lowQualScore : 1111 111 4444444444444444
lowQualScore : 444 1111 4444 1 11111 0 4 0 0 00 444 00 88 3 2222222222 111 0 22222222222 00 1111111 0 0 88 0 888 666 222 555 3 111 00 0 2222222222222222
lowQualScore : ... .... .... . ..... . . . . .. ... .. .. . .......... ... . ........... .. ....... . . .. . ... ... ... ... . ... .. . ................
lowQualScore : 777 0000 3333 0 22222 5 9 5 5 77 111 77 11 3 0000000000 666 5 22222222222 66 5555555 5 9 00 5 000 111 444 666 6 555 77 6 2222222222222222
consensus : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTA
Reference ( gi|134329 ) : CCTGTCTTAAGCAGCCA--TA----TTT--T-CTA-T-----TTC-CTATTTCT-ATG--CTTT-A-A--GAGT-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-ATT-CT--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTA
gi|134305 : CCTGTCTTAAGCAACCA--TA----TTT--TTCTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAGT-AAA-TTAATCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-ATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134305 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--ta
gi|134304 : cctgtcttaagcaaccatatttttctatttcccatttctatgctttcagagtaaattaatctgtattaagcaacaacctgtcttaaaaggccacttttgctcattcccttgacCCTGTCTTAAGCAACCA--TA----TTT--T-CTA-T-----TCC-CTATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAGT-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-ATT-CC--CTTGACTT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttttgactgtatata
gi|134297 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134286 : cttttcttaagcagccacatttgctatttcccatttctatgttttcagagcaaattaacctgtattaagcaacaacttgtcttaaaaggccacatttgcttattcccttaacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTC--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTTACCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTTGCT---G--TA-TA---tttagctgtatatgagatatgaac
gi|134286 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--tga
gi|134459 : cttgtcttaagcagccacattcgctatttcccatttctatgttttcagagcaaatttacctgtatcaagcaacaacctgtcttaaaaggccatttttgctccttcccttgacCCTGTCTTAAGCAGCCA--ttttgctgtatatga
gi|134274 : ttgtcttaagcagccacatttgctatttcccatttctatgctttcagaccaaattaacctgtattaaccaacaacctgtcttaaaatgccacttttgctcatgtccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAAC-AAT-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGT-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTAACT---G--TA-TA---tttgactgtatattatttaaatta
gi|134316 : CCTATCTTAAACAGCCA--TA----TTT--T-TTG-T-----TTC-CCATTTAT-ATG--CTTT-T-A--GAGT-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAATCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TA-CTT-CC--CCTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---tggtatgttcaatttcttcaaaaatatattaaaaaaatgactcaatct
gi|134316 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--t
gi|134303 : cctatcttaaacagccatattttttgtttcccatttatatgcttttagagtaaattaacctgtattaagcaatcacctgtcttaaaaggccacttttgctacttcccctgacCTTGTCTTAAGCAGTCA--TA----TTT--G-TTA-T-----TTC-CGATTTAT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTATGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttttgactgtacat
gi|134312 : CTTATTTTAAGCAGCCA--CA----TTC--G-CCA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCG-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134312 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--ttaata
gi|134276 : cttattttaagcagccacattcgccatttcccatttctatgttttcagagcaaatttacctgtattaagcaacaacctgtcgtaaaaggccacttttgctccttcccttgacCTTGTTTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-C-----TTC-CCATTTCT-ATA--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACATCC---TG-TCT-----------C--AAA-------AGGCCAC-TATTGC-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-TA---tttgactgtatattaata
gi|134327 : CTTGTCTTAAGCAACCA--CA----TTA--G-CTA-T-----ATC-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-ATT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAATCAGGTTTGACT---G--TA-T-----TT-------A--AACATTAtgcaatgcatggttgctatttgacttctggcataaggtaataatacataccatcta
gi|134302 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTA--G-CTA-T-----TTC-GCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAC-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAGCC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGC-TC-ATT-CC--CTTGACTG---GCTT---C---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ttttcatattaattgaatatgttgaaaa
gi|134277 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTC--G-CTA-T-----TTC-CCATGTCT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TATGGC-TC-CTT-CA--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ATtagtat
gi|134277 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--a
gi|134322 : cttgtcttaagcagccacattcgctatttcccatgtctatgttttcagagcaaatttacctgtattaagcaacaatctgtcttaaaaggccactatggctccttcacttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----ATC-TTATTTTT-ATG--CTTT-T-A--GTGT-AAC-TTTACCTG----------TATTAAGCAGCAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-ATT--T--CTTGACTG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-tttgactgtataata
gi|134283 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--TA----TTT--G-GTA-T-----TTC-CCATTTCT-AAG--CCTT-C-A--GGGA-AAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------GGGTCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTGACTA---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---gtatcattgactaattcagtcattatt
gi|134287 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTA--G-CTA-T-----TTC-CCATTTTT-ATG--CTTT-T-A--TAGC-AAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTAC-TC-CTT-TC--CTGGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tt
gi|134293 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTA--A-TTA-T-----TTC-CCATTGCT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTAC-TC-CTT-CC--CTGGTTTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--TA-Tgt
gi|134293 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--gtgtatattca
gi|134336 : cttgtcttaagcagccacattaattatttcccattgctatgttttcagagcaaattaacctgtatcaagcaacaacctgtcttaaaaggccacttttactccttccctggttCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTC--A-CTT-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------TAAAAA-------AGGCCAC-TTTTAC-TT-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---GTTTA-TA---Gtttggctgtatgtgtatattca
gi|134336 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--catcatt
gi|134279 : cttgtcttaagcagccacattcactttttcccatttctatgttttcagagcaaatttacctgtattaagcaacaacttgtcttaaaaaaggccacttttacttcttcccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--TA----TTT--G-CTA-T-----TTT-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAGT-AAA-TTAGCCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCTTACATACAGTAT--AAA-------AGGCCAC-TCTCAC-TC-CAT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--tttgactgtttatagcatcatt
gi|134279 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134291 : cttgtcttaagcagccatatttgctattttccatttctatgctttcagagtaaattagcctgtattaagcaacaacctgtcttacatacagtataaaaggccactctcactccatcccttgacCCTGTTTTAAGCAGCCA--TA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATT-CT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-CTAACCTA----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGG-TC-CTA-CC--TTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--Ttttgactg
gi|134291 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--tga
gi|134284 : cctgttttaagcagccatatttgctatttcccattctatgttttcagagcaaactaacctatattaagcaacaacctgtcttaaaaggccacttttggtcctacctttcacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TGC--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTTACCTG----------TCTTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-GTT-C---CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--tttgactgttga
gi|134284 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134308 : cttgtcttaagcagccacatgcgctatttcccatttctatgttttcagagcaaatttacctgtcttaagcaacaacatgtcttaaaaggccacttttgctcgttccttaacCTTGTCTTAAGCAGCCA--TA----TTT--G-CTT-T-----TTC-CCATTTGT-ATG--CTAA-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAGCT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTATGC-TC-CTT-CC--CTTGGCTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttttgactg
gi|134308 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134263 : cttgtcttaagcagccatatttgctttttcccatttgtatgctaacagagcaaattaacctgtattaaacaacagcttgtcttaaaaggccacttatgctccttcccttggcCTTGTGTTAAGCAGCCA--CA----TAT--G-CCA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTCATCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttttgactgtat
gi|134263 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--tggatctacaca
gi|134256 : cttgtgttaagcagccacatatgccatttcccatttctatgttttcagagcaaattaacctgtattcatcaaccacctgtcttaaaaggccacttttgctccttcccttcacCTTGTCTTAAACAGCCA--CA----TTT--T-C-------------CCATTTCT-ATG--CTTT-T-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGACAT-TTTTGT-CC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--tttgactgtattggatctacaca
gi|134256 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134301 : cttgtcttaaacagccacattttcccatttctatgcttttagagcaaattaacctgtattaagcaacaatctgtcttaaaaggacatttttgtcccttcccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-TTA-T-----TTC-CCATTTTT-ATA--CTTT-T-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCTT-TTTTGC-TC-ATT-CC--ACTGACTG---GCTG---C---TTAAGAAACGTTTGACT---G--TA-Ttttggctg
gi|134292 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATTTAT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTGATCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CATGACTG---ACTA---C---TTAAGCCAGGTGTGACT---G--
gi|134266 : CTTGTGTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCGTTTCT-ATA--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGC-TA-ATT-CC--CTTGAATG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--
gi|134266 : CCTGTCTTAAGCAACCA--Tatttaaaataattgtaatattgcaattattaatat
gi|134334 : cttgtgttaagcagccacatttgctatttcccgtttctatactttcagagcaaattaacctgtatttagcaacaacatgtcttaaaaggtcacttttgctaattcccttgaCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTT-CAATTTTTTATG--CTTT-T-A--GAAC-AAA-TTAACCTG----------CATTAAGCAAAAACC---TG-CTT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTGC-CC-ATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGATAGGTTTGACT---G--TA-Ttttgactgatttaaaataattgtaatattgcaattattaatat
gi|134335 : CCTGTCTTAAGCAGTCC--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATTGTT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TA-TCT-----------T--AAA-------AGATCAT-TTTTGCTTC-A-T-CC--CTCGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tgtatta
gi|134335 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--tataat
gi|134461 : cctgtcttaagcagtcccatttgctatttcccattgttatgttttcagagcaaattaacctgtattaagcaacaacctatcttaaaagatcatttttgcttcatccctcgacCCTGTCTTAAGCAGCCA--tttgactgtattataat
gi|134299 : ttgtcttaagcagccacatttgctatttctgattgctatgcgttcagaccaaattaacgtgtattaaacaacaacctttcttaaagggccacttttgctcctttccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--TA----TTT--A-CTA-T-----ATC-CCATGTTC-ATA--CTTT-C-A--GTGC-AAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCTAC-TTTCAC-TC-ATT-CC--CTTGACTG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTAACT---G--TA-TA---tttgactgtatataa
gi|134328 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--TA----TTT--G-TTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-A-ATCTAGC-AAA-TTTACCTG----------TATCAAACAACAACC---TG-TAT-----------T--AAA-------AGGCCATGTTTTTC-TC-CTT-CC--CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ctagtatacatactgtatttatcac
gi|134328 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--tagt
gi|134320 : cttgtcttaagcagccatatttgttatttcccatttctatgctttaatctagcaaatttacctgtatcaaacaacaacctgtattaaaaggccatgtttttctccttcccatgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTC--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG---TTT-C-A--GGGC-AAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------GGGCCAC-ATTTGC-TT-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGtttgactgtatatagt
gi|134320 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134278 : cttgtcttaagcagccacattcgctatttcccatttctatgtttcagggcaaatttacctgtattaagcaacaacctgtcttaaagggccacatttgcttcttcccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCG--CA----TTT--A-ATA-T-----TTC-TCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GGGC-AAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCGCC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACTTC-A--TA-TA---GTtttg
gi|134278 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--atatacat
gi|134289 : cttgtcttaagcagccgcatttaatatttctcatttctatgttttcagggcaaagtaacctgtattaagcaaccgcctgtcttaaaagaccacttttgctccttcccttaacCTTGTCTTAAACAGTCA--CA----TTT--G-TT--T-----TTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-T-A--CAGC-AAA-TTAAACTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGT-CC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGCTTGACT---G--tttgacttcatatagtatatacat
gi|134289 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134270 : cttgtcttaaacagtcacatttgtttttcccatttctatgcttttacagcaaattaaactgtattaagcaacaacctgtcttaaaaggccacttttgtcccttcccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATTTAT-ATG--CTTT-C-A--GTAC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T---AA-------AGGCCAT-TTTTGC-TC-CTT-CC--ACTGAGTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---cttgactg
gi|134270 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--acagtacat
gi|134331 : cttgtcttaagcagccacatttgctatttcccatttatatgctttcagtacaaattaacctgtattaagcaacaatctgtcttaaaggccatttttgctccttccactgagCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TAT--G-CTA-T-----ATC-CCATTTCT-AAG--CTTT-C-A--TAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------TAGCCAC-TTTT-C-TC-CTT-CC--CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttttgactgtacaacagtacat
gi|134331 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--ttacattaatttcgtta
gi|134288 : cttgtcttaagcagccacatatgctatatcccatttctaagctttcatagcaaattaacctgtattaagcaacaacctgtcttaaatagccacttttctccttcccatgacCTTGTGTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-TTA-T-----TTC-CCATTTAT-ATG--CCTT-A-A--GATC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAAAC---TG-TCT-----------T---AA-------AGACCAC-TTTTGC-TC-CTT-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--CA-tttgactgtatttacattaatttcgtta
gi|134288 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--gata
gi|134275 : cttgtgttaagcagccacatttgttatttcccatttatatgccttaagatcaaattaacctgtattaaacaacaaactgtcttaaagaccacttttgctcctttccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--A-ATA-T-----TTT-CCATTTTC-ATG--CTTT-C-A--TAGC-AAA-TAAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAC-------AGGCCAC-TTTTGT-TC-CTT-CC--CTTGACTG---ACTG---C---TTAATGCAGGTTTGACT---G--TA-TA---tttgactgcagata
gi|134281 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-TTA-T-----TTC-CCATGTAT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAA-G-AACTTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTTGC-TA-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-taatatcaaactctcacatatgctgttgtgcaaa
gi|134281 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--atgt
gi|134330 : cttgtcttaagcagccacatttgttatttcccatgtatatgctttcagagcaaagaacttgcattaaacaacaacctgtcttaaaaggccatttttgctacttcccttgacCTTATCTTAAACAGCCA--AA----TTT--T-TT--------TCC-CCAGT-CT-ATG--CTTT-T-A--GAGT-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-CC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--tttgactgtaatgt
gi|134330 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134271 : cttatcttaaacagccaaatttttttccccagtctatgcttttagagtaaattaacctgtattaagcaacaatatgtcttaaaaggccacttttgccccttcccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----ATG----CTA-T-----GTC-CCATTTTT-ATA--TTTT-C-A--GGGA-AAA-TTAATCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACAAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttttgactg
gi|134271 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--tattaatat
gi|134326 : cttgtcttaagcagccacaatgctatgtcccatttttatattttcagggaaaattaatctgtatcaagcaacaacctgtcttaaaagacaacttttgctccttcccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----ATC-CCATTTTT-ATG--CTTT-C-A--GTGC-AAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAGCC---TC-CCA-----------T--AAA-------AGGTCAA-TTTTGC-TT-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttttgactgtattattaatat
gi|134326 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--gtagatatttaaaattactatta
gi|134295 : cttgtcttaagcagccacatttgctatatcccatttttatgctttcagtgcaaattcacctgtattaagcaacagcctcccataaaaggtcaattttgcttcttcccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTC--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GACC-AAA-TTTACATG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC--TTTAT-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TAAAGACAGGTTTGACT---G--TAGTA---Gtttgactgtatgtagatatttaaaattactatta
gi|134310 : CTTGTGTTAAGCAGCCG--CA----TAT--G-CTA-T-----TTC-ATATTTCG-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTC----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCGC-TTTCAT-TT-ATT-CC--CTTGACTG---ACTG---T---TTAAGACAGGTTTGACT---G--gaatatg
gi|134294 : CTTGTCTTAAGCAGTCA--AA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATATCT---G--CTTC-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--TTTGGCTG---GCTT---C---TTAAGACAGGTTTG
gi|134273 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--TA----TCT--G-CT--T-----TTC-CCATTTCT-ATGTGCTT----A--GAAC-AAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTAA-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---aatataatattatgtacaatcttaattttattacactgctgaaaataaa
gi|134273 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--aaaatataa
gi|134298 : cttgtcttaagcagccatatctgcttttcccatttctatgtgcttagaacaaagtaacctgtattaagcaaccacttgtcttaaaaggccacttttaatccttcccttgacCTTGTCTTAAGCAGCCA--TA----ATT--G-TTA-T-----TTC-CCATTTAT-ATA--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCTAC-TTTTGC-TC--TT-CC--CTTGACTG---TCTG---C---GTAAGACAGGTTTGACT---G--tttgactaaaatataa
gi|134315 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--CA----CTT--G-TTA-T-----TTC-ACATTTAT-ATG--CTTA-C-A--AAGC-AAA-TTGATCTG----------TATTAAGCAAAAATC---TG-TCC-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TCTATT-C---CTTGATTG---GCTG---T---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-T
gi|134317 : CTTGTCTTGAGCAGCCA--CA----TTG--G--TA-T-----ATC-CCATTTCG-ATT--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTCATCTG----------TATTCAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTGACT---G--ttattttacacgaatta
gi|134333 : CTTGTCTTAACCAGCCA--CA----TTT--G-TGA-T-----TTC-CCATTTAT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAATC---TT-TCA-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-AC-CTT-CC--CTTTACTG---TCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-T
gi|134282 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-TTA-T-----TTC-CCATTAAG-GTG--CTTT-C-A--GGGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAC-TTTTGC-TT-CTT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTttaat
gi|134282 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--
gi|134280 : cttgtcttaagcagccacatttgttatttcccattaaggtgctttcagggcaaattaacctgtattaaacaacaacctgtcttaagaggtcacttttgcttcttcccttcacCTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----CTT------A-T-----C-----ATTTCC-ATG--CTTT-C-A--TGGC-AAA-CTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGCCAC--TTTGC-TT-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGATAGGTTTGACT---G--TA-Tttt
gi|134318 : CTTGTTCTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-ATA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTATCCTG----------TATTAAGCTACAACC---TG-TCT-----------T---AA-------AGGCCAT-TTTTGT-TC-ATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TAAATACCGGTTTGATTTTAA--TA-TA---ATTgtgctat
gi|134290 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--TA----TTT--G-TTA-A-----TTC-CTATGTAT-ATG--CTTC-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------CATTA---AATAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGGCCA--TTTTGC-TC-CTA-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGTCAGGTTTGACT---G--TA-TA---atg
gi|134296 : CTTGTCTTAAACAGCCA--CA----TTTGAT-TTA-T-------C-CTATGTTC-ATA--CTTT-C-A--GTGA-AAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-CTTTGC-TC-CTTCCC--CTTGATTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---taaaaaacacactatctggcagcagcattctg
gi|134296 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--ctgtgtatat
gi|134319 : cttgtcttaaacagccacatttgatttatcctatgttcatactttcagtgaaaattcacctgtattaagcaacaacatgtcttaaaaggccacctttgctccttccccttgatCTTGTCTTAAGCAGCTA--TA----TTT--G-TAA-T-----TTC-CCAATTTT-ATA--CTTT-T-A--CAGC-AAA-TTAATCTGCATTTAACAACATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGACAC-TTTTGC-TC-ATT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TAAAGACAGGTTTGACT---G--Ttttgactgtacactgtgtatat
gi|134264 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--AA----TTT--G-CTA-T-----ATT-CCATTTAT-ATA--TTTT-C-A--GATC-AAA-CTAACCTG----------TATTAAGCAATAGCC---AG-CTT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTCGC-TC-ATT-C---CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGATTTGACT---G--TA-CA---taatgtagata
gi|134267 : CTTGTCTTAAACAGCCA--CA----TTT--T-CCG-T-----TTA-CCATGTTT-ATA--TTTT-A-A--GTTA-AAA-TCAACTTG----------TATTAAGCGACCACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAT-TTTTGC-TC-TTT-CC--CTTGAGTG---GCTA---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttgtgataatttgtaca
gi|134323 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-TTA-T-----TTC-CAATC--------------------AGC-AAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTAC-TC-CTT-CC--CTTGACTC---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttaa
gi|134285 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-GTA-T-----TTC-CTGTTTCT-GTG--CTTT-C-A--AAGC-AAA-CTGACCTG----------TATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACCAC-TTTTGT-GC-CTT-TC--AATGGGTG---GCTG---C---TTAACACAGGTTGGACT---G--AA-TA---taacaattctattcaccacatattc
gi|134311 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT------A-T-----TTC-CAATTTAT-ATG--TTTT-C-T--GAGT-AAA-TTAATCTG----------CATTAAACCACAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGACCAC-TTTAGC-TT-CTT-TC--CTTTACAT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134306 : CTTGTCTTAAGCAGCCA--C----------------T-----TTCACTATTTCC-ATG--CTTA-C-A--GAAC-AAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAG-TTTTGC-TC-CTT-CC--ACTGATTG---GCTG---C---TTCATACAGGTTTGACT---G--TA-Tacat
gi|134321 : CTTGTATTAAGCAGCCA--CA----GTA--T-CTG-T-----ATC-CCATTTCT-ATG--ATTT-C-A--TAGC-AAA-TTAAGCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGTTAC-CTTTGCTTC-GTT-C---ATTGACTT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGATT---A--TA-TA---AT
gi|134307 : CTTGTCTTAAGCAGCGA--CA----TTT--G-TTA-T-----TTC-CCGGTTAT-GTG--CTTA-C-A--TAGC-AAA-TTAATCTG----------AATTAAACAACAACC---TG-TAT-----------A--AAA-------AGGCCAA-TTTTGC-TC-CTC-CC--CGTGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---gatatgcactaactc
gi|134269 : CTTGTCTTAAATAGCCA--CA----TTT--T-CAG-T-----TTA-CCATGTTC-ATA--CTTT-A-A--GTTG-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCATCCACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAT-TTTTGT-TC-TTT-CC--CTTGAGTG---GCTG---C---TTAACACAGGTTTGATT---G--TA-TA---tattat
gi|134268 : CTTGTCTTAAACAGCTAATTACCATTTT--T-ATA-T-----TT-----TTTTT-AC---TTTT-A-A-----T-TAA-CCAACCTG----------TATTAAACAGCCACC---TA-CCC-----------T--AAG-------GGGTCAC-TTTTGG-TA-TTT-CC--CTTGAATG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--AA-Tta
gi|134268 : CCTGTCTTAAGCAGCCA--Tgt
gi|134252 : cttgtcttaaacagctaattaccatttttatattttttttacttttaattaaccaacctgtattaaacagccacctaccctaaggggtcacttttggtatttcccttgaCTTGTGTTAAGCAGCCA--AA----CAT--G-TTAGT-----TTT-ATATTT-----G--C----------AGCCAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGT-AC-ATC-CC--C---ACTGTATGTTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---tttgactgaatgt
gi|134250 : CTTGTGTTAAGCAGCCA--AA----T--------A-T-----GT---TAGTTTT-ATA--ATT----A--CAGTCAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAGCAACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGT-AC-ATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TAAACACAGGTTTGGTT------TA-TA------T-CATATG--CACATTAtgctcattactcattactattatgaaaatctcaagaatactcatctactctgattttgaagagtaattattcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134251 : CTTGTGTTAAGCAGACA--AA----T------ATA-T-----T-----AGTTTT-ATA--TTT----A--CAGCCAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGT-AC-ATC-CCCACTTTAT-----GCTGCAAC---TTAACACAGGGTTGGTT---G--TA-TA---ctcattactattctgaaaaactcaagaatactcatctactttgattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134253 : CTTGTGTTAAGCAGCCA--AA----TAC--A-TTAGT-----TTT-ATATTTAT-A-G--CC-------------AAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--GGG-------GGTCCAT-TATAGT-AC-ATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGTTT---G--AA-TA---tcatatgcgcattactcattactattctgaaaaactcaagaatactcatctactcattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134255 : CTTGTATAAAGCAGCCA--AA----C--------A-T-----GT---TAGTTAT-ATA--TTT----A--CAGCCAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GCACCAT-TATAGT-AC-ATC-CC--CATGTATG----CTG---CAACTAAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---tcatatgcgcattactcattactattctgaaaactcaagaatactaatctactatgattttgatgagtaataactcatcctcttaaaatatcatctggagctct
gi|134259 : CTTGTGTTGAGCAGCCA--AA----C--------A-T-----GT---TAGTTTT-ATA--TTT-------------AC-TTGGTCTG----------TATCCAACACCCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GAGCCAT-TATAGT-AC-CTC-CC--C---ACTAT--GCTGAAGC---TTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---tcatatgtacgttactctactgaaaaactcaagaatattcatctactctgattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134264 : CTGTCTTAAGCAGCCA--ttatatgtgcaattctcattactattccaaaaaatctcaagaatactcatctactctgattttgatgagtaattactcattggcttaaaaagttatctgggggcctg
gi|134459 : cttgtcttaagcagccaaatttgctatattccatttatatattttcagatcaaactaacctgtattaagcaatagccagctttaaaaggccattttcgctcattccatgacTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GACC-AAA-TTAACCTG----------TATTAACCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTGC-TC-ATG-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---TTAT-T-TA-A--atttgactgtacatgtgataatttgtaca
gi|134462 : tTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTT-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAGC-ATG-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTAC-TC-CTT-CC--CTCGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTAATT---G--TA-TA---tta
gi|134464 : tTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTT-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-G--CAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGC-TT-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAAACAGCTTTGACT---T--TA-TAAATATTTAC-TA-GCTAATATTtagta
gi|134478 : tTGTCTTAAGCAGCCA--CA----ATT--G-CTA-T-----TTT-CCATTTTA-ATG--CTTC-T-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTAGT-TC-ATT-CT--CTTGACTG---GCTG---C---TTATTACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134461 : TGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-TGATTGCT-ATG--CGTT-C-A--GACC-AAA-TTAACGTG----------TATTAAACAACAACC---TT-TCT-----------T--AAA-------GGGCCAC-TTTTGC-TC-CTT-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ccata
gi|134477 : tTGTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-TTA-T-----TTT-CCATTTAT-ATG--CTTT-G-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------CATTTAACAACAATA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTAC-TA-CTT-CC--CATGATTG---GCTG---C---TTGGGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttaa
gi|134460 : TGTCTTAAGCAGTCA--CA----TTT--G-TTA-CATGTATTC-CCATTTCT-ATG--CTTT-C-A--GAAC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGGACAC-TATTGT-TC-CTT-CC--CTTGACTG---GCCG---C---TTAATACAGGTTTGACT---A--AA-TA---tacataa
gi|134463 : tTGTCTTAAGC-GCCA--CA----TTT--G-CGA-A-----GTC-CCATTTAT-ATG---TTT-ACA--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAAACTAAAGAGGAAAT-TTTTGC-CC-GTT-CC--CTGGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTGATT---G--TA-Tt
gi|134314 : tGTCTTAAGCAGCCA--AA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCA-TTCT-ATG--TTTTCA-A--AATC-AAA-TTAACCTG----------CATTAAGCAATAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-CAATGT-TC-CTT-CC--CTTGACTG---TGTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---tagctgcaaacttact
gi|134297 : ctcTCTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-ATTTGC-TT-ATT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTAGCT---G--TA-TA---tcat
gi|134488 : ctttTTAAGCAGCCA--CA----TTT--G-CTA-T-----TTC-CCATTTCT-ATG--TTTT-C-A--GCAC-AAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTTAC-TTTTGC-TC-CTT-TC--CTTAACTC---GCTA---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---tgagatatgaac
gi|134486 : taTTAAGCAGCCA--TA----TTT--G-TCA-T-----TTC-CCATTTAT-ATA--CTTT-C-A--GAGC-AAA-TTAATCTG----------CATTCAACAGAAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAA-TTTTGC-TG-CTT-CC--CTTGACTG---GCTG---A---CTAAGACAGGTTTGACT---G--AA-Tccaaaataatat
gi|134508 : taGCAGCCA--AA----T------ATA-T-----T-----AGTTTT-ATA--TTT----A--CAGCCAAACTTGGTCTG----------TATTCAAAAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGGCAT-TATAGT-AC-ATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---
gi|134476 : TTCT-ATA--TTT----A--CAGCCAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTT-----------T--AAG-------GGGCCAtaatatgcgcattactcattactattctgaaaaactcaagaatattcatctactcttgagtttgatgagtgattattcatcgacttaaaaaaattatcttgagctctg
gi|134457 : tgtggtaagtagccaaaatcataag-AAC-TTGGTCTG----------TATTCAACAACAACA---TGCTCT---------------AA-------GGACCAT-TATAGT-AC-ATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTAGTT---G--TA-TA---taatagtacctcccactgtat
gi|134285 : ttgcgtcaagcagccgaaattgtaagttttatatttacagccaAACCTG----------TGTTAAGCAGCCACC---CA---T-----------T--GAA-------AGGCtcatatgcgcattactcatcactattctgcaaaactaaaaaatactcatctcctctgattctgatgagtaattgcttataagcttaaaaaaaaatcggggactctg
gi|134258 : cttgtcttaagcagccacatttggtatttcctgtttctgtgctttcaaagcaaactgacctgtattaaacaacaacctgtcttaaaagaccacttttgtCAACAACCACATG-CTC-----------T--AAG-------GGGCTAT-TATAGT-AC-ATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---ggactgaata
gi|134522 : cttgtgttaagcagccaaatatattagttttatatttacagcCAACAACCACATG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGT-AC-ATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACAAAGGTTTGGTT---G--TA-TA---taatatgcgcattactcattactattctggagaaaaaaaaacaagaatattcatctactctgagtttgatgagtaattacttatcggtttaaaatatttctggagctctg
gi|134315 : TG---GCTG---C---TTAAGACAGGtcatatacgcattactcattactattctgaaaaactcaaaaatactcatctactctgattttgatgagtaattactcatcgtcttaaaatattatctggagctctg
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|134523 ): CCATACTATAGTACCTCCCCACTGTATGCTGTAGCTTAACACATATTTGGTTGTATATCATATTCATAATACTCGTCACTATGTGAAAAACTTATAGATACTCATCTATTCTGATTTTGATGAGTAATTACTCATCAGCTTAAAAAATTACCTGGGGCTCTG
Unaligned ( gi|134513 ): ATGTGGATTTTANNNNNNNNNNCAAACTTGGTCTGCATTTAACAACCACATGCTCTATAGTACCTCCCACTGTATGCTGTAGCTGAACACATATTTAGTTTTAAATTTTTTGCACAATACTCATCACTATTTTGAAAAACTGTTGAATATTCATCTACTCTGATTTGATGGGTAATTACTACTCATAAGCTTAAATTGTTATCTAGGGTCCTG
Unaligned ( gi|134524 ): CAACTCTGCACTGGTTGTATATAACATACGCAATACTCATCACTATTCTGAAAAACTCAAGAATACTCATCTACTCTGATTTTGAGTAATTACTCATCGGCTCAAAGAGTTATCTGTGGCTCT
Unaligned ( gi|134526 ): TGGTTGTATATATATCATATATGCACAATACTCATCACTGTTCCGAAAAACTCAAGAATACTCCCATCTACTCTGATTTTGATGAGAAATTACTCATCAGCTTAAAAAATTTTCCAGGGCT
Unaligned ( gi|134525 ): TTTGGTAGTACATGTATATCAAATGTGCAATACTCACCACTACTCTGAAAAACTCAAGAATACTCATCTACTCAGATTTTGATGAGTATAATTACTCATTGGCATAAAAATTTATCTGGAGCTATG
Unaligned ( gi|134527 ): TGATTGTATGTCATAATTATGTGCAATACTCATTACTATTTTGGAAAAACTCAAGAATACTGAGTCTCATCTACTCTGATTTTGATGAGTTATTACTCATTGGCTTAAAAATTATCTGGGGATCTG
Unaligned ( gi|134261 ): CTTGTGTTAAGCAGCCAAATATATTAGTTTTATATTTACAGTCAAACTTGGTCTGTATTCAACCACATGCTCTGA
Unaligned ( gi|134260 ): CTTGTGTTAAGCAGTCAAGCATGTTAGTTTTATATTTACAGACAAACTTGGTCTGTATTCAACAGCCTCATGCTCTA
Unaligned ( gi|134528 ): TAATAAACAATGTCGCTAACCACTATTCCGAAAAACTCAAGAAAAATCATCAACTCTGATTTTGAGTAGTACTCATCGACTTAAAAAATTATCTGGGACTCTG
Unaligned ( gi|134529 ): ACACTCATCTTCTCTGATTTTGATGAGTTATTACTCCTCGGCTTAAAAAATTATCTTGGGCTTTG
Unaligned ( gi|134530 ): TGCTCTGATTTTGCTGTAATTACCCATCGGCTTAAAAAATGATCTGGAGCTCTG
Unaligned ( gi|134531 ): AATTACTCATCGGCTTAAAAAATTATCTGGAGCTCTG
Alignments
lowQualScore : 2222222222
lowQualScore : 11111 000 11111 1 0 00 0 4 2222222222 000 0 22222222222 00 1111111 0 0 00 666 444 333 111 00 0 6666 2222222222
lowQualScore : ..... ... ..... . . .. . . .......... ... . ........... .. ....... . . .. ... ... ... ... .. . .... ..........
lowQualScore : 88888 666 11111 9 4 66 9 5 0000000000 888 9 11111111111 66 5555555 5 5 66 111 888 222 555 77 6 4444 0000000000
consensus : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTA
Reference ( family-142 ) : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTA
gi|134250 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AATATG-T-TA-----------GTTT-T-ATAATTACAG---T-CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAGCAACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TAAACACAGGTTTGGTT------TA-TA------T-CATATG--CACATTA
gi|134251 : CTTGTGTTAAGCAGACA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CCCACTTTAT-----GCTGCAAC---TTAACACAGGGTTGGTT---G--TA-TA---ctcattactattctgaaaaactcaagaatactcatctactttgattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134252 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AACATG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTTGCAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGTTGCAAC---TTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---tcatatgcgcattactcattactattctgaaaaactcaagaatactcatctactcattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134253 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AA--TA-C--AT-----T----AGTTTT-ATA--TTTAT--AGCCAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--GGG-------GGTCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TTAACACAGGTTTGTTT---G--AA-TA---tgctcattactcattactattatgaaaatctcaagaatactcatctactctgattttgaagagtaattattcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134255 : CTTGTATAAAGCAGCCA-----AACATG-T-TAG-----TT---AT-----ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GCACCAT-TATAGTACATC-CC--CATGTATG----CTG---CAACTAAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---tcatatgcgcattactcattactattctgaaaactcaagaatactaatctactatgattttgatgagtaataactcatcctcttaaaatatcatctggagctct
gi|134256 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTT-------------TCCCATTTCT-ATGCTTTTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGACAT-TTTTGTCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--tcatatgtacgttactctactgaaaaactcaagaatattcatctactctgattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134258 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--------------CC-----------------AACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCTAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---
gi|134259 : CTTGTGTTGAGCAGCCA-----AACATG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTT-----------AC-TTGGTCTG----------TATCCAACACCCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GAGCCAT-TATAGTACCTC-CC--C---ACTAT--GCTGAAGC---TTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---taatatgcgcattactcattactattctggagaaaaaaaaacaagaatattcatctactctgagtttgatgagtaattacttatcggtttaaaatatttctggagctctg
gi|134260 : CTTGTGTTAAGCAGTCAAG---CA--TG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTTACAG--A--CAAACTTGGTCTG----------TATT---CAACAGCC---Tttatatgtgcaattctcattactattccaaaaaatctcaagaatactcatctactctgattttgatgagtaattactcattggcttaaaaagttatctgggggcctg
gi|134261 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG---T-CAAACTTGGTCTG----------TATT---CAACCACA---TGCTCT-----------catgctcta
gi|134263 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATATG-C-CAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTCATCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tga
gi|134264 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----AATTTG-C-TAT-----ATTCCATTTAT-ATATTTTCAG--AT-CAAA-CTAACCTG----------TATTAAGCAATAGCC---AG-CTT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTCGCTCATT-CC--A-TGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGATTTGACT---G--TA-CA---tggatctacaca
gi|134266 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCGTTTCT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTAATT-CC--CTTGAATG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--tgtgataatttgtaca
gi|134267 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTTT-C-CGT-----TTACCATGTTT-ATATTTTAAG--TT-AAAA-TCAACTTG----------TATTAAGCGACCACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAT-TTTTGCTCTTT-CC--CTTGAGTG---GCTA---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tatttaaaataattgtaatattgcaattattaatat
gi|134268 : CTTGTCTTAAACAGCTAATTACCATTTT-TATAT-----TT----TTTTT-A--CTTTTAA-----TTAA-CCAACCTG----------TATTAAACAGCCACC---TA-CCC-----------T--AAG-------GGGTCAC-TTTTGGTATTT-CC--CTTGAATG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--AA-Ttaa
gi|134269 : CTTGTCTTAAATAGCCA-----CATTTT-C-AGT-----TTACCATGTTC-ATACTTTAAG--TT-GAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCATCCACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAT-TTTTGTTCTTT-CC--CTTGAGTG---GCTG---C---TTAACACAGGTTTGATT---G--TA-TA---gt
gi|134270 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--TA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T---AA-------AGGCCAT-TTTTGCTCCTT-CC--ACTGAGTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---ta
gi|134271 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CAAT-G-C-TAT-----GTCCCATTTTT-ATATTTTCAG--GG-AAAA-TTAATCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACAAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tacagtacat
gi|134273 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATCTG-C-T-T-----TTCCCATTTCT-ATGTGCTTAG--AA-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTAATCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---tattaatat
gi|134274 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AA-CAAT-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTAACT---G--TA-TA---aaaatataa
gi|134275 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTA-A-TAT-----TTTCCATTTTC-ATGCTTTCAT--AG-CAAA-TAAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAC-------AGGCCAC-TTTTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---ACTG---C---TTAATGCAGGTTTGACT---G--TA-TA---tggtatgttcaatttcttcaaaaatatattaaaaaaatgactcaatct
gi|134276 : CTTGTTTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAC-----TTCCCATTTCT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACATCC---TG-TCT-----------C--AAA-------AGGCCAC-TATTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-TA---taatatcaaactctcacatatgctgttgtgcaaa
gi|134277 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATGTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TATGGCTCCTT-CA--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ATtgcaatgcatggttgctatttgacttctggcataaggtaataatacataccatcta
gi|134278 : CTTGTCTTAAGCAGCCG-----CATTTA-A-TAT-----TTCTCATTTCT-ATGTTTTCAG--GG-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCGCC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACTTC-A--TA-TA---GTa
gi|134279 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TAT-----TTTCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAGCCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCTTACATACAGTAT--AAA-------AGGCCAC-TCTCACTCCAT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--atatacat
gi|134280 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CACTT-----AT---------CATTTCC-ATGCTTTCAT--GG-CAAA-CTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGCCAC--TTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGATAGGTTTGACT---G--TA-T
gi|134281 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATGTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-G-AACTTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTTGCTACTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-gtgctat
gi|134282 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTAAG-GTGCTTTCAG--GG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAC-TTTTGCTTCTT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTatgt
gi|134283 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-G-TAT-----TTCCCATTTCT-AAGCCTTCAG--GG-AAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------GGGTCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTA---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134284 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATGCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TCTTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCGTT--C--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--t
gi|134285 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-G-TAT-----TTCCTGTTTCT-GTGCTTTCAA--AG-CAAA-CTGACCTG----------TATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACCAC-TTTTGTGCCTT-TC--AATGGGTG---GCTG---C---TTAACACAGGTTGGACT---G--AA-TA---
gi|134286 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTTGCT---G--TA-TA---
gi|134287 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAG-C-TAT-----TTCCCATTTTT-ATGCTTTTAT--AG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-TC--CTGGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttga
gi|134288 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCCTTAAG--AT-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAAAC---TG-TCT-----------T---AA-------AGACCAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--CA-gt
gi|134289 : CTTGTCTTAAACAGTCA-----CATTTG-T-T-T-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTTAC--AG-CAAA-TTAAACTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGTCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGCTTGACT---G--gata
gi|134290 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-TAA-----TTCCTATGTAT-ATGCTTCCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTA---AATAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGGCCA--TTTTGCTCCTA-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGTCAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134291 : CCTGTTTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TAT-----TTCCCATT-CT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-CTAACCTA----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGGTCCTA-CC--TTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--Ttaaaaaacacactatctggcagcagcattctg
gi|134292 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTGATCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CATGACTG---ACTA---C---TTAAGCCAGGTGTGACT---G--tga
gi|134293 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAA-T-TAT-----TTCCCATTGCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTGGTTTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--TA-T
gi|134294 : CTTGTCTTAAGCAGTCA-----AATTTG-C-TAT-----TTCCCATATCT---GCTTCCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTCCTT-CC--TTTGGCTG---GCTT---C---TTAAGACAGGTTTGAAT---A--TA-gtgtatattca
gi|134295 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AC-CAAA-TTTACATG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC--TTTATTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TAAAGACAGGTTTGACT---G--TAGTA---Gatattatgtacaatcttaattttattacactgctgaaaataaa
gi|134296 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTTG-A-TTT-----ATCCTATGTTC-ATACTTTCAG--TG-AAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-CTTTGCTCCTTCCC--CTTGATTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---gaatatg
gi|134297 : CTTTTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-ATTTGCTTATT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTAGCT---G--TA-TA---ctgtgtatat
gi|134298 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TAATTG-T-TAT-----TTCCCATTTAT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCTAC-TTTTGCT-CTT-CC--CTTGACTG---TCTG---C---GTAAGACAGGTTTGACT---G--tgagatatgaac
gi|134299 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTA-C-TAT-----ATCCCATGTTC-ATACTTTCAG--TG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCTAC-TTTCACTCATT-CC--CTTGACTG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTAACT---G--TA-TA---
gi|134301 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTTT-ATACTTTTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCTT-TTTTGCTCATT-CC--ACTGACTG---GCTG---C---TTAAGAAACGTTTGACT---G--TA-Tctagtatacatactgtatttatcac
gi|134302 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAG-C-TAT-----TTCGCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAC-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAGCC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTG---GCTT---C---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134303 : CTTGTCTTAAGCAGTCA-----TATTTG-T-TAT-----TTCCGATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTATGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttagtat
gi|134304 : CCTGTCTTAAGCAACCA-----TATTTT-C-TAT-----TCCCTATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-T
gi|134305 : CCTGTCTTAAGCAACCA-----TATTTTTC-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAATCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134306 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CTTTCA-C-TAT-----TTCC--------ATGCTTACAG--AA-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAG-TTTTGCTCCTT-CC--ACTGATTG---GCTG---C---TTCATACAGGTTTGACT---G--TA-Tta
gi|134307 : CTTGTCTTAAGCAGCGA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCGGTTAT-GTGCTTACAT--AG-CAAA-TTAATCTG----------AATTAAACAACAACC---TG-TAT-----------A--AAA-------AGGCCAA-TTTTGCTCCTC-CC--CGTGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134308 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TTT-----TTCCCATTTGT-ATGCTAACAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAGCT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTATGCTCCTT-CC--CTTGGCTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttattat
gi|134310 : CTTGTGTTAAGCAGCCG-----CATATG-C-TAT-----TTCATATTTCG-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTC----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCGC-TTTCATTTATT-CC--CTTGACTG---ACTG---T---TTAAGACAGGTTTGACT---G--
gi|134311 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTT-----AT-----TTCCAATTTAT-ATGTTTTCTG--AG-TAAA-TTAATCTG----------CATTAAACCACAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGACCAC-TTTAGCTTCTT-TC--CTTTACAT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134312 : CTTATTTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-CAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCG-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---acat
gi|134314 : CTCGTCTTAAGCAGCCA-----AATTTG-C-TAT-----TTCCCA-TTCT-ATGTTTTCAA--AATCAAA-TTAACCTG----------CATTAAGCAATAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-CAATGTTCCTT-CC--CTTGACTG---TGTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ttaata
gi|134315 : CCTGTCTTAAGCAGCCA-----CACTTG-T-TAT-----TTCACATTTAT-ATGCTTACAA--AG-CAAA-TTGATCTG----------TATTAAGCAAAAATC---TG-TCC-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCTAT-TC--CTTGATTG---GCTG---T---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-Ttcat
gi|134316 : CCTATCTTAAACAGCCA-----TATTTT-T-TGT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTTAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAATCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTACTT-CC--CCTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---ttattttacacgaatta
gi|134317 : CTTGTCTTGAGCAGCCA-----CATTGG---TAT-----ATCCCATTTCG-ATTCTTTCAG--AG-CAAA-TTCATCTG----------TATTCAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTGACT---G--t
gi|134318 : CTTGTTCTAAGCAGCCA-----CATTTG-A-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTATCCTG----------TATTAAGCTACAACC---TG-TCT-----------T---AA-------AGGCCAT-TTTTGTTCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TAAATACCGGTTTGATTTTAA--TA-TA---ATT
gi|134319 : CTTGTCTTAAGCAGCTA-----TATTTG-T-AAT-----TTCCCAATTTT-ATACTTTTAC--AG-CAAA-TTAATCTGCATTTAACAACATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGACAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TAAAGACAGGTTTGACT---G--Tatg
gi|134320 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATG-TTTCAG--GG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------GGGCCAC-ATTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGtaatgtagata
gi|134321 : CTTGTATTAAGCAGCCA-----CAGTAT-C-TGT-----ATCCCATTTCT-ATGATTTCAT--AG-CAAA-TTAAGCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGTTAC-CTTTGCTTCGT-TC--ATTGACTT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGATT---A--TA-TA---AT
gi|134322 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----ATCTTATTTTT-ATGCTTTTAG--TG-TAAC-TTTACCTG----------TATTAAGCAGCAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT--T--CTTGACTG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-gatatgcactaactc
gi|134323 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCAATC----------------AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTTGACTC---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tgtatcattgactaattcagtcattatt
gi|134326 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----ATCCCATTTTT-ATGCTTTCAG--TG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAGCC---TC-CCA-----------T--AAA-------AGGTCAA-TTTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttaacaattctattcaccacatattc
gi|134327 : CTTGTCTTAAGCAACCA-----CATTAG-C-TAT-----ATCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAATCAGGTTTGACT---G--TA-T-----TT-------A--AACATTAgtagatatttaaaattactatta
gi|134328 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTAATCTAG-CAAA-TTTACCTG----------TATCAAACAACAACC---TG-TAT-----------T--AAA-------AGGCCATGTTTTTCTCCTT-CC--CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ttttcatattaattgaatatgttgaaaa
gi|134329 : CCTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTT-C-TAT-----TTCCTATTTCT-ATGCTTTAAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CT--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTAtagt
gi|134330 : CTTATCTTAAACAGCCA-----AATTT----TTT-----TCCCCAGT-CT-ATGCTTTTAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--
gi|134331 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATATG-C-TAT-----ATCCCATTTCT-AAGCTTTCAT--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------TAGCCAC-TTTT-CTCCTT-CC--CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-T
gi|134333 : CTTGTCTTAACCAGCCA-----CATTTG-T-GAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAATC---TT-TCA-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCACCTT-CC--CTTTACTG---TCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tttacattaatttcgtta
gi|134334 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTTCAATTTTTTATGCTTTTAG--AA-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAGCAAAAACC---TG-CTT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTGCCCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGATAGGTTTGACT---G--TA-Tttaat
gi|134335 : CCTGTCTTAAGCAGTCC-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTGTT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TA-TCT-----------T--AAA-------AGATCAT-TTTTGCTTCAT-CC--CTCGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tgtatta
gi|134336 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCA-C-TTT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------TAAAAA-------AGGCCAC-TTTTACTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---GTTTA-TA---Gtataat
gi|134457 : TTGCGTCAAGCAGCCG-----AAATTG---TA-----------AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACAACA---TGCTCT---------------AA-------GGACCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TTAACACAGGTTTAGTT---G--TA-TA---catcatt
gi|134459 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AC-CAAA-TTAACCTG----------TATTAACCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTGCTCATG-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---TTAT-T-TA-A--tcatatgcgcattactcatcactattctgcaaaactaaaaaatactcatctcctctgattctgatgagtaattgcttataagcttaaaaaaaaatcggggactctg
gi|134460 : TTGTCTTAAGCAGTCA-----CATTTG-T-TACATGTATTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGGACAC-TATTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---GCCG---C---TTAATACAGGTTTGACT---A--AA-TA---tta
gi|134461 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCTGATTGCT-ATGCGTTCAG--AC-CAAA-TTAACGTG----------TATTAAACAACAACC---TT-TCT-----------T--AAA-------GGGCCAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---t
gi|134462 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TTT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CATG-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTCGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTAATT---G--TA-TA---taa
gi|134463 : TTGTCTTAAGC-GCCA-----CATTTG-C-GAA-----GTCCCATTTAT-ATGTTTACAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAAACTAAAGAGGAAAT-TTTTGCCCGTT-CC--CTGGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTGATT---G--TA-Ttagta
gi|134464 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTTCCATTTCT-ATGCTTTCGC--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAAACAGCTTTGACT---T--TA-TAAATATTTAC-TA-GCTAATATTtagctgcaaacttact
gi|134476 : TTCT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTT-----------T--AAG-------GGGCCA
gi|134477 : tgtggtaagtagccaaaatcataagTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTTCCATTTAT-ATGCTTTGAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTTAACAACAATA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTACTT-CC--CATGATTG---GCTG---C---TTGGGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttaatagtacctcccactgtat
gi|134478 : TGTCTTAAGCAGCCA-----CAATTG-C-TAT-----TTTCCATTTTA-ATGCTTCTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTAGTTCATT-CT--CTTGACTG---GCTG---C---TTATTACAGGTTTGACT---G--TA-TA---tacataa
gi|134486 : TTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-CAT-----TTCCCATTTAT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAATCTG----------CATTCAACAGAAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAA-TTTTGCTGCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---A---CTAAGACAGGTTTGACT---G--AA-Tccata
gi|134488 : taTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--CA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTTAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTAACTC---GCTA---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134508 : taGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAAAAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGGCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---ccaaaataatat
gi|134522 : CAACAACCACATG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACAAAGGTTTGGTT---G--TA-TA---taatatgcgcattactcattactattctgaaaaactcaagaatattcatctactcttgagtttgatgagtgattattcatcgacttaaaaaaattatcttgagctctg
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|134523 ): CCATACTATAGTACCTCCCCACTGTATGCTGTAGCTTAACACATATTTGGTTGTATATCATATTCATAATACTCGTCACTATGTGAAAAACTTATAGATACTCATCTATTCTGATTTTGATGAGTAATTACTCATCAGCTTAAAAAATTACCTGGGGCTCTG
Unaligned ( gi|134513 ): ATGTGGATTTTANNNNNNNNNNCAAACTTGGTCTGCATTTAACAACCACATGCTCTATAGTACCTCCCACTGTATGCTGTAGCTGAACACATATTTAGTTTTAAATTTTTTGCACAATACTCATCACTATTTTGAAAAACTGTTGAATATTCATCTACTCTGATTTGATGGGTAATTACTACTCATAAGCTTAAATTGTTATCTAGGGTCCTG
Unaligned ( gi|134524 ): CAACTCTGCACTGGTTGTATATAACATACGCAATACTCATCACTATTCTGAAAAACTCAAGAATACTCATCTACTCTGATTTTGAGTAATTACTCATCGGCTCAAAGAGTTATCTGTGGCTCT
Unaligned ( gi|134526 ): TGGTTGTATATATATCATATATGCACAATACTCATCACTGTTCCGAAAAACTCAAGAATACTCCCATCTACTCTGATTTTGATGAGAAATTACTCATCAGCTTAAAAAATTTTCCAGGGCT
Unaligned ( gi|134525 ): TTTGGTAGTACATGTATATCAAATGTGCAATACTCACCACTACTCTGAAAAACTCAAGAATACTCATCTACTCAGATTTTGATGAGTATAATTACTCATTGGCATAAAAATTTATCTGGAGCTATG
Unaligned ( gi|134527 ): TGATTGTATGTCATAATTATGTGCAATACTCATTACTATTTTGGAAAAACTCAAGAATACTGAGTCTCATCTACTCTGATTTTGATGAGTTATTACTCATTGGCTTAAAAATTATCTGGGGATCTG
Unaligned ( gi|134528 ): TAATAAACAATGTCGCTAACCACTATTCCGAAAAACTCAAGAAAAATCATCAACTCTGATTTTGAGTAGTACTCATCGACTTAAAAAATTATCTGGGACTCTG
Unaligned ( gi|134529 ): ACACTCATCTTCTCTGATTTTGATGAGTTATTACTCCTCGGCTTAAAAAATTATCTTGGGCTTTG
Unaligned ( gi|134530 ): TGCTCTGATTTTGCTGTAATTACCCATCGGCTTAAAAAATGATCTGGAGCTCTG
Unaligned ( gi|134531 ): AATTACTCATCGGCTTAAAAAATTATCTGGAGCTCTG
Alignments
lowQualScore : 2222222222
lowQualScore : 11111 000 11111 1 0 00 0 4 2222222222 000 0 22222222222 00 1111111 0 0 00 666 444 333 111 00 0 6666 2222222222
lowQualScore : ..... ... ..... . . .. . . .......... ... . ........... .. ....... . . .. ... ... ... ... .. . .... ..........
lowQualScore : 88888 666 11111 9 4 66 9 5 0000000000 888 9 11111111111 66 5555555 5 5 66 111 888 222 555 77 6 4444 0000000000
consensus : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTA
Reference ( family-142 ) : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTA
gi|134250 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AATATG-T-TA-----------GTTT-T-ATAATTACAG---T-CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAGCAACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TAAACACAGGTTTGGTT------TA-TA------T-CATATG--CACATTA
gi|134251 : CTTGTGTTAAGCAGACA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CCCACTTTAT-----GCTGCAAC---TTAACACAGGGTTGGTT---G--TA-TA---ctcattactattctgaaaaactcaagaatactcatctactttgattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134252 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AACATG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTTGCAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGTTGCAAC---TTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---tcatatgcgcattactcattactattctgaaaaactcaagaatactcatctactcattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134253 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AA--TA-C--AT-----T----AGTTTT-ATA--TTTAT--AGCCAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--GGG-------GGTCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TTAACACAGGTTTGTTT---G--AA-TA---tgctcattactcattactattatgaaaatctcaagaatactcatctactctgattttgaagagtaattattcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134255 : CTTGTATAAAGCAGCCA-----AACATG-T-TAG-----TT---AT-----ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GCACCAT-TATAGTACATC-CC--CATGTATG----CTG---CAACTAAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---tcatatgcgcattactcattactattctgaaaactcaagaatactaatctactatgattttgatgagtaataactcatcctcttaaaatatcatctggagctct
gi|134256 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTT-------------TCCCATTTCT-ATGCTTTTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGACAT-TTTTGTCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--tcatatgtacgttactctactgaaaaactcaagaatattcatctactctgattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134258 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--------------CC-----------------AACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCTAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---
gi|134259 : CTTGTGTTGAGCAGCCA-----AACATG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTT-----------AC-TTGGTCTG----------TATCCAACACCCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GAGCCAT-TATAGTACCTC-CC--C---ACTAT--GCTGAAGC---TTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---taatatgcgcattactcattactattctggagaaaaaaaaacaagaatattcatctactctgagtttgatgagtaattacttatcggtttaaaatatttctggagctctg
gi|134260 : CTTGTGTTAAGCAGTCAAG---CA--TG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTTACAG--A--CAAACTTGGTCTG----------TATT---CAACAGCC---Tttatatgtgcaattctcattactattccaaaaaatctcaagaatactcatctactctgattttgatgagtaattactcattggcttaaaaagttatctgggggcctg
gi|134261 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG---T-CAAACTTGGTCTG----------TATT---CAACCACA---TGCTCT-----------catgctcta
gi|134263 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATATG-C-CAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTCATCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tga
gi|134264 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----AATTTG-C-TAT-----ATTCCATTTAT-ATATTTTCAG--AT-CAAA-CTAACCTG----------TATTAAGCAATAGCC---AG-CTT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTCGCTCATT-CC--A-TGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGATTTGACT---G--TA-CA---tggatctacaca
gi|134266 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCGTTTCT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTAATT-CC--CTTGAATG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--tgtgataatttgtaca
gi|134267 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTTT-C-CGT-----TTACCATGTTT-ATATTTTAAG--TT-AAAA-TCAACTTG----------TATTAAGCGACCACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAT-TTTTGCTCTTT-CC--CTTGAGTG---GCTA---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tatttaaaataattgtaatattgcaattattaatat
gi|134268 : CTTGTCTTAAACAGCTAATTACCATTTT-TATAT-----TT----TTTTT-A--CTTTTAA-----TTAA-CCAACCTG----------TATTAAACAGCCACC---TA-CCC-----------T--AAG-------GGGTCAC-TTTTGGTATTT-CC--CTTGAATG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--AA-Ttaa
gi|134269 : CTTGTCTTAAATAGCCA-----CATTTT-C-AGT-----TTACCATGTTC-ATACTTTAAG--TT-GAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCATCCACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAT-TTTTGTTCTTT-CC--CTTGAGTG---GCTG---C---TTAACACAGGTTTGATT---G--TA-TA---gt
gi|134270 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--TA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T---AA-------AGGCCAT-TTTTGCTCCTT-CC--ACTGAGTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---ta
gi|134271 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CAAT-G-C-TAT-----GTCCCATTTTT-ATATTTTCAG--GG-AAAA-TTAATCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACAAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tacagtacat
gi|134273 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATCTG-C-T-T-----TTCCCATTTCT-ATGTGCTTAG--AA-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTAATCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---tattaatat
gi|134274 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AA-CAAT-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTAACT---G--TA-TA---aaaatataa
gi|134275 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTA-A-TAT-----TTTCCATTTTC-ATGCTTTCAT--AG-CAAA-TAAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAC-------AGGCCAC-TTTTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---ACTG---C---TTAATGCAGGTTTGACT---G--TA-TA---tggtatgttcaatttcttcaaaaatatattaaaaaaatgactcaatct
gi|134276 : CTTGTTTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAC-----TTCCCATTTCT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACATCC---TG-TCT-----------C--AAA-------AGGCCAC-TATTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-TA---taatatcaaactctcacatatgctgttgtgcaaa
gi|134277 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATGTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TATGGCTCCTT-CA--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ATtgcaatgcatggttgctatttgacttctggcataaggtaataatacataccatcta
gi|134278 : CTTGTCTTAAGCAGCCG-----CATTTA-A-TAT-----TTCTCATTTCT-ATGTTTTCAG--GG-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCGCC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACTTC-A--TA-TA---GTa
gi|134279 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TAT-----TTTCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAGCCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCTTACATACAGTAT--AAA-------AGGCCAC-TCTCACTCCAT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--atatacat
gi|134280 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CACTT-----AT---------CATTTCC-ATGCTTTCAT--GG-CAAA-CTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGCCAC--TTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGATAGGTTTGACT---G--TA-T
gi|134281 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATGTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-G-AACTTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTTGCTACTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-gtgctat
gi|134282 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTAAG-GTGCTTTCAG--GG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAC-TTTTGCTTCTT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTatgt
gi|134283 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-G-TAT-----TTCCCATTTCT-AAGCCTTCAG--GG-AAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------GGGTCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTA---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134284 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATGCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TCTTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCGTT--C--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--t
gi|134285 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-G-TAT-----TTCCTGTTTCT-GTGCTTTCAA--AG-CAAA-CTGACCTG----------TATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACCAC-TTTTGTGCCTT-TC--AATGGGTG---GCTG---C---TTAACACAGGTTGGACT---G--AA-TA---
gi|134286 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTTGCT---G--TA-TA---
gi|134287 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAG-C-TAT-----TTCCCATTTTT-ATGCTTTTAT--AG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-TC--CTGGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttga
gi|134288 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCCTTAAG--AT-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAAAC---TG-TCT-----------T---AA-------AGACCAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--CA-gt
gi|134289 : CTTGTCTTAAACAGTCA-----CATTTG-T-T-T-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTTAC--AG-CAAA-TTAAACTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGTCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGCTTGACT---G--gata
gi|134290 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-TAA-----TTCCTATGTAT-ATGCTTCCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTA---AATAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGGCCA--TTTTGCTCCTA-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGTCAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134291 : CCTGTTTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TAT-----TTCCCATT-CT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-CTAACCTA----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGGTCCTA-CC--TTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--Ttaaaaaacacactatctggcagcagcattctg
gi|134292 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTGATCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CATGACTG---ACTA---C---TTAAGCCAGGTGTGACT---G--tga
gi|134293 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAA-T-TAT-----TTCCCATTGCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTGGTTTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--TA-T
gi|134294 : CTTGTCTTAAGCAGTCA-----AATTTG-C-TAT-----TTCCCATATCT---GCTTCCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTCCTT-CC--TTTGGCTG---GCTT---C---TTAAGACAGGTTTGAAT---A--TA-gtgtatattca
gi|134295 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AC-CAAA-TTTACATG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC--TTTATTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TAAAGACAGGTTTGACT---G--TAGTA---Gatattatgtacaatcttaattttattacactgctgaaaataaa
gi|134296 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTTG-A-TTT-----ATCCTATGTTC-ATACTTTCAG--TG-AAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-CTTTGCTCCTTCCC--CTTGATTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---gaatatg
gi|134297 : CTTTTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-ATTTGCTTATT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTAGCT---G--TA-TA---ctgtgtatat
gi|134298 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TAATTG-T-TAT-----TTCCCATTTAT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCTAC-TTTTGCT-CTT-CC--CTTGACTG---TCTG---C---GTAAGACAGGTTTGACT---G--tgagatatgaac
gi|134299 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTA-C-TAT-----ATCCCATGTTC-ATACTTTCAG--TG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCTAC-TTTCACTCATT-CC--CTTGACTG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTAACT---G--TA-TA---
gi|134301 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTTT-ATACTTTTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCTT-TTTTGCTCATT-CC--ACTGACTG---GCTG---C---TTAAGAAACGTTTGACT---G--TA-Tctagtatacatactgtatttatcac
gi|134302 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAG-C-TAT-----TTCGCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAC-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAGCC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTG---GCTT---C---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134303 : CTTGTCTTAAGCAGTCA-----TATTTG-T-TAT-----TTCCGATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTATGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttagtat
gi|134304 : CCTGTCTTAAGCAACCA-----TATTTT-C-TAT-----TCCCTATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-T
gi|134305 : CCTGTCTTAAGCAACCA-----TATTTTTC-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAATCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134306 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CTTTCA-C-TAT-----TTCC--------ATGCTTACAG--AA-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAG-TTTTGCTCCTT-CC--ACTGATTG---GCTG---C---TTCATACAGGTTTGACT---G--TA-Tta
gi|134307 : CTTGTCTTAAGCAGCGA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCGGTTAT-GTGCTTACAT--AG-CAAA-TTAATCTG----------AATTAAACAACAACC---TG-TAT-----------A--AAA-------AGGCCAA-TTTTGCTCCTC-CC--CGTGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134308 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TTT-----TTCCCATTTGT-ATGCTAACAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAGCT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTATGCTCCTT-CC--CTTGGCTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttattat
gi|134310 : CTTGTGTTAAGCAGCCG-----CATATG-C-TAT-----TTCATATTTCG-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTC----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCGC-TTTCATTTATT-CC--CTTGACTG---ACTG---T---TTAAGACAGGTTTGACT---G--
gi|134311 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTT-----AT-----TTCCAATTTAT-ATGTTTTCTG--AG-TAAA-TTAATCTG----------CATTAAACCACAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGACCAC-TTTAGCTTCTT-TC--CTTTACAT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134312 : CTTATTTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-CAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCG-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---acat
gi|134314 : CTCGTCTTAAGCAGCCA-----AATTTG-C-TAT-----TTCCCA-TTCT-ATGTTTTCAA--AATCAAA-TTAACCTG----------CATTAAGCAATAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-CAATGTTCCTT-CC--CTTGACTG---TGTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ttaata
gi|134315 : CCTGTCTTAAGCAGCCA-----CACTTG-T-TAT-----TTCACATTTAT-ATGCTTACAA--AG-CAAA-TTGATCTG----------TATTAAGCAAAAATC---TG-TCC-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCTAT-TC--CTTGATTG---GCTG---T---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA-Ttcat
gi|134316 : CCTATCTTAAACAGCCA-----TATTTT-T-TGT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTTAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAATCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTACTT-CC--CCTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-CA---ttattttacacgaatta
gi|134317 : CTTGTCTTGAGCAGCCA-----CATTGG---TAT-----ATCCCATTTCG-ATTCTTTCAG--AG-CAAA-TTCATCTG----------TATTCAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTGACT---G--t
gi|134318 : CTTGTTCTAAGCAGCCA-----CATTTG-A-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTATCCTG----------TATTAAGCTACAACC---TG-TCT-----------T---AA-------AGGCCAT-TTTTGTTCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TAAATACCGGTTTGATTTTAA--TA-TA---ATT
gi|134319 : CTTGTCTTAAGCAGCTA-----TATTTG-T-AAT-----TTCCCAATTTT-ATACTTTTAC--AG-CAAA-TTAATCTGCATTTAACAACATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGACAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TAAAGACAGGTTTGACT---G--Tatg
gi|134320 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATG-TTTCAG--GG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------GGGCCAC-ATTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGtaatgtagata
gi|134321 : CTTGTATTAAGCAGCCA-----CAGTAT-C-TGT-----ATCCCATTTCT-ATGATTTCAT--AG-CAAA-TTAAGCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGTTAC-CTTTGCTTCGT-TC--ATTGACTT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGATT---A--TA-TA---AT
gi|134322 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----ATCTTATTTTT-ATGCTTTTAG--TG-TAAC-TTTACCTG----------TATTAAGCAGCAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT--T--CTTGACTG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-gatatgcactaactc
gi|134323 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCAATC----------------AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTTGACTC---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tgtatcattgactaattcagtcattatt
gi|134326 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----ATCCCATTTTT-ATGCTTTCAG--TG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAGCC---TC-CCA-----------T--AAA-------AGGTCAA-TTTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttaacaattctattcaccacatattc
gi|134327 : CTTGTCTTAAGCAACCA-----CATTAG-C-TAT-----ATCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAATCAGGTTTGACT---G--TA-T-----TT-------A--AACATTAgtagatatttaaaattactatta
gi|134328 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTAATCTAG-CAAA-TTTACCTG----------TATCAAACAACAACC---TG-TAT-----------T--AAA-------AGGCCATGTTTTTCTCCTT-CC--CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---ttttcatattaattgaatatgttgaaaa
gi|134329 : CCTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTT-C-TAT-----TTCCTATTTCT-ATGCTTTAAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CT--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTAtagt
gi|134330 : CTTATCTTAAACAGCCA-----AATTT----TTT-----TCCCCAGT-CT-ATGCTTTTAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--
gi|134331 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATATG-C-TAT-----ATCCCATTTCT-AAGCTTTCAT--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------TAGCCAC-TTTT-CTCCTT-CC--CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-T
gi|134333 : CTTGTCTTAACCAGCCA-----CATTTG-T-GAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAATC---TT-TCA-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCACCTT-CC--CTTTACTG---TCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tttacattaatttcgtta
gi|134334 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTTCAATTTTTTATGCTTTTAG--AA-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAGCAAAAACC---TG-CTT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTGCCCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGATAGGTTTGACT---G--TA-Tttaat
gi|134335 : CCTGTCTTAAGCAGTCC-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTGTT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TA-TCT-----------T--AAA-------AGATCAT-TTTTGCTTCAT-CC--CTCGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-Tgtatta
gi|134336 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCA-C-TTT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------TAAAAA-------AGGCCAC-TTTTACTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---GTTTA-TA---Gtataat
gi|134457 : TTGCGTCAAGCAGCCG-----AAATTG---TA-----------AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACAACA---TGCTCT---------------AA-------GGACCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TTAACACAGGTTTAGTT---G--TA-TA---catcatt
gi|134459 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AC-CAAA-TTAACCTG----------TATTAACCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTGCTCATG-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---TTAT-T-TA-A--tcatatgcgcattactcatcactattctgcaaaactaaaaaatactcatctcctctgattctgatgagtaattgcttataagcttaaaaaaaaatcggggactctg
gi|134460 : TTGTCTTAAGCAGTCA-----CATTTG-T-TACATGTATTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGGACAC-TATTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---GCCG---C---TTAATACAGGTTTGACT---A--AA-TA---tta
gi|134461 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCTGATTGCT-ATGCGTTCAG--AC-CAAA-TTAACGTG----------TATTAAACAACAACC---TT-TCT-----------T--AAA-------GGGCCAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---t
gi|134462 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TTT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CATG-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTCGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTAATT---G--TA-TA---taa
gi|134463 : TTGTCTTAAGC-GCCA-----CATTTG-C-GAA-----GTCCCATTTAT-ATGTTTACAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAAACTAAAGAGGAAAT-TTTTGCCCGTT-CC--CTGGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTGATT---G--TA-Ttagta
gi|134464 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTTCCATTTCT-ATGCTTTCGC--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAAACAGCTTTGACT---T--TA-TAAATATTTAC-TA-GCTAATATTtagctgcaaacttact
gi|134476 : TTCT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTT-----------T--AAG-------GGGCCA
gi|134477 : tgtggtaagtagccaaaatcataagTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTTCCATTTAT-ATGCTTTGAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTTAACAACAATA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTACTT-CC--CATGATTG---GCTG---C---TTGGGACAGGTTTGACT---G--TA-Ttaatagtacctcccactgtat
gi|134478 : TGTCTTAAGCAGCCA-----CAATTG-C-TAT-----TTTCCATTTTA-ATGCTTCTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTAGTTCATT-CT--CTTGACTG---GCTG---C---TTATTACAGGTTTGACT---G--TA-TA---tacataa
gi|134486 : TTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-CAT-----TTCCCATTTAT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAATCTG----------CATTCAACAGAAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAA-TTTTGCTGCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---A---CTAAGACAGGTTTGACT---G--AA-Tccata
gi|134488 : taTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--CA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTTAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTAACTC---GCTA---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---
gi|134508 : taGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAAAAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGGCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA-TA---ccaaaataatat
gi|134522 : CAACAACCACATG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACAAAGGTTTGGTT---G--TA-TA---taatatgcgcattactcattactattctgaaaaactcaagaatattcatctactcttgagtttgatgagtgattattcatcgacttaaaaaaattatcttgagctctg
blockSeqs : ATTAC ATGTA T C CATTTAACAA TACATACAGTA ACTAAAG TAT CAA AAC TTA AATA TACTAGCT
blockSeqs : AG . T C . . . TAT CAA AAC TC A TCTAG
blockSeqs : . . C C . . . TAT CAA AAC . G TTTAA
blockSeqs : . . T C . . . TAT AAG AAC . G A
blockSeqs : . . T C . . . TAT CAA . . A
blockSeqs : . . C C . . . TAT . . . A
blockSeqs : . . A C . . . T . . . G
blockSeqs : . . C C . . . . . . . G
blockSeqs : . . T C . . . . . . . T
blockSeqs : . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : *** *** G*** TCTAA*****
originalCons : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TA---GTTT-C-TA-G--AACATTA
finalCons : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA-TAG---TTTCTAA-----AACATTA
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|134523 ): CCATACTATAGTACCTCCCCACTGTATGCTGTAGCTTAACACATATTTGGTTGTATATCATATTCATAATACTCGTCACTATGTGAAAAACTTATAGATACTCATCTATTCTGATTTTGATGAGTAATTACTCATCAGCTTAAAAAATTACCTGGGGCTCTG
Unaligned ( gi|134513 ): ATGTGGATTTTANNNNNNNNNNCAAACTTGGTCTGCATTTAACAACCACATGCTCTATAGTACCTCCCACTGTATGCTGTAGCTGAACACATATTTAGTTTTAAATTTTTTGCACAATACTCATCACTATTTTGAAAAACTGTTGAATATTCATCTACTCTGATTTGATGGGTAATTACTACTCATAAGCTTAAATTGTTATCTAGGGTCCTG
Unaligned ( gi|134524 ): CAACTCTGCACTGGTTGTATATAACATACGCAATACTCATCACTATTCTGAAAAACTCAAGAATACTCATCTACTCTGATTTTGAGTAATTACTCATCGGCTCAAAGAGTTATCTGTGGCTCT
Unaligned ( gi|134526 ): TGGTTGTATATATATCATATATGCACAATACTCATCACTGTTCCGAAAAACTCAAGAATACTCCCATCTACTCTGATTTTGATGAGAAATTACTCATCAGCTTAAAAAATTTTCCAGGGCT
Unaligned ( gi|134525 ): TTTGGTAGTACATGTATATCAAATGTGCAATACTCACCACTACTCTGAAAAACTCAAGAATACTCATCTACTCAGATTTTGATGAGTATAATTACTCATTGGCATAAAAATTTATCTGGAGCTATG
Unaligned ( gi|134527 ): TGATTGTATGTCATAATTATGTGCAATACTCATTACTATTTTGGAAAAACTCAAGAATACTGAGTCTCATCTACTCTGATTTTGATGAGTTATTACTCATTGGCTTAAAAATTATCTGGGGATCTG
Unaligned ( gi|134528 ): TAATAAACAATGTCGCTAACCACTATTCCGAAAAACTCAAGAAAAATCATCAACTCTGATTTTGAGTAGTACTCATCGACTTAAAAAATTATCTGGGACTCTG
Unaligned ( gi|134529 ): ACACTCATCTTCTCTGATTTTGATGAGTTATTACTCCTCGGCTTAAAAAATTATCTTGGGCTTTG
Unaligned ( gi|134530 ): TGCTCTGATTTTGCTGTAATTACCCATCGGCTTAAAAAATGATCTGGAGCTCTG
Unaligned ( gi|134531 ): AATTACTCATCGGCTTAAAAAATTATCTGGAGCTCTG
Alignments
lowQualScore : 1111111
lowQualScore : 11111 000 11111 1 0 00 0 4 2222222222 000 0 22222222222 00 1111111 0 0 00 666 444 333 111 00 11 4444444 3
lowQualScore : ..... ... ..... . . .. . . .......... ... . ........... .. ....... . . .. ... ... ... ... .. .. ....... .
lowQualScore : 88888 666 11111 9 4 66 9 5 0000000000 888 9 11111111111 66 5555555 5 5 66 111 888 222 555 77 99 8888888 2
consensus : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TAG-TTTCTAAAACATTA
Reference ( family-142 ) : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TAG-TTTCTAAAACATTA
gi|134250 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AATATG-T-TA-----------GTTT-T-ATAATTACAG---T-CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAGCAACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TAAACACAGGTTTGGTT------TA--TA
gi|134251 : CTTGTGTTAAGCAGACA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CCCACTTTAT-----GCTGCAAC---TTAACACAGGGTTGGTT---G--TA--TAtcatatgcacattactcattactattctgaaaaactcaagaatactcatctactttgattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134252 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AACATG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTTGCAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGTTGCAAC---TTAACACAGGTTTGGTT---G--TA--TAtcatatgcgcattactcattactattctgaaaaactcaagaatactcatctactcattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134253 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AA--TA-C--AT-----T----AGTTTT-ATA--TTTAT--AGCCAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--GGG-------GGTCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TTAACACAGGTTTGTTT---G--AA--TAtgctcattactcattactattatgaaaatctcaagaatactcatctactctgattttgaagagtaattattcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134255 : CTTGTATAAAGCAGCCA-----AACATG-T-TAG-----TT---AT-----ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GCACCAT-TATAGTACATC-CC--CATGTATG----CTG---CAACTAAACACAGGTTTGGTT---G--TA--TAtcatatgcgcattactcattactattctgaaaactcaagaatactaatctactatgattttgatgagtaataactcatcctcttaaaatatcatctggagctct
gi|134256 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTT-------------TCCCATTTCT-ATGCTTTTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGACAT-TTTTGTCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--tcatatgtacgttactctactgaaaaactcaagaatattcatctactctgattttgatgagtaattactcatcggcttaaaaaattatctggagctctg
gi|134258 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--------------CC-----------------AACAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGCTAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA--TA
gi|134259 : CTTGTGTTGAGCAGCCA-----AACATG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTT-----------AC-TTGGTCTG----------TATCCAACACCCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GAGCCAT-TATAGTACCTC-CC--C---ACTAT--GCTGAAGC---TTAACACAGGTTTGGTT---G--TA--TAtaatatgcgcattactcattactattctggagaaaaaaaaacaagaatattcatctactctgagtttgatgagtaattacttatcggtttaaaatatttctggagctctg
gi|134260 : CTTGTGTTAAGCAGTCAAG---CA--TG-T-TA-----------GTTT-T-ATATTTACAG--A--CAAACTTGGTCTG----------TATT---CAACAGCC---Tttatatgtgcaattctcattactattccaaaaaatctcaagaatactcatctactctgattttgatgagtaattactcattggcttaaaaagttatctgggggcctg
gi|134261 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG---T-CAAACTTGGTCTG----------TATT---CAACCACA---TGCTCT-----------catgctcta
gi|134263 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATATG-C-CAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTCATCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--Tga
gi|134264 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----AATTTG-C-TAT-----ATTCCATTTAT-ATATTTTCAG--AT-CAAA-CTAACCTG----------TATTAAGCAATAGCC---AG-CTT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTCGCTCATT-CC--A-TGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGATTTGACT---G--TA--CAtggatctacaca
gi|134266 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCGTTTCT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTAATT-CC--CTTGAATG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--tgtgataatttgtaca
gi|134267 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTTT-C-CGT-----TTACCATGTTT-ATATTTTAAG--TT-AAAA-TCAACTTG----------TATTAAGCGACCACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAT-TTTTGCTCTTT-CC--CTTGAGTG---GCTA---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--Tatttaaaataattgtaatattgcaattattaatat
gi|134268 : CTTGTCTTAAACAGCTAATTACCATTTT-TATAT-----TT----TTTTT-A--CTTTTAA-----TTAA-CCAACCTG----------TATTAAACAGCCACC---TA-CCC-----------T--AAG-------GGGTCAC-TTTTGGTATTT-CC--CTTGAATG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--AA--Ttaa
gi|134269 : CTTGTCTTAAATAGCCA-----CATTTT-C-AGT-----TTACCATGTTC-ATACTTTAAG--TT-GAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCATCCACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAT-TTTTGTTCTTT-CC--CTTGAGTG---GCTG---C---TTAACACAGGTTTGATT---G--TA--TAgt
gi|134270 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--TA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T---AA-------AGGCCAT-TTTTGCTCCTT-CC--ACTGAGTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--CAta
gi|134271 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CAAT-G-C-TAT-----GTCCCATTTTT-ATATTTTCAG--GG-AAAA-TTAATCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACAAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--Tacagtacat
gi|134273 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATCTG-C-T-T-----TTCCCATTTCT-ATGTGCTTAG--AA-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTAATCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---tattaatat
gi|134274 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AA-CAAT-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTAACT---G--TA--TAaaaatataa
gi|134275 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTA-A-TAT-----TTTCCATTTTC-ATGCTTTCAT--AG-CAAA-TAAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAC-------AGGCCAC-TTTTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---ACTG---C---TTAATGCAGGTTTGACT---G--TA--TAtggtatgttcaatttcttcaaaaatatattaaaaaaatgactcaatct
gi|134276 : CTTGTTTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAC-----TTCCCATTTCT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACATCC---TG-TCT-----------C--AAA-------AGGCCAC-TATTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA--TAtaatatcaaactctcacatatgctgttgtgcaaa
gi|134277 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATGTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TATGGCTCCTT-CA--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TAA-Ttgcaatgcatggttgctatttgacttctggcataaggtaataatacataccatcta
gi|134278 : CTTGTCTTAAGCAGCCG-----CATTTA-A-TAT-----TTCTCATTTCT-ATGTTTTCAG--GG-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCGCC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACTTC-A--TA--TAG-Ta
gi|134279 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TAT-----TTTCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAGCCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCTTACATACAGTAT--AAA-------AGGCCAC-TCTCACTCCAT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--atatacat
gi|134280 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CACTT-----AT---------CATTTCC-ATGCTTTCAT--GG-CAAA-CTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGCCAC--TTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGATAGGTTTGACT---G--TA--T
gi|134281 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATGTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-G-AACTTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTTGCTACTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--gtgctat
gi|134282 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTAAG-GTGCTTTCAG--GG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAG-------AGGTCAC-TTTTGCTTCTT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTatgt
gi|134283 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-G-TAT-----TTCCCATTTCT-AAGCCTTCAG--GG-AAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------GGGTCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTA---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TA
gi|134284 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATGCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TCTTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCGTT--C--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--t
gi|134285 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-G-TAT-----TTCCTGTTTCT-GTGCTTTCAA--AG-CAAA-CTGACCTG----------TATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGACCAC-TTTTGTGCCTT-TC--AATGGGTG---GCTG---C---TTAACACAGGTTGGACT---G--AA--TA
gi|134286 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAT-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTTGCT---G--TA--TA
gi|134287 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAG-C-TAT-----TTCCCATTTTT-ATGCTTTTAT--AG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-TC--CTGGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--Ttga
gi|134288 : CTTGTGTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCCTTAAG--AT-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAAAC---TG-TCT-----------T---AA-------AGACCAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--CA--gt
gi|134289 : CTTGTCTTAAACAGTCA-----CATTTG-T-T-T-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTTAC--AG-CAAA-TTAAACTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGTCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGCTTGACT---G--gata
gi|134290 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-TAA-----TTCCTATGTAT-ATGCTTCCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTA---AATAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGGCCA--TTTTGCTCCTA-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGTCAGGTTTGACT---G--TA--TA
gi|134291 : CCTGTTTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TAT-----TTCCCATT-CT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-CTAACCTA----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGGTCCTA-CC--TTTCACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--Ttaaaaaacacactatctggcagcagcattctg
gi|134292 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTGATCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CATGACTG---ACTA---C---TTAAGCCAGGTGTGACT---G--tga
gi|134293 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAA-T-TAT-----TTCCCATTGCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATCAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTGGTTTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--TA--T
gi|134294 : CTTGTCTTAAGCAGTCA-----AATTTG-C-TAT-----TTCCCATATCT---GCTTCCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTCCTT-CC--TTTGGCTG---GCTT---C---TTAAGACAGGTTTGAAT---A--TA--gtgtatattca
gi|134295 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AC-CAAA-TTTACATG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC--TTTATTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TAAAGACAGGTTTGACT---G--TAG-TAG-atattatgtacaatcttaattttattacactgctgaaaataaa
gi|134296 : CTTGTCTTAAACAGCCA-----CATTTG-A-TTT-----ATCCTATGTTC-ATACTTTCAG--TG-AAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-CTTTGCTCCTTCCC--CTTGATTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--CAgaatatg
gi|134297 : CTTTTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-ATTTGCTTATT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTAGCT---G--TA--TActgtgtatat
gi|134298 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TAATTG-T-TAT-----TTCCCATTTAT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACA---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCTAC-TTTTGCT-CTT-CC--CTTGACTG---TCTG---C---GTAAGACAGGTTTGACT---G--tgagatatgaac
gi|134299 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTA-C-TAT-----ATCCCATGTTC-ATACTTTCAG--TG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCTAC-TTTCACTCATT-CC--CTTGACTG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTAACT---G--TA--TA
gi|134301 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTTT-ATACTTTTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTTAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCTT-TTTTGCTCATT-CC--ACTGACTG---GCTG---C---TTAAGAAACGTTTGACT---G--TA--Tctagtatacatactgtatttatcac
gi|134302 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTAG-C-TAT-----TTCGCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAC-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAGCC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTG---GCTT---C---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA--TA
gi|134303 : CTTGTCTTAAGCAGTCA-----TATTTG-T-TAT-----TTCCGATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTATGACAGGTTTGACT---G--TA--Ttagtat
gi|134304 : CCTGTCTTAAGCAACCA-----TATTTT-C-TAT-----TCCCTATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--T
gi|134305 : CCTGTCTTAAGCAACCA-----TATTTTTC-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-TAAA-TTAATCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TA
gi|134306 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CTTTCA-C-TAT-----TTCC--------ATGCTTACAG--AA-CAAA-GTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAG-TTTTGCTCCTT-CC--ACTGATTG---GCTG---C---TTCATACAGGTTTGACT---G--TA--Tta
gi|134307 : CTTGTCTTAAGCAGCGA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCCGGTTAT-GTGCTTACAT--AG-CAAA-TTAATCTG----------AATTAAACAACAACC---TG-TAT-----------A--AAA-------AGGCCAA-TTTTGCTCCTC-CC--CGTGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TA
gi|134308 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-C-TTT-----TTCCCATTTGT-ATGCTAACAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAACAACAGCT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTATGCTCCTT-CC--CTTGGCTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--Ttattat
gi|134310 : CTTGTGTTAAGCAGCCG-----CATATG-C-TAT-----TTCATATTTCG-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTC----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCGC-TTTCATTTATT-CC--CTTGACTG---ACTG---T---TTAAGACAGGTTTGACT---G--
gi|134311 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTT-----AT-----TTCCAATTTAT-ATGTTTTCTG--AG-TAAA-TTAATCTG----------CATTAAACCACAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGACCAC-TTTAGCTTCTT-TC--CTTTACAT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TA
gi|134312 : CTTATTTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-CAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCG-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TAacat
gi|134314 : CTCGTCTTAAGCAGCCA-----AATTTG-C-TAT-----TTCCCA-TTCT-ATGTTTTCAA--AATCAAA-TTAACCTG----------CATTAAGCAATAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAC-CAATGTTCCTT-CC--CTTGACTG---TGTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TAttaata
gi|134315 : CCTGTCTTAAGCAGCCA-----CACTTG-T-TAT-----TTCACATTTAT-ATGCTTACAA--AG-CAAA-TTGATCTG----------TATTAAGCAAAAATC---TG-TCC-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCTAT-TC--CTTGATTG---GCTG---T---TTAAAACAGGTTTGACT---G--TA--Ttcat
gi|134316 : CCTATCTTAAACAGCCA-----TATTTT-T-TGT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTTAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAATCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTACTT-CC--CCTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--CAttattttacacgaatta
gi|134317 : CTTGTCTTGAGCAGCCA-----CATTGG---TAT-----ATCCCATTTCG-ATTCTTTCAG--AG-CAAA-TTCATCTG----------TATTCAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTGACT---G--t
gi|134318 : CTTGTTCTAAGCAGCCA-----CATTTG-A-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTATCCTG----------TATTAAGCTACAACC---TG-TCT-----------T---AA-------AGGCCAT-TTTTGTTCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TAAATACCGGTTTGATTTTAA--TA--TAA-TT
gi|134319 : CTTGTCTTAAGCAGCTA-----TATTTG-T-AAT-----TTCCCAATTTT-ATACTTTTAC--AG-CAAA-TTAATCTGCATTTAACAACATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGACAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTAACTG---GCTG---C---TAAAGACAGGTTTGACT---G--Tatg
gi|134320 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATG-TTTCAG--GG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------GGGCCAC-ATTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGtaatgtagata
gi|134321 : CTTGTATTAAGCAGCCA-----CAGTAT-C-TGT-----ATCCCATTTCT-ATGATTTCAT--AG-CAAA-TTAAGCTG----------TATTAAGCAACAATC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGTTAC-CTTTGCTTCGT-TC--ATTGACTT---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGATT---A--TA--TAA-T
gi|134322 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----ATCTTATTTTT-ATGCTTTTAG--TG-TAAC-TTTACCTG----------TATTAAGCAGCAATC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT--T--CTTGACTG---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--gatatgcactaactc
gi|134323 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTCCAATC----------------AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTTGACTC---GTTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--Tgtatcattgactaattcagtcattatt
gi|134326 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----ATCCCATTTTT-ATGCTTTCAG--TG-CAAA-TTCACCTG----------TATTAAGCAACAGCC---TC-CCA-----------T--AAA-------AGGTCAA-TTTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TATGTAGATATTTAAAAtaacaattctattcaccacatattc
gi|134327 : CTTGTCTTAAGCAACCA-----CATTAG-C-TAT-----ATCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CC--CTTCACTG---GCTG---C---TTAAATCAGGTTTGACT---G--TA--T---TT----AAACATTAttactatta
gi|134328 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTAATCTAG-CAAA-TTTACCTG----------TATCAAACAACAACC---TG-TAT-----------T--AAA-------AGGCCATGTTTTTCTCCTT-CC--CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TAttttcatattaattgaatatgttgaaaa
gi|134329 : CCTGTCTTAAGCAGCCA-----TATTTT-C-TAT-----TTCCTATTTCT-ATGCTTTAAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTCATT-CT--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGGCT---G--TA--TAG-TTTCTAGAACATTAtagt
gi|134330 : CTTATCTTAAACAGCCA-----AATTT----TTT-----TCCCCAGT-CT-ATGCTTTTAG--AG-TAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAATA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCCCCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--
gi|134331 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATATG-C-TAT-----ATCCCATTTCT-AAGCTTTCAT--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------TAGCCAC-TTTT-CTCCTT-CC--CATGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--T
gi|134333 : CTTGTCTTAACCAGCCA-----CATTTG-T-GAT-----TTCCCATTTAT-ATGCTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAACAACAATC---TT-TCA-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCACCTT-CC--CTTTACTG---TCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--Tttacattaatttcgtta
gi|134334 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTTCAATTTTTTATGCTTTTAG--AA-CAAA-TTAACCTG----------CATTAAGCAAAAACC---TG-CTT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTGCCCATT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGATAGGTTTGACT---G--TA--Tttaat
gi|134335 : CCTGTCTTAAGCAGTCC-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTGTT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TA-TCT-----------T--AAA-------AGATCAT-TTTTGCTTCAT-CC--CTCGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--Tgtatta
gi|134336 : CTTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTCA-C-TTT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--AG-CAAA-TTTACCTG----------TATTAAGCAACAACT---TG-TCT-----------TAAAAA-------AGGCCAC-TTTTACTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---GTTTA--TAG-tataat
gi|134457 : TTGCGTCAAGCAGCCG-----AAATTG---TA-----------AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACAACA---TGCTCT---------------AA-------GGACCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTGCAAC---TTAACACAGGTTTAGTT---G--TA--TAcatcatt
gi|134459 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AC-CAAA-TTAACCTG----------TATTAACCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------ATGCCAC-TTTTGCTCATG-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TAT-TATTTAAAtcatatgcgcattactcatcactattctgcaaaactaaaaaatactcatctcctctgattctgatgagtaattgcttataagcttaaaaaaaaatcggggactctg
gi|134460 : TTGTCTTAAGCAGTCA-----CATTTG-T-TACATGTATTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--TAA-------AGGACAC-TATTGTTCCTT-CC--CTTGACTG---GCCG---C---TTAATACAGGTTTGACT---A--AA--TAtta
gi|134461 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCTGATTGCT-ATGCGTTCAG--AC-CAAA-TTAACGTG----------TATTAAACAACAACC---TT-TCT-----------T--AAA-------GGGCCAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TAt
gi|134462 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TTT-----TTCCCATTTCT-ATGCTTTCAG--AG-CATG-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTCCTT-CC--CTCGACTG---ACTG---C---TTAAGACAGGTTTAATT---G--TA--TAtaa
gi|134463 : TTGTCTTAAGC-GCCA-----CATTTG-C-GAA-----GTCCCATTTAT-ATGTTTACAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACA---TG-TCT-----------T--AAAACTAAAGAGGAAAT-TTTTGCCCGTT-CC--CTGGACTG---GCTG---C---TTAATACAGGTTTGATT---G--TAT-TAG-CTGC--AAAC-TTAtagta
gi|134464 : TTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTTCCATTTCT-ATGCTTTCGC--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TTT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTGCTTCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---C---TTAAAACAGCTTTGACT---T--TA--TAct
gi|134476 : TTCT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAACAACCACA---TG-CTT-----------T--AAG-------GGGCCAaatatttactagctaatatt
gi|134477 : tgtggtaagtagccaaaatcataagTGTCTTAAGCAGCCA-----CATTTG-T-TAT-----TTTCCATTTAT-ATGCTTTGAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------CATTTAACAACAATA---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTTACTACTT-CC--CATGATTG---GCTG---C---TTGGGACAGGTTTGACT---G--TA--Ttaatagtacctcccactgtat
gi|134478 : TGTCTTAAGCAGCCA-----CAATTG-C-TAT-----TTTCCATTTTA-ATGCTTCTAG--AG-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGCCAC-TTTAGTTCATT-CT--CTTGACTG---GCTG---C---TTATTACAGGTTTGACT---G--TA--TAtacataa
gi|134486 : TTAAGCAGCCA-----TATTTG-T-CAT-----TTCCCATTTAT-ATACTTTCAG--AG-CAAA-TTAATCTG----------CATTCAACAGAAACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTCAA-TTTTGCTGCTT-CC--CTTGACTG---GCTG---A---CTAAGACAGGTTTGACT---G--AA--Tccata
gi|134488 : taTTAAGCAGCCA-----CATTTG-C-TAT-----TTCCCATTTCT-ATGTTTTCAG--CA-CAAA-TTAACCTG----------TATTAAGCAACCACC---TG-TCT-----------T--AAA-------AGGTTAC-TTTTGCTCCTT-TC--CTTAACTC---GCTA---C---TTAAGACAGGTTTGACT---G--TA--TA-----CCAAAATAATA
gi|134508 : taGCAGCCA-----AAT----A-TAT-----T----AGTTTT-ATATTTACAG--C--CAAACTTGGTCTG----------TATTCAAAAACCACA---TG-CTC-----------T--AAG-------GGGGCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACACAGGTTTGGTT---G--TA--TAt
gi|134522 : CAACAACCACATG-CTC-----------T--AAG-------GGGCCAT-TATAGTACATC-CC--C---ACTGTATGCTG---CAACTTAACAAAGGTTTGGTT---G--TA--TAtaatatgcgcattactcattactattctgaaaaactcaagaatattcatctactcttgagtttgatgagtgattattcatcgacttaaaaaaattatcttgagctctg
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|134523 ): CCATACTATAGTACCTCCCCACTGTATGCTGTAGCTTAACACATATTTGGTTGTATATCATATTCATAATACTCGTCACTATGTGAAAAACTTATAGATACTCATCTATTCTGATTTTGATGAGTAATTACTCATCAGCTTAAAAAATTACCTGGGGCTCTG
Unaligned ( gi|134513 ): ATGTGGATTTTANNNNNNNNNNCAAACTTGGTCTGCATTTAACAACCACATGCTCTATAGTACCTCCCACTGTATGCTGTAGCTGAACACATATTTAGTTTTAAATTTTTTGCACAATACTCATCACTATTTTGAAAAACTGTTGAATATTCATCTACTCTGATTTGATGGGTAATTACTACTCATAAGCTTAAATTGTTATCTAGGGTCCTG
Unaligned ( gi|134524 ): CAACTCTGCACTGGTTGTATATAACATACGCAATACTCATCACTATTCTGAAAAACTCAAGAATACTCATCTACTCTGATTTTGAGTAATTACTCATCGGCTCAAAGAGTTATCTGTGGCTCT
Unaligned ( gi|134526 ): TGGTTGTATATATATCATATATGCACAATACTCATCACTGTTCCGAAAAACTCAAGAATACTCCCATCTACTCTGATTTTGATGAGAAATTACTCATCAGCTTAAAAAATTTTCCAGGGCT
Unaligned ( gi|134525 ): TTTGGTAGTACATGTATATCAAATGTGCAATACTCACCACTACTCTGAAAAACTCAAGAATACTCATCTACTCAGATTTTGATGAGTATAATTACTCATTGGCATAAAAATTTATCTGGAGCTATG
Unaligned ( gi|134527 ): TGATTGTATGTCATAATTATGTGCAATACTCATTACTATTTTGGAAAAACTCAAGAATACTGAGTCTCATCTACTCTGATTTTGATGAGTTATTACTCATTGGCTTAAAAATTATCTGGGGATCTG
Unaligned ( gi|134528 ): TAATAAACAATGTCGCTAACCACTATTCCGAAAAACTCAAGAAAAATCATCAACTCTGATTTTGAGTAGTACTCATCGACTTAAAAAATTATCTGGGACTCTG
Unaligned ( gi|134529 ): ACACTCATCTTCTCTGATTTTGATGAGTTATTACTCCTCGGCTTAAAAAATTATCTTGGGCTTTG
Unaligned ( gi|134530 ): TGCTCTGATTTTGCTGTAATTACCCATCGGCTTAAAAAATGATCTGGAGCTCTG
Unaligned ( gi|134531 ): AATTACTCATCGGCTTAAAAAATTATCTGGAGCTCTG