lowQualScore : 111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 111 4444444444 111111111111 2 1 22 1 1111111111 000000000000000000000000000 1111111111111 11 4444444 22222222 1 4444444 22222 111 1 11111111 1 1 1 22222222 11 22222222222 888888888888888888888888888888888888888 111111 111111 1 111 1 11 1111
lowQualScore : 0 1 1 6 2 666666 111 22 333 2 2 55555 8 0000000000 4 222 3 8 1 5 666666666666 33 3 1 6 8 2 9999999 0 2 1 00 1 44 1 1 22 333 5555555 555555 4 22 5555555555 777777777 222222222222222222222222222 3 3333333333333 2 44 22 4444 2 0000000 55 4 44444444 2 666666 2 0 2 5 2 33 3333333 22 333 44444 55555 2 333 3 2 4 444 2 88888888 55 2 2 22 4 1 4 1 3 3 4 1 88888888 22 2 2 22 0 2 1 22222222222 000000000000000000000000000000000000000 111111 4 44444 444444 1 3333 3 666 1 1 1 44444 6666 444 1 1 4 33 333 2222
lowQualScore : . . . . . ...... ... .. ... . . ..... . .......... . ... . . . . ............ .. . . . . . ....... . . . .. . .. . . .. ... ....... ...... . .. .......... ......... ........................... . ............. . .. .. .... . ....... .. . ........ . ...... . . . . . .. ....... .. ... ..... ..... . ... . . . ... . ........ .. . . .. . . . . . . . . ........ .. . . .. . . . ........... ....................................... ...... . ..... ...... . .... . ... . . . ..... .... ... . . . .. ... ....
lowQualScore : 9 5 2 6 4 888888 111 99 777 0 0 00000 0 3333333333 0 999 8 6 5 0 999999999999 33 4 5 6 3 9 3333333 3 0 7 33 7 88 7 7 44 000 7777777 000000 2 44 7777777777 333333333 999999999999999999999999999 6 9999999999999 0 88 88 2222 0 3333333 55 3 22222222 2 444444 1 3 1 8 2 11 8888888 99 777 66666 66666 2 000 3 4 7 111 5 77777777 55 0 3 88 0 9 1 9 8 8 1 8 66666666 77 1 2 99 7 6 3 33333333333 222222222222222222222222222222222222222 555555 0 88888 222222 8 9999 5 777 7 7 7 33333 7777 111 8 8 7 00 777 9999
consensus : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT------TT-AT--T---TAA-ATATGA-A-----GTGGAAAAACGAAA-AATTTAAAGGAGACCCATAA---TNTTATAT-TAGATTGCTGTTTATTTAC--G-----T---TTTTT-AACAA-GAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-T--T-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATT--TTAT--TA------GTAATGTT---------C-------C---------ATA-T-A-A-A-AT-------------GT-C-CAAG--A----T-AAAG-CA---CA--GTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATG-CCTTTGANATAATGCTTT--TGTGAN--G--ATGG---TGATAN---AATGAAGC-----AT-A--GTTTTAGAAC-C-AAAAT---AAAAC-TAGAGCGGG-G--T-N-T--G-TCACT--TTCAAG-AGTTGA-AAATCTG-AGAAAAA-GAGAGAAC-AATTGGTGAG-TGAA--AA-ATAACAG-TGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGA----CCNC--TTTCT--------C--------C--------C--GAC-------CC------CC-ATCCC-----CC-----A-AAC----AAAAT-G-A-GT-A-T-----T---CC-T-TTT-C-TGACAATCATAACTCAAGATACCGCTATTA---CTAAGATA-GACTTATTT
Reference ( gi|4 ) : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAGATAG-TTT------TA-AT--T---TAA-ATATGA-A-----GTGGGAAAACGAGATAATGTAAAGGAGACCTATAA---TATCATAT-TAAATTGCTGTTTATTTAC--A-----T---TTTTT-ATCAA-GAATTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACGTTT-T--T-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TACTT--TTAT--AA------GTAATGTT---------C-------C---------A---------A-AT-------------GT-C-GAAG--A----T-AAA---A---CA--GTAAATTTAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATA-CGTTTAAAATAATGCTTT--TAAGAA--G--ATGG---TGATCC---AATGAAGC-----AT-A--TTTTTATAAC-C-AAAAT---AAAAC-TAGAGCAGG-G--T-C-T--G-TCAAT--TTCAAG-AGTTGA-ACATCTG-AGAAAAA-GAGAGAAC-AGTTGTTGAG-GGTA--AA-GTAACAG-TGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAAAATTGATCTTGG----TCAT--TTTCT--------C--------C--------C--AAT-------CC------CC-ATCCC-----CA-----A-AAC----ACAAT-T-A-GT-A-T-----T---TC-C-TTT-C-TGACAATAATAACTTGAGATACCGCTATTA---CTAAGATA-TACTTATTT
gi|3 : TCAGAAATATTGGACGTTCT-CTTTAACCTCTAGTAAATAG-TTT------TT-AT--T---CAA-ATATGA-A-----GCGAAAAAA-GA---AATTTAAAGAAGTCCCATAATTTTTTCATA---AGATTGCTGTTTATTTGT--G-----T---TTTTG-A-CAA-GATTTTTAGA-------TATCTAGT-------TACCATCCAACAATT-TTATTTTT-T--T-TAA--AAGG---CTA-------AGTGA------TAATG--TTAT--TAGTTACTGTAATGTT---------T-------TATAATTATAA---------A-AT-------------AT-C-CAAG--A----T-AAAATTA---CA--GTAAGTTTAATACTATGTTG--------CCA-C------GTCAG-CCTA-CCTTTAAAGTACTGCTTTGGTA--AC--G--ATGG---TTATAA---AATAAAGC-----AT-A--GTTTTGAATC-CAAAAATAAAAAAAC-TAGAGTGAG-C--T-G-T--G-TCACA--CTCGAG-AGTTGA-AAATAAGAAAAAAAA-GAGAGAAC-AATTGATGAA-TGAA--AA-TTAACAA-TATTTATGCA--TTGTTCTAATTTTAGTGAATTTTATCTTGA----CCTC--TTTTT--------C--------CCTAAACCTC--GAC-------CC------CCTATTCC-----TC-----A-AAC----AAAAT-T-A-GT-A-T-----T---CC-C-TTT-C-TGACAATCATAACTCAAGATACCGCTATTA---CTAAAATA-
gi|8 : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTC-TTAACCTTTGATAACTAG-TTT------TA-ATAAT---TTT-ATATGA-G-----ATAGgcattattct
gi|5 : CAGAGATGTTAAACGTTTTCCTG-AATCTCTTGTTACTAG-TTT------TT-GT--T---TAA-ATATGA-A------TAGGAAAA--AAATAATTTTTTCTAGACCAACCA---TTTTATATATTAATTGCTGC--GTTTAC--A-------------------A-ATGTTTGAGATGATAAGTGACTCCT-------TATCTTCCATTAATG-TTATTATT-T--T-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATT--TTATCAAA------GTAATGTT---------C-------C---------AT--------A-ATTACAATATGTCCAAT-C-TAAA--ATTTGT-AAA---A---CA--GTAAATTTGATGATATATTG--------CGA-C------ATCAA-CCTACCCTTT--AATAATGCTTT--TGTAAC--G--ATGG---TAAT----------AAC-----ATGA--GTT--------C-AAAAT---AAAAC-TAGAGCTGG-C--T-A-T--G-TCACT--TTCAGG-AGTTGA-AAATCTG-A-AAAAA-GATAGAAC-AGTTGGCGAG-TGAC--AA-ATAACAG-TATTTATGCA--TTATTCTAA----GTTAA-----ATCTTGA----CTAT--TTTCT--------CA-------T--------T--AAA-------CCTTGACTTT-GTGCC-----CT-----A-AAC----AAAAT-G-A-GT-A-A-----T---CC-T-TTT-C-TGACAATCATAACTCAAGATAACGGTATTA---CTAAGATA-ctgtttatttacgttttttaacaagactttgacatgataagagtcaacttacattccaacaacgctatttttttaaacactaagtgataatttgtcataattacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttaataatatgttgcgagatcaatcgtcctttagtttaatgtttttgtagcgatgatcttaaaatgaagcatagtttttcacccccaaaataaagcgtaagagggctattcactcttaagagttgtaaatttgagaaaaagaaagaacaattgttgagtgacaagtaacagtatttatgatttttggttaaattgatcttgaccctttctccctacacctcaacccccatccaccgaacaaaaagtgtattccttttctgacaatcataaatcatataccgctattacacgtatcaaaataacattattatatt
gi|24 : CAGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AATCTCCGGTTTATAG-CTT------TT-AT--T---TAA-ATATGA-A-----GTGGAAAAACGAAA--ATTTAAAGGAGACCTATAA---TAT---AT-TAAAGTGCTATTTATTTAC--G-----T---TTTTTTAACAA-GAGCTGGAGATGATAAGTATCTATC-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-T--T-A-G--AAGA---CTC-------AGTGA------TAATT--TTAT--TA------GTAATGTT---------C-------C---------ATAATAAA--A-ATAAGG---------GT-C-CAAG--A----T-AAA---A---gcattattgt
gi|2 : AGAGATATTGGACGTTTTTCTT-AACCTCTGGTAAATAGATTT------TA-----T---TAATATATGATATTTTTATATGAAAATTAAA------AAAAAATATTCACGA---TATTATAT-TAGACTGCTGTTTAATTA-------------------AC--A-GAGTT-----TGA--AGTATCCACT-------TAGTTTACAATATTG-TCAT-TTT-T--T-C-A--AACA---CTA-------AATAA------T-TTT--CCAT--AA------TTAA---------------------A---------A---------A-AT-------------GT-C-CAAG--A----T-AAGGGCA---CA--GTTAATTTTATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-TATA-CA-ATGAGATAATGCTTT--TATAAT--G--ATGG---TGACAC---AAGGAAGC-----AT-A--GGTTTAGAAT-C----AT---AGA----AGAGCAacaca
gi|1 : GACATGTTTAATATTTTTCTT-AACCTCTAGTAAAAAT-TTT------TT-GT--C---TAA-ATATGA-A-----GTAA-AAAATGGGA-AATATAAAGGAGAC--ACAA---CTTTATAT-TAGACTGCTGTTTATTTAC--G-----TGTTTTTTT-A-CAA-CAGCTTGAGAAAGTAAGTGTCCACT-------TACCTTTCAAGATTG-TAATTTTTCT--T-C-A--AACA---CGT-------ATTAA------TATTT--TTAT--CA------GTAATGTT---------C-------C---------ATAATTACAAA-AT-------------GT-CTAAAGTAA----T-GAC---A---CA--GTTAATTTAATAATATATTGTAAGTTTGCGA-C------GTCAG-CATG-CCTTTGAGATAATGCTTT--TGTAAT--G--ATGG---TGATAC---AAGGAAGC-----AT-A--TTTTAAGAAC-C-AAAAT---AAAAC-TAGAGCActgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagctgtgtcacttttaagagtggagcatctgtgaaaactagagaacaatcggtgagtaaaaaataagtgtttatgcattgttctgatttgggtgaaagtgatcttgacctcttactccataaactccgaccacataacccaaacaatatgagtattccttttctgacaattagaactcaagataccgctattactagggtagcattatcta
gi|15 : GAGATGTTGGACGTTTTC--TTAACCTCTGGTAAATAG-TTT------TT-AT--T---TAA-ATATGA-A-----GTGAAAAAAAG-GAAAATATAAAGGAGACCTTCAA---TA----------------------TTAT--A-----T---T-----------GAGTTTGGGATAATGAGTGTCAAAT-------TAACTTCCATCATTG-TCA---TT-TGAC-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATG--TTAT--TAT-----GTAATGTT---------C-------C---------ATAATTATAAA-AT-------------GT-C-CACG--A----C-AAGGGTA---TA--GTCAATTGAATACTATTTTG--------CGA-C------AACAG-CGTG-TCTTTGACATAATGCTGT--T--GTATTG--ATGG---TGGTAA---AATGAAAC-----AC----TGTTTAAAAC-CAAAAAT---ACAAC-TAGAACA--------C-T--G-ACAGT--T--AAG-AGctaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcaggggttttgtcgcttcaagagttgagaaatctgagaacaagatagagcaattggtgagtgacaaatgtcagtgtgtgtaattttagtgaaagagatattaacctcatgcttaaacccaaccagtatcccccacacaatatgagtattccttttctgacaagtataactcaagatacctctattattgccaggatagaattattcta
gi|28 : GAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AACATCTGGTAAATAG-TTT------TT-TA--T---TAT-ATATGA-A-----GTA------------AATGTAAA-------CATAC---TTTTATAT-TAGAT-GCTGCTTATTTACGGA-----A---TATTT-AACAC-GAATTGGAGAT---AAGTGTCTACTTAGTACTTACCTTCCAA-ATTGTTTACAGTT-T--T-C-A--AACA---CTG-------AGTGA------TAATT--Tcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgctatatcaattttaagagttggaaataagataaaaaggaagaacaattggtgataaatattatt
gi|31 : GATATGTTGGAA--------TTAACCTCTGGTAAGTAG-CTT------TT-AT--T---TAG-CTATGA-A-----GTGA-AAAAGGA---AATTTAAAA---ACCCATAA---TCT-ATAT-AAGATTGCTGTTTATTTAT--A-----A---TTTTT-AACAA-GAGTTTGAGATGATattacttctacttttgataacgtatcaaatt
gi|34 : AAATGTTGGAC-TTTTTCTT-AAAATTTGGTAAATAG-GTT------TT-AT--T---TAA-ATATGA-A-----GTGGAAAAAT----TA----AAAGGAGACCTATAA---TATTATAT-TAGATTtacgcttagt
gi|23 : GATATTAGACGTTTTTCGT-AGCCACTGTTAAATAG-TTT------TTTAT--T---TAA-ATTTAA-A-----GTGGTAAAACAAAA--ATTTAAAGGAGACCCACAA---TATTATAT-TATATTGCTGTTTGTTTGC--G-----G---TTTTT-AACAA-GAGTTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACA-TT-T--T-C-A--AACA---CTA-------AGGGA------TAATT--GTAT--TA------GTAATATT---------C-------CATAATAACAA---------A-AT-------------GT-C-AAAG--A----T-AAAAACA---CA--GTTAA
gi|10 : GGTGTTGGACGTTTTATCTTAACCTCTAGTAAATAG-TTTAATATTTG-AT--TATATAA-ATATGA-A-----GTGTAATAA--AGAAACTTTAATGGAGACCCACAA---TATAACAT-TAGACTGCTGTTTATTTAC--G-----G---TTTCT-TTAAACGAGTTTGAGAAGATACGTGTCCGCT-------TACCTCACAACATTA-TCAT-TTT-TAGT-C-AGTAATATTTTTATTAGAATAGTGCTCTTTTTACTT--TTAT--TA------ATCATTTT---------C-------CATTATTATAA---------A-AT-------------GT-C-CAAG--A----T-AGAGACA---CA--GTAAATCTAAAAATATATTG--------ATT-T------GGTAG-CATG-CCTTTGAGATAATTATTT--T--GAC--G--GTGGGAATAAT------ATGAAGT-----TT-A--GCTTTAGAAC-C-AAAAT---ACAAC-TAGAGCA
gi|32 : gcGATGTTGGACGTTTTTCTT-AAC-----GTAAATAT-TTT------TA-TT--T---TAA-GT--------------GGAAATTT---TTTTTTAAAGGAGACCCATAT---TTTTATAT-TAAATTCCTGTTTATTTAT--G-----T---TTTTT-AACAT-GAGTTTGAAATGctgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagacaagagttaaaaacctgagaaaaatagagaacaattggtgaatgacaaa
gi|7 : GTAAATAT-TTT------TT-GT--T---TAA-ATATGA-A-----GTGGAAAAACGAAA--ATTCAAAGGACACCCATAA---TTTTATAT-TAGATTGCTGTTT---------------------TT-A-CAA-GAGTTTGAGTTGATAAGTGTTTATT-------TACCTGCCATCAATA-T-ACTTTT-T--TTC-A--AACA---CTA-------AGTGA------TCAAT--TTAT--TA------GTAATGCT---------C-------C---------ATAATTACAAA-AT-------------GT-C-CAAG--A----T-AAA---AACATA--GTAAATTTAATAATATATTG--------CAA-C------GTCTG-CTTA-CCATTAAATTCATGCTTT--TGTAAC--G--ATGG---TGATAA---AACGAAGC-----AT-A--GTTTTAGAAC-C-AAACT---AAAAC-TACAGC-GG-G--TGA-T--G-CCACT--TTTAAG-AGTTGA-AAATATG-ACAAAAA-GAGAAAAC-AATTGGTAGT-GACA--AA--TAACAG-TATTTATTCA--TTGTTCTAATTTTAATGCCATTGATATT-A----CCTC--TTTCTGCTTAAACC--------T--------C--GAC-------CA------CC-ATCCC-----TT-----A-AAC----AAAAT-G-A-GT-A-T-----T---CC-T-TTT-C-TGACAACCATAACTCAAAATAACACTATTA---CTAAGATA-
gi|6 : tcAAATAG-TTT------TA-AT--G---TAA-ATATGA-A-----GTTGAAAAAAAAGAAAATTTAAAGGAGTTCCACAA---TAGCATAT-TAGATTGCTGTTTATTTAC--A-----T---TTTTA-A-CAA-GCGTTTGCTATGTTAAGTGTCTATT-------CACTTTCAAACAGTG-TCA-GTTT-T----C-A--AACA---CTT-------TGTGA------TTATT--TTAT--TG------GTAATGTT---------T-------C---------ACAATTACAAA-AT-------------GT-C-CAAT--G----T-AAGGACA---CA--GTAAAATTAACAACATATTG--------CCAGCATATAAGTCAG-CATG-CCTTTGAGATAATGATTT----AGTA--GTGATGG---TAATAC---AATAAAGC-----AA-A--ATTTTAGAAC-C-AAAAT---ACAAC-TAGAGCAgcattattcttt
gi|13 : cG-TTT------TT-AT--T---TGA-ATATGA-A-----GTGGAAAAACGAAAC--TTTAAAGGATAACCATAA---TATTATAT-TAGATTGCTGTTTACTTAC--G-----GG--CTTTT-A-CAA-GAGTTTGAG-------TT-TCTACT-------GACCTTCCAACAGTG-TTACTTTT-T--T-C-A--AACA---CTA-------ATTGA------TGATT--TTAT--AT------GTTATGTT---------C-------C---------ATAATATCAAA-AT-------------GT-C-CAAG--A----TTAAATC-A---TA--GTAAATTAAGTAATATAATG--------CAA-C------GTCAG-CATA-C-CTTAAAATAATGCTTT--ACACAA--G--ATAG---TGACAC---AATGAATT-----AT-A--TTTTTAGAAC-C-AAAAT---AAAAC-TAGAGCTGG-T--T-A-T--G-TCACT--TTCAAG-AGATAA-A-ATCTG-AGAAAAG-AAGAGAAC-AATTGGTGA---GTAACAA-ATAACAG-AGTTTGTGCA--TTGTTCTGACTTTGGTAAAATTGATCTTGA----TCAT--TTTCT--------C--------C--------CTAAACCTCTAA-CC------CC-ATCCC-----CA-----A-AAC----ATAAT-G-A-GT-A-T-----T---CC-T-TTT-A-TGACAATcttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccggggctaagtcactttcaagatttgaaaatctaaaaaaaagagagaacaattggtgagtgacagatgatcatgatttcttgttccctaaacccgaccccaccccatcccccctaacaatatgagtattacttttcttacaacata
gi|27 : G-TTT------TA--T--T---TAA-ATATGA-A-----GTGGAAAAACGAAA--ATTTAAAGGAGACCCATAA---TATTATGT-TACATTGCTTTTTATTTAC--G-----G---TTTTA-A-CAA-GAGTTGGAGATGATAAGTGTCTACTGGCT---TACCCTCCAACATTG-TTGCTTTT-A--T-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATT--TTAT--TA------CTAAGGTT---------C-------C---------AT--------A-AT-------------caacatcaa
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngA-AT--T---TAA-ATATGA-A-----GTGGAAAAACGAAAaa
gi|26 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AT--T---TAA-ATAGGA-A-----GTGGAAAAATGAAA--ACTTCAAGGAGACCCATAA---TATTATAT-CATATTGCTGTTTATTTAT--G-----T---TTTTC-AACAA-GATTTGGAGATGATAAGTGTTTGCT-------TACTTTCTAACATTG-TTACTTTT-T--T-T-G--ACCA---CTA-------AGTGA------TGATA--TTAT--TA------TTAATGTT---------C-------C---------AT--------A-AT-------------atttacgtttttttaacatgagttggagatgatatgtgtctacttacctttcaacattattcctctttacaaacaataagcgataattgtattagtaatgttccatactaacaaaatgtccaaggtaaaaacacaataaattcagtaatatattgcgacgtcagcatacctttacaataatgcttttataaagattgtgatacaatgaagcatagttttagatccaaaataaaactagagcgaggtatgtcactttcaaatgttgaaaatctgagaaaaaggagagaacacatgggaagtgaaaattaacaatgtttatgcatcgttctaattctagtaaaattaatcttgattactttcttactaaacctacaccccttcctccaaacaaaatgagtaattgtaattcaagataccgcaaatactaagatagacttattttatt
gi|16 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-ATATGA-A-----GTTGAAAAACGAAA--ATTTAAAGTAAACCCATAA---TATTACAT-TAGATCGCTGTTTATTTAC--G-----G---GTTTT-AACAA-GAGTTTGAGATGATAAGTGTCCACT-------TACCTTCCAACAGTG-TTACTTTC-T--C-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATT--TTAT--TA------GTAATGTTGCATTATAAC-------A---------A---------A-AT-------------GT-C-CAAG--A----T-AAAAACA---CA--GTAAATTTAGCAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATG-CCTTTAAAATA-------------AA--G--ATGG---TGATAC---AATGAAGCTTTCAAT-A--TTTaacaaaatgtc
gi|14 : AAATTATG-AAAAAAGATCCACAA---TATTATAT-TAGACTG-TGTTTATTTAC--G-----T---TTTCT-AACAA-GAGTTTGAGATGGTAAGTGTTCATT-------TACTTTCCAACATTG-TCATTTTT-T--A-C-A--ATCA---CGA-------AGTAA------TAATT--TTAT--AA------GCATTGTT---------CATAATTAC---------A---------A-AT-------------GT-C-TAAG--A----T-AAGGGCA---TA--GTAAATTTAATAATGTA-TG--------TGA-C------GTCAG-TATG-CCTTTAcaagagttgaaaatctgagaaaaaagggagaacaattggtgagtggcaaataacagcgtttatgcattgttctaattctggtaaaattgatcttgatcacattctcccttaacatcgacccccatcgcccaaacaaaatgagtattcct
gi|25 : aatAATATGAAGTGGATTTTTAT---T-TTACAT-TTAACTGCTGGGTATTTAC--A-----C---TTTTA-A-CAC-GAGTTTGAGGTGATAAGTGT-----------------TCTA----------------T--T-C-A--AACA---TTA-------AGTGA------TA-TT--TTAC--TG------GTAATGTT---------C-------C---------ATACTTACAAA-AT-------------GT-C-CAAG--A----T-AAGGGCA---CA--GTAAATTTA---ATATATTG--------CAT-C------TTCAG-CATG-CCTTTGAGATAACGCTTT--TGTAAT--G--GTGG---TGATctgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcaggggctatgtcactttcaagagttgaatatctgaaaaaaagagaaaaccattggtgagtgacaaataacagtgttcatgcattgttttaattttggtgaaagtaattttgaccttttgctcctaaaccccgacccccaccaacaaacaatatgcgtatgccttttcagtgaattagaaattagata
gi|12 : ataaataagttttaaataATAA---TTTTATAT-TAGATTGCTGTTTATTTAT--G-----T---TTTAA-A-CAA-GAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTAT-TTT-T--T-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATT--TTAT--TA------GTTATATT---------C-------C---------ATAATCAAA-ATAT-------------AT-C-ATAG--A----T-AAA---A---CACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTA-CCTTTAATTTAATGCTTT--T--GTACCG--ATGG---TGATAA---AATGAAGC-----AT-A--GTTTTAGAAC-C-AATAT---AAAAC-TAGAGCGGG-C--T-A-T--G-TCGCT--TTTAAGTAG-TGA-AAATCGG-AGAAAGA-GAGAGAACAAGCGGTT-AG-TGAA--AA-TTAACAG-TATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGA----CCTC--TTTCT--------C--------CCTAAACCTC--GAC-------CC------CC-ATTCC-----CC-----A-AAC----AAAAT-G-A-GT-T-T-----T---CT-C-TTG-C-TGACAACCATAACTTAAGATACCGCTATTA---CTGAGATA-aaaaaatg
gi|11 : cATAA---TTTTATAT-TAGATTGCTGTTTATTTAT--G-----T---TTTAA-A-CAA-GAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTAT-TTT-T--T-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATT--TTAT--TA------GTTATATT---------C-------C---------ATAATCAAA-ATAT-------------AT-C-ATAG--A----T-AAA---A---CACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTA-CCTTTAATTTAATGCTTT--T--GTACCG--ATGG---TGATAA---AATGAAGC-----AT-A--GTTTTAGAAC-C-AATAT---AAAAC-TAGAGCGGG-C--T-A-T--G-TCGCT--TTTAAGTAG-TGA-AAATCGG-AGAAAGA-GAGAGAACAAGCGGTT-AG-TGAA--AA-TTAACAG-TATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGA----CCTC--TTTCT--------C--------CCTAAACCTC--GAC-------CC------CC-ATTCC-----CC-----A-AAC----AAAAT-G-A-GT-T-T-----T---CT-C-TTG-C-TGACAACCATAACTTAAGATACCGCTATTA---CTGAGATA-gcattattata
gi|8 : cATAA---TTTTATAT-GAGATAGCTGTTTATTTAC--G-----T---TTTTT-AACAA-GACTTTGACATGATAAGAGTCAACT-------TACATTCCAACAACG-CTAT-TTT-T--T-T-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATTTGTCAT--AA------TTA--------------C-------A---------A---------A-AT-------------GT-C-CAAG--A----T-AAAAACA---CA--GTAAATTTAATAATATGTTG--------CGA-G------ATCAATCGT--CCTTTAGTTTAATGTTTT--T--GTA--G---CGA---TGATCTTAAAATGAAGC-----AT-AGTTTTTCACCCC-C-AAAAT---AAAGCGTA-AG-AGG-G----C-T--ATTCACT--CTTAAG-AGTTGT-AAATTTG-AGAAAAA-GAAAGAAC-AATTGTTGAG-TGAC--AA-GTAACAG-TATTTATG-A--T--------TTTTGGTTAAATTGATCTTGA----CC-C--TTTCT--------C--------CCTACACCTC--AAC-------CC------CC-ATCCA-----CC-----G-AAC----AAAAA-G-T-GT-A-T-----T---CC-T-TTT-C-TGACAATCATAAATC-ATATACCGCTATTA---Cgcattattata
gi|30 : tcagagatgttggacgtttttcttaacctttgataactagtttta---TATAATAT----ATTGCTGTTTATTTAC--G-----T---TTTTT-AACAA-GAGTTGGAAATGATAAGTGTC---------------------CATTG-TTACTTTT-T--T-C-T--AACA---TTA-------AGTAA------TAATA--TTAT-----------TAATGTT---------C-------CATAACAACAA---------A-AT-------------TTCC-AAAA--A----T-AAG---AACTCG--GTAAAacgtatcaaaataacattattatatt
gi|38 : ATAT-TAAATTGCAGTTTATCTAT--GGGCTTT---TTTTT-AACAA-GAGCTTAAGATGATA
gi|21 : tTAT-TAGATTGCTGTTTATTTAT--G-----TG--TTTTT-AACAA-GAGTTGGAGGTGATAAGGGTCTTCT-------TACCTTCCAGCATTG-TTACTTTT-T--T-C-A--AACA---CTA-------AGTGA------TAATT--TTAT--GA------GTAATGTT---------C-------CATAATAACAA---------A-GT-------------GT-C-CAAG--A----T-AAAATCA---CA--GTTAATTTAGTAATATATTG--------CTA-C------ATCAG-CATA-CCTTTGAAATAAAGCCTT--TAAAAA--G--ATGC---TGATTC---AATGAAGC-----AT-A----AGCATAACTC-AAGAT---A
gi|9 : ATTTAC--G-----T---TTTTTTAACAT-GAGTTGGAGATGATATGTGTCTACT-------TACCTTTCAACATTA-TTCCTCTT-T--A-C-A--AACA---ATA-------AGCGA------TAATT--GTAT--TA------GTAATGTT---------C-------C---------ATACTAACAAA-AT-------------GT-C-CAAG--G----T-AAA---AACACA--ATAAATTCAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATA-CCTTTACAATAATGCTTT--TATAAA--G--ATTG---TGATAC---AATGAAGC-----AT-A--GTTTTAGATC-C-AAAAT---AAAAC-TAGAGCGAG-G--T-A-T--G-TCACT--TTCAAA-TGTTGA-AAATCTG-AGAAAAAGGAGAGAAC-ACATGGGAAG-TGAA--AA-TTAACAA-TGTTTATGCA--TCGTTCTAATTCTAGTAAAATTAATCTTGA----TTAC--TTTCTTACTAAA-C--------C--------T--ACA-------CC------CC-TTCCT-----CC-----A-AAC----AAAAT-G-A-GT----------------------------AATTGTAATTCAAGATACCGCAAATA---CTAAGATA-GACTTATTTccgctattactaagagagacttattctatt
gi|17 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttaaatatgaagtggaaaaacgaaa---A---CA--ATACATTTAATACTGTAATG--------TGA-C------GTCAG-CATG-CCTTTGACATACTGCTTT--T--GTATTG--ATAG---TGATAA---AATGAAGC-----AT-A--GTTTCAGAAC-C-AAAAT---AAAAC-TAGAGCAtatt
gi|18 : cacgataggagcAG-CCTA-CCTTTAAATCAATGCTTT--TGTAAC--A--ATGG---TGATAA---AATGAAGT-----AT-A--ATTTCAGAAC-C-AAAAT---AAAAC-TAGAGTGGG-C--T-T-T--G-TCACT--TTCAAG-AGTTGA-AAATCTG-ATAAAAA-GTGAGAAC-AATTGGTGA---GTAACAA-ATAACAG-TATTTATGCA--TTGTTCTAGTTTGGGTGAAATTGATCTTGT----CCTC--TTTCT--------C--------CTTAAACCTT--GAC-------CC------CC-ACCCC-----GC-----A-AAC----AAAAT-G-A-GT-A-CCGGTAT---TC-C-TCT-CATGACAATCATA---------ACCACTATTA---CTAAGATA-ctggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccagggcgtatgccactatcaagtgttgaaaatctgagaaaaagagagaacaaatgatgagtgacaaataacagtgtttatgcattgttgtaattttggtgaaagtgatcttgaccgcttgctccctaaattccaatcctcatcccctaaacattatgtgatttccttttttgacaattagacttttttatattattaggatagcattattg
gi|19 : acaataagatatataaccccgtacataaagtatgttatttttatgcaatatatttgcatatgtatattaaaacctgtgttttttacacaag--ATGA---TGATAA---AATGAGGC-----AA-A--GTTGTAGAAT-C-AAAAT---ACAAC-TAGAGCAgcattattctctt
gi|1 : aacaCAGG-GGTT-T-T--G-TCG-C--TTCAAG-AGTTGAGAAATCTG-AGAACAA-GATAGAGC-AATTGGTGAGTGACA--AATGT--CAG-TGT--GTG----------TAATTTTAGTGAAAGAGATATTAACC--TCATGCTTAAA--------C--------C--------C--AAC-------CA------GT-ATCCC-----CC-----A---C----ACAATATGA-GT-A-T-----T---CC-T-TTT-C-TGACAAGTATAACTCAAGATACCTCTATTATTGCCAGGATA-GAATTATTcttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcgggggctatgtcattttcaagagtttaaaatctgagaaaaagagataacaattggtgtgtgacaaataacagtgtttatgcattgttctaattttgtgaaagtggtcgtgatttcttattccctaaaccccgacccaatccctcaaataatatgagttttccttttctgacaattataactcaagataccgcaattacttggatagcattatttta
gi|14 : gacatgtttaatatttttcttaacctctagtaaaaattttttgtctaaatatgaagtaaaaaatgggaaatataaaggagacacaactttatattagactgctgtttatttacgtgtttttttacaacagcttgagaaagtaagtgtccacttacctttcaagattgtaatttttcttcaaacacgtattaatatttttatcagtaatgttccataattacaaaatgtctaaagtaatgacacagttaatttaataatatattgtaagtttgcgacgtcagcatgcctttgagataatgcttttgtaatgatggtgatacaaggaagcatattttaagaaccaaaataaaactagagcactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctCAGG-G--G-C-TATG-TCACT--TTCAAG-AGTTGA-ATATCTG-AAAAAAA-GAGAAAAC-CATTGGTGAG-TGAC--AA-ATAACAG-TGTTCATGCA--TTGTTTTAATTTTGGTGAAAGTAATTTTGA----CCTT--TTGCT--------C--------C--------T--AAA-------CC------CCGACCCC-----CACCAACA-AAC----AATAT-G-C-GT-A-T-----G---CC-T-TTT-C-AGTGAATTAGAAATT-AGATActa
gi|17 : aataaattatgaaaaaagatccacaatattatattagactgtgtttatttacgttttctaacaagagtttgagatggtaagtgttcatttactttccaacattgtcattttttacaatcacgaagtaataattttataagcattgttcataattacaaatgtctaagataagggcatagtaaatttaataatgtatgtgacgtcagtatgcctttactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctCAGG-GCGT-A-T--G-CCACT--ATCAAG-TGTTGA-AAATCTG-AGAAAAA-GAGAGAAC-AAATGATGAG-TGAC--AA-ATAACAG-TGTTTATGCA--TTGTTGTAATTTTGGTGAAAGTGATCTTGA----CCGC--TTGCT--------CCCTAAATTC--------C--AAT-------CC------TC-ATCCC-----CT-----A-AAC-------AT-T-ATGTGA-T-----T---TC-CTTTT-T-TGACAAT
gi|20 : cacgataggagcacaatacatttaatactgtaatgtgacgtcagcatgcctttgacatactgcttttgtattgatagtgataaaatgaagcatagtttcagaaccaaaataaaactagagcactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttccCAGGTG--T-TAT--G-TCACT--TTCAAG-AACTAA-AAATCCG-AGAAAAA-GAGAGATC-AATTGGTCAG-TGAC--AA-ATAGCAG-TGCTTATG-ATTTTTTTCTTATTTTGGTGAAAGTAATCTTGA----CC-T--CTTGC--------C--------C--------C--GA--------CC------CC-TTCCT-----CC-----A-AAC----AGTAT-G-A-GT-AGT-----C---TT-C-TTC-T-TG-TAATTAGAACTCAAGATACCGATTTAA---CTAGGATG-GCTTTATTtagacttttttatattattaggatagcattattg
gi|6 : aacaaaaaaaacctagagccctgaaagggcaacaagagcctcgtagtgtgcctgactctatatcccattggctttggtcacaacattaattctgtctGG-G--G-C-TAAG-TCACT--TTCAAG-ATTTGA-AAATCTA-AAAAAAA-GAGAGAAC-AATTGGTG----------A-GTGACAGATGATCATG-A--T--TTCTTGTTCC-CTAAACCCGA--------------------C--------C--------C--------C--A---------CC------CC-ATCCC-----CC-----CTAAC----AATAT-G-A-GT-A-T-----T---AC-T-TTT-C-TTACAACActa
gi|10 : caaatagttttaatgtaaatatgaagttgaaaaaaaagaaaatttaaaggagttccacaatagcatattagattgctgtttatttacatttttaacaagcgtttgctatgttaagtgtctattcactttcaaacagtgtcagttttcaaacactttgtgattattttattggtaatgtttcacaattacaaaatgtccaatgtaaggacacagtaaaattaacaacatattgccagcatataagtcagcatgcctttgagataatgatttagtagtgatggtaatacaataaagcaaaattttagaaccaaaatacaactagagcacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctcc--T-C-T--G-TCAAA--GACAAG-AGTTAA-AAACCTG-AGAAAAA-TAGAGAAC-AATTGGTGAta
gi|16 : gcggtgttggacgttttatcttaacctctagtaaatagtttaatatttgattatataaatatgaagtgtaataaagaaactttaatggagacccacaatataacattagactgctgtttatttacggtttctttaaacgagtttgagaagatacgtgtccgcttacctcacaacattatcatttttagtcagtaatatttttattagaatagtgctctttttacttttattaatcattttccattattataaaatgtccaagatagagacacagtaaatctaaaaatatattgatttggtagcatgcctttgagataattattttgacggtgggaataatatgaagtttagctttagaaccaaaatacaactagagcactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaat-C-T--T-TCAATATTTCAAG-AGTTGA-AAATCTG-AGAAAAAAGGGAGAAC-AATTGGTGAGTGGCA--AA--TAACAG-CGTTTATGCA--TTGTTCTAATTCTGGTAAAATTGATCTTGA----TCAC--ATTCT--------C--------CCTTAACATC--GAC-------CC------CC-ATCGC-----CC-----A-AAC----AAAAT-G-A-GT-A-T-----T---CC-atgacaaa
gi|15 : aaatatgaagttgaaaaacgaaaatttaaagtaaacccataatattacattagatcgctgtttatttacgggttttaacaagagtttgagatgataagtgtccacttaccttccaacagtgttactttctccaaacactaagtgataattttattagtaatgttgcattataacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttagcaatatattgcgacgtcagcatgcctttaaaataaagatggtgatacaatgaag-T--A-TCAAT--TTTAAG-AGTTGG-AAATAAG-ATAAAAA-GGAAGAAC-AATTGGTGA----TA--AA-t
gi|2 : gagatgttggacgttttcttaacctctggtaaatagtttttatttaaatatgaagtgaaaaaaaggaaaatataaaggagaccttcaatattatattgagtttgggataatgagtgtcaaattaacttccatcattgtcatttgaccaaacactaagtgataatgttattatgtaatgttccataattataaaatgtccacgacaagggtatagtcaattgaatactattttgcgacaacagcgtgtctttgacataatgctgttgtattgatggtggtaaaatgaaacactgtttaaaaccaaaaatacaactagaacactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgcta-T--G-TCACT--TTTAAG-AGTGGA-GCATCTG-TGAAAAC-TAGAGAAC-AATCGGTGAG-TAAA--AA-ATAA--G-TGTTTATGCA--TTGTTCTGATTTGGGTGAAAGTGATCTTGA----CCTC--TTACT--------C--------CA-------T--AAA-------CT------CC-GACCA-----CA-----T-AACCCAAACAATATGA-GT-A-T-----T---CC-T-TTT-C-TGACAATTAGAACTCAAGATACCGCTATTA---CTAGGGTA-tattatt
gi|19 : agagatattggacgtttttcttaacctctggtaaatagattttattaatatatgatatttttatatgaaaattaaaaaaaaatattcacgatattatattagactgctgtttaattaacagagtttgaagtatccacttagtttacaatattgtcattttttcaaacactaaataattttccataattaaaaaatgtccaagataagggcacagttaattttataatatattgcgacgtcagtatacaatgagataatgcttttataatgatggtgacacaaggaagcataggtttagaatcatagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagctg-T--G-TCATT--TTCAAG-AGTTTA-AAATCTG-AGAAAAA-GAGATAAC-AATTGGTGTG-TGAC--AA-ATAACAG-TGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTT-GTGAAAGTGGTCGTGATTTCTTAT--TCCCTAAAC----C--------C--------C--GA--------CC------CA-ATCCC-----TC-----A-AAT----AATAT-G-A-GT-T-T-----T---CC-T-TTT-C-TGACAATTATAACTCAAGATACCGCAATTA---CTTGGATA-GCATTATTTgcattatcta
gi|29 : aacaatgatgataaaatgaggcaaagttgtagaatcaaaatacaactagagcacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcgggggctaGA-AAATCTG-AGAAAAA-G------C-AATTGGTGAG-TGAC--AA-ATAACAG-T--TTATGCA--TTGTTCTTATTTTGGTTAAATTTATCTTGA----TCGC--TTTCT--------C--------CTGAAACCTC--GAC-------CC------CT-ATCCC-----CT-----A-TAC----AAAAT-G-A-GA-A-T-----T---CA-T-TTT-C-TGACAATCCTAACTCAAGATATCGCTATTA---CTAAGATA-GACTTATTTta
gi|22 : A-ATATCTG-AGAAAAA-GAGAGAAC-AATTGGTTAGTGGCA--AA--TAACAG-TGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAGCATTGATCTTGA----TCAC--TTTCT-----------------T--------C--AATAA-----CCTCGACACT-ATCACACAAACA-----A-AAT----A-AAT-G-A-GT-A-T-----T---CCTT-TTT-C-TGAAAATCATGACTTAAGATACAGTAATTG---CTAAGATA-TACTTATta
gi|33 : tgataaagaatatgatagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGAAAGTGTTCTTGA----TCTA--TTGCT--------C--------C--------C--TATACCTAGACC------CC-ATCCC-----CC-----A-AAC----GATAT-G-A-GT-A-T-----T---CC-T-TTT-C-TAACAATTAGAAC-TAAGATACCGCTATTA---CTAAGATAGTA-TTATTgtt
gi|37 : TCCC-----CA-----A-A-C----AAAAA-G-A-GT-A-T-----T---CA-T-TTT-C-TGACGATCAAAGCTCAAGAAACCGATATTT---CTcta
gi|36 : cacggt-----A-AAC----AATAT-G-A-GT-A-T-----TCATTC-C-TTTTC-TGACAATTAGAACACAAGATACCGCTATAA---CTAGGATA-
gi|35 : cAT-T-A-TT-G-T-----T---TC-C-T------GACAATTTGAGCTCCAGATACTGCTTTTA---TTAAGATA-gca
gi|21 : aacaattggtgataaatATAACTCAAGATACCGCTATTA---CTAAGAGA-GACTTATTgcattattctct
Alignments
lowQualScore : 1 1 11111111 55555555555555 222222222222 22222222 111 88888888888888888888888888888888888 11
lowQualScore : 0 0 9 2 888888888 22 1 555555 6666 1 1 1 1 333 2 1 22 0 00000000 1 55 9999999 1 1 5 3 1 22 1 666666666 1 444444 22 1 555555 3333 77777777777777 3 1 3333 3 1 3 9 000000000000 22222222 2 666666 2 1 3 5 1 1 33 55 444 2 111 1 4 1 1 3 8 2 22 1 2 2 0 88888888888888888888888888888888888 777777 666666 1 3333 0 444444 3333 1 1 1 333 44
lowQualScore : . . . . ......... .. . ...... .... . . . . ... . . .. . ........ . .. ....... . . . . . .. . ......... . ...... .. . ...... .... .............. . . .... . . . . ............ ........ . ...... . . . . . . .. .. ... . ... . . . . . . . .. . . . . ................................... ...... ...... . .... . ...... .... . . . ... ..
lowQualScore : 2 7 0 2 444444444 99 7 555555 9999 8 0 8 8 333 6 5 00 4 99999999 5 77 0000000 5 7 8 3 7 33 7 777777777 7 888888 33 7 000000 7777 22222222222222 5 8 9999 6 8 6 1 666666666666 99999999 1 111111 0 3 1 3 0 0 22 66 444 5 999 0 0 8 8 6 1 0 88 3 5 9 3 55555555555555555555555555555555555 444444 444444 7 5555 8 888888 5555 7 1 7 333 77
consensus : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATTTTATT--A-GT------AATGTTCCA----T----AAT--C----A-AA-AT----GT-CC-A-AGAT-AA-AA-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTTTGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC--TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCNCTTTCT--------C--------C----AC--C--------GAC------CCC--C---ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---CTAAGATAGCATTATTT
Reference ( family-913 ) : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATTTTATT--A-GT------AATGTTCCA----T----A----T----A-AA-AT----GT-CC-A-AGAT-AA-AG-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTTTGTGANGATGGTGATANAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGG--TNTGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGAAAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCNCTTTCT--------C--------C--------C--------GAC------CCC--C---ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---CTAAGATAGACTTATTT
gi|1 : GACATGTTTAATATTTTTCTT-AACCTCTAGTAAAAAT-TTT---------T--TGTCTAAATATGAAGTA-AAA------AATGG-GA-AATA-T-AAAGGAGA---C--ACAACTTTAT-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACG-----TGTTTT-TT-TACAACAGCTTGAGAAAGTAAGTGTCCACT-------TACCTTTCAAGATTG-TAATTTTTCTT-CA--AACA-CG---------T-ATTAAT------ATTTTTATC--A-GT------AATGTTCCA----T----AATTAC----A-AA-AT----GT-CT-A-AAGT-AA-TGAC-------ACAGTTAATTTAATAATATATTGTAAGTTTGCGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGCTTTTGTAATGATGGTGATACAAGGAAGCATATTTTA--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|1 : GGGT--TTTGTCGCTT-CAAG-AGTTGAGAAATCTGAGAACA-A-GATAGAGCAATTGGTGAGTGACAAATGTCAGTG-T--GTG----------TAATTTTAGTGAAAGAGATATTAACCTCATGCTTAAA----C--------C--------C--------AAC------CAG--T---ATCCCCCA-CACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAAGTATAAC-TCAAGATACCTCTATTATTGCCAGGATAGAATTATTactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcaggggttttgtcgcttcaagagttgagaaatctgagaacaagatagagcaattggtgagtgacaaatgtcagtgtgtgtaattttagtgaaagagatattaacctcatgcttaaacccaaccagtatcccccacacaatatgagtattccttttctgacaagtataactcaagatacctctattattgccaggatagaattattcta
gi|10 : gacatgtttaatatttttcttaacctctagtaaaaattttttgtctaaatatgaagtaaaaaatgggaaatataaaggagacacaactttatattagactgctgtttatttacgtgtttttttacaacagcttgagaaagtaagtgtccacttacctttcaagattgtaatttttcttcaaacacgtattaatatttttatcagtaatgttccataattacaaaatgtctaaagtaatgacacagttaatttaataatatattgtaagtttgcgacgtcagcatgcctttgagataatgcttttgtaatgatggtgatacaaggaagcatattttaagaaccaaaataaaactagagcactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcagGGTGTTGGACGTTTTATCTTAACCTCTAGTAAATAG-TTTAATATTTGAT--TATATAAATATGAAGTGTAAT------AAAGA-AA-C-TT-T-AATGGAGA---CCCACAATATAAC-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACGGT---T--TCT-TT-AA-ACGAGTTTGAGAAGATACGTGTCCGCT-------TACCTCACAACATTA-TCATTTTTAGT-CAGTAATA-TTTTTATTAGAATAGTGCTCTTTTTACTTTTATT--A-AT------CATTTTCCA----TTATTA----T----A-AA-AT----GT-CC-A-AGAT-AG-AGAC-------ACAGTAAATCTAAAAATATATTG--------ATT-T------GGTAG-CATGCCTTTGAGATAATTATTT--TGACGGTGGGAATAATATGAAGTTTAGCTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCcta
gi|10 : gcCAAG-AGTTAA-AAACCTGAGAAAA-A-TAGAGAACAATTGGTGAATGACAAAactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagacaagagttaaaaacctgagaaaaatagagaacaattggtgaatgacaaa
gi|11 : gcggtgttggacgttttatcttaacctctagtaaatagtttaatatttgattatataaatatgaagtgtaataaagaaactttaatggagacccacaatataacattagactgctgtttatttacggtttctttaaacgagtttgagaagatacgtgtccgcttacctcacaacattatcatttttagtcagtaatatttttattagaatagtgctctttttacttttattaatcattttccattattataaaatgtccaagatagagacacagtaaatctaaaaatatattgatttggtagcatgcctttgagataattattttgacggtgggaataatatgaagtttagctttagaaccaaaatacaactagagcactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagaCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATTTTATT--A-GT------TATATTCCA----T----AAT--C----A-AA-AT----ATATC-ATAGAT-AA-AA-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTTTGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC--TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAG-A-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTA-TAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCT--------C--------CCTAAACCTC--------GAC------CCC--C---ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---CTGAGATAGCATTATT
gi|12 : CATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATTTTATT--A-GT------TATATTCCA----T----AAT--C----A-AA-AT----ATATC-ATAGAT-AA-AA-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTTTGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC--TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAG-A-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTA-TAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCT--------C--------CCTAAACCTC--------GAC------CCC--C---ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---CTGAGATAGCATTATTata
gi|13 : G-TTT---------T--TATTTGAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-C-TT-T-AAAGGATA---ACCATAATATTAT-AT--TAGATTGCTGTTTACTTACG-----G--GCT-TT-TACAAGAGTTTGAG--------TTTCTACT-------GACCTTCCAACAGTG-TTACTTTT-TT-CA--AACA-CT---------A-ATTGAT------GATTTTATA--T-GT------TATGTTCCA----T----AATATC----A-AA-AT----GT-CC-A-AGATTAA-AT-C-------ATAGTAAATTAAGTAATATAATG--------CAA-C------GTCAG-CATACCTT-AAAATAATGCTTTACACAAGATAGTGACACAATGAATTATATTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGT--TATGTCACTTTCAAG-AGAT-A-AAATCTGAGAAAA-G-AAGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGAG-TTTGTGCA--TTGTTCTGACTTTGGTAAAATTGATCTTGATCATTTTCT--------C--------C--------CTA------AACCTCTAACCC--C---ATCCCCAA-AACA----TAATGA------GTATTC----C-TTTTATGACAATC--AACATCAAata
gi|14 : A-AATTATGAAAAAAGA---TCCACAATATTAT-AT--TAGACTG-TGTTTATTTACG-----T--TTT-CT-AACAAGAGTTTGAGATGGTAAGTGTTCATT-------TACTTTCCAACATTG-TCATTTTT-TA-CA--ATCA-CG---------A-AGTAAT------AATTTTATA--A-GC------ATTGTT-CA----T----AAT--T----ACAA-AT----GT-CT-A-AGAT-AAGGG-C-------ATAGTAAATTTAATAATGTA-TG--------TGA-C------GTCAG-TATGCCTTT
gi|14 : aatGGGC--TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-ATATCTGAAAAAA-A-GAGAAAACCATTGGTGAGTGACAAATAACAGTG-TTCATGCA--TTGTTTTAATTTTGGTGAAAGTAATTTTGACCTTTTGCTCCTAAAC-C--------C--------C--------GAC------CCC--C---A-CCAACA-AACA----ATATGC------GTATGC----C-TTTTCAGTGAATTAGAAA-TT-AGATAactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcaggggctatgtcactttcaagagttgaatatctgaaaaaaagagaaaaccattggtgagtgacaaataacagtgttcatgcattgttttaattttggtgaaagtaattttgaccttttgctcctaaaccccgacccccaccaacaaacaatatgcgtatgccttttcagtgaattagaaattagata
gi|15 : aataaattatgaaaaaagatccacaatattatattagactgtgtttatttacgttttctaacaagagtttgagatggtaagtgttcatttactttccaacattgtcattttttacaatcacgaagtaataattttataagcattgttcataattacaaatgtctaagataagggcatagtaaatttaataatgtatgtgacgtcagtatgcctttactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcagGAGATGTTGGACGTTTTC--TTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGAAAA------AAAGG-AA-AATA-T-AAAGGAGA---CC-----TTCAAT-AT--TA----------TATT------------------------GAGTTTGGGATAATGAGTGTCAAAT-------TAACTTCCATCATTG-TCA-TTTG-AC-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATGTTATT--ATGT------AATGTTCCA----T----AATTAT----A-AA-AT----GT-CC-A-CGAC-AA-GGGT-------ATAGTCAATTGAATACTATTTTG--------CGA-C------AACAG-CGTGTCTTTGACATAATGCTGTTGTATTGATGGTGGTAAAATGAAACACTG-TTT--AAAACCA-AAAATACAA---C-TAGAAC
gi|15 : --TATATCAATTTTAAG-AGTTGG-AAATAAGATAAAA-A-GGAAGAACAATTGGTGAactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgctatatcaattttaagagttggaaataagataaaaaggaagaacaattggtgataaatattatt
gi|16 : gagatgttggacgttttcttaacctctggtaaatagtttttatttaaatatgaagtgaaaaaaaggaaaatataaaggagaccttcaatattatattgagtttgggataatgagtgtcaaattaacttccatcattgtcatttgaccaaacactaagtgataatgttattatgtaatgttccataattataaaatgtccacgacaagggtatagtcaattgaatactattttgcgacaacagcgtgtctttgacataatgctgttgtattgatggtggtaaaatgaaacactgtttaaaaccaaaaatacaactagaacactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgcAAATATGAAGTTGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGTAAA---CCCATAATATTAC-AT--TAGATCGCTGTTTATTTACG-----G--GTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCCACT-------TACCTTCCAACAGTG-TTACTTTC-TC-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATTTTATT--A-GT------AATGTTGCA----TTATAA----C----A-AA-AT----GT-CC-A-AGATAAA-AA-C-------ACAGTAAATTTAGCAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTAAAATA-----------AAGATGGTGATACAATGAAGCtaaatattatt
gi|16 : TTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-AAGGGAGAACAATTGGTGAGTGGCAAATAACAGCG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTCTGGTAAAATTGATCTTGATCACATTCT--------C--------CCTTAACATC--------GAC------CCC--C---ATCGCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-Ttttcaatatttcaagagttgaaaatctgagaaaaaagggagaacaattggtgagtggcaaataacagcgtttatgcattgttctaattctggtaaaattgatcttgatcacattctcccttaacatcgacccccatcgcccaaacaaaatgagtattcct
gi|17 : aaatatgaagttgaaaaacgaaaatttaaagtaaacccataatattacattagatcgctgtttatttacgggttttaacaagagtttgagatgataagtgtccacttaccttccaacagtgttactttctccaaacactaagtgataattttattagtaatgttgcattataacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttagcaatatattgcgacgtcagcatgcctttaaaataaagatggtgatacaatgaagctttcaataC-A-CGAT-AGGAG-C-------ACAATACATTTAATACTGTAATG--------TGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGACATACTGCTTTTGTATTGATAGTGATAAAATGAAGCATAGTTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|17 : GGCG--TATGCCACTATCAAG-TGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAAATGATGAGTGACAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTGTAATTTTGGTGAAAGTGATCTTGACCGCTTGCT--------CCCTAAATTC--------C--------AAT------CCT--C---ATCCCCTA-AACA----TTATGT------GATTTC----C-TTTTTTGACAATTA-GAC-T-----TTTTTATATTA---TTAGGATAGCATTATTactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccagggcgtatgccactatcaagtgttgaaaatctgagaaaaagagagaacaaatgatgagtgacaaataacagtgtttatgcattgttgtaattttggtgaaagtgatcttgaccgcttgctccctaaattccaatcctcatcccctaaacattatgtgatttccttttttgacaattagacttttttatattattaggatagcattattg
gi|18 : cacgataggagcacaatacatttaatactgtaatgtgacgtcagcatgcctttgacatactgcttttgtattgatagtgataaaatgaagcatagtttcagaaccaaaataaaactagagcactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccagAG-CCTACCTTTAAATCAATGCTTTTGTAACAATGGTGATAAAATGAAGTATAATTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGTGGGC--TTTGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGATAAAA-A-GTGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGTA-TTTATGCA--TTGTTCTAGTTTGGGTGAAATTGATCTTGTCCTCTTTCT--------C--------CTTAAACCTT--------GAC------CCC--C---ACCCCGCA-AACA----AAATGAGTACCGGTATTC----C-TCTCATGACAATCATA----------ACCACTATTA---CTAAGATAGCATTATTg
gi|19 : acaataagatatataaccccgtacataaagtatgttatttttatgcaatatatttgcatatgtatattaaaacctgtgttttttacacaagACAATGATGATAAAATGAGGCAAAGTTGT--AGAATC--AAAATACAA---C-TAGAGCctctt
gi|19 : aCGGGGGCTATGTCATTTTCAAG-AGTTTA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGATAACAATTGGTGTGTGACAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTT-GTGAAAGTGGTCGTGATTTCTTATT--------C--------C--------CTA------AAC------CCCGACCCAATCCCTCA-AATA----ATATGA------GTTTTC----C-TTTTCTGACAATTATAAC-TCAAGATACCGCAATTA---CTTGGATAGCATTATTTacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcgggggctatgtcattttcaagagtttaaaatctgagaaaaagagataacaattggtgtgtgacaaataacagtgtttatgcattgttctaattttgtgaaagtggtcgtgatttcttattccctaaaccccgacccaatccctcaaataatatgagttttccttttctgacaattataactcaagataccgcaattacttggatagcattatttta
gi|2 : aacaatgatgataaaatgaggcaaagttgtagaatcaaaatacaactagagcacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctAGAGATATTGGACGTTTTTCTT-AACCTCTGGTAAATAG-ATT---------T--TATTAATATATGATATTTTTA------TATGA-AA-A--T-T-AAAAAAAAATATTCACGATATTAT-AT--TAGACTGCTGTTTA---A--------------TT-AAC-AGAGTTTG-------AAGTATCCACT-------TAGTTTACAATATTG-TCA-TTTT-TT-CA--AACA-CT---------A-A---AT------AATTTT-CC--A--T------AAT----------T----A----A----A-AA-AT----GT-CC-A-AGAT-AAGGG-C-------ACAGTTAATTTTATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-TATACA-ATGAGATAATGCTTTTATAATGATGGTGACACAAGGAAGCATAGGTTT--AGAATC--Ata
gi|2 : --TGTGTCACTTTTAAG-AGTGGA-GCATCTGTGAAAA-C-TAGAGAACAATCGGTGAGTAAAAAATAA--GTG-TTTATGCA--TTGTTCTGATTTGGGTGAAAGTGATCTTGACCTCTTACT--------C--------CATAAACTCC--------GAC------CAC------ATAACCCA-AACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATTAGAAC-TCAAGATACCGCTATTA---CTAGGGTAGCATTATCTtagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagctgtgtcacttttaagagtggagcatctgtgaaaactagagaacaatcggtgagtaaaaaataagtgtttatgcattgttctgatttgggtgaaagtgatcttgacctcttactccataaactccgaccacataacccaaacaatatgagtattccttttctgacaattagaactcaagataccgctattactagggtagcattatcta
gi|20 : agagatattggacgtttttcttaacctctggtaaatagattttattaatatatgatatttttatatgaaaattaaaaaaaaatattcacgatattatattagactgctgtttaattaacagagtttgaagtatccacttagtttacaatattgtcattttttcaaacactaaataattttccataattaaaaaatgtccaagataagggcacagttaattttataatatattgcgacgtcagtatacaatgagataatgcttttataatgatggtgacacaaggaagcataggtttagaatcatagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagc--TATGTCACTTTCAAG-AACTAA-AAATCCGAGAAAA-A-GAGAGATCAATTGGTCAGTGACAAATAGCAGTG-CTTATG-ATTTTTTTCTTATTTTGGTGAAAGTAATCTTGACCTCTTGC---------C--------C--------C--------GAC------CCC--T----TCCTCCA-AACA----GTATGA------GTAGTC----T-TCTTCTTGTAATTAGAAC-TCAAGATACCGATTTAA---CTAGGATGGCTTTATTa
gi|21 : aacaaaaaaaacctagagccctgaaagggcaacaagagcctcgtagtgtgcctgactctatatcccattggctttggtcacaacattaattctgtctcaggtgtT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----TG-TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGGTGATAAGGGTCTTCT-------TACCTTCCAGCATTG-TTACTTTT-TT-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATTTTATG--A-GT------AATGTTCCA----TAATAA----C----A-AA-GT----GT-CC-A-AGAT-AA-AATC-------ACAGTTAATTTAGTAATATATTG--------CTA-C------ATCAG-CATACCTTTGAAATAAAGCCTTTAAAAAGATGCTGATTCAATGAAGCATActa
gi|21 : ATAAGCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---CTAAGAGAGACTTATTagcataactcaagataccgctattactaagagagacttattctatt
gi|22 : tattagattgctgtttatttatgtgtttttaacaagagttggaggtgataagggtcttcttaccttccagcattgttacttttttcaaacactaagtgataattttatgagtaatgttccataataacaaagtgtccaagataaaatcacagttaatttagtaatatattgctacatcagcatacctttgaaataaagcctttaaaaagatgctgattcaatgaagcA-ATATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTTAGTGGCAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAGCATTGATCTTGATCACTTTCTTCAATAACC--------T--------C--------GA-------CAC--T---ATCACACA-AACAAAATAAATGA------GTATTC----CTTTTTCTGAAAATCATGAC-TTAAGATACAGTAATTG---CTAAGATATACTTATctatt
gi|23 : tgataaagaatatgatagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATATTAGACGTTTTTCGT-AGCCACTGTTAAATAGTTTT---------T--TATTTAAATTTAAAGTGGTAA------AAC-A-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCACAATATTAT-AT--TATATTGCTGTTTGTTTGCG-----G--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTAC-ATT-TT-CA--AACA-CT---------A-AGGGAT------AATTGTATT--A-GT------AATATTCCA----TAATAA----C----A-AA-AT----GT-CA-A-AGATAAA-AA-C-------ACAGTTAAgtt
gi|24 : CAGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AATCTCCGGTTTATAG-CTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCTATAAT---AT-AT--TAAAGTGCTATTTATTTACG-----T--TTTTTT-AACAAGAGCTGGAGATGATAAGTATCTATC-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-AG--AAGA-CT---------C-AGTGAT------AATTTTATT--A-GT------AATGTTCCA----TA---A----TA---A-AA-ATAAGGGT-CC-A-AGATAAA-AA-C-------ACA
gi|25 : TAAATAA-GTT---------T--TAAATAAATATGAAGTGGA-------------------TT-T----------------TTATTTTAC-AT--TTAACTGCTGGGTATTTACA-----C--TTT-T--AACACGAGTTTGAGGTGATAAGTGT-----------------TCTA----------------TT-CA--AACA-TT---------A-AGTGAT------A-TTTTACT--G-GT------AATGTTCCA----T----A----CTTACA-AA-AT----GT-CC-A-AGAT-AA-GGGC-------ACAGTAAATTTAAT---ATATTG--------CAT-C------TTCAG-CATGCCTTTGAGATAACGCTTTTGTAATGGTGGTGATAAAA
gi|26 : aATTTAAATAGGAAGTGGAAA------AATGA-AA-ACTT-C-AA-GGAGA---CCCATAATATTAT-AT--CATATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TC-AACAAGATTTGGAGATGATAAGTGTTTGCT-------TACTTTCTAACATTG-TTACTTTT-TT-TG--ACCA-CT---------A-AGTGAT------GATATTATT--A-TT------AATGTTCCA----TAATAA----C----A-AA-AT----GT-Caatg
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCCATAATATTAT-GT--TACATTGCTTTTTATTTACG-----G--TTT-T--AACAAGAGTTGGAGATGATAAGTGTCTACTGGCT---TACCCTCCAACATTG-TTGCTTTT-AT-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATTTTATT--A-CT------AAGGTTCCA----TA---A----T----A-A
gi|28 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AACATCTGGTAAATAG-TTT---------T--TTATTATATATGAAGT------------------A-AATG-T-AAA----------CATACTTTTAT-AT--TAGAT-GCTGCTTATTTACG-----GAATAT-TT-AACACGAATTGGAGAT---AAGTGTCTACTTAGTACTTACCTTCCAA-ATTGTTTACAGTT-TT-CA--AACA-CT---------G-AGTGAT------AA-TTTATT--A-
gi|29 : GA-AAATCTGAGAAAA-A-G------CAATTGGTGAGTGACAAATAACA--G-TTTATGCA--TTGTTCTTATTTTGGTTAAATTTATCTTGATCGCTTTCT--------C--------CTGAAACCTC--------GAC------CCC--T---ATCCCCTA-TACA----AAATGA------GAATTC----A-TTTTCTGACAATCCTAAC-TCAAGATATCGCTATTA---CTAAGATAGACTTATTTcttctacttttgataacgtatcaaatt
gi|3 : TCAGAAATATTGGACGTTCT-CTTTAACCTCTAGTAAATAG-TTT---------T--TATTCAAATATGAAGCGAAAA------AA----GA-AATT-T-AAAGAAGT---CCCATAATTTTTTCAT--AAGATTGCTGTTTATTTGTG-----T--TTT-T--GACAAGATTTTTAGATA-------TCTAGT-------TACCATCCAACAATT-TTATTTTT-TT-TA--AAAGGCT---------A-AGTGAT------AATGTTATT--A-GTTACTGTAATGTTTTA----T----AATTAT----A-AA-AT----AT-CC-A-AGAT-AA-AA-TT------ACAGTAAGTTTAATACTATGTTG--------CCA-C------GTCAG-CCTACCTTTAAAGTACTGCTTTGGTAACGATGGTTATAAAATAAAGCATAGTTTT---GAATCCAAAAATAAAAAAAC-TAGAGTGAGC--TGTGTCACACTCGAG-AGTTGA-AAATAAGAAAAAAAA-GAGAGAACAATTGATGAATGAAAATTAACAATA-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTAGTGAATTTTATCTTGACCTCTTTTT--------C--------CCTAAACCTC--------GAC------CCC--CT--ATTCCTCA-AACA----AAATTA------GTATTC----C-CTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---CTAAAATAGCATTATTta
gi|30 : TAT-AA--TATATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAAATGATAAGTGTC---------------------CATTG-TTACTTTT-TT-CT--AACA-TT---------A-AGTAAT------AA---TATT--A-TT------AATGTTCCA----TAACAA----C----A-AA-AT----TT-CCAA-AAAT-AAGAA-C-------TCGGTAAAct
gi|31 : GATATGTTGGAA--------TTAACCTCTGGTAAGTAG-CTT---------T--TATTTAGCTATGAAGTG-AAA------AAGGA-AA---TT-T-AAAA---A---CCCATAATCT-AT-AT--AAGATTGCTGTTTATTTATA-----A--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGAT
gi|32 : GATGTTGGACGTTTTTCTT-AAC-----GTAAATA--TTT---------T--TATTT-----T-AAGTGGAAATTTTTT-----------TT-T-AAAGGAGA---CCCATATTTTTAT-AT--TAAATTCCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TT-AACATGAGTTTGAAATGtacgcttagt
gi|33 : TGAAAGTGTTCTTGATCTATTGCT--------C--------C--------CTATACCTAGAC------CCC------ATCCCCCA-AACG----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTAACAATTAGAAC-T-AAGATACCGCTATTA---CTAAGATAGTATTATT
gi|34 : AAATGTTGGAC-TTTTTCTT-AAAATTTGGTAAATAG-GTT---------T--TATTTAAATATGAAGTG-------------GA-AA-AATT-A-AAAGGAGA---CCTATAATATTAT-AT--TAGATTcta
gi|35 : ----AAAT-A------TTATTG------TTTCCTGACAATTTGAGC-TCCAGATACTGCTTTTA---TTAAGATAGCATTATT
gi|36 : aacaattggtgatCA-AACA----ATATGA------GTATTCATTCC-TTTTCTGACAATTAGAAC-ACAAGATACCGCTATAA---CTAGGATAGctct
gi|37 : TTCCCCA-AACA----AAAAGA------GTATTC----A-TTTTCTGACGATCAAAGC-TCAAGAAACCGATATTT---CTca
gi|38 : cacggTAT-AT--TAAATTGCAGTTTATCTATGGGCTTT--TTT-TT-AACAAGAGCTTAAGATGATA
gi|4 : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAGATAG-TTT---------T--AATTTAAATATGAAGTGGGAA------AACGA-GATAATG-T-AAAGGAGA---CCTATAATATCAT-AT--TAAATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-TT-ATCAAGAATTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACGTTT-TT-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------ACTTTTATA--A-GT------AATGTTCCA----------------------A-AT----GT-CG-A-AGAT-AA-A----------ACAGTAAATTTAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACGTTTAAAATAATGCTTTTAAGAAGATGGTGATCCAATGAAGCATATTTTT--ATAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCAGGG--TCTGTCAATTTCAAG-AGTTGA-ACATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAGTTGTTGAGGGTAAAGTAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAAAATTGATCTTGGTCATTTTCT--------C--------C--------C--------AAT------CCC--C---ATCCCCAA-AACA----CAATTA------GTATTT----C-CTTTCTGACAATAATAAC-TTGAGATACCGCTATTA---CTAAGATATACTTATTT
gi|5 : CAGAGATGTTAAACGTTTTCCTG-AATCTCTTGTTACTAG-TTT---------T--TGTTTAAATATGAATAGGAAA------AA--A-AT-AATT-T-TTTCTAGA---CCAACCATTTTAT-ATATTA-ATTGCTG--------CG-----T--TT------ACAAATGTTTGAGATGATAAGTGACTCCT-------TATCTTCCATTAATG-TTATTATT-TT-CA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AATTTTATCAAA-GT------AATGTTCCA----T----AAT--T----ACAATAT----GT-CC-A-ATCT-AA-AA-TTTGTAAAACAGTAAATTTGATGATATATTG--------CGA-C------ATCAA-CCTACCCTTTA-ATAATGCTTTTGTAACGATGGTAATAACATG------AGTT---------C--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGC--TATGTCACTTTCAGG-AGTTGA-AAATCTGA-AAAA-A-GATAGAACAGTTGGCGAGTGACAAATAACAGTA-TTTATGCA--TTATTCTAA-----GTTAA----ATCTTGACTATTTTCT--------CATTAAA--C--------CTT------GA-------CTT--T---GTGCCCTA-AACA----AAATGA------GTAATC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATAACGGTATTA---CTAAGATAGCATTATT
gi|6 : AAATAG-TTT---------T--AATGTAAATATGAAGTTGAAA------AAAAAGAA-AATT-T-AAAGGAGT---TCCACAATAGCAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-T--AACAAGCGTTTGCTATGTTAAGTGTCTATT-------CACTTTCAAACAGTG-TCAGTTTT----CA--AACA-CT---------T-TGTGAT------TATTTTATT--G-GT------AATGTTTCACAATT----A----C----A-AA-AT----GT-CC-A-ATGT-AA-GGAC-------ACAGTAAAATTAACAACATATTG--------CCAGCATATAAGTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGATTTAGTAGTGATGGTAATACAATAAAGCAAAATTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCgt
gi|6 : cCGGGGC-TAAGTCACTTTCAAG-ATTTGA-AAATCTAAAAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAGATGATCATGATTT---C---TTGTTCC--CT------AAA-----CCCGACCCC-----------------------------------------A-------CCC--C---ATCCCCCCTAACA----ATATGA------GTATTA----C-TTTTCTTACAA-CATAacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccggggctaagtcactttcaagatttgaaaatctaaaaaaaagagagaacaattggtgagtgacagatgatcatgatttcttgttccctaaacccgaccccaccccatcccccctaacaatatgagtattacttttcttacaacata
gi|7 : caaatagttttaatgtaaatatgaagttgaaaaaaaagaaaatttaaaggagttccacaatagcatattagattgctgtttatttacatttttaacaagcgtttgctatgttaagtgtctattcactttcaaacagtgtcagttttcaaacactttgtgattattttattggtaatgtttcacaattacaaaatgtccaatgtaaggacacagtaaaattaacaacatattgccagcatataagtcagcatgcctttgagataatgatttagtagtgatggtaatacaataaagcaaaattttagaaccaaaatacaactagagcacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctcGTAAATAT-TTT---------T--TGTTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-C-AAAGGACA---CCCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTT-------------------TT-A-CAAGAGTTTGAGTTGATAAGTGTTTATT-------TACCTGCCATCAATA-T-ACTTTT-TTTCA--AACA-CT---------A-AGTGAT------CAATTTATT--A-GT------AATGCTCCA----T----AATTAC----A-AA-AT----GT-CC-A-AGAT-AA-AAAC-------ATAGTAAATTTAATAATATATTG--------CAA-C------GTCTG-CTTACCATTAAATTCATGCTTTTGTAACGATGGTGATAAAACGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAACTAAAA---C-TACAGCGGGT--GATGCCACTTTTAAG-AGTTGA-AAATATGACAAAA-A-GAGAAAACAATTGGT-AGTGACAAATAACAGTA-TTTATTCA--TTGTTCTAATTTTAATGCCATTGATATT-ACCTCTTTCTGCTTAAACC--------T--------C--------GAC------CAC--C---ATCCCTTA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAACCATAAC-TCAAAATAACACTATTA---CTAAGATAGCATTATT
gi|8 : tcTCAGAGATGTTGGACGTTTTTC-TTAACCTTTGATAACTAG-TTT---------TAATAATTTTATATGAGATAGcttt
gi|8 : ATAATTTTAT-AT--GAGATAGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGACTTTGACATGATAAGAGTCAACT-------TACATTCCAACAACG-CTA-TTTT-TT-TA--AACA-CT---------A-AGTGAT------AA-TTTGTC--A--T------AAT----------T----A----C----A-AA-AT----GT-CC-A-AGATAAA-AA-C-------ACAGTAAATTTAATAATATGTTG--------CGA-G------ATCAATCGT-CCTTTAGTTTAATGTTTTTGTAGCGATGATCTTAAAATGAAGCATAGTTTTTCACCCCC--AAAATAAAG---CGTA-AGAGGGC--TAT-TCACTCTTAAG-AGTTGT-AAATTTGAGAAAA-A-GAAAGAACAATTGTTGAGTGACAAGTAACAGTA-TTTATG-A--T--------TTTTGGTTAAATTGATCTTGACC-CTTTCT--------C--------CCTACACCTC--------AAC------CCC--C---ATCCACCG-AACA----AAAAGT------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAA-TC-ATATACCGCTATTA---Cctgtttatttacgttttttaacaagactttgacatgataagagtcaacttacattccaacaacgctatttttttaaacactaagtgataatttgtcataattacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttaataatatgttgcgagatcaatcgtcctttagtttaatgtttttgtagcgatgatcttaaaatgaagcatagtttttcacccccaaaataaagcgtaagagggctattcactcttaagagttgtaaatttgagaaaaagaaagaacaattgttgagtgacaagtaacagtatttatgatttttggttaaattgatcttgaccctttctccctacacctcaacccccatccaccgaacaaaaagtgtattccttttctgacaatcataaatcatataccgctattacacgtatcaaaataacattattatatt
gi|9 : tcagagatgttggacgtttttcttaacctttgataactagttttaATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACG--AA-AATT-T-Aacgtatcaaaataacattattatatt
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTACG-----T--TTT-TTTAACATGAGTTGGAGATGATATGTGTCTACT-------TACCTTTCAACATTA-TTCCTCTT-TA-CA--AACA-AT---------A-AGCGAT------AATTGTATT--A-GT------AATGTTCCA----T----A----CTAACA-AA-AT----GT-CC-A-AGGT-AA-AAAC-------ACAATAAATTCAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACCTTTACAATAATGCTTTTATAAAGATTGTGATACAATGAAGCATAGTTTT--AGATCC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGAGG--TATGTCACTTTCAAA-TGTTGA-AAATCTGAGAAAA-AGGAGAGAACACATGGGAAGTGAAAATTAACAATG-TTTATGCA--TCGTTCTAATTCTAGTAAAATTAATCTTGATTACTTTCT--------TACTAAA--C--------C--------TACA-----CCC--C---TTCCTCCA-AACA----AAATGA------GT-------------------AATTGTAAT-TCAAGATACCGCAAATA---CTAAGATAGACTTATTTcgtttttttaacatgagttggagatgatatgtgtctacttacctttcaacattattcctctttacaaacaataagcgataattgtattagtaatgttccatactaacaaaatgtccaaggtaaaaacacaataaattcagtaatatattgcgacgtcagcatacctttacaataatgcttttataaagattgtgatacaatgaagcatagttttagatccaaaataaaactagagcgaggtatgtcactttcaaatgttgaaaatctgagaaaaaggagagaacacatgggaagtgaaaattaacaatgtttatgcatcgttctaattctagtaaaattaatcttgattactttcttactaaacctacaccccttcctccaaacaaaatgagtaattgtaattcaagataccgcaaatactaagatagacttattttatt
Alignments
lowQualScore : 1 1 11111111 444444444444444444 11111 22222222 77777777777777777777777777
lowQualScore : 0 0 9 2 888888888 22 1 555555 6666 1 1 1 1 333 2 1 22 0 00000000 1 55 9999999 1 1 5 1 1 1 22 1 22 555555 3333 5555555 000000000000000000 66 3333 3 1 3 7 1 22222 7777777 22222222 2 666666 2 1 3 2 2 0 33 55 444 2 2 4 1 5 2 22 1 2 4 22 88888888888888888888888888 1 44444 1 1 3333 0 444444 3333 1 1 1 333 555555
lowQualScore : . . . . ......... .. . ...... .... . . . . ... . . .. . ........ . .. ....... . . . . . . .. . .. ...... .... ....... .................. .. .... . . . . . ..... ....... ........ . ...... . . . . . . .. .. ... . . . . . . .. . . . .. .......................... . ..... . . .... . ...... .... . . . ... ......
lowQualScore : 2 7 0 2 444444444 99 7 555555 9999 8 0 8 8 333 6 5 00 4 99999999 5 77 0000000 5 7 8 7 7 7 33 7 44 000000 7777 7777777 111111111111111111 88 9999 6 8 6 3 8 00000 7777777 99999999 1 111111 0 3 1 1 3 6 22 66 444 5 2 0 8 5 0 88 3 5 7 66 44444444444444444444444444 9 88888 9 7 5555 8 888888 5555 7 1 7 333 555555
consensus : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATT--A-G--T------AATGTTC----CA-------TAAT-AC---------------A--AAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCT--TTCTC------CCTA-A------C----C--GAC-CC-----CC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
Reference ( family-913 ) : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATT--A-G--T------AATGTTC----CA-------TAAT--C---------------A--AAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCNCT--TTCTC------C----A------C----C--GAC-CC-----CC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
gi|1 : GACATGTTTAATATTTTTCTT-AACCTCTAGTAAAAAT-TTT---------T--TGTCTAAATATGAAGTA-AAA------AATGG-GA-AATA-T-AAAGGAGA---C--ACAACTTTAT-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACG-----TGTTTT-TT-TACAACAGCTTGAGAAAGTAAGTGTCCACT-------TACCTTTCAAGATTG-TAATTTTTCTT-CAAACA-CGTATTAATATTTTTATC--A-G--T------AATGTTC----CA-------TAATTAC---------------A--AAAT----GT-CT-A-AAGT-A-ATG-A-C-------ACAGTTAATTTAATAATATATTGTAAGTTTGCGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGCTTT-TGTAATGATGGTGATACAAGGAAGCATATTTTA--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|1 : GGGT-TTTGTCGCTT-CAAG-AGTTGAGAAATCTGAGAACAA-GATAGAGCAATTGGTGAGTGACAAATGTCAGTG-T--GTG----------TAATTTTAGTGAAAGAGATATTAACCTCA--TGCTT------A----AAC----C----C--AAC-CA-----GT-ATCCCCCA-CACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAAGTATAAC-TCAAGATACCTCTATTATTGC------CAGGATAGAATTATTactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcaggggttttgtcgcttcaagagttgagaaatctgagaacaagatagagcaattggtgagtgacaaatgtcagtgtgtgtaattttagtgaaagagatattaacctcatgcttaaacccaaccagtatcccccacacaatatgagtattccttttctgacaagtataactcaagatacctctattattgccaggatagaattattcta
gi|10 : gacatgtttaatatttttcttaacctctagtaaaaattttttgtctaaatatgaagtaaaaaatgggaaatataaaggagacacaactttatattagactgctgtttatttacgtgtttttttacaacagcttgagaaagtaagtgtccacttacctttcaagattgtaatttttcttcaaacacgtattaatatttttatcagtaatgttccataattacaaaatgtctaaagtaatgacacagttaatttaataatatattgtaagtttgcgacgtcagcatgcctttgagataatgcttttgtaatgatggtgatacaaggaagcatattttaagaaccaaaataaaactagagcactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcagGGTGTTGGACGTTTTATCTTAACCTCTAGTAAATAG-TTTAATATTTGAT--TATATAAATATGAAGTGTAAT------AAAGA-AA-C-TT-T-AATGGAGA---CCCACAATATAAC-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACGGT---T--TCT-TT-AA-ACGAGTTTGAGAAGATACGTGTCCGCT-------TACCTCACAACATTA-TCATTTTT---------A-GTCAGTAATATTTTTATT--A-GAAT------AGTGCTCTTTTTACTTTTATTAAT--CATTTTCCATTATTATA--AAAT----GT-CC-A-AGAT-AGA-G-A-C-------ACAGTAAATCTAAAAATATATTG--------ATT-T------GGTAG-CATGCCTTTGAGATAATTATTT-TG--ACGGTGGGAATAATATGAAGTTTAGCTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCcta
gi|10 : gcCAAG-AGTTAA-AAACCTGAGAAAAA-TAGAGAACAATTGGTGAATGACAAAactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagacaagagttaaaaacctgagaaaaatagagaacaattggtgaatgacaaa
gi|11 : gcggtgttggacgttttatcttaacctctagtaaatagtttaatatttgattatataaatatgaagtgtaataaagaaactttaatggagacccacaatataacattagactgctgtttatttacggtttctttaaacgagtttgagaagatacgtgtccgcttacctcacaacattatcatttttagtcagtaatatttttattagaatagtgctctttttacttttattaatcattttccattattataaaatgtccaagatagagacacagtaaatctaaaaatatattgatttggtagcatgcctttgagataattattttgacggtgggaataatatgaagtttagctttagaaccaaaatacaactagagcactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagaCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATT--A-G--T------TATATTC----CA-------TAAT--C---------------A--AAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAGA-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTA-TAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCT--TTCTC------CCTAAA------CCT--C--GAC-CC-----CC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATT
gi|12 : CATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATT--A-G--T------TATATTC----CA-------TAAT--C---------------A--AAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAGA-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTA-TAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCT--TTCTC------CCTAAA------CCT--C--GAC-CC-----CC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATTata
gi|13 : G-TTT---------T--TATTTGAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-C-TT-T-AAAGGATA---ACCATAATATTAT-AT--TAGATTGCTGTTTACTTACG-----G--GCT-TT-TACAAGAGTTTGAG--------TTTCTACT-------GACCTTCCAACAGTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAATTGATGATTTTATA--T-G--T------TATGTTC----CA-------TAATATC---------------A--AAAT----GT-CC-A-AGAT-T-A-A-ATC-------ATAGTAAATTAAGTAATATAATG--------CAA-C------GTCAG-CATACCTT-AAAATAATGCTTTACACAA-GATAGTGACACAATGAATTATATTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGT-TATGTCACTTTCAAG-AGAT-A-AAATCTGAGAAAAG-AAGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGAG-TTTGTGCA--TTGTTCTGACTTTGGTAAAATTGATCTTGATCATT--TTCTC------CCTAAA------CCT--C--TAA-CC-----CC-ATCCCCAA-AACA----TAATGA------GTATTC----C-TTTTATGACAATC--AACATCAAata
gi|14 : A-AATTATGAAAAAAGA---TCCACAATATTAT-AT--TAGACTG-TGTTTATTTACG-----T--TTT-CT-AACAAGAGTTTGAGATGGTAAGTGTTCATT-------TACTTTCCAACATTG-TCATTTTT-TA-CAATCA-CGAAGTAATAATTTTATA--A-G--C------ATTGTT-----CA-------TAAT--T---------------AC-AAAT----GT-CT-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ATAGTAAATTTAATAATGTA-TG--------TGA-C------GTCAG-TATGCCTTT
gi|14 : aatGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-ATATCTGAAAAAAA-GAGAAAACCATTGGTGAGTGACAAATAACAGTG-TTCATGCA--TTGTTTTAATTTTGGTGAAAGTAATTTTGACCTTT--TGCTC------CT---AAACC--C----C--GAC-CC-----CC-A-CCAACA-AACA----ATATGC------GTATGC----C-TTTTCAGTGAATTAGAAA-TT-AGATAactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcaggggctatgtcactttcaagagttgaatatctgaaaaaaagagaaaaccattggtgagtgacaaataacagtgttcatgcattgttttaattttggtgaaagtaattttgaccttttgctcctaaaccccgacccccaccaacaaacaatatgcgtatgccttttcagtgaattagaaattagata
gi|15 : aataaattatgaaaaaagatccacaatattatattagactgtgtttatttacgttttctaacaagagtttgagatggtaagtgttcatttactttccaacattgtcattttttacaatcacgaagtaataattttataagcattgttcataattacaaatgtctaagataagggcatagtaaatttaataatgtatgtgacgtcagtatgcctttactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcagGAGATGTTGGACGTTTTC--TTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGAAAA------AAAGG-AA-AATA-T-AAAGGAGA---CC-----TTCAAT-AT--TA----------TATT------------------------GAGTTTGGGATAATGAGTGTCAAAT-------TAACTTCCATCATTG-TCA-TTTG-AC-CAAACA-CTAAGTGATAATGTTATT--ATG--T------AATGTTC----CA-------TAAT--T---------------ATAAAAT----GT-CC-A-CGAC-A-A-G-GGT-------ATAGTCAATTGAATACTATTTTG--------CGA-C------AACAG-CGTGTCTTTGACATAATGCTGT-TGTATTGATGGTGGTAAAATGAAACACTG-TTT--AAAACCA-AAAATACAA---C-TAGAAC
gi|15 : GC-TATATCAATTTTAAG-AGTTGG-AAATAAGATAAAAA-GGAAGAACAATTGGTGAactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgctatatcaattttaagagttggaaataagataaaaaggaagaacaattggtgataaatattatt
gi|16 : gagatgttggacgttttcttaacctctggtaaatagtttttatttaaatatgaagtgaaaaaaaggaaaatataaaggagaccttcaatattatattgagtttgggataatgagtgtcaaattaacttccatcattgtcatttgaccaaacactaagtgataatgttattatgtaatgttccataattataaaatgtccacgacaagggtatagtcaattgaatactattttgcgacaacagcgtgtctttgacataatgctgttgtattgatggtggtaaaatgaaacactgtttaaaaccaaaaatacaactagaacactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtAAATATGAAGTTGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGTAAA---CCCATAATATTAC-AT--TAGATCGCTGTTTATTTACG-----G--GTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCCACT-------TACCTTCCAACAGTG-TTACTTTC-TC-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATT--A-G--T------AATGTTG----CA-------TTATAAC---------------A--AAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAGCAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTAAAATAA----------A--GATGGTGATACAATGAAGCtaaatattatt
gi|16 : TTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAAAAGGGAGAACAATTGGTGAGTGGCAAATAACAGCG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTCTGGTAAAATTGATCTTGATCACA--TTCTCCCTTAAC----A------T----C--GAC-CC-----CC-ATCGCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-Ttttcaatatttcaagagttgaaaatctgagaaaaaagggagaacaattggtgagtggcaaataacagcgtttatgcattgttctaattctggtaaaattgatcttgatcacattctcccttaacatcgacccccatcgcccaaacaaaatgagtattcct
gi|17 : aaatatgaagttgaaaaacgaaaatttaaagtaaacccataatattacattagatcgctgtttatttacgggttttaacaagagtttgagatgataagtgtccacttaccttccaacagtgttactttctccaaacactaagtgataattttattagtaatgttgcattataacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttagcaatatattgcgacgtcagcatgcctttaaaataaagatggtgatacaatgaagctttcaataC-A-CGAT-A-G-G-AGC-------ACAATACATTTAATACTGTAATG--------TGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGACATACTGCTTT-TGTATTGATAGTGATAAAATGAAGCATAGTTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|17 : GGGCGTATGCCACTATCAAG-TGTTGA-AAATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAAATGATGAGTGACAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTGTAATTTTGGTGAAAGTGATCTTGACCGCT--TGCTC------CCT--AAATT--C----C--AAT-CC-----TC-ATCCCCTA-AACA----TTATGT------GATTTC----C-TTTTTTGACAATTA-GAC-T-----TTTTTATATTA---T------TAGGATAGCATTATTactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccagggcgtatgccactatcaagtgttgaaaatctgagaaaaagagagaacaaatgatgagtgacaaataacagtgtttatgcattgttgtaattttggtgaaagtgatcttgaccgcttgctccctaaattccaatcctcatcccctaaacattatgtgatttccttttttgacaattagacttttttatattattaggatagcattattg
gi|18 : cacgataggagcacaatacatttaatactgtaatgtgacgtcagcatgcctttgacatactgcttttgtattgatagtgataaaatgaagcatagtttcagaaccaaaataaaactagagcactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccaAG-CCTACCTTTAAATCAATGCTTT-TGTAACAATGGTGATAAAATGAAGTATAATTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGTGGGC-TTTGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGATAAAAA-GTGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGTA-TTTATGCA--TTGTTCTAGTTTGGGTGAAATTGATCTTGTCCTCT--TTCTC------CTTAAA------C----CTTGAC-CC-----CC-ACCCCGCA-AACA----AAATGAGTACCGGTATTC----C-TCTCATGACAATCATA----------ACCACTATTA---C------TAAGATAGCATTATTg
gi|19 : acaataagatatataaccccgtacataaagtatgttatttttatgcaatatatttgcatatgtatattaaaacctgtgttttttacacaagAACAATGATGATAAAATGAGGCAAAGTTGT--AGAATC--AAAATACAA---C-TAGAGCctctt
gi|19 : GGGC-TATGTCATTTTCAAG-AGTTTA-AAATCTGAGAAAAA-GAGATAACAATTGGTGTGTGACAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTT-GTGAAAGTGGTCGTGATTTCTTATTCCC------T----AAACC--C----C--GA--CC-----CA-ATCCCTCA-AATA----ATATGA------GTTTTC----C-TTTTCTGACAATTATAAC-TCAAGATACCGCAATTA---C------TTGGATAGCATTATTTacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcgggggctatgtcattttcaagagtttaaaatctgagaaaaagagataacaattggtgtgtgacaaataacagtgtttatgcattgttctaattttgtgaaagtggtcgtgatttcttattccctaaaccccgacccaatccctcaaataatatgagttttccttttctgacaattataactcaagataccgcaattacttggatagcattatttta
gi|2 : aacaatgatgataaaatgaggcaaagttgtagaatcaaaatacaactagagcacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcggAGAGATATTGGACGTTTTTCTT-AACCTCTGGTAAATAG-ATT---------T--TATTAATATATGATATTTTTA------TATGA-AA-A--T-T-AAAAAAAAATATTCACGATATTAT-AT--TAGACTGCTGTTTA---A--------------TT-AAC-AGAGTTTG-------AAGTATCCACT-------TAGTTTACAATATTG-TCA-TTTT-TT-CAAACA-CTAA---ATAATT-----------------------TTC----CA-------TAAT--TAA-------------A--AAAT----GT-CC-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ACAGTTAATTTTATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-TATACA-ATGAGATAATGCTTT-TATAATGATGGTGACACAAGGAAGCATAGGTTT--AGAATC--Ata
gi|2 : GAGC-TGTGTCACTTTTAAG-AGTGGA-GCATCTGTGAAAAC-TAGAGAACAATCGGTGAGTAAAAAATAA--GTG-TTTATGCA--TTGTTCTGATTTGGGTGAAAGTGATCTTGACCTCT--TACTC------C----ATAAACTC----C--GAC-CA-----C--ATAACCCA-AACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATTAGAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAGGGTAGCATTATCTtagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagctgtgtcacttttaagagtggagcatctgtgaaaactagagaacaatcggtgagtaaaaaataagtgtttatgcattgttctgatttgggtgaaagtgatcttgacctcttactccataaactccgaccacataacccaaacaatatgagtattccttttctgacaattagaactcaagataccgctattactagggtagcattatcta
gi|20 : agagatattggacgtttttcttaacctctggtaaatagattttattaatatatgatatttttatatgaaaattaaaaaaaaatattcacgatattatattagactgctgtttaattaacagagtttgaagtatccacttagtttacaatattgtcattttttcaaacactaaataattttccataattaaaaaatgtccaagataagggcacagttaattttataatatattgcgacgtcagtatacaatgagataatgcttttataatgatggtgacacaaggaagcataggtttagaatcatagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcagGT-TATGTCACTTTCAAG-AACTAA-AAATCCGAGAAAAA-GAGAGATCAATTGGTCAGTGACAAATAGCAGTG-CTTATG-ATTTTTTTCTTATTTTGGTGAAAGTAATCTTGACCTCT--TGCC-------------------C----C--GAC-CC-----CT--TCCTCCA-AACA----GTATGA------GTAGTC----T-TCTTCTTGTAATTAGAAC-TCAAGATACCGATTTAA---C------TAGGATGGCTTTATTa
gi|21 : aacaaaaaaaacctagagccctgaaagggcaacaagagcctcgtagtgtgcctgactctatatcccattggctttggtcacaacattaattctgtctcaggtT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----TG-TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGGTGATAAGGGTCTTCT-------TACCTTCCAGCATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATG--A-G--T------AATGTTC----CA-------TAATAAC---------------A--AAGT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-ATC-------ACAGTTAATTTAGTAATATATTG--------CTA-C------ATCAG-CATACCTTTGAAATAAAGCCTT-TAAAAAGATGCTGATTCAATGAAGCATActa
gi|21 : ATAAGCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGAGAGACTTATTagcataactcaagataccgctattactaagagagacttattctatt
gi|22 : tattagattgctgtttatttatgtgtttttaacaagagttggaggtgataagggtcttcttaccttccagcattgttacttttttcaaacactaagtgataattttatgagtaatgttccataataacaaagtgtccaagataaaatcacagttaatttagtaatatattgctacatcagcatacctttgaaataaagcctttaaaaagatgctgattcaatgaagcA-ATATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAATTGGTTAGTGGCAAATAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAGCATTGATCTTGATCACT--TTCTT------C----A------A----T--AAC-CTCGACACT-ATCACACA-AACAAAATAAATGA------GTATTC----CTTTTTCTGAAAATCATGAC-TTAAGATACAGTAATTG---C------TAAGATActatt
gi|23 : tgataaagaatatgatagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATATTAGACGTTTTTCGT-AGCCACTGTTAAATAGTTTT---------T--TATTTAAATTTAAAGTGGTAA------AAC-A-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCACAATATTAT-AT--TATATTGCTGTTTGTTTGCG-----G--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTAC-ATT-TT-CAAACA-CTAAGGGATAATTGTATT--A-G--T------AATATTC----CA-------TAATAAC---------------A--AAAT----GT-CA-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTTAAtacttatgtt
gi|24 : CAGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AATCTCCGGTTTATAG-CTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCTATAAT---AT-AT--TAAAGTGCTATTTATTTACG-----T--TTTTTT-AACAAGAGCTGGAGATGATAAGTATCTATC-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-AGAAGA-CTCAGTGATAATTTTATT--A-G--T------AATGTTC----CA-------TAAT--A---------------A--AAATAAGGGT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACA
gi|25 : TAAATAA-GTT---------T--TAAATAAATATGAAGTGGA-------------------TT-T----------------TTATTTTAC-AT--TTAACTGCTGGGTATTTACA-----C--TTT-T--AACACGAGTTTGAGGTGATAAGTGT-----------------TCTA----------------TT-CAAACA-TTAAGTGATA-TTTTACT--G-G--T------AATGTTC----CA-------TACTTAC---------------A--AAAT----GT-CC-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ACAGTAAATT---TAATATATTG--------CAT-C------TTCAG-CATGCCTTTGAGATAACGCTTT-TGTAATGGTGGTGATAAAA
gi|26 : aATTTAAATAGGAAGTGGAAA------AATGA-AA-ACTT-C-AA-GGAGA---CCCATAATATTAT-AT--CATATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TC-AACAAGATTTGGAGATGATAAGTGTTTGCT-------TACTTTCTAACATTG-TTACTTTT-TT-TGACCA-CTAAGTGATGATATTATT--A-T--T------AATGTTC----CA-------TAATAAC---------------A--AAAT----GT-Caatg
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCCATAATATTAT-GT--TACATTGCTTTTTATTTACG-----G--TTT-T--AACAAGAGTTGGAGATGATAAGTGTCTACTGGCT---TACCCTCCAACATTG-TTGCTTTT-AT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATT--A-C--T------AAGGTTC----CA-------TAAT--
gi|28 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AACATCTGGTAAATAG-TTT---------T--TTATTATATATGAAGT------------------A-AATG-T-AAA----------CATACTTTTAT-AT--TAGAT-GCTGCTTATTTACG-----GAATAT-TT-AACACGAATTGGAGAT---AAGTGTCTACTTAGTACTTACCTTCCAA-ATTGTTTACAGTT-TT-CAAACA-CTGAGTGATAA-TTTATT--A-aa
gi|29 : GA-AAATCTGAGAAAAA-G------CAATTGGTGAGTGACAAATAACAGT---TTATGCA--TTGTTCTTATTTTGGTTAAATTTATCTTGATCGCT--TTCTC------CTGAAA------C----CTCGAC-CC-----CT-ATCCCCTA-TACA----AAATGA------GAATTC----A-TTTTCTGACAATCCTAAC-TCAAGATATCGCTATTA---C------TAAGATAGACTTATTTcttctacttttgataacgtatcaaatt
gi|3 : TCAGAAATATTGGACGTTCT-CTTTAACCTCTAGTAAATAG-TTT---------T--TATTCAAATATGAAGCGAAAA------AA----GA-AATT-T-AAAGAAGT---CCCATAATTTTTTCAT--AAGATTGCTGTTTATTTGTG-----T--TTT-T--GACAAGATTTTTAGATA-------TCTAGT-------TACCATCCAACAATT-TTATTTTT-TT-TAAAAGGCTAAGTGATAATGTTATT--A-G--TTACTGTAATGTTT----TA-------TAAT--T---------------ATAAAAT----AT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-TT------ACAGTAAGTTTAATACTATGTTG--------CCA-C------GTCAG-CCTACCTTTAAAGTACTGCTTT-GGTAACGATGGTTATAAAATAAAGCATAGTTTT---GAATCCAAAAATAAAAAAAC-TAGAGTGAGC-TGTGTCACACTCGAG-AGTTGA-AAATAAGAAAAAAAAGAGAGAACAATTGATGAATGAAAATTAACAATA-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTAGTGAATTTTATCTTGACCTCT--TTTTC------CCTAAA------C----CTCGAC-CC-----CCTATTCCTCA-AACA----AAATTA------GTATTC----C-CTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAAATAGCATTATTta
gi|30 : TAT-AA--TATATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAAATGATAAGTGTC---------------------CATTG-TTACTTTT-TT-CTAACA-TTAAGTAATAA---TATT--A-T--T------AATGTTC----CA-------TAACAAC---------------A--AAAT----TT-CCAA-AAAT-A-AGA-A-C-------TCGGTAAAct
gi|31 : GATATGTTGGAA--------TTAACCTCTGGTAAGTAG-CTT---------T--TATTTAGCTATGAAGTG-AAA------AAGGA-AA---TT-T-AAAA---A---CCCATAATCT-AT-AT--AAGATTGCTGTTTATTTATA-----A--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGAT
gi|32 : GATGTTGGACGTTTTTCTT-AAC-----GTAAATA--TTT---------T--TATTT-----T-AAGTGGAAATTTTTT-----------TT-T-AAAGGAGA---CCCATATTTTTAT-AT--TAAATTCCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TT-AACATGAGTTTGAAATGtacgcttagt
gi|33 : TGAAAGTGTTCTTGATCTAT--TGCTC------CCTATA------C----CTAGAC-CC-----C--ATCCCCCA-AACG----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTAACAATTAGAAC-T-AAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGTATTATT
gi|34 : AAATGTTGGAC-TTTTTCTT-AAAATTTGGTAAATAG-GTT---------T--TATTTAAATATGAAGTG-------------GA-AA-AATT-A-AAAGGAGA---CCTATAATATTAT-AT--TAGATTcta
gi|35 : ----AAAT-A------TTATTG------TTTCCTGACAATTTGAGC-TCCAGATACTGCTTTTA---T------TAAGATAGCATTATT
gi|36 : aacaattggtgatCA-AACA----ATATGA------GTATTCATTCC-TTTTCTGACAATTAGAAC-ACAAGATACCGCTATAA---C------TAGGATAGCActct
gi|37 : TTCCCCA-AACA----AAAAGA------GTATTC----A-TTTTCTGACGATCAAAGC-TCAAGAAACCGATATTT---C------
gi|38 : cacggTAT-AT--TAAATTGCAGTTTATCTATGGGCTTT--TTT-TT-AACAAGAGCTTAAGATGATA
gi|4 : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAGATAG-TTT---------T--AATTTAAATATGAAGTGGGAA------AACGA-GATAATG-T-AAAGGAGA---CCTATAATATCAT-AT--TAAATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-TT-ATCAAGAATTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACGTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATACTTTTATA--A-G--T------AATGTTC----CA---------------------------------AAT----GT-CG-A-AGAT-A-A-A-A-C-------A--GTAAATTTAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACGTTTAAAATAATGCTTT-TAAGAAGATGGTGATCCAATGAAGCATATTTTT--ATAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCAGGG-TCTGTCAATTTCAAG-AGTTGA-ACATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAGTTGTTGAGGGTAAAGTAACAGTG-TTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAAAATTGATCTTGGTCATT--TTCTC------------------C----C--AAT-CC-----CC-ATCCCCAA-AACA----CAATTA------GTATTT----C-CTTTCTGACAATAATAAC-TTGAGATACCGCTATTA---C------TAAGATATACTTATTT
gi|5 : CAGAGATGTTAAACGTTTTCCTG-AATCTCTTGTTACTAG-TTT---------T--TGTTTAAATATGAATAGGAAA------AA--A-AT-AATT-T-TTTCTAGA---CCAACCATTTTAT-ATATTA-ATTGCTG--------CG-----T--TT------ACAAATGTTTGAGATGATAAGTGACTCCT-------TATCTTCCATTAATG-TTATTATT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATCAAA-G--T------AATGTTC----CA-------TAATTAC---------------A--ATAT----GT-CC-A-ATCT-A-A-A-A-TTTGTAAAACAGTAAATTTGATGATATATTG--------CGA-C------ATCAA-CCTACCCTTTA-ATAATGCTTT-TGTAACGATGGTAATAACATG------AGTT---------C--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGC-TATGTCACTTTCAGG-AGTTGA-AAATCTGA-AAAAA-GATAGAACAGTTGGCGAGTGACAAATAACAGTA-TTTATGCA--TTATTCTAA-----GTTAA----ATCTTGACTATT--TTCTCATTA--A----A------C----CTTGA--CT-----TT-GTGCCCTA-AACA----AAATGA------GTAATC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATAACGGTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|6 : AAATAG-TTT---------T--AATGTAAATATGAAGTTGAAA------AAAAAGAA-AATT-T-AAAGGAGT---TCCACAATAGCAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-T--AACAAGCGTTTGCTATGTTAAGTGTCTATT-------CACTTTCAAACAGTG-TCAGTTTT----CAAACA-CTTTGTGATTATTTTATT--G-G--T------AATGTTT----CA-------CAATTAC---------------A--AAAT----GT-CC-A-ATGT-A-A-GGA-C-------ACAGTAAAATTAACAACATATTG--------CCAGCATATAAGTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGATTT-AGTAGTGATGGTAATACAATAAAGCAAAATTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCgt
gi|6 : cGGGC-TAAGTCACTTTCAAG-ATTTGA-AAATCTAAAAAAAA-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAGATGATCATGATTT---C---TTGTTCC--CT------AAA-----CCCGACC---------C------C----A------------------CC-----CC-ATCCCCCCTAACA----ATATGA------GTATTA----C-TTTTCTTACAA-CATAacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccggggctaagtcactttcaagatttgaaaatctaaaaaaaagagagaacaattggtgagtgacagatgatcatgatttcttgttccctaaacccgaccccaccccatcccccctaacaatatgagtattacttttcttacaacata
gi|7 : caaatagttttaatgtaaatatgaagttgaaaaaaaagaaaatttaaaggagttccacaatagcatattagattgctgtttatttacatttttaacaagcgtttgctatgttaagtgtctattcactttcaaacagtgtcagttttcaaacactttgtgattattttattggtaatgtttcacaattacaaaatgtccaatgtaaggacacagtaaaattaacaacatattgccagcatataagtcagcatgcctttgagataatgatttagtagtgatggtaatacaataaagcaaaattttagaaccaaaatacaactagagcacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccgGTAAATAT-TTT---------T--TGTTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-C-AAAGGACA---CCCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTT-------------------TT-A-CAAGAGTTTGAGTTGATAAGTGTTTATT-------TACCTGCCATCAATA-T-ACTTTT-TTTCAAACA-CTAAGTGATCAATTTATT--A-G--T------AATGCTC----CA-------TAATTAC---------------A--AAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-AAC-------ATAGTAAATTTAATAATATATTG--------CAA-C------GTCTG-CTTACCATTAAATTCATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAACGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAACTAAAA---C-TACAGCGGGT-GATGCCACTTTTAAG-AGTTGA-AAATATGACAAAAA-GAGAAAACAATTGGT-AGTGACAAATAACAGTA-TTTATTCA--TTGTTCTAATTTTAATGCCATTGATATT-ACCTCT--TTCTG------CTTAAA------CCT--C--GAC-CA-----CC-ATCCCTTA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAACCATAAC-TCAAAATAACACTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|8 : tcTCAGAGATGTTGGACGTTTTTC-TTAACCTTTGATAACTAG-TTT---------TAATAATTTTATATGAGATAGcttt
gi|8 : ATAATTTTAT-AT--GAGATAGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGACTTTGACATGATAAGAGTCAACT-------TACATTCCAACAACG-CTA-TTTT-TT-TAAACA-CTAAGTGATAATTT--------G--T-----------------CA-------TAATTAC---------------A--AAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATGTTG--------CGA-G------ATCAATCGT-CCTTTAGTTTAATGTTTT-TGTAGCGATGATCTTAAAATGAAGCATAGTTTTTCACCCCC--AAAATAAAG---CGTA-AGAGGGC-TAT-TCACTCTTAAG-AGTTGT-AAATTTGAGAAAAA-GAAAGAACAATTGTTGAGTGACAAGTAACAGTA-TTTATG-A--T--------TTTTGGTTAAATTGATCTTGACC-CT--TTCTC------CCT--A------CACCTC--AAC-CC-----CC-ATCCACCG-AACA----AAAAGT------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAA-TC-ATATACCGCTATTA---CACGTATCAAAATAACATTATTctgtttatttacgttttttaacaagactttgacatgataagagtcaacttacattccaacaacgctatttttttaaacactaagtgataatttgtcataattacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttaataatatgttgcgagatcaatcgtcctttagtttaatgtttttgtagcgatgatcttaaaatgaagcatagtttttcacccccaaaataaagcgtaagagggctattcactcttaagagttgtaaatttgagaaaaagaaagaacaattgttgagtgacaagtaacagtatttatgatttttggttaaattgatcttgaccctttctccctacacctcaacccccatccaccgaacaaaaagtgtattccttttctgacaatcataaatcatataccgctattacacgtatcaaaataacattattatatt
gi|9 : tcagagatgttggacgtttttcttaacctttgataactagttttaATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACG--AA-AATT-T-Aatatt
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTACG-----T--TTT-TTTAACATGAGTTGGAGATGATATGTGTCTACT-------TACCTTTCAACATTA-TTCCTCTT-TA-CAAACA-ATAAGCGATAATTGTATT--A-G--T------AATGTTC----CA-------TACTAAC---------------A--AAAT----GT-CC-A-AGGT-A-A-A-AAC-------ACAATAAATTCAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACCTTTACAATAATGCTTT-TATAAAGATTGTGATACAATGAAGCATAGTTTT--AGATCC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGAGG-TATGTCACTTTCAAA-TGTTGA-AAATCTGAGAAAAAGGAGAGAACACATGGGAAGTGAAAATTAACAATG-TTTATGCA--TCGTTCTAATTCTAGTAAAATTAATCTTGATTACT--TTCTTA-----CTAA-A------C----C--TACACC-----CC-TTCCTCCA-AACA----AAATGA------GT-------------------AATTGTAAT-TCAAGATACCGCAAATA---C------TAAGATAGACTTATTTcgtttttttaacatgagttggagatgatatgtgtctacttacctttcaacattattcctctttacaaacaataagcgataattgtattagtaatgttccatactaacaaaatgtccaaggtaaaaacacaataaattcagtaatatattgcgacgtcagcatacctttacaataatgcttttataaagattgtgatacaatgaagcatagttttagatccaaaataaaactagagcgaggtatgtcactttcaaatgttgaaaatctgagaaaaaggagagaacacatgggaagtgaaaattaacaatgtttatgcatcgttctaattctagtaaaattaatcttgattactttcttactaaacctacaccccttcctccaaacaaaatgagtaattgtaattcaagataccgcaaatactaagatagacttattttatt
Alignments
lowQualScore : 1 1 11111111 11111111111111111 2 1 22222222 444444
lowQualScore : 0 0 9 2 888888888 22 1 555555 6666 1 1 1 1 333 2 1 22 0 00000000 1 55 9999999 1 1 5 1 1 1 44 22 555555 22222222222222222 66666666 5 0 3 3333 3 1 3 7 1 7 1 2 7777777 22222222 2 666666 2 1 3 2 2 0 33 55 444 2 2 4 1 5 1 22 0 0 4 333 3 3 222222 77 6666 33 1 3333 0 444444 3333 1 1 1 333 555555
lowQualScore : . . . . ......... .. . ...... .... . . . . ... . . .. . ........ . .. ....... . . . . . . .. .. ...... ................. ........ . . . .... . . . . . . . . ....... ........ . ...... . . . . . . .. .. ... . . . . . . .. . . . ... . . ...... .. .... .. . .... . ...... .... . . . ... ......
lowQualScore : 2 7 0 2 444444444 99 7 555555 9999 8 0 8 8 333 6 5 00 4 99999999 5 77 0000000 5 7 8 7 7 7 00 44 000000 22222222222222222 33333333 2 9 5 9999 6 8 6 3 8 3 8 7 7777777 99999999 1 111111 0 3 1 1 3 6 22 66 444 5 2 0 8 5 6 88 1 1 2 666 8 8 222222 99 0000 33 7 5555 8 888888 5555 7 1 7 333 555555
consensus : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCC-C-T-A-AACCC--C--GAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
Reference ( family-913 ) : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCC-C-T-A-A---C--C--GAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
gi|1 : GACATGTTTAATATTTTTCTT-AACCTCTAGTAAAAAT-TTT---------T--TGTCTAAATATGAAGTA-AAA------AATGG-GA-AATA-T-AAAGGAGA---C--ACAACTTTAT-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACG-----TGTTTT-TT-TACAACAGCTTGAGAAAGTAAGTGTCCACT-------TACCTTTCAAGATTG-TAATTTTTCTT-CAAACA-CGTATTAATATTTTTATCA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAAAAT----GT-CT-A-AAGT-A-ATG-A-C-------ACAGTTAATTTAATAATATATTGTAAGTTTGCGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGCTTT-TGTAATGATGGTGATACAAGGAAGCATATTTTA--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|1 : GGGT-TTTGTCGCTT-CAAG-AGTTGAGAAATCTGAGAACAA-GATAGAGCAATTGGTGAGTGACAAATGTCAGTGT--GTG----------TAATTTTAGTGAAAGAGATATTAACCTCATGCT-----T-A-AAC-C--C--AAC----CAGT-ATCCCCCA-CACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAAGTATAAC-TCAAGATACCTCTATTATTGC------CAGGATAGAATTATTactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcaggggttttgtcgcttcaagagttgagaaatctgagaacaagatagagcaattggtgagtgacaaatgtcagtgtgtgtaattttagtgaaagagatattaacctcatgcttaaacccaaccagtatcccccacacaatatgagtattccttttctgacaagtataactcaagatacctctattattgccaggatagaattattcta
gi|10 : gacatgtttaatatttttcttaacctctagtaaaaattttttgtctaaatatgaagtaaaaaatgggaaatataaaggagacacaactttatattagactgctgtttatttacgtgtttttttacaacagcttgagaaagtaagtgtccacttacctttcaagattgtaatttttcttcaaacacgtattaatatttttatcagtaatgttccataattacaaaatgtctaaagtaatgacacagttaatttaataatatattgtaagtttgcgacgtcagcatgcctttgagataatgcttttgtaatgatggtgatacaaggaagcatattttaagaaccaaaataaaactagagcactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcagGGTGTTGGACGTTTTATCTTAACCTCTAGTAAATAG-TTTAATATTTGAT--TATATAAATATGAAGTGTAAT------AAAGA-AA-C-TT-T-AATGGAGA---CCCACAATATAAC-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACGGT---T--TCT-TT-AA-ACGAGTTTGAGAAGATACGTGTCCGCT-------TACCTCACAACATTA-TCATTTTT---------A-GTCAGTAATATTTTTATTA--GAAT------AGTGCTCTTTTTACTTTTATTAATCATTTTCCATTAT-T-A-TAAAAT----GT-CC-A-AGAT-AGA-G-A-C-------ACAGTAAATCTAAAAATATATTG--------ATT-T------GGTAG-CATGCCTTTGAGATAATTATTT-TG--ACGGTGGGAATAATATGAAGTTTAGCTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCcta
gi|10 : gcCAAG-AGTTAA-AAACCTGAGAAAAA-TAGAGAACAATTGGTGAATGACAAAactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagacaagagttaaaaacctgagaaaaatagagaacaattggtgaatgacaaa
gi|11 : gcggtgttggacgttttatcttaacctctagtaaatagtttaatatttgattatataaatatgaagtgtaataaagaaactttaatggagacccacaatataacattagactgctgtttatttacggtttctttaaacgagtttgagaagatacgtgtccgcttacctcacaacattatcatttttagtcagtaatatttttattagaatagtgctctttttacttttattaatcattttccattattataaaatgtccaagatagagacacagtaaatctaaaaatatattgatttggtagcatgcctttgagataattattttgacggtgggaataatatgaagtttagctttagaaccaaaatacaactagagcactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagaCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------TATATTC-----------------CA--------TAA-T---CAAAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAGA-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCTCC-C-T-A-AACCT--C--GAC----CCCC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATT
gi|12 : CATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------TATATTC-----------------CA--------TAA-T---CAAAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAGA-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCTCC-C-T-A-AACCT--C--GAC----CCCC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATTata
gi|13 : G-TTT---------T--TATTTGAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-C-TT-T-AAAGGATA---ACCATAATATTAT-AT--TAGATTGCTGTTTACTTACG-----G--GCT-TT-TACAAGAGTTTGAG--------TTTCTACT-------GACCTTCCAACAGTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAATTGATGATTTTATAT--G--T------TATGTTC-----------------CA--------TAA-T-ATCAAAAT----GT-CC-A-AGAT-T-A-A-ATC-------ATAGTAAATTAAGTAATATAATG--------CAA-C------GTCAG-CATACCTT-AAAATAATGCTTTACACAA-GATAGTGACACAATGAATTATATTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGT-TATGTCACTTTCAAG-AGAT-A-AAATCTGAGAAAAG-AAGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGAGTTTGTGCA--TTGTTCTGACTTTGGTAAAATTGATCTTGATCATTTTCTCC-C-T-A-AACCT--C--TAA----CCCC-ATCCCCAA-AACA----TAATGA------GTATTC----C-TTTTATGACAATC--AACATCAAata
gi|14 : A-AATTATGAAAAAAGA---TCCACAATATTAT-AT--TAGACTG-TGTTTATTTACG-----T--TTT-CT-AACAAGAGTTTGAGATGGTAAGTGTTCATT-------TACTTTCCAACATTG-TCATTTTT-TA-CAATCA-CGAAGTAATAATTTTATAA--G--C------ATTGTT------------------CA--------TAATT-A-C-AAAT----GT-CT-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ATAGTAAATTTAATAATGTA-TG--------TGA-C------GTCAG-TATGCCTTT
gi|14 : aatGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-ATATCTGAAAAAAA-GAGAAAACCATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTCATGCA--TTGTTTTAATTTTGGTGAAAGTAATTTTGACCTTTTGCT-C-C-T-A-AACCC--C--GAC----CCCC-A-CCAACA-AACA----ATATGC------GTATGC----C-TTTTCAGTGAATTAGAAA-TT-AGATAactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcaggggctatgtcactttcaagagttgaatatctgaaaaaaagagaaaaccattggtgagtgacaaataacagtgttcatgcattgttttaattttggtgaaagtaattttgaccttttgctcctaaaccccgacccccaccaacaaacaatatgcgtatgccttttcagtgaattagaaattagata
gi|15 : aataaattatgaaaaaagatccacaatattatattagactgtgtttatttacgttttctaacaagagtttgagatggtaagtgttcatttactttccaacattgtcattttttacaatcacgaagtaataattttataagcattgttcataattacaaatgtctaagataagggcatagtaaatttaataatgtatgtgacgtcagtatgcctttactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcagGAGATGTTGGACGTTTTC--TTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGAAAA------AAAGG-AA-AATA-T-AAAGGAGA---CC-----TTCAAT-AT--TA----------TATT------------------------GAGTTTGGGATAATGAGTGTCAAAT-------TAACTTCCATCATTG-TCA-TTTG-AC-CAAACA-CTAAGTGATAATGTTATTAT-G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-TAAAAT----GT-CC-A-CGAC-A-A-G-GGT-------ATAGTCAATTGAATACTATTTTG--------CGA-C------AACAG-CGTGTCTTTGACATAATGCTGT-TGTATTGATGGTGGTAAAATGAAACACTG-TTT--AAAACCA-AAAATACAA---C-TAGAAC
gi|15 : GC-TATATCAATTTTAAG-AGTTGG-AAATAAGATAAAAA-GGAAGAACAATTGGTGAactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgctatatcaattttaagagttggaaataagataaaaaggaagaacaattggtgataaatattatt
gi|16 : gagatgttggacgttttcttaacctctggtaaatagtttttatttaaatatgaagtgaaaaaaaggaaaatataaaggagaccttcaatattatattgagtttgggataatgagtgtcaaattaacttccatcattgtcatttgaccaaacactaagtgataatgttattatgtaatgttccataattataaaatgtccacgacaagggtatagtcaattgaatactattttgcgacaacagcgtgtctttgacataatgctgttgtattgatggtggtaaaatgaaacactgtttaaaaccaaaaatacaactagaacactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtAAATATGAAGTTGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGTAAA---CCCATAATATTAC-AT--TAGATCGCTGTTTATTTACG-----G--GTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCCACT-------TACCTTCCAACAGTG-TTACTTTC-TC-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTG-----------------CA--------TTA-TAA-CAAAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAGCAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTAAAATAA----------A--GATGGTGATACAATGAAGCtaaatattatt
gi|16 : TTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAAAAGGGAGAACAATTGGTGAGTGGCAAATAACAGCGTTTATGCA--TTGTTCTAATTCTGGTAAAATTGATCTTGATCACATTCTCC-CTT-A-A---CATC--GAC----CCCC-ATCGCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-Ttttcaatatttcaagagttgaaaatctgagaaaaaagggagaacaattggtgagtggcaaataacagcgtttatgcattgttctaattctggtaaaattgatcttgatcacattctcccttaacatcgacccccatcgcccaaacaaaatgagtattcct
gi|17 : aaatatgaagttgaaaaacgaaaatttaaagtaaacccataatattacattagatcgctgtttatttacgggttttaacaagagtttgagatgataagtgtccacttaccttccaacagtgttactttctccaaacactaagtgataattttattagtaatgttgcattataacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttagcaatatattgcgacgtcagcatgcctttaaaataaagatggtgatacaatgaagctttcaataC-A-CGAT-A-G-G-AGC-------ACAATACATTTAATACTGTAATG--------TGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGACATACTGCTTT-TGTATTGATAGTGATAAAATGAAGCATAGTTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|17 : GGGCGTATGCCACTATCAAG-TGTTGA-AAATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAAATGATGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTGTAATTTTGGTGAAAGTGATCTTGACCGCTTGCTCC-C-T-A-AATTC--C--AAT----CCTC-ATCCCCTA-AACA----TTATGT------GATTTC----C-TTTTTTGACAATTA-GAC-T-----TTTTTATATTA---T------TAGGATAGCATTATTactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccagggcgtatgccactatcaagtgttgaaaatctgagaaaaagagagaacaaatgatgagtgacaaataacagtgtttatgcattgttgtaattttggtgaaagtgatcttgaccgcttgctccctaaattccaatcctcatcccctaaacattatgtgatttccttttttgacaattagacttttttatattattaggatagcattattg
gi|18 : cacgataggagcacaatacatttaatactgtaatgtgacgtcagcatgcctttgacatactgcttttgtattgatagtgataaaatgaagcatagtttcagaaccaaaataaaactagagcactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccaAG-CCTACCTTTAAATCAATGCTTT-TGTAACAATGGTGATAAAATGAAGTATAATTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGTGGGC-TTTGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGATAAAAA-GTGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGTATTTATGCA--TTGTTCTAGTTTGGGTGAAATTGATCTTGTCCTCTTTCTCC-T-TAA-A---C--CTTGAC----CCCC-ACCCCGCA-AACA----AAATGAGTACCGGTATTC----C-TCTCATGACAATCATA----------ACCACTATTA---C------TAAGATAGCATTATTg
gi|19 : acaataagatatataaccccgtacataaagtatgttatttttatgcaatatatttgcatatgtatattaaaacctgtgttttttacacaagAACAATGATGATAAAATGAGGCAAAGTTGT--AGAATC--AAAATACAA---C-TAGAGCctctt
gi|19 : GGGC-TATGTCATTTTCAAG-AGTTTA-AAATCTGAGAAAAA-GAGATAACAATTGGTGTGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTT-GTGAAAGTGGTCGTGATTTCTTATTCC-C-T-A-AACCC--C--GA-----CCCA-ATCCCTCA-AATA----ATATGA------GTTTTC----C-TTTTCTGACAATTATAAC-TCAAGATACCGCAATTA---C------TTGGATAGCATTATTTacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcgggggctatgtcattttcaagagtttaaaatctgagaaaaagagataacaattggtgtgtgacaaataacagtgtttatgcattgttctaattttgtgaaagtggtcgtgatttcttattccctaaaccccgacccaatccctcaaataatatgagttttccttttctgacaattataactcaagataccgcaattacttggatagcattatttta
gi|2 : aacaatgatgataaaatgaggcaaagttgtagaatcaaaatacaactagagcacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcggAGAGATATTGGACGTTTTTCTT-AACCTCTGGTAAATAG-ATT---------T--TATTAATATATGATATTTTTA------TATGA-AA-A--T-T-AAAAAAAAATATTCACGATATTAT-AT--TAGACTGCTGTTTA---A--------------TT-AAC-AGAGTTTG-------AAGTATCCACT-------TAGTTTACAATATTG-TCA-TTTT-TT-CAAACA-CTAA---ATAATT----------------------TTC-----------------CA--------TAATT-A-AAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ACAGTTAATTTTATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-TATACA-ATGAGATAATGCTTT-TATAATGATGGTGACACAAGGAAGCATAGGTTT--AGAATC--Ata
gi|2 : GAGC-TGTGTCACTTTTAAG-AGTGGA-GCATCTGTGAAAAC-TAGAGAACAATCGGTGAGTAAAAAATAA--GTGTTTATGCA--TTGTTCTGATTTGGGTGAAAGTGATCTTGACCTCTTACTCC-A-T-A-AACTC--C--GAC----CAC--ATAACCCA-AACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATTAGAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAGGGTAGCATTATCTtagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagctgtgtcacttttaagagtggagcatctgtgaaaactagagaacaatcggtgagtaaaaaataagtgtttatgcattgttctgatttgggtgaaagtgatcttgacctcttactccataaactccgaccacataacccaaacaatatgagtattccttttctgacaattagaactcaagataccgctattactagggtagcattatcta
gi|20 : agagatattggacgtttttcttaacctctggtaaatagattttattaatatatgatatttttatatgaaaattaaaaaaaaatattcacgatattatattagactgctgtttaattaacagagtttgaagtatccacttagtttacaatattgtcattttttcaaacactaaataattttccataattaaaaaatgtccaagataagggcacagttaattttataatatattgcgacgtcagtatacaatgagataatgcttttataatgatggtgacacaaggaagcataggtttagaatcatagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcagGT-TATGTCACTTTCAAG-AACTAA-AAATCCGAGAAAAA-GAGAGATCAATTGGTCAGTGACAAATAGCAGTGCTTATG-ATTTTTTTCTTATTTTGGTGAAAGTAATCTTGACCTCTTGCC-------------C--C--GAC----CCCT--TCCTCCA-AACA----GTATGA------GTAGTC----T-TCTTCTTGTAATTAGAAC-TCAAGATACCGATTTAA---C------TAGGATGGCTTTATTa
gi|21 : aacaaaaaaaacctagagccctgaaagggcaacaagagcctcgtagtgtgcctgactctatatcccattggctttggtcacaacattaattctgtctcaggtT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----TG-TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGGTGATAAGGGTCTTCT-------TACCTTCCAGCATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATGA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAGT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-ATC-------ACAGTTAATTTAGTAATATATTG--------CTA-C------ATCAG-CATACCTTTGAAATAAAGCCTT-TAAAAAGATGCTGATTCAATGAAGCATActa
gi|21 : ATAAGCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGAGAGACTTATTagcataactcaagataccgctattactaagagagacttattctatt
gi|22 : tattagattgctgtttatttatgtgtttttaacaagagttggaggtgataagggtcttcttaccttccagcattgttacttttttcaaacactaagtgataattttatgagtaatgttccataataacaaagtgtccaagataaaatcacagttaatttagtaatatattgctacatcagcatacctttgaaataaagcctttaaaaagatgctgattcaatgaagcA-ATATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAATTGGTTAGTGGCAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAGCATTGATCTTGATCACTTTCTTCAA-T-A-A---CCTC--GA-----CACT-ATCACACA-AACAAAATAAATGA------GTATTC----CTTTTTCTGAAAATCATGAC-TTAAGATACAGTAATTG---C------TAAGATActatt
gi|23 : tgataaagaatatgatagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATATTAGACGTTTTTCGT-AGCCACTGTTAAATAGTTTT---------T--TATTTAAATTTAAAGTGGTAA------AAC-A-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCACAATATTAT-AT--TATATTGCTGTTTGTTTGCG-----G--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTAC-ATT-TT-CAAACA-CTAAGGGATAATTGTATTA--G--T------AATATTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAAT----GT-CA-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTTAAtacttatgtt
gi|24 : CAGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AATCTCCGGTTTATAG-CTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCTATAAT---AT-AT--TAAAGTGCTATTTATTTACG-----T--TTTTTT-AACAAGAGCTGGAGATGATAAGTATCTATC-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-AGAAGA-CTCAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A--AAAATAAGGGT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACA
gi|25 : TAAATAA-GTT---------T--TAAATAAATATGAAGTGGA-------------------TT-T----------------TTATTTTAC-AT--TTAACTGCTGGGTATTTACA-----C--TTT-T--AACACGAGTTTGAGGTGATAAGTGT-----------------TCTA----------------TT-CAAACA-TTAAGTGATA-TTTTACTG--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAC-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-G-GGC-------ACAGTAAATTTAAT---ATATTG--------CAT-C------TTCAG-CATGCCTTTGAGATAACGCTTT-TGTAATGGTGGTGATAAAA
gi|26 : aATTTAAATAGGAAGTGGAAA------AATGA-AA-ACTT-C-AA-GGAGA---CCCATAATATTAT-AT--CATATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TC-AACAAGATTTGGAGATGATAAGTGTTTGCT-------TACTTTCTAACATTG-TTACTTTT-TT-TGACCA-CTAAGTGATGATATTATTA--T--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAAT----GT-Caatg
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCCATAATATTAT-GT--TACATTGCTTTTTATTTACG-----G--TTT-T--AACAAGAGTTGGAGATGATAAGTGTCTACTGGCT---TACCCTCCAACATTG-TTGCTTTT-AT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--C--T------AAGGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-
gi|28 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AACATCTGGTAAATAG-TTT---------T--TTATTATATATGAAGT------------------A-AATG-T-AAA----------CATACTTTTAT-AT--TAGAT-GCTGCTTATTTACG-----GAATAT-TT-AACACGAATTGGAGAT---AAGTGTCTACTTAGTACTTACCTTCCAA-ATTGTTTACAGTT-TT-CAAACA-CTGAGTGATAA-TTTATTA--a
gi|29 : GA-AAATCTGAGAAAAA-G------CAATTGGTGAGTGACAAATAACAGT--TTATGCA--TTGTTCTTATTTTGGTTAAATTTATCTTGATCGCTTTCTCC-T-G-A-AACCT--C--GAC----CCCT-ATCCCCTA-TACA----AAATGA------GAATTC----A-TTTTCTGACAATCCTAAC-TCAAGATATCGCTATTA---C------TAAGATAGACTTATTTcttctacttttgataacgtatcaaatt
gi|3 : TCAGAAATATTGGACGTTCT-CTTTAACCTCTAGTAAATAG-TTT---------T--TATTCAAATATGAAGCGAAAA------AA----GA-AATT-T-AAAGAAGT---CCCATAATTTTTTCAT--AAGATTGCTGTTTATTTGTG-----T--TTT-T--GACAAGATTTTTAGATA-------TCTAGT-------TACCATCCAACAATT-TTATTTTT-TT-TAAAAGGCTAAGTGATAATGTTATTA--G--TTACTGTAATGTTT-----------------TA--------TAA-TTA-TAAAAT----AT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-TT------ACAGTAAGTTTAATACTATGTTG--------CCA-C------GTCAG-CCTACCTTTAAAGTACTGCTTT-GGTAACGATGGTTATAAAATAAAGCATAGTTTT---GAATCCAAAAATAAAAAAAC-TAGAGTGAGC-TGTGTCACACTCGAG-AGTTGA-AAATAAGAAAAAAAAGAGAGAACAATTGATGAATGAAAATTAACAATATTTATGCA--TTGTTCTAATTTTAGTGAATTTTATCTTGACCTCTTTTTCC-C-T-A-AACCT--C--GAC----CCCCTATTCCTCA-AACA----AAATTA------GTATTC----C-CTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAAATAGCATTATTta
gi|30 : TAT-AA--TATATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAAATGATAAGTGTC---------------------CATTG-TTACTTTT-TT-CTAACA-TTAAGTAATAA---TATTA--T--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-CAA-CAAAAT----TT-CCAA-AAAT-A-AGA-A-C-------TCGGTAAAct
gi|31 : GATATGTTGGAA--------TTAACCTCTGGTAAGTAG-CTT---------T--TATTTAGCTATGAAGTG-AAA------AAGGA-AA---TT-T-AAAA---A---CCCATAATCT-AT-AT--AAGATTGCTGTTTATTTATA-----A--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGAT
gi|32 : GATGTTGGACGTTTTTCTT-AAC-----GTAAATA--TTT---------T--TATTT-----T-AAGTGGAAATTTTTT-----------TT-T-AAAGGAGA---CCCATATTTTTAT-AT--TAAATTCCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TT-AACATGAGTTTGAAATGtacgcttagt
gi|33 : TGAAAGTGTTCTTGATCTATTGCTCC-C-T-ATA---C--CTAGAC----CCC--ATCCCCCA-AACG----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTAACAATTAGAAC-T-AAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGTATTATT
gi|34 : AAATGTTGGAC-TTTTTCTT-AAAATTTGGTAAATAG-GTT---------T--TATTTAAATATGAAGTG-------------GA-AA-AATT-A-AAAGGAGA---CCTATAATATTAT-AT--TAGATTcta
gi|35 : ----AAAT-A------TTATTG------TTTCCTGACAATTTGAGC-TCCAGATACTGCTTTTA---T------TAAGATAGCATTATT
gi|36 : aacaattggtgatCA-AACA----ATATGA------GTATTCATTCC-TTTTCTGACAATTAGAAC-ACAAGATACCGCTATAA---C------TAGGATAGCActct
gi|37 : TTCCCCA-AACA----AAAAGA------GTATTC----A-TTTTCTGACGATCAAAGC-TCAAGAAACCGATATTT---C------
gi|38 : cacggTAT-AT--TAAATTGCAGTTTATCTATGGGCTTT--TTT-TT-AACAAGAGCTTAAGATGATA
gi|4 : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAGATAG-TTT---------T--AATTTAAATATGAAGTGGGAA------AACGA-GATAATG-T-AAAGGAGA---CCTATAATATCAT-AT--TAAATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-TT-ATCAAGAATTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACGTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATACTTTTATAA--G--T------AATGTTC-----------------CA-------------------AAT----GT-CG-A-AGAT-A-A-A-A-C-------A--GTAAATTTAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACGTTTAAAATAATGCTTT-TAAGAAGATGGTGATCCAATGAAGCATATTTTT--ATAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCAGGG-TCTGTCAATTTCAAG-AGTTGA-ACATCTGAGAAAAA-GAGAGAACAGTTGTTGAGGGTAAAGTAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAAAATTGATCTTGGTCATTTTCTC------------C--C--AAT----CCCC-ATCCCCAA-AACA----CAATTA------GTATTT----C-CTTTCTGACAATAATAAC-TTGAGATACCGCTATTA---C------TAAGATATACTTATTT
gi|5 : CAGAGATGTTAAACGTTTTCCTG-AATCTCTTGTTACTAG-TTT---------T--TGTTTAAATATGAATAGGAAA------AA--A-AT-AATT-T-TTTCTAGA---CCAACCATTTTAT-ATATTA-ATTGCTG--------CG-----T--TT------ACAAATGTTTGAGATGATAAGTGACTCCT-------TATCTTCCATTAATG-TTATTATT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATCAAAG--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAATAT----GT-CC-A-ATCT-A-A-A-A-TTTGTAAAACAGTAAATTTGATGATATATTG--------CGA-C------ATCAA-CCTACCCTTTA-ATAATGCTTT-TGTAACGATGGTAATAACATGA------GTT---------C--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGC-TATGTCACTTTCAGG-AGTTGA-AAATCTGA-AAAAA-GATAGAACAGTTGGCGAGTGACAAATAACAGTATTTATGCA--TTATTCTAA-----GTTAAAT----CTTGACTATTTTCTCA-T-T-A-AA--C--CTTGAC----TTT--GTGCCCTA-AACA----AAATGA------GTAATC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATAACGGTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|6 : AAATAG-TTT---------T--AATGTAAATATGAAGTTGAAA------AAAAAGAA-AATT-T-AAAGGAGT---TCCACAATAGCAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-T--AACAAGCGTTTGCTATGTTAAGTGTCTATT-------CACTTTCAAACAGTG-TCAGTTTT----CAAACA-CTTTGTGATTATTTTATTG--G--T------AATGTTT-----------------CA--------CAA-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-ATGT-A-A-GGA-C-------ACAGTAAAATTAACAACATATTG--------CCAGCATATAAGTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGATTT-AGTAGTGATGGTAATACAATAAAGCAAAATTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCgt
gi|6 : cGGGC-TAAGTCACTTTCAAG-ATTTGA-AAATCTAAAAAAAA-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAGATGA------TCATG-A--TT----------------------TCTTG------TTC-CC-T-A-A-A---CC-C--GACCCCACCCC-ATCCCCCCTAACA----ATATGA------GTATTA----C-TTTTCTTACAA-CATAacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccggggctaagtcactttcaagatttgaaaatctaaaaaaaagagagaacaattggtgagtgacagatgatcatgatttcttgttccctaaacccgaccccaccccatcccccctaacaatatgagtattacttttcttacaacata
gi|7 : caaatagttttaatgtaaatatgaagttgaaaaaaaagaaaatttaaaggagttccacaatagcatattagattgctgtttatttacatttttaacaagcgtttgctatgttaagtgtctattcactttcaaacagtgtcagttttcaaacactttgtgattattttattggtaatgtttcacaattacaaaatgtccaatgtaaggacacagtaaaattaacaacatattgccagcatataagtcagcatgcctttgagataatgatttagtagtgatggtaatacaataaagcaaaattttagaaccaaaatacaactagagcacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccgGTAAATAT-TTT---------T--TGTTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-C-AAAGGACA---CCCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTT-------------------TT-A-CAAGAGTTTGAGTTGATAAGTGTTTATT-------TACCTGCCATCAATA-T-ACTTTT-TTTCAAACA-CTAAGTGATCAATTTATTA--G--T------AATGCTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-AAC-------ATAGTAAATTTAATAATATATTG--------CAA-C------GTCTG-CTTACCATTAAATTCATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAACGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAACTAAAA---C-TACAGCGGGT-GATGCCACTTTTAAG-AGTTGA-AAATATGACAAAAA-GAGAAAACAATTGGT-AGTGACAAATAACAGTATTTATTCA--TTGTTCTAATTTTAATGCCATTGATATT-ACCTCTTTCTGC-T-T-A-AACCT--C--GAC----CACC-ATCCCTTA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAACCATAAC-TCAAAATAACACTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|8 : tcTCAGAGATGTTGGACGTTTTTC-TTAACCTTTGATAACTAG-TTT---------TAATAATTTTATATGAGATAGcttt
gi|8 : ATAATTTTAT-AT--GAGATAGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGACTTTGACATGATAAGAGTCAACT-------TACATTCCAACAACG-CTA-TTTT-TT-TAAACA-CTAAGTGATAATTT-------G--T------------------------------CA--------TAATT-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATGTTG--------CGA-G------ATCAATCGT-CCTTTAGTTTAATGTTTT-TGTAGCGATGATCTTAAAATGAAGCATAGTTTTTCACCCCC--AAAATAAAG---CGTA-AGAGGGC-TAT-TCACTCTTAAG-AGTTGT-AAATTTGAGAAAAA-GAAAGAACAATTGTTGAGTGACAAGTAACAGTATTTATG-A--T--------TTTTGGTTAAATTGATCTTGACC-CTTTCTCC-C-T-ACA---CCTC--AAC----CCCC-ATCCACCG-AACA----AAAAGT------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAA-TC-ATATACCGCTATTA---CACGTATCAAAATAACATTATTctgtttatttacgttttttaacaagactttgacatgataagagtcaacttacattccaacaacgctatttttttaaacactaagtgataatttgtcataattacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttaataatatgttgcgagatcaatcgtcctttagtttaatgtttttgtagcgatgatcttaaaatgaagcatagtttttcacccccaaaataaagcgtaagagggctattcactcttaagagttgtaaatttgagaaaaagaaagaacaattgttgagtgacaagtaacagtatttatgatttttggttaaattgatcttgaccctttctccctacacctcaacccccatccaccgaacaaaaagtgtattccttttctgacaatcataaatcatataccgctattacacgtatcaaaataacattattatatt
gi|9 : tcagagatgttggacgtttttcttaacctttgataactagttttaATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACG--AA-AATT-T-Aatatt
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTACG-----T--TTT-TTTAACATGAGTTGGAGATGATATGTGTCTACT-------TACCTTTCAACATTA-TTCCTCTT-TA-CAAACA-ATAAGCGATAATTGTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAC-T-AACAAAAT----GT-CC-A-AGGT-A-A-A-AAC-------ACAATAAATTCAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACCTTTACAATAATGCTTT-TATAAAGATTGTGATACAATGAAGCATAGTTTT--AGATCC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGAGG-TATGTCACTTTCAAA-TGTTGA-AAATCTGAGAAAAAGGAGAGAACACATGGGAAGTGAAAATTAACAATGTTTATGCA--TCGTTCTAATTCTAGTAAAATTAATCTTGATTACTTTCTTA-C-TAA-A---C--C--TACA---CCCC-TTCCTCCA-AACA----AAATGA------GT-------------------AATTGTAAT-TCAAGATACCGCAAATA---C------TAAGATAGACTTATTTcgtttttttaacatgagttggagatgatatgtgtctacttacctttcaacattattcctctttacaaacaataagcgataattgtattagtaatgttccatactaacaaaatgtccaaggtaaaaacacaataaattcagtaatatattgcgacgtcagcatacctttacaataatgcttttataaagattgtgatacaatgaagcatagttttagatccaaaataaaactagagcgaggtatgtcactttcaaatgttgaaaatctgagaaaaaggagagaacacatgggaagtgaaaattaacaatgtttatgcatcgttctaattctagtaaaattaatcttgattactttcttactaaacctacaccccttcctccaaacaaaatgagtaattgtaattcaagataccgcaaatactaagatagacttattttatt
Alignments
lowQualScore : 1 1 11111111 11111111111111111 2 1 22222222
lowQualScore : 0 0 9 2 888888888 22 1 555555 6666 1 1 1 1 333 2 1 22 0 00000000 1 55 9999999 1 1 5 1 1 1 44 22 555555 22222222222222222 66666666 5 0 3 3333 3 1 3 7 1 7 1 2 7777777 22222222 2 666666 2 1 3 2 2 0 33 55 444 2 2 4 1 1 3 1 22 0 0 4 0 1 0 4444 44 1 3333 0 444444 3333 1 1 1 333 555555
lowQualScore : . . . . ......... .. . ...... .... . . . . ... . . .. . ........ . .. ....... . . . . . . .. .. ...... ................. ........ . . . .... . . . . . . . . ....... ........ . ...... . . . . . . .. .. ... . . . . . . . .. . . . . . . .... .. . .... . ...... .... . . . ... ......
lowQualScore : 2 7 0 2 444444444 99 7 555555 9999 8 0 8 8 333 6 5 00 4 99999999 5 77 0000000 5 7 8 7 7 7 00 44 000000 22222222222222222 33333333 2 9 5 9999 6 8 6 3 8 3 8 7 7777777 99999999 1 111111 0 3 1 1 3 6 22 66 444 5 2 0 8 8 6 6 88 1 1 2 4 0 2 0000 00 7 5555 8 888888 5555 7 1 7 333 555555
consensus : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
Reference ( family-913 ) : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCCCGAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
gi|1 : GACATGTTTAATATTTTTCTT-AACCTCTAGTAAAAAT-TTT---------T--TGTCTAAATATGAAGTA-AAA------AATGG-GA-AATA-T-AAAGGAGA---C--ACAACTTTAT-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACG-----TGTTTT-TT-TACAACAGCTTGAGAAAGTAAGTGTCCACT-------TACCTTTCAAGATTG-TAATTTTTCTT-CAAACA-CGTATTAATATTTTTATCA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAAAAT----GT-CT-A-AAGT-A-ATG-A-C-------ACAGTTAATTTAATAATATATTGTAAGTTTGCGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGCTTT-TGTAATGATGGTGATACAAGGAAGCATATTTTA--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|1 : GGGT-TTTGTCGCTT-CAAG-AGTTGAGAAATCTGAGAACA-A-GATAGAGCAATTGGTGAGTGACAAATGTCAGTGT--GTG----------TAATTTTAGTGAAAGAGATATTAACCTCATGCT---TAAACCC-AAC----CAGT-ATCCCCCA-CACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAAGTATAAC-TCAAGATACCTCTATTATTGC------CAGGATAGAATTATTactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcaggggttttgtcgcttcaagagttgagaaatctgagaacaagatagagcaattggtgagtgacaaatgtcagtgtgtgtaattttagtgaaagagatattaacctcatgcttaaacccaaccagtatcccccacacaatatgagtattccttttctgacaagtataactcaagatacctctattattgccaggatagaattattcta
gi|10 : gacatgtttaatatttttcttaacctctagtaaaaattttttgtctaaatatgaagtaaaaaatgggaaatataaaggagacacaactttatattagactgctgtttatttacgtgtttttttacaacagcttgagaaagtaagtgtccacttacctttcaagattgtaatttttcttcaaacacgtattaatatttttatcagtaatgttccataattacaaaatgtctaaagtaatgacacagttaatttaataatatattgtaagtttgcgacgtcagcatgcctttgagataatgcttttgtaatgatggtgatacaaggaagcatattttaagaaccaaaataaaactagagcactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcagGGTGTTGGACGTTTTATCTTAACCTCTAGTAAATAG-TTTAATATTTGAT--TATATAAATATGAAGTGTAAT------AAAGA-AA-C-TT-T-AATGGAGA---CCCACAATATAAC-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACGGT---T--TCT-TT-AA-ACGAGTTTGAGAAGATACGTGTCCGCT-------TACCTCACAACATTA-TCATTTTT---------A-GTCAGTAATATTTTTATTA--GAAT------AGTGCTCTTTTTACTTTTATTAATCATTTTCCATTAT-T-A-TAAAAT----GT-CC-A-AGAT-AGA-G-A-C-------ACAGTAAATCTAAAAATATATTG--------ATT-T------GGTAG-CATGCCTTTGAGATAATTATTT-TG--ACGGTGGGAATAATATGAAGTTTAGCTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCcta
gi|10 : gcCAAG-AGTTAA-AAACCTGAGAAAA-A-TAGAGAACAATTGGTGAATGACAAAactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagacaagagttaaaaacctgagaaaaatagagaacaattggtgaatgacaaa
gi|11 : gcggtgttggacgttttatcttaacctctagtaaatagtttaatatttgattatataaatatgaagtgtaataaagaaactttaatggagacccacaatataacattagactgctgtttatttacggtttctttaaacgagtttgagaagatacgtgtccgcttacctcacaacattatcatttttagtcagtaatatttttattagaatagtgctctttttacttttattaatcattttccattattataaaatgtccaagatagagacacagtaaatctaaaaatatattgatttggtagcatgcctttgagataattattttgacggtgggaataatatgaagtttagctttagaaccaaaatacaactagagcactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagaCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------TATATTC-----------------CA--------TAA-T---CAAAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAG-A-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATT
gi|12 : CATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------TATATTC-----------------CA--------TAA-T---CAAAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAG-A-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATTata
gi|13 : G-TTT---------T--TATTTGAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-C-TT-T-AAAGGATA---ACCATAATATTAT-AT--TAGATTGCTGTTTACTTACG-----G--GCT-TT-TACAAGAGTTTGAG--------TTTCTACT-------GACCTTCCAACAGTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAATTGATGATTTTATAT--G--T------TATGTTC-----------------CA--------TAA-T-ATCAAAAT----GT-CC-A-AGAT-T-A-A-ATC-------ATAGTAAATTAAGTAATATAATG--------CAA-C------GTCAG-CATACCTT-AAAATAATGCTTTACACAA-GATAGTGACACAATGAATTATATTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGT-TATGTCACTTTCAAG-AGAT-A-AAATCTGAGAAAA-G-AAGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGAGTTTGTGCA--TTGTTCTGACTTTGGTAAAATTGATCTTGATCATTTTCTCCCTAAACCTCTAA----CCCC-ATCCCCAA-AACA----TAATGA------GTATTC----C-TTTTATGACAATC--AACATCAAata
gi|14 : A-AATTATGAAAAAAGA---TCCACAATATTAT-AT--TAGACTG-TGTTTATTTACG-----T--TTT-CT-AACAAGAGTTTGAGATGGTAAGTGTTCATT-------TACTTTCCAACATTG-TCATTTTT-TA-CAATCA-CGAAGTAATAATTTTATAA--G--C------ATTGTT------------------CA--------TAATT-A-C-AAAT----GT-CT-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ATAGTAAATTTAATAATGTA-TG--------TGA-C------GTCAG-TATGCCTTT
gi|14 : aatGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-ATATCTGAAAAAA-A-GAGAAAACCATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTCATGCA--TTGTTTTAATTTTGGTGAAAGTAATTTTGACCTTTTGCT-CCTAAACCCCGAC----CCCC-A-CCAACA-AACA----ATATGC------GTATGC----C-TTTTCAGTGAATTAGAAA-TT-AGATAactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcaggggctatgtcactttcaagagttgaatatctgaaaaaaagagaaaaccattggtgagtgacaaataacagtgttcatgcattgttttaattttggtgaaagtaattttgaccttttgctcctaaaccccgacccccaccaacaaacaatatgcgtatgccttttcagtgaattagaaattagata
gi|15 : aataaattatgaaaaaagatccacaatattatattagactgtgtttatttacgttttctaacaagagtttgagatggtaagtgttcatttactttccaacattgtcattttttacaatcacgaagtaataattttataagcattgttcataattacaaatgtctaagataagggcatagtaaatttaataatgtatgtgacgtcagtatgcctttactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcagGAGATGTTGGACGTTTTC--TTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGAAAA------AAAGG-AA-AATA-T-AAAGGAGA---CC-----TTCAAT-AT--TA----------TATT------------------------GAGTTTGGGATAATGAGTGTCAAAT-------TAACTTCCATCATTG-TCA-TTTG-AC-CAAACA-CTAAGTGATAATGTTATTAT-G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-TAAAAT----GT-CC-A-CGAC-A-A-G-GGT-------ATAGTCAATTGAATACTATTTTG--------CGA-C------AACAG-CGTGTCTTTGACATAATGCTGT-TGTATTGATGGTGGTAAAATGAAACACTG-TTT--AAAACCA-AAAATACAA---C-TAGAAC
gi|15 : GC-TATATCAATTTTAAG-AGTTGG-AAATAAGATAAAA-A-GGAAGAACAATTGGTGAactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgctatatcaattttaagagttggaaataagataaaaaggaagaacaattggtgataaatattatt
gi|16 : gagatgttggacgttttcttaacctctggtaaatagtttttatttaaatatgaagtgaaaaaaaggaaaatataaaggagaccttcaatattatattgagtttgggataatgagtgtcaaattaacttccatcattgtcatttgaccaaacactaagtgataatgttattatgtaatgttccataattataaaatgtccacgacaagggtatagtcaattgaatactattttgcgacaacagcgtgtctttgacataatgctgttgtattgatggtggtaaaatgaaacactgtttaaaaccaaaaatacaactagaacactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtAAATATGAAGTTGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGTAAA---CCCATAATATTAC-AT--TAGATCGCTGTTTATTTACG-----G--GTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCCACT-------TACCTTCCAACAGTG-TTACTTTC-TC-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTG-----------------CA--------TTA-TAA-CAAAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAGCAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTAAAATAA----------A--GATGGTGATACAATGAAGCtaaatattatt
gi|16 : TTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-AAGGGAGAACAATTGGTGAGTGGCAAATAACAGCGTTTATGCA--TTGTTCTAATTCTGGTAAAATTGATCTTGATCACATTCTCCCTTAACATCGAC----CCCC-ATCGCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-Ttttcaatatttcaagagttgaaaatctgagaaaaaagggagaacaattggtgagtggcaaataacagcgtttatgcattgttctaattctggtaaaattgatcttgatcacattctcccttaacatcgacccccatcgcccaaacaaaatgagtattcct
gi|17 : aaatatgaagttgaaaaacgaaaatttaaagtaaacccataatattacattagatcgctgtttatttacgggttttaacaagagtttgagatgataagtgtccacttaccttccaacagtgttactttctccaaacactaagtgataattttattagtaatgttgcattataacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttagcaatatattgcgacgtcagcatgcctttaaaataaagatggtgatacaatgaagctttcaataC-A-CGAT-A-G-G-AGC-------ACAATACATTTAATACTGTAATG--------TGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGACATACTGCTTT-TGTATTGATAGTGATAAAATGAAGCATAGTTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|17 : GGGCGTATGCCACTATCAAG-TGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAAATGATGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTGTAATTTTGGTGAAAGTGATCTTGACCGCTTGCTCCCTAAATTCCAAT----CCTC-ATCCCCTA-AACA----TTATGT------GATTTC----C-TTTTTTGACAATTA-GAC-T-----TTTTTATATTA---T------TAGGATAGCATTATTactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccagggcgtatgccactatcaagtgttgaaaatctgagaaaaagagagaacaaatgatgagtgacaaataacagtgtttatgcattgttgtaattttggtgaaagtgatcttgaccgcttgctccctaaattccaatcctcatcccctaaacattatgtgatttccttttttgacaattagacttttttatattattaggatagcattattg
gi|18 : cacgataggagcacaatacatttaatactgtaatgtgacgtcagcatgcctttgacatactgcttttgtattgatagtgataaaatgaagcatagtttcagaaccaaaataaaactagagcactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccaAG-CCTACCTTTAAATCAATGCTTT-TGTAACAATGGTGATAAAATGAAGTATAATTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGTGGGC-TTTGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGATAAAA-A-GTGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGTATTTATGCA--TTGTTCTAGTTTGGGTGAAATTGATCTTGTCCTCTTTCTCCTTAAACCTTGAC----CCCC-ACCCCGCA-AACA----AAATGAGTACCGGTATTC----C-TCTCATGACAATCATA----------ACCACTATTA---C------TAAGATAGCATTATTg
gi|19 : acaataagatatataaccccgtacataaagtatgttatttttatgcaatatatttgcatatgtatattaaaacctgtgttttttacacaagAACAATGATGATAAAATGAGGCAAAGTTGT--AGAATC--AAAATACAA---C-TAGAGCctctt
gi|19 : GGGC-TATGTCATTTTCAAG-AGTTTA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGATAACAATTGGTGTGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTT-GTGAAAGTGGTCGTGATTTCTTATTCCCTAAACCCCGA-----CCCA-ATCCCTCA-AATA----ATATGA------GTTTTC----C-TTTTCTGACAATTATAAC-TCAAGATACCGCAATTA---C------TTGGATAGCATTATTTacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcgggggctatgtcattttcaagagtttaaaatctgagaaaaagagataacaattggtgtgtgacaaataacagtgtttatgcattgttctaattttgtgaaagtggtcgtgatttcttattccctaaaccccgacccaatccctcaaataatatgagttttccttttctgacaattataactcaagataccgcaattacttggatagcattatttta
gi|2 : aacaatgatgataaaatgaggcaaagttgtagaatcaaaatacaactagagcacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcggAGAGATATTGGACGTTTTTCTT-AACCTCTGGTAAATAG-ATT---------T--TATTAATATATGATATTTTTA------TATGA-AA-A--T-T-AAAAAAAAATATTCACGATATTAT-AT--TAGACTGCTGTTTA---A--------------TT-AAC-AGAGTTTG-------AAGTATCCACT-------TAGTTTACAATATTG-TCA-TTTT-TT-CAAACA-CTAA---ATAATT----------------------TTC-----------------CA--------TAATT-A-AAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ACAGTTAATTTTATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-TATACA-ATGAGATAATGCTTT-TATAATGATGGTGACACAAGGAAGCATAGGTTT--AGAATC--Ata
gi|2 : GAGC-TGTGTCACTTTTAAG-AGTGGA-GCATCTGTGAAAA-C-TAGAGAACAATCGGTGAGTAAAAAATAA--GTGTTTATGCA--TTGTTCTGATTTGGGTGAAAGTGATCTTGACCTCTTACTCCATAAACTCCGAC----CAC--ATAACCCA-AACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATTAGAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAGGGTAGCATTATCTtagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagctgtgtcacttttaagagtggagcatctgtgaaaactagagaacaatcggtgagtaaaaaataagtgtttatgcattgttctgatttgggtgaaagtgatcttgacctcttactccataaactccgaccacataacccaaacaatatgagtattccttttctgacaattagaactcaagataccgctattactagggtagcattatcta
gi|20 : agagatattggacgtttttcttaacctctggtaaatagattttattaatatatgatatttttatatgaaaattaaaaaaaaatattcacgatattatattagactgctgtttaattaacagagtttgaagtatccacttagtttacaatattgtcattttttcaaacactaaataattttccataattaaaaaatgtccaagataagggcacagttaattttataatatattgcgacgtcagtatacaatgagataatgcttttataatgatggtgacacaaggaagcataggtttagaatcatagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcagGT-TATGTCACTTTCAAG-AACTAA-AAATCCGAGAAAA-A-GAGAGATCAATTGGTCAGTGACAAATAGCAGTGCTTATG-ATTTTTTTCTTATTTTGGTGAAAGTAATCTTGACCTCTT---------GCCCCGAC----CCCT--TCCTCCA-AACA----GTATGA------GTAGTC----T-TCTTCTTGTAATTAGAAC-TCAAGATACCGATTTAA---C------TAGGATGGCTTTATTa
gi|21 : aacaaaaaaaacctagagccctgaaagggcaacaagagcctcgtagtgtgcctgactctatatcccattggctttggtcacaacattaattctgtctcaggtT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----TG-TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGGTGATAAGGGTCTTCT-------TACCTTCCAGCATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATGA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAGT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-ATC-------ACAGTTAATTTAGTAATATATTG--------CTA-C------ATCAG-CATACCTTTGAAATAAAGCCTT-TAAAAAGATGCTGATTCAATGAAGCATActa
gi|21 : ATAAGCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGAGAGACTTATTagcataactcaagataccgctattactaagagagacttattctatt
gi|22 : tattagattgctgtttatttatgtgtttttaacaagagttggaggtgataagggtcttcttaccttccagcattgttacttttttcaaacactaagtgataattttatgagtaatgttccataataacaaagtgtccaagataaaatcacagttaatttagtaatatattgctacatcagcatacctttgaaataaagcctttaaaaagatgctgattcaatgaagcA-ATATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTTAGTGGCAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAGCATTGATCTTGATCACTTTCTTCAATAACCTCGA-----CACT-ATCACACA-AACAAAATAAATGA------GTATTC----CTTTTTCTGAAAATCATGAC-TTAAGATACAGTAATTG---C------TAAGATActatt
gi|23 : tgataaagaatatgatagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATATTAGACGTTTTTCGT-AGCCACTGTTAAATAGTTTT---------T--TATTTAAATTTAAAGTGGTAA------AAC-A-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCACAATATTAT-AT--TATATTGCTGTTTGTTTGCG-----G--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTAC-ATT-TT-CAAACA-CTAAGGGATAATTGTATTA--G--T------AATATTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAAT----GT-CA-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTTAAtacttatgtt
gi|24 : CAGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AATCTCCGGTTTATAG-CTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCTATAAT---AT-AT--TAAAGTGCTATTTATTTACG-----T--TTTTTT-AACAAGAGCTGGAGATGATAAGTATCTATC-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-AGAAGA-CTCAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A--AAAATAAGGGT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACA
gi|25 : TAAATAA-GTT---------T--TAAATAAATATGAAGTGGA-------------------TT-T----------------TTATTTTAC-AT--TTAACTGCTGGGTATTTACA-----C--TTT-T--AACACGAGTTTGAGGTGATAAGTGT-----------------TCTA----------------TT-CAAACA-TTAAGTGATA-TTTTACTG--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAC-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-G-GGC-------ACAGTAAATTTAAT---ATATTG--------CAT-C------TTCAG-CATGCCTTTGAGATAACGCTTT-TGTAATGGTGGTGATAAAA
gi|26 : aATTTAAATAGGAAGTGGAAA------AATGA-AA-ACTT-C-AA-GGAGA---CCCATAATATTAT-AT--CATATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TC-AACAAGATTTGGAGATGATAAGTGTTTGCT-------TACTTTCTAACATTG-TTACTTTT-TT-TGACCA-CTAAGTGATGATATTATTA--T--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAAT----GT-Caatg
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCCATAATATTAT-GT--TACATTGCTTTTTATTTACG-----G--TTT-T--AACAAGAGTTGGAGATGATAAGTGTCTACTGGCT---TACCCTCCAACATTG-TTGCTTTT-AT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--C--T------AAGGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-
gi|28 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AACATCTGGTAAATAG-TTT---------T--TTATTATATATGAAGT------------------A-AATG-T-AAA----------CATACTTTTAT-AT--TAGAT-GCTGCTTATTTACG-----GAATAT-TT-AACACGAATTGGAGAT---AAGTGTCTACTTAGTACTTACCTTCCAA-ATTGTTTACAGTT-TT-CAAACA-CTGAGTGATAA-TTTATTA--a
gi|29 : GA-AAATCTGAGAAAA-A-G------CAATTGGTGAGTGACAAATAACAGT--TTATGCA--TTGTTCTTATTTTGGTTAAATTTATCTTGATCGCTTTCTCCTGAAACCTCGAC----CCCT-ATCCCCTA-TACA----AAATGA------GAATTC----A-TTTTCTGACAATCCTAAC-TCAAGATATCGCTATTA---C------TAAGATAGACTTATTTcttctacttttgataacgtatcaaatt
gi|3 : TCAGAAATATTGGACGTTCT-CTTTAACCTCTAGTAAATAG-TTT---------T--TATTCAAATATGAAGCGAAAA------AA----GA-AATT-T-AAAGAAGT---CCCATAATTTTTTCAT--AAGATTGCTGTTTATTTGTG-----T--TTT-T--GACAAGATTTTTAGATA-------TCTAGT-------TACCATCCAACAATT-TTATTTTT-TT-TAAAAGGCTAAGTGATAATGTTATTA--G--TTACTGTAATGTTT-----------------TA--------TAA-TTA-TAAAAT----AT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-TT------ACAGTAAGTTTAATACTATGTTG--------CCA-C------GTCAG-CCTACCTTTAAAGTACTGCTTT-GGTAACGATGGTTATAAAATAAAGCATAGTTTT---GAATCCAAAAATAAAAAAAC-TAGAGTGAGC-TGTGTCACACTCGAG-AGTTGA-AAATAAGAAAAAAAA-GAGAGAACAATTGATGAATGAAAATTAACAATATTTATGCA--TTGTTCTAATTTTAGTGAATTTTATCTTGACCTCTTTTTCCCTAAACCTCGAC----CCCCTATTCCTCA-AACA----AAATTA------GTATTC----C-CTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAAATAGCATTATTta
gi|30 : TAT-AA--TATATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAAATGATAAGTGTC---------------------CATTG-TTACTTTT-TT-CTAACA-TTAAGTAATAA---TATTA--T--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-CAA-CAAAAT----TT-CCAA-AAAT-A-AGA-A-C-------TCGGTAAAct
gi|31 : GATATGTTGGAA--------TTAACCTCTGGTAAGTAG-CTT---------T--TATTTAGCTATGAAGTG-AAA------AAGGA-AA---TT-T-AAAA---A---CCCATAATCT-AT-AT--AAGATTGCTGTTTATTTATA-----A--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGAT
gi|32 : GATGTTGGACGTTTTTCTT-AAC-----GTAAATA--TTT---------T--TATTT-----T-AAGTGGAAATTTTTT-----------TT-T-AAAGGAGA---CCCATATTTTTAT-AT--TAAATTCCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TT-AACATGAGTTTGAAATGtacgcttagt
gi|33 : TGAAAGTGTTCTTGATCTATTGCTCCCTATACCTAGAC----CCC--ATCCCCCA-AACG----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTAACAATTAGAAC-T-AAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGTATTATT
gi|34 : AAATGTTGGAC-TTTTTCTT-AAAATTTGGTAAATAG-GTT---------T--TATTTAAATATGAAGTG-------------GA-AA-AATT-A-AAAGGAGA---CCTATAATATTAT-AT--TAGATTcta
gi|35 : ----AAAT-A------TTATTG------TTTCCTGACAATTTGAGC-TCCAGATACTGCTTTTA---T------TAAGATAGCATTATT
gi|36 : aacaattggtgatCA-AACA----ATATGA------GTATTCATTCC-TTTTCTGACAATTAGAAC-ACAAGATACCGCTATAA---C------TAGGATAGCActct
gi|37 : TTCCCCA-AACA----AAAAGA------GTATTC----A-TTTTCTGACGATCAAAGC-TCAAGAAACCGATATTT---C------
gi|38 : cacggTAT-AT--TAAATTGCAGTTTATCTATGGGCTTT--TTT-TT-AACAAGAGCTTAAGATGATA
gi|4 : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAGATAG-TTT---------T--AATTTAAATATGAAGTGGGAA------AACGA-GATAATG-T-AAAGGAGA---CCTATAATATCAT-AT--TAAATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-TT-ATCAAGAATTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACGTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATACTTTTATAA--G--T------AATGTTC-----------------CA-------------------AAT----GT-CG-A-AGAT-A-A-A-A-C-------A--GTAAATTTAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACGTTTAAAATAATGCTTT-TAAGAAGATGGTGATCCAATGAAGCATATTTTT--ATAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCAGGG-TCTGTCAATTTCAAG-AGTTGA-ACATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAGTTGTTGAGGGTAAAGTAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAAAATTGATCTTGGTCATTTTCT--------CCCAAT----CCCC-ATCCCCAA-AACA----CAATTA------GTATTT----C-CTTTCTGACAATAATAAC-TTGAGATACCGCTATTA---C------TAAGATATACTTATTT
gi|5 : CAGAGATGTTAAACGTTTTCCTG-AATCTCTTGTTACTAG-TTT---------T--TGTTTAAATATGAATAGGAAA------AA--A-AT-AATT-T-TTTCTAGA---CCAACCATTTTAT-ATATTA-ATTGCTG--------CG-----T--TT------ACAAATGTTTGAGATGATAAGTGACTCCT-------TATCTTCCATTAATG-TTATTATT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATCAAAG--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAATAT----GT-CC-A-ATCT-A-A-A-A-TTTGTAAAACAGTAAATTTGATGATATATTG--------CGA-C------ATCAA-CCTACCCTTTA-ATAATGCTTT-TGTAACGATGGTAATAACATGA------GTT---------C--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGC-TATGTCACTTTCAGG-AGTTGA-AAATCTGA-AAAA-A-GATAGAACAGTTGGCGAGTGACAAATAACAGTATTTATGCA--TTATTCTAA-----GTTAAAT----CTTGACTATTTTCTCATTAAACCTTGAC----TTT--GTGCCCTA-AACA----AAATGA------GTAATC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATAACGGTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|6 : AAATAG-TTT---------T--AATGTAAATATGAAGTTGAAA------AAAAAGAA-AATT-T-AAAGGAGT---TCCACAATAGCAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-T--AACAAGCGTTTGCTATGTTAAGTGTCTATT-------CACTTTCAAACAGTG-TCAGTTTT----CAAACA-CTTTGTGATTATTTTATTG--G--T------AATGTTT-----------------CA--------CAA-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-ATGT-A-A-GGA-C-------ACAGTAAAATTAACAACATATTG--------CCAGCATATAAGTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGATTT-AGTAGTGATGGTAATACAATAAAGCAAAATTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCgt
gi|6 : cGGGC-TAAGTCACTTTCAAG-ATTTGA-AAATCTAAAAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAGATGA------TCATG-A--TT----------------------TCTTG------TTCCC--TAAA-CCCGACCCCACCCC-ATCCCCCCTAACA----ATATGA------GTATTA----C-TTTTCTTACAA-CATAacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccggggctaagtcactttcaagatttgaaaatctaaaaaaaagagagaacaattggtgagtgacagatgatcatgatttcttgttccctaaacccgaccccaccccatcccccctaacaatatgagtattacttttcttacaacata
gi|7 : caaatagttttaatgtaaatatgaagttgaaaaaaaagaaaatttaaaggagttccacaatagcatattagattgctgtttatttacatttttaacaagcgtttgctatgttaagtgtctattcactttcaaacagtgtcagttttcaaacactttgtgattattttattggtaatgtttcacaattacaaaatgtccaatgtaaggacacagtaaaattaacaacatattgccagcatataagtcagcatgcctttgagataatgatttagtagtgatggtaatacaataaagcaaaattttagaaccaaaatacaactagagcacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccgGTAAATAT-TTT---------T--TGTTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-C-AAAGGACA---CCCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTT-------------------TT-A-CAAGAGTTTGAGTTGATAAGTGTTTATT-------TACCTGCCATCAATA-T-ACTTTT-TTTCAAACA-CTAAGTGATCAATTTATTA--G--T------AATGCTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-AAC-------ATAGTAAATTTAATAATATATTG--------CAA-C------GTCTG-CTTACCATTAAATTCATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAACGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAACTAAAA---C-TACAGCGGGT-GATGCCACTTTTAAG-AGTTGA-AAATATGACAAAA-A-GAGAAAACAATTGGT-AGTGACAAATAACAGTATTTATTCA--TTGTTCTAATTTTAATGCCATTGATATT-ACCTCTTTCTGCTTAAACCTCGAC----CACC-ATCCCTTA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAACCATAAC-TCAAAATAACACTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|8 : tcTCAGAGATGTTGGACGTTTTTC-TTAACCTTTGATAACTAG-TTT---------TAATAATTTTATATGAGATAGcttt
gi|8 : ATAATTTTAT-AT--GAGATAGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGACTTTGACATGATAAGAGTCAACT-------TACATTCCAACAACG-CTA-TTTT-TT-TAAACA-CTAAGTGATAATTT-------G--T------------------------------CA--------TAATT-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATGTTG--------CGA-G------ATCAATCGT-CCTTTAGTTTAATGTTTT-TGTAGCGATGATCTTAAAATGAAGCATAGTTTTTCACCCCC--AAAATAAAG---CGTA-AGAGGGC-TAT-TCACTCTTAAG-AGTTGT-AAATTTGAGAAAA-A-GAAAGAACAATTGTTGAGTGACAAGTAACAGTATTTATG-A--T--------TTTTGGTTAAATTGATCTTGACC-CTTTCTCCCTACACCTCAAC----CCCC-ATCCACCG-AACA----AAAAGT------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAA-TC-ATATACCGCTATTA---CACGTATCAAAATAACATTATTctgtttatttacgttttttaacaagactttgacatgataagagtcaacttacattccaacaacgctatttttttaaacactaagtgataatttgtcataattacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttaataatatgttgcgagatcaatcgtcctttagtttaatgtttttgtagcgatgatcttaaaatgaagcatagtttttcacccccaaaataaagcgtaagagggctattcactcttaagagttgtaaatttgagaaaaagaaagaacaattgttgagtgacaagtaacagtatttatgatttttggttaaattgatcttgaccctttctccctacacctcaacccccatccaccgaacaaaaagtgtattccttttctgacaatcataaatcatataccgctattacacgtatcaaaataacattattatatt
gi|9 : tcagagatgttggacgtttttcttaacctttgataactagttttaATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACG--AA-AATT-T-Aatatt
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTACG-----T--TTT-TTTAACATGAGTTGGAGATGATATGTGTCTACT-------TACCTTTCAACATTA-TTCCTCTT-TA-CAAACA-ATAAGCGATAATTGTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAC-T-AACAAAAT----GT-CC-A-AGGT-A-A-A-AAC-------ACAATAAATTCAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACCTTTACAATAATGCTTT-TATAAAGATTGTGATACAATGAAGCATAGTTTT--AGATCC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGAGG-TATGTCACTTTCAAA-TGTTGA-AAATCTGAGAAAA-AGGAGAGAACACATGGGAAGTGAAAATTAACAATGTTTATGCA--TCGTTCTAATTCTAGTAAAATTAATCTTGATTACTTTCTTACTAAACCTACAC----CCCT--TCCTCCA-AACA----AAATGA------GT-------------------AATTGTAAT-TCAAGATACCGCAAATA---C------TAAGATAGACTTATTTcgtttttttaacatgagttggagatgatatgtgtctacttacctttcaacattattcctctttacaaacaataagcgataattgtattagtaatgttccatactaacaaaatgtccaaggtaaaaacacaataaattcagtaatatattgcgacgtcagcatacctttacaataatgcttttataaagattgtgatacaatgaagcatagttttagatccaaaataaaactagagcgaggtatgtcactttcaaatgttgaaaatctgagaaaaaggagagaacacatgggaagtgaaaattaacaatgtttatgcatcgttctaattctagtaaaattaatcttgattactttcttactaaacctacaccccttcctccaaacaaaatgagtaattgtaattcaagataccgcaaatactaagatagacttattttatt
Alignments
lowQualScore : 1 1 11111111 11111111111111111 2 1 22222222
lowQualScore : 0 0 9 2 888888888 22 1 555555 6666 1 1 1 1 333 2 1 22 0 00000000 1 55 9999999 1 1 5 1 1 1 44 22 555555 22222222222222222 66666666 5 0 3 3333 3 1 3 7 1 7 1 2 7777777 22222222 2 666666 2 1 3 2 2 0 33 55 444 2 2 4 1 1 3 1 22 0 0 4 0 1 0 4444 44 1 3333 0 444444 3333 1 1 1 333 555555
lowQualScore : . . . . ......... .. . ...... .... . . . . ... . . .. . ........ . .. ....... . . . . . . .. .. ...... ................. ........ . . . .... . . . . . . . . ....... ........ . ...... . . . . . . .. .. ... . . . . . . . .. . . . . . . .... .. . .... . ...... .... . . . ... ......
lowQualScore : 2 7 0 2 444444444 99 7 555555 9999 8 0 8 8 333 6 5 00 4 99999999 5 77 0000000 5 7 8 7 7 7 00 44 000000 22222222222222222 33333333 2 9 5 9999 6 8 6 3 8 3 8 7 7777777 99999999 1 111111 0 3 1 1 3 6 22 66 444 5 2 0 8 8 6 6 88 1 1 2 4 4 4 0000 00 7 5555 8 888888 5555 7 1 7 333 555555
consensus : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
Reference ( family-913 ) : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
gi|1 : GACATGTTTAATATTTTTCTT-AACCTCTAGTAAAAAT-TTT---------T--TGTCTAAATATGAAGTA-AAA------AATGG-GA-AATA-T-AAAGGAGA---C--ACAACTTTAT-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACG-----TGTTTT-TT-TACAACAGCTTGAGAAAGTAAGTGTCCACT-------TACCTTTCAAGATTG-TAATTTTTCTT-CAAACA-CGTATTAATATTTTTATCA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAAAAT----GT-CT-A-AAGT-A-ATG-A-C-------ACAGTTAATTTAATAATATATTGTAAGTTTGCGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGCTTT-TGTAATGATGGTGATACAAGGAAGCATATTTTA--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|1 : GGGT-TTTGTCGCTT-CAAG-AGTTGAGAAATCTGAGAACA-A-GATAGAGCAATTGGTGAGTGACAAATGTCAGTGT--GTG----------TAATTTTAGTGAAAGAGATATTAACCTCATGCT---TAAACC-CAAC----CAGT-ATCCCCCA-CACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAAGTATAAC-TCAAGATACCTCTATTATTGC------CAGGATAGAATTATTactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcaggggttttgtcgcttcaagagttgagaaatctgagaacaagatagagcaattggtgagtgacaaatgtcagtgtgtgtaattttagtgaaagagatattaacctcatgcttaaacccaaccagtatcccccacacaatatgagtattccttttctgacaagtataactcaagatacctctattattgccaggatagaattattcta
gi|10 : gacatgtttaatatttttcttaacctctagtaaaaattttttgtctaaatatgaagtaaaaaatgggaaatataaaggagacacaactttatattagactgctgtttatttacgtgtttttttacaacagcttgagaaagtaagtgtccacttacctttcaagattgtaatttttcttcaaacacgtattaatatttttatcagtaatgttccataattacaaaatgtctaaagtaatgacacagttaatttaataatatattgtaagtttgcgacgtcagcatgcctttgagataatgcttttgtaatgatggtgatacaaggaagcatattttaagaaccaaaataaaactagagcactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcagGGTGTTGGACGTTTTATCTTAACCTCTAGTAAATAG-TTTAATATTTGAT--TATATAAATATGAAGTGTAAT------AAAGA-AA-C-TT-T-AATGGAGA---CCCACAATATAAC-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACGGT---T--TCT-TT-AA-ACGAGTTTGAGAAGATACGTGTCCGCT-------TACCTCACAACATTA-TCATTTTT---------A-GTCAGTAATATTTTTATTA--GAAT------AGTGCTCTTTTTACTTTTATTAATCATTTTCCATTAT-T-A-TAAAAT----GT-CC-A-AGAT-AGA-G-A-C-------ACAGTAAATCTAAAAATATATTG--------ATT-T------GGTAG-CATGCCTTTGAGATAATTATTT-TG--ACGGTGGGAATAATATGAAGTTTAGCTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCcta
gi|10 : gcCAAG-AGTTAA-AAACCTGAGAAAA-A-TAGAGAACAATTGGTGAATGACAAAactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagacaagagttaaaaacctgagaaaaatagagaacaattggtgaatgacaaa
gi|11 : gcggtgttggacgttttatcttaacctctagtaaatagtttaatatttgattatataaatatgaagtgtaataaagaaactttaatggagacccacaatataacattagactgctgtttatttacggtttctttaaacgagtttgagaagatacgtgtccgcttacctcacaacattatcatttttagtcagtaatatttttattagaatagtgctctttttacttttattaatcattttccattattataaaatgtccaagatagagacacagtaaatctaaaaatatattgatttggtagcatgcctttgagataattattttgacggtgggaataatatgaagtttagctttagaaccaaaatacaactagagcactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagaCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------TATATTC-----------------CA--------TAA-T---CAAAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAG-A-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATT
gi|12 : CATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------TATATTC-----------------CA--------TAA-T---CAAAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAG-A-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATTata
gi|13 : G-TTT---------T--TATTTGAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-C-TT-T-AAAGGATA---ACCATAATATTAT-AT--TAGATTGCTGTTTACTTACG-----G--GCT-TT-TACAAGAGTTTGAG--------TTTCTACT-------GACCTTCCAACAGTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAATTGATGATTTTATAT--G--T------TATGTTC-----------------CA--------TAA-T-ATCAAAAT----GT-CC-A-AGAT-T-A-A-ATC-------ATAGTAAATTAAGTAATATAATG--------CAA-C------GTCAG-CATACCTT-AAAATAATGCTTTACACAA-GATAGTGACACAATGAATTATATTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGT-TATGTCACTTTCAAG-AGAT-A-AAATCTGAGAAAA-G-AAGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGAGTTTGTGCA--TTGTTCTGACTTTGGTAAAATTGATCTTGATCATTTTCTCCCTAAACCTCTAA----CCCC-ATCCCCAA-AACA----TAATGA------GTATTC----C-TTTTATGACAATC--AACATCAAata
gi|14 : A-AATTATGAAAAAAGA---TCCACAATATTAT-AT--TAGACTG-TGTTTATTTACG-----T--TTT-CT-AACAAGAGTTTGAGATGGTAAGTGTTCATT-------TACTTTCCAACATTG-TCATTTTT-TA-CAATCA-CGAAGTAATAATTTTATAA--G--C------ATTGTT------------------CA--------TAATT-A-C-AAAT----GT-CT-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ATAGTAAATTTAATAATGTA-TG--------TGA-C------GTCAG-TATGCCTTT
gi|14 : aatGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-ATATCTGAAAAAA-A-GAGAAAACCATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTCATGCA--TTGTTTTAATTTTGGTGAAAGTAATTTTGACCTTTTGCT-CCTAAACCCCGAC----CCCC-A-CCAACA-AACA----ATATGC------GTATGC----C-TTTTCAGTGAATTAGAAA-TT-AGATAactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcaggggctatgtcactttcaagagttgaatatctgaaaaaaagagaaaaccattggtgagtgacaaataacagtgttcatgcattgttttaattttggtgaaagtaattttgaccttttgctcctaaaccccgacccccaccaacaaacaatatgcgtatgccttttcagtgaattagaaattagata
gi|15 : aataaattatgaaaaaagatccacaatattatattagactgtgtttatttacgttttctaacaagagtttgagatggtaagtgttcatttactttccaacattgtcattttttacaatcacgaagtaataattttataagcattgttcataattacaaatgtctaagataagggcatagtaaatttaataatgtatgtgacgtcagtatgcctttactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcagGAGATGTTGGACGTTTTC--TTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGAAAA------AAAGG-AA-AATA-T-AAAGGAGA---CC-----TTCAAT-AT--TA----------TATT------------------------GAGTTTGGGATAATGAGTGTCAAAT-------TAACTTCCATCATTG-TCA-TTTG-AC-CAAACA-CTAAGTGATAATGTTATTAT-G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-TAAAAT----GT-CC-A-CGAC-A-A-G-GGT-------ATAGTCAATTGAATACTATTTTG--------CGA-C------AACAG-CGTGTCTTTGACATAATGCTGT-TGTATTGATGGTGGTAAAATGAAACACTG-TTT--AAAACCA-AAAATACAA---C-TAGAAC
gi|15 : GC-TATATCAATTTTAAG-AGTTGG-AAATAAGATAAAA-A-GGAAGAACAATTGGTGAactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgctatatcaattttaagagttggaaataagataaaaaggaagaacaattggtgataaatattatt
gi|16 : gagatgttggacgttttcttaacctctggtaaatagtttttatttaaatatgaagtgaaaaaaaggaaaatataaaggagaccttcaatattatattgagtttgggataatgagtgtcaaattaacttccatcattgtcatttgaccaaacactaagtgataatgttattatgtaatgttccataattataaaatgtccacgacaagggtatagtcaattgaatactattttgcgacaacagcgtgtctttgacataatgctgttgtattgatggtggtaaaatgaaacactgtttaaaaccaaaaatacaactagaacactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtAAATATGAAGTTGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGTAAA---CCCATAATATTAC-AT--TAGATCGCTGTTTATTTACG-----G--GTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCCACT-------TACCTTCCAACAGTG-TTACTTTC-TC-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTG-----------------CA--------TTA-TAA-CAAAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAGCAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTAAAATAA----------A--GATGGTGATACAATGAAGCtaaatattatt
gi|16 : TTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-AAGGGAGAACAATTGGTGAGTGGCAAATAACAGCGTTTATGCA--TTGTTCTAATTCTGGTAAAATTGATCTTGATCACATTCTCCCTTAACATCGAC----CCCC-ATCGCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-Ttttcaatatttcaagagttgaaaatctgagaaaaaagggagaacaattggtgagtggcaaataacagcgtttatgcattgttctaattctggtaaaattgatcttgatcacattctcccttaacatcgacccccatcgcccaaacaaaatgagtattcct
gi|17 : aaatatgaagttgaaaaacgaaaatttaaagtaaacccataatattacattagatcgctgtttatttacgggttttaacaagagtttgagatgataagtgtccacttaccttccaacagtgttactttctccaaacactaagtgataattttattagtaatgttgcattataacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttagcaatatattgcgacgtcagcatgcctttaaaataaagatggtgatacaatgaagctttcaataC-A-CGAT-A-G-G-AGC-------ACAATACATTTAATACTGTAATG--------TGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGACATACTGCTTT-TGTATTGATAGTGATAAAATGAAGCATAGTTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|17 : GGGCGTATGCCACTATCAAG-TGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAAATGATGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTGTAATTTTGGTGAAAGTGATCTTGACCGCTTGCTCCCTAAATTCCAAT----CCTC-ATCCCCTA-AACA----TTATGT------GATTTC----C-TTTTTTGACAATTA-GAC-T-----TTTTTATATTA---T------TAGGATAGCATTATTactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccagggcgtatgccactatcaagtgttgaaaatctgagaaaaagagagaacaaatgatgagtgacaaataacagtgtttatgcattgttgtaattttggtgaaagtgatcttgaccgcttgctccctaaattccaatcctcatcccctaaacattatgtgatttccttttttgacaattagacttttttatattattaggatagcattattg
gi|18 : cacgataggagcacaatacatttaatactgtaatgtgacgtcagcatgcctttgacatactgcttttgtattgatagtgataaaatgaagcatagtttcagaaccaaaataaaactagagcactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccaAG-CCTACCTTTAAATCAATGCTTT-TGTAACAATGGTGATAAAATGAAGTATAATTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGTGGGC-TTTGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGATAAAA-A-GTGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGTATTTATGCA--TTGTTCTAGTTTGGGTGAAATTGATCTTGTCCTCTTTCTCCTTAAACCTTGAC----CCCC-ACCCCGCA-AACA----AAATGAGTACCGGTATTC----C-TCTCATGACAATCATA----------ACCACTATTA---C------TAAGATAGCATTATTg
gi|19 : acaataagatatataaccccgtacataaagtatgttatttttatgcaatatatttgcatatgtatattaaaacctgtgttttttacacaagAACAATGATGATAAAATGAGGCAAAGTTGT--AGAATC--AAAATACAA---C-TAGAGCctctt
gi|19 : GGGC-TATGTCATTTTCAAG-AGTTTA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGATAACAATTGGTGTGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTT-GTGAAAGTGGTCGTGATTTCTTATTCCCTAAACCCCGA-----CCCA-ATCCCTCA-AATA----ATATGA------GTTTTC----C-TTTTCTGACAATTATAAC-TCAAGATACCGCAATTA---C------TTGGATAGCATTATTTacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcgggggctatgtcattttcaagagtttaaaatctgagaaaaagagataacaattggtgtgtgacaaataacagtgtttatgcattgttctaattttgtgaaagtggtcgtgatttcttattccctaaaccccgacccaatccctcaaataatatgagttttccttttctgacaattataactcaagataccgcaattacttggatagcattatttta
gi|2 : aacaatgatgataaaatgaggcaaagttgtagaatcaaaatacaactagagcacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcggAGAGATATTGGACGTTTTTCTT-AACCTCTGGTAAATAG-ATT---------T--TATTAATATATGATATTTTTA------TATGA-AA-A--T-T-AAAAAAAAATATTCACGATATTAT-AT--TAGACTGCTGTTTA---A--------------TT-AAC-AGAGTTTG-------AAGTATCCACT-------TAGTTTACAATATTG-TCA-TTTT-TT-CAAACA-CTAA---ATAATT----------------------TTC-----------------CA--------TAATT-A-AAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ACAGTTAATTTTATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-TATACA-ATGAGATAATGCTTT-TATAATGATGGTGACACAAGGAAGCATAGGTTT--AGAATC--Ata
gi|2 : GAGC-TGTGTCACTTTTAAG-AGTGGA-GCATCTGTGAAAA-C-TAGAGAACAATCGGTGAGTAAAAAATAA--GTGTTTATGCA--TTGTTCTGATTTGGGTGAAAGTGATCTTGACCTCTTACTCCATAAACTCCGAC----CAC--ATAACCCA-AACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATTAGAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAGGGTAGCATTATCTtagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagctgtgtcacttttaagagtggagcatctgtgaaaactagagaacaatcggtgagtaaaaaataagtgtttatgcattgttctgatttgggtgaaagtgatcttgacctcttactccataaactccgaccacataacccaaacaatatgagtattccttttctgacaattagaactcaagataccgctattactagggtagcattatcta
gi|20 : agagatattggacgtttttcttaacctctggtaaatagattttattaatatatgatatttttatatgaaaattaaaaaaaaatattcacgatattatattagactgctgtttaattaacagagtttgaagtatccacttagtttacaatattgtcattttttcaaacactaaataattttccataattaaaaaatgtccaagataagggcacagttaattttataatatattgcgacgtcagtatacaatgagataatgcttttataatgatggtgacacaaggaagcataggtttagaatcatagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcagGT-TATGTCACTTTCAAG-AACTAA-AAATCCGAGAAAA-A-GAGAGATCAATTGGTCAGTGACAAATAGCAGTGCTTATG-ATTTTTTTCTTATTTTGGTGAAAGTAATCTTGACCTCTT---------GCCCCGAC----CCCT--TCCTCCA-AACA----GTATGA------GTAGTC----T-TCTTCTTGTAATTAGAAC-TCAAGATACCGATTTAA---C------TAGGATGGCTTTATTa
gi|21 : aacaaaaaaaacctagagccctgaaagggcaacaagagcctcgtagtgtgcctgactctatatcccattggctttggtcacaacattaattctgtctcaggtT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----TG-TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGGTGATAAGGGTCTTCT-------TACCTTCCAGCATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATGA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAGT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-ATC-------ACAGTTAATTTAGTAATATATTG--------CTA-C------ATCAG-CATACCTTTGAAATAAAGCCTT-TAAAAAGATGCTGATTCAATGAAGCATActa
gi|21 : ATAAGCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGAGAGACTTATTagcataactcaagataccgctattactaagagagacttattctatt
gi|22 : tattagattgctgtttatttatgtgtttttaacaagagttggaggtgataagggtcttcttaccttccagcattgttacttttttcaaacactaagtgataattttatgagtaatgttccataataacaaagtgtccaagataaaatcacagttaatttagtaatatattgctacatcagcatacctttgaaataaagcctttaaaaagatgctgattcaatgaagcA-ATATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTTAGTGGCAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAGCATTGATCTTGATCACTTTCTTCAATAACCTCGA-----CACT-ATCACACA-AACAAAATAAATGA------GTATTC----CTTTTTCTGAAAATCATGAC-TTAAGATACAGTAATTG---C------TAAGATActatt
gi|23 : tgataaagaatatgatagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATATTAGACGTTTTTCGT-AGCCACTGTTAAATAGTTTT---------T--TATTTAAATTTAAAGTGGTAA------AAC-A-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCACAATATTAT-AT--TATATTGCTGTTTGTTTGCG-----G--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTAC-ATT-TT-CAAACA-CTAAGGGATAATTGTATTA--G--T------AATATTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAAT----GT-CA-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTTAAtacttatgtt
gi|24 : CAGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AATCTCCGGTTTATAG-CTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCTATAAT---AT-AT--TAAAGTGCTATTTATTTACG-----T--TTTTTT-AACAAGAGCTGGAGATGATAAGTATCTATC-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-AGAAGA-CTCAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A--AAAATAAGGGT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACA
gi|25 : TAAATAA-GTT---------T--TAAATAAATATGAAGTGGA-------------------TT-T----------------TTATTTTAC-AT--TTAACTGCTGGGTATTTACA-----C--TTT-T--AACACGAGTTTGAGGTGATAAGTGT-----------------TCTA----------------TT-CAAACA-TTAAGTGATA-TTTTACTG--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAC-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-G-GGC-------ACAGTAAATTTAAT---ATATTG--------CAT-C------TTCAG-CATGCCTTTGAGATAACGCTTT-TGTAATGGTGGTGATAAAA
gi|26 : aATTTAAATAGGAAGTGGAAA------AATGA-AA-ACTT-C-AA-GGAGA---CCCATAATATTAT-AT--CATATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TC-AACAAGATTTGGAGATGATAAGTGTTTGCT-------TACTTTCTAACATTG-TTACTTTT-TT-TGACCA-CTAAGTGATGATATTATTA--T--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAAT----GT-Caatg
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCCATAATATTAT-GT--TACATTGCTTTTTATTTACG-----G--TTT-T--AACAAGAGTTGGAGATGATAAGTGTCTACTGGCT---TACCCTCCAACATTG-TTGCTTTT-AT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--C--T------AAGGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-
gi|28 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AACATCTGGTAAATAG-TTT---------T--TTATTATATATGAAGT------------------A-AATG-T-AAA----------CATACTTTTAT-AT--TAGAT-GCTGCTTATTTACG-----GAATAT-TT-AACACGAATTGGAGAT---AAGTGTCTACTTAGTACTTACCTTCCAA-ATTGTTTACAGTT-TT-CAAACA-CTGAGTGATAA-TTTATTA--a
gi|29 : GA-AAATCTGAGAAAA-A-G------CAATTGGTGAGTGACAAATAACAGT--TTATGCA--TTGTTCTTATTTTGGTTAAATTTATCTTGATCGCTTTCTCCTGAAACCTCGAC----CCCT-ATCCCCTA-TACA----AAATGA------GAATTC----A-TTTTCTGACAATCCTAAC-TCAAGATATCGCTATTA---C------TAAGATAGACTTATTTcttctacttttgataacgtatcaaatt
gi|3 : TCAGAAATATTGGACGTTCT-CTTTAACCTCTAGTAAATAG-TTT---------T--TATTCAAATATGAAGCGAAAA------AA----GA-AATT-T-AAAGAAGT---CCCATAATTTTTTCAT--AAGATTGCTGTTTATTTGTG-----T--TTT-T--GACAAGATTTTTAGATA-------TCTAGT-------TACCATCCAACAATT-TTATTTTT-TT-TAAAAGGCTAAGTGATAATGTTATTA--G--TTACTGTAATGTTT-----------------TA--------TAA-TTA-TAAAAT----AT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-TT------ACAGTAAGTTTAATACTATGTTG--------CCA-C------GTCAG-CCTACCTTTAAAGTACTGCTTT-GGTAACGATGGTTATAAAATAAAGCATAGTTTT---GAATCCAAAAATAAAAAAAC-TAGAGTGAGC-TGTGTCACACTCGAG-AGTTGA-AAATAAGAAAAAAAA-GAGAGAACAATTGATGAATGAAAATTAACAATATTTATGCA--TTGTTCTAATTTTAGTGAATTTTATCTTGACCTCTTTTTCCCTAAACCTCGAC----CCCCTATTCCTCA-AACA----AAATTA------GTATTC----C-CTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAAATAGCATTATTta
gi|30 : TAT-AA--TATATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAAATGATAAGTGTC---------------------CATTG-TTACTTTT-TT-CTAACA-TTAAGTAATAA---TATTA--T--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-CAA-CAAAAT----TT-CCAA-AAAT-A-AGA-A-C-------TCGGTAAAct
gi|31 : GATATGTTGGAA--------TTAACCTCTGGTAAGTAG-CTT---------T--TATTTAGCTATGAAGTG-AAA------AAGGA-AA---TT-T-AAAA---A---CCCATAATCT-AT-AT--AAGATTGCTGTTTATTTATA-----A--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGAT
gi|32 : GATGTTGGACGTTTTTCTT-AAC-----GTAAATA--TTT---------T--TATTT-----T-AAGTGGAAATTTTTT-----------TT-T-AAAGGAGA---CCCATATTTTTAT-AT--TAAATTCCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TT-AACATGAGTTTGAAATGtacgcttagt
gi|33 : TGAAAGTGTTCTTGATCTATTGCTCCCTATACCTAGAC----CCC--ATCCCCCA-AACG----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTAACAATTAGAAC-T-AAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGTATTATT
gi|34 : AAATGTTGGAC-TTTTTCTT-AAAATTTGGTAAATAG-GTT---------T--TATTTAAATATGAAGTG-------------GA-AA-AATT-A-AAAGGAGA---CCTATAATATTAT-AT--TAGATTcta
gi|35 : ----AAAT-A------TTATTG------TTTCCTGACAATTTGAGC-TCCAGATACTGCTTTTA---T------TAAGATAGCATTATT
gi|36 : aacaattggtgatCA-AACA----ATATGA------GTATTCATTCC-TTTTCTGACAATTAGAAC-ACAAGATACCGCTATAA---C------TAGGATAGCActct
gi|37 : TTCCCCA-AACA----AAAAGA------GTATTC----A-TTTTCTGACGATCAAAGC-TCAAGAAACCGATATTT---C------
gi|38 : cacggTAT-AT--TAAATTGCAGTTTATCTATGGGCTTT--TTT-TT-AACAAGAGCTTAAGATGATA
gi|4 : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAGATAG-TTT---------T--AATTTAAATATGAAGTGGGAA------AACGA-GATAATG-T-AAAGGAGA---CCTATAATATCAT-AT--TAAATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-TT-ATCAAGAATTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACGTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATACTTTTATAA--G--T------AATGTTC-----------------CA-------------------AAT----GT-CG-A-AGAT-A-A-A-A-C-------A--GTAAATTTAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACGTTTAAAATAATGCTTT-TAAGAAGATGGTGATCCAATGAAGCATATTTTT--ATAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCAGGG-TCTGTCAATTTCAAG-AGTTGA-ACATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAGTTGTTGAGGGTAAAGTAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAAAATTGATCTTGGTCATTTTCTCC--------CAAT----CCCC-ATCCCCAA-AACA----CAATTA------GTATTT----C-CTTTCTGACAATAATAAC-TTGAGATACCGCTATTA---C------TAAGATATACTTATTT
gi|5 : CAGAGATGTTAAACGTTTTCCTG-AATCTCTTGTTACTAG-TTT---------T--TGTTTAAATATGAATAGGAAA------AA--A-AT-AATT-T-TTTCTAGA---CCAACCATTTTAT-ATATTA-ATTGCTG--------CG-----T--TT------ACAAATGTTTGAGATGATAAGTGACTCCT-------TATCTTCCATTAATG-TTATTATT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATCAAAG--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAATAT----GT-CC-A-ATCT-A-A-A-A-TTTGTAAAACAGTAAATTTGATGATATATTG--------CGA-C------ATCAA-CCTACCCTTTA-ATAATGCTTT-TGTAACGATGGTAATAACATGA------GTT---------C--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGC-TATGTCACTTTCAGG-AGTTGA-AAATCTGA-AAAA-A-GATAGAACAGTTGGCGAGTGACAAATAACAGTATTTATGCA--TTATTCTAA-----GTTAAAT----CTTGACTATTTTCTCATTAAACCTTGAC----TTT--GTGCCCTA-AACA----AAATGA------GTAATC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATAACGGTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|6 : AAATAG-TTT---------T--AATGTAAATATGAAGTTGAAA------AAAAAGAA-AATT-T-AAAGGAGT---TCCACAATAGCAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-T--AACAAGCGTTTGCTATGTTAAGTGTCTATT-------CACTTTCAAACAGTG-TCAGTTTT----CAAACA-CTTTGTGATTATTTTATTG--G--T------AATGTTT-----------------CA--------CAA-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-ATGT-A-A-GGA-C-------ACAGTAAAATTAACAACATATTG--------CCAGCATATAAGTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGATTT-AGTAGTGATGGTAATACAATAAAGCAAAATTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCgt
gi|6 : cGGGC-TAAGTCACTTTCAAG-ATTTGA-AAATCTAAAAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAGATGA------TCATG-A--TT----------------------TCTTG------TTCCC--TAAACC-CGACCCCACCCC-ATCCCCCCTAACA----ATATGA------GTATTA----C-TTTTCTTACAA-CATAacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccggggctaagtcactttcaagatttgaaaatctaaaaaaaagagagaacaattggtgagtgacagatgatcatgatttcttgttccctaaacccgaccccaccccatcccccctaacaatatgagtattacttttcttacaacata
gi|7 : caaatagttttaatgtaaatatgaagttgaaaaaaaagaaaatttaaaggagttccacaatagcatattagattgctgtttatttacatttttaacaagcgtttgctatgttaagtgtctattcactttcaaacagtgtcagttttcaaacactttgtgattattttattggtaatgtttcacaattacaaaatgtccaatgtaaggacacagtaaaattaacaacatattgccagcatataagtcagcatgcctttgagataatgatttagtagtgatggtaatacaataaagcaaaattttagaaccaaaatacaactagagcacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccgGTAAATAT-TTT---------T--TGTTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-C-AAAGGACA---CCCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTT-------------------TT-A-CAAGAGTTTGAGTTGATAAGTGTTTATT-------TACCTGCCATCAATA-T-ACTTTT-TTTCAAACA-CTAAGTGATCAATTTATTA--G--T------AATGCTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-AAC-------ATAGTAAATTTAATAATATATTG--------CAA-C------GTCTG-CTTACCATTAAATTCATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAACGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAACTAAAA---C-TACAGCGGGT-GATGCCACTTTTAAG-AGTTGA-AAATATGACAAAA-A-GAGAAAACAATTGGT-AGTGACAAATAACAGTATTTATTCA--TTGTTCTAATTTTAATGCCATTGATATT-ACCTCTTTCTGCTTAAACCTCGAC----CACC-ATCCCTTA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAACCATAAC-TCAAAATAACACTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|8 : tcTCAGAGATGTTGGACGTTTTTC-TTAACCTTTGATAACTAG-TTT---------TAATAATTTTATATGAGATAGcttt
gi|8 : ATAATTTTAT-AT--GAGATAGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGACTTTGACATGATAAGAGTCAACT-------TACATTCCAACAACG-CTA-TTTT-TT-TAAACA-CTAAGTGATAATTT-------G--T------------------------------CA--------TAATT-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATGTTG--------CGA-G------ATCAATCGT-CCTTTAGTTTAATGTTTT-TGTAGCGATGATCTTAAAATGAAGCATAGTTTTTCACCCCC--AAAATAAAG---CGTA-AGAGGGC-TAT-TCACTCTTAAG-AGTTGT-AAATTTGAGAAAA-A-GAAAGAACAATTGTTGAGTGACAAGTAACAGTATTTATG-A--T--------TTTTGGTTAAATTGATCTTGACC-CTTTCTCCCTACACCTCAAC----CCCC-ATCCACCG-AACA----AAAAGT------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAA-TC-ATATACCGCTATTA---CACGTATCAAAATAACATTATTctgtttatttacgttttttaacaagactttgacatgataagagtcaacttacattccaacaacgctatttttttaaacactaagtgataatttgtcataattacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttaataatatgttgcgagatcaatcgtcctttagtttaatgtttttgtagcgatgatcttaaaatgaagcatagtttttcacccccaaaataaagcgtaagagggctattcactcttaagagttgtaaatttgagaaaaagaaagaacaattgttgagtgacaagtaacagtatttatgatttttggttaaattgatcttgaccctttctccctacacctcaacccccatccaccgaacaaaaagtgtattccttttctgacaatcataaatcatataccgctattacacgtatcaaaataacattattatatt
gi|9 : tcagagatgttggacgtttttcttaacctttgataactagttttaATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACG--AA-AATT-T-Aatatt
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTACG-----T--TTT-TTTAACATGAGTTGGAGATGATATGTGTCTACT-------TACCTTTCAACATTA-TTCCTCTT-TA-CAAACA-ATAAGCGATAATTGTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAC-T-AACAAAAT----GT-CC-A-AGGT-A-A-A-AAC-------ACAATAAATTCAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACCTTTACAATAATGCTTT-TATAAAGATTGTGATACAATGAAGCATAGTTTT--AGATCC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGAGG-TATGTCACTTTCAAA-TGTTGA-AAATCTGAGAAAA-AGGAGAGAACACATGGGAAGTGAAAATTAACAATGTTTATGCA--TCGTTCTAATTCTAGTAAAATTAATCTTGATTACTTTCTTACTAAACCTACAC----CCCT--TCCTCCA-AACA----AAATGA------GT-------------------AATTGTAAT-TCAAGATACCGCAAATA---C------TAAGATAGACTTATTTcgtttttttaacatgagttggagatgatatgtgtctacttacctttcaacattattcctctttacaaacaataagcgataattgtattagtaatgttccatactaacaaaatgtccaaggtaaaaacacaataaattcagtaatatattgcgacgtcagcatacctttacaataatgcttttataaagattgtgatacaatgaagcatagttttagatccaaaataaaactagagcgaggtatgtcactttcaaatgttgaaaatctgagaaaaaggagagaacacatgggaagtgaaaattaacaatgtttatgcatcgttctaattctagtaaaattaatcttgattactttcttactaaacctacaccccttcctccaaacaaaatgagtaattgtaattcaagataccgcaaatactaagatagacttattttatt
blockSeqs : T T AATATTTGA AA T TTTTTT AAAG T A A G ATA A C AT GGCTTT T TT TAGTACT T T T . T G AA AA TACTGT TTTTTACTTTTATTAAT TTTTCCAT T T T AAGG A A T A G G G T TTGTAAA ATATATTG G ATATAA T G G A C TC CA AAA G G T . A A T TT T C CCCA CT T AAAT GTACCG ATTC T T A . ACGTAT
blockSeqs : T . . . G . AGA . A . . . T . . GTT . T GGCT A . C . . . T . . . . T A A . A . T A . G . G T ATATATTG . . . A T . C . A . . . T . . G T . T C . C . . . . . T . . .
blockSeqs : T . . . A . CGA . A . . . T . . GAA . T . A . T . . . . . . . . T A . . . . . A . G . G . . . . . A T . C . . . . . . . . . C . A C . C . . . . . G . . .
blockSeqs : T . . . G . AGG . C . . . A . . TG . T . G . C . . . . . . . . . A . . . . . A . . . T . . . . . A A . T . . . . . . . . . C . T C . C . . . . . T . . .
blockSeqs : T . . . T . CGA . A . . . A . . T . T . T . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . G C . T . . . . . . . . . C . A C . C . . . . . T . . .
blockSeqs : T . . . G . TGA . A . . . T . . T . T . T . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . G A . C . . . . . . . . . C . G C . C . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . G . CGA . A . . . A . . G . T . G . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . G C . C . . . . . . . . . C . T T . C . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . G . TGA . A . . . A . . T . T . T . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G A . T . . . . . . . . . C . T C . C . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . G . CGA . A . . . A . . G . T . T . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A G . A . . . . . . . . . C . T A . A . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . G . GGA . A . . . T . . G . C . T . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A A . T . . . . . . . . . C . T A . T . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . A . CGA . A . . . A . . T . T . T . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A G . C . . . . . . . . . C . A T . T . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . G . CGA . . . . . A . . C . T . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . A . . . . . . . . . C . G C . T . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . G . CA . . . . . T . . T . T . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . C . . . . . . . . . C . T C . C . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . G . GA . . . . . T . . G . T . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . T . . . . . . . . . C . T T . C . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . G . CG . . . . . C . . T . T . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . C . . . . . . . . . C . A T . C . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . G . A . . . . . T . . T . T . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . C . . . . . . . C . A C . C . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . A . . A . T . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . A . . . . . . . T C . T . . . . . T . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . A . . T . T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . T . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : T . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : T******* ******** ***
originalCons : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
finalCons : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACGT-------TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
Alignments
lowQualScore : 1 1 11111111 11111111111111111 2 1 22222222
lowQualScore : 0 0 9 2 888888888 22 1 555555 6666 1 1 1 1 333 2 1 22 0 00000000 1 55 9999999 1 1 5 1 1 1 44 22 555555 22222222222222222 66666666 5 0 3 3333 3 1 3 7 1 7 1 2 7777777 22222222 2 666666 2 1 3 2 2 0 33 55 444 2 2 4 1 1 3 1 22 0 0 4 0 1 0 4444 44 1 3333 0 444444 3333 1 1 1 333 555555
lowQualScore : . . . . ......... .. . ...... .... . . . . ... . . .. . ........ . .. ....... . . . . . . .. .. ...... ................. ........ . . . .... . . . . . . . . ....... ........ . ...... . . . . . . .. .. ... . . . . . . . .. . . . . . . .... .. . .... . ...... .... . . . ... ......
lowQualScore : 2 7 0 2 444444444 99 7 555555 9999 8 0 8 8 333 6 5 00 4 99999999 5 77 0000000 5 7 8 7 7 7 00 44 000000 22222222222222222 33333333 2 9 5 9999 6 8 6 3 8 3 8 7 7777777 99999999 1 111111 0 3 1 1 3 6 22 66 444 5 2 0 8 8 6 6 88 1 1 2 4 4 4 0000 00 7 5555 8 888888 5555 7 1 7 333 555555
consensus : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
Reference ( family-913 ) : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCATAATNTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGANATAATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTGAAATTGATCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATCCCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGCATTATTT
gi|1 : GACATGTTTAATATTTTTCTT-AACCTCTAGTAAAAAT-TTT---------T--TGTCTAAATATGAAGTA-AAA------AATGG-GA-AATA-T-AAAGGAGA---C--ACAACTTTAT-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACG-----TGTTTT-TT-TACAACAGCTTGAGAAAGTAAGTGTCCACT-------TACCTTTCAAGATTG-TAATTTTTCTT-CAAACA-CGTATTAATATTTTTATCA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAAAAT----GT-CT-A-AAGT-A-ATG-A-C-------ACAGTTAATTTAATAATATATTGTAAGTTTGCGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGCTTT-TGTAATGATGGTGATACAAGGAAGCATATTTTA--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|1 : GGGT-TTTGTCGCTT-CAAG-AGTTGAGAAATCTGAGAACA-A-GATAGAGCAATTGGTGAGTGACAAATGTCAGTGT--GTG----------TAATTTTAGTGAAAGAGATATTAACCTCATGCT---TAAACC-CAAC----CAGT-ATCCCCCA-CACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAAGTATAAC-TCAAGATACCTCTATTATTGC------CAGGATAGAATTATTactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcaggggttttgtcgcttcaagagttgagaaatctgagaacaagatagagcaattggtgagtgacaaatgtcagtgtgtgtaattttagtgaaagagatattaacctcatgcttaaacccaaccagtatcccccacacaatatgagtattccttttctgacaagtataactcaagatacctctattattgccaggatagaattattcta
gi|10 : gacatgtttaatatttttcttaacctctagtaaaaattttttgtctaaatatgaagtaaaaaatgggaaatataaaggagacacaactttatattagactgctgtttatttacgtgtttttttacaacagcttgagaaagtaagtgtccacttacctttcaagattgtaatttttcttcaaacacgtattaatatttttatcagtaatgttccataattacaaaatgtctaaagtaatgacacagttaatttaataatatattgtaagtttgcgacgtcagcatgcctttgagataatgcttttgtaatgatggtgatacaaggaagcatattttaagaaccaaaataaaactagagcactaacagggcagtttgagcgtcgtagtgtggccatatttctccttggcttggtcacgggaattaattctgtctcagGGTGTTGGACGTTTTATCTTAACCTCTAGTAAATAG-TTTAATATTTGAT--TATATAAATATGAAGTGTAAT------AAAGA-AA-C-TT-T-AATGGAGA---CCCACAATATAAC-AT--TAGACTGCTGTTTATTTACGGT---T--TCT-TT-AA-ACGAGTTTGAGAAGATACGTGTCCGCT-------TACCTCACAACATTA-TCATTTTT---------A-GTCAGTAATATTTTTATTA--GAAT------AGTGCTCTTTTTACTTTTATTAATCATTTTCCATTAT-T-A-TAAAAT----GT-CC-A-AGAT-AGA-G-A-C-------ACAGTAAATCTAAAAATATATTG--------ATT-T------GGTAG-CATGCCTTTGAGATAATTATTT-TG--ACGGTGGGAATAATATGAAGTTTAGCTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCcta
gi|10 : gcCAAG-AGTTAA-AAACCTGAGAAAA-A-TAGAGAACAATTGGTGAATGACAAAactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagacaagagttaaaaacctgagaaaaatagagaacaattggtgaatgacaaa
gi|11 : gcggtgttggacgttttatcttaacctctagtaaatagtttaatatttgattatataaatatgaagtgtaataaagaaactttaatggagacccacaatataacattagactgctgtttatttacggtttctttaaacgagtttgagaagatacgtgtccgcttacctcacaacattatcatttttagtcagtaatatttttattagaatagtgctctttttacttttattaatcattttccattattataaaatgtccaagatagagacacagtaaatctaaaaatatattgatttggtagcatgcctttgagataattattttgacggtgggaataatatgaagtttagctttagaaccaaaatacaactagagcactgacagagcggtaagagctacgtagtgtggctgaccgtatatcccattggctttggtcacgggaattaattctgtcaaagaCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------TATATTC-----------------CA--------TAA-T---CAAAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAG-A-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATT
gi|12 : CATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-A--AACAAGAGTTTGAGATAATAAGTGTCTACT-------TACCTTCCACCAATG-TTA-TTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------TATATTC-----------------CA--------TAA-T---CAAAAT----ATATC-ATAGAT-A-A-A-A-C-------ACAGTAAATCTAATGATATATTGATATATTGCAA-C------GTCTG-CCTACCTTTAATTTAATGCTTT-TGTACCGATGGTGATAAAATGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AATATAAAA---C-TAGAGCGGGC-TATGTCGCTTTTAAGTAG-TGA-AAATCGGAGAAAG-A-GAGAGAACAAGCGGTTAGTGAAAATTAACAGTATAAACGTA--TTGTTCTTATTTTGGTGAAATTGACCTTGACCTCTTTCTCCCTAAACCTCGAC----CCCC-ATTCCCCA-AACA----AAATGA------GTTTTC----T-CTTGCTGACAACCATAAC-TTAAGATACCGCTATTA---C------TGAGATAGCATTATTata
gi|13 : G-TTT---------T--TATTTGAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-C-TT-T-AAAGGATA---ACCATAATATTAT-AT--TAGATTGCTGTTTACTTACG-----G--GCT-TT-TACAAGAGTTTGAG--------TTTCTACT-------GACCTTCCAACAGTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAATTGATGATTTTATAT--G--T------TATGTTC-----------------CA--------TAA-T-ATCAAAAT----GT-CC-A-AGAT-T-A-A-ATC-------ATAGTAAATTAAGTAATATAATG--------CAA-C------GTCAG-CATACCTT-AAAATAATGCTTTACACAA-GATAGTGACACAATGAATTATATTTTT--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGT-TATGTCACTTTCAAG-AGAT-A-AAATCTGAGAAAA-G-AAGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGAGTTTGTGCA--TTGTTCTGACTTTGGTAAAATTGATCTTGATCATTTTCTCCCTAAACCTCTAA----CCCC-ATCCCCAA-AACA----TAATGA------GTATTC----C-TTTTATGACAATC--AACATCAAata
gi|14 : A-AATTATGAAAAAAGA---TCCACAATATTAT-AT--TAGACTG-TGTTTATTTACG-----T--TTT-CT-AACAAGAGTTTGAGATGGTAAGTGTTCATT-------TACTTTCCAACATTG-TCATTTTT-TA-CAATCA-CGAAGTAATAATTTTATAA--G--C------ATTGTT------------------CA--------TAATT-A-C-AAAT----GT-CT-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ATAGTAAATTTAATAATGTA-TG--------TGA-C------GTCAG-TATGCCTTT
gi|14 : aatGGGC-TATGTCACTTTCAAG-AGTTGA-ATATCTGAAAAAA-A-GAGAAAACCATTGGTGAGTGACAAATAACAGTGTTCATGCA--TTGTTTTAATTTTGGTGAAAGTAATTTTGACCTTTTGCT-CCTAAACCCCGAC----CCCC-A-CCAACA-AACA----ATATGC------GTATGC----C-TTTTCAGTGAATTAGAAA-TT-AGATAactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcaggggctatgtcactttcaagagttgaatatctgaaaaaaagagaaaaccattggtgagtgacaaataacagtgttcatgcattgttttaattttggtgaaagtaattttgaccttttgctcctaaaccccgacccccaccaacaaacaatatgcgtatgccttttcagtgaattagaaattagata
gi|15 : aataaattatgaaaaaagatccacaatattatattagactgtgtttatttacgttttctaacaagagtttgagatggtaagtgttcatttactttccaacattgtcattttttacaatcacgaagtaataattttataagcattgttcataattacaaatgtctaagataagggcatagtaaatttaataatgtatgtgacgtcagtatgcctttactgacacagtagaaatagtctcttagtgttcctatatatccctttggctttggtcattggaattaattcggtctcagGAGATGTTGGACGTTTTC--TTAACCTCTGGTAAATAG-TTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGAAAA------AAAGG-AA-AATA-T-AAAGGAGA---CC-----TTCAAT-AT--TA----------TATT------------------------GAGTTTGGGATAATGAGTGTCAAAT-------TAACTTCCATCATTG-TCA-TTTG-AC-CAAACA-CTAAGTGATAATGTTATTAT-G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-TAAAAT----GT-CC-A-CGAC-A-A-G-GGT-------ATAGTCAATTGAATACTATTTTG--------CGA-C------AACAG-CGTGTCTTTGACATAATGCTGT-TGTATTGATGGTGGTAAAATGAAACACTG-TTT--AAAACCA-AAAATACAA---C-TAGAAC
gi|15 : GC-TATATCAATTTTAAG-AGTTGG-AAATAAGATAAAA-A-GGAAGAACAATTGGTGAactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtgctatatcaattttaagagttggaaataagataaaaaggaagaacaattggtgataaatattatt
gi|16 : gagatgttggacgttttcttaacctctggtaaatagtttttatttaaatatgaagtgaaaaaaaggaaaatataaaggagaccttcaatattatattgagtttgggataatgagtgtcaaattaacttccatcattgtcatttgaccaaacactaagtgataatgttattatgtaatgttccataattataaaatgtccacgacaagggtatagtcaattgaatactattttgcgacaacagcgtgtctttgacataatgctgttgtattgatggtggtaaaatgaaacactgtttaaaaccaaaaatacaactagaacactgacagttaagagcctcatagtatgtctgaccgtagatccccttggctttggtcacagaaattaattctgtAAATATGAAGTTGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGTAAA---CCCATAATATTAC-AT--TAGATCGCTGTTTATTTACG-----G--GTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGATAAGTGTCCACT-------TACCTTCCAACAGTG-TTACTTTC-TC-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTG-----------------CA--------TTA-TAA-CAAAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAGCAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATGCCTTTAAAATAA----------A--GATGGTGATACAATGAAGCtaaatattatt
gi|16 : TTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGAGAAAA-AAGGGAGAACAATTGGTGAGTGGCAAATAACAGCGTTTATGCA--TTGTTCTAATTCTGGTAAAATTGATCTTGATCACATTCTCCCTTAACATCGAC----CCCC-ATCGCCCA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-Ttttcaatatttcaagagttgaaaatctgagaaaaaagggagaacaattggtgagtggcaaataacagcgtttatgcattgttctaattctggtaaaattgatcttgatcacattctcccttaacatcgacccccatcgcccaaacaaaatgagtattcct
gi|17 : aaatatgaagttgaaaaacgaaaatttaaagtaaacccataatattacattagatcgctgtttatttacgggttttaacaagagtttgagatgataagtgtccacttaccttccaacagtgttactttctccaaacactaagtgataattttattagtaatgttgcattataacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttagcaatatattgcgacgtcagcatgcctttaaaataaagatggtgatacaatgaagctttcaataC-A-CGAT-A-G-G-AGC-------ACAATACATTTAATACTGTAATG--------TGA-C------GTCAG-CATGCCTTTGACATACTGCTTT-TGTATTGATAGTGATAAAATGAAGCATAGTTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGC
gi|17 : GGGCGTATGCCACTATCAAG-TGTTGA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAAATGATGAGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTGTAATTTTGGTGAAAGTGATCTTGACCGCTTGCTCCCTAAATTCCAAT----CCTC-ATCCCCTA-AACA----TTATGT------GATTTC----C-TTTTTTGACAATTA-GAC-T-----TTTTTATATTA---T------TAGGATAGCATTATTactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccagggcgtatgccactatcaagtgttgaaaatctgagaaaaagagagaacaaatgatgagtgacaaataacagtgtttatgcattgttgtaattttggtgaaagtgatcttgaccgcttgctccctaaattccaatcctcatcccctaaacattatgtgatttccttttttgacaattagacttttttatattattaggatagcattattg
gi|18 : cacgataggagcacaatacatttaatactgtaatgtgacgtcagcatgcctttgacatactgcttttgtattgatagtgataaaatgaagcatagtttcagaaccaaaataaaactagagcactggcaggacagtaagagcctcataaatgtctgattgtagatcccttggctttgatcacgagaattaattctttcccaAG-CCTACCTTTAAATCAATGCTTT-TGTAACAATGGTGATAAAATGAAGTATAATTTC--AGAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGTGGGC-TTTGTCACTTTCAAG-AGTTGA-AAATCTGATAAAA-A-GTGAGAACAATTGGTGAGTAACAAATAACAGTATTTATGCA--TTGTTCTAGTTTGGGTGAAATTGATCTTGTCCTCTTTCTCCTTAAACCTTGAC----CCCC-ACCCCGCA-AACA----AAATGAGTACCGGTATTC----C-TCTCATGACAATCATA----------ACCACTATTA---C------TAAGATAGCATTATTg
gi|19 : acaataagatatataaccccgtacataaagtatgttatttttatgcaatatatttgcatatgtatattaaaacctgtgttttttacacaagAACAATGATGATAAAATGAGGCAAAGTTGT--AGAATC--AAAATACAA---C-TAGAGCctctt
gi|19 : GGGC-TATGTCATTTTCAAG-AGTTTA-AAATCTGAGAAAA-A-GAGATAACAATTGGTGTGTGACAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTT-GTGAAAGTGGTCGTGATTTCTTATTCCCTAAACCCCGA-----CCCA-ATCCCTCA-AATA----ATATGA------GTTTTC----C-TTTTCTGACAATTATAAC-TCAAGATACCGCAATTA---C------TTGGATAGCATTATTTacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcgggggctatgtcattttcaagagtttaaaatctgagaaaaagagataacaattggtgtgtgacaaataacagtgtttatgcattgttctaattttgtgaaagtggtcgtgatttcttattccctaaaccccgacccaatccctcaaataatatgagttttccttttctgacaattataactcaagataccgcaattacttggatagcattatttta
gi|2 : aacaatgatgataaaatgaggcaaagttgtagaatcaaaatacaactagagcacttaaatggcagtaagagactcgtattgtgcccactctatattcctatggatttggtctcgggaattaattctgtctcggAGAGATATTGGACGTTTTTCTT-AACCTCTGGTAAATAG-ATT---------T--TATTAATATATGATATTTTTA------TATGA-AA-A--T-T-AAAAAAAAATATTCACGATATTAT-AT--TAGACTGCTGTTTA---A--------------TT-AAC-AGAGTTTG-------AAGTATCCACT-------TAGTTTACAATATTG-TCA-TTTT-TT-CAAACA-CTAA---ATAATT----------------------TTC-----------------CA--------TAATT-A-AAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-AGG-G-C-------ACAGTTAATTTTATAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-TATACA-ATGAGATAATGCTTT-TATAATGATGGTGACACAAGGAAGCATAGGTTT--AGAATC--Ata
gi|2 : GAGC-TGTGTCACTTTTAAG-AGTGGA-GCATCTGTGAAAA-C-TAGAGAACAATCGGTGAGTAAAAAATAA--GTGTTTATGCA--TTGTTCTGATTTGGGTGAAAGTGATCTTGACCTCTTACTCCATAAACTCCGAC----CAC--ATAACCCA-AACA----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAATTAGAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAGGGTAGCATTATCTtagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcaggagctgtgtcacttttaagagtggagcatctgtgaaaactagagaacaatcggtgagtaaaaaataagtgtttatgcattgttctgatttgggtgaaagtgatcttgacctcttactccataaactccgaccacataacccaaacaatatgagtattccttttctgacaattagaactcaagataccgctattactagggtagcattatcta
gi|20 : agagatattggacgtttttcttaacctctggtaaatagattttattaatatatgatatttttatatgaaaattaaaaaaaaatattcacgatattatattagactgctgtttaattaacagagtttgaagtatccacttagtttacaatattgtcattttttcaaacactaaataattttccataattaaaaaatgtccaagataagggcacagttaattttataatatattgcgacgtcagtatacaatgagataatgcttttataatgatggtgacacaaggaagcataggtttagaatcatagaagagcactgacagacagggcagtaatagcctgaccgtatatccccttgacctttgtcacaggaattaattctgtctcagGT-TATGTCACTTTCAAG-AACTAA-AAATCCGAGAAAA-A-GAGAGATCAATTGGTCAGTGACAAATAGCAGTGCTTATG-ATTTTTTTCTTATTTTGGTGAAAGTAATCTTGACCTCTT---------GCCCCGAC----CCCT--TCCTCCA-AACA----GTATGA------GTAGTC----T-TCTTCTTGTAATTAGAAC-TCAAGATACCGATTTAA---C------TAGGATGGCTTTATTa
gi|21 : aacaaaaaaaacctagagccctgaaagggcaacaagagcctcgtagtgtgcctgactctatatcccattggctttggtcacaacattaattctgtctcaggtT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTATG-----TG-TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGGTGATAAGGGTCTTCT-------TACCTTCCAGCATTG-TTACTTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATGA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAGT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-ATC-------ACAGTTAATTTAGTAATATATTG--------CTA-C------ATCAG-CATACCTTTGAAATAAAGCCTT-TAAAAAGATGCTGATTCAATGAAGCATActa
gi|21 : ATAAGCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAGAGAGACTTATTagcataactcaagataccgctattactaagagagacttattctatt
gi|22 : tattagattgctgtttatttatgtgtttttaacaagagttggaggtgataagggtcttcttaccttccagcattgttacttttttcaaacactaagtgataattttatgagtaatgttccataataacaaagtgtccaagataaaatcacagttaatttagtaatatattgctacatcagcatacctttgaaataaagcctttaaaaagatgctgattcaatgaagcA-ATATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTTAGTGGCAAATAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAGCATTGATCTTGATCACTTTCTTCAATAACCTCGA-----CACT-ATCACACA-AACAAAATAAATGA------GTATTC----CTTTTTCTGAAAATCATGAC-TTAAGATACAGTAATTG---C------TAAGATActatt
gi|23 : tgataaagaatatgatagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATATTAGACGTTTTTCGT-AGCCACTGTTAAATAGTTTT---------T--TATTTAAATTTAAAGTGGTAA------AAC-A-AA-AATT-T-AAAGGAGA---CCCACAATATTAT-AT--TATATTGCTGTTTGTTTGCG-----G--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTAC-ATT-TT-CAAACA-CTAAGGGATAATTGTATTA--G--T------AATATTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAAT----GT-CA-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTTAAtacttatgtt
gi|24 : CAGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AATCTCCGGTTTATAG-CTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCTATAAT---AT-AT--TAAAGTGCTATTTATTTACG-----T--TTTTTT-AACAAGAGCTGGAGATGATAAGTATCTATC-------TACCTTCCAACATTG-TTACTTTT-TT-AGAAGA-CTCAGTGATAATTTTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-T-A--AAAATAAGGGT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACA
gi|25 : TAAATAA-GTT---------T--TAAATAAATATGAAGTGGA-------------------TT-T----------------TTATTTTAC-AT--TTAACTGCTGGGTATTTACA-----C--TTT-T--AACACGAGTTTGAGGTGATAAGTGT-----------------TCTA----------------TT-CAAACA-TTAAGTGATA-TTTTACTG--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAC-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-G-GGC-------ACAGTAAATTTAAT---ATATTG--------CAT-C------TTCAG-CATGCCTTTGAGATAACGCTTT-TGTAATGGTGGTGATAAAA
gi|26 : aATTTAAATAGGAAGTGGAAA------AATGA-AA-ACTT-C-AA-GGAGA---CCCATAATATTAT-AT--CATATTGCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TC-AACAAGATTTGGAGATGATAAGTGTTTGCT-------TACTTTCTAACATTG-TTACTTTT-TT-TGACCA-CTAAGTGATGATATTATTA--T--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TAA-CAAAAT----GT-Caatg
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT---------T--TATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-T-AAAGGAGA---CCCATAATATTAT-GT--TACATTGCTTTTTATTTACG-----G--TTT-T--AACAAGAGTTGGAGATGATAAGTGTCTACTGGCT---TACCCTCCAACATTG-TTGCTTTT-AT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATTA--C--T------AAGGTTC-----------------CA--------TAA-T-A-
gi|28 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggGAGATGTTGGACGTTTTTCTT-AACATCTGGTAAATAG-TTT---------T--TTATTATATATGAAGT------------------A-AATG-T-AAA----------CATACTTTTAT-AT--TAGAT-GCTGCTTATTTACG-----GAATAT-TT-AACACGAATTGGAGAT---AAGTGTCTACTTAGTACTTACCTTCCAA-ATTGTTTACAGTT-TT-CAAACA-CTGAGTGATAA-TTTATTA--a
gi|29 : GA-AAATCTGAGAAAA-A-G------CAATTGGTGAGTGACAAATAACAGT--TTATGCA--TTGTTCTTATTTTGGTTAAATTTATCTTGATCGCTTTCTCCTGAAACCTCGAC----CCCT-ATCCCCTA-TACA----AAATGA------GAATTC----A-TTTTCTGACAATCCTAAC-TCAAGATATCGCTATTA---C------TAAGATAGACTTATTTcttctacttttgataacgtatcaaatt
gi|3 : TCAGAAATATTGGACGTTCT-CTTTAACCTCTAGTAAATAG-TTT---------T--TATTCAAATATGAAGCGAAAA------AA----GA-AATT-T-AAAGAAGT---CCCATAATTTTTTCAT--AAGATTGCTGTTTATTTGTG-----T--TTT-T--GACAAGATTTTTAGATA-------TCTAGT-------TACCATCCAACAATT-TTATTTTT-TT-TAAAAGGCTAAGTGATAATGTTATTA--G--TTACTGTAATGTTT-----------------TA--------TAA-TTA-TAAAAT----AT-CC-A-AGAT-A-A-A-A-TT------ACAGTAAGTTTAATACTATGTTG--------CCA-C------GTCAG-CCTACCTTTAAAGTACTGCTTT-GGTAACGATGGTTATAAAATAAAGCATAGTTTT---GAATCCAAAAATAAAAAAAC-TAGAGTGAGC-TGTGTCACACTCGAG-AGTTGA-AAATAAGAAAAAAAA-GAGAGAACAATTGATGAATGAAAATTAACAATATTTATGCA--TTGTTCTAATTTTAGTGAATTTTATCTTGACCTCTTTTTCCCTAAACCTCGAC----CCCCTATTCCTCA-AACA----AAATTA------GTATTC----C-CTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATACCGCTATTA---C------TAAAATAGCATTATTta
gi|30 : TAT-AA--TATATTGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGAGTTGGAAATGATAAGTGTC---------------------CATTG-TTACTTTT-TT-CTAACA-TTAAGTAATAA---TATTA--T--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-CAA-CAAAAT----TT-CCAA-AAAT-A-AGA-A-C-------TCGGTAAAct
gi|31 : GATATGTTGGAA--------TTAACCTCTGGTAAGTAG-CTT---------T--TATTTAGCTATGAAGTG-AAA------AAGGA-AA---TT-T-AAAA---A---CCCATAATCT-AT-AT--AAGATTGCTGTTTATTTATA-----A--TTT-TT-AACAAGAGTTTGAGATGAT
gi|32 : GATGTTGGACGTTTTTCTT-AAC-----GTAAATA--TTT---------T--TATTT-----T-AAGTGGAAATTTTTT-----------TT-T-AAAGGAGA---CCCATATTTTTAT-AT--TAAATTCCTGTTTATTTATG-----T--TTT-TT-AACATGAGTTTGAAATGtacgcttagt
gi|33 : TGAAAGTGTTCTTGATCTATTGCTCCCTATACCTAGAC----CCC--ATCCCCCA-AACG----ATATGA------GTATTC----C-TTTTCTAACAATTAGAAC-T-AAGATACCGCTATTA---C------TAAGATAGTATTATT
gi|34 : AAATGTTGGAC-TTTTTCTT-AAAATTTGGTAAATAG-GTT---------T--TATTTAAATATGAAGTG-------------GA-AA-AATT-A-AAAGGAGA---CCTATAATATTAT-AT--TAGATTcta
gi|35 : ----AAAT-A------TTATTG------TTTCCTGACAATTTGAGC-TCCAGATACTGCTTTTA---T------TAAGATAGCATTATT
gi|36 : aacaattggtgatCA-AACA----ATATGA------GTATTCATTCC-TTTTCTGACAATTAGAAC-ACAAGATACCGCTATAA---C------TAGGATAGCActct
gi|37 : TTCCCCA-AACA----AAAAGA------GTATTC----A-TTTTCTGACGATCAAAGC-TCAAGAAACCGATATTT---C------
gi|38 : cacggTAT-AT--TAAATTGCAGTTTATCTATGGGCTTT--TTT-TT-AACAAGAGCTTAAGATGATA
gi|4 : TCAGAGATGTTGGACGTTTTTCTTTAACCTCTGGTAGATAG-TTT---------T--AATTTAAATATGAAGTGGGAA------AACGA-GATAATG-T-AAAGGAGA---CCTATAATATCAT-AT--TAAATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-TT-ATCAAGAATTGGAGATGATAATTGTCTACT-------TACCTTCCAACATTG-TTACGTTT-TT-CAAACA-CTAAGTGATACTTTTATAA--G--T------AATGTTC-----------------CA-------------------AAT----GT-CG-A-AGAT-A-A-A-A-C-------A--GTAAATTTAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACGTTTAAAATAATGCTTT-TAAGAAGATGGTGATCCAATGAAGCATATTTTT--ATAACC--AAAATAAAA---C-TAGAGCAGGG-TCTGTCAATTTCAAG-AGTTGA-ACATCTGAGAAAA-A-GAGAGAACAGTTGTTGAGGGTAAAGTAACAGTGTTTATGCA--TTGTTCTAATTTTGGTAAAATTGATCTTGGTCATTTTCTCC--------CAAT----CCCC-ATCCCCAA-AACA----CAATTA------GTATTT----C-CTTTCTGACAATAATAAC-TTGAGATACCGCTATTA---C------TAAGATATACTTATTT
gi|5 : CAGAGATGTTAAACGTTTTCCTG-AATCTCTTGTTACTAG-TTT---------T--TGTTTAAATATGAATAGGAAA------AA--A-AT-AATT-T-TTTCTAGA---CCAACCATTTTAT-ATATTA-ATTGCTG--------CG-----T--TT------ACAAATGTTTGAGATGATAAGTGACTCCT-------TATCTTCCATTAATG-TTATTATT-TT-CAAACA-CTAAGTGATAATTTTATCAAAG--T------AATGTTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAATAT----GT-CC-A-ATCT-A-A-A-A-TTTGTAAAACAGTAAATTTGATGATATATTG--------CGA-C------ATCAA-CCTACCCTTTA-ATAATGCTTT-TGTAACGATGGTAATAACATGA------GTT---------C--AAAATAAAA---C-TAGAGCTGGC-TATGTCACTTTCAGG-AGTTGA-AAATCTGA-AAAA-A-GATAGAACAGTTGGCGAGTGACAAATAACAGTATTTATGCA--TTATTCTAA-----GTTAAAT----CTTGACTATTTTCTCATTAAACCTTGAC----TTT--GTGCCCTA-AACA----AAATGA------GTAATC----C-TTTTCTGACAATCATAAC-TCAAGATAACGGTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|6 : AAATAG-TTT---------T--AATGTAAATATGAAGTTGAAA------AAAAAGAA-AATT-T-AAAGGAGT---TCCACAATAGCAT-AT--TAGATTGCTGTTTATTTACA-----T--TTT-T--AACAAGCGTTTGCTATGTTAAGTGTCTATT-------CACTTTCAAACAGTG-TCAGTTTT----CAAACA-CTTTGTGATTATTTTATTG--G--T------AATGTTT-----------------CA--------CAA-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-ATGT-A-A-GGA-C-------ACAGTAAAATTAACAACATATTG--------CCAGCATATAAGTCAG-CATGCCTTTGAGATAATGATTT-AGTAGTGATGGTAATACAATAAAGCAAAATTTT--AGAACC--AAAATACAA---C-TAGAGCgt
gi|6 : cGGGC-TAAGTCACTTTCAAG-ATTTGA-AAATCTAAAAAAA-A-GAGAGAACAATTGGTGAGTGACAGATGA------TCATG-A--TT----------------------TCTTG------TTCCC--TAAACC-CGACCCCACCCC-ATCCCCCCTAACA----ATATGA------GTATTA----C-TTTTCTTACAA-CATAacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccggggctaagtcactttcaagatttgaaaatctaaaaaaaagagagaacaattggtgagtgacagatgatcatgatttcttgttccctaaacccgaccccaccccatcccccctaacaatatgagtattacttttcttacaacata
gi|7 : caaatagttttaatgtaaatatgaagttgaaaaaaaagaaaatttaaaggagttccacaatagcatattagattgctgtttatttacatttttaacaagcgtttgctatgttaagtgtctattcactttcaaacagtgtcagttttcaaacactttgtgattattttattggtaatgtttcacaattacaaaatgtccaatgtaaggacacagtaaaattaacaacatattgccagcatataagtcagcatgcctttgagataatgatttagtagtgatggtaatacaataaagcaaaattttagaaccaaaatacaactagagcacttaaagggcagcctgagccccgtatatcctcttgcctttggtcatgggaattaattgtgtctccgGTAAATAT-TTT---------T--TGTTTAAATATGAAGTGGAAA------AACGA-AA-A-TT-C-AAAGGACA---CCCATAATTTTAT-AT--TAGATTGCTGTTT-------------------TT-A-CAAGAGTTTGAGTTGATAAGTGTTTATT-------TACCTGCCATCAATA-T-ACTTTT-TTTCAAACA-CTAAGTGATCAATTTATTA--G--T------AATGCTC-----------------CA--------TAA-TTA-CAAAAT----GT-CC-A-AGAT-A-A-A-AAC-------ATAGTAAATTTAATAATATATTG--------CAA-C------GTCTG-CTTACCATTAAATTCATGCTTT-TGTAACGATGGTGATAAAACGAAGCATAGTTTT--AGAACC--AAACTAAAA---C-TACAGCGGGT-GATGCCACTTTTAAG-AGTTGA-AAATATGACAAAA-A-GAGAAAACAATTGGT-AGTGACAAATAACAGTATTTATTCA--TTGTTCTAATTTTAATGCCATTGATATT-ACCTCTTTCTGCTTAAACCTCGAC----CACC-ATCCCTTA-AACA----AAATGA------GTATTC----C-TTTTCTGACAACCATAAC-TCAAAATAACACTATTA---C------TAAGATAGCATTATT
gi|8 : tcTCAGAGATGTTGGACGTTTTTC-TTAACCTTTGATAACTAG-TTT---------TAATAATTTTATATGAGATAGcttt
gi|8 : ATAATTTTAT-AT--GAGATAGCTGTTTATTTACG-----T--TTT-TT-AACAAGACTTTGACATGATAAGAGTCAACT-------TACATTCCAACAACG-CTA-TTTT-TT-TAAACA-CTAAGTGATAATTT-------G--T------------------------------CA--------TAATT-A-CAAAAT----GT-CC-A-AGATAA-A-A-A-C-------ACAGTAAATTTAATAATATGTTG--------CGA-G------ATCAATCGT-CCTTTAGTTTAATGTTTT-TGTAGCGATGATCTTAAAATGAAGCATAGTTTTTCACCCCC--AAAATAAAG---CGTA-AGAGGGC-TAT-TCACTCTTAAG-AGTTGT-AAATTTGAGAAAA-A-GAAAGAACAATTGTTGAGTGACAAGTAACAGTATTTATG-A--T--------TTTTGGTTAAATTGATCTTGACC-CTTTCTCCCTACACCTCAAC----CCCC-ATCCACCG-AACA----AAAAGT------GTATTC----C-TTTTCTGACAATCATAAA-TC-ATATACCGCTATTA---CACGTATCAAAATAACATTATTctgtttatttacgttttttaacaagactttgacatgataagagtcaacttacattccaacaacgctatttttttaaacactaagtgataatttgtcataattacaaaatgtccaagataaaaacacagtaaatttaataatatgttgcgagatcaatcgtcctttagtttaatgtttttgtagcgatgatcttaaaatgaagcatagtttttcacccccaaaataaagcgtaagagggctattcactcttaagagttgtaaatttgagaaaaagaaagaacaattgttgagtgacaagtaacagtatttatgatttttggttaaattgatcttgaccctttctccctacacctcaacccccatccaccgaacaaaaagtgtattccttttctgacaatcataaatcatataccgctattacacgtatcaaaataacattattatatt
gi|9 : tcagagatgttggacgtttttcttaacctttgataactagttttaATTTAAATATGAAGTGGAAA------AACG--AA-AATT-T-Aatatt
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaATTTACG-----T--TTT-TTTAACATGAGTTGGAGATGATATGTGTCTACT-------TACCTTTCAACATTA-TTCCTCTT-TA-CAAACA-ATAAGCGATAATTGTATTA--G--T------AATGTTC-----------------CA--------TAC-T-AACAAAAT----GT-CC-A-AGGT-A-A-A-AAC-------ACAATAAATTCAGTAATATATTG--------CGA-C------GTCAG-CATACCTTTACAATAATGCTTT-TATAAAGATTGTGATACAATGAAGCATAGTTTT--AGATCC--AAAATAAAA---C-TAGAGCGAGG-TATGTCACTTTCAAA-TGTTGA-AAATCTGAGAAAA-AGGAGAGAACACATGGGAAGTGAAAATTAACAATGTTTATGCA--TCGTTCTAATTCTAGTAAAATTAATCTTGATTACTTTCTTACTAAACCTACAC----CCCT--TCCTCCA-AACA----AAATGA------GT-------------------AATTGTAAT-TCAAGATACCGCAAATA---C------TAAGATAGACTTATTTcgtttttttaacatgagttggagatgatatgtgtctacttacctttcaacattattcctctttacaaacaataagcgataattgtattagtaatgttccatactaacaaaatgtccaaggtaaaaacacaataaattcagtaatatattgcgacgtcagcatacctttacaataatgcttttataaagattgtgatacaatgaagcatagttttagatccaaaataaaactagagcgaggtatgtcactttcaaatgttgaaaatctgagaaaaaggagagaacacatgggaagtgaaaattaacaatgtttatgcatcgttctaattctagtaaaattaatcttgattactttcttactaaacctacaccccttcctccaaacaaaatgagtaattgtaattcaagataccgcaaatactaagatagacttattttatt