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lowQualScore                  :    6   3   4   777     4 55555555 8 5555 8888888 4  3333 22222222 8 111111111 00000 777 00 66 4 8  66    66 4 4      4      4 4 4  66   4  111111111111111111111111111111111 0000 77  5 8  8    4444 5  66666  5  5 6 2   
consensus                     : ACA-ACTCCTC-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--TTTT-G--G----G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
Reference ( gi|12743 )        : ACA-ACTTCTC-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--TTTA-A--G----G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TTCA-AGTTT
gi|12748                      : ACA-ACTCCTC-CTG---ATCCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----TA------A-A--TTTG-A--G----A--AG-TGAG-CTTT----T-CT-----TT-TTTG-AATTT
gi|12750                      : ACA-ACTCCTT-CTT---AACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---G--T--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGG-TT------G-----T-------A-A--TTAA-G--G----G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TATA-AATTT
gi|12745                      : ACA-ATTCCTT-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------G-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATTAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--ATTT-T--G----G-AGG-TGAA-CTTT----T-CT-----AT-TTTA-AATTT
gi|12744                      : ACC-ACTCCTC-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-T-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--G----A-TTG-TGAA-TTTT----T-AT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12746                      : ACA-ACTCTTC-CTG---AGCTA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-GT--TTTA--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-CT--TAA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--G----G-TGG-TGAA-GTTT----T-CT-----TT-TT
gi|12751                      : ACACACTCCTC-CTG---AACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-AT------GA----A-------A-A--TTTG-A--G----A--GG--GAA-CTTT----T-CT-----TT-TTAA-AATTT
gi|12742                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----T---T--G--T-T-AT--TTTG--G-T-ATCAGA-AGAAAG-G-G-CT--TAA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--G----A-TGG-TATA-CTTT----T-CT-----TT-TT-A-AATTT
gi|12757                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AACCA-G---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AG-AAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--TTT-----G----G-CAG-TG-----TT----T-TT-----TT-TTC
gi|12752                      : ACA-TCTCGTC-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----T---T--G--T-G-AC--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-AT--TGA-CT------G-----T-------A-C--TTT--G--G----G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TTTA-GATTTta
gi|12749                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-G-ACCAAA-AG--GG-G-G-TT--TGG-TT------G-----C-------A-A--CTTT-G--G----G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TT
gi|12755                      : ACA-ACTCTTC-CTG---AACCT-A---C----A-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---TTTG--T-G-AT--TTTG--G-T-ATGAAA-A--AAG-G-G-CT--TGA-CT------G-----T-------A-A--CTTT-T--G----G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTTatactt
gi|12753                      : ACA-GCTCCTT-CTG---AACAA-A---C----G-A----A-------C-TT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-ACAATG-G-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-C--G----G-TAG-TAAA-CTTT----T-CT-----TT-TTTA-AA
gi|12756                      : ACA-ACTTCTC-CTG---AACAA-A---C----C-A----A-------T-ATA---A--------A-A---------T-----T---T--G--G-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-TT--TGA-TT------------T-------A-A--CTTT-G--G----G-TGG-TTAA-CTTT----C-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12759                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AACCA-A---C----C-A----AACATATTT-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTAA--G-T-ATCAAT-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----C-------A-G--CTTA-G----------GG-TGAA-TTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12764                      : ACA-ACTTGTC-CTG---AGCCA-A-----------------------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AA--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--TCA-TT------GT----T-------A-A--TTT--G--G----G-AGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12747                      : ACA-ACTCTTC-CTG---AAACA-A---C----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTGCCA-T-ATCAAA-AGGAAGAG-G-CT--TGG-TC------G-----T-------A-A--CTTT-G--G----G-TGG-TAAA-CGTT----T-CT-----TT-TT-A-AATTT
gi|12754                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AACCA-A---T----C-A----AA------C-GT----A--------T-T---------T-----A---T--G--T-G-AT--TTTA--T-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--ATTT-G--G----G-AGG-TGAA-CTTT----T--T-----TT-TTTA-AATTT
gi|12761                      : ACA-GCTCCTC-CCG---AATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-GT--TTTG--T-T-ATCAAAGAAAAAG-G-T-CT--TGA-CT------G-----TG------A-A--TTT--G--G----G-AGG-TGAA-CTTT----C-AT-----TT-TTTA-AATT
gi|12767                      : ACA-ACTTCCC-CTG---AACCA-A---T----T-A----A-------C-A-----A--------T-G---------T------------G--T-G-GG--TTTG--G-T-ATTAAA-AAAAAA-GAG-TT--TTA-TT------G-----T-------A-A--TTTT-A--G----G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TT
gi|12758                      : ACA-ACACCTC-CTG---AACCA-A---CTATCC-A----A-------C-AT----A--------T-TATTTTTTTTT-----T---T--G--T-T-AT--TTTG--G-T-GTCAAA-AGAAAG-A-T-CT--TGA-TT------T-----T-------A-A--CTTA-G--G----A-TGT-TAAA-CTTT----T-CT-----TT-TTTA-ATTTagattt
gi|12762                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AACTA-A---A----C-A----A-------C-ATGATTA--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TCTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-AT--CGA-TT------AT----T-------A-A--TTT--T--G----G-TGG-CAAA-CTGT----T-CT-----AT-TATA-AATTT
gi|12763                      : ACA-ACGCCTC-CTG---AACCA-A---A----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T------G--T-G-AT--TTTG--A-T-AACAAA-AGAAAG-C-G-CT--TGA-T--------------------------TTGG-A--G-------GG-TGAA-CTTT----T-CT-----AT-TTTA-AATTT
gi|12760                      : ACA-ACTCGTT-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-TT----A--------T-T---------TAAATTT---T--A--T-G-AT--TTTT--G-T-ATAAAA-AAAAAA-G-GTCT--TGA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--G----G-TGG-TAAA-CTTT----T-TT-----TT-
gi|12766                      : ACA-ACT-----CTG---CATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T-----T----T--TTTG--G-T-ATCAAG-AGAAAG-G-G-CT--TAA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--T----G-TGG-TAAA-A-TT----T-CT-----CT-TTTA-AATTT
gi|12765                      : ACA-ACTCCTC-CAA---AATTA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-CGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--ATTT-T--G----G-AGA-TTAA--TTT----T-GT-----TT-T--A-AATTT
gi|12775                      : ACA-ACTCGTT-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AA----A--------T-C---------T-----A---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ACCAGA-ATAAAA-A-G-CT--TGA-AC------A-----T-------ATA--TTTA-A--G----A-T-G-TAAG-CTTT----T-CC-----CT-TTTA-AATT
gi|12772                      : ATA-ACTACTC-CTT---AGCCA-A---C----C-T----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATC-AA-AGAAAG-T-G-AT--TAA-TT------G-----C-------A-AACTTTA-ATGG----G-TTG-TAAA-CTTT----T-TT-----T
gi|12770                      : ACA-ACTCTTC-CTG---AACCA-A---T----C-A----T-------C-AT----A--------G-T---------T-----T------G--T-G-AC--TTTG--A-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-TT--TGA-TT------G-----T-------A-T--CTCT-T--G----G-CGG-TGAA-CGTT----T-CT-----TC-TAAA-AATTTaaat
gi|12771                      : ACA-ATTCCTC-CTT---AACCT-A---C----A-G----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----T---T--G--G-G-AT--TTTT--A-T-ATCAAA-AGATAG-G-A-CT--TGA-TT------T-----T-------A-A--TTAT-G--G----G-TGA-TCAA-CTTT----T-C------TT-TTCA-ATTT
gi|12773                      : ACA-ACTCCTC-CTT---AACAA-A---A----C-A----A-------A-CT----G--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--A-T-ATCAAA-AGAATG-T-G-CT--TGA-TT------G-----G-------A-A------------------GG-TGAA-CTTT----T-CA-----AT-TTTA-AATTT
gi|12769                      : ATA-ACTCGTC-CTA---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------A-G---------T-----T---T--G--T-GTTT--TTTG--A-T-ATCTAA-AGAAAG-A-A-CT--TGG-TT------G-----T-------A-AC-TTT-----G----G-TGT-TGAA-CCTT----T-TT-----TG-GTTA-AATTT
gi|12768                      : ACA-ACT---C-CAG---AACTA-A---A----C-A----C-------T-AT----A--------T-T---------T-----TTTTT--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G--------GA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--C----A-TCG-TAAA-CTTT----T-CT-----TA-TTTA-
gi|12778                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AACCA-A---T---------------------AG----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAGAG-G-G-TT--TGA-TC------A-----T-------A-
gi|12779                      : ACA-ACTTATC-CTG---TATAA-A---C----A-A----A-------C-TT----A--------T-T---------C-----T---G--C--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCGGA-GCAAAG-A-C-TT--TGA-TT------G-----C-------A-A--CTTT-T--G----G-TGG-TGGA-CTTT----C-CT-----TT-TT
gi|12777                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AACAA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----T---T--G--T-G-AT--ATT---G-T-ATCAAA-CGAATG-A-G-T-------TT------G-----C-------A-A--CTTG-G--C----G-TTG-TAAA-CTTT----T-TT-----
gi|12774                      : ACA-ACTACTT-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-GT----CTTT-----T-T---------T-----T---T--T--T-C-AT--TTTG--G-T-A-CA-----AAAG-G-T-CT--TAG-TT------G-----T-------A-A--TTTT-G--G----C-TAG-TAAA-TTTT----T-TC-----TT-TTTA-AATTaaattt
gi|12780                      : ACA-A-TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TACG--G-T-ATGAAA-AGAAAG-G-A-CT--GGA-TTTGG---G-----G-------A-A--TT---A--T----G-T--------CTTTC---T-TT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12776                      : ACG-ACTCCTC-CCG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----T---T--A--T-G-ATTGTTTA------ATCAAA-GGAAAA-T-G-TT--TGA-TT------------T-------A-AACTGTG-A-------G-TGG-TAAA-CGAA----C-CT-----TT-TT-A-AATTT
gi|12781                      : ACA-ACTCATC-TTG---AGCCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------T-T---------T-----T---TT-A--T-G-AT--TTCA---------AAA-AGAAAG-G-G-CT--TAA-TT------T-----T-------T-A--CTTT-A--G----G-TGG-TCAA-
gi|12785                      : ACA-ACTT------G---ACCCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCGAA-AGGAAT-G-A-CT--TGA-
gi|12783                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AATCA-A---C----T-A----A-------A-TT----A--------C-T---------T-----T---T--G--A-G-AT--GTTT--G-T-AT--AA-AAAAAG---------CGA-TT--------------------------------------G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TGTA-AATTT
gi|12784                      : ACA-ACTCCTC-CTG---AAACA-A---A----C-A----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA------------TT--T---TT------G-----T-------T-G--GTTA-G--GTGATG-TGA-TAAT-CATT----T-CC-----TT-TTTA-ATTT
gi|12782                      : ACA-ACTCCAC-CTG---AAACA-A---C----A-A----T-------G-AG----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-TTC-AA-AGCAAT-G-G-CA--TGA-TT------
gi|12788                      : ACA-ACTGCTC-CTG---AACCA-A---C----C-AAAAGA-------T-AT----T--------T-T---------T-----T---T--A--T-G-AT--TTTC--A-T-ATAAAA-ACAAA
gi|12787                      : ACA-GCTCCTC-CTG---AAACA-A---C----A-A----A-------C-AT----ACATGTATAT-T---------T-----T---T--T--T-T-AT--TTTG--G-T-A-------GA---------T--TGA-TT------G-----T-------A-A--CT-----------A-TGGCTG---CTTT----T-CT-----TT-CT
gi|12789                      :  CA-ACTCCTC-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-TT--CGA-TT------G-----T-------T-A--CTTtctttaaatt
gi|12791                      :  CG-ACTCCTC-CTG---AACTA-A---T----C-A----A-------C-A--------------------------------------------A-AT--GTTG--G-T-ATCAAA-CGTAAT-G-G-TT--TGA-TT------A-----T-------A-T--TTTG-A-------G-TG-------CTTT----T-TTGAATGTT-TTCA-AATTtgtgtatggca
gi|12792                      :  CA-ACTTCTC-ATG---TACCA-AAAGC----C-ATA--A-------C-AA----A--------A-T---------T-----G---T--G--T-A-AT--TTTT--A-T-ATCAAA-ATAAAA-G-G-CT--TGA-T
gi|12790                      :  CG-ACTTCCCACTG---ACCCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----T---T--G--T-C-CT--TTTG--G-T-ATCGAA-AGAAAG-G-A-CT------TC------G--------------------------G----G-CGG-TAAT-CTTT----T-TT-----TT-Tattaaatatctttg
gi|12793                      :   A-ATTCCTC-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T-----T-G-AT--TTTT--G-T-ATCAAA-CGAAAA-G-G-CT--TGG-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--G----A-TGG-TAAA-CTTT----C-CT-----CT-TTAA-Acttaaat
gi|12797                      :   A-ACTCCTC-GTG---AAGCA-AT--C----C-A----A-------CGAT----T--------T-T---------T-----T---T--G--A-G-AT--TTTA--G-T-ATCA----GAAAA-G-G-AT--TAA-TT------G-----T-------A-G--TTTT-T--G----G--GA-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-t
gi|12794                      :   A-ACTACTC-CTG---AATAA-A---C----C-A----A-------C-GT----A--------T-A---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTT--G---------------G-G-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-AC-TTTT-G--G----G-TGG-TAAA-CTTT----T-C
gi|12796                      :   A-ACTCCTC-CTG---AAACA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------TGT---------T-----T---T----------T--TTTT--G-T-ATCGGA-A-AAAG-T-T-TT--TAA-TT------G-----TAAATATGA-A--TTT--G--G----G-TGG-TAAA-CTTT----T-CA-----TT-TTCA-ATTT
gi|12795                      :   A-ACTCCTA-ATG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-A--------------------------------------------G-AT--TTTG--T-T-ATCAAA-TGAAAC-G-G-CCAATGA-TT------G-----T-------A-C--TTTT-G--A----G-TGG-TAAA-CTTT----T-TG-----TT-TTTATAATTT
gi|12799                      :   A-ACTCCTC-GTG---AAGCA-AT--C----C-A----A-------C-G-----A--------T-T---------C-----T---T--G--A-G-AT--TTTA--G-T-ATCA----GAAAA-G-T-AT--TAA-TT------G-----T-------A-A--TTTT-T--G----G--GA-TGAA-CTTT----T-CT-----
gi|12802                      :   A-ACTCCTC-GTA---AAGCA-A---T----CTA----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----T---T--G--A-G-AT--TTAA--T-T-TTCA----GAAAA-G-G-AT--TAA-TT------G-----T-------A-G--TTTT-T--G----G--GA-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-
gi|12801                      :   A-ACTCCGC-CTG---AACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A--------TAT---------T-----T---T--GTTT-C-AT--TTTG--G-A-ATTAAA-ACATA--T-A-CT--TGA-TT------A-----T-------A-
gi|12800                      :   A-ATTCCTC-CAG---AACTA-A---C----C-A----T-------A-GG----A--------T-G---------T-----T---T--A--T-G-AT--TTTA--G-T-ATCAAA-TGTAA--G-C-CA--TGA-TT------G-----T-------A-A--TGTT-G--G----C-TAG-TAAC-CGTT----T-CT-----TT-CTtctatgtat
gi|12804                      :   A-ACTCCTT-CTG---AACGA-A---C----C-A----A-------A-TT----A--------T-T---------TTT---T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-TAATAAAA-ACAAAttgattt
gi|12798                      :   A-AATCCTC-CTC---AACGA-A---C----G-A----A-------C-AT-------------T-T---------T-----T---T--G--T-T-GT--TCTG---------------AAAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--A----A-TAA-CCAA-CATT----T--T-----TT-TTTA-AATTT
gi|12805                      :   A-ACTCTTT-GTG---AAGCA-A---C----CCA----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----T---T--G--A-G-AT--TTTA--A-T-AT---A-AGAAAT-T-A-AT--TAA-TT------A-----T-------A-G--TTTT-T--G----G-T-A-TAAA-CATT----T-CT-----TT-T
gi|12803                      :   A-ACTCCTC-TTG---ATCTA-A---C----C-A----A-------C-AC-------------T-T---------T-----T---T--T--T-A-AA--CTT----------AAA-AGAAA--A-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-
gi|12806                      :    -ACTCATC-CTG---AACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--T-T-ATGAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------G-----A-------A-A--ATAT-G--G----G-AGG-TTAA-CTTT----T-CTA----TT-TTC--AGTTTtctttgagcgtcaaaccccttttta
gi|12807                      :    -ACTTCTT-CTG---AACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A----------T---------T-----T---T--G--T-C-AT--TTAA--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-TT------TT------A-----T-------G-A---------------G-TGG-TGAA-CTTT----T-CT-----TT-TT
gi|12808                      :    -ATTCCTC-CTG---AAC------------------------------T----A--------T-T---------T-----T---T--A------AT--TTTA--G-T-ATCAAA-AAGAAA-G-G-TT--TGA-TT------G-----T-------T-A--TTTT-G--G----A-TGG-TAAA-CTTTTGTCT-CT-----TT-TTtttaaatt
gi|12809                      :    -ATTTCTC-CTG---AAT---A---T-----------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--T--T-ATAT--TTTG--A-T-ATCAAA-GAGAAG-C-G-TT--TGA-TC------C-----T---------A--TCTG-GT-A----G-TGG-TAAT-CGTT----T-CT-----CT-TTTA-AATTTtttttaaattt
gi|12810                      :      CTCCTC-CTG---AACCA-A---C----A-G----A-------C-CT----A--------T-T---------A-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--GGT-ATGAAA-AGAAAC-G-G-AA--TAA-TT------G-----T-------A-A--CTTT-G--G----G-TGG-TAAA-CTTT----T-CT-----TT-T
gi|12812                      :      CTCCTC-GTG---AAGCA-AT--C----C-A----A-------C-A-----A--------T-T---------T-----T---T--G--A-G-AT--TTTA--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--TAA-TT------G-----T-------A-G--TTTT-T--G----G--GA-TGAA-CATT----T-TT-----TT-
gi|12824                      :       TTCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------------T-----------------G--G----G-AGA-TTAATTTTT----T-CT-----TT-TTTA-GATTTaacgattt
gi|12822                      :       TTCTC-CAG---AAACA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGTAAG-G-G-CT--TGA-TT-------------------------TGGG-A--G----A-TTA-TT---TTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12815                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---------------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------------T-----------------G--G----G-AGA-TTAATTTTT----T-CT-----TT-TTAA-AATTT
gi|12814                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--AGA-TT------------T-----------------G--G----A-TGG-TTAA--TTT----T-AT-----TT-T--A-AATTT
gi|12818                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT------------T-----------------G--G----G-AGA-TTAT-TTTT----T-TT-----TT-TTTA-GATTT
gi|12817                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATA--G-T-AACAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT-------------------------TTGG-A--G----A-TAA-TTTT-TTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12820                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT-------------------------TGGG-A--G----A-TTA-TT---TTTT----T-CT-----TT-TTTA-AACTT
gi|12819                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-GT--TATG--G-A-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TT-------------------------TGGG-A--G----A-TTA-TT---TTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12823                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----G-------C-AT----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-A-CT--TGA-TT------------T-----------------G--G----G-AGA-TTAATTTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12826                      :       TCCTT-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-G---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-TGAAAG-G-G-CT--TAACTT------G-----G-------G-A-----G-A--G----A-T-T-TG---TTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12825                      :       TCCTC-CAG---AATCG-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-CT--TGA-TTTGG---G-----A-------G-A--TTT------------T--------TTTT----T-CT-----TT-TTTA-A
gi|12827                      :       TCCCC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--TGA-TT-------------------------TGGG-A--G----A-TTA-TT---TTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTTaattt
gi|12828                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--T-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--TGA-TT------------T-----------------G--G----G-AGA-TTAATTTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12829                      :       TCCTC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AA----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--TAA-TT------T-----G-------G-A--TTT------------T--------TTTT----C-CT-----TT-TTTG-AATTT
gi|12813                      :       TCCTT-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----T---T--G--T-G-AT--AATG--G-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--TGA-TT------------T-----------------G--G----G-AGA-TTAA---TT----T-AT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12830                      :         CTC-CTG---AACCA-A---C----C-G----A-------C-AG----A--------T-T---------TC----T---T--A--T-G-AT--TTTT--G-T-ATCACA-AGAAAG-A-G-CT--TGA-TT------A-----C-------A-A--TTT--T--G----G-TGA-TAAA-CTTT----T-TT-----CT-TTTA-AATT
gi|12831                      :         CTC-CTG---AACCG-A---C----C-A----G-------C-AT---------------T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTCG--G-T-AT-AAA-ACAAAT-G-G-CT--CGA-TT------G-----T-------A-A--ATTT-T--G----G-TGG-TAAA-CCTT----T-CT-----TT-TT---AGTT
gi|12811                      :         CTC-CTG---AAACA-A---C----C-A----A-------C-GG----C--------T-T---------T-----T---T--G--TGG-A----TTG--A-T-ATAAAA-ATAAAA-A-G-CT--TAT-TT------T-----T-------A-A--TTTT-G--G----G-TGG-TAAT-TTTT----T-CT-----CT-TTCA-AATTTaaattt
gi|12832                      :      cccCTA-CTG---ATTCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----T---T--G--T-C-CT--TTTG--G-T-ATCGAA-AGGAAG-G-A-CT--T----T------G--------------------------G----G-TGG-TAAA-CTTT----T-CT-----TT-TT
gi|12821                      :          TC-CAG---AATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAA-G-G-CT--TGA-TT------GGGAGAT-------T-A--TTT----------------------TTT----T-CT-----TT-TTCA-AATTTtttaaat
gi|12816                      :       tctTC-CTGCAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TATG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--TGA-TTTGGGAGA-----T-------T-A--TTT---------------------TTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12833                      :          TC-TTA---AAGTA-A---T----C-A----C-------C-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-T--T--TTCG--G-T-ATAAAA-AGAAAA-A-G-CT--TAG-CG------A-----T-------ATA--TTTG-A-------G-TGG-TAAA-CTTT----C-CT-----CTGTTCA-ATTT
gi|12786                      :           C-CTG---AACCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------C-T---------T------------G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATGAAA-AAAAAG-A-A-CT--TGA-T
gi|12834                      :   actattcgc-CTG---ACCCGGA---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----T---T--G--T-C-CT--TTTG--A-T-ATCGAA-AGGAAG-G-A-CT--T----T------G--------------------------G----G-CGG-TAAA-CTTT----T-CT-----CT-TT
gi|12835                      :              TG---GACCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-G-GT--CGA-TA------G-----T-------A-A--CCTC-A--G----T-TG---GAA-CTTT----T-CT-----TT-TTTA-AATTTtttttaaat
gi|12836                      :              TG---AACCA-A---C----C-A----A-------C-A--------------------------------------------G-GT--TTTG--C-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-CT--TGA-TT------G-----T---------A--TTTGTA--G----G-TGG-AAAA-CTTT----TACT-----TT-
gi|12837                      :                       A-A---C----T-A----A-------C-TT----A--------T-TG--------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G---AT-AAA-AAAATG-G-A-CT---GA-CT------G-----T-------A-A--TTTT-T--G----G-TGG-TATA--TTT----T-CT-----TT-TTTA-AATT
gi|12840                      :                                                    T----A--------T-T---------T-----T---T--G--T-G-AT--TTTG--G-T-ATCAGA-GGAAAG-G-A-AT--TGA-TT------G-----TTA-----A-A--TTT
gi|12841                      :                                                                                                   T--TCCG--G-A-ATCAAA-C--AAG-G-G-TT--TGA-TT------G-----C-------A-A--CTTC-G--G----G-TGA-TGAA-C-TT----T-CT-----TT-TTTA-AA
gi|12842                      :                                                                                                       TTG--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--TGA-TT------G-----T-------A-A--AGTT-G--G----G-AGG-GGAA-AGTA----T-CT-----TT-TTTA-AATTT
gi|12843                      :                                                                                                          --G-T-ATAAAA-AGAA-G-G-G-AT--TGG-TT------G-----T-------A-A--TTT-----G----GTTGG-TAAA-CTTT----T-CT-----TT-TT-A-AATT

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lowQualScore                  :    .       .        . ........ . .... ....... .  .... ........ . ......... .....  ... ..  ...  ..   . .. . .      .      . . .  .. ...  . ..........................  ..   .... .   . ... .  ........  . . .... .....  .... ...  . . ..    
lowQualScore                  :    6       4        4 66666666 4 5555 3333333 4  9999 55555555 8 555555555 44444  777 66  555  66   4 66 4 4      4      4 4 4  66 777  2 88888888888888888888888888  66   5555 6   0 222 8  66666666  4 4 2222 11111  0000 333  5 5 77    
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Reference ( family-301 )      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATT------G-----T--A-A--T-----TT--TGG----GTGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12742                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TT---AT--TTT-G--G-T-ATCAGA-AGAAAG-G-G-CT--T---AATT------G-----T--A-A--C-----TT--TGG----ATGGTAT---A-CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12743                      : ACA-ACTTCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATT------G-----T--A-A--T-----TT--AAG----GTGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TC-A-A--GTTT
gi|12744                      : ACC-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-T-CT--T---GATT------G-----T--A-A--C-----TT--TGG----ATTGTGA---A-TT--------TT-T-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12745                      : ACA-ATTCCTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------G-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATTAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATT------G-----TA-A-A--T-----TT--TGG----A-GGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12746                      : ACA-ACTCTTC-CTGAGCTA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TTT-A--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-CT--T---AATT------G-----T--A-A--C-----TT--TGG----GTGGTGA---A-GT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12747                      : ACA-ACTCTTC-CTGAAACA-A---C----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-GCCA-T-ATCAAA-AGGAAGAG-G-CT--T---GGTC------G-----T--A-A--C-----TT--TGG----GTGGTAA---A-CG--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12748                      : ACA-ACTCCTC-CTGATCCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATT------G-----T--A-A--A-----TT--TGA----GAAGTGA---G-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-G-A--ATTT
gi|12749                      : ACA-ACTCCTC-CTGAATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-G-ACCAAA-AG--GG-G-G-TT--T---GGTT------G-----C--A-A--C-----TT--TGG----GTGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12750                      : ACA-ACTCCTT-CTTAACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TG---T--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GGTT------G-----T--A-A--T-----TA--AGG----GTGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---AT-A-A--ATTTatactt
gi|12751                      : ACACACTCCTC-CTGAACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GAAT------G-----A--A-A--A-----TT--TGA----GAGG-GA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TA-A-A--ATTT
gi|12752                      : ACA-TCTCGTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AC--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-AT--T---GACT------G-----T----A--C-----TT--TGG----GTGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12753                      : ACA-GCTCCTT-CTGAACAA-A---C----G-A----A-------C-TT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-ACAATG-G-G-CT--T---GATT------G-----T--A-A--C-----TT--TCG----GTAGTAA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12754                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---T----C-A----AA------C-GT----A--------T-T---------T-----AT---G--TG---AT--TTT-A--T-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-CT--T---GATT------G-----T--A-A--A-----TT--TGG----GAGGTGA---A-CT--------TT-T------T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12755                      : ACA-ACTCTTC-CTGAACCT-A---C----A-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TTTT-G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATGAAA-A--AAG-G-G-CT--T---GACT------G-----T--A-A--C-----TT--TTG----GTGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12756                      : ACA-ACTTCTC-CTGAACAA-A---C----C-A----A-------T-AT----A--------A-AA--------T-----TT---G--GG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-TT--T---GATT------------T--A-A--C-----TT--TGG----GTGGTTA---A-CT--------TT-C-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12757                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-G---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AG-AAG-G-G-CT--T---GATT------G-----T--A-A--T-----TT----G----GCAGTG-------T--------TT-T-T----T-----TT----T---CT-A-
gi|12758                      : ACA-ACACCTC-CTGAACCA-A---CTATCC-A----A-------C-AT----A--------T-TATTTTTTTTT-----TT---G--TT---AT--TTT-G--G-T-GTCAAA-AGAAAG-A-T-CT--T---GATT------T-----T--A-A--C-----TT--AGG----ATGTTAA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT---A--ATTT
gi|12759                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----AACATATTT-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTA-A--G-T-ATCAAT-AGAAAG-G-G-CT--T---GATT------G-----C--A-G--C-----TT--AG-------GGTGA---A-TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12760                      : ACA-ACTCGTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-TT----A--------T-T---------TAAATTTT---A--TG---AT--TTT-T--G-T-ATAAAA-AAAAAA-G-GTCT--T---GATT------G-----T--A-A--C-----TT--TGG----GTGGTAA---A-CT--------TT-T-T----T-----TT----
gi|12761                      : ACA-GCTCCTC-CCGAATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TTT-G--T-T-ATCAAAGAAAAAG-G-T-CT--T---GACT------G-----T--G-A--A-----TT--TGG----GAGGTGA---A-CT--------TT-C-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12762                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACTA-A---A----C-A----A-------C-ATGATTA--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TCT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-AT--C---GATT------AT----T--A-A--T-----TT--T-G----GTGGCAA---A-CT--------GT-T-C----T-----AT----T---AT-A-A--ATTT
gi|12763                      : ACA-ACGCCTC-CTGAACCA-A---A----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T----G--TG---AT--TTT-G--A-T-AACAAA-AGAAAG-C-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----AGGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12764                      : ACA-ACTTGTC-CTGAGCCA-A-----------------------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AA--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--T---CATT------G-----T--T-A--A-----TT--TGG----GAGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12765                      : ACA-ACTCCTC-CAAAATTA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-CGAAAG-G-G-CT--T---GATT------G-----TA-A-A--T-----TT--TGG----A-GATTA---A------------T-T-T----T-----GT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12766                      : ACA-ACTC-----TGCATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT------T-----T--TTT-G--G-T-ATCAAG-AGAAAG-G-G-CT--T---AATT------G-----T--A-A--C-----TT--TGT----GTGGTAA---A-A---------TT-T-C----T-----CT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12767                      : ACA-ACTTCCC-CTGAACCA-A---T----T-A----A-------C-A-----A--------T-G---------T----------G--TG---GG--TTT-G--G-T-ATTAAA-AAAAAA-GAG-TT--T---TATT------G-----T--A-A--T-----TT--TAG----GTGGTGA---A-CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12768                      : ACA-ACTCCA----GAACTA-A---A----C-A----C-------T-AT----A--------T-T---------T-----TTTTTG--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G----------ATT------G-----T--A-A--C-----TT--TGC----ATCGTAA---A-CT--------TT-T-C----T-----TA----T---TT-A-
gi|12769                      : ATA-ACTCGTC-CTAAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------A-G---------T-----TT---G--TG---TT--TTTTG--A-T-ATCTAA-AGAAAG-A-A-CT--T---GGTT------G-----T--A-A--C-----TT--T-G----GTGTTGA---A-CC--------TT-T-T----T-----TG----G---TT-A-A--ATTT
gi|12770                      : ACA-ACTCTTC-CTGAACCA-A---T----C-A----T-------C-AT----A--------G-T---------T-----T----G--TG---AC--TTT-G--A-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-TT--T---GATT------G-----T--A-T--C-----TC--TTG----GCGGTGA---A-CG--------TT-T-C----T-----TC----T---AA-A-A--ATTT
gi|12771                      : ACA-ATTCCTC-CTTAACCT-A---C----A-G----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--GG---AT--TTT-T--A-T-ATCAAA-AGATAG-G-A-CT--T---GATT------T-----T--A-A--T-----TA--TGG----GTGATCA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---C----A--ATTT
gi|12772                      : ATA-ACTACTC-CTTAGCCA-A---C----C-T----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATC-AA-AGAAAG-T-G-AT--T---AATT------G-----C--A-AACT-----TTAATGG----GTTGTAA---A-CT------------------T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12773                      : ACA-ACTCCTC-CTTAACAA-A---A----C-A----A-------A-CT----G--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--A-T-ATCAAA-AGAATG-T-G-CT--T---GATT------G-----G--A-A---------------------GGTGA---A-CT--------TT-T-C----A-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12774                      : ACA-ACTACTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-GT----C--------T-T---------T-----TT---T--TTTTCAT--TTT-G--G-T-A-CAAA-AG-----G-T-CT--T---AGTT------G-----T--A-A--T-----TT--TGG----CTAGTAA---A-TT--------TT-T-T----C-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12775                      : ACA-ACTCGTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AA----A--------T-C---------T-----AT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ACCAGA-ATAAAA-A-G-CT--T---GAAC------A-----T--ATA--T-----TT--AAG----AT-GTAA---G-CT--------TT-T-C----C-----CT----T---TT-A-A--ATT
gi|12776                      : ACG-ACTCCTC-CCGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---A--TG---ATTGTTT-A------ATCAAA-GGAAAA-T-G-TT--T---GATT------T-----A--A-A--C-----TG--TGA----GTGGTAA---A-C---------GA-A-C----C-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12777                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACAA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--ATT----G-T-ATCAAA-CGAATG-A-G-T---------TT------G-----C--A-A--C-----TT--GGC----GTTGTAA---A----------------C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12778                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---T---------------------AG----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAGAG-G-G-TT--T---GATC------A-----T--A-
gi|12779                      : ACA-ACTTATC-CTGTATAA-A---C----A-A----A-------C-TT----A--------T-T---------C-----TG---C--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCGGA-GCAAAG-A-C-TT--T---GATT------G-----C--A-A--C-----TT--TTG----GTGGTGG---A-CT--------TT-C-C----T-----TT----T---
gi|12780                      : ACA-A-TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAC-G--G-T-ATGAAA-AGAAAG-G-A-CT--G---GATTTGG---G-----G--A-A--T-----TA--T------GT----------CT--------TTCT-T----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12781                      : ACA-ACTCATC-TTGAGCCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------T-T---------T-----TTT--A--TG---AT--TTC-A---------AAA-AGAAAG-G-G-CT--T---AATT------T-----T--T-A--C-----TT--TAG----GTGGTCA---A-
gi|12782                      : ACA-ACTCCAC-CTGAAACA-A---C----A-A----T-------G-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-TTC-AA-AGCAAT-G-G-CA--T---GATT------
gi|12783                      : ACA-ACTCCTC-CTGAATCA-A---C----T-A----A-------A-TT----A--------C-T---------T-----TT---G--AG---AT--GTT-T--G-T-AT--AA-AAAAAG---------C---GATT-------------------------------------GTGGTGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---GT-A-A--ATTT
gi|12784                      : ACA-ACTCCTC-CTGAAACA-A---A----C-A----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA------------TT--T-----TT------G-----T--T-G--G-----TT--AGGTGATGTGATAA---T-CA--------TT-T-C----C-----TT----T---TT---A--ATTT
gi|12785                      : ACA-ACT------TGACCCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGGAAT-G-A-CT--T---GA
gi|12786                      : ACT-ATTCGCC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------C-T---------T----------G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATGAAA-AAAAAG-A-A-CT--T---GAT
gi|12787                      : ACA-GCTCCTC-CTGAAACA-A---C----A-A----A-------C-AT----ACATGTATAT-T---------T-----TT---T--TT---AT--TTT-G--G-T-A-------GA---------T--T---GATT------G-----T--A-A--C-----TA--TGG----CTG---------CT--------TT-T-C----T-----TTCTTCT---TT-A-A--ATT
gi|12788                      : ACA-ACTGCTC-CTGAACCA-A---C----C-AAAAGA-------T-AT----T--------T-T---------T-----TT---A--TG---AT--TTT-C--A-T-ATAAAA-ACAAA
gi|12789                      :  CA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-TT--C---GATT------G-----T--T-A--C-----TT--TGT----GT
gi|12790                      :  CG-ACTTCCCACTGACCCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGAAAG-G-A-C-------------------------------------TT--CGG----GCGGTAA---T-CT--------TT-T-T----T-----TT----TC--TT-A-A--ATatggca
gi|12791                      :  CG-ACTCCTC-CTGAACTA-A---T----C-A----A-------C-A-----------------------------------------A---AT--GTT-G--G-T-ATCAAA-CGTAAT-G-G-TT--T---GATT------A-----T----A--T-----TT--TGA----GTG---------CT--------TT-T-T----TGAATGTT----T---TC-A-A--ATT
gi|12792                      :  CA-ACTTCTC-ATGTACCA-AAAGC----C-ATA--A-------C-AA----A--------A-T---------T-----GT---G--TA---AT--TTT-T--A-T-ATCAAA-ATAAAA-G-G-CT--T---GAT
gi|12793                      :   A-ATTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT------TG---AT--TTT-T--G-T-ATCAAA-CGAAAA-G-G-CT--T---GGTT------G-----T--A-A--C-----TT--TGG----ATGGTAA---A-C---------TT-T-C----C-----TC----T---TT-A-A--ATattaaatatctttg
gi|12794                      :   A-ACTACTC-CTGAATAA-A---C----C-A----A-------C-GT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-T--G---------------G-G-G-CT--T---GATT------G-----T--A-AC-T-----TT--TGG----GTGGTAA---A-CT--------TT-T-C----
gi|12795                      :   A-ACTCCTA-ATGAACCA-A---C----C-A----A-------C-A-----------------------------------------G---AT--TTT-G--T-T-ATCAAA-TGAAAC-G-G-CCAAT---GATT------G-----T--A-C--T-----TT--TGA----GTGGTAA---A-CT--------TT-T-T----G-----TT----T---TT-ATA--ATTT
gi|12796                      :   A-ACTCCTC-CTGAAACA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------TGT---------T-----TT------------T--TTT-T--G-T-ATCGGA-A-AAAG-T-T-TT--T---AATT------G-----TA-A-A--TATGAATT--TGG----GTGGTAA---A-CT--------TT-T-C----A-----TT----T---TC---A--ATTT
gi|12797                      :   A-ACTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------CGAT----T--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATT------G-----T--A-G--T-----TT--TTG----G-GATGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----
gi|12798                      :   A-AATCCTC-CTCAACGA-A---C----G-A----A-------C-AT-------------T-T---------T-----TT---G--TT---GT--TCT-G---------------AAAG-G-G-CT--T---GATT------G-----T--A-A--C-----TT--TGA----ATAACCA---A-CA--------TT-T------T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12799                      :   A-ACTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------C-G-----A--------T-T---------C-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-T-AT--T---AATT------G-----T--A-A--T-----TT--TTG----G-GATGA---A-CT--------TT-T-C----T-----
gi|12800                      :   A-ATTCCTC-CAGAACTA-A---C----C-A----T-------A-GG----A--------T-G---------T-----TT---A--TG---AT--TTT-A--G-T-ATCAAA-TGTAA--G-C-CA--T---GATT------G-----T--A-A--T-----GT--TGG----CTAGTAA---C-CG--------TT-T-C----T-----TT----C---TT-T-G--ATTT
gi|12801                      :   A-ACTCCGC-CTGAACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A--------TAT---------T-----TT---GTTTC---AT--TTT-G--G-A-ATTAAA-ACATA--T-A-CT--T---GATT------A-----T--A-
gi|12802                      :   A-ACTCCTC-GTAAAGCA-AT--C----T-A----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTA-A--T-T-TTC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATT------G-----T--A-G--T-----TT--TTG----G-GATGA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----tctatgtat
gi|12803                      :   A-ACTCCTC-TTGATCTA-A---C----C-A----A-------C-AC-------------T-T---------T-----TT---T--TA---AA--CTT-----------AAA-AGAAA--A-G-CT--T---GATT------G-----T--A-T--C-----TT--TGA----GCGTCAA---A-C------------C-C----C-----TT----T---TT-A-
gi|12804                      :   A-ACTCCTT-CTGAACGA-A---C----C-A----AAT-----T-AT----T--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-TAATAAAA-ACAAA
gi|12805                      :   A-ACTCTTT-GTGAAGCA-A---C----CCA----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--A-T-AT---A-AGAAAT-T-A-AT--T---AATT------A-----T--A-G--T-----TT--TTG----GT-ATAA---A-CA--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12806                      :    -ACTCATC-CTGAACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--T-T-ATGAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATT------G-----A--A-A--A-----TA--TGG----GAGGTTA---A-CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-C-A--GTTT
gi|12807                      :    -ACTTCTT-CTGAACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A----------T---------T-----TT---G--TC---AT--TTA-A--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-TT--T-------------------T--A--------------TGA----GTGGTGA---A-CT--------TT-T-CTT--T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12808                      :    -ATTCCTC-CTGAAC------------------------------T----A--------T-T---------T-----TT---A-------AT--TTT-A--G-T-ATCAAA-AAGAAA-G-G-TT--T---GATT------G-----T--T-A--T-----TT--TGG----ATGGTAA---A-CTTTTGTCTCTT-T-T----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12809                      :    -ATTTCTC-CTGAAT---A---T-----------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---T--TAT--AT--TTT-G--A-T-ATCAAA-GAGAAG-C-G-TT--T---GATC------C-----T--A----------TC--TGGTA--GTGGTAA---T-CG--------TT-T-C----T-----CT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12810                      :      CTCCTC-CTGAACCA-A---C----A-G----A-------C-CT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AT--TTT-G--GGT-ATGAAA-AGAAAC-G-G-AA--T---AATT------G-----T--A-A--C-----TT--TGG----GTGGTAA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12811                      :      CCCCTC-CTGAAACA-A---C----C-A----A-------C-GG----C--------T-T---------T-----TT---G--TGG--AT--T---G--A-T-ATAAAA-ATAAAA-A-G-CT--T---ATTT------T-----T--A-A--T-----TT--TGG----GTGGTAA---T-TT--------TT-T-C----T-----CT----T---TC-A-A--ATTT
gi|12812                      :      CTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------C-A-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATT------G-----T--A-G--T-----TT--TTG----G-GATGA---A-CA--------T---------T-----TT----T---TT-A-ACGATTT
gi|12813                      :       TCCTT-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----TT---G--TG---AT--AAT-G--G-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTA---A-----------TT-T-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12814                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--A---GA----------------------------TT--TGG----ATGGTTA---A------------T-T-T----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12815                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---------------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTA---ATTT--------TT-T-C----T-----TT----T---TA-A-A--ATTT
gi|12816                      :       TCCTG-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTATT-T-TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12817                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-A--G-T-AACAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTTTGGAGA-----T--A-A--T-----TT--T------------------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12818                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTA---T-TT--------TT-T-T----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12819                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TAT-G--G-A-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTAT--T-TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12820                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTAT--T-TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ACTT
gi|12821                      :       TCTTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAA-G-G-CT--T---GATT------GGGAGAT--T-A--T-----TT----------------------T--------TT-T-C----T-----TT----T---TC-A-A--ATTT
gi|12822                      :       TTCTC-CAGAAACA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGTAAG-G-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTAT--T-TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12823                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----G-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTA---ATTT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12824                      :       TTCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTA---ATTT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12825                      :       TCCTC-CAGAATCG-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTT---T-TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TTAA-A--ATTT
gi|12826                      :       TCCTT-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-G---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-TGAAAG-G-G-CT--T---AA----------------------------CT--TGG----G-AGAGATTTG-TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12827                      :       TCCCC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTAT--T-TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12828                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--T-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA----------------------------TT--TGG----GAGATTA---ATTT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12829                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AA----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--T---AATT------T-----G--G-A--T-----TT--T------------------TT--------TT-C-C----T-----TT----T---TT-G-A--ATTT
gi|12830                      :         CTC-CTGAACCA-A---C----C-G----A-------C-AG----A--------T-T---------TC----TT---A--TG---AT--TTT-T--G-T-ATCACA-AGAAAG-A-G-CT--T---GATT------A-----C--A-A--T-----TT--T-G----GTGATAA---A-CT--------TT-T-T----T-----CT----T---TT-A-A--ATT
gi|12831                      :         CTC-CTGAACCG-A---C----C-A----G-------C-AT---------------T---------T-----TT---G--TG---AT--TTC-G--G-T-AT-AAA-ACAAAT-G-G-CT--C---GATT------G-----T--A-A--A-----TT--TTG----GTGGTAA---A-CC--------TT-T-C----T-----TT----TTAGTT-A-A--ATTT
gi|12832                      :         CTA-CTGATTCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGGAAG-G-A-CT--T-------------------------------------TGG----GTGGTAA---A-CT--------TT-T-CTT--T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12833                      :          TC-TTAAAGTA-A---T----C-A----C-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TT----T--TTC-G--G-T-ATAAAA-AGAAAA-A-G-CT--TAGCGA-T------A-----T--A----------TT--TGA----GTGGTAA---A-CT--------TT-C-C----T-----CT----G---TT-C-A--ATTT
gi|12834                      :            -CTGACCCGGA---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--A-T-ATCGAA-AGGAAG-G-A-CT--T-------------------------------------TGG----GCGGTAA---A-CT--------TT-T-CTCTTT-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12835                      :              TGGACCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-G-GT--C---GATA------G-----T--A-A--C-----CT--CAG----TTG--GA---A-CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12836                      :              TGAACCA-A---C----C-A----A-------C-A-----------------------------------------G---GT--TTT-G--C-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-CT--T---GATT------G-----T--A-T--T-----TG--TAG----GTGGAAA---A-CT--------TT-TAC----T-----TT----
gi|12837                      :                    A-A---C----T-A----A-------C-TT----A--------T-TG--------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G---AT-AAA-AAAATG-G-A-CT------GACT------G-----T--A-A--T-----TT--TTG----GTGGTAT---A--T--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12840                      :                                                 T----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAGA-GGAAAG-G-A-AT--T---GATT------G-----TTAA-A--T-----TT--
gi|12841                      :                                                                                               T--TCC-G--G-A-ATCAAA-C--AAG-G-G-TT--T---GATT------G-----C--A-A--C-----TT--CGG----GTGATGA---A-C---------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12842                      :                                                                                                   TT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--T---GATT------G-----T--A-A--A-----GT--TGG----GAGGGGA---A-AG--------TA-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12843                      :                                                                                                       --G-T-ATAAAA-AGAA-G-G-G-AT--T---GGTT------G-----T--A-A--T-----TT---GG----TTGGTAA---A-CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATT

lowQualScore                  :    0       0        0 33333333 0 1111 2222222 0  0000 11111111 0 222222222 11111  111 00  111  00   0 00 0 0      0      0 0 0  00 000  2 00 0 6666666666666  000  00 2222 3   3 22 444444  11111111  0 0 2222 11111  1111 111  0 0 00    
lowQualScore                  :    .       .        . ........ . .... ....... .  .... ........ . ......... .....  ... ..  ...  ..   . .. . .      .      . . .  .. ...  . .. . .............  ...  .. .... .   . .. ......  ........  . . .... .....  .... ...  . . ..    
lowQualScore                  :    6       4        4 66666666 4 5555 3333333 4  9999 55555555 8 555555555 44444  777 66  555  66   4 66 4 4      4      4 4 4  66 777  0 77 4 7777777777777  777  66 0000 0   3 88 000000  66666666  4 4 2222 11111  0000 333  5 5 77    
consensus                     : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
Reference ( family-301 )      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12742                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TT---AT--TTT-G--G-T-ATCAGA-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----ATGGTAT--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12743                      : ACA-ACTTCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----T-TT---AA--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TC-A-A--GTTT
gi|12744                      : ACC-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-T-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----ATTGTGA--A------TT--------TT-T-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12745                      : ACA-ATTCCTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------G-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATTAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TT--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12746                      : ACA-ACTCTTC-CTGAGCTA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TTT-A--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-CT--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------GT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12747                      : ACA-ACTCTTC-CTGAAACA-A---C----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-GCCA-T-ATCAAA-AGGAAGAG-G-CT--T---GGTCG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CG--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12748                      : ACA-ACTCCTC-CTGATCCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TG--A----GAAGTGA--G------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-G-A--ATTT
gi|12749                      : ACA-ACTCCTC-CTGAATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-G-ACCAAA-AG--GG-G-G-TT--T---GGTTG-C-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12750                      : ACA-ACTCCTT-CTTAACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TG---T--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GGTTG-T-A------A----T-TA---AG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---AT-A-A--ATTTatactt
gi|12751                      : ACACACTCCTC-CTGAACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GAATG-A-A------A----A-TT---TG--A----GAGG-GA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TA-A-A--ATTT
gi|12752                      : ACA-TCTCGTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AC--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-AT--T---GACTG-T--------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12753                      : ACA-GCTCCTT-CTGAACAA-A---C----G-A----A-------C-TT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-ACAATG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TC--G----GTAGTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12754                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---T----C-A----AA------C-GT----A--------T-T---------T-----AT---G--TG---AT--TTT-A--T-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TG--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-T------T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12755                      : ACA-ACTCTTC-CTGAACCT-A---C----A-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TTTT-G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATGAAA-A--AAG-G-G-CT--T---GACTG-T-A------A----C-TT---TT--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12756                      : ACA-ACTTCTC-CTGAACAA-A---C----C-A----A-------T-AT----A--------A-AA--------T-----TT---G--GG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-TT--T---GATT--T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTTA--A------CT--------TT-C-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12757                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-G---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AG-AAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----T-TT-------G----GCAGTG-----------T--------TT-T-T----T-----TT----T---CT-A-
gi|12758                      : ACA-ACACCTC-CTGAACCA-A---CTATCC-A----A-------C-AT----A--------T-TATTTTTTTTT-----TT---G--TT---AT--TTT-G--G-T-GTCAAA-AGAAAG-A-T-CT--T---GATTT-T-A------A----C-TT---AG--G----ATGTTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT---A--ATTT
gi|12759                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----AACATATTT-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTA-A--G-T-ATCAAT-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-C-A------G----C-TT---AG---------GGTGA--A------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12760                      : ACA-ACTCGTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-TT----A--------T-T---------TAAATTTT---A--TG---AT--TTT-T--G-T-ATAAAA-AAAAAA-G-GTCT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-T----T-----TT----
gi|12761                      : ACA-GCTCCTC-CCGAATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TTT-G--T-T-ATCAAAGAAAAAG-G-T-CT--T---GACTG-T-G------A----A-TT---TG--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-C-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12762                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACTA-A---A----C-A----A-------C-ATGATTA--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TCT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-AT--C---GATTA-T-T------A----A-TT---TT--G----GTGGCAA--A------CT--------GT-T-C----T-----AT----T---AT-A-A--ATTT
gi|12763                      : ACA-ACGCCTC-CTGAACCA-A---A----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T----G--TG---AT--TTT-G--A-T-AACAAA-AGAAAG-C-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----AGGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12764                      : ACA-ACTTGTC-CTGAGCCA-A-----------------------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AA--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--T---CATTG-T-T------A----A-TT---TG--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12765                      : ACA-ACTCCTC-CAAAATTA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-CGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TT--G----GAGATTA--A-----------------T-T-T----T-----GT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12766                      : ACA-ACTC-----TGCATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT------T-----T--TTT-G--G-T-ATCAAG-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--T----GTGGTAA--A------A---------TT-T-C----T-----CT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12767                      : ACA-ACTTCCC-CTGAACCA-A---T----T-A----A-------C-A-----A--------T-G---------T----------G--TG---GG--TTT-G--G-T-ATTAAA-AAAAAA-GAG-TT--T---TATTG-T-A------A----T-TT---TA--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12768                      : ACA-ACTCCA----GAACTA-A---A----C-A----C-------T-AT----A--------T-T---------T-----TTTTTG--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G----------ATTG-T-A------A----C-TT---TG--C----ATCGTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TA----T---TT-A-
gi|12769                      : ATA-ACTCGTC-CTAAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------A-G---------T-----TT---G--TG---TT--TTTTG--A-T-ATCTAA-AGAAAG-A-A-CT--T---GGTTG-T-A------A----C-TT---T---G----GTGTTGA--A------CC--------TT-T-T----T-----TG----G---TT-A-A--ATTT
gi|12770                      : ACA-ACTCTTC-CTGAACCA-A---T----C-A----T-------C-AT----A--------G-T---------T-----T----G--TG---AC--TTT-G--A-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-TT--T---GATTG-T-A------T----C-TC---TT--G----GCGGTGA--A------CG--------TT-T-C----T-----TC----T---AA-A-A--ATTT
gi|12771                      : ACA-ATTCCTC-CTTAACCT-A---C----A-G----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--GG---AT--TTT-T--A-T-ATCAAA-AGATAG-G-A-CT--T---GATTT-T-A------A----T-TA---TG--G----GTGATCA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---C----A--ATTT
gi|12772                      : ATA-ACTACTC-CTTAGCCA-A---C----C-T----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATC-AA-AGAAAG-T-G-AT--T---AATTG-CAA------A----C-TTTAATG--G----GTTGTAA--A------CT------------------T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12773                      : ACA-ACTCCTC-CTTAACAA-A---A----C-A----A-------A-CT----G--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--A-T-ATCAAA-AGAATG-T-G-CT--T---GATTG-G-A------A----------------------GGTGA--A------CT--------TT-T-C----A-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12774                      : ACA-ACTACTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-GT----C--------T-T---------T-----TT---T--TTTTCAT--TTT-G--G-T-A-CAAA-AG-----G-T-CT--T---AGTTG-T-A------A----T-TT---TG--G----CTAGTAA--A------TT--------TT-T-T----C-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12775                      : ACA-ACTCGTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AA----A--------T-C---------T-----AT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ACCAGA-ATAAAA-A-G-CT--T---GAACA-T-A------T----A-TT---TA--A----GATGTAA--G------CT--------TT-T-C----C-----CT----T---TT-A-A--ATT
gi|12776                      : ACG-ACTCCTC-CCGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---A--TG---ATTGTTT-A------ATCAAA-GGAAAA-T-G-TT--T---GATTT-A-A------A----C-TG---TG--A----GTGGTAA--A------C---------GA-A-C----C-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12777                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACAA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--ATT----G-T-ATCAAA-CGAATG-A-G-T---------TTG-C-A------A----C-TT---GG--C----GTTGTAA--A---------------------C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12778                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---T---------------------AG----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAGAG-G-G-TT--T---GATCA-T-A------
gi|12779                      : ACA-ACTTATC-CTGTATAA-A---C----A-A----A-------C-TT----A--------T-T---------C-----TG---C--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCGGA-GCAAAG-A-C-TT--T---GATTG-C-A------A----C-TT---TT--G----GTGGTGG--A------CT--------TT-C-C----T-----TT----T---
gi|12780                      : ACA-A-TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAC-G--G-T-ATGAAA-AGAAAG-G-A-CT--G---GA--------------------TT---TG--G----G----GA--ATTATGTCT--------TTCT-T----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12781                      : ACA-ACTCATC-TTGAGCCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------T-T---------T-----TTT--A--TG---AT--TTC-A---------AAA-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTT-T-T------A----C-TT---TA--G----GTGGTCA--A------
gi|12782                      : ACA-ACTCCAC-CTGAAACA-A---C----A-A----T-------G-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-TTC-AA-AGCAAT-G-G-CA--T---GATT
gi|12783                      : ACA-ACTCCTC-CTGAATCA-A---C----T-A----A-------A-TT----A--------C-T---------T-----TT---G--AG---AT--GTT-T--G-T-AT--AA-AAAAAG---------C---GATT--------------------------------GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---GT-A-A--ATTT
gi|12784                      : ACA-ACTCCTC-CTGAAACA-A---A----C-A----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA------------TT--T-----TTG-T-T------G----G-TT---AG--GTGATGTGATAA--T------CA--------TT-T-C----C-----TT----T---TT---A--ATTT
gi|12785                      : ACA-ACT------TGACCCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGGAAT-G-A-CT--T---GA
gi|12786                      : ACT-ATTCGCC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------C-T---------T----------G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATGAAA-AAAAAG-A-A-CT--T---GAT
gi|12787                      : ACA-GCTCCTC-CTGAAACA-A---C----A-A----A-------C-AT----ACATGTATAT-T---------T-----TT---T--TT---AT--TTT-G--G-T-A-------GA---------T--T---GATTG-T-A------A----C-TA---TG--G----CTG-------------CT--------TT-T-C----T-----TTCTTCT---TT-A-A--ATT
gi|12788                      : ACA-ACTGCTC-CTGAACCA-A---C----C-AAAAGA-------T-AT----T--------T-T---------T-----TT---A--TG---AT--TTT-C--A-T-ATAAAA-ACAAA
gi|12789                      :  CA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-TT--C---GATTG-T-T------A----C-TT---TG--T----GT
gi|12790                      :  CG-ACTTCCCACTGACCCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGAAAG-G--------------------------A----C-TT---CG--G----GCGGTAA--T------CT--------TT-T-T----T-----TT----TC--TT-A-A--ATatggca
gi|12791                      :  CG-ACTCCTC-CTGAACTA-A---T----C-A----A-------C-A-----------------------------------------A---AT--GTT-G--G-T-ATCAAA-CGTAAT-G-G-TT--T---GATTA-T--------A----T-TT---TG--A----GTG-------------CT--------TT-T-T----TGAATGTT----T---TC-A-A--ATT
gi|12792                      :  CA-ACTTCTC-ATGTACCA-AAAGC----C-ATA--A-------C-AA----A--------A-T---------T-----GT---G--TA---AT--TTT-T--A-T-ATCAAA-ATAAAA-G-G-CT--T---GATAT-T-A------AATATC-TT---TG--
gi|12793                      :   A-ATTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT------TG---AT--TTT-T--G-T-ATCAAA-CGAAAA-G-G-CT--T---GGTTG-T-A------A----C-TT---TG--G----ATGGTAA--A------C---------TT-T-C----C-----TC----T---TT-A-A--AT
gi|12794                      :   A-ACTACTC-CTGAATAA-A---C----C-A----A-------C-GT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-T--G---------------G-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----CTTT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----
gi|12795                      :   A-ACTCCTA-ATGAACCA-A---C----C-A----A-------C-A-----------------------------------------G---AT--TTT-G--T-T-ATCAAA-TGAAAC-G-G-CCAAT---GATTG-T-A------C----T-TT---TG--A----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-T----G-----TT----T---TT-ATA--ATTT
gi|12796                      :   A-ACTCCTC-CTGAAACA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------TGT---------T-----TT------------T--TTT-T--G-T-ATCGGA-A-AAAG-T-T-TT--T---AATTG-T-AAATATGA----A-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----A-----TT----T---TC---A--ATTT
gi|12797                      :   A-ACTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------CGAT----T--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----
gi|12798                      :   A-AATCCTC-CTCAACGA-A---C----G-A----A-------C-AT-------------T-T---------T-----TT---G--TT---GT--TCT-G---------------AAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--A----ATAACCA--A------CA--------TT-T------T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12799                      :   A-ACTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------C-G-----A--------T-T---------C-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-T-AT--T---AATTG-T-A------A----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----
gi|12800                      :   A-ATTCCTC-CAGAACTA-A---C----C-A----T-------A-GG----A--------T-G---------T-----TT---A--TG---AT--TTT-A--G-T-ATCAAA-TGTAA--G-C-CA--T---GATTG-T-A------A----T-GT---TG--G----CTAGTAA--C------CG--------TT-T-C----T-----TT----C---TT-T-G--ATTT
gi|12801                      :   A-ACTCCGC-CTGAACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A--------TAT---------T-----TT---GTTTC---AT--TTT-G--G-A-ATTAAA-ACATA--T-A-CT--T---GATTA-T-A------T----C-TA---TG--
gi|12802                      :   A-ACTCCTC-GTAAAGCA-AT--C----T-A----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTA-A--T-T-TTC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----tat
gi|12803                      :   A-ACTCCTC-TTGATCTA-A---C----C-A----A-------C-AC-------------T-T---------T-----TT---T--TA---AA--CTT-----------AAA-AGAAA--A-G-CT--T---GATTG-T-A------T----C-TT---TG--A----GCGTCAA--A------C------------C-C----C-----TT----T---TT-A-
gi|12804                      :   A-ACTCCTT-CTGAACGA-A---C----C-A----AAT-----T-AT----T--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-TAATAAAA-ACAAA
gi|12805                      :   A-ACTCTTT-GTGAAGCA-A---C----CCA----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--A-T-AT---A-AGAAAT-T-A-AT--T---AATTA-T-A------G----T-TT---TT--G----GT-ATAA--A------CA--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12806                      :    -ACTCATC-CTGAACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--T-T-ATGAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-A-A------A----A-TA---TG--G----GAGGTTA--A------CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-C-A--GTTT
gi|12807                      :    -ACTTCTT-CTGAACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A----------T---------T-----TT---G--TC---AT--TTA-A--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-TT--T---------T-A------------------TG--A----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-CTT--T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12808                      :    -ATTCCTC-CTGAAC------------------------------T----A--------T-T---------T-----TT---A-------AT--TTT-A--G-T-ATCAAA-AAGAAA-G-G-TT--T---GATTG-T-T------A----T-TT---TG--G----ATGGTAA--A------CTTTTGTCTCTT-T-T----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12809                      :    -ATTTCTC-CTGAAT---A---T-----------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---T--TAT--AT--TTT-G--A-T-ATCAAA-GAGAAG-C-G-TT--T---GATCC-T-A-------------TC---TG--GTA--GTGGTAA--T------CG--------TT-T-C----T-----CT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12810                      :      CTCCTC-CTGAACCA-A---C----A-G----A-------C-CT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AT--TTT-G--GGT-ATGAAA-AGAAAC-G-G-AA--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12811                      :      CCCCTC-CTGAAACA-A---C----C-A----A-------C-GG----C--------T-T---------T-----TT---G--TGG--AT--T---G--A-T-ATAAAA-ATAAAA-A-G-CT--T---ATTTT-T-A------A----T-TT---TG--G----GTGGTAA--T------TT--------TT-T-C----T-----CT----T---TC-A-A--ATTT
gi|12812                      :      CTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------C-A-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CA--------T---------T-----TT----T---TT-A-ACGATTT
gi|12813                      :       TCCTT-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----TT---G--TG---AT--AAT-G--G-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--A----------------TT-T-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12814                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--A---GA--------------------TT---TG--G----ATGGTTA--A-----------------T-T-T----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12815                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---------------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TA-A-A--ATTT
gi|12816                      :       TCCTG-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTATTT------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12817                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-A--G-T-AACAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GAT-------------------TT---TG--G----A-GAT-A--ATTTT--TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12818                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--T------TT--------TT-T-T----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12819                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TAT-G--G-A-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12820                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ACTT
gi|12821                      :       TCTTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAA-G-G-CT--T---GA---------------------T---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TC-A-A--ATTT
gi|12822                      :       TTCTC-CAGAAACA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGTAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12823                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----G-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12824                      :       TTCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12825                      :       TCCTC-CAGAATCG-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTT--T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TTAA-A--ATTT
gi|12826                      :       TCCTT-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-G---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-TGAAAG-G-G-CT------------T-A------A----C-TT---GG--GA---GAGATTT--G------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12827                      :       TCCCC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12828                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--T-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12829                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AA----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--T---AATTT-G-G------A----T-TT---T------------------------TT--------TT-C-C----T-----TT----T---TT-G-A--ATTT
gi|12830                      :         CTC-CTGAACCA-A---C----C-G----A-------C-AG----A--------T-T---------TC----TT---A--TG---AT--TTT-T--G-T-ATCACA-AGAAAG-A-G-CT--T---GATTA-C-A------A----T-TT---T---G----GTGATAA--A------CT--------TT-T-T----T-----CT----T---TT-A-A--ATT
gi|12831                      :         CTC-CTGAACCG-A---C----C-A----G-------C-AT---------------T---------T-----TT---G--TG---AT--TTC-G--G-T-AT-AAA-ACAAAT-G-G-CT--C---GATTG-T-A------A----A-TT---TT--G----GTGGTAA--A------CC--------TT-T-C----T-----TT----TTAGTT-A-A--ATTT
gi|12832                      :         CTA-CTGATTCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGGAAG-G--------------------------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-CTT--T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12833                      :          TC-TTAAAGTA-A---T----C-A----C-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TT----T--TTC-G--G-T-ATAAAA-AGAAAA-A-G-CT--TAGCGA-TA-T-A-------------TT---TG--A----GTGGTAA--A------CT--------TT-C-C----T-----CT----G---TT-C-A--ATTT
gi|12834                      :            -CTGACCCGGA---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--A-T-ATCGAA-AGGAAG-G--------------------------A----C-TT---TG--G----GCGGTAA--A------CT--------TT-T-CTCTTT-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12835                      :              TGGACCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-G-GT--C---GATAG-T-A------A----C-CT---CA--G----TTG--GA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12836                      :              TGAACCA-A---C----C-A----A-------C-A-----------------------------------------G---GT--TTT-G--C-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-CT--T---GATTG-T-A-------------TT---TGTAG----GTGGAAA--A------CT--------TT-TAC----T-----TT----
gi|12837                      :                    A-A---C----T-A----A-------C-TT----A--------T-TG--------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G---AT-AAA-AAAATG-G-A-CT------GACTG-T-A------A----T-TT---TT--G----GTGGTAT--A-------T--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12840                      :                                                 T----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAGA-GGAAAG-G-A-AT--T---GATTGTT-A------A----A-TT---T
gi|12841                      :                                                                                               T--TCC-G--G-A-ATCAAA-C--AAG-G-G-TT--T---GATTG-C-A------A----C-TT---CG--G----GTGATGA--A------C---------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12842                      :                                                                                                   TT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-GT---TG--G----GAGGGGA--A------AG--------TA-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12843                      :                                                                                                       --G-T-ATAAAA-AGAA-G-G-G-AT--T---GGTTG-T-A------A------TT---TG--G----TTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATT

lowQualScore                  :    0       0        0 33333333 0 1111 2222222 0  0000 11111111 0 222222222 11111  111 00  111  00   0 00 0 0      0      0 0 0  00 000  2 00 0 6666666666666  000  00 2222 3   3 22 444444  11111111  0 0 2222 11111  1111 111  0 0 00    
lowQualScore                  :    .       .        . ........ . .... ....... .  .... ........ . ......... .....  ... ..  ...  ..   . .. . .      .      . . .  .. ...  . .. . .............  ...  .. .... .   . .. ......  ........  . . .... .....  .... ...  . . ..    
lowQualScore                  :    6       4        4 66666666 4 5555 3333333 4  9999 55555555 8 555555555 44444  777 66  555  66   4 66 4 4      4      4 4 4  66 777  0 77 4 7777777777777  777  66 0000 0   3 88 000000  66666666  4 4 2222 11111  0000 333  5 5 77    
consensus                     : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
Reference ( family-301 )      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12742                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TT---AT--TTT-G--G-T-ATCAGA-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----ATGGTAT--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12743                      : ACA-ACTTCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----T-TT---AA--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TC-A-A--GTTT
gi|12744                      : ACC-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-T-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----ATTGTGA--A------TT--------TT-T-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12745                      : ACA-ATTCCTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------G-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATTAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TT--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12746                      : ACA-ACTCTTC-CTGAGCTA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TTT-A--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-CT--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------GT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12747                      : ACA-ACTCTTC-CTGAAACA-A---C----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-GCCA-T-ATCAAA-AGGAAGAG-G-CT--T---GGTCG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CG--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12748                      : ACA-ACTCCTC-CTGATCCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TG--A----GAAGTGA--G------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-G-A--ATTT
gi|12749                      : ACA-ACTCCTC-CTGAATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-G-ACCAAA-AG--GG-G-G-TT--T---GGTTG-C-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12750                      : ACA-ACTCCTT-CTTAACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TG---T--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GGTTG-T-A------A----T-TA---AG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---AT-A-A--ATTTatactt
gi|12751                      : ACACACTCCTC-CTGAACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GAATG-A-A------A----A-TT---TG--A----GAGG-GA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TA-A-A--ATTT
gi|12752                      : ACA-TCTCGTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AC--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-AT--T---GACTG-T--------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12753                      : ACA-GCTCCTT-CTGAACAA-A---C----G-A----A-------C-TT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-ACAATG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TC--G----GTAGTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12754                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---T----C-A----AA------C-GT----A--------T-T---------T-----AT---G--TG---AT--TTT-A--T-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TG--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-T------T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12755                      : ACA-ACTCTTC-CTGAACCT-A---C----A-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TTTT-G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATGAAA-A--AAG-G-G-CT--T---GACTG-T-A------A----C-TT---TT--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12756                      : ACA-ACTTCTC-CTGAACAA-A---C----C-A----A-------T-AT----A--------A-AA--------T-----TT---G--GG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-TT--T---GATT--T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTTA--A------CT--------TT-C-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12757                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-G---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AG-AAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----T-TT-------G----GCAGTG-----------T--------TT-T-T----T-----TT----T---CT-A-
gi|12758                      : ACA-ACACCTC-CTGAACCA-A---CTATCC-A----A-------C-AT----A--------T-TATTTTTTTTT-----TT---G--TT---AT--TTT-G--G-T-GTCAAA-AGAAAG-A-T-CT--T---GATTT-T-A------A----C-TT---AG--G----ATGTTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT---A--ATTT
gi|12759                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----AACATATTT-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTA-A--G-T-ATCAAT-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-C-A------G----C-TT---AG---------GGTGA--A------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12760                      : ACA-ACTCGTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-TT----A--------T-T---------TAAATTTT---A--TG---AT--TTT-T--G-T-ATAAAA-AAAAAA-G-GTCT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-T----T-----TT----
gi|12761                      : ACA-GCTCCTC-CCGAATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TTT-G--T-T-ATCAAAGAAAAAG-G-T-CT--T---GACTG-T-G------A----A-TT---TG--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-C-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12762                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACTA-A---A----C-A----A-------C-ATGATTA--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TCT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-AT--C---GATTA-T-T------A----A-TT---TT--G----GTGGCAA--A------CT--------GT-T-C----T-----AT----T---AT-A-A--ATTT
gi|12763                      : ACA-ACGCCTC-CTGAACCA-A---A----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T----G--TG---AT--TTT-G--A-T-AACAAA-AGAAAG-C-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----AGGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12764                      : ACA-ACTTGTC-CTGAGCCA-A-----------------------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AA--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--T---CATTG-T-T------A----A-TT---TG--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12765                      : ACA-ACTCCTC-CAAAATTA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-CGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TT--G----GAGATTA--A-----------------T-T-T----T-----GT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12766                      : ACA-ACTC-----TGCATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT------T-----T--TTT-G--G-T-ATCAAG-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--T----GTGGTAA--A------A---------TT-T-C----T-----CT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12767                      : ACA-ACTTCCC-CTGAACCA-A---T----T-A----A-------C-A-----A--------T-G---------T----------G--TG---GG--TTT-G--G-T-ATTAAA-AAAAAA-GAG-TT--T---TATTG-T-A------A----T-TT---TA--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12768                      : ACA-ACTCCA----GAACTA-A---A----C-A----C-------T-AT----A--------T-T---------T-----TTTTTG--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G----------ATTG-T-A------A----C-TT---TG--C----ATCGTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TA----T---TT-A-
gi|12769                      : ATA-ACTCGTC-CTAAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------A-G---------T-----TT---G--TG---TT--TTTTG--A-T-ATCTAA-AGAAAG-A-A-CT--T---GGTTG-T-A------A----C-TT---T---G----GTGTTGA--A------CC--------TT-T-T----T-----TG----G---TT-A-A--ATTT
gi|12770                      : ACA-ACTCTTC-CTGAACCA-A---T----C-A----T-------C-AT----A--------G-T---------T-----T----G--TG---AC--TTT-G--A-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-TT--T---GATTG-T-A------T----C-TC---TT--G----GCGGTGA--A------CG--------TT-T-C----T-----TC----T---AA-A-A--ATTT
gi|12771                      : ACA-ATTCCTC-CTTAACCT-A---C----A-G----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--GG---AT--TTT-T--A-T-ATCAAA-AGATAG-G-A-CT--T---GATTT-T-A------A----T-TA---TG--G----GTGATCA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---C----A--ATTT
gi|12772                      : ATA-ACTACTC-CTTAGCCA-A---C----C-T----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATC-AA-AGAAAG-T-G-AT--T---AATTG-CAA------A----C-TTTAATG--G----GTTGTAA--A------CT------------------T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12773                      : ACA-ACTCCTC-CTTAACAA-A---A----C-A----A-------A-CT----G--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--A-T-ATCAAA-AGAATG-T-G-CT--T---GATTG-G-A------A----------------------GGTGA--A------CT--------TT-T-C----A-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12774                      : ACA-ACTACTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-GT----C--------T-T---------T-----TT---T--TTTTCAT--TTT-G--G-T-A-CAAA-AG-----G-T-CT--T---AGTTG-T-A------A----T-TT---TG--G----CTAGTAA--A------TT--------TT-T-T----C-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12775                      : ACA-ACTCGTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AA----A--------T-C---------T-----AT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ACCAGA-ATAAAA-A-G-CT--T---GAACA-T-A------T----A-TT---TA--A----GATGTAA--G------CT--------TT-T-C----C-----CT----T---TT-A-A--ATT
gi|12776                      : ACG-ACTCCTC-CCGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---A--TG---ATTGTTT-A------ATCAAA-GGAAAA-T-G-TT--T---GATTT-A-A------A----C-TG---TG--A----GTGGTAA--A------C---------GA-A-C----C-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12777                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACAA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--ATT----G-T-ATCAAA-CGAATG-A-G-T---------TTG-C-A------A----C-TT---GG--C----GTTGTAA--A---------------------C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12778                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---T---------------------AG----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAGAG-G-G-TT--T---GATCA-T-A------
gi|12779                      : ACA-ACTTATC-CTGTATAA-A---C----A-A----A-------C-TT----A--------T-T---------C-----TG---C--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCGGA-GCAAAG-A-C-TT--T---GATTG-C-A------A----C-TT---TT--G----GTGGTGG--A------CT--------TT-C-C----T-----TT----T---
gi|12780                      : ACA-A-TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAC-G--G-T-ATGAAA-AGAAAG-G-A-CT--G---GA--------------------TT---TG--G----G----GA--ATTATGTCT--------TTCT-T----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12781                      : ACA-ACTCATC-TTGAGCCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------T-T---------T-----TTT--A--TG---AT--TTC-A---------AAA-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTT-T-T------A----C-TT---TA--G----GTGGTCA--A------
gi|12782                      : ACA-ACTCCAC-CTGAAACA-A---C----A-A----T-------G-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-TTC-AA-AGCAAT-G-G-CA--T---GATT
gi|12783                      : ACA-ACTCCTC-CTGAATCA-A---C----T-A----A-------A-TT----A--------C-T---------T-----TT---G--AG---AT--GTT-T--G-T-AT--AA-AAAAAG---------C---GATT--------------------------------GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---GT-A-A--ATTT
gi|12784                      : ACA-ACTCCTC-CTGAAACA-A---A----C-A----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA------------TT--T-----TTG-T-T------G----G-TT---AG--GTGATGTGATAA--T------CA--------TT-T-C----C-----TT----T---TT---A--ATTT
gi|12785                      : ACA-ACT------TGACCCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGGAAT-G-A-CT--T---GA
gi|12786                      : ACT-ATTCGCC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------C-T---------T----------G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATGAAA-AAAAAG-A-A-CT--T---GAT
gi|12787                      : ACA-GCTCCTC-CTGAAACA-A---C----A-A----A-------C-AT----ACATGTATAT-T---------T-----TT---T--TT---AT--TTT-G--G-T-A-------GA---------T--T---GATTG-T-A------A----C-TA---TG--G----CTG-------------CT--------TT-T-C----T-----TTCTTCT---TT-A-A--ATT
gi|12788                      : ACA-ACTGCTC-CTGAACCA-A---C----C-AAAAGA-------T-AT----T--------T-T---------T-----TT---A--TG---AT--TTT-C--A-T-ATAAAA-ACAAA
gi|12789                      :  CA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-TT--C---GATTG-T-T------A----C-TT---TG--T----GT
gi|12790                      :  CG-ACTTCCCACTGACCCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGAAAG-G--------------------------A----C-TT---CG--G----GCGGTAA--T------CT--------TT-T-T----T-----TT----TC--TT-A-A--ATatggca
gi|12791                      :  CG-ACTCCTC-CTGAACTA-A---T----C-A----A-------C-A-----------------------------------------A---AT--GTT-G--G-T-ATCAAA-CGTAAT-G-G-TT--T---GATTA-T--------A----T-TT---TG--A----GTG-------------CT--------TT-T-T----TGAATGTT----T---TC-A-A--ATT
gi|12792                      :  CA-ACTTCTC-ATGTACCA-AAAGC----C-ATA--A-------C-AA----A--------A-T---------T-----GT---G--TA---AT--TTT-T--A-T-ATCAAA-ATAAAA-G-G-CT--T---GATAT-T-A------AATATC-TT---TG--
gi|12793                      :   A-ATTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT------TG---AT--TTT-T--G-T-ATCAAA-CGAAAA-G-G-CT--T---GGTTG-T-A------A----C-TT---TG--G----ATGGTAA--A------C---------TT-T-C----C-----TC----T---TT-A-A--AT
gi|12794                      :   A-ACTACTC-CTGAATAA-A---C----C-A----A-------C-GT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-T--G---------------G-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----CTTT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----
gi|12795                      :   A-ACTCCTA-ATGAACCA-A---C----C-A----A-------C-A-----------------------------------------G---AT--TTT-G--T-T-ATCAAA-TGAAAC-G-G-CCAAT---GATTG-T-A------C----T-TT---TG--A----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-T----G-----TT----T---TT-ATA--ATTT
gi|12796                      :   A-ACTCCTC-CTGAAACA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------TGT---------T-----TT------------T--TTT-T--G-T-ATCGGA-A-AAAG-T-T-TT--T---AATTG-T-AAATATGA----A-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----A-----TT----T---TC---A--ATTT
gi|12797                      :   A-ACTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------CGAT----T--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----
gi|12798                      :   A-AATCCTC-CTCAACGA-A---C----G-A----A-------C-AT-------------T-T---------T-----TT---G--TT---GT--TCT-G---------------AAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--A----ATAACCA--A------CA--------TT-T------T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12799                      :   A-ACTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------C-G-----A--------T-T---------C-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-T-AT--T---AATTG-T-A------A----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----
gi|12800                      :   A-ATTCCTC-CAGAACTA-A---C----C-A----T-------A-GG----A--------T-G---------T-----TT---A--TG---AT--TTT-A--G-T-ATCAAA-TGTAA--G-C-CA--T---GATTG-T-A------A----T-GT---TG--G----CTAGTAA--C------CG--------TT-T-C----T-----TT----C---TT-T-G--ATTT
gi|12801                      :   A-ACTCCGC-CTGAACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A--------TAT---------T-----TT---GTTTC---AT--TTT-G--G-A-ATTAAA-ACATA--T-A-CT--T---GATTA-T-A------T----C-TA---TG--
gi|12802                      :   A-ACTCCTC-GTAAAGCA-AT--C----T-A----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTA-A--T-T-TTC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----tat
gi|12803                      :   A-ACTCCTC-TTGATCTA-A---C----C-A----A-------C-AC-------------T-T---------T-----TT---T--TA---AA--CTT-----------AAA-AGAAA--A-G-CT--T---GATTG-T-A------T----C-TT---TG--A----GCGTCAA--A------C------------C-C----C-----TT----T---TT-A-
gi|12804                      :   A-ACTCCTT-CTGAACGA-A---C----C-A----AAT-----T-AT----T--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-TAATAAAA-ACAAA
gi|12805                      :   A-ACTCTTT-GTGAAGCA-A---C----CCA----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--A-T-AT---A-AGAAAT-T-A-AT--T---AATTA-T-A------G----T-TT---TT--G----GT-ATAA--A------CA--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12806                      :    -ACTCATC-CTGAACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--T-T-ATGAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-A-A------A----A-TA---TG--G----GAGGTTA--A------CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-C-A--GTTT
gi|12807                      :    -ACTTCTT-CTGAACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A----------T---------T-----TT---G--TC---AT--TTA-A--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-TT--T---------T-A------------------TG--A----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-CTT--T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12808                      :    -ATTCCTC-CTGAAC------------------------------T----A--------T-T---------T-----TT---A-------AT--TTT-A--G-T-ATCAAA-AAGAAA-G-G-TT--T---GATTG-T-T------A----T-TT---TG--G----ATGGTAA--A------CTTTTGTCTCTT-T-T----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12809                      :    -ATTTCTC-CTGAAT---A---T-----------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---T--TAT--AT--TTT-G--A-T-ATCAAA-GAGAAG-C-G-TT--T---GATCC-T-A-------------TC---TG--GTA--GTGGTAA--T------CG--------TT-T-C----T-----CT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12810                      :      CTCCTC-CTGAACCA-A---C----A-G----A-------C-CT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AT--TTT-G--GGT-ATGAAA-AGAAAC-G-G-AA--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12811                      :      CCCCTC-CTGAAACA-A---C----C-A----A-------C-GG----C--------T-T---------T-----TT---G--TGG--AT--T---G--A-T-ATAAAA-ATAAAA-A-G-CT--T---ATTTT-T-A------A----T-TT---TG--G----GTGGTAA--T------TT--------TT-T-C----T-----CT----T---TC-A-A--ATTT
gi|12812                      :      CTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------C-A-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CA--------T---------T-----TT----T---TT-A-ACGATTT
gi|12813                      :       TCCTT-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----TT---G--TG---AT--AAT-G--G-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--A----------------TT-T-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12814                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--A---GA--------------------TT---TG--G----ATGGTTA--A-----------------T-T-T----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12815                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---------------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TA-A-A--ATTT
gi|12816                      :       TCCTG-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTATTT------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12817                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-A--G-T-AACAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GAT-------------------TT---TG--G----A-GAT-A--ATTTT--TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12818                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--T------TT--------TT-T-T----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12819                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TAT-G--G-A-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12820                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ACTT
gi|12821                      :       TCTTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAA-G-G-CT--T---GA---------------------T---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TC-A-A--ATTT
gi|12822                      :       TTCTC-CAGAAACA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGTAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12823                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----G-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12824                      :       TTCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12825                      :       TCCTC-CAGAATCG-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTT--T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TTAA-A--ATTT
gi|12826                      :       TCCTT-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-G---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-TGAAAG-G-G-CT------------T-A------A----C-TT---GG--GA---GAGATTT--G------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12827                      :       TCCCC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12828                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--T-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12829                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AA----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--T---AATTT-G-G------A----T-TT---T------------------------TT--------TT-C-C----T-----TT----T---TT-G-A--ATTT
gi|12830                      :         CTC-CTGAACCA-A---C----C-G----A-------C-AG----A--------T-T---------TC----TT---A--TG---AT--TTT-T--G-T-ATCACA-AGAAAG-A-G-CT--T---GATTA-C-A------A----T-TT---T---G----GTGATAA--A------CT--------TT-T-T----T-----CT----T---TT-A-A--ATT
gi|12831                      :         CTC-CTGAACCG-A---C----C-A----G-------C-AT---------------T---------T-----TT---G--TG---AT--TTC-G--G-T-AT-AAA-ACAAAT-G-G-CT--C---GATTG-T-A------A----A-TT---TT--G----GTGGTAA--A------CC--------TT-T-C----T-----TT----TTAGTT-A-A--ATTT
gi|12832                      :         CTA-CTGATTCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGGAAG-G--------------------------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-CTT--T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12833                      :          TC-TTAAAGTA-A---T----C-A----C-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TT----T--TTC-G--G-T-ATAAAA-AGAAAA-A-G-CT--TAGCGA-TA-T-A-------------TT---TG--A----GTGGTAA--A------CT--------TT-C-C----T-----CT----G---TT-C-A--ATTT
gi|12834                      :            -CTGACCCGGA---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--A-T-ATCGAA-AGGAAG-G--------------------------A----C-TT---TG--G----GCGGTAA--A------CT--------TT-T-CTCTTT-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12835                      :              TGGACCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-G-GT--C---GATAG-T-A------A----C-CT---CA--G----TTG--GA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12836                      :              TGAACCA-A---C----C-A----A-------C-A-----------------------------------------G---GT--TTT-G--C-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-CT--T---GATTG-T-A-------------TT---TGTAG----GTGGAAA--A------CT--------TT-TAC----T-----TT----
gi|12837                      :                    A-A---C----T-A----A-------C-TT----A--------T-TG--------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G---AT-AAA-AAAATG-G-A-CT------GACTG-T-A------A----T-TT---TT--G----GTGGTAT--A-------T--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12840                      :                                                 T----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAGA-GGAAAG-G-A-AT--T---GATTGTT-A------A----A-TT---T
gi|12841                      :                                                                                               T--TCC-G--G-A-ATCAAA-C--AAG-G-G-TT--T---GATTG-C-A------A----C-TT---CG--G----GTGATGA--A------C---------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12842                      :                                                                                                   TT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-GT---TG--G----GAGGGGA--A------AG--------TA-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12843                      :                                                                                                       --G-T-ATAAAA-AGAA-G-G-G-AT--T---GGTTG-T-A------A------TT---TG--G----TTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATT


blockSeqs                     :                       CTATC      AAAG ACATATT         CATGTATA   ATTTTTTTT AAATT  TTT     TTC                                           T      AATATGAA               TGAT T   G TT TTATGT  TTTGTCTC      TCTT GAATG       TAG
blockSeqs                     :                       AAGC       TA   AT              .          A         C      TT      T                                             T      AATATC                 TA   T   G T  TTTT    .             TT   .           C  
blockSeqs                     :                       TC         .    A               .          G         .      T       G                                             T      ACT                    A    A   G T  T       .             TT   .           .  
blockSeqs                     :                       TC         .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    T   G T  T       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       TC         .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   A T  T       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       TC         .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    A   G T  T       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             A      AA                     .    A   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             C      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    A   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             C      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    C   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    A   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             C      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      GC                     .    G   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    A   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    A   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    T   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    C   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   C .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      TC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    A   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             A      AC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      TA                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   C .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      GG                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    C   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      CT                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      GT                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    T   C .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    C   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      TC                     .    A   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      GT                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      TC                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             T      GT                     .    T   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    T   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    A   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      GT                     .    A   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    A   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AT                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AC                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      AA                     .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             C      A                      .    A   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      A                      .    T   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      .                      .    T   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      .                      .    T   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             T      .                      .    T   T .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    C   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    A   G .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    T   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .   A .  .       .             .    .           .  
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .   G .  .       .             .    .              
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .   G .  .       .             .    .              
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .   A .  .       .             .    .              
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .   . .  .       .             .    .              
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .   . .  .       .             .    .              
blockSeqs                     :                       T          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .   . .  .       .             .                   
blockSeqs                     :                       A          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .   . .  .                                         
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                      .    .                                                  
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                                                                              
blockSeqs                     :                       C          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                                                                              
blockSeqs                     :                       .          .    .               .          .         .      .       .                                             .      .                                                                              
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Reference ( family-301 )      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12742                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----T-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TT---AT--TTT-G--G-T-ATCAGA-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----ATGGTAT--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATTT
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gi|12758                      : ACA-ACACCTC-CTGAACCA-A---CTATCC-A----A-------C-AT----A--------T-TATTTTTTTTT-----TT---G--TT---AT--TTT-G--G-T-GTCAAA-AGAAAG-A-T-CT--T---GATTT-T-A------A----C-TT---AG--G----ATGTTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT---A--ATTT
gi|12759                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----AACATATTT-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTA-A--G-T-ATCAAT-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-C-A------G----C-TT---AG---------GGTGA--A------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12760                      : ACA-ACTCGTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-TT----A--------T-T---------TAAATTTT---A--TG---AT--TTT-T--G-T-ATAAAA-AAAAAA-G-GTCT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-T----T-----TT----
gi|12761                      : ACA-GCTCCTC-CCGAATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TTT-G--T-T-ATCAAAGAAAAAG-G-T-CT--T---GACTG-T-G------A----A-TT---TG--G----GAGGTGA--A------CT--------TT-C-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12762                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACTA-A---A----C-A----A-------C-ATGATTA--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TCT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-A-G-AT--C---GATTA-T-T------A----A-TT---TT--G----GTGGCAA--A------CT--------GT-T-C----T-----AT----T---AT-A-A--ATTT
gi|12763                      : ACA-ACGCCTC-CTGAACCA-A---A----C-G----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----T----G--TG---AT--TTT-G--A-T-AACAAA-AGAAAG-C-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----AGGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
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gi|12765                      : ACA-ACTCCTC-CAAAATTA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-CGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-TT---TT--G----GAGATTA--A-----------------T-T-T----T-----GT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12766                      : ACA-ACTC-----TGCATCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT------T-----T--TTT-G--G-T-ATCAAG-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--T----GTGGTAA--A------A---------TT-T-C----T-----CT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12767                      : ACA-ACTTCCC-CTGAACCA-A---T----T-A----A-------C-A-----A--------T-G---------T----------G--TG---GG--TTT-G--G-T-ATTAAA-AAAAAA-GAG-TT--T---TATTG-T-A------A----T-TT---TA--G----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12768                      : ACA-ACTCCA----GAACTA-A---A----C-A----C-------T-AT----A--------T-T---------T-----TTTTTG--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G----------ATTG-T-A------A----C-TT---TG--C----ATCGTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TA----T---TT-A-
gi|12769                      : ATA-ACTCGTC-CTAAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------A-G---------T-----TT---G--TG---TT--TTTTG--A-T-ATCTAA-AGAAAG-A-A-CT--T---GGTTG-T-A------A----C-TT---T---G----GTGTTGA--A------CC--------TT-T-T----T-----TG----G---TT-A-A--ATTT
gi|12770                      : ACA-ACTCTTC-CTGAACCA-A---T----C-A----T-------C-AT----A--------G-T---------T-----T----G--TG---AC--TTT-G--A-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-TT--T---GATTG-T-A------T----C-TC---TT--G----GCGGTGA--A------CG--------TT-T-C----T-----TC----T---AA-A-A--ATTT
gi|12771                      : ACA-ATTCCTC-CTTAACCT-A---C----A-G----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--GG---AT--TTT-T--A-T-ATCAAA-AGATAG-G-A-CT--T---GATTT-T-A------A----T-TA---TG--G----GTGATCA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---C----A--ATTT
gi|12772                      : ATA-ACTACTC-CTTAGCCA-A---C----C-T----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATC-AA-AGAAAG-T-G-AT--T---AATTG-CAA------A----C-TTTAATG--G----GTTGTAA--A------CT------------------T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12773                      : ACA-ACTCCTC-CTTAACAA-A---A----C-A----A-------A-CT----G--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--A-T-ATCAAA-AGAATG-T-G-CT--T---GATTG-G-A------A----------------------GGTGA--A------CT--------TT-T-C----A-----AT----T---TT-A-A--ATTT
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gi|12775                      : ACA-ACTCGTT-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AA----A--------T-C---------T-----AT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ACCAGA-ATAAAA-A-G-CT--T---GAACA-T-A------T----A-TT---TA--A----GATGTAA--G------CT--------TT-T-C----C-----CT----T---TT-A-A--ATT
gi|12776                      : ACG-ACTCCTC-CCGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---A--TG---ATTGTTT-A------ATCAAA-GGAAAA-T-G-TT--T---GATTT-A-A------A----C-TG---TG--A----GTGGTAA--A------C---------GA-A-C----C-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12777                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACAA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--ATT----G-T-ATCAAA-CGAATG-A-G-T---------TTG-C-A------A----C-TT---GG--C----GTTGTAA--A---------------------C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12778                      : ACA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---T---------------------AG----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAGAG-G-G-TT--T---GATCA-T-A------
gi|12779                      : ACA-ACTTATC-CTGTATAA-A---C----A-A----A-------C-TT----A--------T-T---------C-----TG---C--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCGGA-GCAAAG-A-C-TT--T---GATTG-C-A------A----C-TT---TT--G----GTGGTGG--A------CT--------TT-C-C----T-----TT----T---
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gi|12781                      : ACA-ACTCATC-TTGAGCCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------T-T---------T-----TTT--A--TG---AT--TTC-A---------AAA-AGAAAG-G-G-CT--T---AATTT-T-T------A----C-TT---TA--G----GTGGTCA--A------
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gi|12783                      : ACA-ACTCCTC-CTGAATCA-A---C----T-A----A-------A-TT----A--------C-T---------T-----TT---G--AG---AT--GTT-T--G-T-AT--AA-AAAAAG---------C---GATT--------------------------------GTGGTGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---GT-A-A--ATTT
gi|12784                      : ACA-ACTCCTC-CTGAAACA-A---A----C-A----A-------C-AG----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA------------TT--T-----TTG-T-T------G----G-TT---AG--GTGATGTGATAA--T------CA--------TT-T-C----C-----TT----T---TT---A--ATTT
gi|12785                      : ACA-ACT------TGACCCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGGAAT-G-A-CT--T---GA
gi|12786                      : ACT-ATTCGCC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------A-AG----A--------C-T---------T----------G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATGAAA-AAAAAG-A-A-CT--T---GAT
gi|12787                      : ACA-GCTCCTC-CTGAAACA-A---C----A-A----A-------C-AT----ACATGTATAT-T---------T-----TT---T--TT---AT--TTT-G--G-T-A-------GA---------T--T---GATTG-T-A------A----C-TA---TG--G----CTG-------------CT--------TT-T-C----T-----TTCTTCT---TT-A-A--ATT
gi|12788                      : ACA-ACTGCTC-CTGAACCA-A---C----C-AAAAGA-------T-AT----T--------T-T---------T-----TT---A--TG---AT--TTT-C--A-T-ATAAAA-ACAAA
gi|12789                      :  CA-ACTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-A-TT--C---GATTG-T-T------A----C-TT---TG--T----GT
gi|12790                      :  CG-ACTTCCCACTGACCCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGAAAG-G--------------------------A----C-TT---CG--G----GCGGTAA--T------CT--------TT-T-T----T-----TT----TC--TT-A-A--ATatggca
gi|12791                      :  CG-ACTCCTC-CTGAACTA-A---T----C-A----A-------C-A-----------------------------------------A---AT--GTT-G--G-T-ATCAAA-CGTAAT-G-G-TT--T---GATTA-T--------A----T-TT---TG--A----GTG-------------CT--------TT-T-T----TGAATGTT----T---TC-A-A--ATT
gi|12792                      :  CA-ACTTCTC-ATGTACCA-AAAGC----C-ATA--A-------C-AA----A--------A-T---------T-----GT---G--TA---AT--TTT-T--A-T-ATCAAA-ATAAAA-G-G-CT--T---GATAT-T-A------AATATC-TT---TG--
gi|12793                      :   A-ATTCCTC-CTGAACCA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT------TG---AT--TTT-T--G-T-ATCAAA-CGAAAA-G-G-CT--T---GGTTG-T-A------A----C-TT---TG--G----ATGGTAA--A------C---------TT-T-C----C-----TC----T---TT-A-A--AT
gi|12794                      :   A-ACTACTC-CTGAATAA-A---C----C-A----A-------C-GT----A--------T-A---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-T--G---------------G-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----CTTT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----
gi|12795                      :   A-ACTCCTA-ATGAACCA-A---C----C-A----A-------C-A-----------------------------------------G---AT--TTT-G--T-T-ATCAAA-TGAAAC-G-G-CCAAT---GATTG-T-A------C----T-TT---TG--A----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-T----G-----TT----T---TT-ATA--ATTT
gi|12796                      :   A-ACTCCTC-CTGAAACA-A---C----C-A----A-------C-AT----A--------TGT---------T-----TT------------T--TTT-T--G-T-ATCGGA-A-AAAG-T-T-TT--T---AATTG-T-AAATATGA----A-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----A-----TT----T---TC---A--ATTT
gi|12797                      :   A-ACTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------CGAT----T--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----
gi|12798                      :   A-AATCCTC-CTCAACGA-A---C----G-A----A-------C-AT-------------T-T---------T-----TT---G--TT---GT--TCT-G---------------AAAG-G-G-CT--T---GATTG-T-A------A----C-TT---TG--A----ATAACCA--A------CA--------TT-T------T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12799                      :   A-ACTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------C-G-----A--------T-T---------C-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-T-AT--T---AATTG-T-A------A----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----
gi|12800                      :   A-ATTCCTC-CAGAACTA-A---C----C-A----T-------A-GG----A--------T-G---------T-----TT---A--TG---AT--TTT-A--G-T-ATCAAA-TGTAA--G-C-CA--T---GATTG-T-A------A----T-GT---TG--G----CTAGTAA--C------CG--------TT-T-C----T-----TT----C---TT-T-G--ATTT
gi|12801                      :   A-ACTCCGC-CTGAACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A--------TAT---------T-----TT---GTTTC---AT--TTT-G--G-A-ATTAAA-ACATA--T-A-CT--T---GATTA-T-A------T----C-TA---TG--
gi|12802                      :   A-ACTCCTC-GTAAAGCA-AT--C----T-A----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTA-A--T-T-TTC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----tat
gi|12803                      :   A-ACTCCTC-TTGATCTA-A---C----C-A----A-------C-AC-------------T-T---------T-----TT---T--TA---AA--CTT-----------AAA-AGAAA--A-G-CT--T---GATTG-T-A------T----C-TT---TG--A----GCGTCAA--A------C------------C-C----C-----TT----T---TT-A-
gi|12804                      :   A-ACTCCTT-CTGAACGA-A---C----C-A----AAT-----T-AT----T--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-TAATAAAA-ACAAA
gi|12805                      :   A-ACTCTTT-GTGAAGCA-A---C----CCA----A-------C-G-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--A-T-AT---A-AGAAAT-T-A-AT--T---AATTA-T-A------G----T-TT---TT--G----GT-ATAA--A------CA--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12806                      :    -ACTCATC-CTGAACCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--T-T-ATGAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GATTG-A-A------A----A-TA---TG--G----GAGGTTA--A------CT--------TT-T-C----T-----AT----T---TT-C-A--GTTT
gi|12807                      :    -ACTTCTT-CTGAACCA-A---T----C-A----A-------C-AT----A----------T---------T-----TT---G--TC---AT--TTA-A--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-TT--T---------T-A------------------TG--A----GTGGTGA--A------CT--------TT-T-CTT--T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12808                      :    -ATTCCTC-CTGAAC------------------------------T----A--------T-T---------T-----TT---A-------AT--TTT-A--G-T-ATCAAA-AAGAAA-G-G-TT--T---GATTG-T-T------A----T-TT---TG--G----ATGGTAA--A------CTTTTGTCTCTT-T-T----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12809                      :    -ATTTCTC-CTGAAT---A---T-----------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---T--TAT--AT--TTT-G--A-T-ATCAAA-GAGAAG-C-G-TT--T---GATCC-T-A-------------TC---TG--GTA--GTGGTAA--T------CG--------TT-T-C----T-----CT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12810                      :      CTCCTC-CTGAACCA-A---C----A-G----A-------C-CT----A--------T-T---------A-----TT---G--TG---AT--TTT-G--GGT-ATGAAA-AGAAAC-G-G-AA--T---AATTG-T-A------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---
gi|12811                      :      CCCCTC-CTGAAACA-A---C----C-A----A-------C-GG----C--------T-T---------T-----TT---G--TGG--AT--T---G--A-T-ATAAAA-ATAAAA-A-G-CT--T---ATTTT-T-A------A----T-TT---TG--G----GTGGTAA--T------TT--------TT-T-C----T-----CT----T---TC-A-A--ATTT
gi|12812                      :      CTCCTC-GTGAAGCA-AT--C----C-A----A-------C-A-----A--------T-T---------T-----TT---G--AG---AT--TTT-A--G-T-ATC----AGAAAA-G-G-AT--T---AATTG-T-A------G----T-TT---TT--G----G-GATGA--A------CA--------T---------T-----TT----T---TT-A-ACGATTT
gi|12813                      :       TCCTT-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----TT---G--TG---AT--AAT-G--G-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--A----------------TT-T-A----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12814                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--A---GA--------------------TT---TG--G----ATGGTTA--A-----------------T-T-T----T-----AT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12815                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---------------A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TA-A-A--ATTT
gi|12816                      :       TCCTG-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTATTT------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12817                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-A--G-T-AACAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GAT-------------------TT---TG--G----A-GAT-A--ATTTT--TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12818                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--T------TT--------TT-T-T----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12819                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---GT--TAT-G--G-A-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12820                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ACTT
gi|12821                      :       TCTTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAA-G-G-CT--T---GA---------------------T---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TC-A-A--ATTT
gi|12822                      :       TTCTC-CAGAAACA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGTAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12823                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----G-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12824                      :       TTCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------A-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-G--ATTT
gi|12825                      :       TCCTC-CAGAATCG-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-G-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTT--T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TTAA-A--ATTT
gi|12826                      :       TCCTT-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------T-G---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-TGAAAG-G-G-CT------------T-A------A----C-TT---GG--GA---GAGATTT--G------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12827                      :       TCCCC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----G--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTAT-T------TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12828                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AT----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--T-T-TTCAAA-AGAAAG-T-A-CT--T---GA--------------------TT---TG--G----GAGATTA--AT-----TT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12829                      :       TCCTC-CAGAATCA-A---A----C-A----A-------C-AA----A--------A-T---------T-----TT---G--TG---AT--TAT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAT-G-G-CT--T---AATTT-G-G------A----T-TT---T------------------------TT--------TT-C-C----T-----TT----T---TT-G-A--ATTT
gi|12830                      :         CTC-CTGAACCA-A---C----C-G----A-------C-AG----A--------T-T---------TC----TT---A--TG---AT--TTT-T--G-T-ATCACA-AGAAAG-A-G-CT--T---GATTA-C-A------A----T-TT---T---G----GTGATAA--A------CT--------TT-T-T----T-----CT----T---TT-A-A--ATT
gi|12831                      :         CTC-CTGAACCG-A---C----C-A----G-------C-AT---------------T---------T-----TT---G--TG---AT--TTC-G--G-T-AT-AAA-ACAAAT-G-G-CT--C---GATTG-T-A------A----A-TT---TT--G----GTGGTAA--A------CC--------TT-T-C----T-----TT----TTAGTT-A-A--ATTT
gi|12832                      :         CTA-CTGATTCT-A---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--G-T-ATCGAA-AGGAAG-G--------------------------A----C-TT---TG--G----GTGGTAA--A------CT--------TT-T-CTT--T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12833                      :          TC-TTAAAGTA-A---T----C-A----C-------C-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TT----T--TTC-G--G-T-ATAAAA-AGAAAA-A-G-CT--TAGCGA-TA-T-A-------------TT---TG--A----GTGGTAA--A------CT--------TT-C-C----T-----CT----G---TT-C-A--ATTT
gi|12834                      :            -CTGACCCGGA---A----C-A----A-------A-AT----A--------T-G---------C-----TT---G--TC---CT--TTT-G--A-T-ATCGAA-AGGAAG-G--------------------------A----C-TT---TG--G----GCGGTAA--A------CT--------TT-T-CTCTTT-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12835                      :              TGGACCA-A---C----C-A----A-------A-AT----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATAAAA-AGAAAG-G-G-GT--C---GATAG-T-A------A----C-CT---CA--G----TTG--GA--A------CT--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12836                      :              TGAACCA-A---C----C-A----A-------C-A-----------------------------------------G---GT--TTT-G--C-T-ATCAAA-TGAAAG-G-A-CT--T---GATTG-T-A-------------TT---TGTAG----GTGGAAA--A------CT--------TT-TAC----T-----TT----
gi|12837                      :                    A-A---C----T-A----A-------C-TT----A--------T-TG--------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G---AT-AAA-AAAATG-G-A-CT------GACTG-T-A------A----T-TT---TT--G----GTGGTAT--A-------T--------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATT
gi|12840                      :                                                 T----A--------T-T---------T-----TT---G--TG---AT--TTT-G--G-T-ATCAGA-GGAAAG-G-A-AT--T---GATTGTT-A------A----A-TT---T
gi|12841                      :                                                                                               T--TCC-G--G-A-ATCAAA-C--AAG-G-G-TT--T---GATTG-C-A------A----C-TT---CG--G----GTGATGA--A------C---------TT-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--AT
gi|12842                      :                                                                                                   TT-G--G-T-ATCAAA-AGAAAG-T-G-CT--T---GATTG-T-A------A----A-GT---TG--G----GAGGGGA--A------AG--------TA-T-C----T-----TT----T---TT-A-A--ATTT
gi|12843                      :                                                                                                       --G-T-ATAAAA-AGAA-G-G-G-AT--T---GGTTG-T-A------A------TT---TG--G----TTGGTAA--A------CT--------TT-T-C----------TT----T---TT-A-A--ATT