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gi|22 : TGTTTTGTGTACGTGA-CAAATGTGTTTGTGTAAAATTGTTA-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCAAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTAAAAGCCAATAACTATaataacattttaccccaa
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gi|12 : AAAAATTATAA-TTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAAACAGTTTGTCA-TTG--TTTTC--ATaaaaacattttaccccaa
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Alignments
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Reference ( family-713 ) : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATACGACCACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAACGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATCGGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTGGACTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACGTTGCCATATCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C-AAAAAAAAAG-ACCAAC--AA-A--T--T--TTTTTTNCCCCAA
gi|1 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAAATAATATCCTTTATCAAACGACCATGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGAATCATGCTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCAAGGCCAAATATTGCAATGTCTTGTGGAAAAAGCTGATAATTGTTCGATAACAGGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAATCCCAAT--TA-------TTTA----TCAACGTATGATCATTGTTTGGGTGGAATAAACTGAAATGTTTGCTATTTGTTTTATTACAATTAAAGGATCGTCAATAACATAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTA-GAC-AAAAATATTAAATAGGTTTGATTGAACTTTTTGATAAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTATACTGAGTGCTGTTTG--TTTAT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGAATAAAAATTATTATTACTTTTGATTATTTGGTCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTATTTTCATGGACAGTTTGAAAG-T-TTGTC-AAGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACACTGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAAAGTTGCCATGTCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGATCAGCGGTTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ATGTAC------ATGCATAATATAAGA-C-AAAAAAAAAG-ACCAACA-AA-A--T--T--TTTTTTACCCCAA
gi|10 : CTTTAAATCAATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATATGACCACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTC-------------CAATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAGATAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAATGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATAAAAGGATCATTAGTTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTATGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATTGGACTTTTTGATCAGGTT--------AAATTGAGATTGGATTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA---T-TT-TTT----ATTATG-------CTTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGATGGTTTGAAAG-TGTT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAATGTAAGACAATGAATATCGAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTTGATAAAAGTTGCAATATCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCAGATAAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C-AAAAAAAAAACACCAACAAAA-A--A--A--CATTTTACCCCAA
gi|11 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATACCACCACGAATACACAAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGT-TACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAACTGTCA-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TTAGCGGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTTGATAACAAGT-TAT-AGAGATAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TTAACGTTTGATATTTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTATGATTAAAAAATCGTCATTTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATTAGTTTGATCAGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTAGACTGTGTGCCTTTCG--GTTTT--ATA---T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAAATTAATTTGGAAAATAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAGTT-TT-TT-ATGACAAAAATGAGTAAACGTACGACAATGAATATCAAGGTTTATCTGACTGGGTCTTAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACGTTGCCATATCTTCAGCAAGGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCTCT-AAA--ATGACGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTACATAAGA-C-AAAAA
gi|12 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTAACATATGACCACGAATACATGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTCACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCT-ATTTTCAAGGTAATGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTTGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTCGATAACAAGA-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAATTATA-------TATA----TCAACGTTTGATCATTATTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGG
gi|12 : ATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAAACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATAGCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACATTGCCATATTTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGATGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C---AAAAAAAG-AACAAC--AA-A--T--T--TTTTTTACCCCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgattaaaaattataattacgtttgattatttgatcggctttttgattagattaaattggaaactaaagacaaaacagtttgtcattgttttcatggacggtttgaaagtttttacgacaaaaatgagtaaacgtaagacaatgaatagcaaggtttatttgactgggtttcaatattgtggtttcatactgcgatattctatcaacattgccatattttcagcaaagagaaaatgtctaacattagaacagcggatgaaagccctaaaaatgatggaaacgtacatgcattatataagacaaaaaaagaacaacaaattttttttacccca
gi|13 : cttaaaatccatcaaatttcaacaaatatcctttaacatatgaccacgaatacatgaggtgtgaaatttcagcatcatgttttgtgtacgtcacaaatgtgtaagtgtaaaattgtctattttcaaggtaatgtgctaaaaataacccgaggccaaatactgcagtgtcttgtggtaaaagccgataattgttcgataacaagatatagagttaaaacactttaaccccaattatatatatcaacgtttgatcattatttgggtggaataaattgacatgtttgctatttgttttattacgattaaaggatcgtcaattacttaaataaaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCATACGACCATGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATTATGCTTTATGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCGGATCTCCGAGGTAGCGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTGAAAGCGGATAATTGTTTGATAACAAGT-TAC-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAACGTTTGATCATT--------------AATTGAAATGTTTACTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATTGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTATATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATCAGACTTTTTGATCAGGTTAAATGGGAAAATTGAGATTGGACTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA---T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCAGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TTGTC-GCCACAACAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTCC----ATACT-GTGATATTCTATAAACGTTGCCATGTCTTCAGC--AGAGAAAATGTCTAACGTTAGAACAGCGGGTGAAAGTCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATGTAAGA-C----AAAAAAG-ACCAACAAAA-A--T--T--TTTTTTACCCCAA
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gi|18 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATACGACTACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCAT---GTTTTGTGTACGTGACAAATGTGTTAGTGTAAAATTGTTG-ATCTCCGAGGTAACATGCTAAAAA-TTACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCAAGGTAAAAGCCGATAATTGTTCGATAACATGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATAATTATCAACGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACCATTAAAGGATCGTTAATAACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTATTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATTGGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGGGATTGGACTGTGTGCTGTTTT--TTTTTAAATA-T-T-TT-TTT----AATATGATTAAAAATTATAGTTACGTTTGATTATTTGATTGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAGTT-TT-TT-ACGACAAAAATAAATAAACGTAAGACAATGAATATCAAAG
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Reference ( family-713 ) : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATACGACCACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAACGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATCGGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTGGACTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACGTTGCCATATCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C-AAAAAAAAAG-ACCAAC-AAA--A-NTCNTTTTACCCCAA
gi|1 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAAATAATATCCTTTATCAAACGACCATGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGAATCATGCTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCAAGGCCAAATATTGCAATGTCTTGTGGAAAAAGCTGATAATTGTTCGATAACAGGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAATCCCAAT--TA-------TTTA----TCAACGTATGATCATTGTTTGGGTGGAATAAACTGAAATGTTTGCTATTTGTTTTATTACAATTAAAGGATCGTCAATAACATAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTA-GAC-AAAAATATTAAATAGGTTTGATTGAACTTTTTGATAAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTATACTGAGTGCTGTTTG--TTTAT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGAATAAAAATTATTATTACTTTTGATTATTTGGTCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTATTTTCATGGACAGTTTGAAAG-T-TTGTC-AAGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACACTGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAAAGTTGCCATGTCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGATCAGCGGTTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ATGTAC------ATGCATAATATAAGA-C-AAAAAAAAAG-ACCAAC-AAA--A-TTTTTTTTACCCCAA
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gi|17 : TAATGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTAGTAAAAGCCGATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAATTAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCTATGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAAATGACATGTTTGCTATTTGTTTTATAACTATTAAAGGATTGCCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATCGGACTTTTTGATCAGGTAAAATTGGAAAATTGAGATTGGACTATGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA-T-TATT-TTT----TTTGTGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAAACAGTTTGTCATTGTTTTCATAGACGGTTTGAAAG-T-TT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACAATGGATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGAAATTCTATCAACGTTGCCATATCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGC-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-CAAAAAAAAAAG-ACCAAC-AA
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gi|6 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTAACATACGACCACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTGACAAATGTAAAAGTGTGAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAATGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTAAAAGCCAATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAGTTAAAACAGTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAACGTTTG-----------GGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGCACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTGGT----------TTTTTTTACGACAAAAAAGATTAAATAGGTTTGATCAGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTGGACTGTGT--CGTTTG--TTTTT--ATA-T-T-TTATTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTGTGGTTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAAACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTTAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACATTGCCCTATTTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-CAAAAAAAAAAG-ATCAAC-AAA--ATTTTTTTTTACCCCAA
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gi|8 : CTTTAAATCCATCAAATTTCAATAAATAACCTTTACCACATGACCATGAATACACTAGGTGTGAAATTTCAACATCATGCTTTGAGTACGTAACAAATGTGTAAGTGT---------------CCAAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCACTGTCTCGTGGTTAAAACCGATAATTGTTTGATAACAAGT-TAT-AGAGTTGAAACACTTTAACCACAAT--TA-------TGTA----TCAAAATTTGATCATTGTTTGGTTGGAATAAATTGAAATGTT-GCTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAATTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACTAAAAATATCAAATAGGTTTGATTGGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTGGACTGTTTGCCGTTTG--TGTTT--ATATT-T-TT-TTT----ATTACTATTAAAAATTATTATTACCTTTGATTATTTGATCGGTTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTGAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TTGTT-ACGACAAAAATGAGTTAACGTA--------------------TATTTGACTTGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCAATATTCTATCAACATTGCCATGTCTTCAGCAAAGAGAAAATG---AACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCCCTAAAAACATAGTGTACATACATATACATACACGTACATGCATTATATTAGA-C---ACAAAAAG-AACAAA-AAA--A-ACCATTTTACCC
gi|9 : CTTTAAATCAATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATATGACCACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTC-------------CAATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAGATAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAATGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATAAAAGGATCATTAGTTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTATGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATTGGACTTTTTGATCAGGTT--------AAATTGAGATTGGATTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA---T-TT-TTT----ATTATG-------CTTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGATGGTTTGAAAG-TGTT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAATGTAAGACAATGAATATCGAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTTGATAAAAGTTGCAATATCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCAGATAAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C-AAAAAAAAAACACCAACAAAA--A-AACATTTTACCCCAAa
Alignments
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lowQualScore : . . . . .. ....... .... . .......... .. .. ... . . .... . . . . .... . . .. . ....... ...... . .. . . .. .
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Reference ( family-713 ) : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATACGACCACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAACGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATCGGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTGGACTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACGTTGCCATATCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C-AAAAAAAAAG-ACCAACAAAAANNCNTTTTACCCCAA
gi|1 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAAATAATATCCTTTATCAAACGACCATGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGAATCATGCTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCAAGGCCAAATATTGCAATGTCTTGTGGAAAAAGCTGATAATTGTTCGATAACAGGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAATCCCAAT--TA-------TTTA----TCAACGTATGATCATTGTTTGGGTGGAATAAACTGAAATGTTTGCTATTTGTTTTATTACAATTAAAGGATCGTCAATAACATAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTA-GAC-AAAAATATTAAATAGGTTTGATTGAACTTTTTGATAAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTATACTGAGTGCTGTTTG--TTTAT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGAATAAAAATTATTATTACTTTTGATTATTTGGTCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTATTTTCATGGACAGTTTGAAAG-T-TTGTC-AAGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACACTGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAAAGTTGCCATGTCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGATCAGCGGTTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ATGTAC------ATGCATAATATAAGA-C-AAAAAAAAAG-ACCAAC-AAAATTTTTTTTACCCCAA
gi|10 : CTTTAAATCAATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATATGACCACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTC-------------CAATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAGATAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAATGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATAAAAGGATCATTAGTTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTATGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATTGGACTTTTTGATCAGGTT--------AAATTGAGATTGGATTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA---T-TT-TTT----ATTATG-------CTTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGATGGTTTGAAAG-TGTT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAATGTAAGACAATGAATATCGAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTTGATAAAAGTTGCAATATCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCAGATAAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C-AAAAAAAAAACACCAACAAAAAAACATTTTACCCCAA
gi|11 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATACCACCACGAATACACAAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGT-TACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAACTGTCA-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TTAGCGGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTTGATAACAAGT-TAT-AGAGATAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TTAACGTTTGATATTTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTATGATTAAAAAATCGTCATTTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATTAGTTTGATCAGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTAGACTGTGTGCCTTTCG--GTTTT--ATA---T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAAATTAATTTGGAAAATAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAGTT-TT-TT-ATGACAAAAATGAGTAAACGTACGACAATGAATATCAAGGTTTATCTGACTGGGTCTTAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACGTTGCCATATCTTCAGCAAGGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCTCT-AAA--ATGACGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTACATAAGA-C-AAAAA
gi|12 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTAACATATGACCACGAATACATGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTCACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCT-ATTTTCAAGGTAATGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTTGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTCGATAACAAGA-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAATTATA-------TATA----TCAACGTTTGATCATTATTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGG
gi|12 : ATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAAACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATAGCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACATTGCCATATTTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGATGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C---AAAAAAAG-AACAAC--AAATTTTTTTTACCCCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgattaaaaattataattacgtttgattatttgatcggctttttgattagattaaattggaaactaaagacaaaacagtttgtcattgttttcatggacggtttgaaagtttttacgacaaaaatgagtaaacgtaagacaatgaatagcaaggtttatttgactgggtttcaatattgtggtttcatactgcgatattctatcaacattgccatattttcagcaaagagaaaatgtctaacattagaacagcggatgaaagccctaaaaatgatggaaacgtacatgcattatataagacaaaaaaagaacaacaaattttttttacccca
gi|13 : cttaaaatccatcaaatttcaacaaatatcctttaacatatgaccacgaatacatgaggtgtgaaatttcagcatcatgttttgtgtacgtcacaaatgtgtaagtgtaaaattgtctattttcaaggtaatgtgctaaaaataacccgaggccaaatactgcagtgtcttgtggtaaaagccgataattgttcgataacaagatatagagttaaaacactttaaccccaattatatatatcaacgtttgatcattatttgggtggaataaattgacatgtttgctatttgttttattacgattaaaggatcgtcaattacttaaataaaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCATACGACCATGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATTATGCTTTATGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCGGATCTCCGAGGTAGCGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTGAAAGCGGATAATTGTTTGATAACAAGT-TAC-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAACGTTTGATCATT--------------AATTGAAATGTTTACTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATTGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTATATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATCAGACTTTTTGATCAGGTTAAATGGGAAAATTGAGATTGGACTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA---T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCAGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TTGTC-GCCACAACAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTCC----ATACT-GTGATATTCTATAAACGTTGCCATGTCTTCAGC--AGAGAAAATGTCTAACGTTAGAACAGCGGGTGAAAGTCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATGTAAGA-C----AAAAAAG-ACCAACAAAAATTTTTTTTACCCCAA
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gi|16 : cttaaaatccatcaaatttcaacaaacatcctttaacatacgaccacgaatacacgaggtgtgaaatttcagcatcatgttttgtatacgTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATACGACCATGAATACACGAGATGTGAAATTTCAGCATCATACTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGA-------------------------GGCCAAATACTGCAGTGTCTGGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTTGATAACAAGT-T-T---------AACACTTTATCCCCAAT--TA-------TATA----TCAACATTTGATCATTG--------------ATTGAAATGTTTACTATTTGTTTTATTACAATTAAAAGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGGGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATCAGACTTTTTGATTGGGTTATATTAGAAAATTGAGATTGGACTGTGTGCCGATTG--TTTTT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATTATAACG--------TTTGATCGGCTTTTCGATTAGATTAAATTGGAAATTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAC-T-TTGTT-ACACCAAAAATGAGTAAATGTAAGACAATGAATATTAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----GTACT-GCGATATTCTATCAACGTTGCCATGTCTTCAGC--AGAGAAAATGTCTAACATTAGAACA
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Reference ( family-713 ) : CTTAAAATCCATCAAATTTCAACAAATATCCTTTACCATACGACCACGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGCATCATGTTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCGAGGCCAAATACTGCAGTGTCTCGTGGTAAAAGCCGATAATTGTTCGATAACAAGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAACCCCAAT--TA-------TATA----TCAACGTTTGATCATTGTTTGGGTGGAATAAATTGACATGTTTGCTATTTGTTTTATTACGATTAAAGGATCGTCAATTACTTAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTACGACAAAAAATATTAAATAGGTTTGATCGGACTTTTTGATCAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTGGACTGTGTGCCGTTTG--TTTTT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGATTAAAAATTATAATTACGTTTGATTATTTGATCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTGTTTTCATGGACGGTTTGAAAG-T-TT-TT-ACGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACAATGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAACGTTGCCATATCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGAACAGCGGGTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ACGTAC------ATGCATTATATAAGA-C-AAAAAAAAAG-ACCAACAAAAANNCNTTTTACCCCAA
gi|1 : CTTAAAATCCATCAAATTTCAAATAATATCCTTTATCAAACGACCATGAATACACGAGGTGTGAAATTTCAGAATCATGCTTTGTGTACGTGACAAATGTGTAAGTGTAAAATTGTCG-ATCTCCGAGGTAACGTGCTAAAAA-TAACCCAAGGCCAAATATTGCAATGTCTTGTGGAAAAAGCTGATAATTGTTCGATAACAGGT-TAT-AGAGTTAAAACACTTTAATCCCAAT--TA-------TTTA----TCAACGTATGATCATTGTTTGGGTGGAATAAACTGAAATGTTTGCTATTTGTTTTATTACAATTAAAGGATCGTCAATAACATAAATAAAATTGGAATTAAAGATTGGACAGTTTGAGGTTTGTTTGTTGTTTG-T----------TTTTATTA-GAC-AAAAATATTAAATAGGTTTGATTGAACTTTTTGATAAGGTTAAATTGGAAAATTGAGATTATACTGAGTGCTGTTTG--TTTAT--ATA-T-T-TT-TTT----ATTATGAATAAAAATTATTATTACTTTTGATTATTTGGTCGGCTTTTTGATTAGATTAAATTGGAAACTAAAGACAAGACAGTTTGTCATTATTTTCATGGACAGTTTGAAAG-T-TTGTC-AAGACAAAAATGAGTAAACGTAAGACACTGAATATCAAGGTTTATTTGACTGGGTTTCAATATTGTGGTTTC----ATACT-GCGATATTCTATCAAAGTTGCCATGTCTTCAGCAAAGAGAAAATGTCTAACATTAGATCAGCGGTTGAAAGCCCTAAAA--ATGATGGA-A-------ATGTAC------ATGCATAATATAAGA-C-AAAAAAAAAG-ACCAAC-AAAATTTTTTTTACCCCAA
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