lowQualScore : 11111
lowQualScore : 0 0 66 11111 00 33 0 00 11111 33 11 11 0 5 1 0 0 000 0 0 0 00 0 0000 0 11111 0 0000 44 0 0
lowQualScore : . . .. ..... .. .. . .. ..... .. .. .. . . . . . ... . . . .. . .... . ..... . .... .. . .
lowQualScore : 5 5 11 00000 66 99 4 66 99999 11 44 44 4 9 2 4 4 777 8 4 4 66 4 9999 4 00000 4 9999 55 4 4
consensus : ATGAGTTC-AA-GT-AAT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--T--T-TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
Reference ( gi|52745 ) : ATGAGTTC-AA-GC-AAT-TG--T--TTAGAA-A-AAT--T-----GAG-A--T--T-TCT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-AT-TTAG-TGAAA
gi|52751 : ATGAGTTC-AA-GC-AAT-TG--C--TTGGAG-A-GAT--T-----GAG-A--A--T-TCT-G-AG-TT---G-AAG-AA-AA--T-C----TCGG-C-----TTAAG-A----T-GT-TTAG-AGAAA
gi|52754 : ATGAGTTC-AA-GT-GAT-TG--T--TTAGAA-A-AAT--T-----GAA-A--A--T-TTT-G-AT-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TTAG-C-----TGGAG-A----T-GT-TTGG-TGAAA
gi|52746 : ATGAGTTC-AA-GC-AAT-GA--T--TTTGAG-A-TAT--T-----GAA-A--T--T-TTG-G-AA-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52747 : ATGAGTTC-AA-GC-AAT-CA--T--TAAGAG-A-AAT--T-----AA--A--T--G-TTG-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52752 : ATGGTTTT-AA-GT-TAT-CA--T--TTAGAA-A-AAT--T-----GAA-A--T--T-TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TTAA
gi|52761 : ATGAGTTC-AA-GT-AAC-CG--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--T--T-ATT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AC--T-G----TCAG-C-----TTGAG-A----A-GT-TGAG-TGAAA
gi|52756 : ATGAATTC-TA-GT-AAT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--T--T-TTT-TTAG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-T-----TTGAG-A----T-GT-TAAG-TGAAA
gi|52750 : ATGAGTTT-AA-GT-AAT-CA--T--TAAGAG-A-AAT--T-----GAA-T--T--T-TTT-G-AG-TT---T-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-G-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52749 : ATGAGTAC-AA-GC-AAT-CA--T--TTAGAG-A-TAT--T-----GAG-A--A--T-TTC-G-AG-TT---G-AGG-AA-TA--C-C----TCAA-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52755 : ATAAGTTT-GG-GG-AAT-TA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAC-A--T--T-TTT-G-AA-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-G-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52767 : ATGAGTTG-AA-AT-AGT-TG--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-TCT-G-AG-TT---G-AGC-AA-AA--T-C----TCAG-A-----TTGAG-A----T-GT-TTCG-TAAGA
gi|52753 : ATTAGTTC-GA-GT-AAT-GA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-T-T-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-T-----TTTAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52760 : ATGAATTC-AA-GT-TAT-CA--A--TTAGAG-A-AGT--T-----AAG-A--T--T-TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GG-TAAG-TGAAA
gi|52766 : ATGAGTTC-GA-GC-AAT-GG--T--TCAGAG-A-AAT--T-----GAC-AT-T--T-TTT-G-AA-TT---G-AGG-AA-AA--T-CTCAGTCAG-C-----TTGTG-A----T-GT-TTAG-CGAAA
gi|52758 : ATGAGTTC-AA-GT-ACT-CA--T--TTAAAG-A-AAT--TT----GAG-A--A--T-TTT-T-AG-AT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGGG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52763 : ATGTGTTG-AA-AA-AAT-CAA-T--TTAGAA-A-AAT--T-----GAA-A--T--T-TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GC-CTTG-TGAAA
gi|52764 : ATGAGTTC-AA-GT-AAT-TA--T--TCAGAG-A-AAG--T-----CAG-T--T--T-TCT-G-TC-TT---G-AGG-AA-AT--T-C----TGAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52748 : ATGAATTC-AA-GT-AAC-CA--T--TGAGAG-A-AAG--T-----GAA-A--T--T-TCG-G-AG-TT---T-AGG-TA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAA
gi|52765 : ATGAGATC-CA-GT-AAT-GA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAA-A--A--T-ATT-G-TG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAC-C-----TTGAG-A----T-AT-TTAG-TGAAA
gi|52775 : ACGAGTTT-AA-GT-TAT-CT--T--TT-GAA-A-AAC--T-----GAA-A--T--T-TTT-G-AG-TG---A-AGA-AA-AA--T-C----TCAG-T-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52762 : ATGAGTTT-GA-GT-AGT-GA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAA-A--A--T-TTT-G-AC-TT---G-AGG-AA-GA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTA--TGGAA
gi|52779 : ATGAGTTT-AA-GT-AAT-TA--T--TTGAAA-A-ATT--T-----GAA-A--T--T-TTT-A-AG-TT---G--GG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGA
gi|52772 : ATGAGATC-AA-GT-AAT-CA--T--TTAGAG-G-AAT--T-----GGG-A--C--T-TTT---AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TAAG-C-----TTGAA-A----A-GT-TTAT-TGAAA
gi|52774 : ACGAGTTT-AA-AT-AAT-TA--T--TTAAAA-A-CA---------GAA-A--T--A-TTT-G-AG-TT---C-AGG-AA-AA--T-C----TCGG-C-----TTGAA-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52757 : ATGAGTTC-AA-GTTAAT-AA--T--TTCGAG-G-AAT--T-----GAG-A--T--T-TTT-T-TA-TT---GGAGG-AA-AA--T-C----TGCG-C-----TTGAG-A----T-AT-TTAG-TGAAA
gi|52773 : ATGAGTTT-AAAGA-AAC-CA--T--TTAGAG-A-AAC--T-----GAG-A--T--T-TGT-G-AG-TT---T-AGG-AA-AA--T------TTAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TAAG-TGAAA
gi|52769 : ATGAGTTC-AA-GT-AAT-CA--T--TTAGAG-A-AAC--T-----GAA-A--T--T-TTT-A-AG-TT---T-AGG-AA-AA--C-G----ACAG-C-----TTGAA-A----T-GT-T
gi|52771 : ATGACTTT-GA-GT-AAT-GA--T--TTCGAG-A-AAT--T-----GAA-A--T--T-CTT-G-AG-TT---G-TGA-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTCAG-A----T-GT-TTTG-TGAA
gi|52768 : ATGAGTTC-AA-GT-AAA-GG--T--TAAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-TTA-G-AG-TT---G-AGG-AA-CA--T-T----TCAG-C-----TTCCG-A----T-G--TCAG-TGAAA
gi|52792 : ATGAGTTC-AA-AT-TAT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-TCT-T-AG-TT---G-AGG-AA-TG--T-C----T-AG-------TTGAT-A----C-AT-TTAG-TGAAA
gi|52780 : ATGAGTTC-AG-GT-AAT-AA--C--TTA----A-AAT--T-----GAT-A--T--T-TTT-G-AG-AT---C-AGG-AA-AA--T-A----TCAG-C-----TTGAG-A------GT-TTAG-TAAAA
gi|52777 : ATGAGATC-GA-CT-AAT-AA--T--TTAAAG-A-AAT--T-----GAC-A--T--T-GTT---AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----CCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TAAG-TGAGA
gi|52782 : ATCAGTTG-GA-GA-AAG-GA--T--TCATAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TTAG-C-----CTGAG-A----T-TG-TTAG-TGAAA
gi|52776 : ATGAGTTA-CA-GT-AGT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----AAATA--T--T-TTT---AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-A-----TTAAA-A----T-GT-TAAG-TGAAA
gi|52778 : ATGAGTTA-AA-GT-TAT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAA-A--T--T-TTT-T-CG-TT---G-AGG-AA-AG--T-T----TCAG-C-----TTAAG-T----T-GT-TT
gi|52781 : ATGAGTT---------AT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-T--T--T-TTT-A-AA-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-T----C-GA-TTAA-TGAAA
gi|52783 : ATGAGTTG-AG-GT-G-T-CA--T--TTAGAG-A-AAA--T-----GAG-AT-T--T-TTT-G-AG-TT---G-AGG--A-AA--T-C----TCAA-C-----TTGAG-A----T-GT-T
gi|52790 : ATGAGTTC-AA-GT-TTT-TA--T--AAAGAA-A-AAT--------GAA-A--T--A-TTT-T-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----
gi|52789 : ATGAGCAC-GA-GA-AAT-GA--T--TTATAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-TTT-A-AG-TT---A-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-C-----TTGAGTT----T-TT-TTGG-TGAAAagtt
gi|52788 : ATAAGGTC-AA-GT-TAT-CA--A--TTAGAG-A-AAT--C-----TAG-A--T--T-TCT-G-AA-TT---G-AGA-AA-AA--T-C----TCAG-T-----TTAAG-A----T-GA-TAAC-TGAAA
gi|52770 : ATAAGTT--AA-GT-AAT-GA--T--TTCGAG-A-AAT--T-----AA--A--T--T-TTT-T-AT-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TAAG-C-----TGGAG-A----T-GT-CTAG-TGAAA
gi|52791 : ATGAGTTC-AA-TT-AAT-CA--T--TTTGAG-T-AAT--------GAG-A--T--T-TTT-A-A--TT---G-AAG-AA-AA--C-C----TCAG-C-----TTTGG-A----T-GT-GTAG-TGAA
gi|52787 : ATGAGTTT-AA-AT-AAC-TA--C--TTAAAG-A-CAT--T-----GAG-AATT--TGTTT-T-AT-TT---G-AGA-GA-AC--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TCAG-TGAAA
gi|52797 : ATAAGTTT-TA-GC-A-T-TGATT--TTA-AA-A-AAT--T-----GAA-A--T--T-TTT-T-A--TT---G-AGG-AA-AT--T-C----TCAG-C-----TCAAG-A----T-GT-TAAG-TGAGA
gi|52786 : ATGAGTTT-AA-AT-AAT-CA--T--TTAAAG-A-AGT--T---------------T-TTT-G-AG-CT---G-GGG-AACAA--T-C----TCAG-C-----TAATG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52785 : ATGAGTTC-AA-GT-AGT-CA--T--TTGGA-------------------------------G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----ACAA-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAGA
gi|52794 : ATGAATGC-AA-GT-TAT-TA--A--TTAGAG-A-ATA--T-----AAG-A--T--T-ATT-G-AG-TT---------AA-AA--T-C----TCAG-C-----TAGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52759 : ATGAGTT---A-G-------A--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-TTT-G-AGATTCAAG-AAG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTTAG-A----T-GT-TTAG-CAAAA
gi|52795 : ATGGATTC-AG-GA-AAC-AA--T--TTGAAG-A-ATT--T-----GAA-A--A--G-TTT-G-AG-TT---T-AGG-AA-AA--T-C----TCAT-C-----TTGAG-A----T-AT-TTAG-CTAAA
gi|52784 : ACGAGTTCCAA-GT-AAT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GCT-A--T--A-ATT-G-AG-TT---G-AGG-TA-AA--T-C----TCAA-C-----TTGGA-A----G-CT-TT-G-TGAAA
gi|52806 : TAAGTTT-AA-AT-AAT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--T--C-TCT-G-AG-TT---A-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-A-----TTGAG-A----T-AT-TTGA-CGAAA
gi|52805 : TGAGTTC-AA-AC-GAT-CT--T--TTAGAG-A-AAC--T-----GTA-A--T--T-TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-A-----TTGAG-A----T-GT-TTTG-TGAAA
gi|52807 : TAAGTTC-AA-GT-AAT-CG--T--TTAGAG-A-ATT--A-----GAA-A--T--T-TTTTG-AG-TT---G-ATG-AA-AA--T-C----TCAA-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAT-TGAAA
gi|52809 : TGAGTTT-GA-GT-AAT-GG--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GGA-A--T--G-TTT-G-AA-TT---G-AGG-GA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TATG-TGAAA
gi|52808 : TGAGTTC-AA-GT-AAT-CA-------AGAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-TTT-G-AA-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAT-C-----TTGAG-T----T-GT-TTAA-TGAAA
gi|52812 : TAAGTTC-AA-AG-AGT-CA--T--TTAGAA-A-AGC--T-----GA--A--TG-T-TTT-T-AG-TT---C-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAA
gi|52810 : TAAGTTT-AA-GT-GAT-CA--G--TTAGAG-A-AG---------GGG-A--TCGT-TTT-G-AG-TT---G-AGG-GA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52813 : TAAGTTT-AA-GT-AGT-TA--T--ATAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--G--T-TTT-A-A--TT---G-AAG-AA-AA--T-A----TTAG-C-----TTGAA-A----T-GC-TTAG-TGAAA
gi|52815 : TGAGTCT-AA-GT-TAT-CA--T--TTAGAT-A-TGT--T-----AAG-A--A--T-TCT-G-AG-TT---A-AG--AA-AA--TGC----TCAG-T-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52811 : TGAGTTC-AA-GT-TAC-CA--T--ATAGAG-A-AAT--T-----AAG-A--T--A-TTG-G-AG-TT---G-AAG-CA-TA--T-T----TCAG-C-----TAGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52816 : TGTGTTC-AA-GT-TAT-CA--T--TTGGAG-A-AAT--T-----TAC-A--T--T-TTT-G-TG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TT
gi|52817 : TAAATTC-AA-GC-CAT-CA--T--TTAAAG-A-AAT--T-----GAC-G--T--T-TTT-T-AG-TT---ATGGG-AA-AA--T-T----TCAG-C-----TTGAG-A----T-
gi|52814 : TGAGTTC-AA-GT-AAT-CA--T--TTAGAG-ATAAT--T-----TA-----T--T-TTA-T-AC-TT---G-GAG-AA-AA--T-C----TCAG-T-----TTGAG-A----T-GT-
gi|52820 : GAGTTC-AA-AT-AAT-CG--T--TTAGAA-A-AAA--T-----GAA-A--T--T-TTT-G-AG-TT---G-AAG-AA-AA--T-C----TCAA-C-----TTGAA-G----T-GT-TTAA-TGAAA
gi|52823 : GAATTT-GA-GT-AAT-AG--A--TTAGAG-G-TAT--T-----GAG-A--C--A-TTT-G-AG-TT---G-AAG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAA-TGA
gi|52825 : GAGGTC-CA-GC-AAT-CA--T--TTAGAA-A-AAT--T-----GAG-A--T--G-TTT-A-AC-AT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-CTAATATTCAG-G----T-GT-TTAG-TAAA
gi|52821 : GAGTTC-AA-G--------------TAGAG-A-AAT--T-----TGA-A--T--T-TTA-G-AG-TT---A-AAG-AA-AA--T-C----TCAG-T-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52822 : GAGTTC-AA-GT-AAA-CA--T--TTAGAG-A-AAC--T-----GAG-A--T--T-TTA-G-TG-TT---G-AGC-TA-AA--T-C----TCAG-C-----TAGAG-AGAGGT-GT-TTAG-TGGAA
gi|52829 : AGTTC-AA-GT-AGT-CA--T--TTGGAG-A-AAT--T-----GAA-A--T--T-T-T-G-AT-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----ATGAG-A----T-GT-TTAG-TGA
gi|52830 : AATTC-AA-GT-TAT-CA--A--TTAAAG-A-AAT--T-----GAC-A--T--T-TTC-A-CG-TT---A-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAA-A----T-AT-TTAG-TGAAA
gi|52831 : AATTT-AA-GT-AAT-AA--T--ATAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--T--T-TTT-T-AA-TT---G-AGGAAA-AA--T-C----TGAT-C-----TTGAG-A----T-AT-TAAG-TGAAA
gi|52832 : AGTTC-AA----AAT-TA--TCATTAGAG-A-GAT--T-----GAG-A--T--T-ATT-T-AG-TT---G-AAC-AA-AA--T-T----TCAG-C-----TTAAG-T----T-GT-TTAG-TGGAA
gi|52834 : GTTC-GA-GT-AAT-GA--T--TTAAAG-A-AAT--T-----GAG-A--A--T-TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-T-----TTGAG-A----T-GT-TAAG-AGAAA
gi|52836 : GTTC-AA-AT-AAT-CG--T--TTAGAA-A-AAAAAT-----GAA-A--T--T-TTT---AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-T-----CTGGG-A----T-AT-GTAG-TGAAA
gi|52835 : GTTC-GA-GT-AAT-GA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----AAA-A--T--T-T-T-G-AG-TT---G-AAA-AA-AAAAT-C----CCAG-C-----TTCAG-A----T-AT-TTAG-TGAAA
gi|52838 : GTTT-GA-GT-A-C-TG--A--TTAAAAGA-AAT--T-----GAG-A--T--T-TTT-T-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TTAA-C-----TTGAG-A----TGAA-CTAG-TGAA
gi|52837 : GTTC-AA-GT-AAT-GA--T--TTAAAG-A-AAT--T-----GAT-A--A--T-TTT-T-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TTGGTT-----TTG--------T-ATGCTAG-TGAAA
gi|52841 : TTT-AA-GT-AAT-CA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAG-A--T--T-TTT-G-AA-GT---G-ATA-AA-AA--T-C----GCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTGG-TGAAA
gi|52842 : TTC-AA-GT-AAT-CA--A--TAAGAG-A-AAT--T-----GAA-A--T--T-TTC-T-AG-TT---A-AGG-GA-TA--T-C----TCAG-T-----TTGAG-A----T-AT-TTAG-TGAAA
gi|52869 : TTA-AA-GC-AAT-TC---------AA-A-AAT--T-------------------T-G-AG-CT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-G-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52846 : C-AA-GT-AAT-CA--T--TTGAAG-A-GTT--T-----GAT-A--T--T-TTTTG-AG-TT---C-AGG-AA-TA--T-C----TAAC-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52847 : -AA-GT-AAT-CA--T--TTAGAA-A-AAT--T-----GA--C--T--T-TATAG-AG-TT---G-AGG-GG-AA--T-C----CCAG-C-----TTGAG-G----G-GT-TTAG-TGAAA
gi|52848 : -AA-GT-AAT-CA--T--T-AGAT-A-A-T--T-----GA--A--T--T-TTT-T-AG-TT---G-AGG-GA-AA--T-C----TCAT-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52850 : A-GT-AAT-TC--T--TTAGAG-T-AAT--T-----AAA-A--T--T-TTT-G-AG-TT---A-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-C-----TTAAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52849 : A-GA-AAT-TA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----GAA-A--G--T-TCT-G-AG-TT---A-AGG-CA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-ATAA-TGAA
gi|52852 : A-GC-AAT-CA--T--GTAGAG-A-AAT--T-----GAT-T--T--T-TTT-G-AT-TT---G-AGG-CA-AA--T-C----TCAG-T-----CTGAT-A----T-GT-TTAG-
gi|52853 : C-AAT-T---T--TTAAAA-A-AAT--T-------------------T-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-G-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52855 : -AATATA--T--TTAGAG-G-AAT--T-----CAG-A--C--T-TTT-T-AA-TT---C-AAG-AA-AA--T-G----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52859 : AT-CA--T--TTAGAA-A-AAT--T-----GAA-A--A--T-TTT-G-AG-TT---G-TGG-AA-AA--T-C----TGAG-C-----TTGAG-A----T-G--TTAG-TGAAA
gi|52866 : -TA--T--TTAGAG-A-AAT--T-----AAG-A--A--T-TCT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TCGAG-A----T-AT-TTA
gi|52856 : --T--TTGAAA-A-AAT--T-----GAG-A--TG-T-TCC-T-AG-TT---G-AGG-AA-AT--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-AT-TTAGTTGAA
gi|52863 : aatcat--T--TTAGAA-A-ATT--T-----GAA-A--T--T-TTT-G-AG-TT---A-ATG-AA-CA--T-C----TCAA-C-----TTG-G-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52867 : tca--T--TTGGAG-A-AAT--T-----GAG-A--T--T-TCC-G-AG-AT---G-TAC-AA-AA--T-C----TCAG-C-----TTGAG-G----T-GT-TTAA-TGA
gi|52871 : aAGAG-A-AAT--TC----GAA-G--T--T-TTT---AG-TG---A-AGG-AA-AC--T-C----TCAG-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52844 : AA-A-AAT--TCTTCAGAA-A--T--T-T---G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-G-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52873 : tcaagtcaaataT--T-----CAA-A--T--A-TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-G-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52886 : --T--T-TTT-G-AG-TT---G-AAG-AA-AA--T-C----TCAA-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGAAA
gi|52882 : -TTT-G-AG-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-G-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-CGAAA
gi|52889 : aaa-G-AA-TT---G-AGG-AA-AA--T-C----TCAA-C-----TTGAG-A----T-GT-TTAG-TGA
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 00 0 0 00 0 22 11 11 0 0 0 0 0 000 11 0 0 0 0000 11111 0 0000 0 0
lowQualScore : . . . . .. . . .. . .. .. .. . . . . . ... .. . . . .... ..... . .... . .
lowQualScore : 5 5 5 4 66 9 4 66 8 22 44 44 4 4 4 4 4 777 33 4 4 4 8888 00000 4 9999 4 4
consensus : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
Reference ( family-220 ) : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52745 : ATGAGTTC-AA-GC-AATTG-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52746 : ATGAGTTC-AA-GC-AATGA-T--TTTGAGA-TA-T--T-GAA-A--T--T-TT-G-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52747 : ATGAGTTC-AA-GC-AATCA-T--TAAGAGA-AA-T--T-AA--A--T--G-TT-G-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52748 : ATGAATTC-AA-GT-AACCA-T--TGAGAGA-AA-G--T-GAA-A--T--T-TC-G-G-AG-TT---T--AGG-TA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAA
gi|52749 : ATGAGTAC-AA-GC-AATCA-T--TTAGAGA-TA-T--T-GAG-A--A--T-TT-C-G-AG-TT---G--AGG-AA-TAC-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52750 : ATGAGTTT-AA-GT-AATCA-T--TAAGAGA-AA-T--T-GAA-T--T--T-TT-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT-C----TCAGG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52751 : ATGAGTTC-AA-GC-AATTG-C--TTGGAGA-GA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCGGC-----TTAAG-A----TG-TTTAG-AGAAA
gi|52752 : ATGGTTTT-AA-GT-TATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TTAA
gi|52753 : ATTAGTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT---G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTTAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52754 : ATGAGTTC-AA-GT-GATTG-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAGC-----TGGAG-A----TG-TTTGG-TGAAA
gi|52755 : ATAAGTTT-GG-GG-AATTA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52756 : ATGAATTC-TA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-TTAG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52757 : ATGAGTTC-AA-GTTAATAA-T--TTCGAGG-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-TA-TT---GG-AGG-AA-AAT-C----TGCGC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52758 : ATGAGTTC-AA-GT-ACTCA-T--TTAAAGA-AA-T--TTGAG-A--A--T-TT-T-T-AG-AT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGGG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52759 : ATGAGTT---A-G------A-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AGATTCAAG--AAG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTTAG-A----TG-TTTAG-CAAAA
gi|52760 : ATGAATTC-AA-GT-TATCA-A--TTAGAGA-AG-T--T-AAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-GTAAG-TGAAA
gi|52761 : ATGAGTTC-AA-GT-AACCG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-AT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-ACT-G----TCAGC-----TTGAG-A----AG-TTGAG-TGAAA
gi|52762 : ATGAGTTT-GA-GT-AGTGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AC-TT---G--AGG-AA-GAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTA--TGGAA
gi|52763 : ATGTGTTG-AA-AA-AATCAAT--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-CCTTG-TGAAA
gi|52764 : ATGAGTTC-AA-GT-AATTA-T--TCAGAGA-AA-G--T-CAG-T--T--T-TC-T-G-TC-TT---G--AGG-AA-ATT-C----TGAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52765 : ATGAGATC-CA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--A--T-AT-T-G-TG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCACC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52766 : ATGAGTTC-GA-GC-AATGG-T--TCAGAGA-AA-T--T-GAC-AT-T--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-CTCAGTCAGC-----TTGTG-A----TG-TTTAG-CGAAA
gi|52767 : ATGAGTTG-AA-AT-AGTTG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGC-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TG-TTTCG-TAAGA
gi|52768 : ATGAGTTC-AA-GT-AAAGG-T--TAAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-A-G-AG-TT---G--AGG-AA-CAT-T----TCAGC-----TTCCG-A----TG--TCAG-TGAAA
gi|52769 : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAA-A--T--T-TT-T-A-AG-TT---T--AGG-AA-AAC-G----ACAGC-----TTGAA-A----TG-TT
gi|52770 : ATAAGTT--AA-GT-AATGA-T--TTCGAGA-AA-T--T-AA--A--T--T-TT-T-T-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TAAGC-----TGGAG-A----TG-TCTAG-TGAAA
gi|52771 : ATGACTTT-GA-GT-AATGA-T--TTCGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-CT-T-G-AG-TT---G--TGA-AA-AAT-C----TCAGC-----TTCAG-A----TG-TTTTG-TGAA
gi|52772 : ATGAGATC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGG-AA-T--T-GGG-A--C--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TAAGC-----TTGAA-A----AG-TTTAT-TGAAA
gi|52773 : ATGAGTTT-AAAGA-AACCA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAG-A--T--T-TG-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT------TTAGC-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52774 : ACGAGTTT-AA-AT-AATTA-T--TTAAAAA-CA------GAA-A--T--A-TT-T-G-AG-TT---C--AGG-AA-AAT-C----TCGGC-----TTGAA-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52775 : ACGAGTTT-AA-GT-TATCT-T--TT-GAAA-AA-C--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TG---A--AGA-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52776 : ATGAGTTA-CA-GT-AGTCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAATA--T--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTAAA-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52777 : ATGAGATC-GA-CT-AATAA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-GT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----CCAGC-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAGA
gi|52778 : ATGAGTTA-AA-GT-TATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-T-CG-TT---G--AGG-AA-AGT-T----TCAGC-----TTAAG-T----TG-TTT
gi|52779 : ATGAGTTT-AA-GT-AATTA-T--TTGAAAA-AT-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-A-AG-TT---G---GG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGA
gi|52780 : ATGAGTTC-AG-GT-AATAA-C--TTA---A-AA-T--T-GAT-A--T--T-TT-T-G-AG-AT---C--AGG-AA-AAT-A----TCAGC-----TTGAG-A-----G-TTTAG-TAAAA
gi|52781 : ATGAGTT---------ATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-T--T--T-TT-T-A-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-T----CG-ATTAA-TGAAA
gi|52782 : ATCAGTTG-GA-GA-AAGGA-T--TCATAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAGC-----CTGAG-A----TT-GTTAG-TGAAA
gi|52783 : ATGAGTTG-AG-GT-G-TCA-T--TTAGAGA-AA-A--T-GAG-AT-T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG--A-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TT
gi|52784 : ACGAGTTCCAA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GCT-A--T--A-AT-T-G-AG-TT---G--AGG-TA-AAT-C----TCAAC-----TTG-G-A----AG-CTTTG-TGAAA
gi|52785 : ATGAGTTC-AA-GT-AGTCA-T--TTGGAGA-----------------------------G-TT---G--AGG-AA-AAT-C----ACAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAGA
gi|52786 : ATGAGTTT-AA-AT-AATCA-T--TTAAAGA-AG-T-----------T--T-TT-T-G-AG-CT---G--GGG-AACAAT-C----TCAGC-----TAATG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52787 : ATGAGTTT-AA-AT-AACTA-C--TTAAAGA-CA-T--T-GAG-AATT--TGTT-T-T-AT-TT---G--AGA-GA-ACT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTCAG-TGAAA
gi|52788 : ATAAGGTC-AA-GT-TATCA-A--TTAGAGA-AA-T--C-TAG-A--T--T-TC-T-G-AA-TT---G--AGA-AA-AAT-C----TCAGT-----TTAAG-A----TG-ATAAC-TGAAA
gi|52789 : ATGAGCAC-GA-GA-AATGA-T--TTATAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-A-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAGTT----TT-TTTGG-TGAAA
gi|52790 : ATGAGTTC-AA-GT-TTTTA-T--AAAGAAA-AA-T----GAA-A--T--A-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----AG-TT
gi|52791 : ATGAGTTC-AA-TT-AATCA-T--TTTGAGT-AA-T----GAG-A--T--T-TT-T-A-A--TT---G--AAG-AA-AAC-C----TCAGC-----TTTGG-A----TG-TGTAG-TGAA
gi|52792 : ATGAGTTC-AA-AT-TATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-TGT-C----T-AG------TTGAT-A----CA-TTTAG-TGAAA
gi|52794 : ATGAATGC-AA-GT-TATTA-A--TTAGAGA-AT-A--T-AAG-A--T--T-AT-T-G-AG-TT----------AA-AAT-C----TCAGC-----TAGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52795 : ATGGATTC-AG-GA-AACAA-T--TTGAAGA-AT-T--T-GAA-A--A--G-TT-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-CTAAA
gi|52797 : ATAAGTTT-TA-GC-ATTGA-T--TTTAAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-T-A--TT---G--AGG-AA-ATT-C----TCAGC-----TCAAG-A----TG-TTAAG-TGAGA
gi|52805 : TGAGTTC-AA-AC-GATCT-T--TTAGAGA-AA-C--T-GTA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TG-TTTTG-TGAAA
gi|52806 : TAAGTTT-AA-AT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--C-TC-T-G-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TA-TTTGA-CGAAA
gi|52807 : TAAGTTC-AA-GT-AATCG-T--TTAGAGA-AT-T--A-GAA-A--T--T-TTTT-G-AG-TT---G--ATG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAT-TGAAA
gi|52808 : TGAGTTC-AA-GT-AATCA------AGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-T----TG-TTTAA-TGAAA
gi|52809 : TGAGTTT-GA-GT-AATGG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GGA-A--T--G-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTATG-TGAAA
gi|52810 : TAAGTTT-AA-GT-GATCA-G--TTAGAGA-AG------GGG-A--TCGT-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52811 : TGAGTTC-AA-GT-TACCA-T--ATAGAGA-AA-T--T-AAG-A--T--A-TT-G-G-AG-TT---G--AAG-CA-TAT-T----TCAGC-----TAGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52812 : TAAGTTC-AA-AG-AGTCA-T--TTAGAAA-AG-C--T-GA--A--TG-T-TT-T-T-AG-TT---C--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAA
gi|52813 : TAAGTTT-AA-GT-AGTTA-T--ATAGAGA-AA-T--T-GAG-A--G--T-TT-T-A-A--TT---G--AAG-AA-AAT-A----TTAGC-----TTGAA-A----TG-CTTAG-TGAAA
gi|52814 : TGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGATAA-T--T---T-A--T--T-TT-A-T-AC-TT---G--GAG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-T
gi|52815 : TGAGTCT-AA-GT-TATCA-T--TTAGATA-TG-T--T-AAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---A--AG--AA-AATGC----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52816 : TGTGTTC-AA-GT-TATCA-T--TTGGAGA-AA-T--T-TAC-A--T--T-TT-T-G-TG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TT
gi|52817 : TAAATTC-AA-GC-CATCA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-G--T--T-TT-T-T-AG-TT---AT-GGG-AA-AAT-T----TCAGC-----TTGAG-A----T
gi|52820 : GAGTTC-AA-AT-AATCG-T--TTAGAAA-AA-A--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAA-G----TG-TTTAA-TGAAA
gi|52821 : GAGTTC-AA-GT-A-----------GAGA-AA-T--T-TGA-A--T--T-TT-A-G-AG-TT---A--AAG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52822 : GAGTTC-AA-GT-AAACA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAG-A--T--T-TT-A-G-TG-TT---G--AGC-TA-AAT-C----TCAGC-----TAGAG-AGAGGTG-TTTAG-TGGAA
gi|52823 : GAATTT-GA-GT-AATAG-A--TTAGAGG-TA-T--T-GAG-A--C--A-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAA-TGA
gi|52825 : GAGGTC-CA-GC-AATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAG-A--T--G-TT-T-A-AC-AT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGCTAATATTCAG-G----TG-TTTAG-TAAA
gi|52829 : AGTTC-AA-GT-AGTCA-T--TTGGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT---G-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----ATGAG-A----TG-TTTAG-TGA
gi|52830 : AATTC-AA-GT-TATCA-A--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-TT-C-A-CG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAA-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52831 : AATTT-AA-GT-AATAA-T--ATAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-AA-TT---G--AGGAAA-AAT-C----TGATC-----TTGAG-A----TA-TTAAG-TGAAA
gi|52832 : AGTTC-AA----AATTA-TCATTAGAGA-GA-T--T-GAG-A--T--T-AT-T-T-AG-TT---G--AAC-AA-AAT-T----TCAGC-----TTAAG-T----TG-TTTAG-TGGAA
gi|52834 : GTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTAAG-AGAAA
gi|52835 : GTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAA-A-----T-TT-T-G-AG-TT---GAAAAA-AA-AAT-C----CCAGC-----TTCAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52836 : GTTC-AA-AT-AATCG-T--TTAGAAA-AA-AAAT-GAA-A--T--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----CTGGG-A----TA-TGTAG-TGAAA
gi|52837 : GTTC-AA-GT-AATGA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAT-A--A--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTGGT-----TTTGT-A----TG--CTAG-TGAAA
gi|52838 : GTTT-GA-GT-ACTGA-T--TAAAAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAAC-----TTGAG-A----TGAACTAG-TGAA
gi|52841 : TTT-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AA-GT---G--ATA-AA-AAT-C----GCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTGG-TGAAA
gi|52842 : TTC-AA-GT-AATCA-A--TAAGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-C-T-AG-TT---A--AGG-GA-TAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52844 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52846 : tcaagtcaaataaaaaattcttcagaaaC-AA-GT-AATCA-T--TTGAAGA-GT-T--T-GAT-A--T--T-TT-TTG-AG-TT---C--AGG-AA-TAT-C----TAACC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52847 : -AA-GT-AATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAC-T--T--T-AT-A-G-AG-TT---G--AGG-GG-AAT-C----CCAGC-----TTGAG-G----GG-TTTAG-TGAAA
gi|52848 : -AA-GT-AATCA-T--T---AGATAA-T--T-GA--A--T--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52849 : A-GA-AATTA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--G--T-TC-T-G-AG-TT---A--AGG-CA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TATAA-TGAA
gi|52850 : A-GT-AATTC-T--TTAGAGT-AA-T--T-AAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTAAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52852 : A-GC-AATCA-T--GTAGAGA-AA-T--T-GAT-T--T--T-TT-T-G-AT-TT---G--AGG-CA-AAT-C----TCAGT-----CTGAT-A----TG-TTTAG-
gi|52853 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52855 : caatttttaaaaaaaA-T--TTAGAGG-AA-T--T-CAG-A--C--T-TT-T-T-AA-TT---C--AAG-AA-AAT-G----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52856 : aatat-AATCA-T--TTTGAAA-AAAT--T-GAG-A--TG-T-TC-C-T-AG-TT---G--AGG-AA-ATT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TA-TTTAGTTGAA
gi|52859 : ATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--TGG-AA-AAT-C----TGAGC-----TTGAG-A----TG--TTAG-TGAAA
gi|52863 : TCA-T--TTAGAAA-AT-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---A--ATG-AA-CAT-C----TCAAC-----TTG-G-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52866 : A-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TCGAG-A----TA-TTTA
gi|52867 : tA-T--TTGGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TC-C-G-AG-AT---G--TAC-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-G----TG-TTTAA-TGA
gi|52869 : --TTAAAGC-AA-T--T-CAA-A--A--A-TT-T-G-AG-CT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52871 : AGAGA-AA-T--TCGAA-G--T--T-TT-T---AG-TG---A--AGG-AA-ACT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52873 : -T--T-CAA-A--T--A-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52882 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-CGAAA
gi|52886 : aaa--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52889 : -G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGA
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 00 0 0 00 0 22 11 11 0 0 0 0 0 000 11 0 0 0 0000 11111 0 0000 0 0
lowQualScore : . . . . .. . . .. . .. .. .. . . . . . ... .. . . . .... ..... . .... . .
lowQualScore : 5 5 5 4 66 9 4 66 8 22 44 44 4 4 4 4 4 777 33 4 4 4 8888 00000 4 9999 4 4
consensus : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
Reference ( family-220 ) : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52745 : ATGAGTTC-AA-GC-AATTG-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52746 : ATGAGTTC-AA-GC-AATGA-T--TTTGAGA-TA-T--T-GAA-A--T--T-TT-G-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52747 : ATGAGTTC-AA-GC-AATCA-T--TAAGAGA-AA-T--T-AA--A--T--G-TT-G-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52748 : ATGAATTC-AA-GT-AACCA-T--TGAGAGA-AA-G--T-GAA-A--T--T-TC-G-G-AG-TT---T--AGG-TA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAA
gi|52749 : ATGAGTAC-AA-GC-AATCA-T--TTAGAGA-TA-T--T-GAG-A--A--T-TT-C-G-AG-TT---G--AGG-AA-TAC-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52750 : ATGAGTTT-AA-GT-AATCA-T--TAAGAGA-AA-T--T-GAA-T--T--T-TT-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT-C----TCAGG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52751 : ATGAGTTC-AA-GC-AATTG-C--TTGGAGA-GA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCGGC-----TTAAG-A----TG-TTTAG-AGAAA
gi|52752 : ATGGTTTT-AA-GT-TATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TTAA
gi|52753 : ATTAGTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT---G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTTAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52754 : ATGAGTTC-AA-GT-GATTG-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAGC-----TGGAG-A----TG-TTTGG-TGAAA
gi|52755 : ATAAGTTT-GG-GG-AATTA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52756 : ATGAATTC-TA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-TTAG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52757 : ATGAGTTC-AA-GTTAATAA-T--TTCGAGG-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-TA-TT---GG-AGG-AA-AAT-C----TGCGC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52758 : ATGAGTTC-AA-GT-ACTCA-T--TTAAAGA-AA-T--TTGAG-A--A--T-TT-T-T-AG-AT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGGG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52759 : ATGAGTT---A-G------A-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AGATTCAAG--AAG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTTAG-A----TG-TTTAG-CAAAA
gi|52760 : ATGAATTC-AA-GT-TATCA-A--TTAGAGA-AG-T--T-AAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-GTAAG-TGAAA
gi|52761 : ATGAGTTC-AA-GT-AACCG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-AT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-ACT-G----TCAGC-----TTGAG-A----AG-TTGAG-TGAAA
gi|52762 : ATGAGTTT-GA-GT-AGTGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AC-TT---G--AGG-AA-GAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTA--TGGAA
gi|52763 : ATGTGTTG-AA-AA-AATCAAT--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-CCTTG-TGAAA
gi|52764 : ATGAGTTC-AA-GT-AATTA-T--TCAGAGA-AA-G--T-CAG-T--T--T-TC-T-G-TC-TT---G--AGG-AA-ATT-C----TGAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52765 : ATGAGATC-CA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--A--T-AT-T-G-TG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCACC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52766 : ATGAGTTC-GA-GC-AATGG-T--TCAGAGA-AA-T--T-GAC-AT-T--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-CTCAGTCAGC-----TTGTG-A----TG-TTTAG-CGAAA
gi|52767 : ATGAGTTG-AA-AT-AGTTG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGC-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TG-TTTCG-TAAGA
gi|52768 : ATGAGTTC-AA-GT-AAAGG-T--TAAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-A-G-AG-TT---G--AGG-AA-CAT-T----TCAGC-----TTCCG-A----TG--TCAG-TGAAA
gi|52769 : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAA-A--T--T-TT-T-A-AG-TT---T--AGG-AA-AAC-G----ACAGC-----TTGAA-A----TG-TT
gi|52770 : ATAAGTT--AA-GT-AATGA-T--TTCGAGA-AA-T--T-AA--A--T--T-TT-T-T-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TAAGC-----TGGAG-A----TG-TCTAG-TGAAA
gi|52771 : ATGACTTT-GA-GT-AATGA-T--TTCGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-CT-T-G-AG-TT---G--TGA-AA-AAT-C----TCAGC-----TTCAG-A----TG-TTTTG-TGAA
gi|52772 : ATGAGATC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGG-AA-T--T-GGG-A--C--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TAAGC-----TTGAA-A----AG-TTTAT-TGAAA
gi|52773 : ATGAGTTT-AAAGA-AACCA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAG-A--T--T-TG-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT------TTAGC-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52774 : ACGAGTTT-AA-AT-AATTA-T--TTAAAAA-CA------GAA-A--T--A-TT-T-G-AG-TT---C--AGG-AA-AAT-C----TCGGC-----TTGAA-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52775 : ACGAGTTT-AA-GT-TATCT-T--TT-GAAA-AA-C--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TG---A--AGA-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52776 : ATGAGTTA-CA-GT-AGTCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAATA--T--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTAAA-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52777 : ATGAGATC-GA-CT-AATAA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-GT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----CCAGC-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAGA
gi|52778 : ATGAGTTA-AA-GT-TATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-T-CG-TT---G--AGG-AA-AGT-T----TCAGC-----TTAAG-T----TG-TTT
gi|52779 : ATGAGTTT-AA-GT-AATTA-T--TTGAAAA-AT-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-A-AG-TT---G---GG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGA
gi|52780 : ATGAGTTC-AG-GT-AATAA-C--TTA---A-AA-T--T-GAT-A--T--T-TT-T-G-AG-AT---C--AGG-AA-AAT-A----TCAGC-----TTGAG-A-----G-TTTAG-TAAAA
gi|52781 : ATGAGTT---------ATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-T--T--T-TT-T-A-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-T----CG-ATTAA-TGAAA
gi|52782 : ATCAGTTG-GA-GA-AAGGA-T--TCATAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAGC-----CTGAG-A----TT-GTTAG-TGAAA
gi|52783 : ATGAGTTG-AG-GT-G-TCA-T--TTAGAGA-AA-A--T-GAG-AT-T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG--A-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TT
gi|52784 : ACGAGTTCCAA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GCT-A--T--A-AT-T-G-AG-TT---G--AGG-TA-AAT-C----TCAAC-----TTG-G-A----AG-CTTTG-TGAAA
gi|52785 : ATGAGTTC-AA-GT-AGTCA-T--TTGGAGA-----------------------------G-TT---G--AGG-AA-AAT-C----ACAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAGA
gi|52786 : ATGAGTTT-AA-AT-AATCA-T--TTAAAGA-AG-T-----------T--T-TT-T-G-AG-CT---G--GGG-AACAAT-C----TCAGC-----TAATG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52787 : ATGAGTTT-AA-AT-AACTA-C--TTAAAGA-CA-T--T-GAG-AATT--TGTT-T-T-AT-TT---G--AGA-GA-ACT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTCAG-TGAAA
gi|52788 : ATAAGGTC-AA-GT-TATCA-A--TTAGAGA-AA-T--C-TAG-A--T--T-TC-T-G-AA-TT---G--AGA-AA-AAT-C----TCAGT-----TTAAG-A----TG-ATAAC-TGAAA
gi|52789 : ATGAGCAC-GA-GA-AATGA-T--TTATAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-A-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAGTT----TT-TTTGG-TGAAA
gi|52790 : ATGAGTTC-AA-GT-TTTTA-T--AAAGAAA-AA-T----GAA-A--T--A-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----AG-TT
gi|52791 : ATGAGTTC-AA-TT-AATCA-T--TTTGAGT-AA-T----GAG-A--T--T-TT-T-A-A--TT---G--AAG-AA-AAC-C----TCAGC-----TTTGG-A----TG-TGTAG-TGAA
gi|52792 : ATGAGTTC-AA-AT-TATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-TGT-C----T-AG------TTGAT-A----CA-TTTAG-TGAAA
gi|52794 : ATGAATGC-AA-GT-TATTA-A--TTAGAGA-AT-A--T-AAG-A--T--T-AT-T-G-AG-TT----------AA-AAT-C----TCAGC-----TAGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52795 : ATGGATTC-AG-GA-AACAA-T--TTGAAGA-AT-T--T-GAA-A--A--G-TT-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-CTAAA
gi|52797 : ATAAGTTT-TA-GC-ATTGA-T--TTTAAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-T-A--TT---G--AGG-AA-ATT-C----TCAGC-----TCAAG-A----TG-TTAAG-TGAGA
gi|52805 : TGAGTTC-AA-AC-GATCT-T--TTAGAGA-AA-C--T-GTA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TG-TTTTG-TGAAA
gi|52806 : TAAGTTT-AA-AT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--C-TC-T-G-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TA-TTTGA-CGAAA
gi|52807 : TAAGTTC-AA-GT-AATCG-T--TTAGAGA-AT-T--A-GAA-A--T--T-TTTT-G-AG-TT---G--ATG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAT-TGAAA
gi|52808 : TGAGTTC-AA-GT-AATCA------AGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-T----TG-TTTAA-TGAAA
gi|52809 : TGAGTTT-GA-GT-AATGG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GGA-A--T--G-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTATG-TGAAA
gi|52810 : TAAGTTT-AA-GT-GATCA-G--TTAGAGA-AG------GGG-A--TCGT-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52811 : TGAGTTC-AA-GT-TACCA-T--ATAGAGA-AA-T--T-AAG-A--T--A-TT-G-G-AG-TT---G--AAG-CA-TAT-T----TCAGC-----TAGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52812 : TAAGTTC-AA-AG-AGTCA-T--TTAGAAA-AG-C--T-GA--A--TG-T-TT-T-T-AG-TT---C--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAA
gi|52813 : TAAGTTT-AA-GT-AGTTA-T--ATAGAGA-AA-T--T-GAG-A--G--T-TT-T-A-A--TT---G--AAG-AA-AAT-A----TTAGC-----TTGAA-A----TG-CTTAG-TGAAA
gi|52814 : TGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGATAA-T--T---T-A--T--T-TT-A-T-AC-TT---G--GAG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-T
gi|52815 : TGAGTCT-AA-GT-TATCA-T--TTAGATA-TG-T--T-AAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---A--AG--AA-AATGC----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52816 : TGTGTTC-AA-GT-TATCA-T--TTGGAGA-AA-T--T-TAC-A--T--T-TT-T-G-TG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TT
gi|52817 : TAAATTC-AA-GC-CATCA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-G--T--T-TT-T-T-AG-TT---AT-GGG-AA-AAT-T----TCAGC-----TTGAG-A----T
gi|52820 : GAGTTC-AA-AT-AATCG-T--TTAGAAA-AA-A--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAA-G----TG-TTTAA-TGAAA
gi|52821 : GAGTTC-AA-GT-A-----------GAGA-AA-T--T-TGA-A--T--T-TT-A-G-AG-TT---A--AAG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52822 : GAGTTC-AA-GT-AAACA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAG-A--T--T-TT-A-G-TG-TT---G--AGC-TA-AAT-C----TCAGC-----TAGAG-AGAGGTG-TTTAG-TGGAA
gi|52823 : GAATTT-GA-GT-AATAG-A--TTAGAGG-TA-T--T-GAG-A--C--A-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAA-TGA
gi|52825 : GAGGTC-CA-GC-AATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAG-A--T--G-TT-T-A-AC-AT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGCTAATATTCAG-G----TG-TTTAG-TAAA
gi|52829 : AGTTC-AA-GT-AGTCA-T--TTGGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT---G-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----ATGAG-A----TG-TTTAG-TGA
gi|52830 : AATTC-AA-GT-TATCA-A--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-TT-C-A-CG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAA-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52831 : AATTT-AA-GT-AATAA-T--ATAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-AA-TT---G--AGGAAA-AAT-C----TGATC-----TTGAG-A----TA-TTAAG-TGAAA
gi|52832 : AGTTC-AA----AATTA-TCATTAGAGA-GA-T--T-GAG-A--T--T-AT-T-T-AG-TT---G--AAC-AA-AAT-T----TCAGC-----TTAAG-T----TG-TTTAG-TGGAA
gi|52834 : GTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTAAG-AGAAA
gi|52835 : GTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAA-A-----T-TT-T-G-AG-TT---GAAAAA-AA-AAT-C----CCAGC-----TTCAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52836 : GTTC-AA-AT-AATCG-T--TTAGAAA-AA-AAAT-GAA-A--T--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----CTGGG-A----TA-TGTAG-TGAAA
gi|52837 : GTTC-AA-GT-AATGA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAT-A--A--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTGGT-----TTTGT-A----TG--CTAG-TGAAA
gi|52838 : GTTT-GA-GT-ACTGA-T--TAAAAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAAC-----TTGAG-A----TGAACTAG-TGAA
gi|52841 : TTT-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AA-GT---G--ATA-AA-AAT-C----GCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTGG-TGAAA
gi|52842 : TTC-AA-GT-AATCA-A--TAAGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-C-T-AG-TT---A--AGG-GA-TAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52844 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52846 : tcaagtcaaataaaaaattcttcagaaaC-AA-GT-AATCA-T--TTGAAGA-GT-T--T-GAT-A--T--T-TT-TTG-AG-TT---C--AGG-AA-TAT-C----TAACC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52847 : -AA-GT-AATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAC-T--T--T-AT-A-G-AG-TT---G--AGG-GG-AAT-C----CCAGC-----TTGAG-G----GG-TTTAG-TGAAA
gi|52848 : -AA-GT-AATCA-T--T---AGATAA-T--T-GA--A--T--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52849 : A-GA-AATTA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--G--T-TC-T-G-AG-TT---A--AGG-CA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TATAA-TGAA
gi|52850 : A-GT-AATTC-T--TTAGAGT-AA-T--T-AAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTAAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52852 : A-GC-AATCA-T--GTAGAGA-AA-T--T-GAT-T--T--T-TT-T-G-AT-TT---G--AGG-CA-AAT-C----TCAGT-----CTGAT-A----TG-TTTAG-
gi|52853 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52855 : caatttttaaaaaaaA-T--TTAGAGG-AA-T--T-CAG-A--C--T-TT-T-T-AA-TT---C--AAG-AA-AAT-G----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52856 : aatat-AATCA-T--TTTGAAA-AAAT--T-GAG-A--TG-T-TC-C-T-AG-TT---G--AGG-AA-ATT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TA-TTTAGTTGAA
gi|52859 : ATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--TGG-AA-AAT-C----TGAGC-----TTGAG-A----TG--TTAG-TGAAA
gi|52863 : TCA-T--TTAGAAA-AT-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---A--ATG-AA-CAT-C----TCAAC-----TTG-G-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52866 : A-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TCGAG-A----TA-TTTA
gi|52867 : tA-T--TTGGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TC-C-G-AG-AT---G--TAC-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-G----TG-TTTAA-TGA
gi|52869 : --TTAAAGC-AA-T--T-CAA-A--A--A-TT-T-G-AG-CT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52871 : AGAGA-AA-T--TCGAA-G--T--T-TT-T---AG-TG---A--AGG-AA-ACT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52873 : -T--T-CAA-A--T--A-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52882 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-CGAAA
gi|52886 : aaa--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52889 : -G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGA
blockSeqs : AT AT CG AA
blockSeqs : A T G G
blockSeqs : A T G T
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : C . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : C . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : C . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : T . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : T . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : T . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : C . . .
blockSeqs : C . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : C . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : T . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : T . . .
blockSeqs : C . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : T . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : G . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : A . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
finalCons : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 00 0 0 00 0 22 11 11 0 0 0 0 0 000 11 0 0 0 0000 11111 0 0000 0 0
lowQualScore : . . . . .. . . .. . .. .. .. . . . . . ... .. . . . .... ..... . .... . .
lowQualScore : 5 5 5 4 66 9 4 66 8 22 44 44 4 4 4 4 4 777 33 4 4 4 8888 00000 4 9999 4 4
consensus : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
Reference ( family-220 ) : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52745 : ATGAGTTC-AA-GC-AATTG-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52746 : ATGAGTTC-AA-GC-AATGA-T--TTTGAGA-TA-T--T-GAA-A--T--T-TT-G-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52747 : ATGAGTTC-AA-GC-AATCA-T--TAAGAGA-AA-T--T-AA--A--T--G-TT-G-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52748 : ATGAATTC-AA-GT-AACCA-T--TGAGAGA-AA-G--T-GAA-A--T--T-TC-G-G-AG-TT---T--AGG-TA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAA
gi|52749 : ATGAGTAC-AA-GC-AATCA-T--TTAGAGA-TA-T--T-GAG-A--A--T-TT-C-G-AG-TT---G--AGG-AA-TAC-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52750 : ATGAGTTT-AA-GT-AATCA-T--TAAGAGA-AA-T--T-GAA-T--T--T-TT-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT-C----TCAGG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52751 : ATGAGTTC-AA-GC-AATTG-C--TTGGAGA-GA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCGGC-----TTAAG-A----TG-TTTAG-AGAAA
gi|52752 : ATGGTTTT-AA-GT-TATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TTAA
gi|52753 : ATTAGTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT---G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTTAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52754 : ATGAGTTC-AA-GT-GATTG-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAGC-----TGGAG-A----TG-TTTGG-TGAAA
gi|52755 : ATAAGTTT-GG-GG-AATTA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52756 : ATGAATTC-TA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-TTAG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52757 : ATGAGTTC-AA-GTTAATAA-T--TTCGAGG-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-TA-TT---GG-AGG-AA-AAT-C----TGCGC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52758 : ATGAGTTC-AA-GT-ACTCA-T--TTAAAGA-AA-T--TTGAG-A--A--T-TT-T-T-AG-AT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGGG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52759 : ATGAGTT---A-G------A-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AGATTCAAG--AAG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTTAG-A----TG-TTTAG-CAAAA
gi|52760 : ATGAATTC-AA-GT-TATCA-A--TTAGAGA-AG-T--T-AAG-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-GTAAG-TGAAA
gi|52761 : ATGAGTTC-AA-GT-AACCG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-AT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-ACT-G----TCAGC-----TTGAG-A----AG-TTGAG-TGAAA
gi|52762 : ATGAGTTT-GA-GT-AGTGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AC-TT---G--AGG-AA-GAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTA--TGGAA
gi|52763 : ATGTGTTG-AA-AA-AATCAAT--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-CCTTG-TGAAA
gi|52764 : ATGAGTTC-AA-GT-AATTA-T--TCAGAGA-AA-G--T-CAG-T--T--T-TC-T-G-TC-TT---G--AGG-AA-ATT-C----TGAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52765 : ATGAGATC-CA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--A--T-AT-T-G-TG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCACC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52766 : ATGAGTTC-GA-GC-AATGG-T--TCAGAGA-AA-T--T-GAC-AT-T--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-CTCAGTCAGC-----TTGTG-A----TG-TTTAG-CGAAA
gi|52767 : ATGAGTTG-AA-AT-AGTTG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGC-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TG-TTTCG-TAAGA
gi|52768 : ATGAGTTC-AA-GT-AAAGG-T--TAAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-A-G-AG-TT---G--AGG-AA-CAT-T----TCAGC-----TTCCG-A----TG--TCAG-TGAAA
gi|52769 : ATGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAA-A--T--T-TT-T-A-AG-TT---T--AGG-AA-AAC-G----ACAGC-----TTGAA-A----TG-TT
gi|52770 : ATAAGTT--AA-GT-AATGA-T--TTCGAGA-AA-T--T-AA--A--T--T-TT-T-T-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TAAGC-----TGGAG-A----TG-TCTAG-TGAAA
gi|52771 : ATGACTTT-GA-GT-AATGA-T--TTCGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-CT-T-G-AG-TT---G--TGA-AA-AAT-C----TCAGC-----TTCAG-A----TG-TTTTG-TGAA
gi|52772 : ATGAGATC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGG-AA-T--T-GGG-A--C--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TAAGC-----TTGAA-A----AG-TTTAT-TGAAA
gi|52773 : ATGAGTTT-AAAGA-AACCA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAG-A--T--T-TG-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT------TTAGC-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52774 : ACGAGTTT-AA-AT-AATTA-T--TTAAAAA-CA------GAA-A--T--A-TT-T-G-AG-TT---C--AGG-AA-AAT-C----TCGGC-----TTGAA-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52775 : ACGAGTTT-AA-GT-TATCT-T--TT-GAAA-AA-C--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TG---A--AGA-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52776 : ATGAGTTA-CA-GT-AGTCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAATA--T--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTAAA-A----TG-TTAAG-TGAAA
gi|52777 : ATGAGATC-GA-CT-AATAA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-GT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----CCAGC-----TTGAG-A----TG-TTAAG-TGAGA
gi|52778 : ATGAGTTA-AA-GT-TATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-T-CG-TT---G--AGG-AA-AGT-T----TCAGC-----TTAAG-T----TG-TTT
gi|52779 : ATGAGTTT-AA-GT-AATTA-T--TTGAAAA-AT-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-A-AG-TT---G---GG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGA
gi|52780 : ATGAGTTC-AG-GT-AATAA-C--TTA---A-AA-T--T-GAT-A--T--T-TT-T-G-AG-AT---C--AGG-AA-AAT-A----TCAGC-----TTGAG-A-----G-TTTAG-TAAAA
gi|52781 : ATGAGTT---------ATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-T--T--T-TT-T-A-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-T----CG-ATTAA-TGAAA
gi|52782 : ATCAGTTG-GA-GA-AAGGA-T--TCATAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAGC-----CTGAG-A----TT-GTTAG-TGAAA
gi|52783 : ATGAGTTG-AG-GT-G-TCA-T--TTAGAGA-AA-A--T-GAG-AT-T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG--A-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TT
gi|52784 : ACGAGTTCCAA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GCT-A--T--A-AT-T-G-AG-TT---G--AGG-TA-AAT-C----TCAAC-----TTG-G-A----AG-CTTTG-TGAAA
gi|52785 : ATGAGTTC-AA-GT-AGTCA-T--TTGGAGA-----------------------------G-TT---G--AGG-AA-AAT-C----ACAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAGA
gi|52786 : ATGAGTTT-AA-AT-AATCA-T--TTAAAGA-AG-T-----------T--T-TT-T-G-AG-CT---G--GGG-AACAAT-C----TCAGC-----TAATG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52787 : ATGAGTTT-AA-AT-AACTA-C--TTAAAGA-CA-T--T-GAG-AATT--TGTT-T-T-AT-TT---G--AGA-GA-ACT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTCAG-TGAAA
gi|52788 : ATAAGGTC-AA-GT-TATCA-A--TTAGAGA-AA-T--C-TAG-A--T--T-TC-T-G-AA-TT---G--AGA-AA-AAT-C----TCAGT-----TTAAG-A----TG-ATAAC-TGAAA
gi|52789 : ATGAGCAC-GA-GA-AATGA-T--TTATAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-A-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAGTT----TT-TTTGG-TGAAA
gi|52790 : ATGAGTTC-AA-GT-TTTTA-T--AAAGAAA-AA-T----GAA-A--T--A-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----AG-TT
gi|52791 : ATGAGTTC-AA-TT-AATCA-T--TTTGAGT-AA-T----GAG-A--T--T-TT-T-A-A--TT---G--AAG-AA-AAC-C----TCAGC-----TTTGG-A----TG-TGTAG-TGAA
gi|52792 : ATGAGTTC-AA-AT-TATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TC-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-TGT-C----T-AG------TTGAT-A----CA-TTTAG-TGAAA
gi|52794 : ATGAATGC-AA-GT-TATTA-A--TTAGAGA-AT-A--T-AAG-A--T--T-AT-T-G-AG-TT----------AA-AAT-C----TCAGC-----TAGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52795 : ATGGATTC-AG-GA-AACAA-T--TTGAAGA-AT-T--T-GAA-A--A--G-TT-T-G-AG-TT---T--AGG-AA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-A----TA-TTTAG-CTAAA
gi|52797 : ATAAGTTT-TA-GC-ATTGA-T--TTTAAAA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-T-A--TT---G--AGG-AA-ATT-C----TCAGC-----TCAAG-A----TG-TTAAG-TGAGA
gi|52805 : TGAGTTC-AA-AC-GATCT-T--TTAGAGA-AA-C--T-GTA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TG-TTTTG-TGAAA
gi|52806 : TAAGTTT-AA-AT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--C-TC-T-G-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAGA-----TTGAG-A----TA-TTTGA-CGAAA
gi|52807 : TAAGTTC-AA-GT-AATCG-T--TTAGAGA-AT-T--A-GAA-A--T--T-TTTT-G-AG-TT---G--ATG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAT-TGAAA
gi|52808 : TGAGTTC-AA-GT-AATCA------AGAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-T----TG-TTTAA-TGAAA
gi|52809 : TGAGTTT-GA-GT-AATGG-T--TTAGAGA-AA-T--T-GGA-A--T--G-TT-T-G-AA-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTATG-TGAAA
gi|52810 : TAAGTTT-AA-GT-GATCA-G--TTAGAGA-AG------GGG-A--TCGT-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52811 : TGAGTTC-AA-GT-TACCA-T--ATAGAGA-AA-T--T-AAG-A--T--A-TT-G-G-AG-TT---G--AAG-CA-TAT-T----TCAGC-----TAGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52812 : TAAGTTC-AA-AG-AGTCA-T--TTAGAAA-AG-C--T-GA--A--TG-T-TT-T-T-AG-TT---C--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAA
gi|52813 : TAAGTTT-AA-GT-AGTTA-T--ATAGAGA-AA-T--T-GAG-A--G--T-TT-T-A-A--TT---G--AAG-AA-AAT-A----TTAGC-----TTGAA-A----TG-CTTAG-TGAAA
gi|52814 : TGAGTTC-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGATAA-T--T---T-A--T--T-TT-A-T-AC-TT---G--GAG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-T
gi|52815 : TGAGTCT-AA-GT-TATCA-T--TTAGATA-TG-T--T-AAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---A--AG--AA-AATGC----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52816 : TGTGTTC-AA-GT-TATCA-T--TTGGAGA-AA-T--T-TAC-A--T--T-TT-T-G-TG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TT
gi|52817 : TAAATTC-AA-GC-CATCA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-G--T--T-TT-T-T-AG-TT---AT-GGG-AA-AAT-T----TCAGC-----TTGAG-A----T
gi|52820 : GAGTTC-AA-AT-AATCG-T--TTAGAAA-AA-A--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAA-G----TG-TTTAA-TGAAA
gi|52821 : GAGTTC-AA-GT-A-----------GAGA-AA-T--T-TGA-A--T--T-TT-A-G-AG-TT---A--AAG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52822 : GAGTTC-AA-GT-AAACA-T--TTAGAGA-AA-C--T-GAG-A--T--T-TT-A-G-TG-TT---G--AGC-TA-AAT-C----TCAGC-----TAGAG-AGAGGTG-TTTAG-TGGAA
gi|52823 : GAATTT-GA-GT-AATAG-A--TTAGAGG-TA-T--T-GAG-A--C--A-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAA-TGA
gi|52825 : GAGGTC-CA-GC-AATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAG-A--T--G-TT-T-A-AC-AT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGCTAATATTCAG-G----TG-TTTAG-TAAA
gi|52829 : AGTTC-AA-GT-AGTCA-T--TTGGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT---G-AT-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----ATGAG-A----TG-TTTAG-TGA
gi|52830 : AATTC-AA-GT-TATCA-A--TTAAAGA-AA-T--T-GAC-A--T--T-TT-C-A-CG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAA-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52831 : AATTT-AA-GT-AATAA-T--ATAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-AA-TT---G--AGGAAA-AAT-C----TGATC-----TTGAG-A----TA-TTAAG-TGAAA
gi|52832 : AGTTC-AA----AATTA-TCATTAGAGA-GA-T--T-GAG-A--T--T-AT-T-T-AG-TT---G--AAC-AA-AAT-T----TCAGC-----TTAAG-T----TG-TTTAG-TGGAA
gi|52834 : GTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAG-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TG-TTAAG-AGAAA
gi|52835 : GTTC-GA-GT-AATGA-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAA-A-----T-TT-T-G-AG-TT---GAAAAA-AA-AAT-C----CCAGC-----TTCAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52836 : GTTC-AA-AT-AATCG-T--TTAGAAA-AA-AAAT-GAA-A--T--T-TT-T---AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGT-----CTGGG-A----TA-TGTAG-TGAAA
gi|52837 : GTTC-AA-GT-AATGA-T--TTAAAGA-AA-T--T-GAT-A--A--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTGGT-----TTTGT-A----TG--CTAG-TGAAA
gi|52838 : GTTT-GA-GT-ACTGA-T--TAAAAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TTAAC-----TTGAG-A----TGAACTAG-TGAA
gi|52841 : TTT-AA-GT-AATCA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TT-T-G-AA-GT---G--ATA-AA-AAT-C----GCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTGG-TGAAA
gi|52842 : TTC-AA-GT-AATCA-A--TAAGAGA-AA-T--T-GAA-A--T--T-TT-C-T-AG-TT---A--AGG-GA-TAT-C----TCAGT-----TTGAG-A----TA-TTTAG-TGAAA
gi|52844 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52846 : tcaagtcaaataaaaaattcttcagaaaC-AA-GT-AATCA-T--TTGAAGA-GT-T--T-GAT-A--T--T-TT-TTG-AG-TT---C--AGG-AA-TAT-C----TAACC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52847 : -AA-GT-AATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAC-T--T--T-AT-A-G-AG-TT---G--AGG-GG-AAT-C----CCAGC-----TTGAG-G----GG-TTTAG-TGAAA
gi|52848 : -AA-GT-AATCA-T--T---AGATAA-T--T-GA--A--T--T-TT-T-T-AG-TT---G--AGG-GA-AAT-C----TCATC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52849 : A-GA-AATTA-T--TTAGAGA-AA-T--T-GAA-A--G--T-TC-T-G-AG-TT---A--AGG-CA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TATAA-TGAA
gi|52850 : A-GT-AATTC-T--TTAGAGT-AA-T--T-AAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---A--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTAAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52852 : A-GC-AATCA-T--GTAGAGA-AA-T--T-GAT-T--T--T-TT-T-G-AT-TT---G--AGG-CA-AAT-C----TCAGT-----CTGAT-A----TG-TTTAG-
gi|52853 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52855 : caatttttaaaaaaaA-T--TTAGAGG-AA-T--T-CAG-A--C--T-TT-T-T-AA-TT---C--AAG-AA-AAT-G----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52856 : aatat-AATCA-T--TTTGAAA-AAAT--T-GAG-A--TG-T-TC-C-T-AG-TT---G--AGG-AA-ATT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TA-TTTAGTTGAA
gi|52859 : ATCA-T--TTAGAAA-AA-T--T-GAA-A--A--T-TT-T-G-AG-TT---G--TGG-AA-AAT-C----TGAGC-----TTGAG-A----TG--TTAG-TGAAA
gi|52863 : TCA-T--TTAGAAA-AT-T--T-GAA-A--T--T-TT-T-G-AG-TT---A--ATG-AA-CAT-C----TCAAC-----TTG-G-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52866 : A-T--TTAGAGA-AA-T--T-AAG-A--A--T-TC-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAGC-----TCGAG-A----TA-TTTA
gi|52867 : tA-T--TTGGAGA-AA-T--T-GAG-A--T--T-TC-C-G-AG-AT---G--TAC-AA-AAT-C----TCAGC-----TTGAG-G----TG-TTTAA-TGA
gi|52869 : --TTAAAGC-AA-T--T-CAA-A--A--A-TT-T-G-AG-CT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52871 : AGAGA-AA-T--TCGAA-G--T--T-TT-T---AG-TG---A--AGG-AA-ACT-C----TCAGC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52873 : -T--T-CAA-A--T--A-TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52882 : -TT-T-G-AG-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAG-----TTGAG-A----TG-TTTAG-CGAAA
gi|52886 : aaa--T--T-TT-T-G-AG-TT---G--AAG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGAAA
gi|52889 : -G-AA-TT---G--AGG-AA-AAT-C----TCAAC-----TTGAG-A----TG-TTTAG-TGA