lowQualScore : 3 1 00 0 0 2 0 00 4
lowQualScore : . . .. . . . . .. .
lowQualScore : 4 0 66 4 4 0 8 66 4
consensus : TTGGTAGCGCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
Reference ( gi|23272 ) : TTGGTAACACGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23268 : TTGGTAACGCGTTT-G--ACTATCAATTCAGGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23280 : TTGGTTACGCATCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23279 : TTGGTTACGCGTCT-G--ACTATCAGTTCAGGGGT-CATGAGTTCGAAT-C-CCC--GTCCGGCAACAGTCT
gi|23274 : TTGGTAACGCGTCT-G--ACTATCAATCCTGGGGT-TGTGAGTTCGAAT-C-CCT--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23284 : TTGGTAGTGTGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTTGAAT-C-CTC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23270 : TTGGTTGCGCGTTT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23281 : TTGGTTATGCGTCT-G--ACTATCAATCAATGGGT-TGTGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCTt
gi|23266 : TTGGTAATGCATCT-G--ACTATCAATCCAGGGAC-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCCAGTCACAGTCT
gi|23282 : TTGGTAGCATGTCT-G--ACTATCAATCTAGGGGT-TGTGAGTTTGAAA-C-CCC--ACCCAGCCACAGTCT
gi|23277 : TTGGTAGCATATCT-G--ACTATCAATCGAGGGAT-CATGAGTTTGAAT---CCC--GCCCAGCCACAGTCT
gi|23263 : TTGGTAGCCTGTCT-A--ACTATCAATGTTTGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-TCT--GTCCAGCCACAGT
gi|23244 : cTTGGCGA-GCGTAT-T--ACTATCAATCCTTGGTT-CATAAGTTTGAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTgtt
gi|23317 : tcaataccagtatttcccctTGGTAACGCATCT-G--ACTATCAATCCTGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTTTt
gi|23258 : TGGCAA-GCGTAT-T--ACTATCAATCCTTGGTT-CATGAGTTTGAAT---CCC--ATCCGGCCACAGTCT
gi|23249 : ataccaatatttccccctgTGGCGA-ACGTAT-T--ACTATCAATCCACGGTT-CATGAGTTTGAAT-C-TCC--ATTCAACCACAGTCTt
gi|23254 : tcaatatgagtattttcccctgGGTAA-GTGTAT-T--ACTATCAATCCTTGGTT-CG-GAGTTTGAAT-C-CCC--ATCCGGACGCAGTCT
gi|23253 : tcaataccagtgtttcccccgGTGACAAGTGT-ATTACTATCAATTTTTTGTT-CATGAGTTTGAAT-C-TCC--ATCTGGTCACAGTCTt
gi|23271 : tcattaccagtatttccccctTAGCGCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCTt
gi|23283 : tTAGCGCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-TATTAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCAGCCACAATCTt
gi|23278 : tTAGCGCGTCT-G--ACTATCAATCCAAGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCTCAGCCACAATCT
gi|23273 : tTAGCGCGTCT-G--ACTATCAATCCTGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--TCCCGGCCACGGTCT
gi|23276 : tTAGCGCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGTT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCA--GCCCGACCACTGTCT
gi|23339 : tAGCGTGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTCAAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23342 : AGCGCATCT-G--ACTATCAAACCAGGGAT-CACGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23336 : AGCGCATCT-G--ACTGTCAATCCAGGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCT--GTCCGGCCACAATCT
gi|23334 : AGCGTGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCA--ATCTGGCCACAGTCT
gi|23340 : AGCGTGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTTGAAT-C-TTC--GCCCAGCCACAATCT
gi|23338 : AGCATATCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CATAAGTTTGAAT-C-CCT--G-CCAACCATAGTCT
gi|23337 : AGCGTGTTT-G--ACTATCAATCCAGGAGT-TGTGGGTTTGAAT-C-CCC--ACCCAGCCACAGTTT
gi|23335 : AACGTGTTC-G--ACTAACAATCCAGGGAT-CATGAGTTTGAAT-C-CCT--ATCTGACCACAGTC
gi|23257 : ACGTAT-A--ACTATCAGTCATTGGTT-TGTGAGTTTGAAT-C-CCT--ATCCGGCTACAGTCTct
gi|23358 : aataccagtatgtccccctattgcaaCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCTt
gi|23482 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23389 : CGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23387 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23386 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23385 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23369 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23375 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23391 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCTt
gi|23382 : gCGTCTTG--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCGGAAACAGTCT
gi|23479 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CACGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23364 : CGTAT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23362 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGTT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23381 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTCGAATCC-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23383 : gCGTCT-G--ATTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTTGAATCC-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23388 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTCCGAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23384 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCCTTGCCCAGCAACAGTTT
gi|23323 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGAT-CGTGAGTTCAAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23357 : gagCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTTGGAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23372 : gCGTCT-G--ACTGTCAATCCAGGGTT-CATGAGTTTGAATCC-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23365 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCTAGGGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CTC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23360 : gCGTCT-G--ACTTTCAATCCATGGGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23380 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-CTCCC--ACCCGACAACAGTCT
gi|23366 : gCGTCT-T--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTCGAAT-T-TCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23363 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCAGGCTT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23374 : gCGCCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CTC--ACCCGGCCACAGTCT
gi|23498 : gCATTT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTTGAATCC-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23477 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCATGGGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCCGGCTACAG
gi|23377 : CGTCT-G--ACTATCAATCCAGCAGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CCT--GCCCAGCCACAGTCT
gi|23480 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCGGTGAT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--ACCCGGTCACAGTCT
gi|23361 : CGTCTTG--ACTATCAATCCAGGT-T-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--ATCTGGCAACAGTCT
gi|23481 : gCGTCT-G--ACTATCAATCCATGAGT-CGTGAGTTCGAAT-A-CCT--ACCCAGCCACAGTCT
gi|23250 : CGTAT-T--ACTATCAATCTATGGTT-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--ATCCAGCCACAGTCT
gi|23321 : tcaatatgagtatttctccctgtgacgatCGTCT-G--ACTATCAACCCTGGGGT-CATGAGCTTGAAT-C-TTG--GCCAAACCACAGTCTt
gi|23320 : gagCGTCT-G--ACTATCAATCCTGGGCT-TGTGAGTTTCAAT-C-CCC--ACTTGGCCACAGT
gi|23245 : gagCGTAT-T--ACTATCAATCCTTGGTT-CTTGAGTTTGAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCT
gi|23247 : tcaataccagtatttctccctgtggcgagCGTAT-T--ACTATCAATTCTTGGTT-CATGACTTTGAAT-C-CCC--ATCCGCCCACAGTCTt
gi|23246 : tcaataccagtatttcaaccctgtggcgagCGTAT-T--ACTATCATTACTTGGTT-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23252 : tcaataccagtatttcccctgtggcgagCGTAT-T--GCTATCAATCCTTGGTT-CATGAGTTTGAAT---CCC--ATCTGGCCAAAGTCTt
gi|23251 : tcagtaccagtatttctgtctgtggcgagCGTAT-T--GCTATCAGTCCTTAGTC-CGTGAGTTTGAAT---CCC--ATCCGACCACAGTCTt
gi|23322 : tcaataccagtaccttcccctgtggcgagGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCTt
gi|23371 : gagtGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CCC--GTCCGGCAACAGTCT
gi|23319 : gtGTCT-G--ACTATCAATCCAGGTGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23367 : cgtgtGTCT-G--ACTATCAATCCAGGGGT-CTTGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCTGGCCACAGTCT
gi|23495 : gtGTCT-T--ACTATCAATCCAGAGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCT--GCCCAGCCACATTCTt
gi|23496 : GTCT-T--ACTATCAATCCAGGGAT-TGTGAGTTTGAAT-C-CCT--ACCCAATGACAGTCT
gi|23494 : GTCT-T--ACCATCAATCCAGTGGT-CATGAGCTTGAAT-C-TCC--ATCCATCCATAGTCT
gi|23368 : T-G--ACTATCAATCCAGGGTTTCGTGAGTTTGAAT-C-CCC--ACACGGCCACAGTCT
gi|23373 : gcgatT-G--ACTATCAATCCTGGGGC-CGTGAATTTGAAT-C-CCT--GCCCAAC--CAGTCT
gi|23493 : gcataT-G--ACTATCAATCCCGGGAT-CGTGAGTTTGAATCC-CCC--ATCTGACCACAATCT
gi|23513 : gca--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTTGAAT-C-CCC--GCCCGACAACAGTCT
gi|23505 : --ACTATCAATCCAGGGTT-CACGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23512 : --ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23497 : --ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCC--GTCCAGCAACAGTCT
gi|23499 : gcattca--ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTTGAAT-C-CCT--GCCCAGTCACAGTCT
gi|23509 : tgtc--ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTGGAAT-C-CCC--GGCCAGCCACAGTCT
gi|23514 : --ACTATCAATCCAATGGC-CGTGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCCGGCCACAGTCT
gi|23510 : --ACTATCAATCCAGGTGT-CGTGAGTTTGATT-C-CCC--ATCCGACAACAGTCT
gi|23500 : --ACTAGCAATCCAGGG-T-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--ACCTGGCCACAGTCT
gi|23504 : tagt--ACTATCAATCCTTGGGT-CATGAGTTCGAAT-CTCCC--GTCCGGCCACAGTCT
gi|23511 : --ACTATCAATCCAGGATT-CGTGAGTTCGAAT-C-CCT--ATCCAGCAACAGTCT
gi|23248 : --ACTATCAATCCTTGGTT-CGTGAGTTTGAAT---CCC--ATCCGGCCACAGTCT
gi|23259 : tcaatacgagtatttccccctgtggcaagcttatt--ACTATTAATCTAATGTT-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--ATCTGGTCACAGTCTt
gi|23515 : gcatttcctgtggcgagcggact--ACTATCAATCTTGGGAT-CATAACTCTGAAT-C-CCC--ATGCAGCCACAGTCT
gi|23506 : --ACTGTCAATCCATGA-T-TGTGAGTTTGAAT-C-CCC--ATCCAGCCACAATCT
gi|23555 : ATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTTGAAT-T-CCC--ACTCAACCACAGTCT
gi|23255 : GGTT-CATGAGTTTGAAT-C-CCC--ATCCGACCACAATCT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|23256 ): TTAATATCGGTATTTCCCCCCTGTGGCGAGCGTATTACTATAAATTCTTGGTTTATGAATCCCCATCCAACCACAGTCTT
Alignments
lowQualScore : 00 44 0 0 111 2 0 00 2
lowQualScore : .. .. . . ... . . .. .
lowQualScore : 77 88 9 4 444 0 8 55 3
consensus : TTGGTAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
Reference ( family-133 ) : TTGGTAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23244 : TTGGC-GA--G--CGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CATAAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCT
gi|23245 : tcaataccagtatttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CTTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23246 : tcaataccagtatttctccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCATTACTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23247 : tcaataccagtatttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCAATTCTTGGTT-CATGACTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGCCCACAGTCTt
gi|23248 : tcaataccagtatttcaaccctACTATCAATCCTTGGTT-CGTGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGGCCACAGTCTt
gi|23249 : tcaatacgagtatttccccctgtggcaagcttattGTGGC--GAACGTAT-TACTATCAATCCACGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCC--ATTCAACCACAGTCTt
gi|23250 : tcaatatgagtattttcccct--CGTAT-TACTATCAATCTATGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAGCCACAGTCT
gi|23251 : tcaatatgagtatttctccctgtgacgatGTGGC--GAGCGTAT-TGCTATCAGTCCTTAGTC-CGTGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGACCACAGTCTt
gi|23252 : tcaataccagtaccttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TGCTATCAATCCTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--ATCTGGCCAAAGTCTt
gi|23253 : tcagtaccagtatttctgtct--G--TGTAT-TACTATCAATTTTTTGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCC--ATCTGGTCACAGTCTt
gi|23254 : tcattaccagtatttccccctgtgacaaGGTAA---G--TGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CG-GAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGGACGCAGTCTt
gi|23255 : tcaataccagtgtttcccccgGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGACCACAATCTt
gi|23256 : tcaataccagtatttccccctgtggcgagcatactctttGTGGC--GAGCGTAT-TACTATAAAT-------T-CTTG-GTTTATGAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23257 : ttaatatcggtatttcccccct--CGTAT-AACTATCAGTCATTGGTT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--ATCCGGCTACAGTCTt
gi|23258 : aataccagtatgtccccctattgcaaaGTGGCAAG--CGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGGCCACAGTCTt
gi|23259 : ataccaatatttccccctAGC--G---GACT--ACTATTAATCTAATGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCTGGTCACAGTCTt
gi|23263 : gcatttcctgtggcgTTGGTAGC--C--TGTCT-AACTATCAATGTTTGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCT--GTCCAGCCACAGT
gi|23266 : cTTGGTAAT--G--CATCT-GACTATCAATCCAGGGAC-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGTCACAGTCTgtt
gi|23268 : TTGGTAAC--G--CGTTT-GACTATCAATTCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23270 : TTGGTTGC--G--CGTTT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23271 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCTt
gi|23272 : tTTGGTAAC--A--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCTt
gi|23273 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--TCCCGGCCACGGTCT
gi|23274 : tTTGGTAAC--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGGT-TGTGAGTTC--GAAT-C-CCT--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23276 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCA--GCCCGACCACTGTCT
gi|23277 : tTTGGTAGC--A--TATCT-GACTATCAATCGAGGGAT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--GCCCAGCCACAGTCT
gi|23278 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAAGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCTCAGCCACAATCT
gi|23279 : tTTGGTTAC--G--CGTCT-GACTATCAGTTCAGGGGT-CATGAGTTC--GAAT-C-CCC--GTCCGGCAACAGTCT
gi|23280 : TTGGTTAC--G--CATCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23281 : TTGGTTAT--G--CGTCT-GACTATCAATCAATGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23282 : TTGGTAGC--A--TGTCT-GACTATCAATCTAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAA-C-CCC--ACCCAGCCACAGTCT
gi|23283 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TATTAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCAGCCACAATCT
gi|23284 : tTTGGTAGT--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CTC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23317 : TGGTAAC--G--CATCT-GACTATCAATCCTGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTTT
gi|23319 : GT--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGTGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23320 : c--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGCT-TGTGAGTTT--CAAT-C-CCC--ACTTGGCCACAGT
gi|23321 : ga--G--CGTCT-GACTATCAACCCTGGGGT-CATGAGCTT--GAAT-C-TTG--GCCAAACCACAGTCT
gi|23322 : ga--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23323 : ga--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGAT-CGTGAGTTC--AAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23334 : gaAGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCA--ATCTGGCCACAGTCT
gi|23335 : AAC--G--TGTTC-GACTAACAATCCAGGGAT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--ATCTGACCACAGTC
gi|23336 : AGC--G--CATCT-GACTGTCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GTCCGGCCACAATCTct
gi|23337 : AGC--G--TGTTT-GACTATCAATCCAGGAGT-TGTGGGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCCACAGTTT
gi|23338 : AGC--A--TATCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATAAGTTT--GAAT-C-CCT--G-CCAACCATAGTCT
gi|23339 : AGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--AAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23340 : AGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-TTC--GCCCAGCCACAATCT
gi|23342 : AGC--G--CATCT-GACTATCAAACCAGGGAT-CACGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23357 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GGAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23358 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23360 : --G--CGTCT-GACTTTCAATCCATGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23361 : --G--CGTCTTGACTATCAATCCAGGT-T-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ATCTGGCAACAGTCT
gi|23362 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23363 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGCTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23364 : --G--CGTAT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23365 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCTAGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CTC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23366 : --G--CGTCT-TACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--GAAT-T-TCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23367 : --G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CTTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCTGGCCACAGTCT
gi|23368 : --G--CGATT-GACTATCAATCCAGGGTTTCGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACACGGCCACAGTCTt
gi|23369 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23371 : --G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GTCCGGCAACAGTCT
gi|23372 : --G--CGTCT-GACTGTCAATCCAGGGTT-CATGAGTTT--GAATCC-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23373 : --G--CATAT-GACTATCAATCCTGGGGC-CGTGAATTT--GAAT-C-CCT--GCCCAAC--CAGTCT
gi|23374 : --G--CGCCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CTC--ACCCGGCCACAGTCT
gi|23375 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23377 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGCAGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGCCACAGTCTt
gi|23380 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-CTCCC--ACCCGACAACAGTCT
gi|23381 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--GAATCC-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23382 : --G--CGTCTTGACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGAAACAGTCT
gi|23383 : --G--CGTCT-GATTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAATCC-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23384 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCCTTGCCCAGCAACAGTTT
gi|23385 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23386 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23387 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23388 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTCC--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23389 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23391 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23477 : --CGTCT-GACTATCAATCCATGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCTACAG
gi|23479 : --CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CACGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23480 : --CGTCT-GACTATCAATCCGGTGAT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCGGTCACAGTCT
gi|23481 : --CGTCT-GACTATCAATCCATGAGT-CGTGAGTTC--GAAT-A-CCT--ACCCAGCCACAGTCT
gi|23482 : --CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23493 : T-GACTATCAATCCCGGGAT-CGTGAGTTT--GAATCC-CCC--ATCTGACCACAATCT
gi|23494 : gcaGTCT-TACCATCAATCCAGTGGT-CATGAGCTT--GAAT-C-TCC--ATCCATCCATAGTCT
gi|23495 : GTCT-TACTATCAATCCAGAGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGCCACATTCT
gi|23496 : GTCT-TACTATCAATCCAGGGAT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--ACCCAATGACAGTCT
gi|23497 : --G--CATTC-AACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GTCCAGCAACAGTCT
gi|23498 : --G--CATTT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAATCC-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23499 : ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGTCACAGTCT
gi|23500 : tgtcACTAGCAATCCAGGG-T-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCTGGCCACAGTCT
gi|23504 : tagtACTATCAATCCTTGGGT-CATGAGTTC--GAAT-CTCCC--GTCCGGCCACAGTCT
gi|23505 : ACTATCAATCCAGGGTT-CACGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23506 : ACTGTCAATCCATGA-T-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAGCCACAATCT
gi|23509 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTG--GAAT-C-CCC--GGCCAGCCACAGTCT
gi|23510 : ACTATCAATCCAGGTGT-CGTGAGTTT--GATT-C-CCC--ATCCGACAACAGTCT
gi|23511 : ACTATCAATCCAGGATT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCT--ATCCAGCAACAGTCT
gi|23512 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23513 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGACAACAGTCT
gi|23514 : ACTATCAATCCAATGGC-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCCACAGTCT
gi|23515 : ACTATCAATCTTGGGAT-CATAACTCT--GAAT-C-CCC--ATGCAGCCACAGTCT
gi|23555 : ATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-T-CCC--ACTCAACCACAGTCT
Alignments
lowQualScore : 00 44 0 0 111 2 0 00 2
lowQualScore : .. .. . . ... . . .. .
lowQualScore : 77 88 9 4 444 0 8 55 3
consensus : TTGGTAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
Reference ( family-133 ) : TTGGTAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23244 : TTGGC-GA--G--CGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CATAAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCT
gi|23245 : tcaataccagtatttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CTTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23246 : tcaataccagtatttctccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCATTACTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23247 : tcaataccagtatttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCAATTCTTGGTT-CATGACTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGCCCACAGTCTt
gi|23248 : tcaataccagtatttcaaccctACTATCAATCCTTGGTT-CGTGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGGCCACAGTCTt
gi|23249 : tcaatacgagtatttccccctgtggcaagcttattGTGGC--GAACGTAT-TACTATCAATCCACGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCC--ATTCAACCACAGTCTt
gi|23250 : tcaatatgagtattttcccct--CGTAT-TACTATCAATCTATGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAGCCACAGTCT
gi|23251 : tcaatatgagtatttctccctgtgacgatGTGGC--GAGCGTAT-TGCTATCAGTCCTTAGTC-CGTGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGACCACAGTCTt
gi|23252 : tcaataccagtaccttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TGCTATCAATCCTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--ATCTGGCCAAAGTCTt
gi|23253 : tcagtaccagtatttctgtct--G--TGTAT-TACTATCAATTTTTTGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCC--ATCTGGTCACAGTCTt
gi|23254 : tcattaccagtatttccccctgtgacaaGGTAA---G--TGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CG-GAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGGACGCAGTCTt
gi|23255 : tcaataccagtgtttcccccgGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGACCACAATCTt
gi|23256 : tcaataccagtatttccccctgtggcgagcatactctttGTGGC--GAGCGTAT-TACTATAAAT-------T-CTTG-GTTTATGAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23257 : ttaatatcggtatttcccccct--CGTAT-AACTATCAGTCATTGGTT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--ATCCGGCTACAGTCTt
gi|23258 : aataccagtatgtccccctattgcaaaGTGGCAAG--CGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGGCCACAGTCTt
gi|23259 : ataccaatatttccccctAGC--G---GACT--ACTATTAATCTAATGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCTGGTCACAGTCTt
gi|23263 : gcatttcctgtggcgTTGGTAGC--C--TGTCT-AACTATCAATGTTTGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCT--GTCCAGCCACAGT
gi|23266 : cTTGGTAAT--G--CATCT-GACTATCAATCCAGGGAC-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGTCACAGTCTgtt
gi|23268 : TTGGTAAC--G--CGTTT-GACTATCAATTCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23270 : TTGGTTGC--G--CGTTT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23271 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCTt
gi|23272 : tTTGGTAAC--A--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCTt
gi|23273 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--TCCCGGCCACGGTCT
gi|23274 : tTTGGTAAC--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGGT-TGTGAGTTC--GAAT-C-CCT--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23276 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCA--GCCCGACCACTGTCT
gi|23277 : tTTGGTAGC--A--TATCT-GACTATCAATCGAGGGAT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--GCCCAGCCACAGTCT
gi|23278 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAAGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCTCAGCCACAATCT
gi|23279 : tTTGGTTAC--G--CGTCT-GACTATCAGTTCAGGGGT-CATGAGTTC--GAAT-C-CCC--GTCCGGCAACAGTCT
gi|23280 : TTGGTTAC--G--CATCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23281 : TTGGTTAT--G--CGTCT-GACTATCAATCAATGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23282 : TTGGTAGC--A--TGTCT-GACTATCAATCTAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAA-C-CCC--ACCCAGCCACAGTCT
gi|23283 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TATTAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCAGCCACAATCT
gi|23284 : tTTGGTAGT--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CTC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23317 : TGGTAAC--G--CATCT-GACTATCAATCCTGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTTT
gi|23319 : GT--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGTGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23320 : c--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGCT-TGTGAGTTT--CAAT-C-CCC--ACTTGGCCACAGT
gi|23321 : ga--G--CGTCT-GACTATCAACCCTGGGGT-CATGAGCTT--GAAT-C-TTG--GCCAAACCACAGTCT
gi|23322 : ga--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23323 : ga--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGAT-CGTGAGTTC--AAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23334 : gaAGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCA--ATCTGGCCACAGTCT
gi|23335 : AAC--G--TGTTC-GACTAACAATCCAGGGAT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--ATCTGACCACAGTC
gi|23336 : AGC--G--CATCT-GACTGTCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GTCCGGCCACAATCTct
gi|23337 : AGC--G--TGTTT-GACTATCAATCCAGGAGT-TGTGGGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCCACAGTTT
gi|23338 : AGC--A--TATCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATAAGTTT--GAAT-C-CCT--G-CCAACCATAGTCT
gi|23339 : AGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--AAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23340 : AGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-TTC--GCCCAGCCACAATCT
gi|23342 : AGC--G--CATCT-GACTATCAAACCAGGGAT-CACGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23357 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GGAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23358 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23360 : --G--CGTCT-GACTTTCAATCCATGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23361 : --G--CGTCTTGACTATCAATCCAGGT-T-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ATCTGGCAACAGTCT
gi|23362 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23363 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGCTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23364 : --G--CGTAT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23365 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCTAGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CTC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23366 : --G--CGTCT-TACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--GAAT-T-TCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23367 : --G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CTTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCTGGCCACAGTCT
gi|23368 : --G--CGATT-GACTATCAATCCAGGGTTTCGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACACGGCCACAGTCTt
gi|23369 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23371 : --G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GTCCGGCAACAGTCT
gi|23372 : --G--CGTCT-GACTGTCAATCCAGGGTT-CATGAGTTT--GAATCC-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23373 : --G--CATAT-GACTATCAATCCTGGGGC-CGTGAATTT--GAAT-C-CCT--GCCCAAC--CAGTCT
gi|23374 : --G--CGCCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CTC--ACCCGGCCACAGTCT
gi|23375 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23377 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGCAGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGCCACAGTCTt
gi|23380 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-CTCCC--ACCCGACAACAGTCT
gi|23381 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--GAATCC-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23382 : --G--CGTCTTGACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGAAACAGTCT
gi|23383 : --G--CGTCT-GATTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAATCC-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23384 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCCTTGCCCAGCAACAGTTT
gi|23385 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23386 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23387 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23388 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTCC--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23389 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23391 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23477 : --CGTCT-GACTATCAATCCATGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCTACAG
gi|23479 : --CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CACGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23480 : --CGTCT-GACTATCAATCCGGTGAT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCGGTCACAGTCT
gi|23481 : --CGTCT-GACTATCAATCCATGAGT-CGTGAGTTC--GAAT-A-CCT--ACCCAGCCACAGTCT
gi|23482 : --CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23493 : T-GACTATCAATCCCGGGAT-CGTGAGTTT--GAATCC-CCC--ATCTGACCACAATCT
gi|23494 : gcaGTCT-TACCATCAATCCAGTGGT-CATGAGCTT--GAAT-C-TCC--ATCCATCCATAGTCT
gi|23495 : GTCT-TACTATCAATCCAGAGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGCCACATTCT
gi|23496 : GTCT-TACTATCAATCCAGGGAT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--ACCCAATGACAGTCT
gi|23497 : --G--CATTC-AACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GTCCAGCAACAGTCT
gi|23498 : --G--CATTT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAATCC-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23499 : ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGTCACAGTCT
gi|23500 : tgtcACTAGCAATCCAGGG-T-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCTGGCCACAGTCT
gi|23504 : tagtACTATCAATCCTTGGGT-CATGAGTTC--GAAT-CTCCC--GTCCGGCCACAGTCT
gi|23505 : ACTATCAATCCAGGGTT-CACGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23506 : ACTGTCAATCCATGA-T-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAGCCACAATCT
gi|23509 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTG--GAAT-C-CCC--GGCCAGCCACAGTCT
gi|23510 : ACTATCAATCCAGGTGT-CGTGAGTTT--GATT-C-CCC--ATCCGACAACAGTCT
gi|23511 : ACTATCAATCCAGGATT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCT--ATCCAGCAACAGTCT
gi|23512 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23513 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGACAACAGTCT
gi|23514 : ACTATCAATCCAATGGC-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCCACAGTCT
gi|23515 : ACTATCAATCTTGGGAT-CATAACTCT--GAAT-C-CCC--ATGCAGCCACAGTCT
gi|23555 : ATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-T-CCC--ACTCAACCACAGTCT
blockSeqs : AG TAT C C
blockSeqs : AG T C C
blockSeqs : AG T C C
blockSeqs : AA T C C
blockSeqs : AG T C C
blockSeqs : AG T . C
blockSeqs : AG T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . T
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . C . C
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . C . C
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . C . C
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . C . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . C
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . T . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . T
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : . C . C
blockSeqs : . C . C
blockSeqs : . C . A
blockSeqs : . T . C
blockSeqs : T . C
blockSeqs : T . C
blockSeqs : T . G
blockSeqs : T . A
blockSeqs : C . A
blockSeqs : T . C
blockSeqs : T . C
blockSeqs : T . C
blockSeqs : C . A
blockSeqs : T . C
blockSeqs : T . C
blockSeqs : G . A
blockSeqs : T . A
blockSeqs : C . A
blockSeqs : C . A
blockSeqs : T . C
blockSeqs : T . C
blockSeqs : T . C
blockSeqs : T . .
blockSeqCons :
originalCons : TTGGTAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
finalCons : TTGGTAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
Alignments
lowQualScore : 00 44 0 0 111 2 0 00 2
lowQualScore : .. .. . . ... . . .. .
lowQualScore : 77 88 9 4 444 0 8 55 3
consensus : TTGGTAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
Reference ( family-133 ) : TTGGTAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23244 : TTGGC-GA--G--CGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CATAAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCT
gi|23245 : tcaataccagtatttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CTTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23246 : tcaataccagtatttctccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCATTACTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23247 : tcaataccagtatttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TACTATCAATTCTTGGTT-CATGACTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGCCCACAGTCTt
gi|23248 : tcaataccagtatttcaaccctACTATCAATCCTTGGTT-CGTGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGGCCACAGTCTt
gi|23249 : tcaatacgagtatttccccctgtggcaagcttattGTGGC--GAACGTAT-TACTATCAATCCACGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCC--ATTCAACCACAGTCTt
gi|23250 : tcaatatgagtattttcccct--CGTAT-TACTATCAATCTATGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAGCCACAGTCT
gi|23251 : tcaatatgagtatttctccctgtgacgatGTGGC--GAGCGTAT-TGCTATCAGTCCTTAGTC-CGTGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGACCACAGTCTt
gi|23252 : tcaataccagtaccttcccctGTGGC--GAGCGTAT-TGCTATCAATCCTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--ATCTGGCCAAAGTCTt
gi|23253 : tcagtaccagtatttctgtct--G--TGTAT-TACTATCAATTTTTTGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCC--ATCTGGTCACAGTCTt
gi|23254 : tcattaccagtatttccccctgtgacaaGGTAA---G--TGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CG-GAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGGACGCAGTCTt
gi|23255 : tcaataccagtgtttcccccgGGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCGACCACAATCTt
gi|23256 : tcaataccagtatttccccctgtggcgagcatactctttGTGGC--GAGCGTAT-TACTATAAAT-------T-CTTG-GTTTATGAAT-C-CCC--ATCCAACCACAGTCTt
gi|23257 : ttaatatcggtatttcccccct--CGTAT-AACTATCAGTCATTGGTT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--ATCCGGCTACAGTCTt
gi|23258 : aataccagtatgtccccctattgcaaaGTGGCAAG--CGTAT-TACTATCAATCCTTGGTT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--ATCCGGCCACAGTCTt
gi|23259 : ataccaatatttccccctAGC--G---GACT--ACTATTAATCTAATGTT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCTGGTCACAGTCTt
gi|23263 : gcatttcctgtggcgTTGGTAGC--C--TGTCT-AACTATCAATGTTTGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-TCT--GTCCAGCCACAGT
gi|23266 : cTTGGTAAT--G--CATCT-GACTATCAATCCAGGGAC-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGTCACAGTCTgtt
gi|23268 : TTGGTAAC--G--CGTTT-GACTATCAATTCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23270 : TTGGTTGC--G--CGTTT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23271 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCTt
gi|23272 : tTTGGTAAC--A--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCTt
gi|23273 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--TCCCGGCCACGGTCT
gi|23274 : tTTGGTAAC--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGGT-TGTGAGTTC--GAAT-C-CCT--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23276 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCA--GCCCGACCACTGTCT
gi|23277 : tTTGGTAGC--A--TATCT-GACTATCAATCGAGGGAT-CATGAGTTT--GAAT---CCC--GCCCAGCCACAGTCT
gi|23278 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAAGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCTCAGCCACAATCT
gi|23279 : tTTGGTTAC--G--CGTCT-GACTATCAGTTCAGGGGT-CATGAGTTC--GAAT-C-CCC--GTCCGGCAACAGTCT
gi|23280 : TTGGTTAC--G--CATCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23281 : TTGGTTAT--G--CGTCT-GACTATCAATCAATGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23282 : TTGGTAGC--A--TGTCT-GACTATCAATCTAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAA-C-CCC--ACCCAGCCACAGTCT
gi|23283 : TAGC--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TATTAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCAGCCACAATCT
gi|23284 : tTTGGTAGT--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CTC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23317 : TGGTAAC--G--CATCT-GACTATCAATCCTGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTTT
gi|23319 : GT--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGTGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23320 : c--G--CGTCT-GACTATCAATCCTGGGCT-TGTGAGTTT--CAAT-C-CCC--ACTTGGCCACAGT
gi|23321 : ga--G--CGTCT-GACTATCAACCCTGGGGT-CATGAGCTT--GAAT-C-TTG--GCCAAACCACAGTCT
gi|23322 : ga--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23323 : ga--G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGAT-CGTGAGTTC--AAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23334 : gaAGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCA--ATCTGGCCACAGTCT
gi|23335 : AAC--G--TGTTC-GACTAACAATCCAGGGAT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--ATCTGACCACAGTC
gi|23336 : AGC--G--CATCT-GACTGTCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GTCCGGCCACAATCTct
gi|23337 : AGC--G--TGTTT-GACTATCAATCCAGGAGT-TGTGGGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCAGCCACAGTTT
gi|23338 : AGC--A--TATCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATAAGTTT--GAAT-C-CCT--G-CCAACCATAGTCT
gi|23339 : AGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--AAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23340 : AGC--G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-TTC--GCCCAGCCACAATCT
gi|23342 : AGC--G--CATCT-GACTATCAAACCAGGGAT-CACGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23357 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GGAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23358 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23360 : --G--CGTCT-GACTTTCAATCCATGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23361 : --G--CGTCTTGACTATCAATCCAGGT-T-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ATCTGGCAACAGTCT
gi|23362 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23363 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGCTT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23364 : --G--CGTAT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23365 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCTAGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CTC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23366 : --G--CGTCT-TACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--GAAT-T-TCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23367 : --G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CTTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCTGGCCACAGTCT
gi|23368 : --G--CGATT-GACTATCAATCCAGGGTTTCGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACACGGCCACAGTCTt
gi|23369 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23371 : --G--TGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GTCCGGCAACAGTCT
gi|23372 : --G--CGTCT-GACTGTCAATCCAGGGTT-CATGAGTTT--GAATCC-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23373 : --G--CATAT-GACTATCAATCCTGGGGC-CGTGAATTT--GAAT-C-CCT--GCCCAAC--CAGTCT
gi|23374 : --G--CGCCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CTC--ACCCGGCCACAGTCT
gi|23375 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23377 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGCAGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGCCACAGTCTt
gi|23380 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-CTCCC--ACCCGACAACAGTCT
gi|23381 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTC--GAATCC-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23382 : --G--CGTCTTGACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGAAACAGTCT
gi|23383 : --G--CGTCT-GATTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAATCC-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23384 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCCTTGCCCAGCAACAGTTT
gi|23385 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23386 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23387 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23388 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTCC--GAAT-C-CCC--GCCCAGCAACAGTCT
gi|23389 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23391 : --G--CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23477 : --CGTCT-GACTATCAATCCATGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCTACAG
gi|23479 : --CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CACGAGTTC--GAAT-C-CCC--GCCCGGCCACAGTCT
gi|23480 : --CGTCT-GACTATCAATCCGGTGAT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCGGTCACAGTCT
gi|23481 : --CGTCT-GACTATCAATCCATGAGT-CGTGAGTTC--GAAT-A-CCT--ACCCAGCCACAGTCT
gi|23482 : --CGTCT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGGCAACAGTCT
gi|23493 : T-GACTATCAATCCCGGGAT-CGTGAGTTT--GAATCC-CCC--ATCTGACCACAATCT
gi|23494 : gcaGTCT-TACCATCAATCCAGTGGT-CATGAGCTT--GAAT-C-TCC--ATCCATCCATAGTCT
gi|23495 : GTCT-TACTATCAATCCAGAGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGCCACATTCT
gi|23496 : GTCT-TACTATCAATCCAGGGAT-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCT--ACCCAATGACAGTCT
gi|23497 : --G--CATTC-AACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--GTCCAGCAACAGTCT
gi|23498 : --G--CATTT-GACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAATCC-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23499 : ACTATCAATCCAGGGGT-CATGAGTTT--GAAT-C-CCT--GCCCAGTCACAGTCT
gi|23500 : tgtcACTAGCAATCCAGGG-T-CATGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCTGGCCACAGTCT
gi|23504 : tagtACTATCAATCCTTGGGT-CATGAGTTC--GAAT-CTCCC--GTCCGGCCACAGTCT
gi|23505 : ACTATCAATCCAGGGTT-CACGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCAACAGTCT
gi|23506 : ACTGTCAATCCATGA-T-TGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ATCCAGCCACAATCT
gi|23509 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTG--GAAT-C-CCC--GGCCAGCCACAGTCT
gi|23510 : ACTATCAATCCAGGTGT-CGTGAGTTT--GATT-C-CCC--ATCCGACAACAGTCT
gi|23511 : ACTATCAATCCAGGATT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCT--ATCCAGCAACAGTCT
gi|23512 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTC--GAAT-C-CCC--ACCCAGCAACAGTCT
gi|23513 : ACTATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--GCCCGACAACAGTCT
gi|23514 : ACTATCAATCCAATGGC-CGTGAGTTT--GAAT-C-CCC--ACCCGGCCACAGTCT
gi|23515 : ACTATCAATCTTGGGAT-CATAACTCT--GAAT-C-CCC--ATGCAGCCACAGTCT
gi|23555 : ATCAATCCAGGGGT-CGTGAGTTT--GAAT-T-CCC--ACTCAACCACAGTCT