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gi|54462 : agggcttttccagaataaaatgtatggggggGGGTGT-TT-TCATAAAAGAA-----------GA-TGCCTTTAAGGGTAAAAG-----------TTTTATGTCTTGT---------------------GGCAGATTTCT---AAAATTGCTGGTAC----TTCT--GT-TTT-TAGGCCTTTTTTT-CTTCTTGAAGTTTTATAAATTGTCTGTTTAGATAATTCCT-ACAAA----TCGTATA-AAAAAC-ATAAAAT
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gi|54450 : AAAAGTTTA-TTCAAATTTTATGCCTTGTGACAGGGCTTCTAAAAGTGACAGTA--GTTTT-------TCTTTGG-ACCAAATTTT--TT-TTTTCAAGACCGTTTTT-CTTCTCGAAATTTTATAAATTTTGTGTCCAGATATTTCCT-ACTGATTGATCGTAT--AAACCC-ATAAAATTGTCTT
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gi|54470 : CCTTCCCCAGAAGCTTTATTTCCAAA------C-----------------T--------CAATATT---CCGCAGCGTCTAGATTCCTGCAAGCGTAT-TATCTTCATCGCAGT-GGAAGCAGCAT-TTCTTTTAGATTT-ACCTTGATTTTACCTACATTTTTACCACTGACACACGggggcaataatatttgctccataacctgattgtttgtcaatgtgtgtgtaaaatgaggtcaaattggacttaaccattatcaatagtaggga
gi|54471 : CTTCCCCA-----GGT------GCT------T-G---AA----------G--------CACCATGGTACCTCAGCGCCTTGATTTC--CAAA-GTCAATAT-TCTGTGGCGTCTAGATTCCGGGGAGTCTTTTAAATTT-ACCTTGATTTGACCTACATGTTTGTCTGTGACACTCATGTTGTGCA-AATTGGAATA--CACAACCTCCCAACA--TC--AGGACTAAG--TGTAATGTTAAATGCGACTGCACAATTGG-ACACTTGATACACAGATGCTGT---ATATG---T--TA-----GGGAATATCTTTTATAAA-CTTTTT--CTTCCCAAACTGTTT--TTTTCATTT-TTGTTAAGATCACCATAA---TATAATTATATAACCTGATAACAACATAACATTTAAATGTTTTGTTTGAACTAAAAGTGTAATAAT---TATATACCCGTAGACT-CCCGAAAGGTAACGAAAACCATACTCTGGGTCATGAATAAATTATTAACACGGAAAAGTATAAGCTAATCAAAAGTCAAAATACACTCATactgcacagttggacacttgatacacagatgctgtttatatgttagggattatcttgttaaactttatcccacactgacttttcttttttgttaagatcgccattatataattacatcacctgacaacgacataacattaagttggtttgtttgaaacagtgtataataaatatctatccgcatactctggttaatgaataaatcatttacacggaaaagtacaagctaatctgaagtcggaataagtcgtagcaggccataaccccgccagtgaccctgccttctttaaaatttataccttgatgccgtgtcacagcacaagatcagacacgctatttcctcaagtaaatttcaccaattacatatcaatatttgatgtatcgaatctgtttacaaatcctccgctacggatatgaatattaaaatgtgcatataatattctgcataaatgttgattcaactttttggcggcatgcatattactataactgcacgcttattcctgctgtatgtccagtagtgtcaaaggctaatttcttcggcacaaaaacaaacaccaataaatgcaaagtcttgtgacaaaaaatctaaatacggacattgcgtcagcagtgaaaataactttgaaacatgcatctacactcgcagatttgtta
gi|54472 : ----------T--------CAATATC---CTGCAGCGTCTTGATTTCGGCAAGCGTAT-TATCTTCATCGCAAT-TGAAACAGCAG-GTCTTTTAAATTT-ACTTTGATTTGACCTACTTGTTTGCCACTGACACAAGTGTTGTGGCTGATTGTAATA--CACAACCTCC--CGA--C---ATCAGCAGGACTA-A--GTTACACGCGACTGCACAGTTGG-ACACTCGATACACAGGTGCTGT---ATATG---T--TA-----GAGATTATCTTCAATAAA-CTTTTT--CATCCTTAACTGACTTTTCTT---TT-TTGTTAAGATTGCCATTA---TATAATTACATCACACAACAATGACATATTATTAAGTTGGTTTGTTTGAAACAAA---GTA-TAATAATTATCTAC-----------CC---------------ACATACTCTGGGTCATGAATAAATTATTTACACGGAAAAGTACAAGCTAATCAGAAGTTGGAATACACTAGTAGCAGGC------------CGTAACC-CCGCC--------TTCTTTA----AAATTTATACCTTGATGCCGTGTTACAGCACA-----AGG--------------TAAGACACGCTATTTCCTCAAGTAAATTTCACCAATTACATAT------------------CAATATTTGACGTATCCAATA------CAAATTCTCTGC-TACGGATATGAATAT--AAAAGCGTGCATATGA---AATTATGCAAAAAATGT-TGATTCAACTTTTCGGCGGC------ATGTGCATTAC-TATAACTGCA--CGCGTATTCCCACTGTTCGTCAGGTAGTGTCAAACACTCATTTCTTTGG---CTCAAAAAGAATACC---AGTTAATGCAAAGTC--TTGTGAC-AAATAGTCTAAATTGGGATATTGTGTCAGCAGTGAAAATAACTTTGAAACATACATCAGCA-------CTCGCAGATTTGTTA
gi|54473 : ----------T--------CAATGTC---CTGCATCGTCTAGATATCAGCAAGCGTAG-TATCTTCACCGCAGT-GGTAACAGCAG-GTCTTCTAAATTTTACCTTGATTTGACCTACATGTTTGCCACTGACACGCGTGTTGTGGCCGATTGTAATA--CAAAACCTCC--CGA--C---ATCAGCAGGACTA-A--GTTACACGCGACTGCACATTTGG-ACACTAGATACACAGGTGCTGTATATAATAAAAT--TATGTAAGGGATTATCTTCGATAAA-CTTTTT--CATCTCAAACTGGCTTTTGTT---TT-TTGTTAAGATC-CC--AAGTTTATAATTACATCACCCAGCAACAACATAACATTAAGTTGGTTTGTTTGAAACAAA---GTA-TAAT---AA--CAATTT----CTACCCG---------------CATACTCATGGTCGTGAATAAATTATTTACACGGAAAAGTACACACTAATCAGAAGTCAGAATACACTCGTAGTAGGC------------TGTAACC-CCGCC--------CAATTTA----AAATTGATACCTTGATGCCATGT-----CACA-----GAACAAGATAAGACACGC---------TATTTCCTCAAGTAAATTTCACCAATTACATAT------------------CAATATTTGACGTATCAGATACGTTTACAAATCCTCCGC-TACGGATATGAATAT--AAAAATGTGCATA-TGT--AATTCTGCAAAAACG-T-TGATTCAACTTTTTGGTGGC------A-------TGCACATTACTATAACTGC----C--CGCTGTTTGTCAGGTAGTG----------------TCGAGAGCACAAAAAGAA-ACACCAAT-TAATGCAAAGTT--TTAAGAC-AAAAAATCTAAATTGGGATATTGCGTCAGCAGTGAAAA------------------CAAC---------TTTGAGACATA-CAT-CCACAC
gi|54474 : CTGCAG-TTCTTTTAAATTT-ACCTTGTTTTAGCCTACATGTTTACCGCTGACATGCATGTTGTCTC-GATTATA--ATACAAAACCTCC--AAA--CACCAGGACTAAG--TGTAAC-----AAGCGACAGCACAGATGG-AC
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gi|54475 : ccttccccagaagctttatttccaaactcaatattccgcagcgtctagattcctgcaagcgtattatcttcatcgcagtggaagcagcatttcttttagatttaccttgattttacctacatttttaccactgacAGTT---ACACTGGATACACTGGTGTTGT---TTATG---T--TA-----GGGATTGTCTTCAATTAA-CTTTTT--CATCTCAAACGGATTGATCTT---TT-TTGTTAAGACCGCCATAA---TATAATTACATCACCCAACAACAATTCATGATTTAATTTGTTTGTTTGAATCAAA---GTA-TAAT---TATCTACTTTCGGATTTCCCGAAAGGTGACAAGAATCATATTCTTGGTCGCAAATAAATTATTTACACGGAAATGTACAAGCTAATCAGATGTAGGAATATACTCGTAGCAGGC------------CTCAACT-CCGCC--------TACTTTATT--ATATTTATGCCTAGATGCCGTGT-----CACA-----ACG--------------T---------TATCTCCTCAAGTAAATTTCACAAATTATATAT------------------CAATACTTGACGTATCAGGTACGTTTACAAATACTCCAC-TATGGATATGAA-GT--CAAAACGTGTATACTATTAAATTCTGCAAAAACG-C-AAATTCAATTATATGGCTTC------AT------TGC-TATAATTGTA--TGCGTATCCGTGCTGTTTGTCAGATGATGTAAAATGCTAATTTATTCGG---CACAATAAGAA-ACACTAAG-TAATGCAAAGTCTATTGTGAC-CAAAAATATAAATTAAGACATTGTGTCAGCAGTGAAAATAA-----C-------ATCCATA-------TTCTCAGATTTGTCATCCCACGCTC---ACGCCTCATTCTTAACCCAGCGTCAG-A--ACAA-AT-----CATGAGGAAAGGC--AGATATTTCTTG---GT-GGTCGTA-AA-A-A---------A-C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AAT--------------TGTC-TT--CG-GGC-----------A-----------TCC-A---TA--AC--CTGATTG-TTT-GTCTTCGGGTGTGCGAAATGAGATTAAATTAGATTAAACC-TTTATCGATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATGTGTTACAATAACG-T-TTGTTTCACTGTCAGAGTGATGTCA-TTGGACATTGGCACAAGG-TGTTA--ATGAA---------AG----GCAC----A----GTGTGTTCATTCTGTACATAAATTTAGGCATGT-GA-------A---GTTATAAAC-------ATAACT-CTCTTTACAGATTG---T--AT--CAATTTAATAGTAAT-TC------T-T-T--TTATA-AAGAAAT---TAG--TA-TAC--TGAAAATAAACA-TTTT-AGAAAACAACTAGTTACAAACACA---AACAAACACTAA-GC------TTTG------A-------T-TAT---TAT-TATGT-TGT--T-GTTTTT--------------TC---A-TTTG-----------------TT---------A-TC--------T--------GTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACC-TGTGGTAAATTGTGACGTAATCACTTGCATATCAGCAT-TAG-ATCAAAA-GTGTAACCTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTAGTAATTTT------GTG-TT-----A-CAATAA--G-AAAACA----TTAGAAAGGGGATTTTAGC---CT-C-TTATTTTTTTTTTTGATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCAAATTAAAATTTTATGCATGGT-GGT-ATA--ATAACAATT-AAA
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gi|54476 : CTCCTCGGCGGC------ATGCCCATTAC-TATAACTGCA--TGCATACTCCCGCTGTTTGTCGGGTAGTGTAAAATGCTAATTTCTTCGG---CACAAAAAGAA-ACACCAAT-TAATGCAAAGTC--TTGTGACAAAAAAATCTAAATTGGGATATTGCATCAGCAGTGAAAATAACTTTGAAACATACATCCACA-------CTTGCAGATTTGTTA---GAAA---TGTG-GCTTCACT-TTACCTTGGGCCCTG-G--AAAATATGCACATATAGCTGAAATT--AGATGTTTCT
gi|54478 : catactctgggtcatgaataaattatttacacggaaaagtgcaagctaatcagaagtcggaatacacttgtagcagcccgtaacctccgactactttaaaatttataccttgatgccgtgtcacagcacaagataagacacgctatttcctcgagtaaatttcaccaattacatatcagtatttgacgtattggatatgtttacaaatcAATGAAAAAAA-----A-------ATCAGCAGAACACCTCCTCC------TCA-CCCACGCCCTA--CACCTCATTCTTACCCCAGCATCTG-A--AAAA-AT-----ACTGGGGAAAGGC--AGGTATTTCTTA---GT-GGTCGTAAAATA-A---------A-T--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AAT--------------TGTC-TT--TG-GGC-----------A-----------TCA-A---TA--AC--CAGATTG-TTT-GTCA
gi|54479 : CTGATTTTCGTTTCAAAGTTTA-ATAAAAA-AT-----CA---------GTCCAGATATTTTCTA---TC-GGTCATATAA-A-A---------T-CTCA----TA--A--------A-TTGCTCCTACCATGCCATTCTGACCTGTGA-AATACGCCATGAGGCAATATCATT--TG-ACC------------------------CA-A---TA--AT--CCGTTTG-TTTTGTCATCTGCTGTGCGAAATGATGTCAATTTCGACTAAACC-ATTGACGGTA-TT-AG--GGGAGT-
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gi|54521 : c--AGATAATTCCTA---CA-AATCGTATAA-A-A---------AAC--A----TA--A--------A---------------------------ATAA-CAT--------------T--------TA-A-------------------------TCG-A---TA--TC--CCAATTG-TTT-GTCATTATGTGTGCGAAATGGGGTCAAATTAGGCTAAACC-ATTACAGATA-GT-A---GGGA
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gi|54493 : --AGATATTTTCTA---TC-GGTCGTATAA-A-A---------T-CTAA----TA--A--------A-TTGCTCTTACCATGCCATACTGACCTGTGA-AATACGCCTTGCGGCAATATCATT--TG-ACC------------------------CA-A---TA--AT--CCGATTG-TTTTGTCACCTGCTGTTCGAAATGATGTCAATTTTGACTAAACC-ATTAATGATA-GT-A---GGGGG
gi|54497 : c--AGATATTTTCTA---TT-GGTCATATGA-A-A---------T-CTTA----TA--A--------A-TTGCCCTTACCATGTCTTACTGACCTGTGA-AATA-------------TGCC-TT--GC-AGCAATATCATTTGA-----------TCCGA---TA--AT--CGGATTGTTTT-GTCACCCGCTGTGTGAAAGGATGTCAATTTTAACTAAACC-ATTAACGATA-GT-AG--GGGAGT-
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gi|54474 : CTGCAG-TTCTTTTAAATTT-ACCTTGTTTTAGCCTACATGTTTACCGCTGACATGCATGTTGTCTC-GATTA------TAATA--CAAAACCTCC--AAACA--C--CAGGACTAAG--TGTAAC-----AAGCGACAGCACAGATGG-ACctttgagacatacatccacac
gi|54475 : AGTT---ACACTGGATACACTGGTGTTGT---TTATG---T--TA-----GG-GATTGTCTTCAATTAA-CTTTT--TCATCTCAAACGGATTGATCTT---TT-TTGTTAAGACCGCCATAA--TATAATTACATCACCCAACAACAATTCATGATTTAATTTGTTTGTTTGAATC--AAAGT---ATAAT---TATCTACTTTCGGATTTCCCGAAAGGTGACAAGAATCATATTCTTGGTCGCAAATAAATTATTTACACGGAAATGTACAAGCTAATCAGATGTAGGAATATACTCGTAGCAGGC------------CTCAACT-CCGCC--------TACTTTATT--ATATTTATGCCTAGATGCCGTGT-----CACA-----ACG--------------T---------TATCTCCTCAAGTAAATTTCACAAATTATATA------------------TCAATACTTGACGTATCAGGTACGTTTACAAATACTCC-ACTATGGATATGAA-GT--CAAAACGTGTATACTATTAAATTCTGCAAAAACGCA-AATTCAATTATATGGCTT------C------AT------TGCTATAATTGTATGCGTATCCGTGCTGTTTGTCAGATGATGTAAAATGCTAATTTATTCGGCACAATAAGAAACACTAAGTAATGCAAAGTCTATTGTGACCAAAAA-TATAAATTAAGACATTGTGTCAGCAGTGAAAATAA-----------C-------ATC-------CATATTCTCAGATTTGTCATCCCACGCTC---ACGCCTCATTCTTAACCCAGCGTCAG-AACAA-AT-----CATGA-GGAAAGGCAGATATTTCTTGGTGGT----CGTA-AA-AAA---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AAT--------------TGTC-TT--CG-GG-------CA-----------T-----CC---A-TA--AC--CTGATTG-TTT-GTCTTCGGGTGTGCGAAATGAGATTAAATTAGATTAAACC-TTTATCGATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATGTGTTACAATAACGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGATGTCATTGGACATTGGCACAAGG-TGTTAATGAA---------AG----GCACA----GTGTGTTCATTCTGTACATAAATTTAGGCATGT-GA-------A---G-------TTATAAACATAACT-CTCTTTAC-AGATTGT---ATCAAT--TTAATAGTAAT-TC------T-T-T--TTATA-AAGAAATTAG--TATAC--TGAAAATAAACA-TTTT-AGAAAACAACTAGTTACAAACACA---AACAAACACTAA-GC------TTTG------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TGT--T-GTT-TTT---------TC----ATT---T---G-----------------TT---------A-T--------CTGTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACC-TGTGGTAAATTGTGACGTAATCACTTGCATATCAGCATTAG-ATCAAAAGTGTAACCTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTAGTAATTTT------GTGTT----AC-AATAA-GAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCCT---CTTATT-TTTTTTTTTGATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCAAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATA--ATAACAATTAAA
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gi|54477 : catactctgggtcatgaataaattatttacacggaaaagtgcaagctaatcagaagtcggaatacacttgtagcagcccgtaacctccgactactttaaaatttataccttgatgccgtgtcacagcacaagataagacacgctatttcctcgagtaaatttcaccaattacatatcagtatttgacgtattggatatgtttacaaatc--ACAGACGTGTATATTATTAAATTCCGCAAAAACTAC-GATTCAACTCTACGGCGG------C------AT------TGCTATAATTATATGCATATCCGCGCTGTTTGTCAGATAGTGTAAAACACTAATTTATTCGGCACAAAAAGAAACCCCAAGAAATGCAAAGTCTATTGTGACAACAAA-TCTAAATTAAGACATTGCGTTAGCAGTGAAAATAA-----------A-------ATC-------AACATTCTCAGATATGTCATCCCACACCCTATACGCCTCATTCTTACCCCAGTGTCTG-AAAAA-AT-----CATGG-CGAAAAGCAGATGTTTCTTAACGGT----CGTACAA-AAA---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AAT--------------TGTC-TT--TG-AG-------CA-----------T-----CC---A-TA--AC--CGGATTG-TTT-GCCATCGGGTGTGCGAAATGAGGTCAAATTAGATTAAACC-TTTATCAATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATG-----------TGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGATGTCATCGGACATTGGCACAAGG-CGTTAATGAA---------AG----GGACA----GCGTGTTCATTCTGTGCATAAATTTAGGCATGT-GT-------A---G-------C-------ATAA---CTCATTAC-GGATCTT---ATCAAT--TTAATAGTAAT-TC------T-T-T--TT-T--AAGAAATTAG--TTTAC--TGAAAATAAACA-TTTT-AGAAGACAACTAGTT------ACA---AACAAACATTAA-CC------TTTA------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TG---T-GTT-TTTTTC----TCTC----GTT---T---G-----------------TT---------A-T--------CAATAGTGCCCCTTTATTTATTTCTCGACC-TGAGGTAATTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAG-ATC-AAAGTGTATCGTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTGGTAATTTTG-G-AAGCGTT----AC-AGTAA-GAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCCT---CTT-TT-TTATTTTT--ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATAT-ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGT--AAAAAAAATAAGTGCCGTCCGACC-----CCCCCAT--------ACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTt
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Reference ( family-208 ) : AGGGCTTTTCCAGAATTAAATGTATGGG-GGGGTCGGACGGCAGTATAATTAAAA--TTT----TATGCCTGGTGGGTGTTT-TCATAAAAA-----------------AA-----AA---TGATGCCTTGCGGGGTAAAAGCTTA-TTAAAATTTTATGCCTTGC--------------------CGGTATTTCC---G---TCTCTGA-ACCGAATTTTTT-CTT-CAACACCGTTTTT-CTTCTCGAAATTTTATACATTTTCTGCCCAGATATTTCCT-CCCG-----TCGTATACAAAAAC-ATAAAATTGTCCTTCCCCTG-CCTTCCCCA-----TGTA---CCGCA------C-G---AG----------T--------CAACATC---CCGCAGCGTCTAGATTTCGGCGAGCGTCT-TATCTTTATCGCAGC-AGAAACTGCAG-GTCTTTTAAATTT-ACCTTGATTTGACCTNCATGTTTGCCACTGACACGCGTGTTGTAAC-GATTG------TAATA--CACAACCTCC--AG--A--T--CATGACCAAG--TG-AACGTTTTACGCGACTGCACAGTTGG-ACACTCGATACACTGGTGNTGT---TNATA---T--TA-----GG-GATTGTCTTCAATTAA-CTTTT--TCATCTCAAACTGATTGATCTT---TT-TTGTTAAGACCGCCATAA--TATAATTACATCACCCGACAACAACATATGATTTAATTTGTTTGTTTGAAAC--AAAGT---ATAAT---TATCTACCTTCGGACTTCCCGAAAAGGGACAAGAAACATACTCTTGGTCGTGAATAAATTATTAACACGGAAATGTACGAGCTAATCAGATGNCGGAATACACTCGTAGCAGGC------------CGTAACC-CCGCC--------TACTTTATT--AAATTGATGCCGAGATGCCGTGT-----CACA-----AAA--------------T---------TATCTCCTCAAGTAAATTTCACGAATTATATA------------------TCAATATTTGACGTATCGGATACGTTTACAAATACTCC-AATACGGATATGAATAT--ACAGACGTGTATATTATTAAATTCCGCAAAAACTNC-GATTCAACTCTACGGCGG------C------AT------TGCTATAATTGTATGCGTATCCGCGCTGTTTGTCAGATAGTGTAAAACACTAATTTATTCGGCACAAAAAGAAACACCAAGAAATGCAAAGTCTATTGTGACAAAAAA-TCTAAATTAGGACATTGCGTCAGCAGTGAAAATAA-----------A-------ATC-------CACATTCTCAGATNTGTCATCCCACACCCTATACGCCTCATTCTTACCCCAGCGTCTG-AAAAA-AT-----CATGG-CGAAAAGCAGATATTTCCTANCGGT----CGTATAA-A-AN---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AATA-TGCCTT--TG-AG-------CA-----------T-----CC---A-TA--AC--CCGATTG-TTT-GTCATCGGGTGTGCGAAATGAGGTCAAATTNGACTAAACC-ATTATCGATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGACGTCATCGGACATTGGCACAAGG-CGNTAGTGAA---------AG----GGACA----GCGTGTTCATTCTGTACATAAATTTAGGCATGTGTAGTTA-T-A---A---TAACTCTCTTTAC-GGATC-T---ATCAGT--TTAATAGTAAT-T-C------T-TT--TT-T--AACAAATNAG--TATACTGAAAACAAACA-TTTT-AGAAGACAACCAGTT------ACA---AACAAACACTAA-CC------TTTA------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TG---T-GTT-TTTTT-----TCTC----GTT---T---G-----------------TT---------A-T--------CTATAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACC-TGNGGTAANTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAG-ATCAAAAGTGTAACGTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTAGTAATTTTG-G-AAGCGTT----AC-AATAA-GAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCCT---CTT-TT-TTATTTTT--ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATAT-ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGT--AAAAAAAATAAGTGCCGTCCGACC-----CCCCCAT--------ACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTTA
gi|54431 : AGGGCTTTTCCAGAATTAAATGTATGGG-GGGGTCGGACGGCAGTATAATTAAAA--TTT----TATGCCTGGTGGGTGTTT-TCATAAAAA-----------------AA-----AA---TGATGCCTTGCGGGGTAAAAGCTTA-TTAAAATTTTATGCCTTGC--------------------CGGTATTTCT---G---TCTCTGA-ACCGAATTTTTT-CTT-CAACACCGTTTTT-CTTCTCGAAATTTTATACATTTTCTGCCCAAATATTTCCT-CCCG-----TCGTATACAAAAAC-ATAAAATTGTCCTTCCCCTGTCCTTCCCCA-----TGTA---CCGCA------C-G---AG----------T--------CAACATC---CCGCAGCGTCTAGATTTCGGCGAGCGTCT-TATCTTTATCGCAGC-AGAAACTGCAG-GTCTTTTAAATTT-ACCTTGATTTGACCTTTATGTTTGCCACTGACACGCGTGTTGTAAC-GATTG------TAATATACACAACCTCC--AG--A--T--GATGACCAAG--TG-AACGTTTTACGCGACTACACAGTTGG-ACACTCAGTACACTGGTGATGT---TAATA---T--TA-----GA-AAATGTCTTCAATTAA-CTTTT--TCATCTCAAACTGATTGATCTT---TT-TTGTTAAGACCGCCGTAA--TATAATTACATCACCCGACAACAACATATGATTTAATTTGTTTGTTTGAAAT--AAAGT---ATAAT---TATCTACCTTCGGACTTCCCGAAAAGGGACAAGAAACATACTCTTAGTCGTGAATAAATTATTAACACGGAAATGTACGAGCTAATCAGATGGCGGAATACACTCGTAGCGGGC------------CGTAACC-ACGTC--------TACTTTATT--AAATTGATGCCGAGATGCCGTGT-----CACA-----AAA--------------T---------TATCTCCTCAAGTAAATTTTACGAATTATATA------------------TCAATATTTGACGTATCGGATATGTTTACAAATACTCC-AATACGGATATGAATAT--ACAGACGTGTATATTATTAAATTCCGCAAAAACTTC-GATTCAACTCTACGGCGG------C------AT------TGCTATAATTATATGCATATCCGCGCTGTTTGTCAGATAGTGTAAAACACTAATTTATTCGACACAAAAAGAAACCCCAAGAAATGCAAAGTCTATTGTGACAACAAA-TCTAAATGAAGACATTGCGTTAGCAGTGAAAATAA-----------A-------ATC-------AACATTCTCAGATATGTCATCCCACACCCTATACGCCTCATTCTTGCCCCAGTGTCTG-AAAAA-AT-----CATGG-CGAAAAGTAGATGTTTCTTAACGGT----CGTACAA-A-AA---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AAT--TGTCTT--TG-AG-------CA-----------T-----CC---A-TA--AC--CGGATTG-TTT-GCCATCGGGTGTGCGAAATGAGGTCAAGTTAGATTAAACC-TTTATCGATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGACGTCATCGGACATTGGCACAAGG-CGTTAATGAA---------AG----GGACA----GCGTGTTCATTCTGTGCATAAATTTAGGCATGTGTAGC---------A---TAACTCTCTTTAC-GGATCTT---ATCAAT--TTAATAGTAAT-T-C------T-TT--TT-T--AAGAAATTAG--TTTACTGAAAATAAACA-TTTT-AGAAGACAACTAGTT------ACA---AACAAACACTAA-CC------TTTA------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TG---T-GTT-TTTTT-----TCTC----TTT---T---G-----------------TT---------A-T--------CTATAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACC-TGAGGTAATTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAG-ATC-AAAGTGTAACGTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTGATAATTTTG-G-AAGCGTT----AC-AGTAACAAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCTT---CTT-TT-TTATTTTT--ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATAT-ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGT--AAAAAAAATAAGTGCCGTCCGACC-----CCCCCAT--------ACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTCA
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gi|54476 : CTCCTCGGCGG------C------ATGCCCATTACTATAACTGCATGCATACTCCCGCTGTTTGTCGGGTAGTGTAAAATGCTAATTTCTTCGGCACAAAAAGAAACACCAATTAATGCAAAGTCT--TGTGACAAAAAAATCTAAATTGGGATATTGCATCAGCAGTGAAAATAACTTTGAAACATAC------ATC-------CACACTTGCAGATTTGTTA---GAAA---TGTG-GCTTCACT-TTACCTTGGGCCCTG-GAAAATATGCACATATAG-CTGAAATTAGATGTTTCtcggcggcatgcccattactataactgcatgcatactcccgctgtttgtcgggtagtgtaaaatgctaatttcttcggcacaaaaagaaacaccaattaatgcaaagtcttgtgacaaaaaaatctaaattgggatattgcatcagcagtgaaaataactttgaaacatacatccacacttgcagatttgttagaaatgtggcttcactttaccttgggccctggaaaatatgcacatatagctgaaattagatgtttct
gi|54477 : catactctgggtcatgaataaattatttacacggaaaagtgcaagctaatcagaagtcggaatacacttgtagcagcccgtaacctccgactactttaaaatttataccttgatgccgtgtcacagcacaagataagacacgctatttcctcgagtaaatttcaccaattacatatcagtatttgacgtattggatatgtttacaaatc--ACAGACGTGTATATTATTAAATTCCGCAAAAACTAC-GATTCAACTCTACGGCGG------C------AT------TGCTATAATTATATGCATATCCGCGCTGTTTGTCAGATAGTGTAAAACACTAATTTATTCGGCACAAAAAGAAACCCCAAGAAATGCAAAGTCTATTGTGACAACAAA-TCTAAATTAAGACATTGCGTTAGCAGTGAAAATAA-----------A-------ATC-------AACATTCTCAGATATGTCATCCCACACCCTATACGCCTCATTCTTACCCCAGTGTCTG-AAAAA-AT-----CATGG-CGAAAAGCAGATGTTTCTTAACGGT----CGTACAA-A-AA---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AAT--TGTCTT--TG-AG-------CA-----------T-----CC---A-TA--AC--CGGATTG-TTT-GCCATCGGGTGTGCGAAATGAGGTCAAATTAGATTAAACC-TTTATCAATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATG-----------TGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGATGTCATCGGACATTGGCACAAGG-CGTTAATGAA---------AG----GGACA----GCGTGTTCATTCTGTGCATAAATTTAGGCATGTGTAG-CA-T-A---A--------CTCATTAC-GGATCTT---ATCAAT--TTAATAGTAAT-T-C------T-TT--TT-T--AAGAAATTAG--TTTACTGAAAATAAACA-TTTT-AGAAGACAACTAGTT------ACA---AACAAACATTAA-CC------TTTA------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TG---T-GTT-TTTTTC----TCTC----GTT---T---G-----------------TT---------A-T--------CAATAGTGCCCCTTTATTTATTTCTCGACC-TGAGGTAATTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAG-ATC-AAAGTGTATCGTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTGGTAATTTTG-G-AAGCGTT----AC-AGTAA-GAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCCT---CTT-TT-TTATTTTT--ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATAT-ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGT--AAAAAAAATAAGTGCCGTCCGACC-----CCCCCAT--------ACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTt
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gi|54538 : AGTGAAATAGCATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCACTG-----GTGACGTCATCGGCCATTGGCATAATG-TGATAATGAA---------AT----GGACA----GCGTATTCATTCTGTACATCAATTTAGAC-TGTGTTGTTA-T-AT--A---TATATCTC---------TC-T---ATCAGT--TTAATAATAA--T-C------T-TT--TT-T--AACATCTTGGCTATATCAAAAATAAACA-TTTT-AAAAGACAACCAGTT------CGATGTAACGAACA
gi|54539 : AGTGAAATAGCATGTGTCATATTAATGTTTGTTTCACTGTT---------TCCTCGGACATTGGCACAAGG-TGATAATGAA---------AT----GGACA----GCCCGTTCATTCTGTACATAAATGTAGATGCGTGTAGTTA-T-AC--A---TATCTCTCT
gi|54540 : AGTGAAATAGTATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCACTG-----GTGACGTCAATGGACATTGACACAAGG-TAATAATGAA---------AT----GGGCA----GCGTGTTC-TTTTGTTCAatcaggccttgtagatt
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gi|54543 : ATAA-AATGTTTGATTCACTG-----GTGACGTCATCGGACATTGGCACAAGG-TGATAGTGAA---------AG----GGACA----GGGTGTTCATTCTGTACACAAATTTAGGTATGTGTAGTTGTT-A---A---TAAC------TA--------T---ATCAGC--TTAATAGTAATCT-CT-----T-TT--TT-T--AACA-AAAGCCTATATTGAAAACAAACA-TTTT-GTAAGACACCCAGTA------ACA---AACAAACACCAA-CC------CTT
gi|54544 : ATAA-AATGTTTGTTTCACTG-----GTGACGTCATCGGACATTGGCAAAAGG-TGATAGTGAA---------AG----GGACA----TAGTGTTCATTCTGTACATAAATGTAGGTATGTGTAGTTA-TAA---A---TAACT-TCT-----------T---ATCAGT--TTATTAGTAAT-T-T------T-TTG-TT-T--AACA-AATGGCTATATTGAAAATAAACA-TTTT-AGAAGACAATCAATT------ACA---AACAAACACTTA-CC------TTTA----------------CA-----------------TG---T-GTT-TTTTT-----
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gi|54592 : AGGGCTTTTCCAGAATTAAATGTATGGG-GGGGTCGGACGGCA
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blockSeqs : . . T . . . AA T CTTA . G . C . . G . . . AC . . . . CGAGT . . . A . . TT . . . . . T . . T . A . A . . . . . . . . . A . . . G G . A . . . AAAT . . A . A . . . . G C T . A . T T T C . . . . TG G . . . TCTC . . . . CTCTTACCATGCTATAAT C . AT GAGGCAATATCA . . . . . T . . G A T T . . . . T TCAGA T T . . . T TAC . TCTCTTTACGGATCG . . . . . . . . . . TAG . . A . . . . AA . . . . A . GTT . . C . . . . AT . A T . A A . . . G C . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . N . . . AA T CTTA . G . C . . G . . . AC . . . . TGAAG . . . A . . AC . . . . . C . . A . T . T . . . . . . . . . A . . . T T . C . . . AAAT . . C . C . . . . T C A . C . T T . G . . . . GA A . . . TCTC . . . . CCCTTACCATGCCATACT C . AT GCTGCAATA . . . . . G . . G A A A . . . . T TCAGA T T . . . T TTA . TCTCTTAATGGATTG . . . . . . . . . . TAG . . A . . . . AA . . . . A . GT . . T . . . . AT . A T . A A . . . G C . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . A . . . AA A TTTA . G . T . . G . . . A . . . CT . . . C . . AC . . . . . . . . A . C . T . . . . . . . . . T . . . T T . C . . . TCGT . . C . T . . . . G C T . A . T . . T . . . . GA G . . . TCTC . . . . . . . AC TGAGCA . . . . . A . . T C A A . . . . T TCAGA C A . . . T TAA . TCTATTTACGGATTG . . . . . . . . . . TAG . . A . . . . AA . . . . A . GT . . C . . . . AT . T A . A T . . . G T . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . G . . . AA A CTT . G . C . . . . . . A . . . C . . . A . . AC . . . . . . . . A . C . T . . . . . . . . . A . . . T T . C . . . AAAT . . C . G . . . . G G T . C . T . . C . . . . A T . . . AAC . . . . . . . AT TGAGCA . . . . . C . . T T A A . . . . T TCAGA C T . . . T TTA . TCTATTTACGGATTG . . . . . . . . . . GGC . . A . . . . AA . . . . A . GT . . T . . . . AT . T A . A T . . . G T . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . G . . . AA A . . G . . . . . . . . . . . . . A . . AC . . . . . . . . A . C . T . . . . . . . . . A . . . . T . C . . . AAAT . . C . T . . . . A C T . C . T . . . . . T . . . AC . . . . . . . AC TGAGCA . . . . . C . . T G A C . . . . T TCTGA T A . . . T TTA . TGTATTTACTGATTG . . . . . . . . . . TAG . . A . . . . AA . . . . A . GT . . C . . . . AT . T A . A T . . . C T . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . G . . . A A . . G . . . . . . . . . . . . . T . . AC . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . T . . . . T . C . . . ACGT . . C . C . . . . A G T . A . A . . . . . T . . . AC . . . . . . . AT TGAGCA . . . . . C . . A A A T . . . . T TCTGA T A . . . T TTA . TCTATTTACAGAAAG . . . . . . . . . . GGC . . C . . . . GA . . . . A . TT . . A . . . . AT . T A . A T . . . G T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . A T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . ACGT . . . A . . . . . . A . A . . . . . . . C . . . AC . . . . . . . AC TGAGCA . . . . . C . . A A A A . . . . T TCTGA T A . . . T TTA . CTCATTACGGATCT . . . . . . . . . . GCC . . A . . . . AA . . . . A . GT . . C . . . . AT . T A . A T . . . G T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . T C . . . AC . . . . . . . AT TAGGCA . . . . . C . . T T A T . . . . T TCTGA T T . . . T TTA . TATCTTTGCGGAT . . . . . . . . . . GGC . . C . . . . AA . . . . G . GT . . C . . . . AT . A A . A T . . . C T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . . . AC . . . . . . . T TGAGCA . . . . . T . . G G A T . . . . T TCAGA T A . . . T TTA . TATCTTTGCAGAT . . . . . . . . . . GAC . . C . . . . TA . . . . G . GT . . T . . . . AT . T C . . A . . . C T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . C . . . AC . . . . . . . T CGGGCA . . . . . C . . A A A T . . . . T TCAGA T A . . . T TTA . TCTTTACATT . . . . . . . . . . GCC . . C . . . . TA . . . . A . GT . . . . . . . AT . T C . . A . . . C T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . AC . . . . . . . T TGAGCA . . . . . T . . C T A A . . . . T TT T A . . . T TTA . TCTCTC . . . . . . . . . . GCC . . C . . . . AA . . . . A . GT . . . . . . . TA . C C . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . AC . . . . . . . T TGGGCA . . . . . G . . C T A A . . . . T T T A . . . T TTA . TCTCT . . . . . . . . . . GCC . . C . . . . AA . . . . A . TT . . . . . . . TT . T A . . . .
blockSeqs : . T . . . AC . . . . . . . T TGA . . . . . T . . T T A A . . . . . . T A . . . T TTA . TCTCT . . . . . . . . . . GCC . . C . . . . AA . . . . A . AT . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . AT . . . . . . . T TGA . . . . . C . . T T A C . . . . . . T A . . . T TA . TTCT . . . . . . . . . . GCC . . C . . . . AA . . . . G . AT . .
blockSeqs : . T . . . CC . . . . . . . T TGC . . . . . T . . C T A A . . . . . T A . . . T TA . ATC . . . . . . . . . . GCC . . C . . . . A . . . . A . G . .
blockSeqs : . T . . . CC . . . . . . . T TGA . . . . . C . . T C A C . . . . . T A . . . T TA . ATC . . . . . . . . . . GCC . . C . . . . A . . . . . . T .
blockSeqs : . T . . . CC . . . . . . . T GCG . . . . . C . . A T A C . . . . . T A . . . T TA . ATC . . . . . . . . . . GCC . . C . . . . A . . . . . . T .
blockSeqs : . T . . . AT . . . . . . . T GCG . . . . . C . . A A G A . . . . . T A . . . T TA . TA . . . . . . . . . . GCC . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . TT . . . . . . . A TAA . . . . . A . . C T A C . . . . . T A . . . T TA . TC . . . . . . . . . . CGT . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . GT . . . . . . . A TGA . . . . . T . . A T A C . . . . . T A . . . T T . TC . . . . . . . . . . GGC . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A GCA . . . . . T . . C T A T . . . . . T A . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A TGA . . . . . A . . A A A C . . . . . T T . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : GC . . . . . C . . A A A T . . . . . T T . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A A T T . . . . . T C . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . A A . T . . . . . T C . . . . . . TC . . . C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . T A . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : *********** CCGAGT*************************** ** CAT** AT* TGGGCA********************* TA*****
originalCons : AGGGCTTTTCCAGAATTAAATGTATGGG-GGGGTCGGACGGCAGTATAATTAAAA--TTT----TATGCCTGGTGGGTGTTT-TCATAAAAA-----------------AA-----AA---TGATGCCTTGCGGGGTAAAAGCTTA-TTAAAATTTTATGCCTTGC--------------------CGGTATTTCC---G---TCTCTGA-ACCGAATTTTTT-CTT-CAACACCGTTTTT-CTTCTCGAAATTTTATACATTTTCTGCCCAGATATTTCCT-CCCG-----TCGTATACAAAAAC-ATAAAATTGTCCTTCCCCTG-CCTTCCCCA-----TGTA---CCGCA------C-G---AG----------T--------CAACATC---CCGCAGCGTCTAGATTTCGGCGAGCGTCT-TATCTTTATCGCAGC-AGAAACTGCAG-GTCTTTTAAATTT-ACCTTGATTTGACCTNCATGTTTGCCACTGACACGCGTGTTGTAAC-GATTG------TAATA--CACAACCTCC--AG--A--T--CATGACCAAG--TG-AACGTTTTACGCGACTGCACAGTTGG-ACACTCGATACACTGGTGNTGT---TNATA---T--TA-----GG-GATTGTCTTCAATTAA-CTTTT--TCATCTCAAACTGATTGATCTT---TT-TTGTTAAGACCGCCATAA--TATAATTACATCACCCGACAACAACATATGATTTAATTTGTTTGTTTGAAAC--AAAGT---ATAAT---TATCTACCTTCGGACTTCCCGAAAAGGGACAAGAAACATACTCTTGGTCGTGAATAAATTATTAACACGGAAATGTACGAGCTAATCAGATGNCGGAATACACTCGTAGCAGGC------------CGTAACC-CCGCC--------TACTTTATT--AAATTGATGCCGAGATGCCGTGT-----CACA-----AAA--------------T---------TATCTCCTCAAGTAAATTTCACGAATTATATA------------------TCAATATTTGACGTATCGGATACGTTTACAAATACTCC-AATACGGATATGAATAT--ACAGACGTGTATATTATTAAATTCCGCAAAAACTNC-GATTCAACTCTACGGCGG------C------AT------TGCTATAATTGTATGCGTATCCGCGCTGTTTGTCAGATAGTGTAAAACACTAATTTATTCGGCACAAAAAGAAACACCAAGAAATGCAAAGTCTATTGTGACAAAAAA-TCTAAATTAGGACATTGCGTCAGCAGTGAAAATAA-----------A-------ATC-------CACATTCTCAGATNTGTCATCCCACACCCTATACGCCTCATTCTTACCCCAGCGTCTG-AAAAA-AT-----CATGG-CGAAAAGCAGATATTTCCTANCGGT----CGTATAA-A-AN---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AATA-TGCCTT--TG-AG-------CA-----------T-----CC---A-TA--AC--CCGATTG-TTT-GTCATCGGGTGTGCGAAATGAGGTCAAATTNGACTAAACC-ATTATCGATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGACGTCATCGGACATTGGCACAAGG-CGNTAGTGAA---------AG----GGACA----GCGTGTTCATTCTGTACATAAATTTAGGCATGTGTAGTTA-T-A---A---TAACTCTCTTTAC-GGATC-T---ATCAGT--TTAATAGTAAT-T-C------T-TT--TT-T--AACA-AATGNCTATACTGAAAACAAACA-TTTT-AGAAGACAACCAGTT------ACA---AACAAACACTAA-CC------TTTA------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TG---T-GTT-TTTTT-----TCTC----GTT---T---G-----------------TT---------A-T--------CTATAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACC-TGNGGTAANTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAG-ATCAAAAGTGTAACGTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTAGTAATTTTG-G-AAGCGTT----AC-AATAA-GAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCCT---CTT-TT-TTATTTTT--ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATAT-ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGT--AAAAAAAATAAGTGCCGTCCGACC-----CCCCCAT--------ACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTTA
finalCons : AGGGCTTTTCCAGAATTAAATGTATGGG-GGGGTCGGACGGCAGTATAATTAAAA--TTT----TATGCCTGGTGGGTGTTT-TCATAAAAA-----------------AA-----AA---TGATGCCTTGCGGGGTAAAAGCTTA-TTAAAATTTTATGCCTTGC--------------------CGGTATTTCC---G---TCTCTGA-ACCGAATTTTTT-CTT-CAACACCGTTTTT-CTTCTCGAAATTTTATACATTTTCTGCCCAGATATTTCCT-CCCG-----TCGTATACAAAAAC-ATAAAATTGTCCTTCCCC-----------A-----TGTA---CCGCACCGAGT---------------------------CAACATC---CCGCAGCGTCTAGATTTCGGCGAGCGTCT-TATCTTTATCGCAGC-AGAAACTGCAG-GTCTTTTAAATTT-ACCTTGATTTGACCTNCATGTTTGCCACTGACACGCGTGTTGTAAC-GATTG------TAATA--CACAACCTCC--AG--ACAT--CATGACCAAG--TG-AACGTTTTACGCGACTGCACAGTTGG-ACACTCGATACACTGGTGNTGT---TNATA---T--TA-----GG-GATTGTCTTCAATTAA-CTTTT--TCATCTCAAACTGATTGATCTT---TT-TTGTTAAGACCGCCATAA--TATAATTACATCACCCGACAACAACATATGATTTAATTTGTTTGTTTGAAAC--AAAGT---ATAAT---TATCTACCTTCGGACTTCCCGAAAAGGGACAAGAAACATACTCTTGGTCGTGAATAAATTATTAACACGGAAATGTACGAGCTAATCAGATGNCGGAATACACTCGTAGCAGGC------------CGTAACC-CCGCC--------TACTTTATT--AAATTGATGCCGAGATGCCGTGT-----CACA-----AAA--------------T---------TATCTCCTCAAGTAAATTTCACGAATTATATA------------------TCAATATTTGACGTATCGGATACGTTTACAAATACTCC-AATACGGATATGAATAT--ACAGACGTGTATATTATTAAATTCCGCAAAAACTNC-GATTCAACTCTACGGCGG------C------AT------TGCTATAATTGTATGCGTATCCGCGCTGTTTGTCAGATAGTGTAAAACACTAATTTATTCGGCACAAAAAGAAACACCAAGAAATGCAAAGTCTATTGTGACAAAAAA-TCTAAATTAGGACATTGCGTCAGCAGTGAAAATAA-----------A-------ATC-------CACATTCTCAGATNTGTCATCCCACACCCTATACGCCTCATTCTTACCCCAGCGTCTG-AAAAA-AT-----CATGG-CGAAAAGCAGATATTTCCTANCGGT----CGTATAA-A-AN---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AATAT-GCCTTTGGGCA---------------------T-----CC---A-TA--AC--CCGATTG-TTT-GTCATCGGGTGTGCGAAATGAGGTCAAATTNGACTAAACC-ATTATCGATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATGTGTCATAATAATGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGACGTCATCGGACATTGGCACAAGG-CGNTAGTGAA---------AG----GGACA----GCGTGTTCATTCTGTACATAAATTTAGGCATGTGTAGTTATA-----A---TAACTCTCTTTAC-GGATC-T---ATCAGT--TTAATAGTAAT-T-C------T-TT--TT-T--AACA-AATGNCTATACTGAAAACAAACA-TTTT-AGAAGACAACCAGTT------ACA---AACAAACACTAA-CC------TTTA------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TG---T-GTT-TTTTT-----TCTC----GTT---T---G-----------------TT---------A-T--------CTATAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACC-TGNGGTAANTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAG-ATCAAAAGTGTAACGTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTAGTAATTTTG-G-AAGCGTT----AC-AATAA-GAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCCT---CTT-TT-TTATTTTT--ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATAT-ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGT--AAAAAAAATAAGTGCCGTCCGACC-----CCCCCAT--------ACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTTA
Alignments
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lowQualScore : . .. . .... . ................. .......... . ..... .................... ....... . . . . . . . . . ..... .. ... . . ........... ... .... ............................... . . . . . .. . ...... .. . .... . . . . ... . ... .. ..... . . .. ... . .. . . .. ... ... . . . ............ .. . ........ . .. ..... ................................ . .................. . . . .. . . ...... ...... ...... . . . . . ................... ....... . . . . . . ..... .. . .. . . .... . . ............. .... .. ........ . .................. . . ... ............................ ... . .. .. . . . . . . .. . . . ... . . ..... .. . ......... .... .... . ....... ... ................ ... .. . . ...... . .. . .. . ... . . . . . ...... ... . ...... ............... . ... ... . . . ...... . ..... . .... ... ... ................. .................... . . . . . . . ... .. ... . .... . . .. . ... ... . . . .. . . .. ..... ........
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gi|54471 : ccttccccagaagctttatttccaaactcaatattccgcagcgtctagattcctgcaagcgtattatcttcatcgcagtggaagcagcatttcttttagatttaccttgattttacctacatttttaccactgacCTT-----------CC---CCAGGTGCTTGAAGCA------------CCA---T-G----------GTA-----CCTCAGCGCCTTGATTTC--CAAA-GTCAATAT-TCTGTGGCGTCTAGATTCCGGGGAGTCTTTTAAATTT-ACCTTGATTTGACCTACATGTTTGTCTGTGACACTCATGTTGTGCA-AATTG------GA--ATACACAACCTCCCAACATCAG---GACTAAGTGTAATGTTAAATGCGACTGCACAATTGG-ACACTTGATACACAGATGCTGT---ATATG---T--TA-----GG-GAATATCTTTTATAAA-CTTTT--TCTTCCCAAACTGTTT--TTTTCATTT-TTGTTAAGATCACCATAA--TATAATTATATAACCTGATAACAACATAACATTTAAATGTTTTGTTTG-AACTAAAAGTGTAATAAT---TATATACCCGTAGAC-TCCCGAAAGGTAACGAAAACCATACTCTGGGTCATGAATAAATTATTAACACGGAAAAGTATAAGCTAATCAAAAGTCAAAATACACTCAT
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gi|54473 : ----------TCAATGTCCTGCATCGTCTAGATATCAGCAAGCGTAG-TATCTTCACCGCAGT-GGTAACAGCAG-GTCTTCTAAATTTTACCTTGATTTGACCTACATGTTTGCCACTGACACGCGTGTTGTGGCCGATTG------TA--ATACAAAACCTCCCGACATCAGCAGGACTAAGTT-A------CACGCGACTGCACATTTGG-ACACTAGATACACAGGTGCTGTATATAATAAAAT--TATGTAAGG-GATTATCTTCGATAAA-CTTTT--TCATCTCAAACTGGCTTTTGT---TTT-TTGTTAAGATC-CCA-AGTTTATAATTACATCACCCAGCAACAACATAACATTAAGTTGGTTTGTTTGAAAC--AAAGT---ATAAT---AA--CAATTT----CTACCCG---------------CATACTCATGGTCGTGAATAAATTATTTACACGGAAAAGTACACACTAATCAGAAGTCAGAATACACTCGTAGTAGGC------------TGTAACC-CCGCC--------CAATTTA----AAATTGATACCTTGATGCCATGT-----CACA-----GAACAAGATAAGACACGC---------TATTTCCTCAAGTAAATTTCACCAATTACATA------------------TCAATATTTGACGTATCAGATACGTTTACAAATCCTCC-GCTACGGATATGAATAT--AAAAATGTGCATA-TGT--AATTCTGCAAAAACGTT-GATTCAACTTTTTGGTGGCATGCAC------AT------TACTATAACTG---------CC-CGCTGTTTGTCAGGTAGTGTCGAG-------------AGCACAAAAAGAAACACCAATTAATGCAAAGTT--TTAAGACAAAAAA-TCTAAATTGGGATATTGCGTCAGCAGTGAAAACAA-----------
gi|54474 : CTGCAG-TTCTTTTAAATTT-ACCTTGTTTTAGCCTACATGTTTACCGCTGACATGCATGTTGTCTC-GATTA------TA--ATACAAAACCTCCAAACACCAG---GACTAAGTGTAAC-----AAGCGACAGCACAGATGG-ACctttgagacatacatccacac
gi|54475 : AGTT---ACACTGGATACACTGGTGTTGT---TTATG---T--TA-----GG-GATTGTCTTCAATTAA-CTTTT--TCATCTCAAACGGATTGATCT---TTT-TTGTTAAGACCGCCATAA--TATAATTACATCACCCAACAACAATTCATGATTTAATTTGTTTGTTTGAATC--AAAGT---ATAAT---TATCTACTTTCGGATTTCCCGAAAGGTGACAAGAATCATATTCTTGGTCGCAAATAAATTATTTACACGGAAATGTACAAGCTAATCAGATGTAGGAATATACTCGTAGCAGGC------------CTCAACT-CCGCC--------TACTTTATT--ATATTTATGCCTAGATGCCGTGT-----CACA-----ACG--------------T---------TATCTCCTCAAGTAAATTTCACAAATTATATA------------------TCAATACTTGACGTATCAGGTACGTTTACAAATACTCC-ACTATGGATATGAA-GT--CAAAACGTGTATACTATTAAATTCTGCAAAAACGCA-AATTCAATTATATGGCTT------C------AT------TGCTATAATTGTATGCGTATCCGTGCTGTTTGTCAGATGATGTAAAATGCTAATTTATTCGGCACAATAAGAAACACTAAGTAATGCAAAGTCTATTGTGACCAAAAA-TATAAATTAAGACATTGTGTCAGCAGTGAAAATAA-----------C-------ATC-------CATATTCTCAGATTTGTCATCCCACGCTC---ACGCCTCATTCTTAACCCAGCGTCAG-AACAA-AT-----CATGA-GGAAAGGCAGATATTTCTTGGTGGT----CGTA-AA-A-AA---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AAT--TGTCTTCGGGC-----------A-----------TCC---A-TA--AC--CTGATTG-TTT-GTCTTCGGGTGTGCGAAATGAGATTAAATTAGATTAAACC-TTTATCGATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATGTGTTACAATAACGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGATGTCATTGGACATTGGCACAAGG-TGTTAATGAA---------AG----GCACA----GTGTGTTCATTCTGTACATAAATTTAGGCATGTGAAGTTA-T-AAACA---TAACTCTCTTTAC-AGATTGT---ATCAAT--TTAATAGTAAT-T-C------T-TT--TTATA-AAGA-AATTAGTATACTGAAAATAAACA-TTTT-AGAAAACAACTAGTTACAAACACA---AACAAACACTAA-GC------TTTG------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TGT--T-GTT-TTT---------TC----ATT---T---G-----------------TT---------A-T--------CTGTAGTGCCCCTTTATTTAATTCTCGACC-TGTGGTAAATTGTGACGTAATCACTTGCATATCAGCATTAG-ATCAAAAGTGTAACCTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTAGTAATTTT------GTGTT----AC-AATAA-GAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCCT---CTTATT-TTTTTTTTTGATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCAAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATA--ATAACAATTAAA
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gi|54476 : CTCCTCGGCGG------C------ATGCCCATTACTATAACTGCATGCATACTCCCGCTGTTTGTCGGGTAGTGTAAAATGCTAATTTCTTCGGCACAAAAAGAAACACCAATTAATGCAAAGTCT--TGTGACAAAAAAATCTAAATTGGGATATTGCATCAGCAGTGAAAATAACTTTGAAACATAC------ATC-------CACACTTGCAGATTTGTTA---GAAA---TGTG-GCTTCACT-TTACCTTGGGCCCTG-GAAAATATGCACATATAG-CTGAAATTAGATGTTTCtcggcggcatgcccattactataactgcatgcatactcccgctgtttgtcgggtagtgtaaaatgctaatttcttcggcacaaaaagaaacaccaattaatgcaaagtcttgtgacaaaaaaatctaaattgggatattgcatcagcagtgaaaataactttgaaacatacatccacacttgcagatttgttagaaatgtggcttcactttaccttgggccctggaaaatatgcacatatagctgaaattagatgtttct
gi|54477 : catactctgggtcatgaataaattatttacacggaaaagtgcaagctaatcagaagtcggaatacacttgtagcagcccgtaacctccgactactttaaaatttataccttgatgccgtgtcacagcacaagataagacacgctatttcctcgagtaaatttcaccaattacatatcagtatttgacgtattggatatgtttacaaatc--ACAGACGTGTATATTATTAAATTCCGCAAAAACTAC-GATTCAACTCTACGGCGG------C------AT------TGCTATAATTATATGCATATCCGCGCTGTTTGTCAGATAGTGTAAAACACTAATTTATTCGGCACAAAAAGAAACCCCAAGAAATGCAAAGTCTATTGTGACAACAAA-TCTAAATTAAGACATTGCGTTAGCAGTGAAAATAA-----------A-------ATC-------AACATTCTCAGATATGTCATCCCACACCCTATACGCCTCATTCTTACCCCAGTGTCTG-AAAAA-AT-----CATGG-CGAAAAGCAGATGTTTCTTAACGGT----CGTACAA-A-AA---------C--A----TA--A--------A-TTG------------------GAC-TGTGA-AAT--TGTCTTTGAGC-----------A-----------TCC---A-TA--AC--CGGATTG-TTT-GCCATCGGGTGTGCGAAATGAGGTCAAATTAGATTAAACC-TTTATCAATA-GT-A---GGGAGT-AAATAACATG-----------TGTTTGTTTCACTGTCAGAGTGATGTCATCGGACATTGGCACAAGG-CGTTAATGAA---------AG----GGACA----GCGTGTTCATTCTGTGCATAAATTTAGGCATGTGTAG-CA-T-A---A--------CTCATTAC-GGATCTT---ATCAAT--TTAATAGTAAT-T-C------T-TT--TT-T--AAGA-AATTAGTTTACTGAAAATAAACA-TTTT-AGAAGACAACTAGTT------ACA---AACAAACATTAA-CC------TTTA------A-------T-TA---T---TAT-TATGT-TG---T-GTT-TTTTTC----TCTC----GTT---T---G-----------------TT---------A-T--------CAATAGTGCCCCTTTATTTATTTCTCGACC-TGAGGTAATTTGTGACGTAATCACTTGCATATCGGCATTAG-ATC-AAAGTGTATCGTCGGC-GTACTTCAAAGAAAGTAGGCA---AC--CGTCCAGACTGGTAATTTTG-G-AAGCGTT----AC-AGTAA-GAA--AACATTAGAA---AGGGGATTTTAGCCT---CTT-TT-TTATTTTT--ATTTTGTGCATGGTGGTATTTTATCTAATTAAAATTTTATGCATGGTGGTATAT-ATCACAATTAAATTTTATGCTCTGTGGGT--AAAAAAAATAAGTGCCGTCCGACC-----CCCCCAT--------ACATTTAATTCTGGAAAAGCCCTt
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gi|54479 : ctga-AAAAA-AT-----CA-GT-C------CAGATATTTTCTATCGGT----CATATAA-A-AT---------CTCA----TA--A--------A-TTGCTCCTACCATGCCATTCTGACCTGTGA-AATA-CGCCATGAGGC-----------AATATCATTTGACCC---AATA--AT--CCGTTTG-TTTTGTCATCTGCTGTGCGAAATGATGTCAATTTCGACTAAACC-ATTGACGGTA-TT-AG--GGGAGT-tctgacctgtgaaatacgccatgaggcaatatcatttgacccaataatccgtttgttttgtcatctgctgtgcgaaatgatgtcaatttcgactaaaccattgacggtattaggggagt
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