATT--------------T----ATGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATTCCCA----T-GCTTGCATTTTCAtgccatatggcat
gi|104062                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CAGT--------------C----ATAT-CAT--A---C-ATG-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----C-ACTT
gi|104063                     :  AA-A-C--AAGG-T---A-AGAAA--------GTTTT----GTCTTGGTT-TGT-CATT--------------A----ATTT-AAT--A---C-ATA-------C-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCG----T-ACTT
gi|104064                     :  AA-G-C--ATGG-T---C-AGAAA--------GTTTT----GTCGTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CGT--A---T-CTC-------G-A--TTT---TA--T--A--T-AATACCAA----T-ATTTCCGTTTTTA
gi|104065                     :  AA-A-T--AAAG-T---G-TGAAAACAAATATGTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CACT--------------C----ATGT-AAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--T--G-AATACCCA----T-ACGCGCGTT
gi|104066                     :  AA-A-G--AAGG-T---A-AGAAT--------GTTTT----GTCTTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTA-------T-A--CTT---G
gi|104067                     :   A-A-C--AAGGAT---A-A-ATA--------GTTTT----GTCTTCGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-TAT--A---T-CAA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-ATTACCCA----T-ACTTGCGTATT
gi|104068                     :   A-A-C--AAGA-T---A-AAAAT--------GTTTT----GTCATGGTT----------------------------ATGC-CAT--A---T-CTA-------G-A--CTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTTTT
gi|104069                     :   A-A-C--AAAA-T---A-AGACA--------ATTTT-----TACTGGTT-TAT-CATG--------------C----ATGA-CAT--A---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACTTGCGTTATTA
gi|104070                     :   A-A-C--A-GG-T---A-TGAAA--------GTTTT----TTCTTGGTT-TAC-CATT--------------CCCGTATGT-C-T--A---T-CTA-------G-A--TTT---GT--A--A--C-ACTATGCA----T-GCCTGCGTTTT
gi|104071                     :   A-A-C--AGTG-T---A-GGAAA--------GTTTT----GACTTGGTT-AA-----------------------------------A---T-CAA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACTCA----T-ACTTGTGTCTTTA
gi|104072                     :   A-A-C--AAGA-T---A-AAAAAAA------GTTTT----GTCTTTG---TAT--ATG--------------C----ATAT-CGT--A---T-CTA-------A-A--TGT---CA--T--G--C-AAGACCCA----C-AA-TGCGTT
gi|104073                     :      -C--AAGA-T---A-A-AAA--------GTTTT----GTCTTA-TT-TAT-CATT--------------C----ATAA-CGT--A---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-ACTTGCCTTTGTA
gi|104074                     :        --AAGA-A---A-AGGAA--------ATTAA----GTCTTGGTT-TAT-CATC--------------T----ATGT-CCT--A---T-TTA-------T-A--TTT---GA--C--A--C-AATTGTCA----T-ATTTGCGT
gi|104075                     :              -T---A-AAAAA--------GTT------AACTTGATT-TTT-CCTT--------------C----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-T--TTT---GA--T--A--C-GATAACGA----T-ATTTGCGTTTTTA
gi|104076                     :                       AAA--------GTTCC----ATTTTAATT-AAC-CATT--------------T----AGGT-CAT--A---T-ATA-------G-A--TTT---TA--A--A--C-AACACCCA----T-ATTTGCATTTTTA
gi|104077                     :                        AA--------GCTTT----GAAACGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTT-------T-T--TTT---TA--T--C--C-AATACCTA----T-ACTTG
gi|104078                     :                        AA--------GCTTT----GTATCGGTT-TAT-CATT--------------G----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104079                     :                        AA--------ATTTG----ATTTAAGTT-TAT-CATT--------------C----ATGT-CCT--A---T-CTA-------G-A--TAT---GA--T--A--C-AATACCAA----T-A----CGTTTTTA
gi|104080                     :                          --------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATC--------------C----ATGT-CAT--A---T-CCA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTT
gi|104081                     :                          --------GTTTT----GTCTTGGTT-TAT-CATNNNNNNNNNNTCATCC----ATGT-CAT--A---C-CCA-------T-A---CT---GA--T--A--C-ATAACCCA----T-ACTTGTGTTTTTA
gi|104082                     :                                   TTTT----GTCTTGGTT-TAT-CTTT--------------C----ATGT-CAA--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-TCTTGCATTTTTA
gi|104083                     :                                     TT----GTCTTTGTT-TAT-CAAT--------------C----ATAC-CAT--G---T-CTA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCTT----T-TCTTGCGTTATTA
gi|104084                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104085                     :                                     TT----GTCCTTGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-GCATGCGTTTTTA
gi|104086                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATAT-CAT--A---T-CTT-------T-T--TTT---TA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104087                     :                                     TT----GTCCTGGAT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---C-ATA-------T-G--TTT---GA--T--C--C-AATAACCA----T-ACTTG
gi|104088                     :                                     TT----GTACTGGTT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAT--A---T-CTA-------T-G--TTT---AA--T--C--C-AATACCCA----T-GCATGCGTTTTTA
gi|104089                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAC-CATT--------------C----ATGT-CAT--A---T-CTANNNNNNNN-N--NTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104090                     :                                     TT----GTCCTGATT-TAT-CATT--------------C----ATGC-CAA--T---T-CTA-------A-G--TTT---GA--T--C--C-AATACCCA----T-ACTTG
gi|104091                     :                                     TT----GTCCTGGTT-TAC-CATT--------------C----GTGT-CAT--A---T-CAA-------T-G--TTT---GA--T--C--A-AATACCCA----T-ACTTGtactggttta
gi|104092                     :                                     TT----GTACTGGTT-TAT-AATT--------------C----ATGC-CAT--T---T-CTA-------T-A--GTT---TA--T--C--C-AATACCTA----T-ACTTGtactggttta
gi|104093                     :                                     TC----GTTTTGGTT-TAT-CATT--------------C----GTGC-CAT--A---T-CTA-------G-A----T---GA--T--A--C-TATA
gi|104094                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------G----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCA----T-ACATG
gi|104095                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-ACAATCCA----T-ATTTG
gi|104096                     :                                             CTTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--A--A--C-TATATCCA----T-ACTTG
gi|104097                     :                                              TTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--C--A--C-AATATCCA----T-ACTTG
gi|104098                     :                                              TTGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--TAAA--C-AAT--CCA----T-ATTTG
gi|104099                     :                                              TTGGAC-TAC-CGCC--------------C----ATG---AT--A---T-CCA-------G-A--TTT---GA--A--A--C-AATACCCA----C-ACTTGTGTTTTTA
gi|104100                     :                                               TGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CGT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-TATATCCA----T-ACTTG
gi|104101                     :                                               TGGTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-TGT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATATCCC----T-ACTTG
gi|104102                     :                                                 GTT-TAT-CATT--------------A----ATAT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTT---GA--T--A--C-ACTATCCA----T-ACGTG
gi|104103                     :                                                  TT-CAT-CATT--------------T----ACGT-CTT--A---T-CTA-------A-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ACCTGCATT
gi|104104                     :                                                  TT-TATTCATT--------------T----GTGT-CAT--A---T-CTA-------G-A--TTTCAGAA--A--A--T-AATACCCA----T-ACTTGCATTTTTA
gi|104105                     :                                                   T-CAT-CATT--------------A----ATGT-TAT--A---T-CGG-------G-A--TTT---GA--T--A--C-AATAACCA----T-ATTTGCGTTTTTA
gi|104106                     :                                                      AT-CATT--------------C----ATGT-CAT--G---T-CTA-------G-A--TTT---AA--T--A--A-AATATCCA----T-ACTTGCGTTTTTA
gi|104107                     :                                                           TT--------------C----ATGT-CAT--A---T-ATA-------T-A--TTT---GA--T--A--C-AATACCCA----T-ATTTGCGTTTATA