lowQualScore : 0 0 00 0 2 111111 0
lowQualScore : . . .. . . ...... .
lowQualScore : 4 4 66 4 0 222222 4
consensus : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
Reference ( gi|44528 ) : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44527 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAC-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44530 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACCACGTTGAC
gi|44532 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--G-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44535 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGATA--A-TACCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44545 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTAAC-ATGGACA--A-TATCAC------AT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44544 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAT-ATTGACA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44546 : CGTCACAGTACAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44529 : CGTCACAGTACAACGT-TGAAAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44547 : CGTAACAGTACAATGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGCTGAC
gi|44533 : CGTCGCAGTAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44531 : CGTCACAGTACGACGT-TGATAAC-GTTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44549 : CGCCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTGA
gi|44550 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGAAA--A-TAGCAC------GT-CGCAGTAAAACGTTGAC
gi|44552 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTGCATCTTTGAC
gi|44554 : CGTCACTGTACAACAT-TGATAAC-GTAGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44534 : CGTCATAGTACAACGT-TGGTAAC-ATGGACA--A-TTGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44548 : CGTCACAGTGCAACGT-TGACAGC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44536 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTAAC-GTGGGCA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACATTGA
gi|44537 : CGTCTCAGTACAACGT-TGATAAC-GTGGACA--A-TAGTAT------GT-CACAGTACAACGTTGGC
gi|44538 : CGTCACAGTACATCGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTAAC
gi|44539 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAT-ATGGACA--A-CAGTAC------GC-CACAGTACAACGTT
gi|44557 : CGTCACAGTAGAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TATCAT------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44540 : CGTCACAGTACAACGT-TGAAAAC-ATGGGCA--A-AAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44542 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAGC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAATGTAACGTTG
gi|44541 : CGTCACAATACAACGT-TGACAGC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTATAACGTTAAC
gi|44561 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTG
gi|44560 : CGTCACAGTACAGCGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACACCACTGA
gi|44543 : CGTCACAGTACCACGT-TGATAAT-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-AACAGTACAACGTTGAC
gi|44553 : CATCAAAGTATAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44565 : CGTAACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAGCGCTGA
gi|44559 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGCCA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44551 : CGTCACAGTACAACGC-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACTGTGCAACTTTGAC
gi|44568 : CGTCACAGTACAATGT-TGGTTTC-ATGGACA--A-CAGCAC------GC-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44555 : CGTCACAGTACAACGT-TAATATC-ATTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTG
gi|44563 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGATC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44556 : CGTCACAGTACAATGT-TGACAGC-ATGGAAA--A-TAGTAC------GT-CATAGTACAACGTTG
gi|44566 : CGTCACAGTACAACAT-TGATAGC-ATGGATA--A-TAGAAC------GT-CATAGTATAACGTTG
gi|44558 : CATCACAGTACAACGT-TTGTAAC-GTTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44567 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44579 : CGCCACAGTACAAAGT-TGATATC-ATTGACA--A-TACCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44578 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGAAAATA-TAGCAC------AT-CACAGTACAACGCCGA
gi|44581 : CGTCACAGTACAACGT-TGCTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACATCGTTAA
gi|44584 : CGACACAGTCAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAA------GT-CACAGTACAACGTTGGC
gi|44562 : CGTCACGGTACATCGT-TGAAAAC-ATGGATA--A-TAGTAC------GT-CATAGTACAACGTTG
gi|44571 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGATC------GT-CACAGTACGACGTTGA
gi|44574 : CGTCACAGTACAACGT-TGCCAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CGAGGTACAACGTTG
gi|44564 : CATCACAGTACAACGC-CGATTAT-ATGGATA--A-TAGTAC------GT-CACAGTGCAACGTTGAC
gi|44591 : CGTAACAGTACAGCGT-TGATAAC-GTAGACA--A-TATCAC------GT-CACCGTACAACGTTG
gi|44590 : CGTCACAGTACACCAC-TGATTAT-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACCGTACAACATTGAC
gi|44594 : CGTCACGGTCCAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTGA
gi|44593 : CGTCACAGTACAGCGC-TGATTAT-ATGGTCA--A-TAGCAC------GT-AACAGTACAATGTTGAC
gi|44577 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTATC-GTGGACA--A-AAGAAC------GT-CACAGTACAACATTG
gi|44597 : CGTCACAGTACAACGT-TTGTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GC-CACAGTACAAAGTTGA
gi|44596 : CGTCACAGAACAACGT-TGGTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GC-CCCAGTACAACGTTGA
gi|44569 : CGTCACATTGCAACAT-TGGTATC-ATGGACA--A-CAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44586 : CGTCACAGTACAAAGT-TGACAAC-ATGGGCA--A-TAGAAC------GT-CAAAGTACGGCGTTGA
gi|44570 : CGTCACAGTACCACGT-TGACAAC-ATGGACA--T-GAGTTC------GT-CACAGTACAGCGTTGAC
gi|44588 : CATCACAGTATAACGT-TGATATC-ATGGACA--T-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGT
gi|44589 : CATCACAGTACAACGT-TGATATT-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTATACCATTGA
gi|44572 : CGTCACAGTACAACAA-TGGTAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTAAATTGTTGA
gi|44573 : CGTCACAGTACAACGT-TGATATT-ATTGACA--A-AAATAC------GT-CACAGTACAACGTTAA
gi|44604 : CGTCACAGTAAAACGT-CGCTATC-ATGGACA--A--AACAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44575 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAGC-GTGGATA--A-TACTAC------GT-CACAGTACAACGTT
gi|44576 : CGTCATAGTATAACGT-TGGAAAC-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-CACTGTACAACATTGA
gi|44598 : CGTCACAGTTCAACGT-TGCCAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CATAGTAAAACGTTAA
gi|44580 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAGTAT------GT-CAAAGTACAACATT
gi|44608 : CGTCACGGTCCAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-AAGCAC------GT-CACAGAACAACGTTG
gi|44582 : CGTCACAGTACATCGT-TAATATC-ATTGACA--A-TAGTAA------GT-AACAGTACAACGTTGAC
gi|44585 : CGTCACCGTACAACAT-TGACAAC-ATGGACA--T-GAGTAC------GT-CACAGTACACCGTTG
gi|44583 : CGTCACAATGTAACGT-TGGTTAC-GTGGACA--T-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTGAC
gi|44610 : CGTCACAGTGCATCTT-TGACAGC-ATAGACA--A-TAGCAC------TT-CACAGTACAAAGTTGAC
gi|44600 : CGTTAAAGCAAAACGT-TAACAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44657 : CGTCACAATACAACGT-TGA
gi|44587 : agtacaacgttagcaacatggacaaaagtaCGTTAAAGCAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACGGTACATCGTTGAc
gi|44613 : CGTCCCAGTTCAACGC-TGGTAAC-AAGGCCA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44617 : CGCCCCAGTACAACGT-TGAATTC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44606 : CGTCACAGTACAACGT-TGCCAAC-AT-GACA--A-TAGAAC------GT-CATAGTAAAACGTT
gi|44592 : CGTCACAGTACAACCC-TGACAAT-ATGGACA--A-TTGTAC------AT-CAAAGTATAACGTTGAC
gi|44607 : CGTCACAGTACACCGT-TGGTAAC-GTGGAC---A-TAGATC------GT-CTCAGTACAACGTTGA
gi|44595 : CGTCACATTTAAACGC-TGATAAT-GTGGACA--A-GAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44599 : CATCACAGTACAACGT-TGATATA-ATTGACA--A-AAATAC------GT-CACAGTACAACGTTAA
gi|44611 : CGCCACAGTACAACAT-TGATATC-ATGGAGA--A-TAGATC------AT-CACAGTACAACGTT
gi|44616 : CGTCACTGTGCAACTT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAAAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44614 : CGTCACAGTACAACGT-TAATATC-ATTGACA--A-CAGAAC------AT-CACTGTACAACATTGGC
gi|44601 : CGCCGCAGTACATCGT-TATTATC-ATTGACG--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44603 : CGTCACAGTACAACGTATG-TATC-ATGGACA--A-GAATAC------GT-CACAGTTCAACGTTG
gi|44602 : CGTTACAGTACTTCGT-CGATAAC-GTAGACA--A-TAGTAC------GA-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44605 : CATCACAGTACAACAT-TGGCAAC-GTGGAAA--A-TAGTAT------GT-CACAGTTCAACATTGA
gi|44609 : CGTCACAGTACAACGT-TGTCAAC-CTGGACA--A-TAGTAC------AT-GGAAGTACAACGTT
gi|44612 : CGTCATAGTAAAACGT-TTAAAAC-ATGGACA--G-CAGTAC------GT-CACAGTAAAACGTCG
gi|44615 : CGTCAAAGTACGGCGT-TGATATC-ATTGACA--G-TAGTAC------GT-CACAGAACAACGTGGA
gi|44642 : GTCACAGTACAACGT-TGGCAAA-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAAAGTTGAC
gi|44643 : GTCACAGTACAACGT-TGGCGAC-ATGGACA--A-TAGCAC------CA-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44644 : GTCAAAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCACCGCACAGTACACAGTACAACGTTGA
gi|44645 : GTTAAAGAAAAACGT-TGACAAC-ATGGAAA--AATAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44646 : GTAACAGTACAACGT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAGAAC------GT-CGCGGTTCAAAGTTGA
gi|44651 : TCACAGTACAAAGT-TGACAAA-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CTCAGTACAACGTTG
gi|44654 : CACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--G-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44655 : CACAGTACAACGT-TGA-AACTGTGGACA--A-TAACAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44657 : AGTACAACGT-TAGCAAC-ATGGACA--A-AAGTAC------GT-CACAATACAACGTTGAC
Alignments
lowQualScore : 0 0 00 0 1 111111 0
lowQualScore : . . .. . . ...... .
lowQualScore : 4 4 66 4 9 111111 4
consensus : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
Reference ( family-246 ) : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44527 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAC-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44528 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44529 : CGTCACAGTACAACGT-TGAAAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44530 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACCACGTTGAC
gi|44531 : CGTCACAGTACGACGT-TGATAAC-GTTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44532 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--G-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44533 : CGTCGCAGTAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44534 : CGTCATAGTACAACGT-TGGTAAC-ATGGACA--A-TTGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44535 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGATA--A-TACCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44536 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTAAC-GTGGGCA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACATTGA
gi|44537 : CGTCTCAGTACAACGT-TGATAAC-GTGGACA--A-TAGTAT------GT-CACAGTACAACGTTGGC
gi|44538 : CGTCACAGTACATCGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTAAC
gi|44539 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAT-ATGGACA--A-CAGTAC------GC-CACAGTACAACGTT
gi|44540 : CGTCACAGTACAACGT-TGAAAAC-ATGGGCA--A-AAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44541 : CGTCACAATACAACGT-TGACAGC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTATAACGTTAAC
gi|44542 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAGC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAATGTAACGTTG
gi|44543 : CGTCACAGTACCACGT-TGATAAT-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-AACAGTACAACGTTGAC
gi|44544 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAT-ATTGACA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44545 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTAAC-ATGGACA--A-TATCAC------AT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44546 : CGTCACAGTACAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44547 : CGTAACAGTACAATGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGCTGAC
gi|44548 : CGTCACAGTGCAACGT-TGACAGC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44549 : CGCCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTGA
gi|44550 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGAAA--A-TAGCAC------GT-CGCAGTAAAACGTTGAC
gi|44551 : CGTCACAGTACAACGC-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACTGTGCAACTTTGAC
gi|44552 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTGCATCTTTGAC
gi|44553 : CATCAAAGTATAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44554 : CGTCACTGTACAACAT-TGATAAC-GTAGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44555 : CGTCACAGTACAACGT-TAATATC-ATTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTG
gi|44556 : CGTCACAGTACAATGT-TGACAGC-ATGGAAA--A-TAGTAC------GT-CATAGTACAACGTTG
gi|44557 : CGTCACAGTAGAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TATCAT------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44558 : CATCACAGTACAACGT-TTGTAAC-GTTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44559 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGCCA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44560 : CGTCACAGTACAGCGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACACCACTGA
gi|44561 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTG
gi|44562 : CGTCACGGTACATCGT-TGAAAAC-ATGGATA--A-TAGTAC------GT-CATAGTACAACGTTG
gi|44563 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGATC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44564 : CATCACAGTACAACGC-CGATTAT-ATGGATA--A-TAGTAC------GT-CACAGTGCAACGTTGAC
gi|44565 : CGTAACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAGCGCTGA
gi|44566 : CGTCACAGTACAACAT-TGATAGC-ATGGATA--A-TAGAAC------GT-CATAGTATAACGTTG
gi|44567 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44568 : CGTCACAGTACAATGT-TGGTTTC-ATGGACA--A-CAGCAC------GC-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44569 : CGTCACATTGCAACAT-TGGTATC-ATGGACA--A-CAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44570 : CGTCACAGTACCACGT-TGACAAC-ATGGACA--T-GAGTTC------GT-CACAGTACAGCGTTGAC
gi|44571 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGATC------GT-CACAGTACGACGTTGA
gi|44572 : CGTCACAGTACAACAA-TGGTAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTAAATTGTTGA
gi|44573 : CGTCACAGTACAACGT-TGATATT-ATTGACA--A-AAATAC------GT-CACAGTACAACGTTAA
gi|44574 : CGTCACAGTACAACGT-TGCCAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CGAGGTACAACGTTG
gi|44575 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAGC-GTGGATA--A-TACTAC------GT-CACAGTACAACGTT
gi|44576 : CGTCATAGTATAACGT-TGGAAAC-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-CACTGTACAACATTGA
gi|44577 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTATC-GTGGACA--A-AAGAAC------GT-CACAGTACAACATTG
gi|44578 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGAAAATA-TAGCAC------AT-CACAGTACAACGCCGA
gi|44579 : CGCCACAGTACAAAGT-TGATATC-ATTGACA--A-TACCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44580 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAGTAT------GT-CAAAGTACAACATT
gi|44581 : CGTCACAGTACAACGT-TGCTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACATCGTTAA
gi|44582 : CGTCACAGTACATCGT-TAATATC-ATTGACA--A-TAGTAA------GT-AACAGTACAACGTTGAC
gi|44583 : CGTCACAATGTAACGT-TGGTTAC-GTGGACA--T-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTGAC
gi|44584 : CGACACAGTCAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAA------GT-CACAGTACAACGTTGGC
gi|44585 : CGTCACCGTACAACAT-TGACAAC-ATGGACA--T-GAGTAC------GT-CACAGTACACCGTTG
gi|44586 : CGTCACAGTACAAAGT-TGACAAC-ATGGGCA--A-TAGAAC------GT-CAAAGTACGGCGTTGA
gi|44587 : CGTTAAAGCAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACGGTACATCGTTGA
gi|44588 : CATCACAGTATAACGT-TGATATC-ATGGACA--T-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGT
gi|44589 : CATCACAGTACAACGT-TGATATT-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTATACCATTGA
gi|44590 : CGTCACAGTACACCAC-TGATTAT-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACCGTACAACATTGAC
gi|44591 : CGTAACAGTACAGCGT-TGATAAC-GTAGACA--A-TATCAC------GT-CACCGTACAACGTTG
gi|44592 : CGTCACAGTACAACCC-TGACAAT-ATGGACA--A-TTGTAC------AT-CAAAGTATAACGTTGAC
gi|44593 : CGTCACAGTACAGCGC-TGATTAT-ATGGTCA--A-TAGCAC------GT-AACAGTACAATGTTGAC
gi|44594 : CGTCACGGTCCAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTGA
gi|44595 : CGTCACATTTAAACGC-TGATAAT-GTGGACA--A-GAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44596 : CGTCACAGAACAACGT-TGGTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GC-CCCAGTACAACGTTGA
gi|44597 : CGTCACAGTACAACGT-TTGTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GC-CACAGTACAAAGTTGA
gi|44598 : CGTCACAGTTCAACGT-TGCCAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CATAGTAAAACGTTAA
gi|44599 : CATCACAGTACAACGT-TGATATA-ATTGACA--A-AAATAC------GT-CACAGTACAACGTTAA
gi|44600 : CGTTAAAGCAAAACGT-TAACAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44601 : CGCCGCAGTACATCGT-TATTATC-ATTGACG--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44602 : CGTTACAGTACTTCGT-CGATAAC-GTAGACA--A-TAGTAC------GA-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44603 : CGTCACAGTACAACGTATG-TATC-ATGGACA--A-GAATAC------GT-CACAGTTCAACGTTG
gi|44604 : CGTCACAGTAAAACGT-CGCTATC-ATGGACA--A--AACAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44605 : CATCACAGTACAACAT-TGGCAAC-GTGGAAA--A-TAGTAT------GT-CACAGTTCAACATTGA
gi|44606 : CGTCACAGTACAACGT-TGCCAAC-AT-GACA--A-TAGAAC------GT-CATAGTAAAACGTT
gi|44607 : CGTCACAGTACACCGT-TGGTAAC-GTGGAC---A-TAGATC------GT-CTCAGTACAACGTTGA
gi|44608 : CGTCACGGTCCAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-AAGCAC------GT-CACAGAACAACGTTG
gi|44609 : CGTCACAGTACAACGT-TGTCAAC-CTGGACA--A-TAGTAC------AT-GGAAGTACAACGTT
gi|44610 : CGTCACAGTGCATCTT-TGACAGC-ATAGACA--A-TAGCAC------TT-CACAGTACAAAGTTGAC
gi|44611 : CGCCACAGTACAACAT-TGATATC-ATGGAGA--A-TAGATC------AT-CACAGTACAACGTT
gi|44612 : CGTCATAGTAAAACGT-TTAAAAC-ATGGACA--G-CAGTAC------GT-CACAGTAAAACGTCG
gi|44613 : CGTCCCAGTTCAACGC-TGGTAAC-AAGGCCA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44614 : CGTCACAGTACAACGT-TAATATC-ATTGACA--A-CAGAAC------AT-CACTGTACAACATTGGC
gi|44615 : CGTCAAAGTACGGCGT-TGATATC-ATTGACA--G-TAGTAC------GT-CACAGAACAACGTGGA
gi|44616 : CGTCACTGTGCAACTT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAAAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44617 : CGCCCCAGTACAACGT-TGAATTC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44642 : GTCACAGTACAACGT-TGGCAAA-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAAAGTTGAC
gi|44643 : GTCACAGTACAACGT-TGGCGAC-ATGGACA--A-TAGCAC------CA-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44644 : GTCAAAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCACCGCACAGTACACAGTACAACGTTGA
gi|44645 : GTTAAAGAAAAACGT-TGACAAC-ATGGAAA--AATAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44646 : GTAACAGTACAACGT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAGAAC------GT-CGCGGTTCAAAGTTGA
gi|44651 : TCACAGTACAAAGT-TGACAAA-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CTCAGTACAACGTTG
gi|44654 : CACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--G-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44655 : CACAGTACAACGT-TGA-AACTGTGGACA--A-TAACAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44657 : AGTACAACGT-TAGCAAC-ATGGACA--A-AAGTAC------GT-CACAATACAACGTTGAC
Alignments
lowQualScore : 0 0 00 0 1 111111 0
lowQualScore : . . .. . . ...... .
lowQualScore : 4 4 66 4 9 111111 4
consensus : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
Reference ( family-246 ) : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44527 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAC-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44528 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44529 : CGTCACAGTACAACGT-TGAAAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44530 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACCACGTTGAC
gi|44531 : CGTCACAGTACGACGT-TGATAAC-GTTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44532 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--G-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44533 : CGTCGCAGTAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44534 : CGTCATAGTACAACGT-TGGTAAC-ATGGACA--A-TTGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44535 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGATA--A-TACCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44536 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTAAC-GTGGGCA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACATTGA
gi|44537 : CGTCTCAGTACAACGT-TGATAAC-GTGGACA--A-TAGTAT------GT-CACAGTACAACGTTGGC
gi|44538 : CGTCACAGTACATCGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTAAC
gi|44539 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAT-ATGGACA--A-CAGTAC------GC-CACAGTACAACGTT
gi|44540 : CGTCACAGTACAACGT-TGAAAAC-ATGGGCA--A-AAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44541 : CGTCACAATACAACGT-TGACAGC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTATAACGTTAAC
gi|44542 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAGC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAATGTAACGTTG
gi|44543 : CGTCACAGTACCACGT-TGATAAT-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-AACAGTACAACGTTGAC
gi|44544 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAT-ATTGACA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44545 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTAAC-ATGGACA--A-TATCAC------AT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44546 : CGTCACAGTACAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44547 : CGTAACAGTACAATGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGCTGAC
gi|44548 : CGTCACAGTGCAACGT-TGACAGC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44549 : CGCCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTGA
gi|44550 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGAAA--A-TAGCAC------GT-CGCAGTAAAACGTTGAC
gi|44551 : CGTCACAGTACAACGC-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACTGTGCAACTTTGAC
gi|44552 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTGCATCTTTGAC
gi|44553 : CATCAAAGTATAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44554 : CGTCACTGTACAACAT-TGATAAC-GTAGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44555 : CGTCACAGTACAACGT-TAATATC-ATTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTG
gi|44556 : CGTCACAGTACAATGT-TGACAGC-ATGGAAA--A-TAGTAC------GT-CATAGTACAACGTTG
gi|44557 : CGTCACAGTAGAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TATCAT------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44558 : CATCACAGTACAACGT-TTGTAAC-GTTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44559 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGCCA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44560 : CGTCACAGTACAGCGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACACCACTGA
gi|44561 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTG
gi|44562 : CGTCACGGTACATCGT-TGAAAAC-ATGGATA--A-TAGTAC------GT-CATAGTACAACGTTG
gi|44563 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGATC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44564 : CATCACAGTACAACGC-CGATTAT-ATGGATA--A-TAGTAC------GT-CACAGTGCAACGTTGAC
gi|44565 : CGTAACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAGCGCTGA
gi|44566 : CGTCACAGTACAACAT-TGATAGC-ATGGATA--A-TAGAAC------GT-CATAGTATAACGTTG
gi|44567 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44568 : CGTCACAGTACAATGT-TGGTTTC-ATGGACA--A-CAGCAC------GC-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44569 : CGTCACATTGCAACAT-TGGTATC-ATGGACA--A-CAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44570 : CGTCACAGTACCACGT-TGACAAC-ATGGACA--T-GAGTTC------GT-CACAGTACAGCGTTGAC
gi|44571 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGATC------GT-CACAGTACGACGTTGA
gi|44572 : CGTCACAGTACAACAA-TGGTAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTAAATTGTTGA
gi|44573 : CGTCACAGTACAACGT-TGATATT-ATTGACA--A-AAATAC------GT-CACAGTACAACGTTAA
gi|44574 : CGTCACAGTACAACGT-TGCCAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CGAGGTACAACGTTG
gi|44575 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAGC-GTGGATA--A-TACTAC------GT-CACAGTACAACGTT
gi|44576 : CGTCATAGTATAACGT-TGGAAAC-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-CACTGTACAACATTGA
gi|44577 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTATC-GTGGACA--A-AAGAAC------GT-CACAGTACAACATTG
gi|44578 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGAAAATA-TAGCAC------AT-CACAGTACAACGCCGA
gi|44579 : CGCCACAGTACAAAGT-TGATATC-ATTGACA--A-TACCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44580 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAGTAT------GT-CAAAGTACAACATT
gi|44581 : CGTCACAGTACAACGT-TGCTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACATCGTTAA
gi|44582 : CGTCACAGTACATCGT-TAATATC-ATTGACA--A-TAGTAA------GT-AACAGTACAACGTTGAC
gi|44583 : CGTCACAATGTAACGT-TGGTTAC-GTGGACA--T-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTGAC
gi|44584 : CGACACAGTCAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAA------GT-CACAGTACAACGTTGGC
gi|44585 : CGTCACCGTACAACAT-TGACAAC-ATGGACA--T-GAGTAC------GT-CACAGTACACCGTTG
gi|44586 : CGTCACAGTACAAAGT-TGACAAC-ATGGGCA--A-TAGAAC------GT-CAAAGTACGGCGTTGA
gi|44587 : CGTTAAAGCAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACGGTACATCGTTGA
gi|44588 : CATCACAGTATAACGT-TGATATC-ATGGACA--T-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGT
gi|44589 : CATCACAGTACAACGT-TGATATT-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTATACCATTGA
gi|44590 : CGTCACAGTACACCAC-TGATTAT-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACCGTACAACATTGAC
gi|44591 : CGTAACAGTACAGCGT-TGATAAC-GTAGACA--A-TATCAC------GT-CACCGTACAACGTTG
gi|44592 : CGTCACAGTACAACCC-TGACAAT-ATGGACA--A-TTGTAC------AT-CAAAGTATAACGTTGAC
gi|44593 : CGTCACAGTACAGCGC-TGATTAT-ATGGTCA--A-TAGCAC------GT-AACAGTACAATGTTGAC
gi|44594 : CGTCACGGTCCAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTGA
gi|44595 : CGTCACATTTAAACGC-TGATAAT-GTGGACA--A-GAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44596 : CGTCACAGAACAACGT-TGGTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GC-CCCAGTACAACGTTGA
gi|44597 : CGTCACAGTACAACGT-TTGTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GC-CACAGTACAAAGTTGA
gi|44598 : CGTCACAGTTCAACGT-TGCCAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CATAGTAAAACGTTAA
gi|44599 : CATCACAGTACAACGT-TGATATA-ATTGACA--A-AAATAC------GT-CACAGTACAACGTTAA
gi|44600 : CGTTAAAGCAAAACGT-TAACAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44601 : CGCCGCAGTACATCGT-TATTATC-ATTGACG--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44602 : CGTTACAGTACTTCGT-CGATAAC-GTAGACA--A-TAGTAC------GA-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44603 : CGTCACAGTACAACGTATG-TATC-ATGGACA--A-GAATAC------GT-CACAGTTCAACGTTG
gi|44604 : CGTCACAGTAAAACGT-CGCTATC-ATGGACA--A--AACAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44605 : CATCACAGTACAACAT-TGGCAAC-GTGGAAA--A-TAGTAT------GT-CACAGTTCAACATTGA
gi|44606 : CGTCACAGTACAACGT-TGCCAAC-AT-GACA--A-TAGAAC------GT-CATAGTAAAACGTT
gi|44607 : CGTCACAGTACACCGT-TGGTAAC-GTGGAC---A-TAGATC------GT-CTCAGTACAACGTTGA
gi|44608 : CGTCACGGTCCAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-AAGCAC------GT-CACAGAACAACGTTG
gi|44609 : CGTCACAGTACAACGT-TGTCAAC-CTGGACA--A-TAGTAC------AT-GGAAGTACAACGTT
gi|44610 : CGTCACAGTGCATCTT-TGACAGC-ATAGACA--A-TAGCAC------TT-CACAGTACAAAGTTGAC
gi|44611 : CGCCACAGTACAACAT-TGATATC-ATGGAGA--A-TAGATC------AT-CACAGTACAACGTT
gi|44612 : CGTCATAGTAAAACGT-TTAAAAC-ATGGACA--G-CAGTAC------GT-CACAGTAAAACGTCG
gi|44613 : CGTCCCAGTTCAACGC-TGGTAAC-AAGGCCA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44614 : CGTCACAGTACAACGT-TAATATC-ATTGACA--A-CAGAAC------AT-CACTGTACAACATTGGC
gi|44615 : CGTCAAAGTACGGCGT-TGATATC-ATTGACA--G-TAGTAC------GT-CACAGAACAACGTGGA
gi|44616 : CGTCACTGTGCAACTT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAAAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44617 : CGCCCCAGTACAACGT-TGAATTC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44642 : GTCACAGTACAACGT-TGGCAAA-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAAAGTTGAC
gi|44643 : GTCACAGTACAACGT-TGGCGAC-ATGGACA--A-TAGCAC------CA-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44644 : GTCAAAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCACCGCACAGTACACAGTACAACGTTGA
gi|44645 : GTTAAAGAAAAACGT-TGACAAC-ATGGAAA--AATAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44646 : GTAACAGTACAACGT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAGAAC------GT-CGCGGTTCAAAGTTGA
gi|44651 : TCACAGTACAAAGT-TGACAAA-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CTCAGTACAACGTTG
gi|44654 : CACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--G-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44655 : CACAGTACAACGT-TGA-AACTGTGGACA--A-TAACAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44657 : AGTACAACGT-TAGCAAC-ATGGACA--A-AAGTAC------GT-CACAATACAACGTTGAC
blockSeqs : C CGCACA
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : A .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : A .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : A .
blockSeqs : A .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : A .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : A .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : A .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : C .
blockSeqs : A .
blockSeqs : T .
blockSeqs : T .
blockSeqs : C .
blockSeqs : T .
blockSeqCons :
originalCons : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
finalCons : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
Alignments
lowQualScore : 0 0 00 0 1 111111 0
lowQualScore : . . .. . . ...... .
lowQualScore : 4 4 66 4 9 111111 4
consensus : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
Reference ( family-246 ) : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44527 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAC-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44528 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44529 : CGTCACAGTACAACGT-TGAAAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44530 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACCACGTTGAC
gi|44531 : CGTCACAGTACGACGT-TGATAAC-GTTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44532 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--G-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44533 : CGTCGCAGTAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44534 : CGTCATAGTACAACGT-TGGTAAC-ATGGACA--A-TTGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44535 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGATA--A-TACCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44536 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTAAC-GTGGGCA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACATTGA
gi|44537 : CGTCTCAGTACAACGT-TGATAAC-GTGGACA--A-TAGTAT------GT-CACAGTACAACGTTGGC
gi|44538 : CGTCACAGTACATCGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTAAC
gi|44539 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAT-ATGGACA--A-CAGTAC------GC-CACAGTACAACGTT
gi|44540 : CGTCACAGTACAACGT-TGAAAAC-ATGGGCA--A-AAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44541 : CGTCACAATACAACGT-TGACAGC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTATAACGTTAAC
gi|44542 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAGC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAATGTAACGTTG
gi|44543 : CGTCACAGTACCACGT-TGATAAT-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-AACAGTACAACGTTGAC
gi|44544 : CGTCACAGTACAACGT-TGATAAT-ATTGACA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44545 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTAAC-ATGGACA--A-TATCAC------AT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44546 : CGTCACAGTACAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44547 : CGTAACAGTACAATGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGCTGAC
gi|44548 : CGTCACAGTGCAACGT-TGACAGC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44549 : CGCCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTGA
gi|44550 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGAAA--A-TAGCAC------GT-CGCAGTAAAACGTTGAC
gi|44551 : CGTCACAGTACAACGC-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACTGTGCAACTTTGAC
gi|44552 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTGCATCTTTGAC
gi|44553 : CATCAAAGTATAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44554 : CGTCACTGTACAACAT-TGATAAC-GTAGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44555 : CGTCACAGTACAACGT-TAATATC-ATTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTG
gi|44556 : CGTCACAGTACAATGT-TGACAGC-ATGGAAA--A-TAGTAC------GT-CATAGTACAACGTTG
gi|44557 : CGTCACAGTAGAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TATCAT------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44558 : CATCACAGTACAACGT-TTGTAAC-GTTGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44559 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGCCA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44560 : CGTCACAGTACAGCGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACACCACTGA
gi|44561 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTG
gi|44562 : CGTCACGGTACATCGT-TGAAAAC-ATGGATA--A-TAGTAC------GT-CATAGTACAACGTTG
gi|44563 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGATC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44564 : CATCACAGTACAACGC-CGATTAT-ATGGATA--A-TAGTAC------GT-CACAGTGCAACGTTGAC
gi|44565 : CGTAACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAGCGCTGA
gi|44566 : CGTCACAGTACAACAT-TGATAGC-ATGGATA--A-TAGAAC------GT-CATAGTATAACGTTG
gi|44567 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44568 : CGTCACAGTACAATGT-TGGTTTC-ATGGACA--A-CAGCAC------GC-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44569 : CGTCACATTGCAACAT-TGGTATC-ATGGACA--A-CAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44570 : CGTCACAGTACCACGT-TGACAAC-ATGGACA--T-GAGTTC------GT-CACAGTACAGCGTTGAC
gi|44571 : CGTCACAGTACATCGT-TGGTAAC-GTGGACA--A-TAGATC------GT-CACAGTACGACGTTGA
gi|44572 : CGTCACAGTACAACAA-TGGTAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACAGTAAATTGTTGA
gi|44573 : CGTCACAGTACAACGT-TGATATT-ATTGACA--A-AAATAC------GT-CACAGTACAACGTTAA
gi|44574 : CGTCACAGTACAACGT-TGCCAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CGAGGTACAACGTTG
gi|44575 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAGC-GTGGATA--A-TACTAC------GT-CACAGTACAACGTT
gi|44576 : CGTCATAGTATAACGT-TGGAAAC-GTGGACA--A-TAGTAC------GT-CACTGTACAACATTGA
gi|44577 : CGTCACAGTACAACGT-TGGTATC-GTGGACA--A-AAGAAC------GT-CACAGTACAACATTG
gi|44578 : CGTCACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGAAAATA-TAGCAC------AT-CACAGTACAACGCCGA
gi|44579 : CGCCACAGTACAAAGT-TGATATC-ATTGACA--A-TACCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44580 : CGTCACAGTAAAACGT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAGTAT------GT-CAAAGTACAACATT
gi|44581 : CGTCACAGTACAACGT-TGCTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACATCGTTAA
gi|44582 : CGTCACAGTACATCGT-TAATATC-ATTGACA--A-TAGTAA------GT-AACAGTACAACGTTGAC
gi|44583 : CGTCACAATGTAACGT-TGGTTAC-GTGGACA--T-TAGTAC------GT-CACAGTACAATGTTGAC
gi|44584 : CGACACAGTCAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCAA------GT-CACAGTACAACGTTGGC
gi|44585 : CGTCACCGTACAACAT-TGACAAC-ATGGACA--T-GAGTAC------GT-CACAGTACACCGTTG
gi|44586 : CGTCACAGTACAAAGT-TGACAAC-ATGGGCA--A-TAGAAC------GT-CAAAGTACGGCGTTGA
gi|44587 : CGTTAAAGCAAAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CACGGTACATCGTTGA
gi|44588 : CATCACAGTATAACGT-TGATATC-ATGGACA--T-TAGAAC------GT-CACAGTACAACGT
gi|44589 : CATCACAGTACAACGT-TGATATT-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTATACCATTGA
gi|44590 : CGTCACAGTACACCAC-TGATTAT-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACCGTACAACATTGAC
gi|44591 : CGTAACAGTACAGCGT-TGATAAC-GTAGACA--A-TATCAC------GT-CACCGTACAACGTTG
gi|44592 : CGTCACAGTACAACCC-TGACAAT-ATGGACA--A-TTGTAC------AT-CAAAGTATAACGTTGAC
gi|44593 : CGTCACAGTACAGCGC-TGATTAT-ATGGTCA--A-TAGCAC------GT-AACAGTACAATGTTGAC
gi|44594 : CGTCACGGTCCAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACGGTCCAACGTTGA
gi|44595 : CGTCACATTTAAACGC-TGATAAT-GTGGACA--A-GAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44596 : CGTCACAGAACAACGT-TGGTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GC-CCCAGTACAACGTTGA
gi|44597 : CGTCACAGTACAACGT-TTGTATA-ATGGACA--A-TAGCAC------GC-CACAGTACAAAGTTGA
gi|44598 : CGTCACAGTTCAACGT-TGCCAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CATAGTAAAACGTTAA
gi|44599 : CATCACAGTACAACGT-TGATATA-ATTGACA--A-AAATAC------GT-CACAGTACAACGTTAA
gi|44600 : CGTTAAAGCAAAACGT-TAACAAC-ATGGACA--A-TAGAAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44601 : CGCCGCAGTACATCGT-TATTATC-ATTGACG--A-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44602 : CGTTACAGTACTTCGT-CGATAAC-GTAGACA--A-TAGTAC------GA-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44603 : CGTCACAGTACAACGTATG-TATC-ATGGACA--A-GAATAC------GT-CACAGTTCAACGTTG
gi|44604 : CGTCACAGTAAAACGT-CGCTATC-ATGGACA--A--AACAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44605 : CATCACAGTACAACAT-TGGCAAC-GTGGAAA--A-TAGTAT------GT-CACAGTTCAACATTGA
gi|44606 : CGTCACAGTACAACGT-TGCCAAC-AT-GACA--A-TAGAAC------GT-CATAGTAAAACGTT
gi|44607 : CGTCACAGTACACCGT-TGGTAAC-GTGGAC---A-TAGATC------GT-CTCAGTACAACGTTGA
gi|44608 : CGTCACGGTCCAACGT-TGATATC-ATTGACA--A-AAGCAC------GT-CACAGAACAACGTTG
gi|44609 : CGTCACAGTACAACGT-TGTCAAC-CTGGACA--A-TAGTAC------AT-GGAAGTACAACGTT
gi|44610 : CGTCACAGTGCATCTT-TGACAGC-ATAGACA--A-TAGCAC------TT-CACAGTACAAAGTTGAC
gi|44611 : CGCCACAGTACAACAT-TGATATC-ATGGAGA--A-TAGATC------AT-CACAGTACAACGTT
gi|44612 : CGTCATAGTAAAACGT-TTAAAAC-ATGGACA--G-CAGTAC------GT-CACAGTAAAACGTCG
gi|44613 : CGTCCCAGTTCAACGC-TGGTAAC-AAGGCCA--A-TATCAC------GT-CACAGTACAACGTTGA
gi|44614 : CGTCACAGTACAACGT-TAATATC-ATTGACA--A-CAGAAC------AT-CACTGTACAACATTGGC
gi|44615 : CGTCAAAGTACGGCGT-TGATATC-ATTGACA--G-TAGTAC------GT-CACAGAACAACGTGGA
gi|44616 : CGTCACTGTGCAACTT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAAAAC------GT-CACAGTACATCGTTG
gi|44617 : CGCCCCAGTACAACGT-TGAATTC-ATTGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTAAAACGTTGAC
gi|44642 : GTCACAGTACAACGT-TGGCAAA-ATGGACA--A-TAGCAC------GT-CACAGTACAAAGTTGAC
gi|44643 : GTCACAGTACAACGT-TGGCGAC-ATGGACA--A-TAGCAC------CA-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44644 : GTCAAAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--A-TAGCACCGCACAGTACACAGTACAACGTTGA
gi|44645 : GTTAAAGAAAAACGT-TGACAAC-ATGGAAA--AATAGCAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44646 : GTAACAGTACAACGT-TGACAAC-ATAGACA--A-TAGAAC------GT-CGCGGTTCAAAGTTGA
gi|44651 : TCACAGTACAAAGT-TGACAAA-ATGGACA--A-TAGTAC------GT-CTCAGTACAACGTTG
gi|44654 : CACAGTACAACGT-TGACAAC-ATGGACA--G-TAGTAC------GT-CACAGTACAACGTTG
gi|44655 : CACAGTACAACGT-TGA-AACTGTGGACA--A-TAACAC------GT-CACAGTACAACGTTGAC
gi|44657 : AGTACAACGT-TAGCAAC-ATGGACA--A-AAGTAC------GT-CACAATACAACGTTGAC