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Reference ( family-237 )      : ACACAT--C----GTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-TGT
gi|96884                      : ACACAT--C----GTCT-GATTAT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTTCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-TGT
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gi|97016                      :          ----GTCT-GATTAT--GTTGAAA------A-----T-----TCAGGTGCC--ATG-T-TA-TTAC-AAAATC-TGT
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Alignments
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Reference ( family-237 )      : ACACAT--C----GTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-TGT
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gi|96885                      : ACACAT--T----GTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----AT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-T
gi|96886                      : ACAAAT--C----GTCT-AATTAT--G-TGAAT------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTA-AAAATCGTGT
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gi|96893                      : ACACAT--C----GTAT-GATAAA--GATGAGC------A-----T-----TT--GTGCC--ATT-T-TA-TTTC-AAAATC-TGT
gi|96895                      : ACACAT--T----GTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TA--GTGCA--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-TGT
gi|96896                      : ACACAT--C----TTCT-GATAAT--GGTGAAC------A-----TAAATTTT--GTGCC--ATG-T-CA-TTTT-AAAATC-TGT
gi|96897                      : ACATAC--C----TTCT-AATTAT--GGTGAAT------AA----TA----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTC-AATATC-T
gi|96898                      : ACACAT--C----GTCTTGATTAT--GGCGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-A-TA-TTTC-AAAGTC-TGT
gi|96899                      : ACATGT--C----GTCT-GATTAT--GGTTAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTT-AAAATA-TG
gi|96900                      : ACACAT--C-----TCT-TATTAT--AGTGAAC------A-----T-----TT--ATGCC--ATG-T-T--TTTT-AAAATG-TGT
gi|96901                      : ACACAT--C----ATCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--TTGCC--TTG-T-TA-TTTT-AAAATC-TGT
gi|96902                      : ACACAT--A----GTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----TA----TT--GT--C--ATG-T-TA-TTTT-AAAATC-T
gi|96903                      : ACACAT--T----GTTT-GAGCAA--GGTGAAC------A-----T-----TG--CTGCC--ATG-T-AA-TTTC-AAAATC-
gi|96905                      : ACACAT--C----ATCT-AATTAT--GGTGAAC------A-----------TT--GTGCC--ATG-T-AA-TTTC-AAAATC-TGT
gi|96906                      : ACACAT--C----ATTT-GATCAT--GGTAAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-CA-TTTT-AAAATC-TG
gi|96908                      : ACACAT--A----GTTT-CATTAT--GGTAAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-
gi|96909                      : ACACAT--C----ATCT-GATTAT--GTTGAAC------A-----T-----AT--GTGCC--ATG-T-TA-TTAC-AAAATC-T
gi|96910                      : ACACAT--C----ATCT-TATTAT--GGTGAGC------A-----T-----TC--GTGCC--ATA-T-TA-TTTC-AAAATA-TGT
gi|96911                      : ACACAT--T----GTCT-GATCAT--GGTGAAC------T-----T-----TT--GTGAC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATA-TG
gi|96912                      : ACATAT--C----GCCA-GATCAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--ATGAC--ATG-T-CA-TTTC-AAA
gi|96913                      : ACACAT--C----ATCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----A-----CT--GTGCC--ATG-T-TA-TTAT-AAAATC-T
gi|96914                      : ACATTT--T----GTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--ATGCC--ATG-T-TA-CTTT-AAAATT-T
gi|96915                      : ACACAT--T----GTTT-GATTAT--GATGGAT------A-----T-----TT--GCGCC--ATG-T-TA-TTTC-AAATTC-TGT
gi|96916                      : ACACAT--C----TCCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATA-C-TA-TTAC-AACATC-TGT
gi|96917                      : ACACAT--T----GTCT-AATTATATGGT--AC------A-----T-----TT--A-ACC--ATG-T-TA-TTTT-AAAATC-TGT
gi|96918                      : ACACTT--C----GTTT-CATTAC--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TCTC-AAAATC-
gi|96919                      : ACATTT--T----GTCT-GATTAT--GGTAAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ACA-T-TA-TTTC-AAAATC-T
gi|96920                      : ACACAT--CTATAGTCT-GATAAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCCATATA-T-TG-TTTC-AAAATC-TGT
gi|96921                      : ACACAT--T-------T-GATTAT--GGTCAGC------A-----A-----TT--GTTCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-T
gi|96922                      : ACACAT--C----GTTT-GAGTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTCCC--ATG-C-TA-TTTT-AAAATG-TG
gi|96923                      : ACATCT--C----GTCT-CGTTAT--ATTGAAC------A-----T-----TT--TTGCT--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-
gi|96925                      : ACACAT--T-------T-GAATAT--AGTGAAC------A-----A-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTT-AAAATC-TG
gi|96926                      : ACACAT--C----ATCT-GATTAT--AGTGAATATTAAAA-----T-----TT--ATGTA--ATG-T-TA-TTTG-AAAATC-T
gi|96927                      : ACACTT--T----ATCT-CACTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TG-TTTC-AAAATC-
gi|96928                      : ACACAT--C----ATCT-GATTAT--GGTCAACATTA--A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTG-AAAATT-T
gi|96929                      : ACACAT--T----GTCC-GATTAT--GA-GAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATA-A-TA-TTTC-AAAAT
gi|96931                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCAT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTA-AAAATC-
gi|96932                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCCT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTT--AAAAT
gi|96933                      : ACACAT--C----GTCT-AATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TC--GTGCC--ATA-A-AC-TTTG-AAAATC-TGT
gi|96934                      : ACACAT--C----CTTT-GATTAT--GGTAAAC------A-----A-----AT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTC-AAATTT-TGT
gi|96935                      : ACACAG--C----ATCT-GACTAT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGAC--ATG-T-TATTTTT-AAAATC-T
gi|96936                      : ACATAT--T----TTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGAC--AAG-T-TC-TTTC-AAAATC-
gi|96937                      : ACACAT--A----GTTC-GATTAA--ACTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTA-AAAATC-T
gi|96938                      : ACACAT--C----GTCT-TATCCT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTT--AAAAT
gi|96939                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCAT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTA-AAAAT
gi|96940                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCAT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTA-AAAAT
gi|96941                      : ACACAT--T----GTCT-TGTCAT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTA-AAAAT
gi|96942                      : ACACAT--T----GTCT-TGTCAT--GGTGATC------A-----T-----TT--GTGCC--AAA-T-TA-TTTC-AAAATC-
gi|96943                      : ACATGT--C----GTCT-CATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCT--AAC-T-TA-TTTC-ACTATC-TGT
gi|96944                      : ACATGT--C----ATCT-CATTAT--GATAAAC------A-----T-----TT--ATGCC--AAG-T-TA-TTTC-AAAATC-
gi|96945                      : ACATAT--C----ATCT-GATTAT--GGTAAAC------A-----T-----TA--GTACC--ATG-T-TA-CATC-ATACTC-TGT
gi|96946                      : ACACAT--C----GTCT-TATAAT--TGTGAAC------A-----T-----TT--GTGTC--ATA-T-CA-TTTA-AAAATA-TGT
gi|96947                      : ACATGT--C----GTCT-GATTAT--AGTGAAC------A-----TTTAA-TT--GTGCA--ATT-T-TA-TTTG-AAAATT-TGT
gi|96948                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCCT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTT-AAATTC-
gi|96949                      : ACATAT--C----TTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--ATGGC--ATG-T-TA----C-AAGAT
gi|96950                      : ACACAT--C----ATCT-TGTCAT--AGCGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTA-AAAAT
gi|96951                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCCT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTA-AAATTC-T
gi|96952                      : ACACAT--C----GTCC-TGTCAT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--GAG-T-TA-TTTT-AAA
gi|96953                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCCT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTT--AAAAT
gi|96955                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCCT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTT--AAAAT
gi|96958                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCCT--AGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTT--AAAAT
gi|96959                      : ACACAT--C----GTCT-TGTCCT--AGTGAAT------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTA-AAAAT
gi|96977                      :  CACAT--T----GTCT-GCTTAT--AATGAAC------A-----T-----TT--GTGCA--AAG-T-TA-ATTC-ATAATC-TGT
gi|96978                      :  CACAT--C----ATCT-GATTAT--GGTGAAT------A-----T-----TT--ATGCC--ATG-T-CA-TTTC-AAAATC-TGT
gi|96979                      :  CACAC--T----GTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----C-----TT--GTGCC--ATG-T-TT-TTTC-AAAATC-TGT
gi|96980                      :  CACAT--T----GCCT-AATCAT--GATGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-TTTG-AAAATA-TG
gi|96981                      :  CACAT--C----GTCT-GATCAT--GGTGAAC------A-----T-----GT--GTACC--ATG-T-TA-CATA-AAAATA-TGT
gi|96982                      :  CACAT--C----ATCT-GATCAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGTC--ATG-T-AA-TATC-AAAATG-TGT
gi|96983                      :  CACAT--C----ATCT-GATTAT--GGTGAAC------CTTTTTT-----TT--TTGTC--ATG-T-TA-TTTC-AAAAT
gi|96984                      :  CATGT--C----ATCT-GACTAT--GGAGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATT-A-TA-TTTC-AAAAAC-TGT
gi|96988                      :   ACAT--C----GCCT-CATTGT--GGTGA-T------A-----T-----TT--GTGTC--AAG-T-TA-TTTC-AAAGTC-TG
gi|96991                      :   ACAT--C----ATTT-GATTAG--GGTTAGC------A-----T-----TT--GTACA--ATG-T-AA-TTTC-AAAATC-TGT
gi|96992                      :   ACATG-C----GTCT-AATTAT--GGTGAAT------A-----T-----TT--ATGCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATT-TGT
gi|96993                      :   ACAT--C----ATCT-TATTAT--GGTGAAC------A-----T-----CT--ATGCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAAT
gi|96996                      :   ATAT--T----GTCT-AATTAT--GGTAAAC------A-----T-----TT--GTACT--ATT-T-TA-TTTT-AAAATC-TGT
gi|96997                      :   ACATGGC----GTCT-CATTAG--GGTGAAT------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTC-AAAATC-
gi|96998                      :   ACAT-------GTTT-GGTTAT--GGTTAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAT-T-TA-TTTC-AAAATA-TGT
gi|96999                      :   ACAT--G----ATAT-GATTAT--GGGGAGC------A-----T-----TT--ATTCC--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-TGT
gi|97000                      :   ACAT--T----GTTT-CACTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGAC--ATG-T-TG-TTTC-AAAAT
gi|97001                      :   ACAT--C----ATCT-GTCTCT--GGTAGAC------A-----T-----TT--TTGAC--ATG-T-TA-TTTC-AAAACC-TGT
gi|97002                      :   ACAT--C----TTAT-TATTAT--GATGAAC------A-----T-----TT--GTTCC--ATA-T-TA-TTT--AAAATC-TGT
gi|97003                      :   ACAT-------GTCT-CATTAT--GTTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTCGAAAATC-
gi|97004                      :   ACGT--T----GCCT-CATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GCGAC--AAT-T-TA-TTTC-AAAATC-TG
gi|97005                      :   ACAT--T----TTCT-GGTTAT--TGTGAAT------A-----T-----TG--GTGCC--AGA-T-TG-TTTC-AAAATC-TGT
gi|97006                      :   ACAC--T----GTCT-CATTAT--GGTGAAT------A-----T-----TT--A-GGC--ATG-T-TA-TTTC-AAATTC-TG
gi|97008                      :    CAT--C----ATCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GCGGC--ATG-C-TT-TTTC-AAAATC-TGT
gi|97009                      :    CAT--C----ATCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GCAGC--ATG-C-TT-TTTC-AAAATC-TGT
gi|97011                      :      T--T----GTCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATG-T-TA-CTTT-AAGA
gi|97012                      :      T--C----ATCC-TATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--AAG-T-TA-TTTT-AAAAT
gi|97013                      :      T--C----ATCT-TATTCT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCC--ATGTT-TT-TTTC-AAAATC-TGT
gi|97016                      :          ----GTCT-GATTAT--GTTGAAA------A-----T-----TCAGGTGCC--ATG-T-TA-TTAC-AAAATC-TGT
gi|97018                      :               TTT-AATTAA--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGAC--ATA-T-TA-TTTC-AAAATC-TGT
gi|97019                      :               TCT-GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--ATGCC--ATA-TAAA-TTTT-AAAGTC-TGT
gi|97021                      :                  -GATTAT--GGTGAAC------A-----T-----TT--GTGCA--ATG-T-TA-TTTC-AAAATC-TAT


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blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  A               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  A               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           G 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           G 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           G 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  A               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           G 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           G 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           A 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  A               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  A               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  A               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           T 
blockSeqs                     :                  C               .      .     .                           C 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           . 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           . 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           . 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           . 
blockSeqs                     :                  T               .      .     .                           . 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           . 
blockSeqs                     :                  A               .      .     .                           . 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           . 
blockSeqs                     :                  G               .      .     .                           . 


blockSeqCons                  : 
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