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Reference ( gi|1 ) : CAGTGTAAA-ACGCTGACGCT--T--CAGCT-GAC-A---ATA------TAGGTAAAGAAGGAA---ACC---GCTGAC-A--ATATGTACAAAGA-A-G-G-AAA-C-GCTGAC-A--ATATG----TACAAAGA-A-GGAAA-CGCTGACGATA---T--AG--AAAT-TG-----AA-GG--AA-A-T-GCTGA---CA--TTATGAAA-TAGA---CT-A-CTATAT---T-T-T--------AT----TC---AAG-AAGG------A-AAT----ATA-TAGAC---A---TATATTT----A----------TGGCAG-ATTT--TCATATTACAGTAAAATATTAGGATGTTAAAGATCAAGGTTTTAAGCAATTAAATTATTAGA----GATTTGTTTGCTACCATCATAATGCAATAAGAAATAAAA-AAAACTGTTATATTGTGTGGAAGTTGTTTGTTTAAATTCATTTTTATCAATGTATTTGTGCATTAATTTTGTTTGTCTTTGTGTGTTTAAGGAAATATAGGCTTATTATATCCATTGAAAAACGATTGAATAAGATGAATTCAAACATGATTGTTTGATCACACAATGGTTTATTGTTTTTAAACTGTTTGT---GACTTATTATAAATGTAATCAATGATCATTT--AAATAAAAATCGGCTGTATAGATG-GATCAAAGATTGAATTGATGTTAATTATATTAATCCGTGACAATTTTGAAACGTTTGTCTAATAGAATGCTTTCAGAC------ACGATTGTTTGATCACACAATGGTATATCGGTTTGAAACTATTTGTGGCTTAGTGAAAATGTTATAATTGATAAGTTTAAATCAAAAGCGGCTGTAAAGTTAGAACAAAGATATAATTGATGTTAATTACATTTATCCGTGAAAATTCTGCGGTCCTTTAATCGTTTGTCTAATAATTTGATTTCAAAC------ACGATTGTTTGATCACACAATGGTATATCGGTTTGAAACTATTTGTGTCTTAGTGAAAATGTAATAATTGATCATTTTAAATTCAACGCGGATGTATAGGTGGATCAATGCTATAATTGATGTTAATTACATTAAACCATGAACATTTTGCGGTCCGTTAATCGTTTGTGTAATAATATGATTTCAAAC------ACAATTGTTTGATCACACAATGGTATATCGGTTTGAAA-CAATTTGTGTCTTAGTGAAAATGTAATAATTGATAATTTTGAATTAAAAGCGGTTGCATT-----AACATTAAAAATACAACAAGTTAGACAAACTGAGAAATATTCATGTATAAAATGGTAAAGGTGTATGTTGATTTCATTCTAAATTATTTATGCGTTTGAGTTAATATATTCTTCAATTCTAATAACAAGTTTGGGTGTATGCTTTAGACAATATATAATCAATTGATTTAGTTTATATCAGCTGTGTTTTATAAGGACTTTATTGTGAACATTCGCTACTGTGTAAGTCAAAAATGGCTTTTGTGATCGGACATAGTTAGGCAAAGTACTTGTCTGAGTATCTTAGCCATGACAGTTACAGTGTGTTTTCGTACCCAGGATTTAGGACTTTCTAGTTTCGCCAGGAGCAGGATATCTTTGACGTTGTGCCATACTTCTCGGTAAGATCATTCAAACCATTTGATAATAAAAAATATATGCTCTATCTACATTGTAATGTTTGCAAGTTCATCTGTTATTTCAACCTGTACATGTTATTATTCATAGATAGATGTAATTTATCTTAAGAAT---TATGTAAATTACA------CATGC--GCCAATCATTGATTGACTTACATGACAATATTTAATTTACATATTTATTCTTTAATATGCCATGACCTTAAGCATTAACCCCCGTTGTCTCAGCTCCGTCTTTAATTGATAGTTAATACAATTTTATGACACGGATATTC---CCCCACCCC-----CGCAGGCAATTCTGTAGTTGTTGATTGCATATTAATTTACGATATTTGTGACAGTAGC-CTACATGTCACATT-TGTCGTCTGCAT--TTG--CACTGTAAT--TAAGAGTAA---GCATGTAATA---------TGCATTATTTTATT-TAA----TGTAG-GTATTTATGTCATA---ATTGATTTATT-----------TTTATATGA-AA---------TTTAACA-------AA-------AT-----------A-------TGAATA------TATTTCGGCTATATTATTTA-----AGAAT--------TGATCATAT-TAG-CGATATAGACAGTGTGTGT-C-----GTCT---GCATTTTCATTATAGCTCTATA-GCGTCAGCGTTTCCCTTC--T--TTCTACATAT-CGTCAGCGGTTTC-CTTCTTTGTATATAT--T-GTCAGCG-TTTTCATTCTTAGTCTATATGCTGGTCAGCGCAAGCGTGGGTCTGCATTATTA--TTATAA-GAGGTGTTGTTATTCA-TGTCACAATGG-ATT----TATTTTAACAAGAAATTTAGCAAAATA----ATAA----G--TGAATATATTCTGGCTATATTATTTANNNNNNNNNNA-A-TAAG---T--GAATATATTCTGGC----TATATTATTTAAGAAT--------TGATCATAT-TAGCGATATAGA--CAGTGTGTGT-C-----GTCT---GCATT----TTCATTA--TAG-T-T-TATA-GCGTCAGCGTTTCCCTTC--T--TTCTACATAT-CGTCAGCGGTTTCCTTCTTTGTATATAT--T-GTCAGCGTTTTCATTCTTAGTCTATAT-----GCTGGTCAGCGCCAGCGTGGGACTGCACTATTATTA--TAA-GAGGTGTTGTTATTTATGTCACAATGGAT-TTATTTTAACATGAAA-T--TTAGCAAAAAAATAA--G--TGAATATATT--CTGGCTATAT--TA-TTTAAGA---ATTGATCATATTAGCGTTATAGACAGTTT--GTGTC-----GTCTGCATTTTCATT--ATAGCTATATA-GC------GTCAGCGTTTCCCTTCTT--TCTACATA-TCGTCAGCGGTTTCCTTCTTTGT
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gi|13 : tgGTGTAAA-ACGCTGACGCT--T--AAGCT-GAC-A---ATA------TAGGTAAAGAAGGAA---ACC---GCTGAC-A--ATATGTACAAAGA-A-G-G-AAA-C-GCTGAC-A--ATATG----TACAAAGA-A-GGAAA-CATTGACGATA---T--AG--AAAT-TG-----AA-GG--AA-A-T-GCTGA---CA--TTATGAAA-TAGA---CT-T-CTATAT---T-T-T--------AT----TC---CAGAAAGG------A-AAT----ATA-TAGAC---A---TATATTT----A----------Tctactatattttattccagaaagaaatatatagacatatatttatggcagattttcgtatcacagtaaaatatatggatgttaaagatcaacgttttaagcaattaaattattagatagagattggtttgccaccatcataatgcaataaaaaataaaaactgttacattgtgttaaagttgtttgtttaaattcatttatatcaatttatttgtacattaattttgtttgtatgtgtgtgtttaaggaaatataggcttattatatccattgaaaaacgactgaacaaaatgaattcaagcatggttgtttaatcacacaatggtatatcggttttaaactgtttgtcacttactataaatgtaatcaacgatcatttaaataaaaagcggttgtatagttggatcaaagatataattgatgttgattatattaatccgtgacaattttgaaacatttgtctattagaatgattttagacacgattgtttgatcgtacaatggtatatcgtttcgacactatttgcgtcttattaaaaatgtaataattgataattttaaatcaaaagtggttgtattgttggaacaaagatataattgatgtaaattacatcaatccatgaaaattttgcggtcctttaatcgtttgtctaataat
gi|12 : gGTGTAAA-ACGCTGACGCT--T--AAGCT-GAC-A---ATA------TAGGTAAAGAAGGAA---ACC---GCTGAC-A--ATATGTACAAAGA-A-G-G-AAA-C-GCTGAC-A--ATATG----TACAAAGA-A-GGAAA-CATTGACGATA---T--AG--AAAT-TG-----AA-GG--AA-A-T-GCTGA---CA--TTATGAAA-TAGA---CT-T-CTATAT---T-T-T--------AT----TC---CAGAAAGG------A-AAT----ATA-TAGAC---A---TATATTT----A----------T
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gi|2 : ATATAG---TAGTCTATTT-CATAATGTCA---GCATT----TCCTTCA---AT-T-TCTATA-TCGTCAGCGTTTCC-TTC--T--TTGTACATAT-TGTCAGCG-TTTCCTTCTTTGTACATAT--T-GTCAGCGGTTTCCTTCTTTACCTATATTGTCAGCT--TAAGCGTCAGCGTctgtcagcgaatgtaggacaaaagctccttgataaaaaaattagattttagatgtttcttctaaatccttcgacctcaatagagaagtacaaattattattttaaaccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggtttggatatctgcactttgttttgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgccagagtatcacaggaatttttaaacactttcaataatattgctttacaaacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttgttgtgcaatacagtttctatactgccttcaagtccccatcatcaattgggcagccataaagagatgactgttttgccgctttacctcaaaacac
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