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Reference ( gi|1 )            :                                         ATTGAGGC-TCTCTTAAAATAAGTTTATCGTATCACA-A-AGAACGTCATATTACATAAAATAATA--AAATGTTTTAATGATAAATGTATAAAATATAATTATGTTTGTAATACAA---------TGAAAACATACTGAAAAACAACAAATAC--ACAAACTAAAAAAGCA---------A-------T-AC----------------CAATAAACGCTAATTG-ATATTTTCG-TAAACGACATTT---TATTTAAAC----G--CTATTTTCGCATTTT-ACTTAATTCGGGAATTTG--TTTGTGAATACGATTAAA--G-------------TAA------------TTTCAAGTAGAACAGC----ATTCCATATTTTTGTTC-TAGAATAGGTCACACTC---------CCTT-TAAATATTTCATTGCTAGTGTTTGA-TATTA---TAAAGG-----GTT--------------------TTAATGTGTGTTGCTCATCATTAGTTCTCATT----------CG------TTTAT----ATTTGTCG-GTGA--AT----TTC-AT-CA--TGTATAATGTACACAGTTTGAAC--GTTTT-------------A-ATAAATTAACA---G-T-TTGTTCAAAAGGCAGCACA-TAA-GTGGGAA----ACGTGCAT----TTTCTAGGCTGTCAGTAGTGTA-TTGACTATTTT----------TGTA------TAA--T---T---T-----GCT----C--------TTCTATGCAAGTTTATA-ATTTTACATGTATTAA-ATATAGATGAATGACCTC-ATATAGTACAGCAGTA-ATTTAGCTGAGGTAAT------ATGCATGC-ATTATAAAACTATAAACAGTGTTTAATTGA-TAAATATGACCGTATCCTA----GA-TAAACG----TCACAAAC-----AAG------------ACGGTATA-AT-TTATATA--T---ATACAGAAAATGTGCATCCCATTGCATGTT------------TGT-ACCGACTATGTTATCACCTGCTGT--T----ATAGCTA-AATAT-----ATAGGTGAATT----ATTACT----GATG-TGTATACGCTTTT-AC-----GCTG------TGA------------CCTTTGATTTGTCACTGTTTAT------AACATTCCATTCTCTCTACACCA-GTTTAAAAGATAATTTAGCGAACATTGTAAATTTAGTTCA-CGATCTGCCTTATCTAATTGAAAATCAT
gi|16                         :                                           TGAGGC-CCTCTTAAAACAAATACATCATATTACATACAGAATGTCATATAACATAAAA----------TGTTCTCATGATACATTTACAAAATATA--TA----TGTATTACAA---------CAAAACCAAATAGAAAAACAAC
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gi|3                          :                                                                             a-A-AGTACGTCACATTACA--AAGTAATA--TAATGTTTTCATGATAGATATACAAAA-A-AGTTATGTAT----TACAA---------CAAAAACAAATTTAG---CAAAAAATGTTTACAAAC---------A---------A-------T--C----------------CAATTAAC--TAA--A-ATAATAGCAATAAACG------------TTAGCC----G--TTATATTC--ATTAA-AGAAAA---GGCAATTTA--TTT----------TT-------------------TAA------------TTTCAAGTAAAATTGC----GTTTCATGTTTATGTTC-TAGAATAAAAGAAACTT---------CTCT-TAAACATTCCATTATTAA-GTTTGG-TATCA----AAATGTTCCTGTTAGACATTGACCGTACTTCAGTTGATGCATCGTGCTCGTCATATGTTATAATT----------TGCAACAATTTATGTAAATATGCCG-GTGA--AA----TTCTTT-TT--TGTATATTAT------CTTGA----GTCTT-------------AGATAAA-AAACATTTA-T-TTTTTCAAAAGACAGCA----AA-GTACGAGATATACTTGCGT----TTTCT----------TA----A-TTAACAA---T----------TATA------CAA----------------GCT--------------------------TGTA-ATTGTTTATGTATGAA-CTATTGAAGAGTGACCCC-ATATAGTAGAGCAGTA-A-TTAAATGAGGAAAt
gi|8                          : agtaagtaagtagaaagtaagtaaattctttatttatggatgaggattgcattgaaaacgccagtcttctttgatgccaccataaaacATAT--CATAAAACA-TA--AAATGTTTTCATGATAAATTTATAAAATA--ATTATGTATGTAAACCAA---------CAAACACAAATTGAAAAACAACAAAGAA--ACAAACTAAAAGAATATATATATATA-------T-ACATATATACATATTTAGCAATAAACACTAG-TG-TTATTTTTA-TTAATGACAATTAAATATTTAAAT----T--CTACTTTCATATTTTAACCT-ATTTAGAAATTTA--TTTGTGAATA--ACTACATTT-------------TAAC-----------TTTCAAGTGGAATAGC----GTTCCATATTTT
gi|13                         :                                                                             atattatgaagtATATCATATAACATAA-----AATGTTTTCATAATAAATTTACAAAATAT--TTA----TACAAAACAA---------CAACAATAAATTAATAAA-AACAA------ACAAAC---AAAAGTA---------AATATATGT-AC----------------CTATACACACTAGTTGTTTTTTTTCA-TTAACAAC--TT---TGTTT
gi|2                          :                                                                                     acaaaatTTACATAATCTAACATCAAATGTTTTA-TGATAAGTATACAAAATAT------GTATGTAATTTAA---------CACAAACAAATTGATAAGCAATAAAC-----TAAATTGAAA----------------------T-AC----------------CAATACACGTTAGATG-TTGTTTTCA-TTAATTGCAATA---GATTCTAAT----T--CGACTTTCGCATTTC-ACCCAATTGAGGATTTTTATTTTG-GACTTTGTTTGAA--G--------------AA------------TC--------AACAGTTTTAACTTCA-ATCTTCCTTT-TAGCATA--TCGTAATTAAGTTGAGGTATTATAAATTTTCCGTT--TAACATTTCCCTCTTA---T----------GTT--------------------TTGATGTGGCTTGCTCGTTATTTGTTTTCATT----------TGAAACAATTCGTTAGAATATACCG-GGTC--AT----TCT-ATTCA--C---TAATTTGTACGTTTCAAAT--GTTTTTTTTCTTTTTGTTA-AGAAAT--------------GTTTAAAATACAGCATA-TTATGAGAGAC----ACGTGAGT----TCTCGA------CACTAACACA-CTGATTATTTT----------TGTA------TAA--T---TG--T-----GCT------------------TGTAAATT----------------ATTAA-CTATAAAAGAAT-ATCTCGATATAGCATTGTGGTATATTT-GATGAGGTAAT------GTGTATGC-ATTATACAATAATAAACTGTGTT-GATTGA-TAAGTATGACCATATCCAA----GA-TAAAAA----ACACAAAC-----GAG------------ACGATATATGT-TCATATG--T---ATACTGCAAATGTGTATTCTATTGCATGTTGTCGTAAATATATGT-ACCTAATATACTATCAACTGCTGC--TAAGGACGGCTC-AATGTTGTGCATAAGTGAATA----ATTATT----CATGCTG-ATACGCTTCTGACTTGTAGTTGATAACATGG------------CATTTGCTTTGTCGGTGTTTATATTGAAAGCATTCCATTTTCTTTACCAGA-GTTTAAAAGATAATTTAGTGAACACTGTTAACTT-GCTCATTGATTTGCTTTAT-TGTTTGAATATCATttgtttgacattta
gi|9                          :                                                                                                                     agATGATAAATATACAA----TAAATATGTATGAAGTACAA---------CAGAAACCAACTGAAAAACAATATACAA--ACAAACTTAAAAAATA---------T-------TTAC----------------CGATAAACGTTAGATG-TTATTTTCA-TTAATGCTGATT---TATTTAAAT----T--CTACTGTAACACTTT-ACCCATTTCAGGAATTTA--TGTGTGCATATGTTTAAA--G-------------AAA------------Ta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                               -------T-AC----------------CAATTAACGCTAGTTG-TTATTTCAG-TAT-TGACTATT---TACTTAAAT----T--CTGCTTTCGCATTTT-ACCAAATT-AAGCATTGA--TTTGTGAATATGTTTAAA--G-------------CAACGGCATTTTCAGTTTCAAGTGGAATAGC----GTTCCATATTTTTGTTCATA-AAT---TTAAACTC---------CCCA-GAAATAggcattgttaaattggaatgaaatgtacagtgcatgtgctctaatatgtgacatttattgcaacatatcaatactcgtgtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                            tATTT---TCTTTGAATTATTGATCTACTTTCGTATTTT-ACTCAATTTAAGAATTTA--TTTGTGACTAGGTTTAAA--AAAACCGTCGTTTTTAA------------TTTCAAGTGGAATGGC----GTATCATGCTTTCTTTC-CAGAATATGGCA----------------------A-ATTTCATCATGAATGTTTGT-CATTGACCTCAAGC-----GTA--------------------TTAATGTATAGTGCTCGCCATTTGTGCTTATT----------TGA-----ACCA-----ATTCGTTG-G-GAACAT----TCC-AT-TGACTATTTTATGTAT-TATTTT--AC--CTTTT-------------AGATAAA-AAATA---A-T-TTGCTCCAAAGACAGCATATTAA-GAGAGAGAC--ACGTGCGT----TTTCTGG------AATAACATA-TTG-CTATTTT----------TGTA------TAgggataatatttaaaattttgaaaaggcctaatatattccctttaaacattttataattagcttgtggtactataaagtttctgtttgacgctgacttcaagtgtattgatgtgtttttgcttgtcatttgttatcatttgaaacaattcgtttaaataacccggagacatgcaattaactattgttgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 t--CTATTTTCACAAATT-AACTCATTCAGGAATTTA--TTTATACATAAGTTTAAA--GCATTTT-------TAA------------TTTCAACTGGAAATTC----GTTCGATACTTTTGTTC-CATAATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tATGTATCTTGCTCATCATTTGTTCTCATTTAAAAAAAAATG------TTTAA----ATATGCCGTGCGC--ATTCAATTG-AT-CA--TGTtggagattcgtgcgtattgaagacaaacatattaata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctatcgTATACATACTTT-AGC--TTTTC-------------A-ATAAA--AATA---GAT-TTATTCAAAAGACA--ACA-TAA--TAAGAA----AGATGCACGCTCTTTCGAG------ATTAACGTA-TT---TATCTT----------CCTA------CAACCT---TACAT-----ACT----C--------GCATGTGCAATTTTGTA-ATTCTATATGTATTAACAT-TAGACACATGTCCCC-AAGTAGCACAACAGTA-ATTGAGAAAAGGTATT------ATGTGTAC-ATTATGAAATAATAAACTGTGCGCAAGTGA-TAtg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcCATTTTGTACATGTTTT-------------A--CAAGTTAA-A---G-TGTCGCTGAAAGTACAGCAAACTGA-GTGAGAT----GTGTGCAC----ATTTGATACTATAATAAGTATAATTGG-TATTTTGCATTGGTATTGTAGACCTATAG--TATAT---T-----GATTATAC--------TTCTCTGTAA--TTATGTATGTTATACGTAATAACATA-AGAGAAACTCCCTT-A-ATAGCACAAGAGTT-ATTTAGACGATGCAAT------TAACATGC-ATTATTGAATAATAAAGGATGCTCAGGCGA-TGCACATGACCGTACCATACTGTGAGTGAAAGCAACTGACAAACTAACAAAGGTTGAATAACTTACGTTATA-TT-TTAGATAAGT---ATGTCGAATATGTGTATTCTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acTA-TTGG-TATTTT----------TGTA------TAA--T---T---TTACATGCT----CATCATTGTTTCTTTG------TGTA-ATTTTACATGCGTTAT-ATGTAGGAGAATGGCCCC-ATATAGAACAATAGTA-ATTTATATTAGATAATGTGTACATGTATGC-ATTATGAAACAATAAAC--T------TTGA-TAAACATGGCCGTACCCTA----GA-TAATAG----ACACAAAG-----AAC------------ACTATATA-TTCTTACATA--TAAAATACTGGAAATGTGTATTCCATTGCATG-T------------TGTAATCGA-TAT-TTA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ------ATGCATGTTGTTATAAAATGATAAACTTTGTAAAAGTAAATAGATAGAACCATATCCTA----AA-TAAAAG----CCAACATC-----AAA------------ACCACATG-CT-TTAT
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-728 )      :                                                 NNTGAGGCCCCTNTTAAAACAAATACATCATATTACA-A-AGAACGTCATATNACATAA---AATAATA-AA-TGTTTTCATGATAAATNTACAAAATATA-TTATGTATGTAATACAACAAAAACAAATT----GAAAAACA---A--CAAAC-A-A-CAAACT-AA--AA-A-A-TA-----------------AT--AC--------CAATAAACGCTAGTTG-TTATTTTCATTAACGA-----CGATT---TATTTAAATTCTACTTTCGCATTTTACCCAATTCAGGAATTT-ATTTGTGAA----TATGTTTAAAG-------------TAA------------T-------TTCAA--GTGGAATNGCGTTCCATATTTTCGTTC-TAGAATA--GN-C-A--AACTT----CN-CT-TAAATATTCCGTTATTAACGTTTGN-TATTATAA-------G--TT--------------------TTGATGTATCNT-GCTCGTCATTTGTTCTCATTTGAAACAA----TTCA--T--G--AATATGCCG-GCGNATTCCATCG--TGT-TAATATATA-CATTTTGAAC--GTTTTA---------GATAAATAAATA---G-T-TTGTTCAAAAGACAGCATA-TAAGT--GAGANA-ACGTGCGTTTTCGAG------ATTAACATA-------TTGGCTATTTT----------TGTA------TAA--T---T---T-----GCT----CTTC-T-TGTAA-TT-----T-GTAATTTTATATGTATTAA-ATATAGAAGAATGNCCCCATATAGCACAGCAGTA-ATTTAGATGAGGTAAT------ATGCATGC-ATTATANAATAATAAACTGTGTTCGATTGA-TAAATATGACCGTATCCTA----GA-TAAAAG--NC--ACAANC-----AAG------------ACGATATA-NT-T-TATA-TA--T---ATACTGNAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTCGTAAATAT---ATGTA-ACCNAATATACT-ATCAACTGCN------------GCAGTAAGGACGGCTNTAATGTTGTGCATAGGTNAATAGAAAATTACTTTAANATGCTGTATACGCNTCTGGCTTGTAGTTGATAACATNGGTATTAACTTGTCGTTTGNTTTGCCGGTGTTTATNTTGAAANCATTCCNTTCTCTTNGCNAGATGTTTAAAANATANTTCAGNGAACACCGTNNGCTTTGCTCATTGATTTGCTTTAT-TGTTTGAATATCAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atAAC-TA-------TTGG-TATTTT----------TGTA------TAA--T---T---TTACATGCT----CATCAT-TGT---TTCTTTGT-GTAATTTTACATGCGTTAT-ATGTAGGAGAATGGCCCCATATAGAACAATAGTA-ATTTATATTAGATAATGTGTACATGTATGC-ATTATGAAACAATAAACT--------TTGA-TAAACATGGCCGTACCCTA----GA-TAATAG--AC--ACAAAG-----AAC------------ACTATATA-TTCT-TACA-TA--TAAAATACTGGAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTAATCGATAT---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTATACA-TACTTT-AGC--TTTTCA----------ATAAA--AATA---GAT-TTATTCAAAAGACAACATAATAAGA--AAGATG--CACGCTCTTTCGAG------ATTAACGTA-------TT---TATCTT----------CCTA------CAACCT---TACAT-----ACT----CGCA-TGTGCAA-TT-----TTGTAATTCTATATGTATTAACAT-TAGACACATGTCCCCAAGTAGCACAACAGTA-ATTGAGAAAAGGTATT------ATGTGTAC-ATTATGAAATAATAAACTGTGCGCAAGTGA-TAtta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tc-TT-----T-GTATTTTTACATGTATTAA--CATAAACTAATTA----ATATGGTACAGCAGTA-ATTTAGATGAGATAAT------ATGCATGC-AATATATAGTAATAAACTATGTTTAATTGA-TAAATACGACC-TATCCTA----GA-CAAAAG--CC--ATAATC-----AAG------------ACGATATA-TT-TGTATA-TG--C---ATACTGTAAATGTTTATTACATTGTA
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gi|14                         :                                                    GAGGCCTTTATTAAAA--------TCATATTACA-A-A-ATTTTCATATAACATGA---AATAAT------GTTTTCATGATAAATTTTCAAAATAT-----T-TATGTAATACAACAAAATCG--TT----GAAAA---------CGAACTA-A-AAGACT-AT--AT-ATA-TAT----------------ATTTAC--------CAATAAAAGCTAGTTG-TTATTTTCATTttgtttgacattta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTCTATTTTCACAAATTAACTCATTCAGGAATTT-ATTTATACA----TAAGTTTAAAGCATTTT-------TAA------------T-------TTCAA--CTGGAAATTCGTTCGATACTTTTGTTC-CATAATA--
gi|16                         :                                                   TGAGGCCC-TCTTAAAACAAATACATCATATTACATACAGAATGTCATATAACATAA---AAT---------GTTCTCATGATACATTTACAAAATATA-T-ATGTAT----TACAACAAAACCAAATA----GAAAAACA---ACGCAAAC-A-tggagattcgtgcgtattgaagacaaacatattaata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cta--------------------TCGATGTATCTT-GCTCATCATTTGTTCTCATTTAAAAAAAAATGTT----T--A--AATATGCCGTGCGCATTCAATTG--ttac
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tctaTGTGTTCGATTGG-AAAATATGGCCATATTCTG----GA-TAAAAA--AC--ACACGC-----AAG------------ACGATATC-TT-T-CATA-TA--C---Aatcatgttg
gi|2                          :                                                                                                 tgtTTACATAATCTAACATCA-AA-TGTTTT-ATGATAAGTATACAAAATAT------GTATGTAATTTAACACAAACAAATT----GATAAGCA---A--TAAAC-----TAAATT-GA--AA-------------------------T--AC--------CAATACACGTTAGATG-TTGTTTTCATTAATTG-----CAATA---GATTCTAATTCGACTTTCGCATTTCACCCAATTGAGGATTTTTATTTTGGAC----TTTGTTTGAAG--------------AA------------T---------CAACAGT----TTTAACTTCA-ATCTTCCTTT-TAGCATATCGT-A-ATTAAGTTGAGGTA-TTATAAATTTTCCGTT--TAACATTTCCCTCTTAT---------G--TT--------------------TTGATGTGGCTT-GCTCGTTATTTGTTTTCATTTGAAACAA----TTCG--TTAG--AATATACCG-GGTCATTCTATT---CAC-TAATTTGTA-CGTTTCAAAT--GTTTTTTTTCTTTTTGTTAAG-AAAT----------GTTTAAAATACAGCATA-TTA-T--GAGAGACACGTGAGTTCTCGAC------ACTAACACA-------CTGATTATTTT----------TGTA------TAA--T---TG--T-----G---------C-T-TGTA-------------AAT--------TATTAA-CTATAAAAGAATATCTCGATATAGCATTGTGGTATATTT-GATGAGGTAAT------GTGTATGC-ATTATACAATAATAAACTGTGTT-GATTGA-TAAGTATGACCATATCCAA----GA-TAAAAA--AC--ACAAAC-----GAG------------ACGATATATGT-T-CATA-TG--T---ATACTGCAAATGTGTATTCTATTGCATGTTGTCGTAAATAT---ATGT--ACCTAATATACT-ATCAACTGCT------------GC--TAAGGACGGCTC-AATGTTGTGCATAAGTGAAT----AATTATT----CATGCTG-ATACGCTTCTGACTTGTAGTTGATAACATGG------------CATTTGCTTTGTCGGTGTTTATATTGAAAGCATTCCATTTTCTTTACCAGA-GTTTAAAAGATAATTTAGTGAACACTGTTAAC-TTGCTCATTGATTTGCTTTAT-TGTTTGAATATCAT
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Reference ( family-728 )      :                        NNTGAGGCCCCTNTTAAAACAAGTACGTCATATTACA-A-AGAATGTCATATAACATAAAATAATAAA-TGTTTTCATGATAAATNTACAAAATATA-TTATGTATGTAATACAACAAAAACAAATT----GAAAAACA---A--CAAAC-A-A-CAAACT-AA--AAA-A-----------------TATAT--AC--------CAATAAACGCTAGTTG-TTATTTTCATTAACGA-----CGATT---TATTTAAATTCTACTTTCGCATTTTACCCAATTCAGGAATTT-ATTTGTGAA----TACGTTTAAAG-------------TAA------------T-------TTCAA--GTGGAATNGCGTTCCATATTTTCGTTC-TAGAATA--GNN-A--A-ACTT----CN-CT-TAAATATTCCGTTATTAACGTTTGN-TATTATAA--G-GTT--------------------------TTGATGTGTCTT-GCTCGTCATTTGTTCTCATTTGAAACAA----TT--CG--T--GAATATGCCG-GCGCATTCCATCG--TAT-TA-ATATATACATTTTGAAC--GTTTTA---------GA---TAAAA-AATA---G-T-TTGTTCAAAAGACAGCATA-T-AAGT--GAGATACACGTGCGTTT--T-CGAG------ANTAA---------------CGTATTGG-T-ATTTT-----T---GTATA---A--TT---T-----GC-TC-T-C-T-TGT--AA-TT-----T-GTAATTTTACATGTATTAA-ATATAGANGAATGNCCCCATATAGCACAGCAGTA-ATTTAGATGAGGTAAT------ATGCATGC-ATTATAAAATAATAAACTGTGTTCAATTGA-TAAATATGACCGTATCCTA----GA-TAAAAG--AC--ACAAAC-----AAG------------ACGATATAT-T-T-TATA-T--GC---ATACTGNAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTCGTAAATAT-----ATGTACCTAATATGCT-ATCAACTGCTGCGTA--GA-------CGG-------CTA-AATAT-----ATAGGTGAATA----ATTACTN----ATG-TGTATACGCTTCTG--C-------TGT------TAACGC-GTG-CGTTTGNTTTGTCGGTGTTTAT------ANCATTCCATTCTCTTTACAANA-GTTTAAAAGATAATTTAGCGAACACCGTAAATTTTGTTCA-CGATTTGCCTTATCTGNTTGAANATCAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atAA---------------C-TATTGG-T-ATTTT-----T---GTATA---A--TT---TTACATGC-TCAT-CAT-TGT-----TTCTTTGT-GTAATTTTACATGCGTTAT-ATGTAGGAGAATGGCCCCATATAGAACAATAGTA-ATTTATATTAGATAATGTGTACATGTATGC-ATTATGAAACAATAAACT--------TTGA-TAAACATGGCCGTACCCTA----GA-TAATAG--AC--ACAAAG-----AAC------------ACTATATAT-TCT-TACA-T--ATAAAATACTGGAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTAATCGATAT-----
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tc-TT-----T-GTATTTTTACATGTATTAA--CATAAACTAATTA----ATATGGTACAGCAGTA-ATTTAGATGAGATAAT------ATGCATGC-AATATATAGTAATAAACTATGTTTAATTGA-TAAATACGACC-TATCCTA----GA-CAAAAG--CC--ATAATC-----AAG------------ACGATATAT-T-TGTATA-T--GC---ATACTGTAAATGTTTATTACATTGTA
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gi|14                         :                           GAGGCCTTTATTAAAA--------TCATATTACA-A-A-ATTTTCATATAACATGAAATAAT-----GTTTTCATGATAAATTTTCAAAATAT-----T-TATGTAATACAACAAAATCG--TT----GAAAA---------CGAACTA-A-AAGACT-AT--ATATA-----------------TATATTTAC--------CAATAAAAGCTAGTTG-TTATTTTCATTttgtttgacattta
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gi|16                         :                          TGAGGCCC-TCTTAAAACAAATACATCATATTACATACAGAATGTCATATAACATAAAAT--------GTTCTCATGATACATTTACAAAATATA-T-ATGTAT----TACAACAAAACCAAATA----GAAAAACA---ACGCAAAC-A-tggagattcgtgcgtattgaagacaaacatattaata
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gi|2                          :                                                                  tgtGTTACATAATCTAACAT--CAAA-TGTTTT-ATGATAAGTATACAAAATAT------GTATGTAATTTAACACAAACAAATT----GATAAGCA---A--TAAAC-----TAAATT-GA--AA------------------------T--AC--------CAATACACGTTAGATG-TTGTTTTCATTAATTG-----CAATA---GATTCTAATTCGACTTTCGCATTTCACCCAATTGAGGATTTTTATTTTGGAC----TTTGTTTGAAG--------------AA------------T---------CAACAGT----TTTAACTTCA-ATCTTCCTTT-TAGCATATCGTA-ATTA-AGTTGAGGTA-TTATAAATTTTCCGTT--TAACATTTCCCTCTTAT------GTT--------------------------TTGATGTGGCTT-GCTCGTTATTTGTTTTCATTTGAAACAA----TT--CG--TTAGAATATACCG-GGTCATTCTATT---CAC-TA-ATTTGTACGTTTCAAAT--GTTTTTTTTCTTTTTGT---TAAGA-AAT----------GTTTAAAATACAGCATA-T-TA-T--GAGAGACACGTGAGTTC--T-CGAC------ACTAA---------------CACACTGA-TTATTTT-----T---GTATA---A--TTG--T-----GC-T-----------------------T-GTAA------AT-TATTAA-CTATAAAAGAATATCTCGATATAGCATTGTGGTATATTT-GATGAGGTAAT------GTGTATGC-ATTATACAATAATAAACTGTGTT-GATTGA-TAAGTATGACCATATCCAA----GA-TAAAAA--AC--ACAAAC-----GAG------------ACGATATATGT-T-CATA-T--GT---ATACTGCAAATGTGTATTCTATTGCATGTTGTCGTAAATAT-----ATGTACCTAATATACT-ATCAACTGCTGC-TAAGGA-------CGG-------CTC-AATGTTGTGCATAAGTGAATA----ATTATTC----ATGCTG-ATACGCTTCTGACT-------TGTAGTTGATAACAT-G-G-CATTTGCTTTGTCGGTGTTTATATTGAAAGCATTCCATTTTCTTTACCAGA-GTTTAAAAGATAATTTAGTGAACACTGTTAA-CTTGCTCATTGATTTGCTTTAT-TGTTTGAATATCAT
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Reference ( family-728 )      :                         NNTGAGGCCCCTNTTAAAACAAGTACGTCATATTACA-A-AGAATGTCATATAACATAAAAT-------TGTTTTCATGATAAATNTACAAAAT---ATA-TTATGTATGTAATACAACAAAAACAAATT----GAAAAACA---ACAAACAAACAAACT-AA--AAA-A-----------------TATAT--AC--------CAATAAACGCTAGTTG-TTATTTTCATTAACGA-----CGATT---TATTTAAATTCTACTTTCGCATTTTACCCAATTCAGGAATTT-ATTTGTGAA----TACGTTTAAAG-------------TAA------------T-------TTCAA--GTGGAATNGCGTTCCATATTTTCGTTC-TAGAATA--GNN------------A--A-AC-TT----CN-CT-TA----------------AATNTTCC-GTTATTAACGTT---TG--TATTATAA--G-GTTTTGATGTGTCTT-GCTCGTCATTTGTTCTCATTTGAAACAA----TT--CG--T--AAATATGCCG-GCG-CATTCCATCG--TAT-TN-ATGTATA-CAT--TTTGAAC--GTTTTA---------GA---TAAAA-AATA---G-T-TTGTTCAAAAGACAGCATA-TAAGT--GAGATACACGCGCGTTT--T-CTAG------ANTAA---------------CGTATTGG-T-ATTTT-----T---GTATA---A--TT----A--TGC-TC-T-C-T-TGT--AA-TT-----T-GTAATTTTACATGTATTAA-ATATAGANGAATGNCCCCATATAGCACAGCAGTA-ATTTAGATGAGGTAAT------ATGCATGC-ATTATAAAATAATAAACTGTGTTCAATTGA-TAAATATGACCGTATCCTA----GA-TAAAAG--AC--ACAAAC-----AAG------------ACGATATAT-T-T-TATA-T--GC---ATACTGNAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTCGTAAATAT-----ATGTACCTAATATGCT-ATCAACTGCTGCTA--GA-------CGG-------CTA-AATAT-----ATAGGTGAATA----ATTACTN----ATG-TGTATACGCTTCTG--C-------TGT------TAACGC-GTG-CGTTTGNTTTGTCGGTGTTTAT------ANCATTCCATTCTCTTTACAANA-GTTTAAAAGATAATTTAGCGAACACCGTAAATTTTGTTCA-CGATTTGCCTTATCTGNTTGAANATCAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atAA---------------C-TATTGG-T-ATTTT-----T---GTATA---A--TTTTACA--TGC-TCAT-CAT-TGT-----TTCTTTGT-GTAATTTTACATGCGTTAT-ATGTAGGAGAATGGCCCCATATAGAACAATAGTA-ATTTATATTAGATAATGTGTACATGTATGC-ATTATGAAACAATAAACT--------TTGA-TAAACATGGCCGTACCCTA----GA-TAATAG--AC--ACAAAG-----AAC------------ACTATATAT-TCT-TACA-T--ATAAAATACTGGAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTAATCGATAT-----
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               agtaagtaagtagaaagtaagtaaattctttatttatggatgaggattgcattgaaaacgccagtcttctt-------------TAA------------T-------TTCAA--GTAAAATTGCGTTTCATGTTTATGTTC-TAGAATA--AAAGAAACTTCTCTTA--A-ACATT----CC-AT-TATTAAGTTTGGTATCAAAATGTTCCTGTTA--GACATTGACCG--TACT-TCA--G----TTGATGCATCGT-GCTCGTCATATGTTATAATTTGCAACAA----TTTATG--T--AAATATGCCG-GTGAAATTCT--------T-TT-TTGTATATTAT--CTTGA----GTCTTA---------GA---TAAAA-AACATTTA-T-TTTTTCAAAAGACAGCA----AAGTACGAGATATACTTGCGTTT--T-CTTA------ATTAA---------------C----------------------------A---A--TT----A--TAC-AA-G-C-T-TGT--AA-TT----------GTTT---ATGTATGAA-CTATTGAAGAGTGACCCCATATAGTAGAGCAGTA-A-TTAAATGAGGAAAaagtaaaattgcgtttcatgtttatgttctagaataaaagaaacttctcttaaacattccattattaagtttggtatcaaaatgttcctgttagacattgaccgtacttcagttgatgcatcgtgctcgtcatatgttataatttgcaacaatttatgtaaatatgccggtgaaattcttttttgtatattatcttgagtcttagataaaaaacatttattttttcaaaagacagcaaagtacgagatatacttgcgttttcttaattaacaattatacaagcttgtaattgtttatgtatgaactattgaagagtgaccccatatagtagagcagtaattaaatgaggaaa
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Reference ( family-728 )      :                         NNTGAGGCCCCTNTTAAAACAAGTACGTCATATTACA-A-AGAATGTCATATAACATAAAAT-------TGTTTTCATGATAAATNTACAAAAT---ATA-TTATGTATGTAATACAACAAAAACAAATT----GAAAAACA---ACAAACAAACAAACT-AA--AAA-A-----------------TATAT--AC--------CAATAAACGCTAGTTG-TTATTTTCATTAACGA-----CGATT---TATTTAAATTCTACTTTCGCATT----TTACCCAATTCAGGAATTT-AT-TTGT-GAA----TACGTTTAAAG-------------TAA------------T-------TTCAA--GTGGAATNGCGTTCCATATTTTCGTTC-TAGAATA--GNNA--A-ACTT----C-CCT-TAAATNTTCCGTTA-TGACGTT---CG-TACTATAA--G-GTNTTGATGTGTCTT-GCTCGTCATTTGTTCTCATTTGAAACAA----TT--CG--T--AAATATGCCG-GCG-CATTCCAT--TG--TA-TTNATGTATA-CAT--TTTGAAC--GTTTTA---------GA---TAAAA-AATA---G-T-TTGTTCAAAAGACAGCATA-TAAGT--GAGATACACGCGCGTTT--T-CTAG------ANTAA---------------CGTATTGG-T-ATTTT-----T---GTATA---A--TT----A--TGC-TC-T-C-T-TGT--AA-TT-----T-GTAATTTTACATGTATTAA-ATATAGANGAATGNCCCCATATAGCACAGCAGTA-ATTTAGATGAGGTAAT------ATGCATGC-ATTATAAAATAATAAACTGTGTTCAATTGA-TAAATATGACCGTATCCTA----GA-TAAAAG--AC--ACAAAC-----AAG------------ACGATATAT-T-T-TATA-T--GC---ATACTGNAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTCGTAAATAT-----ATGTACCTAATATGCT-ATCAACTGCTGNTA--GA-------CGG-------CTA-AATAT-----ATAGGTGAATA----ATTACTN----ATG-TGTATACGCTTCTG--C-------TGT------TAACGC-GTG-CGTTTGNTTTGTCGGTGTTTAT------ANCATTCCATTCTCTTTACAANA-GTTTAAAAGATAATTTAGCGAACACCGTAAATTTTGTTCA-CGATTTGCCTTATCTGNTTGAANATCAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atAA---------------C-TATTGG-T-ATTTT-----T---GTATA---A--TTTTACA--TGC-TCAT-CAT-TGT-----TTCTTTGT-GTAATTTTACATGCGTTAT-ATGTAGGAGAATGGCCCCATATAGAACAATAGTA-ATTTATATTAGATAATGTGTACATGTATGC-ATTATGAAACAATAAACT--------TTGA-TAAACATGGCCGTACCCTA----GA-TAATAG--AC--ACAAAG-----AAC------------ACTATATAT-TCT-TACA-T--ATAAAATACTGGAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTAATCGATAT-----
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tc-TT-----T-GTATTTTTACATGTATTAA--CATAAACTAATTA----ATATGGTACAGCAGTA-ATTTAGATGAGATAAT------ATGCATGC-AATATATAGTAATAAACTATGTTTAATTGA-TAAATACGACC-TATCCTA----GA-CAAAAG--CC--ATAATC-----AAG------------ACGATATAT-T-TGTATA-T--GC---ATACTGTAAATGTTTATTACATTGTA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agtaagtaagtagaaagtaagtaaattctttatttatggatgaggattgcattgaaaacgccagtcttctt------ATGCATGTTGTTATAAAATGATAAACTTTGTAAAAGTAAATAGATAGAACCATATCCTA----AA-TAAAAG--CC--AACATC-----AAA------------ACCACATGC-T-T-TATGCT--GC---TTCATGAACATGCTTAGTTAATTGGCTACTGGCCCAAATATCAAATATATACTTAATAT-CTGATCAAATGTTCATG--GAAATAGTGCAGTAGTATACTATAATAT-----AT-GATCAATAGAAAATTACTTTAAAATA-TGTATACACATCTG--CGTGTTAGTAT------TAACTT-GT--CGTTTGGTTT-CCAGTGTTTATT-----ACCATTTTCTTCTCTTGGCAAAATATTTAAAATATATTTCAGAGAACACCGTATGTTTTGTTTA-TAATTTG
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Reference ( family-728 )      :                         NNTGAGGCCCCTNTTAAAACAAGTACGTCATATTACA-A-AGAATGTCATATAACATAAAAT-------TGTTTTCATGATAAATNTACAAAAT---ATA-TTATGTATGTAATACAACAAAAACAAATT----GAAAAACA---ACAAACAAACAAACT-AA--AAA-A-----------------TATAT--AC--------CAATAAACGCTAGTTG-TTATTTTCATTAACGA-----CGATT---TATTTAAATTCTACTTTCGCATT----TTACCCAATTCAGGAATTT-AT-TTGT-GAA----TACGTTTAAAG-------------TAA------------T-------TTCAA--GTGGAATNGCGTTCCATATTTTCGTTC-TAGAATA--GNNA--A-ACTT----C-CCT-TAAATNTTCCGTTA-TGACGTT---CG-TACTATAA--G-GTATTGATGTGTCTT-GCTCGTCATTTGTTCTCATTTGAAACAA----TT--CG--T--AAATATGCCG-GNG-CATTCNAT--TG--TA-TTNATGTATA-CAT--TTTGAAC--GTTTTA---------GA---TAAAA-AATA---G-T-TTGTTCAAAAGACAGCATA-TAAGT--GAGATACACGCGCGTTT--T-CTAG------ANTAA---------------CGTATTGG-T-ATTTT-----T---GTATA---A--TT----A--TGC-TC-T-C-T-TGT--AA-TT-----T-GTAATTTTACATGTATTAA-ATATAGANGAATGNCCCCATATAGCACAGCAGTA-ATTTAGATGAGGTAAT------ATGCATGC-ATTATAAAATAATAAACTGTGTTCAATTGA-TAAATATGACCGTATCCTA----GA-TAAAAG--AC--ACAAAC-----AAG------------ACGATATAT-T-T-TATA-T--GC---ATACTGNAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTCGTAAATAT-----ATGTACCTAATATGCT-ATCAACTGCTGNTA--GA-------CGG-------CTA-AATAT-----ATAGGTGAATA----ATTACTN----ATG-TGTATACGCTTCTG--C-------TGT------TAACGC-GTG-CGTTTGNTTTGTCGGTGTTTAT------ANCATTCCATTCTCTTTACAANA-GTTTAAAAGATAATTTAGCGAACACCGTAAATTTTGTTCA-CGATTTGCCTTATCTGNTTGAANATCAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atAA---------------C-TATTGG-T-ATTTT-----T---GTATA---A--TTTTACA--TGC-TCAT-CAT-TGT-----TTCTTTGT-GTAATTTTACATGCGTTAT-ATGTAGGAGAATGGCCCCATATAGAACAATAGTA-ATTTATATTAGATAATGTGTACATGTATGC-ATTATGAAACAATAAACT--------TTGA-TAAACATGGCCGTACCCTA----GA-TAATAG--AC--ACAAAG-----AAC------------ACTATATAT-TCT-TACA-T--ATAAAATACTGGAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTAATCGATAT-----
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tc-TT-----T-GTATTTTTACATGTATTAA--CATAAACTAATTA----ATATGGTACAGCAGTA-ATTTAGATGAGATAAT------ATGCATGC-AATATATAGTAATAAACTATGTTTAATTGA-TAAATACGACC-TATCCTA----GA-CAAAAG--CC--ATAATC-----AAG------------ACGATATAT-T-TGTATA-T--GC---ATACTGTAAATGTTTATTACATTGTA
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gi|2                          :                                                                      tgtATCTAACATCAAAT--------GTTTT-ATGATAAGTATACAAAAT---AT------GTATGTAATTTAACACAAACAAATT----GATAAGCA---ATAAAC---TAAATT-GA--AA------------------------T--AC--------CAATACACGTTAGATG-TTGTTTTCATTAATTG-----CAATA---GATTCTAATTCGACTTTCGCATT----TCACCCAATTGAGGATTTTTAT-TTTG-GAC----TTTGTTTGAAG--------------AA------------T---------CAACAGT----TTTAACTTCA-ATCTTCCTTT-TAGCATATCGTAATTA-AGTTGAGGT-ATTATAAATTTTCCGTT--TAACATTTC-CC-TCTTAT------GTTTTGATGTGGCTT-GCTCGTTATTTGTTTTCATTTGAAACAA----TT--CG--TTAGAATATACCG-GGT-CATTCTAT--T---CA-CTAATTTGTA-CGT--TTCAAAT--GTTTTTTTTCTTTTTGT---TAAGA-AAT----------GTTTAAAATACAGCATA-TTA-T--GAGAGACACGTGAGTTC--T-CGAC------ACTAA---------------CACACTGA-TTATTTT-----T---GTATA---A--TT----G--TGC-T-----------------------T-GTAA------AT-TATTAA-CTATAAAAGAATATCTCGATATAGCATTGTGGTATATTT-GATGAGGTAAT------GTGTATGC-ATTATACAATAATAAACTGTGTT-GATTGA-TAAGTATGACCATATCCAA----GA-TAAAAA--AC--ACAAAC-----GAG------------ACGATATATGT-T-CATA-T--GT---ATACTGCAAATGTGTATTCTATTGCATGTTGTCGTAAATAT-----ATGTACCTAATATACT-ATCAACTGCTGCTAAGGA-------CGG-------CTC-AATGTTGTGCATAAGTGAATA----ATTATTC----ATGCTG-ATACGCTTCTGACT-------TGTAGTTGATAACAT-G-G-CATTTGCTTTGTCGGTGTTTATATTGAAAGCATTCCATTTTCTTTACCAGA-GTTTAAAAGATAATTTAGTGAACACTGTTAA-CTTGCTCATTGATTTGCTTTAT-TGTTTGAATATCAT
gi|3                          :                  agttacataTGATGCCACCAT-AAAACAAGTACGTCACATTACA-A-AG---------TAATATAA----------TGTTTTCATGATAGATATACAAAA----AAG-TTATGTAT----TACAACAAAAACAAATTTAGCAAAAAATGTTTACAAACAATCCAATT-AACTAAA-A-----------------TA-AT--AG--------CAATAAACGTTAGCCG-TTATATTCATTAAAGAAAAGGCAATT---TATT----TTTTAATTTCA-AGTAAAATTGCGT--TTCATG--TTT-ATGTTCTAGAA----TA-----AAAG-------------AAA------------C-------TTCTC--TTAAA----CATTCCATTATTAAGTT--TGG--TA--TCAA--A-ATGT----T-CCT-----------GTTA--GACATTGACCG-TACT-TCA--G----TTGATGCATCGT-GCTCGTCATATGTTATAATTTGCAACAA----TTTATG--T--AAATATGCCG-GTG-AA----AT--TC--T--TTTTTGTATATTAT--CTTGA----GTCTTA---------GA---TAAAA-AACATTTA-T-TTTTTCAAAAGACAGCA----AAGTACGAGATATACTTGCGTTT--T-CTTA------ATTAA---------------C----------------------------A---A--TT----A--TAC-AA-G-C-T-TGT--AA-TT----------GTTT---ATGTATGAA-CTATTGAAGAGTGACCCCATATAGTAGAGCAGTA-A-TTAAATGAGGAAAa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agtaagtaagtagaaagtaagtaaattctttatttatggatgaggattgcattgaaaacgccagtcttctt------ATGCATGTTGTTATAAAATGATAAACTTTGTAAAAGTAAATAGATAGAACCATATCCTA----AA-TAAAAG--CC--AACATC-----AAA------------ACCACATGC-T-T-TATGCT--GC---TTCATGAACATGCTTAGTTAATTGGCTACTGGCCCAAATATCAAATATATACTTAATAT-CTGATCAAATGTTCATG--GAAATAGTGCAGTAGTATACTATAATAT-----AT-GATCAATAGAAAATTACTTTAAAATA-TGTATACACATCTG--CGTGTTAGTAT------TAACTT-GT--CGTTTGGTTT-CCAGTGTTTATT-----ACCATTTTCTTCTCTTGGCAAAATATTTAAAATATATTTCAGAGAACACCGTATGTTTTGTTTA-TAATTTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atcaagttatgtga-CAT--TTTGTACATGTTTTA---------CAAGTTAAA---------G-TGTCGCTGAAAGTACAGCAAACTGAGT--GAGATGTGTGCACATTTGATACTAT------AATAAGTATAATTGGTATTTTGCATTGG-T-ATTGTAGACCTATAGTATATTGA--TT----A--TACTTC-T-C---TGT--AA-TTA----T-GT-ATGTTATACGTAATAACATA-AGAGAAACTCCCTTA-ATAGCACAAGAGTT-ATTTAGACGATGCAAT------TAACATGC-ATTATTGAATAATAAAGGATGCTCAGGCGA-TGCACATGACCGTACCATACTGTGAGTGAAAGCAACTGACAAACTAACAAAGGTTGAATAACTTACGTTATAT-T-T-TAGA-TAAGT---ATGTCGAATATGTGTATTCTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                      acT--AC--------CAATTAACGCTAGTTG-TTATTT-CAGTATTGA-----CTATT---TACTTAAATTCTGCTTTCGCATT----TTACCAAATT-AAGCATTG-AT-TTGT-GAA----TATGTTTAAAG-------------CAACGGCATTTTCAGT-------TTCAA--GTGGAATAGCGTTCCATATTTTTGTTCATA-AAT----TTA--A-ACTC----C-CCA-GAAAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                t-TAAAGTTTCTGTT--TGACGCT----G--ACTTCAA--GTGTATTGATGTGTTTTTGCTTGTCATTTGTTATCATTTGAAACAA----TT--CGTTT--AAATAACCCG-GAGACATGCAAT--TAACTA-TTGTTGTagggataatatttaaaattttgaaaaggcctaatatattccctttaaacattttataattagcttgtggtactataaagtttctgtttgacgctgacttcaagtgtattgatgtgtttttgcttgtcatttgttatcatttgaaacaattcgtttaaataacccggagacatgcaattaactattgttgt
gi|7                          : ttaccaattaacgctagttgttatttcagtattgactatttacttaaattctgctttcgcattttaccaaattaagcattgatttgtgaatatgtttaaagcaacggcattttcagtttcaagtggaatagcgttccatatttttgttcataaatttaaactccccagaaatagggataatatttaaaattttgaaaaggcctaatatattccctttaaacattttataattagcttgtggtactaTATTTTCTTT-----------GAAT---TATTGA---TCTACTTTCGTATT----TTACTCAATTTAAGAATTT-AT-TTGT-GAC----TAGGTTTAAAAAAACCGTCGTTTTTAA------------T-------TTCAA--GTGGAATGGCGTATCATGCTTTCTTTC-CAGAATAT-GGCA--A-ATTT----CATCA-TGAATGTT-TGTCATTGAC-----------CT-CAA--GCGTATTAATGTATAGT-GCTCGCCATTTGTGCTTATTTGAACCAA----TT--CG--T-------TG--G-GAA-CATTCCAT--TGACTATTTTATGTAT--TAT--TTT--AC--CTTTTA---------GA---TAAAA-AATA---A-T-TTGCTCCAAAGACAGCATATTAAGA--GAGAGACACGTGCGTTT--T-CTGG------AATAA---------------CATATTGC-T-ATTTT-----T---GTATA---
gi|8                          :                                                      ATATTATG-A-AGTATATCATAAAACATAAAAT--------GTTTTCATGATAAATTTATAAAAT---A-A-TTATGTATGTAAACCAACAAACACAAATT----GAAAAACA---ACAAAGAAACAAACT-AA--AAG-AATATATATATATATACATATAT--ACATATTTAGCAATAAACACTAGT-G-TTATTTTTATTAATGA-----CAATTAAATATTTAAATTCTACTTTCATATT----TTAACCTATTTAGAAATTT-AT-TTGT-GAATAACTACATTT-----------------TAAC-----------T-------TTCAA--GTGGAATAGCGTTCCATATTTT
gi|9                          :                                                                                                     ATGATAAATATACAA--T---AAA-T-ATGTATGAAGTACAACAGAAACCAACT----GAAAAACA---ATATACAAACAAACTTAA--AAA-A-----------------TATTT--AC--------CGATAAACGTTAGATG-TTATTTTCATTAATGC-----TGATT---TATTTAAATTCTACTGTAACACT----TTACCCATTTCAGGAATTT-AT-GTGT-GCA----TATGTTTAAAG-------------AAA------------TGGCATTGTTAAA--TTGGAAT


blockSeqs                     :                                  TT A T    C    ACA          T C ATATA                AAT                    T        GAC AGTTA      GT               A   TAGC        TTT               T  CT  GAATATATATATATATACA   T  TT  ATATTTAG                T             AGAAAAGGCA   AAA    T A                AAAA      C   C        T  G    A   TAAC  A        AAACCGTCGTTTTTAAT                        CA       TT             T   CA  TA   TCGTAATTAAGTTGAGGTATTATAAATTTTCCGTTTAACATTTCCCTCTTAT              A         C  T              C       A     AATG  CGTTAG          C  T C A     A  TGACTATTTT        AT   AC   GTACAT      TTTCTTTTTGT       AAACATTTAT                    TAA     AC    T C      G   GA A   G       T   GTATAATTGGTATTTTG    GATT      AGACCTATA     TTGA    TTACATGCTCATCATTGTTTCTTTGT             A    T C         CA      A     G     T              T                GTGTAC        T                  G   GC      A           G       CTGT  G      CAA TG      TAACA   GTTGAATAACTT         G C G    C ATAAA        G                       GGCCCAAATATCAAAT             A  G           C  GAAATAGTGCAGTAGTATA     T     TGTGC  A        GAAA      TTAAA   C  T          GACTTGTAGTTGATAACATGG           A    C   G           ATTGAA G                   G T                  T            T        TT            .  T     T
blockSeqs                     :                                  AC C T    C    ACG          . . GAATG                T                      T        .   TTTA       GT               A   .           .                 .  .   ATA                   T  .   .                       .             TTGCA        .      C A                .         A   G        .  .    .   .     T        CAACGGCATTTTCAGT                         .        TT             C   C   GC   TGGCAAATTTCATCATGAATGTTTGTCATTGACCTCAAGC                          T         C  .              T       A     .     TATGTA          C  . G .     T  TAACTATTG         A    .    AAAT        CAAGT             AATAGAT                       AAC     .     G C      G   .  .   C       C   CG                   GGT       T             ACC     ACATACTCGCATGTGCAATTTT                 A    T T         CA      C     T     A              .                .             .                  A   TT      .           A       .     .      A   .       .       .                    . . .    . AAGT         T                       GTAATCGATAT                  .  .           A  AGGACGG                 .     .      .        .         C       .  .          GCGTGTTAGTATTAACTTGT            G    G   .           T      C                   A .                  A            .        T                       
blockSeqs                     :                                  C  A .    .    .            . . GTATA                .                      T        .   TATA       GT               C   .           .                 .  .   GTA                   T  .   .                       .             TGACT        .      T A                .         A   C        .  .    .   .     T        AAATGGCATTG                              .        AG             A   T   GA   TCAAAATGTTCCTGTTAGACATTGACCGTACTTCAG                              A         C  .              A       C     .     CGTTTA          C  . T .     A  TCACTA            A    .    AGC         GA                AAATAAT                       TAT     .     T T      A   .  .   A       T   CA                   GGT       C             A       ATACTTCTCTGTAATTAT                     A    T C         A       C     A     T              .                .             .                  G   TC      .           A       .     .      C   .       .       .                    . . .    . GC           C                       GTCGTAAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                              . . ATTT                 .                      A        .   TATT       GT               A   .           .                 .  .   TA                    T  .   .                       .             TGACA        .      G A                .         A   T        .  .    .   .     G        CATTTTTAAT                               .        GG             T   C   G                                                                      A         T  .              A       A     .     CGT             C  . A .     C  TCTTTT            .    .    GA          GA                AAAT                          TA      .     T T      G   .  .   T       A   CA                   GCT       T             A       ATACAAGCTTGTAATT                       A    T T         C       A     T     T              .                .             .                  G   AA      .           A       .     .      A   .       .       .                    . . .    . AC           A                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                              . . G                    .                      A        .   ATTA       GA               A   .           .                 .  .   AA                    T  .   .                       .             TGCTG        .      T .                .         T   T        .  .    .   .     C        TAACT                                    .        AG             C   .   A                                                                      .         A  .              C       A     .     TA              .  . A .     .  TGATC                  .    AC          A                 GTG                           .       .     G C      .   .  .   G       A   C                    T         T             A       GTGCTT                                 .    . .         C       A     A     T              .                .             .                  T   TC      .           G       .     .      A   .       .       .                    . . .    . GT           A                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
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Reference ( family-728 )      :                           NNTGAGGCCCCTNTTAAAACAAGTACGTCATATTACA-A-AGAATGTCATATAACATAAAAT--------GTTTTCATGATAAATNTACAAAAT-ATA--TATGTATGTAATACAACAAAAACAAATT----GAAAAACA---ACAAACAAACAAACT-AA--AAA-A-----------------TATAT--AC--------CAATAAACGCTAGTTG-TTATTTTCATTAACGA-----CGATT---TATTTAAATTCTACTTTCGCATT----TTACCCAATTCAGGAATTT-AT-TTGT-GAA----TACGTTTAAAG-A-----------TCAA---T-------TTCAAGTGGAATNGCGTTCCATATTTTCGTTC-TAGAATA--GNNA--A-ACTT----C-CCT-TAAATNTTCCGTTA-TGACGTT---CG-TACTATAA--G-GTATTGATGTGTCTT-GCTCGTCATTTGTTCTCATTTGAAACAATTCGTTTAAATATGCCG-GNG-CATTCNATTNACTA-TTNATGTATA-CAT--TTT-AN-C-GTTTTA---------GATAAAA-AATA---ATTTGTTCAAAAGACAGCATANTAAGTGAGATACACGCGCGTTT--T-CTAN------ANTAACGTAT---TG--TATTTT----------TGTA--------------TAA--TTA--TAC-TN--C-TN-----TGTAA-TT-----T-GTAATTTTACATGTATTAA-ATATAGANGAATGNCCCCATATAGCACAGCAGTA-ATTTAGATGAGGTAAT------ATGCATGC-ATTATAAAATAATAAACTGTGTTCAATTGA-TAAATATGACCGTATCCTA----GA-TAAAAG--AC--ACAAAC-----AAG------------ACGATATAT-T-T-TATA-T--GC---ATACTGNAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTCGTAAATAT-----ATGTACCTAATATGCT-ATCAACTGCTGNTA--GA-------CGG-------CTA-AATAT-----ATAGGTGAATA----ATTACTN----ATG-TGTATACGCTTCTG--C-------TGT------TAACGC-GTG-CGTTTGNTTTGTCGGTGTTTAT------ANCATTCCATTCTCTTTACAANA-GTTTAAAAGATAATTTAGCGAACACCGTAAATTTTGTTCA-CGATTTGCCTTATCTGNTTGAANATCAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atAAC-TAT---TGG-TATTTT----------TGTA--------------TAA--TTT--TACATG--C-TCATCATTGT---TTCTTTGT-GTAATTTTACATGCGTTAT-ATGTAGGAGAATGGCCCCATATAGAACAATAGTA-ATTTATATTAGATAATGTGTACATGTATGC-ATTATGAAACAATAAACT--------TTGA-TAAACATGGCCGTACCCTA----GA-TAATAG--AC--ACAAAG-----AAC------------ACTATATAT-TCT-TACA-T--ATAAAATACTGGAAATGTGTATTCCATTGCATGTTGTAATCGATAT-----
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTATA-CATACTTT-AG-C-TTTTCA----------ATAAAA-A-TAG--ATTTATTCAAAAGACAACATAATAAGAAAGATGCACGCTC--TT--T-CGAG------ATTAACGTAT---T---TATCTT----------CCTA--------------CAACCTTACATAC-TCG-CATG-----TGCAA-TT-----TTGTAATTCTATATGTATTAACAT-TAGACACATGTCCCCAAGTAGCACAACAGTA-ATTGAGAAAAGGTATT------ATGTGTAC-ATTATGAAATAATAAACTGTGCGCAAGTGA-TAtta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tc-TT-----T-GTATTTTTACATGTATTAA--CATAAACTAATTA----ATATGGTACAGCAGTA-ATTTAGATGAGATAAT------ATGCATGC-AATATATAGTAATAAACTATGTTTAATTGA-TAAATACGACC-TATCCTA----GA-CAAAAG--CC--ATAATC-----AAG------------ACGATATAT-T-TGTATA-T--GC---ATACTGTAAATGTTTATTACATTGTA
gi|13                         :                                                             ACA-A-AATATATCATATAACATAAAAT--------GTTTTCATAATAAATTTACAAAAT-AT---T---TATACAAAACAACAACAATAAATT----AATAAA-A---ACAAACAAACAAAAG-TA--AAT-A-----------------TATGT--AC--------CTATACACACTAGTTGTTTTTTTTCATTAACAA-----C--TT---TGTTT
gi|14                         :                              GAGGCCTTTATTAAAA--------TCATATTACA-A-A-ATTTTCATATAACATGAAATAAT-----GTTTTCATGATAAATTTTCAAAAT-AT-----T-TATGTAATACAACAAAATCG--TT----GAAAA-------CGAACTAAAAGACT-AT--ATATA-----------------TATATTTAC--------CAATAAAAGCTAGTTG-TTATTTTCATTttgtttgacattta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           aTCTATTTTCACAAA----TTAACTCATTCAGGAATTT-AT-TTAT-ACA----TAAGTTTAAAGCATTT--------TTAA---T-------TTCAACTGGAAATTCGTTCGATACTTTTGTTC-CATAATA--
gi|16                         :                             TGAGGCCC-TCTTAAAACAAATACATCATATTACATACAGAATGTCATATAACATAAAAT--------GTTCTCATGATACATTTACAAAAT-ATA--TATGTAT----TACAACAAAACCAAATA----GAAAAACA---AC--GCAAACAtggagattcgtgcgtattgaagacaaacatattaata
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcTGTGTTCGATTGG-AAAATATGGCCATATTCTG----GA-TAAAAA--AC--ACACGC-----AAG------------ACGATATCT-T-T-CATA-T--AC---Agttg
gi|2                          :                                                                        tgtATCTAACATCAAAT--------GTTTT-ATGATAAGTATACAAAAT-AT------GTATGTAATTTAACACAAACAAATT----GATAAGCA---ATAAAC---TAAATT-GA--AA------------------------T--AC--------CAATACACGTTAGATG-TTGTTTTCATTAATTG-----CAATA---GATTCTAATTCGACTTTCGCATT----TCACCCAATTGAGGATTTTTAT-TTTG-GAC----TTTGTTTGAAG-AA----------TCAACAGT-------TTTAA-----------CTTCA-ATCTTCCTTT-TAGCATATCGTAATTA-AGTTGAGGT-ATTATAAATTTTCCGTT--TAACATTTC-CC-TCTTAT------GTTTTGATGTGGCTT-GCTCGTTATTTGTTTTCATTTGAAACAATTCGTTAGAATATACCG-GGT-CATTCTATTCACTA----ATTTGTA-CGT--TTC-AAAT-GTTTTTTTTCTTTTTGTTAAGA-AAT--------GTTTAAAATACAGCATATTA--TGAGAGACACGTGAGTTC--T-CGAC------ACTAACACAC---TGATTATTTT----------TGTA--------------TAA--TTG--TGC-T-------------------------T-GTAA------AT-TATTAA-CTATAAAAGAATATCTCGATATAGCATTGTGGTATATTT-GATGAGGTAAT------GTGTATGC-ATTATACAATAATAAACTGTGTT-GATTGA-TAAGTATGACCATATCCAA----GA-TAAAAA--AC--ACAAAC-----GAG------------ACGATATATGT-T-CATA-T--GT---ATACTGCAAATGTGTATTCTATTGCATGTTGTCGTAAATAT-----ATGTACCTAATATACT-ATCAACTGCTGCTAAGGA-------CGG-------CTC-AATGTTGTGCATAAGTGAATA----ATTATTC----ATGCTG-ATACGCTTCTGACT-------TGTAGTTGATAACAT-G-G-CATTTGCTTTGTCGGTGTTTATATTGAAAGCATTCCATTTTCTTTACCAGA-GTTTAAAAGATAATTTAGTGAACACTGTTAA-CTTGCTCATTGATTTGCTTTAT-TGTTTGAATATCAT
gi|3                          :                    agttacataTGATGCCACCAT-AAAACAAGTACGTCACATTACA-A-AG---------TAATAT--AAT--------GTTTTCATGATAGATATACAAAAA-AGT--TATGTAT----TACAACAAAAACAAATTTAGCAAAAAATGTTTACAAACAATCCAATT-AACTAAA-A-----------------TA-AT--AG--------CAATAAACGTTAGCCG-TTATATTCATTAAAGAAAAGGCAATT---TATT----TTTTAATTTCA-AGTAAAATTGCGT--TTCATG--TTT-ATGTTCTAGAA----TA-----AAAG-A-------------AA---C-------TTCTCTTAAA----CATTCCATTATTAAGTT--TGG--TA--TCAA--A-ATGT----T-CCT-----------GTTA--GACATTGACCG-TACT-TCA--G----TTGATGCATCGT-GCTCGTCATATGTTATAATTTGCAACAATTTATGTAAATATGCCG-GTG-AA----ATT--CT--TTTTTGTATATTAT--CTT-GA---GTCTTA---------GATAAAA-AACATTTATTTTTTCAAAAGACAGCAAAGTA--CGAGATATACTTGCGTTT--T-CTTA------ATTAAC----------------------------------------------AA--TTA--TAC-----------------AAGCT-----T-GTAATTGTTTATGTATGAA-CTATTGAAGAGTGACCCCATATAGTAGAGCAGTA-A-TTAAATGAGGAAAa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agtaagtaagtagaaagtaagtaaattctttatttatggatgaggattgcattgaaaacgccagtcttctt------ATGCATGTTGTTATAAAATGATAAACTTTGTAAAAGTAAATAGATAGAACCATATCCTA----AA-TAAAAG--CC--AACATC-----AAA------------ACCACATGC-T-T-TATGCT--GC---TTCATGAACATGCTTAGTTAATTGGCTACTGGCCCAAATATCAAATATATACTTAATAT-CTGATCAAATGTTCATG--GAAATAGTGCAGTAGTATACTATAATAT-----AT-GATCAATAGAAAATTACTTTAAAATA-TGTATACACATCTG--CGTGTTAGTAT------TAACTT-GT--CGTTTGGTTT-CCAGTGTTTATT-----ACCATTTTCTTCTCTTGGCAAAATATTTAAAATATATTTCAGAGAACACCGTATGTTTTGTTTA-TAATTTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atcaagttatgtgaACCA-TTT-TGTACA-TGT--TTT-AC-AAGTT-----------------AA-AGTG-----TCGCTGAAAGTACAGCAAACTGAGTGAGATGTGTGCACATTTGATACTAT------AATAA-GTATAATTGG-TATTTTGCATTGGTATTGTAGACCTATAGTATATTGA--TTA--TAC-TT--C-TC-----TGTAA-TTA----T-GTA-TGTTATACGTAATAACATA-AGAGAAACTCCCTTA-ATAGCACAAGAGTT-ATTTAGACGATGCAAT------TAACATGC-ATTATTGAATAATAAAGGATGCTCAGGCGA-TGCACATGACCGTACCATACTGTGAGTGAAAGCAACTGACAAACTAACAAAGGTTGAATAACTTACGTTATAT-T-T-TAGA-TAAGT---ATGTCGAATATGTGTATTCTA
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gi|8                          :                                                        ATATTATG-A-AGTATATCATAAAACATAAAAT--------GTTTTCATGATAAATTTATAAAAT-AAT--TATGTATGTAAACCAACAAACACAAATT----GAAAAACA---ACAAAGAAACAAACT-AA--AAG-AATATATATATATATACATATAT--ACATATTTAGCAATAAACACTAGT-G-TTATTTTTATTAATGA-----CAATTAAATATTTAAATTCTACTTTCATATT----TTAACCTATTTAGAAATTT-AT-TTGT-GAATAACTACATTTTAA---------------C-----T-------TTCAAGTGGAATAGCGTTCCATATTTT
gi|9                          :                                                                                                       ATGATAAATATACAA--T-AAA--TATGTATGAAGTACAACAGAAACCAACT----GAAAAACA---ATATACAAACAAACTTAA--AAA-A-----------------TATTT--AC--------CGATAAACGTTAGATG-TTATTTTCATTAATGC-----TGATT---TATTTAAATTCTACTGTAACACT----TTACCCATTTCAGGAATTT-AT-GTGT-GCA----TATGTTTAAAG-A-------------AA---TGGCATTGTTAAATTGGAAT