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Reference ( gi|36124 )        :   TTTTTTAT--AAA-A-ATGG-C-------GT-A-------ATATAAT-GTC---CA-CAATATA-T----ATATATT--AT-------TGTTT-G-ATT------TGT--T--T---C--TG-CT-T-GC---T--T------A----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------A----------------T-----T--A--A----------T-----T-CGAGGA-ATA-----AAA-A-----A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACCGC---------AAA-------AC-T---T-----T---------------A-T---C--A---CGACGAC-AT-AAGCAGGG---C-AG-----GGCT-AT------A--C--CTTTGGTATAA---A--GTCCGGCT-TAGAA
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gi|36109                      :    TTTTTA---AAA-A-ATGA-A-------AT-A-------ATACAAT-TTT---CA-TAATATT-T---------TT--AC-------TTTTT-G-AAT------TGT--A--C---C--TG-CA-T-GC---T--T------A----T---A-----T----T--A---A-A--TGCATGTA--CA---T------------G------A------AGC----A----------------TA----TGAA--A----------G-----T-CGAGGA-TTA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---A---G-T----A----CGATCATT-T-----TGACGG---TGGTCAACACTGC---------AAA-------AC-A---T-----G---------------A-T---T--A---CGACGAC-AT-AA-----A---T-AG-----TGTT-AT------G--G--CCTTGTCATAA---A--GCCCGGCT-TAA
gi|36130                      :  acTTTTTATTAAAG-A-ATGA-C-------AT-G-------ATCCAAT-GTC---AA-CAATATA-T----TT---TT--AT-------TGTTT-T-AAT------TGT--T--T---C--TG-CC-G-GC---A--T------A----T---A-----T----A--A---A-C--T------A--TA---T------------GGAAA--A------A------A----------------T-----GG-A--A----------T-----A-CTAGGA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-CCCTG-ACG---C---G-T----A----TGATTATT---------GCAG---TGATCAACACTGC---------AAA-------GC-G---T-----T---------------A-T---C--A---CGACGAC-GT-AGGCAGGG---C-
gi|36140                      :    TCTTT-T--AAA-A-ATCA-T-------TT-A-------ATACAAT-TTC---CC-CCA----------ATATATT--TT-------TGTTT-G-ATT------TGT--T--T---C--TG-CT-T-GC---T--T------A----T---A-----T----TA-A---A-A--A------A--CA---T------------GAAAAAAA------A------A----------------TG----G--A--A----------T-----T-CGAGGA-ATA-----AAA-AGT---A-----GCTAGT-CACTG-TGG---C---A-T----A----TTGTCATT-T-----TTGCCA---TGATC-ACACTGC---------ACA-------GC-T---T-----G---------------A-T---C--A---TGATGAC-TT-AAGCAGGG---C-A-----------AT------G--C--CTTTGtttgacccggctaaaaa
gi|36145                      :    TTTTT-T--AAA-A-ATGA-C-------AT-A-------ATACAAT-GTC---TG-CAATATC-T----GT-TA----AT-------TATTT-G-ATT------TGT--T--T---C--TG-TT-T-AC---T--T------T----T---G-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------A----------------------------------------------------A-ATA-----AA---------------------------------------T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCTACACTGT---------AAC-------GC-T---T-----G---------------A-T---C--T---TGACGAC-AT-AA-----G---C-AG-----GGCT-AT------A--C--CTTTGGCATGA---cctttatgtcccactaaaaa
gi|36144                      :    TTTTT-T--AAA-A-ATAT-C-------TC-A-------ATACAAT-GTC---TG-CAATATA-T----TT---TT--AT-------TTTTT-T-ATT------TTT--T--T---T--GG-CT-T-GC---T--T------A----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--CA---C------------GACA---A------A------A----------------TGC---T--A--C----------T-----T--GAGGA-AT------AAA-A-----A-----G-TAGT-CCCTG-TTG---C---G-T----A------AT----------------------ATCAACACTGC---------AAA-------TC-T---T-----G---------------A-C---C--A---TGACGAC-AT-GAGCAGGG---C-
gi|36118                      :    TTTTTAA--AAA-A-ATAA-C-------AT-G-------ATACAATTGTC---AA-CAATATG-T-------T-TT--AT-------TGTTT-G-ATT------TTT--T--T---C--TG-CT-G-TA---T--T------A----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--AA---TTAAAAAAAAA--G------A------A------A----------------C-----T--T--G----------T-----G-CGCGGA-A---------A-A-----A-----G-TAGT-CCTTG-TCG---C---G-T----A----AGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGC---------AAA-------GC-T---
gi|36171                      :   aTTTTAAA--AAA-A-ATGA-C-------AT-A-------ATGCAAT-TTC---CA-CAATTTA-C----TTGTATT------------GTTT-A-AGT------TGA--T--G---C--TG-CT-T-GA---A--T------A----T---A-----T----A--A---A-G--T------A--CA---T------------GGGGA--A------A------A----------------T-----G--AG-A----------T-----T-CGAGGA-ACG-----AAA-A-----A-----G-TAGT-TCCTG-TCA---G---A-T----A----TGATCATT-T-----TGGCCT---ATATCAAAACTGC---------AAA-------GC-G---T-----G---------------A-C---C--A---GGACCAC-AA-TAGCA----------------TTT-AT------ATGC--CTTTGGCATAG---A--A-CCGGCcaagcagtgctatgctatttgcattaaaccagcttaaaaa
gi|36152                      :    TTTTTA-----A-A-ATGA-C-------AT-A-------ATACAAT-GAC---CA-CGATATT-T----TT---TT--AT-------TGTTT-T-ATT------TATTAT--T---T--TA-TT-T-AT---T--TTGTTTCA----T---A-----T----T--A---A-C--A------A--CA---T------------G------A------A------A----------------C-----A--A--A----------A-----T--GAAGATATATTAATAAA-A-----C-----G-AAGT-CACTG-TCG---C---A-TAATAA----TGATCATT-T-----TGGCTG---TGCTTATGTCTGC---------AAA-------GC-T---T-----G---------------G-T---C--A---CGACGAC-AT-AAGTAGGG-----A---------T-AT------G--C--CTTTTGCATAA---A--GCCgaaaa
gi|36106                      :     TTTT-T--AAA-A-ATGA-T-------AT-A-------CTACAAT-GTC----A-CAATATA-T----TT---TT--AT-------TGTTT-G-ATA------TGT---------A--TG-TT-T-GC---T--T------A----T---A-----C----T--T---T-A--T------A--CA---T------------G------A------A------AAAAA------------T-----T--A--A----------TA----T-CGAGGA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGTGG---TGATTAACACTGC---------AAA-------GC-G---T-----T---------------A-T---C--A---CGACGAC-AT-AAGTAGGG-----A---------T-AT------G--C--TTTTGATATAA---A--GCCTGGCT-aaactaaaa
gi|36147                      :  ataTTTT-T--AGA-A-TTGA-C-------AT-A-------ATAAAAT-GTC---GA-CAATATA-T-------T-TT--AT-------TGTTTTG-AAT------TAT--T--T---C--TG-AT-G-GC---A--T------A----T---A-----C----A--A---A-A--T------G--CA---T------------G------ACAAA--A------A----------------T-----G--A--A----------T-----T-CGGGAA-CTA-----GAA-------------G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGGTCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGC---------AAA-------GC-T---T-----G---------------A-A---C--A---CGACGAC-AT-AAGCA------C--------GGCT-GT------G--T--CTTTTGCACAA---A--GCCCGGCT-aaaa
gi|36107                      :     TTTTAT--CAA-A-A-GG-C-------AT-A-------AAACAAT-GTC---CG-CAATATA-T----TT-T-TT--AT-------TGTTT-G-GTT------TGT--T--C---A--TG-CA-T-GC---T--T------A----T---A-----T----T--A---A-A--A------A--CA---T------------GGAA---A------A------A----------------T-----G--A--AA---------T-----T-CGAAGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCCTG-TTG---C---G-C----G----TTATTATT-A-----TGGCGG---TGATCAAGACTGC---------AAA-------TC-T---T-----G---------------A-T---C--A---CAACAAG-AT-AAGCA-GG---T-A---------C-AT------G--C--CTTTGGCACAA---A--TCCCGGCT-aaaa
gi|36114                      :    aTTTT-C--AAA-A-ATGA-C-------AT-A-------ACACAAT-GTC---CA-CATTATA-T----TT---TT--AT-------TGTTT-G-ATG------TGT--T----------G-CA-T------T--T------A----T---A-------------A---A-A--C------A--CA---C------------G------A------A------A----------------A-----A--A--A----------A-----T-CGACTA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-TCCTG-TCG---C---G-T----A----TGGTTATC-T-----TGGCGG---TGATCAAAACCGC---------AAA-------GC-T---T-----T---------------A-T---C--A---ACCCGAC-AT-AA-----A---C-AG-----AGCT-GT------G--T--CTTTGGCATAA---A--TTCCGGCT-TAA
gi|36166                      :  ataTTTTA-----A-A-CTAA-C-------AT-A-------ATTAAAT-GTC---GA-CAATATA-C----TT---TT--AT-------TGTTT-G-ATT------TGG--T--T---C--TG-CT-T-GT---A--T------A----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------ACAA---A----------------T-----G--A--AA---------T-----T-CGAGGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCTTC-TCG---C---G-T----A----TGATCAAT-T-----TAGCGG---TGATCAATACTGC---------AAC-------GC-T---T-----A---------------A-T---C--A---CGACAAC-AT----C--TC---C-TG-----GGCT-AT------T--C--ATTTGGCATTA---A--GACTGGCT-AAAAA
gi|36153                      :     TTTT-T--GAA-A-ATGA-C-------AT-T-------TTACAAT-GTC---CA-CAATATA-T----TTCTATT--GT-------TG----A-ATT------TGT--T--T---C--TG-CT-T-GC---T--T------A----T---T-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------A----------------TA----A--A--A----------T-----T-CGAAGA-ATG-----A-----------------------------CG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACCGTGC---------AAA-------GC-T---TG----G---------------A-T---C--A---CGACGAC-TT-AAGCAGTG-----A---------T-AT------G--C--CTCCGCCACCA---A--GTCCGGCT-
gi|36156                      :     TTTT-T--CAA-A-ATGA-C-------TT-A-------ATAAAAT-GTC---CA-CATTATA-T----AAATATT--AT-------T---T-G-ATT------AGT--T--T---A--TT-CT-T-GC---T--T------A----T---G-----T----T--A---T-A--T------A--CA---T------------A------A------AT-----A----------------T-----A--A--A----------T--------GAGGA-GTA-----AAA-A-----------G-TATTTCCCTG-CCG---C---------------TAAT-----T-----TGGCGG---TGATTAACGCTGC---------AG-----------T---T-----T---------------GCT---C--A---CGGCGAC-AT-AAGCTAGG---C-AG-----GGCT-AT------G--A--CTTTGGCATAAC--AATGCCCAGCT-AAAAAaaaa
gi|36148                      :     TTTT-T--AAA-A-ATGA-T-------AT-A-------ATACGAT-GTA---TAACAATATA-T----TT---TT--AT-------TGCTT-C-ATT------TGT--T-----------------GC---A--T------A----T---A-----TAAAAT--A---A-A--TCAAA--A--CA---T------------G------A------A------A----------------T-----T------------------------TGAGGA-ATA-----AAA-T-----------G-TAGT-CCGTG-TGG---C---G-T----A----TGACCATT-T-----TGGCGG---TGATAAAGACTGC---------AAA-------TC-T---T-----G---------------A-T---C--A---TAACGAC-GC--AGCAGGG------G-----GGCT-CT------G--T--CTTTGGCATGA---A--GCCCGG
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gi|36142                      : attgTTTTCT--AAA-A-ATGA-C-------AT-A-------ATACAAT-GTC---TG-CAATATA-T----TT---TT--AT-------TGTTT-C-ATT------TAT--T--T---C--TG-CT-T-GA---T--T------A----T---C-----T----C--A---A-A--T------A--CA---T------------GGAA---A------A------A----------------T-----GG-A--A----------T-----T-TGAGGA-ACA-----AAA-A-----------G-TTGC-CCCTG-TCATCAC---A-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGA---GGATAAACTCTGC---------AAA-------GC-T---T-----G---------------A-T---T--A---CAACTGC-AT-AAaataa
gi|36168                      :     TTTTAA--AAATA-ATGA-C-------AT-A-------ATACGAT-GTT---AA-CAATATA-T----TTTTAT---AT-------TG----G-ATT------TGT--T--T---C--TG-CT-T-G-------T------A----T---A-----T----TTAA---A-A--T------A--CA---C-------------------A------A------A----------------T-----------A----------C-----T-CGAGGA-GTA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCCTG-ACA---C---A-C----A----TGATAATT-T-----TGGCAG---TGATTAACATTGT---------AAA-------GC-C---T-----A---------------A-A---T--A---CGTCGAA-AC-AA-----G---C-AG-----GGCT-AT------G--C--ATTTTTTTTAA---A--ACCCAGCT-
gi|36157                      :     TTTT-T--AGA-A-ATTA-C-------AT-A-------ATATAAT-GTT---CA-TA-TA-A-T----ATCT-TT--AT-------TATTT-G-ATT------TGT--T--G---C--TG--T-T-GC---A--T------A----T---A-----A----A--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------AAA--------------TA----C--A--A----------T-----T-TGACAA-ATA-----AAA-A-----------G-TATT-CCCAG-TCG---C---A-T----A----TGATCAAT-T-----TGGCGG---TGACCAACACTGC---------AAA-------GC-T---T-----C---------------A-C---C--A---CAACGAC-Aataaa
gi|36165                      :     TTTTA-----A-A-GTGA-C-------CT-A-------ATATTAT-GTC---TA-CAATATA-T----GT---TT--AG-------TGTTT-G------------T--T--T---C--TG-CT-T-GCATAT--T------A----T---A-----T----A--A---A-A--T------A--GA---T------------A------ACAA---A------A----------------G-----A--A--A----------T-----T-CAAGGA-ATT-----AAA-T-----A-------TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGGGCATA-T-----TGTCGG---TGATCGACTCTGC----------AA-------AC----------------------------------------------C-AT-AA-----G---C-AG-----GGTT-TT------G--T--CTTTGGCATAA---A--GTCCGGCT-
gi|36158                      :     TTTT-T--AAA-A-ATGA-C-------CA-A-------AAAAAAT-AGG---CA-AAAAATA-T----G-ATTTT--AT-------GGTTT-G-ATT------TGT--T--G---C--TA-CT-T-GC---A--T------AAGCAT---A-----T----C--A---A-A--T------A--CA---T------------A------A------A------ACA--------------T-----T--A--A----------T-----T-CGATGA-ACA-----AAA-A-----------G-AAGT-CTCTG-CCG---C---G-T----T----TGATTATT-T-----TGGCGG---TGATAAACACAGC---------AAG-------GC-T---T-----G---------------A-T---T--A---AGACGTC-AT-AACCAGaataaa
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gi|36170                      :     TTTTAA--AAC-A-AT---C-------AT-A-------ATACAAT-GTC---TA-TACTACA-T----TT---CT--AT-------CGTTT-G-ATT------TAT--T--TGATT--TG--T-T-AC---T--T------A----A---A-----T----A--A---A-A--T------A--TG---T------------G------A------A------ACAA-------------T-----TGAA--A----------T-----T-CAAAGA-ACA-----AAA-A-----------G-TAGT-CTCTGATTG---T---G-T------------------T-----TGGCGG---TAATGAAGACTGC---------AAA-------GC-T---T-----G---------------A-T---C--A---CGCCGAC-A--AAGTAGGG---C-A-----------AT------G--C--ATCTGGCTTAA---T--ACCAGGCT-TAtgtgtcattgt
gi|36169                      :     TTTTA---GAA-A-ATGA-C-------AT-A-------ATACAAT-GTC---GA-AAA---A-T----ATATTTTGAAT-------GGTTG-G-ACT------TGT--T----------G-CA-T-ATA--C--T------G----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--AA---T------------G------A------A------A----------------G-----A--A--AAAAAAAGAAAT-----T-CAACGA-ATA-----AAA-A-----------G-AAAT-CTCTG-TCA---C---G-T----A----T-ATCATG-T-----TTGCGG---TGATAAAGACGGC---------AGC-------GC-T---TGA---T---------------A-T---C--G---C-ACGAC-------CA--G---C-AA-----GGCT-CT------A--T--CTCTGGCATAC---A--ACCCTGCT-TAAAAa
gi|36151                      :     TTTT-T--AAA-A-GTGA-C-------AC-A-------ATACAAT-GTC---TA-CAATAT--------TCTTTT--AT-------TGTTT-TCATT------TGT--T-----------------GC---A--T------A----T---G-----T----G--A---A-A---------A--TA---T------------G------A------A------A----------------T-----T------------------------CGACAA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-TATTG-TTT---C---G-T----A-----GAT---T-T-----TCTCGG---TGATTAAGACTTC---------CAA-------AT-T---T-----G---------------A-T---C--A---GGATGGT-TT-AAGCA---------G-----GGCT-AT------G--T--TTTTGACATAA---A--GTC
gi|36160                      :     TTTTA---AAA-A-ATGA-C-------AA-A-------GTACAAA-GTC---CA-AAATATA-T-------T-TT--AT-------TGTTT-A-ATT------TGT--A--A---C-------------------------A----T---A-----T-------------A--T------A--CA---T------------G------A------A------AAAAAAAA---------G-----A--A--A----------T-----T-CGACGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCCTC-TGG---C---G-A----A----TGATAATT-T-----TTGCGG---TGATCAAAACTGC---------AAA-------GC-tctaataa
gi|36163                      :      TTTA---AAA-A-ATGA-C-------AT-AGATTCTAATACAAT-ATC---CG-GAATATA-T----TT---TT--AT-------TGTTTTG-ATT------TGT--T--T---T--TA-CG-T-AC---A--T------A----T---A-----T----A--A---A-A--T------A--CA---T------------GGAA---A------A------A----------------T-----G--A--AA---------T-----T-CGAGGA-TTA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TAATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGT---------AAA-------AC-T---T-----A---------------A-T---A--A---CGACGAC-AT-AA-----G---C-AG-----GGCT-AT------G--G--CTTT-GT-CAA---A--GCCCGGCTATAAAA
gi|36167                      :      TTT-T--AAA-C-ATTA-C-------AT-A-------ATACAAT-GAA---CT-CAATATA-T----TT---TT--TT-------TGTCT-G-ACT------TGT--T--T---C--TG-CT-T-GC---T--T------T----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------GAAA---A------A------A----------------T-----GA-A--A----------T-----T-TTAGGA-AT------AAA-A-----A-----G-TAGT-TCTTT-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCAG---T--T--------------------A-------AC-T---G-----T---------------A-A---C--A---CGACAAC-AT-AA-----G---C-AG-----GGCT-AT------G--C--CTGTGACATAA---A--GCC
gi|36150                      :      TTTCT--AAA-T-ATGA-A-------AT-A--------TACAAT-GTC---CA-GAAAACA-T----TT---TC--AC-------TGTGT-A-ATT------TCT--T----------G----T-GT---T--C------A----T---A-------------A---A-A--T------A--TA---T------------G------A------A------AAA--------------T-----T--A--AACAAA-----T-----T-AGAAGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCCAG-TCG---C---G-T----A----TGATCATTATATAAATGGCAA---TGAT--------T---------AAA-------GC-T---T-----G---------------A-C---CTGA---GGATGTC-AT-AA-----A---C-AG-----GACT-AT------G--C--CTTTGACATAACTTA--GCTCGGCT-TAAAAttactaaaa
gi|36183                      :       TTAT--AAA----TGA-CATACATTGT-A-------ATACAAT-GTC---CA-CAATGTA-T----TT---CT--GT-------TGTTT-G-ATT------TGT--T--C---C--TG-CT-T-GC---T--TTAAT--A----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--GA---A------------G------A------A------AAAA-------------T-----G--AC-A----------T-----T-CC------TG-----AAT-A-----A-----G-TAGC-CCCTG-TCG---G---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGTAG---GGATCAACACAGC---------AAA-------GC-T---T-----G---------------A-T---C--A---CAAC-------AAG-AAAG---A-AA-----GGTT-GT------G--C--CTTTGGCATAA---A--GCCCAGCT-TAAAA
gi|36138                      :          T--AAA-A-ATAA-C----------A-------ATACAAT-GTC---GA-CAATAAA-T-------T-TC--AT-------TGTTT-G-ATT------TGT--T--T---C--TA-CT-T-GC---T--T------AAA--T---A-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------AACTAAAAAAAAAAAAAT-----T--A--AA---------T-----T-TGAGGA-ATA-----TAA-A-----------G-TAGT-CCCTG-TCA---T-----T----A----TGATAATT-T-----TGGTGG---TGATCAACACCGC---------AAA-------GC-T---T-----G---------------A-T---C--A---AGACAAC-AT-A-----TG---C-AG-----GGCC-AT------A--C--TTGTGGCATAA---A--GTCTGACT-AAAAA
gi|36177                      :     tttgtT--AAA-A-ATGA-T-------AT-A-------ATACAAT-GTC---CA-CAATATT-T----GT---TT--AT-------TTTTT-T-ATT------TGT--T--T---T--TG-CT-G-GC---A--T------A----T---A-----T-----------A-A--C------A---A---T------------G------A------A------A----------------T-----T------------------------CCAGGA-ATT-----TAA-A-----G-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGGTTATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGG---------AAA-------GT-C---T-----G---------------A-T---C--A---CGACGAC-AA-AA-----G---C-AG-----TGCT-AT------G--T--CTTTGTCATAT---A--ATCAGGCT-
gi|36178                      :        ttT--AAA-A-ATGT-C-------AT-A-------ATACAAT-GTC---CA-CAGAATA-T----ATTT-TT--CT-------TGTTT-A-ATT------TGT--T--T---CA-TA--------------T------A----C---A-----T----G--A---G-A--A------A--AA---T------------G------A------A-----------------------T-----G--AC-A----------T-----T-CGATGA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-TCCTG-TTG---C---G-T----A----TGTTTATT-T-----TGGCGG---TGACCAAAATCGC---------AAA-------GC-T---T-----T---------------A-T---C--A---CGCCGAC-AT-TA-----G---C-AG-----GGCT-AC------G--T--CTTTGGCATAaaaa
gi|36181                      :        ttT--AAA-A-ATGGAC-------AA-A-------ACACAAT-GTC---TA-CAATTTA-T----TT---TT--AT-------TATTT-G-ATA------CGT--T--T---C--TG-CT-T-GC---T--A------A----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------A------A------A------A----------------------------------------------------------------A-A-----A-----G-TAAT-CCCT-------------------A----TGATAATT-T-----TTGCGG---TGATCAACACAGC---------AAA-------GC-T---T-----A---------------A-T---C--A---CGACGAC-AT-AAGCAGGG-----A---------T-AT------G--T--GTTTGGCTCAA---A--GCCCAGA--TAGAAcaccttggc
gi|36180                      :        ttT--AAA-A-ATTA-T-------TC-A-------ATACCTT-GTC---CA-CGCTATA-T-------T-TC--AT-------TGTTT-G-ATT------TGC--T--G---C--TG-CT-T-GC---A--T------A----T---A-----T----A--A---A-A--T------A--CA---T------------G------AGGAA--A------A----------------TA----T--AT-A----------T-----T-AAAGGA-ATA-----AAA-A-----------G-TA----TCTA-ACG---C---G-T----A----TGGACATT-T-----TGGCGG---TGACCAAGACTGT---------AAA-------GC-T---T-----G---------------A-C---C--A---CGACGAC-AT-A-----GG---C-AG-----CGCT-G----------------TGGCATAA---A--ACCCGGCT-a
gi|36187                      :         tt--AAA-ATATGA-C-------AT-T-------ATACAAT-GTC---CA-TAATATA-T-------T-TT--AT-------TGTTT-G-ATT------TAT--T--T---C--TG-CT-A-GC---G--T------A----T---A-----T----G--A---A-A--T------A--TA---TGAA---------G------A------A------A----------------A-----A--A--A----------T--------AAGGA-AT------AAA-A-----A-----G-TAGT-CCCTG-CCG---C---G-T----A----TGATTACT-T-----TGGCGG---TGATCAAAACTGC---------AAC-------GT-T---T-----G---------------A-T---C--A---CGACGAC-AT-TAGCAGGG-----A---------T-AT------G--C--CTTTGGTATAA---A--GCCCGGCT-TAAAAaaaa
gi|36185                      :           --AAA-A-ACAA-C-------AT-A-------ATACAAT-GTC---CA-CAATATA-T----GT---TT--AT-------TGTTT---ATT------TTT--TGTT---C--TG-CT-T-GC---T--T------A----T---A-----T----C--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------AAAA-------------T-----G--A--A----------T-----TTCGAGGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCATG-TTG---C---G-T----A----TGATTATT-T-----TGGCGG---TGATTAACACTGC---------AGA-------GT-T---T-----G---------------A-T---A--A---CGACGAC-AT-AAACAATGCT-C-TGCCTTTGGCT-AT------A--C--AT---GCATAA---A--TCCCGGCT-AAAAA
gi|36184                      :           --AAA-A-ATAA-C-------AT-A-------ATACAAT-ATC---AA-CAACAAA-T-----TATTTC--AT-------TGTTT-T-ATT------TGT--T--T---T--CA-CT-T-GC---T--T------A----C---A-----T----C--A---A----T------A--CA---T------------G------A------A------AAAA-------------T-----G--A--AA---------T-----T-CGAGGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CTCTA-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGC----------AT-------AC-T---T-----G---------------A-T---C--A---CGATGAC-AT-A--C---G---C-AG-----GGCT-GT------T--C--CTATTGTATAA---A--GACCGG-T-TAAAA
gi|36186                      :           --AAA-A-ATA--C-------TT-A-------ATACGAT-GTC---CA-CAATATA-T----------T---T-------TGTTT-G-ATT------TCT--T--T---C--TG-CA-T-TA---T--T------A----T---A-----T----C--A---A-A------------CA---T------------G------ACAA---A------A----------------T-----G--A--AA---------T-----T-CAGTGA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGGTCATT-T-----TGGCGG---TGTTCAACACGAC---------AAA-------GT-T---T-----A---------------A-T---C--A---CGACGAC-AT-AA-----G---C-AG-----GGCT-AT------G--C--CTTTAGCATAA---A--GCTCGGCT-a
gi|36188                      :           --AAG-A-ATGA-C-------AT-A-------ATACAAT-GTC---CG-CAATATA-G----TTTTTTT--AT-------TGTTT---ATT------TTT--G--A---C--TG-CT-T-GC---T--T------A----T---A-----T----T--T---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------AAAAAAC----------G-----A--A--A----------T-----T-CGAGGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCCTA-GCG---C---G-T----G----TGAACGTT-T-----TGTCTG---TGACCAACATTGC---------AAA-------GC-T---T-----G---------------A-T---C--G---CGATAAC-AT---GCGG-------AG-----G---------------C--CTTTGGCATAA---A--ACCCGGCT-aaaa
gi|36190                      :           --AAA-A-ACGA-C-------AT-T-------ATACAAT-GCT---TT-CAATATA-T----TT---TT--AT-------TGTTT-G-ATT------TGT--T--T---CA-TA-TT-A-AC---T--T------A----C---G-----C----T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------ACAA---A----------------T-----G--A--AA---------G-----T-CGAATA-ATA-----AAA-A-----A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----GGATCATT-T-----TGGAAG---TGATCAACACTG--------------------------------------------------------------------C-AT-AA-----G---C-AG-----GGCT-AT------G--C--CGTTGGCGTAA---A--GCCCGGCT-aaaa
gi|36189                      :           --AAA-A-AAGA-C-------AT-A-------CTACAAT-GTC---CG-TAATATA-C----AT---TT--AT-------AGTTT-G-ATC------TGT--T-----------------GC---C--T------A----T---A-----T----A--A---G-A--T------A--TA---TCACAAAAT----G------A------A------A-------------------------A--A----------T-----T--GATTA-ATA-----AAA-A-----------G-TATT-CCCTC-TCG---C---G-T----A----TCATCAAT-A-----AGACGG---TGACCGAGACTGC---------ACA-------CT-T---T-----T---------------A-T---C--A---CGACGAC-AT-A------G---T-AG-----GGCT-AT------G--T--ATTTTGCATAA---A--GCCCGGCaaaa
gi|36191                      :           --AAA-T-ATGT-C-------AT-T-------ATACAAT-GTC---CT-CAATATA-T-----TGTTTC--AT-------TGGTT-G-ATT------TGT--T-----------------GC---A--T------A----T---A-----T----A--A---T-A--T------A--CA---T------------G------A------ACA----A----------------TA----TGAA--A----------T-----T-TGAGGA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-TCCTC-TCG---C---G-T----A----TCGTCA-C-T-----TGG------------ACA--GC---------GGA-------GT-T---T-----G---------------A-C---C--A---CGCCGAC-AT-AAGCAGGA---C-TG--------T-AT------G--C--ATTTAGCATCA---A--GTCCGGCgaaaaa
gi|36193                      :              AA-A-ATGA-C-------AT-T-------ATACATT-ATC---CA-AAATACA-T----GTTTATT--TT-------CATT----ATTA-----TGT--T--G---C--TG-AC-T-GC---A--T------A----T---A-----A-------A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------A----------------CAAAA-T--AT-A----------T-----T-CGTGGA-ATG-----AAA-A-----------G-TAGT-TTTTT-ACA---G---G-T----A----TGTTGATT-T-----AGGCAA---TGATGAAGATTGC---------AAA-------GT-T---T-----G---------------A-TTA-C--A---TGCCGAC-AT-AAGCAAGGGTTC-AT-----G--T-AT------A-------TTGGCATAA---A--GCCCGCCT-aaacaa
gi|36108                      :               A-A-ATGA-C-------AC-A-------ATACA-T-ATC---CA-CACTA-A-T----TTTT-TT--AT-------TGGTT-G-ATT------TAT--T--T---C--TA-CTGG-GA---G--T------A----TAAAA-----T----A--A---A-A--T------A--AA---T------------A------AT-----A------A----------------CAG---TGAA--A----------T-----T-TGAGGA-AT------GAA-A-----A-----G-TAGT-CTCTG-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGA---------GAA-------CC-A---T-----G---------------A-T---C--A---CGGCTAC-AT-AACCAGGG---T-TA-----CGTT-A---------------TTGGTCAAA---A--GTCCGGCT-AAAAAataa
gi|36182                      : atttcgttaattttA-A-ATTG-A-------AT-A-------ATACAAT-GTCGTCCA-CAGTTTA-T----TT---TT--AT-------AGTTT-G-ATT------TGT--T--T---C--TG-CT-T-AC---A--C------A----C---A-----T----T--A---A----T------A--CA---T------------A------A------A------A----------------A-----T--AGAA----------A-----T-CGAGAA-ATA-----AAA-A-----A-----AATAGT-CCCTT-TCG---C---G-T----A----TGTTCATT-T-----TGGTGG---TGATAAACACTGC---------AAA-------GA-T---T-----G---------------A-T---C--A---
gi|36195                      :               ttt-ATGA-C-------AT-A-------ATACAAT-GTT---CA-CAATATA-T------------------------TTT-A-ATT----------------------G-CT-T-G--------------A----C---AG----C----T--G---A-A--T------A--TA---T------------G-------------------------------------------C--A--A----------T-----T-CGATGA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGA-CATTG-ATG---G---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TAATCAAAACTGC---------AGAGGTTCACAT-T---T-----TAAAATGTAAAGCCTAA-T---C--A---CGCCAAA-GT-AAGCA--G---C---------GCT-AT------G--T--CTTTGGCATAA---C--G-CCAGTC-TAAAAttgtcatgactatgcctggctcataa
gi|36164                      :                                 T-A-------ATACAAT-ATT---CT-CAATATC-T----AT-T-TT--AT-------TATTT-G-ATT------TG----------C--TG-CG-T-G-------T------A----T---A-------------A---A-A--T------A--CC---T------------G------ACAAA--A------A----------------A-----T--A--A----------T-----T-TGA----ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-CCCTG-TTG---C---G-T----A----TGATCACT-T-----CAGCAG---TAAACAGGACTGC---------AGG-------GC-T---T-----G---------------A-T---C--A---TGCCAAC-AT-AATCAGGG--------------CT-TT------G--A--ATTTTGTATAC---A--GCACGGCT-a
gi|36137                      :                ttttaaatatgataatta-A-------AAATGAC-GTC---CA-CAGTATA-T----TT---TC--AT-------TGTTT-G-ACT------TGT--T--T---C--TG-CG-T-GC---T--T------A----T---A-----T----C--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------ACA--------------T-----TGAA--A----------T-----T-CGAGGA-ATG-----AAA-A-----------G-TAGT-CCTTG-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TAATCAACACTGA---------AAA-------GC-T---TGGCGGC---------------A-C---C--A---CGACGAC-AA-AAGCAGGA---C-aaaa
gi|36197                      :                           tttttca-A-------AAACAAT-GTC---CA-CAATATA-T-------TGTT--AT-------TGTTT-T-ATT------TAT---------C--TG-CT-T-GC---T--T------A----T---A-----T----T--T---A-A--T------A--TA---T------------A------A------ACA----A----------------C-----TGAA--A----------T-----T-CGAGGA-ATA-----AAA-A-------------TAGT-CCCTC-TTG---T---G-T----A----TGATCATT-T-----TCGCGG---TGATCAACACTGC---------AAA-------TC-C---T-----A---------------A-T---C--A---CTACGAT-AT-AAGCAGGtttgc
gi|36154                      :                                    -------ATACGAT-GTC---CA-CAATATA-T----CT---TT--AT-------TGTTT-C-ATTAAATTTTGT--T--T---CA-TA-TC-T-TC---T--T------A----T--------------T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------AAAAAA-----------TG----T--A--A----------T-----T-CAAGAA-CTA-----AGA-A-----------G-TAGA-ACATG-TCG---C---T-T----T----TGATCAAT-T-----TGGTGG---TGATAAATAATGC---------AAA-------GG-T---T-----G---------------G-T---C--A---CGACGAC-----AGCA--T---C-AA-----GGCT-AT------G--T--CTCTGGCAT-T---A--GTCCGGCT-attatgattattgcataatacctggctaaaa
gi|36196                      :                                tttttaatgcaacATTAT-GGC---CA-TAATATA-T----ATTT-TT--CT-------TGTTT-G-GTT------TGA--T--T---C--TG-CT-T-GC---T--T------A----A---G-----T----T--A---A-A--T------A--CA---A------------G------A------A------A----------------AAAAAAT--A--AAA--------C-----T-CTAGAA-ATA-----AAA-A-----------G-TATT-CCCCT-TCG---T---G-A----A----TGATTATT-T-----TGGCGG---TGATCAAGACTAC---------A-----------------------------------------------A---CGATCAC-AT-AGGCAGGG---C-Aaaaa
gi|36139                      :                                      acattattcAAT-G------A-CAAGACA-T----TT---TT--AT-------TTTTT-G-ATT------TAC--T--T---C--GG-CT-T-AC---T--T------A----T---A-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------ACAA---A------A----------------T-----G--A--AA---------T-----T-AGAGAA-ATA-----AAA-A-----A-------TAGT-CCCGG-TCA---C---A-T----A----TAATCATT-G-----TGACGG---TGATCAACACTGT---------AAA-------GC-T---T-----A---------------A-T---C--A---CGACAAC-AT-AAA-AAGG---C----------CT-AT------G--C--CTGAGGCATAA---A--GCCCaaaagtccggctaaa
gi|36198                      :                                             tttttaaaa---CA-CAACATG-T----AT---TT--AT-------TGTTT-A------------T--T--T---C--TG-CT-T-GC---A--T------A----T---A-----T----G--A---A-A--T------A--AA---C------------GGAA---A------A------A----------------T-----G--A--AA---------T-----T-CGAGGA-ATA-----AAA-A-----A-------TCGT-CCCTG-TTG---A---G-T----A----TGATCATT-T-----AAGCGG---TGATCGGCTCTGC---------AAA-------CC-T---T-----A---------------A-T---C--A---CGGCGAA-AT-AAGCAGGG---C-TG-----A------------A--C--TTTTGGCATCA---A--CCCCGGCT-ctataaaa
gi|36201                      :                                                        aatgaAATACA------ATGTTTT--AT-------TGTTC-C-GCT------TAT--T--T---C--TG-CT-T-GC---A--T------A----T---A-----T----A--A---A-A--T------A--CAAGGTTGGGCG------G------A------A------A----------------G-----A--A--A----------T-----T-TGAGGA-AT------AAA-A-----C-----G-TGGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGATCAGT-T-----TGGCGG---TGAT-AGCACTAC---------AAA-------TG-T---T-----A---------------A-T---C--A---CGACGAC-AT-AA-----G---C-AG-----GGCT-AT------G--C--CTTTGCT-TAC---A--GCCCTG-T-TAAAAgaaa
gi|36205                      :                                                                              TT--AT-------TGTTT-G-ATT------TAT--T--T---C--T-------------------------------A-----T----T--A---A-A--T------A--CA---T------------G------A------A------A----------------------------------------------------A-ATG-----AAATA-----A-----G-TAGT-CCCTG-TCA---C---G-T----A----TAATCATT-T-----TGGTGG---TGATCAATTCTGC---------AAA-------GC-TAAAT-----G---------------A-T---G--A---CGATGGC-AA-AAACAGGG---C-GG-----------T------G--C--CTTTGGCATAA---A--GCCa
gi|36207                      :                                                                           tttTT--AT-------TGTTT-G-ATA------TGT--T-----------------AC---A--T------A----T---A-----T----G--A---A-A--T------A--CAAG-T------------A------A------A------A----------------T-----G--A--A----------A-------CTAGAC-ATA-----AAG-A-------------TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGTTTATT-T-----TGGCGG---TTATCAGGACTTC---------AAT-------GC-T---T-----G---------------A-T---C--A---CGCTGAC-AT------GAA---C-AG-----GGTT-AT------A--T--CTTTGGCATAA---A--GTCTAG-T-TAA
gi|36206                      :                                                                             tTT--AA-------TGTTT-G-ATT------TGT--T------------------C---A--A------A----T---ACAAT-T----T--A---A-A-------------A---G------------A------A------A------A----------------A-----T--A--G----------TC----T-CAATGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCTTA-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----AAACGG---TGGTCAAGATTGC---------AAA-------CA-T---T-----G---------------G-T---C--A---CGAATACAAT-AAATA--G---C--C-----GGCT-AT------G--A--GTTAGGCATAA---A--GCAAGGCT-
gi|36202                      :                                                                              ttgttT-------TGTTG-G-ATT------TGT--T--T---C--TG-CT-T-GC---T--T------A----T---A-----T----T--A---A-AAAT------A--CA---T------------G------A------A------AAAAAAAG---------G-----A--A--A----------T-----T-AGTGGA-ATA-----AAA-A-----GTACTGG-TAGT-CCCTG-TCA---G---G-T----A----TGATGATT-T-----TAGTGG---TGATCAACTCTGT---------AAA-------AC-T---T-----G---------------A-T---C--G---CAACGAC-TT-AAGTAGGG-----A---------T-AT------G--C--CTTAGTCATAA---A--ACCCGGCT-AAAAAaaa
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Reference ( family-243 )      :                                                                                                                 TTTTTTAT--AAA-A-ATG-ACA----T-A-------ATACA--AT-GTC---CA-C-A--A-TATA--T---T-T-------------T-T-TATTG-TTT-GATT----T-GT--T--T---C-TGCTT-GCN--T------A----T------A--------T-N-AA-A--T------A---CA---T------G-----A------A------A-----------------T-N----A-----A----------T-----T---CGAGGA-ATA-----AAA-A-----A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGCA----------------------AAGCT---T-G-----AT------------C--A---C--G-A------CGAC-AT-AAGCAGGG-CAGGGCT---A-TGCC-------------T-TTG---------G-CA-TAA---A--GCCCGGCT-NA-AAA
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gi|36202                      :                                                                                                                                                                                    --T---T-T-------------G-T-T-TTG-TTG-GATT----T-GT--T--T---C-TGCTT-GCT--T------A----T------A--------T-T-AA-AAAT------A---CA---T------G-----A------A------AAAAAAAG----------G-A----A-----A----------T-----T---AGTGGA-ATA-----AAA-A-----GTACTGG-TAGT-CCCTG-TCA---G---G-T----A----TGATGATT-T-----TAGTGG---TGATCAACTCTGTA----------------------AAACT---T-G-----AT------------C--G---C--A-A------CGAC-TT-AAGTAGGG--A----T---A-TGCC-------------T-TAG---------T-CA-TAA---A--ACCCGGCT-AA-AAA
gi|36203                      :                                                                                                                                                                                       ---T-T-------------T-T-TATTG-TTT------------------------TG-TT-GCA--T------T----T------A--------T-A-AA-A--T------A---CA---T------G-----A------A------A--------------------------------------------------------------------A-A-----A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGGTCATT-T-----TGGCGG---TGATAAAGACTGCA----------------------AAGCT---T-G-----AT------------C--A---T--G-A------CGTC-AT-AA
gi|36204                      :                                                                                                                                                                                    --T---T-T-------------T-T-CATTG-CTT-GATT----T-GA-----------------ACGA-T------A----A------A--------T-A-AA-A--T------A---CA---TTT----G-----A------A------A-----------------T-G----A-----AA---------T-----T---TGAGGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----GGATCATT-T-----TGGCGG---TGATAAAGAATACA----------------------ATCCT---G-G-----AT------------C--A---C--G-C------CGGC-AT-AAGCAGGGATA----T---A-TGCC-------------T-TTG---------A-CT-TAC---A--ACTCAGCC-GA-AAA
gi|36205                      :                                                                                                                                                                                      t---T-T-------------T-T-TATTG-TTT-GATT----T-AT--T--T---C-T-----------------------------A--------T-T-AA-A--T------A---CA---T------G-----A------A------A--------------------------------------------------------A-ATG-----AAATA-----A-----G-TAGT-CCCTG-TCA---C---G-T----A----TAATCATT-T-----TGGTGG---TGATCAATTCTGCA----------------------AAGCTAAAT-G-----AT------------G--A---C--G-A------TGGC-AA-AAACAGGG-CGG---------TGCC-------------T-TTG---------G-CA-TAA---A--GCC
gi|36206                      :                                                                                                                                                                                           -T-------------T-T-TAATG-TTT-GATT----T-GT--T---------------CA--A------A----T------A--------C-A-AT-T--T------A---AA---A------G-----A------A------A------------------------A-----A----------TAGTC-T---CAATGA-ATA-----AAA-------A-----G-TAGT-CCTTA-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----AAACGG---TGGTCAAGATTGCA----------------------AACAT---T-G-----GT------------C--A---C--G-A------ATACAAT-AAATA--G-C-CGGCT---A-TGAG-------------T-TAG---------G-CA-TAA---A--GCAAGGCT-AA-A
gi|36207                      :                                                                                                                                                                                          ttg-------------T-T-TATTG-TTT-GATA----T-GT--T--------------ACA--T------A----T------A--------T-G-AA-A--T------A---CAAG-T------A-----A------A------A-----------------T-G----A-----A----------A---------CTAGAC-ATA-----AAG-A-------------TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGTTTATT-T-----TGGCGG---TTATCAGGACTTCA----------------------ATGCT---T-G-----AT------------C--A---C--G-C------TGAC-AT------GAA-CAGGGTT---A-TATC-------------T-TTG---------G-CA-TAA---A--GTCTAGTT-AA-A
gi|36208                      :                                                                                                                                                                                                                                                        --T------A----T------T--------T-A-AG-A--T------A---CA---A------G-----A------C------A-------------------A----A-----A----------T-----T---CGATGG-CTG-----AAA-A-----------G-TAGT-CCCTG-TCG---T---G-T----A----TGCTAATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGCA----------------------AAGCT---T-A-----AA------------C--A---C--G-A------CGAC-AT-GAG
gi|36209                      :                                                                                                                                                                                                                                           tttatttatacaaaaatttttaa----T------A--------T-A-AA-A--T------A---AA---T------A-----A------A------AAA---------------T-G----A-----AA---------T-----T---CGAGGA-ATA-----AAA-------------G-TTGT-CCCTG-TCG---C---A-T----A----TGATCATT-T-----TTGCGG---TGATCAACACTGCA----------------------AATCA---T-T-----AT------------G--A---C--G-A------CGAC-A-----------------T---A-TGTC-------------T-TTG---------G-CA-TTA---G--GCTTGGAT-AA-AA
gi|36210                      :                                                                                                                                                                                                                                           ttaatcgTT-GTA--T------A----T------T--------T-A-AG-A--TG-----A---AA---C------G-----A------A------A-----------------T-AGA--A-----A----------T-----T---CAAAGA-ATA-----AAA-A-----------G-TAGT-TCCTG-TCG---T---GGT----A-----GATCGTT-TG----TGGCGA---TAATTAACACTGTA----------------------AAGCT---T-A-----CT------------C--A---C--G-A------CGAC-AT-A
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gi|36213                      :                                                                                                                                                                                                                     ttatataacaataaaaaaagaatgaaattttactt--T------G----T------A--------T-A-CA-A--T------A---AA---T------G-----A------A------AA----------------C-A----A-----A----------TGAAAAT---CGAAGA-ACA-----GAA-A-----------G-TAGT-TCCAG-TCG---C---G-T----A----TGATTATT-A-----TGATGG---CGGCCAATAGTGCA----------------------AAGCT---T-G-----AT------------C--A---C--G-C------CGAC-AC-AAG-------ATGGAT---C-TACC-------------T-TTG---------G-CA-TCA---T--ACCCGACT-AA-A
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gi|36116                      :                                                                                                               atTTTTTTA-------A-ACG-ACA----T-T-------ATGCA--TT-ACC---TT-C-A--ATATG--T---T-T-------------T-T--GCTG-TAT-GCTG----T-GT--T--G---C-TGCTT-AC-A--T------A----C------T--------T-A-A-A-A--C------A---AA---A------G-----A------A------A-----------------A--A-----------A-AAAGAAGAAAAC----T-----CGAGTA-ATA-----CAA-A-----------G-TAGT-CCCTA-TCG---C---G-T----A----TATTTATT-T-----TGGCGG---TGATCAAAACTACA----------------------AAGCT---T-G-----AT------------C--A---C--G-AC------GAC-AT-AAG--G----ATGGCT---A-AGTC-------------T-TTG---------G-CAGTA---A--GCCCGGC
gi|36117                      :                                                                                                                aTTGTTT-T--AAA-A-ATG-ACA----T-A-------GTACA--AT-GTC---CA-C-A--ATGTA--T---T-T-------------T---TATTG-TTT-GATT----T-GT--T--T---C-TTTTT-GC-A--T------A----T------A--------T-A-G-T-A--T------A---CA---T------A-----A------A------A-----------------T--T-----------A-T----------A----T-----CGAGCA-ATA-----AAA-A-----A-----G-TAGT-CCCTA-TCG---C---G-T----A----TGTTCATT-T-----TGGTGG---TAATTTACCCTGCA----------------------AAGAT---T-G-----AT------------A--A---C--G-GC------GAC-AT-TAGCATGG-C
gi|36118                      :                                                                                                                 aTTTTTAA--AAA-A-ATA-ACA----T-G-------ATACA--ATTGTC---AA-C-A--ATATG--T---T-T-------------T----ATTG-TTT-GATT----T-TT--T--T---C-TGCTG-TA-T--T------A----T------A--------T-T-A-A-A--T------A---AA---TTAAAA-A-----A------A------A-----------------A--G-----------A-AAC--------T----TGTG--CGCGGA-A---------A-A-----A-----G-TAGT-CCTTG-TCG---C---G-T----A----AGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGCA----------------------AAGCT---C-A-----A-----------------------------------------------G-CAGTGCT---A-TGCT-------------A-TTT---------G-CATTA---A--ACCAGCTTA-A-AAActtggctt
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gi|36120                      :                                                                                                                 acTTTTAT--AAA-A--TA-AAA----A-A-------ATACG--TT-GTC---CA-C-A--ATTTA--T---A-T-------------T-T-T---G-TTT-CATT----T-GT--T--T---C-TGCTT-GC-T--T------A----C------G--------T-A-A-A-G--T------A---CG---T------A-----A------C------A-----------------A--A-----------A-A----------T----------CGAGGC-ATA-----AAA-------------G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGATAAGT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGCA----------------------AAGCG---T-G-----TA------------C--A---C--T-TC------GCC-AT-AA-----A-CAGAGCT---A---------------------TG---------G-CATAA---A--ACCCGACTA-A-TAA
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gi|36121                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aCCGCA----------------------AAGCT---T-G-----AT------------C--A---C--A-GC------GAT-AT-AAGCA-------GGCT---A-TGCC-------------T-TTG---------G-CATCA---A--GCCCATCTA-A-cagcgatataagcaggctatgcctttggcatcaagcccatctaa
gi|36123                      : atttttttaaaaaaatatacacaatatatttttattgtctgatttgtttcacgcttgcatatataaaatacgtgaaaaaaaatgaaattcagggaataaaaagtagtccctgTTTTTT-T--AAA-A-A-G-GCA----T-A-------ATACA--AT-GTC---CA-C-A--ATATA--C---T-T-------------T-T--ATTG-TTT-G----------T--T--T---C-TGCTT-GC-A--T------A----T------A--------C-A-A-A-A--T------A---CA---T------G-----A------ACAAA--A-----------------T--G-----------A-AA---------T----T-----CGAGGA-ATA-----AAA-A-----------G-AAGT-CCCAG-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACTCTGCA----------------------AACCA---T-G-----AT------------C--A---C--G-AC------AAC-AT-AA-----G-CAGGGCT---A-TGCC-------------T-TTG---------G-CATTA---A--GACCGAGTA-A-
gi|36124                      :                                                                                                                 TTTTTTAT--AAA-A-ATG-GCG----T-A-------ATATA--AT-GTC---CA-C-A--ATATA--T---A-TA------------TAT-TATTG-TTT-GATT----T-GT--T--T---C-TGCTT-GC-T--T------A----T------A--------T-T-A-A-A--T------A---CA---T------G-----A------A------A-----------------T--T-----------A-A----------T----T-----CGAGGA-ATA-----AAA-A-----A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACCGCA----------------------AAACT---T-T-----AT------------C--A---C--G-AC------GAC-AT-AAGCAGGG-CAGGGCT---A-TACC-------------T-TTG---------G-TATAA---A--GTCCGGCTT-A-GAA
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Reference ( family-243 )      :                                                                                                                 TTTTTTAT--AAA-A-ATG-ACA----T-A-------ATACA--AT-GTC---CA-C-A--ATATA--T---T-T-------------T-T-TATTG-TTT-GATT----T-GT--T--T---C-TGCTT-GC-N--T------A----T------A--------T-N-A-A-A--T------A---CA---T------G-----A------A------A-----------------T--G-----------A-A----------T----T-----CGAGGA-ATA-----AAA-A-----A-----G-TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGCA----------------------AAGCT---T-G-----AT------------C--A---C--G-AC------GAC-AT-AAGCAGGG-CAGGGCT---A-TGCC-------------T-TTG---------G-CATAA---A--GCCCGGCTA-A-AAA
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gi|36207                      :                                                                                                                                                                                         ttg-------------T-T-TATTG-TTT-GATA----T-GT--T--------------AC-A--T------A----T------A--------T-G-A-A-A--T------A---CAAG-T------A-----A------A------A-----------------T--G-----------A-A----------A----------CTAGAC-ATA-----AAG-A-------------TAGT-CCCTG-TCG---C---G-T----A----TGTTTATT-T-----TGGCGG---TTATCAGGACTTCA----------------------ATGCT---T-G-----AT------------C--A---C--G-CT------GAC-AT------GAA-CAGGGTT---A-TATC-------------T-TTG---------G-CATAA---A--GTCTAGTTA-A-A
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gi|36209                      :                                                                                                                                                                                                                                           tttatttatacaaaaatttttaa----T------A--------T-A-A-A-A--T------A---AA---T------A-----A------A------AAA---------------T--G-----------A-AA---------T----T-----CGAGGA-ATA-----AAA-------------G-TTGT-CCCTG-TCG---C---A-T----A----TGATCATT-T-----TTGCGG---TGATCAACACTGCA----------------------AATCA---T-T-----AT------------G--A---C--G-AC------GAC-A-----------------T---A-TGTC-------------T-TTG---------G-CATTA---G--GCTTGGATA-A-AA
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blockSeqs                     :                                                                                                                       A                .      .                   .               .  .   . .               T                         T               T    .      .    .      .        T          .      .    .   .      AACAAAATGAAA                                                      .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              CAGCAGG       .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               T                         A               T    .      .    .      .        C          .      .    .   .      AAAAAAATGAAA                                                      .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              GCAGGGC       .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               T                         T               G    .      .    .      .        A          .      .    .   .      GGTGAAAATAAA                                                      .    .             A        AC                                                        .                           .                                .      .                         .              CAGCAGG       .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       C                .      .                   .               .  .   . .               T                         T               A    .      .    .      .        T          .      .    .   .      GAAAAAATGGAA                                                      .    .             G        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              GCAGGGA       .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                       A                .      .                   .               .  .   . .               T                         T               A    .      .    .      .        T          .      .    .   .      AAACAATTGAAA                                                      .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              CCAGATG       .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               T                         T               A    .      .    .      .        A          .      .    .   .      AACAATATGAAA                                                      .    .             A        AG                                                        .                           .                                .      .                         .              CAGCAAG       .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               C                         T               A    .      .    .      .        C          .      .    .   .      AAACAAAATATA                                                      .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              GCAGGGA       .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               C                         T               T    .      .    .      .        T          .      .    .   .      AAAACAAATGAA                                                      .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              GCAGGGA       .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               T                         T               T    .      .    .      .        T          .      .    .   .      GAAAAATGAAA                                                       .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              GTAGGGA       .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       A                .      .                   .               .  .   . .               C                         T               T    .      .    .      .        T          .      .    .   .      ACAAATTGAAA                                                       .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              ATAGCCG       .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               T                         T               T    .      .    .      .        A          .      .    .   .      AAACAAATAAA                                                       .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              GAACAGG       .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               T                         T               T    .      .    .      .        T          .      .    .   .      ACAAAATGAAA                                                       .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              GCCAGG        .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                       C                .      .                   .               .  .   . .               C                         T               T    .      .    .      .        A          .      .    .   .      ACAAAATGCTA                                                       .    .             A        AA                                                        .                           .                                .      .                         .              AAAGGC        .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               .                         T               G    .      .    .      .        T          .      .    .   .      ACAAAAAATAA                                                       .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GGCAGA        .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               .                         T               A    .      .    .      .        T          .      .    .   .      AACAAATGAAA                                                       .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              CCAGG         .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               .                         G               T    .      .    .      .        T          .      .    .   .      AAAAAATGAAA                                                       .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              ATAGT         .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               .                         G               T    .      .    .      .        T          .      .    .   .      AAAAAATGACA                                                       .    .             T        A                                                         .                           .                                .      .                         .              ACAGA         .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       A                .      .                   .               .  .   . .               .                         T               A    .      .    .      .        A          .      .    .   .      AAAAAATGAAA                                                       .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GGATG         .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               .                         T               T    .      .    .      .        C          .      .    .   .      ACAAAATGAAA                                                       .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GCAGT         .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               .                         T               T    .      .    .      .        G          .      .    .   .      AACAAATGAAA                                                       .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              ACAGA         .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                       A                .      .                   .               .  .   . .               .                         T               A    .      .    .      .        T          .      .    .   .      ACAAAAGAAA                                                        .    .             G        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GCAGA         .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       T                .      .                   .               .  .   . .               .                         T               G    .      .    .      .        A          .      .    .   .      AAAAAATGAA                                                        .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GAAGG         .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                       A                .      .                   .               .  .   . .               .                         G               A    .      .    .      .        T          .      .    .   .      AAATGAAAAA                                                        .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GCAGG         .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                        .      .                   .               .  .   . .               .                         T               T    .      .    .      .        G          .      .    .   .      AAACATTAA                                                         .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              ACATA         .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                        .      .                   .               .  .   . .               .                         T               A    .      .    .      .        C          .      .    .   .      AAAAGAAA                                                          .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GCAGG         .        .                 .               .              .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                        .      .                   .               .  .   . .               .                         .               A    .      .    .      .        G          .      .    .   .      AAATGAA                                                           .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GCAGG         .        .                 .               .              .
blockSeqs                     :                                                                                                                                        .      .                   .               .  .   . .               .                         .               T    .      .    .      .        A          .      .    .   .      AAAGAAA                                                           .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              TCAAG         .        .                 .               .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                               .                   .               .  .   . .               .                         .               T    .      .    .      .        T          .      .    .   .      AAACAAA                                                           .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GCAGG         .        .                 .               .               
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                   .               .  .   . .               .                         .               A    .      .    .      .        A          .      .    .   .      AATGACA                                                           .    .             A        A                                                         .                           .                                .      .                         .              GCAGA         .        .                 .               .               
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                          . .               .                         .               .    .      .    .      .        A          .      .    .   .      AAAAA                                                             .    .             .        A                                                         .                           .                                .      .                         .                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                            .               .                         .               .    .      .    .      .        A          .      .    .   .      AAATA                                                             .    .             .        A                                                         .                           .                                .      .                         .                                                                                       
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Reference ( family-243 )      :                                                                                                                 TTTTTTAT--AAA-A-ATG-ACA----T-A-------ATACA--AT-GTC---CA-C-A--ATATA--T-T-T-------------T-T---TATTGTTT-G-ATT----T-GTT--T---C-TGCTT-GC-N--T------A----T------A--------TN-A-A-A--T------A---CA---T------G-----A------A------A-----------------T--G-----------A-A----------T----T-----CGAGGA-ATA-----AAA-A-----A-----G-TA-GTCCCTG-TCG---C---G-TA----TGATCATT-T-----TGGCGG---TGATCAACACTGCA----------------------AAGCT---T-G-----AT------------C--A---CG-AC------GAC-AT-AA-----GC-A---G--GG----C--T---A-TGCC-------------T-TTG---------G--CATAA---A--GCCCGGCTA-A-AAA
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