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gi|149385 : CTATTAACCACC-A-ATCGA-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTATCAA----ACA--ATTCATAGCAATTGAGCGTTTACT-AAGA--TATGACG---TCA--TTCAAAT-ATC-C-------------C-----T-GACCAATCAGCG-TGCTCG-----------------TAA---CAA-TTA--CTA--TTG-A-----ACGGAT-C----A-A----A---TC--GGGAGA-------------------GCTGGGTTCGTTCTACAGACTA------ttatttggcgtgtaatgtagtaatacgtttgtataactgcaacgtgactgatgctgaagacactatttttcgtgttactgctaacttgtcatcaactcatcaaattgaggacaatcggcaaaagtgagttttttcagtcttattattacgacttaccttaccgttcttcttattata
gi|149442 : CTATTAACTGTT-A-AT--G-A-AA-A--AA-G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCA----ACA--ATTCATAGCAACTGAGCTCTTG-------------ACA---TCA--TTCAAAC-TTT-C-C--CTA-A-AG-C-A-ACT-GACCAATCAGCA-TGCTCG-----------------TAA---C-AATTG--CTA--GTT-A-----ACGGAC-C----C-A----A---TC--GGGAGA-------------------GCTGGGTTCGTTCTACAGACTagtttttt
gi|149380 : CTATGAACCTCC-A-AT--G-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCC----TCA--ATTCATAGCTATTCAACGCTTACC-AAAC--TGTGACG---TCA--TTC-AAC-------------------------T-GACCAATCAAAG-TGCTCA-AA---------T--CC------C-A-TTC--CTA--GTT-T-----ACAGAC-C----C-A----A---TC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCAGCTCCACAGACTA------G-T--T---ATTTGGCGTGTAATGTAGTA-ATAC-GTTTGTATAAC--TGCGAC
gi|149374 : CTATCAACCCCC-A-AT--G-A-AA-A--G--G-----CAGTGAATTC----CATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATA-CTATTCAACGCTTACC-AAAC--TGTGACG---TCA--TTC-AAC-------------------------T-GACCAATCAAAG-TGCTCA-AA---------T--CC------C-A-TTC--CTA--GTT-T-----ACGGAC-C----A-A----A---CC--AGGAGA-------------------GCTGGGTCCGTTTTACAGACTA------G-T--T---ATTTGGCGTGTAATGTAGTA-ATAC-GTTTGTATAAC--TGCGACgtgactgatgcttaagaccccatatttcctgatactgacagctggtcatcaactcatcaaattgaggacaatcggcaaaagtgaggcttattattacgacctaccttacagtactacttattata
gi|149375 : CTATGAACCCCC-A-AT--G-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCC----ACG--ATGCATAGCTATTCAACGCTTACC-AAAC--TGTGACG---TCA--TTC-AAC-------------------------T-GACCAATCGAAG-TTCTCA-AA--------TT--C-------C-A-TTC--CTA--GTT-T-----ACGGAC-C----C-A----A---TC--TGGAGA-------------------GCTTGGTCCACACTACAAACTA------G-gtgactgatgctgaagacgccatttttcctgatactgaaagctggtcatcaactcatcaaattgaggacaatcggcaaaagtgattttttttcagtcatattattacgacataccttaccgttcttcttataata
gi|149377 : CTATGAACCCCC-A-AT--G-A-AA-A--G--G-----GTGGGAATTC----TATTACTGCCCC----ACA--ATTCATAGCTATTTAACACTTACC-AAAC--TGTGACG---TCA--TTC-AAC-------------------------T-GACCAATCAAAG-TGCTCA-AA---------T--CC------C-A-TTC--CTA--GTT-T-----ACGGAC-C----C-A----A---TC--AGGAGA-------------------GCTTGGTCCGTTCTACAGACTA------G-ttatttggcgtgtaatgtagtaatacgtttgtataactgtgacgtgactgatgctgaagacgccatttttcctgatactgataggtggtcatcaactcatcacattgaggacaatcggcaaaagtgagtttttttcagtcttattattacggcataccttacagctcttcttattata
gi|149382 : CTATAAACCCCC-A-AT--G-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCTTGTCCC----ACA--ATTCATAGCTATTCAACGCTTACC-AAAC--TGTGACG---TCA--TT----------------------------------CCAATCAAAG-TGCTCA----------TAT--CC------C-A-TTC--CTA--GTT-T-----ACGGAC-C----C-A----A---TC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCGCTCTAGAGATTA------G-taattaggcgtctaatgtagtgatacgtttgtataactgcgacgtgactgatgctgaagacgccattttgcttgatactgatagctggtcatcaactcatcaaattgaggacaatcggcaaaagtgagtttttttcagtcttattcttacggcataccttaccgttcttcttattata
gi|149381 : CTATGAACCCCC-A-AT--G-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCTATTCAACGCTTACC-AAAC--TGTGACG---TCA--TTCAAA--------------------------T-GACCAATCAAAG-TGCTCA-AA---------T--CC------C-A-TTC--CTA--GTT-T-----ACGGAC-C----T----------TT----------------------------CTGGGTCCGCTCTACAGACTA------G-ttatttggcgtgtaatgtagaaatacgtcggtatatctgcgacatgactgatgctgaacacgcaatttttcctgatactgataggtggtcatcaactcattacattgaggacaaacggcaaaagtgagttttttttcagtctta
gi|149461 : CTATTAACC-CC-A-AT--G-A-AA-T--G--G-----CAGGGAATTC----CATGTCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCTATTGAACGCTTACT-A-----TGTGACG---TCA--TTCAACT-TTC-C-A---TG-A-AA-C-A-ACT-GACCAACCAGCG-TGCTCGTAA--------------CAA---T-A---G--CTA--TTT-T-----ACGGAC-C----C-A----G---TC--GGAAGA-------------------ACTttatttggcgtgtaatgtagtaatacgtttgtataattgctacgtggctgatactgaagacgccatttttcctgatactgatagctgttcatcaactcatcaaattgaggacaatcggtaaaagtgagttttttcagtcttattattactgcatacctacagttattgttatt
gi|149575 : TATTAACCGCC-A-AT--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----AAA--ATTCATAGCAATTGAGTGCTTACT-AAAC--TGTGACG---TCA--TCCAAAC-TTT-C-AG-CTG-A-AG-A-A-C-T-GACCAATCAATG-CGCTCA-AATGTGGT-TTC--CCCAA---C-A-TTG--CTA--TCT-A-----ACGGTC-C----C-A----A---TC--GGGAGA-------------------GCTGGGTACATTCTACAGAC-A------A-ATGTGAC-TATG
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gi|149645 : -A-AT--G-ACAA-A--A--G-----CTGGCATTTC----TATACCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAACTGAACACTTTCT-AAAC--TATGACG---TCA--TTCAAAC-TTT-C--C-CTG-A-AG-A-A-ACT-GACCAATCAACG-TGCTCA-AATG------TT--CTGAA--------------A--TTT-A-----ACGGAC-T----C-A----A---GC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCGTTCTATAGACTA------G-
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gi|149429 : CTATTAA-CCCCC--A-A-T--ACA-AA-A--G--G-----CAGGGAAGTA----TATGCCTGTCCC----ATA--ATTCATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAT--TGTGACGTTA--C-------AT-TTTCAG-T-TG-ATG-CAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AATGTGGT-TTT--CTCAA---C-A-TTGCTAT-----ATAACAGACG----T-ATTC--GAGAGA-------------------ACTGGGTCCG-----TAAACAGAC-TA--T-T-TA-C------ATT---GC----GT-ATt
gi|149430 : CTATTAA-CCACC--A-A-T--GGA-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAAGGCTTAC-TAAAT--TATGACGCCA--TT---CAAAC-TTTC-C-C-TG-AAG-CAACT--GACCAGTCAGCA-TGCCC-----GTAA---------CAA---C----TGCAGT-----TAAACGGACC----T-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTTCG----TTTAACAGAC-TA--G-
gi|149431 : CTATTTA-CCACC--A-A-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACG--TTTCATAGCAGCTGAAAGCTTAC-TTAAC--TATGCCGTAA---T---CAAAC-ATTCAG-T-T--AAA-CAACT--GACCAATCAACG-TGTTCA-AAAGTGGC-TTT---CCAG---C-A-TTGCTAT-----TT-ACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTTGGCCCG----TACTACAGAC-T
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gi|149682 : -CCCCC--A-A-T--G-A-AA-A--A--GG----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAGTTGAACGCTTAC-TAAAC--TGTGACATCA--TT---CAAAC-TTTCAG-T-TG-AAG-CAACT--GACCAATCAACG-TACTCA-AATGGGGC-TTC--CCCAA---C--------AT-----TTAACGGACC----C-ATTC--AGG-GA-------------------GCTGGGCCAG----TACTACAAAC-TA--ATA-TG-T-------TATGTGT----AT-ATAAT--CGTA--------A-ATG-CG--GTTG--TATCAAACA-TGCtgtta
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gi|149427 : CTATTAACCCC---AA-T--A-A-AT-A--A--------CAGGAAATTCAATTTATGCCTGTCCC----ACA--GTTCATAGCAGTTGAACGACTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---T-AAT-TTTCAG-T-TG-AAA-CAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AAAGTGGCGTTT--CAAAA---C-A-TTGCTAT-----TTAACGGACC----A-AATC--GGGAGA-------------------GCTGAGTCCG----CACTGCAGACT-A--G--TG----------T-T-T--G------C----CC-GTA-A-
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gi|149427 : CTATTAACCCC---AA-T--A-A-AT-A--A--------CAGGAAATTCAATTTATGCCTGTCCC----ACA--GTTCATAGCAGTTGAACGACTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---T-AAT-TTT-CAG-T-TG-AAA-CAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AAAGTGGCGTTT--CAAAA---C-A-TTGCTAT-----TTAACGGACC----A-AATC--GGGAGA-------------------GCTGAGTCCG----CACTGCAGA-----C---T-A--G--T----GT-T-T--G------CCC-GTA-A-
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gi|149649 : AACCCCC--AA-T--A-A-AA-A--AT-G-----CAGAAAATTC----TATACCGGTCCC----ATA--ATTAATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAG--AGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTTTC---T-TG-AAG-CAAAT--GACCAATCAGCG-TTCTCA-AATG-GGC-TTT--CCCAA---C-A-CTGCTTT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGACA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--T
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gi|149423 : CTGTTAATCCCC--AA-T--G-A-AA-A--AA-G-----CAGGGAATTC----AATGCTTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAAATGAACGCTTGC-TAAAC--TGTGACGTCACATT---CGAAC-TTT-CAG-T-TG-AAG-CAACT--GACCAATCATCG-TGCTCA-AATGTGGC-TTT--CCCAA---C-A-TTGCTAC-----TTAACGGACC----C-AGTC--GGGAAA-------------------GCTGTGTCTG----TTCTTCAGA-----C---T-A--
gi|149424 : CTATTAACCACC--AA-T--G-A-AA-A--AA-G-----GAGGGAATTC----AATGCCTTTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAATGCTTAT-TAAAT--TATGACGTCA--TT---CATAC-TTT-C-C-C-TG-AAG-CAACT--GACCAATCAGC-----------TGT------------AA---CAA-TTGCTGT-----TGAACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTTCG----TTCTACAGA-----C---T-A--A--T
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gi|149647 : AACCTCC--AA-T--GGA-AA-A--A--G-----CAGGGATTTC----TATGCCTGTCCC----GCA--TTTCATAGC-ATTGAACATTTAC-TTAAT--TATGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAA---TG-AAG-----T--GACCAGTCAGCT-TGCTCATAATA--------------------A-TTACTGT-----TTAACGGACC----C-AATC--GTGAGA-------------------GCTGGTTTCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--T
gi|149648 : AACCACT--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGTAAATGC----TATGCCTGTCAA----ACA--ATTCATAGCAATTGAACGCTTAT-TACAC--TTTGACGTCA--TT---CAATT-TTT-CAA-T-TG-CTG-TAACT--GACTAATCAACG-TGCTCA-AATGCGGC-TTT--CCCAA---A-A-TTG-----------AACGCACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCTG----TACTACAGA-----C---T-ATGG--TT--AAT-T-Tattgaaaatataatataaata
gi|149649 : AACCCCC--AA-T--A-A-AA-A--AT-G-----CAGAAAATTC----TATACCGGTCCC----ATA--ATTAATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAG--AGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTTTC---T-TG-AAG-CAAAT--GACCAATCAGCG-TTCTCA-AATG-GGC-TTT--CCCAA---C-A-CTGCTTT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGACA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--T
gi|149650 : AACCCTC--AA-T--G-A-AA-AA-A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTATTCA----ACA--ATTCATACCATTTAAATGCTTAC-TAAAC--TATGACGTCA--TT---CAAAC-TTT---GCC-TA-AAG-TAACT--GACCAATCAACG-TGC------TGTG--------------------TTGCTAT-----TTGAAGGAGC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCA----TTCTTCAGATTAAGC---T-A--G---T--CAT-T-T
gi|149668 : ACCCCC--GA-T--G-A-AA-A--A--G-----TAGGAAATTC----GATGCCTGTCCC----ACA--ATGCATAGCTATTGAACGCTTAT-CAAAC--TGTGACGTAA--TT---CAAAC-GTC-C-C-C-TA-AGG-CAACT--GACCAATCAATG-TGCTCA-AATGT-GC-T-----CTAATTTC-A-CTGC-A--------AACGGA-C----C-AGTT--GGAAGA-------------------GTTCGGTTCG----TTCTACAGA-----C---T-AT-G--TT--
gi|149682 : CCCCC--AA-T--G-A-AA-A--A--GG----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAGTTGAACGCTTAC-TAAAC--TGTGACATCA--TT---CAAAC-TTT-CAG-T-TG-AAG-CAACT--GACCAATCAACG-TACTCA-AATGGGGC-TTC--CCCAA---C--------AT-----TTAACGGACC----C-ATTC--AGG-GA-------------------GCTGGGCCAG----TACTACAAA-----C---T-A--A--TA--TGT-TATGTG------TAT-ATA-ATCGTA--------A-ATG-CG--GTTG--TATCAAACA-TGCa
gi|149683 : CCCCCTAAA-T--G-A-TA-G--A--A-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCA----ACA--ATCCATAGCAATTGAACGAATAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TC---CAAAC-TTT-CTG-A-AG-AAG-CAACT--GACAAATCAATG-TGCTTG-AATATGGC-TTT--CCCAA---C-A-TTCCTAT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGAAA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-AT-G--TT--TA
gi|149684 : CCCCC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGTCTGTCCC----ACA--ATTCATAGAAACTGAACGCT--------------GAAGTCA--T----CAAAC-GTT-CCG-T--G-GAG-TAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AATGTGAC-TTT--CGCAA---T-A-CTGCTAT-----TTAACGGACC----C-AATC--GAGAGA-------------------GCTTGGTCCA----TTCTACAGA-----C---T-A--atatctgcaaataatatggtggtatg
gi|149693 : CCCC--AA-T--G-A-AA-A-----G-----CAGGGAATTC----CATGCGTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACGCATAC-TCAAC--TATGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAG-T-TG-AAG-CATCT--AACCAATCAACG-TGCTCA-AATGTATC-TTT--CCCAT---C-A-CTGCTAA-----TTAAGGGACC----C-AATC--GGGATA-------------------GCTTGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-AC-G--TC--CATGT-TG-G-------AT--TA-A-CATAA------TA-
gi|149695 : CCCC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGACTGTCCC----ACG--ATCCATAGCAATTGAATGCCTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CC--C-TA-AAG-CAACT--GACCAATCAACA-TGTTCA-AATGTGGC-TTT--CCCAA---C-A-TTGCTAT-----TTAATGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTTGGTCCG----TTCTGCAGA-----C---T-A--ctcctgcttaaattgcaacg
gi|149696 : CCCA--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----CATGCCCGTCCC----ACA--ATACATAGCATTCCAACACTTGC-TAAAC--TGTGGTGTAA--------AATT-TTT-C---C-TG-AAG-CAAAT--GACCAATCAACA-TGCTCA-AAT----C-T------------C-A-TTGCTATG----GTAATGGACC----C-TGTC--AGGAGC-------------------GCTGGGTCCA----TTCTACAGA-----C---T-A--A---T--CAT-
gi|149700 : CCCC--AA-T--G-A-AA-G--A--G-----CAGAGAATTA----TATGCCTGTACC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACTCTTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAG-T-TG-ACA-CAACT--GACCAATCAACG-TGCCCA-AATGTGGC-ATT--CCCAG---C-A-TTACTTT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCT
gi|149701 : CCTC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGAAACTC----CATGCCTGTCCC----ACA--TCTCATAGTTATTGAATACTTAC-CAAAC--TGTCACATTG--TT---C-AAC-TTC-CCG----G-AGG-CAACT--GACCAAAAATCG-AGCTCA-AA----GC-T------------C-A-CTGCTAT-----ATAACAGACT----C-CAGC--AGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGT-----C---T-AT-G--TT--CAT-T-
gi|149730 : CC--AA-T--G-A-GA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCTATCTAACGCTAAC-TAAAC--TGTGAAATCA--TT---C-AAC-TTC-C-C-C-TA-TAG-CAACT--GATAAATCAATA-TGCTCA-AAT----C-T------------C-A-TAACTAT-----GTAATGGACC----A-ACAC--AGGAGA-------------------TCTGGGACCA----TTCTACAGT-----C---T-A--
gi|149733 : C--AA-T--G-A-AA-A-----G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACACCTAC-TAAAC--TGTGACATCA--TT---CAAAT-TTT-CAG-T-AT-ACT-CAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AACGTAGC-TTT--CCCAA---C-T-TTGCTAT-----TTAACGG-CC----C-AATT--GGGAAA-------------------GCTAGGTTCG----TTCTACAGA-----C---T-A--
gi|149743 : --AA-T--G-A-AA-A--A--G-----TAGGAAAAGC----TATGCCTGTTAC----ACA--ATCCATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAC--TGCAACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CC--T-TG-AA--CAACT--AAACAATCAACG-TGCCCA-AATGTGGC-TTT--CCCAA---C-A-TTGCTAT-----TTAACAGACC----C-GATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCA----CTCTACAGA-----C---T-A--
gi|149776 : GAATTA----TACGCCTGCCCT----AAA--ATTCATAGCAATTTGACGCTTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAA-T---------AACT--GACCAATCAAAG-TGCTCA-AAT-------------CA----C-A-TTGCTAT-----TCAACCGACC----A-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAAA---------T-A--A--TT--
blockSeqs : G G CA AA AACAA AATT CGGCTTTAATTC TTT A A TTACC GGGGGTGGGGGTGGGGGTT TTAAG A TG GAC G A T ATAATACA AG C TC CCATTT C G TA CT CA CA
blockSeqs : G T A A G AGT TGGCGTTTCAA T A A G . TTC A T AC . A . CG G . T . . C . . . A
blockSeqs : G C A A G AGT CGGCTTTCCC . A A . . . A T A . . . CG G . T . . . . . . .
blockSeqs : C . . A . AAT TTGCTTTCCC . A A . . . . C G . . . CG C . T . . . . . . .
blockSeqs : G . . A . AGT TAGCTTTCCC . A A . . . . T C . . . CG G . C . . . . . . .
blockSeqs : G . . A . AGT TGACTTTCCC . A A . . . . T T . . . CG G . T . . . . . . .
blockSeqs : T . . C . AGC TGGCTTTCCC . A A . . . . C C . . . CG G . T . . . . . . .
blockSeqs : A . . A . AGT TGGCTTTCCC . . . . . . . T C . . . CG G . T . . . . . . .
blockSeqs : G . . A . TGT TGGCTTTCTC . . . . . . . . G . . . CC A . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . AGT AGGCTTTCCT . . . . . . . . T . . . CG G . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTTCC . . . . . . . . A . . . CG A . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . ATC GGGCTTTCCC . . . . . . . . C . . . CA A . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT GGGCTTTCCC . . . . . . . . T . . . TA T . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGACTGTCCC . . . . . . . . T . . . T G . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTCCT . . . . . . . . C . . . T A . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAT CAGCTTTCTC . . . . . . . . C . . . C G . T . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTCCC . . . . . . . . C . . . C G . C . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTCCC . . . . . . . . . . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGTTTTCTC . . . . . . . . . . . . A A .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTCCT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT CGGCTTTCCC . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGACTTTCCC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GTT TGGCTTTTCT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TTACTTTCCC . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT CAGCTTTCCC . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTCCA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGT TGGCTTTCCA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT GGGCTTTCCC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . ACT TGGCTTTCCT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT GGGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGACATTTCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TCACTTTCCA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGT TGGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGC TGGTTTCCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTTCT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . ATT TGGCTTAACC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CCT GGGCTTTTCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GCT CGACTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT GGGCTTTTCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . ATT CGGCTTTCCG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGACTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGA TGGCTTCCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GGT TGGCTTGTCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CCT CGGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT GGGCTTCCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAT TGGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GCC TGACTTTCGC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TATCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TGA TGGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CGT TGGCATTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TAGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AGT TGGCTTTCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AAT GGCTTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TTTCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TGCTCT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TA TTCTC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TTCTG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TG TAAC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC TCCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TTC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CT TCC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TTC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TTC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC GCT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CT CC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC CC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC CC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC CC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC CC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AG TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GC TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC GG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA TT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CG CT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CC CT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CT T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : AGT** TGGCTTTCCC*** C**
originalCons : CTATTAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAG-T-TG-AAG-CAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AATGTGGC-TTT--CCCAA---C-A-TTGCTAT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--TT--CAT-T-TG-G------CGT-GTA-A-CGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCGAC
finalCons : CTATTAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAGT--TG-AAG-CAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AATGTGGCTTTCCC---AA---C-A-TTGCTAT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--TTC--AT-T-TG-G------CGT-GTA-A-CGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCGAC
Alignments
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lowQualScore : 66 4 00 7 2 4 44 22 88888 9999 8888 55 4 55 55 777 4 4 99999 4 4 55 4 4 6666666666666 111 8 8 44444 8888 4 55 1111111111111111111 9999 88888 777 2 77 99 888 4 9 7 88888888 33 9 33 111111 1 7 22 44 99 88
consensus : CTATTAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAG-T-TG-AAG-CAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AATGTGGC-TTT--CCCAA---C-A-TTGCTAT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--TT--CAT-T-TG-G------CGT-GTA-A-CGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCGAC
Reference ( family-101 ) : CTATTAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAG-T-TG-AAG-CAACT--GACCAATCAACG-TGCTCA-AATGTGGC-TTT--CCCAA---C-A-TTGCTAT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--TT--CAT-T-TG-G------CGT-GTA-A-CGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCGAC
gi|149374 : CTATCAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--G--G-----CAGTGAATTC----CATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATA-CTATTCAACGCTTAC-CAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAA-----------------------CT--GACCAATCAAAG-TGCTCA-AAT------------CC-----C-A-TTCCTAG-----TTTACGGACC----A-AACC--AGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTTTACAGA-----C---T-A--G--TT---AT-T-TG-G------CGT-GTA-A-TGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCGAC
gi|149375 : CTATGAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCC----ACG--ATGCATAGCTATTCAACGCTTAC-CAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAA-----------------------CT--GACCAATCGAAG-TTCTCA-AA--------TT--C-------C-A-TTCCTAG-----TTTACGGACC----C-AATC--TGGAGA-------------------GCTTGGTCCA----CACTACAAA-----C---T-A--G--TT---AT-T-TG-G------CGT-GTA-A-TGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGTGACgtgactgatgctgaagacgccatttttcctgatactgaaagctggtcatcaactcatcaaattgaggacaatcggcaaaagtgattttttttcagtcatattattacgacataccttaccgttcttcttataata
gi|149376 : CTATGAACCCCC--AA-T--A-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCTATTAAACACTTAC-AAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAA-----------------------CT--GACCAATCAAAG-TGCTCA-AAT------------CC-----C-A-TTCCTAG-----TTTACGGACC----A-AATC--AGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--TT---AT-T-TG-G------CGT-GTA-A-TGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCAACgtgactgatgctgaagacgccatttttcctgatactgataggtggtcatcaactcatcacattgaggacaatcggcaaaagtgagtttttttcagtcttattattacggcataccttacagctcttcttattata
gi|149377 : CTATGAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--G--G-----GTGGGAATTC----TATTACTGCCCC----ACA--ATTCATAGCTATTTAACACTTAC-CAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAA-----------------------CT--GACCAATCAAAG-TGCTCA-AAT------------CC-----C-A-TTCCTAG-----TTTACGGACC----C-AATC--AGGAGA-------------------GCTTGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G---T--AAT-T-AG-G------CGT-CTA-A-TGTAG------TG-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCGACgtgactgatgctgaagacactatttttcgtgttactgctaacttgtcatcaactcatcaaattgaggacaatcggcaaaagtgagttttttcagtcttattattacgacttaccttaccgttcttcttattata
gi|149379 : CTATGAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCC----ACA--ATTCAAAGCTATTCAACGCTTAC-CAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAA--------------------CA-----GACCAATTAAAG-TGCTCA-TAT------------CC-----C-A-TTCCTAG-----TTTACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----CTCTACAGA-----C---T-A--G--TT---AT-T-TG-G------CGT-GTA-A-CGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCGgtgactgatgctgaagacgccattttgcttgatactgatagctggtcatcaactcatcaaattgaggacaatcggcaaaagtgagtttttttcagtcttattcttacggcataccttaccgttcttcttattata
gi|149380 : CTATGAACCTCC--AA-T--G-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCC----TCA--ATTCATAGCTATTCAACGCTTAC-CAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAA-----------------------CT--GACCAATCAAAG-TGCTCA-AAT------------CC-----C-A-TTCCTAG-----TTTACAGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCAG----CTCCACAGA-----C---T-A--G--TT---AT-T-TG-G------CGT-GTA-A-TGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAC--TGCGACtcgtgactcatgctgaagacgccattttccccgatactgataggtggtcatcagctcatcacaatgaggacaatcggccaaagtgagttttttttcagtgttattattacggcataccttacggttcttcttattata
gi|149381 : CTATGAACCCCC--AA-T--G-A-AA-A--G--G-----CAGGGAATTC----CATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCTATTCAACGCTTAC-CAAAC--TGTGACGTCA--TT---CAAA-----------------------T--GACCAATCAAAG-TGCTCA-AA---------T--CC------C-A-TTCCTAG-----TTTACGGACC----T---TT----------------------------CTGGGTCCG----CTCTACAGA-----C---T-A--G--TT---AT-T-TG-G------CGT-GTA-A-TGTAG------TA-ATA-CG--TTTG--TAT--AAT--TGCTACgtgactgatgcttaagaccccatatttcctgatactgacagctggtcatcaactcatcaaattgaggacaatcggcaaaagtgaggcttattattacgacctaccttacagtactacttattata
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gi|149384 : CTATAAACCACA--AA-T--GGA-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATACCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACGCTTTC-TAAAC--TATGACGTCA--TT---CAAAC-GTT-CC--C-CG-GAG-CAACT--GACCAGTCAGTG-TGCTC-----GT------------AA---C-AATTGCTAG-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGATA-------------------GCTGGGTCCG----TTGTACAGA-----C---T-A--A--Tatgactgatgctgaacacgcaatttttcctgatactgataggtggtcatcaactcattacattgaggacaaacggcaaaagtgagttttttttcagtctta
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gi|149573 : TATTAACCCCG--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGTCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGAATGTTTAG-TACAC--TGTGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAG----------CAACT--GACCAATGAACG-TACTCA-AATGTGGC-TTT--CCCAA---C-A-TTTCTAT-----TTAACGGACC----C-AATG--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TTCTACAGA-----C---T-A--G--TT--CCT-T-TG-A------CACAGTA-A-AATAA------TA-AAAGCA--TTTACTTAC--AAC--gtgactgatgctgaagacgccatttttcctgatactgatagctggtcatcagctcatcaaattgaggacactcggcaaaagtgagtttttttttcactcttattattacggcatacct
gi|149574 : TATAAACCGCA--AG-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGTAATAC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTTATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TT----------------------AAG-CAAAT--AACCAATCAAAG-TGCTCA-AATGTGGC-TTT--CCCAA---T-A-TTGCTAT-----TTAACGGACA----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TACAACAGA-----C---T-A--
gi|149575 : TATTAACCGCC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----AAA--ATTCATAGCAATTGAGTGCTTAC-TAAAC--TGTGACGTCA--TC---CAAAC-TTT-CAG-C-TG-AAG--AACT--GACCAATCAATG-CGCTCA-AATGTGGT-TTC--CCCAA---C-A-TTGCTAT-----CTAACGGTCC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTACA----TTCTACAGA-----C---A-A----------AT-G-TG-A------C-T-ATG-A-CATAG-------A-ATACCG--TTTG--
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gi|149578 : TATTACCCCTC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGCCTGTCCC----ACA--ATTCATAGCAATTGCACGCTTAC-TAAAC--TGTGACATCA--TT---CAAAC-TTT-CAG-T-TG-AAG-CAACT--GGCCAATCAACG-TGCTCA-AATGTGGC-TTT--TCTAC---C-A-TATCTGT-----TTAACGGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------ACCGGGTTCG----TTCTATAGA-----C---T-A--A--Tagaaagttgtgtgagttttaacgtgtcatgt
gi|149585 : TATTAACCACC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATACCTGTCTC----ACA--ATTCATAGCAATTGAACGCTTAC-TAAAT--TATGACATCA--TT---CAAAC-TTT-C-C-C-TG-AAA-CAACT--GACTAATAAGCG-TGCTCG-TAC-TG------------------A-TTGTTAT-----GTAACGGACC----A-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTTCG----TTCTACAGA-----C---T-AC-G--TT--
gi|149586 : TATTAACCCCC--AG-T--G-A-AA-A--AA-G-----CTGGGAATTC----TATACCTGTCCC----ACA--ATTCATAGTAATTGAACGCTTAC-TAAAC--TATGACGTCA--TT---CAAAC-TTT-CAT-T-TA-AAG-CAACT--GACCAAACAACA-TGCTTA-AATGTGGC-TTA--ACCAG---C-A-TGGCTAT-----TTAACAGACC----C-AATC--GGGAGA-------------------GCTGGGTCCG----TT-TATAGATTC--T---T-C--G--TT--GAT-TAT-----------T-GTA-A-AG--G------TA-ACA-TG--TT
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gi|149591 : tgtgaactttccgtaagTATTAACCACC--AA-T--G-A-AA-A--A--G-----CAGGGAATTC----TATGTATGTCGC----ACA--ATTTATAGCAATTGAACGCTTAC-TTAAC--TGTGACGTCA--TT---TAAAC-TTT-CAG-T-TG-AAG-CAACT--GACCAATCAATG-TGCTGA-AATGCGAC-TTT--CCCAA---C-A-T---AAT-----TAAATGGACC----C-AATC--GGGAAA-------------------GCTGGGTTCG----TACTTCAGA-----T---T-
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