lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                 11111111                          222222222222                       1                                                                                                                    44444444444  11   11       
lowQualScore                  :              2          1   22     66666 1  3333333     8  222   222 5  111        1   1     1  0 88888888     333333  44444444     2222           555555555555 222 11 11 66  1 00000000  33 1 1   222 4444       111111111111 11    6666666666666   6  222      1   22    11 0 1            7   2    3333    1   22 22              77  1         5555 3  3 1    2   4   88888888888  00   22       
lowQualScore                  :              .          .   ..     ..... .  .......     .  ...   ... .  ...        .   .     .  . ........     ......  ........     ....           ............ ... .. .. ..  . ........  .. . .   ... ....       ............ ..    .............   .  ...      .   ..    .. . .            .   .    ....    .   .. ..              ..  .         .... .  . .    .   .   ...........  ..   ..       
lowQualScore                  :              1          0   88     22222 0  2222222     8  666   777 1  888        1   1     1  1 99999999     888888  88888888     8888           777777777777 222 77 88 88  3 66666666  55 3 4   222 4444       777777777777 77    7777777777777   0  000      1   44    44 7 1            5   1    1111    0   55 66              22  2         7777 0  3 7    1   4   00000000000  00   00       
consensus                     :          GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TC-GG-------ACCCANGA---TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-------CACGGC------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--A--GA-CA-C--T-----TT-TT-C-CGC---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---ACCCAG-GAA--GACT--TCG-AGCGTGATTTGTNTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCGAN-GT-AAAATAAAT----A-AG-T-TTAA-AAC-AAA---ATNCTGGTATNTATCGACTCAAGT
Reference ( gi|1 )            :          GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----CC-GA-------ACCCATGA---TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-------TACGGC------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--A--GG-CA-C--T-----TT-TT-C-CGC---A----TATGCTT------T-----G--TACT-------------GGTACT---ACCCAG-GAA--GACT--TCG-AGCGTGATTTGTCTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCGAA-GT-AAAATAAAT----A-AG-T-TTAA-AAC-AAA---ATTC----ATTCATCAGCTCAAGTCTAAGAATATTCTTCGGAAGGTTGGTGTATTCCACCCC
gi|12                         :          GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TC-GA-------ACCCATGA---TCG---G-GG---GTCG-GGG-TTC-GACCCTCCGC-------CACAGC------TACATTCGTTTGTGT----GGTATCCTTGA-G----------C---A--A--GA-CA-C--A-----TT-TT-C-CGC---A----TATGCTT------A-----G--TTCT-------------GGTTCT---ACCCAG-GTG--GAAT--T-G-AGCGTGATTTGTCTA-----------------------------ACAACCGAA-GT-AAAATAAAT----A-AA-T-TT
gi|47                         :       ggaGCACTTGGTCCAGTG-GTA--AAACA----TT-GG-------GCCCATGA---TTG---GAGG---GTCCTGGG-TTC-GATCTCCCGC-------CACta
gi|36                         :          GCTCATGGCCTAGTG-ATA--GGGAA----CCAGG-------TTCTATAA---C------AGA---GTTGCGGG-TTT-GATCCCCAAC-------CTCGTC------TA--------TGTAT----TGTGTCTTTGA-G----------C---A--G--GA-CA-C--T-----TT-attta
gi|77                         :        gaGCGCGTGGTCTAGTA-GTA--GAGCA----CC-GA-------ACCgt
gi|53                         :     gtggaGCTCATGATCCAGTG-GTA--GAGCAT---CC-GACTGTCTGATCCATGA---TC
gi|49                         : atatgtggaGTGCGTGTTGCAGTG-ATA--G-GCA----TC-GG-------ATAATTGA---TCG---GTTT---ATCGTGAG-ATC-GATCCCCC
gi|60                         :     tcgtggaGCATGGTCCAGTA-GTA--GAGCA----TT-GG-------ACCAAGGA---TTA---G-GG---ATC
gi|32                         :     gggtggggCATGGTCCAGTG-GTA--GGACT----TC-GA-------ACCTACGA---TCG---G-GG---ATCGCGAA-TTC-GAACCTGCGC-------CACGGC------TA--------TATGT----GGTGCCATTGACA----------C---A--A--G---A-C--T-----AT-AT-C-CGC---A----TATGCTT------
gi|39                         :            aCATGGTCCAGTG-GTA--CAGCA----TC-GG-------ACCCAGGA---TCG---GAGG---GTCACGGG-TTT-GATCCTCCCC-------CATGGC------TT--------TGTGC----TGTGTTCTTGA-A----------C---A--a
gi|27                         :             CGTGGTCCAGTG-GTT--GAGTA----TC-GA-------ACCCAGGA---CCG---GAGG---ATCGTTGG-TCC-
gi|10                         :             CATGGTCTTGTG-GTA--GAAAA----TC-TG-------ACACGGAA---CTA---TAGG---GTCGTGA--TTC-GAACCCCCAA-------AACTGT------TA-----------AT----GAT--CCATAA-G----------T---G--ATTG--------T-----CT-TT-A-AGT---A----TATGTTT------A-----A--TACT-------------GATTTT---ACTCAG-GAA--GACT--TTG-AGCCTGATTTGTTCAA-GTTGA---TATG-AAatgtctatatgtattagtactggatctacccaagaagacttttggtgtgacttgtataagcttgtttcacattcgacataaaattattaagtttaaacc
gi|64                         :     gtagaactCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TT-GG-------ACCAATGA---TTG---GGGgtaaataatagtgtaaaagtacagtatt
gi|70                         :   gagtgggggaCATGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TT-GG-------GCCAAGGA---TTG---GGGG---
gi|59                         :        ggggaCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TT-GG-------ACCAAGGA---TTA---G-GG---GTTGT
gi|4                          :        tgggggaTGGTTCGGTG-GTC--GAGCA----AC-AA-------ATCCATGA---CCG---GAGT---GTCGTTGG-TTC-GATCTACCGC-------CACGGC------TA--------TTTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--A--GA-CA-C--A-----TT-TT-T-CGC---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---ACCCAG-GAA--GACT--TCG-AGTGTGATGTGCATAA-GCTG----TAAG-AAT--T--TGTTTAACTGTCGAA-GT-AAAATAGAT----A-AG-T-TTAA-ATC-A
gi|6                          :               TGATTCAATG-GTA--GAGCA----TA-GA-------ACCTAGGA---TCG---GAGG---GTCACGGG-TTC-AGTTCACCCC-------CACAGC------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTCA-G----------C---A--A--GA-CATT--T-----TT-TT-C-CTT---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTTT---ACCCAG-GAA--GACT--CCG-AATGTGATTTTTTTAA-GTTG----TAAT-AATAATAATGTTTCACAATCAAA-GT-AAAATAG------A-AG-T-TTt
gi|16                         :               TGGTCCAGTT-ATA--GAGCA----TC-AG-------ACCAAGGA---TCG---G-GG---GCTGT-----------CCACCGT----------GTC------TA--------TGTGT----GGTGGCCTTGA-C----------C---A--A--GA-CA-C--T-----TT-AT-C-TGC---A----T------------------G--TACT-------------GGTTCT---GCACAG-GAA--GACT--TC--AGCATGATTTGTCTCA-GTTG----TAAG-ATC--T--TGTTTCACAATCGAT-GT-A------------A-AG-T-TTAA-AACTAAA---A
gi|71                         :               TGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TT-GG-------CCACAGGA---TCGA--GAGT---GTcac
gi|67                         :              tTGGTCCAGTATGCA--AAGCG----TC-GG-------ACCAAGGA---TCG---Gtat
gi|21                         :      gttgatcagaGGCCCAGTG-GCA--GAGCA----TC-AG-------AGCTATGA---TCG---GGAG---GTCGTGGG-TTT-GATCCTCCTT-------CATGGC------TA--------TTTGT----GGTGTACTTGA--------------------------A-C--T-----TT-T----------------A-----------------G--TACT-------------GGTTCT---ACTAAG-GAA--GACT--TTG-AGTGTGATTTGTATAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAGTCG
gi|19                         :                GATTCAGTG-GTA--GAGCA----TC-GG-------ACCCAGGA---TCG---GAGG---GTCATTGG-TTC-GATCCATCGC-------CACGGC------TA--------TGTGT----GGTGCACGTGA-C----------C---A--A--Ggtg
gi|20                         :                GGCCCAGTG-ATA--GAGCA----TA-GG-------ATCTAAGAT--TCT---GGGGACTGTTGTTGG-TTT-GATCCTCTGC-------CGCACC------TA--------cgtgacccatgaatacttcgtgcgtggtttgtaataataactagtttcaaaaacaaagaataacaaataagttgaaatca
gi|58                         :                GATCCAGTG-GTC--AAACA----TC-GG-------ACCCAAAA---CCG---GAGT---GTTGTTAG-TTC-Gactgcatatataattactggttctacccagtaagagcaggattttaagttgtttcactgtaaaaataataagtttgctcactatttgtaatgcat
gi|51                         :             gccGGTCTAGTG-GTA--GAACA----TC-AG-------ACCTG-GG---TTA---GGGA---GTCATCGG-TTT-GAT
gi|14                         :                 GTCAAGTG-GTA--GAGTA----CC-AA-------ACCCATGA---TCG---GTGG---GTCGCGGG-TTC-AATCCTCCGC-------CACGGC------TA--------TATGT----GGTGTCCTTGG-G----------C---A--A--GA-CA-C--------TT-TT-C-CAC---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---AACCAT-GAA--GAAT--TCG-ATTGTGATTTGCCCAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCGCAATCGAA-GT-AAAATAAAC----A-Ataactgtcaaggccat
gi|9                          :                 GTCTAGTG-GTA--AAG---------GA----------TA-GG---TTG---GACG---GTCACAGG-TTC-AATCCACAAC-------CATAGT------CA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--A--GA-CA-T--T-----TT-TTTC-CGT---AAAATTGTGCCT-----------------CT-------------GGTTCT---GCATAG-GAA--GACT--TCG-AGCATGATTTGTATAA-ATCG----TAAT-AGC--T--TGTTTCACAATTGAA-AT-AAAAAAGGTTTC-A-AG-T-TTAA-A
gi|68                         :                 GTCTAGTG-GTA--GAGGA----TC-GG-------GTCTAGGA---TCG---GAGG---GCCATTAG-TTca
gi|5                          :                  TCCTGGG-GTA--GAGTA----TC-GG-------ACCAAGGA---TCGTGGGTGG---GTTGGGGGATTT-GATCTTCCAT-------CATGGC------TA--------AGTAT----GGTTTCCTT-A-G----------C---A--A--GA-TT-C--T-----TA-AT-C-TGC---A----TATGCTA------AA----G--TACT-------------GGTTCT---ACCCAA-GAA--GACT--TAATAG-ATGACTT-TTTGT-ATTG----TAAT-AAT--T--TGTTTCACAATCAAT-GT-AAAATGAAT----A-AG-A-TTAA-A
gi|17                         :                 ttaCAGCG-GTC--GGGCA----TC-GG-------ACCCATGA---CC
gi|7                          :                     AGTG-GTACAGAACA----C---A-------ACCCAAGA---TTT---G-TG---ATTGTGGG-TTC-GATCCTCCCC-------CACAGC------TA--------TGTGT----GGTGTGCTTGA-A----------C---A--A--GA-CA-A--T-----TT-AT-C-CAC---A----AA--CTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---ACAAAG-TAA--GAGT--TTG-AGTATGATTTGTGTAA-ATTG----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATCAAT-GT-AAAATAAAG----A-AG---TTAA-Acacgtcacgttggtgtcttgagcaggacactagctttttccgccgcatacgctttgtactggttctatccatgaacacatcgcgcgtgatttgcggaagttgcacataataactctgccacattcgaagtgaaacaaataagtttaaaac
gi|28                         :                  ccaAATG-GTA--GAGCA----CC-GA-------ACCCATGA---TCA---G-------TCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-------CACGTC------TT--------TGTGT----GGTGTCCATGA-G----------C---A--T--GG-CA-C--------TT-TT-C-CGT---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---AACCAG-GAA--GTCT--TCG-AGCGTGATTttaa
gi|25                         :                     AGTT-GTA--GAGCA----TC-GG-------ATCCAAGA---TTG---GAGG---A-CTTGGG-TTC-TATCCTCCGC-------CACGGC------TA--------TGTGT----GGTGTACTGGA-G---------------------G-CA-C--T-----TT-AC-A-TGC---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---ACCCAG-GAA--CACG--TCG-AGCGTAGTTTATCAAA-GTTG----TAAT-AAC--ggcc
gi|62                         :                     AGTG-GTA--TACCA----AC-TG-------ACCCAAGG---TCA---GAGG---GTCATGGG-TTT-GATC
gi|8                          :                   tggGTG-GTC--GAGTA----TC-GA-------ATCCAAGA---TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-AGTACTCAAC-------CACGGC------TA---------ATGT----GGTGTCCTTGA-G----------T---A--A--GA-CA-C--T-----TT-AT-C-TGC---A----TAT--TT------CA----G--TACC-------------GATTCT---ACCAAG-GAA--GACT--TCG-AGCGTGATTTGTCTAA-GTTG----TTAG-AAC--T--TGTTTCATAATCGAT-GT-AAAATAAAT----GTTG-T-TTAA-AA
gi|8                          :                     cGTG-GTT--GAGTA----CT-GA-------ACCCACGACCCTCC---GA------TCTTGGA-TTC-GATACTCGAC-------CACGaa
gi|28                         :                      GTG-GCG--GAGGA----TC-GA-------ACCCACGA----CT---GA------TCATGGG-TTC-GGTGCTCTAC-------CAggctaatgtggtgtccttgagtaagacactttatctgcatatttcagtaccgattctaccaaggaagacttcgagcgtgatttgtctaagttgttagaacttgtttcataatcgatgtaaaataaatgttgtttaaaaaa
gi|13                         :                     aaTG-GTA--GAGCATCATTC-AG-------ACCTAAGA---TTG---GTGG---GTCGTGGG-CTC-AA---TACGC-------TGC-GC------TG--------TGTGT----AATGTCCTTGG-G----------C---A--A--GA-CG-C--T-----TT-AT-C-TGC---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGCTCT---ACCCAA-GTA--GATT--TTA-AGTGTGATTTAT-GAT-GTTG----TAAG-AAC--T--TGATTTACAATAAAT-GT-TGAATAAAT----A-AA-T-CTAA-Agtctttgtgtggtgtccatgagcatggcacttttccgtatatgcttagtactggttctaaccaggaagtcttcgagcgtgattggcc
gi|18                         :                       TG-GTA--GAGCA----TC-AA-------AGCCATTA---TCG---GAGG---GACAAGGA-TTC-GATACTCTGC-------CACGGC-----------------GTGTTCTTGGTGTACTTGA-----------------------------------------------C---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GTTTCT---ACCCAG-GAA--GACT--TCG-AGCGTGATATGTATAA-GCTA----TAAG-------------TCAT--TCAAA-GT-AAAACAAAT----A-AG-T-TTA
gi|23                         :                  tttatTG-GTACAAAGTG----CC-AA-------AATCAGGA---TTG---ATGA---GTCATGGG-TTC-AATCCCGTACATAATTTTATAATATTTTATA--------TGTGT----TGTATCCTTGA-ATACTACGTATC---A--A--AG-CA-C--A-----TT-TT-C-TTC---A----TAAGCTTGATTAAT-----GAATAGT-------------GGTTCT---ACC
gi|15                         :                        G-GTA--GA-CA----CC-GG-------ACCTAAGA---TCT---GAGG---GTTGTGTA-CTC-GATCCCCAAC-------CGCAGC------CG--------TGCAA----A-------TGA-A----------C---A--A--GA-AA----T-----TT-AT-C-TGT---A----TATGCTT------A-----C--TACC-------------AGTTCT---TCCCTG-AAACGGA----TCG-AGCGTCATTTGTCCAA-GTTG----TAAA-AAC--T--GGTTACAC-ATCGAT-GT-AAAGTAAAC----A-Atttaaa
gi|61                         :                                       acgcga-------ACCCAGGA---TCA---GAGG---GTCATTGG-TTCAGCTGCTT-AT-------TGCAGC------TA--------TGTGT----Gtt
gi|46                         :                                                          GG---TCA---GAAG---GTTGTGGA-CTC-AGT-----AC-------CACA-C------CA--------TGTGC----TGTGTCCTTGA-G----------CATTA--A--AG-CA-C--A-----TT-TT-
gi|22                         :                                                          aA---TCG---AAGA---GTCGTATG-TTC-GATCCGTCAC-------TACGGC------TA--------CATGT----TATGTTTTTA-----------------------------------------TT-C-CAA---ATT--TATGC-T------T-----G--CA-T-------------GGTA--------CAGTGAA--A------TG-AGTGTAATTTG-----------------G-A--------GCCTCACAGCTGAT-GT-AAAA-A--------------TTCA-AAC-TAA---GTTCTGGTATATATCGACTCAAGTatttg
gi|75                         :                                                          aA---TCG---GGCG---GTCGTGGG-TTC-GATCTCCCTT-------AATGGC------TA--------T
gi|30                         :                                                                         ---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGT-------CACGGC------TA--------TGTGC----AGTACCCTTGA-G----------C---A--A--GA-CA-T--T-----TT-AT-C-TGC---A----CATGCAT------A-----G--TATT-------------GATTCT---ACCCGG-GAA--GATT--TCA-AGCGTAATt
gi|48                         :                                                                              aGTGGG-TTC-CATCC-CTGC-------TGCGGC------CA--------TGAAT----CGTGTCCTTAT-G----------C---A--T--GG-CA-CAGG-----TT-TT-C-TAC---A----TATACatatatatata
gi|24                         :                                                                                   t-TTC-GATCCTCCGC-------CACGGC------AA--------TGTGT----GGCGTCGTTGA-G----------C---A--A--GA-CA-C---------T-TT-CACGC---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---AACCAA-AAAC-GATT--TCG-AGCGTGATTTGTCTAA-GTTG----TAAG-AGC--T--TGTTTCACAATCGAA-AT-AAAATAAAT----A-AA-T-TTAA-
gi|11                         :                                                                                               CCAC-------TTTGGC------CA--------TGTGT----GATGTCCTTGA-G----------C---A--A--GG-CC-C--T-----CTGTT-G-CG----A----TGTATTT------C-----G--TACT-------------GGTCCG---GTCCAG-GAA--GGCT--TTG-AAGGCGACTCGTATTG-CTTG----TTAT-AACT-T--TATTT----AT-----GT-AAAATAAAT----GTAG-TCTTAA-A
gi|35                         :                                                                              gtcattcattcacttcacagagggacttacatatataccttaatagatttgaTAT----AGTGGCATGAA-A----------C---A--A--GAACA-C--C-----TT-AT-C-TGC---A----TGTATTT------TACCAAG--TACT-------------GGTTCTTGGACTCAT-GAA--CACA--TTT-AGCGCAACTTGCCCGA-GTTA----TAAG-g
gi|17                         :                                                                                                                                 gtcT----GGTGTC-TTGA-G----------C---A--G--GA-CA-C--TAGCT-TT-TT-C-CGCCGCA----TACGCTT------T-----G--TACT-------------GGTTCT---ATCCAT-GAA--CACA--TCG-CGCGTGATTTGCGGAA-GTTGCACATAAT-AAC--TC-TG--CCACATTCGAA-GT-GAAACAAAT----A-AG-T-TTAA-AAC-
gi|2                          :                                                                                                     cagcggtcgggcatcggacccatgacccacgtcacgtGTGTCCGTAA-G----------C---ACAA--AA-CA-C--T-----TT-AT-C-CAC---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---TACCAG-GAA--AACC--AGG-AGCGTGATTTGTCAAAAGTTG----TAAT-AAC--T--TTTTTCACAATCGAG-AT-AAAATAAGT----A-AG-T-TTAA-AAC-AAATACATGT----ATTTAT
gi|31                         :                                                                                                                 atctgttcttatcattcaatacgtataccaCTTAA-G----------C---A--A--TA-TA-C--T-----TT-AT-C-AGC---A----CATCCTT------A-----G--TTCT-------------GGTTCT---ACCAAG-CAA--CAAT--TTG-AGCTTGATTT-------GTTG----TAAA-AAC--T--TGTTTCAC-ATCGAT-GT-AAA--AAAT----A-AG-A-TTAT-AAC-Agaaaccttaactgtaatacacattataataatataatataaat
gi|38                         :                                                                                                                                                                 ---A--A--GG-CA-C--CGAACCTT-TT-C-CGC---A----TTTGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTTT---GTCTA-------------------CGGGATTTGTATAA-GT-------AAT-AAC--T--TGTTTCGCAGTCGAA-GT-AAt
gi|73                         :                                                                                                                                                                                  ga-----TT-TT-C-CGC---A----TATGCTC------A-----G--TACT-------------GGCCCA---ATCCAG-TAA--G
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                 caC---A----TATGCTT------A-----G--TACT-------------GGTTCT---AACCAG-GAA--GACT--TCG-AGCGTGATTTGCCTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTTACAATCGAA-GT-AAAATAAAT----A-AG-T-TTAA-A
gi|33                         :                                                                                                                                                        tatatgttgtgttcagaccattggctataataattgaattgaaC---A----TATGCTG------T-----G--TACTTGAACAATAATCTGGTCCT---ACCGAT-GAA--GACA--TCG-ATTGAGATGTATATAC-GGTG----AAAA-AAT--C--T---TCACAATCGAT-GT-AAActtaacttaacaaatgggcagtatatgtttactaatttactaaaacgtgattatttattgaaatatg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                       cctctaccatggt---A----TATGTAT------TA----G--TACT-------------GGATCT---ACCCAA-GAA--GACT--TTT-GGTGTGACTTGTATAA-G--------------C--T--TGTTTCACATTCGAC-AT-AAAATTATT----A-AG-T-TTAA-Acc
gi|69                         :                                                                                                                                                        cgtggtccagtggttgagtatcgaacccaggaccggaggatcgttggtccatgtctCTT------T-----G--TACT-------------GGCTCT---ACCCTG-GAA--GACT--TTG-AATGTTATTcc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                            tact--TACT-------------GGTTCT---ACCCAG-TAA--GA---------GCAGGATTT---------------TAAG------T--TGTTTCAC--T-----GT-AAAAATAAT----A-AG-T-TT
gi|57                         :                                                                                                                                                 ggcccagtgatagagcataggatctaagattctggggactgttgttggtttgatcctctgccgcacctaactgcatatataatCT-------------GGTTCT---ATCCAC-AAA--GAAT---CA-ATCGTGATTTAT--AA-GTTG----TAAG-A----T--TATTTgctcactatttgtaatgcat
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                       CT---ACCATG-TAC--GACT--TTG-AGAGTGATATGTCTAATGTTA----ACAG-AG------TGTTTCATAATTAAT-TC-AAAATAATG----A-AGTT-TTAA-AA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                         ---ACCCAT-GAA--TACT--TCG-TGCGTGGTTTGT--AA---------TAAT-AAC--T--AGTTTCAAAAACAAA-GA-ATAACAAAT----A-AG-T-TGAA-ATC-A
gi|44                         :                                                                                                                                                                   gattcagtggtagagcatcggacccaggatcggagggtcattggttcgatccatcgccacggctatgtgtggtgcacgtgaccaagcgtgCCGAG-GAA--TACT--CTG-ATCATGATTTGTCTA---T------TAAG------T--TG---CACAGTCGAT-GT-TAAATAAGTATTAA-AG-T-TTAA-AAG-AA
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                AG-TAA--GAGTCATCG-GACAAGATTTGTATAT-GTGG----TAAG-AGC--C--TGTTTCGTAATCTAT-GG-AAAATAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                AG-GAA---ACT--T---AATGTGATTTGAATAA-ATTT----TAAG-GAC--T--TTTTGCAAAAAGGAATGT-AGAAGAAAtgacatattgttaaaa
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                          caagacactttcccaaatacgcttaagaagttaatacagtttcttaaaaccaaaaagtAA--GAGT--CTG-AGGGCGACCAG-CTCA-TCTG----TCAA-AAT--T--CGTTTCACAATTGAA-GT-AGAATAAAC----A-AGTT-TTAATAAC-AAA---a
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      --GACT--TCG-AGCATG-TTTGTCTAA-GTTA----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAAT
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGGTTGGTATAA-GTTG----TAGG-ATT--T--TGTTTAACAGTC
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  cttgttttactaaggatatcatATATGTTTTA-GTTG----CAAA-AAC--T--GCTTTCACAATCGAT-GTAAAAATAAAC----A-Aa
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    tctcttagaagcagttccattTTTGT---A-ATTA----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATTAAT-GT-AAAATAAActat
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgaagAA-GTTG----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAGT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        attgaagatgagtttcagttgaattcgtaTA----TAAGGAAC--A--TGTTTCACAATCAAT-GT-AAAATAAAC----A-AG-T-ATA
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TGTGGTGGGCATGGTCAGTAGTACAGTATCTAAACTAGGATCAGACGGCCATCGGTTCAATCCCCAAAATGGCTTTGTGAGATCTGCATAATTTTATGCTCAGTGCTGGATCTGCGTATGGAAGACATTGAATAAAATTTGTAGCTGTATAT
Unaligned ( gi|34 ): TTATGTTCGTAGTACACAATGTACTTTATATGCATTAATTAAGCACTAGTTCTTCCCAGGAAGACATCGTTTATCATTTGTATTTGTCAAATAAACAAGTTTTAA
Unaligned ( gi|37 ): TAGTGTTAAAGCATCGGATCAATAATTAGATGTCATTGATTCTATCCACACCAATGTCATGTATCGTGTTACTGAACAAGACATGTTATCACGGAAAA
Unaligned ( gi|40 ): CTTGTGACAGCATCAGACCCAAGATTGGAGGATTGTTGGCTCAATCTCCCACCATGGGGGTCATGTGATGTGTGCAAGACAATTTAT
Unaligned ( gi|50 ): ATATTCTTGAACAAGACGTTTATCTGCACATACTAGAGCTTGTTCTGCCTAGATGGATATTGTATGA
Unaligned ( gi|55 ): AAAACGTCTGCATTGAAGCTTTAGAGAACATTAATTAAACGTATCCATACAAT
Unaligned ( gi|65 ): AATGTTCTTAATTATGAAACTAGTGGTGCCGTTCAATATAATTAAAT
Unaligned ( gi|72 ): TGGAGCACACGATCTAATGGTAAAGCATCAGACCCAGGATTG
Unaligned ( gi|74 ): ACAAGAAATAAGAAGAGATACATGATGCATTACAATGTAC
Unaligned ( gi|76 ): GGAGCACCTGGTCCAATGGTAAAGCATTCGACTCAGGAT






Alignments
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lowQualScore                  :                                                                     6          0   33     0000  9    33333333   3  9   444 7  666        0   0     6    1   888  999 44444444444444  99999999     4444           1 6666666666 888 44   1  1 555555  4444444 1    8888     1  66666666 2 00000000          0000   999999  0 0   33    44 2 0       9     111  0    0000    0   55 66             2 0  2         555 9999  2 6    0   0     0 77    0             
consensus                     :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TC-GGAC--------CCAGGA-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-NTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-ANGT-AAAATAAAT---A----AG-T-TTAA-AAC-AAAATNC--GTATTTATCGGCTCAAGT
Reference ( family-764 )      :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TC-GGAC--------CCANGA-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-NTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-ANGT-AAAATAAAT---A----AG-T-TTAA-AAC-AAAATNCTGGTATNTATCGACTCAAGT
gi|1                          :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----CC-GAAC--------CCATGA-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-TAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGG-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------T-G--------TACTGGTACT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-AAGT-AAAATAAAT---A----AG-T-TTAA-AAC-AAAATTC----ATTCATCAGCTCAAGT
gi|10                         :                                                                    CATGGTCTTGTG-GTA--GAAAA----TC-TGAC--------ACGGAA-CTA---TAGG---GTCGTGA--TTC-GAACCCCCAA-AAC---TG---T--------------TA-----------AT----GAT--CCATAA-G----------T-------GA-TT-G--T---CT-TT----A-AGTA----TATGT-TT--------A-A--------TACTGATTTT----ACT------CA-G-GAA--GACT--TTG-AGCCTGA-TTTGT-TCAA-GTTGA---TATG-AActaagaatattcttcggaaggttggtgtattccacccc
gi|11                         :                                                                                                                                                gtagaactC-CACTTTGG---C--------------CA--------TGTGT----GATGTCCTTGA-G----------C---A--AGG-CC-C--T---CTGTT----G-CG-A----TGTAT-TT--------C-G--------TACTGGTCCG----GTC------CA-G-GAA--GGCT--TTG-AAGGCGA-CTCGT-ATTG-CTTG----TTAT-AACT-T--TATTT---------ATGT-AAAATAAAT---GT---AG-TCTTAA-Agtaaataatagtgtaaaagtacagtatt
gi|12                         :             gtcattcattcacttcacagagggacttacatatataccttaatagatttgaGCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TC-GAAC--------CCATGA-TCG---G-GG---GTCG-GGG-TTC-GACCCTCCGC-CAC---AG---C--------------TACATTCGTTTGTGT----GGTATCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------CA-G-GTG--GAAT--T-G-AGCGTGA-TTTGT-CTA-----------------------------ACAACCG-AAGT-AAAATAAAT---A----AA-T-TTg
gi|13                         :                                                                           ggaTG-GTA--GAGCATCATTC-AGAC--------CTAAGA-TTG---GTGG---GTCGTGGG-CTC-AATACGCTGC--------G---C--------------TG--------TGTGT----AATGTCCTTGG-G----------C---A--AGA-CG-C--T---TT-AT----C-TGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGCTCT----ACC------CA-A-GTA--GATT--TTA-AGTGTGA-TTTAT-G-AT-GTTG----TAAG-AAC--T--TGATTTACAATAA-ATGT-TGAATAAAT---A----AA-T-CTAA-Ata
gi|14                         :                                                                        GTCAAGTG-GTA--GAGTA----CC-AAAC--------CCATGA-TCG---GTGG---GTCGCGGG-TTC-AATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGTCCTTGG-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-T-----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-T-GAA--GAAT--TCG-ATTGTGA-TTTGC-CCAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCGCAATCG-AAGT-AAAATAAAC---A----A
gi|15                         :                                                                               G-GTA--GA-CA----CC-GGAC--------CTAAGA-TCT---GAGG---GTTGTGTA-CTC-GATCCCCAAC-CGC---AG---C--------------CG--------TGCAA----A-------TGA-A----------C---A--AGA-AA----T---TT-AT----C-TGTA----TATGC-TT--------A-C--------TACCAGTTCT----TCC------CT-G-AAACGGA----TCG-AGCGTCA-TTTGT-CCAA-GTTG----TAAA-AAC--T--GGTTACAC-ATCG-ATGT-AAAGTAAAC---A----A
gi|16                         :                                                                acgcgaTGGTCCAGTT-ATA--GAGCA----TC-AGAC--------CAAGGA-TCG---G-GG---GCTGT--------------CCAC-CGT---GT---C--------------TA--------TGTGT----GGTGGCCTTGA-C----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-AT----C-TGCA----T-----------------G--------TACTGGTTCT----GCA------CA-G-GAA--GACT--TC--AGCATGA-TTTGT-CTCA-GTTG----TAAG-ATC--T--TGTTTCACAATCG-ATGT-A-----------A----AG-T-TTAA-AACTAAAACACtt
gi|17                         :                                                                           CAGCG-GTC--GGGCA----TC-GGAC--------CCATGA------------------------------CCCACGT-CAC---G-------------------T-------------T----GGTGT-CTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--TAGCTT-TTTCCGC-CGCA----TACGC-TT--------T-G--------TACTGGTTCT----ATC------CA-T-GAA--CACA--TCG-CGCGTGA-TTTGC-GGAA-GTTGCACATAAT-AAC--TC-TG--CCACATTCG-AAGT-GAAACAAAT---A----AG-T-TTAA-AAC-
gi|18                         :                                                                              TG-GTA--GAGCA----TC-AAAG--------CCATTA-TCG---GAGG---GACAAGGA-TTC-GATACTCTGC-CAC---GG---C-------------------------GTGTTCTTGGTGTACTTGA----------------------------------------------CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGTTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TATGT-ATAA-GCTA----TAAG-------------TCAT--TCA-AAGT-AAAACAAAT---A----AG-T-TTA
gi|19                         :                                                                  tttatGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TC-GGAC--------CCAGGA-TCG---GAGG---GTCATTGG-TTC-GATCCATCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGCACGTGA-C----------C---A--AG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----ACC------CA-T-GAA--TACT--TCG-TGCGTGG-TTTGT---AA---------TAAT-AAC--T--AGTTTCAAAAACA-AAGA-ATAACAAAT---A----AG-T-TGAA-ATC-Acgtgacccatgaatacttcgtgcgtggtttgtaataataactagtttcaaaaacaaagaataacaaataagttgaaatca
gi|2                          :                                                                                                              gattcagtggtagagcatcggacccaggatcggagggtcattggttcgatccatcgccacggctatgtgtggtgcacgtgaccaagcgtgGTGTCCGTAA-G----------C---ACAAAA-CA-C--T---TT-AT----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----TAC------CA-G-GAA--AACC--AGG-AGCGTGA-TTTGTCAAAA-GTTG----TAAT-AAC--T--TTTTTCACAATCG-AGAT-AAAATAAGT---A----AG-T-TTAA-AAC--AAATACATGTATTTAT
gi|20                         :                                         atctgttcttatcattcaatacgtataccaGGCCCAGTG-ATA--GAGCA----TA-GGAT--------CTAAGATTCT---GGGGACTGTTGTTGG-TTT-GATCCTCTGC-CGC---AC---C--------------TA--------gaaaccttaactgtaatacacattataataatataatataaat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                        ----C-TGCA----TATA--TA--------A-T--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-TAA--GA---------GCAGGA-TTT----------------TAAG------T--TGTTTCAC-------TGT-AAAAATAAT---A----AG-T-TTactgcatatataattactggttctacccagtaagagcaggattttaagttgtttcactgtaaaaataataagtttgctcactatttgtaatgcat
gi|21                         : ggcccagtgatagagcataggatctaagattctggggactgttgttggtttgatcctctgccgcacctaaGGCCCAGTG-GCA--GAGCA----TC-AGAG--------CTATGA-TCG---GGAG---GTCGTGGG-TTT-GATCCTCCTT-CAT---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTACTTGA------------------------A-C--T---TT-T-------------------------------A-G--------TACTGGTTCT----ACT------AA-G-GAA--GACT--TTG-AGTGTGA-TTTGT-ATAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAGTCG-GTGgctcactatttgtaatgcat
gi|22                         :                                                                                                                   A-TCG---AAGA---GTCGTATG-TTC-GATCCGTCAC-TAC---GG---C--------------TA--------CATGT----TATGTTTTTA-------------------------------------TT----C-CAAATT--TATGC-TT----------G--------CA-TGG---T----A--------CA-GTGAA--A------TG-AGTGTAA-TTTG------------------G-A--------GCCTCACAGCTG-ATGT-AAAA-A----------------TTCA-AAC-TAAGTTCTGGTATATATCGACTCAAGT
gi|23                         :                                                                                                              aCAGGA-TTG---ATGA---GTCATGGG-TTC-AATC--CCGTACAT---AA---TTTTATAATATTTTATA--------TGTGT----TGTATCCTTGA-ATACTACGTATC---A--AAG-CA-C--A---TT-TT----C-TTCA----TAAGC-TTGATTAATGA-A--------TAGTGGTTCT----ACC------
gi|24                         :                                                                                                                       tggtacaaagtgccaaaat-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------AA--------TGTGT----GGCGTCGTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C-------T-TT----CACGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-A-AAAC-GATT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TAAG-AGC--T--TGTTTCACAATCG-AAAT-AAAATAAAT---A----AA-T-TTAA-tttaaa
gi|25                         :                                                                            AGTT-GTA--GAGCA----TC-GGAT--------CCAAGA-TTG---GAGG---A-CTTGGG-TTC-TATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTACTGGA-G-------------------G-CA-C--T---TT-AC----A-TGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--CACG--TCG-AGCGTAG-TTTAT-CAAA-GTTG----TAAT-AAC--
gi|26                         :                                                                   GCATGGTC-AGTA-GTA--CAGTA----TC-TAAA--------CTAGGA-TCA---GACG---GCCATCGG-TTC-AATCC-CCAA-AAT---GG---C--------------TT--------TGTGA----GAT---CT----G----------C---A------TA-A--T---TT-T----------------ATGC-TC--------A-G--------TGCTGGATCT----GCG------TATG-GAA--GACA--TTG-AATAAAA-TTTGT----A-GCTG----TA
gi|27                         :                                                            tgtggtggCGTGGTCCAGTG-GTT--GAGTA----TC-GAAC--------CCAGGA-CCG---GAGG---ATCGTTGG-TCC-tat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 A----TATGTATT--------A-G--------TACTGGATCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TTT-GGTGTGA-CTTGT-ATAA-G--------------C--T--TGTTTCACATTCG-ACAT-AAAATTATT---A----AG-T-TTAA-Aatgtctatatgtattagtactggatctacccaagaagacttttggtgtgacttgtataagcttgtttcacattcgacataaaattattaagtttaaacc
gi|28                         :                    cgtggtccagtggttgagtatcgaacccaggaccggaggatcgttggtccatgtctAATG-GTA--GAGCA----CC-GAAC--------CCATGA-TCA---G-------TCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GT---C--------------TT--------TGTGT----GGTGTCCATGA-G----------C---A--TGG-CA-C------TT-TT----C-CGTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GTCT--TCG-AGCGTGA-TTcc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                    ----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-C-----C-CAAA----TACGC-TT--------A-AGAAGTTAATACAGTTTCTTAAAACCAAAAAGTA-G-GAA---ACT--T---AATGTGA-TTTGA-ATAA-ATTT----TAAG-GAC--T--TTTTGCAAAAAGGAATGT-AGAAGAAAggcc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGC-CTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTTACAATCG-AAGT-AAAATAAAT---A----AG-T-TTAA-Aa
gi|30                         :                                                                                    tatatgttgtgttcagaccattggctataataattgaattgaa---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGT-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGC----AGTACCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-AT----C-TGCA----CATGC-AT--------A-G--------TATTGATTCT----ACC------CG-G-GAA--GATT--TCA-AGCGTAA-TATAT-ATActtaacttaacaaatgggcagtatatgtttactaatttactaaaacgtgattatttattgaaatatg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                            aCTTAA-G----------C---A--ATA-TA-C--T---TT-AT----C-AGCA----CATCC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------AA-G-CAA--CAAT--TTG-AGCTTGA-TTT--------GTTG----TAAA-AAC--T--TGTTTCAC-ATCG-ATGT-AAA--AAAT---A----AG-A-TTAT-AAC-Atata
gi|32                         :                                                                    CATGGTCCAGTG-GTA--GGACT----TC-GAAC--------CTACGA-TCG---G-GG---ATCGCGAA-TTC-GAACCTGCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGCCATTGACA----------C---A--AG---A-C--T---AT-AT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-t
gi|33                         :                                                                                                                                                 aCCTCTAC-CAT---GG---T--------------CA--------TATGC----TGTGTACTTGA-A----------C---A--A---------------------------------------T--------A-A--------T-CTGGTCCT----ACC------GA-T-GAA--GACA--TCG-ATTGAGA-TGTAT-ATAC-GGTG----AAAA-AAT--C--T---TCACAATCG-ATGT-AAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                    ----------C---A--ATG-TA-C--T---TT-AT----A-TGCA----T-TAA-TT--------AAG--------CACTAGTTCT----TCC------CA-G-GAA--GACA--TCG-TTTATCA-TTTGT-AT----TTG----Tcc
gi|35                         :                                                                                                                                                                                ttatgttcgtagtacaTAT----AGTGGCATGAA-A----------C---A--AGAACA-C--C---TT-AT----C-TGCA----TGTAT-TTTACCA---A-G--------TACTGGTTCTTGG-ACT------CA-T-GAA--CACA--TTT-AGCGCAA-CTTGC-CCGA-GTTA----TAAG-caaataaacaagttttaa
gi|36                         :                                                              gtcGCTCATGGCCTAGTG-ATA--GGGAA----CCAGGTT--------CTATAA-C------AGA---GTTGCGGG-TTT-GATCCCCAAC-CTC---GT---C--------------TA--------TGTAT----TGTGTCTTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--T---TT-
gi|37                         :                                                                          gaAGTG-TTA--AAGCA----TC-GGAT--------CAATAA-TTA---GA-T---GTCATTGA-TTC-TATCC-ACAC-CAA---TG---T--------------CA--------TGTAT----CGTGTTACTGA-A----------C---A--AGA-CA-gt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                         tA-C--C---TT-TT----C-CGCA----TTTGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----GTC------TA--------------------CGGGA-TTTGT-ATAA----G----TAAT-AAC--T--TGTTTCGCAGTCG-AAGT-AAtgttatcacggaaaa
gi|39                         :                                                        gaaaggcaccgaCATGGTCCAGTG-GTA--CAGCA----TC-GGAC--------CCAGGA-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTT-GATCCTCCCC-CAT---GG---C--------------TT--------TGTGC----TGTGTTCTTGA-A----------C---A--
gi|4                          :                                                                      TGGTTCGGTG-GTC--GAGCA----AC-AAAT--------CCATGA-CCG---GAGT---GTCGTTGG-TTC-GATCTACCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----T-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGTGTGA-TGTGC-ATAA-GCTG----TAAG-AAT--T--TGTTTAACTGTCG-AAGT-AAAATAGAT---A----AG-T-TTAA-ATC-A
gi|40                         :                                                                                       AGCA----TC-AGAC--------CCAAGA-TTG---GAGG---ATTGTTGG-CTC-AATCTCCCAC-CAT---GGGGGT--------------CA--------TGTGA----TGTGT-------G----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-t
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttgtgacCT----ACC------AT-G-TAC--GACT--TTG-AGAGTGA-TATGT-CTAATGTTA----ACAG-AG------TGTTTCATAATTA-ATTC-AAAATAATG---A----AGTT-TTAA-AAat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A-G-TAA--GAGTCATCG-GACAAGA-TTTGT-ATAT-GTGG----TAAG-AGC--C--TGTTTCGTAATCT-ATGG-AAAATAA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TG----TCAA-AAT--T--CGTTTCACAATTG-AAGT-AGAATAAAC---A----AGTT-TTAATAAC-AAAtgacatattgttaaaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      aagagtctgagggcgaccagctcatcCC------GA-G-GAA--TACT--CTG-ATCATGA-TTTGT-CTA----T-----TAAG------T--TG---CACAGTCG-ATGT-TAAATAAGT---ATTAAAG-T-TTAA-AAG-AA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-TATGT-TTTA-GTTG----CAAA-AAC--T--GCTTTCACAATCG-ATGTAAAAATAAAC---A----A
gi|46                         :                                                                                             tctcttagaagcagttccattGG-TCA---GAAG---GTTGTGGA-CTC-AGT-----AC-CAC---A----C--------------CA--------TGTGC----TGTGTCCTTGA-G----------CATTA--AAG-CA-C--A---TT-TT----ctat
gi|47                         :                                                                aGCACTTGGTCCAGTG-GTA--AAACA----TT-GGGC--------CCATGA-TTG---GAGG---GTCCTGGG-TTC-GATCTCCCGC-CAC---atttg
gi|48                         :                                                                                                                                     GTGGG-TTC-CATCC-CTGC-TGC---GG---C--------------CA--------TGAAT----CGTGTCCTTAT-G----------C---A--TGG-CA-CAGG---TT-TT----C-TACA----TATAC-attta
gi|49                         :                                                                tGTGCGTGTTGCAGTG-ATA--G-GCA----TC-GGAT--------AATTGA-TCG---GTTT---ATCGTGAG-ATC-GATCCCCC
gi|5                          :                                                                  tcgtggaTCCTGGG-GTA--GAGTA----TC-GGAC--------CAAGGA-TCGTGGGTGG---GTTGGGGGATTT-GATCTTCCAT-CAT---GG---C--------------TA--------AGTAT----GGTTTCCTT-A-G----------C---A--AGA-TT-C--T---TA-AT----C-TGCA----TATGC-TA--------AAG--------TACTGGTTCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TAATAG-ATGACTTTTT-GTA---TTG----TAAT-AAT--T--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAATGAAT---A----AG-A-TTAA-A
gi|51                         :                                                                    ttaGGTCTAGTG-GTA--GAACA----TC-AGAC--------CT-GGG-TTA---GGGA---GTCATCGG-TTT-GATTAACTGT-CAA---GG---C--------------CA--------T
gi|53                         :                                                                 GCTCATGATCCAGTG-GTA--GAGCA----TC-CGACTGTCTGATCCATGA-TC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatgtggaA-TTCGT-A-AA-GTTG----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAGT
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           attgaagatgagtttcagttgaTA----TAAGGAAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAATAAAC---A----AG-T-ATA
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtaaaCTGGTTCT----ATC------CA-C-AAA--GAA---TCA-ATCGTGA-TT--T-ATAA-GTTG----TAAG-A----T--TATTTtta
gi|58                         :                                                                       GATCCAGTG-GTC--AAACA----TC-GGAC--------CCAAAA-CCG---GAGT---GTTGTTAG-TTC-G
gi|59                         :                                                                 gccCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TT-GGAC--------CAAGGA-TTA---G-GG---GTTGT
gi|6                          :                                                               tgggggaTGATTCAATG-GTA--GAGCA----TA-GAAC--------CTAGGA-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTC-AGTTCACCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTCA-G----------C---A--AGA-CATT--T---TT-TT----C-CTTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----ACC------CA-G-GAA--GACT--CCG-AATGTGA-TTTTT-TTAA-GTTG----TAAT-AATAATAATGTTTCACAATCA-AAGT-AAAATAG-----A----AG-T-TT
gi|60                         :                                                                   GCATGGTCCAGTA-GTA--GAGCA----TT-GGAC--------CAAGGA-TTA---G-GG---ATC
gi|61                         :                                                                                            gggtggggAC--------CCAGGA-TCA---GAGG---GTCATTGG-TTCAGCTGCTT-AT-TGC---AG---C--------------TA--------TGTGT----G
gi|62                         :                                                                            AGTG-GTA--TACCA----AC-TGAC--------CCAAGG-TCA---GAGG---GTCATGGG-TTT-GATC
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgg-TTTGT----A-ATTA----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATTA-ATGT-AAAATAAA
gi|64                         :                                                               tgaagCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TT-GGAC--------CAATGA-TTG---GGG
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gagtggggga--GACT--TCG-AGCATG--TTTGT-CTAA-GTTA----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAAT
gi|67                         :                                                                      TGGTCCAGTATGCA--AAGCG----TC-GGAC--------CAAGGA-TCG---G
gi|68                         :                                                              gttgatcagaGTCTAGTG-GTA--GAGGA----TC-GGGT--------CTAGGA-TCG---GAGG---GCCATTAG-TT
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          C-TT--------T-G--------TACTGGCTCT----ACC------CT-G-GAA--GACT--TTG-AATGTTA-TT
gi|7                          :                                                                        tactAGTG-GTACAGAACA----C---AAC--------CCAAGA-TTT---G-TG---ATTGTGGG-TTC-GATCCTCCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTGCTTGA-A----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-AT----C-CACA----AA--C-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACA------AA-G-TAA--GAGT--TTG-AGTATGA-TTTGT-GTAA-ATTG----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAATAAAG---A----AG---TTAA-A
gi|70                         :                                                                 ccaCATGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TT-GGGC--------CAAGGA-TTG---GGGG---ttaa
gi|71                         :                                                                 ggggaTGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TT-GGCC--------ACAGGA-TCGA--GAGT---GT
gi|72                         :                                                                tGCACACGATCTAATG-GTA--AAGCA----TC-AGAC--------CCAGGA-TTG---tat
gi|73                         :                                                                                                                                                                                                                                            tgga---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TC--------A-G--------TACTGGCCCA----ATC------CA-G-TAA--G
gi|75                         :                                                                                                                 caA-TCG---GGCG---GTCGTGGG-TTC-GATCTCCCTT-AAT---GG---C--------------TA--------T
gi|76                         :                                                                 GCACCTGGTCCAATG-GTA--AAGCA----TT-CGAC--------TCAGGA-Tt
gi|77                         :                                                              ggaGCGCGTGGTCTAGTA-GTA--GAGCA----CC-GAAC--------C
gi|8                          :                                                                        gtggaGTG-GTC--GAGTA----TC-GAAT--------CCAAGA-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-AGTACTCAAC-CAC---GG---C--------------TA---------ATGT----GGTGTCCTTGA-G----------T---A--AGA-CA-C--T---TT-AT----C-TGCA----TAT-T-TC--------A-G--------TACCGATTCT----ACC------AA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TTAG-AAC--T--TGTTTCATAATCG-ATGT-AAAATAAAT---GT---TG-T-TTAA-AA
gi|9                          :                                                                       cGTCTAGTG-GTA--AAGGA----TA-GG-----------------TTG---GACG---GTCACAGG-TTC-AATCCACAAC-CAT---AG---T--------------CA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-TTT---C-CGTAAAATTGTGC-CT---------------------CTGGTTCT----GCA------TA-G-GAA--GACT--TCG-AGCATGA-TTTGT-ATAA-ATCG----TAAT-AGC--T--TGTTTCACAATTG-AAAT-AAAAAAGGTTTCA----AG-T-TTAA-Aaa
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|50 ): ATATTCTTGAACAAGACGTTTATCTGCACATACTAGAGCTTGTTCTGCCTAGATGGATATTGTATGA
Unaligned ( gi|52 ): CTTGTTTTACTAAGGATATCATTGGTTGGTATAAGTTGTAGGATTTTGTTTAACAGTCA
Unaligned ( gi|55 ): AAAACGTCTGCATTGAAGCTTTAGAGAACATTAATTAAACGTATCCATACAAT
Unaligned ( gi|65 ): AATGTTCTTAATTATGAAACTAGTGGTGCCGTTCAATATAATTAAAT
Unaligned ( gi|74 ): ACAAGAAATAAGAAGAGATACATGATGCATTACAATGTAC






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consensus                     :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-NTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-ANGT-AAAATAAAT---A----AG-T-TTAA-AAC-AAA-ACNC--GTATTTATCGGCTCAAGT
Reference ( family-764 )      :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-NTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-ANGT-AAAATAAAT---A----AG-T-TTAA-AAC-AAA-ATNC--GTATTTATCGGCTCAAGT
gi|1                          :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----CCGAACCCAT--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-TAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGG-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------T-G--------TACTGGTACT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-AAGT-AAAATAAAT---A----AG-T-TTAA-AAC-AAA-ATTC----ATTCATCAGCTCAAGT
gi|10                         :                                                                    CATGGTCTTGTG-GTA--GAAAA----TCTGACACGG--A----A-CTA---TAGG---GTCGTGA--TTC-GAACCCCCAA-AAC---TG---T--------------TA-----------AT----GAT--CCATAA-G----------T-------GA-TT-G--T---CT-TT----A-AGTA----TATGT-TT--------A-A--------TACTGATTTT----ACT------CA-G-GAA--GACT--TTG-AGCCTGA-TTTGT-TCAA-GTTGA---TATG-AActaagaatattcttcggaaggttggtgtattccacccc
gi|11                         :                                                                                                                                             gtagaactC-CACTTTGG---C--------------CA--------TGTGT----GATGTCCTTGA-G----------C---A--AGG-CC-C--T---CTGTT----G-CG-A----TGTAT-TT--------C-G--------TACTGGTCCG----GTC------CA-G-GAA--GGCT--TTG-AAGGCGA-CTCGT-ATTG-CTTG----TTAT-AACT-T--TATTT---------ATGT-AAAATAAAT---GT---AG-TCTTAA-Agtaaataatagtgtaaaagtacagtatt
gi|12                         :             gtcattcattcacttcacagagggacttacatatataccttaatagatttgaGCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGAACCCAT--G----A-TCG---G-GG---GTCG-GGG-TTC-GACCCTCCGC-CAC---AG---C--------------TACATTCGTTTGTGT----GGTATCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------CA-G-GTG--GAAT--T-G-AGCGTGA-TTTGT-CTA-----------------------------ACAACCG-AAGT-AAAATAAAT---A----AA-T-TTg
gi|13                         :                                                                           ggaTG-GTA--GAGCATCATTCAGACCTAA--G----A-TTG---GTGG---GTCGTGGG-CTC-AATACGCTGC--------G---C--------------TG--------TGTGT----AATGTCCTTGG-G----------C---A--AGA-CG-C--T---TT-AT----C-TGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGCTCT----ACC------CA-A-GTA--GATT--TTA-AGTGTGA-TTTAT-G-AT-GTTG----TAAG-AAC--T--TGATTTACAATAA-ATGT-TGAATAAAT---A----AA-T-CTAA-Ata
gi|14                         :                                                                        GTCAAGTG-GTA--GAGTA----CCAAACCCAT--G----A-TCG---GTGG---GTCGCGGG-TTC-AATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGTCCTTGG-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-T-----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-T-GAA--GAAT--TCG-ATTGTGA-TTTGC-CCAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCGCAATCG-AAGT-AAAATAAAC---A----A
gi|15                         :                                                                               G-GTA--GA-CA----CCGGACCTAA--G----A-TCT---GAGG---GTTGTGTA-CTC-GATCCCCAAC-CGC---AG---C--------------CG--------TGCAA----A-------TGA-A----------C---A--AGA-AA----T---TT-AT----C-TGTA----TATGC-TT--------A-C--------TACCAGTTCT----TCC------CT-G-AAACGGA----TCG-AGCGTCA-TTTGT-CCAA-GTTG----TAAA-AAC--T--GGTTACAC-ATCG-ATGT-AAAGTAAAC---A----A
gi|16                         :                                                                acgcgaTGGTCCAGTT-ATA--GAGCA----TCAGACCAAG--G----A-TCG---G-GG---GCTGT--------------CCAC-CGT---GT---C--------------TA--------TGTGT----GGTGGCCTTGA-C----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-AT----C-TGCA----T-----------------G--------TACTGGTTCT----GCA------CA-G-GAA--GACT--TC--AGCATGA-TTTGT-CTCA-GTTG----TAAG-ATC--T--TGTTTCACAATCG-ATGT-A-----------A----AG-T-TTAA-AACTAAA-ACAC--tt
gi|17                         :                                                                           CAGCG-GTC--GGGCA----TCGGACCCAT--G----A------------------------------CCCACGT-CAC---G-------------------T-------------T----GGTGT-CTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--TAGCTT-TTTCCGC-CGCA----TACGC-TT--------T-G--------TACTGGTTCT----ATC------CA-T-GAA--CACA--TCG-CGCGTGA-TTTGC-GGAA-GTTGCACATAAT-AAC--TC-TG--CCACATTCG-AAGT-GAAACAAAT---A----AG-T-TTAA-AAC-
gi|18                         :                                                                              TG-GTA--GAGCA----TCAAAGCCAT--T----A-TCG---GAGG---GACAAGGA-TTC-GATACTCTGC-CAC---GG---C-------------------------GTGTTCTTGGTGTACTTGA----------------------------------------------CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGTTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TATGT-ATAA-GCTA----TAAG-------------TCAT--TCA-AAGT-AAAACAAAT---A----AG-T-TTA
gi|19                         :                                                                  tttatGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCATTGG-TTC-GATCCATCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGCACGTGA-C----------C---A--AG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----ACC------CA-T-GAA--TACT--TCG-TGCGTGG-TTTGT---AA---------TAAT-AAC--T--AGTTTCAAAAACA-AAGA-ATAACAAAT---A----AG-T-TGAA-ATC-Acgtgacccatgaatacttcgtgcgtggtttgtaataataactagtttcaaaaacaaagaataacaaataagttgaaatca
gi|2                          :                                                                                                           gattcagtggtagagcatcggacccaggatcggagggtcattggttcgatccatcgccacggctatgtgtggtgcacgtgaccaagcgtgGTGTCCGTAA-G----------C---ACAAAA-CA-C--T---TT-AT----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----TAC------CA-G-GAA--AACC--AGG-AGCGTGA-TTTGTCAAAA-GTTG----TAAT-AAC--T--TTTTTCACAATCG-AGAT-AAAATAAGT---A----AG-T-TTAA-AAC-AAATACAT--GTATTTAT
gi|20                         :                                         atctgttcttatcattcaatacgtataccaGGCCCAGTG-ATA--GAGCA----TAGGATCTAA--G----ATTCT---GGGGACTGTTGTTGG-TTT-GATCCTCTGC-CGC---AC---C--------------TA--------gaaaccttaactgtaatacacattataataatataatataaat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ----C-TGCA----TATA--TA--------A-T--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-TAA--GA---------GCAGGA-TTT----------------TAAG------T--TGTTTCAC-------TGT-AAAAATAAT---A----AG-T-TTactgcatatataattactggttctacccagtaagagcaggattttaagttgtttcactgtaaaaataataagtttgctcactatttgtaatgcat
gi|21                         : ggcccagtgatagagcataggatctaagattctggggactgttgttggtttgatcctctgccgcacctaaGGCCCAGTG-GCA--GAGCA----TCAGAGCTAT--G----A-TCG---GGAG---GTCGTGGG-TTT-GATCCTCCTT-CAT---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTACTTGA------------------------A-C--T---TT-T-------------------------------A-G--------TACTGGTTCT----ACT------AA-G-GAA--GACT--TTG-AGTGTGA-TTTGT-ATAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAGTCG-GTGgctcactatttgtaatgcat
gi|22                         :                                                                                                            ----A-TCG---AAGA---GTCGTATG-TTC-GATCCGTCAC-TAC---GG---C--------------TA--------CATGT----TATGTTTTTA-------------------------------------TT----C-CAAATT--TATGC-TT----------G--------CA-TGG---T----A--------CA-GTGAA--A------TG-AGTGTAA-TTTG------------------G-A--------GCCTCACAGCTG-ATGT-AAAA-A----------------TTCA-AAC-TAA-GTTCTGGTATATATCGACTCAAGT
gi|23                         :                                                                                                     aCAG--G----A-TTG---ATGA---GTCATGGG-TTC-AATC--CCGTACAT---AA---TTTTATAATATTTTATA--------TGTGT----TGTATCCTTGA-ATACTACGTATC---A--AAG-CA-C--A---TT-TT----C-TTCA----TAAGC-TTGATTAATGA-A--------TAGTGGTTCT----ACC------
gi|24                         :                                                                                                                    tggtacaaagtgccaaaat-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------AA--------TGTGT----GGCGTCGTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C-------T-TT----CACGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-A-AAAC-GATT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TAAG-AGC--T--TGTTTCACAATCG-AAAT-AAAATAAAT---A----AA-T-TTAA-tttaaa
gi|25                         :                                                                            AGTT-GTA--GAGCA----TCGGATCCAA--G----A-TTG---GAGG---A-CTTGGG-TTC-TATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTACTGGA-G-------------------G-CA-C--T---TT-AC----A-TGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--CACG--TCG-AGCGTAG-TTTAT-CAAA-GTTG----TAAT-AAC--
gi|26                         :                                                                   GCATGGTC-AGTA-GTA--CAGTA----TCTAAACTAG--G----A-TCA---GACG---GCCATCGG-TTC-AATCC-CCAA-AAT---GG---C--------------TT--------TGTGA----GAT---CT----G----------C---A------TA-A--T---TT-T----------------ATGC-TC--------A-G--------TGCTGGATCT----GCG------TATG-GAA--GACA--TTG-AATAAAA-TTTGT----A-GCTG----TA
gi|27                         :                                                            tgtggtggCGTGGTCCAGTG-GTT--GAGTA----TCGAACCCAG--G----A-CCG---GAGG---ATCGTTGG-TCC-tat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                              A----TATGTATT--------A-G--------TACTGGATCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TTT-GGTGTGA-CTTGT-ATAA-G--------------C--T--TGTTTCACATTCG-ACAT-AAAATTATT---A----AG-T-TTAA-Aatgtctatatgtattagtactggatctacccaagaagacttttggtgtgacttgtataagcttgtttcacattcgacataaaattattaagtttaaacc
gi|28                         :                    cgtggtccagtggttgagtatcgaacccaggaccggaggatcgttggtccatgtctAATG-GTA--GAGCA----CCGAACCCAT--G----A-TCA---G-------TCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GT---C--------------TT--------TGTGT----GGTGTCCATGA-G----------C---A--TGG-CA-C------TT-TT----C-CGTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GTCT--TCG-AGCGTGA-TTcc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                 ----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-C-----C-CAAA----TACGC-TT--------A-AGAAGTTAATACAGTTTCTTAAAACCAAAAAGTA-G-GAA---ACT--T---AATGTGA-TTTGA-ATAA-ATTT----TAAG-GAC--T--TTTTGCAAAAAGGAATGT-AGAAGAAAggcc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                             CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGC-CTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTTACAATCG-AAGT-AAAATAAAT---A----AG-T-TTAA-Aa
gi|30                         :                                                                                 tatatgttgtgttcagaccattggctataataattgaattgaa---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGT-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGC----AGTACCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-AT----C-TGCA----CATGC-AT--------A-G--------TATTGATTCT----ACC------CG-G-GAA--GATT--TCA-AGCGTAA-TATAT-ATActtaacttaacaaatgggcagtatatgtttactaatttactaaaacgtgattatttattgaaatatg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                         aCTTAA-G----------C---A--ATA-TA-C--T---TT-AT----C-AGCA----CATCC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------AA-G-CAA--CAAT--TTG-AGCTTGA-TTT--------GTTG----TAAA-AAC--T--TGTTTCAC-ATCG-ATGT-AAA--AAAT---A----AG-A-TTAT-AAC-Atata
gi|32                         :                                                                    CATGGTCCAGTG-GTA--GGACT----TCGAACCTAC--G----A-TCG---G-GG---ATCGCGAA-TTC-GAACCTGCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGCCATTGACA----------C---A--AG---A-C--T---AT-AT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-t
gi|33                         :                                                                                                                                              aCCTCTAC-CAT---GG---T--------------CA--------TATGC----TGTGTACTTGA-A----------C---A--A---------------------------------------T--------A-A--------T-CTGGTCCT----ACC------GA-T-GAA--GACA--TCG-ATTGAGA-TGTAT-ATAC-GGTG----AAAA-AAT--C--T---TCACAATCG-ATGT-AAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                 ----------C---A--ATG-TA-C--T---TT-AT----A-TGCA----T-TAA-TT--------AAG--------CACTAGTTCT----TCC------CA-G-GAA--GACA--TCG-TTTATCA-TTTGT-AT----TTG----Tcc
gi|35                         :                                                                                                                                                                             ttatgttcgtagtacaTAT----AGTGGCATGAA-A----------C---A--AGAACA-C--C---TT-AT----C-TGCA----TGTAT-TTTACCA---A-G--------TACTGGTTCTTGG-ACT------CA-T-GAA--CACA--TTT-AGCGCAA-CTTGC-CCGA-GTTA----TAAG-caaataaacaagttttaa
gi|36                         :                                                              gtcGCTCATGGCCTAGTG-ATA--G----------GGAACCAG--GTTCTA-TAA---CAGA---GTTGCGGG-TTT-GATCCCCAAC-CTC---GT---C--------------TA--------TGTAT----TGTGTCTTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--T---TT-
gi|37                         :                                                                          gaAGTG-TTA--AAGCA----TCGGATCAAT--A----A-TTA---GA-T---GTCATTGA-TTC-TATCC-ACAC-CAA---TG---T--------------CA--------TGTAT----CGTGTTACTGA-A----------C---A--AGA-CA-gt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                      tA-C--C---TT-TT----C-CGCA----TTTGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----GTC------TA--------------------CGGGA-TTTGT-ATAA-GT-------AAT-AAC--T--TGTTTCGCAGTCG-AAGT-AAtgttatcacggaaaa
gi|39                         :                                                        gaaaggcaccgaCATGGTCCAGTG-GTA--CAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTT-GATCCTCCCC-CAT---GG---C--------------TT--------TGTGC----TGTGTTCTTGA-A----------C---A--
gi|4                          :                                                                      TGGTTCGGTG-GTC--GAGCA----ACAAATCCAT--G----A-CCG---GAGT---GTCGTTGG-TTC-GATCTACCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----T-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGTGTGA-TGTGC-ATAA-GCTG----TAAG-AAT--T--TGTTTAACTGTCG-AAGT-AAAATAGAT---A----AG-T-TTAA-ATC-A
gi|40                         :                                                                                       AGCA----TCAGACCCAA--G----A-TTG---GAGG---ATTGTTGG-CTC-AATCTCCCAC-CAT---GGGGGT--------------CA--------TGTGA----TGTGT-------G----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-t
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttgtgacCT----ACC------AT-G-TAC--GACT--TTG-AGAGTGA-TATGT-CTAATGTTA----ACAG-AG------TGTTTCATAATTA-ATTC-AAAATAATG---A----AGTT-TTAA-AAat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-G-TAA--GAGTCATCG-GACAAGA-TTTGT-ATAT-GTGG----TAAG-AGC--C--TGTTTCGTAATCT-ATGG-AAAATAA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TG----TCAA-AAT--T--CGTTTCACAATTG-AAGT-AGAATAAAC---A----AGTT-TTAATAAC-AAA-tgacatattgttaaaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagagtctgagggcgaccagctcatcCC------GA-G-GAA--TACT--CTG-ATCATGA-TTTGT-CTA----T-----TAAG------T--TG---CACAGTCG-ATGT-TAAATAAGT---ATTAAAG-T-TTAA-AAG-AA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-TATGT-TTTA-GTTG----CAAA-AAC--T--GCTTTCACAATCG-ATGTAAAAATAAAC---A----A
gi|46                         :                                                                                    tctcttagaagcagttccatt--G----G-TCA---GAAG---GTTGTGGA-CTC-AGT-----AC-CAC---A----C--------------CA--------TGTGC----TGTGTCCTTGA-G----------CATTA--AAG-CA-C--A---TT-TT----ctat
gi|47                         :                                                                aGCACTTGGTCCAGTG-GTA--AAACA----TTGGGCCCAT--G----A-TTG---GAGG---GTCCTGGG-TTC-GATCTCCCGC-CAC---atttg
gi|48                         :                                                                                                                                  GTGGG-TTC-CATCC-CTGC-TGC---GG---C--------------CA--------TGAAT----CGTGTCCTTAT-G----------C---A--TGG-CA-CAGG---TT-TT----C-TACA----TATAC-attta
gi|49                         :                                                                tGTGCGTGTTGCAGTG-ATA--G-GCA----TCGGA--TAATTG----A-TCG---GTTT---ATCGTGAG-ATC-GATCCCCC
gi|5                          :                                                                  tcgtggaTCCTGGG-GTA--GAGTA----TCGGACCAAG--G----A-TCGTGGGTGG---GTTGGGGGATTT-GATCTTCCAT-CAT---GG---C--------------TA--------AGTAT----GGTTTCCTT-A-G----------C---A--AGA-TT-C--T---TA-AT----C-TGCA----TATGC-TA--------AAG--------TACTGGTTCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TAATAG-ATGACTTTTT-GTA---TTG----TAAT-AAT--T--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAATGAAT---A----AG-A-TTAA-A
gi|51                         :                                                                    ttaGGTCTAGTG-GTA--GAACA----TCAGACCT-G--G----G-TTA---GGGA---GTCATCGG-TTT-GATTAACTGT-CAA---GG---C--------------CA--------T
gi|53                         :                                                                 GCTCATGATCCAGTG-GTA--GAGCA----TCCGAC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatgtggaA-TTCGT-A-AA-GTTG----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAGTtgtctgatccatgatc
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attgaagatgagtttcagttgaTA----TAAGGAAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAATAAAC---A----AG-T-ATA
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaaaCTGGTTCT----ATC------CA-C-AAA--GAA---TCA-ATCGTGA-TT--T-ATAA-GTTG----TAAG-A----T--TATTTtta
gi|58                         :                                                                       GATCCAGTG-GTC--AAACA----TCGGACCCAA--A----A-CCG---GAGT---GTTGTTAG-TTC-G
gi|59                         :                                                                 gccCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TTGGACCAAG--G----A-TTA---G-GG---GTTGT
gi|6                          :                                                               tgggggaTGATTCAATG-GTA--GAGCA----TAGAACCTAG--G----A-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTC-AGTTCACCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTCA-G----------C---A--AGA-CATT--T---TT-TT----C-CTTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----ACC------CA-G-GAA--GACT--CCG-AATGTGA-TTTTT-TTAA-GTTG----TAAT-AATAATAATGTTTCACAATCA-AAGT-AAAATAG-----A----AG-T-TT
gi|60                         :                                                                   GCATGGTCCAGTA-GTA--GAGCA----TTGGACCAAG--G----A-TTA---G-GG---ATC
gi|61                         :                                                                                           gggtggggACCCAG--G----A-TCA---GAGG---GTCATTGG-TTCAGCTGCT-TAT-TGC---AG---C--------------TA--------TGTGT----G
gi|62                         :                                                                            AGTG-GTA--TACCA----ACTGACCCAA--G----G-TCA---GAGG---GTCATGGG-TTT-GATC
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgg-TTTGT----A-ATTA----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATTA-ATGT-AAAATAAA
gi|64                         :                                                               tgaagCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TTGGACCAAT--G----A-TTG---GGG
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gi|7                          :                                                                        tactAGTG-GTACAGAACA----C--AACCCAA--G----A-TTT---G-TG---ATTGTGGG-TTC-GATCCTCCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTGCTTGA-A----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-AT----C-CACA----AA--C-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACA------AA-G-TAA--GAGT--TTG-AGTATGA-TTTGT-GTAA-ATTG----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAATAAAG---A----AG---TTAA-A
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gi|9                          :                                                                       cGTCTAGTG-GTA--AAGGA----T-------AG--G------TTG---GACG---GTCACAGG-TTC-AATCCACAAC-CAT---AG---T--------------CA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-TTT---C-CGTAAAATTGTGC-CT---------------------CTGGTTCT----GCA------TA-G-GAA--GACT--TCG-AGCATGA-TTTGT-ATAA-ATCG----TAAT-AGC--T--TGTTTCACAATTG-AAAT-AAAAAAGGTTTCA----AG-T-TTAA-Aaa
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-764 )      :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-NTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-ANGT-AAAA---TAAA-T---A----AG-T-TTAA-AAC-AAA-ACNCGTATTTATCGGCTCAAGT
gi|1                          :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----CCGAACCCAT--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-TAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGG-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------T-G--------TACTGGTACT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-AAGT-AAAA---TAAA-T---A----AG-T-TTAA-AAC-AAA-ATTC--ATTCATCAGCTCAAGT
gi|10                         :                                                                    CATGGTCTTGTG-GTA--GAAAA----TCTGACACGG--A----A-CTA---TAGG---GTCGTGA--TTC-GAACCCCCAA-AAC---TG---T--------------TA-----------AT----GAT--CCATAA-G----------T-------GA-TT-G--T---CT-TT----A-AGTA----TATGT-TT--------A-A--------TACTGATTTT----ACT------CA-G-GAA--GACT--TTG-AGCCTGA-TTTGT-TCAA-GTTGA---TATG-AActaagaatattcttcggaaggttggtgtattccacccc
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gi|12                         :             gtcattcattcacttcacagagggacttacatatataccttaatagatttgaGCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGAACCCAT--G----A-TCG---G-GG---GTCG-GGG-TTC-GACCCTCCGC-CAC---AG---C--------------TACATTCGTTTGTGT----GGTATCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------CA-G-GTG--GAAT--T-G-AGCGTGA-TTTGT-CTA-----------------------------ACAACCG-AAGT-AAAA---TAAA-T---A----AA-T-TTg
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gi|14                         :                                                                        GTCAAGTG-GTA--GAGTA----CCAAACCCAT--G----A-TCG---GTGG---GTCGCGGG-TTC-AATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGTCCTTGG-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-T-----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-T-GAA--GAAT--TCG-ATTGTGA-TTTGC-CCAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCGCAATCG-AAGT-AAAA---TAAA-C---A----A
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gi|18                         :                                                                              TG-GTA--GAGCA----TCAAAGCCAT--T----A-TCG---GAGG---GACAAGGA-TTC-GATACTCTGC-CAC---GG---C-------------------------GTGTTCTTGGTGTACTTGA----------------------------------------------CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGTTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TATGT-ATAA-GCTA----TAAG-------------TCAT--TCA-AAGT-AAAA---CAAA-T---A----AG-T-TTA
gi|19                         :                                                                  tttatGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCATTGG-TTC-GATCCATCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGCACGTGA-C----------C---A--AG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----ACC------CA-T-GAA--TACT--TCG-TGCGTGG-TTTGT---AA---------TAAT-AAC--T--AGTTTCAAAAACA-AAGA-ATAA---CAAA-T---A----AG-T-TGAA-ATC-Acgtgacccatgaatacttcgtgcgtggtttgtaataataactagtttcaaaaacaaagaataacaaataagttgaaatca
gi|2                          :                                                                                                           gattcagtggtagagcatcggacccaggatcggagggtcattggttcgatccatcgccacggctatgtgtggtgcacgtgaccaagcgtgGTGTCCGTAA-G----------C---ACAAAA-CA-C--T---TT-AT----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----TAC------CA-G-GAA--AACC--AGG-AGCGTGA-TTTGTCAAAA-GTTG----TAAT-AAC--T--TTTTTCACAATCG-AGAT-AAAA---TAAG-T---A----AG-T-TTAA-AAC-AAATACATGTATTTAT
gi|20                         :                                         atctgttcttatcattcaatacgtataccaGGCCCAGTG-ATA--GAGCA----TAGGATCTAA--G----ATTCT---GGGGACTGTTGTTGG-TTT-GATCCTCTGC-CGC---AC---C--------------TA--------gaaaccttaactgtaatacacattataataatataatataaat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ----C-TGCA----TATA--TA--------A-T--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-TAA--GA---------GCAGGA-TTT----------------TAAG------T--TGTTTCAC-------TGT-AAAA---ATAA-T---A----AG-T-TTactgcatatataattactggttctacccagtaagagcaggattttaagttgtttcactgtaaaaataataagtttgctcactatttgtaatgcat
gi|21                         : ggcccagtgatagagcataggatctaagattctggggactgttgttggtttgatcctctgccgcacctaaGGCCCAGTG-GCA--GAGCA----TCAGAGCTAT--G----A-TCG---GGAG---GTCGTGGG-TTT-GATCCTCCTT-CAT---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTACTTGA------------------------A-C--T---TT-T-------------------------------A-G--------TACTGGTTCT----ACT------AA-G-GAA--GACT--TTG-AGTGTGA-TTTGT-ATAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAGTCG-GTGgctcactatttgtaatgcat
gi|22                         :                                                                                                            ----A-TCG---AAGA---GTCGTATG-TTC-GATCCGTCAC-TAC---GG---C--------------TA--------CATGT----TATGTTTTTA-------------------------------------TT----C-CAAATT--TATGC-TT----------G--------CA-TGG---T----A--------CA-GTGAA--A------TG-AGTGTAA-TTTG------------------G-A--------GCCTCACAGCTG-ATGT-AAAAATTCAAACT---A----AG-T-T-------------CTGGTATATATCGACTCAAGT
gi|23                         :                                                                                                     aCAG--G----A-TTG---ATGA---GTCATGGG-TTC-AATC--CCGTACAT---AA---TTTTATAATATTTTATA--------TGTGT----TGTATCCTTGA-ATACTACGTATC---A--AAG-CA-C--A---TT-TT----C-TTCA----TAAGC-TTGATTAATGA-A--------TAGTGGTTCT----ACC------
gi|24                         :                                                                                                                    tggtacaaagtgccaaaat-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------AA--------TGTGT----GGCGTCGTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C-------T-TT----CACGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-A-AAAC-GATT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TAAG-AGC--T--TGTTTCACAATCG-AAAT-AAAA---TAAA-T---A----AA-T-TTAA-tttaaa
gi|25                         :                                                                            AGTT-GTA--GAGCA----TCGGATCCAA--G----A-TTG---GAGG---A-CTTGGG-TTC-TATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTACTGGA-G-------------------G-CA-C--T---TT-AC----A-TGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--CACG--TCG-AGCGTAG-TTTAT-CAAA-GTTG----TAAT-AAC--
gi|26                         :                                                                   GCATGGTC-AGTA-GTA--CAGTA----TCTAAACTAG--G----A-TCA---GACG---GCCATCGG-TTC-AATCC-CCAA-AAT---GG---C--------------TT--------TGTGA----GAT---CT----G----------C---A------TA-A--T---TT-T----------------ATGC-TC--------A-G--------TGCTGGATCT----GCG------TATG-GAA--GACA--TTG-AATAAAA-TTTGT----A-GCTG----TA
gi|27                         :                                                            tgtggtggCGTGGTCCAGTG-GTT--GAGTA----TCGAACCCAG--G----A-CCG---GAGG---ATCGTTGG-TCC-tat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                              A----TATGTATT--------A-G--------TACTGGATCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TTT-GGTGTGA-CTTGT-ATAA-G--------------C--T--TGTTTCACATTCG-ACAT-AAAA---TTAT-T---A----AG-T-TTAA-Aatgtctatatgtattagtactggatctacccaagaagacttttggtgtgacttgtataagcttgtttcacattcgacataaaattattaagtttaaacc
gi|28                         :                    cgtggtccagtggttgagtatcgaacccaggaccggaggatcgttggtccatgtctAATG-GTA--GAGCA----CCGAACCCAT--G----A-TCA---G-------TCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GT---C--------------TT--------TGTGT----GGTGTCCATGA-G----------C---A--TGG-CA-C------TT-TT----C-CGTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GTCT--TCG-AGCGTGA-TTcc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                 ----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-C-----C-CAAA----TACGC-TT--------A-AGAAGTTAATACAGTTTCTTAAAACCAAAAAGTA-G-GAA---ACT--T---AATGTGA-TTTGA-ATAA-ATTT----TAAG-GAC--T--TTTTGCAAAAAGGAATGT-AGAA---GAAA-ggcc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                             CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGC-CTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTTACAATCG-AAGT-AAAA---TAAA-T---A----AG-T-TTAA-Aa
gi|30                         :                                                                                 tatatgttgtgttcagaccattggctataataattgaattgaa---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGT-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGC----AGTACCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-AT----C-TGCA----CATGC-AT--------A-G--------TATTGATTCT----ACC------CG-G-GAA--GATT--TCA-AGCGTAA-TATAT-ATActtaacttaacaaatgggcagtatatgtttactaatttactaaaacgtgattatttattgaaatatg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                         aCTTAA-G----------C---A--ATA-TA-C--T---TT-AT----C-AGCA----CATCC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------AA-G-CAA--CAAT--TTG-AGCTTGA-TTT--------GTTG----TAAA-AAC--T--TGTTTCAC-ATCG-ATGT-AAA-----AAA-T---A----AG-A-TTAT-AAC-Atata
gi|32                         :                                                                    CATGGTCCAGTG-GTA--GGACT----TCGAACCTAC--G----A-TCG---G-GG---ATCGCGAA-TTC-GAACCTGCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGCCATTGACA----------C---A--AG---A-C--T---AT-AT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-t
gi|33                         :                                                                                                                                              aCCTCTAC-CAT---GG---T--------------CA--------TATGC----TGTGTACTTGA-A----------C---A--A---------------------------------------T--------A-A--------T-CTGGTCCT----ACC------GA-T-GAA--GACA--TCG-ATTGAGA-TGTAT-ATAC-GGTG----AAAA-AAT--C--T---TCACAATCG-ATGT-AAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                 ----------C---A--ATG-TA-C--T---TT-AT----A-TGCA----T-TAA-TT--------AAG--------CACTAGTTCT----TCC------CA-G-GAA--GACA--TCG-TTTATCA-TTTGT-AT----TTG----Tcc
gi|35                         :                                                                                                                                                                             ttatgttcgtagtacaTAT----AGTGGCATGAA-A----------C---A--AGAACA-C--C---TT-AT----C-TGCA----TGTAT-TTTACCA---A-G--------TACTGGTTCTTGG-ACT------CA-T-GAA--CACA--TTT-AGCGCAA-CTTGC-CCGA-GTTA----TAAG-caaataaacaagttttaa
gi|36                         :                                                              gtcGCTCATGGCCTAGTG-ATA--G----------GGAACCAG--GTTCTA-TAA---CAGA---GTTGCGGG-TTT-GATCCCCAAC-CTC---GT---C--------------TA--------TGTAT----TGTGTCTTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--T---TT-
gi|37                         :                                                                          gaAGTG-TTA--AAGCA----TCGGATCAAT--A----A-TTA---GA-T---GTCATTGA-TTC-TATCC-ACAC-CAA---TG---T--------------CA--------TGTAT----CGTGTTACTGA-A----------C---A--AGA-CA-gt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                      tA-C--C---TT-TT----C-CGCA----TTTGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----GTC------TA--------------------CGGGA-TTTGT-ATAA-GT-------AAT-AAC--T--TGTTTCGCAGTCG-AAGT-AAtgttatcacggaaaa
gi|39                         :                                                        gaaaggcaccgaCATGGTCCAGTG-GTA--CAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTT-GATCCTCCCC-CAT---GG---C--------------TT--------TGTGC----TGTGTTCTTGA-A----------C---A--
gi|4                          :                                                                      TGGTTCGGTG-GTC--GAGCA----ACAAATCCAT--G----A-CCG---GAGT---GTCGTTGG-TTC-GATCTACCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----T-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGTGTGA-TGTGC-ATAA-GCTG----TAAG-AAT--T--TGTTTAACTGTCG-AAGT-AAAA---TAGA-T---A----AG-T-TTAA-ATC-A
gi|40                         :                                                                                       AGCA----TCAGACCCAA--G----A-TTG---GAGG---ATTGTTGG-CTC-AATCTCCCAC-CAT---GGGGGT--------------CA--------TGTGA----TGTGT-------G----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-t
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttgtgacCT----ACC------AT-G-TAC--GACT--TTG-AGAGTGA-TATGT-CTAATGTTA----ACAG-AG------TGTTTCATAATTA-ATTC-AAAA---TAAT-G---A----AGTT-TTAA-AAat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-G-TAA--GAGTCATCG-GACAAGA-TTTGT-ATAT-GTGG----TAAG-AGC--C--TGTTTCGTAATCT-ATGG-AAAA---TAA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TG----TCAA-AAT--T--CGTTTCACAATTG-AAGT-AGAA---TAAA-C---A----AGTT-TTAATAAC-AAA-tgacatattgttaaaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagagtctgagggcgaccagctcatcCC------GA-G-GAA--TACT--CTG-ATCATGA-TTTGT-CTA----T-----TAAG------T--TG---CACAGTCG-ATGT-TAAA---TAAG-T---ATTAAAG-T-TTAA-AAG-AA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-TATGT-TTTA-GTTG----CAAA-AAC--T--GCTTTCACAATCG-ATGTAAAAA---TAAA-C---A----A
gi|46                         :                                                                                    tctcttagaagcagttccatt--G----G-TCA---GAAG---GTTGTGGA-CTC-AGT-----AC-CAC---A----C--------------CA--------TGTGC----TGTGTCCTTGA-G----------CATTA--AAG-CA-C--A---TT-TT----ctat
gi|47                         :                                                                aGCACTTGGTCCAGTG-GTA--AAACA----TTGGGCCCAT--G----A-TTG---GAGG---GTCCTGGG-TTC-GATCTCCCGC-CAC---atttg
gi|48                         :                                                                                                                                  GTGGG-TTC-CATCC-CTGC-TGC---GG---C--------------CA--------TGAAT----CGTGTCCTTAT-G----------C---A--TGG-CA-CAGG---TT-TT----C-TACA----TATAC-attta
gi|49                         :                                                                tGTGCGTGTTGCAGTG-ATA--G-GCA----TCGGA--TAATTG----A-TCG---GTTT---ATCGTGAG-ATC-GATCCCCC
gi|5                          :                                                                  tcgtggaTCCTGGG-GTA--GAGTA----TCGGACCAAG--G----A-TCGTGGGTGG---GTTGGGGGATTT-GATCTTCCAT-CAT---GG---C--------------TA--------AGTAT----GGTTTCCTT-A-G----------C---A--AGA-TT-C--T---TA-AT----C-TGCA----TATGC-TA--------AAG--------TACTGGTTCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TAATAG-ATGACTTTTT-GTA---TTG----TAAT-AAT--T--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TGAA-T---A----AG-A-TTAA-A
gi|51                         :                                                                    ttaGGTCTAGTG-GTA--GAACA----TCAGACCT-G--G----G-TTA---GGGA---GTCATCGG-TTT-GATTAACTGT-CAA---GG---C--------------CA--------T
gi|53                         :                                                                 GCTCATGATCCAGTG-GTA--GAGCA----TCCGAC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatgtggaA-TTCGT-A-AA-GTTG----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAGTtgtctgatccatgatc
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attgaagatgagtttcagttgaTA----TAAGGAAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TAAA-C---A----AG-T-ATA
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaaaCTGGTTCT----ATC------CA-C-AAA--GAA---TCA-ATCGTGA-TT--T-ATAA-GTTG----TAAG-A----T--TATTTtta
gi|58                         :                                                                       GATCCAGTG-GTC--AAACA----TCGGACCCAA--A----A-CCG---GAGT---GTTGTTAG-TTC-G
gi|59                         :                                                                 gccCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TTGGACCAAG--G----A-TTA---G-GG---GTTGT
gi|6                          :                                                               tgggggaTGATTCAATG-GTA--GAGCA----TAGAACCTAG--G----A-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTC-AGTTCACCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTCA-G----------C---A--AGA-CATT--T---TT-TT----C-CTTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----ACC------CA-G-GAA--GACT--CCG-AATGTGA-TTTTT-TTAA-GTTG----TAAT-AATAATAATGTTTCACAATCA-AAGT-AAAA---TAG------A----AG-T-TT
gi|60                         :                                                                   GCATGGTCCAGTA-GTA--GAGCA----TTGGACCAAG--G----A-TTA---G-GG---ATC
gi|61                         :                                                                                           gggtggggACCCAG--G----A-TCA---GAGG---GTCATTGG-TTCAGCTGCT-TAT-TGC---AG---C--------------TA--------TGTGT----G
gi|62                         :                                                                            AGTG-GTA--TACCA----ACTGACCCAA--G----G-TCA---GAGG---GTCATGGG-TTT-GATC
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgg-TTTGT----A-ATTA----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATTA-ATGT-AAAA---TAAA-
gi|64                         :                                                               tgaagCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TTGGACCAAT--G----A-TTG---GGG
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gagtggggga--GACT--TCG-AGCATG--TTTGT-CTAA-GTTA----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAAT
gi|67                         :                                                                      TGGTCCAGTATGCA--AAGCG----TCGGACCAAG--G----A-TCG---G
gi|68                         :                                                              gttgatcagaGTCTAGTG-GTA--GAGGA----TCGGGTCTAG--G----A-TCG---GAGG---GCCATTAG-TT
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       C-TT--------T-G--------TACTGGCTCT----ACC------CT-G-GAA--GACT--TTG-AATGTTA-TT
gi|7                          :                                                                        tactAGTG-GTACAGAACA----C--AACCCAA--G----A-TTT---G-TG---ATTGTGGG-TTC-GATCCTCCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTGCTTGA-A----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-AT----C-CACA----AA--C-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACA------AA-G-TAA--GAGT--TTG-AGTATGA-TTTGT-GTAA-ATTG----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TAAA-G---A----AG---TTAA-A
gi|70                         :                                                                 ccaCATGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TTGGGCCAAG--G----A-TTG---GGGG---ttaa
gi|71                         :                                                                 ggggaTGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TTGGCCACAG--G----A-TCGA--GAGT---GT
gi|72                         :                                                                tGCACACGATCTAATG-GTA--AAGCA----TCAGACCCAG--G----A-TTG---tat
gi|73                         :                                                                                                                                                                                                                                         tgga---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TC--------A-G--------TACTGGCCCA----ATC------CA-G-TAA--G
gi|75                         :                                                                                                          ca----A-TCG---GGCG---GTCGTGGG-TTC-GATCTCCCTT-AAT---GG---C--------------TA--------T
gi|76                         :                                                                 GCACCTGGTCCAATG-GTA--AAGCA----TTCGACTCAG--G----A-Tt
gi|77                         :                                                              ggaGCGCGTGGTCTAGTA-GTA--GAGCA----CCGAACC
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gi|9                          :                                                                       cGTCTAGTG-GTA--AAGGA----T-------AG--G------TTG---GACG---GTCACAGG-TTC-AATCCACAAC-CAT---AG---T--------------CA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-TTT---C-CGTAAAATTGTGC-CT---------------------CTGGTTCT----GCA------TA-G-GAA--GACT--TCG-AGCATGA-TTTGT-ATAA-ATCG----TAAT-AGC--T--TGTTTCACAATTG-AAAT-AAAA---AAGG-TTTCA----AG-T-TTAA-Aaa
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-764 )      :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-NTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-ANGT-AAAA---TAAA-T---A----AG-T-TTAA-AAC-AAA-ACNCGTATTTATCGGCTCAAGT
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gi|10                         :                                                                    CATGGTCTTGTG-GTA--GAAAA----TCTGACACGG--A----A-CTA---TAGG---GTCGTGA--TTC-GAACCCCCAA-AAC---TG---T--------------TA-----------AT----GAT--CCATAA-G----------T-------GA-TT-G--T---CT-TT----A-AGTA----TATGT-TT--------A-A--------TACTGATTTT----ACT------CA-G-GAA--GACT--TTG-AGCCTGA-TTTGT-TCAA-GTTGA---TATG-AActaagaatattcttcggaaggttggtgtattccacccc
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gi|12                         :             gtcattcattcacttcacagagggacttacatatataccttaatagatttgaGCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGAACCCAT--G----A-TCG---G-GG---GTCG-GGG-TTC-GACCCTCCGC-CAC---AG---C--------------TACATTCGTTTGTGT----GGTATCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------CA-G-GTG--GAAT--T-G-AGCGTGA-TTTGT-CTA-----------------------------ACAACCG-AAGT-AAAA---TAAA-T---A----AA-T-TTg
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gi|14                         :                                                                        GTCAAGTG-GTA--GAGTA----CCAAACCCAT--G----A-TCG---GTGG---GTCGCGGG-TTC-AATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGTCCTTGG-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-T-----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-T-GAA--GAAT--TCG-ATTGTGA-TTTGC-CCAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCGCAATCG-AAGT-AAAA---TAAA-C---A----A
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gi|17                         :                                                                           CAGCG-GTC--GGGCA----TCGGACCCAT--G----A------------------------------CCCACGT-CAC---G-------------------T-------------T----GGTGT-CTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--TAGCTT-TTTCCGC-CGCA----TACGC-TT--------T-G--------TACTGGTTCT----ATC------CA-T-GAA--CACA--TCG-CGCGTGA-TTTGC-GGAA-GTTGCACATAAT-AAC--TC-TG--CCACATTCG-AAGT-GAAA---CAAA-T---A----AG-T-TTAA-AAC-
gi|18                         :                                                                              TG-GTA--GAGCA----TCAAAGCCAT--T----A-TCG---GAGG---GACAAGGA-TTC-GATACTCTGC-CAC---GG---C-------------------------GTGTTCTTGGTGTACTTGA----------------------------------------------CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGTTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TATGT-ATAA-GCTA----TAAG-------------TCAT--TCA-AAGT-AAAA---CAAA-T---A----AG-T-TTA
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----ACC------CA-T-GAA--TACT--TCG-TGCGTGG-TTTGT---AA---------TAAT-AAC--T--AGTTTCAAAAACA-AAGA-ATAA---CAAA-T---A----AG-T-TGAA-ATC-Acgtgacccatgaatacttcgtgcgtggtttgtaataataactagtttcaaaaacaaagaataacaaataagttgaaatca
gi|2                          :                                                                                                           gattcagtggtagagcatcggacccaggatcggagggtcattggttcgatccatcgccacggctatgtgtggtgcacgtgaccaagcgtgGTGTCCGTAA-G----------C---ACAAAA-CA-C--T---TT-AT----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----TAC------CA-G-GAA--AACC--AGG-AGCGTGA-TTTGTCAAAA-GTTG----TAAT-AAC--T--TTTTTCACAATCG-AGAT-AAAA---TAAG-T---A----AG-T-TTAA-AAC-AAATACATGTATTTAT
gi|20                         :                                         atctgttcttatcattcaatacgtataccaGGCCCAGTG-ATA--GAGCA----TAGGATCTAA--G----ATTCT---GGGGACTGTTGTTGG-TTT-GATCCTCTGC-CGC---AC---C--------------TA--------gaaaccttaactgtaatacacattataataatataatataaat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ----C-TGCA----TATA--TA--------A-T--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-TAA--GA---------GCAGGA-TTT----------------TAAG------T--TGTTTCAC-------TGT-AAAA---ATAA-T---A----AG-T-TTactgcatatataattactggttctacccagtaagagcaggattttaagttgtttcactgtaaaaataataagtttgctcactatttgtaatgcat
gi|21                         : ggcccagtgatagagcataggatctaagattctggggactgttgttggtttgatcctctgccgcacctaaGGCCCAGTG-GCA--GAGCA----TCAGAGCTAT--G----A-TCG---GGAG---GTCGTGGG-TTT-GATCCTCCTT-CAT---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTACTTGA------------------------A-C--T---TT-T-------------------------------A-G--------TACTGGTTCT----ACT------AA-G-GAA--GACT--TTG-AGTGTGA-TTTGT-ATAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAGTCG-GTGgctcactatttgtaatgcat
gi|22                         :                                                                                                            ----A-TCG---AAGA---GTCGTATG-TTC-GATCCGTCAC-TAC---GG---C--------------TA--------CATGT----TATGTTTTTA-------------------------------------TT----C-CAAATT--TATGC-TT----------G--------CA-TGG---T----A--------CA-GTGAA--A------TG-AGTGTAA-TTTG------------------G-A--------GCCTCACAGCTG-ATGT-AAAAATTCAAACT---A----AG-T-T-------------CTGGTATATATCGACTCAAGT
gi|23                         :                                                                                                     aCAG--G----A-TTG---ATGA---GTCATGGG-TTC-AATC--CCGTACAT---AA---TTTTATAATATTTTATA--------TGTGT----TGTATCCTTGA-ATACTACGTATC---A--AAG-CA-C--A---TT-TT----C-TTCA----TAAGC-TTGATTAATGA-A--------TAGTGGTTCT----ACC------
gi|24                         :                                                                                                                    tggtacaaagtgccaaaat-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------AA--------TGTGT----GGCGTCGTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C-------T-TT----CACGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-A-AAAC-GATT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TAAG-AGC--T--TGTTTCACAATCG-AAAT-AAAA---TAAA-T---A----AA-T-TTAA-tttaaa
gi|25                         :                                                                            AGTT-GTA--GAGCA----TCGGATCCAA--G----A-TTG---GAGG---A-CTTGGG-TTC-TATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTACTGGA-G-------------------G-CA-C--T---TT-AC----A-TGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--CACG--TCG-AGCGTAG-TTTAT-CAAA-GTTG----TAAT-AAC--
gi|26                         :                                                                   GCATGGTC-AGTA-GTA--CAGTA----TCTAAACTAG--G----A-TCA---GACG---GCCATCGG-TTC-AATCC-CCAA-AAT---GG---C--------------TT--------TGTGA----GAT---CT----G----------C---A------TA-A--T---TT-T----------------ATGC-TC--------A-G--------TGCTGGATCT----GCG------TATG-GAA--GACA--TTG-AATAAAA-TTTGT----A-GCTG----TA
gi|27                         :                                                            tgtggtggCGTGGTCCAGTG-GTT--GAGTA----TCGAACCCAG--G----A-CCG---GAGG---ATCGTTGG-TCC-tat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                              A----TATGTATT--------A-G--------TACTGGATCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TTT-GGTGTGA-CTTGT-ATAA-G--------------C--T--TGTTTCACATTCG-ACAT-AAAA---TTAT-T---A----AG-T-TTAA-Aatgtctatatgtattagtactggatctacccaagaagacttttggtgtgacttgtataagcttgtttcacattcgacataaaattattaagtttaaacc
gi|28                         :                    cgtggtccagtggttgagtatcgaacccaggaccggaggatcgttggtccatgtctAATG-GTA--GAGCA----CCGAACCCAT--G----A-TCA---G-------TCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GT---C--------------TT--------TGTGT----GGTGTCCATGA-G----------C---A--TGG-CA-C------TT-TT----C-CGTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GTCT--TCG-AGCGTGA-TTcc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                 ----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-C-----C-CAAA----TACGC-TT--------A-AGAAGTTAATACAGTTTCTTAAAACCAAAAAGTA-G-GAA---ACT--T---AATGTGA-TTTGA-ATAA-ATTT----TAAG-GAC--T--TTTTGCAAAAAGGAATGT-AGAA---GAAA-ggcc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                             CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGC-CTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTTACAATCG-AAGT-AAAA---TAAA-T---A----AG-T-TTAA-Aa
gi|30                         :                                                                                 tatatgttgtgttcagaccattggctataataattgaattgaa---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGT-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGC----AGTACCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-AT----C-TGCA----CATGC-AT--------A-G--------TATTGATTCT----ACC------CG-G-GAA--GATT--TCA-AGCGTAA-TATAT-ATActtaacttaacaaatgggcagtatatgtttactaatttactaaaacgtgattatttattgaaatatg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                         aCTTAA-G----------C---A--ATA-TA-C--T---TT-AT----C-AGCA----CATCC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------AA-G-CAA--CAAT--TTG-AGCTTGA-TTT--------GTTG----TAAA-AAC--T--TGTTTCAC-ATCG-ATGT-AAA-----AAA-T---A----AG-A-TTAT-AAC-Atata
gi|32                         :                                                                    CATGGTCCAGTG-GTA--GGACT----TCGAACCTAC--G----A-TCG---G-GG---ATCGCGAA-TTC-GAACCTGCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGCCATTGACA----------C---A--AG---A-C--T---AT-AT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-t
gi|33                         :                                                                                                                                              aCCTCTAC-CAT---GG---T--------------CA--------TATGC----TGTGTACTTGA-A----------C---A--A---------------------------------------T--------A-A--------T-CTGGTCCT----ACC------GA-T-GAA--GACA--TCG-ATTGAGA-TGTAT-ATAC-GGTG----AAAA-AAT--C--T---TCACAATCG-ATGT-AAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                 ----------C---A--ATG-TA-C--T---TT-AT----A-TGCA----T-TAA-TT--------AAG--------CACTAGTTCT----TCC------CA-G-GAA--GACA--TCG-TTTATCA-TTTGT-AT----TTG----Tcc
gi|35                         :                                                                                                                                                                             ttatgttcgtagtacaTAT----AGTGGCATGAA-A----------C---A--AGAACA-C--C---TT-AT----C-TGCA----TGTAT-TTTACCA---A-G--------TACTGGTTCTTGG-ACT------CA-T-GAA--CACA--TTT-AGCGCAA-CTTGC-CCGA-GTTA----TAAG-caaataaacaagttttaa
gi|36                         :                                                              gtcGCTCATGGCCTAGTG-ATA--G----------GGAACCAG--GTTCTA-TAA---CAGA---GTTGCGGG-TTT-GATCCCCAAC-CTC---GT---C--------------TA--------TGTAT----TGTGTCTTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--T---TT-
gi|37                         :                                                                          gaAGTG-TTA--AAGCA----TCGGATCAAT--A----A-TTA---GA-T---GTCATTGA-TTC-TATCC-ACAC-CAA---TG---T--------------CA--------TGTAT----CGTGTTACTGA-A----------C---A--AGA-CA-gt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                      tA-C--C---TT-TT----C-CGCA----TTTGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----GTC------TA--------------------CGGGA-TTTGT-ATAA-GT-------AAT-AAC--T--TGTTTCGCAGTCG-AAGT-AAtgttatcacggaaaa
gi|39                         :                                                        gaaaggcaccgaCATGGTCCAGTG-GTA--CAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTT-GATCCTCCCC-CAT---GG---C--------------TT--------TGTGC----TGTGTTCTTGA-A----------C---A--
gi|4                          :                                                                      TGGTTCGGTG-GTC--GAGCA----ACAAATCCAT--G----A-CCG---GAGT---GTCGTTGG-TTC-GATCTACCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----T-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGTGTGA-TGTGC-ATAA-GCTG----TAAG-AAT--T--TGTTTAACTGTCG-AAGT-AAAA---TAGA-T---A----AG-T-TTAA-ATC-A
gi|40                         :                                                                                       AGCA----TCAGACCCAA--G----A-TTG---GAGG---ATTGTTGG-CTC-AATCTCCCAC-CAT---GGGGGT--------------CA--------TGTGA----TGTGT-------G----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-t
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttgtgacCT----ACC------AT-G-TAC--GACT--TTG-AGAGTGA-TATGT-CTAATGTTA----ACAG-AG------TGTTTCATAATTA-ATTC-AAAA---TAAT-G---A----AGTT-TTAA-AAat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-G-TAA--GAGTCATCG-GACAAGA-TTTGT-ATAT-GTGG----TAAG-AGC--C--TGTTTCGTAATCT-ATGG-AAAA---TAA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TG----TCAA-AAT--T--CGTTTCACAATTG-AAGT-AGAA---TAAA-C---A----AGTT-TTAATAAC-AAA-tgacatattgttaaaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagagtctgagggcgaccagctcatcCC------GA-G-GAA--TACT--CTG-ATCATGA-TTTGT-CTA----T-----TAAG------T--TG---CACAGTCG-ATGT-TAAA---TAAG-T---ATTAAAG-T-TTAA-AAG-AA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-TATGT-TTTA-GTTG----CAAA-AAC--T--GCTTTCACAATCG-ATGTAAAAA---TAAA-C---A----A
gi|46                         :                                                                                    tctcttagaagcagttccatt--G----G-TCA---GAAG---GTTGTGGA-CTC-AGT-----AC-CAC---A----C--------------CA--------TGTGC----TGTGTCCTTGA-G----------CATTA--AAG-CA-C--A---TT-TT----ctat
gi|47                         :                                                                aGCACTTGGTCCAGTG-GTA--AAACA----TTGGGCCCAT--G----A-TTG---GAGG---GTCCTGGG-TTC-GATCTCCCGC-CAC---atttg
gi|48                         :                                                                                                                                  GTGGG-TTC-CATCC-CTGC-TGC---GG---C--------------CA--------TGAAT----CGTGTCCTTAT-G----------C---A--TGG-CA-CAGG---TT-TT----C-TACA----TATAC-attta
gi|49                         :                                                                tGTGCGTGTTGCAGTG-ATA--G-GCA----TCGGA--TAATTG----A-TCG---GTTT---ATCGTGAG-ATC-GATCCCCC
gi|5                          :                                                                  tcgtggaTCCTGGG-GTA--GAGTA----TCGGACCAAG--G----A-TCGTGGGTGG---GTTGGGGGATTT-GATCTTCCAT-CAT---GG---C--------------TA--------AGTAT----GGTTTCCTT-A-G----------C---A--AGA-TT-C--T---TA-AT----C-TGCA----TATGC-TA--------AAG--------TACTGGTTCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TAATAG-ATGACTTTTT-GTA---TTG----TAAT-AAT--T--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TGAA-T---A----AG-A-TTAA-A
gi|51                         :                                                                    ttaGGTCTAGTG-GTA--GAACA----TCAGACCT-G--G----G-TTA---GGGA---GTCATCGG-TTT-GATTAACTGT-CAA---GG---C--------------CA--------T
gi|53                         :                                                                 GCTCATGATCCAGTG-GTA--GAGCA----TCCGAC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatgtggaA-TTCGT-A-AA-GTTG----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAGTtgtctgatccatgatc
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attgaagatgagtttcagttgaTA----TAAGGAAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TAAA-C---A----AG-T-ATA
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaaaCTGGTTCT----ATC------CA-C-AAA--GAA---TCA-ATCGTGA-TT--T-ATAA-GTTG----TAAG-A----T--TATTTtta
gi|58                         :                                                                       GATCCAGTG-GTC--AAACA----TCGGACCCAA--A----A-CCG---GAGT---GTTGTTAG-TTC-G
gi|59                         :                                                                 gccCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TTGGACCAAG--G----A-TTA---G-GG---GTTGT
gi|6                          :                                                               tgggggaTGATTCAATG-GTA--GAGCA----TAGAACCTAG--G----A-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTC-AGTTCACCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTCA-G----------C---A--AGA-CATT--T---TT-TT----C-CTTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----ACC------CA-G-GAA--GACT--CCG-AATGTGA-TTTTT-TTAA-GTTG----TAAT-AATAATAATGTTTCACAATCA-AAGT-AAAA---TAG------A----AG-T-TT
gi|60                         :                                                                   GCATGGTCCAGTA-GTA--GAGCA----TTGGACCAAG--G----A-TTA---G-GG---ATC
gi|61                         :                                                                                           gggtggggACCCAG--G----A-TCA---GAGG---GTCATTGG-TTCAGCTGCT-TAT-TGC---AG---C--------------TA--------TGTGT----G
gi|62                         :                                                                            AGTG-GTA--TACCA----ACTGACCCAA--G----G-TCA---GAGG---GTCATGGG-TTT-GATC
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgg-TTTGT----A-ATTA----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATTA-ATGT-AAAA---TAAA-
gi|64                         :                                                               tgaagCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TTGGACCAAT--G----A-TTG---GGG
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gagtggggga--GACT--TCG-AGCATG--TTTGT-CTAA-GTTA----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAAT
gi|67                         :                                                                      TGGTCCAGTATGCA--AAGCG----TCGGACCAAG--G----A-TCG---G
gi|68                         :                                                              gttgatcagaGTCTAGTG-GTA--GAGGA----TCGGGTCTAG--G----A-TCG---GAGG---GCCATTAG-TT
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       C-TT--------T-G--------TACTGGCTCT----ACC------CT-G-GAA--GACT--TTG-AATGTTA-TT
gi|7                          :                                                                        tactAGTG-GTACAGAACA----C--AACCCAA--G----A-TTT---G-TG---ATTGTGGG-TTC-GATCCTCCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTGCTTGA-A----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-AT----C-CACA----AA--C-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACA------AA-G-TAA--GAGT--TTG-AGTATGA-TTTGT-GTAA-ATTG----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TAAA-G---A----AG---TTAA-A
gi|70                         :                                                                 ccaCATGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TTGGGCCAAG--G----A-TTG---GGGG---ttaa
gi|71                         :                                                                 ggggaTGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TTGGCCACAG--G----A-TCGA--GAGT---GT
gi|72                         :                                                                tGCACACGATCTAATG-GTA--AAGCA----TCAGACCCAG--G----A-TTG---tat
gi|73                         :                                                                                                                                                                                                                                         tgga---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TC--------A-G--------TACTGGCCCA----ATC------CA-G-TAA--G
gi|75                         :                                                                                                          ca----A-TCG---GGCG---GTCGTGGG-TTC-GATCTCCCTT-AAT---GG---C--------------TA--------T
gi|76                         :                                                                 GCACCTGGTCCAATG-GTA--AAGCA----TTCGACTCAG--G----A-Tt
gi|77                         :                                                              ggaGCGCGTGGTCTAGTA-GTA--GAGCA----CCGAACC
gi|8                          :                                                                        gtggaGTG-GTC--GAGTA----TCGAATCCAA--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-AGTACTCAAC-CAC---GG---C--------------TA---------ATGT----GGTGTCCTTGA-G----------T---A--AGA-CA-C--T---TT-AT----C-TGCA----TAT-T-TC--------A-G--------TACCGATTCT----ACC------AA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TTAG-AAC--T--TGTTTCATAATCG-ATGT-AAAA---TAAA-T---GT---TG-T-TTAA-AA
gi|9                          :                                                                       cGTCTAGTG-GTA--AAGGA----T-------AG--G------TTG---GACG---GTCACAGG-TTC-AATCCACAAC-CAT---AG---T--------------CA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-TTT---C-CGTAAAATTGTGC-CT---------------------CTGGTTCT----GCA------TA-G-GAA--GACT--TCG-AGCATGA-TTTGT-ATAA-ATCG----TAAT-AGC--T--TGTTTCACAATTG-AAAT-AAAA---AAGG-TTTCA----AG-T-TTAA-Aaa


blockSeqs                     :                                                                     A              CA     TCAT         ATT TTCT     TGG A  ACT            A     C    A   TTT  GGG TTTATAATATTTTA  CATTCGTT     TCTT           C TACTACGTAT ATT CA   A  T TAGC    TTTCCG  A    AAAT     A  GATTAATG A GAAGTTAA          TAAA   AAAAAG  T T   CG    CA   T             CAA  T    CACA    G   AA AA             A T  A    ATT    C TTC TTAA  T C    T   T   T  ATG
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blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            T   .        .   A  .              .     C    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . A       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CC   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .    .   .         
blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            A   .        .   A  .              .     C    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CC   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .    .   .         
blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            G   .        .   G  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CT   .    .       .   .  .              . A  .    .      . .   .     . .    .   .         
blockSeqs                     :                                                                     T              .      .            T   .        .   G  .              .     A    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             GG   .    .       .   .  .              . A  .    .      . .   .     . .    .   .         
blockSeqs                     :                                                                     G              .      .            T   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . A  .    .      . .   .     . .    .   .         
blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            G   .        .   T  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . G  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            A   .        .   A  .              .     G    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            T   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . A       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CA   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            G   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AC      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            A   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . A  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                     A              .      .            G   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CT   .    .       .   .  .              . C  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                     C              .      .            G   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                     G              .      .            T   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . A  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            C   .        .   A  .              .     C    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CC   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .    .             
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            T   .        .   A  .              .     A    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . C       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . A  .    .      . .   .     . .                  
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   T  .              .     C    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . A  .    .      . .   .     . .                  
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            T   .        .   T  .              .     C    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . C       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .                  
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            A   .        .   G  .              .     C    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . A       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .     . .                  
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            T   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CT   .    .       .   .  .              . A  .    .      . .   .     . .                  
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   A  .              .     A    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . A       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             TT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .                          
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   A  .              .     A    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             GT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .                          
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            A   .        .   A  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       TT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . T  .    .      . .   .                          
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   G  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       AT      .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             TT   .    .       .   .  .              . T  .    .      .                                
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   A  .              .     C    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       T       .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CT   .    .       .   .  .              . A  .    .      .                                
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   G  .              .     T    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . T       T       .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             GT   .    .       .   .  .              . T  .    .                                       
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   A  .              .     A    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . .       T       .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             CT   .    .       .   .  .              . T  .                                            
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            A   .        .   G  .              .     .    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . .       C       .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             AT   .    .       .   .  .              . T  .                                            
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            T   .        .   A  .              .     .    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . .       .       .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             G    .    .       .   .  .              . A                                               
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   A  .              .     .    .   .    .   .               .            .              . .          .   .    .  . .       .       .    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             A    .    .       .   .  .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   .  .              .     .    .   .    .   .               .                           . .          .   .    .  . .                    .        .  .        . .                 .      .       . .   .     .    .             .    .    .       .   .  .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            A   .        .   .  .              .     .    .   .    .   .               .                             .          .   .       .                      .        .  .        .                   .      .       . .   .     .    .             .    .    .       .   .  .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   .  .              .     .    .   .                                                      .          .   .                                       .                               .      .       . .   .     .    .             .    .    .       .   .                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   .  .              .                                                                                                                                                            .      .       . .   .     .    .             .    .    .       .                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                    .      .            G   .        .   .  .              .                                                                                                                                                                   .       . .   .     .    .             .    .    .       .                                                                       
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|50 ): ATATTCTTGAACAAGACGTTTATCTGCACATACTAGAGCTTGTTCTGCCTAGATGGATATTGTATGA
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Reference ( family-764 )      :                                                                 GCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-NTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAATCG-ANGT-AAAA---TAAA-T---A----AG-T-TTAA-AAC-AAA-ACNCGTATTTATCGGCTCAAGT
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gi|10                         :                                                                    CATGGTCTTGTG-GTA--GAAAA----TCTGACACGG--A----A-CTA---TAGG---GTCGTGA--TTC-GAACCCCCAA-AAC---TG---T--------------TA-----------AT----GAT--CCATAA-G----------T-------GA-TT-G--T---CT-TT----A-AGTA----TATGT-TT--------A-A--------TACTGATTTT----ACT------CA-G-GAA--GACT--TTG-AGCCTGA-TTTGT-TCAA-GTTGA---TATG-AActaagaatattcttcggaaggttggtgtattccacccc
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gi|12                         :             gtcattcattcacttcacagagggacttacatatataccttaatagatttgaGCGCGTGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TCGAACCCAT--G----A-TCG---G-GG---GTCG-GGG-TTC-GACCCTCCGC-CAC---AG---C--------------TACATTCGTTTGTGT----GGTATCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------CA-G-GTG--GAAT--T-G-AGCGTGA-TTTGT-CTA-----------------------------ACAACCG-AAGT-AAAA---TAAA-T---A----AA-T-TTg
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gi|17                         :                                                                           CAGCG-GTC--GGGCA----TCGGACCCAT--G----A------------------------------CCCACGT-CAC---G-------------------T-------------T----GGTGT-CTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--TAGCTT-TTTCCGC-CGCA----TACGC-TT--------T-G--------TACTGGTTCT----ATC------CA-T-GAA--CACA--TCG-CGCGTGA-TTTGC-GGAA-GTTGCACATAAT-AAC--TC-TG--CCACATTCG-AAGT-GAAA---CAAA-T---A----AG-T-TTAA-AAC-
gi|18                         :                                                                              TG-GTA--GAGCA----TCAAAGCCAT--T----A-TCG---GAGG---GACAAGGA-TTC-GATACTCTGC-CAC---GG---C-------------------------GTGTTCTTGGTGTACTTGA----------------------------------------------CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGTTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TATGT-ATAA-GCTA----TAAG-------------TCAT--TCA-AAGT-AAAA---CAAA-T---A----AG-T-TTA
gi|19                         :                                                                  tttatGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCATTGG-TTC-GATCCATCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGCACGTGA-C----------C---A--AG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----ACC------CA-T-GAA--TACT--TCG-TGCGTGG-TTTGT---AA---------TAAT-AAC--T--AGTTTCAAAAACA-AAGA-ATAA---CAAA-T---A----AG-T-TGAA-ATC-Acgtgacccatgaatacttcgtgcgtggtttgtaataataactagtttcaaaaacaaagaataacaaataagttgaaatca
gi|2                          :                                                                                                           gattcagtggtagagcatcggacccaggatcggagggtcattggttcgatccatcgccacggctatgtgtggtgcacgtgaccaagcgtgGTGTCCGTAA-G----------C---ACAAAA-CA-C--T---TT-AT----C-CACA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----TAC------CA-G-GAA--AACC--AGG-AGCGTGA-TTTGTCAAAA-GTTG----TAAT-AAC--T--TTTTTCACAATCG-AGAT-AAAA---TAAG-T---A----AG-T-TTAA-AAC-AAATACATGTATTTAT
gi|20                         :                                         atctgttcttatcattcaatacgtataccaGGCCCAGTG-ATA--GAGCA----TAGGATCTAA--G----ATTCT---GGGGACTGTTGTTGG-TTT-GATCCTCTGC-CGC---AC---C--------------TA--------gaaaccttaactgtaatacacattataataatataatataaat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ----C-TGCA----TATA--TA--------A-T--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-TAA--GA---------GCAGGA-TTT----------------TAAG------T--TGTTTCAC-------TGT-AAAA---ATAA-T---A----AG-T-TTactgcatatataattactggttctacccagtaagagcaggattttaagttgtttcactgtaaaaataataagtttgctcactatttgtaatgcat
gi|21                         : ggcccagtgatagagcataggatctaagattctggggactgttgttggtttgatcctctgccgcacctaaGGCCCAGTG-GCA--GAGCA----TCAGAGCTAT--G----A-TCG---GGAG---GTCGTGGG-TTT-GATCCTCCTT-CAT---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTACTTGA------------------------A-C--T---TT-T-------------------------------A-G--------TACTGGTTCT----ACT------AA-G-GAA--GACT--TTG-AGTGTGA-TTTGT-ATAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTCACAGTCG-GTGgctcactatttgtaatgcat
gi|22                         :                                                                                                            ----A-TCG---AAGA---GTCGTATG-TTC-GATCCGTCAC-TAC---GG---C--------------TA--------CATGT----TATGTTTTTA-------------------------------------TT----C-CAAATT--TATGC-TT----------G--------CA-TGG---T----A--------CA-GTGAA--A------TG-AGTGTAA-TTTG------------------G-A--------GCCTCACAGCTG-ATGT-AAAAATTCAAACT---A----AG-T-T-------------CTGGTATATATCGACTCAAGT
gi|23                         :                                                                                                     aCAG--G----A-TTG---ATGA---GTCATGGG-TTC-AATC--CCGTACAT---AA---TTTTATAATATTTTATA--------TGTGT----TGTATCCTTGA-ATACTACGTATC---A--AAG-CA-C--A---TT-TT----C-TTCA----TAAGC-TTGATTAATGA-A--------TAGTGGTTCT----ACC------
gi|24                         :                                                                                                                    tggtacaaagtgccaaaat-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------AA--------TGTGT----GGCGTCGTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C-------T-TT----CACGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-A-AAAC-GATT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TAAG-AGC--T--TGTTTCACAATCG-AAAT-AAAA---TAAA-T---A----AA-T-TTAA-tttaaa
gi|25                         :                                                                            AGTT-GTA--GAGCA----TCGGATCCAA--G----A-TTG---GAGG---A-CTTGGG-TTC-TATCCTCCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTACTGGA-G-------------------G-CA-C--T---TT-AC----A-TGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--CACG--TCG-AGCGTAG-TTTAT-CAAA-GTTG----TAAT-AAC--
gi|26                         :                                                                   GCATGGTC-AGTA-GTA--CAGTA----TCTAAACTAG--G----A-TCA---GACG---GCCATCGG-TTC-AATCC-CCAA-AAT---GG---C--------------TT--------TGTGA----GAT---CT----G----------C---A------TA-A--T---TT-T----------------ATGC-TC--------A-G--------TGCTGGATCT----GCG------TATG-GAA--GACA--TTG-AATAAAA-TTTGT----A-GCTG----TA
gi|27                         :                                                            tgtggtggCGTGGTCCAGTG-GTT--GAGTA----TCGAACCCAG--G----A-CCG---GAGG---ATCGTTGG-TCC-tat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                              A----TATGTATT--------A-G--------TACTGGATCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TTT-GGTGTGA-CTTGT-ATAA-G--------------C--T--TGTTTCACATTCG-ACAT-AAAA---TTAT-T---A----AG-T-TTAA-Aatgtctatatgtattagtactggatctacccaagaagacttttggtgtgacttgtataagcttgtttcacattcgacataaaattattaagtttaaacc
gi|28                         :                    cgtggtccagtggttgagtatcgaacccaggaccggaggatcgttggtccatgtctAATG-GTA--GAGCA----CCGAACCCAT--G----A-TCA---G-------TCGTGGG-TTC-GATCCTCCGC-CAC---GT---C--------------TT--------TGTGT----GGTGTCCATGA-G----------C---A--TGG-CA-C------TT-TT----C-CGTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GTCT--TCG-AGCGTGA-TTcc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                 ----------C---A--AGA-CA-C--T---TT-C-----C-CAAA----TACGC-TT--------A-AGAAGTTAATACAGTTTCTTAAAACCAAAAAGTA-G-GAA---ACT--T---AATGTGA-TTTGA-ATAA-ATTT----TAAG-GAC--T--TTTTGCAAAAAGGAATGT-AGAA---GAAA-ggcc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                             CA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----AAC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGC-CTAA-GTTG----TAAG-AAC--T--TGTTTTACAATCG-AAGT-AAAA---TAAA-T---A----AG-T-TTAA-Aa
gi|30                         :                                                                                 tatatgttgtgttcagaccattggctataataattgaattgaa---GTCGTGGG-TTC-GATCCTCCGT-CAC---GG---C--------------TA--------TGTGC----AGTACCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-AT----C-TGCA----CATGC-AT--------A-G--------TATTGATTCT----ACC------CG-G-GAA--GATT--TCA-AGCGTAA-TATAT-ATActtaacttaacaaatgggcagtatatgtttactaatttactaaaacgtgattatttattgaaatatg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                         aCTTAA-G----------C---A--ATA-TA-C--T---TT-AT----C-AGCA----CATCC-TT--------A-G--------TTCTGGTTCT----ACC------AA-G-CAA--CAAT--TTG-AGCTTGA-TTT--------GTTG----TAAA-AAC--T--TGTTTCAC-ATCG-ATGT-AAA-----AAA-T---A----AG-A-TTAT-AAC-Atata
gi|32                         :                                                                    CATGGTCCAGTG-GTA--GGACT----TCGAACCTAC--G----A-TCG---G-GG---ATCGCGAA-TTC-GAACCTGCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TATGT----GGTGCCATTGACA----------C---A--AG---A-C--T---AT-AT----C-CGCA----TATGC-TT--------A-t
gi|33                         :                                                                                                                                              aCCTCTAC-CAT---GG---T--------------CA--------TATGC----TGTGTACTTGA-A----------C---A--A---------------------------------------T--------A-A--------T-CTGGTCCT----ACC------GA-T-GAA--GACA--TCG-ATTGAGA-TGTAT-ATAC-GGTG----AAAA-AAT--C--T---TCACAATCG-ATGT-AAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                 ----------C---A--ATG-TA-C--T---TT-AT----A-TGCA----T-TAA-TT--------AAG--------CACTAGTTCT----TCC------CA-G-GAA--GACA--TCG-TTTATCA-TTTGT-AT----TTG----Tcc
gi|35                         :                                                                                                                                                                             ttatgttcgtagtacaTAT----AGTGGCATGAA-A----------C---A--AGAACA-C--C---TT-AT----C-TGCA----TGTAT-TTTACCA---A-G--------TACTGGTTCTTGG-ACT------CA-T-GAA--CACA--TTT-AGCGCAA-CTTGC-CCGA-GTTA----TAAG-caaataaacaagttttaa
gi|36                         :                                                              gtcGCTCATGGCCTAGTG-ATA--G----------GGAACCAG--GTTCTA-TAA---CAGA---GTTGCGGG-TTT-GATCCCCAAC-CTC---GT---C--------------TA--------TGTAT----TGTGTCTTTGA-G----------C---A--GGA-CA-C--T---TT-
gi|37                         :                                                                          gaAGTG-TTA--AAGCA----TCGGATCAAT--A----A-TTA---GA-T---GTCATTGA-TTC-TATCC-ACAC-CAA---TG---T--------------CA--------TGTAT----CGTGTTACTGA-A----------C---A--AGA-CA-gt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                      tA-C--C---TT-TT----C-CGCA----TTTGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----GTC------TA--------------------CGGGA-TTTGT-ATAA-GT-------AAT-AAC--T--TGTTTCGCAGTCG-AAGT-AAtgttatcacggaaaa
gi|39                         :                                                        gaaaggcaccgaCATGGTCCAGTG-GTA--CAGCA----TCGGACCCAG--G----A-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTT-GATCCTCCCC-CAT---GG---C--------------TT--------TGTGC----TGTGTTCTTGA-A----------C---A--
gi|4                          :                                                                      TGGTTCGGTG-GTC--GAGCA----ACAAATCCAT--G----A-CCG---GAGT---GTCGTTGG-TTC-GATCTACCGC-CAC---GG---C--------------TA--------TTTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-C--A---TT-TT----T-CGCA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACC------CA-G-GAA--GACT--TCG-AGTGTGA-TGTGC-ATAA-GCTG----TAAG-AAT--T--TGTTTAACTGTCG-AAGT-AAAA---TAGA-T---A----AG-T-TTAA-ATC-A
gi|40                         :                                                                                       AGCA----TCAGACCCAA--G----A-TTG---GAGG---ATTGTTGG-CTC-AATCTCCCAC-CAT---GGGGGT--------------CA--------TGTGA----TGTGT-------G----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-t
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttgtgacCT----ACC------AT-G-TAC--GACT--TTG-AGAGTGA-TATGT-CTAATGTTA----ACAG-AG------TGTTTCATAATTA-ATTC-AAAA---TAAT-G---A----AGTT-TTAA-AAat
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-G-TAA--GAGTCATCG-GACAAGA-TTTGT-ATAT-GTGG----TAAG-AGC--C--TGTTTCGTAATCT-ATGG-AAAA---TAA
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TG----TCAA-AAT--T--CGTTTCACAATTG-AAGT-AGAA---TAAA-C---A----AGTT-TTAATAAC-AAA-tgacatattgttaaaa
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagagtctgagggcgaccagctcatcCC------GA-G-GAA--TACT--CTG-ATCATGA-TTTGT-CTA----T-----TAAG------T--TG---CACAGTCG-ATGT-TAAA---TAAG-T---ATTAAAG-T-TTAA-AAG-AA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-TATGT-TTTA-GTTG----CAAA-AAC--T--GCTTTCACAATCG-ATGTAAAAA---TAAA-C---A----A
gi|46                         :                                                                                    tctcttagaagcagttccatt--G----G-TCA---GAAG---GTTGTGGA-CTC-AGT-----AC-CAC---A----C--------------CA--------TGTGC----TGTGTCCTTGA-G----------CATTA--AAG-CA-C--A---TT-TT----ctat
gi|47                         :                                                                aGCACTTGGTCCAGTG-GTA--AAACA----TTGGGCCCAT--G----A-TTG---GAGG---GTCCTGGG-TTC-GATCTCCCGC-CAC---atttg
gi|48                         :                                                                                                                                  GTGGG-TTC-CATCC-CTGC-TGC---GG---C--------------CA--------TGAAT----CGTGTCCTTAT-G----------C---A--TGG-CA-CAGG---TT-TT----C-TACA----TATAC-attta
gi|49                         :                                                                tGTGCGTGTTGCAGTG-ATA--G-GCA----TCGGA--TAATTG----A-TCG---GTTT---ATCGTGAG-ATC-GATCCCCC
gi|5                          :                                                                  tcgtggaTCCTGGG-GTA--GAGTA----TCGGACCAAG--G----A-TCGTGGGTGG---GTTGGGGGATTT-GATCTTCCAT-CAT---GG---C--------------TA--------AGTAT----GGTTTCCTT-A-G----------C---A--AGA-TT-C--T---TA-AT----C-TGCA----TATGC-TA--------AAG--------TACTGGTTCT----ACC------CA-A-GAA--GACT--TAATAG-ATGACTTTTT-GTA---TTG----TAAT-AAT--T--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TGAA-T---A----AG-A-TTAA-A
gi|51                         :                                                                    ttaGGTCTAGTG-GTA--GAACA----TCAGACCT-G--G----G-TTA---GGGA---GTCATCGG-TTT-GATTAACTGT-CAA---GG---C--------------CA--------T
gi|53                         :                                                                 GCTCATGATCCAGTG-GTA--GAGCA----TCCGAC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatgtggaA-TTCGT-A-AA-GTTG----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAGTtgtctgatccatgatc
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attgaagatgagtttcagttgaTA----TAAGGAAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TAAA-C---A----AG-T-ATA
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaaaCTGGTTCT----ATC------CA-C-AAA--GAA---TCA-ATCGTGA-TT--T-ATAA-GTTG----TAAG-A----T--TATTTtta
gi|58                         :                                                                       GATCCAGTG-GTC--AAACA----TCGGACCCAA--A----A-CCG---GAGT---GTTGTTAG-TTC-G
gi|59                         :                                                                 gccCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TTGGACCAAG--G----A-TTA---G-GG---GTTGT
gi|6                          :                                                               tgggggaTGATTCAATG-GTA--GAGCA----TAGAACCTAG--G----A-TCG---GAGG---GTCACGGG-TTC-AGTTCACCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTCCTTCA-G----------C---A--AGA-CATT--T---TT-TT----C-CTTA----TATGC-TT--------A-G--------TACTGGTTTT----ACC------CA-G-GAA--GACT--CCG-AATGTGA-TTTTT-TTAA-GTTG----TAAT-AATAATAATGTTTCACAATCA-AAGT-AAAA---TAG------A----AG-T-TT
gi|60                         :                                                                   GCATGGTCCAGTA-GTA--GAGCA----TTGGACCAAG--G----A-TTA---G-GG---ATC
gi|61                         :                                                                                           gggtggggACCCAG--G----A-TCA---GAGG---GTCATTGG-TTCAGCTGCT-TAT-TGC---AG---C--------------TA--------TGTGT----G
gi|62                         :                                                                            AGTG-GTA--TACCA----ACTGACCCAA--G----G-TCA---GAGG---GTCATGGG-TTT-GATC
gi|63                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgg-TTTGT----A-ATTA----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATTA-ATGT-AAAA---TAAA-
gi|64                         :                                                               tgaagCATGGTCCAGTG-GTA--GAGAA----TTGGACCAAT--G----A-TTG---GGG
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gagtggggga--GACT--TCG-AGCATG--TTTGT-CTAA-GTTA----TAAG-AAT--T--TGTTTCACAAT
gi|67                         :                                                                      TGGTCCAGTATGCA--AAGCG----TCGGACCAAG--G----A-TCG---G
gi|68                         :                                                              gttgatcagaGTCTAGTG-GTA--GAGGA----TCGGGTCTAG--G----A-TCG---GAGG---GCCATTAG-TT
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       C-TT--------T-G--------TACTGGCTCT----ACC------CT-G-GAA--GACT--TTG-AATGTTA-TT
gi|7                          :                                                                        tactAGTG-GTACAGAACA----C--AACCCAA--G----A-TTT---G-TG---ATTGTGGG-TTC-GATCCTCCCC-CAC---AG---C--------------TA--------TGTGT----GGTGTGCTTGA-A----------C---A--AGA-CA-A--T---TT-AT----C-CACA----AA--C-TT--------A-G--------TACTGGTTCT----ACA------AA-G-TAA--GAGT--TTG-AGTATGA-TTTGT-GTAA-ATTG----TAAG-AAC--A--TGTTTCACAATCA-ATGT-AAAA---TAAA-G---A----AG---TTAA-A
gi|70                         :                                                                 ccaCATGGTCCAGTG-GTA--GAGCA----TTGGGCCAAG--G----A-TTG---GGGG---ttaa
gi|71                         :                                                                 ggggaTGATTCAGTG-GTA--GAGCA----TTGGCCACAG--G----A-TCGA--GAGT---GT
gi|72                         :                                                                tGCACACGATCTAATG-GTA--AAGCA----TCAGACCCAG--G----A-TTG---tat
gi|73                         :                                                                                                                                                                                                                                         tgga---TT-TT----C-CGCA----TATGC-TC--------A-G--------TACTGGCCCA----ATC------CA-G-TAA--G
gi|75                         :                                                                                                          ca----A-TCG---GGCG---GTCGTGGG-TTC-GATCTCCCTT-AAT---GG---C--------------TA--------T
gi|76                         :                                                                 GCACCTGGTCCAATG-GTA--AAGCA----TTCGACTCAG--G----A-Tt
gi|77                         :                                                              ggaGCGCGTGGTCTAGTA-GTA--GAGCA----CCGAACC
gi|8                          :                                                                        gtggaGTG-GTC--GAGTA----TCGAATCCAA--G----A-TCG---GAGG---GTCGTGGG-TTC-AGTACTCAAC-CAC---GG---C--------------TA---------ATGT----GGTGTCCTTGA-G----------T---A--AGA-CA-C--T---TT-AT----C-TGCA----TAT-T-TC--------A-G--------TACCGATTCT----ACC------AA-G-GAA--GACT--TCG-AGCGTGA-TTTGT-CTAA-GTTG----TTAG-AAC--T--TGTTTCATAATCG-ATGT-AAAA---TAAA-T---GT---TG-T-TTAA-AA
gi|9                          :                                                                       cGTCTAGTG-GTA--AAGGA----T-------AG--G------TTG---GACG---GTCACAGG-TTC-AATCCACAAC-CAT---AG---T--------------CA--------TGTGT----GGTGTCCTTGA-G----------C---A--AGA-CA-T--T---TT-TTT---C-CGTAAAATTGTGC-CT---------------------CTGGTTCT----GCA------TA-G-GAA--GACT--TCG-AGCATGA-TTTGT-ATAA-ATCG----TAAT-AGC--T--TGTTTCACAATTG-AAAT-AAAA---AAGG-TTTCA----AG-T-TTAA-Aaa
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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