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lowQualScore                  :        ..      ..       ......   .   ...  .... ...   . .. ...   ... ... .. .                      ....            . .   
lowQualScore                  :        33      22       222222   7   777  7777 222   0 33 777   888 777 55 2                      9999            8 4   
consensus                     : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-TGG---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
Reference ( gi|43601 )        : TAAACGTATGACATT--TGGCGGC------AGA-TGG---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CAATT
gi|43600                      : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-TGG---GT----T---TGC-G--A---TAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CAATT
gi|43604                      : TAAACGTGTGACATT--TGGCGGC------AGA-TGG---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CTTCTCACACCACTATTACATT----TCCCGTAGGGCT-AAATT
gi|43602                      : TAACCGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-TGG---GC----T----GC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CAATT
gi|43603                      : TAAACGTGCAACATT--TGGCGGC------CGA-TGG---GT----T---TGT-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCACATAGGGCT-CAATT
gi|43605                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------AAA-TGG---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTATATT----TCCCATAGGACT-CAATT
gi|43606                      : TAAACGTGAGACATT--TTGCGAC------AGA-TGG---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-AGTCTAACACCACTATCACATT----TCCCATAGGGCT-CAAT
gi|43607                      : TGAACGTGCGACATT--TGTCGGC------AGA-TGG---GT----T---TGA-A--A---CAT---T---A--A-CGTATTTCACCACTATTACATT----TCCTATATGGGT-CAATT
gi|43608                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------ATA-TGA---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCCAACCACTATTACATT----TTCCACAG
gi|43609                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------AGA-TGA----T----T---T-----------AT---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACAAT----TCCAATAGAGCT-CAACT
gi|43610                      : TAAATGTACGA--TT--TG-TGAT------AGA-TGG---CTATTTT---TAT-C--C---CAA-------A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43611                      : TAAAGGTGCGACATA--TAGCGGC------AGA-TGA---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---C--A--GTCTTGCAACAA-ATAACATT----T
gi|43618                      :           ACATT---AGCGCC------AGAATGGTAAG----------GC-G--A---TGTCT-T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCT-C
gi|43621                      :        tgcACATTAATGGCGACGCCAATAAA-TGT---GC----TAGTTGC-GCAA---CGT---T---TTTA-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43623                      :                    GTGGT------AG---GG---GT----T-----C-A--A---CACACGT---A--A-CGTCTCACACCACTATTACCTT----TCCCATAGGGTT-CCATT
gi|43628                      :                                GA-TTA---GT----T---TTC----A---CTT---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43629                      :                                    GG---GG----T---CAT-G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43630                      :                                     G---GT----TA--TGC-C--A---CTT---T---A--AACGTCTCACACCACCATTACATT----TCCCATTGGGCT-CCATT
gi|43631                      :                                      ---GT----T---TG-----------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTAAATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43620                      :                                      ---GT----T---CGCAG--C---CCT---T---G--A-TGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-C
gi|43633                      :                      cggcatctgccaccggccaaT----T---TGC-A--A---TAG---T---A----CGTCTCGCACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43634                      :                                          T----T---TCT-G--A---TGT---T---A--A-CGTCTCACACCATTATTACATT----TCCCATAGGGCA-CCATT
gi|43635                      :                                          T----T---TAA-G--A---CAT---TTTTAC-A-CATCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43636                      :                                          T----T---TGC----------T---T---T--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCCCAGAGGGCT-CCATT
gi|43638                      :                                           ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43637                      :                                           ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43643                      :                                           ----T---TGC-G------CAT---TTT-AT-A-CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43644                      :                                           ----T---TGT-G--A---AAC---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGAT-CCATT
gi|43640                      :                                           ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--T-TGTCTCACACAACTATTACATT----TCTCATAGGGCT-CAATT
gi|43639                      :                                           ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--T-TGTCTCACACAACTATTACATT----TCTCATAGGGCT-CAATT
gi|43642                      :                                           ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATGACATT----TCCAATAGGGCT-TCATT
gi|43641                      :                                           ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATGACATT----TCCAATAGGGCT-TCATT
gi|43651                      :                                                ---TAC-G--A---CAT---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43652                      :                                                ---TGC-G--AAGTCAT---C---ATTA-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43653                      :                                                ---TGA-G--A---CCT---T---A--A-CGTTTCACACCACTGTTACATT----TCCCTTAGGTCT-CCATT
gi|43654                      :                                                    GT-G--A---C-T---T---A--T-CGTCTCACACTACTATTACATT----TCCCACAGGGCT-CCATT
gi|43655                      :                                                     C-G--T---CAT---T---A----CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43659                      :                                                      -G--A---GAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43658                      :                                                      -G--A---TAT---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43661                      :                                                      -G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43660                      :                                                      -G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43666                      :                                                        --A---CCT---T---AG-A-CGTCTCACACCATTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43670                      :                                                           ---CAT---T---C--A-CGTCCCACACCACTTTTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43676                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43617                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43616                      :                                     tgcaacatgcagatctgtcagtttctgT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
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gi|43677                      :                                     tgcaacatgcagatctgtcagtttctgT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-C
gi|43679                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-TCATT
gi|43678                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCTCATAGGGCT-CCATT
gi|43675                      :                                                                T---T---C--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43681                      :                                                                T---T---A--ATCGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43619                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGAT-CCATT
gi|43683                      :                                     tgcaacatgcagatctgtcagtttctgT---T---A--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCTCATAGGGCT-CCATT
gi|43682                      :                                                                T---T---A--A-TGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43680                      :                                                                T---T---A--A-CGTCGCACACCACTATTACGTT----TCCCATTGGGCT-CAATT
gi|43688                      :                                                                T---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCT-CCATT
gi|43689                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TGCCATAGGACT-CTATT
gi|43690                      :                                                                T---T---G--G-CGTCTCACACCACTGTTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43692                      :                                                                T---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCACATAGGGCT-CCATT
gi|43691                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCACACCACAATTAAATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43695                      :                                                                T---T---A--A-CATCTCACACCACTATTACATTAAAATCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43694                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCACACCACCATTTCATT----TCCCGTAGGGCT-CCATT
gi|43684                      :                                                                T---T---A--A-CGTCTCATCCCACTATTACATT----TCTCATAGGGCT-CCATT
gi|43701                      :                                                                 ---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
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gi|43703                      :                                                                 ---T---A--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43704                      :                                                                 ---T---A--ATCGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCT-CCATT
gi|43706                      :                                                                     ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CAATT
gi|43708                      :                                                                     ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43709                      :                                                                     ---A--A-CGTCTCACACCACTGTTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43710                      :                                                                     ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----CCCCATAGGGCTCCAAT
gi|43711                      :                                                                     ---A--A-TGTCCCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43712                      :                                                                     ---A--A-CGCCTCACACCACTATTACATT----TCCCAAAGGGCT-CCATT
gi|43707                      :                                                                     ---A--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGAT-CCATT
gi|43727                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43726                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43725                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43724                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43723                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43722                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
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gi|43720                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43719                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43718                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43729                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGACT-CCATT
gi|43728                      :                                                                         --A-CATCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43730                      :                                                                         --A-CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CTATT
gi|43731                      :                                                                         --A-CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-C
gi|43732                      :                                                                         --A-CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGTT-CCATT
gi|43733                      :                                                                         --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCAT-GGGCT-CCATT
gi|43745                      :                                                                            -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43746                      :                                                                            -CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43748                      :                                                                            -CGTCTCATACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT
gi|43747                      :                                                                            -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-TCATT
gi|43749                      :                                                                            -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCAGAGGGCT-CCATT
gi|43751                      :                                                                            -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATATGGCT-CCATT
gi|43750                      :                                                                            -CGTCTCACACCACTATTATATT----TCCCATAGGGCTCCAAT
gi|43758                      :                                                                              GTCTCGCACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCT-CCATT





Alignments
lowQualScore                  :                                    111111111                                                                               
lowQualScore                  :               666 0     555555   1 111111111  2222 222   0 222222   111 111 22 1                      0000                 
lowQualScore                  :               ... .     ......   . .........  .... ...   . ......   ... ... .. .                      ....                 
lowQualScore                  :               444 8     888888   9 777777777  4444 888   9 222222   888 666 55 2                      8888                 
consensus                     : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
Reference ( family-210 )      : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43600                      : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---TAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43601                      : TAAACGTATGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43602                      : TAACCGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GC----T----GC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43603                      : TAAACGTGCAACATT--TGGCGGC------CGA-T--G--G---GT----T---TGT-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCACATAGGGCTCAATT
gi|43604                      : TAAACGTGTGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CTTCTCACACCACTATTACATT----TCCCGTAGGGCT
gi|43605                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------AAA-T--G--G---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTATATT----TCCCATAGGACTCAATTaaatt
gi|43606                      : TAAACGTGAGACATT--TTGCGAC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-AGTCTAACACCACTATCACATT----TCCCATAGGGCTCAAT
gi|43607                      : TGAACGTGCGACATT--TGTCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGA-A--A---CAT---T---A--A-CGTATTTCACCACTATTACATT----TCCTATATGGGTCAATT
gi|43608                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------ATA-T--G--A---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCCAACCACTATTACATT----TTCCACAG
gi|43609                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------AGA-T--G--A----T----T---T-----------AT---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACAAT----TCCAATAGAGCTC
gi|43610                      : TAAATGTACGA--TT--TG-TGAT------AGA-T--G--G---CTATTTT---TAT-C--C---CAA-------A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATTaact
gi|43611                      : TAAAGGTGCGACATA--TAGCGGC------AGA-T--G--A---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---C--A--GTCTTGCAACAA-ATAACATT----T
gi|43615                      :       TGCAACAT--------GC------AGA-TCTGTCA---GT----T---TCT-G--------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43616                      :       TGCAACAT--------GC------AGA-TCTGTCA---GT----T---TCT-G--------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43617                      :       TGCAACAT--------GC------AGA-TCTGTCA---GT----T---TCT-G--------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43618                      :       TGC-ACATT---AGCGCC------AGAAT--G--GTAAG----------GC-G--A---TGTCT-T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCTC
gi|43619                      :       TGCAACAT--------GC------AGA-TCTGTCA---GT----T---TCT-G--------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGATCCATT
gi|43620                      :         CGGCATC--TGCCACC------GGC-C--A--A---GT----T---CGCAG--C---CCT---T---G--A-TGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTC
gi|43621                      :           ACATTAATGGCGACGCCAATAAA-T--G--T---GC----TAGTTGC-GCAA---CGT---T---TTTA-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43623                      :                    GTGGT------AG-----G--G---GT----T-----C-A--A---CACACGT---A--A-CGTCTCACACCACTATTACCTT----TCCCATAGGGTTCCATT
gi|43628                      :                                GA-T--T--A---GT----T---TTC----A---CTT---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43629                      :                                    --G--G---GG----T---CAT-G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43630                      :                                       --G---GT----TA--TGC-C--A---CTT---T---A--AACGTCTCACACCACCATTACATT----TCCCATTGGGCTCCATT
gi|43631                      :                                          ---GT----T---TG-----------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTAAATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43633                      :                                              T----T---TGC-A--A---TAG---T---A----CGTCTCGCACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43634                      :                                              T----T---TCT-G--A---TGT---T---A--A-CGTCTCACACCATTATTACATT----TCCCATAGGGCACCATT
gi|43635                      :                                              T----T---TAA-G--A---CAT---TTTTAC-A-CATCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43636                      :                                              T----T---TGC----------T---T---T--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCCCAGAGGGCTCCATT
gi|43637                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43638                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43639                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--T-TGTCTCACACAACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCAATT
gi|43640                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--T-TGTCTCACACAACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCAATT
gi|43641                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATGACATT----TCCAATAGGGCTTCATT
gi|43642                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATGACATT----TCCAATAGGGCTTCATT
gi|43643                      :                                               ----T---TGC-G------CAT---TTT-AT-A-CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43644                      :                                               ----T---TGT-G--A---AAC---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGATCCATT
gi|43651                      :                                                    ---TAC-G--A---CAT---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43652                      :                                                    ---TGC-G--AAGTCAT---C---ATTA-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43653                      :                                                    ---TGA-G--A---CCT---T---A--A-CGTTTCACACCACTGTTACATT----TCCCTTAGGTCTCCATT
gi|43654                      :                                                        GT-G--A---C-T---T---A--T-CGTCTCACACTACTATTACATT----TCCCACAGGGCTCCATT
gi|43655                      :                                                         C-G--T---CAT---T---A----CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43658                      :                                                          -G--A---TAT---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43659                      :                                                          -G--A---GAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43660                      :                                                          -G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43661                      :                                                          -G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43666                      :                                                            --A---CCT---T---AG-A-CGTCTCACACCATTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43670                      :                                                               ---CAT---T---C--A-CGTCCCACACCACTTTTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43675                      :                                                                    T---T---C--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43676                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43677                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTC
gi|43678                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCCATT
gi|43679                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTTCATT
gi|43680                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCGCACACCACTATTACGTT----TCCCATTGGGCTCAATT
gi|43681                      :                                                                    T---T---A--ATCGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43682                      :                                                                    T---T---A--A-TGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43683                      :                                                                    T---T---A--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCCATT
gi|43684                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCATCCCACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCCATT
gi|43688                      :                                                                    T---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCTCCATT
gi|43689                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TGCCATAGGACTCTATT
gi|43690                      :                                                                    T---T---G--G-CGTCTCACACCACTGTTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43691                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACAATTAAATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43692                      :                                                                    T---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCACATAGGGCTCCATT
gi|43694                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACCATTTCATT----TCCCGTAGGGCTCCATT
gi|43695                      :                                                                    T---T---A--A-CATCTCACACCACTATTACATTAAAATCCCATAGGGCTCCATT
gi|43700                      :                                                                     ---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43701                      :                                                                     ---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43702                      :                                                                     ---T---A--A-CGTCTCACACCGCTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43703                      :                                                                     ---T---A--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43704                      :                                                                     ---T---A--ATCGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCTCCATT
gi|43706                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43707                      :                                                                         ---A--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGATCCATT
gi|43708                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43709                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTGTTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43710                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----CCCCATAGGGCTCCA
gi|43711                      :                                                                         ---A--A-TGTCCCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATTat
gi|43712                      :                                                                         ---A--A-CGCCTCACACCACTATTACATT----TCCCAAAGGGCTCCATT
gi|43718                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43719                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43720                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43721                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43722                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43723                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43724                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43725                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43726                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43727                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43728                      :                                                                             --A-CATCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43729                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGACTCCATT
gi|43730                      :                                                                             --A-CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCTATT
gi|43731                      :                                                                             --A-CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTC
gi|43732                      :                                                                             --A-CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGTTCCATT
gi|43733                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCAT-GGGCTCCATT
gi|43745                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43746                      :                                                                                -CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43747                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTTCATT
gi|43748                      :                                                                                -CGTCTCATACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43749                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCAGAGGGCTCCATT
gi|43750                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTATATT----TCCCATAGGGCTCCA
gi|43751                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATATGGCTCCATTat
gi|43758                      :                                                                                  GTCTCGCACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT





Alignments
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consensus                     : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
Reference ( family-210 )      : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43600                      : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---TAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
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gi|43702                      :                                                                     ---T---A--A-CGTCTCACACCGCTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43703                      :                                                                     ---T---A--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43704                      :                                                                     ---T---A--ATCGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCTCCATT
gi|43706                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43707                      :                                                                         ---A--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGATCCATT
gi|43708                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43709                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTGTTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43710                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----CCCCATAGGGCTCCA
gi|43711                      :                                                                         ---A--A-TGTCCCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATTat
gi|43712                      :                                                                         ---A--A-CGCCTCACACCACTATTACATT----TCCCAAAGGGCTCCATT
gi|43718                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43719                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43720                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43721                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43722                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43723                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43724                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43725                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43726                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43727                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43728                      :                                                                             --A-CATCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43729                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGACTCCATT
gi|43730                      :                                                                             --A-CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCTATT
gi|43731                      :                                                                             --A-CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTC
gi|43732                      :                                                                             --A-CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGTTCCATT
gi|43733                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCAT-GGGCTCCATT
gi|43745                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43746                      :                                                                                -CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43747                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTTCATT
gi|43748                      :                                                                                -CGTCTCATACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43749                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCAGAGGGCTCCATT
gi|43750                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTATATT----TCCCATAGGGCTCCA
gi|43751                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATATGGCTCCATTat
gi|43758                      :                                                                                  GTCTCGCACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT


blockSeqs                     :               TAA       GCCAAT   A CTGTCA     ATTT AGT     AAGT     ACG TTT TT A
blockSeqs                     :               T         .        . CTGTCA     .    A       CAA      CT  TT  TT T
blockSeqs                     :               T         .        . CTGTCA     .    .       A        .   .   C  T
blockSeqs                     :               T         .        . CTGTCA     .    .       A        .   .   T  .
blockSeqs                     :               T         .        . GGTAA      .    .       A        .   .   G  .
blockSeqs                     :               T         .        . GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               T         .        . GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               T         .        . GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               T         .        . GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               T         .        . GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               T         .        . GG         .    .       C        .   .   .  .
blockSeqs                     :               A         .        . GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               T         .        . GA         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               C         .        . GA         .    .       C        .   .   .  .
blockSeqs                     :               .         .        . GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               .         .        . GA         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               .         .        . AA         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :               .         .        . GT         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                         .        . GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                  . TA         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                    GG         .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       T        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                               .    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                                    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                                    .       A        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                                    .       .        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                                            .        .   .   .  .
blockSeqs                     :                                                            .        .   .   .  .
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Alignments
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consensus                     : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
Reference ( family-210 )      : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43600                      : TAAACGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---TAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43601                      : TAAACGTATGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43602                      : TAACCGTGCGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GC----T----GC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43603                      : TAAACGTGCAACATT--TGGCGGC------CGA-T--G--G---GT----T---TGT-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCACATAGGGCTCAATT
gi|43604                      : TAAACGTGTGACATT--TGGCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CTTCTCACACCACTATTACATT----TCCCGTAGGGCT
gi|43605                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------AAA-T--G--G---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTATATT----TCCCATAGGACTCAATTaaatt
gi|43606                      : TAAACGTGAGACATT--TTGCGAC------AGA-T--G--G---GT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-AGTCTAACACCACTATCACATT----TCCCATAGGGCTCAAT
gi|43607                      : TGAACGTGCGACATT--TGTCGGC------AGA-T--G--G---GT----T---TGA-A--A---CAT---T---A--A-CGTATTTCACCACTATTACATT----TCCTATATGGGTCAATT
gi|43608                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------ATA-T--G--A---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---A--A-CGTCTCCAACCACTATTACATT----TTCCACAG
gi|43609                      : TAAACGTGCGACATT--TAGCGGC------AGA-T--G--A----T----T---T-----------AT---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACAAT----TCCAATAGAGCTC
gi|43610                      : TAAATGTACGA--TT--TG-TGAT------AGA-T--G--G---CTATTTT---TAT-C--C---CAA-------A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATTaact
gi|43611                      : TAAAGGTGCGACATA--TAGCGGC------AGA-T--G--A---TT----T---TGC-G--A---CAT---T---C--A--GTCTTGCAACAA-ATAACATT----T
gi|43615                      :       TGCAACAT--------GC------AGA-TCTGTCA---GT----T---TCT-G--------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43616                      :       TGCAACAT--------GC------AGA-TCTGTCA---GT----T---TCT-G--------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43617                      :       TGCAACAT--------GC------AGA-TCTGTCA---GT----T---TCT-G--------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43618                      :       TGC-ACATT---AGCGCC------AGAAT--G--GTAAG----------GC-G--A---TGTCT-T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCTC
gi|43619                      :       TGCAACAT--------GC------AGA-TCTGTCA---GT----T---TCT-G--------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGATCCATT
gi|43620                      :         CGGCATC--TGCCACC------GGC-C--A--A---GT----T---CGCAG--C---CCT---T---G--A-TGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTC
gi|43621                      :           ACATTAATGGCGACGCCAATAAA-T--G--T---GC----TAGTTGC-GCAA---CGT---T---TTTA-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43623                      :                    GTGGT------AG-----G--G---GT----T-----C-A--A---CACACGT---A--A-CGTCTCACACCACTATTACCTT----TCCCATAGGGTTCCATT
gi|43628                      :                                GA-T--T--A---GT----T---TTC----A---CTT---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43629                      :                                    --G--G---GG----T---CAT-G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43630                      :                                       --G---GT----TA--TGC-C--A---CTT---T---A--AACGTCTCACACCACCATTACATT----TCCCATTGGGCTCCATT
gi|43631                      :                                          ---GT----T---TG-----------T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTAAATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43633                      :                                              T----T---TGC-A--A---TAG---T---A----CGTCTCGCACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43634                      :                                              T----T---TCT-G--A---TGT---T---A--A-CGTCTCACACCATTATTACATT----TCCCATAGGGCACCATT
gi|43635                      :                                              T----T---TAA-G--A---CAT---TTTTAC-A-CATCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43636                      :                                              T----T---TGC----------T---T---T--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCCCAGAGGGCTCCATT
gi|43637                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43638                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43639                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--T-TGTCTCACACAACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCAATT
gi|43640                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--T-TGTCTCACACAACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCAATT
gi|43641                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATGACATT----TCCAATAGGGCTTCATT
gi|43642                      :                                               ----T---TGT-A--A---CAT---T---T--A-TGTCTCACACCACTATGACATT----TCCAATAGGGCTTCATT
gi|43643                      :                                               ----T---TGC-G------CAT---TTT-AT-A-CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43644                      :                                               ----T---TGT-G--A---AAC---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGATCCATT
gi|43651                      :                                                    ---TAC-G--A---CAT---A---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43652                      :                                                    ---TGC-G--AAGTCAT---C---ATTA-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43653                      :                                                    ---TGA-G--A---CCT---T---A--A-CGTTTCACACCACTGTTACATT----TCCCTTAGGTCTCCATT
gi|43654                      :                                                        GT-G--A---C-T---T---A--T-CGTCTCACACTACTATTACATT----TCCCACAGGGCTCCATT
gi|43655                      :                                                         C-G--T---CAT---T---A----CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43658                      :                                                          -G--A---TAT---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43659                      :                                                          -G--A---GAT---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43660                      :                                                          -G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43661                      :                                                          -G--A---CAA---T---A----CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43666                      :                                                            --A---CCT---T---AG-A-CGTCTCACACCATTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43670                      :                                                               ---CAT---T---C--A-CGTCCCACACCACTTTTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43675                      :                                                                    T---T---C--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43676                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43677                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTC
gi|43678                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCCATT
gi|43679                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTTCATT
gi|43680                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCGCACACCACTATTACGTT----TCCCATTGGGCTCAATT
gi|43681                      :                                                                    T---T---A--ATCGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43682                      :                                                                    T---T---A--A-TGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43683                      :                                                                    T---T---A--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCCATT
gi|43684                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCATCCCACTATTACATT----TCTCATAGGGCTCCATT
gi|43688                      :                                                                    T---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCTCCATT
gi|43689                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TGCCATAGGACTCTATT
gi|43690                      :                                                                    T---T---G--G-CGTCTCACACCACTGTTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43691                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACAATTAAATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43692                      :                                                                    T---T---T--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCACATAGGGCTCCATT
gi|43694                      :                                                                    T---T---A--A-CGTCTCACACCACCATTTCATT----TCCCGTAGGGCTCCATT
gi|43695                      :                                                                    T---T---A--A-CATCTCACACCACTATTACATTAAAATCCCATAGGGCTCCATT
gi|43700                      :                                                                     ---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43701                      :                                                                     ---T---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43702                      :                                                                     ---T---A--A-CGTCTCACACCGCTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43703                      :                                                                     ---T---A--A-CGTTTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43704                      :                                                                     ---T---A--ATCGTCTCACACCACTATTACATT----TCCTATAGGGCTCCATT
gi|43706                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCAATT
gi|43707                      :                                                                         ---A--A-TGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGATCCATT
gi|43708                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43709                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTGTTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43710                      :                                                                         ---A--A-CGTCTCACACCACTATTACATT----CCCCATAGGGCTCCA
gi|43711                      :                                                                         ---A--A-TGTCCCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATTat
gi|43712                      :                                                                         ---A--A-CGCCTCACACCACTATTACATT----TCCCAAAGGGCTCCATT
gi|43718                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43719                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43720                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43721                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43722                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43723                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43724                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43725                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43726                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43727                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43728                      :                                                                             --A-CATCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43729                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGACTCCATT
gi|43730                      :                                                                             --A-CGTCTCACATCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCTATT
gi|43731                      :                                                                             --A-CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTC
gi|43732                      :                                                                             --A-CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGTTCCATT
gi|43733                      :                                                                             --A-CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCAT-GGGCTCCATT
gi|43745                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43746                      :                                                                                -CGTCTCACGCCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT
gi|43747                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTTCATT
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gi|43749                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCAGAGGGCTCCATT
gi|43750                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTATATT----TCCCATAGGGCTCCA
gi|43751                      :                                                                                -CGTCTCACACCACTATTACATT----TCCCATATGGCTCCATTat
gi|43758                      :                                                                                  GTCTCGCACCACTATTACATT----TCCCATAGGGCTCCATT