lowQualScore : 11 1
lowQualScore : 0 44 0 0000 2222 0 00 11 11111 1 1 0 0 11 0 00 000 0 11111 1 0 00
lowQualScore : . .. . .... .... . .. .. ..... . . . . .. . .. ... . ..... . . ..
lowQualScore : 4 00 4 9999 0000 4 66 00 00000 9 0 2 4 88 4 66 777 4 00000 2 4 66
consensus : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----GGTCCATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
Reference ( gi|30149 ) : TTCAAGTT-TGTT-AA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----GATCCATTTGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30143 : TTCAAGTT-TGTT-AA-AA----TGAA----GGGG-CTCAG--G-----GATCTATTTGG-G--C-TT--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30139 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----GAAG-CT--A--G-----GTTCCATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GGCTTT
gi|30146 : TTCAAATT--GTT-CA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--A-----GATCAATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30172 : TTCCAATT-TGTT-TA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----GATCAATTTGG-G--C-CC--C---G-TA-----A-GG-A--GATTTT
gi|30163 : TTCAAATT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--T-----GGTCCATTAGG-G--C-CA--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTTt
gi|30142 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----GAAA----GGGG-CT--A--G-----GGTCCATTGAG-G--T-CT--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30167 : TTCAAGTT-TGTT-GA-AA----TGAA----GGTG-CT--A--G-----GGTCCATAGGA-G--C-CC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30140 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----GAGG-CT--A--G-----GGTCTATTGGG-G--T-CC--A---T-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30175 : TTCATGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGGA-CT--A--G-----GATTTATTTGG-G--T-CC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30183 : TTCACGTT-TGTT-GA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--T-----GGTCCA-TTGG-G--T-CC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30170 : TTCAAGCT-TGTT-AA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----GTACCAATGGG-A--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30151 : TTCAAATT-TGTT-CG-AA----TATA----AGGG-CT--A--G-----GGTCTATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTTt
gi|30184 : TTCGAATT-TGTT-CA-AA----TAAA----GAGG-CT--A--G-----ATTCCATTTGG-G--T-CT--A---G-TA-----A-GG-G--GATTT
gi|30171 : TTCATGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGGA-CT--A--G-----GACCTA-TTGG-G--T-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30155 : TTGAATTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGGG-TT--A--G-----GATGTATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30148 : TTAAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----AGGA-CT--A--G-----GATCAATTGGG-A--C-CC--A---G-TA-----A-TG-G--GACTTT
gi|30158 : TTTAAATT-TGTT-CA-AA----TAAA----GTGG-CT--A--G-----GATCAA-TTGA-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30160 : TTCAAATT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGAG-AT--A--G-----GATCAGTTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-AG-A--GACTTT
gi|30153 : TTCATGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGGA-CT--A--G-----GATCTATTGGG-A--T-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GCCTTT
gi|30181 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----GTTCCAGTGGT-G--T-CC--A---G-AA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30173 : TTCAAATT-TGTT-CA-AA----TAAA----CAGG-GT--A--G-----GATCGATTT-G-G--C-CC--A---G-TA-----A-GA-G--GACTTT
gi|30190 : TTCAAGTT-TATT-CA-AA----CAAA----TGG--CT--A--G-----GGTCCATTTGG-G--C-CC--G---A-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30162 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AG----TAA-----TGGA-CT--A--G-----GGTCCATTGGG-G--C-CT--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30145 : TTCAAGAT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGGG-TT--A--G-----GGTCAATTGGG-G--C-CG--A---G-TA-----A-GG-G--AACTTT
gi|30161 : TTCATGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGGG-CA--A--G-----GATCTGTTGTG-G--T-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30192 : TTCAAGTT-TATT-TA-AA----TAAA----GCAA-CT--A--G-----GATCCCTTGGG-G--C-CC--T---G-TA-----A-GG-A--GACTTT
gi|30154 : TTCAAGCT-TGTT-CA-AA----TAAA----CAAG-TT--A--G-----GGTCCATTGGG-T--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTt
gi|30141 : TTTAAATT-TGTT-CA-AA----TAAA----GAGG-CA--A--G-----GGTCTATTGGG-A--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTT
gi|30194 : TTCAAGTT-TATT-CA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----GATCTATTGGG-G--C-TC--A---A-TA-----A-ct
gi|30197 : TTTAAGTT-TGTT-CA-AG----TAAA----GGGA-CA--A--G-----GGTCCATTAGG-G--C-CT--A---G-TA-----T-GG-G--GACT
gi|30150 : TTCAATTT-TGTT-AA-AA----TGAT----GGGG-TT--A--T-----GATATATTGGG-G--C-CC--A---G-TT-----A-GG-G--GACTTT
gi|30168 : TTCAAGAG-TGTT-CA-AA----TGAC----AGAG-CT--A--G-----GGTCCACTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30180 : TTTGAATTGTGTT-CA-AA----TGAA----GGGG-TT--A--G-----GATGTATT-GG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30196 : TTCAAATT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGGG-CC--A--G-----GATTGA-TTAG-G--C-CA--A---G-TA-----T-GG-G--GACTT
gi|30174 : TTCAATTT-TGTT-CA-AA----TAAA----AGGG-CG--A--G-----GAACGATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-AG-G--TACTTT
gi|30198 : TTCAAGTT-TGCT-CA-TA----TAAA----GGGG-TA--A--G-----GCTCCATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----T-GGTG--GACTTT
gi|30216 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----CAAA----GTAA-CT--A--A-----GGTCCATTTTG-G--A-CC--A---G-CG-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30214 : TTAAAGTT-TGTA-CA-AA----TCAA----GGGG-CT--T--G-----TATTTATTTGG-G--C-CC--T---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30169 : TTCAAGTT-TGTT-TA-AA----TGAA----GAGA-CT--A--G-----GGTCCATTAGG-G--C-AA--A---G-TA-----A-GA-G--AACCTT
gi|30138 : TTGAAGTT-CGTT-CA-GA----TTAA----GGGG-CT--A--G-----GGTCAATTAGG-A--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTt
gi|30152 : TTTAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----GATG-CT--A--G-----TTTTCATTGGG-G--T-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30200 : TTCAAATT-TGTT-CC-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----GAT-CGTTTGG-GT-T-CC--G---G-TC-----A-AG-G--GACTTT
gi|30177 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----GAGT-CT--A--G-----GATTTATTAGG-A--C-CT------G-TA-----A-TG-G--GACTTT
gi|30218 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----CAAAAT--GGGG-TT--G--G-----G-TCCATCTGG-T--G-CC--A---A-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30147 : TTCAAAGT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGGG-TT--A--G-----GGTATACTGGG-G--T-CC--C---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30166 : TTCAAGTG-TGTT-CA-AA----TAAA----AGAG-CT--A--A-----TATTCATTGGG-G--C-TC--A---A-TA-----A-GG-G--GCCTTT
gi|30178 : TTCAGGTT-TGTT-CA-TA----TGTA----GGGA-CT--A--G-----GGTCTATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-A--GAGTTT
gi|30213 : TCCAAGTT-TGTT-CA-AA----TCAA----GGAA-AT--T--T-----GATTCATTTGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GA-A--GACTTT
gi|30206 : TTCTAGTT-TGTT-CA-TA----CAAA----GGTG-CC--A--G-----GGTCCA-TTGG-G--C-CC--A---G-TA-----C-GG-A--GACTTTt
gi|30203 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGGG-AG--AT-G-----GGTCCATTGGG-G--T-CC--A---G-TA-----A-TT-G--GATTTT
gi|30215 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GAGG-CT--A--G-----GATCTATTTGG-G--C-
gi|30189 : TTTAAATT-TGTT-TA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----CGTCTATAAGG-A--C-CC--A---G-TA-----A-AG-G--TACTTT
gi|30156 : TTTGAATT-TGTT-CA-AA----TGAA----GAGG-TC--A--G-----GATATATTGGG-G--C-CA--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30165 : TTCAAGCT-TGTT-CG-AA----TAAA----CAAG-TT--A--G-----GGTTCATTGGG-T--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30199 : TTCAGGTT-TGTT-TA-AA----TAAA----AGGA-CT--A--G-----GGTTCATT--G-G--CACC--T---G-GA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30176 : TTCATTTT-TGTT-CA-AA----TGAATATAGGGG-CT--A--G-----GATCTATTGGG-G--A-CC--A---G-TA-----A-AG-G--AACTTT
gi|30191 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AG----TACA----GAGG-CA--A--G-----AGTTCATTAGG-G--C-CA--A---G-TA-----AGGG-G--GACTTT
gi|30209 : TTCAAGAT-TGTT-CA-AA----TAAA----TGGT-CT--A--G-----GATCCA-TCGG-GAAC-CC--ATGCA-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30186 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----TGAG-CT--ATTA-----GGT-CACTGGA-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30164 : TTCAAATG-TGTT-CA-AA----AAAA----GAGG-CT--A--G-----GATCGATTGAG-A--C-TC--A---G-TA-----A-GG-G--GACATT
gi|30144 : TTTAAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----CAACCATTGGG-A--C-CA--A---G-TA-----A-
gi|30201 : TTCAAAGT-TGTT-AA-AA----TAAA----GGGG-TT--A--T-----GGTATACTGGG-A--T-CC--C---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30204 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----ATAG-CT--A--G-----GGTCC-TTTGGAG--C-CCTGA---G-TAAGCCTA-GG-G--GACTTT
gi|30208 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGAG-CT--A--C-----TGTTCATTGGG-G--C-TC--A---G-TG-----A-AA-G--AACTT
gi|30217 : TTCATATT-TGTT-CA-AA----TAAA----AGCG-CT--T--G-----TGTTCATTGAG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTT
gi|30212 : TTCAAGTA-TGTT-CA-AA----TAAA----GGAG-CT--A--G-----ATTGCATTGCG-A--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--
gi|30159 : TTCAAGTC-TGTT-CA-AA----TAAA----GAGG-CT--A--T-----TGTCTATTTGG-C--T-AC--A---G-TA-----A-GG-GCAGGCTT
gi|30157 : TTGAATTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGTG-TT--G--G-----GGTATATTGAG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTct
gi|30211 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----AGGG-TT--A--G-----GGCTCATTGGG-C--C-CC--A---G-AA-----A-AT-G--GAATT
gi|30202 : TTCAAGTT-TATT-TA-AA----TGAA----GAGG-CT--G--G-----GGTGTATTGGG-G--C-CC--A---GTTA-----A-
gi|30188 : TTCAAATG-TGTT-CA-AA----TAAA----GAGG-TA--A--A-----GGTTCATTGGA-A--C-TC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30220 : TTCATGTT-TGTT-TG-AA----TGAA----GGAG--T--A--G-----GATCTATTGGG-A--T-CC--A---G-TA-----T-GA-A--GACTTT
gi|30219 : TTCAAGTG-TGTT-CA-AG----TTA-----GGGG-CT--A--A-----GATCCATTGGG-G--C-TC--T---G-TA-----A-CG-A--GAC
gi|30185 : TTCAAGTT-TGTTCAATAA----TAA-------GG-CT--A--G-----GGTCGATTGAG-G--C-CC--A---G-TA-----A-
gi|30210 : TTTAAGTT-TGTT-CA-CA----TAAA----GGGA-CT--A--T-----AGTTAATTGGG-G--T-CA--A---G-TA-----G-TG-G--GACTTT
gi|30193 : TTAAAGTT-TGTA-CA-AA----TCAA----GAGG-CT--T--G-----TATTTATAGGG-A--C-CC--T---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30221 : TTCA-GTT-TGTT-TG-AA----TGGA----AGAG-CT--A--G-----GGTCAATTAGG-T--C-TC--A---G-TG-----A-GG-G--G
gi|30187 : TTCAAGTT-TGTT-CA-AATTTTTAAA----GGGT-CT--G--GAGTCTGGTCAAATGGG-G--C-CT--A---G-TA-----T-GG-G--GA
gi|30205 : TTCAATTT-TGTT-CT-CG----TTAA----GGGGTCT--T--G-----G-TGAAGTGGG-A--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTTgtctt
gi|30207 : TTCAGGTA-TGTT-CA-TA----TTAA----AAGT-CT--C--G-----AGTATATATGG-GA-C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GGATTTt
gi|30227 : TCAA-TT-TGTT-CA-AA----TAAA----GAGA-CC--A--G-----GGTTCATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----AGGG-G--GACTTTt
gi|30228 : TCAAGCC-TGTT-CA-GA----CGAA----GGGG-CT--A--G-----GGTCTACTGGG-G--C-CC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30229 : TCAAGCT-TGTT-CA-AA----TAAA----CAAA-TT--A--A-----GGTCCATTGGG-T--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30231 : TCAAATT-CGTG-TA-AA----TAAA----GGGG-CT--A--G-----GAGCGATTGGG-T--C-CC--A---G-TA-----A-GA-T--GACT
gi|30230 : TCAGGTT-TGTT-CA-AG----CCAT----GACC-CT--A--G-----TTTCAATTGGG-A--T-CC--A---G-TA-----A-GT-G--GACTTT
gi|30235 : CAAATT-TGTT-AA-AA----AAAAAA--GGGG-CA--T--G-----GATCAATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30232 : CAAGTG-TGTT-CA-AA----TGAA----GGGG-AC--A--G-----GGTCAATTGGG-G--C-TC--A---A-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30233 : CAAAGT-TGTT-CA-AC----TAAA----TGGA-CT--A--G-----GGTTTATTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----A-GA-G--GACT
gi|30236 : AAGTT-TGTT-CA-AA----TAAA----TGGG-CT--A--G-----GGTCCATTGGA-G--C-CC--A---G-CA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30238 : AATTT-TGTT-CA-AA----TGAA----AGGG-TT--A--G-----GATGTATTTGG----C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30237 : AATTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GAGG-TC--A--G-----GATATATTGGG-A--C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTTT
gi|30239 : AATTT-TCTT-CA-AA----TGAA----GAGG-TC--A--G-----GATATACTTGG-GA-C-CC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30240 : AAGTT-TGTT-TA-AA----TAAA----GGAG-CT--A--G-----TGTTGGTTGGG-G--C-CC--A---G-TA-----ATTA-G--GACTTT
gi|30241 : AGTT-TGTT-CA-AA----TGAA----GGGG-CT--A--T-----GCTCCATTGGG-T--C-AC--A---G-TA-----A-GG-T--GACTTT
gi|30242 : GTA-TGTT-CA-AA----TAGA----GGGG-AT--A--G-----GGTCTATTGTG-G--C-TC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30243 : TT-TGTT-CA-AA----TAAA----GGGG-TT--A--G-----GGTCCATTGCG-A--T-CC--T---G-TA-----A--G-G--GACTTT
gi|30244 : TT-TGTT-CG-AA----TGAA----GGGG-TT--A--C-----AGTTTGTTGGG-G--C-CT--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30245 : GTT-CA-AA----GAAA----GGGA-CT--A--G-----GGTCCATTGGA-G--T-CC--A---G-TA-----A-GA-A--GACTTT
gi|30246 : A-AA----TAAA----GAGG-CT--A--T-----GATCTATTGGG-A--C-CC--A---G-TA-----G-GG-G--GACTT
Alignments
lowQualScore : 0 0000 1111 0 11 11111 0 1 0 0 0 00 000 0 11111 1 0 00
lowQualScore : . .... .... . .. ..... . . . . . .. ... . ..... . . ..
lowQualScore : 4 9999 9999 4 00 00000 4 1 4 8 4 66 777 4 00000 2 4 66
consensus : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
Reference ( family-285 ) : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30138 : TTGAAGTT-CGTTCAGA----TTAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCAA-T-TAGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTT
gi|30139 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAAGCT-A--G-----GT-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GGCTTT
gi|30140 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GTCC--A---T-TA-----A-AG-G--GACTTTt
gi|30141 : TTTAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCA-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTT
gi|30142 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----GAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGAG-GTCT--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTTct
gi|30143 : TTCAAGTT-TGTTAAAA----TGAA----GGGGCTCA--G-----GGATCTA-T-TTGG-GCTT--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30144 : TTTAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----CA-ACCA-T-TGGG-ACCA--A---G-TA-----A-
gi|30145 : TTCAAGAT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GG-TCAA-T-TGGG-GCCG--A---G-TA-----A-GG-G--AACTTT
gi|30146 : TTCAAATT--GTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--A-----GA-TCAA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30147 : TTCAAAGT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGTT-A--G-----GG-TATA-C-TGGG-GTCC--C---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30148 : TTAAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----AGGACT-A--G-----GA-TCAA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-TG-G--GACTTT
gi|30149 : TTCAAGTT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCCA-T-TTGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30150 : TTCAATTT-TGTTAAAA----TGAT----GGGGTT-A--T-----GA-TATA-T-TGGG-GCCC--A---G-TT-----A-GG-G--GACTTT
gi|30151 : TTCAAATT-TGTTCGAA----TATA----AGGGCT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30152 : TTTAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GATGCT-A--G-----TT-TTCA-T-TGGG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30153 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----A-GG-G--GCCTTT
gi|30154 : TTCAAGCT-TGTTCAAA----TAAA----CAAGTT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30155 : TTGAATTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30156 : TTTGAATT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATA-T-TGGG-GCCA--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30157 : TTGAATTT-TGTTCAAA----TGAA----GGTGTT-G--G-----GG-TATA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30158 : TTTAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GTGGCT-A--G-----GA-TCAA-T-T-GA-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30159 : TTCAAGTC-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--T-----TG-TCTA-T-TTGG-CTAC--A---G-TA-----A-GG-GCAGGCTT
gi|30160 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGAGAT-A--G-----GA-TCAG-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-A--GACTTTct
gi|30161 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGCA-A--G-----GA-TCTG-T-TGTG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30162 : TTCAAGTT-TGTTCAAG----TAA-----TGGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCT--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30163 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--T-----GG-TCCA-T-TAGG-GCCA--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30164 : TTCAAATG-TGTTCAAA----AAAA----GAGGCT-A--G-----GA-TCGA-T-TGAG-ACTC--A---G-TA-----A-GG-G--GACATT
gi|30165 : TTCAAGCT-TGTTCGAA----TAAA----CAAGTT-A--G-----GG-TTCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30166 : TTCAAGTG-TGTTCAAA----TAAA----AGAGCT-A--A-----TA-TTCA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-GG-G--GCCTTT
gi|30167 : TTCAAGTT-TGTTGAAA----TGAA----GGTGCT-A--G-----GG-TCCA-T-AGGA-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30168 : TTCAAGAG-TGTTCAAA----TGAC----AGAGCT-A--G-----GG-TCCA-C-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30169 : TTCAAGTT-TGTTTAAA----TGAA----GAGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TAGG-GCAA--A---G-TA-----A-GA-G--AACCTT
gi|30170 : TTCAAGCT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GT-ACCA-A-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GAGTTTt
gi|30171 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-CCTA-T-T-GG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTt
gi|30172 : TTCCAATT-TGTTTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCAA-T-TTGG-GCCC--C---G-TA-----A-GG-A--GATTTT
gi|30173 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----CAGGGT-A--G-----GA-TCGA-T-T-TG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-G--GACTTTt
gi|30174 : TTCAATTT-TGTTCAAA----TAAA----AGGGCG-A--G-----GA-ACGA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--TACTTT
gi|30175 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-TTTA-T-TTGG-GTCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30176 : TTCATTTT-TGTTCAAA----TGAATATAGGGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-GACC--A---G-TA-----A-AG-G--AACTTT
gi|30177 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAGTCT-A--G-----GA-TTTA-T-TAGG-ACCT------G-TA-----A-TG-G--GACTTT
gi|30178 : TTCAGGTT-TGTTCATA----TGTA----GGGACT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-A--GAGTTT
gi|30180 : TTTGAATTGTGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-T-GG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30181 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GT-TCCA-G-TGGT-GTCC--A---G-AA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30183 : TTCACGTT-TGTTGAAA----TAAA----GGGGCT-A--T-----GG-TCCA-T-T-GG-GTCC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30184 : TTCGAATT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--G-----AT-TCCA-T-TTGG-GTCT--A---G-TA-----A-GG-G--GATTT
gi|30185 : TTCAAGTT-TGTTCAA-----TAAT----AAGGCT-A--G-----GG-TCGA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-
gi|30186 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----TGAGCT-ATTA-----GG-T-CA-C-TGGA-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30187 : TTCAAGTT-TGTTCAAATTTTTAAA----GGGTCT-G--GAGTCTGG-TCAA-A-TGGG-GCCT--A---G-TA-----T-GG-G--GA
gi|30188 : TTCAAATG-TGTTCAAA----TAAA----GAGGTA-A--A-----GG-TTCA-T-TGGA-ACTC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTTgtctt
gi|30189 : TTTAAATT-TGTTTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----CG-TCTA-T-AAGG-ACCC--A---G-TA-----A-AG-G--TACTTT
gi|30190 : TTCAAGTT-TATTCAAA----CAAA----TGG-CT-A--G-----GG-TCCA-T-TTGG-GCCC--G---A-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30191 : TTCAAGTT-TGTTCAAG----TACA----GAGGCA-A--G-----AG-TTCA-T-TAGG-GCCA--A---G-TA-----AGGG-G--GACTTT
gi|30192 : TTCAAGTT-TATTTAAA----TAAA----GCAACT-A--G-----GA-TCCC-T-TGGG-GCCC--T---G-TA-----A-GG-A--GACTTT
gi|30193 : TTAAAGTT-TGTACAAA----TCAA----GAGGCT-T--G-----TA-TTTA-T-AGGG-ACCC--T---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30194 : TTCAAGTT-TATTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-
gi|30196 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCC-A--G-----GA-TTGA-T-T-AG-GCCA--A---G-TA-----T-GG-G--GACTT
gi|30197 : TTTAAGTT-TGTTCAAG----TAAA----GGGACA-A--G-----GG-TCCA-T-TAGG-GCCT--A---G-TA-----T-GG-G--GACT
gi|30198 : TTCAAGTT-TGCTCATA----TAAA----GGGGTA-A--G-----GC-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----T-GGTG--GACTTT
gi|30199 : TTCAGGTT-TGTTTAAA----TAAA----AGGACT-A--G-----GG-TTCA-T-TGGC-ACCT--G---G--A-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30200 : TTCAAATT-TGTTCCAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCGT-T-TGGG-TTCC--G---G-TC-----A-AG-G--GACTTT
gi|30201 : TTCAAAGT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGTT-A--T-----GG-TATA-C-TGGG-ATCC--C---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30202 : TTCAAGTT-TATTTAAA----TGAA----GAGGCT-G--G-----GG-TGTA-T-TGGG-GCCC--A---GTTA-----A-
gi|30203 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGAG-AT-G-----GG-TCCA-T-TGGG-GTCC--A---G-TA-----A-TT-G--GATTTT
gi|30204 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----ATAGCT-A--G-----GG-TCCT-T-TGGA-GCCCTGA---G-TAAGCCTA-GG-G--GACTTT
gi|30205 : TTCAATTT-TGTTCTCG----TTAA----GGGGTC-T--T-----GG-TGAA-G-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30206 : TTCTAGTT-TGTTCATA----CAAA----GGTGCC-A--G-----GG-TCCA-T-T-GG-GCCC--A---G-TA-----C-GG-A--GACTTTt
gi|30207 : TTCAGGTA-TGTTCATA----TTAA----AAGTCT-C--G-----AG-TATA-TATGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GGATTT
gi|30208 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGAGCT-A--C-----TG-TTCA-T-TGGG-GCTC--A---G-TG-----A-AA-G--AACTTt
gi|30209 : TTCAAGAT-TGTTCAAA----TAAA----TGGTCT-A--G-----GA-TCCA-T-CGGGAACCC--ATGCA-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30210 : TTTAAGTT-TGTTCACA----TAAA----GGGACT-A--T-----AG-TTAA-T-TGGG-GTCA--A---G-TA-----G-TG-G--GACTTT
gi|30211 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----AGGGTT-A--G-----GG-CTCA-T-TGGG-CCCC--A---G-AA-----A-AT-G--GAATT
gi|30212 : TTCAAGTA-TGTTCAAA----TAAA----GGAGCT-A--G-----AT-TGCA-T-TGCG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--
gi|30213 : TCCAAGTT-TGTTCAAA----TCAA----GGAAAT-T--T-----GA-TTCA-T-TTGG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-A--GACTTT
gi|30214 : TTAAAGTT-TGTACAAA----TCAA----GGGGCT-T--G-----TA-TTTA-T-TTGG-GCCC--T---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30215 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TTGG-GC
gi|30216 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----CAAA----GTAACT-A--A-----GG-TCCA-T-TTTG-GACC--A---G-CG-----A-GG-G--GACTTT
gi|30217 : TTCATATT-TGTTCAAA----TAAA----AGCGCT-T--G-----TG-TTCA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTT
gi|30218 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----CAAAAT--GGGGTT----G-----GG-TCCA-TCTGGT-GCC---A---A-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30219 : TTCAAGTG-TGTTCAAG----TTA-----GGGGCT-A--A-----GA-TCCA-T-TGGG-GCTC--T---G-TA-----A-CG-A--GAC
gi|30220 : TTCATGTT-TGTTTGAA----TGAA----GGAG-T-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----T-GA-A--GACTTT
gi|30221 : TTCA-GTT-TGTTTGAA----TGGA----AGAGCT-A--G-----GG-TCAA-T-TAGG-TCTC--A---G-TG-----A-GG-G--G
gi|30227 : TCAA-TT-TGTTCAAA----TAAA----GAGACC-A--G-----GG-TTCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----AGGG-G--GACTTT
gi|30228 : TCAAGCC-TGTTCAGA----CGAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCTA-C-TGGG-GCCC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30229 : TCAAGCT-TGTTCAAA----TAAA----CAAATT-A--A-----GG-TCCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30230 : TCAGGTT-TGTTCAAG----CCAT----GACCCT-A--G-----TT-TCAA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----A-GT-G--GACTTT
gi|30231 : TCAAATT-CGTGTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-GCGA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GA-T--GACT
gi|30232 : CAAGTG-TGTTCAAA----TGAA----GGGGAC-A--G-----GG-TCAA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30233 : CAAAGT-TGTTCAAC----TAAA----TGGACT-A--G-----GG-TTTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-G--GACT
gi|30235 : CAAATT-TGTTAAAA----AAAAAA--GGGGCA-T--G-----GA-TCAA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30236 : AAGTT-TGTTCAAA----TAAA----TGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGA-GCCC--A---G-CA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30237 : AATTT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTTTt
gi|30238 : AATTT-TGTTCAAA----TGAA----AGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-T-TG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30239 : AATTT-TCTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATACT-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30240 : AAGTT-TGTTTAAA----TAAA----GGAGCT-A--G-----TG-TTGG-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----ATTA-G--GACTTT
gi|30241 : AGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGCT-A--T-----GC-TCCA-T-TGGG-TCAC--A---G-TA-----A-GG-T--GACTTT
gi|30242 : GTA-TGTTCAAA----TAGA----GGGGAT-A--G-----GG-TCTA-T-TGTG-GCTC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30243 : TT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGTT-A--G-----GG-TCCA-T-TGCG-ATCC--T---G-TA-----A--G-G--GACTTT
gi|30244 : TT-TGTTCGAA----TGAA----GGGGTT-A--C-----AG-TTTG-T-TGGG-GCCT--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30245 : GTTCAAA----GAAA----GGGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGA-GTCC--A---G-TA-----A-GA-A--GACTTT
gi|30246 : TCCAAA----TAAA----GAGGCT-A--T-----GA-TCTA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----G-GG-G--GACTT
Alignments
lowQualScore : 0 0000 1111 0 11 11111 0 1 0 0 0 00 000 0 11111 1 0 00
lowQualScore : . .... .... . .. ..... . . . . . .. ... . ..... . . ..
lowQualScore : 4 9999 9999 4 00 00000 4 1 4 8 4 66 777 4 00000 2 4 66
consensus : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
Reference ( family-285 ) : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30138 : TTGAAGTT-CGTTCAGA----TTAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCAA-T-TAGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTT
gi|30139 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAAGCT-A--G-----GT-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GGCTTT
gi|30140 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GTCC--A---T-TA-----A-AG-G--GACTTTt
gi|30141 : TTTAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCA-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTT
gi|30142 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----GAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGAG-GTCT--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTTct
gi|30143 : TTCAAGTT-TGTTAAAA----TGAA----GGGGCTCA--G-----GGATCTA-T-TTGG-GCTT--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30144 : TTTAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----CA-ACCA-T-TGGG-ACCA--A---G-TA-----A-
gi|30145 : TTCAAGAT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GG-TCAA-T-TGGG-GCCG--A---G-TA-----A-GG-G--AACTTT
gi|30146 : TTCAAATT--GTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--A-----GA-TCAA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30147 : TTCAAAGT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGTT-A--G-----GG-TATA-C-TGGG-GTCC--C---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30148 : TTAAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----AGGACT-A--G-----GA-TCAA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-TG-G--GACTTT
gi|30149 : TTCAAGTT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCCA-T-TTGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30150 : TTCAATTT-TGTTAAAA----TGAT----GGGGTT-A--T-----GA-TATA-T-TGGG-GCCC--A---G-TT-----A-GG-G--GACTTT
gi|30151 : TTCAAATT-TGTTCGAA----TATA----AGGGCT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30152 : TTTAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GATGCT-A--G-----TT-TTCA-T-TGGG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30153 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----A-GG-G--GCCTTT
gi|30154 : TTCAAGCT-TGTTCAAA----TAAA----CAAGTT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30155 : TTGAATTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30156 : TTTGAATT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATA-T-TGGG-GCCA--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30157 : TTGAATTT-TGTTCAAA----TGAA----GGTGTT-G--G-----GG-TATA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30158 : TTTAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GTGGCT-A--G-----GA-TCAA-T-T-GA-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30159 : TTCAAGTC-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--T-----TG-TCTA-T-TTGG-CTAC--A---G-TA-----A-GG-GCAGGCTT
gi|30160 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGAGAT-A--G-----GA-TCAG-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-A--GACTTTct
gi|30161 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGCA-A--G-----GA-TCTG-T-TGTG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30162 : TTCAAGTT-TGTTCAAG----TAA-----TGGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCT--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30163 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--T-----GG-TCCA-T-TAGG-GCCA--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30164 : TTCAAATG-TGTTCAAA----AAAA----GAGGCT-A--G-----GA-TCGA-T-TGAG-ACTC--A---G-TA-----A-GG-G--GACATT
gi|30165 : TTCAAGCT-TGTTCGAA----TAAA----CAAGTT-A--G-----GG-TTCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30166 : TTCAAGTG-TGTTCAAA----TAAA----AGAGCT-A--A-----TA-TTCA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-GG-G--GCCTTT
gi|30167 : TTCAAGTT-TGTTGAAA----TGAA----GGTGCT-A--G-----GG-TCCA-T-AGGA-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30168 : TTCAAGAG-TGTTCAAA----TGAC----AGAGCT-A--G-----GG-TCCA-C-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30169 : TTCAAGTT-TGTTTAAA----TGAA----GAGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TAGG-GCAA--A---G-TA-----A-GA-G--AACCTT
gi|30170 : TTCAAGCT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GT-ACCA-A-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GAGTTTt
gi|30171 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-CCTA-T-T-GG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTt
gi|30172 : TTCCAATT-TGTTTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCAA-T-TTGG-GCCC--C---G-TA-----A-GG-A--GATTTT
gi|30173 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----CAGGGT-A--G-----GA-TCGA-T-T-TG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-G--GACTTTt
gi|30174 : TTCAATTT-TGTTCAAA----TAAA----AGGGCG-A--G-----GA-ACGA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--TACTTT
gi|30175 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-TTTA-T-TTGG-GTCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30176 : TTCATTTT-TGTTCAAA----TGAATATAGGGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-GACC--A---G-TA-----A-AG-G--AACTTT
gi|30177 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAGTCT-A--G-----GA-TTTA-T-TAGG-ACCT------G-TA-----A-TG-G--GACTTT
gi|30178 : TTCAGGTT-TGTTCATA----TGTA----GGGACT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-A--GAGTTT
gi|30180 : TTTGAATTGTGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-T-GG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30181 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GT-TCCA-G-TGGT-GTCC--A---G-AA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30183 : TTCACGTT-TGTTGAAA----TAAA----GGGGCT-A--T-----GG-TCCA-T-T-GG-GTCC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30184 : TTCGAATT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--G-----AT-TCCA-T-TTGG-GTCT--A---G-TA-----A-GG-G--GATTT
gi|30185 : TTCAAGTT-TGTTCAA-----TAAT----AAGGCT-A--G-----GG-TCGA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-
gi|30186 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----TGAGCT-ATTA-----GG-T-CA-C-TGGA-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30187 : TTCAAGTT-TGTTCAAATTTTTAAA----GGGTCT-G--GAGTCTGG-TCAA-A-TGGG-GCCT--A---G-TA-----T-GG-G--GA
gi|30188 : TTCAAATG-TGTTCAAA----TAAA----GAGGTA-A--A-----GG-TTCA-T-TGGA-ACTC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTTgtctt
gi|30189 : TTTAAATT-TGTTTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----CG-TCTA-T-AAGG-ACCC--A---G-TA-----A-AG-G--TACTTT
gi|30190 : TTCAAGTT-TATTCAAA----CAAA----TGG-CT-A--G-----GG-TCCA-T-TTGG-GCCC--G---A-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30191 : TTCAAGTT-TGTTCAAG----TACA----GAGGCA-A--G-----AG-TTCA-T-TAGG-GCCA--A---G-TA-----AGGG-G--GACTTT
gi|30192 : TTCAAGTT-TATTTAAA----TAAA----GCAACT-A--G-----GA-TCCC-T-TGGG-GCCC--T---G-TA-----A-GG-A--GACTTT
gi|30193 : TTAAAGTT-TGTACAAA----TCAA----GAGGCT-T--G-----TA-TTTA-T-AGGG-ACCC--T---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30194 : TTCAAGTT-TATTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-
gi|30196 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCC-A--G-----GA-TTGA-T-T-AG-GCCA--A---G-TA-----T-GG-G--GACTT
gi|30197 : TTTAAGTT-TGTTCAAG----TAAA----GGGACA-A--G-----GG-TCCA-T-TAGG-GCCT--A---G-TA-----T-GG-G--GACT
gi|30198 : TTCAAGTT-TGCTCATA----TAAA----GGGGTA-A--G-----GC-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----T-GGTG--GACTTT
gi|30199 : TTCAGGTT-TGTTTAAA----TAAA----AGGACT-A--G-----GG-TTCA-T-TGGC-ACCT--G---G--A-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30200 : TTCAAATT-TGTTCCAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCGT-T-TGGG-TTCC--G---G-TC-----A-AG-G--GACTTT
gi|30201 : TTCAAAGT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGTT-A--T-----GG-TATA-C-TGGG-ATCC--C---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30202 : TTCAAGTT-TATTTAAA----TGAA----GAGGCT-G--G-----GG-TGTA-T-TGGG-GCCC--A---GTTA-----A-
gi|30203 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGAG-AT-G-----GG-TCCA-T-TGGG-GTCC--A---G-TA-----A-TT-G--GATTTT
gi|30204 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----ATAGCT-A--G-----GG-TCCT-T-TGGA-GCCCTGA---G-TAAGCCTA-GG-G--GACTTT
gi|30205 : TTCAATTT-TGTTCTCG----TTAA----GGGGTC-T--T-----GG-TGAA-G-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30206 : TTCTAGTT-TGTTCATA----CAAA----GGTGCC-A--G-----GG-TCCA-T-T-GG-GCCC--A---G-TA-----C-GG-A--GACTTTt
gi|30207 : TTCAGGTA-TGTTCATA----TTAA----AAGTCT-C--G-----AG-TATA-TATGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GGATTT
gi|30208 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGAGCT-A--C-----TG-TTCA-T-TGGG-GCTC--A---G-TG-----A-AA-G--AACTTt
gi|30209 : TTCAAGAT-TGTTCAAA----TAAA----TGGTCT-A--G-----GA-TCCA-T-CGGGAACCC--ATGCA-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30210 : TTTAAGTT-TGTTCACA----TAAA----GGGACT-A--T-----AG-TTAA-T-TGGG-GTCA--A---G-TA-----G-TG-G--GACTTT
gi|30211 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----AGGGTT-A--G-----GG-CTCA-T-TGGG-CCCC--A---G-AA-----A-AT-G--GAATT
gi|30212 : TTCAAGTA-TGTTCAAA----TAAA----GGAGCT-A--G-----AT-TGCA-T-TGCG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--
gi|30213 : TCCAAGTT-TGTTCAAA----TCAA----GGAAAT-T--T-----GA-TTCA-T-TTGG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-A--GACTTT
gi|30214 : TTAAAGTT-TGTACAAA----TCAA----GGGGCT-T--G-----TA-TTTA-T-TTGG-GCCC--T---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30215 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TTGG-GC
gi|30216 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----CAAA----GTAACT-A--A-----GG-TCCA-T-TTTG-GACC--A---G-CG-----A-GG-G--GACTTT
gi|30217 : TTCATATT-TGTTCAAA----TAAA----AGCGCT-T--G-----TG-TTCA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTT
gi|30218 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----CAAAAT--GGGGTT----G-----GG-TCCA-TCTGGT-GCC---A---A-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30219 : TTCAAGTG-TGTTCAAG----TTA-----GGGGCT-A--A-----GA-TCCA-T-TGGG-GCTC--T---G-TA-----A-CG-A--GAC
gi|30220 : TTCATGTT-TGTTTGAA----TGAA----GGAG-T-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----T-GA-A--GACTTT
gi|30221 : TTCA-GTT-TGTTTGAA----TGGA----AGAGCT-A--G-----GG-TCAA-T-TAGG-TCTC--A---G-TG-----A-GG-G--G
gi|30227 : TCAA-TT-TGTTCAAA----TAAA----GAGACC-A--G-----GG-TTCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----AGGG-G--GACTTT
gi|30228 : TCAAGCC-TGTTCAGA----CGAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCTA-C-TGGG-GCCC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30229 : TCAAGCT-TGTTCAAA----TAAA----CAAATT-A--A-----GG-TCCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30230 : TCAGGTT-TGTTCAAG----CCAT----GACCCT-A--G-----TT-TCAA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----A-GT-G--GACTTT
gi|30231 : TCAAATT-CGTGTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-GCGA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GA-T--GACT
gi|30232 : CAAGTG-TGTTCAAA----TGAA----GGGGAC-A--G-----GG-TCAA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30233 : CAAAGT-TGTTCAAC----TAAA----TGGACT-A--G-----GG-TTTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-G--GACT
gi|30235 : CAAATT-TGTTAAAA----AAAAAA--GGGGCA-T--G-----GA-TCAA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30236 : AAGTT-TGTTCAAA----TAAA----TGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGA-GCCC--A---G-CA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30237 : AATTT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTTTt
gi|30238 : AATTT-TGTTCAAA----TGAA----AGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-T-TG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30239 : AATTT-TCTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATACT-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30240 : AAGTT-TGTTTAAA----TAAA----GGAGCT-A--G-----TG-TTGG-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----ATTA-G--GACTTT
gi|30241 : AGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGCT-A--T-----GC-TCCA-T-TGGG-TCAC--A---G-TA-----A-GG-T--GACTTT
gi|30242 : GTA-TGTTCAAA----TAGA----GGGGAT-A--G-----GG-TCTA-T-TGTG-GCTC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30243 : TT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGTT-A--G-----GG-TCCA-T-TGCG-ATCC--T---G-TA-----A--G-G--GACTTT
gi|30244 : TT-TGTTCGAA----TGAA----GGGGTT-A--C-----AG-TTTG-T-TGGG-GCCT--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30245 : GTTCAAA----GAAA----GGGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGA-GTCC--A---G-TA-----A-GA-A--GACTTT
gi|30246 : TCCAAA----TAAA----GAGGCT-A--T-----GA-TCTA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----G-GG-G--GACTT
blockSeqs : TATA AGTCT C AGCCT G
blockSeqs : AT . T . G
blockSeqs : AA . T . T
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . T
blockSeqCons :
originalCons : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
finalCons : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
Alignments
lowQualScore : 0 0000 1111 0 11 11111 0 1 0 0 0 00 000 0 11111 1 0 00
lowQualScore : . .... .... . .. ..... . . . . . .. ... . ..... . . ..
lowQualScore : 4 9999 9999 4 00 00000 4 1 4 8 4 66 777 4 00000 2 4 66
consensus : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
Reference ( family-285 ) : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30138 : TTGAAGTT-CGTTCAGA----TTAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCAA-T-TAGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTT
gi|30139 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAAGCT-A--G-----GT-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GGCTTT
gi|30140 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GTCC--A---T-TA-----A-AG-G--GACTTTt
gi|30141 : TTTAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCA-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTT
gi|30142 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----GAAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGAG-GTCT--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTTct
gi|30143 : TTCAAGTT-TGTTAAAA----TGAA----GGGGCTCA--G-----GGATCTA-T-TTGG-GCTT--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30144 : TTTAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----CA-ACCA-T-TGGG-ACCA--A---G-TA-----A-
gi|30145 : TTCAAGAT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GG-TCAA-T-TGGG-GCCG--A---G-TA-----A-GG-G--AACTTT
gi|30146 : TTCAAATT--GTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--A-----GA-TCAA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30147 : TTCAAAGT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGTT-A--G-----GG-TATA-C-TGGG-GTCC--C---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30148 : TTAAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----AGGACT-A--G-----GA-TCAA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-TG-G--GACTTT
gi|30149 : TTCAAGTT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCCA-T-TTGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30150 : TTCAATTT-TGTTAAAA----TGAT----GGGGTT-A--T-----GA-TATA-T-TGGG-GCCC--A---G-TT-----A-GG-G--GACTTT
gi|30151 : TTCAAATT-TGTTCGAA----TATA----AGGGCT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30152 : TTTAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GATGCT-A--G-----TT-TTCA-T-TGGG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30153 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----A-GG-G--GCCTTT
gi|30154 : TTCAAGCT-TGTTCAAA----TAAA----CAAGTT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30155 : TTGAATTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30156 : TTTGAATT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATA-T-TGGG-GCCA--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30157 : TTGAATTT-TGTTCAAA----TGAA----GGTGTT-G--G-----GG-TATA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30158 : TTTAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GTGGCT-A--G-----GA-TCAA-T-T-GA-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30159 : TTCAAGTC-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--T-----TG-TCTA-T-TTGG-CTAC--A---G-TA-----A-GG-GCAGGCTT
gi|30160 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGAGAT-A--G-----GA-TCAG-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-A--GACTTTct
gi|30161 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGCA-A--G-----GA-TCTG-T-TGTG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30162 : TTCAAGTT-TGTTCAAG----TAA-----TGGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGG-GCCT--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30163 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--T-----GG-TCCA-T-TAGG-GCCA--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30164 : TTCAAATG-TGTTCAAA----AAAA----GAGGCT-A--G-----GA-TCGA-T-TGAG-ACTC--A---G-TA-----A-GG-G--GACATT
gi|30165 : TTCAAGCT-TGTTCGAA----TAAA----CAAGTT-A--G-----GG-TTCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30166 : TTCAAGTG-TGTTCAAA----TAAA----AGAGCT-A--A-----TA-TTCA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-GG-G--GCCTTT
gi|30167 : TTCAAGTT-TGTTGAAA----TGAA----GGTGCT-A--G-----GG-TCCA-T-AGGA-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30168 : TTCAAGAG-TGTTCAAA----TGAC----AGAGCT-A--G-----GG-TCCA-C-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30169 : TTCAAGTT-TGTTTAAA----TGAA----GAGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TAGG-GCAA--A---G-TA-----A-GA-G--AACCTT
gi|30170 : TTCAAGCT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GT-ACCA-A-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GAGTTTt
gi|30171 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-CCTA-T-T-GG-GTCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTt
gi|30172 : TTCCAATT-TGTTTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCAA-T-TTGG-GCCC--C---G-TA-----A-GG-A--GATTTT
gi|30173 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----CAGGGT-A--G-----GA-TCGA-T-T-TG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-G--GACTTTt
gi|30174 : TTCAATTT-TGTTCAAA----TAAA----AGGGCG-A--G-----GA-ACGA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--TACTTT
gi|30175 : TTCATGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGACT-A--G-----GA-TTTA-T-TTGG-GTCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30176 : TTCATTTT-TGTTCAAA----TGAATATAGGGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-GACC--A---G-TA-----A-AG-G--AACTTT
gi|30177 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GAGTCT-A--G-----GA-TTTA-T-TAGG-ACCT------G-TA-----A-TG-G--GACTTT
gi|30178 : TTCAGGTT-TGTTCATA----TGTA----GGGACT-A--G-----GG-TCTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-A--GAGTTT
gi|30180 : TTTGAATTGTGTTCAAA----TGAA----GGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-T-GG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30181 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GT-TCCA-G-TGGT-GTCC--A---G-AA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30183 : TTCACGTT-TGTTGAAA----TAAA----GGGGCT-A--T-----GG-TCCA-T-T-GG-GTCC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30184 : TTCGAATT-TGTTCAAA----TAAA----GAGGCT-A--G-----AT-TCCA-T-TTGG-GTCT--A---G-TA-----A-GG-G--GATTT
gi|30185 : TTCAAGTT-TGTTCAA-----TAAT----AAGGCT-A--G-----GG-TCGA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-
gi|30186 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----TGAGCT-ATTA-----GG-T-CA-C-TGGA-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30187 : TTCAAGTT-TGTTCAAATTTTTAAA----GGGTCT-G--GAGTCTGG-TCAA-A-TGGG-GCCT--A---G-TA-----T-GG-G--GA
gi|30188 : TTCAAATG-TGTTCAAA----TAAA----GAGGTA-A--A-----GG-TTCA-T-TGGA-ACTC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTTgtctt
gi|30189 : TTTAAATT-TGTTTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----CG-TCTA-T-AAGG-ACCC--A---G-TA-----A-AG-G--TACTTT
gi|30190 : TTCAAGTT-TATTCAAA----CAAA----TGG-CT-A--G-----GG-TCCA-T-TTGG-GCCC--G---A-TA-----A-GG-G--GAGTTT
gi|30191 : TTCAAGTT-TGTTCAAG----TACA----GAGGCA-A--G-----AG-TTCA-T-TAGG-GCCA--A---G-TA-----AGGG-G--GACTTT
gi|30192 : TTCAAGTT-TATTTAAA----TAAA----GCAACT-A--G-----GA-TCCC-T-TGGG-GCCC--T---G-TA-----A-GG-A--GACTTT
gi|30193 : TTAAAGTT-TGTACAAA----TCAA----GAGGCT-T--G-----TA-TTTA-T-AGGG-ACCC--T---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30194 : TTCAAGTT-TATTCAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-
gi|30196 : TTCAAATT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGCC-A--G-----GA-TTGA-T-T-AG-GCCA--A---G-TA-----T-GG-G--GACTT
gi|30197 : TTTAAGTT-TGTTCAAG----TAAA----GGGACA-A--G-----GG-TCCA-T-TAGG-GCCT--A---G-TA-----T-GG-G--GACT
gi|30198 : TTCAAGTT-TGCTCATA----TAAA----GGGGTA-A--G-----GC-TCCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----T-GGTG--GACTTT
gi|30199 : TTCAGGTT-TGTTTAAA----TAAA----AGGACT-A--G-----GG-TTCA-T-TGGC-ACCT--G---G--A-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30200 : TTCAAATT-TGTTCCAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-TCGT-T-TGGG-TTCC--G---G-TC-----A-AG-G--GACTTT
gi|30201 : TTCAAAGT-TGTTAAAA----TAAA----GGGGTT-A--T-----GG-TATA-C-TGGG-ATCC--C---G-TA-----A-GG-G--GACTT
gi|30202 : TTCAAGTT-TATTTAAA----TGAA----GAGGCT-G--G-----GG-TGTA-T-TGGG-GCCC--A---GTTA-----A-
gi|30203 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGAG-AT-G-----GG-TCCA-T-TGGG-GTCC--A---G-TA-----A-TT-G--GATTTT
gi|30204 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----ATAGCT-A--G-----GG-TCCT-T-TGGA-GCCCTGA---G-TAAGCCTA-GG-G--GACTTT
gi|30205 : TTCAATTT-TGTTCTCG----TTAA----GGGGTC-T--T-----GG-TGAA-G-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GATTTT
gi|30206 : TTCTAGTT-TGTTCATA----CAAA----GGTGCC-A--G-----GG-TCCA-T-T-GG-GCCC--A---G-TA-----C-GG-A--GACTTTt
gi|30207 : TTCAGGTA-TGTTCATA----TTAA----AAGTCT-C--G-----AG-TATA-TATGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GGATTT
gi|30208 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGAGCT-A--C-----TG-TTCA-T-TGGG-GCTC--A---G-TG-----A-AA-G--AACTTt
gi|30209 : TTCAAGAT-TGTTCAAA----TAAA----TGGTCT-A--G-----GA-TCCA-T-CGGGAACCC--ATGCA-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30210 : TTTAAGTT-TGTTCACA----TAAA----GGGACT-A--T-----AG-TTAA-T-TGGG-GTCA--A---G-TA-----G-TG-G--GACTTT
gi|30211 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----AGGGTT-A--G-----GG-CTCA-T-TGGG-CCCC--A---G-AA-----A-AT-G--GAATT
gi|30212 : TTCAAGTA-TGTTCAAA----TAAA----GGAGCT-A--G-----AT-TGCA-T-TGCG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--
gi|30213 : TCCAAGTT-TGTTCAAA----TCAA----GGAAAT-T--T-----GA-TTCA-T-TTGG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-A--GACTTT
gi|30214 : TTAAAGTT-TGTACAAA----TCAA----GGGGCT-T--G-----TA-TTTA-T-TTGG-GCCC--T---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30215 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGCT-A--G-----GA-TCTA-T-TTGG-GC
gi|30216 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----CAAA----GTAACT-A--A-----GG-TCCA-T-TTTG-GACC--A---G-CG-----A-GG-G--GACTTT
gi|30217 : TTCATATT-TGTTCAAA----TAAA----AGCGCT-T--G-----TG-TTCA-T-TGAG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTT
gi|30218 : TTCAAGTT-TGTTCAAA----CAAAAT--GGGGTT----G-----GG-TCCA-TCTGGT-GCC---A---A-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30219 : TTCAAGTG-TGTTCAAG----TTA-----GGGGCT-A--A-----GA-TCCA-T-TGGG-GCTC--T---G-TA-----A-CG-A--GAC
gi|30220 : TTCATGTT-TGTTTGAA----TGAA----GGAG-T-A--G-----GA-TCTA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----T-GA-A--GACTTT
gi|30221 : TTCA-GTT-TGTTTGAA----TGGA----AGAGCT-A--G-----GG-TCAA-T-TAGG-TCTC--A---G-TG-----A-GG-G--G
gi|30227 : TCAA-TT-TGTTCAAA----TAAA----GAGACC-A--G-----GG-TTCA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----AGGG-G--GACTTT
gi|30228 : TCAAGCC-TGTTCAGA----CGAA----GGGGCT-A--G-----GG-TCTA-C-TGGG-GCCC--A---T-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30229 : TCAAGCT-TGTTCAAA----TAAA----CAAATT-A--A-----GG-TCCA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACT
gi|30230 : TCAGGTT-TGTTCAAG----CCAT----GACCCT-A--G-----TT-TCAA-T-TGGG-ATCC--A---G-TA-----A-GT-G--GACTTT
gi|30231 : TCAAATT-CGTGTAAA----TAAA----GGGGCT-A--G-----GA-GCGA-T-TGGG-TCCC--A---G-TA-----A-GA-T--GACT
gi|30232 : CAAGTG-TGTTCAAA----TGAA----GGGGAC-A--G-----GG-TCAA-T-TGGG-GCTC--A---A-TA-----A-AG-G--GACTTT
gi|30233 : CAAAGT-TGTTCAAC----TAAA----TGGACT-A--G-----GG-TTTA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-GA-G--GACT
gi|30235 : CAAATT-TGTTAAAA----AAAAAA--GGGGCA-T--G-----GA-TCAA-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30236 : AAGTT-TGTTCAAA----TAAA----TGGGCT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGA-GCCC--A---G-CA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30237 : AATTT-TGTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--AACTTTt
gi|30238 : AATTT-TGTTCAAA----TGAA----AGGGTT-A--G-----GA-TGTA-T-T-TG-GCCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTTt
gi|30239 : AATTT-TCTTCAAA----TGAA----GAGGTC-A--G-----GA-TATACT-TGGG-ACCC--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30240 : AAGTT-TGTTTAAA----TAAA----GGAGCT-A--G-----TG-TTGG-T-TGGG-GCCC--A---G-TA-----ATTA-G--GACTTT
gi|30241 : AGTT-TGTTCAAA----TGAA----GGGGCT-A--T-----GC-TCCA-T-TGGG-TCAC--A---G-TA-----A-GG-T--GACTTT
gi|30242 : GTA-TGTTCAAA----TAGA----GGGGAT-A--G-----GG-TCTA-T-TGTG-GCTC--A---G-TA-----A-AG-G--GACTT
gi|30243 : TT-TGTTCAAA----TAAA----GGGGTT-A--G-----GG-TCCA-T-TGCG-ATCC--T---G-TA-----A--G-G--GACTTT
gi|30244 : TT-TGTTCGAA----TGAA----GGGGTT-A--C-----AG-TTTG-T-TGGG-GCCT--A---G-TA-----A-GG-G--GACTTT
gi|30245 : GTTCAAA----GAAA----GGGACT-A--G-----GG-TCCA-T-TGGA-GTCC--A---G-TA-----A-GA-A--GACTTT
gi|30246 : TCCAAA----TAAA----GAGGCT-A--T-----GA-TCTA-T-TGGG-ACCC--A---G-TA-----G-GG-G--GACTT