lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                11111                                                                                                                                                    22222222222222222222222222                            1111111                                              
lowQualScore                  :                                                                     1       66666666 0     22222222  666666      0  11111111   11111111  11 44444444 11111111 11111 2 00 00  111     000 4 111  11111    8888888888888888888888888888888888 111 22  33   00  0 333333 666666666  111 00  11111 77777   8888888 111111111  111111111     00 11 11111 555555555555555555555555 111111  33333  0 11 44444444444  11111 4444444444  0 6666666666666    0 33 33333333333333333333333333 0 444444444  33333333  111 4444444   44444 2  0  0   0 0  77  0   44444  0      
lowQualScore                  :                                                                     .       ........ .     ........  ......      .  ........   ........  .. ........ ........ ..... . .. ..  ...     ... . ...  .....    .................................. ... ..  ..   ..  . ...... .........  ... ..  ..... .....   ....... .........  .........     .. .. ..... ........................ ......  .....  . .. ...........  ..... ..........  . .............    . .. .......................... . .........  ........  ... .......   ..... .  .  .   . .  ..  .   .....  .      
lowQualScore                  :                                                                     5       11111111 6     11111111  888888      7  22222222   11111111  33 55555555 11111111 11111 5 88 44  999     888 8 333  77777    6666666666666666666666666666666666 888 00  11   44  3 333333 999999999  000 44  66666 66666   1111111 555555555  888888888     55 22 55555 555555555555555555555555 111111  33333  4 33 99999999999  66666 4444444444  4 4444444444444    9 88 88888888888888888888888888 7 111111111  88888888  222 5555555   88888 0  7  7   7 7  33  8   33333  8      
consensus                     :                                                                 TCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------CA---T--CG-----T-GCTATCG------CG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGT-GT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-GC-GA-TGG-C-CCN-AA-CGG----AAC-ACCGTA
Reference ( gi|103748 )       :                                                                 TCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GTCATCG------CG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGT-GT-G-CTT--A--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-AA-CGG----GAC-ACCGTA
gi|103747                     :                                                                 TCGT-GTCATCGTACTATC-A-CCATC--------GTGT----TATCGT-AC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT-----------------------------------------GC--TAT--CG-T------G--G------CA---T--CG-----C-G-CAT
gi|103759                     :                                           tcgtgctatcgtgtcatcaccaTCGT-GTCATCG------T-A-CCATC--------AC------CATCGT-GC--------TATCGTACTATCG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT-----------------------------------------GC--TAT--CG-T------G--G------CA---T--CG-----C-GTgcttgttgacaaagcaatagcacgatggccctaacggaacaccgta
gi|103753                     :                                           tcgtgctatcgtgtcatcaccaTCGT-GTCATCGTACTATC-A-CCATC--------GTGC----TATCGT-AC--------TAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATCG---C-G---TCA----TCGT-----------------------------------------GC--TAT--CG-T------G--G------CA---T--CG-----C-GTatacttgttgacaaagcgatagcacgaaggccctaacggaacaccgta
gi|103755                     :                                           tcgtgctatcgtgtcatcaccaTCGT-GTCATCG------C-G-TCATCACCATCGTGT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------G-----CAT--atgcttgttgacaaagcgatagcacgatggccttaacggaacaccgta
gi|103763                     :                     tcgtgctatcgtgtcatcatcatcgtgtcatcgtaccatcaccaTCAT-ACTATCG------T-G-CCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------G--------C-----TAT--C--ATGG-CATCG---C-G---Ttgcgtgtgcttgttgacaaagcgatagcacgatggccctaatggaacaccgta
gi|103846                     :             tcgtgctatcgtgtcatcaccatcgtgtcatcgtactatcaccatcgtgctaTCGT-GTCATTG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------C--------------------------------------------G---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CA-T------G--T------CA---T--CG-----T-GTCATCG------CG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T--------------------------------------------------------------GT-GT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GG-TGG-C-CCT-AA-TGG----GAC-ACCGTAatgcttgtttacaaagcgatagcacgatggccctaatggaacaacata
gi|103751                     :                                                                 TCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCA
gi|103894                     :                                                                 TCGT-ACCATCA------CCA-TTAT---------GC------TATCGT-AC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATTG---T-G---TCA----TCGT-----------------------------------------GC--TAT--CG-T------G--G------CA---T--CG-----
gi|103770                     :                                                             gtcaTCGT-GCCATCA------C----CATC--------GTGT----CATCGT-GT--------TAT--------CG--T--------G--------catatgcttgttgacaaagcgatagcacgatggccctaacagaacaccgta
gi|103752                     :     tcgtgttattgcatcttcgtcatcgtgacatcgctccattaccattgtgctatcgtaatgTCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------CAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATTG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTGTCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAgtattgcgtgtgcctgttgacaaagcgatagcacgattaccctaacggaacaccgta
gi|103783                     :                                                                 TCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T---------------G----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCA
gi|103879                     :                                                                 TCGT-GTCATCG------T-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----TAT--C--AC---CATTG---T-G---TCA----TCGT------G--------C--------TA--------T---CTAGG--CAT--CG-T------G--T------
gi|103812                     :                                                           tcaccaTTGT-GCTGTCG------T-G-GCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----TAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------C--------TA--------T---C--ATGGCAT--TG-C------G--T------atgcttgttgacaaagcaatagcacgatggccctaatggaacaccgta
gi|103750                     :                                             gtaatatcgcgtcattgtcaTCGT-GCTATCG------T-G-TCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---CTA----TCGT------ACTATCGTGC--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TA----G--CATC---------atgcttgttgacaaagcaatagcacgatgacccttacggaacaccgta
gi|103784                     :                                                                 TCGT-GCTATTG------T-G-CCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------G--------T-----TAT--C---CTGGCATCG---C-G---Tg
gi|103784                     :              tcgtgttatcgcttgttcgtcaacgttaatcgtttgttctccatcgtgctaTCGT-GCTATCG------T-G-CTATT--------GTGC----CATCA---C--------CAT--------CG--T--------G--------T------------------CATCG---T-G---TTA----TCCT------G--------G--------CA--------T---C--GC--gtgcctgttgacaaagcgatagcacctaacggaacaccgta
gi|103781                     :                      tcgtgttatcgcttgttcgtcaacgttaatcgtttgttctccaTCGT-GCTATCG------T-G-TCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---CTA----TCGT------G--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TA----G--CATC---------gtgtgcctgttgacaaagcgatagcacctaacggaacaccgta
gi|103887                     :                                                                 TCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GTg
gi|103782                     :                                                             gtcaTCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-G
gi|103921                     :                                             tcgtcatcgtgccatcaccaTCGT-GTCATCG------T-G-CTATC--------GTGG----CATCGC-GC--------
gi|103880                     :                                                                aTCGT-GCCATCG------T-G-TCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--GCGTCAT--CG-T------atgcttgttgacaaagcgatagcacgatggccctaacggaacaccgta
gi|103878                     :                                                           tcgtcaTCGT-GCCATCG------T-G-TCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--GCGTCAT--CG-T------
gi|103888                     :                                                           tcgtcaTCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--
gi|103756                     :                                                             gtcaTCGT-GCCATCG------T-G-CCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---CTA----TCGT------A--------C--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----C-GTCATC--------------------------------------------------------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------
gi|103764                     :                                                                 TCGT-GTCATCG------T-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--t
gi|103764                     :                                   tcgtgttttcgtgccatcgctccatcaccaTCGT-GCCATCG------C-T-CCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--GT---CATCG---T-G---CTA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T---------------A----C--TATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------
gi|103754                     :                                                         tcgtgtttTCGT-GCCATCG------T-G-CCATC--------AC------CTTCGT-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----TAT--C--AC---CATCG---T-G---CTA----TCGT------ACTATCGTGC--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-
gi|103889                     :                                                                 TCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------CAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATTG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--ac
gi|103893                     :                                                             gtcaTCGT-GTCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------CAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----ACGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--
gi|103863                     :                                                             gtcaTCGT-GTCATTG------C-A-CCATC--------AC------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T-------------------------------AC---TATCG---T-G---CCA----TC--------A--------C--------CA---------------------T--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TA----G--CAT
gi|103890                     :                                                            cgtcaTCGT-ACCATCA------CCA-TC-TC--------GC------TATCGT-AC--------TAT--------CA--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---CCA----TCGT------G--------C--------TA--------T---CGTAG--CAT--CG-tg
gi|103832                     :                                                             gtcaTCGT-GTCATCA------T-G-TCATCT-------GCAATCAACATCGT-GC--------TAT--------CG--TACTTTTGTG--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT-----------------------------------------GC--TAT--CG-T------G--G------CG---T--CG-----T-
gi|103777                     :                                                                 TCGT-GCCATCG------TTG-TT-TC--------AT------CATCGT-GC--------CAT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCG---T-A---CCA----TCGT------A--------C--------CATCGCGCTTT---C--AC--CAT--TG-T------A--C------CA---T--CG-----T-G-CATCG------CG----
gi|103908                     :                                                                 TCGT-ACTATCG------C-G-TCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--T--------G--------C-----TAT--C--GTTG-CATCG---gttcagggagacaaaaaatgttacttatgtccaaacggaacaccgta
gi|103901                     :                                                    caccatcgtgctaTCGT-ACCATCA------C----CATC--------ATGA----TATCGT-AC--------TAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------
gi|103758                     :                                                             gtcaTCGT-GATTTCG------T-G-TTTTC--------AT------CATAGT-AG--------TTT--------CG--T--------A--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-G---ATT----TCG-------A--------C--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------
gi|103761                     :                                                                 TCGT-GATTTCG------T-G-TTTTC--------AT------CATCGT-AG--------TTT--------CG--T--------A--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-G---ATT----TCG-------A--------C--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------agtttcgactttcgtggtatggggttcacaaataaaaaacgcgatggtccaaacggaacaccgta
gi|103779                     :                                                                 TCGT-AACATCG------T-G-TTTTC--------AC------CATCGT-AC--------CAT--------CA--C--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCG---T-G---CCT----TCGT------T--------G--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------A--C------CA---T--CG-----T--------------TG----T--T-TC---------ACCAT--C--G-----T----------agtttcgactttcgactttcgtggtatggggttcagaaataaaaaaaacgcgatggtccaaacggaacaccgta
gi|103873                     :                                                                 TCGT-GCCTTCG------TTG-TT-TC--------AC------CATCGT-AC--------CAT--------CG--TT-------G--------T-----T-T--C--AC---CATCG---T-A---CAA----TCGT------T--------G--------TT--------T---C--AC--GTT--CG-T------A--C------CA---T--CG-----T-GT
gi|103767                     :                                                         tttcatcaTCGT-GATTTCG------T-G-TTTTC--------AT------CATCGT-AG--------TTT--------CG--T--------A--------T-----TTT--C--AT---CATCG---T-G---ATT----TCG-------A--------C--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------t
gi|103768                     :                                                                 TCGT-GATTTCG------T-G-TTTTC--------AT------CATCGT-AG--------TTT--------CA--T--------A--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-G-----A----TTTTG-----A--------C--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------agtttcgactttagacttttgtggtatggggctcagaaataaaaaacgcgatggtccaaacggaacaccgta
gi|103792                     :                                                                 TCGTAGTT-TCG------C-G-TTTTC--------AC------CATCGTTGT--------T-T--------TG--C--------G--------T-----TTT--C--AC---CATCG---TAG---TT-----TCGC------G--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------A--G------TA---T--CG-----TAGTT-TCG------CG----T--TTTC---------ACCAT--C--G-----T----------agtttagactttcgactttcgtggtatggggttcagaaataaaaaacgtgatagtccaaacggaacaccgta
gi|103774                     :                                                                 TCGT-GATTTCG------T-G-TTTTC--------AT------CATCGT-AG--------TTT--------CG--T--------A--------T-----TTT--C--AC---CATTG---T-G---ATT----TCG-------A--------C--------TT--------T---C--AC--CGT--CG-T------tgtgttc
gi|103785                     :                                                                 TCGT-GATTTCG------T-G-TTATC--------AT------CATCGT-AA--------TTT--------TG--T--------A--------T-----TTC--C--AC---CATCG---T-agtttcgactttcgacttttgtgttatggggttcagatataaaaaacgcgattgtccaaacggaacaccgta
gi|103794                     :                                                                 TCGTAGTT-TCG------C-G-TTTTC--------AC------CATCGT-TG--------TGT--------TC--C--------T--------T-----TTT--C--AC---CATCG---TAG---TT-----TCGC------G--------T--------TT--------T---C--AT--CAT--CG-T------A--G------TA---T--CG-----TAGTT-TCG------CG----G--TTTC---------ACCAT--C--G-----T----------agtttcgactttcgactttcgactttcgtggtatggggttcagaaataaaaaacgcgatggtccaaatggaacaccgta
gi|103884                     :                                                                    T-GTCATCG------T-A-CCATC--------AC------CATTGT-GC--------TAT--------CG--TACTGCCGTG--------C-----CAT--C--AC---CATTG---T-G---TCA----TTGtgtttcg
gi|103782                     :                                                                    t-GTCATCG------T-G-CCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--C--------G--------T-----CAT--C--GT---CATCG---T-G---CTA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T---------------A----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------C------TA-----TC-G--T-----------Gcgtgtgcctgttgacaacgcaatagcacgatggcttaaacggaacaccgta
gi|103900                     :                                                                   tc-GTCATCG------T-A-CCATC--------AC------CATCGT-GT--------CAT--------CG--C--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------C--------TA--------T---C--GTGGCATCACG-T------G--T------GA---T--TG-----T-
gi|103902                     :                                                                     -GTCATCG------T-A-CCATC--------AC------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T-------------------------------AC---TGTCG---T-G---TCA----TC--------A--------C--------CA--------T---C------------G-T------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TA----G--CATC---------GCCTT--C--C-----T----------G-------------T------tgacaaag
gi|103892                     :                                                                     -GTCATCG------T-A-CCATC--------AC------CATCGT-GCTATCGTACTAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------C--------TA--------T---CGTAG--CAT--CG-aagacatgcgaaaaataataataatggaacac
gi|103814                     :                                                                     -GTCATTG------C-G-TCATC--------TTAC----CATCA---C--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--GC---CATCG---T-G---CTA----TCGG------G--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCA------TG----G--CATT---------GCCTT--C--C-----T----------G-------------T------
gi|103876                     :                                                                     -GTCATCG------T-A-CCATC--------AC------CATCGT-CC--------TAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------T--------C--------TA--------T---CGAAG--CAT--CG-aagacataggaaaaataataataatggaagac
gi|103842                     :                                                            tttgtctctcaTCGTTG------T-T-TCA-C--------GT--------TCGT-AC--------CAT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-A---CCA----TCGC------G--------T--------TT--------T---C--AT--CAT--CG-T------A--C------CA---T--CG-----C-G
gi|103895                     :                                                                        CATCA------CCA-TCAT---------GC------TATCAT-AC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---C-G---TCA----TCGT-----------------------------------------GC--TAT--CG-T------G--G------CA---T--CA-----T-GTctttc
gi|103897                     :                                                              gtcattgaacCATCG------T-G-TCAT--------------------CGT-AC--------TAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------G--------CA--------T---C--GC--atgcttgttaacaaagcgatagcacgatggccctaacggaaaactgta
gi|103904                     :                                                        gtcatcgtaccatcacCATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC------------------------------------------------------------CATCG---T-G---CCA----TCGT------G--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GTCATCG------CG----T--CATC---------gtatgcttgttgacaaagcgatagcacgatggctctaacggaacaccgta
gi|103819                     :                                                                        CATCA------C-AATC-TT--------GC------TATTGT-AC--------CAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---GATTG---T-A---CCA----TCGT------A--------T--------TG--------T---C--GC--gt
gi|103821                     :                                            taattccgtgtctcaacgcgcctttgctcATCG------C-G-TCATC--------GT------CATCGT-GC--------CAT--------CG--T--------AGCATCGCTC-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAgtatttgtgcgtacctgtggacaaagcgatgcaatgatggcactaacggaacaccgta
gi|103818                     :                                                                      gatATCG------C-G-TTTTC--------AT------CATCAT-GC--------CAT--------CG--CA-------G--------T-----T-T--C--AT---CATCG---T-A---CCA----TCGT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------A--A------CA---T--CG-----T-GTT-T-------------------TC---------ACCAT--C--G-----T----------
gi|103839                     :                                                                      taatTCG------T-G-TCATC--------GT------CATGGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---TATCG---T-G---TCA----TTGT------A--------C--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------AC----------------------------------------------CA-----TT-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGT-AT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-GA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103749                     :                                                                          TCG------T-G-CCATC--------AC------CATTGT-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---CTA----TCGT------A--------CTGTCGTGTCA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TA----G--CATC---------GCCTT--C--C-----T----------G-------------T------
gi|103760                     :                                                                          TCG------T-G-CCATC--------AC------CATTGT-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---CTA----TCGT------ACTATCGTGC--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------TA---T--CG-----T-GGCATCG------Caagacatgcgaaaaataataataatggaaca
gi|103840                     :                                                                          TCG------CAG-TT-TC--------AT------CATCGT-AC--------CAT--------CG--T--------A--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-A---ACA----TCGT------G--------T--------TT--------T---C--AC---------------------------CA---T--CG-----T-ACCATCA------CG----T--TTTC---------ATCAT--C--G-----T----------G-------------C------CT-----TC-G--T-----------cttcctgtttgacatgcacaaaaa
gi|103841                     :                                                                          TCG------T-G-TTTTC--------AC------CATCGT-AC--------CAT--------CG--C--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCG---T-A---CCA----TCGC------G--------C--------TT--------T---C--AC--CAT--TG-T------A--C------CA---T--CG-----T-tgtt
gi|103817                     :                                                                          TCG------T-G-TTTTC--------AT------CATCGT-AG--------TTT--------CG--T--------A--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-G---ATT----TCG-------A--------C--------TATTT-----T---C--AC--CAT--CG-T------
gi|103844                     :                                                                     tgattTCG------T-A-TTTTC--------AC------CATCGT-AA--------CAT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-A---CCA----TCAC------G--------T--------TT--------T---C--AT--CAT--CG-T------G--C------CT---T--CG-----T--------------TG----T--T-TC---------ACCAT--C--G-----T----------agtttcggctttcgtggtatggggttcagaaataaaaaacacgattgtccaaacggcacacctta
gi|103810                     :                                                                          TCG------T-G-TTTTC--------AT------CATAGT-AG--------TTT--------CG--T--------A--------T-----TTT--T--AC---CATCG---T-G---ATT----TCG-------A--------C--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------
gi|103813                     :                                                                   catgattTCG------C-G-TTTTC--------GC------CATCGT-GG--------TTT--------CG--A--------C--------T-----T-T--C--AC---CATCG---TAG---TT-----TCG-------A--------C--------TT--------T---CG-AC--TTT--C---------A--T------CA---T--CG-----TAGTT-TCGA-----CT----T----TC---------ACCAT--T--G-----T----------G-------------T------agtttcgactttcgacttttgtggtatggggttcagaaataaaaaaacgcaatggtccaaacggaacaccgta
gi|103909                     :                                                                                  gtaattCATC--------GTGC----TATCGT-AC--------TGT--------CG--T--------G--------C-----TGT--C--AC---CATCG---T-G---TC-------------------------------------------------------AT--CG-T------G--T------TA---T--CG-----T-GGCATCG------CG----T--gtgtgtgtgtgtgggtgggggggggggggggggggggataaaaatacgatggtccaaacggaacactgta
gi|103908                     :                                                                                     cacCATC--------GTGC----TATCGT-AC--------TAT--------CG--C--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------C--------TA--------T---C--GTTGCAT--CG-gtgcctattgacaaagcgatagcacgatggttcggaagatcgta
gi|103880                     :                                                                                       cacTC--------GT------CATCGT-GC--------CAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GTCATCG------CG----T--CATC---------
gi|103878                     :                                                                                          TC--------GT------CATCGT-GC--------CAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GTCATCG------CG----T--CATC---------gt
gi|103766                     :                                                                                          TC--------GT------CATCGT-GC-----------------------------------------------CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATGG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------AC-----C------A---TC-A---C----------CAT-C--G------TGgt
gi|103903                     :                                                                                          TC--------GT------CGTCGT-AC--------TAT---------------------G--------T-----CGT--C--AC---CAATA---T-G---GCA----TCGT------A--------T--------TG--------T---C--
gi|103885                     :                                                                         gtcatggttctgtcgtgTC--------AT------CATCGT-AT--------TAT--------CG--T--------A--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-A---CTA----CCGT------A--------G--------TA--------T---C--AC--CCT--CG-T------A--C------CA---T--CG-----C-ACCGTCG------gtggcagtgtgtgtaccagctgaaaaagcgaaagcaccggggccctaacggaa
gi|103873                     :                                                                                          TC--------AT------CATCGT-GC--------CTT--------CG--TT-------G--------T-----T-T--C--AC---CATCG---T-A---CCA----TCGT------T--------G--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------A--C------AA---T--CGT----T-GTT-TCA------CGT---T--CGT----------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------
gi|103811                     :                                                                                        ttTC--------AC------CATCGT-AG--------TAT--------CG-----------G--------------CATTTC--AC---CATCG---T-A---GTA----TCG-------A--------CT-------TT--------T---C--AC--CAT--CG-TA-----G--T------T----T--CGT----T-GTT-TCG------AC----T--TTTC---------ATCAT--C--G-----TA---------G-------------T------T------TCGG--T-----------GT-----T----------TC-G---T----------TAT-T--T------CG------------A--C--T-G-------------------AA---A---A-CAATATGC--C-GC-GA-TGG-T-CCC-AC-AGG----GAC-ACCGTAt
gi|103843                     :                                                                           cgttgtttcgactttTC--------AC------CATCGT-AC--------AAT--------CG--TT-------G--------T-----T-T--C--AC---GTTCG---T-A---CCA----TCGT------G--------T--------TT--------T---C--AC--CA----------------------------T--CG-----T-ACCATCG------CG----T--TTTC---------ATCAT--C--G-----T----------
gi|103791                     :                                                                                  tcgttgttTC--------AC------CATCGT-AG--------TTT--------CG--C--------G--------T-----TTT--C--AC---CATCGT--T-G---TT-----TCG-------A--------CT-------TT--------T---C--AC--CAT--CG-TA-----G--T------T----T--CG-----T-
gi|103820                     :                                                                  tcgttgtttcgttgtttcgactttTC--------AC------CATCGT-AG--------TTT--------CG--A--------C--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-A---CTT----TCG-------A--------C--------TT--------TT--C--AC--CTT--CG-T------A--C------TT---T--CG-----TTGT-ATCG------AC----T--TTTC---------ATCAT--C--G-----T----------A---------------------------------------------GT-----T----------TC-G---T-T-------GTTT-C--GA-----CTT-G--A-CCT--AG-T--T-T---------AA--------AA---A---A-TG-TG-C---C-GC-GA-TAG-C-CCCCAA-CGG----AAC-ACCGTtgtttcgactttaattaatttatgaatatgccacgatggcacccaacgggacaccgta
gi|103871                     :                                                                              tgatttcgaacttC--------GC------TATCGC-AC--------TGT--------CA--T--------A--------TT----CAT--C--AC---TATTG---T-A---TCA----TCGTCTT---G--------C--------CG--------T------GC--CAT--CG-C---------T------CC---T--T------T-GTCAT---------G----T--CACC---------ACCAT--T--G-----T----------G-------------T------CA-----CC-G--T-----------GC-----T------G---TT-G---T-A-------CCAT-C--G------CAT-TTCG-CT---G--T--T-G---------AC--------AA---C---G-CGATA-T---C-AC-GA-TGA-C-CTC-AA-AGG----AGC-ACCTTA
gi|103887                     :                                                                                        attg--------GT------CATCGT-GT--------CAT--------CG--C--------G--------T-----CAT--C--GT---CATCG---T-G---CTA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T---------------A----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------G
gi|103921                     :                                                                                            --------GT------CATCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------G-----CAT--C--GCG--CATt
gi|103888                     :                                                                                       atcgt--------GT------CATCGT-GT--------CAT--------CG--C--------G--------T-----CAT--C--GT---CATCG---T-G---CTA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T---------------A----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------gcttgttgacaaagcgatagcacgatggccctaacggaacaccgta
gi|103889                     :                                                                                            --------GT------CATCGT-GT--------CAT--------CG--C--------G--------T-----CAT--C--GT---CATCG---T-G---CCA----TCGT------G--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--TG-T------G--T------CA---T--CG-----T---------------A----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------
gi|103893                     :                                                                                            --------GT------CATCGT-GT--------CAT--------CG--C--------G--------T-----CAT--C--GT---CATCG---T-G---CCA----TCGT------G--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---A--CG-----T---------------A----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------
gi|103871                     :                                                                                            --------GT------CATCGT-GA--------TAT--------CG--C--------G--------T-----TGT--C--AA---CAGCGAAAT-G---CGA----TGGT------A--------CAA------CA--------G---C--AC--
gi|103890                     : attgcgctatcgcactgtcatattcatcactattgtatcatcgtcttgccgtgccatcgctcctttgtcatgtcaccaccattgtgtcacc--------GT------CATCGT-AC--------CAT--------CA--CC-------A--------T-----C-T--C--GC---TATCG---T-A---CTA----TCAT------G--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TA----G--CATC---------ctcaaaggagcacctta
gi|103901                     :                                                                                            --------GT------CATCGT-AC--------CAT--------CA--C-----------------------CAT--C--ATGA-TATCG---T-A---CTA----TCGT------G--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-g
gi|103911                     :                                                                                                     T------CGTCGT-GG--------TTT--------CGACT--------T--------T-----CAC--C--AT---CATTG---T-T---TCA--------------A--------C--------TT--------T---C--AT--CAT--CG-T------G--
gi|103747                     :                                                                                                             aTCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGC-AT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CAATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-AA-CGG----AAC-ACCGTAgtttcaagcatagtggtttggagaaaatcataaaaatacgatggtccaatctgaacaccgta
gi|103759                     :                                                                                                              TCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGT-AT-A-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-AGG-C-CCT-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103753                     :                                                                                                              TCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----C----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGT-AT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CTT-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103755                     :                                                                                                              TCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AT---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------C-------------------ATCG------CG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-T--G------CGT-GT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-AA-TGG----AAC-ACCGTA
gi|103763                     :                                                                                                              TCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CA-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-A---T-G-------GCAT-C--G------CGT-AT-G-CTT--G--T--T-T---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-AA-TGG----AAC-AACATA
gi|103770                     :                                                                                                              TCGT-GT--------TAT--------TG--C--------A--------T-----CTT--C--GT---CATCG---T-G---ACA----TCGC------T--------C--------CA--------T---T--AC--CAT--TG-T------G--C------TA---T--CG-----T-AATGTCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GT-----T------A---TC-G---T-G-------GTAT-T--G------CGT-GT-G-CCT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TTA-C-CCT-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103750                     :                                                                                                              TCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAT-C--G------
gi|103784                     :                                                                                                              TCGT-GT--------TAT--------CGCTT--------G--------T-------T--C--GT---CAACG---T-----TAA----TCGT------T--------T--------GT--------T---C--TC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-GCTATTG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GT-----T------A---TC-C---T-G-------GCAT-C--G------CGT-GT-G-CCT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-A-----------CCT-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103781                     :                                                                                                              TCGT-GC--------TAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T---------------G----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAT-C--G------
gi|103764                     :                                                                                                              TCGT-GC--------CAT--------CG--C--------T--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C---------------------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------AC-----T------A---TC-A---C----------CAT-C--G------TG
gi|103754                     :                                                                                                      tcgtgtttTCGT-GC--------CAT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CTTCG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------TA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------AC-----
gi|103777                     :                                                                                                              TCGT-GC--------CAT--------CG--TT-------G--------T-----T-T--C--AT---CATCG---T-G---CCA----TCGT------G--------T--------TT--------T---C--AT--CAT--CG-T------A--C------CA---T--CG-----T-ACCATCG------CG----C--TTTC---------ACCAT--T--G-----T----------A-------------C------CA-----TC-G--T-----------GC------------A---TC-G---C-G-------GT-T-C--A------GGG-A-----------------G---------AC--------AA---A---A--AATG-T---T-ACTTA-T-G-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103758                     :                                                                                                              TCGT-GA--------TTT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATAG---TAG---TT-----TCGT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------G----------A---T--T------------TCGA-----CT----T----TC---------ACCAT--C--G-----TA---------G-------------T------T------TC-G--------------AC-----T------T---TC-G---T-G-------GTAT-G--G------GGT-----------------T-C---------AC--------AA---A---T-AAAAA-A---C-GC-GA-TGG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103761                     :                                                                                                              TCGT-GA--------TTT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCG---TAG---TT-----TCGT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------G----------A---T--T------------TCGA-----CT----T----TC---------ACCAT--C--G-----T----------AGTT----------T------CGACTT-TC-G--------------AC-----T------T---TC-G---T-G-------GTAT-G--G------GGT-------TC--A--G--A-A---------AT--------AA---A------AAAA-A---C-GC-GA-TGG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103778                     :                                                                                                              TCGT-GC--------CTT--------CG--TT-------G--------T-----T-T--C--AC---CATCG---T-A---CCA----TCGTTGTTTCA--------C--------CA--------T---CGTAC--AAT--CGTT------GTTT------CACGTT--CG-----T-ACCATCG------TG----T--TTTC---------ACCAT--C--G-----T----------
gi|103767                     :                                                                                                              TCGT-GA--------TTT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCG---TAG---TT-----TCGT------A--------T--------TT--------T---C--AT--CAT--CG-T------G----------A---T--T------------TCGA-----CT----T----TC---------ACCAT--C--G-----TA---------G-------------T------T------TC-GACTTTAG-------AC-----T------T---TT-G---T-G-------GTAT----G----------GG-G-CTC--A--G--A-A---------AT--------AA---A---A-----A-A---C-GC-GA-TGG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103768                     :                                                                                                              TCGT-GA--------TTT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCG---TAG---TT-----TCAT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------G----------A---T--TT-----T-GACTT-------------------TC---------ACCAT--C--G-----T----------AGT-----------T------TAGACTTTC-G--------------AC-----T------T---TC-G---T-G-------GTAT-G--G------GGT-------TC--A--G--A-A---------AT--------AA---A---A-----A-A---C-GT-GA-TAG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103774                     :                                                                                                              TCGT-GA--------TTT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCG---TAG---TT-----TCGT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--TG-T------G----------A---T--T------------TCGA-----CT----T----TC---------ACCGT--C--G-----TA---------G-------------T------T------TC-G--------------AC-----T------T---TC-------G-------ACTT-T-----------T-GT-G--TT--A--T--G-GGGTTCAGATAT--------AA---A---A-----A-A---C-GC-GA-TTG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103785                     :                                                                                                              TCGT-GA--------TTT--------CG--T--------G--------T-----TAT--C--AT---CATCG---T-A---ATT----TTGT------A--------T--------TT--------C---C--AC--CAT--CG-T------A--------------------------GTT-TCG----------------------------ACTTT--C--G-----A----------C-------------T------T------TC-G--------------AC-----T------T---TC-G---T-G-------GTAT-G--G------GGT-------TC--A--G--A-A---------AT--------AA---A---A-----A-A---C-GC-GA-TGG-T-CCA-AA-TGG----AAC-ACCGTA
gi|103789                     :                                                                                                              TCGTAGT--------TAT--------CT--T--------G--------TTTCGACATTTC--AC---CATTG---TTG---TT-----TCG-------A--------C--------TT--------TT--C--AC--CAT--CG-T------A--------------------------GTT-TCG------AC----T--TTTC---------ACCAT--C--G-----T----------A-------------C------TT-----TC-G--A-----------CT-----T------A---TC-A---T----------CAT-C--GTAGTTTCGT--T-G-TTTCGAT-T--T-G---------ACTTAATTTAAA---A---G-AAATATGC--C-GC-AATTGG-C-CC--AA-CGG----GAC-ACCGT
gi|103794                     :                                                                                                              TCGT-AG--------TTT--------CG--C--------G--------T-----TTT--C--AC---CATCG---TTG---T--------GT------T--------C--------CT--------TTTTC--AC--CAT--CG-T------A--------------------------GTT-TCG------CG----T--TTTC---------A----------------------------------------T------CA-----TC-G--T-----------AG-----T------A---TC-G---T-A-------GTTT-C--G------CG
gi|103788                     :                                                                                                              TCGT-GA--------TTT--------CT--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCA---TAG---TT-----TCAT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CA-T------G----------A---T--T------------TCGA-----CT----T----TC---------ACCAT--T--G-----T----------A------------------------------------------------------------------G---T-G-------GTAT-G--G----------G--G-CTC--A--G--A-A---------AT--------AA---A---A-----A-A---C-AT-GA-TGG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTAgtttcaccatcgttgtttcg
gi|103786                     :                                                                                                              TCGT-GA--------TTT--------TG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---TATCG---TAG---TT-----TTGT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------G----------A---T--T---------TCA--A------CT----T----TT---------ACTAT--C--T-----TA---------G-------------T------T------TC-G--------------AC-----T------T---TC-G---T-G-------GT-T-T--G----------GG-G-TTC--A--G--A-A---------AT--------AA---A---A-----A-A---T-GC-GA-TGG-T-CTA-AA-TGG----AAC-ACCGTA
gi|103847                     :                                                                                                              TCGT-AC--------TTT--------CGACT--------A--------T-----CA---C--AC---CATCG---TAG---TT-----TCG-------A--------C--------TT--------T---C--AC--CAT--CA-T------A--C------TT---T--CGACTTTC-ATCATCGTACTTTCGACTTT--CA-C---------ACCAT--C--G-----T----------
gi|103884                     :                                                                                                                 T-GT--------CAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATTG---T-G---CTA----TCGT------ACTGCCGTGC--------CA--------T---C--AC--CAT--TG-T------G--T------CA---TTGCG-----T-GTagtttcg
gi|103812                     :                                                                                                                    t--------TAT--------CG--C--------G--------T-----CAT--T--GT---CATTG---T-G---CTG----TCGT------G--------G--------CA--------T---C---------------------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TG----T--TATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-A---T-G-------GCAT-T--G------CGT-AT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CAATA-G---C-AC-GA-TGA-C-CCT-TA-CGG----AAC-ACCGTAgcctgttgacaacgcaatagcacgatggcttaaacggaacaccgta
gi|103818                     :                                                                                                                 gtaa--------TAT--------CG--C--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCA---T-G---CCA----TCGC------A--------G--------TT--------T---C--AT--CAT--CG-T------A--C------CA---T--CG-----T-ATT----------------T----TC---------ACCAT--C--G-----T----------A-------------A------CA-----TC-G--T-----------GT-----T------T---TC-A---C----------CAT-C--G------
gi|103897                     :                                                                                                                           taaAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------ACTATCGTGC--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GGCATCG------CG----T--t
gi|103900                     :                                                                                                                           gtcAT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGC------G--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TG----G--CATC---------A------C--G-----T----------G-------------T------GA-----TT-G--T-----------atgcttgttgacaaagcgatagcacgatggctctaacggaacaccgta
gi|103921                     :                                                                                                                           gtcAT--------CG--T--------G--------T-----CAT--CGTGC---TATCG---T-G---GCA----TCGtgacaaag
gi|103876                     :                                                                                                                              AT--------CG--T--------A--------C-----CAT--C--AC---CATCG---T-C---CTA----TCGT------G--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-TCTATCG------AA----G--CATC---------cgcatgcttgttgacaaagcgatagcacgatggccctaacggaacaccgta
gi|103749                     :                                                                                                                 tttgtctctcagtcT--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATTG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTGTCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAT-C--G------Cg
gi|103760                     :                                                                                                                               T--------CG--T--------G--------C-----CAT--C--AC---CATTG---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--TATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T--------------------------------------T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CCT--T-C-CTG--T--T--T-G---------AC--------Acttcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaaca
gi|103832                     :                                                                                                                               T--------CG--T--------G--------T-----CAT--C--A------------T-G---TCA----TC-T------G--------C--------AA--------T---C--AA--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTTTTG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCGT-C--G------tgcacaaaaa
gi|103823                     :                                                                                                                               T--------CG--C--------G--------T-----TTT--C--AC---CATCG---T-G---GTT----TCG-------A--------C--------TT--------T---T--AC--CAT--CG-TA-----G--T------T----T--CG-----T-G--ATTT------CG----T--CATTGTAGTTTCGACTTT--C--A-----T-------------------------------CA-----TC-G--T-----------GG-----T------T---TC-G-----A-------GCAT-C--G------CG--GT-----------T--T-GGGGA-----AA--------AA---A---A-TAAAA-A---T-AC-GA-TGG-T-CCA-AA-CGA----AAC-ACCGTAt
gi|103841                     :                                                                                                                            attT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AC---CATC-------------------GT------A--------C--------CA--------T---C--GC--GTT--TT-C------A--T------CA---T--CG-----T-ACCATCG------CG----C--TTTC---------ACCAT--T--G-----T----------A-------------C------CA-----TC-G--T-----------
gi|103817                     :                                                                                                                               T--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATCG---TAG---TT-----TCGT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------G----------A---T--T------------TCGAC----TA----T--TTTC---------ACCAT--C--G-----TA---------G-------------T------T------TC-G--------------GC-----T------T---TC-G---T-G-------GTAT-G--G------GGT-------TC--A--G--A-A---------AT--------AA---A---A-----A-A---C-AC-GA-TTG-T-CCA-AA-CGG----CAC-ACCTTA
gi|103810                     :                                                                                                                          tgattT--------CG--T--------G--------T-----TTT--C--AT---CATAG---TAG---TT-----TCGT------A--------T--------TT--------T---T--AC--CAT--CG-T------G----------A---T--T------------TCGA-----CT----T----TC---------ACCAT--C--G-----T----------AGTT----------T------CGACTT-TC-G--------------AC-----T------T---TT-G---T-G-------GTAT-G--G------GGT-------TC--A--G--A-A---------AT--------AA---A-------AAA-A---C-GC-AA-TGG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103819                     :                                                                                                                         catgatt--------CG--T--------G--------T-----C-T--C--A-----A-CG---C-G---CCT----TTGC------T--------C--------CA--------T---C--AC--AAT--CT-T------G--C------TA---T--TG-----T-ACCATCG------TG----T--CATC---------ACGAT--T--G-----T----------A-------------C------CA-----TC-G--T-----------AT-----T------G---TC-G---C-G-------TATT-T--G------TGC-GT-A-CCT--G--T--G-G---------AC--------AA---A---G-CGAT--G---CAAT-GA-TGG-C-ACT-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103879                     :                                                                                                                                                                taattcT--C--AC---CATCG---T-G---TCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C---------------------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TG----T--TATC---------ACCAT--T--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-T---A-G-------GCAT-C--G------TGT-AT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CAATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-AA-TGG----AAC-ACCGTA
gi|103880                     :                                                                                                                                                                      T--C--GT---CATCG---T-G---CCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T---------------A----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GT-----C------A---TC-G---C-G-------TCAT-C--G------
gi|103878                     :                                                                                                                                                                      T--C--GT---CATCG---T-G---CCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T---------------A----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GT-----C------A---TC-G---C-G-------TCAT-C--G------t
gi|103885                     :                                                                                                                                                                      T--C--AT---CATCG---T-A---TTA----TCGT------A--------T--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------A--C------TA---C--CG-----T-A-------------G----T---ATC---------ACCCT--C--G-----T----------A-------------C------CA-----TC-G--C-----------AC-----C------G---TC-G---t
gi|103873                     :                                                                                                                                                                      T--C--AT---CATCG---T-G---CCT----TCGT------T--------G--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------A--C------CA---T--CG-----T--------------TG----T--T-TC---------ACCAT--C--G-----T----------A-------------C------AA-----TC-GT-T-----------GT-----TTC----ACGTTC-G---T-A-------CCAT-C--G------TGT-
gi|103790                     :                                                                                                                                                                    ttT--C--GC---CATCG---T-A-----G----TTGT------A--------A--------CT--------TTT-C--AC--CAT--CG-TT-----G--T------T----T--CG-----T---TATTT------CGAC--T--TTTC---------ACCAT--C--G-----T--------------------------------------------T-----------GT-----T----------TC-G---T-T-------GTTT-T--GA-----CTT-A--A-CTT--AATT--T-A---------AT--------AA---A---T---ATG-C---C-AC-GA-TTG-C-CCC-AA-CGG----GAC-ACCGTAt
gi|103801                     :                                                                                                                        tcgttgtttcgttgtttcgacttttcaccctcgtagtttcgactttT--C--AC---CATCG---TAG---TT-----TCG-------A--------C--------TT--------TT--C--AC--CAT--CG-T-------------------------------T-GTT-TCG------TC----T--TTTC---------ACCAT--C--G-----TA---------G-------------T------T------TC-G--TT----------GT-----T----------TC-G---T-T-------ATTT-C--G-------GC-TT-GACTT--AA-T--C-T---------AT--------AA---A---A-T-ATG-C---C-GC-GG-TGG-C-TTC-AA-CGG----GAC-ACCGTA
gi|103791                     :                                                                                                                                              tcatagtttcgttgattcgactttT--C--AC---CATCG---TAG---TT-----TCGC------G--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T-------------------------------T-GTT-TCG------AC----T--TTTC---------ACCAT--C--G-----T----------A---------------------------------------------GT-----T----------TC-G---T-T-------GTTT-C--G------ACT-TT-A-ATT--AA-T--T-T---------AT--------GA---A---T---ATG-C---C-AC-GA-TGG-CACCC-AA-CGG----GAC-ACCGTA
gi|103769                     :                                                                                                                                              tcgttgtttcgttgtttcgactttT--C--AC---CATCG---T-GGTTTCGACTTTCGT---------------C--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-TA-----G--T------T----T--TG-----T-GTT-T--------------T--CATC---------ATCAT--A--G-----TTTCGACTTTCA-------------T------CA-----TC-A--T-----------GG-----T------T---TC-G-----A-------GCAT-C--G------TG-----G-TTT--G--G--G-G---------AA--------AA---A---ATTAAAA-A---T-AC-AA-TGG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACTGTA
gi|103848                     :                                                                                                                                                       ttgtgatttcgacttT--C--AC---CATCG---TAG---TT-----TCG-------A--------C--------TT--------TT--C--AC--AAT--CG-T------A----------G---T--TG-----C-GACTTT-------------T--CATC---------ATCGT--T--G-----T----------T-------------T------CG-----TT-G--TTTCGACTTTTCAC-----T------A---TC-G---T-A-------GTTT-C--GTTGTTTCGA-CT-A-CTTTAA--T--TTA---------AT--------AA---A---T---ATG-C---C-GC-GA-TGG-C-CCC-AA-CGG----GAC-ACCGTA
gi|103799                     :                                                                                                                                                      tcgtagtttcgacttcT--C--AC---CATCA---TAG---TT-----TCGG------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-TA-----G--T------T----T--CGT----T-GTT-TCGA-----CT----T--TATC---------ACCAT--C--G-----T----------A---------------------------------------------GT-----T------------------------------T-C--G------ACT-TT-G-CTT--A--CAAT-A---------AT--------AA---A------TATG-C---C-GC-GA-TGGCC-CCC-AA-CAG----GAC-ACCGT
gi|103800                     :                                                                                                                                     tcgtagtttcgttgtttcgttgtttcgacttgtT--T--AC---CATCG---T-AGTTTCG----TTGTT-----A--------C--------GACTTT----T---C--AC--CAT--CA-TA-----G--T------T----T--CG-----TTGTT-TCG------CC----T--TTTC---------AGCAT--C--G-----T----------A---------------------A-----TT----------------------------------TC-G---T-T-------GTTC-C--GA-----CTT-G--A-CTT--AATT--T-T---------AA--------AA---A-------ATATG---CTGC-GA-TGG-C-CCC-AA-TGG----GAC-ACTGTA
gi|103787                     :                                                                                                                tcgtaatttcgttgtttcgacttttcaccatcgtagtttcgactttcgaccgttT--C--AC---CATCG---T-GGTTTCGACTTTCG-------A--------C--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------A--------------------------GTT-TCG------CG----T--TTTC---------ATCAT--T--G-----T----------AGTTTCGACTT---T------CATCC--TC-G--T-----------GG-----T------T---TC-G-----A-------GCAT-C--G------TG-----G-TTT--A--G--G-G---------GA--------AA---A-----------------AA-AA-TGG-T-CCA-AA-TGG----AAC-ACCGTA
gi|103908                     :                                                                                                                                                        tcgtgatttcgactt--C--AC---CATCG---T-G---CTA----TCGT------A--------CTATCGCGTCA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--T------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TT----G--CATC---------
gi|103863                     :                                                                                                                                                                              ---CATCG---T-G---TCA----TTGC------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAT-T--G------g
gi|103814                     :                                                                                                                                                                           cgt---CATTG---C-G---TCA----TCTT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-TACCATCG--C------CA---T--CG-----T-GCTATCG------GG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-A---T-G-------GCAT-T--G------C
gi|103904                     :                                                                                                                                                                            gt---CATCG---C-G---TCA----TCGT---------------------------------------------CAT--CG-T------G--C------CA---T--CG-----T-GCCATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GT-----C------A---TC-G---C-G-------TCAT-C--G------cttcctgtaagacataggaaaaataataataatggaagac
gi|103842                     :                                                                                                                                                                              ---CGTTG---T-T---TCACGT-TCGT------A--------C-----------------------------CAT--CG-T------G--TTTTCACCA---T--CG-----T-ACCATCG------CG----T--TTTC---------ATCAT--C--G-----T----------A-------------C------CA-----TC-G--C-----------GC-----T------T---TC-t
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                 tATCG---T-G---TCA----TCGT-----------------------------------------GC--TAT--CG-T------G--G------CA---T--CG-----C-G-CAT
gi|103884                     :                                                                                                                                                                                      ---T-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--TG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTGCCG------TG----C--CATC---------ACCAT--T--G-----T----------G-------------T------C-------------------------------------------------------------AT-T--G------CGT-GT-G-CCT--G--T--T-G---------AC--------AA---C---G-CAATA-G---C-AC-GA-TGG-C-TTA-AA-CGG----AAC-ACCGTAgcttgttgacaaagcgatagcacgatggccctaacggaacaccgta
gi|103894                     :                                                                                                                                                                                         t-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--TA-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----T--CATC---------ACCAT--T--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CAT-AT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-AA-CAG----AAC-ACCGTA
gi|103895                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TTGA------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CA-T------G--C------TA---T--CA-----T-ACTATCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----C----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--A------TGT-AT-G-CTT--G--T--T-A---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-AA-CGG----AAA-ACTGTA
gi|103897                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--C----------------------------G-----T-GTCATCGTACTATCG----TGCCATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------C--------------------------------------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGT-AT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-TCT-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103887                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--GCGTCAT--CG-T----------------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--TACCATC-----AC-----C------A---TC-G---T-G-------TCAT-C--G------TGT-
gi|103900                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--C----------------------------G-----T-GTCATCG------CG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--A------CGT-GT-G-ATT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-
gi|103888                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--GCGTCAT--CG-T----------------CA---T--CG-----T-GCTATCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------AC-----C------A---TC-A---C----------CAT-C--G------TG
gi|103889                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--GCGTCAT--CG-T----------------CA---T--CG-----T-GCCATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--T--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------AC-----C------A---TC-A---C----------CAT-C--G------TG
gi|103893                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------G--------T--------CA--------T---C--GCGTCAT--CG-T----------------CA---T--CG-----T-GCCATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----AC-G--T-----------AC-----C------A---TC-A---C----------CAT-C--G------TG
gi|103902                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTGTCG------TG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAT-C--G------C
gi|103892                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAT-C--G------cttcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaacac
gi|103890                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CT-C------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCA------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------C------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-A-------GCAT-C--G------
gi|103876                     :                                                                                                                                                                                          -G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CG-T------C--C------TA---T--CG-----T-GCCATC-----------------------------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------TC-----T------A---TC-G---A-A-------GCAT-C--G------
gi|103901                     :                                                                                                                                                                               tttgtctctca-G---TCA----TCGT------A--------C--------CA--------T---C--AC--CAT--CA-T------G--A------TA---T--CG-----T-ACTATCG------TG----C--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------
gi|103843                     :                                                                                                                                                                                                CA----TCGT------A--------C--------AA--------T---C--G-----T--TG-T------T--T------CACGTT--CG-----T-ACCATCG------TG----T--TTTC---------ACCAT--C--G-----T----------A-------------C------CA-----TC-G--C-----------GT-----T------T---TC-A---T----------CAT-C--G------
gi|103844                     :                                                                                                                                                                                      tcgttgtttcac----TCGT------A--------T--------TT--------T---C--AC--CAT--CG-T------A--A------CA---T--CG-----T-GTTTTCA------C--------CATCGT-------ACCAT--C--A-----C----------G-------------TTTTCATCA-----TC-G--T-----------GC-----C------T---TC-G---T-t
gi|103798                     :                                                                                                                                                                                                                                    --------T---C--AC--CAT--CG-T------A--------------------------GTT-TCG------CG----T--TTTC---------ACTAT--CTAG-----T----------T-------------T------CG-----AC-T--TTTC--------AC-----C------A---TC-G---T-T-------GTTT-C--G------ACT-TT-A-CTT--AA-T--T-A---------AT--------AA---A---T---ATG-C---C-GC-GA-TGG-C-CCC-GA-CGG----GAC-ACCGTAtgtttcaccatcgt
gi|103773                     :                                                                                                                                                                                               tcgtagtttcgcgttttccctatctagtttctacttt--------T---C--AC--CAT--CG-TA-----G--T------T----T--TG-----C-GT--TTT------CG----T--CATC---------ATAGTTTC--GACTTTC----------A-------------T------CA-----TC-G--T-----------GG-----T------T---TC-G-----A-------GCAT-C--G------TG--GT-----------T--T-G---------GGGGGA----AA---A---A-TAAAA-A---T-AC-GA-TGG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTA
gi|103849                     :                                                                                                                                                                                                              tcgtgatttcgactttcgactt--------T---C--AC--CAT--CG-TT-----G--T------T----T--CG-----T-----TC-------------T--TTTC---------ACCAT--C--G-----TA---------G-------------T------T------TT-GT-T-----------GT-----T----------TT-G---T-T-------GCTT-C--GA-----CTT-AA-G-TTT--AT-T--T-A---------AT--------AA---A------TATG-C---C-AC-GG-TGG-T-CCC-AA-CGG----ATC-ACCGTA
gi|103864                     :                                                                                                                                                                                                                    tcgtggtttcgacatc--------T---T--AC--CAT--CG-TA-----G--T------T----T--CG-----TTGTT-TCG------AC----T--TTTT---------ATCAT--C--G-----TA---------G-------------T------T------TC-G--T-----------TA-----T------T---TC-G---T-T-------GTTT-C--GACT---CG-----A-CTT--AA-T--T-T---------A---------AA---ACTTG-AAATATG---CCGC-GA-TGG-C-CCC-AAACGG----GAC-ACCGTA
gi|103909                     :                                                                                                                                                                                                        cgttgtttcgtctttcaaccaacgtagtttcgatttt---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTGTCG------TG----C--TGTC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GT-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGT-GT-G-CCT--A--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-T-T------CGG----AAG-ATCGTA
gi|103908                     :                                                                                                                                                                                                                                             ---C--AC--CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-ACTATCG------CG----T--CATC---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-T-------GCAT-C--G------
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                     --CAT--CG-T------G--C------TA---T--CG-----T-GGCATCG------CG-------CAT
gi|103903                     :                                                                                                                                                                                                                                                  atcgtgtT--CG-T------G--T------CG---T--CG-----TCGT-ACTA------TG----T--CGTC---------ACCAA--T--A-----T----------G-------------G------CA-----TC-G--T-----------AT-----T------G---TC-G---T-G-------GCAG-T--G------TGT-GT-A-CCA--G--C--T-G---------AA--------AA---A---G-CGAAA-G---C-AC-CG-GGG-C-CCT-AA-CGG----Agcttgttgacaaagcgatagcacgatggccctaacggaacaccgta
gi|103841                     :                                                                                                                                                                                                                                             gtcatggttctgT--CG-T------G--TTTTCACCA---T--CG-----T-ACCATCG------CG----T--TTTC---------ATCAT--C--G-----T----------A-------------C------CA-----TC-G--C-----------GC-----TTTCACCA---TT-G---T-A-------CCAT-C--G------
gi|103871                     :                                                                                                                                                                                                                                                                ------G--T------CA---T--CG-----T-GATATCG------CG----T--TGTC---------AACAG--C--GAAA--T----------G-------------C------GA-----TG-G--T-----------ACAACAGC------A---CG-G---T-G-------ACAC-A--A------TG--GT-G-GTG--A--CA-T-G---------AC--------AAAGGA---G-CGATG-G---C-AC-Gt
gi|103911                     :                                                                                                                                                                                                                      attgcgctatcgcactgtcatattcatcactattgtatcatcgtcttgc--T------CG---T--CG-----T-GGTTTCGAC----TT----T--CACC---------ATCAT--T--G-----T----------T-------------T------CA-----AC-T--T-----------TCAT---C------A---TC-G---T-G-------GTTT-CAAG------CATAGT-G-GTT-----T--G-G---------AG--------AA---A---A-TCATA-AAAAT-AC-GA-TGG-T-CCA-AT-CTG----AAC-ACCGTActcaaaggagcacctta
gi|103779                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 a---T--CG-----T-AACATCG------TG----T--TTTC---------ACCAT--C--G-----T----------A-------------C------CA-----TC-A--C-----------GT-----T------T---TC-A---T----------CAT-C--G------TG
gi|103901                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GTCATCG------TA----C--CATC---------ACCAT--C--A-----T----------G-------------A------TA-----TC-G--T-----------AC-----T------A---TC-G---T-G-------CCAT-C--A------Cccttcgttgtttcaccatcgtaccatcgttgtttcaccatcgt
gi|103776                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCG------CA----T--TTTC---------ATCAT--C--G-----T----------AGTTTCGACTTTCAT------CA-----TC-G--T-----------GG-----T------T---TC-G-----G-------GCAT-C--G------TG-----G-TTT--G--G--C-A---------AA--------AA---A---G-TAAAA-A---T-AC-GA-TGA-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACCGTAcatcgtgtcatcgt
gi|103909                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcgtggtttcggctttcgactttcaccatcggaggt---------ACCAT--C--G-----T----------G-------------C------TA-----TC-G--C-----------TT-----T------G---TCAA---TAG-------GCACAC--G------CG--AT-G-C-C--A-----C-G---------AT--------AA---C---A-CGATG-A---C-AC-GA-TGG-----T-GA-CAG----CACGACAGTA
gi|103839                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caccatcgtgctatcgCCGT--CA-G-----G----------G-------------C------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-GCTTT-G-------TCAA-CAAG------CAT-AC-G-C----G--A--T-G---------CC--------A----------CGATA-G---C-AC-AA-TGG-tcggaagatcgta
gi|103763                     :                                                                                                                                                                                                                                                tcgtgtcatcgtcatggtgctatcgtgtcatcactatcgtgtcattgtactatcaccatcgtgttatcgtactatcgtgccatcaCCAT--TA-G-----G----------G-------------C------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-GCTTT-GTAAACAAGCATAC--G------CG--AT-G-C-C--A-----T-G---------AT--------AG---C---A-CGATG-A---C-AC-GA-TGG-aacaccgta
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                tcgtgctatcgtgtcatcaccatcgtgtcatcgtactatcaccatcgtgctatcatactatcgtgccatcaAT--C--G-----T----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-G---T-G-------GCAT-C--G------CGC-AT-G-CTT--G--T--T-G---------AC--------AA---A---G-CGATA-G---C-AC-GA-TGG-C-CCT-AA-CGG----AAC-ACCGTAaacaacata
gi|103747                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ----------G-------------C------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TT-GCTTT-G-------TCAA-CAAG------CAT-GC-G-C----G--A--T-G---------CC--------A----------CGATA-G---C-AC-GA-TGA-C-
gi|103894                     :                                                                                                                                                                                                                                                                       tcgtgctatcgtgtcatcaccatcgtgtcatcgtactatcaccatcgtgttatcgtactatcgtgtcatcaccatcgt----------G-------------C------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-GCTTT-G-------TCAA-CAAG------CAT-AT-G-C----G--A--T-G---------CC--------A----------CGATA-G---C-AC-GA-TGA-C-AC--AA-TGGTGATGAC-ACcctaacggaacaccgta
gi|103812                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtcatcgtaccatcaccattatgctatcgtactatc----------G-------------T------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TT-GCTTT-G-------TCAA-CAAG------CAT-AC-G-C----A--A--T-G---------CC--------A----------TGATA-G---C-AC-GA-TGA-C-cctaacagaacaccgta
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtaatatcgcgtcattgtcattgtgctgtcgtggcatcgtcatcgtgctatcgtgttatcaccatcgt----------G-------------C------CA-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-GCTTT-G-------TCAA-CAAG------CAT-GC-G-C----G--A--T-G---------CC--------A----------CGATA-G---C-AC-GA-TGA-C-ccttacggaacaccgta
gi|103759                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atcgt-----TC-G--T-----------GC-----T------A---TC-GCTTT-G-------TCAA-C--A------AGT-AT-A-CGC--G--A--T-G---------CC--------A----------CGATA-G---C-AC-GA-TGA-C-cctaacggaacaccgta
gi|103816                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcgtgctatcgtgtcatcaccatcgtgtcatcgtaccatcaccatcgtgctatcgtactatcgtgtcatcaccatcgtGAAA-A---C-GC-GA-TGG-T-CCA-AA-TGG----AAC-ACCGTAaggccctaacggaacaccgta
gi|103813                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgatttcaagttttcatgatcgtagttttgtattttcaccatcctgatttcgactttgaccgtcgtagtttcgactttcatgatatggggttcagaaata-AC-GA-TGG-T-CCA-AA-CGG----AAC-ACTGTA
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|103914 ): CATCACATTTTCACAAACGTAGTTTCGTGATTTCGTGTTTTCATCATCGTAGTTTCGACTTTCAACTCTCGTGGTATGGGGTTCAGAAATAAAAAACGCGATGGTCCAAATGGAACACTATA
Unaligned ( gi|103831 ): TTCGTGGTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTAGACTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTCATCATCGTGGTTTCGAAACTACAATGGTGAAAGTCGAAAGTACGATGGT
Unaligned ( gi|103793 ): TCGTAGTTTCGCGGTTTCACCATCGTTGTTTCGACTTTTCACTATCGTAGTTTCGCGTTTTTACCATCGTAGTTTCGACTTTTTACCATCGTAGTTTCG
Unaligned ( gi|103815 ): GTCATTTCGAATTTTCACCATCGTATTTGCGATTTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTTCACCATTGTAGTTTGTTGTTTCGACTTTTTATCATCGTAGTTTCGTTATTTAGACTGGACTTCATTTAAAAAATATGCCGCGATGGCCCCAACGGGCCACCGTA
Unaligned ( gi|103802 ): TCGTAGTTTCGACATTTCATCATCGTAGCGTCGACTTTCCGCCATCGTAGTTTCGACTTTTCACCATCGTATTTTCGT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                 11111111111111                                               111111111111111111111111                                                                2222222222222222222222222222222222222222222222222222222         11111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                    5        1   0          1       11 3 22222222 22222 4 11         7 000  44444      0 3 22 1        222222 77777777777777777777777777777    1 00000000000000   8888 11 222222222222  111111111  00    111  222222222222222222222222 2222222222222 444444  111 6666666666666666 00 00 3    2     00 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4444 0  66666   55555 222 0   0  0 0  22  0            
lowQualScore                  :                                                                                                                    .        .   .          .       .. . ........ ..... . ..         . ...  .....      . . .. .        ...... .............................    . ..............   .... .. ............  .........  ..    ...  ........................ ............. ......  ... ................ .. .. .    .     .. ....................................................... .... .  .....   ..... ... .   .  . .  ..  .            
lowQualScore                  :                                                                                                                    7        8   3          4       77 1 22222222 22222 6 55         9 888  00000      5 1 33 3        111111 88888888888888888888888888888    7 33333333333333   1111 66 999999999999  888888888  77    555  888888888888888888888888 8888888888888 777777  444 3333333333333333 77 77 3    4     88 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0000 7  00000   99999 999 8   8  8 8  88  8            
consensus                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CNT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------CATCG-TA-C---T------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GAT-GG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
Reference ( family-193 )      :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------CATCG-TG-C---T------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GAT-GG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
gi|103747                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-TAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CGC-AT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103748                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------CATCG-TG-T---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----G-CT-T-A---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-AA-CGGGACACCGTA
gi|103749                     :                                                                                                                                                 TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------GTCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCATC--G------C
gi|103750                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCATC--G------cttcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaaca
gi|103751                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCA
gi|103752                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------GTCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCA
gi|103753                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-TAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GC----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CTT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103754                     :                                                                                                                                        TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCTTCGT-G---TCA----TCGTAC-TAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------A--C--
gi|103755                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CATCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------CATCG---------------------C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATT--G------CGT-GT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTA
gi|103756                     :                                                                                                                                        TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---TATCACCATCG--T-G--T---CA-------TC---------GCGTCATC---------------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTG
gi|103758                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTAG---TT-----TCGTAT-TTT--C-ACCATCGT------G-----------------------------ATT-----------------TCGA-C-T--T------------TC---------AC--CATC---GTA---------G-------------T-------------T------TC---G----------------A--C--TTTCGTGGTATG--G----------------G------G---T---T--C--------------------AC---A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GAT-GG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAt
gi|103759                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----A-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAA-GG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103760                     :                                                                                                                                                 TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---TA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T------------------------------------------------TATCGTGGCATC--G------CCT--T----C-CT-G-T---T---T--G--------------------AC---A-
gi|103761                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTAG---TT-----TCGTAT-TTT--C-ACCATCGT------G-----------------------------ATT-----------------TCGA-C-T--T------------TC---------AC--CATC---GT----------AGTT----------T-------------CGACTT-TC---G----------------A--C--TTTCGTGGTATG--G------GGT----------T-C-A---G---A--A--------------------AT---A-AAA----AAA-A---C-G-C-GAT-GG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAtgcacaaaaa
gi|103763                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-TAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCA-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCATGGCATC--G------CGT-AT----G-CT-T-G---T---T--T--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-AA-TGGAACAACATA
gi|103764                     :                                                                                                                                        TCGT-GCCATCG--C-T--------C-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTGT-CAT--C---------------G--------------T-------------CATCG-TG-C---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------A--C--TATCAC--CATC--G------TG
gi|103764                     :                                                                                                        tcgtgtttTCGT-GTCATCGT-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-TAT--C-ACCATCGT------G--------------
gi|103766                     :                                                                                                    tcgtgttttcgtgccatcgctccatcaccaTCGTCATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-TAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATGG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------A--C--CATCAC--CATC--G------TG
gi|103767                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTAG---TT-----TCGTAT-TTT--C-ATCATCGT------G-----------------------------ATT-----------------TCGA-C-T--T------------TC---------AC--CATC---GTA---------G-------------T-------------T------TC---GACTTT-----------AGAC--TTTTGTGGTATG--G----------G-----G-CT-C-A---G---A--A--------------------AT---A-AAA------A-A---C-G-C-GAT-GG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103768                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTAG---TT-----TCATAT-TTT--C-ACCATCGT------G-----------------------------ATTT-TGAC---T-------T----------------------TC---------AC--CATC---GT----------AGT-----------T-------------TAGACTTTC---G----------------A--C--TTTCGTGGTAT---G------GG---------------G---T---T--C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-G-T-GAT-AG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103769                     :                                                                                                                                                                         T--CACCATCGT-GGTTTCGACTTTCGT-C-TTT--C-ACCATCGT------A--------------G-------------TTTTG-TG-T---T-------T---------T---CA-------TC---------AT--CATA---GTTTCGACTTTCA-------------T-------------CA-----TC---A----T-----------G--G--TTTCG-AGCATC--G------TG--------G-TT-T-G---G---G--G--------------------AA---A-AAA-TTAAAA-A---T-A-C-AAT-GG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103770                     :                                                                                                                         ttgtgatttcgacttTCGT-GTTATTG--C-A--------T-----CTT--CGTCATCGT-G---ACA----TCGCTC-CAT--T-ACCATTGT------G--------------C-------------TATCG-TA-A---T------GTCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--T--TATCGTGGTATT--G------CGT-GT----G-CC-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-TA-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103773                     :                                                                                                                                                                                                                              --------------C-------------CATCG-TA-G---T------TTTG--C-G--TTTTCG-------TC---------AT--CATA---GTTTCGACTTTCA-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--G--TTTCG-AGCATC--G------TG--------G-TT-T-G---G---G--G--------------------GG---A-AAAAT-AAAA-A---T-A-C-GAT-GG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103774                     :                                                                                                               tcgtgatttcgactttcgactttcaTCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTAG---TT-----TCGTAT-TTT--C-ACCATTGT------G-----------------------------ATT-----------------TCGA-C-T--T------------TC---------AC--CGTC---GTA---------G-------------T-------------T------TC---G----------------A--C--TTTCG--ACTTT-----------T-GT----G-TTAT-GGGGT---TCAG--------------------AT---ATAA-----AAA-A---C-G-C-GAT-TG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103776                     :                                                                                                                                                                                                          T--C-ACCATCG----------------------------------------G-AG-G---T-------TCG--C-A--T---TT-------TC---------AT--CATC---GT----------AGTTTCGACTTTCAT-------------CA-----TC---G----T-----------G--G--TTTCG-GGCATC--G------TG--------G-TT-T-G---G---C--A--------------------AA---A-AAG-T-AAAA-A---T-A-C-GAT-GA-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103777                     :                                                                                                                  tcgtggtttcggctttcgacttTCGT-GCCATCG--TTG--------T-----T-T--CATCATCGT-G---CCA----TCGTGT-TTT--C-ATCATCGT------A--------------C-------------CATCG-TA-C---C------ATCG--C-G--C---TT-------TC---------AC--CATT---GT----------A-------------C-------------CA-----TC---G----T------------------------GCATC--G------CG--GT----T-CA-G-G---G---A--G--------------------AC---A-AAA---AATG-T---T-A-CTTAT--G-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103778                     :                                                                                                                                        TCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT-A---CCA----TCGTTG-TTT--C-ACCATCGT------A--------------C-------------AATCGTTG-T---T-------TCA--C-GT-T---CG-------T----------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------TT-----TC--------------------A--C--CATCGT
gi|103779                     :                                                                                                                TCGT-AACATCGT-GTTTTCACCATCGT-ACCATCA--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT-G---CCT----TCGTTG-TTT--C-ACCATCGT------A--------------C-------------CATCG-T-------------------T-G--T---T--------TC---------AC--CATC---GT----------
gi|103781                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TG-C-------------------------CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCATC--G------
gi|103782                     :                                                                                                                                  TCGTCATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCG---------C-GTCATCGT-----------------------------------CATCG-TG-C---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------A--C--CATCAC--CATC--G------TG
gi|103782                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TG-ctatcgtg
gi|103783                     :                                                                                            tcgtcatcgtgccatcaccaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TG-C-------------------------CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCA
gi|103784                     :                                                                                                                                        TCGT-GTTATCGCTT-G--------T-------T--CGTCAACGT-----TAA----TCGTTT-GTT--C-TCCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TG-C---T------ATTG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--T--TATCCTGGCATC--G------CGT-GT----G-CC-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A------------CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103785                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TAT--CATCATCGT-A---ATT----TTGTAT-TTC--C-ACCATCGT------A--------------G-------------TTTCG--A-C---T------TTCG-------------------------------AC--TTTC---G--------------------------------------------------------------------A--C--TTTCGTGGTATG--G----------------G------G---T---T--C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GAT-GG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103786                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTTG--T-G--------T-----TTT--CATTATCGTAG---TT-----TTGTAT-TTT--C-ACCATCGT------G--------------
gi|103786                     :                                                                                                                                                                                                                                                           ATCG-TA-G---T------TTTG--T-A--T---TT-------TC---------AC--CATC---GT----------GATT----------T-------------CAAC---TT---T----T-----------A--C--TATCTTAGTTTC--GACTTT-CGT-G-----G-TT-T-GGGGT---T--C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---T-G-C-GAT-GG-T-CTA-AA-TGGAACACCGTAatttcaacttttactatcttagtttcgactttcgtggtttggggttcagaaataaaaaatgcgatggtctaaatggaacaccgta
gi|103787                     :                                                                                                                                                    tcgtgattttgtgttttcattT--CACCATCGT-G---GTT----TCG-AC-TTT--CGACTTTCA----------------------C-------------CATCG-TA-G---T------TTCG--C-G--T---TT-------TC---------AT--CATT---GT----------AGTTTCGACTT---T-------------CA-----TCCTCG----T-----------G--G--TTTCG-AGCATC--G------TG--------G-TT-TAG---G---G--G--------------------AA---A-AAA------------------AAT-GG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103788                     :                                                                                                                         tcgtgatttcgacttTCGT-GATTTCT--T-G--------T-----TTT--CATCATCATAG---TT-----TCATAT-TTT--C-ACCATCAT------G-----------------------------ATT-----------------TCGA-C-T--T------------TC---------AC--CATT---GT----------A---------------------------------------G----T-----------G--G--TATGG-GGC-TC----------------------------------------------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-A-T-GAT-GG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103789                     :                                                                                                                                        TCGTAGTTATCT--T-G--------TTTCGACATTTCACCATTGTTG---TT-----TCG-AC-TTTT-C-ACCATCGT------AGTTTCGACTTTTCAC-------------CATCG-TA-C---T------TTCG--A-C--T---TA-------TC---------AT--CATC---GT----------A--------------------------------------------------------G--T--T-TCGTTGTTTC--G-------AT-TT----GACT-T-AA--T---T--T--------------------A----A-AAG-A-AATATG---CCG-C-AATTGG-C-CC--AA-CGGGACACCGT
gi|103790                     :                                                                                                                                                                         T--CGCCATCGT-A-----G----TTGTAA-CTTTTC-ACCATCGTT-----G--------------T-------------T-TCG-T------T------ATTT--C-GACT---TT-------TC---------AC--CATC---GT-------------------------------------------------------T-----------G--T--T-TCGTTGTTTT--GA-----CTT-A-----A-CT-T-AAT-T---T--A--------------------AT---A-AAT----ATG-C---C-A-C-GAT-TG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103791                     :                                                                                                                                                                                tcgttgtttcgttgtttcgacttttcaccctcgtagtttcgacttt--------------C-------------CATCG-TA-G---T------TTCG--C-G--T---TT-------TC---------AC--CATC---GTT---------G-------------TTTCGACTTTTCACCA-----TC---G----T-----------A--G--TTTCGTTGTTTC--G------ACT-TT----A-AT-T-AA--T---T--T--------------------AT---G-AAT----ATG-C---C-A-C-GAT-GG-CACCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103792                     :                                                                                     tcgttgtttcgttgtttcgacttttcaTCGTAGTT-TCGC-GTTTTCACCATCGTTGTT-TTG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGTAG---TT-----TCGCGT-TTT--C-ACCATCGT------A--------------G-------------TATCG-TA-G---T------TTCG--C-G--T---TT-------TC---------AC--CATC---GT----------
gi|103794                     :                                                                                                                TCGTAGTT-TCGC-GTTTTCACCATCGT-TGTGTTC--C-T--------T-----TTT--CACCATCGTAG---TT-----TCGCGT-TTT--C-ATCATCGT------A--------------G-------------TATCG-TA-G---T------TTCG--C-G--G---TT-------TC---------AC--CATC---GT----------tgtgttc
gi|103798                     :                                                                                                                                                                                                                              --------------C-------------CATCG-TA-G---T------TTCG--C-G--T---TT-------TC---------AC--TATCTA-GT----------T-------------T-------------CG-----AC---T----TTTC--------A--C--CATCGTTGTTTC--G------ACT-TT----A-CT-T-AA--T---T--A--------------------AT---A-AAT----ATG-C---C-G-C-GAT-GG-C-CCC-GA-CGGGACACCGTAtgtttcg
gi|103799                     :                                                                                                                                 tcgtagtttcgcgttttccctatctagtttctacttttcaT--CACCATCATAG---TT-----TCGGAT-TTT--C-ACCATCGT------A--------------G-------------TTTCGTTG-T---T-------TCGA-C-T--T---TA-------TC---------AC--CATC---GT----------A--------------------------------------------------------G--T--T---------TC--G------ACT-TT----G-CT-T-A---CAA-T--A--------------------AT---A-AA----TATG-C---C-G-C-GAT-GGCC-CCC-AA-CAGGACACCGT
gi|103800                     :                                                                                                                                        tcgtagtttcgttgtttcgttgtttcgacttgtT--CACCATCGTAG---TT-----TCG-AC-TTT--CGACCGTTTT------A--------------C-------------CATCG-TA-G---T------TTCG--TTG--T---TACGACTTTTC---------AC--CATCATAGT----------T-------------T-------------CG-----TT---G----TTTC--------G--C--CTTTTCAGCATC--GTAATTTCGTTGTTCCGA-CT-T-GAC-T---T--A--------------------ATTTTA-AAA---AATATG---CTG-C-GAT-GG-C-CCC-AA-TGGGACACTGTA
gi|103801                     :                                                                                                                                                 tcgtaatttcgttgtttcgactttT--CACCATCGTAG---TT-----TCG-AC-TTTT-C-ACCATCGT-----------------------------------------TG-T---T-------TCG--T-C--T---TT-------TC---------AC--CATC---GTA---------G-------------T-------------T------TC---GT---T-----------G--T--T-TCGT--TATT--T------CG--------G-CT-T-GAC-T---T--AATCT----------------AT---A-AAA-T--ATG-C---C-G-C-GGT-GG-C-TTC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103802                     :                                                                                                                                                               tcatagtttcgttgattcgacttt---TCA----TCGTAG-CGT--CGACTTTC-C------G--------------C-------------CATCG-TA-G---T------TTCG--A-C--T---TT-------TC---------AC--CATC---GT----------A-------------T-------------TT-----TC---G----T-----------
gi|103810                     :                                                                                                                              tcgtagtttcgacatttcaTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTAG---TT-----TCGTAT-TTT--T-ACCATCGT------G-----------------------------ATT-----------------TCGA-C-T--T------------TC---------AC--CATC---GT----------AGTT----------T-------------CGACTT-TC---G----------------A--C--TTTTGTGGTATG--G------GGT----------T-C-A---G---A--A--------------------AT---A-AA-----AAA-A---C-G-C-AAT-GG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103811                     :                                                                                                                           catgattTCACCATCGT-AGTATCG----G--------------CATTTCACCATCGT-A---GTA----TCG-ACTTTT--C-ACCATCGT------A--------------G-------------TTTCGTTG-T---T-------TCG--A-C--T---TT-------TC---------AT--CATC---GTA---------G-------------T-------------T------TCG--G----T-----------G--T--T-TCGT--TATT------------------------------T---C--G--------------------ACTG-A-AAA-C-AATATGC--C-G-C-GAT-GG-T-CCC-AC-AGGGACACCGTA
gi|103812                     :                                                                                                                                cgttgtttcgactttTATCG--C-G--------T-----CAT--TGTCATTGT-G---CTG----TCGTGG-CAT--C---------------G--------------T-------------CATCG-TG-C---T------ATCG--T-G--T---TA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCATGGCATT--G------CGT-AT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GAT-GA-C-CCT-TA-CGGAACACCGTA
gi|103813                     :                                                                                                                                             gtaaTCG--C-G--------T-----TTT--CGCCATCGT-G---GTT----TCG-AC-TTT--C-ACCATCGT------A--------------G-------------TTTCG--A-C---T------TTCGACT-T--T---CA-------TC---------AT--CGTA---GT----------T-------------T-------------CG-----AC---T----TTC---------A--C--CATTGTG----T--G------TGT-GT----G-TG-T-G---TGGGT--GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAT---A-AAA----ATA---------C-GAT-GG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103814                     :                                                                                                                                                                         gtaattCATTGC-G---TCA----TCTTAC-CAT--C-ACCATCGTACCATCG--------------C-------------CATCG-TG-C---T------ATCG--G-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCATGGCATT--G------C
gi|103816                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gt-G---T---T--C--------------------AG---A-AAT-A-GAAA-A---C-G-C-GAT-GG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTActtcctgtaagacataggaaaaataataataatggaagac
gi|103817                     :                                                        tgatttcaagttttcatgatcgtagttttgtattttcaccatcctgatttcgactttgaccgtcgtagtttcgactttcatgatatgggTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTAG---TT-----TCGTAT-TTT--C-ACCATCGT------G--------------A-------------TTTCG--A-C---T------ATT--------T------------TC---------AC--CATC---GTA---------G-------------T-------------T------TC---G----------------G--C--TTTCGTGGTAT---G------GG---------------G---T---T--C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-A-C-GAT-TG-T-CCA-AA-CGGCACACCTTA
gi|103818                     :                                                                                                                   tgattATCGC-GTTTTCATCATCAT-GCCATCG--CAG--------T-----T-T--CATCATCGT-A---CCA----TCGTAT-TTT--C-ACCATCGT------A--------------A-------------CATCG-TG-T---T-------T----------------------TC---------AC--CATC---GT----------
gi|103819                     :                                                                                                                                              taatCG--T-G--------T-----C-T--CA--A-CGC-G---CCT----TTGCTC-CAT--C-ACAATCTT------G--------------C-------------TATTG-TA-C---C------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--GATT---GT----------A-------------C-------------CA-----TC---G----T-----------A--T--TGTCGCGTATTT--G------TGC-GT----A-CC-T-G---T---G--G--------------------AC---A-AAG-C-GAT--G---C-AAT-GAT-GG-C-ACT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103820                     :                                                                                                                            taattcTCACCATCGT-AGTTTCG--A-C--------T-----TTT--CACCATCGT-A---CTT----TCG-AC-TTTT-C-ACCTTCGT------A--------------C-------------TTTCG-TT-G---T------ATCG--A-C--T---TT-------TC---------AT--CATC---GT----------A--------------------------------------------------------G--T--T-TCGTTGTTTC--GA-----CTT-GA----C-CT-A-G---T---T--T--------------------AA---A-AAA-T-G-TG-C---C-G-C-GAT-AG-C-CCCCAA-CGGAACACCGT
gi|103821                     :                                                                                                           tgatttcgaacttATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCCATCG--T-AGCATCGCTC-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCA
gi|103823                     :                                                                                                                                              gatTCG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGT-G---GTT----TCG-AC-TTT--T-ACCATCGT------A--------------G-------------TTTCG-TG------------ATTT--C-G--T---CA-------TTGTAGTTTCGAC--TTTC---------------A-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--G--TTTCG-AGCATC--G------CG--------G-TT-T-G---G---G--GA-------------------AA---A-AAA-T-AAAA-A---T-A-C-GAT-GG-T-CCA-AA-CGAAACACCGTA
gi|103832                     :                                                                                                                                              attTCG--T-G--------T-----CAT--CA------T-G---TCA----TC-TGC-AAT--C-AACATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------TTTG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCGTC--G------
gi|103839                     :                                                                                                                         TCGT-GTCATCGTCATGGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACTATCGT-G---TCA----TTGTAC-TAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC-------------------------------------------------CA-----TT---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-GA-CGGAACACCGTAt
gi|103840                     :                                                                                                                         TCGCAGTT-TCATCATCGT-ACCATCG--T-A--------T-----TTT--CACCATCGT-A---ACA----TCGTGT-TTT--C-ACCATCGT------A--------------C-------------C-------------------ATCA--C-G--T---TT-------TC---------AT--CATC---GT----------G-------------C-------------CT-----TC---G----T-----------
gi|103841                     :                                                                                                                         TCGT-GTTTTCACCATCGT-ACCATCG--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT-A---CCA----TCGCGC-TTT--C-ACCATTGT------A--------------C-------------CATCG-Ttgtt
gi|103842                     :                                                                                                                      TCGTTGT-TTCA-CGT--TCGT-ACCATCG--T-G--------T-----TTT--CACCATCGT-A---CCA----TCGCGT-TTT--C-ATCATCGT------A--------------C-------------CATCG-CG-C---T------TTC
gi|103843                     :                                                                                                                                  TCACCATCGT-ACAATCG--TTG--------T-----T-T--CACGTTCGT-A---CCA----TCGTGT-TTT--C-ACCATCGT------A--------------C-------------C-------------------ATCG--C-G--T---TT-------TC---------AT--CATC---GT----------
gi|103844                     :                                                                                                                 tcgttgttTCGT-ATTTTCACCATCGT-AACATCG--T-G--------T-----TTT--CACCATCGT-A---CCA----TCACGT-TTT--C-ATCATCGT------G--------------C-------------CTTCG-T-------------------T-G--T---T--------TC---------AC--CATC---GT----------
gi|103846                     :                                                                                                                TCGT-GTCATTGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--------------------------------T-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCAT------G--------------T-------------CATCG-TG-T---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T---------------------------------------GT-GT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GGT-GG-C-CCT-AA-TGGGACACCGTA
gi|103847                     :                                                                                                                                        TCGT-ACTTTCGACT-A--------T-----CA---CACCATCGTAG---TT-----TCG-AC-TTT--C-ACCATCAT------A--------------CTTTCGACTTTCATCATCG-TA-C---T------TTCGACT-T--T---CA--------C---------AC--CATC---GT----------
gi|103848                     :                                                                                                                                                                         T--CACCATCGTAG---TT-----TCG-AC-TTTT-C-ACAATCGT------A-----------------------------GTTG-CGAC---T------TT---------T---CA-------TC---------AT--CGTT---GT----------T-------------T-------------CG-----TT---G----TTTCGACTTTTCA--C--TATCGTAGTTTC--GTTGTTTCGA-CT----A-CT-T-TAATT---T--A--------------------AT---A-AAT----ATG-C---C-G-C-GAT-GG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTAagtttcg
gi|103849                     :                                                                                                                                                                                          tcgtagtttcgacttcT--C-ACCATCGTT-----G--------------T-------------T-TCG-TT-C---T------TT----------------------TC---------AC--CATC---GTA---------G-------------T-------------T------TT---GT---T-----------G--T--T-TTGTTGCTTC--GA-----CTT-AA----G-TT-T-AT--T---T--A--------------------AT---A-AA----TATG-C---C-A-C-GGT-GG-T-CCC-AA-CGGATCACCGTA
gi|103863                     :                                                                                                                                                               tcgtggtttcgacatcCATCGT-G---TCA----TTGCAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCATT--G------
gi|103864                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cgt---C-G-C-GAT-GG-C-CCC-AAACGGGACACCGTA
gi|103871                     : cgttgtttcgtctttcaaccaacgtagtttcgattttttaccatcgtagtttcgttgtttcgactttttatcatcgtagtttcgttatttcgttgtttcgactcgacttaatttaaaacttgaaatatgcCGCTATCGC-ACTGTCA--T-A--------TT----CAT--CACTATTGT-A---TCA----TCGT---C-T--T-GCC---GT------G--------------C-------------CATCG-CT-CCTTT------GTCA--T-G--T---CA-------CC---------AC--CATT---GT----------G-------------T-------------CA-----CC---G----T-----------G--C--TGTTGTACCATC--G------CAT-TTC---G-CT---G---T---T--G--------------------AC---A-ACG-C-GATA-T---C-A-C-GAT-GA-C-CTC-AA-AGGAGCACCTTA
gi|103873                     :                                                                                                                              attgTCATCATCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT-A---CCA----TCGTTG-TTT--C-ACCATCGT------A--------------C-------------AATCGTTG-T---T-------TCA--C-GT-T---CG-------T----------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------
gi|103876                     :                                                                                                                                                                                   tt-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------C--------------C-------------TATCG-TG-C-------------------------CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------T--C--TATCGAAGCATC--G------t
gi|103878                     :                                                                                                                       tttgtctctcaTCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------CATCG-TG-T---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------
gi|103879                     :                                                                                                                                                                         T--CACCATCGT-G---TCA----TCGTGT-CAT--C---------------G--------------T-------------CATCG-TG-C---T------ATCG--T-G--T---TA-------TC---------AC--CATT---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCTAGGCATC--G------TGT-AT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTAgt
gi|103880                     :                                                                                                                                  TCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------CATCG-TG-T---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------
gi|103884                     :                                                                                                                                                                                    T-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATTGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------GCCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATT---GT----------G-------------T-------------CA-----TT---G-------------------------------------------CGT-GT----G-CC-T-G---T---T--G--------------------AC---A-ACG-C-AATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-TTA-AA-CGGAACACCGTAgt
gi|103885                     :                                                                                                                                 tTCATCATCGT-ATTATCG--T-A--------T-----CAT--CACCATCGT-A---CTA----CCGTAG-TAT--C-ACCCTCGT------A--------------C-------------CATCG-CA-C---C------GTCG--
gi|103887                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------CATCG-TG-
gi|103888                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------t
gi|103889                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------
gi|103890                     :                                                                                                                                                                                 gtca-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCTC------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCA--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------C-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCATC--G------
gi|103892                     :                                                                                                                                                                                     -G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCATC--G------
gi|103893                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT-G---TCA----ACGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------
gi|103894                     :                                                                                                                                                                                 gtca-G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATTAT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATT---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CAT-AT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-AA-CAGAACACCGTA
gi|103895                     :                                                                                                                                                                                     -G---TCA----TTGAAC-CAT--C-ACCATCAT------G--------------C-------------TATCA-TA-C---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GC----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--A------TGT-AT----G-CT-T-G---T---T--A--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-AA-CGGAAAACTGTA
gi|103897                     :                                                                                                                                                                                     -G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------CATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G------------GCATC--G------CGT-AT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-TCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103900                     :                                                                                                                                                                                     -G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------CATCG---------------------C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--A------CGT-GT----G-AT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-
gi|103901                     :                                                                                                                                                                                     -G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCAT------G--------------A-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------
gi|103902                     :                                                                                                                                                                                     -G---TCA----TCGTAC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------GTCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTAGCATC--G------C
gi|103903                     :                                                                                                                                                                                     -G---TCA----TGGTTC-TGT--C-GT-GTCGT-----------------------------------CGTCG-TA-C---T------AT------G--T---CG-------TC---------AC--CAAT---AT----------G-------------G-------------CA-----TC---G----T-----------A--T--TGTCGTGGCAGT--G------TGT-GT----A-CC-A-G---C---T--G--------------------AA---A-AAG-C-GAAA-G---C-A-C-CGG-GG-C-CCT-AA-CGGAActtcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaacac
gi|103904                     :                                                                                                                       CATCGC-GTCATCGTCATCGT-GC--------------------------------CATCGT-G---CCA----TCGTGC-CAT--C-ACCATCGT------G--------------T-------------CATCG-TG-T---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------
gi|103908                     :                                                                                                                                                                                                           --C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTTGCATC--G------gt
gi|103909                     :                                                                                                                                                                                                           --C-ACCATCGT------G--------------C-------------TATCG-TA-C---T------GTCG--T-G--C---TG-------TC---------AC--CATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--T--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----G-CC-T-A---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-T-T------CGGAAGATCGTA
gi|103911                     :                                                                                                                                                                                                                                             -------------CGTCG-TG-G---T------TTCGACT-T--T---CA-------CC---------AT--CATT---GT----------T-------------T-------------CA-----AC---T----T-----------T--CATCATCGTGGTTTCAAG------CATAGT----G-GT-T-----T---G--G--------------------AG---A-AAA-T-CATA-AAAAT-A-C-GAT-GG-T-CCA-AT-CTGAACACCGTA
gi|103914                     :                                                                                                                                                                                         atCA----TCACAT-TTT--C-ACAAACGT------A--------------G-------------TTTCG-TG-A---T------TTCG--T-G--T---TT-------TC---------AT--CATC---GTA---------G-------------T-------------T------TC---GACTTTCA---------A--C--TCTCGTGGTATG--G----------------G------G---T---T--C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GAT-GG-T-CCA-AA-TGGAACACTATA
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATC---GT----------G-------------T-------------CA-----TC---G----T-----------G--C--TATCGTGGCATC--G------CGC-AT----G-CT-T-G---T---T--G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GAT-GG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103831 ): TTCGTGGTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTAGACTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTCATCATCGTGGTTTCGAAACTACAATGGTGAAAGTCGAAAGTACGATGGT
Unaligned ( gi|103793 ): TCGTAGTTTCGCGGTTTCACCATCGTTGTTTCGACTTTTCACTATCGTAGTTTCGCGTTTTTACCATCGTAGTTTCGACTTTTTACCATCGTAGTTTCG
Unaligned ( gi|103815 ): GTCATTTCGAATTTTCACCATCGTATTTGCGATTTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTTCACCATTGTAGTTTGTTGTTTCGACTTTTTATCATCGTAGTTTCGTTATTTAGACTGGACTTCATTTAAAAAATATGCCGCGATGGCCCCAACGGGCCACCGTA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    111111111111111111111111111111111111111111                                                   222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222         11111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                    5        1              1       11 3 22222222 22222 4 00         88   4      0 1 22 1  00      777777777777777777777777777777     0  000 7777777   7777 11 444444444444  111111111  00    111 0 000000000000000000000000000000000000000000   8888888888888888 222222 00 44444444    0     00 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444 0  55555   55555 222 0  0   0 0  22  0            
lowQualScore                  :                                                                                                                    .        .              .       .. . ........ ..... . ..         ..   .      . . .. .  ..      ..............................     .  ... .......   .... .. ............  .........  ..    ... . ..........................................   ................ ...... .. ........    .     .. ............................................................ .... .  .....   ..... ... .  .   . .  ..  .            
lowQualScore                  :                                                                                                                    3        8              5       77 1 33333333 22222 5 77         88   0      4 6 33 3  66      555555555555555555555555555555     9  888 5555555   0000 55 333333333333  888888888  66    555 5 444444444444444444444444444444444444444444   3333333333333333 333333 77 88888888    6     88 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0000 7  99999   99999 999 8  8   8 8  88  8            
consensus                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CGT-GT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
Reference ( family-193 )      :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------CATCGT-AC---T------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CGT-GT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
gi|103747                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CGC-AT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103748                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCGT-GT---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CGT-GT----G-CT-T---A---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGGACACCGTA
gi|103749                     :                                                                                                                                                 TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------GTCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCATC--G------C
gi|103750                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCATC--G------cttcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaaca
gi|103751                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCA
gi|103752                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------GTCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCA
gi|103753                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-C----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CGT-AT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CTT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103754                     :                                                                                                                                        TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCTTCGT--GTCATCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------A------C--
gi|103755                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CATCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCG--------------------C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATT--G------CGT-GT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTA
gi|103756                     :                                                                                                                                        TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---TATCACCATCG--T-G--T---CA-------TC---------GCGTCATC----------------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTG
gi|103758                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTA-GTT-TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT--------------GA-------------TTTCG--AC---T-----------------T------------TC---------AC--CATC---G-TA---------G----------T-------------T------TCG----------------A------C--T-------TTCGTGGTATG--G----------------G--------G---T---T-----C--------------------AC---A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAt
gi|103759                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CGT-AT----A-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-AGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103760                     :                                                                                                                                                 TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---TA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------------------------------------------T-------ATCGTGGCATC--G------CCT--T----C-CT-G---T---T---T-----G--------------------AC---A-
gi|103761                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-GTT-TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT--------------GA-------------TTTCG--AC---T-------T----------------------TC---------AC--CATC---G-T----------AGTT-------T-------------CGACTT-TCG----------------A------C--T-------TTCGTGGTATG--G------GGT----------T-C---A---G---A-----A--------------------AT---A-AA----AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAtgcacaaaaa
gi|103763                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCAT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCATGGCATC--G------CGT-AT----G-CT-T---G---T---T-----T--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACAACATA
gi|103764                     :                                                                                                                TCGT-GCCATCGC-TCCATCACCATCGT-GTCATCG--T-G--------T-----CAT--CGTCATCGT--GCTATCGTGT-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCGT-AC---T----------------------A-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------
gi|103764                     :                                                                                                        tcgtgtttTCGT-GTCATCGT-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT--------------G
gi|103766                     :                                                                                                    tcgtgttttcgtgccatcgctccatcaccaTCGTCATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATGG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------A------C--C-------ATCAC--CATC--G------TG
gi|103767                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-GTT-TCGTAT-TTT--C-AT--CATCGT--------------GA-------------TTTCG--AC---T-----------------T------------TC---------AC--CATC---G-TA---------G----------T-------------T------TCGACTTT-----------AGA----C--T-------TTTGTGGTATG--G----------G-----G-CT-C---A---G---A-----A--------------------AT---A-AAA------A-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103768                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-GTT-TCATAT-TTT--C-AC--CATCGT--------------G---------------ATTTTGAC---T-------T----------------------TC---------AC--CATC---G-T----------AGT--------T-------------TAGACTTTCG----------------A------C--T-------TTCGTGGTAT---G------GG-----------------G---T---T-----C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-G-T-GA-TAG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103769                     :                                                                                                                                                                         T--CACCATCGT--GGTTTCG-AC-TTT--C-GT--C-TTTC--------------AC-------------CATCGT-AG---T------TTTG--T-G--TTTTCA-------TC---------AT--CATA---G-TTTCGACTTTCA----------T-------------CA-----TCA----T-----------G------G--T-------TTCG-AGCATC--G------TG--------G-TT-T---G---G---G-----G--------------------AA---A-AAA-TTAAAA-A---T-A-C-AA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103770                     :                                                                                                                         ttgtgatttcgacttTCGT-GTTATTG--C-A--------T-----CTT--CGTCATCGT--GACATCGCTC-CAT--T-AC--CATTGT--------------GC-------------TATCGT-AA---T------GTCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------T--T-------ATCGTGGTATT--G------CGT-GT----G-CC-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TTA-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103773                     :                                                                                                                                                                                                                                  C-------------CATCGT-AG---T------TTTG--C-G--TTTTCG-------TC---------AT--CATA---G-TTTCGACTTTCA----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------G--T-------TTCG-AGCATC--G------TG--------G-TT-T---G---G---G-----G--------------------GG---A-AAAAT-AAAA-A---T-A-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103774                     :                                                                                                               tcgtgatttcgactttcgactttcaTCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-GTT-TCGTAT-TTT--C-AC--CATTGT--------------GA-------------TTTCG--AC---T-------T----------------------TC---------AC--CGTC---G-TA---------G----------T-------------T------TCG----------------A------C--T-------TTC--GACTTT-----------T-GT----G-TTATGGGG---T---TCA---G--------------------AT---ATAA-----AAA-A---C-G-C-GA-TTG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103776                     :                                                                                                                                                                         T--CACCATCGGAGGT--TCGCAT-TTT--C-AT--CATCGT--------------AG-------------TTTCG--AC---T-----------------T------------TC---------AT--CATC---G-T----------G--------------------------------------------------G------T--T--------TCG-GGCATC--G------TG--------G-TT-T---G---G---C-----A--------------------AA---A-AAG-T-AAAA-A---T-A-C-GA-TGA-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103777                     :                                                                                                                  tcgtggtttcggctttcgacttTCGT-GCCATCG--TTG--------T-----T-T--CATCATCGT--GCCATCGTGT-TTT--C-AT--CATCGT--------------AC-------------CATCGT-AC---C------ATCG--C-G--C---TT-------TC---------AC--CATT---G-T----------A----------C-------------CA-----TCG----T-----------------------------------GCATC--G------CG--GT----T-CA-G---G---G---A-----G--------------------AC---A-AAA---AATG-T---T-A-CTTA-T-G-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103778                     :                                                                                                                                        TCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT--ACCATCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT--------------AC-------------AATCGT-TG---T------TTCA--C-GT-T---CG-------T----------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------TT-----TC-----------------A------C--C-------ATCGT
gi|103779                     :                                                                                                                TCGT-AACATCGT-GTTTTCACCATCGT-ACCATCA--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--GCCTTCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT--------------AC-------------CATCGT-------------------T-G--T---T--------TC---------AC--CATC---G-T----------
gi|103781                     :                                                                                                                                        TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------G----------------------C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCATC--G------
gi|103782                     :                                                                                                                                  TCGTCATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT--GTCATCG---------C-GT--CATCGT-----------------------------CATCGT-GC---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------A------C--C-------ATCAC--CATC--G------TG
gi|103782                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-ctatcgtg
gi|103783                     :                                                                                            tcgtcatcgtgccatcaccaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------G----------------------C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCAg
gi|103784                     :                                                                                                                                        TCGT-GTTATCGCTT-G--------T-------T--CGTCAACGT---TAATCGTTT-GTT--C-TC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-GC---T------ATTG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------T--T-------ATCCTGGCATC--G------CGT-GT----G-CC-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A------------CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103785                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TAT--CATCATCGT--AATTTTGTAT-TTC--C-AC--CATCGT--------------AG-------------TTTCG--AC---T------TTCG-------------------------------AC--TTTC---G---------------------------------------------------------------A------C--T-------TTCGTGGTATG--G----------------G--------G---T---T-----C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103786                     :                                                                                                                                        TCGT-GATTTTG--T-G--------T-----TTT--CATTATCGTA-GTT-TTGTAT-TTT--C-AC--CATCGT--------------G
gi|103786                     :                                                                                                                                                                                                                                                 ATCGT-AG---T------TTTG--T-A--T---TT-------TC---------AC--CATC---G-T----------GATT-------T-------------CAAC---TTT----T-----------A------C--T-------ATCTTAGTTTC--GACTTT-CGT-G-----G-TT-T---GGGGT---T-----C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---T-G-C-GA-TGG-T-CTA-AA-TGGAACACCGTAatttcaacttttactatcttagtttcgactttcgtggtttggggttcagaaataaaaaatgcgatggtctaaatggaacaccgta
gi|103787                     :                                                                                                                                                    tcgtgattttgtgttttcattT--CACCATCGT--GGTTTCG-AC-TTT--CGAC--TTTCA----------------C-------------CATCGT-AG---T------TTCG--C-G--T---TT-------TC---------AT--CATT---G-T----------AGTTTCGACTTT-------------CATCC--TCG----T-----------G------G--T-------TTCG-AGCATC--G------TG--------G-TT-TA--G---G---G-----G--------------------AA---A-AAA------------------AA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103788                     :                                                                                                                         tcgtgatttcgacttTCGT-GATTTCT--T-G--------T-----TTT--CATCATCATA-GTT-TCATAT-TTT--C-AC--CATCAT--------------GA-------------TTTCG--AC---T-----------------T------------TC---------AC--CATT---G-T----------A---------------------------------G----T-----------G------G--T-------ATGG-GGC-TC---------------------------------------------------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-A-T-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103789                     :                                                                                                                                        TCGTAGTTATCT--T-G--------TTTCGACATTTCACCATTGTT-GTT-TCG-AC-TTTT-C-AC--CATCGTAGTTTCGACTTTTCAC-------------CATCGT-AC---T------TTCG--A-C--T---TA-------TC---------AT--CATC---G-T----------A--------------------------------------------------G------T--T--------TCGTTGTTTC--G-------AT-TT----GACT-TA--A---T---T-----T--------------------A----A-AAG-A-AATATGC--C-G-C-AATTGG-C-CC--AA-CGGGACACCGT
gi|103790                     :                                                                                                                                                                         T--CGCCATCGT--A--GTTGTAA-CTTTTC-AC--CATCGTT-------------GT-------------T-TCGT------T------ATTT--C-GACT---TT-------TC---------AC--CATC---G-T-------------------------------------------------T-----------G------T--T--------TCGTTGTTTT--GA-----CTT-A-----A-CT-T---AAT-T---T-----A--------------------AT---A-AAT----ATG-C---C-A-C-GA-TTG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103791                     :                                                                                                                                                                                    tcgttgtttcgttgtttcgacttttcaccctcgtagtttcgactttC-------------CATCGT-AG---T------TTCG--C-G--T---TT-------TC---------AC--CATC---GTT----------G----------TTTCGACTTTTCACCA-----TCG----T-----------A------G--T-------TTCGTTGTTTC--G------ACT-TT----A-AT-TA--A---T---T-----T--------------------AT---G-AA----TATG-C---C-A-C-GA-TGG-CACCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103792                     :                                                                                     tcgttgtttcgttgtttcgacttttcaTCGTAGTT-TCGC-GTTTTCACCATCGTTGTT-TTG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGTA-GTT-TCGCGT-TTT--C-AC--CATCGT--------------AG-------------TATCGT-AG---T------TTCG--C-G--T---TT-------TC---------AC--CATC---G-T----------
gi|103794                     :                                                                                                                TCGTAGTT-TCGC-GTTTTCACCATCGT-TGTGTTC--C-T--------T-----TTT--CACCATCGTA-GTT-TCGCGT-TTT--C-AT--CATCGT--------------AG-------------TATCGT-AG---T------TTCG--C-G--G---TT-------TC---------AC--CATC---G-T----------tgtgttc
gi|103798                     :                                                                                                                                                                                                                                  C-------------CATCGT-AG---T------TTCG--C-G--T---TT-------TC---------AC--TATCTA-G-T----------T----------T-------------CG-----ACT----TTTC--------A------C--C-------ATCGTTGTTTC--G------ACT-TT----A-CT-T---AA--T---T-----A--------------------AT---A-AAT----ATG-C---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-GA-CGGGACACCGTAtgtttcg
gi|103799                     :                                                                                                                                 tcgtagtttcgcgttttccctatctagtttctacttttcaT--CACCATCATA-GTT-TCGGAT-TTT--C-AC--CATCGT--------------AG-------------TTTCGT-TG---T------TTCGA-C-T--T---TA-------TC---------AC--CATC---G-T----------A--------------------------------------------------G------T--T----------------TC--G------ACT-TT----G-CT-T---A---CAA-T-----A--------------------AT---A-AA----TATG-C---C-G-C-GA-TGGCC-CCC-AA-CAGGACACCGT
gi|103800                     :                                                                                                                                        tcgtagtttcgttgtttcgttgtttcgacttgtT--CACCATCGTA-GTT-TCG-AC-TTT--CGAC--CGTTTT--------------AC-------------CATCGT-AG---T------TTCG--TTG--T---TACGACTTTTC---------AC--CATCATAG-T----------T----------T-------------CG-----TTG----TTTC--------G------C--C-------TTTTCAGCATC--GTAATTTCGTTGTTCCGA-CT-T---GAC-T---T-----A--------------------ATTTTA-AAA---AATATG---CTG-C-GA-TGG-C-CCC-AA-TGGGACACTGTA
gi|103801                     :                                                                                                                                                 tcgtaatttcgttgtttcgactttT--CACCATCGTA-GTT-TCG-AC-TTTT-C-AC--CATCGT----------------------------------T-GT---T-------TCG--T-C--T---TT-------TC---------AC--CATC---G-TA---------G----------T-------------T------TCGT---T-----------G------T--T--------TCGT--TATT--T------CG--------G-CT-T---GAC-T---T-----AATCT----------------AT---A-AAA-T--ATG-C---C-G-C-GG-TGG-C-TTC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103802                     :                                                                                                                                                                tcatagtttcgttgattcgactttTCATCGTAG-CGT--CGAC--TTTC-C--------------GC-------------CATCGT-AG---T------TTCG--A-C--T---TT-------TC---------AC--CATC---G-T----------A----------T-------------TT-----TCG----T-----------
gi|103810                     :                                                                                                                              tcgtagtttcgacatttcaTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTA-GTT-TCGTAT-TTT--T-AC--CATCGT--------------GA-------------TTTCG--AC---T-----------------T------------TC---------AC--CATC---G-T----------AGTT-------T-------------CGACTT-TCG----------------A------C--T-------TTTGTGGTATG--G------GGT----------T-C---A---G---A-----A--------------------AT---A-AA-----AAA-A---C-G-C-AA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103811                     :                                                                                                                                                                                  catgattCATCGTAG-TAT--C-GG--CATTTC--------------AC-------------CATCGT-AG---T------ATCG--A-C--T---TT-------TC---------AC--CATC---G-T----------AGTT-------T-------------CG-----TTG----TTTCG-------A------C--TTTTCATCATCGTAGTTTC--G-------GT-GT------TT-C---G---T---TATTTCG--------------------ACTG-A-AAA-C-AATATG---CCG-C-GA-TGG-T-CCC-AC-AGGGACACCGTA
gi|103812                     :                                                                                                                            cgttgtttcgacttttcacTATCG--C-G--------T-----CAT----------T--GTCATTGTGC-TGT--C-GTGGCATCGT-----------------------------CATCGT-GC---T------ATCG--T-G--T---TA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCATGGCATT--G------CGT-AT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGA-C-CCT-TA-CGGAACACCGTA
gi|103813                     :                                                                                                                                             gtaaTCG--C-G--------T-----TTT--CGCCATCGT--GGTTTCG-AC-TTT--C-AC--CATCGT--------------AG-------------TTTCG--AC---T------TTCGACT-T--T---CA-------TC---------AT--CGTA---G-T----------T----------T-------------CG-----ACT----TTC---------A------C--C-------ATTGTG----T--G------TGT-GT----G-TG-T---G---TGGGT-----GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAT---A-AAA----ATA---------C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103814                     :                                                                                                                                                                         gtaattCATTGC--GTCATCTTAC-CAT--C-AC--CATCGTACCATC--------GC-------------CATCGT-GC---T------ATCG--G-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCATGGCATT--G------C
gi|103816                     :                                                                                                                                                                       gtT--CATGATCGTA-GTT-TTGTAT-TTT--C-AC--CATCCT--------------GA-------------TTTCG--AC---T-------TTG-------------------------------AC--CGTC---G-TA---------G----------T-------------T------TCG----------------A------C--T-------TTCATGATATG--G----------------G--------G---T---T-----C--------------------AG---A-AAT-A-GAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTActtcctgtaagacataggaaaaataataataatggaagac
gi|103817                     :                                                                                                                                    tgatttcaagtttTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-GTT-TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT--------------GA-------------TTTCG--AC---T------ATT--------T------------TC---------AC--CATC---G-TA---------G----------T-------------T------TCG----------------G------C--T-------TTCGTGGTAT---G------GG-----------------G---T---T-----C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-A-C-GA-TTG-T-CCA-AA-CGGCACACCTTA
gi|103818                     :                                                                                                                   tgattATCGC-GTTTTCATCATCAT-GCCATCG--CAG--------T-----T-T--CATCATCGT--ACCATCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT--------------AA-------------CATCGT---------------------G--T---TT-------TC---------AC--CATC---G-T----------
gi|103819                     :                                                                                                                                              taatCG--T-G--------T-----C-T--CA--A-CGC--GCCTTTGCTC-CAT--C-AC--AATCTT--------------GC-------------TATTGT-AC---C------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--GATT---G-T----------A----------C-------------CA-----TCG----T-----------A------T--T-------GTCGCGTATTT--G------TGC-GT----A-CC-T---G---T---G-----G--------------------AC---A-AAG-C-GAT--G---C-AAT-GA-TGG-C-ACT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103820                     :                                                                                                                            taattcTCACCATCGT-AGTTTCG--A-C--------T-----TTT--CACCATCGT--ACTTTCG-AC-TTTT-C-AC--CTTCGT--------------AC-------------TTTCGT-TG---T------ATCG--A-C--T---TT-------TC---------AT--CATC---G-T----------A--------------------------------------------------G------T--T--------TCGTTGTTTC--GA-----CTT-GA----C-CT-A---G---T---T-----T--------------------AA---A-AAA-T-G-TG-C---C-G-C-GA-TAG-C-CCCCAA-CGGAACACCGT
gi|103821                     :                                                                                                           tgatttcgaacttATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCCATCG--T-AGCATCGCTC-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCA
gi|103823                     :                                                                                                                                              gatTCG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGT--GGTTTCG-AC-TTT--T-AC--CATCGT--------------AG-------------TTTCGT-G-----------ATTT--C-G--T---CA-------TTGTAGTTTCGAC--TTTC----------------A----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------G--T-------TTCG-AGCATC--G------CG--------G-TT-T---G---G---G-----GA-------------------AA---A-AAA-T-AAAA-A---T-A-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGAAACACCGTA
gi|103832                     :                                                                                                                                              attTCG--T-G--------T-----CAT--CA------T--GTCATC-TGC-AAT--C-AA--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------TTTG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCGTC--G------
gi|103839                     :                                                                                                                         TCGT-GTCATCGTCATGGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACTATCGT--GTCATTGTAC-TAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC-----------------------------------------------CA-----TTG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CGT-AT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-GA-CGGAACACCGTAt
gi|103840                     :                                                                                                                         TCGCAGTT-TCATCATCGT-ACCATCG--T-A--------T-----TTT--CACCATCGT--AACATCGTGT-TTT--C-AC--CATCGT--------------AC-------------C------------------ATCA--C-G--T---TT-------TC---------AT--CATC---G-T----------G----------C-------------CT-----TCG----T-----------
gi|103841                     :                                                                                                                         TCGT-GTTTTCACCATCGT-ACCATCG--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--ACCATCGCGC-TTT--C-AC--CATTGT--------------AC-------------CATCGT-tgtt
gi|103842                     :                                                                                                                      TCGTTGT-TTCA-CGT--TCGT-ACCATCG--T-G--------T-----TTT--CACCATCGT--ACCATCGCGT-TTT--C-AT--CATCGT--------------AC-------------CATCGC-GC---T------TTC
gi|103843                     :                                                                                                                                  TCACCATCGT-ACAATCG--TTG--------T-----T-T--CACGTTCGT--ACCATCGTGT-TTT--C-AC--CATCGT--------------AC-------------C------------------ATCG--C-G--T---TT-------TC---------AT--CATC---G-T----------
gi|103844                     :                                                                                                                                         tcgttgttTCG--T-A--------T-----TTT--CACCATCGT--AACATCGTGT-TTT--C-AC--CATCG-----------------------------------T-AC---C------ATCA--C-G--T---TT-------TC---------AT--CATC---G-T----------G----------C-------------CT-----TCG----T-----------
gi|103846                     :                                                                                                                TCGT-GTCATTGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--C----------------GTAC-CAT--C-AC--CATCAT--------------GT-------------CATCGT------------------------------------------------------------------------G----------T-------------CA-----TCG----C-----------GTCATCAC--C-------ATCGTGTCATC--G------TGT-GT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GG-TGG-C-CCT-AA-TGGGACACCGTAtgtttcaccatcgt
gi|103847                     :                                                                                                                                        TCGT-ACTTTCGACT-A--------T-----CA---CACCATCGTA-GTT-TCG-AC-TTT--C-AC--CATCAT--------------ACTTTCGACTTTCATCATCGT-AC---T------TTCGACT-T--T---CA--------C---------AC--CATC---G-T----------
gi|103848                     :                                                                                                                                                                         T--CACCATCGTA-GTT-TCG-AC-TTTT-C-AC--AATCGT--------------A---------------GTTGCGAC---T------TT---------T---CA-------TC---------AT--CGTT---G-T----------T----------T-------------CG-----TTG----TTTCGACTTTTCA------C--T-------ATCGTAGTTTC--GTTGTTTCGA-CT----A-CT-T---TAATT---T-----A--------------------AT---A-AAT----ATG-C---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTAagtttcg
gi|103849                     :                                                                                                                                                                 tcgtagtttcgacttcTCGT--GGTTTCG-ACATCT--C-AC--CATCGTT-------------GT-------------T-TCGT-TC---T------TT----------------------TC---------AC--CATC---G-TA---------G----------T-------------T------TTGT---T-----------G------T--T--------TTGTTGCTTC--GA-----CTT-AA----G-TT-T---AT--T---T-----A--------------------AT---A-AA----TATG-C---C-A-C-GG-TGG-T-CCC-AA-CGGATCACCGTA
gi|103863                     :                                                                                                                                                                               CATCGT--GTCATTGCAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCATT--G------
gi|103864                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cgt---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-AAACGGGACACCGTA
gi|103871                     : cgttgtttcgtctttcaaccaacgtagtttcgattttttaccatcgtagtttcgttgtttcgactttttatcatcgtagtttcgttatttcgttgtttcgactcgacttaatttaaaacttgaaatatgcCGCTATCGC-ACTGTCA--T-A--------TT----CAT--CACTATTGT--ATCATCGT----CT--T-GC--C---GT--------------GC-------------CATCGC-TCCTTT------GTCA--T-G--T---CA-------CC---------AC--CATT---G-T----------G----------T-------------CA-----CCG----T-----------G------C--T-------GTTGTACCATC--G------CAT-TTC---G-CT-----G---T---T-----G--------------------AC---A-ACG-C-GATA-T---C-A-C-GA-TGA-C-CTC-AA-AGGAGCACCTTA
gi|103873                     :                                                                                                                              attgTCATCATCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT--ACCATCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT--------------AC-------------AATCGT-TG---T------TTCA--C-GT-T---CG-------T----------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------
gi|103876                     :                                                                                                                                                                                   tt--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------------------------C----C---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------T------C--T-------ATCGAAGCATC--G------t
gi|103878                     :                                                                                                                       tttgtctctcaTCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCGT-GT---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------
gi|103879                     :                                                                                                                                                                         T--CACCATCGT--GTCATCGTGT-C-----------ATCGT-----------------------------CATCGT-GC---T------ATCG--T-G--T---TA-------TC---------AC--CATT---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCTAGGCATC--G------TGT-AT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTAgt
gi|103880                     :                                                                                                                                  TCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCGT-GT---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------
gi|103884                     :                                                                                                                                                                                    T--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATTGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------GCCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATT---G-T----------G----------T-------------CA-----TTG------------------------------------------------------CGT-GT----G-CC-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-ACG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-TTA-AA-CGGAACACCGTAgt
gi|103885                     :                                                                                                                                 tTCATCATCGT-ATTATCG--T-A--------T-----CAT--CACCATCGT--ACTACCGTAG-TAT--C-AC--CCTCGT--------------AC-------------CATCGC-AC---C------GTCG--
gi|103887                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCGT-
gi|103888                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------Ggt
gi|103889                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------G
gi|103890                     :                                                                                                                                                                                 gtca--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCTC--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCA--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------C-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCATC--G------
gi|103892                     :                                                                                                                                                                                     --GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCATC--G------
gi|103893                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGTCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--GTCAACGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------G
gi|103894                     :                                                                                                                                                                                 gtca--GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATTAT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATT---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CAT-AT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CAGAACACCGTA
gi|103895                     :                                                                                                                                                                                     --GTCATTGAAC-CAT--C-AC--CATCAT--------------GC-------------TATCAT-AC---T------ATCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-C----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--A------TGT-AT----G-CT-T---G---T---T-----A--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAAAACTGTA
gi|103897                     :                                                                                                                                                                                     --GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G-----------------------GCATC--G------CGT-AT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-TCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103900                     :                                                                                                                                                                                     --GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCG--------------------C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--A------CGT-GT----G-AT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-
gi|103901                     :                                                                                                                                                                                     --GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCAT--------------GA-------------TATCGT-AC---T------ATCG--T-G--C---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------
gi|103902                     :                                                                                                                                                                                     --GTCATCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------GTCG--T-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTAGCATC--G------C
gi|103903                     :                                                                                                                                                                                     --GTCATGGTTC-TGT--C-GT---GTCGT-----------------------------CGTCGT-AC---T------AT------G--T---CG-------TC---------AC--CAAT---A-T----------G----------G-------------CA-----TCG----T-----------A------T--T-------GTCGTGGCAGT--G------TGT-GT----A-CC-A---G---C---T-----G--------------------AA---A-AAG-C-GAAA-G---C-A-C-CG-GGG-C-CCT-AA-CGGAActtcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaacac
gi|103904                     :                                                                                                                       CATCGC-GTCATCGTCATCGT-GC--------------------------------CATCGT--GCCATCGTGC-CAT--C-AC--CATCGT--------------GT-------------CATCGT-GT---C------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------
gi|103908                     :                                                                                                                                                                                                     --C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------ATCG--C-G--T---CA-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTTGCATC--G------gt
gi|103909                     :                                                                                                                                                                                                     --C-AC--CATCGT--------------GC-------------TATCGT-AC---T------GTCG--T-G--C---TG-------TC---------AC--CATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------T--T-------ATCGTGGCATC--G------CGT-GT----G-CC-T---A---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-T-T------CGGAAGATCGTA
gi|103911                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            --T---CA-------CC---------AT--CATT---G-T----------T----------T-------------CA-----ACT----T-----------T------CATC-------ATCGTGGTTTCAAG------CATAGT----G-GT-T-------T---G-----G--------------------AG---A-AAA-T-CATA-AAAAT-A-C-GA-TGG-T-CCA-AT-CTGAACACCGTA
gi|103914                     :                                                                                                                                                                      atcgtcgtggtttcgacttCATCACAT-TTT--C-AC--AAACGT--------------AG-------------TTTCGT-GA---T------TTCG--T-G--T---TT-------TC---------AT--CATC---G-TA---------G----------T-------------T------TCGACTTTCA---------A------C--T-------CTCGTGGTATG--G----------------G--------G---T---T-----C--------------------AG---A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACTATA
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATC---G-T----------G----------T-------------CA-----TCG----T-----------G------C--T-------ATCGTGGCATC--G------CGC-AT----G-CT-T---G---T---T-----G--------------------AC---A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103831 ): TTCGTGGTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTAGACTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTCATCATCGTGGTTTCGAAACTACAATGGTGAAAGTCGAAAGTACGATGGT
Unaligned ( gi|103793 ): TCGTAGTTTCGCGGTTTCACCATCGTTGTTTCGACTTTTCACTATCGTAGTTTCGCGTTTTTACCATCGTAGTTTCGACTTTTTACCATCGTAGTTTCG
Unaligned ( gi|103815 ): GTCATTTCGAATTTTCACCATCGTATTTGCGATTTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTTCACCATTGTAGTTTGTTGTTTCGACTTTTTATCATCGTAGTTTCGTTATTTAGACTGGACTTCATTTAAAAAATATGCCGCGATGGCCCCAACGGGCCACCGTA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             11111111111111                                                                                                                  22222222222222222222222222222222222222222222222222222222              11111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                    5        1   0    11      1       11 3 22222222 22222 4 11         99 000  55555      111 22 1  00      333333 1 33333333333333   11 000 22222222222222 11  22222222  111111111  00   00 111 11111 888888888888888888888  666666  111 8888888888888888  00 3    1     00 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555555555 0  66666   66666 222 0  0   0 0  22  0            
lowQualScore                  :                                                                                                                    .        .   .    ..      .       .. . ........ ..... . ..         .. ...  .....      ... .. .  ..      ...... . ..............   .. ... .............. ..  ........  .........  ..   .. ... ..... .....................  ......  ... ................  .. .    .     .. ........................................................ ......... .  .....   ..... ... .  .   . .  ..  .            
lowQualScore                  :                                                                                                                    0        8   3    77      4       77 1 22222222 22222 3 44         11 888  33333      111 33 2  66      333333 2 00000000000000   77 888 77777777777777 66  22222222  999999999  77   66 555 22222 555555555555555555555  111111  444 1111111111111111  77 4    8     88 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888888 7  77777   66666 111 8  8   8 8  88  8            
consensus                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
Reference ( family-193 )      :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
gi|103747                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GTT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGC-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103748                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---A---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGGACACCGTA
gi|103749                     :                                                                                                                                                   TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------C
gi|103750                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------cttcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaaca
gi|103751                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103752                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103753                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----C----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CTT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103754                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCTTCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--
gi|103755                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CATCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G----------------TC--------------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATT--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTA
gi|103756                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---TATCACCATCG--T-G--TCA-------TC---------GCGTCAT--C--------------------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTG
gi|103758                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTCGTGGTATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AC--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAt
gi|103759                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----ACT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-AGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103760                     :                                                                                                                                                   TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------T---------------------------------TATCGTGGCATC--G------CCT--T----CCT-G---T---T---T--G--------------------AC--------A-
gi|103761                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGTT-------TCGACTT-TC---G----------------AC--TTTCGTGGTATG--G------GGT---------T-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AA----AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAtgcacaaaaa
gi|103763                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCATAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--T--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACAACATA
gi|103764                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--C-T--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--TATCAC--CATC--G------TG
gi|103764                     :                                                                                                        tcgtgtttTCGT-GTCATCGT-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103766                     :                                                                                                    tcgtgttttcgtgccatcgctccatcaccaTCGT--CATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATGG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--CATCAC--CATC--G------TG
gi|103767                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AT--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GAC--TTTAG-------AC--TTTTGTGGTAT---G----------GG----GCT-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AAA------A-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103768                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCATAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTTG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGT--------TTAGACTTTC---G----------------AC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-T-GA-TAG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103769                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGT--GGTTTCGACTTTCGT-C-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTTGTGT---T-------T---------TCA-------TC---------AT--CAT--A---G-----TTTCGACTTTCA----------TCA-----TC---A----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------AA--------A-AAA-TTAAAA-A---T-A-C-AA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103770                     :                                                                                                                           ttgtgatttcgacttTCGT-GTTATTG--C-A--------T-----CTT--CGTCATCGT--G---ACA----TCGCTC-CAT--T-AC--CATTGT------GCT-------------ATCGTAA---T------GTCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCGTGGTATT--G------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TTA-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103773                     :                                                                                                                                                                                                ----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTTGCGT---T------TTCG-------TCA-------TC---------AT--AGTTTC---GACTTTC----------A----------TCA-----TC---G----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------GG--------A-AAAAT-AAAA-A---T-A-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103774                     :                                                                                                                           tcgtgatttcgacttTCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATTGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CGT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTC--GACTTT-----------T-GT----GTTATGGGG---T---TCAG--------------------AT--------ATAA-----AAA-A---C-G-C-GA-TTG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103776                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGGAGG---T------TCGCAT-TTT--C-AT--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------G----------------------------------------GT--T-TCG-GGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---C--A--------------------AA--------A-AAG-T-AAAA-A---T-A-C-GA-TGA-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103777                     :                                                                                                                    tcgtggtttcggctttcgacttTCGT-GCCATCG--TTG--------T-----T-T--CATCATCGT--G---CCA----TCGTGT-TTT--C-AT--CATCGT------ACC-------------ATCGTAC---C------ATCG--C-G--CTT-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------A----------CCA-----TC---G----T----------------------GCATC--G------CG--GT----TCA-G---G---G---A--G--------------------AC--------A-AAA---AATG-T---T-A-CTTA-T-G-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103778                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT--A---CCA----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACA-------------ATCGTTG---T------TTCA--C-GT-TCG-------T----------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TTT-----TC--------------------AC--CATCGT
gi|103779                     :                                                                                                                TCGT-AACATCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCA--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--G---CCT----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACC-------------ATCGT------------------T-G--TT--------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103781                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103782                     :                                                                                                                                  TCGT--CATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGCGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G---------------------------------------------T-----------GT--CATCGTACCATC--AC-----CATCGT----GCT-
gi|103782                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTatcgtg
gi|103783                     :                                                                                            tcgtcatcgtgccatcaccaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCAg
gi|103784                     :                                                                                                                                          TCGT-GTTATCGCTT-G--------T-------T--CGTCAACGT------TAA----TCGTTT-GTT--C-TC--CATCGT------GCT-------------ATCGTGC---T------ATTG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCCTGGCATC--G------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A------------CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103785                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TAT--CATCATCGT--A---ATT----TTGTAT-TTC--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TTCG----------------------------AC--TTT--C---G---------------------------------------------------------AC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103786                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTTG--T-G--------T-----TTT--CATTATCGTA-G---TT-----TTGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------G
gi|103786                     :                                                                                                                                                                                                                                    T-------------ATCGTAG---T------TTTG--T-A--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------GATT-------TCAAC---TT---T----T-----------AC--TATCTTAGTTTC--GACTTT-CGT-G-----GTT-T---GGGGT---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---T-G-C-GA-TGG-T-CTA-AA-TGGAACACCGTAatttcaacttttactatcttagtttcgactttcgtggtttggggttcagaaataaaaaatgcgatggtctaaatggaacaccgta
gi|103787                     :                                                                                                                                                       tcgtgattttgtgttttcatT--CACCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--CGAC--TTTCA--------CC-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--T---G-----T----------AGTTTCGACTTTCA-----TCCTCG----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-TA--G---G---G--G--------------------AA--------A-AAA------------------AA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103788                     :                                                                                                                           tcgtgatttcgacttTCGT-GATTTCT--T-G--------T-----TTT--CATCATCATA-G---TT-----TCATAT-TTT--C-AC--CATCAT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------A-----------------------G----T-----------GG--TATGG-GGC-TC-----------------------------------------------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-A-T-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103789                     :                                                                                                                                          TCGTAGTTATCT--T-G--------TTTCGACATTTCACCATTGTT-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------CTT-----TC---G----A-----------CT--TATCAT--CATC--GTAGTTTCGT--T----GTT-TC--GAT-T---T--G--------------------ACTTAATTTAA-AAG-A-AATATGC--C-G-C-AATTGG-C-CC--AA-CGGGACACCGT
gi|103790                     :                                                                                                                                                                           T--CGCCATCGT--A-----G----TTGTAA-CTTTTC-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGT-----T------ATTT--C-GACTTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T---------------------------------------T-----------GT--T-TCGTTGTTTT--GA-----CTT-A-----ACT-T---AAT-T---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-A-C-GA-TTG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103791                     :                                                                                                                             tcgttgtttcgttgtttcgacttttcaccctcgtagtttcgactttT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCG-AC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T-TCGTTGTTTC--G------ACT-TT----AAT-T---AA--T---T--T--------------------AT--------G-AAT----ATG-C---C-A-C-GA-TGG-CACCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103792                     :                                                                                        tcgttgtttcgttgtttcgactttTCGTAGTT-TCGC-GTTTTCAC--CATCGTTGTT-TTG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103794                     :                                                                                                                TCGTAGTT-TCGC-GTTTTCAC--CATCGT-TGTGTTC--C-T--------T-----TTT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AT--CATCGT------AGT-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--GTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------tgtgttc
gi|103798                     :                                                                                                                                                                                                                                   CC-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AC--TAT--CTA-G-----T----------T----------TCG-----AC---T----TTTC--------AC--CATCGTTGTTTC--G------ACT-TT----ACT-T---AA--T---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-GA-CGGGACACCGTAtgtttcg
gi|103799                     :                                                                                                                                   tcgtagtttcgcgttttccctatctagtttctacttttcaT--CACCATCATA-G---TT-----TCGGAT-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTTG---T------TTCGA-C-T--TTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T---------TC--G------ACT-TT----GCT-T---A---CAA-T--A--------------------AT--------A-AA----TATG-C---C-G-C-GA-TGGCC-CCC-AA-CAGGACACCGT
gi|103800                     :                                                                                                                                          tcgtagtttcgttgtttcgttgtttcgacttgtT--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTT--CGAC--CGTTTT------ACC-------------ATCGTAG---T------TTCG--TTG--TTACGACTTTTC---------AC--CAT--CATAG-----T----------T----------TCG-----TT---G----TTTC--------GC--CTTTTCAGCATC--GTAATTTCGTTGTTCCGACT-T---GAC-T---T--A--------------------ATTTT-----A-AAA---AATATG---CTG-C-GA-TGG-C-CCC-AA-TGGGACACTGTA
gi|103801                     :                                                                                                                                                   tcgtaatttcgttgtttcgactttT--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGT-C---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GT---T-----------GT--T-TCGT--TATT--T------CG--------GCT-T---GAC-T---T--AATCT----------------AT--------A-AAA-T--ATG-C---C-G-C-GG-TGG-C-TTC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103802                     :                                                                                                                                                                  tcatagtttcgttgattcgacttt---TCA----TCGTAG-CGT--CGAC--TTTC-C------GCC-------------ATCGTAG---T------TTCG--A-C--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------TTT-----TC---G----T-----------
gi|103810                     :                                                                                                                                tcgtagtttcgacatttcaTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--T-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGTT-------TCGACTT-TC---G----------------AC--TTTTGTGGTATG--G------GGT---------T-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AA-----AAA-A---C-G-C-AA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103811                     :                                                                                                                           catgattTCAC--CATCGT-AGTATCG----G--------------CATTTCACCATCGT--A---GTA----TCG-ACTTTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTTG---T------TTCG--A-C--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TCG--G----T-----------GT--T-TCGT--TATT-------------------------------T---C--G--------------------ACTG------A-AAA-C-AATATGC--C-G-C-GA-TGG-T-CCC-AC-AGGGACACCGTA
gi|103812                     :                                                                                                                                  cgttgtttcgactttTATCG--C-G--------T-----CAT--TGTCATTGT--G---CTG----TCGTGG-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATT--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGA-C-CCT-TA-CGGAACACCGTA
gi|103813                     :                                                                                                                                               gtaaTCG--C-G--------T-----TTT--CGCCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TTCGACT-T--TCA-------TC---------AT--CGT--A---G-----T----------T----------TCG-----AC---T----TTC---------AC--CATTGTG----T--G------TGT-GT----GTG-T---G---TGGGT--GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAT--------A-AAA----ATA---------C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103814                     :                                                                                                                                                                           gtaattCATTGC--G---TCA----TCTTAC-CAT--C-AC--CATCGTACCATCGCC-------------ATCGTGC---T------ATCG--G-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATT--G------C
gi|103816                     :                                                                                                                                                                         gtT--CATGATCGTA-G---TT-----TTGTAT-TTT--C-AC--CATCCT------GAT-------------TTCG-AC---T-------TTG----------------------------AC--CGT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTCATGATATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-GAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTActtcctgtaagacataggaaaaataataataatggaagac
gi|103817                     :                                                                                                                                      tgatttcaagtttTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T------ATT--------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------GC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-A-C-GA-TTG-T-CCA-AA-CGGCACACCTTA
gi|103818                     :                                                                                                                   tgattATCGC-GTTTTCAT--CATCAT-GCCATCG--CAG--------T-----T-T--CATCATCGT--A---CCA----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------A--------------------AC----------ATCG--T-G--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103819                     :                                                                                                                                                taatCG--T-G--------T-----C-T--CA--A-CGC--G---CCT----TTGCTC-CAT--C-AC--AATCTT------GCT-------------ATTGTAC---C------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--GAT--T---G-----T----------A----------CCA-----TC---G----T-----------AT--TGTCGCGTATTT--G------TGC-GT----ACC-T---G---T---G--G--------------------AC--------A-AAG-C-GAT--G---C-AAT-GA-TGG-C-ACT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103820                     :                                                                                                                            taattcTCAC--CATCGT-AGTTTCG--A-C--------T-----TTT--CACCATCGT--A---CTT----TCG-AC-TTTT-C-AC--CTTCGT------ACT-------------TTCGTTG---T------ATCG--A-C--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T-TCGTTGTTTC--GA-----CTT-GA----CCT-A---G---T---T--T--------------------AA--------A-AAA-T-G-TG-C---C-G-C-GA-TAG-C-CCCCAA-CGGAACACCGT
gi|103821                     :                                                                                                           tgatttcgaacttATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-AGCATCGCTC-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103823                     :                                                                                                                                                gatTCG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--T-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTG-----------ATTT--C-G--TCA-------TTGTAGTTTCGAC--TTT--C---A-----T----------------------CA-----TC---G----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------CG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------AA--------A-AAAAT-AAAA-A---T-A-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGAAACACCGTA
gi|103832                     :                                                                                                                                                attTCG--T-G--------T-----CAT--CA------T--G---TCA----TC-TGC-AAT--C-AA--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------TTTG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCGTC--G------
gi|103839                     :                                                                                                                         TCGT-GTCATCGT--CATGGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACTATCGT--G---TCA----TTGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GTT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC----------------------------------------CA-----TT---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-GA-CGGAACACCGTAt
gi|103840                     :                                                                                                                         TCGCAGTT-TCAT--CATCGT-ACCATCG--T-A--------T-----TTT--CACCATCGT--A---ACA----TCGTGT-TTT--C-AC--C---------------------------ATCGTAC---C------ATCA--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------G----------CCT-----TC---G----T-----------
gi|103841                     :                                                                                                                         TCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCG--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--A---CCA----TCGCGC-TTT--C-AC--CATTGT------ACC-------------ATCGTtgtt
gi|103842                     :                                                                                                                      TCGTTGT-TTCA-CGT----TCGT-ACCATCG--T-G--------T-----TTT--CACCATCGT--A---CCA----TCGCGT-TTT--C-AT--CATCGT------ACC-------------ATCGCGC---T------TTC
gi|103843                     :                                                                                                                                  TCAC--CATCGT-ACAATCG--TTG--------T-----T-T--CACGTTCGT--A---CCA----TCGTGT-TTT--C-AC--CA---------------------------TCGTAC---C------ATCG--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------
gi|103844                     :                                                                                                        tcgttgttTCGT-AACATCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCA--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--G---CCT----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------
gi|103846                     :                                                                                                  tcgtattttcaccaTCGT-GTCATTGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--------------------------------T--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCAT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-------------------------------------GT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GG-TGG-C-CCT-AA-TGGGACACCGTA
gi|103847                     :                                                                                                                                          TCGT-ACTTTCGACT-A--------T-----CA---CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCAT------ACTTTCGACTTTCATCATCGTAC---T------TTCGACT-T--TCA--------C---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103848                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--AATCGTA-----GTT-------------G-CG-AC---T------TT---------TCA-------TC---------AT--CGT--T---G-----T----------T----------TCG-----TT---G----TTTCGACTTTTCAC--TATCGTAGTTTC--GTTGTTTCGA-CT----ACT-T---TAATT---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTAagtttcg
gi|103849                     :                                                                                                                                                                   tcgtagtttcgacttcTCGT--G---GTT----TCG-ACATCT--C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGTTC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TT---GT---T-----------GT--T-TTGTTGCTTC--GA-----CTT-AA----GTT-T---AT--T---T--A--------------------AT--------A-AA----TATG-C---C-A-C-GG-TGG-T-CCC-AA-CGGATCACCGTA
gi|103863                     :                                                                                                                                                                                 CATCGT--G---TCA----TTGCAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATT--G------
gi|103864                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgt---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-AAACGGGACACCGTA
gi|103871                     : cgttgtttcgtctttcaaccaacgtagtttcgattttttaccatcgtagtttcgttgtttcgactttttatcatcgtagtttcgttatttcgttgtttcgactcgacttaatttaaaacttgaaatatgcCGC--TATCGC-ACTGTCA--T-A--------TT----CAT--CACTATTGT--A---TCA----TCGT----CT--T-GC--C---GT------GCC-------------ATCGCTCCTTT------GTCA--T-G--TCA-------CC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----CC---G----T-----------GC--TGTTGTACCATC--G------CAT-TTC---GCT-----G---T---T--G--------------------AC--------A-ACG-C-GATA-T---C-A-C-GA-TGA-C-CTC-AA-AGGAGCACCTTA
gi|103873                     :                                                                                                                              attgTCAT--CATCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT--A---CCA----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACA-------------ATCGTTG---T------TTCA--C-GT-TCG-------T----------AC--CAT--C---G-----T----------G----------T
gi|103876                     :                                                                                                                                                                                     tt--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------CCT-------------ATCGTGC----------------------CA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------TC--TATCGAAGCATC--G------t
gi|103878                     :                                                                                                                       tttgtctctcaTCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------
gi|103879                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TTA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCTAGGCATC--G------TGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTAgt
gi|103880                     :                                                                                                                                  TCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------
gi|103884                     :                                                                                                                                                                                      T--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATTGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GCCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TT---G-----------------------------------------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-ACG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-TTA-AA-CGGAACACCGTAgt
gi|103885                     :                                                                                                                                 tTCAT--CATCGT-ATTATCG--T-A--------T-----CAT--CACCATCGT--A---CTA----CCGTAG-TAT--C-AC--CCTCGT------ACC-------------ATCGCAC---C------GTCG--
gi|103887                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGT
gi|103888                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------Ggt
gi|103889                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103890                     :                                                                                                                                                                                   gtca--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCTC------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCA--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------CCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103892                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103893                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----ACGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103894                     :                                                                                                                                                                                   gtca--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATTAT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CAT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CAGAACACCGTA
gi|103895                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TTGAAC-CAT--C-AC--CATCAT------GCT-------------ATCATAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----C----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--A------TGT-AT----GCT-T---G---T---T--A--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAAAACTGTA
gi|103897                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------G----------GCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-TCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103900                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G----------------TC--------------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--A------CGT-GT----GAT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-
gi|103901                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCAT------GAT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------
gi|103902                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------C
gi|103903                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TGGTTC-TGT--C-GT---GTCGT--------C-------------GTCGTAC---T------AT------G--TCG-------TC---------AC--CAA--T---A-----T----------G----------GCA-----TC---G----T-----------AT--TGTCGTGGCAGT--G------TGT-GT----ACC-A---G---C---T--G--------------------AA--------A-AAG-C-GAAA-G---C-A-C-CG-GGG-C-CCT-AA-CGGAActtcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaacac
gi|103904                     :                                                                                                                TCGC-GTCATCG---TCATCGTGCCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GCGTCATCGT------
gi|103908                     :                                                                                                                                                                                                            ca--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTTGCATC--G------
gi|103909                     :                                                                                                                                                                                                              --C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--CTG-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCC-T---A---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-T-T------CGGAAGATCGTA
gi|103911                     :                                                                                                                                                                                                                 -AT--CGTCGT------GGT-------------TTCG-AC---T-------T---------TCA-------CC---------AT--CAT--T---G-----T----------T----------TCA-----AC---T----T-----------TCATCATCGTGGTTTCAAG------CATAGT----GGT-T-------T---G--G--------------------AG--------A-AAA-T-CATA-AAAAT-A-C-GA-TGG-T-CCA-AT-CTGAACACCGTA
gi|103914                     :                                                                                                                                                                                              CA----TCACAT-TTT--C-AC--AAACGT------AGT-------------TTCGTGA---T------TTCG--T-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GACTTTCA---------AC--TCTCGTGGTATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACTATA
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGC-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103831 ): TTCGTGGTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTAGACTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTCATCATCGTGGTTTCGAAACTACAATGGTGAAAGTCGAAAGTACGATGGT
Unaligned ( gi|103793 ): TCGTAGTTTCGCGGTTTCACCATCGTTGTTTCGACTTTTCACTATCGTAGTTTCGCGTTTTTACCATCGTAGTTTCGACTTTTTACCATCGTAGTTTCG
Unaligned ( gi|103815 ): GTCATTTCGAATTTTCACCATCGTATTTGCGATTTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTTCACCATTGTAGTTTGTTGTTTCGACTTTTTATCATCGTAGTTTCGTTATTTAGACTGGACTTCATTTAAAAAATATGCCGCGATGGCCCCAACGGGCCACCGTA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             11111111111111                                                                                                                  22222222222222222222222222222222222222222222222222222222              11111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                    5        1   0    11      1       11 3 22222222 22222 4 11         99 000  55555      111 22 1  00      333333 1 33333333333333   11 000 22222222222222 11  22222222  111111111  00   00 111 11111 888888888888888888888  666666  111 8888888888888888  00 3    1     00 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555555555 0  66666   66666 222 0  0   0 0  22  0            
lowQualScore                  :                                                                                                                    .        .   .    ..      .       .. . ........ ..... . ..         .. ...  .....      ... .. .  ..      ...... . ..............   .. ... .............. ..  ........  .........  ..   .. ... ..... .....................  ......  ... ................  .. .    .     .. ........................................................ ......... .  .....   ..... ... .  .   . .  ..  .            
lowQualScore                  :                                                                                                                    0        8   3    77      4       77 1 22222222 22222 3 44         11 888  33333      111 33 2  66      333333 2 00000000000000   77 888 77777777777777 66  22222222  999999999  77   66 555 22222 555555555555555555555  111111  444 1111111111111111  77 4    8     88 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888888 7  77777   66666 111 8  8   8 8  88  8            
consensus                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
Reference ( family-193 )      :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
gi|103747                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GTT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGC-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103748                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---A---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGGACACCGTA
gi|103749                     :                                                                                                                                                   TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------C
gi|103750                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------cttcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaaca
gi|103751                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103752                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103753                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----C----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CTT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103754                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCTTCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--
gi|103755                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CATCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G----------------TC--------------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATT--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTA
gi|103756                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---TATCACCATCG--T-G--TCA-------TC---------GCGTCAT--C--------------------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTG
gi|103758                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTCGTGGTATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AC--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAt
gi|103759                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----ACT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-AGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103760                     :                                                                                                                                                   TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------T---------------------------------TATCGTGGCATC--G------CCT--T----CCT-G---T---T---T--G--------------------AC--------A-
gi|103761                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGTT-------TCGACTT-TC---G----------------AC--TTTCGTGGTATG--G------GGT---------T-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AA----AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAtgcacaaaaa
gi|103763                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCATAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--T--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACAACATA
gi|103764                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--C-T--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--TATCAC--CATC--G------TG
gi|103764                     :                                                                                                        tcgtgtttTCGT-GTCATCGT-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103766                     :                                                                                                    tcgtgttttcgtgccatcgctccatcaccaTCGT--CATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATGG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--CATCAC--CATC--G------TG
gi|103767                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AT--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GAC--TTTAG-------AC--TTTTGTGGTAT---G----------GG----GCT-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AAA------A-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103768                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCATAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTTG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGT--------TTAGACTTTC---G----------------AC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-T-GA-TAG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103769                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGT--GGTTTCGACTTTCGT-C-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTTGTGT---T-------T---------TCA-------TC---------AT--CAT--A---G-----TTTCGACTTTCA----------TCA-----TC---A----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------AA--------A-AAA-TTAAAA-A---T-A-C-AA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103770                     :                                                                                                                           ttgtgatttcgacttTCGT-GTTATTG--C-A--------T-----CTT--CGTCATCGT--G---ACA----TCGCTC-CAT--T-AC--CATTGT------GCT-------------ATCGTAA---T------GTCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCGTGGTATT--G------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TTA-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103773                     :                                                                                                                                                                                                ----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTTGCGT---T------TTCG-------TCA-------TC---------AT--AGTTTC---GACTTTC----------A----------TCA-----TC---G----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------GG--------A-AAAAT-AAAA-A---T-A-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103774                     :                                                                                                                           tcgtgatttcgacttTCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATTGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CGT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTC--GACTTT-----------T-GT----GTTATGGGG---T---TCAG--------------------AT--------ATAA-----AAA-A---C-G-C-GA-TTG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103776                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGGAGG---T------TCGCAT-TTT--C-AT--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------G----------------------------------------GT--T-TCG-GGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---C--A--------------------AA--------A-AAG-T-AAAA-A---T-A-C-GA-TGA-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103777                     :                                                                                                                    tcgtggtttcggctttcgacttTCGT-GCCATCG--TTG--------T-----T-T--CATCATCGT--G---CCA----TCGTGT-TTT--C-AT--CATCGT------ACC-------------ATCGTAC---C------ATCG--C-G--CTT-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------A----------CCA-----TC---G----T----------------------GCATC--G------CG--GT----TCA-G---G---G---A--G--------------------AC--------A-AAA---AATG-T---T-A-CTTA-T-G-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103778                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT--A---CCA----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACA-------------ATCGTTG---T------TTCA--C-GT-TCG-------T----------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TTT-----TC--------------------AC--CATCGT
gi|103779                     :                                                                                                                TCGT-AACATCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCA--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--G---CCT----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACC-------------ATCGT------------------T-G--TT--------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103781                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103782                     :                                                                                                                                  TCGT--CATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGCGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G---------------------------------------------T-----------GT--CATCGTACCATC--AC-----CATCGT----GCT-
gi|103782                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTatcgtg
gi|103783                     :                                                                                            tcgtcatcgtgccatcaccaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCAg
gi|103784                     :                                                                                                                                          TCGT-GTTATCGCTT-G--------T-------T--CGTCAACGT------TAA----TCGTTT-GTT--C-TC--CATCGT------GCT-------------ATCGTGC---T------ATTG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCCTGGCATC--G------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A------------CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103785                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TAT--CATCATCGT--A---ATT----TTGTAT-TTC--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TTCG----------------------------AC--TTT--C---G---------------------------------------------------------AC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103786                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTTG--T-G--------T-----TTT--CATTATCGTA-G---TT-----TTGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------G
gi|103786                     :                                                                                                                                                                                                                                    T-------------ATCGTAG---T------TTTG--T-A--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------GATT-------TCAAC---TT---T----T-----------AC--TATCTTAGTTTC--GACTTT-CGT-G-----GTT-T---GGGGT---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---T-G-C-GA-TGG-T-CTA-AA-TGGAACACCGTAatttcaacttttactatcttagtttcgactttcgtggtttggggttcagaaataaaaaatgcgatggtctaaatggaacaccgta
gi|103787                     :                                                                                                                                                       tcgtgattttgtgttttcatT--CACCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--CGAC--TTTCA--------CC-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--T---G-----T----------AGTTTCGACTTTCA-----TCCTCG----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-TA--G---G---G--G--------------------AA--------A-AAA------------------AA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103788                     :                                                                                                                           tcgtgatttcgacttTCGT-GATTTCT--T-G--------T-----TTT--CATCATCATA-G---TT-----TCATAT-TTT--C-AC--CATCAT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------A-----------------------G----T-----------GG--TATGG-GGC-TC-----------------------------------------------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-A-T-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103789                     :                                                                                                                                          TCGTAGTTATCT--T-G--------TTTCGACATTTCACCATTGTT-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------CTT-----TC---G----A-----------CT--TATCAT--CATC--GTAGTTTCGT--T----GTT-TC--GAT-T---T--G--------------------ACTTAATTTAA-AAG-A-AATATGC--C-G-C-AATTGG-C-CC--AA-CGGGACACCGT
gi|103790                     :                                                                                                                                                                           T--CGCCATCGT--A-----G----TTGTAA-CTTTTC-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGT-----T------ATTT--C-GACTTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T---------------------------------------T-----------GT--T-TCGTTGTTTT--GA-----CTT-A-----ACT-T---AAT-T---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-A-C-GA-TTG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103791                     :                                                                                                                             tcgttgtttcgttgtttcgacttttcaccctcgtagtttcgactttT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCG-AC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T-TCGTTGTTTC--G------ACT-TT----AAT-T---AA--T---T--T--------------------AT--------G-AAT----ATG-C---C-A-C-GA-TGG-CACCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103792                     :                                                                                        tcgttgtttcgttgtttcgactttTCGTAGTT-TCGC-GTTTTCAC--CATCGTTGTT-TTG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103794                     :                                                                                                                TCGTAGTT-TCGC-GTTTTCAC--CATCGT-TGTGTTC--C-T--------T-----TTT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AT--CATCGT------AGT-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--GTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------tgtgttc
gi|103798                     :                                                                                                                                                                                                                                   CC-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AC--TAT--CTA-G-----T----------T----------TCG-----AC---T----TTTC--------AC--CATCGTTGTTTC--G------ACT-TT----ACT-T---AA--T---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-GA-CGGGACACCGTAtgtttcg
gi|103799                     :                                                                                                                                   tcgtagtttcgcgttttccctatctagtttctacttttcaT--CACCATCATA-G---TT-----TCGGAT-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTTG---T------TTCGA-C-T--TTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T---------TC--G------ACT-TT----GCT-T---A---CAA-T--A--------------------AT--------A-AA----TATG-C---C-G-C-GA-TGGCC-CCC-AA-CAGGACACCGT
gi|103800                     :                                                                                                                                          tcgtagtttcgttgtttcgttgtttcgacttgtT--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTT--CGAC--CGTTTT------ACC-------------ATCGTAG---T------TTCG--TTG--TTACGACTTTTC---------AC--CAT--CATAG-----T----------T----------TCG-----TT---G----TTTC--------GC--CTTTTCAGCATC--GTAATTTCGTTGTTCCGACT-T---GAC-T---T--A--------------------ATTTT-----A-AAA---AATATG---CTG-C-GA-TGG-C-CCC-AA-TGGGACACTGTA
gi|103801                     :                                                                                                                                                   tcgtaatttcgttgtttcgactttT--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGT-C---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GT---T-----------GT--T-TCGT--TATT--T------CG--------GCT-T---GAC-T---T--AATCT----------------AT--------A-AAA-T--ATG-C---C-G-C-GG-TGG-C-TTC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103802                     :                                                                                                                                                                  tcatagtttcgttgattcgacttt---TCA----TCGTAG-CGT--CGAC--TTTC-C------GCC-------------ATCGTAG---T------TTCG--A-C--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------TTT-----TC---G----T-----------
gi|103810                     :                                                                                                                                tcgtagtttcgacatttcaTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--T-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGTT-------TCGACTT-TC---G----------------AC--TTTTGTGGTATG--G------GGT---------T-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AA-----AAA-A---C-G-C-AA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103811                     :                                                                                                                           catgattTCAC--CATCGT-AGTATCG----G--------------CATTTCACCATCGT--A---GTA----TCG-ACTTTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTTG---T------TTCG--A-C--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TCG--G----T-----------GT--T-TCGT--TATT-------------------------------T---C--G--------------------ACTG------A-AAA-C-AATATGC--C-G-C-GA-TGG-T-CCC-AC-AGGGACACCGTA
gi|103812                     :                                                                                                                                  cgttgtttcgactttTATCG--C-G--------T-----CAT--TGTCATTGT--G---CTG----TCGTGG-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATT--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGA-C-CCT-TA-CGGAACACCGTA
gi|103813                     :                                                                                                                                               gtaaTCG--C-G--------T-----TTT--CGCCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TTCGACT-T--TCA-------TC---------AT--CGT--A---G-----T----------T----------TCG-----AC---T----TTC---------AC--CATTGTG----T--G------TGT-GT----GTG-T---G---TGGGT--GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAT--------A-AAA----ATA---------C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103814                     :                                                                                                                                                                           gtaattCATTGC--G---TCA----TCTTAC-CAT--C-AC--CATCGTACCATCGCC-------------ATCGTGC---T------ATCG--G-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATT--G------C
gi|103816                     :                                                                                                                                                                         gtT--CATGATCGTA-G---TT-----TTGTAT-TTT--C-AC--CATCCT------GAT-------------TTCG-AC---T-------TTG----------------------------AC--CGT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTCATGATATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-GAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTActtcctgtaagacataggaaaaataataataatggaagac
gi|103817                     :                                                                                                                                      tgatttcaagtttTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T------ATT--------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------GC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-A-C-GA-TTG-T-CCA-AA-CGGCACACCTTA
gi|103818                     :                                                                                                                   tgattATCGC-GTTTTCAT--CATCAT-GCCATCG--CAG--------T-----T-T--CATCATCGT--A---CCA----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------A--------------------AC----------ATCG--T-G--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103819                     :                                                                                                                                                taatCG--T-G--------T-----C-T--CA--A-CGC--G---CCT----TTGCTC-CAT--C-AC--AATCTT------GCT-------------ATTGTAC---C------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--GAT--T---G-----T----------A----------CCA-----TC---G----T-----------AT--TGTCGCGTATTT--G------TGC-GT----ACC-T---G---T---G--G--------------------AC--------A-AAG-C-GAT--G---C-AAT-GA-TGG-C-ACT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103820                     :                                                                                                                            taattcTCAC--CATCGT-AGTTTCG--A-C--------T-----TTT--CACCATCGT--A---CTT----TCG-AC-TTTT-C-AC--CTTCGT------ACT-------------TTCGTTG---T------ATCG--A-C--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T-TCGTTGTTTC--GA-----CTT-GA----CCT-A---G---T---T--T--------------------AA--------A-AAA-T-G-TG-C---C-G-C-GA-TAG-C-CCCCAA-CGGAACACCGT
gi|103821                     :                                                                                                           tgatttcgaacttATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-AGCATCGCTC-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103823                     :                                                                                                                                                gatTCG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--T-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTG-----------ATTT--C-G--TCA-------TTGTAGTTTCGAC--TTT--C---A-----T----------------------CA-----TC---G----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------CG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------AA--------A-AAAAT-AAAA-A---T-A-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGAAACACCGTA
gi|103832                     :                                                                                                                                                attTCG--T-G--------T-----CAT--CA------T--G---TCA----TC-TGC-AAT--C-AA--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------TTTG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCGTC--G------
gi|103839                     :                                                                                                                         TCGT-GTCATCGT--CATGGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACTATCGT--G---TCA----TTGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GTT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC----------------------------------------CA-----TT---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-GA-CGGAACACCGTAt
gi|103840                     :                                                                                                                         TCGCAGTT-TCAT--CATCGT-ACCATCG--T-A--------T-----TTT--CACCATCGT--A---ACA----TCGTGT-TTT--C-AC--C---------------------------ATCGTAC---C------ATCA--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------G----------CCT-----TC---G----T-----------
gi|103841                     :                                                                                                                         TCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCG--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--A---CCA----TCGCGC-TTT--C-AC--CATTGT------ACC-------------ATCGTtgtt
gi|103842                     :                                                                                                                      TCGTTGT-TTCA-CGT----TCGT-ACCATCG--T-G--------T-----TTT--CACCATCGT--A---CCA----TCGCGT-TTT--C-AT--CATCGT------ACC-------------ATCGCGC---T------TTC
gi|103843                     :                                                                                                                                  TCAC--CATCGT-ACAATCG--TTG--------T-----T-T--CACGTTCGT--A---CCA----TCGTGT-TTT--C-AC--CA---------------------------TCGTAC---C------ATCG--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------
gi|103844                     :                                                                                                        tcgttgttTCGT-AACATCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCA--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--G---CCT----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------
gi|103846                     :                                                                                                  tcgtattttcaccaTCGT-GTCATTGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--------------------------------T--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCAT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-------------------------------------GT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GG-TGG-C-CCT-AA-TGGGACACCGTA
gi|103847                     :                                                                                                                                          TCGT-ACTTTCGACT-A--------T-----CA---CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCAT------ACTTTCGACTTTCATCATCGTAC---T------TTCGACT-T--TCA--------C---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103848                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--AATCGTA-----GTT-------------G-CG-AC---T------TT---------TCA-------TC---------AT--CGT--T---G-----T----------T----------TCG-----TT---G----TTTCGACTTTTCAC--TATCGTAGTTTC--GTTGTTTCGA-CT----ACT-T---TAATT---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTAagtttcg
gi|103849                     :                                                                                                                                                                   tcgtagtttcgacttcTCGT--G---GTT----TCG-ACATCT--C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGTTC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TT---GT---T-----------GT--T-TTGTTGCTTC--GA-----CTT-AA----GTT-T---AT--T---T--A--------------------AT--------A-AA----TATG-C---C-A-C-GG-TGG-T-CCC-AA-CGGATCACCGTA
gi|103863                     :                                                                                                                                                                                 CATCGT--G---TCA----TTGCAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATT--G------
gi|103864                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgt---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-AAACGGGACACCGTA
gi|103871                     : cgttgtttcgtctttcaaccaacgtagtttcgattttttaccatcgtagtttcgttgtttcgactttttatcatcgtagtttcgttatttcgttgtttcgactcgacttaatttaaaacttgaaatatgcCGC--TATCGC-ACTGTCA--T-A--------TT----CAT--CACTATTGT--A---TCA----TCGT----CT--T-GC--C---GT------GCC-------------ATCGCTCCTTT------GTCA--T-G--TCA-------CC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----CC---G----T-----------GC--TGTTGTACCATC--G------CAT-TTC---GCT-----G---T---T--G--------------------AC--------A-ACG-C-GATA-T---C-A-C-GA-TGA-C-CTC-AA-AGGAGCACCTTA
gi|103873                     :                                                                                                                              attgTCAT--CATCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT--A---CCA----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACA-------------ATCGTTG---T------TTCA--C-GT-TCG-------T----------AC--CAT--C---G-----T----------G----------T
gi|103876                     :                                                                                                                                                                                     tt--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------CCT-------------ATCGTGC----------------------CA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------TC--TATCGAAGCATC--G------t
gi|103878                     :                                                                                                                       tttgtctctcaTCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------
gi|103879                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TTA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCTAGGCATC--G------TGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTAgt
gi|103880                     :                                                                                                                                  TCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------
gi|103884                     :                                                                                                                                                                                      T--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATTGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GCCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TT---G-----------------------------------------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-ACG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-TTA-AA-CGGAACACCGTAgt
gi|103885                     :                                                                                                                                 tTCAT--CATCGT-ATTATCG--T-A--------T-----CAT--CACCATCGT--A---CTA----CCGTAG-TAT--C-AC--CCTCGT------ACC-------------ATCGCAC---C------GTCG--
gi|103887                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGT
gi|103888                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------Ggt
gi|103889                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103890                     :                                                                                                                                                                                   gtca--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCTC------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCA--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------CCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103892                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103893                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----ACGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103894                     :                                                                                                                                                                                   gtca--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATTAT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CAT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CAGAACACCGTA
gi|103895                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TTGAAC-CAT--C-AC--CATCAT------GCT-------------ATCATAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----C----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--A------TGT-AT----GCT-T---G---T---T--A--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAAAACTGTA
gi|103897                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------G----------GCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-TCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103900                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G----------------TC--------------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--A------CGT-GT----GAT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-
gi|103901                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCAT------GAT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------
gi|103902                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------C
gi|103903                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TGGTTC-TGT--C-GT---GTCGT--------C-------------GTCGTAC---T------AT------G--TCG-------TC---------AC--CAA--T---A-----T----------G----------GCA-----TC---G----T-----------AT--TGTCGTGGCAGT--G------TGT-GT----ACC-A---G---C---T--G--------------------AA--------A-AAG-C-GAAA-G---C-A-C-CG-GGG-C-CCT-AA-CGGAActtcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaacac
gi|103904                     :                                                                                                                TCGC-GTCATCG---TCATCGTGCCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GCGTCATCGT------
gi|103908                     :                                                                                                                                                                                                            ca--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTTGCATC--G------
gi|103909                     :                                                                                                                                                                                                              --C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--CTG-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCC-T---A---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-T-T------CGGAAGATCGTA
gi|103911                     :                                                                                                                                                                                                                 -AT--CGTCGT------GGT-------------TTCG-AC---T-------T---------TCA-------CC---------AT--CAT--T---G-----T----------T----------TCA-----AC---T----T-----------TCATCATCGTGGTTTCAAG------CATAGT----GGT-T-------T---G--G--------------------AG--------A-AAA-T-CATA-AAAAT-A-C-GA-TGG-T-CCA-AT-CTGAACACCGTA
gi|103914                     :                                                                                                                                                                                              CA----TCACAT-TTT--C-AC--AAACGT------AGT-------------TTCGTGA---T------TTCG--T-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GACTTTCA---------AC--TCTCGTGGTATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACTATA
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGC-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA


blockSeqs                     :                                                                                                                    A        A        GC      A       CT T GCATCGCT TTCGA A TT         AG      GACTT      TTT TT G          ACCATC T TTCGACTTTCATCA   TG     ATCACCATCGT    AC  ACGACTTT  GTAGTTTCG          ATA ACTTT TTCGACTTTCA            AGACTT  CTC TTTCGACTTTTC         A    G        TGTGTGTGTGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG                     CTTAATTTA    ATTA    AAAA  TG              CC
blockSeqs                     :                                                                                                                    A        .        .       T       AC T .        T     A TT         A       A          ATC T  G          T      C A                TA     TTCGACT        T   A         .                  TA  .     AGTTTCGACTT            GACTT   G   ACTTTAG              A    A        TAATTTCGTTGTTCCGACTTGACTTA                               TTTT         AATA    TGC   AA              T 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  A .        .     A .          A       A          CA  T  G          T      C A                TA     TTCGACT        T   A         .                  .   .     AGTT                   GACTT   .   ACTTTCA              A    A        TTGTTTCGACTACTTTAATTTA                                   CTG          AATA    TGC   A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  T .        .     A .          A       A          CA  T  .          T      C A                TA     TTCGAC         .   A         .                  .   .     GATT                   AAC     .   TTTC                 A    A        TAGTTTCGTTGTTTCGATTTG                                    C            GCG     TG    A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  T .        .     A .          A       A          CA  T  .          A      C A                TA     TTCGTT         .   A         .                  .   .     AGTT                   A       .   TTTC                 A    A        ACTTTCGTGGTTTGGGGTTC                                     C            GCG     G     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          CA  .  .          T      C A                TA     ATCGC          .   A         .                  .   .     AGT                    A       .   TTC                  A    G        TGTGTTATGGGGTTCAG                                        C            GCG     G     G               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          CA  .  .          .      C A                TA     GTCGT          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   TT                   A    G        CGGCTTGACTTAATCT                                         C            TAA     G     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          TA  .  .          .      C A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   TT                   A    G        ACTTAACTTAATTTA                                          C            GCG     A     G               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     A .          T       A          TA  .  .          .      A A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   T                    T    G        ACTTTGCTTACAATA                                          C            GCG     G     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     T .          A       A          CA  .  .          .      C T                TA     GTCGT          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   T                    A    G        ACTTAAGTTTATTTA                                          T            TAA     A     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          CA  .  .          .      C A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   T                    A    G        ACTTTAATTAATTT                                           C            GCG     G     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          TT  .  .          .      A A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   T                    T    G        ACTTTACTTAATTA                                           T            GTA     A     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     T .          A       A          CA  .  .          .      C T                TG     ATCGC          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   T                    A    G        ACTTGACCTAGTTT                                           G            GCG     A     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          CA  .  .          .      C A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   T                    A    G        CGTGTGCTTATTG                                            A            TAA     A     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                    .        .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          TT  .  .          .      C A                CG     ATCGT          .   A         .                  .   .     AG                     A       .   T                    A    G        CGTATGCTTGTTG                                            C            TAA     G     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                             .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          TA  .  .          .      A A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    T    A        CGTGTGCTTGTTG                                            G            TAA     A     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                             .        .       .       .  . .        .     A .          A       A          CA  .  .          .      A T                TT     ATGGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    T    G        CGTATACTTGTTG                                            T            GAA     A     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                             .        .       .       .  . .        .     T .          A       A          TA  .  .          .      G T                TG     GTCGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    T    A        CGTATGCTTGTTT                                            A            ACA     A     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                             .        .       .       .  . .        .     T .          A       A          TA  .  .          .      C T                TA     ATCGC          .   T         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G        CGTGTGCCTGTTG                                            C            GCA     T     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                             .        .       .       .  . .        .     T .          A       T          TT  .  .          .      G A                TA     TTCAC          .   G         .                  .   .     G                      A       .   T                    T    G        CGTGTGCCTGTTG                                            C            TAG     G     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                             .        .       .       .  . .        .     T .          .       A          TT  .  .          .      A T                TA     ATTGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    T    A        CGTATGCTTGTTG                                            G            TAA     A     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     T .          .       A          TT  .  .          .      G T                TA     TTTGT          .   A         .                  .   .     G                      T       .   T                    A    A        TGCGTACCTGTGG                                            G            GCG     A     G               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     A .          .       A          CA  .  .          .      C T                TA     TTCGC          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    A        CGTATGCTTGTTG                                            A            ATG     A     A               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      C A                TT     ATTTC          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G        CATTTCGCTGTTG                                            G            GCG     C     A               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      C A                TA     TTCGC          .   T         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G        TGTATGCTTGTTG                                            T            GCG     C     G               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     A .          .       T          TT  .  .          .      C A                TA     TTCGC          .   T         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    A        CGTGTGCCTGTTG                                            T            GCG     C     G               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     A .          .       T          TT  .  .          .      C A                TT     TTCGC          .   T         .                  .   .     G                      T       .   T                    T    A        CATATGCTTGTTG                                            T            GCA     C     G               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     T .          .       G          TT  .  .          .      C A                TG     TTCGA          .   T         .                  .   .     G                      G       .   T                    A    G        TGTATGCTTGTTA                                            T            GCA     C     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     T .          .       A          TT  .  .          .      C A                TA     TTCGA          .   T         .                  .   .     G                      G       .   T                    T    T        CGTATGCTTGTTG                                            T            GCG     A     G               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     A .          .       A          CA  .  .          .      C A                TT     ATCGG          .   T         .                  .   .     G                      T       .   T                    A    T        CGTGTGATTGTTG                                            T            GCG     G     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .       .       .  . .        .     T .          .       G          CA  .  .          .      G A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     A                      A       .   T                    A    T        TGTGTACCAGCTG                                            C            GCG     A     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       T          CA  .  .          .      C T                TG     ATCGT          .   T         .                  .   .     G                      G       .   T                    A    A        CGTGTGCCTATTG                                            T            GCG     A     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       A          CA  .  .          .      A A                TA     ATCGA          .   T         .                  .   .     A                      A       .   A                    T    G        CATAGTGGTTTGG                                            G            GCG     G     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          GT  .  .          .      G A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    T    G        CGCATGCTTGTTG                                            G            ATC     C     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       T          TT  .  .          .      T T                TA     ATTTC          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G        CCTTCCTGTTTG                                             C            TAA     A     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       T          TT  .  .          .      T T                CG     TTTGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G        CGGTTCAGGGAG                                             A            GCG     G     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       A          TT  .  .          .      G A                TA     ATCGT          .   T         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G        GTGTGCTTGTTG                                             A            AA      G     G               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       T          TT  .  .          .      G A                TG     ATCAC          .   A         .                  .   .     A                      A       .   T                    T    G        TGGTTTAGGGG                                              C            AA      C     A               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      C A                TA     ATCGC          .   T         .                  .   .     A                      T       .   T                    T    G        GGGCTCAGAA                                               C            AT      C     G               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       A          CT  .  .          .      G T                TT     ATCGC          .   A         .                  .   .     A                      A       .   T                    G    T        TGGTTTGGGG                                               T            A       T     A               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      C A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     T                      G       .   T                    A    A        TGGTTTGGGG                                               T            A       G     A               C 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      T A                CT     GTCAT          .   A         .                  .   .     A                      A       .   T                    T    A        TGGTTTGGCA                                               C            A       G     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       A          TT  .  .          .      C T                TT     TTCAC          .   A         .                  .   .     T                      A       .   T                    A    G        CGGTTTGGGG                                               C            T       G     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       A          TT  .  .          .      A T                TG     ATCGC          .   T         .                  .   .     A                      A       .   T                    A    G        GGTTCAGAA                                                C            T       G     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       T          TT  .  .          .      G A                TG     ATCGC          .   T         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    A        GGTTCAGAA                                                C            T       G     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     T .          .       A          TT  .  .          .      C T                TG     GCCGT          .   A         .                  .   .     T                      A       .   T                    A    T        GGGTTC                                                   C            T       G     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       T          CG  .  .          .      G A                TA     ATCAT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    G    A        GGGTTC                                                   C            A       G     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      C T                CA     ATCGT          .   A         .                  .   .     A                      A       .   T                    A    A        GGGTTC                                                   C            T       A     A               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          CA  .  .          .      A T                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     A                      A       .   T                    A    A        GGTTC                                                    A            T       G     G               A 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      A A                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G        GGTTC                                                    C            .       .     A               T 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          CA  .  .          .      C T                TA     ATCGT          .   G         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    A        GGTTC                                                    G            .       .     .               . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      C A                TA     ATCGC          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    A        TCG                                                      G                          .               . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      C T                TA     ATCGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G        .                                                        C                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      G A                TA     GTCGT          .   A         .                  .   .     T                      A       .   T                    A    G                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                              .       .  . .        .     A .          .       A          CA  .  .          .      C A                TA     ATCGC          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     A .          .       A          TT  .  .          .      T A                TA     GTCGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    G    A                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     . .          .       A          CA  .  .          .      C A                TA     TTCGT          .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     . .          .       A          TT  .  .          .      C A                TA     TTCG           .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    T                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     . .          .       A          AA  .  .          .      T A                TG     TTCG           .   A         .                  .   .     G                      A       .   T                    A    G                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     . .          .       A          TA  .  .          .      C G                A      TTG            .   A         .                  .   .     G                      .       .   T                    C    G                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     . .          .       A          TT  .  .          .      T A                A      ATT            .   A         .                  .   .     G                      .       .   T                    A    G                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     . .          .       A          TT  .  .          .      T A                T      TT             .   A         .                  .   .     G                      .       .   T                    .    G                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     . .          .       A          TT  .  .          .      C A                A      TT             .   A         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                      .  . .        .     . .          .       A          TT  .  .          .      C A                A      TT             .   A         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       A          TT  .  .          .      C A                A      TT             .   G         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       A          CA  .  .          .      C A                A      TT             .   A         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       A          TT  .  .          .      T A                T      AT             .   G         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       A          TT  .  .          .      C A                T      T              .   A         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       A          CA  .  .          .      T A                T      T              .   T         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       A          TT  .  .          .      C A                T      T              .   .         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       A          CA  .  .          .      C A                A      T              .   .         .                  .   .     G                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       .          CA  .  .          .      T A                A      T              .   .         .                  .   .     T                      .       .   .                    .    .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       .          CA  .  .          .      C A                A      T              .   .         .                  .   .     G                      .       .   .                    .                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       .          CA  .  .          .      C A                T      T              .   .         .                  .   .     .                      .       .   .                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                            .          .       .          CA  .  .          .      C A                A      .              .   .         .                  .   .     .                      .       .   .                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          TA  .  .          .      C A                T      .              .   .         .                  .   .     .                      .       .   .                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      T A                A      .              .   .         .                  .   .     .                      .       .   .                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      A G                T      .              .   .         .                  .   .     .                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      C A                A      .              .   .         .                  .   .                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      C A                A      .              .   .         .                  .   .                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      C T                A      .              .   .         .                  .   .                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      G T                A      .              .   .         .                  .   .                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      G .                A      .              .   .         .                  .   .                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      . .                T      .              .   .         .                  .   .                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      . .                A      .              .   .         .                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      . .                .                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      . .                .                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          CA  .  .          .      . .                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .       .          TG  .  .          .      . .                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .          CA  .  .          .        .                                                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               .          TT  .  .          .                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          C   .  .          .                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                              .  .          .                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                              .  .          .                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                 .          .                                                                                                                                                                                                                                                                      


blockSeqCons                  :                                                                                                                
originalCons                  :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
finalCons                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103831 ): TTCGTGGTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTAGACTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTCATCATCGTGGTTTCGAAACTACAATGGTGAAAGTCGAAAGTACGATGGT
Unaligned ( gi|103793 ): TCGTAGTTTCGCGGTTTCACCATCGTTGTTTCGACTTTTCACTATCGTAGTTTCGCGTTTTTACCATCGTAGTTTCGACTTTTTACCATCGTAGTTTCG
Unaligned ( gi|103815 ): GTCATTTCGAATTTTCACCATCGTATTTGCGATTTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTTCACCATTGTAGTTTGTTGTTTCGACTTTTTATCATCGTAGTTTCGTTATTTAGACTGGACTTCATTTAAAAAATATGCCGCGATGGCCCCAACGGGCCACCGTA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             11111111111111                                                                                                                  22222222222222222222222222222222222222222222222222222222              11111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                    5        1   0    11      1       11 3 22222222 22222 4 11         99 000  55555      111 22 1  00      333333 1 33333333333333   11 000 22222222222222 11  22222222  111111111  00   00 111 11111 888888888888888888888  666666  111 8888888888888888  00 3    1     00 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555555555 0  66666   66666 222 0  0   0 0  22  0            
lowQualScore                  :                                                                                                                    .        .   .    ..      .       .. . ........ ..... . ..         .. ...  .....      ... .. .  ..      ...... . ..............   .. ... .............. ..  ........  .........  ..   .. ... ..... .....................  ......  ... ................  .. .    .     .. ........................................................ ......... .  .....   ..... ... .  .   . .  ..  .            
lowQualScore                  :                                                                                                                    0        8   3    77      4       77 1 22222222 22222 3 44         11 888  33333      111 33 2  66      333333 2 00000000000000   77 888 77777777777777 66  22222222  999999999  77   66 555 22222 555555555555555555555  111111  444 1111111111111111  77 4    8     88 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888888888 7  77777   66666 111 8  8   8 8  88  8            
consensus                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
Reference ( family-193 )      :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CNT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-G-C-GA-TGG-C-CCN-AA-CGGAACACCGTA
gi|103747                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GTT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGC-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103748                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCT-T---A---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGGACACCGTA
gi|103749                     :                                                                                                                                                   TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------C
gi|103750                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------cttcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaaca
gi|103751                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103752                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103753                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----C----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CTT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103754                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCTTCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--
gi|103755                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CATCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G----------------TC--------------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATT--G------CGT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTA
gi|103756                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---TATCACCATCG--T-G--TCA-------TC---------GCGTCAT--C--------------------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTG
gi|103758                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTCGTGGTATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AC--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAt
gi|103759                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----ACT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-AGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103760                     :                                                                                                                                                   TCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------T---------------------------------TATCGTGGCATC--G------CCT--T----CCT-G---T---T---T--G--------------------AC--------A-
gi|103761                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGTT-------TCGACTT-TC---G----------------AC--TTTCGTGGTATG--G------GGT---------T-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AA----AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTAtgcacaaaaa
gi|103763                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCATAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--T--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACAACATA
gi|103764                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCATCG--C-T--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--TATCAC--CATC--G------TG
gi|103764                     :                                                                                                        tcgtgtttTCGT-GTCATCGT-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103766                     :                                                                                                    tcgtgttttcgtgccatcgctccatcaccaTCGT--CATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATGG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------AC--CATCAC--CATC--G------TG
gi|103767                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AT--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GAC--TTTAG-------AC--TTTTGTGGTAT---G----------GG----GCT-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AAA------A-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103768                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCATAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTTG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGT--------TTAGACTTTC---G----------------AC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-T-GA-TAG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103769                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGT--GGTTTCGACTTTCGT-C-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTTGTGT---T-------T---------TCA-------TC---------AT--CAT--A---G-----TTTCGACTTTCA----------TCA-----TC---A----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------AA--------A-AAA-TTAAAA-A---T-A-C-AA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103770                     :                                                                                                                           ttgtgatttcgacttTCGT-GTTATTG--C-A--------T-----CTT--CGTCATCGT--G---ACA----TCGCTC-CAT--T-AC--CATTGT------GCT-------------ATCGTAA---T------GTCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCGTGGTATT--G------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TTA-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103773                     :                                                                                                                                                                                                ----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTTGCGT---T------TTCG-------TCA-------TC---------AT--AGTTTC---GACTTTC----------A----------TCA-----TC---G----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------GG--------A-AAAAT-AAAA-A---T-A-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103774                     :                                                                                                                           tcgtgatttcgacttTCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATTGT------GAT-------------TTCG-AC---T-------T-------------------TC---------AC--CGT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTC--GACTTT-----------T-GT----GTTATGGGG---T---TCAG--------------------AT--------ATAA-----AAA-A---C-G-C-GA-TTG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103776                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGGAGG---T------TCGCAT-TTT--C-AT--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------G----------------------------------------GT--T-TCG-GGCATC--G------TG--------GTT-T---G---G---C--A--------------------AA--------A-AAG-T-AAAA-A---T-A-C-GA-TGA-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103777                     :                                                                                                                    tcgtggtttcggctttcgacttTCGT-GCCATCG--TTG--------T-----T-T--CATCATCGT--G---CCA----TCGTGT-TTT--C-AT--CATCGT------ACC-------------ATCGTAC---C------ATCG--C-G--CTT-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------A----------CCA-----TC---G----T----------------------GCATC--G------CG--GT----TCA-G---G---G---A--G--------------------AC--------A-AAA---AATG-T---T-A-CTTA-T-G-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103778                     :                                                                                                                                          TCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT--A---CCA----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACA-------------ATCGTTG---T------TTCA--C-GT-TCG-------T----------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TTT-----TC--------------------AC--CATCGT
gi|103779                     :                                                                                                                TCGT-AACATCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCA--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--G---CCT----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACC-------------ATCGT------------------T-G--TT--------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103781                     :                                                                                                                                          TCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103782                     :                                                                                                                                  TCGT--CATCGT-GC------------------------CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGCGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G---------------------------------------------T-----------GT--CATCGTACCATC--AC-----CATCGT----GCT-
gi|103782                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTatcgtg
gi|103783                     :                                                                                            tcgtcatcgtgccatcaccaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCAg
gi|103784                     :                                                                                                                                          TCGT-GTTATCGCTT-G--------T-------T--CGTCAACGT------TAA----TCGTTT-GTT--C-TC--CATCGT------GCT-------------ATCGTGC---T------ATTG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCCTGGCATC--G------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A------------CCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103785                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTCG--T-G--------T-----TAT--CATCATCGT--A---ATT----TTGTAT-TTC--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TTCG----------------------------AC--TTT--C---G---------------------------------------------------------AC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103786                     :                                                                                                                                          TCGT-GATTTTG--T-G--------T-----TTT--CATTATCGTA-G---TT-----TTGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------G
gi|103786                     :                                                                                                                                                                                                                                    T-------------ATCGTAG---T------TTTG--T-A--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------GATT-------TCAAC---TT---T----T-----------AC--TATCTTAGTTTC--GACTTT-CGT-G-----GTT-T---GGGGT---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---T-G-C-GA-TGG-T-CTA-AA-TGGAACACCGTAatttcaacttttactatcttagtttcgactttcgtggtttggggttcagaaataaaaaatgcgatggtctaaatggaacaccgta
gi|103787                     :                                                                                                                                                       tcgtgattttgtgttttcatT--CACCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--CGAC--TTTCA--------CC-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--T---G-----T----------AGTTTCGACTTTCA-----TCCTCG----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------TG--------GTT-TA--G---G---G--G--------------------AA--------A-AAA------------------AA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTA
gi|103788                     :                                                                                                                           tcgtgatttcgacttTCGT-GATTTCT--T-G--------T-----TTT--CATCATCATA-G---TT-----TCATAT-TTT--C-AC--CATCAT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------A-----------------------G----T-----------GG--TATGG-GGC-TC-----------------------------------------------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-A-T-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103789                     :                                                                                                                                          TCGTAGTTATCT--T-G--------TTTCGACATTTCACCATTGTT-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------CTT-----TC---G----A-----------CT--TATCAT--CATC--GTAGTTTCGT--T----GTT-TC--GAT-T---T--G--------------------ACTTAATTTAA-AAG-A-AATATGC--C-G-C-AATTGG-C-CC--AA-CGGGACACCGT
gi|103790                     :                                                                                                                                                                           T--CGCCATCGT--A-----G----TTGTAA-CTTTTC-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGT-----T------ATTT--C-GACTTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T---------------------------------------T-----------GT--T-TCGTTGTTTT--GA-----CTT-A-----ACT-T---AAT-T---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-A-C-GA-TTG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103791                     :                                                                                                                             tcgttgtttcgttgtttcgacttttcaccctcgtagtttcgactttT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCG-AC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T-TCGTTGTTTC--G------ACT-TT----AAT-T---AA--T---T--T--------------------AT--------G-AAT----ATG-C---C-A-C-GA-TGG-CACCC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103792                     :                                                                                        tcgttgtttcgttgtttcgactttTCGTAGTT-TCGC-GTTTTCAC--CATCGTTGTT-TTG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103794                     :                                                                                                                TCGTAGTT-TCGC-GTTTTCAC--CATCGT-TGTGTTC--C-T--------T-----TTT--CACCATCGTA-G---TT-----TCGCGT-TTT--C-AT--CATCGT------AGT-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--GTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------tgtgttc
gi|103798                     :                                                                                                                                                                                                                                   CC-------------ATCGTAG---T------TTCG--C-G--TTT-------TC---------AC--TAT--CTA-G-----T----------T----------TCG-----AC---T----TTTC--------AC--CATCGTTGTTTC--G------ACT-TT----ACT-T---AA--T---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-GA-CGGGACACCGTAtgtttcg
gi|103799                     :                                                                                                                                   tcgtagtttcgcgttttccctatctagtttctacttttcaT--CACCATCATA-G---TT-----TCGGAT-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTTG---T------TTCGA-C-T--TTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T---------TC--G------ACT-TT----GCT-T---A---CAA-T--A--------------------AT--------A-AA----TATG-C---C-G-C-GA-TGGCC-CCC-AA-CAGGACACCGT
gi|103800                     :                                                                                                                                          tcgtagtttcgttgtttcgttgtttcgacttgtT--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTT--CGAC--CGTTTT------ACC-------------ATCGTAG---T------TTCG--TTG--TTACGACTTTTC---------AC--CAT--CATAG-----T----------T----------TCG-----TT---G----TTTC--------GC--CTTTTCAGCATC--GTAATTTCGTTGTTCCGACT-T---GAC-T---T--A--------------------ATTTT-----A-AAA---AATATG---CTG-C-GA-TGG-C-CCC-AA-TGGGACACTGTA
gi|103801                     :                                                                                                                                                   tcgtaatttcgttgtttcgactttT--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGT-C---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GT---T-----------GT--T-TCGT--TATT--T------CG--------GCT-T---GAC-T---T--AATCT----------------AT--------A-AAA-T--ATG-C---C-G-C-GG-TGG-C-TTC-AA-CGGGACACCGTA
gi|103802                     :                                                                                                                                                                  tcatagtttcgttgattcgacttt---TCA----TCGTAG-CGT--CGAC--TTTC-C------GCC-------------ATCGTAG---T------TTCG--A-C--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------A----------TTT-----TC---G----T-----------
gi|103810                     :                                                                                                                                tcgtagtttcgacatttcaTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATAGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--T-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T-----------------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------AGTT-------TCGACTT-TC---G----------------AC--TTTTGTGGTATG--G------GGT---------T-C---A---G---A--A--------------------AT--------A-AA-----AAA-A---C-G-C-AA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACCGTA
gi|103811                     :                                                                                                                           catgattTCAC--CATCGT-AGTATCG----G--------------CATTTCACCATCGT--A---GTA----TCG-ACTTTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTTG---T------TTCG--A-C--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TCG--G----T-----------GT--T-TCGT--TATT-------------------------------T---C--G--------------------ACTG------A-AAA-C-AATATGC--C-G-C-GA-TGG-T-CCC-AC-AGGGACACCGTA
gi|103812                     :                                                                                                                                  cgttgtttcgactttTATCG--C-G--------T-----CAT--TGTCATTGT--G---CTG----TCGTGG-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TTA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATT--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGA-C-CCT-TA-CGGAACACCGTA
gi|103813                     :                                                                                                                                               gtaaTCG--C-G--------T-----TTT--CGCCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCGT------AGT-------------TTCG-AC---T------TTCGACT-T--TCA-------TC---------AT--CGT--A---G-----T----------T----------TCG-----AC---T----TTC---------AC--CATTGTG----T--G------TGT-GT----GTG-T---G---TGGGT--GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAT--------A-AAA----ATA---------C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGGAACACTGTA
gi|103814                     :                                                                                                                                                                           gtaattCATTGC--G---TCA----TCTTAC-CAT--C-AC--CATCGTACCATCGCC-------------ATCGTGC---T------ATCG--G-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCATGGCATT--G------C
gi|103816                     :                                                                                                                                                                         gtT--CATGATCGTA-G---TT-----TTGTAT-TTT--C-AC--CATCCT------GAT-------------TTCG-AC---T-------TTG----------------------------AC--CGT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------AC--TTTCATGATATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-GAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACCGTActtcctgtaagacataggaaaaataataataatggaagac
gi|103817                     :                                                                                                                                      tgatttcaagtttTCG--T-G--------T-----TTT--CATCATCGTA-G---TT-----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------GAT-------------TTCG-AC---T------ATT--------T---------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---G----------------GC--TTTCGTGGTAT---G------GG----------------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-A-C-GA-TTG-T-CCA-AA-CGGCACACCTTA
gi|103818                     :                                                                                                                   tgattATCGC-GTTTTCAT--CATCAT-GCCATCG--CAG--------T-----T-T--CATCATCGT--A---CCA----TCGTAT-TTT--C-AC--CATCGT------A--------------------AC----------ATCG--T-G--TTT-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103819                     :                                                                                                                                                taatCG--T-G--------T-----C-T--CA--A-CGC--G---CCT----TTGCTC-CAT--C-AC--AATCTT------GCT-------------ATTGTAC---C------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--GAT--T---G-----T----------A----------CCA-----TC---G----T-----------AT--TGTCGCGTATTT--G------TGC-GT----ACC-T---G---T---G--G--------------------AC--------A-AAG-C-GAT--G---C-AAT-GA-TGG-C-ACT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103820                     :                                                                                                                            taattcTCAC--CATCGT-AGTTTCG--A-C--------T-----TTT--CACCATCGT--A---CTT----TCG-AC-TTTT-C-AC--CTTCGT------ACT-------------TTCGTTG---T------ATCG--A-C--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------A----------------------------------------GT--T-TCGTTGTTTC--GA-----CTT-GA----CCT-A---G---T---T--T--------------------AA--------A-AAA-T-G-TG-C---C-G-C-GA-TAG-C-CCCCAA-CGGAACACCGT
gi|103821                     :                                                                                                           tgatttcgaacttATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-AGCATCGCTC-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCA
gi|103823                     :                                                                                                                                                gatTCG--C-G--------T-----TTT--CACCATCGT--G---GTT----TCG-AC-TTT--T-AC--CATCGT------AGT-------------TTCGTG-----------ATTT--C-G--TCA-------TTGTAGTTTCGAC--TTT--C---A-----T----------------------CA-----TC---G----T-----------GG--TTTCG-AGCATC--G------CG--------GTT-T---G---G---G--G--------------------AA--------A-AAAAT-AAAA-A---T-A-C-GA-TGG-T-CCA-AA-CGAAACACCGTA
gi|103832                     :                                                                                                                                                attTCG--T-G--------T-----CAT--CA------T--G---TCA----TC-TGC-AAT--C-AA--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------TTTG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCGTC--G------
gi|103839                     :                                                                                                                         TCGT-GTCATCGT--CATGGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACTATCGT--G---TCA----TTGTAC-TAT--C-AC--CATCGT------GTT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC----------------------------------------CA-----TT---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-GA-CGGAACACCGTAt
gi|103840                     :                                                                                                                         TCGCAGTT-TCAT--CATCGT-ACCATCG--T-A--------T-----TTT--CACCATCGT--A---ACA----TCGTGT-TTT--C-AC--C---------------------------ATCGTAC---C------ATCA--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------G----------CCT-----TC---G----T-----------
gi|103841                     :                                                                                                                         TCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCG--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--A---CCA----TCGCGC-TTT--C-AC--CATTGT------ACC-------------ATCGTtgtt
gi|103842                     :                                                                                                                      TCGTTGT-TTCA-CGT----TCGT-ACCATCG--T-G--------T-----TTT--CACCATCGT--A---CCA----TCGCGT-TTT--C-AT--CATCGT------ACC-------------ATCGCGC---T------TTC
gi|103843                     :                                                                                                                                  TCAC--CATCGT-ACAATCG--TTG--------T-----T-T--CACGTTCGT--A---CCA----TCGTGT-TTT--C-AC--CA---------------------------TCGTAC---C------ATCG--C-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----T----------
gi|103844                     :                                                                                                        tcgttgttTCGT-AACATCGT-GTTTTCAC--CATCGT-ACCATCA--C-G--------T-----TTT--CATCATCGT--G---CCT----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------
gi|103846                     :                                                                                                  tcgtattttcaccaTCGT-GTCATTGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--------------------------------T--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCAT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-------------------------------------GT-GT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GG-TGG-C-CCT-AA-TGGGACACCGTA
gi|103847                     :                                                                                                                                          TCGT-ACTTTCGACT-A--------T-----CA---CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTT--C-AC--CATCAT------ACTTTCGACTTTCATCATCGTAC---T------TTCGACT-T--TCA--------C---------AC--CAT--C---G-----T----------
gi|103848                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGTA-G---TT-----TCG-AC-TTTT-C-AC--AATCGTA-----GTT-------------G-CG-AC---T------TT---------TCA-------TC---------AT--CGT--T---G-----T----------T----------TCG-----TT---G----TTTCGACTTTTCAC--TATCGTAGTTTC--GTTGTTTCGA-CT----ACT-T---TAATT---T--A--------------------AT--------A-AAT----ATG-C---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-AA-CGGGACACCGTAagtttcg
gi|103849                     :                                                                                                                                                                   tcgtagtttcgacttcTCGT--G---GTT----TCG-ACATCT--C-AC--CATCGTT-----GTT--------------TCGTTC---T------TT-------------------TC---------AC--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TT---GT---T-----------GT--T-TTGTTGCTTC--GA-----CTT-AA----GTT-T---AT--T---T--A--------------------AT--------A-AA----TATG-C---C-A-C-GG-TGG-T-CCC-AA-CGGATCACCGTA
gi|103863                     :                                                                                                                                                                                 CATCGT--G---TCA----TTGCAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATT--G------
gi|103864                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cgt---C-G-C-GA-TGG-C-CCC-AAACGGGACACCGTA
gi|103871                     : cgttgtttcgtctttcaaccaacgtagtttcgattttttaccatcgtagtttcgttgtttcgactttttatcatcgtagtttcgttatttcgttgtttcgactcgacttaatttaaaacttgaaatatgcCGC--TATCGC-ACTGTCA--T-A--------TT----CAT--CACTATTGT--A---TCA----TCGT----CT--T-GC--C---GT------GCC-------------ATCGCTCCTTT------GTCA--T-G--TCA-------CC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----CC---G----T-----------GC--TGTTGTACCATC--G------CAT-TTC---GCT-----G---T---T--G--------------------AC--------A-ACG-C-GATA-T---C-A-C-GA-TGA-C-CTC-AA-AGGAGCACCTTA
gi|103873                     :                                                                                                                              attgTCAT--CATCGT-GCCTTCG--TTG--------T-----T-T--CACCATCGT--A---CCA----TCGTTG-TTT--C-AC--CATCGT------ACA-------------ATCGTTG---T------TTCA--C-GT-TCG-------T----------AC--CAT--C---G-----T----------G----------T
gi|103876                     :                                                                                                                                                                                     tt--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------CCT-------------ATCGTGC----------------------CA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------TC--TATCGAAGCATC--G------t
gi|103878                     :                                                                                                                       tttgtctctcaTCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------
gi|103879                     :                                                                                                                                                                           T--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GT--CATCGT------GCT-------------ATCGT--------------------G--TTA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCTAGGCATC--G------TGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-TGGAACACCGTAgt
gi|103880                     :                                                                                                                                  TCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTGT---C------ATCG--C-G--TCA-------TC---------
gi|103884                     :                                                                                                                                                                                      T--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATTGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GCCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TT---G-----------------------------------------CGT-GT----GCC-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-ACG-C-AATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-TTA-AA-CGGAACACCGTAgt
gi|103885                     :                                                                                                                                 tTCAT--CATCGT-ATTATCG--T-A--------T-----CAT--CACCATCGT--A---CTA----CCGTAG-TAT--C-AC--CCTCGT------ACC-------------ATCGCAC---C------GTCG--
gi|103887                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGT
gi|103888                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCTATCG--T-G--------T-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------Ggt
gi|103889                     :                                                                                                            gtcaTCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATTGT--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103890                     :                                                                                                                                                                                   gtca--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCTC------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCA--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------CCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103892                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------
gi|103893                     :                                                                                                                TCGT-GTCATCGC-GTCATCGT--CATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----ACGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G
gi|103894                     :                                                                                                                                                                                   gtca--G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATTAT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--T---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CAT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CAGAACACCGTA
gi|103895                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TTGAAC-CAT--C-AC--CATCAT------GCT-------------ATCATAC---T------ATCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----C----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--A------TGT-AT----GCT-T---G---T---T--A--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAAAACTGTA
gi|103897                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GTC-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------G----------GCATC--G------CGT-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-TCT-AA-CGGAACACCGTA
gi|103900                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------G----------------TC--------------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--A------CGT-GT----GAT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-
gi|103901                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCAT------GAT-------------ATCGTAC---T------ATCG--T-G--CCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------
gi|103902                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TCGTAC-CAT--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTAGCATC--G------C
gi|103903                     :                                                                                                                                                                                       --G---TCA----TGGTTC-TGT--C-GT---GTCGT--------C-------------GTCGTAC---T------AT------G--TCG-------TC---------AC--CAA--T---A-----T----------G----------GCA-----TC---G----T-----------AT--TGTCGTGGCAGT--G------TGT-GT----ACC-A---G---C---T--G--------------------AA--------A-AAG-C-GAAA-G---C-A-C-CG-GGG-C-CCT-AA-CGGAActtcctgtaagacatgcgaaaaataataataatggaacac
gi|103904                     :                                                                                                                TCGC-GTCATCG---TCATCGTGCCATCGT-GCCATCG--T-G--------C-----CAT--CACCATCGT--G---TCA----TCGTGT-CAT--C-GCGTCATCGT------
gi|103908                     :                                                                                                                                                                                                            ca--C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------ATCG--C-G--TCA-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTTGCATC--G------
gi|103909                     :                                                                                                                                                                                                              --C-AC--CATCGT------GCT-------------ATCGTAC---T------GTCG--T-G--CTG-------TC---------AC--CAT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GT--TATCGTGGCATC--G------CGT-GT----GCC-T---A---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-T-T------CGGAAGATCGTA
gi|103911                     :                                                                                                                                                                                                                 -AT--CGTCGT------GGT-------------TTCG-AC---T-------T---------TCA-------CC---------AT--CAT--T---G-----T----------T----------TCA-----AC---T----T-----------TCATCATCGTGGTTTCAAG------CATAGT----GGT-T-------T---G--G--------------------AG--------A-AAA-T-CATA-AAAAT-A-C-GA-TGG-T-CCA-AT-CTGAACACCGTA
gi|103914                     :                                                                                                                                                                                              CA----TCACAT-TTT--C-AC--AAACGT------AGT-------------TTCGTGA---T------TTCG--T-G--TTT-------TC---------AT--CAT--C---G-----TA---------G----------TT------TC---GACTTTCA---------AC--TCTCGTGGTATG--G----------------G-------G---T---T--C--------------------AG--------A-AAT-A-AAAA-A---C-G-C-GA-TGG-T-CCA-AA-TGGAACACTATA
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT--C---G-----T----------G----------TCA-----TC---G----T-----------GC--TATCGTGGCATC--G------CGC-AT----GCT-T---G---T---T--G--------------------AC--------A-AAG-C-GATA-G---C-A-C-GA-TGG-C-CCT-AA-CGGAACACCGTA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103831 ): TTCGTGGTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTAGACTTTCGACTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTCATCATCGTGGTTTCGAAACTACAATGGTGAAAGTCGAAAGTACGATGGT
Unaligned ( gi|103793 ): TCGTAGTTTCGCGGTTTCACCATCGTTGTTTCGACTTTTCACTATCGTAGTTTCGCGTTTTTACCATCGTAGTTTCGACTTTTTACCATCGTAGTTTCG
Unaligned ( gi|103815 ): GTCATTTCGAATTTTCACCATCGTATTTGCGATTTTTCACCATCGTAGTTTCGACTTTTCACCATTGTAGTTTGTTGTTTCGACTTTTTATCATCGTAGTTTCGTTATTTAGACTGGACTTCATTTAAAAAATATGCCGCGATGGCCCCAACGGGCCACCGTA