lowQualScore                  :                                                                   1      
lowQualScore                  :             000   0  0   00    0000  0 0                          4      
lowQualScore                  :             ...   .  .   ..    ....  . .                          .      
lowQualScore                  :             777   4  4   66    9999  4 8                          3      
consensus                     : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
Reference ( gi|14242 )        : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14272                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTTTACAAGAAAAAGGTAAATGGA
gi|14243                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAATGTTAACAGA
gi|14248                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGGTATTGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14246                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTTTCGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14296                      : TGGTTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTGTCGCGTCTACAAG-AAAAGGTAAACAGA
gi|14298                      : TGGTTAAGATTC---AAT-TA-AAA--ATAC----AG-G-TGCTATCGCGTCTTCAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14250                      : TGGTTAAGTTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTGTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14252                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGGATCTACAAGAAAATGGTTAACAGA
gi|14271                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-A-TGCTATAGCGTCTACAAGAAAAAGGT
gi|14254                      : TGGTTAAGATTC---AAT-AA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTG-CTACAAGAAAAAGGTTAACAGAt
gi|14255                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA----AATG-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14257                      : TGGTTAAGACTC---AAT-GA-AAA---TGA----AG-G-TGCTGTCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14278                      : TGGTTAAGATTC---AGT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAG
gi|14259                      : TGGTTAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTAGAAGAAAAAAGTTAACAGtttaa
gi|14262                      : TGGTTAAGCTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATCGTGTCTACAGGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14263                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTAAATGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14282                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAG----TG-G-TGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGGTCAACGGA
gi|14264                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----GG-G-TGCTAGCGCATCTACAAGAAAAAAGTTAACAGA
gi|14265                      : TGGTTAAGATTC---AAT--A-AAA--ATGA----AG-G-AGCTATCGCCTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14274                      : TGGATAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCACCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14269                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATCACATCTACAAGAAAAAGATTAACAGA
gi|14280                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA-------G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGATTAACAGA
gi|14281                      : TGGTTAAGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGA-ATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAATAGA
gi|14284                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACA--AAAATGGTTAACGGA
gi|14286                      : TGGTTAAGAGTG---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGGCTATAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14285                      : TGGTTAAGATAT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAAATTAACGGA
gi|14287                      : TGGTTAATAGTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCATGTCTAAAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14288                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AA-G-TTCTATCTTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14290                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATGATGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14293                      : TGATTAAGATCC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTACAAGAAAAAAGTTAATGGA
gi|14292                      : TGGTCAAAATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGTTATTGCGCCTACAAGAAAAAGGTTAACAAA
gi|14302                      : TGATTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATGGCATCTACTAGAAAAAGGTTAA
gi|14325                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-A-TTCTATCACGTCCACAAGAAAAAGGT
gi|14304                      : TGGTTAAGATTC---CAT-GA-AAA--ATGG----GG-G-TTCTATTGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14317                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTACAA
gi|14244                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTTTACAA
gi|14315                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTATTGCATCTACAAGACAAGAGT
gi|14305                      : TGGTTAGGATTC---AAT-GA-ACA---TGG----GG-A-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGAtgtcaga
gi|14307                      : TGGTTAAGGTTC---AAT-GA-AAA--ATGT----AG-G-TGCTATAACGTCTACAAGAAAAATGTTAACTGA
gi|14330                      : TGGTTCAGATTC---GAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAA
gi|14308                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGG----AG-G-TGCTATTGTGTCTACAGG--AAAGATTAATAGA
gi|14300                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATAGCGTCTACAA
gi|14245                      : TGGTTAAGATTA---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14275                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14266                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGACTACAA
gi|14260                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-ATA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTCTACAA
gi|14294                      : TGTTTAAGACTT---ATT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCCTCTACAAGAAAAAGGTTAATGGA
gi|14299                      : TGGTTAAGATTC---AAT-TA-AAA--ATAG----AG-G-TGCTTTCGTGTCTAAAAGAAAAAGGTTAACA
gi|14338                      : TGGTTAAGACTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTTTACAA
gi|14334                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCGATCGCATCTACA
gi|14256                      : TGGTTAAAGTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14339                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCATGTCTACAA
gi|14316                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-ATA--ATGA----AG-G-TGCTATTCCCTCTACAAAAGAAAGGTTAATAG
gi|14310                      : TGGTGAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCGCGTGTACAAGGACAAGGTTAACGGA
gi|14267                      : TGGTTAATATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCTTCTACAA
gi|14318                      : TGGATAAGATTC---AGT-CA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCACGTGTACAAGAAAAGGGTTAACAGA
gi|14319                      : TGGTTAAGATTCTTTAA---A-AAA--ATGA----GA-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAAA
gi|14321                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTTTCGCGTCAACTAGAAAAATGTTAAC
gi|14343                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGG----GG-GATGCTATCGCGTCTACAA
gi|14342                      : TGGTTAAGGTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTACAGCGTCTACAA
gi|14251                      : TGATTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCTTCTAC
gi|14332                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----GG-G-TGCTATCATATCTACATGAAAA
gi|14344                      : TGGTTAAGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTATCTACAAttttaacaga
gi|14346                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-A-TGATATCACGTCTACAA
gi|14345                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA----AG-G-TGCTATTGCGTGTACAA
gi|14324                      : TAGTTAAGATTC---AAT-GA-AAAAAATGA----AG-G-TGCTATCAGGTCAACATGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14323                      : TGGTTAAGAT----------A-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAGGGTTAACGGA
gi|14327                      : TGCTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCGTGTCTAAAAGAAAATGTTA
gi|14326                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAT---TGA----AG-G-TGCTATTGTGCATATAAGAAAAAGGTTAACGGAcgga
gi|14329                      : TGGTTAAGAATC---AAT-GA-AAA--ATAA----AG-G-TGCTTTCACATTTACAAGAAAGAGTTTAACAG
gi|14328                      : TGGTTATGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-C-TGCTATCACGTCTACAATAAGAAAGTTAACGGA
gi|14291                      : TAGTTAAAATTC---AAT-GATAAA--ATAA----AA-G-TGTTATCGCGTCTTCAAGAAAAAGGTTAA
gi|14276                      : TAGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA-------G-TGCTAAAGCATCTACAAGAAAAAGCTTAACGGA
gi|14333                      : TGGTCAAGATTC---TTT-GA-AAA--ATGACGTGAG-GATGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACCGA
gi|14337                      : TGGTTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGCTATTGCATTTATAAGAAAACGTTTAACGG
gi|14341                      : TGGCTAAGATCC---AAT-CA-AAA--AATA----TG-G-TGCTATCGTATCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14411                      :  GGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCCATCGCGTCTACAAGAAAAAGGT
gi|14412                      :  GGGTAAGATGC---AGT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTAAACAGAttatggacaga
gi|14410                      :  GATTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAATAAAAAGGTTAACAGA
gi|14418                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AT-G-TGCTATCGCGCCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14425                      :   GTTAATAT-C---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGGTAAAC
gi|14419                      :   GTTAAAATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14420                      :   GTTAAGAGTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGACTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14421                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAA
gi|14431                      :   GTTAAGATAC---AAT-AC-GAA--ATGA----AG-G-TGGTATCGCGTCTATAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14429                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTATCGCGTCTACAA
gi|14416                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTCTACAA
gi|14423                      :   GTTAAGATTC---AATTAA-AAA--ATGA----TG-A-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14433                      :   GTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAA
gi|14417                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----GG-G-TGCTATCGCATCTACAA
gi|14430                      :   GTTAAGATTC---AAT-AA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTGTCGGCTCTACAAGAAAAAG
gi|14427                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATTG----GG-G-TGCTATCCCATCTACAAGAAAAAGATTAACGGAtttaa
gi|14428                      :   GTTAAGATTC---CAT--A-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGTGTCTGCAAG-AAAAGGTTAACAGA
gi|14451                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--AAGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14452                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGCTTAAC
gi|14456                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGCTATCGTGTCTGCAAGTAAAAACTTAACAG
gi|14461                      :     TAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-T-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAATGGTTAACAGA
gi|14465                      :                  T-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAAAAAAACGTTAACAGA
gi|14470                      :                             TGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA





Alignments
lowQualScore                  :             000   0  0   00    0000  0 0                                 
lowQualScore                  :             ...   .  .   ..    ....  . .                                 
lowQualScore                  :             777   4  4   66    9999  4 8                                 
consensus                     : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
Reference ( family-158 )      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14242                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14243                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAATGTTAACAGA
gi|14244                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTTTACAA
gi|14245                      : TGGTTAAGATTA---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14246                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTTTCGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14248                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGGTATTGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14250                      : TGGTTAAGTTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTGTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14251                      : TGATTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCTTCTAC
gi|14252                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGGATCTACAAGAAAATGGTTAACAGA
gi|14254                      : TGGTTAAGATTC---AAT-AA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTG-CTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14255                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA----AATG-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14256                      : TGGTTAAAGTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14257                      : TGGTTAAGACTC---AAT-GA-AAA---TGA----AG-G-TGCTGTCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14259                      : TGGTTAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTAGAAGAAAAAAGTTAACAG
gi|14260                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-ATA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTCTACAA
gi|14262                      : TGGTTAAGCTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATCGTGTCTACAGGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14263                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTAAATGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14264                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----GG-G-TGCTAGCGCATCTACAAGAAAAAAGTTAACAGA
gi|14265                      : TGGTTAAGATTC---AAT--A-AAA--ATGA----AG-G-AGCTATCGCCTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14266                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGACTACAA
gi|14267                      : TGGTTAATATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCTTCTACAA
gi|14269                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATCACATCTACAAGAAAAAGATTAACAGA
gi|14271                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-A-TGCTATAGCGTCTACAAGAAAAAGGTT
gi|14272                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTTTACAAGAAAAAGGTAAATGGA
gi|14274                      : TGGATAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCACCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14275                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14276                      : TAGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA-------G-TGCTAAAGCATCTACAAGAAAAAGCTTAACGGA
gi|14278                      : TGGTTAAGATTC---AGT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGTTTAA
gi|14280                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA-------G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGATTAACAGA
gi|14281                      : TGGTTAAGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGA-ATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAATAGA
gi|14282                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAG----TG-G-TGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGGTCAACGGA
gi|14284                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACA--AAAATGGTTAACGGA
gi|14285                      : TGGTTAAGATAT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAAATTAACGGA
gi|14286                      : TGGTTAAGAGTG---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGGCTATAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14287                      : TGGTTAATAGTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCATGTCTAAAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14288                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AA-G-TTCTATCTTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14290                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATGATGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14291                      : TAGTTAAAATTC---AAT-GATAAA--ATAA----AA-G-TGTTATCGCGTCTTCAAGAAAAAGGTTAA
gi|14292                      : TGGTCAAAATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGTTATTGCGCCTACAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14293                      : TGATTAAGATCC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTACAAGAAAAAAGTTAATGGAaaa
gi|14294                      : TGTTTAAGACTT---ATT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCCTCTACAAGAAAAAGGTTAATGGA
gi|14296                      : TGGTTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTGTCGCGTCTACAAG-AAAAGGTAAACAGA
gi|14298                      : TGGTTAAGATTC---AAT-TA-AAA--ATAC----AG-G-TGCTATCGCGTCTTCAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14299                      : TGGTTAAGATTC---AAT-TA-AAA--ATAG----AG-G-TGCTTTCGTGTCTAAAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14300                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATAGCGTCTACAAa
gi|14302                      : TGATTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATGGCATCTACTAGAAAAAGGTTAA
gi|14304                      : TGGTTAAGATTC---CAT-GA-AAA--ATGG----GG-G-TTCTATTGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14305                      : TGGTTAGGATTC---AAT-GA-ACA---TGG----GG-A-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14307                      : TGGTTAAGGTTC---AAT-GA-AAA--ATGT----AG-G-TGCTATAACGTCTACAAGAAAAATGTTAACTGA
gi|14308                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGG----AG-G-TGCTATTGTGTCTACAGG--AAAGATTAATAGA
gi|14310                      : TGGTGAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCGCGTGTACAAGGACAAGGTTAACGGA
gi|14315                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTATTGCATCTACAAGACAAGAGTT
gi|14316                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-ATA--ATGA----AG-G-TGCTATTCCCTCTACAAAAGAAAGGTTAAgtcaga
gi|14317                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTACAAtag
gi|14318                      : TGGATAAGATTC---AGT-CA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCACGTGTACAAGAAAAGGGTTAACAGA
gi|14319                      : TGGTTAAGATTCTTTAA---A-AAA--ATGA----GA-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14321                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTTTCGCGTCAACTAGAAAAATGTTAACaaa
gi|14323                      : TGGTTAAGAT----------A-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAGGGTTAACGGA
gi|14324                      : TAGTTAAGATTC---AAT-GA-AAAAAATGA----AG-G-TGCTATCAGGTCAACATGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14325                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-A-TTCTATCACGTCCACAAGAAAAAGGT
gi|14326                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAT---TGA----AG-G-TGCTATTGTGCATATAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14327                      : TGCTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCGTGTCTAAAAG-AAAATGTTAACGGA
gi|14328                      : TGGTTATGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-C-TGCTATCACGTCTACAATAAGAAAGTTAACGGA
gi|14329                      : TGGTTAAGAATC---AAT-GA-AAA--ATAA----AG-G-TGCTTTCACATTTACAAGAAAGAGTTTAACAG
gi|14330                      : TGGTTCAGATTC---GAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAA
gi|14332                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----GG-G-TGCTATCATATCTACATG-AAAATTTTAACAGA
gi|14333                      : TGGTCAAGATTC---TTT-GA-AAA--ATGACGTGAG-GATGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACCGA
gi|14334                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCGATCGCATCTACA
gi|14337                      : TGGTTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGCTATTGCATTTATAAGAAAACGTTTAACGG
gi|14338                      : TGGTTAAGACTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTTTACAA
gi|14339                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCATGTCTACAA
gi|14341                      : TGGCTAAGATCC---AAT-CA-AAA--AATA----TG-G-TGCTATCGTATCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14342                      : TGGTTAAGGTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTACAGCGTCTACAA
gi|14343                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGG----GG-GATGCTATCGCGTCTACAA
gi|14344                      : TGGTTAAGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTATCTACAA
gi|14345                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA----AG-G-TGCTATTGCGTGTACAA
gi|14346                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-A-TGATATCACGTCTACAA
gi|14410                      :  GATTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAATAAAAAGGTTAACAGA
gi|14411                      :  GGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCCATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTTATGGA
gi|14412                      :  GGGTAAGATGC---AGT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTAAACAGAcaga
gi|14416                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTCTACAA
gi|14417                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----GG-G-TGCTATCGCATCTACAA
gi|14418                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AT-G-TGCTATCGCGCCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14419                      :   GTTAAAATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14420                      :   GTTAAGAGTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGACTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14421                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAA
gi|14423                      :   GTTAAGATTC---AATTAA-AAA--ATGA----TG-A-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14425                      :   GTTAATAT-C---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGGTAAAC
gi|14427                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATTG----GG-G-TGCTATCCCATCTACAAGAAAAAGATTAACGGA
gi|14428                      :   GTTAAGATTC---CAT--A-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGTGTCTGCAAG-AAAAGGTTAACAGA
gi|14429                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTATCGCGTCTACAA
gi|14430                      :   GTTAAGATTC---AAT-AA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTGTCGGCTCTACAAGAAAAAGTTTAA
gi|14431                      :   GTTAAGATAC---AAT-AC-GAA--ATGA----AG-G-TGGTATCGCGTCTATAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14433                      :   GTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAA
gi|14451                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--AAGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14452                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGCTTAAC
gi|14456                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGCTATCGTGTCTGCAAGTAAAAACTTAACAG
gi|14461                      :     TAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-T-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAATGGTTAACAGA
gi|14465                      :                  T-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAAAAAAACGTTAACAGA
gi|14470                      :                             TGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA





Alignments
lowQualScore                  :             000   0  0   00    0000  0 0                                 
lowQualScore                  :             ...   .  .   ..    ....  . .                                 
lowQualScore                  :             777   4  4   66    9999  4 8                                 
consensus                     : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
Reference ( family-158 )      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14242                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14243                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAATGTTAACAGA
gi|14244                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTTTACAA
gi|14245                      : TGGTTAAGATTA---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14246                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTTTCGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14248                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGGTATTGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14250                      : TGGTTAAGTTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTGTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14251                      : TGATTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCTTCTAC
gi|14252                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGGATCTACAAGAAAATGGTTAACAGA
gi|14254                      : TGGTTAAGATTC---AAT-AA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTG-CTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14255                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA----AATG-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14256                      : TGGTTAAAGTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14257                      : TGGTTAAGACTC---AAT-GA-AAA---TGA----AG-G-TGCTGTCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14259                      : TGGTTAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTAGAAGAAAAAAGTTAACAG
gi|14260                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-ATA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTCTACAA
gi|14262                      : TGGTTAAGCTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATCGTGTCTACAGGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14263                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTAAATGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14264                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----GG-G-TGCTAGCGCATCTACAAGAAAAAAGTTAACAGA
gi|14265                      : TGGTTAAGATTC---AAT--A-AAA--ATGA----AG-G-AGCTATCGCCTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14266                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGACTACAA
gi|14267                      : TGGTTAATATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCTTCTACAA
gi|14269                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATCACATCTACAAGAAAAAGATTAACAGA
gi|14271                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-A-TGCTATAGCGTCTACAAGAAAAAGGTT
gi|14272                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTTTACAAGAAAAAGGTAAATGGA
gi|14274                      : TGGATAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCACCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14275                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14276                      : TAGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA-------G-TGCTAAAGCATCTACAAGAAAAAGCTTAACGGA
gi|14278                      : TGGTTAAGATTC---AGT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGTTTAA
gi|14280                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA-------G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGATTAACAGA
gi|14281                      : TGGTTAAGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGA-ATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAATAGA
gi|14282                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAG----TG-G-TGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGGTCAACGGA
gi|14284                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACA--AAAATGGTTAACGGA
gi|14285                      : TGGTTAAGATAT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAAATTAACGGA
gi|14286                      : TGGTTAAGAGTG---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGGCTATAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14287                      : TGGTTAATAGTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCATGTCTAAAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14288                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AA-G-TTCTATCTTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14290                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATGATGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14291                      : TAGTTAAAATTC---AAT-GATAAA--ATAA----AA-G-TGTTATCGCGTCTTCAAGAAAAAGGTTAA
gi|14292                      : TGGTCAAAATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGTTATTGCGCCTACAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14293                      : TGATTAAGATCC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTACAAGAAAAAAGTTAATGGAaaa
gi|14294                      : TGTTTAAGACTT---ATT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCCTCTACAAGAAAAAGGTTAATGGA
gi|14296                      : TGGTTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTGTCGCGTCTACAAG-AAAAGGTAAACAGA
gi|14298                      : TGGTTAAGATTC---AAT-TA-AAA--ATAC----AG-G-TGCTATCGCGTCTTCAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14299                      : TGGTTAAGATTC---AAT-TA-AAA--ATAG----AG-G-TGCTTTCGTGTCTAAAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14300                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATAGCGTCTACAAa
gi|14302                      : TGATTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATGGCATCTACTAGAAAAAGGTTAA
gi|14304                      : TGGTTAAGATTC---CAT-GA-AAA--ATGG----GG-G-TTCTATTGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14305                      : TGGTTAGGATTC---AAT-GA-ACA---TGG----GG-A-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14307                      : TGGTTAAGGTTC---AAT-GA-AAA--ATGT----AG-G-TGCTATAACGTCTACAAGAAAAATGTTAACTGA
gi|14308                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGG----AG-G-TGCTATTGTGTCTACAGG--AAAGATTAATAGA
gi|14310                      : TGGTGAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCGCGTGTACAAGGACAAGGTTAACGGA
gi|14315                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTATTGCATCTACAAGACAAGAGTT
gi|14316                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-ATA--ATGA----AG-G-TGCTATTCCCTCTACAAAAGAAAGGTTAAgtcaga
gi|14317                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTACAAtag
gi|14318                      : TGGATAAGATTC---AGT-CA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCACGTGTACAAGAAAAGGGTTAACAGA
gi|14319                      : TGGTTAAGATTCTTTAA---A-AAA--ATGA----GA-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14321                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTTTCGCGTCAACTAGAAAAATGTTAACaaa
gi|14323                      : TGGTTAAGAT----------A-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAGGGTTAACGGA
gi|14324                      : TAGTTAAGATTC---AAT-GA-AAAAAATGA----AG-G-TGCTATCAGGTCAACATGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14325                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-A-TTCTATCACGTCCACAAGAAAAAGGT
gi|14326                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAT---TGA----AG-G-TGCTATTGTGCATATAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14327                      : TGCTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCGTGTCTAAAAG-AAAATGTTAACGGA
gi|14328                      : TGGTTATGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-C-TGCTATCACGTCTACAATAAGAAAGTTAACGGA
gi|14329                      : TGGTTAAGAATC---AAT-GA-AAA--ATAA----AG-G-TGCTTTCACATTTACAAGAAAGAGTTTAACAG
gi|14330                      : TGGTTCAGATTC---GAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAA
gi|14332                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----GG-G-TGCTATCATATCTACATG-AAAATTTTAACAGA
gi|14333                      : TGGTCAAGATTC---TTT-GA-AAA--ATGACGTGAG-GATGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACCGA
gi|14334                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCGATCGCATCTACA
gi|14337                      : TGGTTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGCTATTGCATTTATAAGAAAACGTTTAACGG
gi|14338                      : TGGTTAAGACTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTTTACAA
gi|14339                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCATGTCTACAA
gi|14341                      : TGGCTAAGATCC---AAT-CA-AAA--AATA----TG-G-TGCTATCGTATCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14342                      : TGGTTAAGGTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTACAGCGTCTACAA
gi|14343                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGG----GG-GATGCTATCGCGTCTACAA
gi|14344                      : TGGTTAAGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTATCTACAA
gi|14345                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA----AG-G-TGCTATTGCGTGTACAA
gi|14346                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-A-TGATATCACGTCTACAA
gi|14410                      :  GATTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAATAAAAAGGTTAACAGA
gi|14411                      :  GGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCCATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTTATGGA
gi|14412                      :  GGGTAAGATGC---AGT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTAAACAGAcaga
gi|14416                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTCTACAA
gi|14417                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----GG-G-TGCTATCGCATCTACAA
gi|14418                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AT-G-TGCTATCGCGCCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14419                      :   GTTAAAATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14420                      :   GTTAAGAGTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGACTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14421                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAA
gi|14423                      :   GTTAAGATTC---AATTAA-AAA--ATGA----TG-A-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14425                      :   GTTAATAT-C---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGGTAAAC
gi|14427                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATTG----GG-G-TGCTATCCCATCTACAAGAAAAAGATTAACGGA
gi|14428                      :   GTTAAGATTC---CAT--A-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGTGTCTGCAAG-AAAAGGTTAACAGA
gi|14429                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTATCGCGTCTACAA
gi|14430                      :   GTTAAGATTC---AAT-AA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTGTCGGCTCTACAAGAAAAAGTTTAA
gi|14431                      :   GTTAAGATAC---AAT-AC-GAA--ATGA----AG-G-TGGTATCGCGTCTATAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14433                      :   GTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAA
gi|14451                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--AAGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14452                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGCTTAAC
gi|14456                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGCTATCGTGTCTGCAAGTAAAAACTTAACAG
gi|14461                      :     TAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-T-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAATGGTTAACAGA
gi|14465                      :                  T-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAAAAAAACGTTAACAGA
gi|14470                      :                             TGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA




blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
finalCons                     : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA





Alignments
lowQualScore                  :             000   0  0   00    0000  0 0                                 
lowQualScore                  :             ...   .  .   ..    ....  . .                                 
lowQualScore                  :             777   4  4   66    9999  4 8                                 
consensus                     : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
Reference ( family-158 )      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14242                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14243                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAATGTTAACAGA
gi|14244                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTTTACAA
gi|14245                      : TGGTTAAGATTA---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14246                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTTTCGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14248                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGGTATTGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14250                      : TGGTTAAGTTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTGTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14251                      : TGATTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCTTCTAC
gi|14252                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGGATCTACAAGAAAATGGTTAACAGA
gi|14254                      : TGGTTAAGATTC---AAT-AA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTG-CTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14255                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA----AATG-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14256                      : TGGTTAAAGTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14257                      : TGGTTAAGACTC---AAT-GA-AAA---TGA----AG-G-TGCTGTCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14259                      : TGGTTAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTAGAAGAAAAAAGTTAACAG
gi|14260                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-ATA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTCTACAA
gi|14262                      : TGGTTAAGCTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATCGTGTCTACAGGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14263                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTAAATGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14264                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----GG-G-TGCTAGCGCATCTACAAGAAAAAAGTTAACAGA
gi|14265                      : TGGTTAAGATTC---AAT--A-AAA--ATGA----AG-G-AGCTATCGCCTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14266                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGACTACAA
gi|14267                      : TGGTTAATATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCTTCTACAA
gi|14269                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATCACATCTACAAGAAAAAGATTAACAGA
gi|14271                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-A-TGCTATAGCGTCTACAAGAAAAAGGTT
gi|14272                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTTTACAAGAAAAAGGTAAATGGA
gi|14274                      : TGGATAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCACCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14275                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAA
gi|14276                      : TAGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA-------G-TGCTAAAGCATCTACAAGAAAAAGCTTAACGGA
gi|14278                      : TGGTTAAGATTC---AGT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGTTTAA
gi|14280                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA-------G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGATTAACAGA
gi|14281                      : TGGTTAAGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGA-ATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAATAGA
gi|14282                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAG----TG-G-TGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGGTCAACGGA
gi|14284                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACA--AAAATGGTTAACGGA
gi|14285                      : TGGTTAAGATAT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAAATTAACGGA
gi|14286                      : TGGTTAAGAGTG---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGGCTATAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14287                      : TGGTTAATAGTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCATGTCTAAAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14288                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AA-G-TTCTATCTTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14290                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCAATGATGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA
gi|14291                      : TAGTTAAAATTC---AAT-GATAAA--ATAA----AA-G-TGTTATCGCGTCTTCAAGAAAAAGGTTAA
gi|14292                      : TGGTCAAAATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGTTATTGCGCCTACAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14293                      : TGATTAAGATCC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTACAAGAAAAAAGTTAATGGAaaa
gi|14294                      : TGTTTAAGACTT---ATT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCCTCTACAAGAAAAAGGTTAATGGA
gi|14296                      : TGGTTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTGTCGCGTCTACAAG-AAAAGGTAAACAGA
gi|14298                      : TGGTTAAGATTC---AAT-TA-AAA--ATAC----AG-G-TGCTATCGCGTCTTCAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14299                      : TGGTTAAGATTC---AAT-TA-AAA--ATAG----AG-G-TGCTTTCGTGTCTAAAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14300                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATAGCGTCTACAAa
gi|14302                      : TGATTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATGGCATCTACTAGAAAAAGGTTAA
gi|14304                      : TGGTTAAGATTC---CAT-GA-AAA--ATGG----GG-G-TTCTATTGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14305                      : TGGTTAGGATTC---AAT-GA-ACA---TGG----GG-A-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14307                      : TGGTTAAGGTTC---AAT-GA-AAA--ATGT----AG-G-TGCTATAACGTCTACAAGAAAAATGTTAACTGA
gi|14308                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGG----AG-G-TGCTATTGTGTCTACAGG--AAAGATTAATAGA
gi|14310                      : TGGTGAAGATTT---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCGCGTGTACAAGGACAAGGTTAACGGA
gi|14315                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTATTGCATCTACAAGACAAGAGTT
gi|14316                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-ATA--ATGA----AG-G-TGCTATTCCCTCTACAAAAGAAAGGTTAAgtcaga
gi|14317                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCATCTACAAtag
gi|14318                      : TGGATAAGATTC---AGT-CA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCACGTGTACAAGAAAAGGGTTAACAGA
gi|14319                      : TGGTTAAGATTCTTTAA---A-AAA--ATGA----GA-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAAC
gi|14321                      : TGGTTAAGATTC---AAA-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTTTCGCGTCAACTAGAAAAATGTTAACaaa
gi|14323                      : TGGTTAAGAT----------A-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAGGGTTAACGGA
gi|14324                      : TAGTTAAGATTC---AAT-GA-AAAAAATGA----AG-G-TGCTATCAGGTCAACATGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14325                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-A-TTCTATCACGTCCACAAGAAAAAGGT
gi|14326                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAT---TGA----AG-G-TGCTATTGTGCATATAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14327                      : TGCTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-T-TGCTATCGTGTCTAAAAG-AAAATGTTAACGGA
gi|14328                      : TGGTTATGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-C-TGCTATCACGTCTACAATAAGAAAGTTAACGGA
gi|14329                      : TGGTTAAGAATC---AAT-GA-AAA--ATAA----AG-G-TGCTTTCACATTTACAAGAAAGAGTTTAACAG
gi|14330                      : TGGTTCAGATTC---GAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAA
gi|14332                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----GG-G-TGCTATCATATCTACATG-AAAATTTTAACAGA
gi|14333                      : TGGTCAAGATTC---TTT-GA-AAA--ATGACGTGAG-GATGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGGTTAACCGA
gi|14334                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCGATCGCATCTACA
gi|14337                      : TGGTTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGCTATTGCATTTATAAGAAAACGTTTAACGG
gi|14338                      : TGGTTAAGACTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTTTACAA
gi|14339                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCATGTCTACAA
gi|14341                      : TGGCTAAGATCC---AAT-CA-AAA--AATA----TG-G-TGCTATCGTATCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14342                      : TGGTTAAGGTTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTACAGCGTCTACAA
gi|14343                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGG----GG-GATGCTATCGCGTCTACAA
gi|14344                      : TGGTTAAGATGC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTATCTACAA
gi|14345                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATAA----AG-G-TGCTATTGCGTGTACAA
gi|14346                      : TGGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-A-TGATATCACGTCTACAA
gi|14410                      :  GATTAAGATTC---ACT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAATAAAAAGGTTAACAGA
gi|14411                      :  GGTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCCATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTTATGGA
gi|14412                      :  GGGTAAGATGC---AGT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTAAACAGAcaga
gi|14416                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TACTATCGCGTCTACAA
gi|14417                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----GG-G-TGCTATCGCATCTACAA
gi|14418                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AT-G-TGCTATCGCGCCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14419                      :   GTTAAAATTC---AAT-GA-AAA--TTGA----AG-G-TGCTATTGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14420                      :   GTTAAGAGTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGACTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14421                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAA
gi|14423                      :   GTTAAGATTC---AATTAA-AAA--ATGA----TG-A-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14425                      :   GTTAATAT-C---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAGAAAAAGGTAAAC
gi|14427                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATTG----GG-G-TGCTATCCCATCTACAAGAAAAAGATTAACGGA
gi|14428                      :   GTTAAGATTC---CAT--A-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATTGTGTCTGCAAG-AAAAGGTTAACAGA
gi|14429                      :   GTTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGTTATCGCGTCTACAA
gi|14430                      :   GTTAAGATTC---AAT-AA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTGTCGGCTCTACAAGAAAAAGTTTAA
gi|14431                      :   GTTAAGATAC---AAT-AC-GAA--ATGA----AG-G-TGGTATCGCGTCTATAAGAAAAAGGTAAACAGA
gi|14433                      :   GTTAAGATTC---AAT-GG-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAA
gi|14451                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--AAGA----AG-G-TGCTATCGTGTCTACAAGAAAAAGGTTAACGGA
gi|14452                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCGCATCTACAAGAAAAAGCTTAAC
gi|14456                      :    TTAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-G-TGCTATCGTGTCTGCAAGTAAAAACTTAACAG
gi|14461                      :     TAAGATTC---AAT-GA-AAA--ATGA----AA-T-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAATGGTTAACAGA
gi|14465                      :                  T-GA-AAA--ATGA----AG-G-TGCTATCACGTCTACAAAAAAAACGTTAACAGA
gi|14470                      :                             TGA----AG-G-TGCTATCGCGTCTACAAGAAAAAGGTTAACAGA