lowQualScore : 11111111 22 11 1 1 1 1111 22 111 1 3333333 3333333333333333333333333333333333333333333333 333
lowQualScore : 5 3 2222 1111 22 1111 1111 0 888 9999 1111111 000 000 0 0 0 3 0 0 0 1 1111 1111 00 0 0 111111 0 1 77777777 11 1111 33333333 111111 0 3 333 1 33 22 3 222 44 3 33 0 333 22 333 5 1 1 333 1 4 7 1 5 1 2 3333 555 2 7 55 88888888 1 9 2 888 111 33 5555 5 3333333 6666666666666666666666666666666666666666666666 4 6 444
lowQualScore : . . .... .... .. .... .... . ... .... ....... ... ... . . . . . . . . .... .... .. . . ...... . . ........ .. .... ........ ...... . . ... . .. .. . ... .. . .. . ... .. ... . . . ... . . . . . . . .... ... . . .. ........ . . . ... ... .. .... . ....... .............................................. . . ...
lowQualScore : 4 5 1111 2222 99 2222 2222 5 777 1111 8888888 888 888 5 5 5 3 5 5 5 1 0000 0000 77 5 5 444444 5 0 66666666 22 1111 66666666 555555 9 0 333 9 99 44 1 777 44 1 77 8 000 55 222 4 8 9 000 2 3 1 3 7 6 9 6666 000 9 9 99 44444444 1 9 9 111 888 99 6666 1 6666666 7777777777777777777777777777777777777777777777 2 0 555
consensus : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------TCGGGT---A-CGC-GT--A-T---T--C-A--ACTTCCTGC---ACAAT--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ACGTGG---TCGATTGTTTGAATCGG-CAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAAAATTGTTTTAAT------T-AAATTAAAATAA-AN--TA---ATG--CT---GAATATTTTATTACTCGTTAATA----CTTTTCAAT------------TACAT---A--------------A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTGTTCTTGCTG
Reference ( gi|124167 ) : TACATCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-T-AACTACATCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----A---A--TG----TACATTCAC--------TACA------TTGGGT---A-TG--GT--A-T---T--C-A--ATTTCCTGC---ACAAT--T---GGCAATATTTACAAAAA-GTATCC-ACGTGG---TTGATTGTTTCA-TCAG-CAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATCAGTGTTTTGCCTAAAATTAGTTTAAT------T-AAATTAAAACAA-AC--TA---ATG--CT---AAATATTTTATTAATCATTAATT----CTTTTCAAT------------TACAT---A--------------A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTTAGAGATCTTGCTG
gi|124164 : TACATAGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-T-AACTACATCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-TC----A---A--TG----TACATTTAC--------TACA------TCGGGT---A-TG--GT--A-T---T--C-A--ATTTCCTGC---ACAAC--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ACGTGA---TTGATTGTTTCA-TCGG-CAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-CTTAGTGTTTTGCCTAAAATTGTTTTAAT------T-AAATTAAAATAA-AC--TA---ATG--CT---AAATATTTTATTACTCATTGATA----CTTTTCAAT------------TACAT---A--------------A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAATAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTGTTCTTGCTG
gi|124166 : TACATAGTTGCTCAA----CTTC----AAAA-T----ACAG----TCAGTG-CACTT-T-AACTACATCGCT------GTAA---G---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----A---A--TG----TACATTCAC--------TACA------TCGGGT---A-TG--GT--A-T---T--C-A--ATTTCCTGC---AGAAT--T---GGCAATATTTACAAATA-GAATCC-ACGTGG---TTGATTGTTTCA-TCGG-CAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-CTTAGTGTTTTGCCTAAAATTGTTTTAAT---------AATTAAAATAA-AC--TA---GTG--CT---AAATATTTTATTACTCATTAATA----CTTTTCAAT------------TACAT---A--------------A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACTTATCCACAATTGTCAATGTTCTTGCTG
gi|124168 : TACATCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-T-AACTACATCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAA-CA-A-GAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----A---T--TG----TACATTCAC--------TACA------TCGGGT---A-TG--GT--A-T---T--C-A--ATTTCCTGC---ACAAT--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ATGTGG---TTGATTGTTTCA-TCGG-CAATGTTGGTGAT-ATAA-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAAAATTGTTTTAAT------T-AAATTAAAATAA-AA--CA---ATG--CT---AAATATTTTATTACTTATTAATA----CTTTTCAGT------------TACAT---A--------------A----------T-----------------CAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCAACAATTGTCAGTGTACTTGCTG
gi|124169 : TACATCGTTGCTTAA----CT-C----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-T-AACCACATTGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----A---A--TG----TACATTCACAGTTTCACTACA------TCGCGT---A-TGT-GT--A-T---T--TTA--ATTTCTTGC---ACAAT--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ACGTGG---TTGATTGTTTCA-T--GTCAATGTTGGTGAT-ATTT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAAAATTGTTTTAAT------C-AAGTTAAAATAA-AC--TA---ATG--CT---GAACATTTTATTACTCATTAATA----CTTTTCAAT------------CACAT---A--------------A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTA--CAC--TTGTCAGTGTTCTTGC
gi|124171 : TACATCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CAGTT-T-AACCACATCGAC------GAAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-TC----A---A--TG----TACATTCAC--------TACA------TCGCGT---A-TGT-GT--A-T---T--C-A--ATTTCCTGC---ACAAT--T---GGCAATATTTAC-AAAA-GTATCC-ACATGG---TTGATTGTTTCA-TCAG-CAATGTTGATGAT-ATTT-ATAAAAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTTAAATTGTTTTAAT------T-AAGTTAAAATAA-AG--TA---ATG--CT---GAATATTTAATTACGCATTAATA----CTTTTCAAT------------CACATTGCA--------------A----------TTGAAACCTTTTTTAGTTCAACAGACCATAACTGATTCTCAACTATCCACAGTTGTCAGTGTTCTGGC
gi|124172 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT---AACCACATCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----GTT---T-A-AG------TG-A-CC----A---A--TG----TACATTCAC--------TACA------TCGCGT---A-CGT-GT--ATT---T--C-A--ATTTCCTGC---ATAAT--T---AGC-ATATTTACAAATA-GTATCC-ACGTGG---T
gi|124174 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-A-AACCATACCACT------GTAA---A---A-G-CCAG-C-TTAACAG-CA-A-AAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---T--TG----TACATTCAC--------TACA------TCGCGT---A-TGT-GT--ATT---T--C-A--ACTTCCTGC---ACAAG--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ACGTGG---TC-ATTG
gi|124178 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124179 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCGTGTCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-TG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACACTCAC--------TACA------
gi|124182 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCGTGCCACT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124180 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGCCGCT------ATGA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124184 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CCAG-C-TTGACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--C-A-AG------TG-A-CC----A---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124186 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAT--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AATTGTGTCGCT------GTCA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----C---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124187 : TACTTCGTTGGTTTA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TATATTCAC--------TACA------
gi|124185 : TACTTCGTTGCTTTA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-A-CTAG-C-TTAACAG-TA-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACACTCAC--------TACA--------G-------------------------C-A--GTTTACTGCTTAAGAATGGT---AGCAATA--CACAAACATGTATC
gi|124188 : TACAGCATTGCTTAT----TTTC----CAA--T----ACAA----CCAGAG-CACTT-T-AACCATGTCACT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----ATTG--T-A-AG------TG-A-CC----C---A--TG----TACATTCAC--------TACA------T
gi|124191 : TACTTCGTTACTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-TATCGTGTCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAA-CA-A-GGCTGTTT----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------c
gi|124189 : TACTTTGTTACTCAA----CTTC-----AA--T----ACAG----TCAGTG-CATTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CC-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---T--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124192 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----TCAG----GCAGTG-CACTT-C-AATCATGTCGCT------ATGA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GGA----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----A---A--TA----TACATTCAC--------TACA------
gi|124175 : TACATCGCTGCTTAA----TCTT----CAA--T----ACAG----TCAGTA-CACTT-C-AACCATGTCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-AA-A-GAC----------TTG--T-A-AG------TG-ACCC----ATACA--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124181 : TACTTCGTTTCTTAA----CTTT----CAA--A----ACAG----TAAGTG-CACTT-C-AACCGTGTCGCT------GTAA---A---G-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-TAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----C---A--TG----TACAGTCAC--------TACA------
gi|124194 : TACTTCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----AATA----TCGGTA-CACTT-C-AACCATGCCGCT------ATAA---A---A-T-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-TGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TGCATTCAC--------TACA------gcgcgcacatcacctgtatttatacatctacagcatattctacaaatactat
gi|124193 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTC----AAACTT----AGAG----TCAGTG-CACTT-C-AACTATGTCGCT------TCAA---A---A-G-CTAG-T-TTAACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--CA----TACATTCAC--------TACA------
gi|124177 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CTACTT----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCACT------ACAA---A---A-G-CTAA-C-TTAACAG-TG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TA----TACATTAAC--------TACA------
gi|124195 : TACTTTGTAGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCACT------ATAATACATGTA-G-CTAG-T-TTAACAG-TG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CT----T---A--TG----TACATTCAC--------TACAGACCACTTGGCT---G-TGGAGT--A-CTTGT--C-AACATTACATTC---AGGAT--TCCAGATAATAATTACAA
gi|124170 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ATAG----TCAGTG-CACAT-C-AACCATGTTGCT------GTAA---A---A-G-CAAC-C-TTAACAG-AA-A-GAC----------TTA--T-A-AA------TG-A-CCT---AT--A--TG----TACACTCAC--------TACA------ttggt
gi|124183 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----AATA----TCGGTA-CACTT-C-AACAATGTTGCT------ATAA---A---A-T-CTAG-C-TTAACAG-CA-ATGA-----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TGCATTCAC--------TACA------
gi|124196 : TACATTGTTGCTCAA----GTTC----CAA--C----ACAT----TCGGTG-CACTT-C-AGTCATGTTTCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TCAACAG-CA-A-GTC----T----GCTG--T-A-AG------TG-A-CT----A---T--TG----TGTATTCGC--------TACA------
gi|124198 : TACTTCGTTGCTTAATTAACTTC----CAA--T----ATGA----CCAGTG-CACTT-C-AACCATGTTACTTTATTTATAT---A---A-G-CTAG-A-TCAACAG-CA-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------T
gi|124190 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTA----CAA--T----GCAG----TCGGTG-CATTT-C-AACCATGTCACT------ATAA---A---ATG-TT-G-C-ACAAGAG-CA-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TGCATTCAC--------TACA------Tc
gi|124199 : TACACCGTCGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAA----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCAAT------GTAA---A---A-ACCTAG-C-TTAAC------A-GGC----T----GTTT--T-A-AT------TG-A-CC----T---A--TG----TACA
gi|124165 : TACATCATTGCTTAA----CAAC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACAT-C-AACCATGTCGCT------GTAA---A---A-G-TTAC-T-TTAACAG-AA-A-AAC----------TTG--T-ATGG------TG---CCGT--A---A--CG----TATTTTC
gi|124173 : TACATCGTTCCTTAA----CTTC----CAA--T----ATAG----TCAGTG-CACAG-C-AACCGTGTCGAT------GTTA---A---A-G-CTAC-C-ATAACAG-AA-A-TAC----------TTG--T-A-AGTCTTTCTG----T----T---A--TG----TACATGTACTCTT----TACA------TTTGGG---ACTT--AT--A-C---C--C-A--A----CTGC---ACA
gi|124176 : TACATCGTCGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAA----TCAGTG-CACTT-C-AACAATGTCGCA------TTAA---A---A-G-C-A----TTAACAG-AA-A-GAC----------TTG--C-A-CG------------C----AT--A--CG----TACATACAC--------T
gi|124201 : TACTTTGTTGCTTTA----CTTC----CAG--T----ATAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTAGCT------GTAA---A---A-G-CCAG-C-TTAATA
gi|124202 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----AAAAATACTTAGTAACACTA-C-AAA-ATATCACT------TTAA---A---A-T-CTAG-T-TCAACAG-CA-G-GGC----T----GTTG--T-A-AA------TA-A-TC----T---A--TC----TACAATCACA-------TGCA------T
gi|124208 : GTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CGCTT-C-AAGCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GAA----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124210 : GTTGCTTAA----CTTC----CAACTT----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCGCT------ACAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-TA-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TA----TACATTCAC--------TACA------
gi|124207 : GTTGCTTGA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCGTCTCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-A-TTAACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TAGA------T
gi|124213 : GTTGCTTAA----CTTC----CAG--T----ACAG----TCGGTG-CACTT-C-AACCATGTCACT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TCAACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--C-A-AT------TG-A-CCTATAG---A--TG----TACATTCAC--------TGCA------
gi|124211 : GTTGCTTAA----CCTC----TGG--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCACT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TCAACAG-CA-A-TGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----CCCTTACAC--------TACA------
gi|124209 : GTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCGTGTCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-T------------------------------T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124212 : GTTGATTAA----TTTC----CAA--C----ACTA----TTGGTA-CACTT-C-AACAATGTCGCT------ATAA---A---A-C-CTAG-C-TTAACAG-TG-A-GAC----T----GTTG--T-A-AT------TG-ATCT----A---A--TA-----ACTTTCAC--------TGCA------T
gi|124216 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-T-AGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124218 : TTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTC-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-G------T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124215 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCGTGTCGCT------TTTA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTTAC--------TAcc
gi|124219 : TTGTTTAA----CTTC----TCA--T----ACAG----TCAGTG-CATTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GGC----T----ATTG--T-G-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------T
gi|124220 : TTGCTTAA----CTTC----AAA--T----ACAG----TCAGTA-CCCTT-C-AACCACGTCATT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----GTTG--T-T-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATACAC--------TGCA------
gi|124214 : TTGCTCAA----CTCC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCACGTTGCT------ATAA---T---A-G-CTAG-C-TTAACA--------------T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124217 : TTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACAACGACGCT------ATAA---T---A-G-CTAG-C-TTAACA--------------T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124222 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--C----ACTA----TCGGTA-CACTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-T-TTAACAG-CC-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TA
gi|124224 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-T-AACCATGTTCCT------ATGA---A---A-G-CTAG-G-TTAACAG-CG-A-TGC----T----GTTG--T-T-AG------TG-A-CC----T---A--TA----TACACTCAC--------TACA------
gi|124204 : TTGTTTAA----CTTC----CAG--TCTTTACAG----TCCATG-CACTT-C-AGCCATGTTGCT------ATAA---A---A-G-CAAG-C-TTAACAG-CA-A-GGC----T----GTTG--A-A-AT------TG-G-CC----T---A--TT----TACATTCAC--------TACA------TTATG----A-TG--GT--G-T---TACC-AT-ATTTCCT
gi|124225 : acatattTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ATGA----TTGGTC-CACTT-C-AACCATGTCACC------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CA-A-GGC----T----GTTG--T-A-GC------TG-A-CC----T---A--TT----AACATTCAC--------TACA--------GGGTTAAA-CGCCAT--A-T---T--C-A--A
gi|124227 : TTGCTAAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACAACGACGCT------ATAA---T---A-G-CTAG-C-TTAACA--------------T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TAAATTCAC--------TACA------
gi|124226 : TTGCTGAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACAACAACGCT------ATAA---T---A-G-CTAG-G-TTAACA--------------T----GTTG--T-G-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124228 : TTGCTTAC----ATTC----CAA--T----ACAG----TAGGTG-CCTTT-C-AACAATGTCGCT------ATAA---A---A-T-CTAG-C-TCAACAG-CA-A-AGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CT----T---A--TG----TGCATTCTC--------TGCA----------AT---A-TA--GTACA-T---T--T----ATTTC
gi|124229 : TTGCTTAA----TTTT----CAT--T----ACAG----TTTGTG-CACTT-G-AACAATGTCATT------GTAA---A-----T-CTAG-C-TAAACAG-CA-A-GAC----T----GTTG--C-A-AG------TT-A-CC----T---A--TG----TATGTTCAC--------TACA------T
gi|124221 : TTGCCTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CCCTT-C-AACCATGTCCCT------TTTA---A---A-G-CTAT-C-TTAACAG-CA-A-GAC----T----GTTG--T-A-A
gi|124223 : TTGCTTAA----CTGC----CAG--T----ACAG----TCAGTG-CAATT-T-AACAATGTCATG------ACAA---A---T-G-CTAT-T-TAAACAG-CA-A-AGC----T----AATG--T-C-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124230 : TTGCTTAA----ATTT----CAG--T----ACAG----TCAGTA-CACTC---AACCATGTTGCT------ACAA---A---A-G-CTAG-C-TCAACAG-CA-A-TAT----T----G
gi|124232 : TGCTTAAAA--CTTT----CAG--T----ATAG----TCAGTG-CATTT-C-AACCTTGTCACT------ATAA---A---A-A-CTAG-C-TTAACAA-TG-A-GGA----T----GTTG--C-A-AG------TG-A-TC----T---A--TA----TATTTTCAC--------TACA------
gi|124233 : TGCTTAA----CTTA----TGA--A----ACAG----TAGGTG-CACTT-C-AACCATGTCACT------ATAA---A---A-G-CTAG-T-TTAACAG-AA-A-GGC----T----GTTGTAT-A-AG------TG-A-CC----
gi|124234 : CAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CAATT-C-AATCATGTCGCT------ATAA---A---A-T-CTAG-C-TTAACGG-CA-A-AAA----T----GTTG--T-A-TG------TG-A-CC----T---A--TG----TACATTCAC--------TACA------
gi|124235 : AA----CTTC----AGA--T----ACAG----TTGGTA-AACTT-TTAACCATGTCACT------ATAA---A---A-G-CTCG-C-TCAACAG-CA-G-GGC----C----ATTG--T-A-AA------TT-A-CC----A---AGGTG----TACAGTCA
gi|124236 : A----CTTC----CAA--T----ACTA----TCGGTG-CACTT-C-AACCATATCGTT------ATAA---A---A-T-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GGC----T----ATTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TG----TGTAGTCAC--------TACA------
gi|124237 : A----CTTCAGTGCAA--T----ACAA----TAGGTG-CCCTT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TCAATAG-CG-A-GGC----T----GTTG--TAA-AA------TG-A-CC----C---A--AA----CACATCCAC--------
gi|124238 : ----CTTC----TAA--T----ACAG----TCTGTG-CACCT-C-AACCATGTCGCT------ATAA---A---A-G-CTAT-C-ATGACAG-CG-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-------A---A--TA----CACATT
gi|124242 : --T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-GACCATGTCGCT------ACAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-TA-A-GGC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TA----TAAATTCAC--------TACA------
gi|124241 : --T----ACAG----TCAGTG-CACTT-C-AACCATGTCGCA------ACAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-TA-A-GGC----T----GTTG--T-A-GG------TG-A-CC----T---A--TA----TACATTCAC--------TACA------
gi|124239 : --T----ACA-----TCGTTG-C---T-T-AACCATGTCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTCACAG-AATA-GAC----T----GTTG--T-T-AG------TG-A-CC----GAT-A--TG----TACACTCAC--------TACA------
gi|124243 : ----TCAGTG-CACTT-A-AAC-ATGTTGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TCAACAG-CA-G-GGC----T----GTTG--T-A-AG------CG-A-TCGT--A---A---G----TACATTTAT--------T
gi|124244 : CAATG-CATTT-T-AACCATAGTGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TCAGCAC-CG-G-AAC----T----GTTG--T-A-AG------TC-C-CT----T---A--TG----AACATTCAC--------TACA------
gi|124178 : -CACTTAC-AACAGCCTCGCT------GTTA---A-----G-CTAG-CTTTTATAG-CG-A-CAT----G----GTTG----A-AG------TG------------------------CACTGAC--------TGTA------TTGG
gi|124179 : tacttcgttgcttaactt-CACTTAC-AACAGCCTCACT------GTTA---A-----G-CTAG-CTTTTACAG-CG-A-CAC----G----GTTG----A-AG------TG------------------------CACTGAC--------TGTA------TTGGacctatgtacattcactaca
gi|124182 : tacatcgttgcttaactt-CACTTAC-AACAGCCTCGCT------GTTA---A-----G-CTAG-CTTTTACAG-TG-G-CAC----G----GTTG----A-AG------TG------------------------CACTGAC--------TGTA------TTGGacctatgtacactcactaca
gi|124186 : tacttcgttgcttaactt-CACTTAC-AACAGCCTCGCT------GTTA---A-----G-CTAG-CTTTGACAG-CG-A-CAC----A----ATTG----A-AG------TGCA-CT----G---AC-TG----TAacctatgtacattcactaca
gi|124207 : tacttcgttgcttaacttccat-CACTTAC-AACAGCCTCGCT------GT-T---A---A-T-CTAG-CTTTTACAG-CG-A-GAC----G----GTTG----A-AG------TG------------------------CACTGAC--------TGTA------TTGGacccatgtacattcactaca
gi|124215 : gttgcttgactt-CACTTAC-AACAGCCTTGCT------GTTA---A-----G-CTAG-CTTTAAAAG-CG-A-CAC----G----GTTG----A-AG------TG------------------------CACTGAC--------TGTA------TTGGacctatgtacattcactagat
gi|124181 : ttgcttaactt-CACTTAC-AACAGTATCGCT------GT-T---A---A-G-CTAGCC-TTTACAG-CG-A-CAC----G----GTTG----A-AG------TG-acctatgtacatttacta
gi|124246 : tacttcgtttcttaactttcaaaacagtaagtgT-T-GACCATATCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-AA-A-GAC----T----GTTG--T-A-AG------TG-A-CCT---AT--A--TG----TACACTCAC--------TACA------acccatgtacagtcactacagcgcgcacatcacctgtatttatacatctacagcatattctacaaatactat
gi|124245 : T-T-AACCATGTCGCT------GTAA---A---A-G-CTAG-C-TTCACGGAAA-A-GAT----T----GTTA--T-T-AG------TG-A-CCT---AT--A--TG----TACACTCAC--------TACA------
gi|124247 : CACTGCT------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TTAACAG-CG-A-GGT----T----GTTA--T-A-AG------AG-A-CC----T---A--TG----TGCATT-AC--------TACA------
gi|124248 : T------ATAA---A---A-G-CTAG-C-TCAACAG-CA-A-GCC----TAGGAGTTG--T-A-AG------TG-A-CC----T---A--TGTTACTACATTCAC--------TACA------
gi|124209 : ---A---A-G-CTAG-CTTTTACAG-CG-A-CAC----G----GTTG----A-AG------TG------------------------CACTGAC--------TGTA------TTGG
gi|124253 : gttgcttaacttATA------TTGCGC---A-TGC-AT--A-T---TT-C-A--ACTTCCTGC---ACAAT--T---GGTAATATTTACAAATA-GTATCC-ACATGG---Taagtgacctatgtacattcactaca
gi|124254 : ATA------TCGCGC---A-CGC-GT--A-T---TT-C-A--ACTTCCTAC---ACTAT--T---GGCAATATTTACAAACA-GTATCC-ACGTGG---TC-ATTG
gi|124256 : ATA------TCGCGC---A-CGC-GT--A-T---TT-C-A--ACTTCCTAC---ACTAT--T---GGCAATATTAACAAACA-GTATCC-ACGTTG---TC-ATTG
gi|124255 : ATA------TCGCGC---A-CGC-GT--A-T---TT-C-A--ACTTCCTGC---GCAAT--T---TGCAATATTTACAAATT-GTATTT-ACGTGG---T
gi|124259 : A------TCGCGT---A-CGT-GT--A-T---TT-C-A--ACTTCCTGC---ATAAT--T---GGCAATATTAACAAACA-GTATCA-ACGTGG---TC-ATTG
gi|124261 : GGAT---A-TG--GT--A-T---T--C-A--ATTTCCTGC---ACAAT--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ATGTGG---TTGATTGTTTCA-TCGG-CAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAAAATTGTTTTAAT------T-AAATTAAAATAA-AC--CA---ATG--CT---AAATATTTTATTACTCATTAATA----CTTTTCAAT------------TACAT---A--------------A----------TCATAGCACTTGTTAGATCAACAGACCATAACTGGTTCTCACTTATCAACAATTGCCAGTGTCCTTGCTG
gi|124260 : GT---A-TGC-AT--A-T---TT-C-A--ACTTCCTGC---ACAAT--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ACATGG---TC-ATTG
gi|124252 : tcgcGC---A-TGT-GT--A-T---T--TTA--ACTTCCTGC---ACAAT--T---GGCAACATTTACAAATA-GTATCC-ATGTGG---TT-ATTG
gi|124262 : atatcat--GT--A-T---TT-C-A--ACTTCCTAC---ACTAT--T---GGCAATATTTACAAACA-GTATCC-ACGTGG---TC-ATTG
gi|124250 : --GT--A-T---TT-C-T--ACTTCCTGC---ACATT--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ACGTGG---TC-ATTG
gi|124264 : atatcgcgtaccc-T---T--C-A--ACTTCCTGC---ACAAG--T---GGCAATATTTACAAATA-GTATCC-ACGTGGCCATTGAATG
gi|124265 : -T---T--C-A--GCTTTTTGC---ACAAT--T---GGCAATATTTACAAATA-GAATCC-ACATGG---TCAAT
gi|124266 : -T---T--T-A--ACTTCCTGC---ACAGT--T---ATCAATATTTACAAATA-GTATCC-ACATGG---TC-ATTG
gi|124270 : ATATTTATCAATT-GCATTAGATGTGA---TTGA-------A-TCAG-CAATGTTGATGATGATAT--TAATATACATGTATAAGTGTTTGGCCTAAAATTGTTTTATT------T-TTTTTATAAGAA-AA--TATT-ATA--CT---ATATATTTCATTACTTGTTA-------CTTTTCAATAACATACTTGACTACAT---A--------------AAA--------TTATACCCCCAGTTCGTTCAACAGACTGTAACTGGTTGTCACCTATCCACAACTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124273 : GG---CCGATTGTTTGAATCGG-CAATGGTGATGAT-A-ATGATGATAT---TG-ATAAGTGTTTTGCCTAAAATTGTTTTGAT------TTAGATAAAAATAA-ATATTAC--ATGTACT---GAATATTTTATTACTTGTTA-------CTTTTCAATGACATACTTGACTACAT---ATA------------A----------TCATAGCCCTAGTTTGTTCAACAGACCATGACTGGTTCTCACCT
gi|124274 : GG---CCGATTGTTTGAATCGG-CAATGTTGGTGAT-AATT-ATGATAT---CG-ATTGGTGTTTTACATGAAATGGTTTTAAT------T-TAGATAAAAAAA-AA--TA---ATG--CT---GAATATTTTATTACTTGTTA-------CTTTTCAAT------------AAC-----A--------------A----------TTATAGCCCTAGTTTGTTCAACAGACCATAATTGGttattc
gi|124275 : TGATAGTTTGAATCAG-CGATGTTGATGAT-ATTT-ATGATAT---TG-ATTAGAGTTTTGCTTAAAGTTGTTTTAAT------T-CAGATAAAA-AA-AT--TA---ATG--CT---GAATATTTGATTACTTGTTA-------CTTTTCAAT------------AACAT---A--------------A----------TTATAGTCCTTGTCAGTTCAACAGACCATTACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124276 : GATTGTTTGAATCGG-CAATGCTGATGAT-A-ATGATGATAT---TG-ATTACTGTTTTGCCTAAAACT----TAA---------AAAT-GATACA------TG----TA--CT---GAATATTTTAATGA-CAT--A------CTT---GAC------------TACAT---ATA------------A----------TCATAGCCCTAGTTTATTCAACAATCCATAACTGGTTCTCACCTTTCCACAACTGTC---GGTCTTATTG
gi|124277 : ATTGTTTGAATCAG-CAATGTTAATGAC-A-ATGATGATTT---TG-ATAAATGATTTGCCTAAAAGTGTTTTAAT------T-TAGATAATAAAA-AA--TA---ATA--CT---GAATATTTTATTACTTGTTA--------CTTTCAATGATA--------TACAT---G--------------ACTACATATACTTATAGCCCCAATTCGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCATCAATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGCTGctg
gi|124278 : ATTGTTTGAATCGG-CAATGCTGATGAT-AACG-ATGATAT---TG-ATTAGTTTTTTGGCTAAAACT----TAGT------T-AAA--AAAAGGATAC--AT---ATA--CT---GAATATTTTATTA--C-TTAAT-----------AA---------------------A--------------G----------TT---------GTTA-TTCAACATACCATAACTGGTTCTCACCTTTCCACAACTGTCGGTCTTCTTGCTG
gi|124279 : TTGTTTGA-ATAGACAATGTTG-----------ATGATAA---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAAAATTGTTTTAATGTTTGAT-AAACTAATATAT-AT--TATAGAT---CTTTTGAATATTTTATTACTTA--AATTGTTACTTTTCAAT------------GACAT---ACTTGACTTCAATTAA----------TTATAGTCCCAGTTCGTTCAACAGAACAGAACTGGTTCTCACTGATCCACAATTGTCAGTTTTCTTGCTG
gi|124280 : AC------------TACAT---AT-------------A----------ATATAGCCCAAGTTCATTCAACAGACCATAACTGGTTCTAACCTATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGC
Alignments
lowQualScore : 111111 1 1 1 1111 111 11111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 1 2222 1111 22 1111 1111 0 0 111111 0 11111 0 0 0 22 1111 1111 00 0 111111 4444 1111 11 1111 0 33333333 5 333 555555 3 2 3 1 22 1 1 2 1 3 0 0 2 0000 444 2 99999999 2 33 2 777777 1 1 33 3 222 33 444 2 11111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 2
lowQualScore : . .... .... .. .... .... . . ...... . ..... . . . .. .... .... .. . ...... .... .... .. .... . ........ . ... ...... . . . . .. . . . . . . . . .... ... . ........ . .. . ...... . . .. . ... .. ... . ........ .......................................................... . .
lowQualScore : 0 0000 2222 88 2222 2222 5 5 555555 5 33333 5 5 5 77 1111 1111 77 5 666666 7777 2222 33 2222 5 99999999 5 333 999999 2 8 2 6 44 7 7 4 5 3 6 8 7 9999 777 7 11111111 5 44 5 222222 4 2 44 4 888 44 444 5 88888888 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 9 5
consensus : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----CGTA-TT-C-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ANTA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTC--GTTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTNTTCTTGCTG
Reference ( family-275 ) : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGGGT---ACG-----CGTA-TT-C-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ANTA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTC--GTTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTGTTCTTGCTG
gi|124164 : TACATAGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAT------C----A----A--TG----T-ACATTTAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAC--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGATTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-CTTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ACTA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTGATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAATAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTGTTCTTGCTG
gi|124165 : TACATCATTGCTTAA----CAAC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACATC-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-TTACTTTAACAG-AA-AAAC----------TTG--T-A
gi|124166 : TACATAGTTGCTCAA----CTTC----AAAA-T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-G-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCAGAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GAATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-CTTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T--------AATTAAAATAA--ACTA---GTG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACTTATCCACAATTGTCAATGTTCTTGCTGtggtgccgtaacgtattttc
gi|124167 : TACATCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATTGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAAAA-GTATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCAGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATCAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTAGTTTA--A-T------TAAATTAAAACAA--ACTA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTAATC--ATTAATTCTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTTAGAGATCTTGCTG
gi|124168 : TACATCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAA-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----T--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAA-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--AACA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTT--ATTAATACTTTTCAGT------------TAC----------A--------------T---A--A---------------------------TCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCAACAATTGTCAGTGTACTTGCTG
gi|124169 : TACATCGTTGCTTAA----CT-C----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACCACATTGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCACAGTTTCACTACATCGCGT---ATG-----TGTA-TT-TTA-ATTTCTTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA--TGTCAATGTTGGTGAT-ATTT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------CAAGTTAAAATAA--ACTA---ATG--C---TGAACATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------CAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTA--CAC--TTGTCAGTGTTCTTGC
gi|124170 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ATAG----TCAGTG-CACATC-AACCATGTTGCT------GTAA-A-----A-G-CAACCTTAACAG-AA-AGAC----------TTA--T-AAATGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124171 : TACATCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CAGTTT-AACCACATCGAC------GAAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAT------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ATG-----TGTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAA-A-GTATCCACATGGTTGAT-TGTTT-CATCAGCAATGTTGATGAT-ATTT-ATAAAAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTTA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAGTTAAAATAA--AGTA---ATG--C---TGAATATTTAA-TTACGC--ATTAATACTTTTCAAT------------CAC----------A--------------TTGCA--A----------TTGAAACCTTTTTTAGTTCAACAGACCATAACTGATTCTCAACTATCCACAGTTGTCAGTGTTCTGGC
gi|124172 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT--AACCACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTT---T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----TGTATTT-C-A-ATTTCCTGCATAAT--TAGC-ATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGT
gi|124173 : TACATCGTTCCTTAA----CTTC----CAA--T----ATAG----TCAGTG-CACAGC-AACCGTGTCGAT------GTTA-A-----A-G-CTACCATAACAG-AA-ATAC----------TTG--T-AAGT--CTTTCTGT----T----A--TG----T-ACATGTACTCTT----TACATTTGGG---ACT-----TATA-CC-C-A-A----CTGCACA
gi|124174 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTA-AACCATACCACT------GTAA-A-----A-G-CCAGCTTAACAG-CA-AAAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----T--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ATG-----TGTATTT-C-A-ACTTCCTGCACAAG--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124175 : TACATCGCTGCTTAA----TCTT----CAA--T----ACAG----TCAGTA-CACTTC-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-AA-AGAC----------TTG--T-AAGTGAC------CCATAC----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124176 : TACATCGTCGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAA----TCAGTG-CACTTC-AACAATGTCGCA------TTAA-A-----A-G-C-A--TTAACAG-AA-AGAC----------TTG--C-ACG---C------A----T----A--CG----T-ACATACAC--------T
gi|124177 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CTACTT----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ACAA-A-----A-G-CTAACTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTAAC--------TACA
gi|124178 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124179 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124180 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGCCGCT------ATGA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124181 : TACTTCGTTTCTTAA----CTTT----CAA--A----ACAG----TAAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----G-G-CTAGCTTAACAG-CG-ATAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACAGTCAC--------TACAGCGCGC---ACATCACCTGTA-TT-T-ATACAT-CTACA--------GC-ATATTCTACAAATA-CTAT
gi|124182 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGCCACT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124183 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----AATA----TCGGTA-CACTTC-AACAATGTTGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CA-ATGA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACA
gi|124184 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CCAGCTTGACAG-CG-AGGC----T----GTTG--C-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124185 : TACTTCGTTGCTTTA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-A-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACAGCAG------------------TT-T---ACTGCTTA-AGAATGGTAGCAATA---CACAAACATGTATC
gi|124186 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAT--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AATTGTGTCGCT------GTCA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124187 : TACTTCGTTGGTTTA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ATATTCAC--------TACA
gi|124188 : TACAGCATTGCTTAT----TTTC----CAA--T----ACAA----CCAGAG-CACTTT-AACCATGTCACT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----ATTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATC
gi|124189 : TACTTTGTTACTCAA----CTTC-----AA--T----ACAG----TCAGTG-CATTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CC-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----T--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124190 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTA----CAA--T----GCAG----TCGGTG-CATTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----ATG-TT-GCACAAGAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACAT
gi|124191 : TACTTCGTTACTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-TATCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAA-CA-AGGCTGTTT----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124192 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----TCAG----GCAGTG-CACTTC-AATCATGTCGCT------ATGA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124193 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTC----AAACTT----AGAG----TCAGTG-CACTTC-AACTATGTCGCT------TCAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--CA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124194 : TACTTCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----AATA----TCGGTA-CACTTC-AACCATGCCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CA-ATGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACA
gi|124195 : TACTTTGTAGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAATACATGTA-G-CTAGTTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------T----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124196 : TACATTGTTGCTCAA----GTTC----CAA--C----ACAT----TCGGTG-CACTTC-AGTCATGTTTCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-AGTC----T----GCTG--T-AAGTGA-------C----T----AT-TG----T-GTATTCGC--------TACAgaccacttggctgtggagtacttgtcaacattacattcaggattccagataataattacaattggt
gi|124198 : TACTTCGTTGCTTAATTAACTTC----CAA--T----ATGA----CCAGTG-CACTTC-AACCATGTTACTTTATTTATAT-A-----A-G-CTAGATCAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATC
gi|124199 : TACACCGTCGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAA----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCAAT------GTAA-A-----A-ACCTAGCTTAAC------AGGC----T----GTTT--T-AATTGAC------C----T----A--TG----T-ACA
gi|124201 : TACTTTGTTGCTTTA----CTTC----CAG--T----ATAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTAGCT------GTAA-A-----A-G-CCAGCTTAATA
gi|124202 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----AAAAATACTTAGTAACACTAC-AAA-ATATCACT------TTAA-A-----A-T-CTAGTTCAACAG-CA-GGGC----T----GTTG--T-AAATAAT------C----T----A--TC----T-ACAATCACA-------TGCAT
gi|124204 : TTGTTTAA----CTTC----CAG--TCTTTACAG----TCCATG-CACTTC-AGCCATGTTGCT------ATAA-A-----A-G-CAAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--A-AATTGGC------C----T----A--TT----T-ACATTCAC--------TACAT
gi|124207 : acatattGTTGCTTGA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTCTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGATTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TAGATtatgatggtgttaccatatttcct
gi|124208 : GTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CGCTTC-AAGCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGAA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124209 : GTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCT-----------------------------T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124210 : GTTGCTTAA----CTTC----CAACTT----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124211 : GTTGCTTAA----CCTC----TGG--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-ATGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----C-CCTTACAC--------TACA
gi|124212 : GTTGATTAA----TTTC----CAA--C----ACTA----TTGGTA-CACTTC-AACAATGTCGCT------ATAA-A-----A-C-CTAGCTTAACAG-TG-AGAC----T----GTTG--T-AATTGAT------C----T----A---A----TAACTTTCAC--------TGCAT
gi|124213 : GTTGCTTAA----CTTC----CAG--T----ACAG----TCGGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--C-AATTGAC------C----TATAGA--TG----T-ACATTCAC--------TGCA
gi|124214 : TTGCTCAA----CTCC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCACGTTGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124215 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------TTTA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTTAC--------TA
gi|124216 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-TAGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124217 : TTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACGACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124218 : TTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTCC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AG------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACACC
gi|124219 : TTGTTTAA----CTTC----TCA--T----ACAG----TCAGTG-CATTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----ATTG--T-GAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACAT
gi|124220 : TTGCTTAA----CTTC----AAA--T----ACAG----TCAGTA-CCCTTC-AACCACGTCATT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-TAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATACAC--------TGCA
gi|124221 : TTGCCTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CCCTTC-AACCATGTCCCT------TTTA-A-----A-G-CTATCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AA
gi|124222 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--C----ACTA----TCGGTA-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-CC-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TA
gi|124223 : TTGCTTAA----CTGC----CAG--T----ACAG----TCAGTG-CAATTT-AACAATGTCATG------ACAA-A-----T-G-CTATTTAAACAG-CA-AAGC----T----AATG--T-CAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124224 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACCATGTTCCT------ATGA-A-----A-G-CTAGGTTAACAG-CG-ATGC----T----GTTG--T-TAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124225 : TTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ATGA----TTGGTC-CACTTC-AACCATGTCACC------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AGCTGAC------C----T----A--TT----A-ACATTCAC--------TACA--GGGTTAAACGC----CATA-TT-C-A-A
gi|124226 : TTGCTGAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACAACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGGTTAACA-------------T----GTTG--T-GAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124227 : TTGCTAAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACGACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-AAATTCAC--------TACA
gi|124228 : TTGCTTAC----ATTC----CAA--T----ACAG----TAGGTG-CCTTTC-AACAATGTCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTCAACAG-CA-AAGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------T----T----A--TG----T-GCATTCTC--------TGCA
gi|124229 : TTGCTTAA----TTTT----CAT--T----ACAG----TTTGTG-CACTTG-AACAATGTCATT------GTAA-A-------T-CTAGCTAAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--C-AAGTTAC------C----T----A--TG----T-ATGTTCAC--------TACATatatagtacatttatttc
gi|124230 : TTGCTTAA----ATTT----CAG--T----ACAG----TCAGTA-CACT-C-AACCATGTTGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-A
gi|124232 : TGCTTAAAA--CTTT----CAG--T----ATAG----TCAGTG-CATTTC-AACCTTGTCACT------ATAA-A-----A-A-CTAGCTTAACAA-TG-AGGA----T----GTTG--C-AAGTGAT------C----T----A--TA----T-ATTTTCAC--------TACAtattg
gi|124233 : TGCTTAA----CTTA----TGA--A----ACAG----TAGGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-AA-AGGC----T----GTTGTAT-AAGTGAC------C----
gi|124234 : AA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CAATTC-AATCATGTCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACGG-CA-AAAA----T----GTTG--T-ATGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124235 : cAA----CTTC----AGA--T----ACAG----TTGGTA-AACTTTTAACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTCGCTCAACAG-CA-GGGC----C----ATTG--T-AAATTAC------C----A----AGGTG----T-ACAGTCA
gi|124236 : A----CTTC----CAA--T----ACTA----TCGGTG-CACTTC-AACCATATCGTT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----ATTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GTAGTCAC--------TACA
gi|124237 : A----CTTCAGTGCAA--T----ACAA----TAGGTG-CCCTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAATAG-CG-AGGC----T----GTTG--TAAAATGAC------C----C----A--AA----C-ACATCCAC--------
gi|124238 : ----CTTC----TAA--T----ACAG----TCTGTG-CACCTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTATCATGACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAA----------------A--TA----C-ACATT
gi|124239 : --T----ACA-----TCGTTG-C---TT-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTCACAG-AATAGAC----T----GTTG--T-TAGTGAC------CGA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124241 : --T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCA------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AGGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124242 : --T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-GACCATGTCGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-AAATTCAC--------TACA
gi|124243 : ----TCAGTG-CACTTA-AAC-ATGTTGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-GGGC----T----GTTG--T-AAGCGAT------CG---T----A--AG----T-ACATTTAT--------T
gi|124244 : CAATG-CATTTT-AACCATAGTGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAGCAC-CG-GAAC----T----GTTG--T-AAGTCCC------T----T----A--TG----A-ACATTCAC--------TACA
gi|124245 : TT-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTCACGGAAA-AGAT----T----GTTA--T-TAGTGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124246 : ACCATATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-AA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124247 : ttgGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGT----T----GTTA--T-AAGAGAC------C----T----A--TG----T-GCATT-AC--------TACA
gi|124248 : cactT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-AGCC----TAGGAGTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TGTTACT-ACATTCAC--------TACA
gi|124250 : ATATCGCGT---ACC-----CGTA-TTTC-T-ACTTCCTGCACATT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124252 : ATATCATGC---ATG-----TGTA-TT-TTA-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAACATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTT-AT-TG
gi|124253 : ATATTGCGC---ATG-----CATA-TTTC-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGTAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGT
gi|124254 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-TACAAACA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124255 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTGCGCAAT--TTGCAATATT-TACAAATT-GTATTTACGTGGT
gi|124256 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-AACAAACA-GTATCCACGTTGTC-AT-TG
gi|124259 : ATCGCGT---ACG-----TGTA-TTTC-A-ACTTCCTGCATAAT--TGGCAATATT-AACAAACA-GTATCAACGTGGTC-AT-TG
gi|124260 : TCGCGT---ATG-----CATA-TTTC-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGTC-AT-TG
gi|124261 : GGAT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ACCA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TCATAGCACTTGTTAGATCAACAGACCATAACTGGTTCTCACTTATCAACAATTGCCAGTGTCCTTGCTG
gi|124262 : GTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-TACAAACA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124264 : -TT-C-A-ACTTCCTGCACAAG--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGCC-AT-TG
gi|124265 : -TT-C-A-GCTTTTTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GAATCCACATGGTCAAT-aatg
gi|124266 : -TT-T-A-ACTTCCTGCACAGT--TATCAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGTC-AT-TG
gi|124270 : ATATT-TATCAATT-GCAT--------TAGATGTGATTGAATCAGCAATGTTGATGATGATAT--TAATATACATGTATAAGTGTTTGGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--T-T------TTTTTTATAAGAA--AATATT-ATA--C---TATATATTTCA-TTACTT--GTTA---CTTTTCAATAACATACTTGACTAC----------A--------------T---A--AAA--------TTATACCCCCAGTTCGTTCAACAGACTGTAACTGGTTGTCACCTATCCACAACTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124273 : GGCCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGGTGATGAT-A-ATGATGATAT---TG-ATAAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTG--ATT------TAGATAAAAATAAATATTAC--ATGTAC---TGAATATTTTA-TTACTT--GT---TACTTTTCAATGACA--------TACTTGACTACATA--------------T---A--A----------TCATAGCCCTAGTTTGTTCAACAGACCATGACTGGTTCTCACCT
gi|124274 : GGCCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-AATT-ATGATAT---CG-ATTGGTGTTTTACATGA--------AA-TGGTTTTA--A-T------TTAGATAAAAAAA--AATA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTT--GT---TACTTTTCAAT------------AAC-----------------------------A--A----------TTATAGCCCTAGTTTGTTCAACAGACCATAATTGGttattc
gi|124275 : GAT-AGTTTGAATCAGCGATGTTGATGAT-ATTT-ATGATAT---TG-ATTAGAGTTTTGCTTAA--------AG-TTGTTTTA--A-T------TCAGATAAAA-AA--ATTA---ATG--C---TGAATATTTGA-TTACTT--GTTA---CTTTTCAAT------------AAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGTCCTTGTCAGTTCAACAGACCATTACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124276 : tGAT-TGTTTGAATCGGCAATGCTGATGAT-A-ATGATGATAT---TG-ATTACTGTTTTGCCTAA--------AA-CT----TA--A---------AAAT---GATAC--AT-----GTA--C---TGAATATTTTAATGAC--------ATACTT---GAC------------TAC----------A--------------T---ATAA----------TCATAGCCCTAGTTTATTCAACAATCCATAACTGGTTCTCACCTTTCCACAACTGTCGGTCTTATTGCTG
gi|124277 : AT-TGTTTGAATCAGCAATGTTAATGAC-A-ATGATGATTT---TG-ATAAATGATTTGCCTAA--------AA-GTGTTTTA--A-T------TTAGATAATAAAA--AATA---ATA--C---TGAATATTTTA-TTACTT--GTTA----CTTTCAATGATA--------TAC----------A--------------T---G--ACTACATATACTTATAGCCCCAATTCGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCATCAATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124278 : AT-TGTTTGAATCGGCAATGCTGATGAT-AACG-ATGATAT---TG-ATTAGTTTTTTGGCTAA--------AA-CT----TA--G-T------TAAA--AAAAGGA--TACAT--ATA--C---TGAATATTTTA-TTACT-----TAATA----------------------------------A------------------A--G----------TT---------GTTA-TTCAACATACCATAACTGGTTCTCACCTTTCCACAACTGTCGGTCTTCTTGCTG
gi|124279 : T-TGTTTGAATAGACAATGTTG-----------ATGATAA---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-TGTTTGATAAACTAATATAT--ATTATAGAT---CTTTTGAATATTTTA-TTACTTAAATTGTTACTTTTCAAT------------GAC----------ATACTTGACTTCAATT---A--A----------TTATAGTCCCAGTTCGTTCAACAGAACAGAACTGGTTCTCACTGATCCACAATTGTCAGTTTTCTTGCTG
gi|124280 : GTGATTTGTCTAAGTTGTAAGAACTTGTTTCACAA-T------CGAAGTAAAATAA--A-TA---A-G--T---TTAA------A-CTACT---------AC---------------------AT----------A--------------T---A--A----------T-ATAGCCCAAGTTCATTCAACAGACCATAACTGGTTCTAACCTATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGC
Alignments
lowQualScore : 111111 1 1 1 1111 111 11111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 1 2222 1111 22 1111 1111 0 0 111111 0 11111 0 0 0 22 1111 1111 00 0 111111 4444 1111 11 1111 0 33333333 333 444444 3 2 3 1 22 1 1 2 1 3 0 0 2 0000 444 2 99999999 2 33 2 777777 1 1 33 3 222 33 444 2 11111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1
lowQualScore : . .... .... .. .... .... . . ...... . ..... . . . .. .... .... .. . ...... .... .... .. .... . ........ ... ...... . . . . .. . . . . . . . . .... ... . ........ . .. . ...... . . .. . ... .. ... . ........ .......................................................... . .
lowQualScore : 0 0000 2222 88 2222 2222 5 5 555555 5 33333 5 5 5 77 1111 1111 77 5 666666 7777 2222 33 2222 5 99999999 555 666666 2 8 2 6 44 7 7 4 5 3 6 8 7 9999 777 7 11111111 5 44 5 222222 4 2 44 4 888 44 444 5 88888888 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 9 0
consensus : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----CGTA-TT-C-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ANTA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTC--GTTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTNTTCTTGCTG
Reference ( family-275 ) : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----CGTA-TT-C-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ANTA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTC--GTTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTNTTCTTGCTG
gi|124164 : TACATAGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAT------C----A----A--TG----T-ACATTTAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAC--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGATTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-CTTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ACTA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTGATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAATAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTGTTCTTGCTG
gi|124165 : TACATCATTGCTTAA----CAAC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACATC-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-TTACTTTAACAG-AA-AAAC----------TTG--T-A
gi|124166 : TACATAGTTGCTCAA----CTTC----AAAA-T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-G-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCAGAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GAATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-CTTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T--------AATTAAAATAA--ACTA---GTG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACTTATCCACAATTGTCAATGTTCTTGCTGtggtgccgtaacgtattttc
gi|124167 : TACATCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATTGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAAAA-GTATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCAGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATCAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTAGTTTA--A-T------TAAATTAAAACAA--ACTA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTAATC--ATTAATTCTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTTAGAGATCTTGCTG
gi|124168 : TACATCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAA-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----T--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAA-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--AACA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTT--ATTAATACTTTTCAGT------------TAC----------A--------------T---A--A---------------------------TCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCAACAATTGTCAGTGTACTTGCTG
gi|124169 : TACATCGTTGCTTAA----CT-C----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACCACATTGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCACAGTTTCACTACATCGCGT---ATG-----TGTA-TT-TTA-ATTTCTTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA--TGTCAATGTTGGTGAT-ATTT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------CAAGTTAAAATAA--ACTA---ATG--C---TGAACATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------CAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTA--CAC--TTGTCAGTGTTCTTGC
gi|124170 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ATAG----TCAGTG-CACATC-AACCATGTTGCT------GTAA-A-----A-G-CAACCTTAACAG-AA-AGAC----------TTA--T-AAATGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124171 : TACATCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CAGTTT-AACCACATCGAC------GAAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAT------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ATG-----TGTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAA-A-GTATCCACATGGTTGAT-TGTTT-CATCAGCAATGTTGATGAT-ATTT-ATAAAAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTTA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAGTTAAAATAA--AGTA---ATG--C---TGAATATTTAA-TTACGC--ATTAATACTTTTCAAT------------CAC----------A--------------TTGCA--A----------TTGAAACCTTTTTTAGTTCAACAGACCATAACTGATTCTCAACTATCCACAGTTGTCAGTGTTCTGGC
gi|124172 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT--AACCACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTT---T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----TGTATTT-C-A-ATTTCCTGCATAAT--TAGC-ATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGT
gi|124173 : TACATCGTTCCTTAA----CTTC----CAA--T----ATAG----TCAGTG-CACAGC-AACCGTGTCGAT------GTTA-A-----A-G-CTACCATAACAG-AA-ATAC----------TTG--T-AAGT--CTTTCTGT----T----A--TG----T-ACATGTACTCTT----TACATTTGGG---ACT-----TATA-CC-C-A-A----CTGCACA
gi|124174 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTA-AACCATACCACT------GTAA-A-----A-G-CCAGCTTAACAG-CA-AAAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----T--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ATG-----TGTATTT-C-A-ACTTCCTGCACAAG--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124175 : TACATCGCTGCTTAA----TCTT----CAA--T----ACAG----TCAGTA-CACTTC-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-AA-AGAC----------TTG--T-AAGTGAC------CCATAC----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124176 : TACATCGTCGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAA----TCAGTG-CACTTC-AACAATGTCGCA------TTAA-A-----A-G-C-A--TTAACAG-AA-AGAC----------TTG--C-ACG---C------A----T----A--CG----T-ACATACAC--------T
gi|124177 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CTACTT----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ACAA-A-----A-G-CTAACTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTAAC--------TACA
gi|124178 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124179 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124180 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGCCGCT------ATGA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124181 : TACTTCGTTTCTTAA----CTTT----CAA--A----ACAG----TAAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----G-G-CTAGCTTAACAG-CG-ATAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACAGTCAC--------TACAGCGCGC---ACATCACCTGTA-TT-T-ATACAT-CTACA--------GC-ATATTCTACAAATA-CTAT
gi|124182 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGCCACT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124183 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----AATA----TCGGTA-CACTTC-AACAATGTTGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CA-ATGA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACA
gi|124184 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CCAGCTTGACAG-CG-AGGC----T----GTTG--C-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124185 : TACTTCGTTGCTTTA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-A-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA--GCA-------------GT--TT-----ACTGCTTA-AGAATGGTAGCAATA---CACAAACATGTATC
gi|124186 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAT--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AATTGTGTCGCT------GTCA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124187 : TACTTCGTTGGTTTA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ATATTCAC--------TACA
gi|124188 : TACAGCATTGCTTAT----TTTC----CAA--T----ACAA----CCAGAG-CACTTT-AACCATGTCACT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----ATTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATC
gi|124189 : TACTTTGTTACTCAA----CTTC-----AA--T----ACAG----TCAGTG-CATTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CC-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----T--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124190 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTA----CAA--T----GCAG----TCGGTG-CATTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----ATG-TT-GCACAAGAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACAT
gi|124191 : TACTTCGTTACTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-TATCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAA-CA-AGGCTGTTT----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124192 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----TCAG----GCAGTG-CACTTC-AATCATGTCGCT------ATGA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124193 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTC----AAACTT----AGAG----TCAGTG-CACTTC-AACTATGTCGCT------TCAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--CA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124194 : TACTTCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----AATA----TCGGTA-CACTTC-AACCATGCCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CA-ATGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACA
gi|124195 : TACTTTGTAGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAATACATGTA-G-CTAGTTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------T----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124196 : TACATTGTTGCTCAA----GTTC----CAA--C----ACAT----TCGGTG-CACTTC-AGTCATGTTTCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-AGTC----T----GCTG--T-AAGTGA-------C----T----AT-TG----T-GTATTCGC--------TACAgaccacttggctgtggagtacttgtcaacattacattcaggattccagataataattacaattggt
gi|124198 : TACTTCGTTGCTTAATTAACTTC----CAA--T----ATGA----CCAGTG-CACTTC-AACCATGTTACTTTATTTATAT-A-----A-G-CTAGATCAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATC
gi|124199 : TACACCGTCGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAA----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCAAT------GTAA-A-----A-ACCTAGCTTAAC------AGGC----T----GTTT--T-AATTGAC------C----T----A--TG----T-ACA
gi|124201 : TACTTTGTTGCTTTA----CTTC----CAG--T----ATAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTAGCT------GTAA-A-----A-G-CCAGCTTAATA
gi|124202 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----AAAAATACTTAGTAACACTAC-AAA-ATATCACT------TTAA-A-----A-T-CTAGTTCAACAG-CA-GGGC----T----GTTG--T-AAATAAT------C----T----A--TC----T-ACAATCACA-------TGCAT
gi|124204 : TTGTTTAA----CTTC----CAG--TCTTTACAG----TCCATG-CACTTC-AGCCATGTTGCT------ATAA-A-----A-G-CAAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--A-AATTGGC------C----T----A--TT----T-ACATTCAC--------TACAT
gi|124207 : acatattGTTGCTTGA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTCTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGATTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TAGATtatgatggtgttaccatatttcct
gi|124208 : GTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CGCTTC-AAGCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGAA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124209 : GTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCT-----------------------------T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124210 : GTTGCTTAA----CTTC----CAACTT----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124211 : GTTGCTTAA----CCTC----TGG--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-ATGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----C-CCTTACAC--------TACA
gi|124212 : GTTGATTAA----TTTC----CAA--C----ACTA----TTGGTA-CACTTC-AACAATGTCGCT------ATAA-A-----A-C-CTAGCTTAACAG-TG-AGAC----T----GTTG--T-AATTGAT------C----T----A---A----TAACTTTCAC--------TGCAT
gi|124213 : GTTGCTTAA----CTTC----CAG--T----ACAG----TCGGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--C-AATTGAC------C----TATAGA--TG----T-ACATTCAC--------TGCA
gi|124214 : TTGCTCAA----CTCC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCACGTTGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124215 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------TTTA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTTAC--------TA
gi|124216 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-TAGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124217 : TTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACGACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124218 : TTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTCC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AG------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACACC
gi|124219 : TTGTTTAA----CTTC----TCA--T----ACAG----TCAGTG-CATTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----ATTG--T-GAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACAT
gi|124220 : TTGCTTAA----CTTC----AAA--T----ACAG----TCAGTA-CCCTTC-AACCACGTCATT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-TAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATACAC--------TGCA
gi|124221 : TTGCCTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CCCTTC-AACCATGTCCCT------TTTA-A-----A-G-CTATCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AA
gi|124222 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--C----ACTA----TCGGTA-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-CC-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TA
gi|124223 : TTGCTTAA----CTGC----CAG--T----ACAG----TCAGTG-CAATTT-AACAATGTCATG------ACAA-A-----T-G-CTATTTAAACAG-CA-AAGC----T----AATG--T-CAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124224 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACCATGTTCCT------ATGA-A-----A-G-CTAGGTTAACAG-CG-ATGC----T----GTTG--T-TAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124225 : TTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ATGA----TTGGTC-CACTTC-AACCATGTCACC------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AGCTGAC------C----T----A--TT----A-ACATTCAC--------TACA--GGGTTAAACGC----CATA-TT-C-A-A
gi|124226 : TTGCTGAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACAACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGGTTAACA-------------T----GTTG--T-GAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124227 : TTGCTAAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACGACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-AAATTCAC--------TACA
gi|124228 : TTGCTTAC----ATTC----CAA--T----ACAG----TAGGTG-CCTTTC-AACAATGTCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTCAACAG-CA-AAGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------T----T----A--TG----T-GCATTCTC--------TGCA
gi|124229 : TTGCTTAA----TTTT----CAT--T----ACAG----TTTGTG-CACTTG-AACAATGTCATT------GTAA-A-------T-CTAGCTAAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--C-AAGTTAC------C----T----A--TG----T-ATGTTCAC--------TACATatatagtacatttatttc
gi|124230 : TTGCTTAA----ATTT----CAG--T----ACAG----TCAGTA-CACT-C-AACCATGTTGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-A
gi|124232 : TGCTTAAAA--CTTT----CAG--T----ATAG----TCAGTG-CATTTC-AACCTTGTCACT------ATAA-A-----A-A-CTAGCTTAACAA-TG-AGGA----T----GTTG--C-AAGTGAT------C----T----A--TA----T-ATTTTCAC--------TACAtattg
gi|124233 : TGCTTAA----CTTA----TGA--A----ACAG----TAGGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-AA-AGGC----T----GTTGTAT-AAGTGAC------C----
gi|124234 : AA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CAATTC-AATCATGTCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACGG-CA-AAAA----T----GTTG--T-ATGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124235 : cAA----CTTC----AGA--T----ACAG----TTGGTA-AACTTTTAACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTCGCTCAACAG-CA-GGGC----C----ATTG--T-AAATTAC------C----A----AGGTG----T-ACAGTCA
gi|124236 : A----CTTC----CAA--T----ACTA----TCGGTG-CACTTC-AACCATATCGTT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----ATTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GTAGTCAC--------TACA
gi|124237 : A----CTTCAGTGCAA--T----ACAA----TAGGTG-CCCTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAATAG-CG-AGGC----T----GTTG--TAAAATGAC------C----C----A--AA----C-ACATCCAC--------
gi|124238 : ----CTTC----TAA--T----ACAG----TCTGTG-CACCTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTATCATGACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAA----------------A--TA----C-ACATT
gi|124239 : --T----ACA-----TCGTTG-C---TT-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTCACAG-AATAGAC----T----GTTG--T-TAGTGAC------CGA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124241 : --T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCA------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AGGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124242 : --T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-GACCATGTCGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-AAATTCAC--------TACA
gi|124243 : ----TCAGTG-CACTTA-AAC-ATGTTGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-GGGC----T----GTTG--T-AAGCGAT------CG---T----A--AG----T-ACATTTAT--------T
gi|124244 : CAATG-CATTTT-AACCATAGTGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAGCAC-CG-GAAC----T----GTTG--T-AAGTCCC------T----T----A--TG----A-ACATTCAC--------TACA
gi|124245 : TT-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTCACGGAAA-AGAT----T----GTTA--T-TAGTGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124246 : ACCATATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-AA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124247 : ttgGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGT----T----GTTA--T-AAGAGAC------C----T----A--TG----T-GCATT-AC--------TACA
gi|124248 : cactT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-AGCC----TAGGAGTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TGTTACT-ACATTCAC--------TACA
gi|124250 : ATATCGCGT---ACC-----CGTA-TTTC-T-ACTTCCTGCACATT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124252 : ATATCATGC---ATG-----TGTA-TT-TTA-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAACATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTT-AT-TG
gi|124253 : ATATTGCGC---ATG-----CATA-TTTC-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGTAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGT
gi|124254 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-TACAAACA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124255 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTGCGCAAT--TTGCAATATT-TACAAATT-GTATTTACGTGGT
gi|124256 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-AACAAACA-GTATCCACGTTGTC-AT-TG
gi|124259 : ATCGCGT---ACG-----TGTA-TTTC-A-ACTTCCTGCATAAT--TGGCAATATT-AACAAACA-GTATCAACGTGGTC-AT-TG
gi|124260 : TCGCGT---ATG-----CATA-TTTC-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGTC-AT-TG
gi|124261 : GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ACCA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TCATAGCACTTGTTAGATCAACAGACCATAACTGGTTCTCACTTATCAACAATTGCCAGTGTCCTTGCTG
gi|124262 : ggatatgGTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-TACAAACA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124264 : -TT-C-A-ACTTCCTGCACAAG--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGCC-AT-TG
gi|124265 : -TT-C-A-GCTTTTTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GAATCCACATGGTCAAT-aatg
gi|124266 : -TT-T-A-ACTTCCTGCACAGT--TATCAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGTC-AT-TG
gi|124270 : ATATT-TATCAATT-GCAT--------TAGATGTGATTGAATCAGCAATGTTGATGATGATAT--TAATATACATGTATAAGTGTTTGGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--T-T------TTTTTTATAAGAA--AATATT-ATA--C---TATATATTTCA-TTACTT--GTTA---CTTTTCAATAACATACTTGACTAC----------A--------------T---A--AAA--------TTATACCCCCAGTTCGTTCAACAGACTGTAACTGGTTGTCACCTATCCACAACTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124273 : GGCCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGGTGATGAT-A-ATGATGATAT---TG-ATAAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTG--ATT------TAGATAAAAATAAATATTAC--ATGTAC---TGAATATTTTA-TTACTT--GT---TACTTTTCAATGACA--------TACTTGACTACATA--------------T---A--A----------TCATAGCCCTAGTTTGTTCAACAGACCATGACTGGTTCTCACCT
gi|124274 : GGCCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-AATT-ATGATAT---CG-ATTGGTGTTTTACATGA--------AA-TGGTTTTA--A-T------TTAGATAAAAAAA--AATA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTT--GT---TACTTTTCAAT------------AAC-----------------------------A--A----------TTATAGCCCTAGTTTGTTCAACAGACCATAATTGGttattc
gi|124275 : GAT-AGTTTGAATCAGCGATGTTGATGAT-ATTT-ATGATAT---TG-ATTAGAGTTTTGCTTAA--------AG-TTGTTTTA--A-T------TCAGATAAAA-AA--ATTA---ATG--C---TGAATATTTGA-TTACTT--GTTA---CTTTTCAAT------------AAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGTCCTTGTCAGTTCAACAGACCATTACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124276 : tGAT-TGTTTGAATCGGCAATGCTGATGAT-A-ATGATGATAT---TG-ATTACTGTTTTGCCTAA--------AA-CT----TA--A---------AAAT---GATAC--AT-----GTA--C---TGAATATTTTAATGAC--------ATACTT---GAC------------TAC----------A--------------T---ATAA----------TCATAGCCCTAGTTTATTCAACAATCCATAACTGGTTCTCACCTTTCCACAACTGTCGGTCTTATTGCTG
gi|124277 : AT-TGTTTGAATCAGCAATGTTAATGAC-A-ATGATGATTT---TG-ATAAATGATTTGCCTAA--------AA-GTGTTTTA--A-T------TTAGATAATAAAA--AATA---ATA--C---TGAATATTTTA-TTACTT--GTTA----CTTTCAATGATA--------TAC----------A--------------T---G--ACTACATATACTTATAGCCCCAATTCGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCATCAATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124278 : AT-TGTTTGAATCGGCAATGCTGATGAT-AACG-ATGATAT---TG-ATTAGTTTTTTGGCTAA--------AA-CT----TA--G-T------TAAA--AAAAGGA--TACAT--ATA--C---TGAATATTTTA-TTACT-----TAATA----------------------------------A------------------A--G----------TT---------GTTA-TTCAACATACCATAACTGGTTCTCACCTTTCCACAACTGTCGGTCTTCTTGCTG
gi|124279 : T-TGTTTGAATAGACAATGTTG-----------ATGATAA---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-TGTTTGATAAACTAATATAT--ATTATAGAT---CTTTTGAATATTTTA-TTACTTAAATTGTTACTTTTCAAT------------GAC----------ATACTTGACTTCAATT---A--A----------TTATAGTCCCAGTTCGTTCAACAGAACAGAACTGGTTCTCACTGATCCACAATTGTCAGTTTTCTTGCTG
gi|124280 : GTGATTTGTCTAAGTTGTAAGAACTTGTTTCACAA-T------CGAAGTAAAATAA--A-TA---A-G--T---TTAA------A-CTACT---------AC---------------------AT----------A--------------T---A--A----------T-ATAGCCCAAGTTCATTCAACAGACCATAACTGGTTCTAACCTATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGC
blockSeqs : A TTAA AGTG CT CTTT ATAC TTATTT CATGT AT TGTT AGGA TTTCTG CATA ATAG GG TTAC AGTTTCAC TAA TCACCT T T T T GG C T G G C A G TAT ACA T GTTGTAAG C CA T GTTTGA T T AT C TAG TA TTT A TAAATTGT AACATACTTGACTACATAAAA A G
blockSeqs : A AA . CT . . . . A . . . TA . T . TCTT . CC T T T . . . . G . C A . TAT . . . . . . . T C . C TT . . . CATTAA GACATACTTGACTACATATAA A G
blockSeqs : A . . CT . . . . A . . . GA . . . A . T . T . . . . . G . C A . TAA . . . . . . . T T . A C . . . CATTAA GATATACATGACTACATATAC A G
blockSeqs : A . . A . . . . A . . . TA . . . . . T . T . . . . . G . C A . TTT . . . . . . . T T . C T . . . TATTAA GACATACTTGACTTCAATTAA A G
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . TA . . . . . T . T . . . . . G . C A . TTT . . . . . . . T T . G . . . . CATTAA CACATTGCAA A G
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . G . . . . . T . T . . . . . G . G A . TAT . . . . . . . T T . C . . . . CATTAA TACATATAA C G
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . . . . . . . T . T . . . . . A . G A . TAT . . . . . . . T G . A . . . . CATTAA TACATAA T C
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . . . . . . . C . T . . . . . G . G A . ATG . . . . . . . T T . T . . . . TGTTA TACATAA T C
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . G . G A . ATT . . . . . . . A A . A . . . . TGTTA TACATAA A C
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . G . G . . TTT . . . . . . . A T . T . . . . TGTTA CACATAA T C
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . G . G . . ATG . . . . . . . T A . T . . . . TGT TACATAA C C
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . G . G . . ATG . . . . . . . A G . A . . . . TGT AACATAA A T
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . G . . ACG . . . . . . . C T . A . . . . TAA ATATAA C C
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . T . . . . A AACAA C
blockSeqs : A . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAG .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : C*****
originalCons : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----CGTA-TT-C-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ANTA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTC--GTTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTNTTCTTGCTG
finalCons : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACGC-----GTA-TT-C-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ANTA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTC--GTTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTNTTCTTGCTG
Alignments
lowQualScore : 111111 1 1 1 1111 111 11111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 1 2222 1111 22 1111 1111 0 0 111111 0 11111 0 0 0 22 1111 1111 00 0 111111 4444 1111 11 1111 0 33333333 333 444444 3 2 3 1 22 1 1 2 1 3 0 0 2 0000 444 2 99999999 2 33 2 777777 1 1 33 3 222 33 444 2 11111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1
lowQualScore : . .... .... .. .... .... . . ...... . ..... . . . .. .... .... .. . ...... .... .... .. .... . ........ ... ...... . . . . .. . . . . . . . . .... ... . ........ . .. . ...... . . .. . ... .. ... . ........ .......................................................... . .
lowQualScore : 0 0000 2222 88 2222 2222 5 5 555555 5 33333 5 5 5 77 1111 1111 77 5 666666 7777 2222 33 2222 5 99999999 555 666666 2 8 2 6 44 7 7 4 5 3 6 8 7 9999 777 7 11111111 5 44 5 222222 4 2 44 4 888 44 444 5 88888888 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 9 0
consensus : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----CGTA-TT-C-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ANTA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTC--GTTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTNTTCTTGCTG
Reference ( family-275 ) : TACNTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----CGTA-TT-C-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ANTA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTC--GTTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTNGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTNTTCTTGCTG
gi|124164 : TACATAGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAT------C----A----A--TG----T-ACATTTAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAC--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGATTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-CTTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ACTA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTGATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAATAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTGTTCTTGCTG
gi|124165 : TACATCATTGCTTAA----CAAC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACATC-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-TTACTTTAACAG-AA-AAAC----------TTG--T-A
gi|124166 : TACATAGTTGCTCAA----CTTC----AAAA-T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-G-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCAGAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GAATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-CTTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T--------AATTAAAATAA--ACTA---GTG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACTTATCCACAATTGTCAATGTTCTTGCTGtggtgccgtaacgtattttc
gi|124167 : TACATCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATTGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAAAA-GTATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCAGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATCAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTAGTTTA--A-T------TAAATTAAAACAA--ACTA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTAATC--ATTAATTCTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTTAGAGATCTTGCTG
gi|124168 : TACATCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACTACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAA-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----T--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGGGT---ATG------GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAA-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--AACA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTT--ATTAATACTTTTCAGT------------TAC----------A--------------T---A--A---------------------------TCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTATCAACAATTGTCAGTGTACTTGCTG
gi|124169 : TACATCGTTGCTTAA----CT-C----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACCACATTGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCACAGTTTCACTACATCGCGT---ATG-----TGTA-TT-TTA-ATTTCTTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTTGAT-TGTTTCA--TGTCAATGTTGGTGAT-ATTT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------CAAGTTAAAATAA--ACTA---ATG--C---TGAACATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------CAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGCCCTAGTTAGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCACCTA--CAC--TTGTCAGTGTTCTTGC
gi|124170 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ATAG----TCAGTG-CACATC-AACCATGTTGCT------GTAA-A-----A-G-CAACCTTAACAG-AA-AGAC----------TTA--T-AAATGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124171 : TACATCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CAGTTT-AACCACATCGAC------GAAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAT------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ATG-----TGTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAA-A-GTATCCACATGGTTGAT-TGTTT-CATCAGCAATGTTGATGAT-ATTT-ATAAAAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTTA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAGTTAAAATAA--AGTA---ATG--C---TGAATATTTAA-TTACGC--ATTAATACTTTTCAAT------------CAC----------A--------------TTGCA--A----------TTGAAACCTTTTTTAGTTCAACAGACCATAACTGATTCTCAACTATCCACAGTTGTCAGTGTTCTGGC
gi|124172 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTT--AACCACATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTT---T-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ACG-----TGTATTT-C-A-ATTTCCTGCATAAT--TAGC-ATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGT
gi|124173 : TACATCGTTCCTTAA----CTTC----CAA--T----ATAG----TCAGTG-CACAGC-AACCGTGTCGAT------GTTA-A-----A-G-CTACCATAACAG-AA-ATAC----------TTG--T-AAGT--CTTTCTGT----T----A--TG----T-ACATGTACTCTT----TACATTTGGG---ACT-----TATA-CC-C-A-A----CTGCACA
gi|124174 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTA-AACCATACCACT------GTAA-A-----A-G-CCAGCTTAACAG-CA-AAAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----T--TG----T-ACATTCAC--------TACATCGCGT---ATG-----TGTATTT-C-A-ACTTCCTGCACAAG--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124175 : TACATCGCTGCTTAA----TCTT----CAA--T----ACAG----TCAGTA-CACTTC-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-AA-AGAC----------TTG--T-AAGTGAC------CCATAC----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124176 : TACATCGTCGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAA----TCAGTG-CACTTC-AACAATGTCGCA------TTAA-A-----A-G-C-A--TTAACAG-AA-AGAC----------TTG--C-ACG---C------A----T----A--CG----T-ACATACAC--------T
gi|124177 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CTACTT----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ACAA-A-----A-G-CTAACTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTAAC--------TACA
gi|124178 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124179 : TACATCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124180 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGCCGCT------ATGA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124181 : TACTTCGTTTCTTAA----CTTT----CAA--A----ACAG----TAAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----G-G-CTAGCTTAACAG-CG-ATAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACAGTCAC--------TACAGCGCGC---ACATCACCTGTA-TT-T-ATACAT-CTACA--------GC-ATATTCTACAAATA-CTAT
gi|124182 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGCCACT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124183 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----AATA----TCGGTA-CACTTC-AACAATGTTGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CA-ATGA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACA
gi|124184 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CCAGCTTGACAG-CG-AGGC----T----GTTG--C-AAGTGAC------C----A----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124185 : TACTTCGTTGCTTTA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-A-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA--GCA-------------GT--TT-----ACTGCTTA-AGAATGGTAGCAATA---CACAAACATGTATC
gi|124186 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTC----CAT--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AATTGTGTCGCT------GTCA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124187 : TACTTCGTTGGTTTA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ATATTCAC--------TACA
gi|124188 : TACAGCATTGCTTAT----TTTC----CAA--T----ACAA----CCAGAG-CACTTT-AACCATGTCACT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----ATTG--T-AAGTGAC------C----C----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATC
gi|124189 : TACTTTGTTACTCAA----CTTC-----AA--T----ACAG----TCAGTG-CATTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CC-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----T--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124190 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTA----CAA--T----GCAG----TCGGTG-CATTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----ATG-TT-GCACAAGAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACAT
gi|124191 : TACTTCGTTACTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-TATCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAA-CA-AGGCTGTTT----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124192 : TACTTCGTTGCTTAA----CTTT----CAA--T----TCAG----GCAGTG-CACTTC-AATCATGTCGCT------ATGA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----A----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124193 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTC----AAACTT----AGAG----TCAGTG-CACTTC-AACTATGTCGCT------TCAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--CA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124194 : TACTTCGTTGCTCAA----CTTC----CAA--T----AATA----TCGGTA-CACTTC-AACCATGCCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CA-ATGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GCATTCAC--------TACA
gi|124195 : TACTTTGTAGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAATACATGTA-G-CTAGTTTAACAG-TG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------T----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124196 : TACATTGTTGCTCAA----GTTC----CAA--C----ACAT----TCGGTG-CACTTC-AGTCATGTTTCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-AGTC----T----GCTG--T-AAGTGA-------C----T----AT-TG----T-GTATTCGC--------TACAgaccacttggctgtggagtacttgtcaacattacattcaggattccagataataattacaattggt
gi|124198 : TACTTCGTTGCTTAATTAACTTC----CAA--T----ATGA----CCAGTG-CACTTC-AACCATGTTACTTTATTTATAT-A-----A-G-CTAGATCAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACATC
gi|124199 : TACACCGTCGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAA----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCAAT------GTAA-A-----A-ACCTAGCTTAAC------AGGC----T----GTTT--T-AATTGAC------C----T----A--TG----T-ACA
gi|124201 : TACTTTGTTGCTTTA----CTTC----CAG--T----ATAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTAGCT------GTAA-A-----A-G-CCAGCTTAATA
gi|124202 : TACTTTGTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----AAAAATACTTAGTAACACTAC-AAA-ATATCACT------TTAA-A-----A-T-CTAGTTCAACAG-CA-GGGC----T----GTTG--T-AAATAAT------C----T----A--TC----T-ACAATCACA-------TGCAT
gi|124204 : TTGTTTAA----CTTC----CAG--TCTTTACAG----TCCATG-CACTTC-AGCCATGTTGCT------ATAA-A-----A-G-CAAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--A-AATTGGC------C----T----A--TT----T-ACATTCAC--------TACAT
gi|124207 : acatattGTTGCTTGA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTCTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGATTAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TAGATtatgatggtgttaccatatttcct
gi|124208 : GTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CGCTTC-AAGCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGAA----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124209 : GTTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCT-----------------------------T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124210 : GTTGCTTAA----CTTC----CAACTT----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124211 : GTTGCTTAA----CCTC----TGG--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-ATGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----C-CCTTACAC--------TACA
gi|124212 : GTTGATTAA----TTTC----CAA--C----ACTA----TTGGTA-CACTTC-AACAATGTCGCT------ATAA-A-----A-C-CTAGCTTAACAG-TG-AGAC----T----GTTG--T-AATTGAT------C----T----A---A----TAACTTTCAC--------TGCAT
gi|124213 : GTTGCTTAA----CTTC----CAG--T----ACAG----TCGGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CG-AGGC----T----GTTG--C-AATTGAC------C----TATAGA--TG----T-ACATTCAC--------TGCA
gi|124214 : TTGCTCAA----CTCC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCACGTTGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124215 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCGTGTCGCT------TTTA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTTAC--------TA
gi|124216 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-TAGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124217 : TTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACGACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124218 : TTGCTTAA----CTTT----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTCC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AG------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACACC
gi|124219 : TTGTTTAA----CTTC----TCA--T----ACAG----TCAGTG-CATTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----ATTG--T-GAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACAT
gi|124220 : TTGCTTAA----CTTC----AAA--T----ACAG----TCAGTA-CCCTTC-AACCACGTCATT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-TAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATACAC--------TGCA
gi|124221 : TTGCCTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CCCTTC-AACCATGTCCCT------TTTA-A-----A-G-CTATCTTAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--T-AA
gi|124222 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--C----ACTA----TCGGTA-CACTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-CC-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TA
gi|124223 : TTGCTTAA----CTGC----CAG--T----ACAG----TCAGTG-CAATTT-AACAATGTCATG------ACAA-A-----T-G-CTATTTAAACAG-CA-AAGC----T----AATG--T-CAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124224 : TTGCTTAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTT-AACCATGTTCCT------ATGA-A-----A-G-CTAGGTTAACAG-CG-ATGC----T----GTTG--T-TAGTGAC------C----T----A--TA----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124225 : TTGCTCAA----CTTC----CAA--T----ATGA----TTGGTC-CACTTC-AACCATGTCACC------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CA-AGGC----T----GTTG--T-AGCTGAC------C----T----A--TT----A-ACATTCAC--------TACA--GGGTTAAACGC----CATA-TT-C-A-A
gi|124226 : TTGCTGAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACAACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGGTTAACA-------------T----GTTG--T-GAGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124227 : TTGCTAAA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACAACGACGCT------ATAA-T-----A-G-CTAGCTTAACA-------------T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-AAATTCAC--------TACA
gi|124228 : TTGCTTAC----ATTC----CAA--T----ACAG----TAGGTG-CCTTTC-AACAATGTCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTCAACAG-CA-AAGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------T----T----A--TG----T-GCATTCTC--------TGCA
gi|124229 : TTGCTTAA----TTTT----CAT--T----ACAG----TTTGTG-CACTTG-AACAATGTCATT------GTAA-A-------T-CTAGCTAAACAG-CA-AGAC----T----GTTG--C-AAGTTAC------C----T----A--TG----T-ATGTTCAC--------TACATatatagtacatttatttc
gi|124230 : TTGCTTAA----ATTT----CAG--T----ACAG----TCAGTA-CACT-C-AACCATGTTGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-A
gi|124232 : TGCTTAAAA--CTTT----CAG--T----ATAG----TCAGTG-CATTTC-AACCTTGTCACT------ATAA-A-----A-A-CTAGCTTAACAA-TG-AGGA----T----GTTG--C-AAGTGAT------C----T----A--TA----T-ATTTTCAC--------TACAtattg
gi|124233 : TGCTTAA----CTTA----TGA--A----ACAG----TAGGTG-CACTTC-AACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTAGTTTAACAG-AA-AGGC----T----GTTGTAT-AAGTGAC------C----
gi|124234 : AA----CTTC----CAA--T----ACAG----TCAGTG-CAATTC-AATCATGTCGCT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACGG-CA-AAAA----T----GTTG--T-ATGTGAC------C----T----A--TG----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124235 : cAA----CTTC----AGA--T----ACAG----TTGGTA-AACTTTTAACCATGTCACT------ATAA-A-----A-G-CTCGCTCAACAG-CA-GGGC----C----ATTG--T-AAATTAC------C----A----AGGTG----T-ACAGTCA
gi|124236 : A----CTTC----CAA--T----ACTA----TCGGTG-CACTTC-AACCATATCGTT------ATAA-A-----A-T-CTAGCTTAACAG-CG-AGGC----T----ATTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TG----T-GTAGTCAC--------TACA
gi|124237 : A----CTTCAGTGCAA--T----ACAA----TAGGTG-CCCTTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAATAG-CG-AGGC----T----GTTG--TAAAATGAC------C----C----A--AA----C-ACATCCAC--------
gi|124238 : ----CTTC----TAA--T----ACAG----TCTGTG-CACCTC-AACCATGTCGCT------ATAA-A-----A-G-CTATCATGACAG-CG-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAA----------------A--TA----C-ACATT
gi|124239 : --T----ACA-----TCGTTG-C---TT-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTCACAG-AATAGAC----T----GTTG--T-TAGTGAC------CGA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124241 : --T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-AACCATGTCGCA------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AGGTGAC------C----T----A--TA----T-ACATTCAC--------TACA
gi|124242 : --T----ACAG----TCAGTG-CACTTC-GACCATGTCGCT------ACAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-TA-AGGC----T----GTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TA----T-AAATTCAC--------TACA
gi|124243 : ----TCAGTG-CACTTA-AAC-ATGTTGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-GGGC----T----GTTG--T-AAGCGAT------CG---T----A--AG----T-ACATTTAT--------T
gi|124244 : CAATG-CATTTT-AACCATAGTGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAGCAC-CG-GAAC----T----GTTG--T-AAGTCCC------T----T----A--TG----A-ACATTCAC--------TACA
gi|124245 : TT-AACCATGTCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTCACGGAAA-AGAT----T----GTTA--T-TAGTGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124246 : ACCATATCGCT------GTAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-AA-AGAC----T----GTTG--T-AAGTGAC------CTA--T----A--TG----T-ACACTCAC--------TACA
gi|124247 : ttgGCT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTTAACAG-CG-AGGT----T----GTTA--T-AAGAGAC------C----T----A--TG----T-GCATT-AC--------TACA
gi|124248 : cactT------ATAA-A-----A-G-CTAGCTCAACAG-CA-AGCC----TAGGAGTTG--T-AAGTGAC------C----T----A--TGTTACT-ACATTCAC--------TACA
gi|124250 : ATATCGCGT---ACC-----CGTA-TTTC-T-ACTTCCTGCACATT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124252 : ATATCATGC---ATG-----TGTA-TT-TTA-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAACATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTT-AT-TG
gi|124253 : ATATTGCGC---ATG-----CATA-TTTC-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGTAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGT
gi|124254 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-TACAAACA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124255 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTGCGCAAT--TTGCAATATT-TACAAATT-GTATTTACGTGGT
gi|124256 : ATATCGCGC---ACG-----CGTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-AACAAACA-GTATCCACGTTGTC-AT-TG
gi|124259 : ATCGCGT---ACG-----TGTA-TTTC-A-ACTTCCTGCATAAT--TGGCAATATT-AACAAACA-GTATCAACGTGGTC-AT-TG
gi|124260 : TCGCGT---ATG-----CATA-TTTC-A-ACTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGTC-AT-TG
gi|124261 : GTA-TT-C-A-ATTTCCTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCATGTGGTTGAT-TGTTTCA-TCGGCAATGTTGGTGAT-ATAT-ATGATAT---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-T------TAAATTAAAATAA--ACCA---ATG--C---TAAATATTTTA-TTACTC--ATTAATACTTTTCAAT------------TAC----------A--------------T---A--A----------TCATAGCACTTGTTAGATCAACAGACCATAACTGGTTCTCACTTATCAACAATTGCCAGTGTCCTTGCTG
gi|124262 : ggatatgGTA-TTTC-A-ACTTCCTACACTAT--TGGCAATATT-TACAAACA-GTATCCACGTGGTC-AT-TG
gi|124264 : -TT-C-A-ACTTCCTGCACAAG--TGGCAATATT-TACAAATA-GTATCCACGTGGCC-AT-TG
gi|124265 : -TT-C-A-GCTTTTTGCACAAT--TGGCAATATT-TACAAATA-GAATCCACATGGTCAAT-aatg
gi|124266 : -TT-T-A-ACTTCCTGCACAGT--TATCAATATT-TACAAATA-GTATCCACATGGTC-AT-TG
gi|124270 : ATATT-TATCAATT-GCAT--------TAGATGTGATTGAATCAGCAATGTTGATGATGATAT--TAATATACATGTATAAGTGTTTGGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--T-T------TTTTTTATAAGAA--AATATT-ATA--C---TATATATTTCA-TTACTT--GTTA---CTTTTCAATAACATACTTGACTAC----------A--------------T---A--AAA--------TTATACCCCCAGTTCGTTCAACAGACTGTAACTGGTTGTCACCTATCCACAACTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124273 : GGCCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGGTGATGAT-A-ATGATGATAT---TG-ATAAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTG--ATT------TAGATAAAAATAAATATTAC--ATGTAC---TGAATATTTTA-TTACTT--GT---TACTTTTCAATGACA--------TACTTGACTACATA--------------T---A--A----------TCATAGCCCTAGTTTGTTCAACAGACCATGACTGGTTCTCACCT
gi|124274 : GGCCGAT-TGTTTGAATCGGCAATGTTGGTGAT-AATT-ATGATAT---CG-ATTGGTGTTTTACATGA--------AA-TGGTTTTA--A-T------TTAGATAAAAAAA--AATA---ATG--C---TGAATATTTTA-TTACTT--GT---TACTTTTCAAT------------AAC-----------------------------A--A----------TTATAGCCCTAGTTTGTTCAACAGACCATAATTGGttattc
gi|124275 : GAT-AGTTTGAATCAGCGATGTTGATGAT-ATTT-ATGATAT---TG-ATTAGAGTTTTGCTTAA--------AG-TTGTTTTA--A-T------TCAGATAAAA-AA--ATTA---ATG--C---TGAATATTTGA-TTACTT--GTTA---CTTTTCAAT------------AAC----------A--------------T---A--A----------TTATAGTCCTTGTCAGTTCAACAGACCATTACTGGTTCTCACCTATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124276 : tGAT-TGTTTGAATCGGCAATGCTGATGAT-A-ATGATGATAT---TG-ATTACTGTTTTGCCTAA--------AA-CT----TA--A---------AAAT---GATAC--AT-----GTA--C---TGAATATTTTAATGAC--------ATACTT---GAC------------TAC----------A--------------T---ATAA----------TCATAGCCCTAGTTTATTCAACAATCCATAACTGGTTCTCACCTTTCCACAACTGTCGGTCTTATTGCTG
gi|124277 : AT-TGTTTGAATCAGCAATGTTAATGAC-A-ATGATGATTT---TG-ATAAATGATTTGCCTAA--------AA-GTGTTTTA--A-T------TTAGATAATAAAA--AATA---ATA--C---TGAATATTTTA-TTACTT--GTTA----CTTTCAATGATA--------TAC----------A--------------T---G--ACTACATATACTTATAGCCCCAATTCGTTCAACAGACCATAACTGGTTCTCATCAATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGCTG
gi|124278 : AT-TGTTTGAATCGGCAATGCTGATGAT-AACG-ATGATAT---TG-ATTAGTTTTTTGGCTAA--------AA-CT----TA--G-T------TAAA--AAAAGGA--TACAT--ATA--C---TGAATATTTTA-TTACT-----TAATA----------------------------------A------------------A--G----------TT---------GTTA-TTCAACATACCATAACTGGTTCTCACCTTTCCACAACTGTCGGTCTTCTTGCTG
gi|124279 : T-TGTTTGAATAGACAATGTTG-----------ATGATAA---TG-ATTAGTGTTTTGCCTAA--------AA-TTGTTTTA--A-TGTTTGATAAACTAATATAT--ATTATAGAT---CTTTTGAATATTTTA-TTACTTAAATTGTTACTTTTCAAT------------GAC----------ATACTTGACTTCAATT---A--A----------TTATAGTCCCAGTTCGTTCAACAGAACAGAACTGGTTCTCACTGATCCACAATTGTCAGTTTTCTTGCTG
gi|124280 : GTGATTTGTCTAAGTTGTAAGAACTTGTTTCACAA-T------CGAAGTAAAATAA--A-TA---A-G--T---TTAA------A-CTACT---------AC---------------------AT----------A--------------T---A--A----------T-ATAGCCCAAGTTCATTCAACAGACCATAACTGGTTCTAACCTATCCACAATTGTCAGTCTTCTTGC