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Reference ( gi|1 )            :   TCGTCAAGATTATTCTTCT--T-TTACTGGACAAATATGTTTATTAAAATATATATTATACCAGAT-----AAATTAAACTAAAA-TATAAAAGTTTCATCTTTATTAACCTTGTTGTTTTTTTTTTCGTACAAGGGTAATCGAATCGGTAA--A-AATA---TAATA----TATATATATACATTTTAGTGATTGTATGTGTTTATATGTATACATGAGTGTCTATCGTCT-G--TTTTC-CATGTAAA--GGATAAGTATTCAAACTGAACA-------TCTTTGC-T-----CAAGGCTAAACAA--TTT-AAAA-A-TGC--ATAT----ATGCCAACTACACTTGTTATTTATGTGCGTATA-T-GG-TGTATATGTATGTATAAAGTATATGAGTGATATGTA-T-TACATTTGAAACAATCGTAAATCGCT--TCACAT----GTATGTATGTACATTTACG-TATGT-TTGCTAT--CCATTAATT--TATAAT-GTACTGATTTATGCTTGC-CGT-CATGTA-T------ATGTAAACTATGTCCTCTTGGGCCTAAGACCTTCTG-GAAATATG--A-AA---ATAAAACTTGTTCAACCTTGTTTATATC
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|1                          :                                                                                       TCGTCAAGATTATTCTTCT-TTTACTGGA-CAAATATGTTTATTAAAATATATATTATA--------CCAGATAAATTAAACTAAAA-TATAAAAGTTTCATCTTTATTAACCTTGTTGTTTTTTTTTTCGTACAAGGGTAATCGAATCGGTAA----AAATA---TAATA----TATATATATACATTTTAGTGATTGTATGTGTTTATATGTATACATGAGTGTCTATCGTCTG-TTTTC-CATGTAAA--GGATAAGTATTCAAACTGAACAT-------CTTTGCT-----CAAGGCTAAAC-A--A--TTT-AA--AA-A-TGC--A----TATATGCCAACTACACTTGTTATTTATGTGCGT----ATATGG-TGTATATGTATGTATAAAGTATATGAGTGATATGTA-TTACATTTGAAACAATCGTAAA----TCGCT------TCACATGTATG-TATGTAC--ATTTACGT---ATGTTTGCTATCCATTAATT--TATAATGTACTGATTTATGCTTGCCGTCATGTAT------ATGT-AAACTATGTCCTCTTGGGCCTAAGACCTTCTG-GAAATATG--A-AA---ATAAAACTTGTTCAACCTTGTTTATAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATTCAAACTGAACAC-------ACTTGCA-----CAAGGATAAAC-A--A--TTT-AA--AA-AATGC--A----TATATACCAACTACAATTGTTATATATGTGCGT----ATAT------ATATGTATGTAAAAAGTATATGAGTGATATGTA-TTACATTTGAAACAATCGTAAA----TCACT------TCACATGTc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACATGTTTGTCTATCATCTG-TTTTTGCATGTAAA--GGATAAGTATTGAAACTGAACAC-------CTTTGTA-----CAAGGTTAAAC-A--A---TT-AA--AA-A-TACATA----TATATATCAACTACAATTGTTATTTATGTGCGT----ATATTGATGTTTATGTATGTATAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAACAATCGTAAA----TTAAT------TAACG----------GTAT--A--T---T---AT--TTG-------TTCATT--TATAATATATTGATTCATACTTGTCGTCAT--------------------------TT----GTCTAAGACTTCCTG-AAATTATG--ACAA---ATAAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttGCATGCCGTCATGTATTACCATATTT-GAA-CATGTACTTATGGGTCGAAGACCTTCTACGAAAAATG--G-AG---AAAAAAAATGTTTAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACGT-------TTTCTTG-----CAAGGTTAAA--GAAA--TCT-AATCAA-A------A----TATATATGAATTTCAGTTACTATATATGTGTGTTTTAATATGTATGTaaacgatgtttcatatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taatcttattttAACTACAATTGTTATTCATGTGCGT----ATATGGATGTAAATCTATGTATAATGTATATG-------TGT------ATTTAAAACA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tacaaagttaTATATTTGCCGTCATGTAT------ATGT-AAA-C-TGCATTTATGGGACTAAGACCTTCAG-AAAAT
gi|2                          :                                                                                       TCGTCAAGATCATTCTTCTACTTTTTGGT-CGAATATGTTTATTAAAA-ATATAATATAATGTTTTAT-------ATTAACCTAAAAATATAAAATTTTAAACATTATTAACCTTGTT---TTCGTTATCTTACAAGATTAAACGAATCGGTAA---------------TA-----ATATATATACATTTGAGTGATTATATGTCTTTATTTTTATATATGTGTGTC--------------AGCATGTAAA--GGATAAGTATTCAAACTGAACAC-------TTTTGTG-----CAAGGTTGAAC-G--T--TTT-AA--AA-A-TAC--ATATTTATATATCAACTACAATTGTTATTTATGTGCGT----ATATGGATGTATATGTATGTAT-AAGTAAATGAGTGATATGTA-TCACATCTGAAACAATCGTAAA----GCACT------TAACATGTA----------------------------TGCTATCCATTAATT--TGTAATGTACTGATTTATGCTTGCCGTCATGTAT------ATCTAAAA-TATGT--TT------------CCTTCTG-GAAATATGGAA-AA---ATAAAAGTTttactcaaactt
gi|3                          :                                                                                       TCGTCAAGATCATTCTTCT-TCTTTCAGGACAAATATGTTTATTCAAATATACAATATA--------T-------ACTAAACTAAAA-TACGAAAGTTTCTCCATTGTTAACCATGTT---TTTGTTTTCGTACAAAAATAATCGAATCGGTAAT---AA-TA---TGATAATAATATATATATACATTTCAGTGATTGTAAGTGTTGATATGTATACATGTGTGTCTGTTATCTG-TTTTAGCATGTAAT--GGATAAGTATTCAAACTGAAAAC-------CTTTGTG-----TTAAGATAAAC-A--A--TTTAAA--AA-A-TGC--A----TATATACCCACTACAATTGTTATTTATGTGCAT----ATAT--ATATGTATGTATGTGTAAAGTATATGAGCGATATGTA-TTACATTTGAAACAATCGTAAA----TCACT------TCACATGTATG-TAGGTACATA--TATGT---ATGTTTGCTATCCATTTATT--TATAATGTACTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttTGTATACATGTGTGCCTAGCGTTTA-GTTTGGCATGTAAA--AGAAAAGTA-----ACTGAACACATTTATTCTCCGTTTTATGCAGGGTTAAACAG--T--TTT-AA--AA-A-AAC--A----TACATATAAACTACACTTGTTATTTATGTATGT----ATATAAATGTTGATGTATGTAT-ATGTTTATGAGTAATATGTGTTTATATTTAAAACAATCGTAAAATATTTATTATATAATAACATGTATGCTATGTAT--A--TATG----ATA-----TAACCA-----T--TATAATATACTGATGTATGCTTGCCGTCATGTAT------ATGTAAAA-TATGTCCTCTTGGGTCTAAGACCTTAT--GAAATGTA--A-AAAAGATAAAACTTG-TCAAtt
gi|5                          :                                                                                       TCGTCAAGATCATTCTTCT-TCTTTTT-------TAT---TATTAAAATATACAATATA--------T-------ATTAAACTAAAA-TATAAAAGTTTCTTCTTTATTAACCTTGTT---TTCGTTTTCGTGCAAGGAAATTCGAATCGGTAATTATAA-TACACTAATA----TATATATATATATT--AGTGATTTTATGTGTTTATTTGTACACATGTGTGTCTATCGGCTGCTTTTTGCATGTAAA--GGATAAGTATACCAACTGAACAC-------CTTTGCG-----CAAGGATTAAC-A--A--TTT-AA--AA-A-TCC--A----TATATACCAACTACAATTGTTATTTATGTGCAT----ATATGGATGTATATGTATGTATAAAGT---------ATATGTA-GTACATTTGAGACAATCGTAAA----TCACT------TCTCATGTATG-TATGTAaaatctgagtttaacaaacaataaatcaatgatttcactttatct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTATTGTTTG-CTTTTGCTTGTAAA--AGAAAAGTATTCAAACTT----T-------CTCCGTT-----TAA-----AAC-A--AATTTT-GA--AATA-TAC--C----TATATATAAACCATAATTGTTATTTATATGCAT----TTATGGATGTATATGCATGTATAATGTATATGAATGATATGTATTTATATCTAAAACAATCGTAAA----TTACT------TG-TATGTA---TATGTA---A--TATGTAAAATG-TCCCTAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tactatctgtttactataagtgccttttattttgttaatttgagaacggttgttattcatattattaGGT-TAAGACCTTCTG-GAAATATGA-A-AA---ATAAAACGTGTT-AA-CTTGTAaggttaagaccttctggaaatatgaaaaataaaacgtgttaacttgtaaaacttgta
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore                  :                          .  . .      .     .   .  .       ................ .   .      .   .       ..................           .  ...  .               .   .            ...  . .............             ..                                        .    ..   .         ..                       .......   .  ......     . ..    .  ..   .    . .   .. ....                                     .                            .         . .                     .... .    ...... .         ..................................      . . ....      .   .              .   .      . .............................  ..            .        ....  ...      ..  . .              
lowQualScore                  :                          0  0 4      0     0   8  8       0000000000000000 8   6      0   8       222222222222222222           0  777  7               0   4            000  8 4444444444444             00                                        9    11   6         11                       0000000   2  333333     3 55    0  55   0    0 0   55 5555                                     8                            0         0 3                     1111 3    666666 1         5555555555555555555555555555555555      9 9 0000      4   9              4   4      4 11111111111111111111111111111  00            4        9999  888      00  2 5              
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                     ACATGTTTGTCTATCATCTG-TTTTTGCATGTAAA--GGATAAGTATTGAAACTGAACAC-------CTTTGT-----ACAAGGTT--AAAC-AA---TT-AAAA-A-TACATA----TATATATCAACTACAATTGTTATTTATGTGCGTATATTGATGTTTATGTATGTATAA
gi|12                         :                     CTCTT-GGATGAACATGATCACTTAAATAT-CAACATA--------T-------G-------AAAG-TGT----GTTTACTAATCCTCGGTCAAGTTTGTTAAGTTT--T---TT-CGTTCTCGCACAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtttttgttaaaatcaaaAAACAATCGTAAA----T-TAAT------TAACG-GTATA-T--------------T-----AT------TTG-------TTCATT--TATAAT-ATATTGATTCATACTTGT-CGT-CATTT---------------------------------GTCTAAGACTTCCTG-AAATTATG--ACAA---ATAAAAata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttGCATGC-CGT-CATGTA-TTACCATATTT-GAA-CATGT-AC-TTATGGGTCGAAGACCTTCTACGAAAAATG--G-AG---AAAAAAAATGTTTAAA
gi|15                         :                                                                                                                         TAATCTTATT---TTACGTTTTCTTGCAAGGTTAAAGAAATC--TAAT---CA------AA-------ATATATATGAATTTCAGTTACTATATATGTGTGTTT-TA-ATATGTATGTaacgatgtttcatatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTACAATTGTTATTCATGTGCGTATATGGATGTAAATCTATGTATAATGTATATG-------TGT-------ATTTAAAACA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tacaaagttaTATATTTGC-CGT-CATGTA-T------ATGT-AAA-C-TGCATT-TA-TGGGACTAAGACCTTCAG-AAAAT
gi|2                          : TCGTCAAGATCATTCTTCTACTTTTTGGTCGAATATGTTTATTAAAA-ATATAATATAATGTTTTAT-------ATTAACCTAAAAATATAAAATTTT------AAACA-------TTATTAACCTTGTT---TT-CGTTATCTTACAAGATTAAACGAATCGGTAAT---AATA---TA-------------TATACATTTGAGTGATTATATGTCTTTATTTTTATATATGTGTGTC--------------AGCATGTAAA--GGATAAGTATTCAAACTGAACAC-------TTTTGT-----GCAAGGTT--GAAC-GT--TTT-AAAA-A-TAC--ATATTTATATATCAACTACAATTGTTATTTATGTGCGTATATGGATGTATATGTATGTAT-AAGTAAATGAGTGATATGTA-T-CACATCTGAAACAATCGTAAA----G-CACT------TAACATGTA---------------------------------TGCTATCCATTAATT--TGTAAT-GTACTGATTTATGCTTGC-CGT-CATGTA-T------ATCTAAAA-TATGT-TT---------------CCTTCTG-GAAATATGGAA-AA---ATAAAAGTTttactcaaactt
gi|3                          : TCGTCAAGATCATTCTTCTTCTTTCAGGACAAATATGTTTATTCAAATATACAATATA--------T-------ACTAAACTAAAA-TACGAAAGTTT------CTCCA-------TTGTTAACCATGTT---TT-TGTTTTCGTACAAAAATAATCGAATCGGTAAT---AATA---TGATAATAATATATATATACATTTCAGTGATTGTAAGTGTTGATATGTATACATGTGTGTCTGTTATCTG-TTTTAGCATGTAAT--GGATAAGTATTCAAACTGAAAAC-------CTTTGT-----GTTAAGAT--AAAC-AA--TTTAAAAA-A-TGC--A----TATATACCCACTACAATTGTTATTTATGTGCATATAT--ATATGTATGTATGTGTAAAGTATATGAGCGATATGTA-T-TACATTTGAAACAATCGTAAA----T-CACT------TCACATGTATG-T-AGGTAC----ATAT-----ATGTATGTTTGCTATCCATTTATT--TATAAT-GTACTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                              ttTGTATACATGTGTGCCTAGCGTTTA-GTTTGGCATGTAAA--AGAAAAGTA-----ACTGAACACATTTATTCTCCGTTTTATGCAGGGTT--AAACAGT--TTT-AAAA-A-AAC--A----TACATATAAACTACACTTGTTATTTATGTATGTATATAAATGTTGATGTATGTAT-ATGTTTATGAGTAATATGTGTT-TATATTTAAAACAATCGTAAAATATT-TATTATATAATAACATGTATGCT-ATGT------ATAT-----ATG-----ATA-TAACCA-----T--TATAAT-ATACTGATGTATGCTTGC-CGT-CATGTA-T------ATGTAAAA-TATGT-CC-TCTTGGGTCTAAGACCTTAT--GAAATGTA--A-AAAAGATAAAACTTG-TCAAAtt
gi|5                          : TCGTCAAGATCATTCTTCTTCTTTT-T------TAT---TATTAAAATATACAATATA--------T-------ATTAAACTAAAA-TATAAAAGTTT------CTTCT-------TTATTAACCTTGTT---TT-CGTTTTCGTGCAAGGAAATTCGAATCGGTAATTATAATACACTAATA----TATATATATATATT--AGTGATTTTATGTGTTTATTTGTACACATGTGTGTCTATCGGCTGCTTTTTGCATGTAAA--GGATAAGTATACCAACTGAACAC-------CTTTGC-----GCAAGGAT--TAAC-AA--TTT-AAAA-A-TCC--A----TATATACCAACTACAATTGTTATTTATGTGCATATATGGATGTATATGTATGTATAAAGT---------ATATGTA-G-TACATTTGAGACAATCGTAAA----T-CACT------TCTCATGTATG-T-ATGTA-----aatctgagtttaacaaacaataaatcaatgatttcactttatct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                               tTATTGTTTG-CTTTTGCTTGTAAA--AGAAAAGTATTCAAACT--------------TTCTC------C---GTTTAAAAC-AAATTTT-GAAATA-TAC--C----TATATATAAACCATAATTGTTATTTATATGCATTTATGGATGTATATGCATGTATAATGTATATGAATGATATGTATT-TATATCTAAAACAATCGTAAA----T-TACT------T-GTATGTATA-T---GTA-----ATATGTAAAATG-----TCCCTAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tactatctgtttactataagtgccttttattttgttaatttgagaacggttgttattcatattattaTATACCTATATATAAACCATA--ATTGTTATTTA-TATGCATTT--ATGGAT-GTATA----TGCATG------TATAATGTATA-TGA-ATG-----ATAT-----GTA-----TTTATATCTA--AA-----ACAATCGTA---AATTA--CTTGTATGTATATGTAAT------ATGT-AAA--ATGT-CCCTA-TAGGT-TAAGACCTTCTG-GAAATATGA-A-AA---ATAAAACGTGTT--AACTTGTAaggttaagaccttctggaaatatgaaaaataaaacgtgttaacttgtaaaacttgta
gi|7                          :                                                                       tactatctgtttactataagtgccttttattttgttaatttgagaacggttgttattcatattattatattgtttgcttttgcttgtaaaagaaaagtattcaaactttctccgtttaaaacaaattttgaaaAGTGATTATAAGTGTTTATTTGTATACATGTGCTTATATCGTCTG-TTTTTGCATGTAAA--AGATAAGTATTCAAACTGAACAC-------TTTTGT-----ACAAGGTT--AAAC-GA--TTC-AAAA-A-TAC--A----TATATATCAACTACAGTTGTTATTTATGTGCGTATATGGATTAAGGTGTATGTATAAAGCATATGATTGATATGTA-T-TACATTTGAAATAATCGTAAT----T-TACA------TAACATGTA---------------------------------TGCTATCCATTAA------------------------CTTGT-TGT-CATGTA-C------A--------------------TGGGTCTAAGACCTTCTG-GAAATATG--A-AA---ATAAAAAC-GGTAAAACTTGTAaaacttgta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                 TTATATGTGTTTATTTGTATACATGTGAGTCTATC-----------------AAACTG---AAGTATTCAAACTGAACAC-------CTTCGT-----GCAAGGTT--AAAC-GA--TCT-AAAA-A-TAC--A----TAAATATCAACTACTATTGTTATTTGTGTGCTTATAAGGATGTACATGCATGTATAAAGTTTATGCGTGTTATGTT-T-TACATTAGAAACAGTCGTAAC----T-TACT------TAACATGTATG-----G----------------------------TGTCCATTAATT--TATAAG-GTACTGATTTATGCTTaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTATGTGAAAGATATGTAAT-CAGATTGAAAATAATCGTAAA----T-TGCA------TATCATGTATG-T-A-----------------------------CTATCCATTGATTTATATAAA-ATATCAATTTCTGCGTGT-CGT-CATATA-T------ATGC-ACA--ATGT-CC-TC--------ATGACCTTTTG---AATATG---------ATAAAATGTATT-----TTATATATAT


blockSeqs                     :                          T  A G      A     T              ATGTTTTAT        T          A   A       ACTAATCCTCGGTCAAGT           A  .    A               T   A            TAT    TGATAATAAT                TC                                        A    CT   T         CT                       ATTTATT   T  TTTATG       TA    A  AT   A    T A   AT TATT                                     T                            G         T A                     ATAT G    ATATAA C         TAGGTACATATATGTATGTTTGC                 T   TTTA      C   T              A   A      A TACCATATTTGAACATGTACTTATG      TC            C        GAA   AAG      AA  T T
blockSeqs                     :                          A  T G      T     A              T                C          .   G       AAACA                        G  .    .               T   A            .      CACTAATAT                 TG                                        A    T    A         .                        .         T  A            .     .  .    .    . .   .  .                                        G                            G         T .                     .    .    .      A         TGTAATATGTAAAATGTCCC                    T   TT        .   C              .   .      . ATGTAAAATATGTCCTCTTG           TC            .        AC    .        GT  T C
blockSeqs                     :                          .  A A      T     C              T                T          .   A       CTCCA                        G  .    .               A   T            .      AA                        TC                                        G    T    A         .                        .         T  A            .     .  .    .    . .   .  .                                        G                            G         A .                     .    .    .      A         TGAATGATATGTATTTA                       T   TT        .   C              .   .      . ATGTAAACTGCATTTATG             AC            .        AA    .        CT  G A
blockSeqs                     :                          .  . .      .     A              T                .          .   .       CTTCT                        G  .    .               A   T            .      TA                        .                                         G    G    G         .                        .         T  G            .     .  .    .    . .   .  .                                        A                            G         . .                     .    .    .      C         CTATGTATATATGATA                        T   TT        .   C              .   .      . ATGTAAAATGTCCCTATA             TC            .        G     .        CG  T .
blockSeqs                     :                                                                                                                                .  .    .                                                                                                           G    C    T         .                        .         C  G            .     .  .    .    . .   .  .                                        G                            A         . .                     .    .    .      A         TTATTTG                                 T   TT        .   C              .   .      . ATCTAAAATATGTTT                TC            .        A     .        AC  . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                    G    T    T         .                        .         T  G            .     .  .    .    . .   .  .                                        G                            T         . .                     .    .    .      C         TGC                                     T   T         .   T              .   .      . ATGCACAATGTCCTC                T             .        A     .        TG     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                    .    .    T         .                        .         C  A            .     .  .    .    . .   .  .                                        G                            T         . .                     .    .    .      A         TGC                                     .   .         .   .              .   .      . ATG                            .             .        .     .               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                    .    .    .         .                        .         T  G            .     .  .    .    . .   .  .                                        G                            G         . .                     .    .    .      A         TAC                                     .   .         .   .              .   .      . .                              .             .                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .         C  .            .     .  .    .    . .   .  .                                        .                            A         . .                     .    .    .      A         G                                                                                                                                                                 
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originalCons                  : TCGTCAAGATCATTCTTCTTCTTTT-GGACGAATATGTTTATTAAAATATACAATATA--------T-------ATTAAACTAAAA-TATAAAAGTTT------CNTCN-------TTATTAACCTTGTT---TT-CGTTTTCGTACAAGGNTAATCGAATCGGTAAT---AATA---TAATA----TATATATATACATTTCAGTGATTATATGTGTTTATTTGTATACATGTGTGTCTATCGTCTG-TTTTNGCATGTAAA--GGATAAGTATTCAAACTGAACAC-------CTTCGC-----GCAAGGTT--AAAC-GA--TTT-AAAA-A-TAC--A----TATATATCAACTACAATTGTTATTTATGTGCGTATATGGATGTATATGTATGTATAAAGTATATGAGTGATATGTA-T-TACATTTGAAACAATCGTAAA----T-CACT------TAACATGTATG-T-A-GTA-----ATAT-----ATG-----TTGCTATCCATTAATT--TATAAT-GTACTGATTTATGCTTGC-CGT-CATGTA-T------ATGT-AAA-TATGT-CC-TC-TGGGTCTAAGACCTTCTG-GAAATATG--A-AA---ATAAAANNTGTTCAAACTTGTATATAT
finalCons                     : TCGTCAAGATCATTCTTCTTCTTTT-GGACGAATATGTTTATTAAAATATACAATATAT---------------ATTAAACTAAAA-TATAAAAGTTT------CNTCN-------TTATTAACCTTGTT---TT-CGTTTTCGTACAAGGNTAATCGAATCGGTAAT---AATATGAA---------ATATATATACATTTCAGTGATTATATGTGTTTATTTGTATACATGTGTGTCTATCGTCTG-TTTTNGCATGTAAA--GGATAAGTATTCAAACTGAACAC-------CTTCGC-----GCAAGGTT--AAAC-GA--TTT-AAAA-A-TAC--A----TATATATCAACTACAATTGTTATTTATGTGCGTATATGGATGTATATGTATGTATAAAGTATATGAGTGATATGTA-T-TACATTTGAAACAATCGTAAA----T-CACT------TAACATGTATGTGC-------------------------------TATCCATTAATT--TATAAT-GTACTGATTTATGCTTGC-CGT-CATGTA-TATGTAAAATGTNCTTTG------------GGTCTAAGACCTTCTG-GAAATATG--A-AA---ATAAAANNTGTTCAAACTTGTATATAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TTATACATTTTCGAATCTAACTCAAAGCAAATTATCCTATTTCATTTGTGGTTATCT






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Reference ( family-7383 )     :                                                       TCGTCAAGATCATTCTTCTTCTTTT-GGACGAATATGTTTATTAAAATATACAATATA--------T-------ATTAAACTAAAA-TATAAAAGTTT------CNTCN-------TTATTAACCTTGTT---TT-CGTTTTCGTACAAGGNTAATCGAATCGGTAAT---AATA---TGA-A-----ATATATATACATTTCAGTGATTATATGTGTTTATTTGTATACATGTGTGTCTATCGTCTG-TTTTNGCATGTAAA--GGATAAGTATTCAAACTGAACAC-------CTTCGC-----GCAAGGTT--AAAC-GA--TTT-AAAA-A-TAC--A----TATATATCAACTACAATTGTTATTTATGTGCGTATATGGATGTATATGTATGTATAAAGTATATGAGTGATATGTA-TTACATTTGAAACAATCGTAAA----TCACT------TAACATGTATG--------------------TGCTATCCAT---TAAT-------T--TATAATGTACTGATTTATGCTTGCCGTCATGTAT------ATGTAAA--ATGTNCT-T-TGGGTCTAAGACCTTCTG-GAAATATG--A-AA---ATAAAANNTGTTCAAACTTGTATATAT
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gi|2                          :                                                       TCGTCAAGATCATTCTTCTACTTTTTGGTCGAATATGTTTATTAAAA-ATATAATATAATGTTTTAT-------ATTAACCTAAAAATATAAAATTTT------AAACA-------TTATTAACCTTGTT---TT-CGTTATCTTACAAGATTAAACGAATCGGTAAT---AATA---T-------------ATATACATTTGAGTGATTATATGTCTTTATTTTTATATATGTGTGTC--------------AGCATGTAAA--GGATAAGTATTCAAACTGAACAC-------TTTTGT-----GCAAGGTT--GAAC-GT--TTT-AAAA-A-TAC--ATATTTATATATCAACTACAATTGTTATTTATGTGCGTATATGGATGTATATGTATGTAT-AAGTAAATGAGTGATATGTA-TCACATCTGAAACAATCGTAAA----GCACT------TAACATGTA----------------------TGCTATCCAT---TAAT-------T--TGTAATGTACTGATTTATGCTTGCCGTCATGTAT------ATCTAAA--ATATGTT-T------------CCTTCTG-GAAATATGGAA-AA---ATAAAAGTTttactcaaactt
gi|3                          :                                                       TCGTCAAGATCATTCTTCTTCTTTCAGGACAAATATGTTTATTCAAATATACAATATA--------T-------ACTAAACTAAAA-TACGAAAGTTT------CTCCA-------TTGTTAACCATGTT---TT-TGTTTTCGTACAAAAATAATCGAATCGGTAAT---AATA---TGATAATAATATATATATACATTTCAGTGATTGTAAGTGTTGATATGTATACATGTGTGTCTGTTATCTG-TTTTAGCATGTAAT--GGATAAGTATTCAAACTGAAAAC-------CTTTGT-----GTTAAGAT--AAAC-AA--TTTAAAAA-A-TGC--A----TATATACCCACTACAATTGTTATTTATGTGCATATAT--ATATGTATGTATGTGTAAAGTATATGAGCGATATGTA-TTACATTTGAAACAATCGTAAA----TCACT------TCACATGTATGTAGGTACATATATGTATGTTTGCTATCCAT---TTAT-------T--TATAATGTACTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttTGTATACATGTGTGCCTAGCGTTTA-GTTTGGCATGTAAA--AGAAAAGTA-----ACTGAACACATTTATTCTCCGTTTTATGCAGGGTT--AAACAGT--TTT-AAAA-A-AAC--A----TACATATAAACTACACTTGTTATTTATGTATGTATATAAATGTTGATGTATGTAT-ATGTTTATGAGTAATATGTGTTTATATTTAAAACAATCGTAAAATATTTATTATATAATAACATGTA----------------------TGCTATGTATATATGATATAACCAT--TATAATATACTGATGTATGCTTGCCGTCATGTAT------ATGTAAAATATGTCCTCT-TGGGTCTAAGACCTTAT--GAAATGTA--A-AAAAGATAAAACTTG-TCAAAtt
gi|5                          :                                                       TCGTCAAGATCATTCTTCTTCTTTT-T------TAT---TATTAAAATATACAATATA--------T-------ATTAAACTAAAA-TATAAAAGTTT------CTTCT-------TTATTAACCTTGTT---TT-CGTTTTCGTGCAAGGAAATTCGAATCGGTAATTATAATACACTAA-T-----ATATATATATATATTAGTGATTTTATGTGTTTATTTGTACACATGTGTGTCTATCGGCTGCTTTTTGCATGTAAA--GGATAAGTATACCAACTGAACAC-------CTTTGC-----GCAAGGAT--TAAC-AA--TTT-AAAA-A-TCC--A----TATATACCAACTACAATTGTTATTTATGTGCATATATGGATGTATATGTATGTATAAAGT---------ATATGTA-GTACATTTGAGACAATCGTAAA----TCACT------TCTCATGTATG--------------------Taatctgagtttaacaaacaataaatcaatgatttcactttatct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTATTGTTTG-CTTTTGCTTGTAAA--AGAAAAGTATTCAAACT--------------TTCTC------C---GTTTAAAAC-AAATTTT-GAAATA-TAC--C----TATATATAAACCATAATTGTTATTTATATGCATTTATGGATGTATATGCATGTATAATGTATATGAATGATATGTATTTATATCTAAAACAATCGTAAA----TTACT------T-GTATGTATA--------------------TGatgta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tactatctgtttactataagtgccttttattttgttaatttgagaacggttgttattcatattattaAT------ATGTAAA--ATGTCCC-TATAGGT-TAAGACCTTCTG-GAAATATGA-A-AA---ATAAAACGTGTT--AACTTGTAtaatatgtaaaatgtccctataggttaagaccttctggaaatatgaaaaataaaacgtgttaacttgtaaaacttgta
gi|7                          : tactatctgtttactataagtgccttttattttgttaatttgagaacggttgttattcatattattatattgtttgcttttgcttgtaaaagaaaagtattcaaactttctccgtttaaaacaaattttgaaatatacctatatataaaccataattgttatttatatgcatttatggatgtatatgcatgtataatgtatatgaatgatatgtatttatatctaaaacaatcgtaaattacttgtatgtatatgtaAGTGATTATAAGTGTTTATTTGTATACATGTGCTTATATCGTCTG-TTTTTGCATGTAAA--AGATAAGTATTCAAACTGAACAC-------TTTTGT-----ACAAGGTT--AAAC-GA--TTC-AAAA-A-TAC--A----TATATATCAACTACAGTTGTTATTTATGTGCGTATATGGATTAAGGTGTATGTATAAAGCATATGATTGATATGTA-TTACATTTGAAATAATCGTAAT----TTACA------TAACATGTA----------------------TGCTATCCAT---TAA------------------------------CTTGTTGTCATGTAC------A------------------TGGGTCTAAGACCTTCTG-GAAATATG--A-AA---ATAAAAAC-GGTAAAACTTGTAaaacttgta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                       TTATATGTGTTTATTTGTATACATGTGAGTCTATC-----------------AAACTG---AAGTATTCAAACTGAACAC-------CTTCGT-----GCAAGGTT--AAAC-GA--TCT-AAAA-A-TAC--A----TAAATATCAACTACTATTGTTATTTGTGTGCTTATAAGGATGTACATGCATGTATAAAGTTTATGCGTGTTATGTT-TTACATTAGAAACAGTCGTAAC----TTACT------TAACATGTATG---------------------G-TGTCCAT---TAAT-------T--TATAAGGTACTGATTTATGCTTaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTATGTGAAAGATATGTAATCAGATTGAAAATAATCGTAAA----TTGCA------TATCATGTATG--------------------TACTATCCAT---TGAT-------TTATATAAAATATCAATTTCTGCGTGTCGTCATATAT------ATGCACA--ATGTCCT---------CATGACCTTTTG---AATATG---------ATAAAATGTATT-----TTATATATAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TTATACATTTTCGAATCTAACTCAAAGCAAATTATCCTATTTCATTTGTGGTTATCT