lowQualScore                  :                                                                                                    1                   1   
lowQualScore                  :           1111 4       0000 0000 1111     0 0          00  0000  0   0 00 0 111111111  0 22222 0 0 9  0   00 0      00 0   
lowQualScore                  :           .... .       .... .... ....     . .          ..  ....  .   . .. . .........  . ..... . . .  .   .. .      .. .   
lowQualScore                  :           2222 3       9999 9999 6666     4 4          66  9999  4   4 66 4 666666666  4 33333 4 4 9  4   66 4      66 7   
consensus                     :     ACGGAC----GGACGCACG----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
Reference ( gi|6241 )         :     ACGGAC----GCACGCACG----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TATG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6243                       :     ACGGAC----GCACTCACG----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GCG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6244                       :     ACGCAC----GCACGCACG----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AACATA--A-AAA
gi|6250                       :     ACGCAC----ACACGCACG----C----A----CGGAT-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6242                       :     ACGGAC----AGACGCACG----C----A----CGGAC-A-AAGCGGCGAC--AA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6253                       :     ACGGAC----GCATGCACA----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TG-TGT-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-
gi|6254                       :     ACGGAT----ACATGCATG----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6257                       :     ACGGCC----GCATGCACG----C----A----CGGAC-A-AAGCGGCGAC--TA----TA-TCC-T--T-C---------CC-C-----CGC-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6308                       :     ACGAAC----GCACGCACG----C----A------GAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-CTTTTG-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6245                       :     ACGGAC----GGACACACG----C----A----CGGAC-G-CAGCGGAGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6262                       :     ACGGAC----ACATGCATG----C----A----CGGAC-A-AAGCGGCAAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6246                       : acagACGGAC----GGACGCACC----C----A----CGGAT-G-AAGTGGCGGC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6260                       :     ACGGAC----ACATGCACG----CCCATA----CAGAT-G-AAGCTGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6248                       : acggACGGAC----GGACGGACG----C----A----CAGAT-G-AAGTGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-T---------CC-C-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6269                       :     ACGCAT----GCACGCACG----C----A----CGCAC-A-AAGTGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CT-C-----C-T-T-TG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6261                       :     ACGGAT----GCATGCATG----G----A----TGGAC-G-AAACGACGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CT-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6249                       : acggACGGAC----GGACACATG----C----A----CGGAC-A-AAGTGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-T---------GC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6252                       :     ACGGAC----GGACGGACG----C----A----CACAC-G-AAGCGACGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTGAGGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6251                       :     ACAGAC----GGACGGACA----C----A----CAGAC-A-AAGCGGCGAC--TT----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6255                       :     ATGGAC----GGACGGATG----C----A----CGCAC-G-AAGCGGTGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6272                       :     ACAGAT----GCACGCACG----C----A----CGCAC-A-AAGCAGCGAC--TG----TA-GGC-T--A-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6256                       :     ACGGAC----GGACGGACG----C----A----TGAAC-A-AAGCAGTGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-CGCATA--A-AAA
gi|6247                       :     ACAGAC----ACATGCACG----C----A----TGGAA-G-AAGCTGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-A-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6259                       :     ACGGAC----GGACACATG----C----A----TAGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----AA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-ATTG-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6267                       :     ACGGACACATGCACGGACG----C----A----CTGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------AC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6263                       : acggACGGAC----GAAAACACG----C----A----TGGAC-G-AAGCGGCGAC--CA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-T-TT-GGG--G-AGCATA--
gi|6273                       :     ACAGAC----GGACGCACA----C----A----CAGTA-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-A-T-TG-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6274                       :     ATGGAC----ACACGCATGGATGC----A----CGAAT-G-AAGCGGTGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------TC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6270                       : acggATGGAC----GAACGCATG----G----A----CGGAA-G-AAGACGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6264                       :     ATGGGC----GGACGCACG----C----A----CAGAC-G-GAGCCCCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGT--G-AGCATA--A-TAA
gi|6280                       :     ACAGAC----GCACGCACG----C----A----CGGAC-A-AAGCGGCGAC--TT----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-T
gi|6268                       :     ACGGAC----AGATGCAGG----G----A----CAGAA-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-T-TT-GGG--A-AGCATA--A-AAAt
gi|6265                       :     ACGGAC----GGAAGGATG---------G----CGGAC-G-AAGCGGCAAC--TT----TA-TGC-T--T-T---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6271                       :     ACGGAC----GGGCACACA----C----A----CAGA--G-CAGCAGCGAC--TA----CA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6282                       :     ACAGAC----ACACGCACG----C----A----CGGAC-G-AGGCGGCGAC--TA----TA-TGCTT--T-C---------CT-C-----C-T-TACA-GGG--G-
gi|6278                       :     ACGGAC----GGAAGGACG----G----A----CCGAC-G-AAGTGGCGAC--TATAATTA-TGC-T--T-----------CC-C-----C-C-TATT-GGG--G-AGCATA--A-AAAccctaagaa
gi|6275                       :     ATGGAT----GGACGTACG----C----A----CGCAT-G-AAGTGGCGGCAGTA----TT-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGT--G-AGCATA--A-AAA
gi|6276                       :     ATGGAC----AGACGCATG----C----A----CAGAC-G-ACGCGGCAAC--TT----TA-TGT-T--T-C---------AC-T-----C-C-TTTG-AGG--G-AGTATA--A-AAA
gi|6284                       :     ACGAAT----GTACGCACG----G----A----CGGAC-A-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-
gi|6279                       :     ACGGAT----GGATGCACA----G----A----TGGAT-G-AAGCGGCAAC--TT----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-AGG--G-TGCATA--A-
gi|6281                       :     ACGGAT----GGACGCACG----G----A----CAGGC-G-ATGCAGCGAC--TA----TA-TGA----T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--C-AGTATA--A-TAA
gi|6285                       :     ACTGAT----GCATGCATG----C----AACCATGAAC-A-AAGCAGCACC--TA----TA-TAC-T--T-C---------CC-A-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6283                       :     ACGGAC----AGACCCACG----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TC-TG--T--T-C---------CT-C-----C-C-T
gi|6302                       :     ACAGAT----GCACAAACG----G----AATC-CAGAC-G-AAGCAGCAAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-CTAAA-T-T-TTTG-AGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6288                       :   ggACGGAC----GGATGTATG----C----A----TGGAC-A-AAGCAGTGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------TC-C-----
gi|6287                       :     ACGGAC----G-GCGGATG----G----A----CAGAC-G-AAGTGGCGAC--TT----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T
gi|6266                       : acggACGGAT----GGACACAC----------A----CGCAC-G-AAACATCGAC--TA----TA-TGT-T--T-C---------CT-C-----C-C-CTTG-GGt
gi|6286                       :     ACGGAC----AGATGGACG----G----A----CGGAC-G-CTGCGATTAC--TA----TA-TGC-C--A-C---------CC-CAAAAAT-T-TTTG-GGG--G-GGCATA--A-AAA
gi|6291                       :      CGGAC----GCACGCACA----C----A----CGGAC-A-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6292                       :      CAGAC----GGATGCACG----C----A----TGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CT-T-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6293                       :      CGCAT----GGATGCACA----C----A----TGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--TCC---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATATTA-AAA
gi|6299                       :       GAAC----GCATGCACG----G----A----CGGAC-G-AAGTGGAGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGGGAG-AGCATA--ATAAA
gi|6297                       :       GGAC----GGATGGACG----T----A----CAGAC-A-AAGCGGCAAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T-TG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6296                       :       GGAC----GGACGCAGG----C----A----TGGAC-G-AAGCCGCGAC--TA----TA-TGC-TCCC-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATA--A-AA
gi|6300                       :       GGAC----GGACGGATA----C----A----CG------AAGCAGCAAC--TA----TA-TAC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T-TG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6326                       :       GGAC----GCACAGACG----G----A----TGGCC-G-AAGTGGCCAC--TA----TA-TGT-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGAATA--T-AAA
gi|6301                       :       GGAT----GGACGGATG----C----A----CAGAT-G-AAGCAGCAAC--TA----AA-TGC-T----C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAT--G-AGCATA--A-AAA
gi|6327                       :       GGAC----GCACGCACG----C------------AC-G-AAGCGGCGAC--TA----TT-TGC-T--T-C---------
gi|6304                       :        GAC----GCACGCATG----C----A----CGCAC-A-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6305                       :        GAC----GCACGGACG----G----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6331                       :        GAC----ACACGCATG----C----A----CACAT-GCAAG----GAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6306                       :        GAC----AGACGGACG----G----A----CAGAC-A-AAGCGGCAAC--TA----TA-TGC-T---------------C-T-----C-C-T-TT-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6307                       :        GAC----AGACGGACG----G----A----CAGAC-A-AAGCGGCAAC--TA----TA-TGC-T--------------CT-C-----C-T-TTTG-GGA--GCATTATA--A-AAA
gi|6311                       :         AC----GCACGCACG----G----A----CGGAC-G-AAGCGGTGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T-TG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6314                       :         AC----GCATGCACA----C----A----TGGAC-G-AAGCGGCTAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6309                       :         AC----GGACGGACG----C----A----CGGAA-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T-TT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6315                       :         AC----GCATGCACA----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-CCCCCCACCACC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATG--ATAAA
gi|6310                       :         AC----GGACGCATG----C----A----CGGAC-A-AAGCAGCGGC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T-TG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6316                       :         AC----GCACGCATG----C----A----CGCAC-A-AAGTAGTGAC--TA----TA-TGC-T--T-T---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6317                       :         AC----GGATGCACT----G----A----AGGAC-G-AAGCGGCAAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-G-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6319                       :         AC----GAACGCATG----C---------TAGAT-G-AAGCAGTGAC--TA----TA-TGC-T--C-C---------CC-C-----T-C-TCTA-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6318                       :         AC----GGACGCATG----C----A----CAGAC-G-AAGCGGTGGC--TA----TA-TGC-T--T-A---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--
gi|6320                       :          C----GCACGCATG----C----A----CAGAC-G-AAGCGGCGAC--------TA-TGT-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--A-AGCATA--ATAAA
gi|6294                       :          C----GCACAGACA----G----A----CGCACCG-AGGCGGCAAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6328                       :                 ACGCACG----G----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TG----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6321                       :                gACGCACG----C---------CAGAC-G-AAGCGGTGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CG-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6322                       :               ggACGCAAG----C----A----TGGAC-G-AATTGGCGAT--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-CAA
gi|6313                       :               ggACGGACA----G----A----CGGAC-A-AAGCAGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6332                       :             acagACGGACG----G----A----CGGAC-G-AAGCGGCGCC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----G-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6330                       :                 ACACACG----C----A----CGGAC-G-AAGTGGCAAT--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T-TT-GGG--G-AGCATT--A-AAA
gi|6324                       :                gATGCATG----G----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TG----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T-T--GGG--G-AGCATA--A-
gi|6323                       :               ggACGCACG----C----A----CAGTT-G-AAGCTGCGAC--TA----TG-TGC-T--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6277                       :               ggACGCACG----A----A----AGGAC-G-GAGTGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-CG----C-C-T
gi|6333                       :      acgaacttgggaCGCACA----C----A----TGGAT-A-AAGTGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CCAA-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-tt
gi|6298                       :                    CACA----C----A----CGGAT-G-AAGCGGCCAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6334                       :              ggatgaaACG----C----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6335                       :                     ACG----C----A----CGGAC-A-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6336                       :                     ACG----C----A----CGGAC-A-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6337                       :                     ACG----C----A----CGGAC-A-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCTTA--A-
gi|6338                       :                     ACG----C----A----TGGAC-G-AAGCGGCAAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATT--A-AAA
gi|6312                       :                     ACG----C----A----CAGAT-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6325                       :             acagatggACG----C----A----CACAC-A-AAGCGGTGAC--TA----TAATGC-T--T-C---------CT-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6339                       :                   ggACA----C----A----CAGAC-A-AAGCGGCCAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----T-T-T-TT-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6340                       :                     ACG----C----A----CGGAT-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-
gi|6329                       :                             ----A----CGGAC-G-AAGCGGCGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-TTTA-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6341                       :                    gatggatgg----A----CGCAC-G-AAGCGGCGAT--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCTTA--
gi|6342                       :                                        GAC-A-AAGCAGCGAT--TA----TA-CGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6343                       :                                          C-G-AAGCGGCGAC--TT----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-T-T-TG-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6344                       :                                               AGCGCAGAC--TA----T---GC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6345                       :                                                   GTGAC--TA----TA-TGC-T--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                         1   
lowQualScore                  :        1111    1111 0 00     0000  22222222  3333333  33333333  0        00  0000  0    00 0 111111111  0 22222 0 0    0   00 0      00 0   
lowQualScore                  :        ....    .... . ..     ....  ........  .......  ........  .        ..  ....  .    .. . .........  . ..... . .    .   .. .      .. .   
lowQualScore                  :        0000    0000 5 66     9999  11111111  1111111  00000000  4        66  9999  4    55 4 666666666  4 33333 4 4    4   66 4      66 5   
consensus                     :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
Reference ( family-297 )      :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6241                       :  ACGGAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TATG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6242                       :  ACGGAC----AGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--AA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6243                       :  ACGGAC----GCAC----T-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GCG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6244                       :  ACGCAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AACATA--A-AAA
gi|6245                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------CA-GCGGAGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6246                       :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACCCA----CG--------GA-------TG--------AA-GTGGCGGC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6247                       :  ACAGAC----ACAT----G-C--ACGCA----TG--------GA-------AG--------AA-GCTGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-A-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6248                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6249                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------GC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6250                       :  ACGCAC----ACAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6251                       :  ACAGAC----GGAC----G-G--ACACA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6252                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----CA--------CA-------CG--------AA-GCGACGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTGAGGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6253                       :  ACGGAC----GCAT----G-C--ACACA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TG-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-
gi|6254                       :  ACGGAT----ACAT----G-C--ATGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6255                       :  ATGGAC----GGAC----G-G--ATGCA----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6256                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----TG--------AA-------CA--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-CGCATA--A-AAA
gi|6257                       :  ACGGCC----GCAT----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TCCT--T-C---------CC-C-----CGC-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6259                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----TA--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----AA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-ATTG-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6260                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CGCCCATACAGA-------TG--------AA-GCTGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6261                       :  ACGGAC----GGAT----G-C--ATGCA----TG--------GATGGA---CG--------AA-ACGACGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CT-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6262                       :  ACAGAC----GGACACATG-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6263                       :  ACGGAC----GAAA----A-C--ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--CA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTT--GGG--G-AGCATA--
gi|6264                       :  ATGGGC----GGAC----G-C--ACGCA----CA--------GA-------CG--------GA-GCCCCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGT--G-AGCATA--A-TAA
gi|6265                       :  ACGGAC----GGAA----G-G--ATG-G----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TT----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6266                       :  ACGGAT----GGAC----A-C--AC--A----CG--------CA-------CG--------AA-ACATCGAC--TA----TA-TGTT--T-C---------CT-C-----C-C-CTTG-GG
gi|6267                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CG--------GA-------CGCACTGACGAA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------AC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6268                       :  ACGGAC----AGAT----G-C--AGGGA----CA--------GA-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTT--GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6269                       :  ACGCAT----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-T-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6270                       :  ATGGAC----GAAC----G-C--ATGGA----CG--------GA-------AG--------AA-GACGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6271                       :  ACGGAC----GGGC----A-C--ACACA----CA--------GA--------G--------CA-GCAGCGAC--TA----CA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6272                       :  ACAGAT----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GCAGCGAC--TG----TA-GGCT--A-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6273                       :  ACAGAC----GGAC----G-C--ACACA----CA--------GT-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-A--TTG-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6274                       :  ACGGAT----GGAC----A-C--ACGCA----TG--------GA-------TGCACGAATGAA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------TC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6275                       :  ATGGAT----GGAC----G-T--ACGCA----CG--------CA-------TG--------AA-GTGGCGGCAGTA----TT-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGT--G-AGCATA--A-AAA
gi|6276                       :  ATGGAC----AGAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AC-GCGGCAAC--TT----TA-TGTT--T-C---------AC-T-----C-C-TTTG-AGG--G-AGTATA--A-AAA
gi|6277                       :  ACGAACTTGGGAAC----G-C--ACGAA----AG--------GA-------CG--------GA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-CG----C-C-TTT
gi|6278                       :  ACGGAC----GGAA----G-G--ACGGA----CC--------GA-------CG--------AA-GTGGCGAC--TATAATTA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-ATT--GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6279                       :  ACGGAT----GGAT----G-C--ACAGA----TG--------GA-------TG--------AA-GCGGCAAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-AGG--G-TGCATA--A-
gi|6280                       :  ACAGAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TT
gi|6281                       :  ACGGAT----GGAC----G-C--ACGGA----CA--------GG-------CG--------AT-GCAGCGAC--TA----TA-TGA---T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--C-AGTATA--A-TAA
gi|6282                       :  ACAGAC----ACAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AG-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-T-----C-C-TTAC-AGG--G-GCCCTA--A-GAA
gi|6283                       :  ACGGAC----AGAC----C-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TC-TG-T--T-C---------CT-C-----C-C-T
gi|6284                       :  ACGAAT----GTAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-
gi|6285                       :  ACTGAT----GCAT----G-C--ATGCAACCATG--------AA-------CA--------AA-GCAGCACC--TA----TA-TACT--T-C---------CC-A-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6286                       :  ACGGAC----AGAT----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------CT-GCGATTAC--TA----TA-TGCC--A-C---------CC-CAAAAAT-T-TTTG-GGG--G-GGCATA--A-AAA
gi|6287                       :  ACGGAC----GGAC----GGCGGATGGA----CA--------GA-------CG--------AA-GTGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TT
gi|6288                       :  ACGGAC----GGAT----G-T--ATGCA----TG--------GA-------CA--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------TC-C-----
gi|6291                       :   CGGAC----GCAC----G-C--ACACA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6292                       :   CAGAC----GGAT----G-C--ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CT-T-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6293                       :   CGCAT----GGAT----G-C--ACACA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--TCC---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATATTA-AAA
gi|6294                       :  ACAGAC----AGAC----G-C--AC--------------------------CG--------AG-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6296                       : cgcGGAC----GGAC----G-C--AGGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCCGCGAC--TA----TA-TGCTCCC-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATA--A-AA
gi|6297                       :    GGAC----GGAT----G-G--ACGTA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6298                       :    GGAT----GAAC----A-C--AC--A----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCCAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6299                       :    GAAC----GCAT----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GTGGAGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGGGAG-AGCATA--ATAAA
gi|6300                       :    GGAC----GGAC----G-G--ATACA----CG---------------------------AA-GCAGCAAC--TA----TA-TACT--T-C---------C--C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6301                       :    GGAT----GGAC----G-G--ATGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GCAGCAAC--TA----AA-TGCT----C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAT--G-AGCATA--A-AAA
gi|6302                       :    GGAC----AGAT----G-C--ACAAA----CG--------GAATCCAGACG--------AA-GCAGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-CTAAA-T-T-TTTG-AGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6304                       :     GAC----GCAC----G-C--ATGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6305                       :     GAC----GCAC----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6306                       :     GAC----AGAC----G-G--ACGGA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT---------------C-T-----C-C-TTT--GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6307                       :     GAC----AGAC----G-G--ACGGA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--------------CT-C-----C-T-TTTG-GGA--GCATTATA--A-AAA
gi|6308                       :      AC----GAAC----G-C--ACGCA----CGCA------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-CTTTTG-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6309                       :      AC----GGAC----G-G--ACGCA----CG--------GA-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTT--GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6310                       :      AC----GGAC----G-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCAGCGGC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6311                       :      AC----GCAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6312                       :      AC----AGAT----G-G--ACGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6313                       :      AC----AGAC----G-G--ACAGA----CG--------GA-------CA--------AA-GCAGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6314                       :      AC----GCAT----G-C--ACACA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCTAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6315                       :      AC----GCAT----G-C--ACACA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-CCCCCCACCACC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATG--ATAAA
gi|6316                       :      AC----GCAC----G-C--ATGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GTAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6317                       :      AC----GGAT----G-C--ACTGA----AG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-G-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6318                       :      AC----GGAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGTGGC--TA----TA-TGCT--T-A---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--
gi|6319                       :      AC----GAAC----G-C--ATGC-----TA--------GA-------TG--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--C-C---------CC-C-----T-C-TCTA-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6320                       :       C----GCAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--------TA-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--A-AGCATA--ATAAA
gi|6321                       :        ----GGAC----G-C--ACGC-----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CG-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6322                       :        ----GGAC----G-C--AAGCA----TG--------GA-------CG--------AA-TTGGCGAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-CAA
gi|6323                       :        ----GGAC----G-C--ACGCA----CA--------GT-------TG--------AA-GCTGCGAC--TA----TG-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6324                       :        ----GGAT----G-C--ATGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TG----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TT---GGG--G-AGCATA--A-
gi|6325                       :        ----GGAC----G-C--ACACA----CA---------------------------AA-GCGGTGAC--TA----TAATGCT--T-C---------CT-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6326                       :        ----GGAC----G-C--ACAGA----CG--------GATGGC---CG--------AA-GTGGCCAC--TA----TA-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGAATA--T-AAA
gi|6327                       :        ----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TT-TGCT--T-C---------
gi|6328                       :             GAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TG----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6329                       :             GAT----G-G--ATGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTA-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6330                       :             GAC----A-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GTGGCAAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTT--GGG--G-AGCATT--A-AAA
gi|6331                       :             GAC----A-C--ACGCA----TG--------CA-------CA--------CATGCAAGGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6332                       :              AC----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGCC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----G-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6333                       :               C----G-C--ACACA----TG--------GA-------TA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CCAA-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-
gi|6334                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6335                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6336                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6337                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCTTA--A-
gi|6338                       :                       --ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATT--A-AAA
gi|6339                       :                       --ACACA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCCAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-T-TTT--GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6340                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-
gi|6341                       :                             A----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGCGAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCTTA--
gi|6342                       :                                    --------GA-------CA--------AA-GCAGCGAT--TA----TA-CGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6343                       :                                              -------CG--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6344                       :                                                                A-GCGCAGAC--TA----T---GCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6345                       :                                                                     GTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                         1   
lowQualScore                  :        1111    1111 0 00     0000  22222222  3333333  33333333  0        00  0000  0    00 0 111111111  0 22222 0 0    0   00 0      00 0   
lowQualScore                  :        ....    .... . ..     ....  ........  .......  ........  .        ..  ....  .    .. . .........  . ..... . .    .   .. .      .. .   
lowQualScore                  :        0000    0000 5 66     9999  11111111  1111111  00000000  4        66  9999  4    55 4 666666666  4 33333 4 4    4   66 4      66 5   
consensus                     :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
Reference ( family-297 )      :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6241                       :  ACGGAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TATG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6242                       :  ACGGAC----AGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--AA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6243                       :  ACGGAC----GCAC----T-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GCG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6244                       :  ACGCAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AACATA--A-AAA
gi|6245                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------CA-GCGGAGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6246                       :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACCCA----CG--------GA-------TG--------AA-GTGGCGGC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6247                       :  ACAGAC----ACAT----G-C--ACGCA----TG--------GA-------AG--------AA-GCTGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-A-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6248                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6249                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------GC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6250                       :  ACGCAC----ACAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6251                       :  ACAGAC----GGAC----G-G--ACACA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6252                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----CA--------CA-------CG--------AA-GCGACGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTGAGGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6253                       :  ACGGAC----GCAT----G-C--ACACA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TG-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-
gi|6254                       :  ACGGAT----ACAT----G-C--ATGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6255                       :  ATGGAC----GGAC----G-G--ATGCA----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6256                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----TG--------AA-------CA--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-CGCATA--A-AAA
gi|6257                       :  ACGGCC----GCAT----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TCCT--T-C---------CC-C-----CGC-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6259                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----TA--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----AA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-ATTG-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6260                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CGCCCATACAGA-------TG--------AA-GCTGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6261                       :  ACGGAC----GGAT----G-C--ATGCA----TG--------GATGGA---CG--------AA-ACGACGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CT-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6262                       :  ACAGAC----GGACACATG-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6263                       :  ACGGAC----GAAA----A-C--ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--CA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTT--GGG--G-AGCATA--
gi|6264                       :  ATGGGC----GGAC----G-C--ACGCA----CA--------GA-------CG--------GA-GCCCCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGT--G-AGCATA--A-TAA
gi|6265                       :  ACGGAC----GGAA----G-G--ATG-G----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TT----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6266                       :  ACGGAT----GGAC----A-C--AC--A----CG--------CA-------CG--------AA-ACATCGAC--TA----TA-TGTT--T-C---------CT-C-----C-C-CTTG-GG
gi|6267                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CG--------GA-------CGCACTGACGAA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------AC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6268                       :  ACGGAC----AGAT----G-C--AGGGA----CA--------GA-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTT--GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6269                       :  ACGCAT----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-T-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6270                       :  ATGGAC----GAAC----G-C--ATGGA----CG--------GA-------AG--------AA-GACGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6271                       :  ACGGAC----GGGC----A-C--ACACA----CA--------GA--------G--------CA-GCAGCGAC--TA----CA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6272                       :  ACAGAT----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GCAGCGAC--TG----TA-GGCT--A-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6273                       :  ACAGAC----GGAC----G-C--ACACA----CA--------GT-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-A--TTG-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6274                       :  ACGGAT----GGAC----A-C--ACGCA----TG--------GA-------TGCACGAATGAA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------TC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6275                       :  ATGGAT----GGAC----G-T--ACGCA----CG--------CA-------TG--------AA-GTGGCGGCAGTA----TT-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGT--G-AGCATA--A-AAA
gi|6276                       :  ATGGAC----AGAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AC-GCGGCAAC--TT----TA-TGTT--T-C---------AC-T-----C-C-TTTG-AGG--G-AGTATA--A-AAA
gi|6277                       :  ACGAACTTGGGAAC----G-C--ACGAA----AG--------GA-------CG--------GA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-CG----C-C-TTT
gi|6278                       :  ACGGAC----GGAA----G-G--ACGGA----CC--------GA-------CG--------AA-GTGGCGAC--TATAATTA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-ATT--GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6279                       :  ACGGAT----GGAT----G-C--ACAGA----TG--------GA-------TG--------AA-GCGGCAAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-AGG--G-TGCATA--A-
gi|6280                       :  ACAGAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TT
gi|6281                       :  ACGGAT----GGAC----G-C--ACGGA----CA--------GG-------CG--------AT-GCAGCGAC--TA----TA-TGA---T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--C-AGTATA--A-TAA
gi|6282                       :  ACAGAC----ACAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AG-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-T-----C-C-TTAC-AGG--G-GCCCTA--A-GAA
gi|6283                       :  ACGGAC----AGAC----C-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TC-TG-T--T-C---------CT-C-----C-C-T
gi|6284                       :  ACGAAT----GTAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-
gi|6285                       :  ACTGAT----GCAT----G-C--ATGCAACCATG--------AA-------CA--------AA-GCAGCACC--TA----TA-TACT--T-C---------CC-A-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6286                       :  ACGGAC----AGAT----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------CT-GCGATTAC--TA----TA-TGCC--A-C---------CC-CAAAAAT-T-TTTG-GGG--G-GGCATA--A-AAA
gi|6287                       :  ACGGAC----GGAC----GGCGGATGGA----CA--------GA-------CG--------AA-GTGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TT
gi|6288                       :  ACGGAC----GGAT----G-T--ATGCA----TG--------GA-------CA--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------TC-C-----
gi|6291                       :   CGGAC----GCAC----G-C--ACACA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6292                       :   CAGAC----GGAT----G-C--ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CT-T-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6293                       :   CGCAT----GGAT----G-C--ACACA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--TCC---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATATTA-AAA
gi|6294                       :  ACAGAC----AGAC----G-C--AC--------------------------CG--------AG-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6296                       : cgcGGAC----GGAC----G-C--AGGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCCGCGAC--TA----TA-TGCTCCC-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATA--A-AA
gi|6297                       :    GGAC----GGAT----G-G--ACGTA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6298                       :    GGAT----GAAC----A-C--AC--A----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCCAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6299                       :    GAAC----GCAT----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GTGGAGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGGGAG-AGCATA--ATAAA
gi|6300                       :    GGAC----GGAC----G-G--ATACA----CG---------------------------AA-GCAGCAAC--TA----TA-TACT--T-C---------C--C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6301                       :    GGAT----GGAC----G-G--ATGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GCAGCAAC--TA----AA-TGCT----C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAT--G-AGCATA--A-AAA
gi|6302                       :    GGAC----AGAT----G-C--ACAAA----CG--------GAATCCAGACG--------AA-GCAGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-CTAAA-T-T-TTTG-AGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6304                       :     GAC----GCAC----G-C--ATGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6305                       :     GAC----GCAC----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6306                       :     GAC----AGAC----G-G--ACGGA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT---------------C-T-----C-C-TTT--GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6307                       :     GAC----AGAC----G-G--ACGGA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--------------CT-C-----C-T-TTTG-GGA--GCATTATA--A-AAA
gi|6308                       :      AC----GAAC----G-C--ACGCA----CGCA------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-CTTTTG-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6309                       :      AC----GGAC----G-G--ACGCA----CG--------GA-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTT--GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6310                       :      AC----GGAC----G-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCAGCGGC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6311                       :      AC----GCAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6312                       :      AC----AGAT----G-G--ACGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6313                       :      AC----AGAC----G-G--ACAGA----CG--------GA-------CA--------AA-GCAGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6314                       :      AC----GCAT----G-C--ACACA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCTAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6315                       :      AC----GCAT----G-C--ACACA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-CCCCCCACCACC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATG--ATAAA
gi|6316                       :      AC----GCAC----G-C--ATGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GTAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6317                       :      AC----GGAT----G-C--ACTGA----AG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-G-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6318                       :      AC----GGAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGTGGC--TA----TA-TGCT--T-A---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--
gi|6319                       :      AC----GAAC----G-C--ATGC-----TA--------GA-------TG--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--C-C---------CC-C-----T-C-TCTA-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6320                       :       C----GCAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--------TA-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--A-AGCATA--ATAAA
gi|6321                       :        ----GGAC----G-C--ACGC-----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CG-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6322                       :        ----GGAC----G-C--AAGCA----TG--------GA-------CG--------AA-TTGGCGAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-CAA
gi|6323                       :        ----GGAC----G-C--ACGCA----CA--------GT-------TG--------AA-GCTGCGAC--TA----TG-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6324                       :        ----GGAT----G-C--ATGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TG----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TT---GGG--G-AGCATA--A-
gi|6325                       :        ----GGAC----G-C--ACACA----CA---------------------------AA-GCGGTGAC--TA----TAATGCT--T-C---------CT-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6326                       :        ----GGAC----G-C--ACAGA----CG--------GATGGC---CG--------AA-GTGGCCAC--TA----TA-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGAATA--T-AAA
gi|6327                       :        ----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TT-TGCT--T-C---------
gi|6328                       :             GAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TG----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6329                       :             GAT----G-G--ATGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTA-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6330                       :             GAC----A-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GTGGCAAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTT--GGG--G-AGCATT--A-AAA
gi|6331                       :             GAC----A-C--ACGCA----TG--------CA-------CA--------CATGCAAGGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6332                       :              AC----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGCC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----G-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6333                       :               C----G-C--ACACA----TG--------GA-------TA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CCAA-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-
gi|6334                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6335                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6336                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6337                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCTTA--A-
gi|6338                       :                       --ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATT--A-AAA
gi|6339                       :                       --ACACA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCCAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-T-TTT--GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6340                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-
gi|6341                       :                             A----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGCGAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCTTA--
gi|6342                       :                                    --------GA-------CA--------AA-GCAGCGAT--TA----TA-CGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6343                       :                                              -------CG--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6344                       :                                                                A-GCGCAGAC--TA----T---GCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6345                       :                                                                     GTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA


blockSeqs                     :        TTGG                        CCCATACA  ATCCAGA  CACTGACG                               CCCCCACCA    AAAAA                         T
blockSeqs                     :        .                           CA        TGGA     CACGAATG                               .            TAAA                          T
blockSeqs                     :        .                           .         TGGC     .                                      .            G                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             T
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :        .                           .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                             .
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                    .         .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                              .        .                                      .            .                              
blockSeqs                     :                                                                                              .            .                              
blockSeqs                     :                                                                                              .                                           


blockSeqCons                  :  
originalCons                  :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
finalCons                     :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                         1   
lowQualScore                  :        1111    1111 0 00     0000  22222222  3333333  33333333  0        00  0000  0    00 0 111111111  0 22222 0 0    0   00 0      00 0   
lowQualScore                  :        ....    .... . ..     ....  ........  .......  ........  .        ..  ....  .    .. . .........  . ..... . .    .   .. .      .. .   
lowQualScore                  :        0000    0000 5 66     9999  11111111  1111111  00000000  4        66  9999  4    55 4 666666666  4 33333 4 4    4   66 4      66 5   
consensus                     :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
Reference ( family-297 )      :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6241                       :  ACGGAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TATG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6242                       :  ACGGAC----AGAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--AA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6243                       :  ACGGAC----GCAC----T-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GCG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6244                       :  ACGCAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AACATA--A-AAA
gi|6245                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------CA-GCGGAGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6246                       :  ACGGAC----GGAC----G-C--ACCCA----CG--------GA-------TG--------AA-GTGGCGGC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6247                       :  ACAGAC----ACAT----G-C--ACGCA----TG--------GA-------AG--------AA-GCTGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-A-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6248                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6249                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------GC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6250                       :  ACGCAC----ACAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6251                       :  ACAGAC----GGAC----G-G--ACACA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6252                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----CA--------CA-------CG--------AA-GCGACGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTGAGGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6253                       :  ACGGAC----GCAT----G-C--ACACA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TG-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-
gi|6254                       :  ACGGAT----ACAT----G-C--ATGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6255                       :  ATGGAC----GGAC----G-G--ATGCA----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6256                       :  ACGGAC----GGAC----G-G--ACGCA----TG--------AA-------CA--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-CGCATA--A-AAA
gi|6257                       :  ACGGCC----GCAT----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TCCT--T-C---------CC-C-----CGC-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6259                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----TA--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----AA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-ATTG-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6260                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CGCCCATACAGA-------TG--------AA-GCTGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6261                       :  ACGGAC----GGAT----G-C--ATGCA----TG--------GATGGA---CG--------AA-ACGACGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CT-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6262                       :  ACAGAC----GGACACATG-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6263                       :  ACGGAC----GAAA----A-C--ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--CA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTT--GGG--G-AGCATA--
gi|6264                       :  ATGGGC----GGAC----G-C--ACGCA----CA--------GA-------CG--------GA-GCCCCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGT--G-AGCATA--A-TAA
gi|6265                       :  ACGGAC----GGAA----G-G--ATG-G----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TT----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6266                       :  ACGGAT----GGAC----A-C--AC--A----CG--------CA-------CG--------AA-ACATCGAC--TA----TA-TGTT--T-C---------CT-C-----C-C-CTTG-GG
gi|6267                       :  ACGGAC----GGAC----A-C--ATGCA----CG--------GA-------CGCACTGACGAA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------AC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6268                       :  ACGGAC----AGAT----G-C--AGGGA----CA--------GA-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTT--GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6269                       :  ACGCAT----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-T-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6270                       :  ATGGAC----GAAC----G-C--ATGGA----CG--------GA-------AG--------AA-GACGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6271                       :  ACGGAC----GGGC----A-C--ACACA----CA--------GA--------G--------CA-GCAGCGAC--TA----CA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6272                       :  ACAGAT----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GCAGCGAC--TG----TA-GGCT--A-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6273                       :  ACAGAC----GGAC----G-C--ACACA----CA--------GT-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-A--TTG-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6274                       :  ACGGAT----GGAC----A-C--ACGCA----TG--------GA-------TGCACGAATGAA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------TC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6275                       :  ATGGAT----GGAC----G-T--ACGCA----CG--------CA-------TG--------AA-GTGGCGGCAGTA----TT-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGT--G-AGCATA--A-AAA
gi|6276                       :  ATGGAC----AGAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AC-GCGGCAAC--TT----TA-TGTT--T-C---------AC-T-----C-C-TTTG-AGG--G-AGTATA--A-AAA
gi|6277                       :  ACGAACTTGGGAAC----G-C--ACGAA----AG--------GA-------CG--------GA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-CG----C-C-TTT
gi|6278                       :  ACGGAC----GGAA----G-G--ACGGA----CC--------GA-------CG--------AA-GTGGCGAC--TATAATTA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-ATT--GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6279                       :  ACGGAT----GGAT----G-C--ACAGA----TG--------GA-------TG--------AA-GCGGCAAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-AGG--G-TGCATA--A-
gi|6280                       :  ACAGAC----GCAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TT
gi|6281                       :  ACGGAT----GGAC----G-C--ACGGA----CA--------GG-------CG--------AT-GCAGCGAC--TA----TA-TGA---T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--C-AGTATA--A-TAA
gi|6282                       :  ACAGAC----ACAC----G-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AG-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-T-----C-C-TTAC-AGG--G-GCCCTA--A-GAA
gi|6283                       :  ACGGAC----AGAC----C-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TC-TG-T--T-C---------CT-C-----C-C-T
gi|6284                       :  ACGAAT----GTAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-
gi|6285                       :  ACTGAT----GCAT----G-C--ATGCAACCATG--------AA-------CA--------AA-GCAGCACC--TA----TA-TACT--T-C---------CC-A-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6286                       :  ACGGAC----AGAT----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------CT-GCGATTAC--TA----TA-TGCC--A-C---------CC-CAAAAAT-T-TTTG-GGG--G-GGCATA--A-AAA
gi|6287                       :  ACGGAC----GGAC----GGCGGATGGA----CA--------GA-------CG--------AA-GTGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TT
gi|6288                       :  ACGGAC----GGAT----G-T--ATGCA----TG--------GA-------CA--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------TC-C-----
gi|6291                       :   CGGAC----GCAC----G-C--ACACA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6292                       :   CAGAC----GGAT----G-C--ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CT-T-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6293                       :   CGCAT----GGAT----G-C--ACACA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--TCC---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATATTA-AAA
gi|6294                       :  ACAGAC----AGAC----G-C--AC--------------------------CG--------AG-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6296                       : cgcGGAC----GGAC----G-C--AGGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCCGCGAC--TA----TA-TGCTCCC-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATA--A-AA
gi|6297                       :    GGAC----GGAT----G-G--ACGTA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6298                       :    GGAT----GAAC----A-C--AC--A----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCCAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6299                       :    GAAC----GCAT----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GTGGAGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGGGAG-AGCATA--ATAAA
gi|6300                       :    GGAC----GGAC----G-G--ATACA----CG---------------------------AA-GCAGCAAC--TA----TA-TACT--T-C---------C--C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6301                       :    GGAT----GGAC----G-G--ATGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GCAGCAAC--TA----AA-TGCT----C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAT--G-AGCATA--A-AAA
gi|6302                       :    GGAC----AGAT----G-C--ACAAA----CG--------GAATCCAGACG--------AA-GCAGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-CTAAA-T-T-TTTG-AGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6304                       :     GAC----GCAC----G-C--ATGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6305                       :     GAC----GCAC----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6306                       :     GAC----AGAC----G-G--ACGGA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT---------------C-T-----C-C-TTT--GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6307                       :     GAC----AGAC----G-G--ACGGA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--------------CT-C-----C-T-TTTG-GGA--GCATTATA--A-AAA
gi|6308                       :      AC----GAAC----G-C--ACGCA----CGCA------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-CTTTTG-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6309                       :      AC----GGAC----G-G--ACGCA----CG--------GA-------AG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTT--GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6310                       :      AC----GGAC----G-C--ATGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCAGCGGC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6311                       :      AC----GCAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6312                       :      AC----AGAT----G-G--ACGCA----CA--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6313                       :      AC----AGAC----G-G--ACAGA----CG--------GA-------CA--------AA-GCAGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6314                       :      AC----GCAT----G-C--ACACA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCTAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AA
gi|6315                       :      AC----GCAT----G-C--ACACA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-CCCCCCACCACC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATG--ATAAA
gi|6316                       :      AC----GCAC----G-C--ATGCA----CG--------CA-------CA--------AA-GTAGTGAC--TA----TA-TGCT--T-T---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6317                       :      AC----GGAT----G-C--ACTGA----AG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-G-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6318                       :      AC----GGAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGTGGC--TA----TA-TGCT--T-A---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--
gi|6319                       :      AC----GAAC----G-C--ATGC-----TA--------GA-------TG--------AA-GCAGTGAC--TA----TA-TGCT--C-C---------CC-C-----T-C-TCTA-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6320                       :       C----GCAC----G-C--ATGCA----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--------TA-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--A-AGCATA--ATAAA
gi|6321                       :        ----GGAC----G-C--ACGC-----CA--------GA-------CG--------AA-GCGGTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CG-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6322                       :        ----GGAC----G-C--AAGCA----TG--------GA-------CG--------AA-TTGGCGAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-CAA
gi|6323                       :        ----GGAC----G-C--ACGCA----CA--------GT-------TG--------AA-GCTGCGAC--TA----TG-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--ATAAA
gi|6324                       :        ----GGAT----G-C--ATGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TG----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TT---GGG--G-AGCATA--A-
gi|6325                       :        ----GGAC----G-C--ACACA----CA---------------------------AA-GCGGTGAC--TA----TAATGCT--T-C---------CT-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6326                       :        ----GGAC----G-C--ACAGA----CG--------GATGGC---CG--------AA-GTGGCCAC--TA----TA-TGTT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTT-GGG--G-AGAATA--T-AAA
gi|6327                       :        ----GGAC----G-C--ACGCA----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TT-TGCT--T-C---------
gi|6328                       :             GAC----G-C--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TG----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6329                       :             GAT----G-G--ATGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTTA-GGG--G-AGCATA--A-TAA
gi|6330                       :             GAC----A-C--ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GTGGCAAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-T-TTT--GGG--G-AGCATT--A-AAA
gi|6331                       :             GAC----A-C--ACGCA----TG--------CA-------CA--------CATGCAAGGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATA--A-AAA
gi|6332                       :              AC----G-G--ACGGA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGCC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----G-C-TTTT-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6333                       :               C----G-C--ACACA----TG--------GA-------TA--------AA-GTGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CCAA-----A-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-
gi|6334                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6335                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTA-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6336                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GAG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6337                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------CA--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCTTA--A-
gi|6338                       :                       --ACGCA----TG--------GA-------CG--------AA-GCGGCAAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGA--G-AGCATT--A-AAA
gi|6339                       :                       --ACACA----CA--------GA-------CA--------AA-GCGGCCAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-T-TTT--GGG--G-AGCATA--ATAAA
gi|6340                       :                       --ACGCA----CG--------GA-------TG--------AA-GCGGCGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-
gi|6341                       :                             A----CG--------CA-------CG--------AA-GCGGCGAT--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----T-C-TTTG-GGG--G-AGCTTA--
gi|6342                       :                                    --------GA-------CA--------AA-GCAGCGAT--TA----TA-CGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6343                       :                                              -------CG--------AA-GCGGCGAC--TT----TA-TGCT--T-----------CC-C-----C-C-TTTG-AGG--G-AGCATA--A-AAA
gi|6344                       :                                                                A-GCGCAGAC--TA----T---GCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--A-AGCATA--A-AAA
gi|6345                       :                                                                     GTGAC--TA----TA-TGCT--T-C---------CC-C-----C-C-TTTG-GGG--G-AGCATA--ATAAA