lowQualScore : 22 11111 2222 1 222222222
lowQualScore : 11111 00 0 000 0 77777 0 1111 7 1111 11 0 4 0 0 111111 1 0 11 0 2222 0 222222222 222 111 44444 0 1 2222 22222 0 0 4 1
lowQualScore : ..... .. . ... . ..... . .... . .... .. . . . . ...... . . .. . .... . ......... ... ... ..... . . .... ..... . . . .
lowQualScore : 33333 88 5 999 5 88888 5 0000 2 8888 33 5 3 5 5 444444 4 5 33 9 8888 9 111111111 222 444 00000 8 6 7777 22222 9 9 4 0
consensus : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GNGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AA---A-A---CATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
Reference ( gi|86019 ) : AAGTTCAA-----GGCCTAGAATTTAGA-TATTT---TA-C-T---TGTAGC-ATTGCATG----GTGGT--TGCC--T-AAAACA-T-T------TGT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AA---T-A---CATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86022 : AAGTTCAT-----GGTCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGT-ATTGCATG----GTGGT--CTTC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AA---A-A---CATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGAAGAACAATTTTGGCCC-TCTTGGGACTCTTGTT
gi|86026 : AAGTTGAA-----TACCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-C---TGTAGC-ATTGCATG----GTGAT--CTCC--T-AAAAGA-T-G------TAT-TG-AAG--AGGAACT-TAT----AA-AA---A-A---CATTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAGCATTTCAAGCCC-TCTTGGGCTTCTTGTT
gi|86030 : AAGTTCAG-----GACCTAGAACTTAGA-TATTT---TA-T-G---TGAAGT-ATTGAATG----ATGCT--CTCC--T-AAAAGA-T-T------TAT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AA---A-C---CATTC---T---CTCTGAAA-----TG-TTCCAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGCCC-TGTTGGGCCTCTTGT
gi|86033 : AAGTTCAA-----GACTTAGTCCTTAGA-TATTT---T---------GTAGC-ATTGCATG----AAGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T-------GT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AA---A-A---AATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTAT-----T-CATTTGTTGCCAGTTAAGTGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86031 : AAGTTCAA-----CGTCTAGATCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAAC-ATTGCATG----GTGGT--CTCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AAAG-A-A---CATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-TATTTGTTGCCAGTAGACCGATTCAGGACC-T
gi|86032 : AAGTTTAT-----GGCCTAGATCTTAGA-TATTT---TA-C-G---TGTAGT-ATTTTATG----GTGCTCTTG----T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AT-AA---A-A---CATTT---C---CACTGAAA-----TG-CT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGTGTAATTCAGGCCT-TTTTGGGCCTCTTATT
gi|86037 : AAATTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-G---TGTAGC-ATTGCATG----GTGTC--T-CC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AGAAACT-TAC----AA-AA---A-T---CATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-TAT----TGGT-----C-CTTTTGTTGCCAGTAGAGCAATT------C-TCTTGGGCCT
gi|86041 : AAGTTCAA-----GGCCTTGGCCTTAGA-TATTT---TA---------TAGC-ATTGCGTG----GTTGT--CTCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AGAAACT-TAT----AA-AA---C-A---CATTT---C---CCCTG-AA-----TC-TT-CAT----ATGT-----C-CATTTGTTGCAGGTAGAGGGATTCAGGCCT-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86038 : AAGTT-AA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGT-ATTGCATG----GTGGT--CTCC--T-AAAAGG-T-T------TG-----GGG--AGGAATT-TGC----AA-AA---A-AAAACATTT---C---CTCCGAAA-----TG-TT-CAT----CTTT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAAGGACTCAGGCCA-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86042 : AAGCTCAA-----GGC-------TTAGA-TATTC---TA-C-G---TGTAGC-ATTGTATG----GTGGT--CTCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAA--CAAAACT-TAC----AA-AA-----A---AA----------CTCTGAAA-----TG-TA-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGGCC-TCTTGGACCCCTTGTT
gi|86044 : AAGGTTAA-----GGCTTAGACCTTAGA-TCTTT---TA-C-A---TGTATC-ATTTCATG----GAGGT--ACCC--T-AAAAGA-T-T-------GT-TG-AAG--AGGAACT-TAG----AA-AA-----A---CATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTATTCTATC-CTTTTGTTGCCAGTAGAGTGGTTCACACCC-TCTTGGGCTTCTTGCT
gi|86050 : AAATTCAA-----GTTCTAGA-TCTAAACTATTT---AA-CATCA-TGTAGC-ATTACATG----GATGT--CGCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AAAAAAAATAC----AA-AA---A-AAA-CATTT---C---CTCGGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGAAGAGCGAATCAGGCCC-TCCTTGGCCTCGTG
gi|86053 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACATTAGA-TATT-----------------------GTATG----GTGGT--CTCC--T-AAAAGA-T-TAGTAATTGT-TG-AAG--AAGTACT-TGC----AA-AA---C-A---TATTT---C---CTCTGCAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----T-CATTTGTTGGACGTAGAGTGATTTGGGCCC-TCATGGGCCTCTTGTT
gi|86055 : AAGTTGAT-----GGCCTAGATCATAGA-TATTT---TA-C-A---TGTTAT-ATTGACTG----GTGGT--CTCC--T-AAAAGT-G-T------TGT-TG-AAG--AGGAACT-TACCATTAA-A-----------ATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGC-----C-CATTT-TTGCAGGTAGAGCTATCAATGCCCTTTTTGGGCATCTTGTT
gi|86059 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTAAGA-TATTA---TA-T-G---TGTACC-ATTGCATG----GTGGT--C-------------------------T-CG-AGG--AGGAACT-TAC----AT-AA---A-A---CATTT---C---CTGTGAAA-----TG-TA-AAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTTAAGCGATTCAGGCC
gi|86060 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TACTT---TA-T-G---TGTAGC-ATTGCATG----GTGAT--CTCC--C-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AAGAACT-TAC----AA-AG---A-A---CAGTT---C---CTCTGAAC-----TG-TT-CA
gi|86061 : AAGTTTAA-----GGCCTATTCCTTAGA-TATTT---TA-T-G---TGTATC-ATTGCATG----GTAGT--CTCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAT--CGGAACT-TA-----AA-AA-----A---CATCT---C----------------TG-CC-CAT-----------------TTTGTTACAAGTAGACCCATTCAAACCC-TCTTGGGCCTCTTG
gi|86062 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCATAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGCTATT-CATG----CTGAT--C-CC--G-AAAAAAGT-T------TGC-GG-AAG--AAGAACT------------------------------------CTGAAA-----TG-TT-TGT----TTGT-----C-CATTTGTTGCCAATAGAGCGATTCATGCTC-TCTACGACCTCTTGTT
gi|86065 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATTTTAGA-TATTT---TA-C-T---TGTAGC-ATTGCGCG----GTAGT--CTCC--T-AAAAGA-T-G------TGT-TG-ATG--TGGAACT-TAC----AA-CA---A-A---CATTT---CATTTTTTG--A-----TGTTT-CAT----TTAC-----C-CAT
gi|86064 : AAGT-CAA-----GGTTTAGACCTTTGA-TATTT---AA-T-G---TGTAGC-ATTGAATG----ATGGTC-TGCA----AAAAGA-T-T------TGT-GG-AAG--AGGAGCT-TCC----AG-AA---A-A---CATTT---C---CTCTG------------T-CAT----------------------------TAGAGCGATTCAGA-CC-TCTCGGGCCTCTTGTT
gi|86067 : AAGTTCAT-----GACCTAGACCTTATA-TATTTATATAAC-A---TGTAGC-ATTGGATG----GTGGT--CTCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AA-----A---GATTT---C---CT
gi|86073 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATA----GAAGC--CCCC--A-AAAAGA-T-T------TCTCTG-AA------AGTT-TAT----GA-CC---T-A---CG------C---CACAGATA-----TT-TTACATG---CAG--------CATCTGTTGTAAAAAGAGTGATTCAAGTCC-TCTTGGGACTCTTGTT
gi|86071 : AAGTTTAA-----GGCATGTACCTTAGA-TATTT---TA-T-G---TGTAGC-ATTGCATG----GTGGT--CCCC--T-AAAAGG-T-T------TGG-TG-AAGCCAGGTCCC-TG-----GA-AT---T-A---AATTTA--G---GGCTGTCA-----TA-CA-CAA----GGGG-----C-GATTTGTTTCAAGTAGAGTGATTCGGCCCC-TCTTGGGTATCTTGTT
gi|86076 : AAGTTCAA-----GGCCTGTACCTTAGA-CATTT---TT-T-G---TGTAGC-ATTGCATG----ATGGT--CTCC--T-TAAAGA-C-T------TTT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AA---T-A----ATTT---T---CTGTTAAG-----TC-TT--------------------ATT--TTGTAAGTTGAGCCATT
gi|86080 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--TCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86077 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GCGGC--CTCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86020 : AAGTTCAA-----GACCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86093 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TGTTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--CCTC--T-AAAATA-T-T------TGT-CG-AAG--
gi|86079 : AAGTTCAA-----GGCCTAAACCTTAGA-TATTT---AA-T-G---TGTAGC-ATTGCATG----GTGGT--CTCT--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--A
gi|86091 : AAGTTCAA-----GGCTTAGACTTAAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----G-GGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AA
gi|86096 : AAGTTCAA-----GGCCCAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAATT--CCCC--T-AAAATA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86087 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGAATG----GGGGT--CCCG--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86084 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCATAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GGGGT--CTTC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86082 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-AATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--CTCC--T-AAAGGG-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86092 : AAGTTCAA-----AGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--CCCC--T-ACAAGA-T-C------TGT-TG-ATG--TCGAGC--CACT---GA-AA---TCA---AATTTGAAA---TTGTAAAA-----TG-TT-TAT----CT
gi|86039 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---GGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--TCTC--T-AAAAGG-T-G------TGT-TG-AAG--
gi|86063 : AGGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGT-TATTT---TA-C-A---TAAAGC-ATTGCATG----GAGGT--CACC--T-AAAGGT-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86095 : AAGTTCAA-----GGTCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--C-CC--T-AAAAGA-G-T------TAT-TG-AAG--tcagattcatggggtcaaatgtggggtcgccattgcatggtggcctcctttaaagtatttatatgtccatttgttgcaagtagagcgattcaggccctctttggccacttgtt
gi|86070 : AAGTACAA-----GTCCTAGACCTTATA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--CCCC--T-AAAATA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86046 : AGGTTCAA-----GGCCTAAACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TATAGC-ATTGCATG----GAGGT--CCCC--T-AAAAGT-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86074 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---CA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGC--TCCC--T-AAAAGA-T-T------TTTCTG-AA
gi|86098 : AAGTTAAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT----CCTGT-AAAAGA-T-T------TGT-TA-AAG--
gi|86088 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-CATACGTGTAGC-ATTGAATG----GGGGT--CTCC--T-AAATGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86075 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---CA-C-A---TGAAGC-ATTGCATG----GAGGT--TCCC--T-AAAAGA-T-T------TCTCTG-AA
gi|86048 : AAGTTAAA-----GGCCTAGACCTTAAA-TATTT---TG-C-A---TGTAGC-ATTGCAAA----GAGGT--CCCC--T-AAAATA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86117 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---GA-T-A---TGTAGC-ATTGCATG----GACGT--TCCG--T-AAAAGA-T-T------TGT-TA-AAG--
gi|86100 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TTTAGC-AATGCATG----GAGGT--CCTC--T-AAAAGA-G-T------TGT-TG-AAG--
gi|86103 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTATT-ATTGCATG----GAGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TCA-TG-AAG--
gi|86069 : AAGTTCAA-----GGCCTAGAACATAGA-TAGTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GATGC--CCCC--T-ATAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86111 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTTGA-CATTT---TA-C-A---TGTAGC-ACTGCATG----GAGGT----CCTGT-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86107 : AAGTTCAA-----GCCATAGACCTTAGA-CAATT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAA--CGGA
gi|86104 : AAGTTCAA-----GGCTTAGACCTTAGA-TATTT---GA-C-A---TGTAGC-ATTGCACC----AGGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86108 : AAGCTTAA-----TGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GTGGT--CCCC--C-AAAAGA-T-A------TGA-TG-AAG--
gi|86056 : AAATTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATGT---TA-T-G---TGTAGC-ATTGCATT----GGGGT--CCCC--T-AAAAGT-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86040 : AAGTTTAA-----GGCCAAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--CCTT--T-AAAAGG-T-T------TGT-TG-AGG--
gi|86101 : AAGTTCAA-----GGCCAAGACCTTAGA-TATAT---TA-C-A---TGTAG--ATTGCATG----GCGGT--CTCG--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86047 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTGGA-TATTT---TA-C-A---TGTTGC-ATTGCATGCATAGAGGT--CCCC--C-AAAAGA-T-T------CGT-TG-AAG--
gi|86126 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAAA-TATTT---TA-C-C---TGTAGC-ATTCCATT----GAGAT--CCCC--A-AAAAGA-T-T------TAT-TG-AAG--
gi|86116 : AATTTCAA-----GGCT---ACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GGGAT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86113 : AAGTTCAA-----GGCCTATACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGTATG----AAGGT--CTCC--TAAAAAGA-T-T------TGT-T
gi|86109 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCATAGA-TGTTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GTGGT--CCCC--T-CCAAGA-T-T------TAA-TG-AAG--
gi|86034 : AAGTTCAATCCTAGACCTAGACATCAGA-TATTT---TA-C-A---T-TAGC-ATTGCATG----GAGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86120 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-AATTT---CA-C-A---TGTAGC-ATGGTATG----GAGGC--CCCC--T-AAAAGG-T-T------TGT-TG-AGG--
gi|86052 : AGGTTTAA-----GTTCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGTATG----GAGGC--C-CC--T-AAAAGA-T-T------TAT-TG-AAG--
gi|86123 : AAGATCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TACAGC-ATTGCATG----GATGT--CCCC--T-AACAGA-T-T------TGT-TT-AAG--
gi|86045 : AAGTTCAT-----GGCCTATATCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--CTCC--T-AAAA
gi|86125 : AAGTTCAA-----GGTCTAGACCATAAA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATA----AAGGT--CCCC--T-AAAAGC-T-T------TGT-TG-Aga
gi|86027 : AATTTCAA-----GACCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-T-A---TGTTGC-ATTGCGTG----G-GGT--CTCC--T-AAAAGG-T-T------TGT-TA-AAG--
gi|86112 : AAGTTCAA-----GGCCTACACCTTAGA-TATTC---TA-C-A---TGTAGC-AGTGCATG----AAGGT--CCCT--T-AAAAGA-T-T------TGT---------AGGAAGT-T
gi|86028 : AAGTTCAA-----GGCCTAGGCCTTAGA-TATTT---TA-T-G---TGTAGC-ATTTGAGG----GGGAT--CCCC--T-AAAAGG-T-T------TGT-TA-AAG--
gi|86183 : AATTCAA-----GGCATAGACCTTAGA-TATCT---TA-T-G---TGCAGC-ATTACATG----GTGGT--CCCC--T-AAAAGG-T-T------TGT-TG-A
gi|86182 : AGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGA-TATTG---TA-C-A---TGTAGC-GTT--ATT----GAGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--
gi|86190 : GTTTAA-----GGCATAGACCTTTGA-TATTT---TA-C-G---TATATA-TTTGCATG----GTGGT--CTCC--T-AAAAGA-T-G------TGT-TG-AAG--AGGAATT-TAC----AA-AA---A-AAA-CAGTT---C---TTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATGTACTGCCAGTAGAACGATTCAGGTCC-TCTTAGGCCTCTTGTT
gi|86192 : GTTCAT-----GGCCTAGACCGTATA-TACAT---AA-C-A---TGTAGT-ATTGAATG----GCGGTC-TACT--T-AAAAAA-T-T------TGT-TG-AAG--AGAAATT-TAC----AA-AA-----A---CATGT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAC----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAGCTATTCAG
gi|86191 : GTTCAA-----GGCCTAGACCCTAGA-TATTT---TA-C-G---TGTATC-ATTGCATG----GTGGT--CTCC--T-TAATAA-T-T------TTT-TG-AAG--AGGAACT-TAC----A---------A---TGTTT---C---CTCTGAAA-----AA-----A-----------------ATGTGTTGCCAGTAGAGCGAGTCAGGCCC-TTTTAGGCCTCTT
gi|86194 : GTTTGA-----GGCCTAGATCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GGGGT--CCCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-GG-AAG--
gi|86212 : CAA-----GGTCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATG----GAGGT--TTCC--T-AAAACG-T-T------TGA-TG-AAG--
gi|86217 : -----GGTCTAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCACG----GAGAT--CCTC--T-AATAAA-T-T------TGT-TG-AAGTCGGG---T-CGC----TG-GGGTCT-A---GA------C---CTTAGATA-----T--TT-TAC----ATGT-----AGCATTTGTTGCAAGTAGAGTGATTCAGGTCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86218 : -----GGCATAGACCTTAGA-TATTT---TA-C-A---TGTAGC-ATTGCATA----GTG-----------------A-T-T------TGT-TG-AAG--AGTAACT-TAT----AA-AA---A-AAA-CATTT---C---CTCTGAAA-----TA-TT-C
gi|86227 : TTAGA-TATTT---AA-C-A---TGTAGC-ATTTTGTG----GTGGT--CCAC--T-AAAAGG-T-T------TGT-GG-AAG--ggcgattcaggccctc
gi|86239 : cA-C-A---TATAGT-ATTGAATG----GTGGT--CTCT--T-AAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AGGAACT-TGC----AA-AA---A-A---CATTT---C---CTTTGGAG-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCAAGTAGAGTGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTATTcttaatcatcaagataaaatttggcactgccatataccaggggcttataaccactatttaaggagaataataatcctctagcgatttgtttcaagtagagcgaatcaggccctcttgggcctcttgtt
gi|86242 : TAGC-ATTGTATA----CTGGT--CTCC--T-AAACGA-TCT------TGT-CA-AAG--AAGAACT-TAC----AA-AA---A-T---CATTT---C---CTCTGAAA-----TG-
gi|86243 : AGT-ACTGCATG----GTGAT--CTCC--T-AAACGA-T-T------TGG-TG-AAG--AGGAACT-TAC----GA-AA---A-A---TATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-TATTTGCTGAGATTAGAGCGATTCAGCCCC-TCTT-GGCCTCTTGTT
gi|86245 : C-ATTGCATG----GAGGT--TGCT--T-TAAAGA-T-T------TGT-TG-AAG--AAGAATT-TAC----AA-AA---A-A---CATTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAGAGATTCAGGCCC-TCTAAGGCCTATTGTT
gi|86246 : TGTATG----GTTGT--CTCC--T-AAAAGA-T-T------TGT-TA-AAG--TAAAACT-TAC----AA-AA---A-A---CATTT---T---CTCTGAAA-----TG-TG-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCCAGTAGAACAATTCAGGCTC-TCTTCAGCCCCTTGTT
gi|86256 : GT-TT-AAG---GGAACT-TAC----AA-AAA--C-A---CGTTT---C---CTCTGAAAAGTAATG-TT-CAC----CTGT-----T-CATTTGTTGCAAGTAGAGCAATTCAGGTCC-TCTTG
gi|86257 : GT-TA-AAG--GGGAACT-TAA----AA-AA---T-A---GTTTT---T---ATCTGAAA-----TG-TT-CAT-----------------TTTTTTGTTAGTAGAGTGATTAAGACCC-TCTTGGGCCTCTTATT
gi|86258 : T-TGCAGG--AAGAAGT-TAC----AA-AA---A-AA--CGTTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----ATGT-----C-CATTTGTTG--AGT--AGCTATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTTTTGTT
gi|86266 : G-AAG--AGGAACT-TAC----AA-AA-----A---CATTT---C---TTCTGACA-----TG-TA-CAT----TGGT-----C-CATTTGTTACCAGTTGAGCAATCCAGGCCA-TCTGTGGCCTCTTGTT
gi|86268 : -AAG--GGGAACT-TAA----AA-AA---A-A---AATTA---C---TTCTGAAAATTAATG-TT-CAT----CTGT-----T-TACTTGTTGCGAGTAGAGTGATTCAGGTCC-TCTT
gi|86269 : AA--AGGAACT-TAC----AA-A----------CAT-----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATGTGTTGCCAGAAAAGCGATTCAGACCC-TTTTGGGCCTCTTGTT
gi|86270 : AG--AGGAA----------AA-AA----------AT-----C---CTCTAAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTCAGACCC-TCT--GGCCCCTTGTT
gi|86275 : T-TAC----AA-AA---A-A---AAT-----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTTAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86276 : T-TAC----AATAA---C-----CATT----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----T-TATTTGTTGCCAGCAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86279 : -TAC----AT-AA---A-A---CATTT---C---CTCTTAAA-----TG-TT-CAT----CTTT-----C-CATTTGTTGCCAGTATAGCGATTTGGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86277 : -AA---T-AAC-CATTT---C----TCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----T-TATTTGTTGCCAGAAGAGCTATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86287 : tttc-A---CATTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CAT----CTGT-----C-CAGTTGTTGCAAGTAGAGCGATCCAGGCCC-TCTTTGACCTCTTG
gi|86286 : -A---CATTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CATAGATCTGT-----C-TATTTGTTGCCAGTAGACCGATTCAGGCCC-T
gi|86285 : -A---CATTT---C----TCTGAAA-----TA-TT-CAT----TTGT-----T-CATTTGTTGCCAGAAGAGCGACTCAGGCCT-TCTTTAGTTTCTT
gi|86063 : aaT---C---CTTTAAAG-----TA-TT-TAT----ATGT-----C-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTTGGCCACTTGTT
gi|86227 : aggttcaaggcctagaccttagttattttacataaagcattgcatggaggtcacctaaaggttttgttgaagtcagattcatggggtcaaatgtggggtcgccattgcatggtggccAA-----TA-AT-CCT----CTAG-----C-GATTTGTTTCAAGTAGAGCGAATCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
Alignments
lowQualScore : 11111 000 0 1111 000 0 1111 1 0 00 0 0 111111 1 0 000 00 2222 222 22 11 11 11 222 111 33333 0 1 22222 2222 0 1 0
lowQualScore : ..... ... . .... ... . .... . . .. . . ...... . . ... .. .... ... .. .. .. .. ... ... ..... . . ..... .... . . .
lowQualScore : 22222 999 5 0000 999 5 0000 9 5 66 5 5 333333 3 4 888 66 6666 777 33 99 99 11 222 444 99999 8 6 00000 6666 8 0 9
consensus : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GNGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
Reference ( family-115 ) : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GNGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86019 : AAGTTCAA-----GGCCTAGAATTTAGATATTT---TA-CT----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTTG-CC--T-AAAACAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--T--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86020 : AAGTTCAA-----GACCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86022 : AAGTTCAT-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGT-ATTGCATG----GTGGTCT-TC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGAAGAACAATTTTGGCCC-TCTTGGGACTCTTGTT
gi|86026 : AAGTTGAA-----TACCTAGACCTTAGATATTT---TA-CC----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGATCT-CC--T-AAAAGAT-G------TAT-TG-AA---G--AGGAACT----TAT---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCATTTCAAGCCC-TCTTGGGCTTCTTGTT
gi|86027 : AATTTCAA-----GACCTAGACCTTAGATATTT---TA-TA----T---GTTGC-ATTGCGTG----G-GGTCT-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86028 : AAGTTCAA-----GGCCTAGGCCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTTGAGG----GGGATCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86030 : AAGTTCAG-----GACCTAGAACTTAGATATTT---TA-TG----T---GAAGT-ATTGAATG----ATGCTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--C--CA--TTC---T---CTCTGAAA-----TG-TTCCA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGCCC-TGTTGGGCCTCTTGT
gi|86031 : AAGTTCAA-----CGTCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAAC-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAAAGA--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-TATTTGTTGCCAGTAGACCGATTCAGGACC-T
gi|86032 : AAGTTTAT-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CG----T---GTAGT-ATTTTATG----GTGCTCT-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CACTGAAA-----TG-CT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGTGTAATTCAGGCCT-TTTTGGGCCTCTTATT
gi|86033 : AAGTTCAA-----GACTTAGTCCTTAGATATTT---T------------GTAGC-ATTGCATG----AAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T-------GT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--AA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTATT-CATTTGTTGCCAGTTAAGTGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86034 : AAGTTCAATCCTAGACCTAGACATCAGATATTT---TA-CA----T----TAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86037 : AAATTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTG-TCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAACT----TAC---AAAA--A--T--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-TA-----T----TGGTC-CTTTTGTTGCCAGTAGAGCAATT------C-TCTTGGGCCT
gi|86038 : AAGTT-AA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGT-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGGT----------T-TG-GG---G--AGGAATT----TGCAAAAAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCCGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTTTC-CATTTGTTGCCAGTAGAAGGACTCAGGCCA-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86039 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----G---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-TC--T-AAAAGGT-G------TGT-TG-AA---G--
gi|86040 : AAGTTTAA-----GGCCAAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TT--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-AG---G--
gi|86041 : AAGTTCAA-----GGCCTTGGCCTTAGATATTT---TA------------TAGC-ATTGCGTG----GTTGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAACT----TAT---AAAA--C--A--CA--TTT---C---CCCTG-AA-----TC-TT-CA-----T----ATGTC-CATTTGTTGCAGGTAGAGGGATTCAGGCCT-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86042 : AAGCTCAA-----GGC-------TTAGATATTC---TA-CG----T---GTAGC-ATTGTATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---A--CAAAACT----TAC---AAAA--A--A---A------------CTCTGAAA-----TG-TA-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGGCC-TCTTGGACCCCTTGTT
gi|86044 : AAGGTTAA-----GGCTTAGACCTTAGATCTTT---TA-CA----T---GTATC-ATTTCATG----GAGGTAC-CC--T-AAAAGA--T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TA----GAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CATCTATT----CTATC-CTTTTGTTGCCAGTAGAGTGGTTCACACCC-TCTTGGGCTTCTTGCT
gi|86045 : AAGTTCAT-----GGCCTATATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCT-CC--T-AAAAGA
gi|86046 : AGGTTCAA-----GGCCTAAACCTTAGATATTT---TA-CA----T---ATAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86047 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTGGATATTT---TA-CA----T---GTTGC-ATTGCATGCATAGAGGTCC-CC--C-AAAAGAT-T------CGT-TG-AA---G--
gi|86048 : AAGTTAAA-----GGCCTAGACCTTAAATATTT---TG-CA----T---GTAGC-ATTGCAAA----GAGGTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86050 : AAATTCAA-----GTTCTAGATCTAAACTATTT---AA-CA----TCATGTAGC-ATTACATG----GATGTCG-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAAAAAAA---TAC---AAAAAAA--A--CA--TTT---C---CTCGGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGAAGAGCGAATCAGGCCC-TCCTTGGCCTCGTG
gi|86052 : AGGTTTAA-----GTTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGTATG----GAGG-CC-CC--T-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86053 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACATTAGATATT--------------------------GTATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-TAGTAATTGT-TG-AA---G--AAGTACT----TGC---AAAA--C--A--TA--TTT---C---CTCTGCAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-CATTTGTTGGACGTAGAGTGATTTGGGCCC-TCATGGGCCTCTTGTT
gi|86055 : AAGTTGAT-----GGCCTAGATCATAGATATTT---TA-CA----T---GTTAT-ATTGACTG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGTG-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---CATT--A--A--AA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGCC-CATTT-TTGCAGGTAGAGCTATCAATGCCCTTTTTGGGCATCTTGTT
gi|86056 : AAATTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATGT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATT----GGGGTCC-CC--T-AAAAGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86059 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTAAGATATTA---TA-TG----T---GTACC-ATTGCATG----GTGGTCT-C-------------------------G-AG---G--AGGAACT----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CTGTGAAA-----TG-TA-AA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTTAAGCGATTCAGGCC
gi|86060 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATACTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGATCT-CC--C-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAGAACT----TAC---AAAG--A--A--CA--GTT---C---CTCTGAAC-----TG-TT-CA-----
gi|86061 : AAGTTTAA-----GGCCTATTCCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTATC-ATTGCATG----GTAGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---T--CGGAACT----T-----AAAA--A--A--CA--TCT---C----------------TG-CC-CA-----T------------TTTGTTACAAGTAGACCCATTCAAACCC-TCTTGGGCCTCTTG
gi|86062 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCATAGATATTT---TA-CA----T---GTAGCTATT-CATG----CTGATCC-CG--A-AAAAAGT-T------TGC-GG-AA---G--AAGAA--------------------------------------CTCTGAAA-----TG-TT-TG-----T----TTGTC-CATTTGTTGCCAATAGAGCGATTCATGCTC-TCTACGACCTCTTGTT
gi|86063 : AGGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGTTATTT---TA-CA----T---AAAGC-ATTGCATG----GAGGTCA-CC--T-AAAGGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86063 : C-ATTGCATG----GTGGCCT-CCTTT-AAAGTAT-T------TAT-tcagattcatggggtcaaatgtggggtcgccattgcatggtggcctcctttaaagtatttatatgtccatttgttgcaagtagagcgattcaggccctctttggccacttgtt
gi|86063 : aggttcaaggcctagaccttagttattttacataaagcattgcatggaggtcacctaaaggttttgttgaagtcagattcatggggtcaaatgtggggtcgcT---C---CTTTAAAG-----TA-TT-TA-----T----ATGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTTGGCCACTTGTTatgtccatttgttgcaagtagagcgattcaggccctctttggccacttgtt
gi|86064 : aggttcaaggcctagaccttagttattttacataaagcattgcatggaggtcacctaaaggttttgttgaagtcagattcatggggtcaaatgtggggtcgccattgcatggtggccAAGT-CAA-----GGTTTAGACCTTTGATATTT---AA-TG----T---GTAGC-ATTGAATG----ATGGTCT-GC--A-AAAAGAT-T------TGT-GG-AA---G--AGGAGCT----TCC---AGAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTG------------T-CA-----T-----------------------TAGAGCGATTCAGA-CC-TCTCGGGCCTCTTGTT
gi|86065 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATTTTAGATATTT---TA-CT----T---GTAGC-ATTGCGCG----GTAGTCT-CC--T-AAAAGAT-G------TGT-TG-AT---G--TGGAACT----TAC---AACA--A--A--CA--TTT---CATTTTTTG--A-----TGTTT-CA-----T----TTACC-CAT
gi|86067 : AAGTTCAT-----GACCTAGACCTTATATATTTATATAACA----T---GTAGC-ATTGGATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--G---A--TTT---C---CT
gi|86069 : AAGTTCAA-----GGCCTAGAACATAGATAGTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GATGCCC-CC--T-ATAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86070 : AAGTACAA-----GTCCTAGACCTTATATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86071 : AAGTTTAA-----GGCATGTACCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGG-TG-AA---GCCAGGTCCC----TGG---AATT--A--A---A--TTTA--G---GGCTGTCA-----TA-CA-CA-----A----GGGGC-GATTTGTTTCAAGTAGAGTGATTCGGCCCC-TCTTGGGTATCTTGTT
gi|86073 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----GAAGCCC-CC--A-AAAAGAT-T------TCTCTG-AA---------AGTT----TAT---GACC--T--A--CG--------C---CACAGATA-----TT-TTACA-----TG---CAG---CATCTGTTGTAAAAAGAGTGATTCAAGTCC-TCTTGGGACTCTTGTT
gi|86074 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---CA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGCTC-CC--T-AAAAGAT-T------TTTCTG-AA---
gi|86075 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---CA-CA----T---GAAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-CC--T-AAAAGAT-T------TCTCTG-AA---
gi|86076 : AAGTTCAA-----GGCCTGTACCTTAGACATTT---TT-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----ATGGTCT-CC--T-TAAAGAC-T------TTT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--T--A---A--TTT---T---CTGTTAAG-----TC-TT--------------------ATT--TTGTAAGTTGAGCCATT
gi|86077 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GCGGCCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86079 : AAGTTCAA-----GGCCTAAACCTTAGATATTT---AA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCT-CT--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--A
gi|86080 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86082 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGAAATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCT-CC--T-AAAGGGT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86084 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCATAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGGTCT-TC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86087 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGAATG----GGGGTCC-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86088 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CATACGT---GTAGC-ATTGAATG----GGGGTCT-CC--T-AAATGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86091 : AAGTTCAA-----GGCTTAGACTTAAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----G-GGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---
gi|86092 : AAGTTCAA-----AGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-ACAAGAT-C------TGT-TG-AT---G--TCGAGC-----CAC---TGAA--ATCA--AA--TTTGAAA---TTGTAAAA-----TG-TT-TA-----T----CT
gi|86093 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATGTTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TC--T-AAAATAT-T------TGT-CG-AA---G--
gi|86095 : AAGTTCAA-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGT-C-CC--T-AAAAGAG-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86096 : AAGTTCAA-----GGCCCAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAATTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86098 : AAGTTAAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86100 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---TTAGC-AATGCATG----GAGGTCC-TC--T-AAAAGAG-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86101 : AAGTTCAA-----GGCCAAGACCTTAGATATAT---TA-CA----T---GTAG--ATTGCATG----GCGGTCT-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86103 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTATT-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TCA-TG-AA---G--
gi|86104 : AAGTTCAA-----GGCTTAGACCTTAGATATTT---GA-CA----T---GTAGC-ATTGCACC----AGGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86107 : AAGTTCAA-----GCCATAGACCTTAGACAATT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---A--CGGA
gi|86108 : AAGCTTAA-----TGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--C-AAAAGAT-A------TGA-TG-AA---G--
gi|86109 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCATAGATGTTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--T-CCAAGAT-T------TAA-TG-AA---G--
gi|86111 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTTGACATTT---TA-CA----T---GTAGC-ACTGCATG----GAGGTCC-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86112 : AAGTTCAA-----GGCCTACACCTTAGATATTC---TA-CA----T---GTAGC-AGTGCATG----AAGGTCC-CT--T-AAAAGAT-T------TGT------------AGGAAGT----T
gi|86113 : AAGTTCAA-----GGCCTATACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGTATG----AAGGTCT-CC--TAAAAAGAT-T------TGT-T
gi|86116 : AATTTCAA-----GGCT---ACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGATCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86117 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---GA-TA----T---GTAGC-ATTGCATG----GACGTTC-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86120 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGAAATTT---CA-CA----T---GTAGC-ATGGTATG----GAGGCCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-AG---G--
gi|86123 : AAGATCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---ACAGC-ATTGCATG----GATGTCC-CC--T-AACAGAT-T------TGT-TT-AA---G--
gi|86125 : AAGTTCAA-----GGTCTAGACCATAAATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----AAGGTCC-CC--T-AAAAGCT-T------TGT-TG-A
gi|86126 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAAATATTT---TA-CC----T---GTAGC-ATTCCATT----GAGATCC-CC--A-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86182 : AGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTG---TA-CA----T---GTAGC-GTT--ATT----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86183 : AATTCAA-----GGCATAGACCTTAGATATCT---TA-TG----T---GCAGC-ATTACATG----GTGGTCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-A
gi|86190 : GTTTAA-----GGCATAGACCTTTGATATTT---TA-CG----T---ATATA-TTTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-G------TGT-TG-AA---G--AGGAATT----TAC---AAAA--A--AAACA--GTT---C---TTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATGTACTGCCAGTAGAACGATTCAGGTCC-TCTTAGGCCTCTTGTT
gi|86191 : GTTCAA-----GGCCTAGACCCTAGATATTT---TA-CG----T---GTATC-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-TAATAAT-T------TTT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---------A--A--TG--TTT---C---CTCTGAAA-----AA-----A-----------------ATGTGTTGCCAGTAGAGCGAGTCAGGCCC-TTTTAGGCCTCTT
gi|86192 : GTTCAT-----GGCCTAGACCGTATATACAT---AA-CA----T---GTAGT-ATTGAATG----GCGGTCTACT--T-AAAAAAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAATT----TAC---AAAA--A-----CA--TGT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----C----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCTATTCAG
gi|86194 : GTTTGA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-GG-AA---G--
gi|86212 : CAA-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTT-CC--T-AAAACGT-T------TGA-TG-AA---G--
gi|86217 : -----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCACG----GAGATCC-TC--T-AATAAAT-T------TGT-TG-AAGTCG--GGTCGCTGGGGTCT---AGA-------------------C---CTTAGATA-----T--TT-TA-----C----ATGTAGCATTTGTTGCAAGTAGAGTGATTCAGGTCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86218 : -----GGCATAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----GTG----------------AT-T------TGT-TG-AA---G--AGTAACT----TATAA-AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TA-TT-C---------------------------------GGCGATTCAGGCCC-TC
gi|86227 : CTTAGATATTT---AA-CA----T---GTAGC-ATTTTGTG----GTGGTCC-AC--T-AAAAGGT-T------TGT-GG-AA---G--
gi|86227 : AA-----TA-AT-CC-----T----CTAGC-GATTTGTTTCAAGTAGAGCGAATCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTTcttaatcatcaagataaaatttggcactgccatataccaggggcttataaccactatttaaggagaataataatcctctagcgatttgtttcaagtagagcgaatcaggccctcttgggcctcttgtt
gi|86239 : cttagatatttaacatgtagcattttgtggtggtccactaaaaggtttgtggaagcttaatcatcaagataaaatttggcactgccatataccaggggcttataaccactatttaaggagaatA-CA----T---ATAGT-ATTGAATG----GTGGTCT-CT--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TGC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTTTGGAG-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGTGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTATT
gi|86242 : TAGC-ATTGTATA----CTGGTCT-CC--T-AAACGATCT------TGT-CA-AA---G--AAGAACT----TAC---AAAA--A--T--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-
gi|86243 : AGT-ACTGCATG----GTGATCT-CC--T-AAACGAT-T------TGG-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---GAAA--A--A--TA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-TATTTGCTGAGATTAGAGCGATTCAGCCCC-TCTT-GGCCTCTTGTT
gi|86245 : C-ATTGCATG----GAGGTTG-CT--T-TAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAGAATT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGAGATTCAGGCCC-TCTAAGGCCTATTGTT
gi|86246 : TGTATG----GTTGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--TAAAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TG-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAACAATTCAGGCTC-TCTTCAGCCCCTTGTT
gi|86256 : GT-TT-AA---G---GGAACT----TAC---AAAA--AC-A--CG--TTT---C---CTCTGAAAAGTAATG-TT-CA-----C----CTGTT-CATTTGTTGCAAGTAGAGCAATTCAGGTCC-TCTTG
gi|86257 : GT-TA-AA---G--GGGAACT----TA-----AAA--A--A--TAGTTTT---T---ATCTGAAA-----TG-TT-CA-----T------------TTTTTTGTTAGTAGAGTGATTAAGACCC-TCTTGGGCCTCTTATT
gi|86258 : T-TGCAG---G--AAGAAGT----TAC---AAAA--A--AA-CG--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----ATGTC-CATTTGTTG--AGT--AGCTATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTTTTGTT
gi|86266 : G-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA-----A--CA--TTT---C---TTCTGACA-----TG-TA-CA-----T----TGGTC-CATTTGTTACCAGTTGAGCAATCCAGGCCA-TCTGTGGCCTCTTGTT
gi|86268 : -AA---G--GGGAACT----TAA---AAAA--A--A--AA--TTA---C---TTCTGAAAATTAATG-TT-CA-----T----CTGTT-TACTTGTTGCGAGTAGAGTGATTCAGGTCC-TCTT
gi|86269 : A---A--AGGAACT----TAC---AAA---------CA--T-----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATGTGTTGCCAGAAAAGCGATTCAGACCC-TTTTGGGCCTCTTGTT
gi|86270 : A---G--AGGAA-------------AAA--A--A--------T---C---CTCTAAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTCAGACCC-TCT--GGCCCCTTGTT
gi|86275 : T----TAC---AAAA--A--A--AA--T-----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTTAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86276 : T----TAC---AATA--A--C--CA--TT----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-TATTTGTTGCCAGCAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86277 : T----TTC---AATA--A--C--CA--TTT---C----TCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-TATTTGTTGCCAGAAGAGCTATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86279 : ----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTTAAA-----TG-TT-CA-----T----CTTTC-CATTTGTTGCCAGTATAGCGATTTGGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86285 : A--A--A--CA--TTT---C----TCTGAAA-----TA-TT-CA-----T----TTGTT-CATTTGTTGCCAGAAGAGCGACTCAGGCCT-TCTTTAGTTTCTT
gi|86286 : --A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----TAGATCTGTC-TATTTGTTGCCAGTAGACCGATTCAGGCCC-T
gi|86287 : --A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CAGTTGTTGCAAGTAGAGCGATCCAGGCCC-TCTTTGACCTCTTG
Alignments
lowQualScore : 11111 000 0 1111 000 0 1111 1 0 00 0 0 111111 1 0 000 00 2222 222 22 11 11 11 222 111 33333 0 1 22222 2222 0 1 0
lowQualScore : ..... ... . .... ... . .... . . .. . . ...... . . ... .. .... ... .. .. .. .. ... ... ..... . . ..... .... . . .
lowQualScore : 22222 999 5 0000 999 5 0000 9 5 66 5 5 333333 3 4 888 66 6666 777 33 99 99 11 222 444 99999 8 6 00000 6666 8 0 9
consensus : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GNGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
Reference ( family-115 ) : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GNGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86019 : AAGTTCAA-----GGCCTAGAATTTAGATATTT---TA-CT----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTTG-CC--T-AAAACAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--T--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86020 : AAGTTCAA-----GACCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86022 : AAGTTCAT-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGT-ATTGCATG----GTGGTCT-TC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGAAGAACAATTTTGGCCC-TCTTGGGACTCTTGTT
gi|86026 : AAGTTGAA-----TACCTAGACCTTAGATATTT---TA-CC----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGATCT-CC--T-AAAAGAT-G------TAT-TG-AA---G--AGGAACT----TAT---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCATTTCAAGCCC-TCTTGGGCTTCTTGTT
gi|86027 : AATTTCAA-----GACCTAGACCTTAGATATTT---TA-TA----T---GTTGC-ATTGCGTG----G-GGTCT-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86028 : AAGTTCAA-----GGCCTAGGCCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTTGAGG----GGGATCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86030 : AAGTTCAG-----GACCTAGAACTTAGATATTT---TA-TG----T---GAAGT-ATTGAATG----ATGCTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--C--CA--TTC---T---CTCTGAAA-----TG-TTCCA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGCCC-TGTTGGGCCTCTTGT
gi|86031 : AAGTTCAA-----CGTCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAAC-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAAAGA--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-TATTTGTTGCCAGTAGACCGATTCAGGACC-T
gi|86032 : AAGTTTAT-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CG----T---GTAGT-ATTTTATG----GTGCTCT-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CACTGAAA-----TG-CT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGTGTAATTCAGGCCT-TTTTGGGCCTCTTATT
gi|86033 : AAGTTCAA-----GACTTAGTCCTTAGATATTT---T------------GTAGC-ATTGCATG----AAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T-------GT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--AA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTATT-CATTTGTTGCCAGTTAAGTGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86034 : AAGTTCAATCCTAGACCTAGACATCAGATATTT---TA-CA----T----TAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86037 : AAATTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTG-TCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAACT----TAC---AAAA--A--T--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-TA-----T----TGGTC-CTTTTGTTGCCAGTAGAGCAATT------C-TCTTGGGCCT
gi|86038 : AAGTT-AA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGT-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGGT----------T-TG-GG---G--AGGAATT----TGCAAAAAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCCGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTTTC-CATTTGTTGCCAGTAGAAGGACTCAGGCCA-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86039 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----G---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-TC--T-AAAAGGT-G------TGT-TG-AA---G--
gi|86040 : AAGTTTAA-----GGCCAAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TT--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-AG---G--
gi|86041 : AAGTTCAA-----GGCCTTGGCCTTAGATATTT---TA------------TAGC-ATTGCGTG----GTTGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAACT----TAT---AAAA--C--A--CA--TTT---C---CCCTG-AA-----TC-TT-CA-----T----ATGTC-CATTTGTTGCAGGTAGAGGGATTCAGGCCT-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86042 : AAGCTCAA-----GGC-------TTAGATATTC---TA-CG----T---GTAGC-ATTGTATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---A--CAAAACT----TAC---AAAA--A--A---A------------CTCTGAAA-----TG-TA-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGGCC-TCTTGGACCCCTTGTT
gi|86044 : AAGGTTAA-----GGCTTAGACCTTAGATCTTT---TA-CA----T---GTATC-ATTTCATG----GAGGTAC-CC--T-AAAAGA--T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TA----GAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CATCTATT----CTATC-CTTTTGTTGCCAGTAGAGTGGTTCACACCC-TCTTGGGCTTCTTGCT
gi|86045 : AAGTTCAT-----GGCCTATATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCT-CC--T-AAAAGA
gi|86046 : AGGTTCAA-----GGCCTAAACCTTAGATATTT---TA-CA----T---ATAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86047 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTGGATATTT---TA-CA----T---GTTGC-ATTGCATGCATAGAGGTCC-CC--C-AAAAGAT-T------CGT-TG-AA---G--
gi|86048 : AAGTTAAA-----GGCCTAGACCTTAAATATTT---TG-CA----T---GTAGC-ATTGCAAA----GAGGTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86050 : AAATTCAA-----GTTCTAGATCTAAACTATTT---AA-CA----TCATGTAGC-ATTACATG----GATGTCG-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAAAAAAA---TAC---AAAAAAA--A--CA--TTT---C---CTCGGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGAAGAGCGAATCAGGCCC-TCCTTGGCCTCGTG
gi|86052 : AGGTTTAA-----GTTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGTATG----GAGG-CC-CC--T-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86053 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACATTAGATATT--------------------------GTATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-TAGTAATTGT-TG-AA---G--AAGTACT----TGC---AAAA--C--A--TA--TTT---C---CTCTGCAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-CATTTGTTGGACGTAGAGTGATTTGGGCCC-TCATGGGCCTCTTGTT
gi|86055 : AAGTTGAT-----GGCCTAGATCATAGATATTT---TA-CA----T---GTTAT-ATTGACTG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGTG-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---CATT--A--A--AA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGCC-CATTT-TTGCAGGTAGAGCTATCAATGCCCTTTTTGGGCATCTTGTT
gi|86056 : AAATTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATGT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATT----GGGGTCC-CC--T-AAAAGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86059 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTAAGATATTA---TA-TG----T---GTACC-ATTGCATG----GTGGTCT-C-------------------------G-AG---G--AGGAACT----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CTGTGAAA-----TG-TA-AA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTTAAGCGATTCAGGCC
gi|86060 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATACTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGATCT-CC--C-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAGAACT----TAC---AAAG--A--A--CA--GTT---C---CTCTGAAC-----TG-TT-CA-----
gi|86061 : AAGTTTAA-----GGCCTATTCCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTATC-ATTGCATG----GTAGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---T--CGGAACT----T-----AAAA--A--A--CA--TCT---C----------------TG-CC-CA-----T------------TTTGTTACAAGTAGACCCATTCAAACCC-TCTTGGGCCTCTTG
gi|86062 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCATAGATATTT---TA-CA----T---GTAGCTATT-CATG----CTGATCC-CG--A-AAAAAGT-T------TGC-GG-AA---G--AAGAA--------------------------------------CTCTGAAA-----TG-TT-TG-----T----TTGTC-CATTTGTTGCCAATAGAGCGATTCATGCTC-TCTACGACCTCTTGTT
gi|86063 : AGGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGTTATTT---TA-CA----T---AAAGC-ATTGCATG----GAGGTCA-CC--T-AAAGGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86063 : C-ATTGCATG----GTGGCCT-CCTTT-AAAGTAT-T------TAT-tcagattcatggggtcaaatgtggggtcgccattgcatggtggcctcctttaaagtatttatatgtccatttgttgcaagtagagcgattcaggccctctttggccacttgtt
gi|86063 : aggttcaaggcctagaccttagttattttacataaagcattgcatggaggtcacctaaaggttttgttgaagtcagattcatggggtcaaatgtggggtcgcT---C---CTTTAAAG-----TA-TT-TA-----T----ATGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTTGGCCACTTGTTatgtccatttgttgcaagtagagcgattcaggccctctttggccacttgtt
gi|86064 : aggttcaaggcctagaccttagttattttacataaagcattgcatggaggtcacctaaaggttttgttgaagtcagattcatggggtcaaatgtggggtcgccattgcatggtggccAAGT-CAA-----GGTTTAGACCTTTGATATTT---AA-TG----T---GTAGC-ATTGAATG----ATGGTCT-GC--A-AAAAGAT-T------TGT-GG-AA---G--AGGAGCT----TCC---AGAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTG------------T-CA-----T-----------------------TAGAGCGATTCAGA-CC-TCTCGGGCCTCTTGTT
gi|86065 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATTTTAGATATTT---TA-CT----T---GTAGC-ATTGCGCG----GTAGTCT-CC--T-AAAAGAT-G------TGT-TG-AT---G--TGGAACT----TAC---AACA--A--A--CA--TTT---CATTTTTTG--A-----TGTTT-CA-----T----TTACC-CAT
gi|86067 : AAGTTCAT-----GACCTAGACCTTATATATTTATATAACA----T---GTAGC-ATTGGATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--G---A--TTT---C---CT
gi|86069 : AAGTTCAA-----GGCCTAGAACATAGATAGTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GATGCCC-CC--T-ATAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86070 : AAGTACAA-----GTCCTAGACCTTATATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86071 : AAGTTTAA-----GGCATGTACCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGG-TG-AA---GCCAGGTCCC----TGG---AATT--A--A---A--TTTA--G---GGCTGTCA-----TA-CA-CA-----A----GGGGC-GATTTGTTTCAAGTAGAGTGATTCGGCCCC-TCTTGGGTATCTTGTT
gi|86073 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----GAAGCCC-CC--A-AAAAGAT-T------TCTCTG-AA---------AGTT----TAT---GACC--T--A--CG--------C---CACAGATA-----TT-TTACA-----TG---CAG---CATCTGTTGTAAAAAGAGTGATTCAAGTCC-TCTTGGGACTCTTGTT
gi|86074 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---CA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGCTC-CC--T-AAAAGAT-T------TTTCTG-AA---
gi|86075 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---CA-CA----T---GAAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-CC--T-AAAAGAT-T------TCTCTG-AA---
gi|86076 : AAGTTCAA-----GGCCTGTACCTTAGACATTT---TT-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----ATGGTCT-CC--T-TAAAGAC-T------TTT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--T--A---A--TTT---T---CTGTTAAG-----TC-TT--------------------ATT--TTGTAAGTTGAGCCATT
gi|86077 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GCGGCCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86079 : AAGTTCAA-----GGCCTAAACCTTAGATATTT---AA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCT-CT--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--A
gi|86080 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86082 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGAAATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCT-CC--T-AAAGGGT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86084 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCATAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGGTCT-TC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86087 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGAATG----GGGGTCC-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86088 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CATACGT---GTAGC-ATTGAATG----GGGGTCT-CC--T-AAATGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86091 : AAGTTCAA-----GGCTTAGACTTAAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----G-GGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---
gi|86092 : AAGTTCAA-----AGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-ACAAGAT-C------TGT-TG-AT---G--TCGAGC-----CAC---TGAA--ATCA--AA--TTTGAAA---TTGTAAAA-----TG-TT-TA-----T----CT
gi|86093 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATGTTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TC--T-AAAATAT-T------TGT-CG-AA---G--
gi|86095 : AAGTTCAA-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGT-C-CC--T-AAAAGAG-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86096 : AAGTTCAA-----GGCCCAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAATTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86098 : AAGTTAAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86100 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---TTAGC-AATGCATG----GAGGTCC-TC--T-AAAAGAG-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86101 : AAGTTCAA-----GGCCAAGACCTTAGATATAT---TA-CA----T---GTAG--ATTGCATG----GCGGTCT-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86103 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTATT-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TCA-TG-AA---G--
gi|86104 : AAGTTCAA-----GGCTTAGACCTTAGATATTT---GA-CA----T---GTAGC-ATTGCACC----AGGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86107 : AAGTTCAA-----GCCATAGACCTTAGACAATT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---A--CGGA
gi|86108 : AAGCTTAA-----TGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--C-AAAAGAT-A------TGA-TG-AA---G--
gi|86109 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCATAGATGTTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--T-CCAAGAT-T------TAA-TG-AA---G--
gi|86111 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTTGACATTT---TA-CA----T---GTAGC-ACTGCATG----GAGGTCC-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86112 : AAGTTCAA-----GGCCTACACCTTAGATATTC---TA-CA----T---GTAGC-AGTGCATG----AAGGTCC-CT--T-AAAAGAT-T------TGT------------AGGAAGT----T
gi|86113 : AAGTTCAA-----GGCCTATACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGTATG----AAGGTCT-CC--TAAAAAGAT-T------TGT-T
gi|86116 : AATTTCAA-----GGCT---ACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGATCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86117 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---GA-TA----T---GTAGC-ATTGCATG----GACGTTC-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86120 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGAAATTT---CA-CA----T---GTAGC-ATGGTATG----GAGGCCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-AG---G--
gi|86123 : AAGATCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---ACAGC-ATTGCATG----GATGTCC-CC--T-AACAGAT-T------TGT-TT-AA---G--
gi|86125 : AAGTTCAA-----GGTCTAGACCATAAATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----AAGGTCC-CC--T-AAAAGCT-T------TGT-TG-A
gi|86126 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAAATATTT---TA-CC----T---GTAGC-ATTCCATT----GAGATCC-CC--A-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86182 : AGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTG---TA-CA----T---GTAGC-GTT--ATT----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86183 : AATTCAA-----GGCATAGACCTTAGATATCT---TA-TG----T---GCAGC-ATTACATG----GTGGTCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-A
gi|86190 : GTTTAA-----GGCATAGACCTTTGATATTT---TA-CG----T---ATATA-TTTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-G------TGT-TG-AA---G--AGGAATT----TAC---AAAA--A--AAACA--GTT---C---TTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATGTACTGCCAGTAGAACGATTCAGGTCC-TCTTAGGCCTCTTGTT
gi|86191 : GTTCAA-----GGCCTAGACCCTAGATATTT---TA-CG----T---GTATC-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-TAATAAT-T------TTT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---------A--A--TG--TTT---C---CTCTGAAA-----AA-----A-----------------ATGTGTTGCCAGTAGAGCGAGTCAGGCCC-TTTTAGGCCTCTT
gi|86192 : GTTCAT-----GGCCTAGACCGTATATACAT---AA-CA----T---GTAGT-ATTGAATG----GCGGTCTACT--T-AAAAAAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAATT----TAC---AAAA--A-----CA--TGT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----C----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCTATTCAG
gi|86194 : GTTTGA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-GG-AA---G--
gi|86212 : CAA-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTT-CC--T-AAAACGT-T------TGA-TG-AA---G--
gi|86217 : -----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCACG----GAGATCC-TC--T-AATAAAT-T------TGT-TG-AAGTCG--GGTCGCTGGGGTCT---AGA-------------------C---CTTAGATA-----T--TT-TA-----C----ATGTAGCATTTGTTGCAAGTAGAGTGATTCAGGTCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86218 : -----GGCATAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----GTG----------------AT-T------TGT-TG-AA---G--AGTAACT----TATAA-AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TA-TT-C---------------------------------GGCGATTCAGGCCC-TC
gi|86227 : CTTAGATATTT---AA-CA----T---GTAGC-ATTTTGTG----GTGGTCC-AC--T-AAAAGGT-T------TGT-GG-AA---G--
gi|86227 : AA-----TA-AT-CC-----T----CTAGC-GATTTGTTTCAAGTAGAGCGAATCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTTcttaatcatcaagataaaatttggcactgccatataccaggggcttataaccactatttaaggagaataataatcctctagcgatttgtttcaagtagagcgaatcaggccctcttgggcctcttgtt
gi|86239 : cttagatatttaacatgtagcattttgtggtggtccactaaaaggtttgtggaagcttaatcatcaagataaaatttggcactgccatataccaggggcttataaccactatttaaggagaatA-CA----T---ATAGT-ATTGAATG----GTGGTCT-CT--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TGC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTTTGGAG-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGTGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTATT
gi|86242 : TAGC-ATTGTATA----CTGGTCT-CC--T-AAACGATCT------TGT-CA-AA---G--AAGAACT----TAC---AAAA--A--T--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-
gi|86243 : AGT-ACTGCATG----GTGATCT-CC--T-AAACGAT-T------TGG-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---GAAA--A--A--TA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-TATTTGCTGAGATTAGAGCGATTCAGCCCC-TCTT-GGCCTCTTGTT
gi|86245 : C-ATTGCATG----GAGGTTG-CT--T-TAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAGAATT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGAGATTCAGGCCC-TCTAAGGCCTATTGTT
gi|86246 : TGTATG----GTTGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--TAAAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TG-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAACAATTCAGGCTC-TCTTCAGCCCCTTGTT
gi|86256 : GT-TT-AA---G---GGAACT----TAC---AAAA--AC-A--CG--TTT---C---CTCTGAAAAGTAATG-TT-CA-----C----CTGTT-CATTTGTTGCAAGTAGAGCAATTCAGGTCC-TCTTG
gi|86257 : GT-TA-AA---G--GGGAACT----TA-----AAA--A--A--TAGTTTT---T---ATCTGAAA-----TG-TT-CA-----T------------TTTTTTGTTAGTAGAGTGATTAAGACCC-TCTTGGGCCTCTTATT
gi|86258 : T-TGCAG---G--AAGAAGT----TAC---AAAA--A--AA-CG--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----ATGTC-CATTTGTTG--AGT--AGCTATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTTTTGTT
gi|86266 : G-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA-----A--CA--TTT---C---TTCTGACA-----TG-TA-CA-----T----TGGTC-CATTTGTTACCAGTTGAGCAATCCAGGCCA-TCTGTGGCCTCTTGTT
gi|86268 : -AA---G--GGGAACT----TAA---AAAA--A--A--AA--TTA---C---TTCTGAAAATTAATG-TT-CA-----T----CTGTT-TACTTGTTGCGAGTAGAGTGATTCAGGTCC-TCTT
gi|86269 : A---A--AGGAACT----TAC---AAA---------CA--T-----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATGTGTTGCCAGAAAAGCGATTCAGACCC-TTTTGGGCCTCTTGTT
gi|86270 : A---G--AGGAA-------------AAA--A--A--------T---C---CTCTAAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTCAGACCC-TCT--GGCCCCTTGTT
gi|86275 : T----TAC---AAAA--A--A--AA--T-----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTTAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86276 : T----TAC---AATA--A--C--CA--TT----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-TATTTGTTGCCAGCAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86277 : T----TTC---AATA--A--C--CA--TTT---C----TCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-TATTTGTTGCCAGAAGAGCTATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86279 : ----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTTAAA-----TG-TT-CA-----T----CTTTC-CATTTGTTGCCAGTATAGCGATTTGGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86285 : A--A--A--CA--TTT---C----TCTGAAA-----TA-TT-CA-----T----TTGTT-CATTTGTTGCCAGAAGAGCGACTCAGGCCT-TCTTTAGTTTCTT
gi|86286 : --A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----TAGATCTGTC-TATTTGTTGCCAGTAGACCGATTCAGGCCC-T
gi|86287 : --A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CAGTTGTTGCAAGTAGAGCGATCCAGGCCC-TCTTTGACCTCTTG
blockSeqs : TCCTA TACG A AGTAAT C GGGG AAA AG TC AA GT GAA ATT AGTAA C TCTAT AGAT
blockSeqs : . . T . C A AA AA C A . A . ATTAA A . G
blockSeqs : . . T . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . . T . .
blockSeqs : . T . .
blockSeqs : . T . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : A . .
blockSeqs : T . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GNGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
finalCons : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GNGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
Alignments
lowQualScore : 11111 000 0 1111 000 0 1111 1 0 00 0 0 111111 1 0 000 00 2222 222 22 11 11 11 222 111 33333 0 1 22222 2222 0 1 0
lowQualScore : ..... ... . .... ... . .... . . .. . . ...... . . ... .. .... ... .. .. .. .. ... ... ..... . . ..... .... . . .
lowQualScore : 22222 999 5 0000 999 5 0000 9 5 66 5 5 333333 3 4 888 66 6666 777 33 99 99 11 222 444 99999 8 6 00000 6666 8 0 9
consensus : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GNGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
Reference ( family-115 ) : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GNGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86019 : AAGTTCAA-----GGCCTAGAATTTAGATATTT---TA-CT----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTTG-CC--T-AAAACAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--T--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86020 : AAGTTCAA-----GACCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86022 : AAGTTCAT-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGT-ATTGCATG----GTGGTCT-TC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGAAGAACAATTTTGGCCC-TCTTGGGACTCTTGTT
gi|86026 : AAGTTGAA-----TACCTAGACCTTAGATATTT---TA-CC----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGATCT-CC--T-AAAAGAT-G------TAT-TG-AA---G--AGGAACT----TAT---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCATTTCAAGCCC-TCTTGGGCTTCTTGTT
gi|86027 : AATTTCAA-----GACCTAGACCTTAGATATTT---TA-TA----T---GTTGC-ATTGCGTG----G-GGTCT-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86028 : AAGTTCAA-----GGCCTAGGCCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTTGAGG----GGGATCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86030 : AAGTTCAG-----GACCTAGAACTTAGATATTT---TA-TG----T---GAAGT-ATTGAATG----ATGCTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--C--CA--TTC---T---CTCTGAAA-----TG-TTCCA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGCCC-TGTTGGGCCTCTTGT
gi|86031 : AAGTTCAA-----CGTCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAAC-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAAAGA--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-TATTTGTTGCCAGTAGACCGATTCAGGACC-T
gi|86032 : AAGTTTAT-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CG----T---GTAGT-ATTTTATG----GTGCTCT-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CACTGAAA-----TG-CT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGTGTAATTCAGGCCT-TTTTGGGCCTCTTATT
gi|86033 : AAGTTCAA-----GACTTAGTCCTTAGATATTT---T------------GTAGC-ATTGCATG----AAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T-------GT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--A--AA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTATT-CATTTGTTGCCAGTTAAGTGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86034 : AAGTTCAATCCTAGACCTAGACATCAGATATTT---TA-CA----T----TAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86037 : AAATTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTG-TCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAACT----TAC---AAAA--A--T--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-TA-----T----TGGTC-CTTTTGTTGCCAGTAGAGCAATT------C-TCTTGGGCCT
gi|86038 : AAGTT-AA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGT-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGGT----------T-TG-GG---G--AGGAATT----TGCAAAAAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCCGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTTTC-CATTTGTTGCCAGTAGAAGGACTCAGGCCA-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86039 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----G---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-TC--T-AAAAGGT-G------TGT-TG-AA---G--
gi|86040 : AAGTTTAA-----GGCCAAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TT--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-AG---G--
gi|86041 : AAGTTCAA-----GGCCTTGGCCTTAGATATTT---TA------------TAGC-ATTGCGTG----GTTGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAACT----TAT---AAAA--C--A--CA--TTT---C---CCCTG-AA-----TC-TT-CA-----T----ATGTC-CATTTGTTGCAGGTAGAGGGATTCAGGCCT-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86042 : AAGCTCAA-----GGC-------TTAGATATTC---TA-CG----T---GTAGC-ATTGTATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---A--CAAAACT----TAC---AAAA--A--A---A------------CTCTGAAA-----TG-TA-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCAATTCAGGGCC-TCTTGGACCCCTTGTT
gi|86044 : AAGGTTAA-----GGCTTAGACCTTAGATCTTT---TA-CA----T---GTATC-ATTTCATG----GAGGTAC-CC--T-AAAAGA--T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TA----GAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CATCTATT----CTATC-CTTTTGTTGCCAGTAGAGTGGTTCACACCC-TCTTGGGCTTCTTGCT
gi|86045 : AAGTTCAT-----GGCCTATATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCT-CC--T-AAAAGA
gi|86046 : AGGTTCAA-----GGCCTAAACCTTAGATATTT---TA-CA----T---ATAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86047 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTGGATATTT---TA-CA----T---GTTGC-ATTGCATGCATAGAGGTCC-CC--C-AAAAGAT-T------CGT-TG-AA---G--
gi|86048 : AAGTTAAA-----GGCCTAGACCTTAAATATTT---TG-CA----T---GTAGC-ATTGCAAA----GAGGTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86050 : AAATTCAA-----GTTCTAGATCTAAACTATTT---AA-CA----TCATGTAGC-ATTACATG----GATGTCG-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAAAAAAA---TAC---AAAAAAA--A--CA--TTT---C---CTCGGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGAAGAGCGAATCAGGCCC-TCCTTGGCCTCGTG
gi|86052 : AGGTTTAA-----GTTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGTATG----GAGG-CC-CC--T-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86053 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACATTAGATATT--------------------------GTATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-TAGTAATTGT-TG-AA---G--AAGTACT----TGC---AAAA--C--A--TA--TTT---C---CTCTGCAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-CATTTGTTGGACGTAGAGTGATTTGGGCCC-TCATGGGCCTCTTGTT
gi|86055 : AAGTTGAT-----GGCCTAGATCATAGATATTT---TA-CA----T---GTTAT-ATTGACTG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGTG-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---CATT--A--A--AA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGCC-CATTT-TTGCAGGTAGAGCTATCAATGCCCTTTTTGGGCATCTTGTT
gi|86056 : AAATTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATGT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATT----GGGGTCC-CC--T-AAAAGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86059 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTAAGATATTA---TA-TG----T---GTACC-ATTGCATG----GTGGTCT-C-------------------------G-AG---G--AGGAACT----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CTGTGAAA-----TG-TA-AA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTTAAGCGATTCAGGCC
gi|86060 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATACTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGATCT-CC--C-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAGAACT----TAC---AAAG--A--A--CA--GTT---C---CTCTGAAC-----TG-TT-CA-----
gi|86061 : AAGTTTAA-----GGCCTATTCCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTATC-ATTGCATG----GTAGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---T--CGGAACT----T-----AAAA--A--A--CA--TCT---C----------------TG-CC-CA-----T------------TTTGTTACAAGTAGACCCATTCAAACCC-TCTTGGGCCTCTTG
gi|86062 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCATAGATATTT---TA-CA----T---GTAGCTATT-CATG----CTGATCC-CG--A-AAAAAGT-T------TGC-GG-AA---G--AAGAA--------------------------------------CTCTGAAA-----TG-TT-TG-----T----TTGTC-CATTTGTTGCCAATAGAGCGATTCATGCTC-TCTACGACCTCTTGTT
gi|86063 : AGGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGTTATTT---TA-CA----T---AAAGC-ATTGCATG----GAGGTCA-CC--T-AAAGGTT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86063 : C-ATTGCATG----GTGGCCT-CCTTT-AAAGTAT-T------TAT-tcagattcatggggtcaaatgtggggtcgccattgcatggtggcctcctttaaagtatttatatgtccatttgttgcaagtagagcgattcaggccctctttggccacttgtt
gi|86063 : aggttcaaggcctagaccttagttattttacataaagcattgcatggaggtcacctaaaggttttgttgaagtcagattcatggggtcaaatgtggggtcgcT---C---CTTTAAAG-----TA-TT-TA-----T----ATGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTTGGCCACTTGTTatgtccatttgttgcaagtagagcgattcaggccctctttggccacttgtt
gi|86064 : aggttcaaggcctagaccttagttattttacataaagcattgcatggaggtcacctaaaggttttgttgaagtcagattcatggggtcaaatgtggggtcgccattgcatggtggccAAGT-CAA-----GGTTTAGACCTTTGATATTT---AA-TG----T---GTAGC-ATTGAATG----ATGGTCT-GC--A-AAAAGAT-T------TGT-GG-AA---G--AGGAGCT----TCC---AGAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTG------------T-CA-----T-----------------------TAGAGCGATTCAGA-CC-TCTCGGGCCTCTTGTT
gi|86065 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATTTTAGATATTT---TA-CT----T---GTAGC-ATTGCGCG----GTAGTCT-CC--T-AAAAGAT-G------TGT-TG-AT---G--TGGAACT----TAC---AACA--A--A--CA--TTT---CATTTTTTG--A-----TGTTT-CA-----T----TTACC-CAT
gi|86067 : AAGTTCAT-----GACCTAGACCTTATATATTTATATAACA----T---GTAGC-ATTGGATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--A--G---A--TTT---C---CT
gi|86069 : AAGTTCAA-----GGCCTAGAACATAGATAGTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GATGCCC-CC--T-ATAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86070 : AAGTACAA-----GTCCTAGACCTTATATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86071 : AAGTTTAA-----GGCATGTACCTTAGATATTT---TA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGG-TG-AA---GCCAGGTCCC----TGG---AATT--A--A---A--TTTA--G---GGCTGTCA-----TA-CA-CA-----A----GGGGC-GATTTGTTTCAAGTAGAGTGATTCGGCCCC-TCTTGGGTATCTTGTT
gi|86073 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----GAAGCCC-CC--A-AAAAGAT-T------TCTCTG-AA---------AGTT----TAT---GACC--T--A--CG--------C---CACAGATA-----TT-TTACA-----TG---CAG---CATCTGTTGTAAAAAGAGTGATTCAAGTCC-TCTTGGGACTCTTGTT
gi|86074 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---CA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGCTC-CC--T-AAAAGAT-T------TTTCTG-AA---
gi|86075 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---CA-CA----T---GAAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-CC--T-AAAAGAT-T------TCTCTG-AA---
gi|86076 : AAGTTCAA-----GGCCTGTACCTTAGACATTT---TT-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----ATGGTCT-CC--T-TAAAGAC-T------TTT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA--T--A---A--TTT---T---CTGTTAAG-----TC-TT--------------------ATT--TTGTAAGTTGAGCCATT
gi|86077 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GCGGCCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86079 : AAGTTCAA-----GGCCTAAACCTTAGATATTT---AA-TG----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCT-CT--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--A
gi|86080 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86082 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGAAATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCT-CC--T-AAAGGGT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86084 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCATAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGGTCT-TC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86087 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGAATG----GGGGTCC-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86088 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CATACGT---GTAGC-ATTGAATG----GGGGTCT-CC--T-AAATGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86091 : AAGTTCAA-----GGCTTAGACTTAAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----G-GGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---
gi|86092 : AAGTTCAA-----AGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-ACAAGAT-C------TGT-TG-AT---G--TCGAGC-----CAC---TGAA--ATCA--AA--TTTGAAA---TTGTAAAA-----TG-TT-TA-----T----CT
gi|86093 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATGTTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TC--T-AAAATAT-T------TGT-CG-AA---G--
gi|86095 : AAGTTCAA-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGT-C-CC--T-AAAAGAG-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86096 : AAGTTCAA-----GGCCCAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAATTCC-CC--T-AAAATAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86098 : AAGTTAAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86100 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---TTAGC-AATGCATG----GAGGTCC-TC--T-AAAAGAG-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86101 : AAGTTCAA-----GGCCAAGACCTTAGATATAT---TA-CA----T---GTAG--ATTGCATG----GCGGTCT-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86103 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTATT-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TCA-TG-AA---G--
gi|86104 : AAGTTCAA-----GGCTTAGACCTTAGATATTT---GA-CA----T---GTAGC-ATTGCACC----AGGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86107 : AAGTTCAA-----GCCATAGACCTTAGACAATT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---A--CGGA
gi|86108 : AAGCTTAA-----TGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--C-AAAAGAT-A------TGA-TG-AA---G--
gi|86109 : AAGTTTAA-----GGCCTAGACCATAGATGTTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GTGGTCC-CC--T-CCAAGAT-T------TAA-TG-AA---G--
gi|86111 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTTGACATTT---TA-CA----T---GTAGC-ACTGCATG----GAGGTCC-TG--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86112 : AAGTTCAA-----GGCCTACACCTTAGATATTC---TA-CA----T---GTAGC-AGTGCATG----AAGGTCC-CT--T-AAAAGAT-T------TGT------------AGGAAGT----T
gi|86113 : AAGTTCAA-----GGCCTATACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGTATG----AAGGTCT-CC--TAAAAAGAT-T------TGT-T
gi|86116 : AATTTCAA-----GGCT---ACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGATCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86117 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---GA-TA----T---GTAGC-ATTGCATG----GACGTTC-CG--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--
gi|86120 : AAGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGAAATTT---CA-CA----T---GTAGC-ATGGTATG----GAGGCCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-AG---G--
gi|86123 : AAGATCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---ACAGC-ATTGCATG----GATGTCC-CC--T-AACAGAT-T------TGT-TT-AA---G--
gi|86125 : AAGTTCAA-----GGTCTAGACCATAAATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----AAGGTCC-CC--T-AAAAGCT-T------TGT-TG-A
gi|86126 : AAGTTCAA-----GGCCTAGATCTTAAATATTT---TA-CC----T---GTAGC-ATTCCATT----GAGATCC-CC--A-AAAAGAT-T------TAT-TG-AA---G--
gi|86182 : AGTTCAA-----GGCCTAGACCTTAGATATTG---TA-CA----T---GTAGC-GTT--ATT----GAGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--
gi|86183 : AATTCAA-----GGCATAGACCTTAGATATCT---TA-TG----T---GCAGC-ATTACATG----GTGGTCC-CC--T-AAAAGGT-T------TGT-TG-A
gi|86190 : GTTTAA-----GGCATAGACCTTTGATATTT---TA-CG----T---ATATA-TTTGCATG----GTGGTCT-CC--T-AAAAGAT-G------TGT-TG-AA---G--AGGAATT----TAC---AAAA--A--AAACA--GTT---C---TTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATGTACTGCCAGTAGAACGATTCAGGTCC-TCTTAGGCCTCTTGTT
gi|86191 : GTTCAA-----GGCCTAGACCCTAGATATTT---TA-CG----T---GTATC-ATTGCATG----GTGGTCT-CC--T-TAATAAT-T------TTT-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---------A--A--TG--TTT---C---CTCTGAAA-----AA-----A-----------------ATGTGTTGCCAGTAGAGCGAGTCAGGCCC-TTTTAGGCCTCTT
gi|86192 : GTTCAT-----GGCCTAGACCGTATATACAT---AA-CA----T---GTAGT-ATTGAATG----GCGGTCTACT--T-AAAAAAT-T------TGT-TG-AA---G--AGAAATT----TAC---AAAA--A-----CA--TGT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----C----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGCTATTCAG
gi|86194 : GTTTGA-----GGCCTAGATCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GGGGTCC-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-GG-AA---G--
gi|86212 : CAA-----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATG----GAGGTTT-CC--T-AAAACGT-T------TGA-TG-AA---G--
gi|86217 : -----GGTCTAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCACG----GAGATCC-TC--T-AATAAAT-T------TGT-TG-AAGTCG--GGTCGCTGGGGTCT---AGA-------------------C---CTTAGATA-----T--TT-TA-----C----ATGTAGCATTTGTTGCAAGTAGAGTGATTCAGGTCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86218 : -----GGCATAGACCTTAGATATTT---TA-CA----T---GTAGC-ATTGCATA----GTG----------------AT-T------TGT-TG-AA---G--AGTAACT----TATAA-AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TA-TT-C---------------------------------GGCGATTCAGGCCC-TC
gi|86227 : CTTAGATATTT---AA-CA----T---GTAGC-ATTTTGTG----GTGGTCC-AC--T-AAAAGGT-T------TGT-GG-AA---G--
gi|86227 : AA-----TA-AT-CC-----T----CTAGC-GATTTGTTTCAAGTAGAGCGAATCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTTcttaatcatcaagataaaatttggcactgccatataccaggggcttataaccactatttaaggagaataataatcctctagcgatttgtttcaagtagagcgaatcaggccctcttgggcctcttgtt
gi|86239 : cttagatatttaacatgtagcattttgtggtggtccactaaaaggtttgtggaagcttaatcatcaagataaaatttggcactgccatataccaggggcttataaccactatttaaggagaatA-CA----T---ATAGT-ATTGAATG----GTGGTCT-CT--T-AAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AGGAACT----TGC---AAAA--A--A--CA--TTT---C---CTTTGGAG-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGTGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTATT
gi|86242 : TAGC-ATTGTATA----CTGGTCT-CC--T-AAACGATCT------TGT-CA-AA---G--AAGAACT----TAC---AAAA--A--T--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-
gi|86243 : AGT-ACTGCATG----GTGATCT-CC--T-AAACGAT-T------TGG-TG-AA---G--AGGAACT----TAC---GAAA--A--A--TA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-TATTTGCTGAGATTAGAGCGATTCAGCCCC-TCTT-GGCCTCTTGTT
gi|86245 : C-ATTGCATG----GAGGTTG-CT--T-TAAAGAT-T------TGT-TG-AA---G--AAGAATT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAGAGATTCAGGCCC-TCTAAGGCCTATTGTT
gi|86246 : TGTATG----GTTGTCT-CC--T-AAAAGAT-T------TGT-TA-AA---G--TAAAACT----TAC---AAAA--A--A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TG-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCCAGTAGAACAATTCAGGCTC-TCTTCAGCCCCTTGTT
gi|86256 : GT-TT-AA---G---GGAACT----TAC---AAAA--AC-A--CG--TTT---C---CTCTGAAAAGTAATG-TT-CA-----C----CTGTT-CATTTGTTGCAAGTAGAGCAATTCAGGTCC-TCTTG
gi|86257 : GT-TA-AA---G--GGGAACT----TA-----AAA--A--A--TAGTTTT---T---ATCTGAAA-----TG-TT-CA-----T------------TTTTTTGTTAGTAGAGTGATTAAGACCC-TCTTGGGCCTCTTATT
gi|86258 : T-TGCAG---G--AAGAAGT----TAC---AAAA--A--AA-CG--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----ATGTC-CATTTGTTG--AGT--AGCTATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTTTTGTT
gi|86266 : G-AA---G--AGGAACT----TAC---AAAA-----A--CA--TTT---C---TTCTGACA-----TG-TA-CA-----T----TGGTC-CATTTGTTACCAGTTGAGCAATCCAGGCCA-TCTGTGGCCTCTTGTT
gi|86268 : -AA---G--GGGAACT----TAA---AAAA--A--A--AA--TTA---C---TTCTGAAAATTAATG-TT-CA-----T----CTGTT-TACTTGTTGCGAGTAGAGTGATTCAGGTCC-TCTT
gi|86269 : A---A--AGGAACT----TAC---AAA---------CA--T-----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATGTGTTGCCAGAAAAGCGATTCAGACCC-TTTTGGGCCTCTTGTT
gi|86270 : A---G--AGGAA-------------AAA--A--A--------T---C---CTCTAAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTCAGACCC-TCT--GGCCCCTTGTT
gi|86275 : T----TAC---AAAA--A--A--AA--T-----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CATTTGTTGCAAGTAGAGCGATTTAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86276 : T----TAC---AATA--A--C--CA--TT----C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-TATTTGTTGCCAGCAGAGCGATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86277 : T----TTC---AATA--A--C--CA--TTT---C----TCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTT-TATTTGTTGCCAGAAGAGCTATTCAGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86279 : ----TAC---ATAA--A--A--CA--TTT---C---CTCTTAAA-----TG-TT-CA-----T----CTTTC-CATTTGTTGCCAGTATAGCGATTTGGGCCC-TCTTGGGCCTCTTGTT
gi|86285 : A--A--A--CA--TTT---C----TCTGAAA-----TA-TT-CA-----T----TTGTT-CATTTGTTGCCAGAAGAGCGACTCAGGCCT-TCTTTAGTTTCTT
gi|86286 : --A--CA--TTT---C---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----TAGATCTGTC-TATTTGTTGCCAGTAGACCGATTCAGGCCC-T
gi|86287 : --A--CA--TTT---T---CTCTGAAA-----TG-TT-CA-----T----CTGTC-CAGTTGTTGCAAGTAGAGCGATCCAGGCCC-TCTTTGACCTCTTG