lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222 2222222222222 555 2 1111 1111111 1 111 1 1 1
lowQualScore : 00 88888888888888888888888888888888888888888888888 1 111 0 444444 22222 444 4444 11 7777 55555 1 22 22 666 1 22 22 7777777777777 444 33 3 1 7 33 9999 2 2 55 444 33 2 777 444 6 1 66 4 0 66 2 2222 9999999 3 888 5 888 333 66 2 3 4 4 8 2 5 7 4 6 4
lowQualScore : .. ............................................... . ... . ...... ..... ... .... .. .... ..... . .. .. ... . .. .. ............. ... .. . . . .. .... . . .. ... .. . ... ... . . .. . . .. . .... ....... . ... . ... ... .. . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 66 55555555555555555555555555555555555555555555555 0 888 9 444444 99999 111 6666 77 5555 22222 6 22 44 111 7 55 55 6666666666666 333 11 2 1 7 22 7777 5 5 99 444 99 9 888 444 0 2 11 4 9 11 0 1111 4444444 8 888 0 888 000 11 6 3 6 0 0 5 0 8 4 0 3
consensus : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----T----CT---CT--A-TG--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--CGTC--TT--TTA--ATATATNT--T----TTGTA-A-T--T---TGTAATATTTT--AT-TAC---CCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCAC---AAGTCAATTAAAGTATGGGCGTC-GAAAA--ATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATATTGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
Reference ( gi|107930 ) : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------T-A----T----CT---CT--A-TG--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--CGTA--TT--TTA--ATATATTT--T----TTGTA-A-T--T---TGTAATATTTT--AT-TAC---C---ATCCCACCCCGACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCAC---AAGTCAATTAAAGTATGGGCGCT-GAAAA--ATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCATATATTAGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAAGCGTCGATACTTAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAGATAATGTCTGTCTGAACAACATTG
gi|107928 : GATCATGGGTTCGCTGCTCTACCGCTGGACCACGCGTTC--CA---------T-A----T----CT---CT--A-TT--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--TGTC--TT--ATG--ATATATAT--T----TTGTA-A-T--T---TGTTTTATTTT--AC-TAC---CCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TAAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCAC---AAGTCAATTAAAGTATGGGCGTC-GAAAAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATATTGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTGTTCTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATATCCGCCATTTATAGTGGGTTGCGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTTTGAACAACATTG
gi|107926 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTTGACCACGTGCTC--CA---------T-A----T----CT---CT--A-TG--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--TGTC--TT--ATG--ATATATAT--T----TTGTA-A-T--T---TGTAATATTTT--AT-TAC---CTGCACCCCACCCC-ACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTCTTATATATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATT-GCAAAA-GTAAACACTCAC---AAGTCAATTAAAGTATGGGCGTC-GAAAA--ATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATATTGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACACTG
gi|107932 : GATCAAATGTTCAGTGCTCTACCGTTGGACCAACCGCTC--CA---------T-A----T----CT---CT--A-TG--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--TGTC--TT--ATG--ATATATAT--T----TTGCA-A-T--T---TGTAATATTTT--AT-TAC---CCACACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--CGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGGTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCACAA-GTAAACACTCACTTCAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTC-GAAAA--ATAAGAATATAAACGTTATCTATCCAAGTACTATGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATATTGGTGGAAAGGACATTTGAA-TGCATACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCATTAATACTAAAGTCTATACATGAATATCCAGATATGTCTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCATCGGAACAACATTG
gi|107933 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTTGACCATGTGCTC--CA---------T-A----T----CT---CT--A-TG--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--TGTC--TT--ATG--ATATATAT--T----TTGTA-A-T--T---TGTAATATTTTTTAT-TAC---CCGCACCCCACCCC------AACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAAGGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTC----GTATATATATATAAGCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATA-TTGCAAAATATAAACACTCAC---AAATCAATTAAAGTATGGGCGTC-GAAAA--ATAAGAATATAAACGTTACTTATGCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGGGTGTATTCAACACCGCGTATATTGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTCAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAAAACAATAATATTTAGCAGTTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAATACTG
gi|107935 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTGGACTACGCGCTC--CA---------T-A----T----CT---CT--A-TG--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--CA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--TG
gi|107936 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----C----AA---AG--A-CG--G------------A---TAAC------C-----A---A----G--TAAACCAG-----AA-AA--A--A---A-G--ACA--TGTTT-------------TT--TTA--GTATTTCT--TAAA-TTATG-A-TG-T---TGT-ATATTT
gi|107937 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----T----GT---TT--GTTG--CC--T------T-ATACTAGG------C-----G---G----A--TA----AC-----AA-AA--gctgtaataatcta
gi|107938 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGTGCTC--CA---------T-A---------------T--A-T----A--T------T-A---TATA------C-----A---G----C--TA----AG-----cacacatattgatatataatatacat
gi|107941 : GATCATGGGTTCGGTGCTTTACCACTGGACCATGCGCTC--CA---------T-A------------------A-TA--GG--T------T-A---T
gi|107939 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTC--CA-----------A----T-----T---TT--A-TG---------------A---TAGA------T-----A---A----A--
gi|107945 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTT--CA---------T-----------------T--A-TA--GA--T------T-A---TA
gi|107962 : GATCATGGGTTCGGTGCCCTACCACTAGACCACGCGCTC--CA---------T------T----CT---TTC-A-T-------C------T-A---T---------------------------TA----AG-----AATAA--G--G---A-A--GTA--CTATTATACT--CGTAACTT--CTA--ATAT
gi|107946 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------T------T----AT---TT--A------G--T------T-A---TAt
gi|107951 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----
gi|107950 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----
gi|107949 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----
gi|107948 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CAC--------T-A----T----
gi|107956 : GATCGTGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----T----
gi|107955 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTC--CA---------C-A----T----accccctgatcttggatccgattatatttatttgatgaaagaccatgtatgtttgcttatagcatatatactacaattagtgtaagtatatttcat
gi|107954 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCATTGGGCCACGCGCTC--CA---------TGA----T---------------TA--GG--T------T-A---CAAAT-----T-----A---A----A--T
gi|107959 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------
gi|107957 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------
gi|107952 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTC--CA---------C-A------------------A-TT--AA--T------G-A---TCGA------T-----A---A----ATGTA----CG-----TA-AA--G--A---A-
gi|107961 : GATCATGATTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------------------CT---GT--G-TA--GGTAT------T-A---TACA------T-----A---ATCG-A--TA----AA-----A
gi|107963 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTCTC--CA---------C-A----T----
gi|107964 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTC--CA---------C-A----TAAAACT---CG--A-T----A--TTCCACAT-A---TAAA------C-----T---AGTTTA--TA----TG-----AA-AATGG--AATTA-A--ACA-----------C--C-----TT--TCA--A------T--T----TTGTA-G-G--T---TGTAATAT
gi|107973 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTC--CG---------C-A--------------CA--A-AGAAGG-----------A---TAAC------C-----AAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---A-G--ACA--T------------GTT--TT--TTA----GTATTT--C----TTA-A-A-T--T---T-TGATGTTAT--AT-
gi|107965 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--TA---------C-A----T----TT---atttgctgtagtaat
gi|108026 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCATTGGACCACGCGTTC--CG---------C-A--------------CA--A-AGAAGG-----------A---TAAC------C-----A---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---A-G--ACATGTTTTT----T--AGTA--TTTCTTA--A---ATTT--TGATGTTATATA-T--TTGCTGTAGTAATCT--ATGTGC---C---A
gi|107971 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTC--CA---------C-A----T----
gi|107970 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGATCACGCGCTC--CA---------C-A----T----
gi|107969 : GATTATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTC--CA---------C-A----T----
gi|107968 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----T----
gi|107966 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTC--CA---------C-A----T----
gi|107978 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTT--CA---------
gi|107975 : GATCATGGGTTCGGTGTTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------
gi|107974 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------
gi|107940 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----G----AT---TT--T-TGC-GA--T------T-A---TTTT------CATTTTA---A----A--TA-----------AA-AT--C--T---A-A--GTA--CTCTT----C-----A--TA--TTA--A-ATATCTACT----TTAAA-C-TTAT---TATAATATTAT--AT-
gi|107943 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTC--CA---------C-T----T----TT---AA--A-TG-------------T-A---T-GT------C-----A---C----A--TA----AT-----AA-AA--T--A---ACATTATA--TTTTT----T----TA--CT--TGA--A-ATA--G--T----TTGAA-AGT--T---TG-AGT-TTTT--AT-
gi|107967 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACCCTC--CA---------G-A----T----AC---TT--G-CA--G------------A---TAGA------C-----A---G----A--
gi|107981 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCTCGCGCTC--CA---------C-A----
gi|107982 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACACTC--CA---------------------CT---CT--T-TA--AT--T------T-A---TAG
gi|107988 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTC--CA---------T-
gi|107990 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTC--CA---------T-A----C----C
gi|107989 : GATCATGAGCTCGGTGCTGTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------T-A----T----
gi|107953 : GATCATGGTTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTC--CA---------C-A----T----
gi|107987 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATTACTGGACCACGTGCTCCACA---------T-A----T----TT---TT--A-T
gi|107996 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------
gi|107993 : GATAATGGGTTTGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTC--CA---------T-A----T----
gi|107992 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTC--CA---------C-A----
gi|107976 : GACCATGGATTCGATTCTCTACTACTAGACCACGCGCTC--C------------A----T----TT---TT--A---------T------T-A---TAGG------T-----G---A----A--TA----AAT----AT-AA--G--A---A-A--ATA--T
gi|107997 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGTCCACGCGCTC--CA---------
gi|107995 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCATTGGATCACGCGCTC--CA---------T-A----
gi|107986 : GATCATGGGTTCGGTGCGCTACCACTAGACCACGCGCTC--CA---------------------CT---TT----T----G--T------T-G---TA-A------C-----A------------------------AG-AA--T--A---A-A--GCA--TGTTT----TAACATA--TA--TCA--ATAT-TTT--
gi|108010 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTC--Cat
gi|108007 : GATCATGGGTTCGTTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTC--CA----------------------T---TT--A-TG--G
gi|107998 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACTGGCTC--CA---------TAA----T----CT---TT--A-
gi|107994 : GATCATGAGTTCGGTGCTTTACCACTGGACTACGCGCTC--CAC--------T-A---------CT----T--A-T----G--T------C-A----AGA------------A---A----A--TA----
gi|108008 : GATAATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTC--CA---------T-
gi|108004 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTC--CA---------C-A----T----
gi|108001 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACTACGTGCTC--TA---------C-A----T----
gi|108023 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTC--CA---------
gi|108015 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTC--TA---------
gi|108012 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------
gi|107931 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTC--CA---------
gi|108002 : GATCATAGGTTCGGTGCTCTACCACTACACCACGCGCTC--CG---------C-A----T----TT---CT--G-T
gi|107979 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTC--CG---------C-A--------------CA--A-AGAAGG-----------A---TAAC------C-----AAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---A-G--ACA--TTTT--------------TT--TTA--GTA-ATTC--T----C--AA-A-T--T---T-TGATGTTAT--AT-
gi|108018 : GATCACGGGTTCGGTGCTCTACCACTGCACCACGCGCTC--CAC--------T-G----T----C--------A-TG--TG--T------T-
gi|108022 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTC--CA---------C-A----
gi|108019 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTC--CA---------C-A----
gi|108016 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCAGGCGCTC--CAC--------T-A----T----
gi|108014 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGAGCTC--CA---------C-A----
gi|107944 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCAATGGACCACGCACTC--CA---------C-A----
gi|108011 : GATCATTGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATACGCTC--CA---------T------T----TT---AC--A-CG--GG--A------C-A---TAAA------C-----G---A----
gi|107977 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACCCGCTC--TA---------C-A----T----TT---C---------GG--T------TAA---TA--------------A---A----A--TA----
gi|108000 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----
gi|108027 : GATCATGGGTTCAGTGCCCTACCACTGGACCACACGCTC--CA---------C-ACTGTT----CT---TG--A-TG--Gatattgcttcttatggcttgcaaatgtgtctataatatatatgcttaattt
gi|108025 : GATCATGGATTTGGTGCTCTACCACTGGACGACGCGCTC--CA---------C-A----T----GT---AT--A-T
gi|107984 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGA-CATGCGCTC--CA---------C-A----C----AA---AG--A-AG--GA--T------T-A---C---------C-----A---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---A-G--ACA--TGTTT---------TT--TT--TTA--GTAT-TTC--T-------TA-A-A--T---TATGATGTTGT--AT-
gi|108028 : GATTATGGGTTCGGTGCTCAACCACTGGACCACGCATTC--CA---------C-A----C----TT---CA--A-T----G--T------T-G---CAGA------
gi|108021 : GATCATGAGTTCGGTGGTCTATCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----C----ATACACT--G-TGTTGA--TATGCG-T-A---TAGATCTATCT-----A---A----A--TT----AGTATTTAA-AA--GATA---A-A--ACA--TT
gi|108003 : GATCATTGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTC--CA---------C-A----T----
gi|108171 : ATCATGAGTTCCGTGCTCTACCGCTGGACCATGCGCTC--CA---------T-A----T----CT---CT--A-TG--GG--T------T-A---CAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--CGTC--TT--ACG--ATATATAT--T----TTGTA-A-T--T---TGTAATATTTT--AT-TAC---CGGCACCCCAGCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGGTTGCTTTCAGTCGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCAC---AAGTCAATTAAAGTATGGGCATC-AAAAA--ATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGAGGTGCGTGTATTCCACACTGCGTATATTGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTAAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATTCAGATATGTCTGCCATTTATATAGGGTTGTGATCAAATACAATAATATCCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCACCTGAACAACATTatatagtacaatagtagagaatatccatgcgtgttacgaaacatatt
gi|108172 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTTCCATTGGACCATGTACTC--CA---------T-A----T----CT---CT--A-TG--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACG--TTCTT----C----TA--TC--TTATGATATATAT--T----TTGTT-A-T--T---TGTAATATTTT--AT-TAC---CCGCACTGCAACCCTTCATAAACAGAATAAATT--TGA------------CTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCAT---AAGTCAATTAAAGTATGGGCGTC-GAAAA--ATAAGAATATGAACTTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTGTGCGTGTTCAACACCGCATATATTGG
gi|108175 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCACTC--CACGCGCTGTTT-G----T----CT---CTAAA-CT--GA--T------T---------------C-----A---A----A--CA----AA-----GA-AA--G--AAATA-A--ACA--ATCTT----
gi|108176 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTT--CA---------------------CT---GT--A-TG--G
gi|108178 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTC--CA---------T-
gi|108180 : ATCATGGGTACGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTC--CA---------C-A----T----
gi|108177 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCTCGCGCTC--CA---------C-A---------CT--------------G--T------T-T---TAAA------C-----A---A----A--CA----
gi|108179 : ATCATCGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCGCTC--CA--------------------------CT--G-CG--GT--C------T-T---TAAA------T-----A---A----A---A----AA-----AA-AA--
gi|108182 : ATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTC--CA---------C-A--------------CT--A-T
gi|108184 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGTGCTC--CA---------A-A----T----
gi|108237 : ---------T-A----T----TC---CT----TG--GG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--ACA--TTCTT----C--TGTC--TT--CTG--ATATATAT--T----TTGTA-A-T--T---TGTAATATTTT--AT-TAC---CCGAACCCCACTCCCACATAAACTGATTAAATTCATGAT-TTGCT--C--CTAATTTAAAT
gi|108238 : -TG--AG--T------T-A---TAGA------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---A-A--AAA--TTCTT----C--TGCC--TT--GTG--ATA-------------CGTA-T-T--T---TGTAATAGTTT--AC-TACCTGC---ACTCCTCCCCCACATAAACTGATTAAATT--C-AT-TGATTTGCTACTGATTTAAA
gi|108239 : AAGTT--TGGTATCAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACACAGATTTTCTC----TTATATGA------ACACATAGCTGGGATTATCTACGACATATTTGCAATA-GTGAACACTCAC---AAGTTAATTAAAATATGGGC-CTAGAAAA--ATAAGAATA--AACATTACCAATCCAAGTACTTTGTTTCTTTTTAGA---TAACGGATATGCGTGTATTCAACAATGCATATAT-ATT--------CATGTGAAATGCATACAGCA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAATTTTGTACCTGGATATCCAGATA
gi|108240 : GGGTTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCTC---AAGTCAATTAAAGTATGGGCGTC-GAAAA--TTAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTTTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTATGTGTATTCAACAACGCGTATATTGGTGGAAAAGCCATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATAC-TAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATAAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|108241 : ATGGAAGTC-GAAAA--ATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTAATTTGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCGTACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTTTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGGACAACTTTG
gi|108242 : CAACACCGCGTATATTGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATGGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATTTCTGTCTGAGCAACATTG
gi|108243 : CAACACCGCGTATATTGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATAGTGGGCTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCACTATTTTAAATGATGTCCGTCTGAGCAACATTG
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222 111111 111 1111 1111111
lowQualScore : 1 33333333333333333333333333333333 1 111 0 777777 444 4444 11 7777 55555 1 22 22 555 33 2 666666 33 2 33 1 2 666 2 9 2 44 1 5 55 4 55 0 0000 5555555 777 4 777 55 44 3 7 1
lowQualScore : . ................................ . ... . ...... ... .... .. .... ..... . .. .. ... .. . ...... .. . .. . . ... . . . .. . . .. . .. . .... ....... ... . ... .. .. . . .
lowQualScore : 0 44444444444444444444444444444444 0 888 2 777777 111 6666 77 5555 22222 6 22 33 888 00 0 888888 11 7 11 4 6 555 4 4 1 66 9 7 55 0 55 9 6666 8888888 888 4 888 55 66 6 3 4
consensus : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CTGT--CTTNTGAT--ATATATT---TTGTAA-T-TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
Reference ( family-132 ) : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CCGT--CTTTTAAT--ATATNTT---TTGTAA-T-TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|107926 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTTGACCACGTGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CTGT--CTTATGAT--ATATATT---TTGTAA-T-TTGTAATATTTT--ATTACCTGCACCCCACCCC-ACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTCTTATATATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATT-GCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACACTG
gi|107928 : GATCATGGGTTCGCTGCTCTACCGCTGGACCACGCGTTCCAT-A----T----CT---CT-A-TT--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CTGT--CTTATGAT--ATATATT---TTGTAA-T-TTGTTTTATTTT--ACTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TAAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCGAAAAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTGTTCTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATATCCGCCATTTATAGTGGGTTGCGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTTTGAACAACATTG
gi|107930 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CCGT--ATTTTAAT--ATATTTT---TTGTAA-T-TTGTAATATTTT--ATTACC---ATCCCACCCCGACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGCTG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCATATAT--TAGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAAGCGTCGATACTTAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAGATAATGTCTGTCTGAACAACATTG
gi|107931 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTCCA
gi|107932 : GATCAAATGTTCAGTGCTCTACCGTTGGACCAACCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CTGT--CTTATGAT--ATATATT---TTGCAA-T-TTGTAATATTTT--ATTACCCACACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--CGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGGTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCACAA-GTAAACACTCACTTCAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTATCTATCCAAGTACTATGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATTTGAA-TGCATACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCATTAATACTAAAGTCTATACATGAATATCCAGATATGTCTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCATCGGAACAACATTG
gi|107933 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTTGACCATGTGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CTGT--CTTATGAT--ATATATT---TTGTAA-T-TTGTAATATTTTTTATTACCCGCACCCCACCCC------AACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAAGGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTC----GTATATATATATAAGCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATA-TTGCAAAATATAAACACTCA---CAAATCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACTTATGCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGGGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTCAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAAAACAATAATATTTAGCAGTTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAATACTG
gi|107935 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTGGACTACGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--CA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CTG
gi|107936 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----C----AA---AG-A-CG--G----------A---TAAC------CA---A----G--TAAACCAG-----AA-AA--A--A---AGACATGTT-T-----------TTTTAGT--ATTTCTTAAATTATGA-TGTTGT-ATATTT
gi|107937 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----GT---TT-GTTG--CCT------T-ATACTAGG------CG---G----A--TA----AC-----AA-AA--gctgtaataatcta
gi|107938 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGTGCTCCAT-A---------------T-A-T----AT------T-A---TATA------CA---G----C--TA----AG-----cacacatattgatatataatatacat
gi|107939 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCA--A----T-----T---TT-A-TG-------------A---TAGA------TA---A----A--
gi|107940 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107941 : GATCATGGGTTCGGTGCTTTACCACTGGACCATGCGCTCCAT-A-----------------A-TA--GGT------T-A---Tgatttttgcgattattttcattttaaataaaatctaagtactcttcatattaaatatctactttaaacttattataatattatat
gi|107943 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTCCAC-T----T----TT---AA-A-TG-----------T-A---T-GT------CA---C----A--TA----AT-----AA-AA--T-------AACATTATAT-------T--TTTTTACTTGAAATAGT---TTGAAAGT-TTG-AGT-TTTT--AT
gi|107944 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCAATGGACCACGCACTCCAC-A----
gi|107945 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTTCA-----------------TT-A-TA--GAT------T-A---TA
gi|107946 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAT------T----AT---TT-A------GT------T-A---TA
gi|107948 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-
gi|107949 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----tat
gi|107950 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107951 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107952 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCAC-A-----------------A-TT--AAT------G-A---TCGA------TA---A----ATGTA----CG-----TA-AA--G--A---A
gi|107953 : GATCATGGTTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107954 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCATTGGGCCACGCGCTCCATGA----T--------------TA--GGT------T-A---CAAAT-----TA---A----A--T
gi|107955 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCAC-A----T----
gi|107956 : GATCGTGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107957 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAaccccctgatcttggatccgattatatttatttgatgaaagaccatgtatgtttgcttatagcatatatactacaattagtgtaagtatatttcat
gi|107959 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107961 : GATCATGATTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC------T----GT---GT-A-GG--TAT------T-A---TACA------TA---ATCG-A--TA----AA-----A
gi|107962 : GATCATGGGTTCGGTGCCCTACCACTAGACCACGCGCTCCAT------T----CT---TTCA-T-----C------T-A---T----------------------TA----AG-----AATAA--G--G---AAGTACTAT-TATACTCGTAACTTCTAAT--AT
gi|107963 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTCTCCAC-A----T----t
gi|107964 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----TAAAACT---CG-A-T----ATTCCACAT-A---TAAA------CT---AGTTTA--TA----TG-----AA-AATGG--AATTAAACA-------------C--CTTTCAA--------TT---TTGTAG-G-TTGTAATAT
gi|107965 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCTAC-A----T----TT---
gi|107966 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----T----
gi|107967 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACCCTCCAG-A----T----AC---TT-G-CA--G----------A---TAGA------CA---G----A--
gi|107968 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107969 : GATTATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107970 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGATCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107971 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAC-A----T----
gi|107973 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAAC------CAAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---AGACAT-----------GT--TTTTTAGT--ATTTCTTAAATTTTGA-TGTTAT-ATATTT
gi|107974 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAgctgtagtaat
gi|107975 : GATCATGGGTTCGGTGTTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107976 : GACCATGGATTCGATTCTCTACTACTAGACCACGCGCTC--C-A----T----TT---TT-A-------T------T-A---TAGG------TG---A----A--TA----AAT----AT-AA--G--A---AAATAT
gi|107977 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACCCGCTCTAC-A----T----TT---C--------GGT------TAA---TA---------A---A----A--TA----
gi|107978 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTTCA
gi|107979 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAAC------CAAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---AGACATT-----------T--TTTTTAGT--A---ATT---CTCAAA-T-TT-TGATGTTAT--AT
gi|107981 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCTCGCGCTCCAC-A----
gi|107982 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACACTCCAC------T----CT---TT-A-----ATT------T-A---TAG
gi|107984 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGA-CATGCGCTCCAC-A----C----AA---AG-A-AG--GAT------T-A---C---------CA---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---AGACATGTT-T-------T--TTTTTAGT--ATTTCTTAAATTATGA-TGTTGTA
gi|107986 : GATCATGGGTTCGGTGCGCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-T----T----TT-------------GT------T-G---TA-A------CA------------------------AG-AA--T--A---AAGCAT-----------G----TTTTAAC--ATATAT----------------CAATATTTT--ATt
gi|107987 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATTACTGGACCACGTGCTCCAC-A----T----
gi|107988 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAatttttat
gi|107989 : GATCATGAGCTCGGTGCTGTACCACTGGACCACGCGCTCCAT-A----T----t
gi|107990 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAT-A----C----C
gi|107992 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----
gi|107993 : GATAATGGGTTTGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAT-A----T----
gi|107994 : GATCATGAGTTCGGTGCTTTACCACTGGACTACGCGCTCCAC-T----A----CT----T-A-T----GT------C-A----AGA-------A---A----A--TA----
gi|107995 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCATTGGATCACGCGCTCCAT-A----
gi|107996 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107997 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGTCCACGCGCTCCA
gi|107998 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACTGGCTCCATAA----T----CT---TT-A-
gi|108000 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|108001 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACTACGTGCTCTAC-A----T----atattgcttcttatggcttgcaaatgtgtctataatatatatgcttaattt
gi|108002 : GATCATAGGTTCGGTGCTCTACCACTACACCACGCGCTCCGC-A----T----TT---CT-G-T
gi|108003 : GATCATTGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----T----
gi|108004 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAC-A----T----atatagtacaatagtagagaatatccatgcgtgttacgaaacatatt
gi|108007 : GATCATGGGTTCGTTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTCCA-------------T---TT-A-TG--G
gi|108008 : GATAATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTCCA
gi|108010 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTCCt
gi|108011 : GATCATTGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATACGCTCCAT------T----TT---AC-A-CG--GGA------C-A---TAAA------CG---A----
gi|108012 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|108014 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGAGCTCCAC-A----
gi|108015 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCTA
gi|108016 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCAGGCGCTCCAC-
gi|108018 : GATCACGGGTTCGGTGCTCTACCACTGCACCACGCGCTCCAC------T----GT---C--A-TG--TGT------T-tat
gi|108019 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTCCAC-A----
gi|108021 : GATCATGAGTTCGGTGGTCTATCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----C----ATACACT-G-TGTTGATATGCG-T-A---TAGATCTATCTA---A----A--TT----AGTATTTAA-AA--GATA---AAACATT
gi|108022 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTCCAC-A----
gi|108023 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCA
gi|108025 : GATCATGGATTTGGTGCTCTACCACTGGACGACGCGCTCCAC-A----T----GT---AT-A-T
gi|108026 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCATTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAAC------CA---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---AGACAT-----------GT--TTTTTAGT--ATTTCTTAAATTTTGA-TGTTAT-ATATTT
gi|108027 : GATCATGGGTTCAGTGCCCTACCACTGGACCACACGCTCCAC-ACTGTT----CT---TG-A-TG--Ggctgtagtaatctatgtgcca
gi|108028 : GATTATGGGTTCGGTGCTCAACCACTGGACCACGCATTCCAC-A----C----TT---CA-A-T----GT------T-G---CAGA------
gi|108171 : ATCATGAGTTCCGTGCTCTACCGCTGGACCATGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---CAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CCGT--CTTACGAT--ATATATT---TTGTAA-T-TTGTAATATTTT--ATTACCGGCACCCCAGCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGGTTGCTTTCAGTCGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCATCA--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGAGGTGCGTGTATTCCACACTGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTAAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATTCAGATATGTCTGCCATTTATATAGGGTTGTGATCAAATACAATAATATCCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCACCTGAACAACATT
gi|108172 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTTCCATTGGACCATGTACTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACGTTCT-T----CTAT--CTTATGAT--ATATATT---TTGTTA-T-TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACTGCAACCCTTCATAAACAGAATAAATT--TGA------------CTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---TAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATGAACTTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTGTGCGTGTTCAACACCGCATATAT--TGG
gi|108175 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCACTCCAC-G---------CG---CT-G-TT--TGTC-----T-C---TAAACTGATTCA---A----A--CA----AA-----GA-AA--G--AAATAAACAATCT-T----
gi|108176 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTTCA------------CT---GT-A-TG--G
gi|108177 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCTCGCGCTCCAC-A---------CT-------------GT------T-T---TAAA------CA---A----A--CA----
gi|108178 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCA
gi|108179 : ATCATCGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCGCTCCAC---------------------TGC-GGT------C-T---T---------TA---A----A--TA----AA-----AA-AA--A--A---At
gi|108180 : ATCATGGGTACGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|108182 : ATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTCCAC-A--------------CT-A-T
gi|108184 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGTGCTCCAA-A----T----
gi|108237 : -TG--GGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAACATTCT-T----CTGT--CTTCTGAT--ATATATT---TTGTAA-T-TTGTAATATTTT--ATTACCCGAACCCCACTCCCACATAAACTGATTAAATTCATGAT-TTGCT--C--CTAATTTAAAT
gi|108238 : tattcct-TG--AGT------T-A---TAGA------CA---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AAAAATTCT-T----CTGC--CTTGTGAT--A----------CGTAT-T-TTGTAATAGTTT--ACTACCTGCACTCCTCCCCCACATAAACTGATTAAATT--C-AT-TGATTTGCTACTGATTTAAA
gi|108239 : AAGTT--TGGTATCAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACACAGATTTTCTC----TTATATGA------ACACATAGCTGGGATTATCTACGACATATTTGCAATA-GTGAACACTCA---CAAGTTAATTAAAATATGGGCCTAG--AAAAATAAGAATA--AACATTACCAATCCAAGTACTTTGTTTCTTTTTAGA---TAACGGATATGCGTGTATTCAACAATGCATATATATT-----------CATGTGAAATGCATACAGCA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAATTTTGTACCTGGATATCCAGATA
gi|108240 : GGGTTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCT---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAATTAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTTTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTATGTGTATTCAACAACGCGTATAT--TGGTGGAAAAGCCATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACT-AAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATAAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|108241 : ATGGAAGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTAATT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCGTACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTTTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGGACAACTTTG
gi|108242 : CAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATGGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATTTCTGTCTGAGCAACATTG
gi|108243 : CAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATAGTGGGCTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCACTATTTTAAATGATGTCCGTCTGAGCAACATTG
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222 11111111111111 1111 1111111
lowQualScore : 1 66666666666666666666666666666666 1 111 11 777777 22222 333 4444 11 7777 44444 1 22 22 555 22 1 3 1 88888888888888 444 777 1 66 77777 33 1 5 55 4 55 0 0000 5555555 777 4 777 55 44 3 7 1
lowQualScore : . ................................ . ... .. ...... ..... ... .... .. .... ..... . .. .. ... .. . . . .............. ... ... . .. ..... .. . . .. . .. . .... ....... ... . ... .. .. . . .
lowQualScore : 0 99999999999999999999999999999999 0 777 44 333333 88888 999 3333 66 0000 88888 5 00 11 444 33 7 3 9 22222222222222 666 444 6 55 22222 99 9 7 55 0 55 9 6666 8888888 888 4 888 55 66 6 3 4
consensus : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--NTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
Reference ( family-132 ) : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--NTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|107926 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTTGACCACGTGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCTGCACCCCACCCC-ACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTCTTATATATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATT-GCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACACTG
gi|107928 : GATCATGGGTTCGCTGCTCTACCGCTGGACCACGCGTTCCAT-A----T----CT---CT-A-TT--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTTTTATTTT--ACTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TAAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCGAAAAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTGTTCTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATATCCGCCATTTATAGTGGGTTGCGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTTTGAACAACATTG
gi|107930 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCC-G-----T--A-----TT--TTAA---TATATTTTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACC---ATCCCACCCCGACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGCTG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCATATAT--TAGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAAGCGTCGATACTTAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAGATAATGTCTGTCTGAACAACATTG
gi|107931 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTCCA
gi|107932 : GATCAAATGTTCAGTGCTCTACCGTTGGACCAACCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGCAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCACACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--CGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGGTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCACAA-GTAAACACTCACTTCAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTATCTATCCAAGTACTATGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATTTGAA-TGCATACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCATTAATACTAAAGTCTATACATGAATATCCAGATATGTCTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCATCGGAACAACATTG
gi|107933 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTTGACCATGTGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTTTTATTACCCGCACCCCACCCC------AACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAAGGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTC----GTATATATATATAAGCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATA-TTGCAAAATATAAACACTCA---CAAATCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACTTATGCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGGGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTCAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAAAACAATAATATTTAGCAGTTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAATACTG
gi|107935 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTGGACTACGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--CA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----
gi|107936 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----C----AA---AG-A-CG--G----------A---TAA-C------C-----A---A----G--TAAACCAG-----AA-AA--A--A---AG--AC-A-------T-G-----T--T-----TT--TT-----TA-GTATTT--CTTAA-A--TTATGATGTTGT--AT
gi|107937 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----GT---TT-GTTG--CCT------T-ATACTAG-G------C-----G---G----A--TA----AC-----AA-AA--atttgctgtaataatcta
gi|107938 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGTGCTCCAT-A---------------T-A-T----AT------T-A---TAT-A------C-----A---G----C--TA----AG-----cacacatattgatatataatatacat
gi|107939 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCA--A----T-----T---TT-A-TG-------------A---TAG-A------T-----A---A----A--
gi|107940 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----G----AT---TT-T-TGC-GAT------T-A---TTT-T------CATTTTA---A----A--TA-----------AA-AT--C--T---AA--GT-AC-TCTTC--A-----T--A-----TT--A-AA---TATCTACTT--TAAAC-TTATTATAATATTAT--AT
gi|107941 : GATCATGGGTTCGGTGCTTTACCACTGGACCATGCGCTCCAT-A-----------------A-TA--GGT------T-A---T
gi|107943 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTCCAC-T----T----TT---AA-A-TG-----------T-A---T-G-T------C-----A---C----A--TA----AT-----AA-AA--T-------A--AC-AT-TATATT-T-----T--T-----TTACTTGA----A-ATAGTT--TGAAAGT--TTG-AGT-TTTT--AT
gi|107944 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCAATGGACCACGCACTCCAC-A----
gi|107945 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTTCA-----------------TT-A-TA--GAT------T-A---TA
gi|107946 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAT------T----AT---TT-A------GT------T-A---TA
gi|107948 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-
gi|107949 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----tat
gi|107950 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107951 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107952 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCAC-A-----------------A-TT--AAT------G-A---TCG-A------T-----A---A----ATGTA----CG-----TA-AA--G--A---A
gi|107953 : GATCATGGTTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107954 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCATTGGGCCACGCGCTCCATGA----T--------------TA--GGT------T-A---CAA-AT-----T-----A---A----A--T
gi|107955 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCAC-A----T----
gi|107956 : GATCGTGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107957 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAaccccctgatcttggatccgattatatttatttgatgaaagaccatgtatgtttgcttatagcatatatactacaattagtgtaagtatatttcat
gi|107959 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107961 : GATCATGATTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC------T----GT---GT-A-GG--TAT------T-A---TAC-A------T-----A---ATCG-A--TA----AA-----A
gi|107962 : GATCATGGGTTCGGTGCCCTACCACTAGACCACGCGCTCCAT------T----CT---TTCA-T-----C------T-A---T----------------------------TA----AG-----AATAA--G--G---AAGTACTAT-TATACTCG-----TAAC-----TT--CTAA---TAT
gi|107963 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTCTCCAC-A----T----t
gi|107964 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----TAAAACT---CG-A-T----ATTCCACAT-A---TAA-A------C-----T---AGTTTA--TA----TG-----AA-AATGG--AATTAA--AC-AC-CTTTC------------------------A--------ATTT--TGTAG-G--TTGTAATAT
gi|107965 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCTAC-A----T----TT---
gi|107966 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----T----
gi|107967 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACCCTCCAG-A----T----AC---TT-G-CA--G----------A---TAG-A------C-----A---G----A--
gi|107968 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107969 : GATTATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107970 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGATCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107971 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAC-A----T----
gi|107973 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----AAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-ATGTTTTTT-AGTATTT--CTTAAATT--TTGATGTTATATATTTGCTGTA-------GTAAT
gi|107974 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107975 : GATCATGGGTTCGGTGTTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107976 : GACCATGGATTCGATTCTCTACTACTAGACCACGCGCTC--C-A----T----TT---TT-A-------T------T-A---TAG-G------T-----G---A----A--TA----AAT----AT-AA--G--A---AA--AT-AT-
gi|107977 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACCCGCTCTAC-A----T----TT---C--------GGT------TAA---TA---------------A---A----A--TA----
gi|107978 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTTCA
gi|107979 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----AAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-AT-TTTTTT-
gi|107981 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCTCGCGCTCCAC-A----tagtaattctcaaattttgatgttatat
gi|107982 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACACTCCAC------T----CT---TT-A-----ATT------T-A---TAG-
gi|107984 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGA-CATGCGCTCCAC-A----C----AA---AG-A-AG--GAT------T-A---C----------C-----A---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-A-------T-G-----T--T-----TT--TTTT---TA-GTATTT--CTTAA-A--TTATGATGTTGT--AT
gi|107986 : GATCATGGGTTCGGTGCGCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-T----T----TT-------------GT------T-G---TA--A------C-----A------------------------AG-AA--T--A---AA--GC-A-------T-G--------------TT--TTAA---CATATAT----------------CAATATTTT--AT
gi|107987 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATTACTGGACCACGTGCTCCAC-A----T----
gi|107988 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAatttttat
gi|107989 : GATCATGAGCTCGGTGCTGTACCACTGGACCACGCGCTCCAT-A----T----t
gi|107990 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAT-A----C----C
gi|107992 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----
gi|107993 : GATAATGGGTTTGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAT-A----T----
gi|107994 : GATCATGAGTTCGGTGCTTTACCACTGGACTACGCGCTCCAC-T----A----CT----T-A-T----GT------C-A----AG-A------------A---A----A--TA----
gi|107995 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCATTGGATCACGCGCTCCAT-A----
gi|107996 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107997 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGTCCACGCGCTCCA
gi|107998 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACTGGCTCCATAA----T----CT---TT-A-
gi|108000 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|108001 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACTACGTGCTCTAC-A----T----atattgcttcttatggcttgcaaatgtgtctataatatatatgcttaattt
gi|108002 : GATCATAGGTTCGGTGCTCTACCACTACACCACGCGCTCCGC-A----T----TT---CT-G-T
gi|108003 : GATCATTGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A---------------T-A--------------T-A---TAGTA------C---------A----A--TA----GT---------A--G--A---GA--AT-AT-CCATGC-G-----T--G-----TT--ACGA---AACATATT
gi|108004 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAC-A----T----
gi|108007 : GATCATGGGTTCGTTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTCCA-------------T---TT-A-TG--G
gi|108008 : GATAATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTCCA
gi|108010 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTCCt
gi|108011 : GATCATTGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATACGCTCCAT------T----TT---AC-A-CG--GGA------C-A---TAA-A------C-----G---A----
gi|108012 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|108014 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGAGCTCCAC-A----
gi|108015 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCTA
gi|108016 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCAGGCGCTCCAC-
gi|108018 : GATCACGGGTTCGGTGCTCTACCACTGCACCACGCGCTCCAC------T----GT---C--A-TG--TGT------T-tat
gi|108019 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTCCAC-A----
gi|108021 : GATCATGAGTTCGGTGGTCTATCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----C----ATACACT-G-TGTTGATATGCG-T-A---TAG-ATCTATCT-----A---A----A--TT----AGTATTTAA-AA--GATA---AA--AC-AT-T
gi|108022 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTCCAC-A----
gi|108023 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCA
gi|108025 : GATCATGGATTTGGTGCTCTACCACTGGACGACGCGCTCCAC-A----T----GT---AT-A-T
gi|108026 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCATTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----A---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-ATGTTTTTT-AGTATTT--CTTAAATT--TTGATGTTATATATTTGCTGTA-------GTAAT
gi|108027 : GATCATGGGTTCAGTGCCCTACCACTGGACCACACGCTCCAC-ACTGTT----CT---TG-A-TG--Gctatgtgcca
gi|108028 : GATTATGGGTTCGGTGCTCAACCACTGGACCACGCATTCCAC-A----C----TT---CA-A-T----GT------T-G---CAG-A------
gi|108171 : ATCATGAGTTCCGTGCTCTACCGCTGGACCATGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---CAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCC-G-----T--C-----TT--ACGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCGGCACCCCAGCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGGTTGCTTTCAGTCGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCATCA--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGAGGTGCGTGTATTCCACACTGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTAAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATTCAGATATGTCTGCCATTTATATAGGGTTGTGATCAAATACAATAATATCCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCACCTGAACAACATT
gi|108172 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTTCCATTGGACCATGTACTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-GT-TCTTCT-A-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTTA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACTGCAACCCTTCATAAACAGAATAAATT--TGA------------CTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---TAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATGAACTTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTGTGCGTGTTCAACACCGCATATAT--TGG
gi|108175 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCACTCCAC-G---------CG---CT-G-TT--TGTC-----T-C---TAA-ACTGATTC-----A---A----A--CA----AA-----GA-AA--G--AAATAA--AC-AA-TCTT
gi|108176 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTTCA------------CT---GT-A-TG--G
gi|108177 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCTCGCGCTCCAC-A---------CT-------------GT------T-T---TAA-A------C-----A---A----A--CA----
gi|108178 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCA
gi|108179 : ATCATCGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCGCTCCAC---------------------TGC-GGT------C-T---T----------T-----A---A----A--TA----AA-----AA-AA--A--A---At
gi|108180 : ATCATGGGTACGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|108182 : ATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTCCAC-A--------------CT-A-T
gi|108184 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGTGCTCCAA-A----T----
gi|108237 : -TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--CTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGAACCCCACTCCCACATAAACTGATTAAATTCATGAT-TTGCT--C--CTAATTTAAAT
gi|108238 : tattcct-TG--AGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AA-AT-TCTTCT-G-----C--C-----TT--GTGA---TACGTAT----------T--TTGTAATAGTTT--ACTACCTGCACTCCTCCCCCACATAAACTGATTAAATT--C-AT-TGATTTGCTACTGATTTAAA
gi|108239 : AAGTT--TGGTATCAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACACAGATTTTCTC----TTATATGA------ACACATAGCTGGGATTATCTACGACATATTTGCAATA-GTGAACACTCA---CAAGTTAATTAAAATATGGGCCTAG--AAAAATAAGAATA--AACATTACCAATCCAAGTACTTTGTTTCTTTTTAGA---TAACGGATATGCGTGTATTCAACAATGCATATATATT-----------CATGTGAAATGCATACAGCA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAATTTTGTACCTGGATATCCAGATA
gi|108240 : GGGTTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCT---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAATTAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTTTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTATGTGTATTCAACAACGCGTATAT--TGGTGGAAAAGCCATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACT-AAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATAAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|108241 : ATGGAAGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTAATT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCGTACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTTTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGGACAACTTTG
gi|108242 : CAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATGGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATTTCTGTCTGAGCAACATTG
gi|108243 : CAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATAGTGGGCTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCACTATTTTAAATGATGTCCGTCTGAGCAACATTG
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222 11111111111111 1111 1111111
lowQualScore : 1 66666666666666666666666666666666 1 111 11 777777 22222 333 4444 11 7777 44444 1 22 22 555 22 1 3 1 88888888888888 444 777 1 66 77777 33 1 5 55 4 55 0 0000 5555555 777 4 777 55 44 3 7 1
lowQualScore : . ................................ . ... .. ...... ..... ... .... .. .... ..... . .. .. ... .. . . . .............. ... ... . .. ..... .. . . .. . .. . .... ....... ... . ... .. .. . . .
lowQualScore : 0 99999999999999999999999999999999 0 777 44 333333 88888 999 3333 66 0000 88888 5 00 11 444 33 7 3 9 22222222222222 666 444 6 55 22222 99 9 7 55 0 55 9 6666 8888888 888 4 888 55 66 6 3 4
consensus : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--NTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
Reference ( family-132 ) : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--NTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|107926 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTTGACCACGTGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCTGCACCCCACCCC-ACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTCTTATATATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATT-GCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACACTG
gi|107928 : GATCATGGGTTCGCTGCTCTACCGCTGGACCACGCGTTCCAT-A----T----CT---CT-A-TT--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTTTTATTTT--ACTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TAAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCGAAAAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTGTTCTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATATCCGCCATTTATAGTGGGTTGCGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTTTGAACAACATTG
gi|107930 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCC-G-----T--A-----TT--TTAA---TATATTTTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACC---ATCCCACCCCGACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGCTG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCATATAT--TAGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAAGCGTCGATACTTAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAGATAATGTCTGTCTGAACAACATTG
gi|107931 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTCCA
gi|107932 : GATCAAATGTTCAGTGCTCTACCGTTGGACCAACCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGCAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCACACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--CGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGGTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCACAA-GTAAACACTCACTTCAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTATCTATCCAAGTACTATGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATTTGAA-TGCATACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCATTAATACTAAAGTCTATACATGAATATCCAGATATGTCTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCATCGGAACAACATTG
gi|107933 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTTGACCATGTGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTTTTATTACCCGCACCCCACCCC------AACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAAGGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTC----GTATATATATATAAGCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATA-TTGCAAAATATAAACACTCA---CAAATCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACTTATGCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGGGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTCAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAAAACAATAATATTTAGCAGTTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAATACTG
gi|107935 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTGGACTACGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--CA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----
gi|107936 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----C----AA---AG-A-CG--G----------A---TAA-C------C-----A---A----G--TAAACCAG-----AA-AA--A--A---AG--AC-A-------T-G-----T--T-----TT--TT-----TA-GTATTT--CTTAA-A--TTATGATGTTGT--AT
gi|107937 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----GT---TT-GTTG--CCT------T-ATACTAG-G------C-----G---G----A--TA----AC-----AA-AA--atttgctgtaataatcta
gi|107938 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGTGCTCCAT-A---------------T-A-T----AT------T-A---TAT-A------C-----A---G----C--TA----AG-----cacacatattgatatataatatacat
gi|107939 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCA--A----T-----T---TT-A-TG-------------A---TAG-A------T-----A---A----A--
gi|107940 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----G----AT---TT-T-TGC-GAT------T-A---TTT-T------CATTTTA---A----A--TA-----------AA-AT--C--T---AA--GT-AC-TCTTC--A-----T--A-----TT--A-AA---TATCTACTT--TAAAC-TTATTATAATATTAT--AT
gi|107941 : GATCATGGGTTCGGTGCTTTACCACTGGACCATGCGCTCCAT-A-----------------A-TA--GGT------T-A---T
gi|107943 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTCCAC-T----T----TT---AA-A-TG-----------T-A---T-G-T------C-----A---C----A--TA----AT-----AA-AA--T-------A--AC-AT-TATATT-T-----T--T-----TTACTTGA----A-ATAGTT--TGAAAGT--TTG-AGT-TTTT--AT
gi|107944 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCAATGGACCACGCACTCCAC-A----
gi|107945 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTTCA-----------------TT-A-TA--GAT------T-A---TA
gi|107946 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAT------T----AT---TT-A------GT------T-A---TA
gi|107948 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-
gi|107949 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----tat
gi|107950 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107951 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107952 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCAC-A-----------------A-TT--AAT------G-A---TCG-A------T-----A---A----ATGTA----CG-----TA-AA--G--A---A
gi|107953 : GATCATGGTTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107954 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCATTGGGCCACGCGCTCCATGA----T--------------TA--GGT------T-A---CAA-AT-----T-----A---A----A--T
gi|107955 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCAC-A----T----
gi|107956 : GATCGTGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107957 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAaccccctgatcttggatccgattatatttatttgatgaaagaccatgtatgtttgcttatagcatatatactacaattagtgtaagtatatttcat
gi|107959 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107961 : GATCATGATTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC------T----GT---GT-A-GG--TAT------T-A---TAC-A------T-----A---ATCG-A--TA----AA-----A
gi|107962 : GATCATGGGTTCGGTGCCCTACCACTAGACCACGCGCTCCAT------T----CT---TTCA-T-----C------T-A---T----------------------------TA----AG-----AATAA--G--G---AAGTACTAT-TATACTCG-----TAAC-----TT--CTAA---TAT
gi|107963 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTCTCCAC-A----T----t
gi|107964 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----TAAAACT---CG-A-T----ATTCCACAT-A---TAA-A------C-----T---AGTTTA--TA----TG-----AA-AATGG--AATTAA--AC-AC-CTTTC------------------------A--------ATTT--TGTAG-G--TTGTAATAT
gi|107965 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCTAC-A----T----TT---
gi|107966 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----T----
gi|107967 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACCCTCCAG-A----T----AC---TT-G-CA--G----------A---TAG-A------C-----A---G----A--
gi|107968 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107969 : GATTATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107970 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGATCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107971 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAC-A----T----
gi|107973 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----AAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-ATGTTTTTT-AGTATTT--CTTAAATT--TTGATGTTATATATTTGCTGTA-------GTAAT
gi|107974 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107975 : GATCATGGGTTCGGTGTTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107976 : GACCATGGATTCGATTCTCTACTACTAGACCACGCGCTC--C-A----T----TT---TT-A-------T------T-A---TAG-G------T-----G---A----A--TA----AAT----AT-AA--G--A---AA--AT-AT-
gi|107977 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACCCGCTCTAC-A----T----TT---C--------GGT------TAA---TA---------------A---A----A--TA----
gi|107978 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTTCA
gi|107979 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----AAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-AT-TTTTTT-
gi|107981 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCTCGCGCTCCAC-A----tagtaattctcaaattttgatgttatat
gi|107982 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACACTCCAC------T----CT---TT-A-----ATT------T-A---TAG-
gi|107984 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGA-CATGCGCTCCAC-A----C----AA---AG-A-AG--GAT------T-A---C----------C-----A---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-A-------T-G-----T--T-----TT--TTTT---TA-GTATTT--CTTAA-A--TTATGATGTTGT--AT
gi|107986 : GATCATGGGTTCGGTGCGCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-T----T----TT-------------GT------T-G---TA--A------C-----A------------------------AG-AA--T--A---AA--GC-A-------T-G--------------TT--TTAA---CATATAT----------------CAATATTTT--AT
gi|107987 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATTACTGGACCACGTGCTCCAC-A----T----
gi|107988 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAatttttat
gi|107989 : GATCATGAGCTCGGTGCTGTACCACTGGACCACGCGCTCCAT-A----T----t
gi|107990 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAT-A----C----C
gi|107992 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----
gi|107993 : GATAATGGGTTTGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAT-A----T----
gi|107994 : GATCATGAGTTCGGTGCTTTACCACTGGACTACGCGCTCCAC-T----A----CT----T-A-T----GT------C-A----AG-A------------A---A----A--TA----
gi|107995 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCATTGGATCACGCGCTCCAT-A----
gi|107996 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107997 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGTCCACGCGCTCCA
gi|107998 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACTGGCTCCATAA----T----CT---TT-A-
gi|108000 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|108001 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACTACGTGCTCTAC-A----T----atattgcttcttatggcttgcaaatgtgtctataatatatatgcttaattt
gi|108002 : GATCATAGGTTCGGTGCTCTACCACTACACCACGCGCTCCGC-A----T----TT---CT-G-T
gi|108003 : GATCATTGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A---------------T-A--------------T-A---TAGTA------C---------A----A--TA----GT---------A--G--A---GA--AT-AT-CCATGC-G-----T--G-----TT--ACGA---AACATATT
gi|108004 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAC-A----T----
gi|108007 : GATCATGGGTTCGTTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTCCA-------------T---TT-A-TG--G
gi|108008 : GATAATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTCCA
gi|108010 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTCCt
gi|108011 : GATCATTGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATACGCTCCAT------T----TT---AC-A-CG--GGA------C-A---TAA-A------C-----G---A----
gi|108012 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|108014 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGAGCTCCAC-A----
gi|108015 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCTA
gi|108016 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCAGGCGCTCCAC-
gi|108018 : GATCACGGGTTCGGTGCTCTACCACTGCACCACGCGCTCCAC------T----GT---C--A-TG--TGT------T-tat
gi|108019 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTCCAC-A----
gi|108021 : GATCATGAGTTCGGTGGTCTATCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----C----ATACACT-G-TGTTGATATGCG-T-A---TAG-ATCTATCT-----A---A----A--TT----AGTATTTAA-AA--GATA---AA--AC-AT-T
gi|108022 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTCCAC-A----
gi|108023 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCA
gi|108025 : GATCATGGATTTGGTGCTCTACCACTGGACGACGCGCTCCAC-A----T----GT---AT-A-T
gi|108026 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCATTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----A---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-ATGTTTTTT-AGTATTT--CTTAAATT--TTGATGTTATATATTTGCTGTA-------GTAAT
gi|108027 : GATCATGGGTTCAGTGCCCTACCACTGGACCACACGCTCCAC-ACTGTT----CT---TG-A-TG--Gctatgtgcca
gi|108028 : GATTATGGGTTCGGTGCTCAACCACTGGACCACGCATTCCAC-A----C----TT---CA-A-T----GT------T-G---CAG-A------
gi|108171 : ATCATGAGTTCCGTGCTCTACCGCTGGACCATGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---CAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCC-G-----T--C-----TT--ACGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCGGCACCCCAGCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGGTTGCTTTCAGTCGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCATCA--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGAGGTGCGTGTATTCCACACTGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTAAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATTCAGATATGTCTGCCATTTATATAGGGTTGTGATCAAATACAATAATATCCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCACCTGAACAACATT
gi|108172 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTTCCATTGGACCATGTACTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-GT-TCTTCT-A-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTTA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACTGCAACCCTTCATAAACAGAATAAATT--TGA------------CTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---TAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATGAACTTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTGTGCGTGTTCAACACCGCATATAT--TGG
gi|108175 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCACTCCAC-G---------CG---CT-G-TT--TGTC-----T-C---TAA-ACTGATTC-----A---A----A--CA----AA-----GA-AA--G--AAATAA--AC-AA-TCTT
gi|108176 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTTCA------------CT---GT-A-TG--G
gi|108177 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCTCGCGCTCCAC-A---------CT-------------GT------T-T---TAA-A------C-----A---A----A--CA----
gi|108178 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCA
gi|108179 : ATCATCGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCGCTCCAC---------------------TGC-GGT------C-T---T----------T-----A---A----A--TA----AA-----AA-AA--A--A---At
gi|108180 : ATCATGGGTACGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|108182 : ATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTCCAC-A--------------CT-A-T
gi|108184 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGTGCTCCAA-A----T----
gi|108237 : -TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--CTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGAACCCCACTCCCACATAAACTGATTAAATTCATGAT-TTGCT--C--CTAATTTAAAT
gi|108238 : tattcct-TG--AGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AA-AT-TCTTCT-G-----C--C-----TT--GTGA---TACGTAT----------T--TTGTAATAGTTT--ACTACCTGCACTCCTCCCCCACATAAACTGATTAAATT--C-AT-TGATTTGCTACTGATTTAAA
gi|108239 : AAGTT--TGGTATCAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACACAGATTTTCTC----TTATATGA------ACACATAGCTGGGATTATCTACGACATATTTGCAATA-GTGAACACTCA---CAAGTTAATTAAAATATGGGCCTAG--AAAAATAAGAATA--AACATTACCAATCCAAGTACTTTGTTTCTTTTTAGA---TAACGGATATGCGTGTATTCAACAATGCATATATATT-----------CATGTGAAATGCATACAGCA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAATTTTGTACCTGGATATCCAGATA
gi|108240 : GGGTTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCT---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAATTAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTTTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTATGTGTATTCAACAACGCGTATAT--TGGTGGAAAAGCCATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACT-AAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATAAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|108241 : ATGGAAGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTAATT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCGTACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTTTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGGACAACTTTG
gi|108242 : CAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATGGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATTTCTGTCTGAGCAACATTG
gi|108243 : CAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATAGTGGGCTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCACTATTTTAAATGATGTCCGTCTGAGCAACATTG
blockSeqs : G CATACACTGTGTTGATATGCG TAC GT TCTATC ATTTT AGT GTTT TG AACC TATTT T TG AT ATT GT T G C GTATTTCTTAAA ACT TGT T GC CTTA TT C C CA A TG . TATATAA TCT T CTT AA AT A G G
blockSeqs : A TAAAACTCGATATTCCACA . G CTGATT . AGT TCG . ACC T . . . AAT . . G . GTATTTCTTAAA A TGT T GC AGT . C G . . . . C . . . . . . G C
blockSeqs : . TGTTTGTTGCCT . G T . . . . ACC . . . . . . . . . TAAC T . T . AT . C C . . . . C . . . . . . . C
blockSeqs : . GATTTTTGCGAT . G . . . . . . . . . . . . . . . TC A . T . AT . G C . . . . C . . . . . . . C
blockSeqs : . TCTCTATTGGT . G . . . . . . . . . . . . . . . TA A . T . AT . C T . . . . C . . . . . . . C
blockSeqs : . TCTCTATGGGT . G . . . . . . . . . . . . . . . TC T . T . AT . C C . . . . A . . . . . . . C
blockSeqs : . TCTCTATGGGT . A . . . . . . . . . . . . . . . TC A . T . AA . T C . . . . A . . . . . . . C
blockSeqs : . TCTCTATGGGT . G . . . . . . . . . . . . . . . TT C . T . GG . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . TCTCTATGGGT . T . . . . . . . . . . . . . . . TA T . C . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . TGTGTAGGTAT . G . . . . . . . . . . . . . . . TT T . T . AT . . . . .
blockSeqs : . CAAAGAAGGAT . T . . . . . . . . . . . . . . . TT T . T . AT . .
blockSeqs : . TTTACACGGGA . G . . . . . . . . . . . . . . . TG A . T . AT .
blockSeqs : . TCTCTATGGGT . G . . . . . . . . . . . . . . . TC T . T . T .
blockSeqs : . TCTCTATGGGT . A . . . . . . . . . . . . . . . TC A . C . .
blockSeqs : . CGCTGTTTGTC . C . . . . . . . . . . . . . . . TC A . . . .
blockSeqs : . TGTCATGTGT . A . . . . . . . . . . . . . . . CC C . . . .
blockSeqs : . CAAAGACGG . G . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . TCTTTCATC . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TACTTGCAG . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CAAAGAAGG . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CAAAGAAGG . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TCTTTAATT . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CAAAGAAGG . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CTTCAATGT . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TTTAAATG . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TTATAGAT . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . TATTTAGT . G . . . . . . .
blockSeqs : . ACTTATGT . G . . . . . . .
blockSeqs : . TTTTATG . A . . . . . .
blockSeqs : . TTTTTAT . A . . . . . .
blockSeqs : . TTTCGGT . G . . . . . .
blockSeqs : . ATAGGT . G . . . . .
blockSeqs : . ATTAAT . . . . . . .
blockSeqs : . TTAGGT . . . . . . .
blockSeqs : . TGCGGT . . . . . .
blockSeqs : . TATAT . . .
blockSeqs : . TTTGT . .
blockSeqs : . CTGT .
blockSeqs : . TA .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ****
originalCons : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--NTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
finalCons : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--NTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222 11111111111111 1111 1111111
lowQualScore : 1 66666666666666666666666666666666 1 111 11 777777 22222 333 4444 11 7777 44444 1 22 22 555 22 1 3 1 88888888888888 444 777 1 66 77777 33 1 5 55 4 55 0 0000 5555555 777 4 777 55 44 3 7 1
lowQualScore : . ................................ . ... .. ...... ..... ... .... .. .... ..... . .. .. ... .. . . . .............. ... ... . .. ..... .. . . .. . .. . .... ....... ... . ... .. .. . . .
lowQualScore : 0 99999999999999999999999999999999 0 777 44 333333 88888 999 3333 66 0000 88888 5 00 11 444 33 7 3 9 22222222222222 666 444 6 55 22222 99 9 7 55 0 55 9 6666 8888888 888 4 888 55 66 6 3 4
consensus : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--NTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
Reference ( family-132 ) : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--NTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|107926 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTTGACCACGTGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCTGCACCCCACCCC-ACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTCTTATATATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATT-GCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACACTG
gi|107928 : GATCATGGGTTCGCTGCTCTACCGCTGGACCACGCGTTCCAT-A----T----CT---CT-A-TT--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTTTTATTTT--ACTACCCGCACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--TAAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCGAAAAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTGTTCTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATATCCGCCATTTATAGTGGGTTGCGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTTTGAACAACATTG
gi|107930 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCC-G-----T--A-----TT--TTAA---TATATTTTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACC---ATCCCACCCCGACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATAA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGCTG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCATATAT--TAGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAAGCGTCGATACTTAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAGATAATGTCTGTCTGAACAACATTG
gi|107931 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTCCA
gi|107932 : GATCAAATGTTCAGTGCTCTACCGTTGGACCAACCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGCAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCACACCCCACCCCCACATAAACAGAATAAATT--CGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGGTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCACAA-GTAAACACTCACTTCAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTATCTATCCAAGTACTATGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATTTGAA-TGCATACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCATTAATACTAAAGTCTATACATGAATATCCAGATATGTCTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCATCGGAACAACATTG
gi|107933 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTTGACCATGTGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTTTTATTACCCGCACCCCACCCC------AACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAAGGTTTGCTTTCAAACGCATGTTTTCTC----GTATATATATATAAGCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATA-TTGCAAAATATAAACACTCA---CAAATCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACTTATGCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGGGTGTATTCAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTCAACCGTTGACACTAAAGTCTGTACACGAATATCCAGATATATCTGCCATTTATATTGGGTTGTGATTAAAAACAATAATATTTAGCAGTTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAATACTG
gi|107935 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCGCTGGACTACGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--CA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----
gi|107936 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----C----AA---AG-A-CG--G----------A---TAA-C------C-----A---A----G--TAAACCAG-----AA-AA--A--A---AG--AC-A-------T-G-----T--T-----TT--TT-----TA-GTATTT--CTTAA-A--TTATGATGTTGT--AT
gi|107937 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----GT---TT-GTTG--CCT------T-ATACTAG-G------C-----G---G----A--TA----AC-----AA-AA--atttgctgtaataatcta
gi|107938 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGTGCTCCAT-A---------------T-A-T----AT------T-A---TAT-A------C-----A---G----C--TA----AG-----cacacatattgatatataatatacat
gi|107939 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCA--A----T-----T---TT-A-TG-------------A---TAG-A------T-----A---A----A--
gi|107940 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----G----AT---TT-T-TGC-GAT------T-A---TTT-T------CATTTTA---A----A--TA-----------AA-AT--C--T---AA--GT-AC-TCTTC--A-----T--A-----TT--A-AA---TATCTACTT--TAAAC-TTATTATAATATTAT--AT
gi|107941 : GATCATGGGTTCGGTGCTTTACCACTGGACCATGCGCTCCAT-A-----------------A-TA--GGT------T-A---T
gi|107943 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTCCAC-T----T----TT---AA-A-TG-----------T-A---T-G-T------C-----A---C----A--TA----AT-----AA-AA--T-------A--AC-AT-TATATT-T-----T--T-----TTACTTGA----A-ATAGTT--TGAAAGT--TTG-AGT-TTTT--AT
gi|107944 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCAATGGACCACGCACTCCAC-A----
gi|107945 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTTCA-----------------TT-A-TA--GAT------T-A---TA
gi|107946 : GATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAT------T----AT---TT-A------GT------T-A---TA
gi|107948 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-
gi|107949 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----tat
gi|107950 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107951 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|107952 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCAC-A-----------------A-TT--AAT------G-A---TCG-A------T-----A---A----ATGTA----CG-----TA-AA--G--A---A
gi|107953 : GATCATGGTTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107954 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCATTGGGCCACGCGCTCCATGA----T--------------TA--GGT------T-A---CAA-AT-----T-----A---A----A--T
gi|107955 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCAC-A----T----
gi|107956 : GATCGTGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107957 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAaccccctgatcttggatccgattatatttatttgatgaaagaccatgtatgtttgcttatagcatatatactacaattagtgtaagtatatttcat
gi|107959 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107961 : GATCATGATTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC------T----GT---GT-A-GG--TAT------T-A---TAC-A------T-----A---ATCG-A--TA----AA-----A
gi|107962 : GATCATGGGTTCGGTGCCCTACCACTAGACCACGCGCTCCAT------T----CT---TTCA-T-----C------T-A---T----------------------------TA----AG-----AATAA--G--G---AAGTACTAT-TATACTCG-----TAAC-----TT--CTAA---TAT
gi|107963 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTCTCCAC-A----T----t
gi|107964 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----TAAAACT---CG-A-T----ATTCCACAT-A---TAA-A------C-----T---AGTTTA--TA----TG-----AA-AATGG--AATTAA--AC-AC-CTTTC------------------------A--------ATTT--TGTAG-G--TTGTAATAT
gi|107965 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCTAC-A----T----TT---
gi|107966 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----T----
gi|107967 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACCCTCCAG-A----T----AC---TT-G-CA--G----------A---TAG-A------C-----A---G----A--
gi|107968 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107969 : GATTATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107970 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGATCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|107971 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAC-A----T----
gi|107973 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----AAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-ATGTTTTTT-AGTATTT--CTTAAATT--TTGATGTTATATATTTGCTGTA-------GTAAT
gi|107974 : GATCATGGGTTCAGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107975 : GATCATGGGTTCGGTGTTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107976 : GACCATGGATTCGATTCTCTACTACTAGACCACGCGCTC--C-A----T----TT---TT-A-------T------T-A---TAG-G------T-----G---A----A--TA----AAT----AT-AA--G--A---AA--AT-AT-
gi|107977 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACCCGCTCTAC-A----T----TT---C--------GGT------TAA---TA---------------A---A----A--TA----
gi|107978 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTTCA
gi|107979 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----AAGTA----A--CA----AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-AT-TTTTTT-
gi|107981 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCTCGCGCTCCAC-A----tagtaattctcaaattttgatgttatat
gi|107982 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACACTCCAC------T----CT---TT-A-----ATT------T-A---TAG-
gi|107984 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGA-CATGCGCTCCAC-A----C----AA---AG-A-AG--GAT------T-A---C----------C-----A---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-A-------T-G-----T--T-----TT--TTTT---TA-GTATTT--CTTAA-A--TTATGATGTTGT--AT
gi|107986 : GATCATGGGTTCGGTGCGCTACCACTAGACCACGCGCTCCAC-T----T----TT-------------GT------T-G---TA--A------C-----A------------------------AG-AA--T--A---AA--GC-A-------T-G--------------TT--TTAA---CATATAT----------------CAATATTTT--AT
gi|107987 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATTACTGGACCACGTGCTCCAC-A----T----
gi|107988 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAatttttat
gi|107989 : GATCATGAGCTCGGTGCTGTACCACTGGACCACGCGCTCCAT-A----T----t
gi|107990 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAT-A----C----C
gi|107992 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A----
gi|107993 : GATAATGGGTTTGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCAT-A----T----
gi|107994 : GATCATGAGTTCGGTGCTTTACCACTGGACTACGCGCTCCAC-T----A----CT----T-A-T----GT------C-A----AG-A------------A---A----A--TA----
gi|107995 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCATTGGATCACGCGCTCCAT-A----
gi|107996 : GATCATGTGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|107997 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGTCCACGCGCTCCA
gi|107998 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACTGGCTCCATAA----T----CT---TT-A-
gi|108000 : GATCAAGGGTTCGATGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----
gi|108001 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACTACGTGCTCTAC-A----T----atattgcttcttatggcttgcaaatgtgtctataatatatatgcttaattt
gi|108002 : GATCATAGGTTCGGTGCTCTACCACTACACCACGCGCTCCGC-A----T----TT---CT-G-T
gi|108003 : GATCATTGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCATGCGCTCCAC-A---------------T-A--------------T-A---TAGTA------C---------A----A--TA----GT---------A--G--A---GA--AT-AT-CCATGC-G-----T--G-----TT--ACGA---AACATATT
gi|108004 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATGCACTCCAC-A----T----
gi|108007 : GATCATGGGTTCGTTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTCCA-------------T---TT-A-TG--G
gi|108008 : GATAATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGCGCTCCA
gi|108010 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGTGCTCCt
gi|108011 : GATCATTGGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCATACGCTCCAT------T----TT---AC-A-CG--GGA------C-A---TAA-A------C-----G---A----
gi|108012 : GATCATGAGTTTGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCA
gi|108014 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGAGCTCCAC-A----
gi|108015 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCTA
gi|108016 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTATCACTGGACCAGGCGCTCCAC-
gi|108018 : GATCACGGGTTCGGTGCTCTACCACTGCACCACGCGCTCCAC------T----GT---C--A-TG--TGT------T-tat
gi|108019 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTCCAC-A----
gi|108021 : GATCATGAGTTCGGTGGTCTATCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----C----ATACACT-G-TGTTGATATGCG-T-A---TAG-ATCTATCT-----A---A----A--TT----AGTATTTAA-AA--GATA---AA--AC-AT-T
gi|108022 : GATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCTTTCCAC-A----
gi|108023 : GATCATGGATTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGTTCCA
gi|108025 : GATCATGGATTTGGTGCTCTACCACTGGACGACGCGCTCCAC-A----T----GT---AT-A-T
gi|108026 : GATCATGGGTTTGGTGCTCTACCATTGGACCACGCGTTCCGC-A--------------CA-A-AGAAGG---------A---TAA-C------C-----A---A----G--TAACC-AG-----AA-AT--A--A---AG--AC-ATGTTTTTT-AGTATTT--CTTAAATT--TTGATGTTATATATTTGCTGTA-------GTAAT
gi|108027 : GATCATGGGTTCAGTGCCCTACCACTGGACCACACGCTCCAC-ACTGTT----CT---TG-A-TG--Gctatgtgcca
gi|108028 : GATTATGGGTTCGGTGCTCAACCACTGGACCACGCATTCCAC-A----C----TT---CA-A-T----GT------T-G---CAG-A------
gi|108171 : ATCATGAGTTCCGTGCTCTACCGCTGGACCATGCGCTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---CAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCC-G-----T--C-----TT--ACGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCGGCACCCCAGCCCCACATAAACAGAATAAATT--TGAT-TAAAT--CAACTTGTTTAAATGGTTGCTTTCAGTCGCATATTTTCTC----GTATATGC------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCATCA--AAAAATAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGAGGTGCGTGTATTCCACACTGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTAAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATTCAGATATGTCTGCCATTTATATAGGGTTGTGATCAAATACAATAATATCCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCACCTGAACAACATT
gi|108172 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTTCCATTGGACCATGTACTCCAT-A----T----CT---CT-A-TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-GT-TCTTCT-A-----T--C-----TT--ATGA---TATATATTT--TGTTA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGCACTGCAACCCTTCATAAACAGAATAAATT--TGA------------CTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACGCATATTTTCTC----GTATATGA------GCACAGAGCTGGGATTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCA---TAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAAATAAGAATATGAACTTTACCTATCCAAGTACTCTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTGTGCGTGTTCAACACCGCATATAT--TGG
gi|108175 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCACTCCAC-G---------CG---CT-G-TT--TGTC-----T-C---TAA-ACTGATTC-----A---A----A--CA----AA-----GA-AA--G--AAATAA--AC-AA-TCTT
gi|108176 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTTCA------------CT---GT-A-TG--G
gi|108177 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCTCGCGCTCCAC-A---------CT-------------GT------T-T---TAA-A------C-----A---A----A--CA----
gi|108178 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTAGACCACGCGCTCCA
gi|108179 : ATCATCGGTTCGGTGCTCTACCACTGAACCACGCGCTCCAC---------------------TGC-GGT------C-T---T----------T-----A---A----A--TA----AA-----AA-AA--A--A---At
gi|108180 : ATCATGGGTACGGTGCTCTACCACTGGACCACGCGCTCCAC-A----T----
gi|108182 : ATCATGAGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCACACGCTCCAC-A--------------CT-A-T
gi|108184 : ATCATGGGTTCGGTGCTCTACCACTGGACCATGTGCTCCAA-A----T----
gi|108237 : -TG--GGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AC-AT-TCTTCT-G-----T--C-----TT--CTGA---TATATATTT--TGTAA-T--TTGTAATATTTT--ATTACCCGAACCCCACTCCCACATAAACTGATTAAATTCATGAT-TTGCT--C--CTAATTTAAAT
gi|108238 : tattcct-TG--AGT------T-A---TAG-A------C-----A---A----A--TA----AG-----AA-AA--G--A---AA--AA-AT-TCTTCT-G-----C--C-----TT--GTGA---TACGTAT----------T--TTGTAATAGTTT--ACTACCTGCACTCCTCCCCCACATAAACTGATTAAATT--C-AT-TGATTTGCTACTGATTTAAA
gi|108239 : AAGTT--TGGTATCAAT--CAACTTGTTTAAATGTTTGCTTTCAGACACAGATTTTCTC----TTATATGA------ACACATAGCTGGGATTATCTACGACATATTTGCAATA-GTGAACACTCA---CAAGTTAATTAAAATATGGGCCTAG--AAAAATAAGAATA--AACATTACCAATCCAAGTACTTTGTTTCTTTTTAGA---TAACGGATATGCGTGTATTCAACAATGCATATATATT-----------CATGTGAAATGCATACAGCA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAATTTTGTACCTGGATATCCAGATA
gi|108240 : GGGTTA---GTGAAATATTTGCAAAA-GTAAACACTCT---CAAGTCAATTAAAGTATGGGCGTCG--AAAATTAAGAATATAAACGTTACCTATCCAAGTACTTTGTTTCTCTTTAGACCATAACGGATGTATGTGTATTCAACAACGCGTATAT--TGGTGGAAAAGCCATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACT-AAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTCTGCCATTTATAGTGGGTTGTGATAAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGAACAACATTG
gi|108241 : ATGGAAGTCG--AAAAATAAGAATATAAACGTTACATATCCAAGTATTCTGTTTCTCTTTAGACTATAACGGATGTGCGTGTATTCAACACCGCGTAATT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCGTACAACAGTTTAGTGTTCTTGTAAACCGTTGATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATATGTTTGCTATTTATAGTGGGGTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATGTCCGTCTGGACAACTTTG
gi|108242 : CAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAGGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATGGTGGGTTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCATTATTTTAAATAATTTCTGTCTGAGCAACATTG
gi|108243 : CAACACCGCGTATAT--TGGTGGAAAAGACATGTGAA-TGCATACAACA-TTTAGTGTT-------------GATACTAAAGTCTGTACATGAATATCCAGATTTGTCTGCCATTTATAGTGGGCTGTGATCAAATACAATAATATTCAGCAGCTTTCACTATTTTAAATGATGTCCGTCTGAGCAACATTG