lowQualScore : 0 1 0 000 22 999 0 7 0 0 0 0 00 11 0000 000 1111 000 1111 0
lowQualScore : . . . ... .. ... . . . . . . .. .. .... ... .... ... .... .
lowQualScore : 8 2 4 777 11 222 3 6 3 3 4 4 66 00 9999 777 7777 777 0000 5
consensus : TTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCC-GTC
Reference ( gi|75256 ) : TTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAAG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75094 : TTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GCG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75087 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75086 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75085 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75110 : tTTTATA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75081 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCC-GT
gi|75078 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCC-GTC
gi|75119 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCCT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---TG----TCT-GTC
gi|75096 : tTTT-CA-G-CTCACC---TG--AGC-TAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75091 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TCATGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75259 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-TAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---TG----TCT-GTC
gi|75122 : TTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCCCAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--CG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75137 : tTTT-TA-G-CTCATC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGT-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75118 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGTCT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75098 : tTTT-TA-G-CTCATC---TG--AGC-TGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75097 : tTTT-TA-G-CTCATC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-ATGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCC-GTC
gi|75123 : tTTT-TA-G-CTCACC---CG--AGC-CGAAGG-CTGACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75257 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAT-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCC-GTC
gi|75133 : TTT-TA-G-CTAACC---TG--AGC-CGAAGA-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75131 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTAAGCTT-TTGTGA-TCG-CA--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75157 : tTTT-TA-G-CTAACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCA-CC--TG--GTG----T---CTG----T---CG----TCT-GTC
gi|75156 : tTTT-TA-A-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTCAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCA----T---CG----TCT-GTC
gi|75132 : tTTT-TA-G-TTCATC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GT
gi|75129 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TTG-CC--TG--GTG----T---CTG----T---CG----TCT-GT
gi|75093 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGT-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CTG----T---CG----TCC-GT
gi|75112 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TT-TGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---GG----TCT-GTC
gi|75144 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-TTCACAG-ATGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---TG----TCT-GTC
gi|75114 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGC-T-TTGTGA-TCA-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75150 : tTTT-TA-G-CTCAAA---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75151 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAAG-GTCACAT-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CA----TCT-GTC
gi|75120 : tTTT-TAAG-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-TC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCC-GT
gi|75109 : TTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-TAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CA----GCC-GTC
gi|75105 : tTTT-GA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTATGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CA----TCC-GTC
gi|75159 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-ATTACAG-GTGAACTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75155 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAA-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CT--TG--GTT----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75138 : tTTT-TA-AACTCATC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCC-GTC
gi|75102 : TTT-TA-G-CTCATC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TGTCATG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75160 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CCCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--ATG----T---CTG----T---AG----TCT-GTC
gi|75128 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTGACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CA----TCC-ATC
gi|75164 : tTTT-TA-G-TTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CT--TG--GAG----T---CCG----T---TG----TCT-GTC
gi|75167 : tTTT-TA-G-TTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TTA-CT--TG--GTG----T---CCG----T---TG----TCC-GTCgtccgtc
gi|75149 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGTTT-TTGTGA-TCA-CC--TG--GTG----T---CCT----T---CG----TCC-GT
gi|75148 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--ATC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CTG----T---TG----TCC-GT
gi|75143 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AG--CAGAAGTCTCACAG-GTGGGCTT-TTGTGA-TTG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GT
gi|75072 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC---AAAG-CTGA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TCG-CC--TG--TTG----T---CCG----T---C
gi|75146 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGT---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTTAATGTGG-TCA-CT--TG--GTG----T---CCA----T---TG----TCC-ATC
gi|75075 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC---AAAG-TTTA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TCA-CC--TT--TTG----T---CCC----T---TG----TCT-GT
gi|75073 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCTCA-TCG-CC--TG--TTG----T---TCAT---T---CG----T
gi|75083 : tTTT-TA-A-CTCACC---TG--AGT---AAAG-CCCA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TCG-CC--AC--GTG----T---CCG----T---CA----GCC-GTC
gi|75092 : tTTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC---AAAG-CTGG-AG-GTGAGCTA-TTCTGG-TCG-CC--CT--GTG----T---CCG----T---C
gi|75089 : tTTT-TA-G-CTGACC---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCAGA-CCA-CC--TT--GTG----T---TTG----T---CG----TCC-GTC
gi|75074 : tTTT-TA-G-CTTGCC---TG--AGC---AGAG-CTCA-AG-GTGAGCTG-TTCTGA-TTG-GC--TG--TTG----T---CTG----T---CG----TCC-ATC
gi|75103 : tTTT-TA-G-CTCACC---CT--AGT---AAAG-CTTA-AG-GTGAGCTC-TTCTGA-TCG-CC--TG--TTGTTCCT---CTG----T---TG----TCT-GTC
gi|75101 : tTTT-TA-G-CTCACT---TT--AGC---AAAG-CTCAT-G-GTGAGCTA-TTCTGA-TCG-TT--TG--ATG----T---CCA----T---CG----TTG-GTC
gi|75076 : tTTT-TA-A-CTCACC---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAACTG-TTCTGA-TTG-CC--TGT-GTG----T---
gi|75163 : tTTT-TA-G-TTCACC---TG--AGC---AAAA-CTC-CAT-GTGAGCTA-ATCTGA-TCA-CC--AT--GTG----T---CCA----T---CG----TCT-GT
gi|75258 : tTTT-TA-G-CTCATC-------------AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TCG-CC--TG--TTG----T---CCGTCCAT---CG----TCA-GTC
gi|75082 : TTT-TA-G-TTCGCC---TG--AGT---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCTTA-TCG-CC--TG--TTG----T---GCG----T---C
gi|75084 : tTTT-TA-G-CTCACT---TC--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAACTG-TTCTGA-TTG-CC--TG--TTG----T---CCA----C---CGATCATCC-GTC
gi|75090 : tTTT-TA-G-CTCACC---TA--AGC---AAAA-CTCA-AG-ATGAGCTA-CTCTGA-TCG-CC--AG--TTG----T---CTG----T---C
gi|75261 : tTTT-TA-G-CTTACC---AG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTG-TTCTGA-TCG-CC--CG--
gi|75121 : TTT-TA-A-CTCACT---TG--AGC---AAAG-ATCA-AG-GTGAGCTA-TTCTAA-TCT-CC--CT--GTG----T---CCA----T---CG----ACC-GTCt
gi|75095 : tTTT-TA-G-CTCATC---TG--AGC---AAAG-GTCA-AG-GTGAACTA-TTCTGA-TCA-CC--TG--TTG----T---TC
gi|75135 : tTTT-TA-G-CTAACC---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-ATGAGCTA-TTCAGA-CCA-CC--CT--GTG----T---TTA----T---CG----TCC-GTCactttgtccat
gi|75260 : tTTT-TA-T-TTCACC---TG--AGC---AAAG-CTTA-AC-GTGAGCTA-TTCTGA-TTG-CC--C---ATG----T---CCG----T---AG----TCC-GTC
gi|75111 : TTT-TAAG-CTCACC---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TCA-CT--CT--CTC----T---CCA----T---TG----TCC-ATC
gi|75145 : TTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC---AAAG-TTCA-AG-G-GATCTA-TT-CGATTCG-CC--TG--GTT----T-----G----T---CG----TCC-GTC
gi|75139 : tTTT-TA-A-CTCATC---TG--A-C-CAAA-G-CTCA-AG-A-GAGCTA-TTCTAA-TCA-CT--CT--GTG----T---CCG----T---CG----TCC-GT
gi|75113 : tTTT-TAAG-CTCACT---TC--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAACTG-TTCTGA-TTG-CC--TG--TTG----TTCACCGA---T---CA----TCC-GTC
gi|75154 : tTTT-TA-G-TTCACC---TA--AGC---AAAT-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCTTA-TCC-CC--T---GTG----T---TCT----T---CG----TC
gi|75142 : tTTT-TA-G-CTTGCC---TG--AGC---AAAG-CTAA-AT-ATGAGCTA-TTCTGA-TCG-CC--TG--------------------T---CG----TCT-GCC
gi|75136 : tTTTATA-G-CTCACC---TG--AGC-T--AAG-CTCA-AG-CTGAGCTA-TTCTGA-TTT-CC--TT--TTG----T---CTG----TCACCG----TCC-GT
gi|75124 : TTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC---AAAG-CTGA-AG-GTGAAATA-TTCTGA-TAG-CC--CT--ATG----T---TTG----T---C-----TCTCGTC
gi|75165 : tTTT-CA-G-CATACC---TG--AGC--AAATG--TCA-AG-GGGAGCTA-TTCTAA-TCG-CC--TG--TTG----T---CCA----T---Ccgt
gi|75287 : tTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75115 : TT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GCC
gi|75117 : tcTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCATAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CT--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75288 : tcTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-TGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TTG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75289 : TT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TTG-CC--TG--GTG----T---CAG----T---CG----TCC-GTC
gi|75126 : TT-TA-G-CTAACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCATAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75293 : tcTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTAA-TCG-CCTGTG--GTG----T---CCG----T---CG----TTC-ATC
gi|75071 : TT-TA-G-CCCTCC---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TAG-CC--TT--TTG----T---CCG----T---CA----TTC-GT
gi|75290 : tcTT-TA-G-CTCACC---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAACAG-TTCTTA-TCG-CC--TG--TTG----T---
gi|75291 : TT-TG-G-GTC-CC---TT--AGG--AAAAG-CTTA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TCG-CC--TA--TTG----T---CCG----T---CG----TC
gi|75125 : T-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---TG----TCT-GTCc
gi|75100 : ttgT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAA-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75140 : ttgT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAACTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--ATG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75166 : tttaT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CAAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCA----T---CT----TTT-GTC
gi|75127 : tttaT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CTG----T---CG----TCC-ATCgtccgtc
gi|75088 : tttaT-TA-G-CTCACC---TG--AGC-CGAAGG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--TTG----T---CCG----T---TG----TCC-GTC
gi|75168 : tttaT-TA-G-CTCACC---TG--AGT-TGAACG-CTCACAG-GTGAGCTT-TTGTGA-TCG-CC--TG--GTG----T---CCG----T---CG----TCT-G
gi|75070 : ttgT-TA-G-CTCACC---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TCG-AC--TG--TTG----T---CCG----T---CG----TCT-GTC
gi|75079 : tttaT-TG-G-CTCACT---TG--AGC---AAAG-CTCA-AG-GTGAGCTA-TTCTGA-TCG-CC--TG--TTG----T----CG----T---C
gi|75153 : ttgT-TA-G-CTAACA---TG--AGC---AAAA-CTCA-AG-ATGAGCTA-TTTTGA-TCG-CC--TT--GTG----T---CCG----T---TG----TCcatc
gi|75099 : ttaT-TA-G-CTCACC---TT--AAC---AAAG-CTCA--GTGTGAGCTG-TTTTGA-TCG-CC--TA--TTG----T---CCG----T---CG----TTC-GTcat
gi|75106 : ttta-TA-A-CTCACC---TG--AG---AAAAG-CTCA-AG-GTGAGCTG-TTCAGA-TCG-TC--TG--TTG----T---CTG----T---CA----TCA-GTC
gi|75307 : ttttac-TA-A-CTCACC---TA--AGC---AAAG-CTCA-AT-GTGAGCTA-TTCTGA-TTG-CC--T---GTT----T---TCA----T---CA----TCC-GTC
gi|75096 : A-G-CTCACC---TGTGAGC-CTTTAG-CTCA--G-GTGAGCT
gi|75259 : ttttcA-G-CTCACC---TGTGAGC-CTTTAG-CTCA--G-GTGAGCTtttgtgatcgcctggtgtccgtcgtctgtc
gi|75288 : ttttA-G-CTCACC---TGTGAGC-CTTCAG-CTCA--G-GTGAGCTtttgtgatcgcctggtgtccgttgtctgtc
gi|75109 : tttA-G-CTCACC---TGTGAGC-CTTTAG-CTCA--G-GTGAGCTtttgtgattgcctggtgtccgtcgtctgtc
gi|75315 : tttttTCACC---TG--AGC---AAAG-CTTA-AG-GTGAATTA-TTCTGA-TCGGCC--TG---TG----T---CCA----T---CG----TCT-GCCtttgtgatcgcctggtgtccgtcagccgtc
gi|75157 : CACCAGGTG--ATCACAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTG
gi|75287 : tttttagctaacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtctgtcgtctgtc
gi|75094 : tttagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgtcgtctgtc
gi|75110 : tttttagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggcgtccgtcgtctgtc
gi|75081 : ttttatagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgtcgtctgtc
gi|75096 : tttttagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTtgatcgcctggtgtccgtcgtccgt
gi|75125 : ttttcagctcacctgagct-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgtcgtctgtc
gi|75100 : ttgttagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACTT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgttgtctgtc
gi|75259 : ttgttagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTtgatcgcctggtgtccgtcgtctgtc
gi|75137 : ttttagctcacctgagct-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgttgtctgtc
gi|75257 : tttttagctcatctgagc-CAAAAG-CTCACAT-GTGAGCCT-TCGtgttcgcctggtgtccgtcgtctgtc
gi|75093 : ttttagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgtcgtccgtc
gi|75289 : tttttagctcacctgagt-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtctgtcgtccgt
gi|75151 : tttagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACAT-GTGACCTT-TCGtgattgcctggtgtcagtcgtccgtc
gi|75120 : tttttagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgtcatctgtc
gi|75109 : ttttaagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTtgatcgtctggtgtccgtcgtccgt
gi|75138 : tttttagctcacctgagct-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgtcagccgtc
gi|75166 : ttttaaactcatctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgtcgtccgtc
gi|75167 : tttattagctcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccatcttttgtcgtccgtc
gi|75148 : tttttagttcacctgagc-CAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TCG-GA-TCtgattacttggtgtccgttgtccgtc
gi|75112 : tttttagctcacctAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtctgttgtccgt
gi|75105 : tttttagctcacctgagcAAAAG-CTCACCT-GTGAGCCT-TTGtgatcgcctggtgtccgtggtctgtc
gi|75318 : ttttgagctcacctgagcAAAG-CTCA-AG-GTGGGCTA-TTCTGA-TCG-CC--TG--TTG----T---CTA----T---CG----TCC-GCCatgatcgcctggtgtccgtcatccgtc
Alignments
lowQualScore : 11 1
lowQualScore : 0 1 0 33 0 0 1 0 1 0 0 111 11 0000 000 1111111 2222 000 0000
lowQualScore : . . . .. . . . . . . . ... .. .... ... ....... .... ... ....
lowQualScore : 8 2 4 00 0 4 1 4 1 4 4 222 33 9999 777 3333333 3333 777 9999
consensus : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
Reference ( family-148 ) : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75070 : T-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GAC---TG--TTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75071 : tttaTT-TA-G-CCCTCCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TA-GCC---TT--TTG----T---CC-------G----T---CA----TTCGT
gi|75072 : tcTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------G----T---C
gi|75073 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTCA-TC-GCC---TG--TTG----T---TC-------AT---T---CG----T
gi|75074 : tTTT-TA-G-CTTGCCTGAGCAGA--GCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCTGA-TT-GGC---TG--TTG----T---CT-------G----T---CG----TCCATC
gi|75075 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGTTTA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-ACC---TT--TTG----T---CC-------C----T---TG----TCTGT
gi|75076 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TGT-GTG----T---
gi|75078 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75079 : tT-TG-G-CTCACTTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TT------------------G----T---CG----TCCATC
gi|75081 : ttgTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75082 : tTTT-TA-G-TTCGCCTGAGT--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTTA-TC-GCC---TG--TTG----T---GC-------G----T---C
gi|75083 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGT--AAAGCCCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---AC--GTG----T---CC-------G----T---CA----GCCGTC
gi|75084 : tTTT-TA-G-CTCACTTCAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TG--TTG----T---CC-------A----C---CGATCATCCGTC
gi|75085 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75086 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75087 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75088 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------G----T---TG----TCCGTC
gi|75089 : tttaTTT-TA-G-CTGACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCAGA-CC-ACC---TT--GTG----T---TT-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75090 : tTTT-TA-G-CTCACCTAAGC--AAAACTCA-AG-ATGAGCTAC-TCTGA-TC-GCC---AG--TTG----T---CT-------G----T---C
gi|75091 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-CATGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75092 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGG-AG-GTGAGCTAT-TCTGG-TC-GCC---CT--GTG----T---CC-------G----T---C
gi|75093 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGTCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCCGT
gi|75094 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GCG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75095 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAG-CAAAGG-TCA-AG-GTGAACTAT-TCTGA-TC-ACC---TG--TTG----T---TC-------ACT--T---TG----TCCAT
gi|75096 : tTTT-CA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75097 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-ATGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75098 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCTGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75099 : tT-TA-G-CTCACCTTAAC--AAAGCTCA--GTGTGAGCTGT-TTTGA-TC-GCC---TA--TTG----T---CC-------G----T---CG----TTCGT
gi|75100 : tttaT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAA-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75101 : ttgTTT-TA-G-CTCACTTTAGC--AAAGCTCAT-G-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GTT---TG--ATG----T---CC-------A----T---CG----TTGGTC
gi|75102 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TGTCATG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75103 : tTTT-TA-G-CTCACCCTAGT--AAAGCTTA-AG-GTGAGCTCT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTGTTCCT---CT-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75105 : tTTT-GA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TATGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCCGTC
gi|75106 : t-TA-A-CTCACCTGAG--AAAAGCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCAGA-TC-GTC---TG--TTG----T---CT-------G----T---CA----TCAGTC
gi|75109 : ttttacTTT-TA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----GCCGTC
gi|75110 : tTTTATA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75111 : tTTT-TAAG-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-ACT---CT--CTC----T---CC-------A----T---TG----TCCATC
gi|75112 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-T-TGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---GG----TCTGTC
gi|75113 : tTTT-TAAG-CTCACTTCAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TG--TTG----TTCACC-------GA---T---CA----TCCGTC
gi|75114 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGC-TT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75115 : tTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGCC
gi|75117 : tcTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCATAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75118 : tcTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGTCTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75119 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCCTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75120 : tTTT-TAAG-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GTC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75121 : TTT-TA-A-CTCACTTGAGC--AAAGATCA-AG-GTGAGCTAT-TCTAA-TC-TCC---CT--GTG----T---CC-------A----T---CG----ACCGTC
gi|75122 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCCCAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---CG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75123 : tTTT-TA-G-CTCACCCGAGCCGAAGGCTGACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75124 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGA-AG-GTGAAATAT-TCTGA-TA-GCCCTATGT-TTG----T---CT-------C----T---CG----TCCGT
gi|75125 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75126 : ttgTT-TA-G-CTAACCTGAGCCGAAGGCTCATAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75127 : tcT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCCATC
gi|75128 : tttaTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTGACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCCATC
gi|75129 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCTGT
gi|75131 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTAAGCTTT-TGTGA-TC-GCA---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75132 : tTTT-TA-G-TTCATCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGT
gi|75133 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGCCGAAGACTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75135 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-ATGAGCTAT-TCAGA-CC-ACC---CT--GTG----T---TT-------A----T---CG----TCCGTC
gi|75136 : tTTTATA-G-CTCACCTGAGCT--AAGCTCA-AG-CTGAGCTAT-TCTGA-TT-TCC---TT--TTG----T---CT-------G----TCACCG----TCCGT
gi|75137 : TTT-TA-G-CTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGT-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75138 : tTTT-TA-AACTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75139 : TTT-TA-A-CTCATCTGA-CCAAAG-CTCA-AG-A-GAGCTAT-TCTAA-TC-ACT---CT--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75140 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAACTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--ATG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75142 : tttaTTT-TA-G-CTTGCCTGAGC--AAAGCTAA-AT-ATGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TCG----T---CT-------G----C---C
gi|75143 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCAGAAGTCTCACAG-GTGGGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGT
gi|75144 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGTTCACAG-ATGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75145 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGTTCA-AG-G-GATCTAT-T-CGATTC-GCC---TG--GTT----T------------G----T---CG----TCCGTC
gi|75146 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGT--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTTAATGTGG-TC-ACT---TG--GTG----T---CC-------A----T---TG----TCCATC
gi|75148 : tTTT-TA-G-CTCACCTGATCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---TG----TCCGT
gi|75149 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGTTTT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CC-------T----T---CG----TCCGT
gi|75150 : tTTT-TA-G-CTCAAATGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75151 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAAGGTCACAT-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCTGTC
gi|75153 : tT-TA-G-CTAACATGAGC--AAAACTCA-AG-ATGAGCTAT-TTTGA-TC-GCC---TT--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCCAT
gi|75154 : ttaTTT-TA-G-TTCACCTAAGC--AAATCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTTA-TC-CCC---T---GTG----T---TC-------T----T---CG----TC
gi|75155 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAA-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GTT----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75156 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTCAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGTC
gi|75157 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75159 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGATTACAG-GTGAACTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75160 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCCCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--ATG----T---CT-------G----T---AG----TCTGTC
gi|75163 : tTTT-TA-G-TTCACCTGAGC--AAAACTC-CAT-GTGAGCTAA-TCTGA-TC-ACC---AT--GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGT
gi|75164 : tTTT-TA-G-TTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GAG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75165 : tTTT-CA-G-CATACCTGAGC-AAATG-TCA-AG-GGGAGCTAT-TCTAA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------A----T---Cgtccgtc
gi|75166 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CCATCTTTTG----T---CG----TCCGTC
gi|75167 : tttaTTT-TA-G-TTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-ACT---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCCGTC
gi|75168 : tT-TA-G-CTCACCTGAGTTGAACGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTG
gi|75256 : ttgTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAAGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75257 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAT-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75258 : TTT-TA-G-CTCATC-------AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------GTCCAT---CG----TCAGTC
gi|75259 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75260 : TTT-TA-T-TTCACCTGAGC--AAAGCTTA-AC-GTGAGCTAT-TCTGA-TT-GCC---C---ATG----T---CC-------G----T---AG----TCCGTC
gi|75261 : TTT-TA-G-CTTACCAGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCTGA-TC-GCC---CG--
gi|75287 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTCt
gi|75288 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCTGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75289 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CA-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75290 : TT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACAGT-TCTTA-TC-GCC---TG--TTG----T---
gi|75291 : AAAGCTTA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TA--TTG----T---CC-------G----T---CG----TCC
gi|75293 : tttgggtcccttaggaTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTAA-TC-GCCTG-TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TTCATC
gi|75307 : -TA-A-CTCACCTAAGC--AAAGCTCA-AT-GTGAGCTAT-TCTGA-TT-GCC---T---GTT----T---TC-------A----T---CA----TCCGTC
gi|75315 : TCACCTGAGC--AAAGCTTA-AG-GTGAATTAT-TCTGA-TCGGCC---T---GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGCC
gi|75318 : AAAGCTCA-AG-GTGGGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CT-------A----T---CG----TCCGCC
Alignments
lowQualScore : 11 1
lowQualScore : 0 1 0 33 0 0 1 0 1 0 0 111 11 0000 000 1111111 2222 000 0000
lowQualScore : . . . .. . . . . . . . ... .. .... ... ....... .... ... ....
lowQualScore : 8 2 4 00 0 4 1 4 1 4 4 222 33 9999 777 3333333 3333 777 9999
consensus : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
Reference ( family-148 ) : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75070 : T-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GAC---TG--TTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75071 : tttaTT-TA-G-CCCTCCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TA-GCC---TT--TTG----T---CC-------G----T---CA----TTCGT
gi|75072 : tcTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------G----T---C
gi|75073 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTCA-TC-GCC---TG--TTG----T---TC-------AT---T---CG----T
gi|75074 : tTTT-TA-G-CTTGCCTGAGCAGA--GCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCTGA-TT-GGC---TG--TTG----T---CT-------G----T---CG----TCCATC
gi|75075 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGTTTA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-ACC---TT--TTG----T---CC-------C----T---TG----TCTGT
gi|75076 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TGT-GTG----T---
gi|75078 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75079 : tT-TG-G-CTCACTTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TT------------------G----T---CG----TCCATC
gi|75081 : ttgTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75082 : tTTT-TA-G-TTCGCCTGAGT--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTTA-TC-GCC---TG--TTG----T---GC-------G----T---C
gi|75083 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGT--AAAGCCCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---AC--GTG----T---CC-------G----T---CA----GCCGTC
gi|75084 : tTTT-TA-G-CTCACTTCAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TG--TTG----T---CC-------A----C---CGATCATCCGTC
gi|75085 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75086 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75087 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75088 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------G----T---TG----TCCGTC
gi|75089 : tttaTTT-TA-G-CTGACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCAGA-CC-ACC---TT--GTG----T---TT-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75090 : tTTT-TA-G-CTCACCTAAGC--AAAACTCA-AG-ATGAGCTAC-TCTGA-TC-GCC---AG--TTG----T---CT-------G----T---C
gi|75091 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-CATGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75092 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGG-AG-GTGAGCTAT-TCTGG-TC-GCC---CT--GTG----T---CC-------G----T---C
gi|75093 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGTCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCCGT
gi|75094 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GCG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75095 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAG-CAAAGG-TCA-AG-GTGAACTAT-TCTGA-TC-ACC---TG--TTG----T---TC-------ACT--T---TG----TCCAT
gi|75096 : tTTT-CA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75097 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-ATGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75098 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCTGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75099 : tT-TA-G-CTCACCTTAAC--AAAGCTCA--GTGTGAGCTGT-TTTGA-TC-GCC---TA--TTG----T---CC-------G----T---CG----TTCGT
gi|75100 : tttaT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAA-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75101 : ttgTTT-TA-G-CTCACTTTAGC--AAAGCTCAT-G-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GTT---TG--ATG----T---CC-------A----T---CG----TTGGTC
gi|75102 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TGTCATG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75103 : tTTT-TA-G-CTCACCCTAGT--AAAGCTTA-AG-GTGAGCTCT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTGTTCCT---CT-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75105 : tTTT-GA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TATGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCCGTC
gi|75106 : t-TA-A-CTCACCTGAG--AAAAGCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCAGA-TC-GTC---TG--TTG----T---CT-------G----T---CA----TCAGTC
gi|75109 : ttttacTTT-TA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----GCCGTC
gi|75110 : tTTTATA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75111 : tTTT-TAAG-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-ACT---CT--CTC----T---CC-------A----T---TG----TCCATC
gi|75112 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-T-TGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---GG----TCTGTC
gi|75113 : tTTT-TAAG-CTCACTTCAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TG--TTG----TTCACC-------GA---T---CA----TCCGTC
gi|75114 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGC-TT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75115 : tTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGCC
gi|75117 : tcTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCATAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75118 : tcTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGTCTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75119 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCCTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75120 : tTTT-TAAG-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GTC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75121 : TTT-TA-A-CTCACTTGAGC--AAAGATCA-AG-GTGAGCTAT-TCTAA-TC-TCC---CT--GTG----T---CC-------A----T---CG----ACCGTC
gi|75122 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCCCAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---CG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75123 : tTTT-TA-G-CTCACCCGAGCCGAAGGCTGACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75124 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGA-AG-GTGAAATAT-TCTGA-TA-GCCCTATGT-TTG----T---CT-------C----T---CG----TCCGT
gi|75125 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75126 : ttgTT-TA-G-CTAACCTGAGCCGAAGGCTCATAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75127 : tcT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCCATC
gi|75128 : tttaTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTGACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCCATC
gi|75129 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCTGT
gi|75131 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTAAGCTTT-TGTGA-TC-GCA---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75132 : tTTT-TA-G-TTCATCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGT
gi|75133 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGCCGAAGACTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75135 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-ATGAGCTAT-TCAGA-CC-ACC---CT--GTG----T---TT-------A----T---CG----TCCGTC
gi|75136 : tTTTATA-G-CTCACCTGAGCT--AAGCTCA-AG-CTGAGCTAT-TCTGA-TT-TCC---TT--TTG----T---CT-------G----TCACCG----TCCGT
gi|75137 : TTT-TA-G-CTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGT-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75138 : tTTT-TA-AACTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75139 : TTT-TA-A-CTCATCTGA-CCAAAG-CTCA-AG-A-GAGCTAT-TCTAA-TC-ACT---CT--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75140 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAACTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--ATG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75142 : tttaTTT-TA-G-CTTGCCTGAGC--AAAGCTAA-AT-ATGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TCG----T---CT-------G----C---C
gi|75143 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCAGAAGTCTCACAG-GTGGGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGT
gi|75144 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGTTCACAG-ATGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75145 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGTTCA-AG-G-GATCTAT-T-CGATTC-GCC---TG--GTT----T------------G----T---CG----TCCGTC
gi|75146 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGT--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTTAATGTGG-TC-ACT---TG--GTG----T---CC-------A----T---TG----TCCATC
gi|75148 : tTTT-TA-G-CTCACCTGATCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---TG----TCCGT
gi|75149 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGTTTT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CC-------T----T---CG----TCCGT
gi|75150 : tTTT-TA-G-CTCAAATGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75151 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAAGGTCACAT-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCTGTC
gi|75153 : tT-TA-G-CTAACATGAGC--AAAACTCA-AG-ATGAGCTAT-TTTGA-TC-GCC---TT--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCCAT
gi|75154 : ttaTTT-TA-G-TTCACCTAAGC--AAATCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTTA-TC-CCC---T---GTG----T---TC-------T----T---CG----TC
gi|75155 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAA-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GTT----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75156 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTCAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGTC
gi|75157 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75159 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGATTACAG-GTGAACTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75160 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCCCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--ATG----T---CT-------G----T---AG----TCTGTC
gi|75163 : tTTT-TA-G-TTCACCTGAGC--AAAACTC-CAT-GTGAGCTAA-TCTGA-TC-ACC---AT--GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGT
gi|75164 : tTTT-TA-G-TTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GAG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75165 : tTTT-CA-G-CATACCTGAGC-AAATG-TCA-AG-GGGAGCTAT-TCTAA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------A----T---Cgtccgtc
gi|75166 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CCATCTTTTG----T---CG----TCCGTC
gi|75167 : tttaTTT-TA-G-TTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-ACT---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCCGTC
gi|75168 : tT-TA-G-CTCACCTGAGTTGAACGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTG
gi|75256 : ttgTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAAGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75257 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAT-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75258 : TTT-TA-G-CTCATC-------AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------GTCCAT---CG----TCAGTC
gi|75259 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75260 : TTT-TA-T-TTCACCTGAGC--AAAGCTTA-AC-GTGAGCTAT-TCTGA-TT-GCC---C---ATG----T---CC-------G----T---AG----TCCGTC
gi|75261 : TTT-TA-G-CTTACCAGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCTGA-TC-GCC---CG--
gi|75287 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTCt
gi|75288 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCTGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75289 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CA-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75290 : TT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACAGT-TCTTA-TC-GCC---TG--TTG----T---
gi|75291 : AAAGCTTA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TA--TTG----T---CC-------G----T---CG----TCC
gi|75293 : tttgggtcccttaggaTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTAA-TC-GCCTG-TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TTCATC
gi|75307 : -TA-A-CTCACCTAAGC--AAAGCTCA-AT-GTGAGCTAT-TCTGA-TT-GCC---T---GTT----T---TC-------A----T---CA----TCCGTC
gi|75315 : TCACCTGAGC--AAAGCTTA-AG-GTGAATTAT-TCTGA-TCGGCC---T---GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGCC
gi|75318 : AAAGCTCA-AG-GTGGGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CT-------A----T---CG----TCCGCC
blockSeqs : A AG C A C CTA TC ATCTTTT TCCA
blockSeqs : A CG C A C TG T . CT
blockSeqs : A CA C A C . T . T
blockSeqs : . CG C G C . . . A
blockSeqs : . CG C A C . . . .
blockSeqs : . CG C G C . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CA C A C . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . CA C A C . . . .
blockSeqs : . CA C A C . . . .
blockSeqs : . TA C G C . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . TG T T G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CA C A C . . . .
blockSeqs : . TA C A C . . . .
blockSeqs : . CA C T A . . . .
blockSeqs : . CA C A C . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG T T G . . . .
blockSeqs : . CA C A C . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . CA C G T . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CA T A C . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C C C . . . .
blockSeqs : . CG C T A . . . .
blockSeqs : . CG C G C . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C A C . . . .
blockSeqs : . CA C T C . . . .
blockSeqs : . CA C G G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . AG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T C . . . .
blockSeqs : . CG C A G . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T C . . . .
blockSeqs : . CA C A G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CG C T G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . TG C T G . . . .
blockSeqs : . CA C T C . . . .
blockSeqs : . CG C A C . . . .
blockSeqs : . TA C A G . . . .
blockSeqs : . CA C T G . . . .
blockSeqs : . TG C T C . . . .
blockSeqs : . CA C A G . . . .
blockSeqs : . CG . T C . . . .
blockSeqs : . A . A G . . . .
blockSeqs : . T . T G . . . .
blockSeqs : . A . T G . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T T . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . A C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . A C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . A G . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . .
blockSeqs : . . . T G . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . . G G . . . .
blockSeqs : . . . A C . . . .
blockSeqs : . . . T C . . . .
blockSeqs : . . A C . .
blockSeqs : . A . . .
blockSeqs : . A . . .
blockSeqCons : CG
originalCons : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
finalCons : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
Alignments
lowQualScore : 11 1
lowQualScore : 0 1 0 33 0 0 1 0 1 0 0 111 11 0000 000 1111111 2222 000 0000
lowQualScore : . . . .. . . . . . . . ... .. .... ... ....... .... ... ....
lowQualScore : 8 2 4 00 0 4 1 4 1 4 4 222 33 9999 777 3333333 3333 777 9999
consensus : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
Reference ( family-148 ) : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75070 : T-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GAC---TG--TTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75071 : tttaTT-TA-G-CCCTCCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TA-GCC---TT--TTG----T---CC-------G----T---CA----TTCGT
gi|75072 : tcTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------G----T---C
gi|75073 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTCA-TC-GCC---TG--TTG----T---TC-------AT---T---CG----T
gi|75074 : tTTT-TA-G-CTTGCCTGAGCAGA--GCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCTGA-TT-GGC---TG--TTG----T---CT-------G----T---CG----TCCATC
gi|75075 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGTTTA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-ACC---TT--TTG----T---CC-------C----T---TG----TCTGT
gi|75076 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TGT-GTG----T---
gi|75078 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75079 : tT-TG-G-CTCACTTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TT------------------G----T---CG----TCCATC
gi|75081 : ttgTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75082 : tTTT-TA-G-TTCGCCTGAGT--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTTA-TC-GCC---TG--TTG----T---GC-------G----T---C
gi|75083 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGT--AAAGCCCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---AC--GTG----T---CC-------G----T---CA----GCCGTC
gi|75084 : tTTT-TA-G-CTCACTTCAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TG--TTG----T---CC-------A----C---CGATCATCCGTC
gi|75085 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75086 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75087 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75088 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------G----T---TG----TCCGTC
gi|75089 : tttaTTT-TA-G-CTGACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCAGA-CC-ACC---TT--GTG----T---TT-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75090 : tTTT-TA-G-CTCACCTAAGC--AAAACTCA-AG-ATGAGCTAC-TCTGA-TC-GCC---AG--TTG----T---CT-------G----T---C
gi|75091 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-CATGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75092 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGG-AG-GTGAGCTAT-TCTGG-TC-GCC---CT--GTG----T---CC-------G----T---C
gi|75093 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGTCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCCGT
gi|75094 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GCG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75095 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAG-CAAAGG-TCA-AG-GTGAACTAT-TCTGA-TC-ACC---TG--TTG----T---TC-------ACT--T---TG----TCCAT
gi|75096 : tTTT-CA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75097 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-ATGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75098 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCTGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75099 : tT-TA-G-CTCACCTTAAC--AAAGCTCA--GTGTGAGCTGT-TTTGA-TC-GCC---TA--TTG----T---CC-------G----T---CG----TTCGT
gi|75100 : tttaT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAA-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75101 : ttgTTT-TA-G-CTCACTTTAGC--AAAGCTCAT-G-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GTT---TG--ATG----T---CC-------A----T---CG----TTGGTC
gi|75102 : tTTT-TA-G-CTCATCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TGTCATG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75103 : tTTT-TA-G-CTCACCCTAGT--AAAGCTTA-AG-GTGAGCTCT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTGTTCCT---CT-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75105 : tTTT-GA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TATGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCCGTC
gi|75106 : t-TA-A-CTCACCTGAG--AAAAGCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCAGA-TC-GTC---TG--TTG----T---CT-------G----T---CA----TCAGTC
gi|75109 : ttttacTTT-TA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----GCCGTC
gi|75110 : tTTTATA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75111 : tTTT-TAAG-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-ACT---CT--CTC----T---CC-------A----T---TG----TCCATC
gi|75112 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-T-TGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---GG----TCTGTC
gi|75113 : tTTT-TAAG-CTCACTTCAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACTGT-TCTGA-TT-GCC---TG--TTG----TTCACC-------GA---T---CA----TCCGTC
gi|75114 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGC-TT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75115 : tTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGCC
gi|75117 : tcTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCATAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75118 : tcTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGTCTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75119 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCCTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75120 : tTTT-TAAG-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GTC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75121 : TTT-TA-A-CTCACTTGAGC--AAAGATCA-AG-GTGAGCTAT-TCTAA-TC-TCC---CT--GTG----T---CC-------A----T---CG----ACCGTC
gi|75122 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCCCAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---CG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75123 : tTTT-TA-G-CTCACCCGAGCCGAAGGCTGACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75124 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTGA-AG-GTGAAATAT-TCTGA-TA-GCCCTATGT-TTG----T---CT-------C----T---CG----TCCGT
gi|75125 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75126 : ttgTT-TA-G-CTAACCTGAGCCGAAGGCTCATAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75127 : tcT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCCATC
gi|75128 : tttaTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTGACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCCATC
gi|75129 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCTGT
gi|75131 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTAAGCTTT-TGTGA-TC-GCA---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75132 : tTTT-TA-G-TTCATCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGT
gi|75133 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGCCGAAGACTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75135 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-ATGAGCTAT-TCAGA-CC-ACC---CT--GTG----T---TT-------A----T---CG----TCCGTC
gi|75136 : tTTTATA-G-CTCACCTGAGCT--AAGCTCA-AG-CTGAGCTAT-TCTGA-TT-TCC---TT--TTG----T---CT-------G----TCACCG----TCCGT
gi|75137 : TTT-TA-G-CTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGT-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75138 : tTTT-TA-AACTCATCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75139 : TTT-TA-A-CTCATCTGA-CCAAAG-CTCA-AG-A-GAGCTAT-TCTAA-TC-ACT---CT--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGT
gi|75140 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAACTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--ATG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75142 : tttaTTT-TA-G-CTTGCCTGAGC--AAAGCTAA-AT-ATGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TCG----T---CT-------G----C---C
gi|75143 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCAGAAGTCTCACAG-GTGGGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGT
gi|75144 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGTTCACAG-ATGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75145 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGTTCA-AG-G-GATCTAT-T-CGATTC-GCC---TG--GTT----T------------G----T---CG----TCCGTC
gi|75146 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGT--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTTAATGTGG-TC-ACT---TG--GTG----T---CC-------A----T---TG----TCCATC
gi|75148 : tTTT-TA-G-CTCACCTGATCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CT-------G----T---TG----TCCGT
gi|75149 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGTTTT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CC-------T----T---CG----TCCGT
gi|75150 : tTTT-TA-G-CTCAAATGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75151 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAAGGTCACAT-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CA----TCTGTC
gi|75153 : tT-TA-G-CTAACATGAGC--AAAACTCA-AG-ATGAGCTAT-TTTGA-TC-GCC---TT--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCCAT
gi|75154 : ttaTTT-TA-G-TTCACCTAAGC--AAATCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTTA-TC-CCC---T---GTG----T---TC-------T----T---CG----TC
gi|75155 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAA-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GTT----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75156 : tTTT-TA-A-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTCAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGTC
gi|75157 : tTTT-TA-G-CTAACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-ACC---TG--GTG----T---CT-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75159 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGATTACAG-GTGAACTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75160 : tTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCCCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--ATG----T---CT-------G----T---AG----TCTGTC
gi|75163 : tTTT-TA-G-TTCACCTGAGC--AAAACTC-CAT-GTGAGCTAA-TCTGA-TC-ACC---AT--GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGT
gi|75164 : tTTT-TA-G-TTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCT---TG--GAG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75165 : tTTT-CA-G-CATACCTGAGC-AAATG-TCA-AG-GGGAGCTAT-TCTAA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------A----T---Cgtccgtc
gi|75166 : tT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CCATCTTTTG----T---CG----TCCGTC
gi|75167 : tttaTTT-TA-G-TTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-ACT---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCCGTC
gi|75168 : tT-TA-G-CTCACCTGAGTTGAACGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTG
gi|75256 : ttgTTT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAAGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75257 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAT-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75258 : TTT-TA-G-CTCATC-------AAAGCTCA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CC-------GTCCAT---CG----TCAGTC
gi|75259 : TTT-TA-G-CTCACCTGAGCTAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---TG----TCTGTC
gi|75260 : TTT-TA-T-TTCACCTGAGC--AAAGCTTA-AC-GTGAGCTAT-TCTGA-TT-GCC---C---ATG----T---CC-------G----T---AG----TCCGTC
gi|75261 : TTT-TA-G-CTTACCAGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAGCTGT-TCTGA-TC-GCC---CG--
gi|75287 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TC-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTCt
gi|75288 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCTGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TCTGTC
gi|75289 : TT-TA-G-CTCACCTGAGCCAAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTGA-TT-GCC---TG--GTG----T---CA-------G----T---CG----TCCGTC
gi|75290 : TT-TA-G-CTCACCTGAGC--AAAGCTCA-AG-GTGAACAGT-TCTTA-TC-GCC---TG--TTG----T---
gi|75291 : AAAGCTTA-AG-GTGAGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TA--TTG----T---CC-------G----T---CG----TCC
gi|75293 : tttgggtcccttaggaTT-TA-G-CTCACCTGAGCCGAAGGCTCACAG-GTGAGCTTT-TGTAA-TC-GCCTG-TG--GTG----T---CC-------G----T---CG----TTCATC
gi|75307 : -TA-A-CTCACCTAAGC--AAAGCTCA-AT-GTGAGCTAT-TCTGA-TT-GCC---T---GTT----T---TC-------A----T---CA----TCCGTC
gi|75315 : TCACCTGAGC--AAAGCTTA-AG-GTGAATTAT-TCTGA-TCGGCC---T---GTG----T---CC-------A----T---CG----TCTGCC
gi|75318 : AAAGCTCA-AG-GTGGGCTAT-TCTGA-TC-GCC---TG--TTG----T---CT-------A----T---CG----TCCGCC