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Reference ( gi|3086 )         :         ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATT----AG--TT----ACGGCCCT-TCCC
gi|2999                       :         ACATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GA---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATT----AG--TT----ACGGCCCT-TCCC
gi|2998                       :     tttaACATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--AAAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATT----AG--TT----ACGGCCCT-TCCC
gi|3074                       :     tttaATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-AA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGACCACAAGTTCTACCAACATT----AG--TT----ACGGCCCT-TCCC
gi|3073                       :        tATATAT-AT-ATAT---ACAT-------G-------T--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATT----AG--TT----ACGGCCCT-TTCC
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gi|3145                       :                    TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GT---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTGCCAACATA----AG--
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gi|3175                       :      tttaaacatattttattgccaTAT-------T-------T--ACAT--ATA-----A-A-CA--AG-A---GG---------G--T-TCGGCCACAAGATCTGCCAACATT----AG--TT----ACGGCCCCGTCCC
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gi|3168                       :              tttattgctttttTAT-------A-------T--CTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTAATAACATT----AG--TT----ACAGCTTT-CCCC
gi|3167                       :                           TAT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTGACAACATT----AG--CA----ACAGCCCT-CCCC
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gi|3077                       :     tttaaacatatttaatgcttttTAT-------A-------T--ACAT--GTAGTA--A---CA--AA-A---GG---------A--T-TGCGCCACAAGTTAT-CCAACATT----AA--AA----TCGGCTCT-TCCC
gi|3036                       :            tatgtattgctttttTAT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GT---------G--T-TGGGCGACAAGTTAT-CCACCATTAA--AA--TT------GGCTCT-TCCC
gi|3034                       :              tttattgctttttTGT-------A-------T--ACGT--GAA-AA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGATAT-CCATCATT----AG--AA----CCGGCACT-TCCC
gi|3131                       :             tttattgcttttttTAT-------A-------T-----T--ACA-TA--A----A--AT-G---GG---------G--T-TTGACCACAAGTTCTGCTAACATT----AG--AT----TCGGTCCT-TCCC
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gi|3172                       :   tttaaacatattttattgctttttcAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-AA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACATGTTCTACC-ACATT----
gi|3017                       :                            AT-------A-------T--ACAT--GTG-GT--A-G-CA--AA-A---CG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATT----AA--AA----TCGGCCCT-TCCC
gi|3002                       :               tttattgctttttcT-------A-------C--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---TG---------G--T-TGGGTCACAATTTCTACCAACATT----AG--TT----ACGGCCCT-TCCC
gi|3101                       :     tttaaacatattttattgctttgtT-------A-------T--ACAC--ATG-TAGTA-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATT----AA--AA----TCGGCCCT-TCC
gi|3176                       :             atattttattgcttttT-------A-------T--AACT--ATA-TAT-A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCAAACGTTCTGCCAACATT----AG--TT----ATGGCC
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gi|3027                       :               tttattgtttttaaa-------A-------T--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---TG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACA
gi|3179                       :           ttaatttattttctctccc-------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCAACAAGTTCTCTCAACATT----AG--AT----ACGGCCAT-TCCC
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gi|3005                       :                        tttaaacatattttatcgcataattcAT--ATA-TAC-A-G-AA--AC-G---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTCCAACATT----AG--AT----TCGGCCCT-CCCC
gi|3015                       :                          tttaaacatattttatttcttttaAT--ATA-TAC-A-G-AA--AT-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTCCAACATT----AGA-TT----A--GACCT-CCCC
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gi|3093                       :                                     atttaaacatatttT--ATA-TA--T-G-TG--AA-A---TG---------GAAT-CAGGCCATAAGTTCTGACAACATT----AGAATT------GGCCTT-TCCC
gi|3185                       :                           atgtatttttgtttcatataatttt--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---AG---------G--T--GGACCACAAGTTTTGCCAACATT----AG--AT----ATGGTCCA-TCC
gi|3191                       :                                                           A--G-G-CA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATT----TG--AT----TCGGCCAT-TCCC
gi|3018                       :                                                            --A-G-CA--AA-C---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTAGCAACATT----AG--TT----ACGGCCCT-CCCC
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consensus                     :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTNCCAACATTA--GA-T-----NCGGCCCT-TCCC
Reference ( family-171 )      :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTNCCAACATTA--GA-T-----NCGGCCCT-TCCC
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gi|3030                       :                                                                             ttaatttattttctctcccA--AA-T---GGA--------G--T-CGGGCCACAAGTTCTGCCAACATAA--GA-T-----TCGGCCCT-TCC
gi|3031                       :    tttaaacatattttatttcaattttaatatcatgACATAT-GT--TAT----TGT-------A-------T--A-ATTCACA-TT--A-G-CA--AA-C---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTAGCAACATCA--GT-C-----AAGGCCCT-CCCC
gi|3032                       :                                                                                           tttaaA--AA-G---GG---------G--T-AGGGCCACAAGTTCTTCCAAC-TTA--GA-T-----TCGGCCCT-CCCC
gi|3033                       :                                                           tttaaacatattttatttcagatattttga--A-G-CA--AA-C---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTAGCAACATAA--GT-T-----ATGGCCCT-CCCC
gi|3034                       :                          tttaaacatattttattgcataattcacatTGT-------A-------T--ACGT--GAA-AA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGATAT-CCATCATTA--GA-A-----CCGGCACT-TCCC
gi|3035                       :                                                             tttattgctttttt--ACAT--A-A-TA--A-G-CA--AA-C---GT---------G--T-TAGGCCACAAGTTCTAGCAACATTA--GA-A-----ATGGCCCT-CCCC
gi|3036                       :                              tttaaacatattttatcgcataattcTAT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GT---------G--T-TGGGCGACAAGTTAT-CCACCATTA--AA-A-----TTGGCTCT-TCCC
gi|3037                       :                              tttattgctttttT-AT-ATAC---ATAA-------A-------T--A-AT--ATA-CA--G----A--AA-T---GG---------G--G-TGGGCCACAAGTTCTTCCAACATGA--GA-T-----TCCCCCCA-CCCC
gi|3038                       :                                  tttatttcttttT-GTAT---ATCT---------------T--ACAA--AT--TA----G-CA--AA-A---AG---------G--AACGGGCCACAAATTCTATCAACATTA--AG-T-----AAGGCCCT-TCC
gi|3039                       :                                                                                     tttaaacatttttattgc---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAAC-TTA--GA-T-----TCGGCCCT-CCCC
gi|3040                       :                                                                     tttaaacatattttatttcaaatattttgaaatg---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3073                       :        tttaaacatattttatttcaacatgaaatgATATAT-AT-ATAT---ACAT-------G-------T--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TTCC
gi|3074                       :                                     tATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-AA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGACCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3075                       :                                     tATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--G-G-AA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAAC-TCA--TA-T-----CTGGC
gi|3076                       :                                      tTATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------A--GCAT--AGA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTCCG-TCCC
gi|3077                       :                                                        TAT-------A-------T--ACAT--GTAGTA--A---CA--AA-A---GG---------A--T-TGCGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCTCT-TCCC
gi|3078                       :                        tatgtattgctttttTATAT-ATCATGC---ATATGAGTCAAA-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3080                       :                                      ATATATCAT-GCAC---ATATTTCAA--A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCTC
gi|3081                       :                                      tTGTAT-AT--TAT---AAGTCAA----A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-TTGGCCACAAGTTCTCTCAATATTC--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3086                       :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3087                       :                                           T-AT--TAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGAACCACAAGTTCTATCAACATTACTGAGTTCGTGACGGCCCT-TCCC
gi|3088                       :                              acatatttACATAT-TT--TAT---TTCT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--C-G-GA--AACG---GG---------G--T-TGGGTCAAAAGTTCTTCCAACATTA--GA-T-----TCGGCCCT-
gi|3090                       :                                      ATATTT--T-ATTT---CTAT-------A-------T--ACAT--GTA-TA--ATA-TA--AA-AATTGG---------G--T-TGGGTCACAAGGTCTTCCAACATTA--AA-C-----TCGGCCCTGTCC
gi|3091                       :                                         acT-AT-ATACC--ATGC-------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CCGACCACAAGTTCTT-CAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3092                       :                              atataatttgtttT-AT-TTCT---ATTT-------A-------T--A-----ATA-TA--G-------AA-ATT-GG---------G--T-TGGGCCACAAGGTCTTCAAACATTA--AA-T-----TTGGCCCT-CTCC
gi|3093                       :                                                                        acatatttT--ATA-TA--T-G-TG--AA-A---TG---------GAAT-CAGGCCATAAGTTCTGACAACATTA--GA-A-----TTGGCCTT-TCCC
gi|3100                       :             atgtatttttgtttcatataattttATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GA-T-----TCGGCC
gi|3101                       :                                                          T-------A-------T--ACAC--ATG-TAGTA-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCC
gi|3102                       :                      atattttattgcttttATATTT-ATCATGTC--AAAT-------A-------T--A-AT--TTA--A--G-G-CA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGACCAT-TCCC
gi|3103                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTGTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3104                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-TTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--AA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3105                       :                                                                                                A--AA-C---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTAGCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-CCCC
gi|3106                       :           atatttttattgcataattcaattggaATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-ATGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3107                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGTCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3108                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCAGCCAT-TCCC
gi|3109                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TTCC
gi|3120                       :                                           T-AT-TTAT---ACAC-------A-------T--TCAT--GTA-TAC-A-G-AA--AT-G---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTCCAACATTA--GA-T-----TCGACCCT-CCCC
gi|3121                       :                                                    tatttcT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GG---------A--T-TGGGCCACACATTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGACCT-TCCC
gi|3122                       :                                      tattgctttttcgT---ATTT-------A-------T--A-AT--ATG-TA--A-------AT-T---GG---------G--T-TTGGCCACAAATTCTTCCAACATTA--AA-T-----TCGGCCCT-CTCC
gi|3124                       :                                                   atttcTAT-------T-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GC---------G--C-TGGGTCACAAGTTAT-CCAACGTTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCCC
gi|3129                       :                                                                       tttt--ACAT--A-A-TA--A-G-CA--AA-C---GT---------G--T-TGAGCCACAAGTTTTAGCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3131                       :                                        ttttattgcataattcTAT-------A-------T-----T--ACA-TA--A----A--AT-G---GG---------G--T-TTGACCACAAGTTCTGCTAACATTA--GA-T-----TCGGTCCT-TCCC
gi|3132                       :                                                                                             tttatttcat---GG---------G--T-TGGGTCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3136                       :              tttagtttagacatattttatttcaacatgaaatgTAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3137                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGACCCG-TCCC
gi|3138                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGAGCCACAAGTTTTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCG-TCCC
gi|3139                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGTCACAAGTTCTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCC
gi|3140                       :                                              T-ATAT---ATAT-------A-------A--GCAT--AGA-TA--A-G-CA--GG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTC
gi|3143                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--GTA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGTCCACAAGTTCTGCCAACATTA--GT-G-----ACGGCC
gi|3144                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCAACATT
gi|3145                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GT---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTGCCAACATAA--GA-
gi|3152                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TGCC
gi|3154                       :                                                                          attcaaT--ATT-TA--A-A-CATGAA-ATG-GG---------G--T-TGGGCCACACGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3164                       :                                atttaaacatatttT-ATAT---AGAT-------A-------A--GCAA--AGA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTCCG-TCCC
gi|3165                       :                                              T-ATAT---ATAG-------A-------A--ACAT--AGA-TA--C-G-TA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATTATTA--GT-T-----ACGGTCCT-TCCC
gi|3166                       :                                                        TAT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTAACAACATTA--GC-A-----ACAGCCCT-CCCC
gi|3167                       :                                                        TAT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTGACAACATTA--GC-A-----ACAGCCCT-CCCC
gi|3168                       :                                                        TAT-------A-------T--CTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTAATAACATTA--GT-T-----ACAGCTTT-CCCC
gi|3171                       :                                                         AC-------A-------T--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AC-A---GG---------G--T-TAAACCACAAGTTCTGTCAATATTA--GG-T-----ACGGCTCT-TCCC
gi|3172                       :                                                         AT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-AA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACATGTTCTACC-ACATT
gi|3175                       :                                                        TAT-------T-------T--ACAT--ATA-----A-A-CA--AG-A---GG---------G--T-TCGGCCACAAGATCTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCCGTCCC
gi|3176                       :                                                          T-------A-------T--AACT--ATA-TAT-A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCAAACGTTCTGCCAACATTA--GT-T-----ATGGCC
gi|3177                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3178                       :                                                           -------A-------T--ACAT--TT--TA--A-GGCA--AA-A---AG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAATATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3179                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCAACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3185                       :                                                                                 --ATA-TA--A-G-CA--AG-A---AG---------G--T--GGACCACAAGTTTTGCCAACATTA--GA-T-----ATGGTCCA-TCC
gi|3191                       :                                                                                        A--G-G-CA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTT--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3195                       :                                                                                         --A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCAT-TCCC
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gi|3201                       :                                                                                                       ---GG---------G--T-TGGGCCACAATTTCAGCCAACATTA--GA-T-----TTGGCCCT-TCCC
gi|3203                       :                                                                                                           G---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC





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lowQualScore                  :                                            1  11   111    1111111 9999999 77   555   5  44 8 4  66  4 555  000000000 66 4               7         66 88 111111       9    
consensus                     :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTNCCAACATTA--GA-T-----NCGGCCCT-TCCC
Reference ( family-171 )      :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTNCCAACATTA--GA-T-----NCGGCCCT-TCCC
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gi|2998                       :                                  tttaACATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--AAAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
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gi|3036                       :                              tttaaacatattttatcgcataattcTAT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GT---------G--T-TGGGCGACAAGTTAT-CCACCATTA--AA-A-----TTGGCTCT-TCCC
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gi|3038                       :                                  tttatttcttttT-GTAT---ATCT---------------T--ACAA--AT--TA----G-CA--AA-A---AG---------G--AACGGGCCACAAATTCTATCAACATTA--AG-T-----AAGGCCCT-TCC
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gi|3074                       :                                     tATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-AA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGACCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3075                       :                                     tATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--G-G-AA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAAC-TCA--TA-T-----CTGGC
gi|3076                       :                                      tTATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------A--GCAT--AGA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTCCG-TCCC
gi|3077                       :                                                        TAT-------A-------T--ACAT--GTAGTA--A---CA--AA-A---GG---------A--T-TGCGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCTCT-TCCC
gi|3078                       :                        tatgtattgctttttTATAT-ATCATGC---ATATGAGTCAAA-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3080                       :                                      ATATATCAT-GCAC---ATATTTCAA--A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCTC
gi|3081                       :                                      tTGTAT-AT--TAT---AAGTCAA----A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-TTGGCCACAAGTTCTCTCAATATTC--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3086                       :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3087                       :                                           T-AT--TAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGAACCACAAGTTCTATCAACATTACTGAGTTCGTGACGGCCCT-TCCC
gi|3088                       :                              acatatttACATAT-TT--TAT---TTCT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--C-G-GA--AACG---GG---------G--T-TGGGTCAAAAGTTCTTCCAACATTA--GA-T-----TCGGCCCT-
gi|3090                       :                                      ATATTT--T-ATTT---CTAT-------A-------T--ACAT--GTA-TA--ATA-TA--AA-AATTGG---------G--T-TGGGTCACAAGGTCTTCCAACATTA--AA-C-----TCGGCCCTGTCC
gi|3091                       :                                         acT-AT-ATACC--ATGC-------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CCGACCACAAGTTCTT-CAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3092                       :                              atataatttgtttT-AT-TTCT---ATTT-------A-------T--A-----ATA-TA--G-------AA-ATT-GG---------G--T-TGGGCCACAAGGTCTTCAAACATTA--AA-T-----TTGGCCCT-CTCC
gi|3093                       :                                                                        acatatttT--ATA-TA--T-G-TG--AA-A---TG---------GAAT-CAGGCCATAAGTTCTGACAACATTA--GA-A-----TTGGCCTT-TCCC
gi|3100                       :             atgtatttttgtttcatataattttATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GA-T-----TCGGCC
gi|3101                       :                                                          T-------A-------T--ACAC--ATG-TAGTA-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCC
gi|3102                       :                      atattttattgcttttATATTT-ATCATGTC--AAAT-------A-------T--A-AT--TTA--A--G-G-CA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGACCAT-TCCC
gi|3103                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTGTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3104                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-TTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--AA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3105                       :                                                                                                A--AA-C---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTAGCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-CCCC
gi|3106                       :           atatttttattgcataattcaattggaATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-ATGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3107                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGTCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3108                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCAGCCAT-TCCC
gi|3109                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TTCC
gi|3120                       :                                           T-AT-TTAT---ACAC-------A-------T--TCAT--GTA-TAC-A-G-AA--AT-G---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTCCAACATTA--GA-T-----TCGACCCT-CCCC
gi|3121                       :                                                    tatttcT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GG---------A--T-TGGGCCACACATTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGACCT-TCCC
gi|3122                       :                                      tattgctttttcgT---ATTT-------A-------T--A-AT--ATG-TA--A-------AT-T---GG---------G--T-TTGGCCACAAATTCTTCCAACATTA--AA-T-----TCGGCCCT-CTCC
gi|3124                       :                                                   atttcTAT-------T-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GC---------G--C-TGGGTCACAAGTTAT-CCAACGTTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCCC
gi|3129                       :                                                                       tttt--ACAT--A-A-TA--A-G-CA--AA-C---GT---------G--T-TGAGCCACAAGTTTTAGCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3131                       :                                        ttttattgcataattcTAT-------A-------T-----T--ACA-TA--A----A--AT-G---GG---------G--T-TTGACCACAAGTTCTGCTAACATTA--GA-T-----TCGGTCCT-TCCC
gi|3132                       :                                                                                             tttatttcat---GG---------G--T-TGGGTCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3136                       :              tttagtttagacatattttatttcaacatgaaatgTAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3137                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGACCCG-TCCC
gi|3138                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGAGCCACAAGTTTTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCG-TCCC
gi|3139                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGTCACAAGTTCTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCC
gi|3140                       :                                              T-ATAT---ATAT-------A-------A--GCAT--AGA-TA--A-G-CA--GG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTC
gi|3143                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--GTA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGTCCACAAGTTCTGCCAACATTA--GT-G-----ACGGCC
gi|3144                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCAACATT
gi|3145                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GT---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTGCCAACATAA--GA-
gi|3152                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TGCC
gi|3154                       :                                                                          attcaaT--ATT-TA--A-A-CATGAA-ATG-GG---------G--T-TGGGCCACACGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3164                       :                                atttaaacatatttT-ATAT---AGAT-------A-------A--GCAA--AGA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTCCG-TCCC
gi|3165                       :                                              T-ATAT---ATAG-------A-------A--ACAT--AGA-TA--C-G-TA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATTATTA--GT-T-----ACGGTCCT-TCCC
gi|3166                       :                                                        TAT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTAACAACATTA--GC-A-----ACAGCCCT-CCCC
gi|3167                       :                                                        TAT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTGACAACATTA--GC-A-----ACAGCCCT-CCCC
gi|3168                       :                                                        TAT-------A-------T--CTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTAATAACATTA--GT-T-----ACAGCTTT-CCCC
gi|3171                       :                                                         AC-------A-------T--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AC-A---GG---------G--T-TAAACCACAAGTTCTGTCAATATTA--GG-T-----ACGGCTCT-TCCC
gi|3172                       :                                                         AT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-AA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACATGTTCTACC-ACATT
gi|3175                       :                                                        TAT-------T-------T--ACAT--ATA-----A-A-CA--AG-A---GG---------G--T-TCGGCCACAAGATCTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCCGTCCC
gi|3176                       :                                                          T-------A-------T--AACT--ATA-TAT-A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCAAACGTTCTGCCAACATTA--GT-T-----ATGGCC
gi|3177                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3178                       :                                                           -------A-------T--ACAT--TT--TA--A-GGCA--AA-A---AG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAATATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3179                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCAACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3185                       :                                                                                 --ATA-TA--A-G-CA--AG-A---AG---------G--T--GGACCACAAGTTTTGCCAACATTA--GA-T-----ATGGTCCA-TCC
gi|3191                       :                                                                                        A--G-G-CA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTT--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3195                       :                                                                                         --A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3199                       :                                                                                                       ---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3200                       :                                                                                                       ---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3201                       :                                                                                                       ---GG---------G--T-TGGGCCACAATTTCAGCCAACATTA--GA-T-----TTGGCCCT-TCCC
gi|3203                       :                                                                                                           G---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC


blockSeqs                     :                                            C  CA   TGC    GAGTCAA AGTCAAA      TTC      GT T G        ATC  CCGCTCCCG                    A               TCGTGA
blockSeqs                     :                                            .  CA   C      TTCAA   AGTCAAA      T        GT T G        ATT  A                            A               A     
blockSeqs                     :                                            .  CA   C      CAA     AGTCAAA      T        C  T G        TT   .                            T               A     
blockSeqs                     :                                            .  CA   .      .       AGTCAAA      T        C  T G        TG   .                            T               T     
blockSeqs                     :                                            .  CA   .      .       AGTCAAA      T        C  . G        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  CA   .      .       AGTCAAA      T        C  . G        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                            .  CA   .      .       AGTCAAA      T        C  . G        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  CA   .      .       AGTCAAA      T        T  . G        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                            .  CA   .      .       .            T        C  . G        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                            .  CA   .      .       .            T        C  . G        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        T  . G        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . G        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . G        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . G        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . G        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . G        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  G    .      .       .            T        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            C               A     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  G    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               A     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                            .  T    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               A     
blockSeqs                     :                                            .  T    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            A        .  . .        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  A    .      .       .            T        .  . .        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                            .  .    .      .       .            T        .  . .        .    .                            T               C     
blockSeqs                     :                                            .  .    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               A     
blockSeqs                     :                                            .  .    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  .    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                            .  .    .      .       .            T        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                               .    .      .       .            T        .  . .        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                               .    .      .       .            T        .  . .        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                               .    .      .       .            T        .  . .        .    .                            C               A     
blockSeqs                     :                                               .    .      .       .            C        .  . .        .    .                            A               A     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            A               C     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                                    .      .       .            T        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            C               A     
blockSeqs                     :                                                           .       .            C        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            C        .  . .        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            C        .  . .        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            C        .  . .        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            A        .  . .        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            A               A     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            T        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            .        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                                           .       .            .        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            .        .  . .        .    .                            C               T     
blockSeqs                     :                                                           .       .            .        .  . .        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                                           .       .            .        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                                           .       .            .        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                                           .       .            .        .  . .        .    .                            A               A     
blockSeqs                     :                                                           .       .            .        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                                                   .            .        .  . .        .    .                            A               A     
blockSeqs                     :                                                                                .        .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                                                .        .  . .        .    .                            A               T     
blockSeqs                     :                                                                                .        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                                                                .        .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                                                                .        .  . .        .    .                            C               A     
blockSeqs                     :                                                                                .        .  . .        .    .                            C               A     
blockSeqs                     :                                                                                .        .  . .        .    .                            C               A     
blockSeqs                     :                                                                                         .  . .        .    .                            G               A     
blockSeqs                     :                                                                                         .  . .        .    .                            C               A     
blockSeqs                     :                                                                                         .  . .        .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                                                                         .  . .        .    .                            T               T     
blockSeqs                     :                                                                                         .  . .        .    .                            G               T     
blockSeqs                     :                                                                                                       .    .                            T               A     
blockSeqs                     :                                                                                                       .    .                            .               A     
blockSeqs                     :                                                                                                       .    .                            .               T     
blockSeqs                     :                                                                                                       .    .                            .               T     
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originalCons                  :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTNCCAACATTA--GA-T-----NCGGCCCT-TCCC
finalCons                     :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTNCCAACATTA--GA-T-----NCGGCCCT-TCCC





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lowQualScore                  :                                            1  11   111    1111111 9999999 77   555   5  44 8 4  66  4 555  000000000 66 4               7         66 88 111111       9    
consensus                     :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTNCCAACATTA--GA-T-----NCGGCCCT-TCCC
Reference ( family-171 )      :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTNCCAACATTA--GA-T-----NCGGCCCT-TCCC
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gi|2998                       :                                  tttaACATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--AAAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
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gi|3000                       :                                  tttaACATAT-TT--TAT---TTCT-------A-------T--TTAT--ATA-TAC-A-G-AA--AT-G---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTCCAACATTA--GA-T-----TCGGCCCT-TCCC
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gi|3012                       :                                                 tttaaaaTAT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACGTTA--AA-A-----TAGGCCCT-TCCC
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gi|3014                       :                                    tttaaacatattttattgccaAT-------A-------T--ACAT--GTG-------G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCCC
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gi|3016                       :                                tttagacatatttcatttctgtttTGT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGTCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCC
gi|3017                       :                                   tttaaacatatttaatgcttttAT-------A-------T--ACAT--GTG-GT--A-G-CA--AA-A---CG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCCC
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gi|3019                       :                                                                         tttaaacatattttattgcataattcacat---GG---------G--T-TGGGCCATACGTTCTGCCAACATTA--GA-T-----TCGGTCCT-TCCC
gi|3020                       : tttaaacatattttatttcataattttactttaaacgATATAT-CT--TATTGCATA--------A-------TTCACAT--A-A-TA--A-G-CA--AG-C---GG---------G--T-AGGGCCACAAGTTCTAGCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-CCCC
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gi|3027                       :                                            tttattgtttttaaa-------A-------T--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---TG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACA
gi|3030                       :                                                                             ttaatttattttctctcccA--AA-T---GGA--------G--T-CGGGCCACAAGTTCTGCCAACATAA--GA-T-----TCGGCCCT-TCC
gi|3031                       :    tttaaacatattttatttcaattttaatatcatgACATAT-GT--TAT----TGT-------A-------T--A-ATTCACA-TT--A-G-CA--AA-C---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTAGCAACATCA--GT-C-----AAGGCCCT-CCCC
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gi|3033                       :                                                           tttaaacatattttatttcagatattttga--A-G-CA--AA-C---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTAGCAACATAA--GT-T-----ATGGCCCT-CCCC
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gi|3036                       :                              tttaaacatattttatcgcataattcTAT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GT---------G--T-TGGGCGACAAGTTAT-CCACCATTA--AA-A-----TTGGCTCT-TCCC
gi|3037                       :                              tttattgctttttT-AT-ATAC---ATAA-------A-------T--A-AT--ATA-CA--G----A--AA-T---GG---------G--G-TGGGCCACAAGTTCTTCCAACATGA--GA-T-----TCCCCCCA-CCCC
gi|3038                       :                                  tttatttcttttT-GTAT---ATCT---------------T--ACAA--AT--TA----G-CA--AA-A---AG---------G--AACGGGCCACAAATTCTATCAACATTA--AG-T-----AAGGCCCT-TCC
gi|3039                       :                                                                                     tttaaacatttttattgc---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAAC-TTA--GA-T-----TCGGCCCT-CCCC
gi|3040                       :                                                                     tttaaacatattttatttcaaatattttgaaatg---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3073                       :        tttaaacatattttatttcaacatgaaatgATATAT-AT-ATAT---ACAT-------G-------T--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TTCC
gi|3074                       :                                     tATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-AA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGACCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3075                       :                                     tATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--G-G-AA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAAC-TCA--TA-T-----CTGGC
gi|3076                       :                                      tTATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------A--GCAT--AGA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTCCG-TCCC
gi|3077                       :                                                        TAT-------A-------T--ACAT--GTAGTA--A---CA--AA-A---GG---------A--T-TGCGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCTCT-TCCC
gi|3078                       :                        tatgtattgctttttTATAT-ATCATGC---ATATGAGTCAAA-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3080                       :                                      ATATATCAT-GCAC---ATATTTCAA--A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCTC
gi|3081                       :                                      tTGTAT-AT--TAT---AAGTCAA----A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-TTGGCCACAAGTTCTCTCAATATTC--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3086                       :                                      ATATAT-AT-ATAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3087                       :                                           T-AT--TAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGAACCACAAGTTCTATCAACATTACTGAGTTCGTGACGGCCCT-TCCC
gi|3088                       :                              acatatttACATAT-TT--TAT---TTCT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--C-G-GA--AACG---GG---------G--T-TGGGTCAAAAGTTCTTCCAACATTA--GA-T-----TCGGCCCT-
gi|3090                       :                                      ATATTT--T-ATTT---CTAT-------A-------T--ACAT--GTA-TA--ATA-TA--AA-AATTGG---------G--T-TGGGTCACAAGGTCTTCCAACATTA--AA-C-----TCGGCCCTGTCC
gi|3091                       :                                         acT-AT-ATACC--ATGC-------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CCGACCACAAGTTCTT-CAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3092                       :                              atataatttgtttT-AT-TTCT---ATTT-------A-------T--A-----ATA-TA--G-------AA-ATT-GG---------G--T-TGGGCCACAAGGTCTTCAAACATTA--AA-T-----TTGGCCCT-CTCC
gi|3093                       :                                                                        acatatttT--ATA-TA--T-G-TG--AA-A---TG---------GAAT-CAGGCCATAAGTTCTGACAACATTA--GA-A-----TTGGCCTT-TCCC
gi|3100                       :             atgtatttttgtttcatataattttATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GA-T-----TCGGCC
gi|3101                       :                                                          T-------A-------T--ACAC--ATG-TAGTA-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCC
gi|3102                       :                      atattttattgcttttATATTT-ATCATGTC--AAAT-------A-------T--A-AT--TTA--A--G-G-CA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGACCAT-TCCC
gi|3103                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTGTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3104                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-TTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--AA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3105                       :                                                                                                A--AA-C---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTAGCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-CCCC
gi|3106                       :           atatttttattgcataattcaattggaATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-ATGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3107                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGTCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3108                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCAGCCAT-TCCC
gi|3109                       :                                      ATATTT-ATCATGC---ATAT-------AAGTCAAAT--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TTCC
gi|3120                       :                                           T-AT-TTAT---ACAC-------A-------T--TCAT--GTA-TAC-A-G-AA--AT-G---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTCCAACATTA--GA-T-----TCGACCCT-CCCC
gi|3121                       :                                                    tatttcT-------A-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GG---------A--T-TGGGCCACACATTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGACCT-TCCC
gi|3122                       :                                      tattgctttttcgT---ATTT-------A-------T--A-AT--ATG-TA--A-------AT-T---GG---------G--T-TTGGCCACAAATTCTTCCAACATTA--AA-T-----TCGGCCCT-CTCC
gi|3124                       :                                                   atttcTAT-------T-------T--ACAT--GTA-GT--A-G-CA--AA-A---GC---------G--C-TGGGTCACAAGTTAT-CCAACGTTA--AA-A-----TCGGCCCT-TCCC
gi|3129                       :                                                                       tttt--ACAT--A-A-TA--A-G-CA--AA-C---GT---------G--T-TGAGCCACAAGTTTTAGCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3131                       :                                        ttttattgcataattcTAT-------A-------T-----T--ACA-TA--A----A--AT-G---GG---------G--T-TTGACCACAAGTTCTGCTAACATTA--GA-T-----TCGGTCCT-TCCC
gi|3132                       :                                                                                             tttatttcat---GG---------G--T-TGGGTCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3136                       :              tttagtttagacatattttatttcaacatgaaatgTAT---ATAT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCT-TCCC
gi|3137                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTACCAACATTA--GT-T-----ACGACCCG-TCCC
gi|3138                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAT--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGAGCCACAAGTTTTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCG-TCCC
gi|3139                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGTCACAAGTTCTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCC
gi|3140                       :                                              T-ATAT---ATAT-------A-------A--GCAT--AGA-TA--A-G-CA--GG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTC
gi|3143                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--GTA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGTCCACAAGTTCTGCCAACATTA--GT-G-----ACGGCC
gi|3144                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCAACATT
gi|3145                       :                                                 TAT---TTAC-------A-------A--ACAC--ATA-TA--A-G-CA--AG-A---GT---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTGCCAACATAA--GA-
gi|3152                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TGCC
gi|3154                       :                                                                          attcaaT--ATT-TA--A-A-CATGAA-ATG-GG---------G--T-TGGGCCACACGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3164                       :                                atttaaacatatttT-ATAT---AGAT-------A-------A--GCAA--AGA-TA--A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATCATTA--GT-T-----ACGGTCCG-TCCC
gi|3165                       :                                              T-ATAT---ATAG-------A-------A--ACAT--AGA-TA--C-G-TA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCATAAGTTCTGCCATTATTA--GT-T-----ACGGTCCT-TCCC
gi|3166                       :                                                        TAT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTAACAACATTA--GC-A-----ACAGCCCT-CCCC
gi|3167                       :                                                        TAT-------A-------T--TTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTGACAACATTA--GC-A-----ACAGCCCT-CCCC
gi|3168                       :                                                        TAT-------A-------T--CTAT--ATA-TA--GTG-CA--AA-T---GG---------G--T-TGGGCTACAAGTTTTAATAACATTA--GT-T-----ACAGCTTT-CCCC
gi|3171                       :                                                         AC-------A-------T--ATAT--ATA-TA--A-G-CA--AC-A---GG---------G--T-TAAACCACAAGTTCTGTCAATATTA--GG-T-----ACGGCTCT-TCCC
gi|3172                       :                                                         AT-------A-------T--ACAT--ATA-TA--A-G-AA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACATGTTCTACC-ACATT
gi|3175                       :                                                        TAT-------T-------T--ACAT--ATA-----A-A-CA--AG-A---GG---------G--T-TCGGCCACAAGATCTGCCAACATTA--GT-T-----ACGGCCCCGTCCC
gi|3176                       :                                                          T-------A-------T--AACT--ATA-TAT-A-G-CA--AG-A---GG---------G--T-TGGGCCAAACGTTCTGCCAACATTA--GT-T-----ATGGCC
gi|3177                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3178                       :                                                           -------A-------T--ACAT--TT--TA--A-GGCA--AA-A---AG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAATATTA--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3179                       :                                                           -------A-------T--ACA---ATT-TA--A-GGCA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCAACAAGTTCTCTCAACATTA--GA-T-----ACGGCCAT-TCCC
gi|3185                       :                                                                                 --ATA-TA--A-G-CA--AG-A---AG---------G--T--GGACCACAAGTTTTGCCAACATTA--GA-T-----ATGGTCCA-TCC
gi|3191                       :                                                                                        A--G-G-CA--AA-A---GG---------G--T-CTGGCCACAAGTTCTCTCAACATTT--GA-T-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3195                       :                                                                                         --A-G-CA--AA-A---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTAT-CCAACATTA--AA-A-----TCGGCCAT-TCCC
gi|3199                       :                                                                                                       ---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3200                       :                                                                                                       ---GG---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC
gi|3201                       :                                                                                                       ---GG---------G--T-TGGGCCACAATTTCAGCCAACATTA--GA-T-----TTGGCCCT-TCCC
gi|3203                       :                                                                                                           G---------G--T-TGGGCCACAAGTTCTTTCAACATTA--GG-T-----TCGGCCCG-TCCC