lowQualScore                  :              1                                             2222222                             222222              1                               11111                  111111111                                            1111111111                                                                           
lowQualScore                  :          0 0 4 0  0  11 11 11 11 1111 0 11111 0 00 111 3 0 0000000 22 111    111    0   0000   222222 1111  222222 5  0 555 0  111  11 11 22222 0  11111 000   7777777    666666666 22222  22222222 00 11 0 11111 111111  4 00 8888888888 111  0 11111     333333 55555   00 00 0  11 222 00 0 0   00        0      
lowQualScore                  :          . . . .  .  .. .. .. .. .... . ..... . .. ... . . ....... .. ...    ...    .   ....   ...... ....  ...... .  . ... .  ...  .. .. ..... .  ..... ...   .......    ......... .....  ........ .. .. . ..... ......  . .. .......... ...  . .....     ...... .....   .. .. .  .. ... .. . .   ..        .      
lowQualScore                  :          5 5 6 5  4  00 00 00 00 8888 4 11111 4 66 666 4 4 2222222 33 666    333    4   9999   333333 4444  000000 9  4 444 4  333  55 00 66666 8  00000 777   9999999    333333333 77777  22222222 66 00 4 99999 222222  0 66 3333333333 888  4 11111     222222 22222   66 66 4  66 777 66 4 5   66        4      
consensus                     :    AATTTC-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-AAA----AAA-AA-TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------AGAC--C-------ACTA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGTTACCTTGAA
Reference ( gi|52918 )        :    AATTTT-G-TCA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---C---A--T---GGTA---ACAG-AAA----AAA-AA-TGT----TG------ACAA-T-A-A-AA---AC--T--C-----C-CT-A---A---TAG----T--AAAA--------CG-----CA--------C--T--A-C-----T------AGGC--C-------TCCA---GG-T-----TGACA------TA----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGTTATCTTGAA
gi|52942                      :    AATTTT-G-TCA-TT-TT--G--G--C--T----A-------T-T--G---TCT-T---C---A--T---GGTA---ACAG-AAA----AAA-AA-TGT----TG------ACAA-T-A-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TAG----CA-AAAA--------CA-----CA--------T--T--A-C-----T------AGGT--C-------TCCA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AG--A---A--T-T-TCA--TGAAGTTACATTGA
gi|52947                      :    AATTTT-G-TTA-TT-TT--T--G--C--T----A-T-----T-T--C---T-T-TA--C---A--T---TGTA---ACAG-AAA----CAA-A--TAT----TG------AAAA-T-A-A-AA---AC--T--C-----A-AT-C---A---TAG----C--AAAA--------GA-----CATGT-----C--T--A-CACCAAT------AGAC--T-------TCAA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--G---G--T-T-TCG--TGAAGTTATCTTGAtagctt
gi|52921                      :    AATTTT-G-T-A-TT-TTTTA--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---AAAG-AAG----AAA----TAT----TG------AAAA-T-T-A-AA---AC--T--C-----C-TT-C---A---CAG----C--AAAA--------GG-----AA--------C--T--A-C-----T------AGGC--A--------CTA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--C---A--T-T-TCG--TGAAGTTATTTTGAAgagcttt
gi|52935                      :    AATTTT-G-TAA-CT-TT--C--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--G--C---GATA---GCAG-AAA----CA-----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--A-----T-CT-C---G---TAG----T--AAAA--------CG-----TA--------C--T--A-C-----T------AGAC--T-------GCTG---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-GA--A---G--T-T-TCG--TTAAGTTATCTTGAA
gi|52950                      :    AATTTT-G-TAA-TT-TT--C--A--C--T----A-T-----T-C--G---T-T-T---CG--A--T---GGTA---ACAG-AAA----AA-----TGT----TG------AGAA-T-A-A-AA----C--T--T-----T-CT-C---A---TAG----T--AAAC--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------GGGC--C-------ACTA---GG-T-----TTACA------TT----TAT--A--C-AA--A---G--C-T-TCG--TGAGGTTACCATGAcggtttt
gi|52951                      :    AATTTT-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----G-T-----T-T--G---TGT-C---C---A--T---AGTA---ACA----A----AAA-AA-TAT----TG------AAAA-T-A-A-AA---TC--T--C-----A-AT-C---A---TAG----C--AAAAGATATGTGCA-----CA--------C--C--A-G-----T------AGAC--C-------ACAA---GG-T-----TGACA------TA----TGTGTA--C-AC--G---G--T-T-TCG--TGAAGTTATCTTGAgttt
gi|52928                      :    AATTTA-G-TAA-TG-TT--G--G--C--T----T-T-----T-T--G---T-T-TT--C---A--T---GGCA---ACAG-AAA----TA-----TGT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--A-----C-CA-T---A---TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----A------AGAC--C-------GTTA---GG-T-----TCACA------TG----TGT--A--C-AA--A---A--T-T-TCG--TGAAGTTACCgaacttt
gi|52948                      :    AATTTT-G-TAA-TG-TT--C--A--C--T----A-T-----T-T--A---T-T-T---CG--A--T---GGTA---ACAG-AAA----A----A-TGT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--T-----T-CT-T---A---TAG----C---AAA--------CGA----CA--------C--A--A-C-----T------GGGC--C-------ACTA---CG-T-----TTACA------TT----TAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAGGTTACCGTGAaaag
gi|53025                      :    AATTTT-G-CCA--------G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-GAA----ATC----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---ACGTT--C-----A-C------A---TAC----C--AAAA--------GG-----TA--------C--T--A-C-----T------AGGC--C-------ACTA---GG-T-----TGATT------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGTAACCGTGAAtcagttt
gi|52946                      :    AATTTT-G-TAA-TT-TT--A--G--C--T----G-T-----T-T--G---T-T-T---CC--G--T---TGTA---ACAG-AAA----AAA-A--TAT----TG------ATAA-T-G-A-AA---AT--T--T-----G-CC-A---A---TAG----T--AATA--------GA-----CA--------C--T--T-C-----T------GCAC--C-------ACTA---GG-T-----TGACA------CG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TTG--CAAATGTACCTTAAAaggtttt
gi|52940                      :    AATTTA-G-TAA-TT-TT--G--T--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---AGTA---AAAG-AAA----AAA----TAT----CA------A-AA-T-T-A-AA---AC--T--T-----C-CTCA---A---TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------AGCC--A-------ACTA---GA-C-----TCATA------TT----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAGGTACCTTGAAtggtttt
gi|52953                      :    AATTTT-G-TTA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--C---T-T-TA--C---A--T---TGTA---ACAG-AAA----CAA-A--TAT----TG------AAAAAT-G-A-AA---AC--T--C----------AGATA---TAG----C--AAAA--------TA-----CATGTGTACAC--C--A-C-----T------AGAC--T-------ACCA---GG-T-----TGATA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--A-T-TCG--TGAAGTTAtcttttt
gi|52938                      :    AATTTC-G-TAA-TA-TT--G--G--C--T----A-T------------------------------------A---ACAG-AAA----AAA-----------TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--C--C-----C-TT-C---A---TAA----C--AAAA--------GT-----CA--------C--T--A-C-----T------AGAC--C-------AGTA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGTTACCTTGAAc
gi|52936                      :    AATTTT-G-TAC-GT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-TC--C---A--T---GGTA---ACAG---A----AAT-AT-TGT----TG------AAAA-T-G-C-AA---AC--G--T-----C-CA-C---A---TAC----C--CAAA--------GA-----TA--------C--GA-A-C-----T------AGGG--C-------ACTA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGATATTTTGAAcgtgttt
gi|52949                      :    AATTTT-G-TAA-TT-TT--G--G--C--G----T-T-----T-T--G---TGT-C---C---A--T---GGTA---ACAG-AAA----AAA----TAT----TGT-----AAAA-T-A-A-AA---CT--T--C-----A-AT-C---A---TAA----T--AAAAGACATGTGTA-----CA--------C--C--A-G-----T------AGAC--C-------ACAA---AG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AC--G---G--T-T-TCG--TGAAGTTATCATGaggtttt
gi|52929                      :    AAGTTT-G-TAA-TA-TT--A--T--C--T----A-T-----T-A--GA--T-T-C---C---A--T---ATTA---ACAG-AAA----ATA----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-A---A---CAG----C--AAA---------CG-----CA--------C--T--A-C-----T------AGAC--C-------ACTA---GG-T-----TGACA------TG----TAT-----T-AA--A---A--TAT-TCG--TGAAATTAggagcttt
gi|52962                      :    AATTTT-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T----G---T-T-T---CC--A--T---GAAA---ACAG-AAA----AAA-A--CAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---TC--T--T-----CACT-A-------TAC----C--AAAA--------GG-----TA--------T--T--A-C-----T------AGGC--A-------ACAA---GG-T-----TGAAG------TA----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-ATA--TGAAACTACCTTTAAc
gi|52924                      :    AACTTT-A-AAA-TT-TT--A--A--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CT--A--A---GGTA---ACAG-AAA----AAA-AAATAT----TGG-----ACA--T-A-A-AA---AC--T--T-----T-CC-C---A---TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--TCGA-CC----T------GAAC--C-------GTTA---TG-T-----TGACA------TG----TAA--A--C-AA--T---G--T-T-TCA--TGAAGTTACCTTGAA
gi|52956                      :    AATTTT-G-TAA-TT-TT--T--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGT-----CA-----------A-AC-TAT----TG------GAAA-T-T-A-AA----C--T--T-----C-TT-C---A---TAG----C--ATAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------AGTC--C-------ACTA---GA-T-----TGATA------AG----TGT--A--C--A--A---G--T-T-TCA--TGAAGTTACCTTGAA
gi|52963                      :    AATTCT-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T---------------------A---ACAC-AAA----AA---A-TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---GT--T--C-----C-CT-C---A---TAC----C--AAAA--------GG-----CA--------T--T--A-C-----C------ACAC--T-------ACTA---GG-T-----TTACA------TG----T-T--A--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAGTTAT-TTGAAcagtttt
gi|52966                      :    AATTTT-A-TGA-TA-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTT---ACAG-AAA----GAATAA-TG-------------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TAACAATT--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-T-----T------ATAT--C-------ATCA---GG-T-----TAACA------TA----TGT--A--T-AA--A---G--T-
gi|52965                      :    AATTTC-G-TAA-TT-TT--G--A--C--G----T-T-----T-T--G---T-T-TT--C---A--T---GGTA---ACAG-AAT----AAA-A--TAC----TG------AAAA-T-A-A-AAAAAAC--T--C-----C-CT-C---T---TGT----C--AAAA--------GG-----CA--------C--A--G-C-----T------ATAT--C-------ACTG---GG-T-----TAACG------TG----AGT--A--C-AA--C---G--T-T-TAG--TGAAGTTATCTTGAAaatttaaagtgttttttttaagtttt
gi|52930                      :    AATTTA-G-CAA-CT-TT--G--A--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---C---C--TT--GGTA---ACAT-AAA----ACA----TAT----TG------AAAA-T-A-A-AG---AT--A--C-----C-CC-A---A-----G----CC-AAAG--------TG-----CA-----------T--ATC-----T------AGAC--C-------AATA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--C---G--T-T-TCA--TGAAGTTACATTGAA
gi|52959                      :    AATTTT-G-TTT-TT-TT--G--G--A--T----A-T-----T----G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-AAA----CAA-AA-T------TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--T-----C-CA-C---A---TAT----C--AAGT--------GG-----TA--------T--T--A-T-----T------AGGC--C-------ACTG---GG-A-----TGACA------TG----TGT--A--T-TA--A---G--T-T-TCA--TGAAcggtttt
gi|52958                      :    AATTTA-G-TAA-AT-TG--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGCA---ACAG-AAA----ATA----TAT----TG------AAAA-T-T-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---T---TAC----C--AAAA--------GG-----CA--------A--T--A-C-----T------AGAC--T-------ATGA---CA-T-----TGACA------TG----TAT--A--T-AA--A---G--T-T-ACC--TGATGTAACCTTGAA
gi|52922                      :    AATTTC-G-TAA-CT-TT--T--G--A--T----A-A-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACTG-AAC----AAA----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-TT-C---A---AAG----C--AAAA--------AT-----AA--------C--T--A-C-----T------TGAC--T-------ACTA---GA-C-----AGACA------TA----TAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAACAACCTTGAAtggtttt
gi|52974                      :    AATTTC-A-TAA-TT-TT--G--A--C--T----T-A-----T-T--G---T-T-T---CT--A--T---GCTT---ACA---AA----ACA-AA-TAT----TG------ACAT-G-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TGG----C--AAAA--------GG-----CA--------A--T--A-C-----T------AGAC--C-------ACTA---AG-T-----TG----------------GC--A--C-AA--A---T--T-T-TAA--TGAAGTTATTTTGAAcagtttt
gi|52972                      :    AATTTT-T-TAA-TT-TT--A--G--C--T----A-TCGTAGT-T--G---T-T-T---CCATG--T---GGTA---ACAG-AAG----AAA----TAG----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-T---G---TAG----C--AAAT--------GG-----CA--------A--T--A-C-----T------AGAT--C-------ATTT---GG-TTACGGTAACA------CA----TGT--A--T-AA--A---G--T-T-TTG--TCAAATTTTCTTGA
gi|52932                      :    AGTTTT-G-TTA-TT-TT--G--G--A--T----A-T-----T-T--G---TGT-C---C---A--T---GGGA---A----AAA----CAA-GA-TAT----TG------AAAA-T-A-A-AA---AC--T--C-----A-AT-C---A---TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----C------TCAC--C-------ATCA---GG-A-----TGACT------CG----TGA--T--C-AA--A---C--A-T-TCG--TCGAGTTATCTTGAAgcactttt
gi|52957                      :    AATTTC-A-TAA-TT-TA--A--A--C--T----A-G-----T-T--G---T-T-T---CC--G--T---GGTA---ACAG-AAC----AAA----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--T-----C-CT-T---A---CAG----T--AAAA--------GG-----AA--------C--C--A-C-----A------TGAC--A-------ACTA---GA-A-----TGATA------TG----TGC--A--C-AA--A---G--T-T-TTA--TGAAACTATCTTTAAatgtttt
gi|52973                      :    AATTTT-T-TAA-AT-TT--G--G--C--T------T-----T-T--G---T-T-TT--C---A--T---AGAA---ACAG-AAA----AAT-CA-T------TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----T-CT-C---T---TAG----C--AAAA--------GG-----TA--------C--A--A-C-----T------TTAC--C-------AACA---GG-T-----TGATA------TG----TGC--A--C-CG--A--------T-TCG--TGAAGTTGCCTTGAAcagtt
gi|52978                      :    AATTTT-G-GAA-TT-GT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-AAA----AAA-TA-TTT----T----------A-T-ATG-AA---AC--A--A-----C-CT-G---------G----C--AAAT--------TT-----CA--------A--G--A-C-----G------AGGC--C-------ACTA---GG-T-----TGACA------TA----TGT--A--C-AG--A---G--T-T-ATA--AGAAGGTGCCTCGAAa
gi|52984                      :    AATTTA-G-TAA-TT-TT--T--G--C--T----T-C-----A-T--G---T-T-T---CC--A--T---GATA---ACAT-AAA----G------TGT---------------A-T-G-A-AA---AA--T--T-----C-CT-C---G---TA--------------------C------CA--------C--T--A-C-----T------AGAC--C-------ATGA---GG-T-----TGACA------TA----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCC--TGATGTTACCTTGAAcggtttt
gi|52941                      :    AATTTA-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-TC--C---C--T---GGAA---ACAG--AA----AAA-AA-TAT----TG-----------------AA---AC--T--T-----G-CG-A---A---TAG----C--AAAT--------GG-----CA--------C--T--A-T-----T------AGAC--C-------TCTA---CA-T-----TGGCA------TT----TAT--A--T-AA--A---
gi|52954                      :    AATTTC-A-TGACTT-TT--C--G--C--T----G-A-----C-T--G---TGT-C---C---G--T---GGTA---ACAG-AAC----AAG----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--CAACTCC-CT-A---A---CAG----C--AAAA--------AGG----CA--------C--T--A-C-----T------TGAC--C-------ACTA---AG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AATTAAATG--T-T-TCA--TGAA
gi|52982                      :    AACTTTAG-TAA-TT-GT--G--A--C--T----G-C-----T-C--G---T-T-T---C---C--TT--GATA---ACAG-AGA----AGA----TAT----TG------TAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----T-CA-A---A---TAG----T--AA-----------------------------------C-----T------ATGT--T-------ACTA---GT-T-----TAACA------TA----TTT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TAAAGTTACCTTAAAacttaaacagtttgaaagt
gi|52980                      :    AAATTT-G-TAA-GT-TT--G--A--C--T----A-T-----T-T--A---TGT-C---C---A--C---GGTA---A----ATT----ATT-AA-TAT----TG------AAAA-T-G-G-AA---AC--A--C-----T-GT-T-------TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----C------GGGC--C-------ACTG---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AT--A---T--T-T-CCG--TTAAGTTATCTTAAAtggtttt
gi|52927                      :    AATTTC-A-TAA-TT-AT--G--G--C--A----A-A-----T-T--G---TAT-T---A---A--T---ATCA---ACA--AAA----ACA-AA-TAT----TA------A-AA-T-G-A-AA---AT--T--C-----C-CT-C---T---TA-----T--CAAA--------TGGCATTCA--------T--T--A-C-----A------AGAC--C-------ACTA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--G--C--A--G---G--T-T-TCA--TGAAGTTACCTTGAAcggtttt
gi|52925                      :    AATATA-G-TAA-TA-TT--G--G--C--T----T-T-----A-T--G---T-T-T---CC--A--T-----TATTTACAG-AAA----AG-----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----T-CT-T---C---TAA----C--AAAA--------GA-----CA--------C--T--A-T-----T------AGGT--C-------ACTA---GG-T-----TGAAA------TA----TGT--A--T-AG--T---GTAT-T-TAG--TGAAGTTGGCTTCAA
gi|52968                      :    AATTTT-G-TAA-TA-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-TC--C---G--T---GGTA---ACAG-AAA----GAATAA-TGT------------A-AA-T-G-G-AA---A---T--C-----C-CT-T---A---TAG----A--AAAA--------AA-----CA--------C--C--A-C-----T------AGGgagtttt
gi|52937                      :    AATTGT-A-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-G-----T-T--G---T-T-T---C---CC-T---GGTA---ACAG-AAA----ATA----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---ACAAT--C-----C----A---A---TAG----C--ACCA--------GA-----CA--------C--T--A-C-----T------AGAC--C-------ACTA---GT-T-----TGGAA------TG----TAT--T--C-AA--A------T------------GCTATCTTGAttga
gi|52967                      :    AATTTT-A-TAA-TG-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-TC--C---A--T---GGTA---ACAG-AAA----GAATAA--------TG------AAAA-T-G-G-AA---AC--T--A-----A-CT-G---A---TAG----A--GAAA--------GA-----CA--------CCTT--A-C-----TAGACTAAGAC--C-------ACTA---GGTT-----TTACAGT----TA----TGT--A--C-caggttt
gi|52945                      :    AATTTC-A-TTA-TG-AT--G--G--A--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-AAC----ATT----TAT----TG------A-AA-T-G-A-AC---AC--T--T-----T-CT-T---A---TAG----C--TAAA--------GG-----CA--------C--C--A-AA----T------AGACAAC-------TTC-----G-T-----TGAAT------TG----TGC--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATATTACCTCAAA
gi|52991                      :    AAATTT-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-TC--C---A--T---GATA---ACAG-AAG----AAA-TA-T-------------------T-A-A-AA---AC--TA-T-----C-CT-----A---TAG----C--AGAA--------TG-----CA--------C--T--A-C-----T------A
gi|52939                      :    AATTTC-G-TAA-TT-TT--G--GGCT--T----A-C-----T-G--T---T-T-T---C---A--T---G--A---ACA-------------AA-CGC----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TAG----A--AACA--------AG-----CA-----------T--A-T-----A------AAAC--C-------ACTA---GA-T-----TGTGA------AG----TGT--A--C-AA--A---G--T-TCTGG--TAAAA-TATCTTGAA
gi|52989                      :    AATTTC-A-TAT-TT-TT--G--G--T--T----A-A-----C-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ATG---AA----ACA-AA-TAC----TG------CAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----T-CT-C---A---TAGCTT-T--AAA----------------CA--------C--T----------------------------------A---GG-T-----TGACA------AG----CAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAATTATATGGAAcggttt
gi|52981                      :    AATTTC-G-TAA-TG-TT--G--G--C--TG---A------------------------C---A--T---GGTA---ACAG-TAA----ATA----TAT----CG------AAAA-T-T-G-AA---AC--G--C-----C-TT-T---T---TAG----C--AGAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----C------AGAG--C-------ACTA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--T-AT--A---T--T-T-CCG--Tgg
gi|52983                      :    AATTTC-A-TAA-TA-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---C---A--A---AGCA---AT-T-AAA----ATA-AT-TGTAT--TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----G-CT-T---A---TAA----C--AAA---------TGT----CA--------T--T--A-C-----T------AGGC--C-------ACGT---GG-C-----TCACA------TG----TTT--A--A-AA--AAT-G--C-T-TT---TGAAGCTA
gi|52979                      :    AATTTT-A-TAA-TT-TT--G--A--CC-T----A-T-----A----G---T-T-T---C---AC-T---GGTA---ACAG---A----AAA-GA-TAT----TA------AATA-T-G-A-AA---AC-----A-----C-AA-A---A---AAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T----T-----T----------------------------G-T-----TGACA------TG----TCT--A--C-TG--A---A--T-T-TCG--TGAAGTTACATTGAAcaataaatgtttt
gi|52990                      :    AATTTT-G-TAA-TA-TT--C--A--C--A----A-T-----C-T--G---T-T-TC--C---G--T---GGTA---ACA--AAA----CAA-AA-TAT----TA------AAAA-T-A-G-AA---AC--T--C-----C-AT-T---A---TAG----C--AAAA--------AA-----TC--------C--T--A-C-----A------ATAC--C-------ACTA---TA-C-----TGACA------TG----TGC--A--A-AA--T---G--T-T-cggtttt
gi|52969                      :    AATTTT-G-TAA-TA-TT--A--G--C--T----A-T-----T-T--A---T-T-T---CT--A--T---GGTA---ATAG-AAA----TAA-----------TG------AAAA-T-G-G-AA---AC--T--C-----A-CT-C---A---TAG----A--GAAA--------GA-----CA--------T--C--A-C-----T------AGAC--
gi|52955                      :    AATATA-G-TAA-TT-TT--A--G--C--T----C-T-----A-T--G---T-T-T---C---CC-T---GTTA---ACAG-AAA----AA-----TTT----TGCGCTCAACAA-T-A-GCAA---A---------------T-G---A---TAC----T--A-----------CA-----TA-----------T--A-C-----A------AGAC--A-------ACTA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---A--G-T-TCG--TGAAGTTAtaagaccactaggtt
gi|52923                      :    AATTTT-G-TAA-TT-TT--G--G--T--T----A-T-----T-T--A---T-T-TC--C---A--T---GGTA---ACAG--AA----AAA-TA-TAT----TG------AAAT-T-T-A-AA---AC--T--C-----
gi|52988                      :    AAATTA-G-TAA-TT-TT--G--A--T--T----T-T-----T-TAAG---T-T-T---C---CC-T---GATA---ACAG-AAA----AA-----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CC-A---A---TAG----C--AAAA--------GG-----CT--------T--T--A-C-----T------
gi|52992                      :    AATTTT----TA-AT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-AAA----AAATAA--------TA------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----A-CT-gaacatcacta
gi|52977                      :    AATTTC-G-TAA-TA-TT--T--G--C--T----A-A-----T-T--G---T-T-AA--C---A--T---AAAA---ACGG-AAC----AAA----TAT----TG------GAAA-C-G-G-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---CAG----C--AAAA--------GA-----AA--------C--T--A-T-----T------TAAC--C-------ACTA---G-------------------------TGT--A--G-AA--A---G--T-T-tgtatcagaggg
gi|52995                      :     ATTTT-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---A-------------A-AA-TAT----TG------A----------AA---AC--T--C-----CGCT-A-------TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A---------------GAC--A-------ACAA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGTTACCTCAAA
gi|52994                      :     ATTTT-G-T-A-TTGTT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACGG-AAG----AAA-A--TAT----TG------AAAA-T-A-A-A-----C--T--C-----T-C------A---CAA----TCCAAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------ACAC--T-------ACTA---AG-T-----TGGCA------TA----TGT--A--C-AC--A---T--T-T-TTG--TGATGTTACCTTAAAtgatttt
gi|52993                      :     ATTTA-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAT-AAA----ATA----TAT----TA------A-AA-T-T-A-AA---TC--T--C-----T-CT-C---A---TAC----C--AAAA--------GG-----CA--------C--C--A-C-----T------AGAC--C-------TTGA---AG-T-----TGACA------CG----TTT--A--C-AA--A---G--T-A-TCC--TGATGTTACATTGGAtggtttt
gi|52996                      :     ATTTC-G-TAA-TT-TT--G--A--C--T----A-A-----T-T--G---T-----------A--T---GGTA---ACAG-AAC----AAA----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-TT-C---A---CAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------AGAC--C-------ATGA---GA-T-----TGAAA------AG----TGT--T--C-AT--A------T-T-TCC--TGATGTTACCTTGAAcggtttt
gi|52998                      :     ATTTT-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----T-A-----T-T--G---T-T-TC--C---A--T---GGTT---ACAG-AAA----AAA-A---------TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--T-----C-CT-C---A---TGG----C--GAAA--------GA-----CA--------C--T------------------GAC--C-------ACTA---GG-T-----GGGCA------TT----TGT--cagtttt
gi|52997                      :     ATGTT-G-TAA-AT-TT--G--G--C--T----G-C-----A-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACA--AAA----AAA-AA-TAT----TG------G-----------A---AC--T--T-----C-AT-C---A---TAG----C--AAAA----------------A--------C--C--A-C-----T------AGG---------------------T-----TGATA------TG----CAT--A--C-AA--A---T--T-T-TCG--TGAATATATCTT
gi|53004                      :      TTTT-G-TAA-TG-TT--T--G--C--T----A-T-----T-C--G---T-T-T---CC--A--C---GGAA---ACAG-AAA----AAA-AA-TG-------------AGAA-T-G-A-AA---TC--T--C-----C-CT-T---A---TAG----C--AAAA--------AG-----TT--------C--T--A-C-----A------AGAC--C-------TCCA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--A-AA--T---G--T-T-TCG--TAATGTTATCTTTAA
gi|53000                      :      TCTT-G-T---TT-TT--ACTA--C--T----G-T-----T-T--G---T-T-TTTAC---T--T---TGTA---ACAG-GAA----AAT-A--TGT----TA------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TAC----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------ACAA--C-------TCAA---GG-T-----TGATA------TG----TAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATGTTATCTTGAA
gi|53002                      :      TTTT-T-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--C---T-T-TA--C---A--T---TGTA---ACA--AAA----AAA-AT-TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----A-GT-C---A---TAG----T--AAAAGACATATGTA-----CA--------C--C--A-C-----T------AGAC--T-------ACCA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--CAAA--A---G--A-T-TCG--TGAAGTTAtggtttt
gi|53006                      :      TTTC-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----G-T-----T-T--GA--T-T-T---C---A--T---AGAA---ATA----A----AAA-AG-TAT----TG-------CAA-TTG-A-AA---AC--T--C-----T-CT-C---A---TAG----C--AAAA--------TT-----GA--------C--T--T-A-----T------ATGC--TAACAG--TCCATAAGG-T-----TGACAATCACATG----TGT--A--C-AA--A---A--T-T-TCG--TGAAGCTATCTCGActataaacggtttt
gi|53001                      :      TTTC-A-TAA-TT-TT--C--A--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-AAA----AA-----TAT----TT------AAAA-T-G-A-AA---AC--TTGC-----C-C------A---TAG----C--AAAA--------GG-----CC--------A--T--T-C-----T------GGAC--C-------ACTA---TG-T-----TGACA------TT----TGT--ATGC-CG--C---G--T-T-TCA--TGAAGTGACCTTGAA
gi|53005                      :      TTTC-G-TAA-TT-TT--G--G--A--T----A-A-----T-T--G---T-T-T---CC--A--C---GGTA---ACAG--AA----AAA-TA-TTT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----A-AT-C---A---TAC----CA-AAAA--------GG-----CA--------G--C--A-C-----T------AGAT--C-------ATCA---GC-T-----TGGCA------TG----TGT--T--A-AA--C---G--T-T-ACG--TGATGTTACCTTGAAtacttttt
gi|53003                      :      TTTT-G---A-TC-TT--G--G--C--T----A-A-----T----G---T-T-T---CC--G--T---GAAA---ATAG-AAA----CAA-T--TAT----TG------A--------A-AA---AT--C--C-----T-TT-C---A---CAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------TGAC--C-------AACA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AT--ATT-G--C-T-T-GAATGAAATAATCTTGAAcgagttt
gi|53008                      :      TTTT-GCTGA-TA-TT--G--A--CAATG---A-T-----TCT--G---T-TCT---C---ACCT---GGAA---ACAC-ACAGGTTAAATAA-TAT----AG------AAAA-T-T-A-AA----C--T--C-----T-CT-C---A---CAA----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------TGAT--G-------ACTA---GG-T-----TGACA------TG----TAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAACTAa
gi|53009                      :       TTT-G-T-A-TA-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-TC--C---A--T---GGTA---ACAG--AA----ATA-AA-TAT----TG------AAAA-T-G-T-TA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TAT----T--CAAA--------GG-----AA--------C--T--A-C-----T------AAAC--CACATTTATACAT--AG-C-----CGATA------TG----TAT--A--C-AA--A---G--T-G-TCT--TGAAATTACCTTTAAataccctgaacagttt
gi|52975                      :       TTT-A-TTA-TT-TTT-G--G--C--CGAACA-G-----T-T--G---C-------C---A--T---GGTA---ACAG-ATT----AAA----TAC----TG------AAAA-T-G-A-AA---AT--T--C-----C-CT-C---A---TAG----C--AAAG--------GG-----CA--------C--T--A-A-----A------CGAC--T-------GCTA---GG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AC--G---T--T-T-TTG--TTAAATTATCTTGAA
gi|52931                      :     aaTTT-G-ATA-GT-TT--GA-G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CT--A--T---GGTA---ATAG-GAA----ATA-TA-TATATTTTG------AAAA-T-G-A-AA---AA--T--C-----T-CT-T---A---TGC----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-T-----T------AGAT--C-------ATCA---AG-C-----GGATA------GA----TGT--A--C-AC--A---T--T-T-TCC--TGATGTTGCCTTGAAcggtttt
gi|53011                      :     aaTTT-G-TAA-TT-TT--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-TC--C---A--T---AGTT---ACAG-AAA----ACA-----------TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---CAA----C--AAAG--------T------CA--------C--T--T-C-----T------AGAT--C-------AAGA---GC-T-----CAGCA------TG----CGT-----C-A----------T-G-CCG--TGAAGTTATCTTGcgctttt
gi|53012                      :       TTT-G-TTA-TT-TT--G--A--T--T----A-T-----T-T--G---T-T-TC--C---A--T---GGTA---AC----------AAA-AC-TAT-------------CAA-G-G-A-AACT-AC--C--CAA---C-CC-A---A---TAG----C--AAAA--------TG-----CA--------T--T--A-C-----T------AGAT--C-------ACTA---TG-T-----T--TG------TG----TGT--A--C-AA--T---G--T-
gi|53016                      :        TT-G-TAA-TC-TC--G--A--A--G----A-T-----T-T--G---T-T-T---CCA-A--TTCAGGTA---ACAG-AAA----AAA-----------TG------AAAA-G-G-A-AA---TC--T--C-----C-CT-C---A---T-G----T--CAAA--------AG-----GA--------C--T--G--------------AGAC--C-------ACTA---CG-G-----TGACAGTCA--TG----TGT--A--C-AA--A---A--T-T-TTG--TGAAGTTACCTCAAA
gi|53026                      :               A-TT-TT--G--GG-T--T----G-T-----T-A--G---T-T-TT--C---A--T---GGTA---ACAG-AAA----AAA----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AT--T--C-----G-CC-A---A---TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-T-----A------AGAC--C-------ACAA---GG-T-----TGACAG-----TA-----GT--A--C-AC--A---G--T-T-ATG--TCAAGTTACCTTGAAtggtttt
gi|53024                      :              aA-CT-TT--G--C--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACA----A----AAA-AA-TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CA-A---A---TAA----C--AAAA--------GG-----CA--------T--T--A-C-----T------AGAG--C-------ATGA---AT-T-----TGAAA------TG----TGT--A--G-AA--T---A--T-T-TTG--TGATGATACCTTGAA
gi|52960                      :              aA-TT-TT--G--G--T--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-AAA----ATG----TAT----TA------AAAA-T-G-A-AC---TCA-T--C-----C-CT-A---GCCCTAG----C--AATA--------GG-----CA--------T--T--A-C-----T------GGAT--C-------ACT----GG-A-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---A--T-T-TCG--TG-AGTTACCTTGAAtgttttt
gi|53028                      : aattattgtagcaaA-TT-TG--G--G--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---C------------------CAGGAAA----AAA-AA-TGT----TG------AAAA-C-A-A-AA---TC--T--C-----C-AC-A---A----AG--------------------G-----CA--------C--T--A-C-----T------GGAT--C-------ACTA---GA-T-----TGACA------TT----TGT--A--C-AA--T---G--T-G-TCA--TGAAGTTACCGTGGAcggtttt
gi|53021                      :              aA-TT-CT--G-----T--T----AGT-----T-T--G---T-T-T---C------T---AGTATA-ACAG-AAA----AGA-CA-GA------G------AAAA-C-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TAG----C--AAAA--------TG-----CA--------C--A--T-C-----A------AGAC--C-------ACAA---GA-T-----TGACA------TACATGTGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCT--TGAAAATAGCTTGAActgtttt
gi|53032                      :              ta-TT-TT--T--G--C--T------------T-T--GAGTT-T-C---C---C--T---GGTA---ACAA-AAA----AAA-AA-TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--T-----C-CC-A---A---AAG----C--AAAT--------GA-----CA--------C--T--T-C-----T------AG------------CCCATT-GA-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGCAGTTACATTGAtggttt
gi|52952                      :                -TT-TT--G--G--C--T----A-A-----T-T--G---T-T-T---CC--G--T---GATA---ACAG-AAC----AAG----TAT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--CAACTCC-CT-G---A---CAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------TGAC--C-------ACTA---AG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AATTAAATG--T-T-TCA--TAAAATTtagtttt
gi|53033                      :     aatttcacgat-TT-TT--G--G--A--T----A-A-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---A-----------AAA-AA-TAG----CG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---CAT----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------TGAC--C-------AGTA---AG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-taaacagtttt
gi|53031                      :                -TT-TT--G--G--T--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAA-AAA----AA-------T----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CA-T---A---CAA----C--AAAA--------GG-----CA--------C--A--A-C-----T------TGAC--C-------ACTA---GG-A-----TGACA------TG----TGC--A--T-TA--A---A--T-T------AAAAGTTATC
gi|53034                      :                -TT-TT--G--G--T--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---ACAG-AAA----AA-----TAT----TG------A--A-T-A-T-GA---GC--T--C-----C-TC-A---A---------------AC--------CA-----CA--------C--T--A-C-----T------GGAC--A-------TT-A---GG-T-----CGCGA------TG----TGT--A--C-AA--C---G--T-T-TCA--CGAATTTATTCTGAA
gi|52986                      :                -TT-TT--G--G--T--T----A-A-----C-T--G---T-T-TT--C---A--T---GGCA---AAAG-AAC----AAT----TAC----TG------AAAA-T-G-A-AA---TC--T--C-----C-TT-G---A---TAC----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--T-A-----A------AGAC--C-------ACGT---GA-T-----TAA-A------CA----TAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TAATGTTACCTTAAAtggtttt
gi|53018                      :        aattacatatT-TT--G--G--C--T----G-T-----T-G--G---T-T-T---CC--A--T---GGTA---GCAG-ATA----ATA----TAT----TG------AAAA-G-G-A-AA---AC-----C-----C-CT-T---A---TAC----C--AAA---------TGT----CA--------C--T--A-C-----T------AGAC--C-------ATGA---TA-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGATGTTAACTTGA
gi|53019                      :             gtaagT-TT--G--G--C--C----T-T-----T-G--G---T-T-TG--C---A--T---GGTA---ACAG-ATA----ATA----TAT----TA------AAAA-G-G-T-AA---AC--C--C-----T-CT-T---A---TGC----T--AAAT--------GG-----CA--------C--T--A-C-----A------AGAC--C-------ATGA---TG-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAGGTTATC
gi|53036                      :             gtaagT-TT--G--A--T--A----A-T-----T-T--G---T-T-T---CT--G--T---AGTA---A--G-AGA----TAA-AA-TAT----TG------AAAG-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-TT-G---A---TAG----C--AAAA--------GG-----AA--------C--T--A-----------------------------------GG-T-----TAACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGTTAACATGAA
gi|53020                      :                  T-TT--G--A--C--T----A-T-----T-T--G---T-T-T---CC--A--T---GG-A---A-AG-AAA----GAA-TA-GCT----TT------AAAA-T-G-G-AA---AC--T--C-----T-CT-C---A---TAG----C--AATC--------TA-----TA--------C--T--A-T-----T------AGAC--C-------ACTA---AG-T-----TTACA------AG----TGT--A--T-AA--A---G--T-T-TTG--TCAAGTTGTTTTAAcatttt
gi|53039                      :                             gtaag----A-T-----T-T--G---C-T-T---CC--A--T---CGTA---ACAG-AAA----AAA----TAT----TG------AAAA-T-A-A-GA---A------------------------------------AAG--------GG-----CA--------C--T--A-T-----T------AGAC--C-------ACAT---GG-T-----TGCCA------TG----TGT--A--T-GA--A---G--T-T-TCT--TGAAGTTAtggtttt
gi|53040                      :                                         -----T-T--G---TGT-T---G---G--T---GGTA---ACAG-AAA----AAT-A--TGT----TG------AAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CT-C---A---TAG----C--AAAA--------GG-----CA--------C--T--A-C-----T------ACAA--C-------TCAT---GA-T-----TGACA------TA----TAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATATAACCTTGAAc
gi|53035                      :                                                    ---T-T-C---C---A--T---GGTA---ACAA-GAA----AAA-AC-T-T----TA------A------A-A-AA---AC--C--C--------------A---TAG----C--AAGA--------TA-----TA--------C--T--A-C-----A------AGAC--C-------ACTA---GC-T-----TGACA------TG----TAT--G--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGTTATCTTGAAcaatttt
gi|53044                      :                                                                            tttcgttatcccc----AAA-AA-TAT----TT------CAAA-T-G-A-AA---AC--T--C-----G-CC-A---A---TAG----C--TAAA--------GG------------------T--A-A-----T------AGAT--C-------ACTA---GA-T-----TGACA------TG----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGTTAcggtttt
gi|53048                      :                                                                                               A-AA-TGT-----A------AAAA-C-T-A-AA---AC--T--C-----C-CC-C---A---TAG----C--AAAA--------GG-----AA--------C--T--A-C-----T------ACAC--C-------ACTA---GG-T-----TAACA------TG----TAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--TTAAGTTATCTTGacagttacctcaaacagtttt
gi|52926                      :                                                                                                  A-TGT----TG------AACA-T-G-A-AA---AC--T--C-----T-TC-C---A---TA-----T--AAAA--------GA-----CA--------C--T--T-C-----T------AGAC--C-------ACTA---AG-T-----TGACA------TG----TGC--G--C-AAG-G---G--T-T-TCA--CGAAGTTACCTTGAAgtttt
gi|52976                      :                                                                       aaatttgtaattttggcaataattatgttttc----TG------AAAA-T-G-A-AA---CC--T--C-----C-TT-C---A---TAC----T--AAAA--------GG-----GA--------C--T--A-C-----T------AGGC--C-------ACTA---AG-T-----CGACA------TG----TAT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--CGAAGTTATCTTGGAcagtttt
gi|53051                      :                                                                                       aatttagtatgtttggctattacttgatatag-T-G-A-AA---AC--T--C-----C-CC-C---A---TAC----C--AAAA--------GG-----CT--------C--T--T-A-----T------AGAC--C-------ACTA---CA-T-----TAATG------TA----TGT--A--C-AA--A---G--T-T-TCG--CGATGTTACCTTGAAgtt

lowQualScore                  :                                                                                                          11111                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                  4    0    0 0000 0 11 0 0 11111 0 00       22 00    000    000  0000 00 99999 0 00 0000  0     0    00 000 00  22222  0 000  1111   00 1111    22222 44444444  111111 000 111 1111 1 22222 222222 000   00   000 0 11111  0 11111  222222  00 1111   0   00 0  11 222 00 0 0   00      000         
lowQualScore                  :                                  .    .    . .... . .. . . ..... . ..       .. ..    ...    ...  .... .. ..... . .. ....  .     .    .. ... ..  .....  . ...  ....   .. ....    ..... ........  ...... ... ... .... . ..... ...... ...   ..   ... . .....  . .....  ......  .. ....   .   .. .  .. ... .. . .   ..      ...         
lowQualScore                  :                                  9    4    9 9999 9 00 4 8 00000 4 66       33 66    777    777  9999 55 22222 4 66 9999  8     4    55 777 99  66666  4 777  3333   66 3333    00000 44444444  222222 777 333 8888 2 88888 333333 777   66   777 4 44444  4 00000  111111  66 5555   4   66 4  66 777 66 4 5   66      999         
consensus                     :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTTGAA
Reference ( family-219 )      :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTTGAA
gi|52918                      :                             AATTTTGTCA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTC-A--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-G--T----TG-ACAAT-AAAA--A---C--TC-----CC-T---AA----TAG--T----AAAA-----C--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GGC--CTC---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TAT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCTTGAA
gi|52921                      :                             AATTTTGTAT-TTTTTA----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---AAAG--AAG----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-TAAA--A---C--TC-----CT-T---CA----CAG--C----AAAA-----G--------GA------A---C---T----A-C-----T------A---GG---CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--C---A--T-T-TCG--TGAAGT---TATTTTGAA
gi|52922                      :                             AATTTCGTAA-CTTT-T----G-A--T-A-A-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACTG--AAC----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CT-T---CA----AAG--C----AAAA-----A--------TA------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--TAC---T-A-----GA-C-----AG------AC--A----TAT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAAC---AACCTTGAA
gi|52923                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-G----G-T--T-A-T-----T-T--ATTTCCA--T--GGTA---ACAG---AA----A-AA-T--AT-A--T----TG-AAATT-TAAA--A---C--TC-----cagtttt
gi|52924                      :                             AACTTTAAAA-TTTT-A----A-C--T-A-T-----T-T--GTTTCTA--A--GGTA---ACAG--AAA----AAAA-A--AT-A--T----TG-GACAT-AAAA--A---C--TT-----TC-C---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---TCG--ACC-----T------G---AAC--CGT---T-A-----TG-T-----TG------AC--A----TGT-AAA--C-AA--T---G--T-T-TCA--TGAAGT---TACCTTGAA
gi|52925                      :                             AATATAGTAA-TATT-G----G-C--T-T-T-----A-T--GTTTCCA--T----TATTTACAG--AAA----A-G------T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----TC-T---TC----TAA--C----AAAA-----G--------AC------A---C---T----A-T-----T------A---GGT--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AA--A----TAT-GTA--T-AG--T---GTAT-T-TAG--TGAAGT---TGGCTTCAA
gi|52926                      :                             AATTT-GTAA-TTTT-G----G-CAAT-AAT-----TAT--GTTTTCA--T--G---------------------------------T----TG-AACAT-GAAA--A---C--TC-----TT-C---CA----TA---T----AAAA-----G--------AC------A---C---T----T-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GCG--C-AAG-G---G--T-T-TCA--CGAAGT---TACCTTGAAgagtttt
gi|52927                      :                            aAATTTCATAA-TTAT-G----G-C--A-A-A-----T-T--GTATTAA--T--ATCA---ACA---AAA----A-CA-A--AT-A--T----T--AAAAT-GAAA--A---T--TC-----CC-T---CT----TAT--C----AAAT-----G--------GC------A---T---TCATTA-C-----A------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTG--C--A--G---G--T-T-TCA--TGAAGT---TACCTTGAAcagtttt
gi|52928                      :                             AATTTAGTAA-TGTT-G----G-C--T-T-T-----T-T--GTTTTCA--T--GGCA---ACAG--AAA----T-A------T-G--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TA-----CC-A---TA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----A------A---GAC--CGT---T-A-----GG-T-----TC------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---A--T-T-TCG--TGAAGT---TACC
gi|52929                      :                             AAGTTTGTAA-TATT-A----T-C--T-A-T-----T-A--GATTCCA--T--ATTA---ACAG--AAA----A-TA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---AA----CAG--C----AAAC-----G---------C------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-AT---T-AA--A---A--TAT-TCG--TGAAAT---TACaaag
gi|52930                      :                             AATTTAGCAA-CTTT-G----A-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCT--T--GGTA---ACAT--AAA----A-CA-----T-A--T----TG-AAAAT-AAAG--A------TA-----CC-C---CA-----AG--C----CAAA-----GT-------GC------A-------T----ATC-----T------A---GAC--CAA---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--C---G--T-T-TCA--TGAAGT---TACATTGAA
gi|52931                      :                             AATTTGATAG-TTTG-A----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCTA--T--GGTA---ATAG--GAA----A-TA-T--AT-A--TATTTTG-AAAAT-GAAA--A---A--TC-----TC-T---TA----TGC--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-T-----T------A---GAT--CAT---C-A-----AG-C-----GG------AT--A----GAT-GTA--C-AC--A---T--T-T-TCC--TGATGT---TGCCTTGAAcggtttt
gi|52932                      :                             AGTTTTGTTA-TTTT-G----G-A--T-A-T-----T-T--GTGTCCA--T--GGGA---A-----AAA----C-AA-G--AT-A--T----TG-AAAAT-AAAA--A---C--TC-----AA-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----C------T---CAC--CAT---C-A-----GG-A-----TG------AC--T----CGT-GAT--C-AA--A---C--A-T-TCG--TCGAGT---TATCTTGAAcgctttt
gi|52935                      :                             AATTTTGTAA-CTTT-C----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCG--C--GATA---GCAG--AAA----C-A------T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TA-----TC-T---CG----TAG--T----AAAA-----C--------GT------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--TGC---T-G-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-GA--A---G--T-T-TCG--TTAAGT---TATCTTGAAatgtttt
gi|52936                      :                             AATTTTGTAC-GTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----T-AT-----T-G--T----TG-AAAAT-GCAA--A---C--GT-----CC-A---CA----TAC--C----CAAA-----G--------AT------A---C---G----AAC-----T------A---GGG--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGA---TATTTTGAAcggtttt
gi|52937                      :                             AATTGTATAA-TTTT-G----G-C--T-A-G-----T-T--GTTTCCC--T--GGTA---ACAG--AAA----A-TA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---CAATC-----C------AA----TAG--C----ACCA-----G--------AC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GT-T-----TG------GA--A----TGT-ATT--C-AA--A---aggtttt
gi|52938                      :                             AATTTCGTAA-TATT-G----G-C--T-A-T-------------------------A---ACAG--AAA----A-AA---------------TG-AAAAT-GAAA--A---C--CC-----CT-T---CA----TAA--C----AAAA-----G--------TC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAG---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTTGAAtgctatcttgacaggttt
gi|52939                      :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----GGC--T-T-A-----C-T--GTTTTCA--T--G--A---ACA---------------A--AC-G--C----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--A----AACA-----A--------GC------A-------T----A-T-----A------A---AAC--CAC---T-A-----GA-T-----TG------TG--A----AGT-GTA--C-AA--A---G--T-TCTGG--TAAAA----TATCTTGAAcgtgttt
gi|52940                      :                             AATTTAGTAA-TTTT-G----T-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--AGTA---AAAG--AAA----A-AA-----T-A--T----C--AAAAT-TAAA--A---C--TT-----CC-T---CAA---TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GCC--AAC---T-A-----GA-C-----TC------AT--A----TTT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAGG---TACCTTGAAcggttt
gi|52941                      :                             AATTTAGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCC--T--GGAA---ACAG--AAA----A-AA-A---T-A--T----TG-AAA-------------C--TT-----GC-G---AA----TAG--C----AAAT-----G--------GC------A---C---T----A-T-----T------A---GAC--CTC---T-A-----CA-T-----TG------GC--A----TTT-ATA--T-AA--A---tcttttt
gi|52942                      :                             AATTTTGTCA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T----GTCTTCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-G--T----TG-ACAAT-AAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----AC-------AC------A---T---T----A-C-----T------A---GGT--CTC---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AG--A---A--T-T-TCA--TGAAGT---TACATTGA
gi|52945                      :                             AATTTCATTA-TGAT-G----G-A--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG----A----A-CA-T--TT-A--T----TG--AAAT-GAAC--A---C--TT-----TC-T---TA----TAG--C----TAAA-----G--------GC------A---C---CA---A-A-----T------A---GAC--AAC---T-T-----CG-T-----TG------AA--T----TGT-GCA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATAT---TACCTCAAAtagctt
gi|52946                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-A----G-C--T-G-T-----T-T--GTTTCCG--T--TGTA---ACAG--AAA----A--A-A--AT-A--T----TG-ATAAT-GAAA--A---T--TT-----GC-C---AA----TAG--T----AATA-----G--------AC------A---C---T----T-C-----T------G---CAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----CGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--CAAATG---TACCTTAAA
gi|52947                      :                             AATTTTGTTA-TTTT-T----G-C--T-A-T-----T-T--CTTTACA--T--TGTA---ACAG--AAA----C-AA-A---T-A--T----TG-AAAAT-AAAA--A---C--TC-----AA-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------AC------ATGTC---T----A-CACCAAT------A---GAC--TTC---A-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--G---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCTTGAtggtttt
gi|52948                      :                             AATTTTGTAA-TGTT-C----A-C--T-A-T-----T-T--ATTTCGA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-A------T-G--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----TC-T---TA----TAG--C----AAAC-----G--------AC------A---C---A----A-C-----T------G---GGC--CAC---T-A-----CG-T-----TT------AC--A----TTT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAGGT---TACCGTGAgagcttt
gi|52949                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--G-T-T-----T-T--GTGTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-----T-A--T----TGTAAAAT--AAA--A---C--TT-----CAAT---CA----TAA--T----AAAA-----G--------AC------A---TGTGT----A-CACCAGT------A---GAC--CAC---A-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AC--G---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCATGtcagttt
gi|52950                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-C----A-C--T-A-T-----T-C--GTTTCGA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-A------T-G--T----TG-AGAAT--AAA--A---C--TT-----TC-T---CA----TAG--T----AAAC-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------G---GGC--CAC---T-A-----GG-T-----TT------AC--A----TTT-ATA--C-AA--A---G--C-T-TCG--TGAGGT---TACCATGAggagcttt
gi|52951                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-G-T-----T-T--GTGTCCA--T--AGTA---AC-----AA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-AAAA--T---C--TC-----AA-T---CA----TAG--C----AAAA-----GATATGTGCAC------A---C---C----A-G-----T------A---GAC--CAC---A-A-----GG-T-----TG------ACATA----TGT-GTA--C-AC--G---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCTTGAgttt
gi|52952                      :                             AATTTCACGA-TTTTTG----G-C--T-A-A-----T-T--GTTTCCG--T--GATA---ACAG--AAC----A-AG-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TCAACTCCC-T---GA----CAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AATTAAATG--T-T-TCA--TAAAAT---Tgaacttt
gi|52953                      :                             AATTTTGTTA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--CTTTACA--T--TGTA---ACAG---AA----A-CA-A--AT-A--T----TGAAAAAT-GAAA--A---C--TC-----AG-A---TA----TAG--C----AAAATACATGTGT-----AC------A---C---C----A-C-----T------A---GAC--TAC---C-A-----GG-T-----TG------AT--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--A-T-TCG--TGAAGT---TACtaaacagtttt
gi|52954                      :                             AATTTCATGACTTTT-C----G-C--T-G-A-----C-T--GTGTCCG--T--GGTA---ACAG--AAC----A-AG-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TCAACTCCC-T---AA----CAG--C----AAAAA----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AATTAAATG--T-T-TCA--TGAA
gi|52955                      :                             AATATAGTAA-TTTT-A----G-C--T-C-T-----A-T--GTTTCCC--T--GTTA---ACAG--AAA----A-A------T-T--T----TG---------------------C-----GC-T---CAACAATAG--C----AAAT-----G--------AT------A---C---T----A-CATA--T------ACAAGAC--AAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---A--G-T-TCG--TGAAGT---TAacttaaacagtttgaaagt
gi|52956                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-T----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGT-----CA-------------A-A--CT-A--T----TG-GAAAT-TAAA------C--TT-----CT-T---CA----TAG--C----ATAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GTC--CAC---T-A-----GA-T-----TG------AT--A----AGT-GTA--C--A--A---G--T-T-TCA--TGAAGT---TACCTTGAA
gi|52957                      :                             AATTTCATAA-TTTA-A----A-C--T-A-G-----T-T--GTTTCCG--T--GGTA---ACAG--AAC----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----CC-T---TA----CAG--T----AAAA-----G--------GA------A---C---C----A-C-----A------T---GAC--AAC---T-A-----GA-A-----TG------AT--A----TGT-GCA--C-AA--A---G--T-T-TTA--TGAAAC---TATCTTTAAcagtttt
gi|52958                      :                             AATTTAGTAA-ATTG-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGCA---ACAG--AAA----A-TA-----T-A--T----TG-AAAAT-TAAA--A---C--TC-----CC-T---CT----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---A---T----A-C-----T------A---GAC--TAT---G-A-----CA-T-----TG------AC--A----TGT-ATA--T-AA--A---G--T-T-ACC--TGATGT---AACCTTGAAcagtt
gi|52959                      :                             AATTTTGTTT-TTTT-G----G-A--T-A-T-----T----GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----C-AA-A--AT---------TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----CC-A---CA----TAT--C----AAGT-----G--------GT------A---T---T----A-T-----T------A---GGC--CAC---T-G-----GG-A-----TG------AC--A----TGT-GTA--T-TA--A---G--T-T-TCA--TGAAtggtttt
gi|52960                      :                                     AA-TTTT-G----G-T--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG----A----A-AA-T--GT-A--T----TA-AAAAT-GAAC--T---CA-TC-----CC-TAGCCC----TAG--C----AATA-----G--------GC------A---T---T----A-C-----T------G---GAT--CAC---T-------GG-A-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---A--T-T-TCG--TG-AGT---TACCTTGAA
gi|52962                      :                aattattgtagcaAATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T----GTTTCCA--T--GAAA---ACAG--AAA----A-AA-A---C-A--T----TG-AAAAT-GAAA--T---C--TT-----CA-C---TA----TAC--C----AAAA-----G--------GT------A---T---T----A-C-----T------A---GGC--AAC---A-A-----GG-T-----TG------AA--G----TAT-GTA--C-AA--A---G--T-T-ATA--TGAAAC---TACCTTTAAcggtttt
gi|52963                      :                             AATTCTGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GT-------------A---ACAC--AAA----A----A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--G---T--TC-----CC-T---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---T---T----A-C-----C------A---CAC--TAC---T-A-----GG-T-----TT------AC--A----TGT--TA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAGT---TA-TTTGAA
gi|52965                      :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----A-C--G-T-T-----T-T--GTTTTCA--T--GGTA---ACAG--AAT----A-AA-A---T-A--C----TG-AAAAT-AAAA--AAAAC--TC-----CC-T---CT----TGT--C----AAAA-----G--------GC------A---C---A----G-C-----T------A---TAT--CAC---T-G-----GG-T-----TA------AC--G----TGA-GTA--C-AA--C---G--T-T-TAG--TGAAGT---TATCTTGAA
gi|52966                      :                             AATTTTATGA-TATT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTT---ACAG----A----A-AG-A--AT-A--A----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAA--CAATTAAAA-----G--------GC------A---C---T----A-T-----T------A---TAT--CAT---C-A-----GG-T-----TA------AC--A----TAT-GTA--T-AA--A---G--T-
gi|52967                      :                             AATTTTATAA-TGTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG----A----A-AG-A--AT-A--A----TG-AAAAT-GGAA--A---C--TA-----AC-T---GA----TAG--A----GAAA-----G--------AC------A---CCT-T----A-C-----TAGACTAA---GAC--CAC---T-A-----GGTT-----TT------AC--AGT--TAT-GTA--C-aatttaaagtgttttttttaagtttt
gi|52968                      :                             AATTTTGTAA-TATT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCG--T--GGTA---ACAG--AAA----G-AA-----T-A--A----TG-TAAAT-GGAA--A------TC-----CC-T---TA----TAG--A----AAAA-----A--------AC------A---C--------------------------------CAC---T-A-----GG-T-----TG------A
gi|52969                      :                             AATTTTGTAA-TATT-A----G-C--T-A-T-----T-T--ATTTCTA--T--GGTA---ATAG--AAA----T-AA---------------TG-AAAAT-GGAA--A---C--TC-----AC-T---CA----TAG--A----GAAA-----G--------AC------A---T---C----A-C-----TAGACTAA---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----T
gi|52972                      :                             AATTTTTTAA-TTTT-A----G-C--T-A-TCGTAGT-T--GTTTCCATGT--GGTA---ACAG----A----A-GA-A--AT-A--G----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---TG----TAG--C----AAAT-----G--------GC------A---A---T----A-C-----T------A---GAT--CAT---T-T-----GG-TTACGGTA------AC--A----CAT-GTA--T-AA--A---G--T-T-TTG--TCAAAT---TTTCTTGA
gi|52973                      :                             AATTTTTTAA-ATTT-G----G-C--T---T-----T-T--GTTTTCA--T--AGAA---ACAG--AAA----A-A------TCA--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----TC-T---CT----TAG--C----AAAA-----G--------GT------A---C---A----A-C-----T------T---TAC--CAA---C-A-----GG-T-----TG------AT--A----TGT-GCA--C-CG--A--------T-TCG--TGAAGT---TGCCTTGAAgcactttt
gi|52974                      :                             AATTTCATAA-TTTT-G----A-C--T-T-A-----T-T--GTTTCTA--T--GCTT---ACA----AA----A-CA-A--AT-A--T----TG-ACATG-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TGG--C----AAAA-----G--------GC------A---A---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TG-------------------GCA--C-AA--A---T--T-T-TAA--TGAAGT---TATTTTGAAa
gi|52975                      :                             AATTTATTAT-TTTT-G----G-C--CGA-A-----C-A--GTTGCCA--T--GGTA---ACAG--ATT----A-AA-----T-A--C----TG-AAAAT-GAAA--A---T--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAG-----G--------GC------A---C---T----A-A-----A------C---GAC--TGC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AC--G---T--T-T-TTG--TTAAAT---TATCTTGAA
gi|52976                      :                                                                                                            --AT-A--G----TG-AAAAT-GAAA--C---C--TC-----CT-T---CA----TAC--T----AAAA-----G--------GG------A---C---T----A-C-----T------A---GGC--CAC---T-A-----AG-T-----CG------AC--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--CGAAGT---TATCTTGGAcggtttt
gi|52977                      : aatttagtatgtttggctattacttgatAATTTCGTAA-TATT-T----G-C--T-A-A-----T-T--GTTAACA--T--AAAA---ACGG--AAC----A-AA-----T-A--T----TG-GAAAC-GGAA--A---C--TC-----CC-T---CA----CAG--C----AAAA-----G--------AA------A---C---T----A-T-----T------T---AAC--CAC---T-A--------------------------------GT-GTA--G-AA--A---G--T-T-gtt
gi|52978                      :                             AATTTTGGAA-TTGT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG----A----A-AA-A--AT-A--T----TT-TATAT-G-AA--A---C--AA-----CC-----------TGG--C----AAAT-----T--------TC------A---A---G----A-C-----G------A---GGC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TAT-GTA--C-AG--A---G--T-T-ATA--AGAAGG---TGCCTCGAA
gi|52979                      :                             AATTTTATAA-TTTT-G----A-CC-T-A-T-----A----GTTTCAC--T--GGTA---ACAG--AAA----A-GA-----T-A--T----TA-AATAT-GAAA--A---C--AC-----AA-A---AA-----AG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T------------------------------T---T--------G-T-----TG------AC--A----TGT-CTA--C-TG--A---A--T-T-TCG--TGAAGT---TACATTGAAcggtttt
gi|52980                      :                             AATTT-GTAA-GTTT-G----A-C--T-A-T-----T-T--ATGTCCA--C--GGTA---A-----ATT----A-TT-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GGAA--A---C--AC-----TG-T---T-----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----C------G---GGC--CAC---T-G-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AT--A---T--T-T-CCG--TTAAGT---TATCTTAAAcggtttt
gi|52981                      :                            aAATTTCGTAA-TGTT-G----G-C--T-G----------------ACA--T--GGTA---ACAG--TAA----A-TA-----T-A--T----CG-AAAAT-TGAA--A---C--GC-----CT-T---TT----TAG--C----AGAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----C------A---GAG--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--T-AT--A---T--T-T-CCG--Tcggtttt
gi|52982                      :                               TTTAGTAA-TTGT-G----A-C--T-G-C-----T-C--GTTTCCT--T--GATA---ACAG--AGA----A-GA-----T-A--T----TG-TAAAT-GAAA--A---C--TC-----TC-A---AA----TAG--T----AA---------------------------------------C-----T------A---TGT--TAC---T-A-----GT-T-----TA------AC--A----TAT-TTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TAAAGT---TACCTTAAA
gi|52983                      :                          aacAATTTCATAA-TATT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCAA--------A---GCAATTAAA----A-TA-ATTGT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----GC-T---TA----TAA--C----AAAT-----G--------TC------A---T---T----A-C-----T------A---GGC--CAC---G-T-----GG-C-----TC------AC--A----TGT-TTA--A-AA--AAT-G--C-T-TT---TGAAGC---TACtggtttt
gi|52984                      :                             AATTTAGTAA-TTTT-T----G-C--T-T-C-----A-T--GTTTCCA--T--GATA---ACAT--AAA----G--------T-G--T----------AT-GAAA--A---A--TT-----CC-T---CG----TA---C-----------------------C------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAT---G-A-----GG-T-----TG------AC--A----TAT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCC--TGATGT---TACCTTGAAaataaatgtttt
gi|52986                      :                             AATTACATAT-TTTT-G----G-T--T-A-A-----C-T--GTTTTCA--T--GGCA---AAAG--AAC----A-AT-----T-A--C----TG-AAAAT-GAAA--T---C--TC-----CT-T---GA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----T-A-----A------A---GAC--CAC---G-T-----GA-T-----TA------A---A----CAT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TAATGT---TACCTTAAA
gi|52988                      :                             AAATTAGTAA-TTTT-G----A-T--T-T-T-----T-TAAGTTTCCC--T--GATA---ACAG--AAA----A-------AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-C---AA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------T---T---T----A-C-----T------G---AACATCAC---T-A-----
gi|52989                      :                             AATTTCATAT-TTTT-G----G-T--T-A-A-----C-T--GTTTCCA--T--GGTA---AT----GAA----A-CA-A--AT-A--C----TG-CAAAT-GAAA--A---C--TC-----TC-T---CA----TAG-------------------------------------C---T------T-----T------A---AA---CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----AGC-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAAT---TATATGGAA
gi|52990                      :                             AATTTTGTAA-TATT-C----A-C--A-A-T-----C-T--GTTTCCG--T--GGTA---ACA---AAA----C-AA-A--AT-A--T----TA-AAAAT-AGAA--A---C--TC-----CA-T---TA----TAG--C----AAAA-----A--------AT------C---C---T----A-C-----A------A---TAC--CAC---T-A-----TA-C-----TG------AC--A----TGT-GCA--A-AA--T---G--T-T-gg
gi|52991                      :                             AATTT-GTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GATA---ACAG----A----A-GA-A--AT-A--T-----------T-AAAA--A---C--TA-----TC-C---TA----TAG--C----AGAA-----T--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---
gi|52992                      :                            aAATTTT-TAA-TTT--G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AATA--AT-A----------AAAAT-GAAA--A---C--TC-----AC-T---TG----TAT--C----AGAG-----G--------G
gi|52993                      :                              ATTTAGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAT--AAA----A-TA-----T-A--T----T--AAAAT-TAAA--T---C--TC-----TC-T---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---C---C----A-C-----T------A---GAC--CTT---G-A-----AG-T-----TG------AC--A----CGT-TTA--C-AA--A---G--T-A-TCC--TGATGT---TACATTGGA
gi|52994                      :                              ATTTTGTAT-TGTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACGG--AAG----A-AA-A---T-A--T----TG-AAAAT---AA--A---C--TC--------T---CA----CAATCC----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---CAC--TAC---T-A-----AG-T-----TG------GC--A----TAT-GTA--C-AC--A---T--T-T-TTG--TGATGT---TACCTTAAAcggtttt
gi|52995                      :                              ATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---A---------------A-A--AT-A--T----TG-AAAA------------C--TC-----CG-C---TA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A------------------GAC--AAC---A-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTCAAAtggtttt
gi|52996                      :                              ATTTCGTAA-TTTT-G----A-C--T-A-A-----T-T--GT----A--T--GGTA---ACAG--AAC----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CT-T---CA----CAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAT---G-A-----GA-T-----TG------AA--A----AGT-GTT--C-AT--A------T-T-TCC--TGATGT---TACCTTGAAtgatttt
gi|52997                      :                              ATGTTGTAA-ATTT-G----G-C--T-G-C-----A-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACA---AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG---------GA--A---C--TT-----CA-T---CA----TAG--C----AAAA-------------------------------------------------------AC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AT--A----TGC-ATA--C-AA--A---T--T-T-TCG--TGAATA---TATCTTcagtttt
gi|52998                      :                              ATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-T-A-----T-T--GTTTCCA--T--GGTT---ACAG--AAA----A-AA-A-------------TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----CC-T---CA----TGG--C----GAAA-----G--------AC------A---C---T-----------------------GAC--CAC---T-A-----GG-T-----GG------GC--A----TTT-GT
gi|53000                      :                                                   -C--T-G-T-----T-T--GTTTTTACTT--TGTA---ACAG--GAA----A-AT-A---T-G--T----TA-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---CAA--CTC---A-A-----GG-T-----TG------AT--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATGT---TATCTTGAA
gi|53001                      :                 tcttgtttttactaTTTCATAA-TTTT-C----A-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-A------T-A--T----TT-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----GC-C---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------C---A---T----T-C-----T------G---GAC--CAC---T-A-----TG-T-----TG------AC--A----TTT-GTATGC-CG--C---G--T-T-TCA--TGAAGT---GACCTTGAAtggtttt
gi|53002                      :                               TTTTTTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--CTTTACA--T--TGTA---ACA---AAA----A-AA-A--TT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----AG-T---CA----TAG--T----AAAA-----GACATATGTAC------A---C---C----A-C-----T------A---GAC--TAC---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--CAAA--A---G--A-T-TCG--TGAAGT---TACtacttttt
gi|53003                      :                                    TGA-TCTT-G----G-C--T-A-A-----T----GTTTCCG--T--GAAA---ATAG--AAA----C-AA-T---T-A--T----TG-AAAA--------A---T--CC-----TT-T---CA----CAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--CAA---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AT--ATT-G--C-T-T-GAATGAAAT---AATCTTGAAtataaacggtttt
gi|53004                      :                            tttTTTTGTAA-TGTT-T----G-C--T-A-T-----T-C--GTTTCCA--C--GGAA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT----------G-AGAAT-GAAA--T---C--TC-----CC-T---TA----TAG--C----AAAA-----A--------GT------T---C---T----A-C-----A------A---GAC--CTC---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--A-AA--T---G--T-T-TCG--TAATGT---TATCTTTAAa
gi|53005                      :                               TTTCGTAA-TTTT-G----G-A--T-A-A-----T-T--GTTTCCA--C--GGTA---ACAG---AA----A-AA-T--AT-T--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----AA-T---CA----TAC--CA---AAAA-----G--------GC------A---G---C----A-C-----T------A---GAT--CAT---C-A-----GC-T-----TG------GC--A----TGT-GTT--A-AA--C---G--T-T-ACG--TGATGT---TACCTTGAA
gi|53006                      :                               TTTCGTAA-TTTT-G----G-C--T-G-T-----T-T--GATTTCA--T--AGAA---ATA-----A----A-AA-A--GT-A--T----TG-CAATT-GAAA--A---C--TC-----TC-T---CA----TAG--C----AAAATT---G--------ACTTATATG---C---T----A-A-----C------A---GTC--CAT---A-A-----GG-T-----TGACAATCAC--A----TGT-GTA--C-AA--A---A--T-T-TCG--TGAAGC---TATCTCGAcgagttt
gi|53008                      :                                                          -T-----C-T--GTTCTCACCT--GGAA---ACAC--ACAGGTTA-AATA--AT-A--T----AG-AAAAT-TAAA------C--TC-----TC-T---CA----CAA--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAT--GAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAACTAATACCCTGAA
gi|53009                      :          ttttgctgatattgacaatgatTTTGTA--TATT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----T-AA-A---T-A--T----TG-AAAAT-GTTA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAT--T----CAAA-----G--------GA------A---C---T----A-C-----T------A---AAC--CACATTT-ATACATAG-C-----CG------AT--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-G-TCT--TGAAAT---TACCTTTAAcagttt
gi|53011                      :                                TTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--AGTT---ACAG--AAA----A-CA---------------TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----CAA--C-----AAA-----G--------TC------A---C---T----T-C-----T------A---GAT--CAA---G-A-----GC-T-----CA------GC--A----TGC-GT---C-A----------T-G-CCG--TGAAGT---TATCTTG
gi|53012                      :                                TTTGTTA-TTTT-G----A-T--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---AC-----------A-AA-A--CT-A--T----C----AAG-GAAACTA---C--CCAA---CC-C---AA----TAG--C----AAAA-----T--------GC------A---T---T----A-C-----T------A---GAT--CAC---T-A-----TG-T-----T--------T--G----TGT-GTA--C-AA--T---G--T-
gi|53016                      :                                 TTGTAA-TCTC-G----A-A--G-A-T-----T-T--GTTTCCAATTCAGGTA---ACAG--AAA----A-AA---------------TG-AAAAG-GAAA--T---C--TC-----CC-T---CA----TGT--C----AAAA-----G--------G-------A---C---T----G--------------A---GAC--CAC---T-A-----CG-G-----TG------AC--AGTCATGT-GTA--C-AA--A---A--T-T-TTG--TGAAGT---TACCTCAAA
gi|53018                      :                                   GTAA-GTTT-G----G-C--T-G-T-----T-G--GTTTCCA--T--GGTA---GCAG--ATA----A-TA-----T-A--T----TG-AAAAG-GAAA--A---C---C-----CC-T---TA----TAC--C----AAAT-----G--------TC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAT---G-A-----TA-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGATGT---TAACTTGAtggtttt
gi|53019                      :                                   GTAA-GTTT-G----G-C--C-T-T-----T-G--GTTTGCA--T--GGTA---ACAG--ATA----A-TA-----T-A--T----TA-AAAAG-GTAA--A---C--CC-----TC-T---TA----TGC--T----AAAT-----G--------GC------A---C---T----A-C-----A------A---GAC--CAT---G-A-----TG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAGGT---TATC
gi|53020                      :                                   GTAA-GTTT-G----A-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GG-------AA--AGA----A-AG-A--AT-AGCT----TT-AAAAT-GGAA--A---C--TC-----TC-T---CA----TAG--C----AATC-----T--------AT------A---C---T----A-T-----T------A---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TT------AC--A----AGT-GTA--T-AA--A---G--T-T-TTG--TCAAGT---TGTTTTAA
gi|53021                      :                                    TAA-TTCT-G------T--T-AGT-----T-T--GTTTCTA--G--TATA---ACAG--AAA----A-GA-C--AG-A--------G-AAAAC-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----T--------GC------A---C---A----T-C-----A------A---GAC--CAC---A-A-----GA-T-----TGACAT--AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCT--TGAAAA---TAGCTTGAAtggtttt
gi|53024                      :                                     AA-CTTT-G----C-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACA-----A----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-A---AA----TAA--C----AAAA-----G--------GC------A---T---T----A-C-----T------A---GAG--CAT---G-A-----AT-T-----TG------AA--A----TGT-GTA--G-AA--T---A--T-T-TTG--TGATGA---TACCTTGAAtggttt
gi|53025                      :                                     AA-TTTT-GCCAGG-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--GAA----A-TC-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--GT-----TC-A---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GT------A---C---T----A-C-----T------A---GGC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AT--T----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---AACCGTGAAtgttttt
gi|53026                      :                                     AA-TTTT-G----GGT--T-G-T-----T-A--GTTTTCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A----A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---T--TC-----GC-C---AA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-T-----A------A---GAC--CAC---A-A-----GG-T-----TG------AC--A-----GTAGTA--C-AC--A---G--T-T-ATG--TCAAGT---TACCTTGAAaggtttt
gi|53028                      :                                     AA-TTTG-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--------------GG--AAA----A-AA-A--AT-G--T----TG-AAAAC-AAAA--T---C--TC-----C--------------A--C----AAA------G--------GC------A---C---T----A-C-----T------G---GAT--CAC---T-A-----GA-T-----TG------AC--A----TTT-GTA--C-AA--T---G--T-G-TCA--TGAAGT---TACCGTGGA
gi|53031                      :                                       -TTTT-G----G-T--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAA--AAA----A-A-----------T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-A---TA----CAA--C----AAAA-----G--------GC------A---C---A----A-C-----T------T---GAC--CAC---T-A-----GG-A-----TG------AC--A----TGT-GCA--T-TA--A---A--T-T------AAAAGT---TATCctgtttt
gi|53032                      :                                       -TTTT-T----G-C--T-T-T-----G-A--GTTTCCC--T--GGTA---ACAA--AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----CC-C---AA----AAG--C----AAAT-----G--------AC------A---C---T----T-C-----T------A---GCC--CAT---T-------GA-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGCAGT---TACATTGA
gi|53033                      :                                       -TTTT-G----G-A--T-A-A-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---A------------A-AA-A--AT-A--G----CG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----CAT--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--CAG---T-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-tagtttt
gi|53034                      :                                       -TTTT-G----G-T--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG---------A-AA-A--AT-A--T----TG-AATAT-G--A--G---C--T------CC-T---CA----AAC--C----A------------------C------A---C---T----A-C-----T------G---GA---CAT---T-A-----GG-T-----CG------CG--A----TGT-GTA--C-AA--C---G--T-T-TCA--CGAATT---TATTCTGAA
gi|53035                      :                                         TTT-C----G-T--T-A-T-----C-C--CCTTCCA--T--GGTA---ACAA--GAA----A-AA-A--CT----T----TA-AAAA-----A--A---C--CC-------------A----TAG--C----AAGA-----T--------AT------A---C---T----A-C-----A------A---GAC--CAC---T-A-----GC-T-----TG------AC--A----TGT-ATG--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCTTGAAtggtttt
gi|53036                      :                                         TTT-G----A-T--A-A-T-----T-T--GTTTCTG--T--AGTA---A--G--AGA----T-AA-A--AT-A--T----TG-AAAGT-GAAA--A---C--TC-----CT-T---GA----TAG--C----AAAA-----G--------G-------A-------------------------------------AC---T-A-----GG-T-----TA------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGT---TAACATGAAcggtttt
gi|53039                      :                                                        -A-T-----T-T--GCTTCCA--T--CGTA---ACAG--AAA----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-AAGA--A-------------------------------------AAG-----G--------GC------A---C---T----A-T-----T------A---GAC--CAC---A-T-----GG-T-----TG------CC--A----TGT-GTA--T-GA--A---G--T-T-TCT--TGAAGT---TACcatttt
gi|53040                      :                                                            -----T-T--GTGTTGG--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AT-A---T-G--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T-----------AC--AAC---TCAT----GA-T-----TG------AC--A----TAT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATAT---AACCTTGAA
gi|53044                      :                                                                                                  ----A-AA-A--AT-A--T----TT-CAAAT-GAAA--A---C--TC-----GC-C---AA----TAG--C----TAAA-----G--------G---------------T----A-A-----T------A---GAT--CAC---T-A-----GA-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGT---TAcaatttt
gi|53048                      :                                                                                                         A-A--AT-G--T-----A-AAAAC-TAAA--A---C--TC-----CC-C---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GA------A---C---T----A-C-----T------A---CAC--CAC---T-A-----GG-T-----TA------AC--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TTAAGT---TATCTTGacagttacctcaaacagtttt
gi|53051                      :                                                                                                                  --T----TA-AAAATTGAAA--A---C--TC-----CC-C---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------T---C---T----T-A-----T------A---GAC--CAC---T-A-----CA-T-----TA------AT--G----TAT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--CGATGT---TACCTTGAAgtttt

lowQualScore                  :                                                                                                          11111                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                  4    0    0 0000 0 11 0 0 11111 0 00       22 00    000    000  0000 00 99999 0 00 0000  0     0    00 000 00  22222  0 000  1111   00 1111    22222 44444444  111111 000 111 1111 1 22222 222222 000   00   000 0 11111  0 11111  222222  00 1111   0   00 0  11 222 00 0 0   00      000         
lowQualScore                  :                                  .    .    . .... . .. . . ..... . ..       .. ..    ...    ...  .... .. ..... . .. ....  .     .    .. ... ..  .....  . ...  ....   .. ....    ..... ........  ...... ... ... .... . ..... ...... ...   ..   ... . .....  . .....  ......  .. ....   .   .. .  .. ... .. . .   ..      ...         
lowQualScore                  :                                  9    4    9 9999 9 00 4 8 00000 4 66       33 66    777    777  9999 55 22222 4 66 9999  8     4    55 777 99  66666  4 777  3333   66 3333    00000 44444444  222222 777 333 8888 2 88888 333333 777   66   777 4 44444  4 00000  111111  66 5555   4   66 4  66 777 66 4 5   66      999         
consensus                     :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTTGAA
Reference ( family-219 )      :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTTGAA
gi|52918                      :                             AATTTTGTCA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTC-A--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-G--T----TG-ACAAT-AAAA--A---C--TC-----CC-T---AA----TAG--T----AAAA-----C--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GGC--CTC---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TAT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCTTGAA
gi|52921                      :                             AATTTTGTAT-TTTTTA----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---AAAG--AAG----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-TAAA--A---C--TC-----CT-T---CA----CAG--C----AAAA-----G--------GA------A---C---T----A-C-----T------A---GG---CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--C---A--T-T-TCG--TGAAGT---TATTTTGAA
gi|52922                      :                             AATTTCGTAA-CTTT-T----G-A--T-A-A-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACTG--AAC----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CT-T---CA----AAG--C----AAAA-----A--------TA------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--TAC---T-A-----GA-C-----AG------AC--A----TAT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAAC---AACCTTGAA
gi|52923                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-G----G-T--T-A-T-----T-T--ATTTCCA--T--GGTA---ACAG---AA----A-AA-T--AT-A--T----TG-AAATT-TAAA--A---C--TC-----cagtttt
gi|52924                      :                             AACTTTAAAA-TTTT-A----A-C--T-A-T-----T-T--GTTTCTA--A--GGTA---ACAG--AAA----AAAA-A--AT-A--T----TG-GACAT-AAAA--A---C--TT-----TC-C---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---TCG--ACC-----T------G---AAC--CGT---T-A-----TG-T-----TG------AC--A----TGT-AAA--C-AA--T---G--T-T-TCA--TGAAGT---TACCTTGAA
gi|52925                      :                             AATATAGTAA-TATT-G----G-C--T-T-T-----A-T--GTTTCCA--T----TATTTACAG--AAA----A-G------T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----TC-T---TC----TAA--C----AAAA-----G--------AC------A---C---T----A-T-----T------A---GGT--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AA--A----TAT-GTA--T-AG--T---GTAT-T-TAG--TGAAGT---TGGCTTCAA
gi|52926                      :                             AATTT-GTAA-TTTT-G----G-CAAT-AAT-----TAT--GTTTTCA--T--G---------------------------------T----TG-AACAT-GAAA--A---C--TC-----TT-C---CA----TA---T----AAAA-----G--------AC------A---C---T----T-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GCG--C-AAG-G---G--T-T-TCA--CGAAGT---TACCTTGAAgagtttt
gi|52927                      :                            aAATTTCATAA-TTAT-G----G-C--A-A-A-----T-T--GTATTAA--T--ATCA---ACA---AAA----A-CA-A--AT-A--T----T--AAAAT-GAAA--A---T--TC-----CC-T---CT----TAT--C----AAAT-----G--------GC------A---T---TCATTA-C-----A------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTG--C--A--G---G--T-T-TCA--TGAAGT---TACCTTGAAcagtttt
gi|52928                      :                             AATTTAGTAA-TGTT-G----G-C--T-T-T-----T-T--GTTTTCA--T--GGCA---ACAG--AAA----T-A------T-G--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TA-----CC-A---TA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----A------A---GAC--CGT---T-A-----GG-T-----TC------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---A--T-T-TCG--TGAAGT---TACC
gi|52929                      :                             AAGTTTGTAA-TATT-A----T-C--T-A-T-----T-A--GATTCCA--T--ATTA---ACAG--AAA----A-TA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---AA----CAG--C----AAAC-----G---------C------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-AT---T-AA--A---A--TAT-TCG--TGAAAT---TACaaag
gi|52930                      :                             AATTTAGCAA-CTTT-G----A-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCT--T--GGTA---ACAT--AAA----A-CA-----T-A--T----TG-AAAAT-AAAG--A------TA-----CC-C---CA-----AG--C----CAAA-----GT-------GC------A-------T----ATC-----T------A---GAC--CAA---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--C---G--T-T-TCA--TGAAGT---TACATTGAA
gi|52931                      :                             AATTTGATAG-TTTG-A----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCTA--T--GGTA---ATAG--GAA----A-TA-T--AT-A--TATTTTG-AAAAT-GAAA--A---A--TC-----TC-T---TA----TGC--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-T-----T------A---GAT--CAT---C-A-----AG-C-----GG------AT--A----GAT-GTA--C-AC--A---T--T-T-TCC--TGATGT---TGCCTTGAAcggtttt
gi|52932                      :                             AGTTTTGTTA-TTTT-G----G-A--T-A-T-----T-T--GTGTCCA--T--GGGA---A-----AAA----C-AA-G--AT-A--T----TG-AAAAT-AAAA--A---C--TC-----AA-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----C------T---CAC--CAT---C-A-----GG-A-----TG------AC--T----CGT-GAT--C-AA--A---C--A-T-TCG--TCGAGT---TATCTTGAAcgctttt
gi|52935                      :                             AATTTTGTAA-CTTT-C----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCG--C--GATA---GCAG--AAA----C-A------T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TA-----TC-T---CG----TAG--T----AAAA-----C--------GT------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--TGC---T-G-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-GA--A---G--T-T-TCG--TTAAGT---TATCTTGAAatgtttt
gi|52936                      :                             AATTTTGTAC-GTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----T-AT-----T-G--T----TG-AAAAT-GCAA--A---C--GT-----CC-A---CA----TAC--C----CAAA-----G--------AT------A---C---G----AAC-----T------A---GGG--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGA---TATTTTGAAcggtttt
gi|52937                      :                             AATTGTATAA-TTTT-G----G-C--T-A-G-----T-T--GTTTCCC--T--GGTA---ACAG--AAA----A-TA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---CAATC-----C------AA----TAG--C----ACCA-----G--------AC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GT-T-----TG------GA--A----TGT-ATT--C-AA--A---aggtttt
gi|52938                      :                             AATTTCGTAA-TATT-G----G-C--T-A-T-------------------------A---ACAG--AAA----A-AA---------------TG-AAAAT-GAAA--A---C--CC-----CT-T---CA----TAA--C----AAAA-----G--------TC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAG---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTTGAAtgctatcttgacaggttt
gi|52939                      :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----GGC--T-T-A-----C-T--GTTTTCA--T--G--A---ACA---------------A--AC-G--C----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--A----AACA-----A--------GC------A-------T----A-T-----A------A---AAC--CAC---T-A-----GA-T-----TG------TG--A----AGT-GTA--C-AA--A---G--T-TCTGG--TAAAA----TATCTTGAAcgtgttt
gi|52940                      :                             AATTTAGTAA-TTTT-G----T-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--AGTA---AAAG--AAA----A-AA-----T-A--T----C--AAAAT-TAAA--A---C--TT-----CC-T---CAA---TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GCC--AAC---T-A-----GA-C-----TC------AT--A----TTT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAGG---TACCTTGAAcggttt
gi|52941                      :                             AATTTAGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCC--T--GGAA---ACAG--AAA----A-AA-A---T-A--T----TG-AAA-------------C--TT-----GC-G---AA----TAG--C----AAAT-----G--------GC------A---C---T----A-T-----T------A---GAC--CTC---T-A-----CA-T-----TG------GC--A----TTT-ATA--T-AA--A---tcttttt
gi|52942                      :                             AATTTTGTCA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T----GTCTTCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-G--T----TG-ACAAT-AAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----AC-------AC------A---T---T----A-C-----T------A---GGT--CTC---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AG--A---A--T-T-TCA--TGAAGT---TACATTGA
gi|52945                      :                             AATTTCATTA-TGAT-G----G-A--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG----A----A-CA-T--TT-A--T----TG--AAAT-GAAC--A---C--TT-----TC-T---TA----TAG--C----TAAA-----G--------GC------A---C---CA---A-A-----T------A---GAC--AAC---T-T-----CG-T-----TG------AA--T----TGT-GCA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATAT---TACCTCAAAtagctt
gi|52946                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-A----G-C--T-G-T-----T-T--GTTTCCG--T--TGTA---ACAG--AAA----A--A-A--AT-A--T----TG-ATAAT-GAAA--A---T--TT-----GC-C---AA----TAG--T----AATA-----G--------AC------A---C---T----T-C-----T------G---CAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----CGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--CAAATG---TACCTTAAA
gi|52947                      :                             AATTTTGTTA-TTTT-T----G-C--T-A-T-----T-T--CTTTACA--T--TGTA---ACAG--AAA----C-AA-A---T-A--T----TG-AAAAT-AAAA--A---C--TC-----AA-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------AC------ATGTC---T----A-CACCAAT------A---GAC--TTC---A-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--G---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCTTGAtggtttt
gi|52948                      :                             AATTTTGTAA-TGTT-C----A-C--T-A-T-----T-T--ATTTCGA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-A------T-G--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----TC-T---TA----TAG--C----AAAC-----G--------AC------A---C---A----A-C-----T------G---GGC--CAC---T-A-----CG-T-----TT------AC--A----TTT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAGGT---TACCGTGAgagcttt
gi|52949                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--G-T-T-----T-T--GTGTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-----T-A--T----TGTAAAAT--AAA--A---C--TT-----CAAT---CA----TAA--T----AAAA-----G--------AC------A---TGTGT----A-CACCAGT------A---GAC--CAC---A-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AC--G---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCATGtcagttt
gi|52950                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-C----A-C--T-A-T-----T-C--GTTTCGA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-A------T-G--T----TG-AGAAT--AAA--A---C--TT-----TC-T---CA----TAG--T----AAAC-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------G---GGC--CAC---T-A-----GG-T-----TT------AC--A----TTT-ATA--C-AA--A---G--C-T-TCG--TGAGGT---TACCATGAggagcttt
gi|52951                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-G-T-----T-T--GTGTCCA--T--AGTA---AC-----AA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-AAAA--T---C--TC-----AA-T---CA----TAG--C----AAAA-----GATATGTGCAC------A---C---C----A-G-----T------A---GAC--CAC---A-A-----GG-T-----TG------ACATA----TGT-GTA--C-AC--G---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCTTGAgttt
gi|52952                      :                             AATTTCACGA-TTTTTG----G-C--T-A-A-----T-T--GTTTCCG--T--GATA---ACAG--AAC----A-AG-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TCAACTCCC-T---GA----CAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AATTAAATG--T-T-TCA--TAAAAT---Tgaacttt
gi|52953                      :                             AATTTTGTTA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--CTTTACA--T--TGTA---ACAG---AA----A-CA-A--AT-A--T----TGAAAAAT-GAAA--A---C--TC-----AG-A---TA----TAG--C----AAAATACATGTGT-----AC------A---C---C----A-C-----T------A---GAC--TAC---C-A-----GG-T-----TG------AT--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--A-T-TCG--TGAAGT---TACtaaacagtttt
gi|52954                      :                             AATTTCATGACTTTT-C----G-C--T-G-A-----C-T--GTGTCCG--T--GGTA---ACAG--AAC----A-AG-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TCAACTCCC-T---AA----CAG--C----AAAAA----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AATTAAATG--T-T-TCA--TGAA
gi|52955                      :                             AATATAGTAA-TTTT-A----G-C--T-C-T-----A-T--GTTTCCC--T--GTTA---ACAG--AAA----A-A------T-T--T----TG---------------------C-----GC-T---CAACAATAG--C----AAAT-----G--------AT------A---C---T----A-CATA--T------ACAAGAC--AAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---A--G-T-TCG--TGAAGT---TAacttaaacagtttgaaagt
gi|52956                      :                             AATTTTGTAA-TTTT-T----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGT-----CA-------------A-A--CT-A--T----TG-GAAAT-TAAA------C--TT-----CT-T---CA----TAG--C----ATAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GTC--CAC---T-A-----GA-T-----TG------AT--A----AGT-GTA--C--A--A---G--T-T-TCA--TGAAGT---TACCTTGAA
gi|52957                      :                             AATTTCATAA-TTTA-A----A-C--T-A-G-----T-T--GTTTCCG--T--GGTA---ACAG--AAC----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----CC-T---TA----CAG--T----AAAA-----G--------GA------A---C---C----A-C-----A------T---GAC--AAC---T-A-----GA-A-----TG------AT--A----TGT-GCA--C-AA--A---G--T-T-TTA--TGAAAC---TATCTTTAAcagtttt
gi|52958                      :                             AATTTAGTAA-ATTG-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGCA---ACAG--AAA----A-TA-----T-A--T----TG-AAAAT-TAAA--A---C--TC-----CC-T---CT----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---A---T----A-C-----T------A---GAC--TAT---G-A-----CA-T-----TG------AC--A----TGT-ATA--T-AA--A---G--T-T-ACC--TGATGT---AACCTTGAAcagtt
gi|52959                      :                             AATTTTGTTT-TTTT-G----G-A--T-A-T-----T----GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----C-AA-A--AT---------TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----CC-A---CA----TAT--C----AAGT-----G--------GT------A---T---T----A-T-----T------A---GGC--CAC---T-G-----GG-A-----TG------AC--A----TGT-GTA--T-TA--A---G--T-T-TCA--TGAAtggtttt
gi|52960                      :                                     AA-TTTT-G----G-T--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG----A----A-AA-T--GT-A--T----TA-AAAAT-GAAC--T---CA-TC-----CC-TAGCCC----TAG--C----AATA-----G--------GC------A---T---T----A-C-----T------G---GAT--CAC---T-------GG-A-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---A--T-T-TCG--TG-AGT---TACCTTGAA
gi|52962                      :                aattattgtagcaAATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T----GTTTCCA--T--GAAA---ACAG--AAA----A-AA-A---C-A--T----TG-AAAAT-GAAA--T---C--TT-----CA-C---TA----TAC--C----AAAA-----G--------GT------A---T---T----A-C-----T------A---GGC--AAC---A-A-----GG-T-----TG------AA--G----TAT-GTA--C-AA--A---G--T-T-ATA--TGAAAC---TACCTTTAAcggtttt
gi|52963                      :                             AATTCTGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GT-------------A---ACAC--AAA----A----A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--G---T--TC-----CC-T---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---T---T----A-C-----C------A---CAC--TAC---T-A-----GG-T-----TT------AC--A----TGT--TA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAGT---TA-TTTGAA
gi|52965                      :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----A-C--G-T-T-----T-T--GTTTTCA--T--GGTA---ACAG--AAT----A-AA-A---T-A--C----TG-AAAAT-AAAA--AAAAC--TC-----CC-T---CT----TGT--C----AAAA-----G--------GC------A---C---A----G-C-----T------A---TAT--CAC---T-G-----GG-T-----TA------AC--G----TGA-GTA--C-AA--C---G--T-T-TAG--TGAAGT---TATCTTGAA
gi|52966                      :                             AATTTTATGA-TATT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTT---ACAG----A----A-AG-A--AT-A--A----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAA--CAATTAAAA-----G--------GC------A---C---T----A-T-----T------A---TAT--CAT---C-A-----GG-T-----TA------AC--A----TAT-GTA--T-AA--A---G--T-
gi|52967                      :                             AATTTTATAA-TGTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG----A----A-AG-A--AT-A--A----TG-AAAAT-GGAA--A---C--TA-----AC-T---GA----TAG--A----GAAA-----G--------AC------A---CCT-T----A-C-----TAGACTAA---GAC--CAC---T-A-----GGTT-----TT------AC--AGT--TAT-GTA--C-aatttaaagtgttttttttaagtttt
gi|52968                      :                             AATTTTGTAA-TATT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCG--T--GGTA---ACAG--AAA----G-AA-----T-A--A----TG-TAAAT-GGAA--A------TC-----CC-T---TA----TAG--A----AAAA-----A--------AC------A---C--------------------------------CAC---T-A-----GG-T-----TG------A
gi|52969                      :                             AATTTTGTAA-TATT-A----G-C--T-A-T-----T-T--ATTTCTA--T--GGTA---ATAG--AAA----T-AA---------------TG-AAAAT-GGAA--A---C--TC-----AC-T---CA----TAG--A----GAAA-----G--------AC------A---T---C----A-C-----TAGACTAA---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----T
gi|52972                      :                             AATTTTTTAA-TTTT-A----G-C--T-A-TCGTAGT-T--GTTTCCATGT--GGTA---ACAG----A----A-GA-A--AT-A--G----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---TG----TAG--C----AAAT-----G--------GC------A---A---T----A-C-----T------A---GAT--CAT---T-T-----GG-TTACGGTA------AC--A----CAT-GTA--T-AA--A---G--T-T-TTG--TCAAAT---TTTCTTGA
gi|52973                      :                             AATTTTTTAA-ATTT-G----G-C--T---T-----T-T--GTTTTCA--T--AGAA---ACAG--AAA----A-A------TCA--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----TC-T---CT----TAG--C----AAAA-----G--------GT------A---C---A----A-C-----T------T---TAC--CAA---C-A-----GG-T-----TG------AT--A----TGT-GCA--C-CG--A--------T-TCG--TGAAGT---TGCCTTGAAgcactttt
gi|52974                      :                             AATTTCATAA-TTTT-G----A-C--T-T-A-----T-T--GTTTCTA--T--GCTT---ACA----AA----A-CA-A--AT-A--T----TG-ACATG-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TGG--C----AAAA-----G--------GC------A---A---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TG-------------------GCA--C-AA--A---T--T-T-TAA--TGAAGT---TATTTTGAAa
gi|52975                      :                             AATTTATTAT-TTTT-G----G-C--CGA-A-----C-A--GTTGCCA--T--GGTA---ACAG--ATT----A-AA-----T-A--C----TG-AAAAT-GAAA--A---T--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAG-----G--------GC------A---C---T----A-A-----A------C---GAC--TGC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AC--G---T--T-T-TTG--TTAAAT---TATCTTGAA
gi|52976                      :                                                                                                            --AT-A--G----TG-AAAAT-GAAA--C---C--TC-----CT-T---CA----TAC--T----AAAA-----G--------GG------A---C---T----A-C-----T------A---GGC--CAC---T-A-----AG-T-----CG------AC--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--CGAAGT---TATCTTGGAcggtttt
gi|52977                      : aatttagtatgtttggctattacttgatAATTTCGTAA-TATT-T----G-C--T-A-A-----T-T--GTTAACA--T--AAAA---ACGG--AAC----A-AA-----T-A--T----TG-GAAAC-GGAA--A---C--TC-----CC-T---CA----CAG--C----AAAA-----G--------AA------A---C---T----A-T-----T------T---AAC--CAC---T-A--------------------------------GT-GTA--G-AA--A---G--T-T-gtt
gi|52978                      :                             AATTTTGGAA-TTGT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG----A----A-AA-A--AT-A--T----TT-TATAT-G-AA--A---C--AA-----CC-----------TGG--C----AAAT-----T--------TC------A---A---G----A-C-----G------A---GGC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TAT-GTA--C-AG--A---G--T-T-ATA--AGAAGG---TGCCTCGAA
gi|52979                      :                             AATTTTATAA-TTTT-G----A-CC-T-A-T-----A----GTTTCAC--T--GGTA---ACAG--AAA----A-GA-----T-A--T----TA-AATAT-GAAA--A---C--AC-----AA-A---AA-----AG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T------------------------------T---T--------G-T-----TG------AC--A----TGT-CTA--C-TG--A---A--T-T-TCG--TGAAGT---TACATTGAAcggtttt
gi|52980                      :                             AATTT-GTAA-GTTT-G----A-C--T-A-T-----T-T--ATGTCCA--C--GGTA---A-----ATT----A-TT-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GGAA--A---C--AC-----TG-T---T-----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----C------G---GGC--CAC---T-G-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AT--A---T--T-T-CCG--TTAAGT---TATCTTAAAcggtttt
gi|52981                      :                            aAATTTCGTAA-TGTT-G----G-C--T-G----------------ACA--T--GGTA---ACAG--TAA----A-TA-----T-A--T----CG-AAAAT-TGAA--A---C--GC-----CT-T---TT----TAG--C----AGAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----C------A---GAG--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--T-AT--A---T--T-T-CCG--Tcggtttt
gi|52982                      :                               TTTAGTAA-TTGT-G----A-C--T-G-C-----T-C--GTTTCCT--T--GATA---ACAG--AGA----A-GA-----T-A--T----TG-TAAAT-GAAA--A---C--TC-----TC-A---AA----TAG--T----AA---------------------------------------C-----T------A---TGT--TAC---T-A-----GT-T-----TA------AC--A----TAT-TTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TAAAGT---TACCTTAAA
gi|52983                      :                          aacAATTTCATAA-TATT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCAA--------A---GCAATTAAA----A-TA-ATTGT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----GC-T---TA----TAA--C----AAAT-----G--------TC------A---T---T----A-C-----T------A---GGC--CAC---G-T-----GG-C-----TC------AC--A----TGT-TTA--A-AA--AAT-G--C-T-TT---TGAAGC---TACtggtttt
gi|52984                      :                             AATTTAGTAA-TTTT-T----G-C--T-T-C-----A-T--GTTTCCA--T--GATA---ACAT--AAA----G--------T-G--T----------AT-GAAA--A---A--TT-----CC-T---CG----TA---C-----------------------C------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAT---G-A-----GG-T-----TG------AC--A----TAT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCC--TGATGT---TACCTTGAAaataaatgtttt
gi|52986                      :                             AATTACATAT-TTTT-G----G-T--T-A-A-----C-T--GTTTTCA--T--GGCA---AAAG--AAC----A-AT-----T-A--C----TG-AAAAT-GAAA--T---C--TC-----CT-T---GA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----T-A-----A------A---GAC--CAC---G-T-----GA-T-----TA------A---A----CAT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TAATGT---TACCTTAAA
gi|52988                      :                             AAATTAGTAA-TTTT-G----A-T--T-T-T-----T-TAAGTTTCCC--T--GATA---ACAG--AAA----A-------AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-C---AA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------T---T---T----A-C-----T------G---AACATCAC---T-A-----
gi|52989                      :                             AATTTCATAT-TTTT-G----G-T--T-A-A-----C-T--GTTTCCA--T--GGTA---AT----GAA----A-CA-A--AT-A--C----TG-CAAAT-GAAA--A---C--TC-----TC-T---CA----TAG-------------------------------------C---T------T-----T------A---AA---CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----AGC-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAAT---TATATGGAA
gi|52990                      :                             AATTTTGTAA-TATT-C----A-C--A-A-T-----C-T--GTTTCCG--T--GGTA---ACA---AAA----C-AA-A--AT-A--T----TA-AAAAT-AGAA--A---C--TC-----CA-T---TA----TAG--C----AAAA-----A--------AT------C---C---T----A-C-----A------A---TAC--CAC---T-A-----TA-C-----TG------AC--A----TGT-GCA--A-AA--T---G--T-T-gg
gi|52991                      :                             AATTT-GTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GATA---ACAG----A----A-GA-A--AT-A--T-----------T-AAAA--A---C--TA-----TC-C---TA----TAG--C----AGAA-----T--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---
gi|52992                      :                            aAATTTT-TAA-TTT--G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AATA--AT-A----------AAAAT-GAAA--A---C--TC-----AC-T---TG----TAT--C----AGAG-----G--------G
gi|52993                      :                              ATTTAGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAT--AAA----A-TA-----T-A--T----T--AAAAT-TAAA--T---C--TC-----TC-T---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---C---C----A-C-----T------A---GAC--CTT---G-A-----AG-T-----TG------AC--A----CGT-TTA--C-AA--A---G--T-A-TCC--TGATGT---TACATTGGA
gi|52994                      :                              ATTTTGTAT-TGTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACGG--AAG----A-AA-A---T-A--T----TG-AAAAT---AA--A---C--TC--------T---CA----CAATCC----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---CAC--TAC---T-A-----AG-T-----TG------GC--A----TAT-GTA--C-AC--A---T--T-T-TTG--TGATGT---TACCTTAAAcggtttt
gi|52995                      :                              ATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---A---------------A-A--AT-A--T----TG-AAAA------------C--TC-----CG-C---TA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A------------------GAC--AAC---A-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTCAAAtggtttt
gi|52996                      :                              ATTTCGTAA-TTTT-G----A-C--T-A-A-----T-T--GT----A--T--GGTA---ACAG--AAC----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CT-T---CA----CAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAT---G-A-----GA-T-----TG------AA--A----AGT-GTT--C-AT--A------T-T-TCC--TGATGT---TACCTTGAAtgatttt
gi|52997                      :                              ATGTTGTAA-ATTT-G----G-C--T-G-C-----A-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACA---AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG---------GA--A---C--TT-----CA-T---CA----TAG--C----AAAA-------------------------------------------------------AC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AT--A----TGC-ATA--C-AA--A---T--T-T-TCG--TGAATA---TATCTTcagtttt
gi|52998                      :                              ATTTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-T-A-----T-T--GTTTCCA--T--GGTT---ACAG--AAA----A-AA-A-------------TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----CC-T---CA----TGG--C----GAAA-----G--------AC------A---C---T-----------------------GAC--CAC---T-A-----GG-T-----GG------GC--A----TTT-GT
gi|53000                      :                                                   -C--T-G-T-----T-T--GTTTTTACTT--TGTA---ACAG--GAA----A-AT-A---T-G--T----TA-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---CAA--CTC---A-A-----GG-T-----TG------AT--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATGT---TATCTTGAA
gi|53001                      :                 tcttgtttttactaTTTCATAA-TTTT-C----A-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-A------T-A--T----TT-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----GC-C---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------C---A---T----T-C-----T------G---GAC--CAC---T-A-----TG-T-----TG------AC--A----TTT-GTATGC-CG--C---G--T-T-TCA--TGAAGT---GACCTTGAAtggtttt
gi|53002                      :                               TTTTTTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--CTTTACA--T--TGTA---ACA---AAA----A-AA-A--TT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----AG-T---CA----TAG--T----AAAA-----GACATATGTAC------A---C---C----A-C-----T------A---GAC--TAC---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--CAAA--A---G--A-T-TCG--TGAAGT---TACtacttttt
gi|53003                      :                                    TGA-TCTT-G----G-C--T-A-A-----T----GTTTCCG--T--GAAA---ATAG--AAA----C-AA-T---T-A--T----TG-AAAA--------A---T--CC-----TT-T---CA----CAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--CAA---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AT--ATT-G--C-T-T-GAATGAAAT---AATCTTGAAtataaacggtttt
gi|53004                      :                            tttTTTTGTAA-TGTT-T----G-C--T-A-T-----T-C--GTTTCCA--C--GGAA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT----------G-AGAAT-GAAA--T---C--TC-----CC-T---TA----TAG--C----AAAA-----A--------GT------T---C---T----A-C-----A------A---GAC--CTC---C-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--A-AA--T---G--T-T-TCG--TAATGT---TATCTTTAAa
gi|53005                      :                               TTTCGTAA-TTTT-G----G-A--T-A-A-----T-T--GTTTCCA--C--GGTA---ACAG---AA----A-AA-T--AT-T--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----AA-T---CA----TAC--CA---AAAA-----G--------GC------A---G---C----A-C-----T------A---GAT--CAT---C-A-----GC-T-----TG------GC--A----TGT-GTT--A-AA--C---G--T-T-ACG--TGATGT---TACCTTGAA
gi|53006                      :                               TTTCGTAA-TTTT-G----G-C--T-G-T-----T-T--GATTTCA--T--AGAA---ATA-----A----A-AA-A--GT-A--T----TG-CAATT-GAAA--A---C--TC-----TC-T---CA----TAG--C----AAAATT---G--------ACTTATATG---C---T----A-A-----C------A---GTC--CAT---A-A-----GG-T-----TGACAATCAC--A----TGT-GTA--C-AA--A---A--T-T-TCG--TGAAGC---TATCTCGAcgagttt
gi|53008                      :                                                          -T-----C-T--GTTCTCACCT--GGAA---ACAC--ACAGGTTA-AATA--AT-A--T----AG-AAAAT-TAAA------C--TC-----TC-T---CA----CAA--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAT--GAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCA--TGAAACTAATACCCTGAA
gi|53009                      :          ttttgctgatattgacaatgatTTTGTA--TATT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----T-AA-A---T-A--T----TG-AAAAT-GTTA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAT--T----CAAA-----G--------GA------A---C---T----A-C-----T------A---AAC--CACATTT-ATACATAG-C-----CG------AT--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-G-TCT--TGAAAT---TACCTTTAAcagttt
gi|53011                      :                                TTTGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--AGTT---ACAG--AAA----A-CA---------------TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----CAA--C-----AAA-----G--------TC------A---C---T----T-C-----T------A---GAT--CAA---G-A-----GC-T-----CA------GC--A----TGC-GT---C-A----------T-G-CCG--TGAAGT---TATCTTG
gi|53012                      :                                TTTGTTA-TTTT-G----A-T--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---AC-----------A-AA-A--CT-A--T----C----AAG-GAAACTA---C--CCAA---CC-C---AA----TAG--C----AAAA-----T--------GC------A---T---T----A-C-----T------A---GAT--CAC---T-A-----TG-T-----T--------T--G----TGT-GTA--C-AA--T---G--T-
gi|53016                      :                                 TTGTAA-TCTC-G----A-A--G-A-T-----T-T--GTTTCCAATTCAGGTA---ACAG--AAA----A-AA---------------TG-AAAAG-GAAA--T---C--TC-----CC-T---CA----TGT--C----AAAA-----G--------G-------A---C---T----G--------------A---GAC--CAC---T-A-----CG-G-----TG------AC--AGTCATGT-GTA--C-AA--A---A--T-T-TTG--TGAAGT---TACCTCAAA
gi|53018                      :                                   GTAA-GTTT-G----G-C--T-G-T-----T-G--GTTTCCA--T--GGTA---GCAG--ATA----A-TA-----T-A--T----TG-AAAAG-GAAA--A---C---C-----CC-T---TA----TAC--C----AAAT-----G--------TC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAT---G-A-----TA-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGATGT---TAACTTGAtggtttt
gi|53019                      :                                   GTAA-GTTT-G----G-C--C-T-T-----T-G--GTTTGCA--T--GGTA---ACAG--ATA----A-TA-----T-A--T----TA-AAAAG-GTAA--A---C--CC-----TC-T---TA----TGC--T----AAAT-----G--------GC------A---C---T----A-C-----A------A---GAC--CAT---G-A-----TG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAGGT---TATC
gi|53020                      :                                   GTAA-GTTT-G----A-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GG-------AA--AGA----A-AG-A--AT-AGCT----TT-AAAAT-GGAA--A---C--TC-----TC-T---CA----TAG--C----AATC-----T--------AT------A---C---T----A-T-----T------A---GAC--CAC---T-A-----AG-T-----TT------AC--A----AGT-GTA--T-AA--A---G--T-T-TTG--TCAAGT---TGTTTTAA
gi|53021                      :                                    TAA-TTCT-G------T--T-AGT-----T-T--GTTTCTA--G--TATA---ACAG--AAA----A-GA-C--AG-A--------G-AAAAC-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----T--------GC------A---C---A----T-C-----A------A---GAC--CAC---A-A-----GA-T-----TGACAT--AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCT--TGAAAA---TAGCTTGAAtggtttt
gi|53024                      :                                     AA-CTTT-G----C-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACA-----A----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-A---AA----TAA--C----AAAA-----G--------GC------A---T---T----A-C-----T------A---GAG--CAT---G-A-----AT-T-----TG------AA--A----TGT-GTA--G-AA--T---A--T-T-TTG--TGATGA---TACCTTGAAtggttt
gi|53025                      :                                     AA-TTTT-GCCAGG-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--GAA----A-TC-----T-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--GT-----TC-A---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GT------A---C---T----A-C-----T------A---GGC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AT--T----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---AACCGTGAAtgttttt
gi|53026                      :                                     AA-TTTT-G----GGT--T-G-T-----T-A--GTTTTCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A----A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---T--TC-----GC-C---AA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-T-----A------A---GAC--CAC---A-A-----GG-T-----TG------AC--A-----GTAGTA--C-AC--A---G--T-T-ATG--TCAAGT---TACCTTGAAaggtttt
gi|53028                      :                                     AA-TTTG-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--------------GG--AAA----A-AA-A--AT-G--T----TG-AAAAC-AAAA--T---C--TC-----C--------------A--C----AAA------G--------GC------A---C---T----A-C-----T------G---GAT--CAC---T-A-----GA-T-----TG------AC--A----TTT-GTA--C-AA--T---G--T-G-TCA--TGAAGT---TACCGTGGA
gi|53031                      :                                       -TTTT-G----G-T--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAA--AAA----A-A-----------T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-A---TA----CAA--C----AAAA-----G--------GC------A---C---A----A-C-----T------T---GAC--CAC---T-A-----GG-A-----TG------AC--A----TGT-GCA--T-TA--A---A--T-T------AAAAGT---TATCctgtttt
gi|53032                      :                                       -TTTT-T----G-C--T-T-T-----G-A--GTTTCCC--T--GGTA---ACAA--AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TT-----CC-C---AA----AAG--C----AAAT-----G--------AC------A---C---T----T-C-----T------A---GCC--CAT---T-------GA-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGCAGT---TACATTGA
gi|53033                      :                                       -TTTT-G----G-A--T-A-A-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---A------------A-AA-A--AT-A--G----CG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----CAT--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------T---GAC--CAG---T-A-----AG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-tagtttt
gi|53034                      :                                       -TTTT-G----G-T--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG---------A-AA-A--AT-A--T----TG-AATAT-G--A--G---C--T------CC-T---CA----AAC--C----A------------------C------A---C---T----A-C-----T------G---GA---CAT---T-A-----GG-T-----CG------CG--A----TGT-GTA--C-AA--C---G--T-T-TCA--CGAATT---TATTCTGAA
gi|53035                      :                                         TTT-C----G-T--T-A-T-----C-C--CCTTCCA--T--GGTA---ACAA--GAA----A-AA-A--CT----T----TA-AAAA-----A--A---C--CC-------------A----TAG--C----AAGA-----T--------AT------A---C---T----A-C-----A------A---GAC--CAC---T-A-----GC-T-----TG------AC--A----TGT-ATG--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TATCTTGAAtggtttt
gi|53036                      :                                         TTT-G----A-T--A-A-T-----T-T--GTTTCTG--T--AGTA---A--G--AGA----T-AA-A--AT-A--T----TG-AAAGT-GAAA--A---C--TC-----CT-T---GA----TAG--C----AAAA-----G--------G-------A-------------------------------------AC---T-A-----GG-T-----TA------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGT---TAACATGAAcggtttt
gi|53039                      :                                                        -A-T-----T-T--GCTTCCA--T--CGTA---ACAG--AAA----A-AA-----T-A--T----TG-AAAAT-AAGA--A-------------------------------------AAG-----G--------GC------A---C---T----A-T-----T------A---GAC--CAC---A-T-----GG-T-----TG------CC--A----TGT-GTA--T-GA--A---G--T-T-TCT--TGAAGT---TACcatttt
gi|53040                      :                                                            -----T-T--GTGTTGG--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AT-A---T-G--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T-----------AC--AAC---TCAT----GA-T-----TG------AC--A----TAT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGATAT---AACCTTGAA
gi|53044                      :                                                                                                  ----A-AA-A--AT-A--T----TT-CAAAT-GAAA--A---C--TC-----GC-C---AA----TAG--C----TAAA-----G--------G---------------T----A-A-----T------A---GAT--CAC---T-A-----GA-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TTG--TGAAGT---TAcaatttt
gi|53048                      :                                                                                                         A-A--AT-G--T-----A-AAAAC-TAAA--A---C--TC-----CC-C---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GA------A---C---T----A-C-----T------A---CAC--CAC---T-A-----GG-T-----TA------AC--A----TGT-ATA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TTAAGT---TATCTTGacagttacctcaaacagtttt
gi|53051                      :                                                                                                                  --T----TA-AAAATTGAAA--A---C--TC-----CC-C---CA----TAC--C----AAAA-----G--------GC------T---C---T----T-A-----T------A---GAC--CAC---T-A-----CA-T-----TA------AT--G----TAT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--CGATGT---TACCTTGAAgtttt


blockSeqs                     :                                  T                  AA     CGTAG            TG                           ATTG                                   AACTC         ACAA      AATT    TACAT ATATGTGC  TTATAT     GTG CATT C ACCAA AGACTA                  TACAT    TACGG  ACAATC     GTCA             TT AAT
blockSeqs                     :                                  C                  C      .                CT                           TAA                                    AACTC         A         A       TT    ACATATGT  .          CT  CG   T ACCAG AGACTA                  T        .      ACAT       GT               TT AAT
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                CC                           TAA                                    AA            .         .       A     TGT       .          .   A    A ATA   .                       .        .      .          .                G  AT 
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                AT                           TA                                     .             .         .       .     T         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  TT 
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     C         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            TA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            GA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  G                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            TT                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AC                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            TG                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            AT                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            TA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            AG                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AC                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            CA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            AC                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            AA                                     .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            T                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            A                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  A                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  C                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  T                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  .                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  .                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                  .                  .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                .  .  
blockSeqs                     :                                                     .      .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                      
blockSeqs                     :                                                            .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .          .                      
blockSeqs                     :                                                            .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .      .                                 
blockSeqs                     :                                                            .                .                            .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .        .                                        
blockSeqs                     :                                                                                                          .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                       .                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                          .                                      .             .         .       .     .         .          .   .    . .     .                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .             .         .       .     .                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .                                                                                                                                                     


blockSeqCons                  :                             
originalCons                  :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTTGAA
finalCons                     :                             AATTTCGTAA-TTTT-G----G-C--T-A-T-----T-T--GTTTCCA--T--GGTA---ACAG--AAA----A-AA-A--AT-A--T----TG-AAAAT-GAAA--A---C--TC-----CC-T---CA----TAG--C----AAAA-----G--------GC------A---C---T----A-C-----T------A---GAC--CAC---T-A-----GG-T-----TG------AC--A----TGT-GTA--C-AA--A---G--T-T-TCG--TGAAGT---TACCTTGAA