lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 11111111111111                                                  11111111111111111111111111111111111111111111                                                      
lowQualScore                  :                    222    1            1111111111              1111     1111111111             1                        2222222222222222                                           22222222222222                    1111111     888888888888888888888888888888888888888         1111                            11        111   11111                                                      2          222222                                               444444                 1                                                                   555555555    3333         1                      222        333                       1111                                  11                  1                         888888888888888                                                                         111        11    11                        22                 2222            11    1111111111     11  22                    1   11                                   1              22                 11    666666                     44     33333333          44444444          666666666666     11111                2         1                      11       1111                                 1     1  5555555     1   1                         444444444444                       00000000000000     1              33333333        1       1     99999999999999999999999999999999999999999999    111111     1                                      
lowQualScore                  :      88      8     333    7         1  4444444444 0   8 1    6 4444   6 9999999999  6    11  0 0            3   5  8    7777777777777777           8888  888  0      0      0    2 44444444444444    66    888   66  6666666     555555555555555555555555555555555555555 5 11  0 2222          5  3   1 22       33        444   44444       2     1         77  5      7     0       0   9 0      6   555555                                  6            666666     7        6  7  0   8                                          6   2        8    111111111    6666 2 4     7    2                 333        444     3      6      0   3333      1  0                     0  11  3          22   0  6                      111111111111111    1      2       8        1    8      6              2    0          8 444 0      11    22 88                     11                 9999  1       6 33    1111111111     22  33                2   7   22            6     6     6          7       2      11                 22    888888        6            66     11111111          99999999     6    777777777777     88888                0   6     7       6       6 6 4  99    3  8888       4  3             6  8     5  4  5  1111111     7   5   4           6         000000000000    5   6  5     1   1 99999999999999     7       6 6    55555555        5       1     00000000000000000000000000000000000000000000    666666     1            7                 6       
lowQualScore                  :      ..      .     ...    .         .  .......... .   . .    . ....   . ..........  .    ..  . .            .   .  .    ................           ....  ...  .      .      .    . ..............    ..    ...   ..  .......     ....................................... . ..  . ....          .  .   . ..       ..        ...   .....       .     .         ..  .      .     .       .   . .      .   ......                                  .            ......     .        .  .  .   .                                          .   .        .    .........    .... . .     .    .                 ...        ...     .      .      .   ....      .  .                     .  ..  .          ..   .  .                      ...............    .      .       .        .    .      .              .    .          . ... .      ..    .. ..                     ..                 ....  .       . ..    ..........     ..  ..                .   .   ..            .     .     .          .       .      ..                 ..    ......        .            ..     ........          ........     .    ............     .....                .   .     .       .       . . .  ..    .  ....       .  .             .  .     .  .  .  .......     .   .   .           .         ............    .   .  .     .   . ..............     .       . .    ........        .       .     ............................................    ......     .            .                 .       
lowQualScore                  :      55      3     333    0         4  8888888888 6   0 4    8 2222   7 3333333333  7    66  6 7            7   7  6    0000000000000000           4444  888  2      1      1    6 11111111111111    99    888   99  2222222     444444444444444444444444444444444444444 0 44  1 1111          7  0   7 00       66        111   33333       1     6         99  7      9     1       8   6 4      3   888888                                  5            222222     8        0  0  6   0                                          0   5        2    000000000    0000 5 0     0    5                 000        555     0      0      8   4444      4  8                     8  00  0          88   0  6                      888888888888888    4      8       0        4    0      4              8    8          0 000 8      00    44 66                     00                 2222  4       0 00    0000000000     00  00                5   0   00            0     0     0          0       5      00                 00    000000        0            00     55555555          00000000     0    000000000000     00000                0   0     0       0       0 7 0  00    0  5555       0  0             0  2     0  0  0  5555555     0   0   0           0         000000000000    0   6  4     4   4 00000000000000     0       0 6    66666666        0       3     66666666666666666666666666666666666666666666    444444     6            6                 0       
consensus                     : TTTTGCNTTCCCTTACAAC---GACAATATATCATCTATNAA-CG--GGATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTGTAATCNACA-CANAATCG--TTTCG---TA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCANG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAAC----TTTAGC----T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTNGATTTAATCGGAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGCGCCAGTTGCTCT---ACCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAACAAACTAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATCCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCANCTCCGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAANTNAATTTAGCATNTTTTAGTTTTTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTNCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAACATTACCGGAAATGTATG--ATCATGATTTAATTGAAGTACAGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTAGATTATATTTTAATTTT-CC--ATTTACGA--CATT-NACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTATAGAAGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAANAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACNTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTGCTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGATTTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAANAGNGTGGTNAATCCGTCTATGTNATNATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACNAACGACCCTTA-TCCTCATCCCATTNGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGAATGTTCTCTTTTT-C-TTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGG---GGCC-TA----ATTTTGATCGACCTCAGA-TTTTGATCTGCA------TTGTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
Reference ( gi|1 )            : TTTTGTGTTCCCTAACAAC---GACATTATATCATCTATAAA-CG--GAATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAATCTTTCTATAATCAACA-CATAATCT--TTTCG---TA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAAC----TTTGGC----T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATTTTCGAGCCAATCGCTGT---TCCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAA---A--AAGCTGTGTATGTCATCAAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTGTCACCTCTGACTAACATGTTATCTCTTTTACTGAAGTAAATTTTGCATCTTTTAGTTTTTCAACTTATCCAATCACACATCCTTTTCTTAGCTTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATG--ATTATGATTTAATTGAAGGACTGAATTTGAAACTACTAAACCTAGTTCTTAACTTACA-AATCCTGTTTCCAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGGTTATATTTTAATTTT-CT--ATTTACGA--CATT-TATTGTTTGTGGTTTTAAAATGGTG-GTAGATTTAAGTCTTACTATAAAGGAGATATGGATATCCTTATTGGAGAGTTTTATATATGTTCCTTCAATTCTTAACAAATTTAAGTCAAAATAAACTCTAACCCTTTTCCCAGTCAAAAAATCTCTACCTAATATCATTCTTCGATTCATGTTTGGTACCGCTAAAAAAAAGTACGACTAAATTTTTC-CCTCCCAATTCAAAATCTAATTCGAAAC-ACCCATCTACTG-TAAGTGCTCCTCCATTTACAGATTGTAATGCGATTGA-TTTCTTGCTAAGTTTCGATACATTGCGCAAAGATTGATAAAGTCTTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCCCCGGAATCCACTAAAGA-T-TTATTTCTTTTTCAATTAGTTTTCAAAATACATGAACATGGACTACCTGCGATTGCAATATTTTATGTAGGAAT------T-------TTATCACTCTTCACATCGGCTCGAACAGATGAAGAGCATACTAGTTTTCCTGA---AGCCTTATTCTATTTTGATTGAATCCAGT-TTTTGCCATGCA------TTGTCTCTTAAAATGACCTTTCTTCCTACATTTCCAGCATGTGA
gi|6                          : TTTTGCGTTCCCTTACAAC---GACAATATATCATCTACTAA-CT--GGATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACA-CATAATCG--TTTCG---TA---CCATCTTT---ATCTAC---TAAAACTATCGGAGAACTCCGTG--CCTA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAAC----TTTAGC----T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTAT-ATGTTTGTTATTGTTTA--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGCTTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTT-GCGCCAATTGTCCT---ACCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGACTAAACTTTTCAGTTATTACCTTTGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTTTTAGTTTTTCAACTTTTGTAATCATA-A-CCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT--TTGTGAATAACTAATTAGCATTACCGGAAATGTATG--ATCATGATTTAATTGAAGTGCAGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AAACTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGTTGGCAAATTTAGATTATATTTTAATTTT-CC--ATTTACAA--CATT-TACTGTTTTTGGTTTTAAAATGGTG-GTAAATTTAAGTCTTACTATAGAGAAGATATGAA
gi|5                          :   TTGCTTTCCCTTACAAC---GACAATATATCATCTATTAA-CT--GGATTTG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACA-CATAATCG--TTTCG---TA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATT--CCTA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAAC----TTTAGC----T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTAT-ATGTTTGCTATTGTTTA--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGATTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGCGCCAATTGTCCT---ACCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTTTGACTCACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTTTTAGTTTTTCAACTTTTGTAATCATA-A-CCTTTTCTTAGCCTAAGAG-TTT-TTTGTTAATAATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATG--ATCATGATTTAATTGAAGTGCAGAAGTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTATCG-AATCTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGCTGGCAAATTTAGATTATATTTTAATTTT-CC--ATTCACAA--CATT-TACTGTTGGTGGTTTTAAAATGGTG-GTAGATTTAAGTCTTACTATAGAAAAGATATGAAg
gi|4                          :             TAACAACAGTGCCAACAAGTCATCAATAAG-CG--GAAGAGG-AAATGC-A----TAATAT-TT-TG---TT-ATCGCATTGAGTTTTCTAAAGTCTACA-CAGAAACG--CTTGG---AA---CCGTCTTTCTTATCAACAATTACAACT---GGAAAGCTACAAA----AA--------GATTAAGATC---TAG--TT-------ATTAT----TCTAGC----T---------TTTAAC---------ATCTCGTCGTTAACTTTGCCTAT-AACCTTTAAATTG-TTA---CGAAGTGTTCTGT-----AAGGCCTAAACTTTATCGGTGCA--TT-GTTTCCGGTGTCCAATGTCA--TACG-GACAGTTTCTGTGTATCCGAGCTCAGAATCCTTATTAGCAAATATATTTATATTTTg
gi|10                         :                              TATCATCAACAAATCGAAGAATTGG-AAAAATCA----CTG-G------ACGCGT-ATTTTATTTAGCTTTCTATAGTCGACA-CAAAATCTCATTT-----TA---ACATTTTTCTTTTTGAC---TAAAACTATTGGAGA--TGCATAATATGA--------TTGT--GATT---CTT--CT-------ATAATGTCATGTGGTAACATG--------T----C---------A-C--GT------CTTTGCCTTT-GTATTCTC---TGTTTGGCTTTGGGTG--TTGTCCTACATGGTCTAGAT---ATTAGAGGAATTGCATTGCCTGTTTC-AATATtggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgttgacatattttgcttactgacgcgatgctatcttcatgaattcgttctattctagcaagtatgcagccccgttttgataatagttttatctgttatttacagctaaaattaggatatgttgccgttttttcattttcatgacagaatttgaaaccatcagtcctggttcagtactaatgtaaccacgttcacaactcgttaattaataaactgcagcaattggaatgtcaacgttatttttaaccttactggaacaaaccattgcagtttgaggttttaagattgtgtcatatttaattcttacaagggagcagatataaatg
gi|11                         :                                TCGTCTATG---CG------TGGTATGAGCCAAGAGTTG-GG-TG-TA---ATGATTTTGTTTAACTTCCTGTAATCCACA-CAGAATCT--GTGTGATTTA---TCCGCTTTCTG---CAC---TAGGACAACCGGCGAAGCCCACG--GGGAATGAGTGCGTTT--GATCACCTTT--GCTGAGAGCATATC----TT---C----T---------T--------------------TTG----CTTGATCAATTAT-TTTCCTGTCATTTAA-TCGCTGTG---GGT-----ATGGTCTAGATTTCACGGGAGGA--TG-GTCACCCGTGTCT
gi|15                         :                                                             cgA----TAG-GTGTTGTA---AT-TTGTT-TTAA-CTTTCTGCAATCAATAGCA-AATCT--CCATG---AG---TTGTCTTTCTTTTTTAC---GAGGACAACAGGAGAATTCC
gi|13                         :                                                                                 tggttgaaagATTAACTCTTCGGTAATCCACA-TATGGTCG--T---G---TAGATCCATTTTTCTTCCAAAC---TATAACAATGGGTGAAGCCCATG--GTGA--------GGT----ACT---TTTCGGT-------ATAAC----C----C----T---------T----T---------A-CT
gi|7                          :                                                                                           agacaatcttgtacgcgtggtagcggaaaatcgtctggtttaacaagtgcCTTTTTTATCAAC---TAGAACTGTCGCAGAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATGGT----TTCGAA----CATA------T----C---------A-CTAATTG----CTTAATCCAT-ATGTTTCCTTTTGTTTA--TTTGGGTG--TGAT-----ACAGTCTTGATTTAATCGGAGGT--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATCGTTGTGCCAATCGCTTT---GCTTAAATCTATATCTGTTTTAGTAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAA---T--AGGCTTTATATGTCGTCTTAATGTGCCGTAAGGTcaaaatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                                AACTATCGGAAAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GATC---TTT--CT-------ATAAT----TTTAGG----TACAAACATCT----C---------A-CTAATTG----TTTTATCTTT-ATGTTTCCTATTGTTTT--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGAA--TT-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGCTCCAGTGGCTCT---ATCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGGATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTA----AGTAAATTAAGCATCTTTTAGTTTTTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTAATTAACATTACCGGAAATGTATG--ATCATGATTTAATAAAAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGATTATATTTTAATTTT-CC--ATTTAAGA--CATT-AATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACT----AAGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCAATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTGCTCGTAATCTAATTC-AAACAAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGATTTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCCAAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAATAT------------ATTGCAATATTTTATGTAGGGTT------TTTTTCC-TTATCTCTCTTCATATCGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC---------------------TGACTGACCTCAGA-TTTTGATCTGCA------TTGTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCAGCGGCTCT---ATCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTA----AGTAAATTTAGCATCTTTTAGTTTTTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTTATTAACATTACCGGAAATGTATG--ATCATGATTTAATAAAAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGATTATATTTTAATTTT-CC--ATTTAAGA--CATT-AATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACT----AAGAAATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAAGAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACATAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCATAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAACAT------------ATTGCAATATTTTATGTAGGATT------TTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATTGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC---------------------TGACTGACCTCAGA-TTTTGATCTGCA------TTGTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgctTAATAGTTTTATCTGTTATTTAC-AGCTAAAATTA--GGATATGT-TGCCGTTTT--TTCATTTTCATGACAGAATTTGAAACCATCAGTCCTGGTTCAGTACTAATGTAACCACGTTCACAAC--TCGTTAATTAATAAACTGCAGCA-ATTGGAATGTCAACGTTAT-TTTTAACCTTACTGGA---ACAAACCATTGCA--GTTTGAGGTTTTAAGATTGTG-TCATATTTAATTCTTACAAGGGAGCAGATATAAAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taacaacagtgccaacaagtcatcaataagcggaagaggaaatgcataatattttgttatcgcattgagttttctaaagtctacacagaaacgcttggaaccgtctttcttatcaacaattacaactggaaagctacaaaaagattaagatctagttattattctagcttttaacatctcgtcgttaactttgcctataacctttaaattgttacgaagtgttctgtaaggcctaaactttatcggtgcattgtttccggtgtccaatgtcatacggacagtttctgtgtatccgagctcagaatccttattagcaaatatatttatatttttggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgttgacatattttgcttactgacgcgatgctatcttcatgaattcgttctattctagcaagtatgcagccccgttttgaCAAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGAATGTTCTCT-------TTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAA-TTTCCTAGGTTGGCCTTA---GATTTTGATC------------------TGCA------TTGTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGAg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGAATGTTCTCT-------TTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAA-TTTCCTAGGTTGGCCTTA---GATTTTGATC------------------TGCA------TTGTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGAACATTTTCT-------TTATCTCTCTCCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTTCCCTGG---------------------TTGACCTCAGA-TTTTGATCTGCA------TTGTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTCTAGGTTTCCTGA---AGCCGTGTTCTATTTTGATTT-ATCCAATATTTTGATGTGCATTCAATTTGTCTCTTAAAATGCTCATTTTCCCTACATTACAAACATGTGA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggTTGACCTCAGA-TTTTGATCTGCA------TTGTCGCTTAAAATGGCCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGAg





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    11111111111111111111111                                                                       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1111         111111                                       1111111111111111                                           11111111111111                2222222           77777777777777777777777777777777777777         1111                                       111   11111                       11111                                         111                                               555555                                                                                     111111111     11111                                                                      1                                                                                222222222222222                                                                                                                  22                  111                      222                                                                                                                     11                                                1    1                1                                 2                                                                                       333                                                     111                55555555555555                                                  33333333333333333333333                       111111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1                             1  6  9999     6 3      2222   5 77  000000  5          5            1     1  66  6666666666666666           2  1  777                     1 77777777777777    66   777    0000000      66   11111111111111111111111111111111111111 5 0     0000         5   1   0 0       8888        111   22222       1     0         00000      1                 0  5      2      000                                  1            444444                        6                                              1             888888888     22222 1          1                           9        1                 6  5                                                 99   3  4                      333333333333333                   6             6      3                                    99    99    1  2                0    66                  333                      333                              1                                                    1                                 88                        7       0               3    2            7   3                                 3                             1  1     1             1  1                         1     444   8             1                      77  1        000     99         55555555555555               4       22                      8  88888888888888888888888                       444444                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .                             .  .  ....     . .      ....   . ..  ......  .          .            .     .  ..  ................           .  .  ...                     . ..............    ..   ...    .......      ..   ...................................... . .     ....         .   .   . .       ....        ...   .....       .     .         .....      .                 .  .      .      ...                                  .            ......                        .                                              .             .........     ..... .          .                           .        .                 .  .                                                 ..   .  .                      ...............                   .             .      .                                    ..    ..    .  .                .    ..                  ...                      ...                              .                                                    .                                 ..                        .       .               .    .            .   .                                 .                             .  .     .             .  .                         .     ...   .             .                      ..  .        ...     ..         ..............               .       ..                      .  .......................                       ......                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     0                             0  7  7777     7 5      1111   7 11  777777  7          9            0     0  99  4444444444444444           1  0  888                     0 11111111111111    11   888    6666666      11   55555555555555555555555555555555555555 0 1     6666         0   4   2 4       0000        111   55555       0     2         11111      9                 1  7      1      000                                  0            555555                        7                                              0             888888888     88888 0          0                           3        0                 7  5                                                 22   2  0                      888888888888888                   7             7      7                                    22    22    0  2                7    77                  888                      333                              0                                                    0                                 33                        3       7               3    0            3   3                                 7                             0  0     0             0  0                         0     666   0             0                      77  0        777     88         88888888888888               0       88                      9  88888888888888888888888                       444444                                          
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC-GT----TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GAT---CTTT-------GTATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTA-TATGTTTCCTATTGTTT-A--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAAGTAAATTTAGCATCTTTTAGTTTTTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGATTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTG-NTAGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGAACGTTCTCT---CCTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGG--------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
Reference ( family-692 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTGCNTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GGATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTGTAATCNACACANAA--TC-GT----TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCANG--CCGA--------GTTT--GAT---CTTT-------GTATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTA-TATGTTTCCTATTGTTT-A--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTNGATTTAATCGGAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTTGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAACAAACTAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATCCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCANCTCCGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAANTNAATTTAGCATNTTTTAGTTTTTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTNCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACAGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTAGATTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTATAGAAGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAANAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACNTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTGCTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGATTTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAANAGNGTGGTNAATCCGTCTATGTNATNATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACNAACGACCCTTA-TCCTCATCCCATTNGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGAATGTTCTCTTTTTCTTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGGGCC-TA----ATTTTGATCGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTGTGTTCCCTAACAACGACATTATATCATCTATAAA-CG--GAATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC-TT----TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GAT---CTTT-------GTATAA--CTT-------T-GGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTA-TATGTTTCCTATTGTTT-A--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATTTTCGA-GCCAATCGCTGTT---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAA---A--AAGCTGTGTATGTCATCAAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTGTCACCTCTGACTAACATGTTATCTCTTTTACTGAAGTAAATTTTGCATCTTTTAGTTTTTCAACTTATCCAATCACACATCCTTTTCTTAGCTTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATTATGATTTAATTG--AAGGACTGAATTTGAAACTACTAAACCTAGTTCTTAACTTACA-AATCCTGTTTCCAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGGTTATATTTTAATTTTCTATTT--ACGA--CATTTATTGTTTGTGGTTTTAAAATGGTG-GTAGATTTAAGTCTTACTATAAAGGAGATATGGATATCCTTATTGGAGAGTTTTATATATGTTCCTTCAATTCTTAACAAATTTAAGTCAAAATAAACTCTAACCCTTTTCCCAGTCAAAAAATCTCTACCTAATATCATTCTTCGATTCATGTTTGGTACCGCTAAAAAAAAGTACGACTAAATTTTTC-CCTCCCAATTCAAAATCTAATTCGAAAC-ACCCATCTACTG-TAAGTGCTCCTCCATTTACAGATTGTAATGCGATTGA-TTTCTTGCTAAGTTTCGATACATTGCGCAAAGATTGATAAAGTCTTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCCCCGGAATCCACTAAAGA--TTTATTTCTTTTTCAATTAGTTTTCAAAATACATGAACATGGACTACCTGCGATTGCAATATTTTATGTAGGAA-----------TTTTATCACTCTTCACATCGGCTCGAACAGATGAAGAGCATACTAGTTTTCCTGAAGCCTTATTCTATTTTGATTGAATCCAGTTTTTGCCATGCATT------GTCTCTTAAAATGACCTTTCTTCCTACATTTCCAGCATGTGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATCATCAACAAATCGAAGAATTGG-AAAAATCA----CTG-G------ACGCGT-ATTTTATTTAGCTTTCTATAGTCGACACAAAATCTC-AT----TT--TA---ACATTTTTCTTTTTGAC---TAAAACTATTGGAGA--TGCATAATATGA--------TTGT--GAT---TCTT-------CTATAA--TGTCATGTGGT-AACATG--------T----C---------A-C--GT------CTTTGCCTT-TGTATTCTC---TGTTT-GGCTTTGGGTG--TTGTCCTACATGGTCTAGAT---ATTAGAGGAATTGCATTGCCTGTTTC-AATAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCGTCTATG---CG------TGGTATGAGCCAAGAGTTG-GG-TG-TA---ATGATTTTGTTTAACTTCCTGTAATCCACACAGAA--TCTGTGTGATTTAT----CCG-CTTTC---TGCAC---TAGGACAACCGGCGAAGCCCACG--GGGAATGAGTGCGTTT--GATCACCTTTGCTGAGAGCATAT--CTT-----------C-T---------T--------------------TTG----CTTGATCAATTAT-TTTCCTGTCATTTAA--TCGCTGTG---GGT-----ATGGTCTAGATTTCACGGGAGGA--TG-GTCACCCGTGTCT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cgAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGAACATTTTCT-----TTATCTCTCTCCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTTCCCTGG------------------TTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTAACTCTTCGGTAATCCACATATGG--TC-GT-------GTAGATCCATTTTTCTTCCAAAC---TATAACAATGGGTGAAGCCCATG--GTGA--------GGT----AC---TTTTCG-----GTATAACCCTT-------T-A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agacaatcttgtacgcgtggtagcggaaaatcgtctggtttaacaagtgcCTAGGTTTCCTGAAGCCGTGTTCTATTTTGATTTATCCAATATTTTGATGTGCATTCAATTTGTCTCTTAAAATGCTCATTTTCCCTACATTACAAACATGTGActcaaaatatct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggattA----TAG-GTGTTGTA---AT-TTGTT-TTAA-CTTTCTGCAATCAATAGCAAA--TC-------TCCATGAG-TTGTCTTTCTTTTTTAC---GAGGACAACAGGAGAATTCCg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tggttgaaagTTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGGCCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACTATCGGAAAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GAT---CTTT-------CTATAA--TTT-------T-AGG-TACAAACATCT----C---------A-CTAATTG----TTTTATCTT-TATGTTTCCTATTGTTT-T--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGAA--TT-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-TCCAGTGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGGATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTAAGCATCTTTTAGTTTTTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTAATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGATTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCAATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTGCTCGTAATCTAATTC-AAACAAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGATTTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCCAAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAATATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGG---GT--TTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATCGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGC-TCCAGCGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTTAGCATCTTTTAGTTTTTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTTATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGATTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAAATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAAGAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACATAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCATAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAACATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGGA----TTTTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATTGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACAGTGCCAACAAGTCATCAATAAG-CG--GAAGAGG-A-AATGCA----TAATAT-TT-TG---TT-ATCGCATTGAGTTTTCTAAAGTCTACACAGAA--AC-GC----TTGGAA---CCGTCTTTCTTATCAACAATTACAACT---GGAAAGCTACAAA----AA--------GATTAAGAT---CTAG-------TTATTA--TTC-------T-AGC-T---------TTTAAC---------ATCTCGTCGTTAACTTTGCCTA-TAACCTTTAAATTG-TT-A---CGAAGTGTTCTGT-----AAGGCCTAAACTTTATCGGTGCA--TT-GTTTCCGGTGTCCAATGTCA----TACGGACAGTTTCTGTGTATCCGAGCTCAGAATCCTTATTAGCAAATATATTTATATTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taacaTTCTATTCTAGCAAGTATGCAGCCCCGTTTTGA--TAATAGTTTTATCTGTTATTTAC-AGCTAAAATTA--GGATATGT-TG-CCGTTTTTTCATTTTCATG-ACAGAATTTGAAACCATCAGTCCTGGTTCAGTACTAATGTAACCACGTTCACAAC--TCGTTAATTAATAAACTGCAGCA-ATTGGAATGTCAACGTTAT-TTTTAACCTT--ACTGGAACAAACCATTG-CAGTTTGAGGTTTTAAGATTGTG-TCATATTTAATTCTTACAAGGGAGCAGATATAAAtggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgttgacatattttgcttactgacgcgatgctatcttcatgaattcgttctattctagcaagtatgcagccccgttttgataatagttttatctgttatttacagctaaaattaggatatgttgccgttttttcattttcatgacagaatttgaaaccatcagtcctggttcagtactaatgtaaccacgttcacaactcgttaattaataaactgcagcaattggaatgtcaacgttatttttaaccttactggaacaaaccattgcagtttgaggttttaagattgtgtcatatttaattcttacaagggagcagatataaatg
gi|5                          : taacaacagtgccaacaagtcatcaataagcggaagaggaaatgcataatattttgttatcgcattgagttttctaaagtctacacagaaacgcttggaaccgtctttcttatcaacaattacaactggaaagctacaaaaagattaagatctagttattattctagcttttaacatctcgtcgttaactttgcctataacctttaaattgttacgaagtgttctgtaaggcctaaactttatcggtgcattgtttccggtgtccaatgtcatacggacagtttctgtgtatccgagctcagaatccttattagcaaatatatttatatttttggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgttgacatattttgcttactgacgcgatgctatcttcatgaattcgTTGCTTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATTAA-CT--GGATTTG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC-GT----TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATT--CCTA--------GTTT--GAT---CTTT-------GTATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTA-TATGTTTGCTATTGTTT-A--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGATTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTTTGACTCACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTTTTAGTTTTTCAACTTTTGTAATCAT--AACCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTTAATAATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAAGTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTATCG-AATCTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGCTGGCAAATTTAGATTATATTTTAATTTTCCATTC--ACAA--CATTTACTGTTGGTGGTTTTAAAATGGTG-GTAGATTTAAGTCTTACTATAGAAAAGATATGAAGtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTACTAA-CT--GGATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC-GT----TTCGTA---CCATCTTT---ATCTAC---TAAAACTATCGGAGAACTCCGTG--CCTA--------GTTT--GAT---CTTT-------GTATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTA-TATGTTTGTTATTGTTT-A--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGCTTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTT-GC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGACTAAACTTTTCAGTTATTACCTTTGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTTTTAGTTTTTCAACTTTTGTAATCAT--AACCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT--TTGTGAATAACTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AAACTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGTTGGCAAATTTAGATTATATTTTAATTTTCCATTT--ACAA--CATTTACTGTTTTTGGTTTTAAAATGGTG-GTAAATTTAAGTCTTACTATAGAGAAGATATGAAG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTTTTTTATCAAC---TAGAACTGTCGCAGAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GAT---CTTT-------GTATGG--TTT-------CGAACATA--------T----C---------A-CTAATTG----CTTAATCCA-TATGTTTCCTTTTGTTT-A--TTTGGGTG--TGAT-----ACAGTCTTGATTTAATCGGAGGT--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATCGTTGT-GCCAATCGCTTTG---CTTAAATCTATATCTGTTTTAGTAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAA-----TAGGCTTTATATGTCGTCTTAATGTGCCGTAAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGAATGTTCTCT-----TTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTT-CCTAGG-----------------TTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cAAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGAATGTTCTCT-----TTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTT-CCTAGG-----------------TTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111         111111                                       1111111111111111                                           11111111111111                    1111111         77777777777777777777777777777777777777         1111                            11        111   11111                                                                     111                                               444444                                                                                     222222222                                                                                   1                                                                                222222222222222                                                                                                                      1                 111                      222                                                                                                                     11                                                1    1                1                                 1                                                                                       333                                                     111               22222      22                                                  666666666666666666666                         111111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1  6  99       6 3      2222   5 77  000000  5          5            1     1  66  6666666666666666           4  1  777                     1 77777777777777    66    777   66  4444444    66   11111111111111111111111111111111111111 5 0     0000          5  1   0 0        11        111   22222       0     0         66  5      1                 0  5      4      000                                  1            333333                        6                                                            555555555     7777  2             99       6                  9                          6  5                                                 99   3  1                      333333333333333                   6             6      3               99                     99    99    1  2                0    1 3                 333                      333                                                                                                                     88          0             7                       3    2            7   3                                 3                         0   1  1     0             1  0                         1     444   8             1                      77  1        000     99        00000  6   55               1       11                      9  555555555555555555555                         444444                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .  ..       . .      ....   . ..  ......  .          .            .     .  ..  ................           .  .  ...                     . ..............    ..    ...   ..  .......    ..   ...................................... . .     ....          .  .   . .        ..        ...   .....       .     .         ..  .      .                 .  .      .      ...                                  .            ......                        .                                                            .........     ....  .             ..       .                  .                          .  .                                                 ..   .  .                      ...............                   .             .      .               ..                     ..    ..    .  .                .    . .                 ...                      ...                                                                                                                     ..          .             .                       .    .            .   .                                 .                         .   .  .     .             .  .                         .     ...   .             .                      ..  .        ...     ..        .....  .   ..               .       ..                      .  .....................                         ......                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       0  7  22       7 5      1111   7 11  777777  7          9            0     0  99  4444444444444444           9  0  888                     3 11111111111111    11    888   11  4444444    11   55555555555555555555555555555555555555 0 1     6666          0  4   2 4        99        111   55555       8     2         99  0      0                 1  7      0      000                                  0            222222                        7                                                            888888888     7777  2             22       7                  3                          7  5                                                 22   2  0                      888888888888888                   7             7      7               22                     22    22    0  2                7    0 3                 888                      333                                                                                                                     33          7             3                       3    0            3   3                                 3                         7   4  4     6             4  6                         4     666   0             4                      77  0        777     88        55555  3   88               0       33                      3  333333333333333333333                         444444                                          
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTC-TTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGAACG-TTTTCT--TTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGG--------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
Reference ( family-692 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAAGTAAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGAACG-TTCTCTCCTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGG--------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGTGTTCCCTAACAACGACATTATATCATCTATAAA-CG--GAATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---TT--TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-GGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATTTTCGA-GCCAATCGCTGTT---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAA---A--AAGCTGTGTATGTCATCAAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTGTCACCTCTGACTAACATGTTATCTCTTTTACTGAAGTAAATTTTGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTATCCAATCACACATCCTTTTCTTAGCTTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATTATGATTTAATTG--AAGGACTGAATTTGAAACTACTAAACCTAGTTCTTAACTTACA-AATCCTGTTTCCAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGG--TTATATTTTAATTTTCTATTT--ACGA--CATTTATTGTTTGTGGTTTTAAAATGGTGGT-AGATTTAAGTCTTACTATAAAGGAGATATGGATATCCTTATTGGAGAGTTTTATATATGTTCCTTCAATTCTTAACAAATTTAAGTCAAAATAAACTCTAACCCTTTTCCCAGTCAAAAAATCTCTACCTAATATCATTCTTCGATTCATGTTTGGTACCGCTAAAAAAAAGTACGACTAAATTTTTC-CCTCCCAATTCAAAATCTAATTCGAAAC-ACCCATCTACTG-TAAGTGCTCCTCCATTTACAGATTGTAATGCGATTGA-TTTCTTGCTAAGTTTCGATACATTGCGCAAAGATTGATAAAGTCTTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCCCCGGAATCCACTAAAGA--TTTATTTCTTTTTCAATTAGTTTTCAAAATACATGAACATGGACTACCTGCGATTGCAATATTTTATGTAGGAA---TT------TTATCACTCTTCACATCGGCTCGAACAGATGAAGAGCATACTAGTTTTCCTGAAGCCTTATTCTATTTTGATTGAATCCAGTTTTTGCCATGCATT------GTCTCTTAAAATGACCTTTCTTCCTACATTTCCAGCATGTGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCATCAACAAATCGAAGAATTGG-AAAAATCA----CTG-G------ACGCGT-ATTTTATTTAGCTTTCTATAGTCGACACAAAATCTC---AT--TT--TA---ACATTTTTCTTTTTGAC---TAAAACTATTGGAGA--TGCATAATATGA--------TTGT--GATT---CTT--CT-------ATAA--TGTCATGTGGT-AACATG--------T----C---------A-C--GT------CTTTGCCTTT-GTATTCTC---TGTTTGGCTTTGGGTG--TTGTCCTACATGGTCTAGAT---ATTAGAGGAATTGCATTGCCTGTTTC-AATAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCGTCTATG---CG------TGGTATGAGCCAAGAGTTG-GG-TG-TA---ATGATTTTGTTTAACTTCCTGTAATCCACACAGAA--TCTGTGTGATTTAT----CCG-CTTTCTG---CAC---TAGGACAACCGGCGAAGCCCACG--GGGAATGAGTGCGTTT--GATCACCTTT--GCTGAGAGCATAT--CTT-----------C-T---------T--------------------TTG----CTTGATCAATTAT-TTTCCTGTCATTTAA-TCGCTGTG---GGT-----ATGGTCTAGATTTCACGGGAGGA--TG-GTCACCCGTGTCT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGAACA-TTTTCT--TTATCTCTCTCCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTTCCCTGG------------------TTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTAACTCTTCGGTAATCCACATATGG--TC---GT-----GTAGATCCATTTTTCTTCCAAAC---TATAACAATGGGTGAAGCCCATG--GTGA--------GGT----ACT---TTTCGGT-------ATAACCCTT-------T-A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              agacaatcttgtacgcgtggtagcggaaaatcgtctggtttaacaagtgc--------------TGATTTATCCAATATTTTGATGTGCATTCAATTTGTCTCTTAAAATGCTCATTTTCCCTACATTACAAACATGTGActcaaaatatct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggattctaggtttcctgaagccgtgttctatttA----TAG-GTGTTGTA---AT-TTGTT-TTAA-CTTTCTGCAATCAATAGCAAA--TC-------TCCATGAG-TTGTCTTTCTTTTTTAC---GAGGACAACAGGAGAATTCCg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tggttgaaagTTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGGCCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACTATCGGAAAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GATC---TTT--CT-------ATAA--TTT-------T-AGG-TACAAACATCT----C---------A-CTAATTG----TTTTATCTTT-ATGTTTCCTATTGTTTT--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGAA--TT-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-TCCAGTGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGGATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTAAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTAATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCAATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTGCTCGTAATCTAATTC-AAACAAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGATTTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCCAAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAATATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGG---GTTTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATCGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGC-TCCAGCGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTTATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAAATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAAGAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACATAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCATAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAACATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGG-ATT-TTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATTGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGTGCCAACAAGTCATCAATAAG-CG--GAAGAGG-A-AATGCA----TAATAT-TT-TG---TT-ATCGCATTGAGTTTTCTAAAGTCTACACAGAA--AC---GC--TTGGAA---CCGTCTTTCTTATCAACAATTACAACT---GGAAAGCTACAAA----AA--------GATTAAGATC---TAG--TT-------ATTA--TTC-------T-AGC-T---------TTTAAC---------ATCTCGTCGTTAACTTTGCCTAT-AACCTTTAAATTG-TTA---CGAAGTGTTCTGT-----AAGGCCTAAACTTTATCGGTGCA--TT-GTTTCCGGTGTCCAATGTCA----TACGGACAGTTTCTGTGTATCCGAGCTCAGAATCCTTATTAGCAAATATATTTATATTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taacaTGACATATT---TTGCTTACTGACGCGA---TGCTATCTTCATGAATTCGTTCTATTCTAGCAAGTATGCAGCCCCGTTTTGA--TAATAGTTTTATCTGTTATTTAC-AGCTAAAATTA--GGATATGT-TG-CCGTTTTTTCATTTTCATG-ACAGAATTTGAAACCATCAGTCCTGGTTCAGTACTAATGTAACCACGTTCACAAC--TCGTTAATTAATAAACTGCAGCA-ATTGG--AATGTCAACGTTAT-TTTTAACCTT--ACTGGAACAAACCATTG-CAGTTTGAGGTTTTAAGATTGTGTC-ATATTTAATTCTTACAAGGGAGCAGATATAAAtggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgttgacatattttgcttactgacgcgatgctatcttcatgaattcgttctattctagcaagtatgcagccccgttttgataatagttttatctgttatttacagctaaaattaggatatgttgccgttttttcattttcatgacagaatttgaaaccatcagtcctggttcagtactaatgtaaccacgttcacaactcgttaattaataaactgcagcaattggaatgtcaacgttatttttaaccttactggaacaaaccattgcagtttgaggttttaagattgtgtcatatttaattcttacaagggagcagatataaatg
gi|5                          : taacaacagtgccaacaagtcatcaataagcggaagaggaaatgcataatattttgttatcgcattgagttttctaaagtctacacagaaacgcttggaaccgtctttcttatcaacaattacaactggaaagctacaaaaagattaagatctagttattattctagcttttaacatctcgtcgttaactttgcctataacctttaaattgttacgaagtgttctgtaaggcctaaactttatcggtgcattgtttccggtgtccaatgtcatacggacagtttctgtgtatccgagctcagaatccttattagcaaatatatttatatttttggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgtTTGCTTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATTAA-CT--GGATTTG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---GT--TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATT--CCTA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTAT-ATGTTTGCTATTGTTTA--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGATTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTTTGACTCACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGTAATCAT--AACCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTTAATAATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAAGTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTATCG-AATCTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGCTGGCAAATTTAGA--TTATATTTTAATTTTCCATTC--ACAA--CATTTACTGTTGGTGGTTTTAAAATGGTGGT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAAAAGATATGAAGtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTACTAA-CT--GGATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---GT--TTCGTA---CCATCTTT---ATCTAC---TAAAACTATCGGAGAACTCCGTG--CCTA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTAT-ATGTTTGTTATTGTTTA--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGCTTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTT-GC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGACTAAACTTTTCAGTTATTACCTTTGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGTAATCAT--AACCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT--TTGTGAATAACTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AAACTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGTTGGCAAATTTAGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACAA--CATTTACTGTTTTTGGTTTTAAAATGGTGGT-AAATTTAAGTCTTACTATAGAGAAGATATGAAG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTTTTTATCAAC---TAGAACTGTCGCAGAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATGG--TTT-------CGAACATA--------T----C---------A-CTAATTG----CTTAATCCAT-ATGTTTCCTTTTGTTTA--TTTGGGTG--TGAT-----ACAGTCTTGATTTAATCGGAGGT--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATCGTTGT-GCCAATCGCTTTG---CTTAAATCTATATCTGTTTTAGTAAATAAATCTGAATTTTCCTGT-A---A-TAGGCTTTATATGTCGTCTTAATGTGCCGTAAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGAATG-TTCTCT--TTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTT-CCTAGG-----------------TTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cAAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGAATG-TTCTCT--TTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTT-CCTAGG-----------------TTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111         111111                                       1111111111111111                                           11111111111111                    1111111         77777777777777777777777777777777777777         1111                            11        111   11111                                                                     111                                               444444                                                                                     444444444                                                                                   1                                                                                222222222222222                                                                                                                      1                 111                      222                                                                                                                     11                                                1    1                1                                 1                                                                                       333                                                     111                2222                                                        666666666666666666666                         111111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1  6  99       6 3      2222   5 77  000000  5          5            1     1  66  6666666666666666           4  1  777                     1 77777777777777    66    777   66  4444444    66   11111111111111111111111111111111111111 5 0     0000          5  1   0 0        11        111   22222       0     0         66  5      1                 0  5      4      000                                  1            333333                        6                                                            000000000     7777  1             99       6                  9                          6  5                                                 99   3  1                      333333333333333                   6             6      3               99                     99    99    1  2                0    1 3                 333                      333                                                                                                                     88          0             7                       3    2            7   3                                 3                         0   1  1     0             1  0                         1     444   8             1                      77  1        000     99         0000                     1       11                      9  555555555555555555555                         444444                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .  ..       . .      ....   . ..  ......  .          .            .     .  ..  ................           .  .  ...                     . ..............    ..    ...   ..  .......    ..   ...................................... . .     ....          .  .   . .        ..        ...   .....       .     .         ..  .      .                 .  .      .      ...                                  .            ......                        .                                                            .........     ....  .             ..       .                  .                          .  .                                                 ..   .  .                      ...............                   .             .      .               ..                     ..    ..    .  .                .    . .                 ...                      ...                                                                                                                     ..          .             .                       .    .            .   .                                 .                         .   .  .     .             .  .                         .     ...   .             .                      ..  .        ...     ..         ....                     .       ..                      .  .....................                         ......                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       0  7  22       7 5      1111   7 11  777777  7          9            0     0  99  4444444444444444           9  0  888                     3 11111111111111    11    888   11  4444444    11   55555555555555555555555555555555555555 0 1     6666          0  4   2 4        99        111   55555       8     2         99  0      0                 1  7      0      000                                  0            222222                        7                                                            000000000     7777  0             22       7                  3                          7  5                                                 22   2  0                      888888888888888                   7             7      7               22                     22    22    0  2                7    0 3                 888                      333                                                                                                                     33          7             3                       3    0            3   3                                 3                         7   4  4     6             4  6                         4     666   0             4                      77  0        777     88         5555                     0       33                      3  333333333333333333333                         444444                                          
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTC-TTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ATNTTTTCTTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGG--------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
Reference ( family-692 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTC-TTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ACGTTTTCTTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGG--------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGTGTTCCCTAACAACGACATTATATCATCTATAAA-CG--GAATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---TT--TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-GGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATTTTCGA-GCCAATCGCTGTT---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAA---A--AAGCTGTGTATGTCATCAAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTGTCACCTCTGACTAACATGTTATCTCTTTTACTGAAGTAAATTTTGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTATCCAATCACACATCCTTTTCTTAGCTTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATTATGATTTAATTG--AAGGACTGAATTTGAAACTACTAAACCTAGTTCTTAACTTACA-AATCCTGTTTCCAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGG--TTATATTTTAATTTTCTATTT--ACGA--CATTTATTGTTTGTGGTTTTAAAATGGTGGT-AGATTTAAGTCTTACTATAAAGGAGATATGGATATCCTTATTGGAGAGTTTTATATATGTTCCTTCAATTCTTAACAAATTTAAGTCAAAATAAACTCTAACCCTTTTCCCAGTCAAAAAATCTCTACCTAATATCATTCTTCGATTCATGTTTGGTACCGCTAAAAAAAAGTACGACTAAATTTTTC-CCTCCCAATTCAAAATCTAATTCGAAAC-ACCCATCTACTG-TAAGTGCTCCTCCATTTACAGATTGTAATGCGATTGA-TTTCTTGCTAAGTTTCGATACATTGCGCAAAGATTGATAAAGTCTTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCCCCGGAATCCACTAAAGA--TTTATTTCTTTTTCAATTAGTTTTCAAAATACATGAACATGGACTACCTGCGATTGCAATATTTTATGTAGGA-A------TTTTATCACTCTTCACATCGGCTCGAACAGATGAAGAGCATACTAGTTTTCCTGAAGCCTTATTCTATTTTGATTGAATCCAGTTTTTGCCATGCATT------GTCTCTTAAAATGACCTTTCTTCCTACATTTCCAGCATGTGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCATCAACAAATCGAAGAATTGG-AAAAATCA----CTG-G------ACGCGT-ATTTTATTTAGCTTTCTATAGTCGACACAAAATCTC---AT--TT--TA---ACATTTTTCTTTTTGAC---TAAAACTATTGGAGA--TGCATAATATGA--------TTGT--GATT---CTT--CT-------ATAA--TGTCATGTGGT-AACATG--------T----C---------A-C--GT------CTTTGCCTTT-GTATTCTC---TGTTTGGCTTTGGGTG--TTGTCCTACATGGTCTAGAT---ATTAGAGGAATTGCATTGCCTGTTTC-AATAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCGTCTATG---CG------TGGTATGAGCCAAGAGTTG-GG-TG-TA---ATGATTTTGTTTAACTTCCTGTAATCCACACAGAA--TCTGTGTGATTTAT----CCG-CTTTCTG---CAC---TAGGACAACCGGCGAAGCCCACG--GGGAATGAGTGCGTTT--GATCACCTTT--GCTGAGAGCATAT--CTT-----------C-T---------T--------------------TTG----CTTGATCAATTAT-TTTCCTGTCATTTAA-TCGCTGTG---GGT-----ATGGTCTAGATTTCACGGGAGGA--TG-GTCACCCGTGTCT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ACATTTTCTTTATCTCTCTCCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTTCCCTGG------------------TTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTAACTCTTCGGTAATCCACATATGG--TC---GT-----GTAGATCCATTTTTCTTCCAAAC---TATAACAATGGGTGAAGCCCATG--GTGA--------GGT----ACT---TTTCGGT-------ATAACCCTT-------T-A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agacaatcttgtacgcgtggtagcggaaaatcgtctggtttaacaagtgc--------------TGATTTATCCAATATTTTGATGTGCATTCAATTTGTCTCTTAAAATGCTCATTTTCCCTACATTACAAACATGTGActcaaaatatct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggattctaggtttcctgaagccgtgttctatttA----TAG-GTGTTGTA---AT-TTGTT-TTAA-CTTTCTGCAATCAATAGCAAA--TC-------TCCATGAG-TTGTCTTTCTTTTTTAC---GAGGACAACAGGAGAATTCCg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggttgaaagTTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGGCCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACTATCGGAAAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GATC---TTT--CT-------ATAA--TTT-------T-AGG-TACAAACATCT----C---------A-CTAATTG----TTTTATCTTT-ATGTTTCCTATTGTTTT--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGAA--TT-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-TCCAGTGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGGATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTAAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTAATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCAATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTGCTCGTAATCTAATTC-AAACAAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGATTTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCCAAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAATATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGGG-TTTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATCGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGC-TCCAGCGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTTATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAAATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAAGAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACATAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCATAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAACATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGGATTTTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATTGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGTGCCAACAAGTCATCAATAAG-CG--GAAGAGG-A-AATGCA----TAATAT-TT-TG---TT-ATCGCATTGAGTTTTCTAAAGTCTACACAGAA--AC---GC--TTGGAA---CCGTCTTTCTTATCAACAATTACAACT---GGAAAGCTACAAA----AA--------GATTAAGATC---TAG--TT-------ATTA--TTC-------T-AGC-T---------TTTAAC---------ATCTCGTCGTTAACTTTGCCTAT-AACCTTTAAATTG-TTA---CGAAGTGTTCTGT-----AAGGCCTAAACTTTATCGGTGCA--TT-GTTTCCGGTGTCCAATGTCA----TACGGACAGTTTCTGTGTATCCGAGCTCAGAATCCTTATTAGCAAATATATTTATATTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taacaTGACATATT--TTG-CTTACTGACGCGA---TGCTATCTTCATGAATTCGTTCTATTCTAGCAAGTATGCAGCCCCGTTTTGA--TAATAGTTTTATCTGTTATTTAC-AGCTAAAATTA--GGATATGT-TG-CCGTTTTTTCATTTTCATG-ACAGAATTTGAAACCATCAGTCCTGGTTCAGTACTAATGTAACCACGTTCACAAC--TCGTTAATTAATAAACTGCAGCA-ATTGG--AATGTCAACGTTAT-TTTTAACCTT--ACTGGAACAAACCATTG-CAGTTTGAGGTTTTAAGATTGTGTC-ATATTTAATTCTTACAAGGGAGCAGATATAAAtggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgttgacatattttgcttactgacgcgatgctatcttcatgaattcgttctattctagcaagtatgcagccccgttttgataatagttttatctgttatttacagctaaaattaggatatgttgccgttttttcattttcatgacagaatttgaaaccatcagtcctggttcagtactaatgtaaccacgttcacaactcgttaattaataaactgcagcaattggaatgtcaacgttatttttaaccttactggaacaaaccattgcagtttgaggttttaagattgtgtcatatttaattcttacaagggagcagatataaatg
gi|5                          : taacaacagtgccaacaagtcatcaataagcggaagaggaaatgcataatattttgttatcgcattgagttttctaaagtctacacagaaacgcttggaaccgtctttcttatcaacaattacaactggaaagctacaaaaagattaagatctagttattattctagcttttaacatctcgtcgttaactttgcctataacctttaaattgttacgaagtgttctgtaaggcctaaactttatcggtgcattgtttccggtgtccaatgtcatacggacagtttctgtgtatccgagctcagaatccttattagcaaatatatttatatttttggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgtTTGCTTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATTAA-CT--GGATTTG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---GT--TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATT--CCTA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTAT-ATGTTTGCTATTGTTTA--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGATTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTTTGACTCACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGTAATCAT--AACCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTTAATAATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAAGTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTATCG-AATCTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGCTGGCAAATTTAGA--TTATATTTTAATTTTCCATTC--ACAA--CATTTACTGTTGGTGGTTTTAAAATGGTGGT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAAAAGATATGAAGtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTACTAA-CT--GGATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---GT--TTCGTA---CCATCTTT---ATCTAC---TAAAACTATCGGAGAACTCCGTG--CCTA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTAT-ATGTTTGTTATTGTTTA--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGCTTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTT-GC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGACTAAACTTTTCAGTTATTACCTTTGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGTAATCAT--AACCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT--TTGTGAATAACTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AAACTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGTTGGCAAATTTAGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACAA--CATTTACTGTTTTTGGTTTTAAAATGGTGGT-AAATTTAAGTCTTACTATAGAGAAGATATGAAG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTTTTTATCAAC---TAGAACTGTCGCAGAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATGG--TTT-------CGAACATA--------T----C---------A-CTAATTG----CTTAATCCAT-ATGTTTCCTTTTGTTTA--TTTGGGTG--TGAT-----ACAGTCTTGATTTAATCGGAGGT--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATCGTTGT-GCCAATCGCTTTG---CTTAAATCTATATCTGTTTTAGTAAATAAATCTGAATTTTCCTGT-A---A-TAGGCTTTATATGTCGTCTTAATGTGCCGTAAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGA-ATGTTCTCTTTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTT-CCTAGG-----------------TTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cAAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGA-ATGTTCTCTTTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTT-CCTAGG-----------------TTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111         111111                                       1111111111111111                                           11111111111111                    1111111         77777777777777777777777777777777777777         1111                            11        111   11111                                                                     111                                               444444                                                                                     444444444                                                                                   1                                                                                222222222222222                                                                                                                      1                 111                      222                                                                                                                     11                                                1    1                1                                 1                                                                                       333                                                     111                                                                            666666666666666666666                         111111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1  6  99       6 3      2222   5 77  000000  5          5            1     1  66  6666666666666666           4  1  777                     1 77777777777777    66    777   66  4444444    66   11111111111111111111111111111111111111 5 0     0000          5  1   0 0        11        111   22222       0     0         66  5      1                 0  5      4      000                                  1            333333                        6                                                            000000000     7777  1             99       6                  9                          6  5                                                 99   3  1                      333333333333333                   6             6      3               99                     99    99    1  2                0    1 3                 333                      333                                                                                                                     88          0             7                       3    2            7   3                                 3                         0   1  1     0             1  0                         1     444   8             1                      77  1        000     99         6  7                     1       11                      9  555555555555555555555                         444444                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .  ..       . .      ....   . ..  ......  .          .            .     .  ..  ................           .  .  ...                     . ..............    ..    ...   ..  .......    ..   ...................................... . .     ....          .  .   . .        ..        ...   .....       .     .         ..  .      .                 .  .      .      ...                                  .            ......                        .                                                            .........     ....  .             ..       .                  .                          .  .                                                 ..   .  .                      ...............                   .             .      .               ..                     ..    ..    .  .                .    . .                 ...                      ...                                                                                                                     ..          .             .                       .    .            .   .                                 .                         .   .  .     .             .  .                         .     ...   .             .                      ..  .        ...     ..         .  .                     .       ..                      .  .....................                         ......                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       0  7  22       7 5      1111   7 11  777777  7          9            0     0  99  4444444444444444           9  0  888                     3 11111111111111    11    888   11  4444444    11   55555555555555555555555555555555555555 0 1     6666          0  4   2 4        99        111   55555       8     2         99  0      0                 1  7      0      000                                  0            222222                        7                                                            000000000     7777  0             22       7                  3                          7  5                                                 22   2  0                      888888888888888                   7             7      7               22                     22    22    0  2                7    0 3                 888                      333                                                                                                                     33          7             3                       3    0            3   3                                 3                         7   4  4     6             4  6                         4     666   0             4                      77  0        777     88         7  5                     0       33                      3  333333333333333333333                         444444                                          
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTC-TTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ATNTTTTCTTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGG--------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
Reference ( family-692 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTC-TTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ATNTTTTCTTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGG--------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGTGTTCCCTAACAACGACATTATATCATCTATAAA-CG--GAATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---TT--TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-GGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATTTTCGA-GCCAATCGCTGTT---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAA---A--AAGCTGTGTATGTCATCAAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTGTCACCTCTGACTAACATGTTATCTCTTTTACTGAAGTAAATTTTGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTATCCAATCACACATCCTTTTCTTAGCTTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATTATGATTTAATTG--AAGGACTGAATTTGAAACTACTAAACCTAGTTCTTAACTTACA-AATCCTGTTTCCAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGG--TTATATTTTAATTTTCTATTT--ACGA--CATTTATTGTTTGTGGTTTTAAAATGGTGGT-AGATTTAAGTCTTACTATAAAGGAGATATGGATATCCTTATTGGAGAGTTTTATATATGTTCCTTCAATTCTTAACAAATTTAAGTCAAAATAAACTCTAACCCTTTTCCCAGTCAAAAAATCTCTACCTAATATCATTCTTCGATTCATGTTTGGTACCGCTAAAAAAAAGTACGACTAAATTTTTC-CCTCCCAATTCAAAATCTAATTCGAAAC-ACCCATCTACTG-TAAGTGCTCCTCCATTTACAGATTGTAATGCGATTGA-TTTCTTGCTAAGTTTCGATACATTGCGCAAAGATTGATAAAGTCTTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCCCCGGAATCCACTAAAGA--TTTATTTCTTTTTCAATTAGTTTTCAAAATACATGAACATGGACTACCTGCGATTGCAATATTTTATGTAGGA-AT------TTTATCACTCTTCACATCGGCTCGAACAGATGAAGAGCATACTAGTTTTCCTGAAGCCTTATTCTATTTTGATTGAATCCAGTTTTTGCCATGCATT------GTCTCTTAAAATGACCTTTCTTCCTACATTTCCAGCATGTGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCATCAACAAATCGAAGAATTGG-AAAAATCA----CTG-G------ACGCGT-ATTTTATTTAGCTTTCTATAGTCGACACAAAATCTC---AT--TT--TA---ACATTTTTCTTTTTGAC---TAAAACTATTGGAGA--TGCATAATATGA--------TTGT--GATT---CTT--CT-------ATAA--TGTCATGTGGT-AACATG--------T----C---------A-C--GT------CTTTGCCTTT-GTATTCTC---TGTTTGGCTTTGGGTG--TTGTCCTACATGGTCTAGAT---ATTAGAGGAATTGCATTGCCTGTTTC-AATAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCGTCTATG---CG------TGGTATGAGCCAAGAGTTG-GG-TG-TA---ATGATTTTGTTTAACTTCCTGTAATCCACACAGAA--TCTGTGTGATTTAT----CCG-CTTTCTG---CAC---TAGGACAACCGGCGAAGCCCACG--GGGAATGAGTGCGTTT--GATCACCTTT--GCTGAGAGCATAT--CTT-----------C-T---------T--------------------TTG----CTTGATCAATTAT-TTTCCTGTCATTTAA-TCGCTGTG---GGT-----ATGGTCTAGATTTCACGGGAGGA--TG-GTCACCCGTGTCT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ACATTTTCTTTATCTCTCTCCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTTCCCTGG------------------TTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTAACTCTTCGGTAATCCACATATGG--TC---GT-----GTAGATCCATTTTTCTTCCAAAC---TATAACAATGGGTGAAGCCCATG--GTGA--------GGT----ACT---TTTCGGT-------ATAACCCTT-------T-A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agacaatcttgtacgcgtggtagcggaaaatcgtctggtttaacaagtgc--------------TGATTTATCCAATATTTTGATGTGCATTCAATTTGTCTCTTAAAATGCTCATTTTCCCTACATTACAAACATGTGActcaaaatatct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggattctaggtttcctgaagccgtgttctatttA----TAG-GTGTTGTA---AT-TTGTT-TTAA-CTTTCTGCAATCAATAGCAAA--TC-------TCCATGAG-TTGTCTTTCTTTTTTAC---GAGGACAACAGGAGAATTCCg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggttgaaagTTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGGCCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACTATCGGAAAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GATC---TTT--CT-------ATAA--TTT-------T-AGG-TACAAACATCT----C---------A-CTAATTG----TTTTATCTTT-ATGTTTCCTATTGTTTT--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGAA--TT-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-TCCAGTGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGGATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTAAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTAATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCAATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTGCTCGTAATCTAATTC-AAACAAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGATTTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCCAAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAATATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGGG-TTTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATCGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGC-TCCAGCGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTTATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA---------------AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAAATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAAGAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACATAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCATAAATCAACAAACGA-TCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAACATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGGATTTTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATTGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGTGCCAACAAGTCATCAATAAG-CG--GAAGAGG-A-AATGCA----TAATAT-TT-TG---TT-ATCGCATTGAGTTTTCTAAAGTCTACACAGAA--AC---GC--TTGGAA---CCGTCTTTCTTATCAACAATTACAACT---GGAAAGCTACAAA----AA--------GATTAAGATC---TAG--TT-------ATTA--TTC-------T-AGC-T---------TTTAAC---------ATCTCGTCGTTAACTTTGCCTAT-AACCTTTAAATTG-TTA---CGAAGTGTTCTGT-----AAGGCCTAAACTTTATCGGTGCA--TT-GTTTCCGGTGTCCAATGTCA----TACGGACAGTTTCTGTGTATCCGAGCTCAGAATCCTTATTAGCAAATATATTTATATTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taacaTGACATATT--TTG-CTTACTGACGCGA---TGCTATCTTCATGAATTCGTTCTATTCTAGCAAGTATGCAGCCCCGTTTTGA--TAATAGTTTTATCTGTTATTTAC-AGCTAAAATTA--GGATATGT-TG-CCGTTTTTTCATTTTCATG-ACAGAATTTGAAACCATCAGTCCTGGTTCAGTACTAATGTAACCACGTTCACAAC--TCGTTAATTAATAAACTGCAGCA-ATTGG--AATGTCAACGTTAT-TTTTAACCTT--ACTGGAACAAACCATTG-CAGTTTGAGGTTTTAAGATTGTGTC-ATATTTAATTCTTACAAGGGAGCAGATATAAAtggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgttgacatattttgcttactgacgcgatgctatcttcatgaattcgttctattctagcaagtatgcagccccgttttgataatagttttatctgttatttacagctaaaattaggatatgttgccgttttttcattttcatgacagaatttgaaaccatcagtcctggttcagtactaatgtaaccacgttcacaactcgttaattaataaactgcagcaattggaatgtcaacgttatttttaaccttactggaacaaaccattgcagtttgaggttttaagattgtgtcatatttaattcttacaagggagcagatataaatg
gi|5                          : taacaacagtgccaacaagtcatcaataagcggaagaggaaatgcataatattttgttatcgcattgagttttctaaagtctacacagaaacgcttggaaccgtctttcttatcaacaattacaactggaaagctacaaaaagattaagatctagttattattctagcttttaacatctcgtcgttaactttgcctataacctttaaattgttacgaagtgttctgtaaggcctaaactttatcggtgcattgtttccggtgtccaatgtcatacggacagtttctgtgtatccgagctcagaatccttattagcaaatatatttatatttttggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgtTTGCTTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATTAA-CT--GGATTTG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---GT--TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATT--CCTA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTAT-ATGTTTGCTATTGTTTA--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGATTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTTTGACTCACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGTAATCAT--AACCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTTAATAATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAAGTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTATCG-AATCTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGCTGGCAAATTTAGA--TTATATTTTAATTTTCCATTC--ACAA--CATTTACTGTTGGTGGTTTTAAAATGGTGGT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAAAAGATATGAAGtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTACTAA-CT--GGATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---GT--TTCGTA---CCATCTTT---ATCTAC---TAAAACTATCGGAGAACTCCGTG--CCTA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----CGAGTATATCA-CTAATTG----GTTTATCTAT-ATGTTTGTTATTGTTTA--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGCTTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTT-GC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGACTAAACTTTTCAGTTATTACCTTTGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGTAATCAT--AACCTTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT--TTGTGAATAACTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AAACTTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGTTGGCAAATTTAGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACAA--CATTTACTGTTTTTGGTTTTAAAATGGTGGT-AAATTTAAGTCTTACTATAGAGAAGATATGAAG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTTTTTATCAAC---TAGAACTGTCGCAGAACTCCAAG--CTGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATGG--TTT-------CGAACATA--------T----C---------A-CTAATTG----CTTAATCCAT-ATGTTTCCTTTTGTTTA--TTTGGGTG--TGAT-----ACAGTCTTGATTTAATCGGAGGT--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATCGTTGT-GCCAATCGCTTTG---CTTAAATCTATATCTGTTTTAGTAAATAAATCTGAATTTTCCTGT-A---A-TAGGCTTTATATGTCGTCTTAATGTGCCGTAAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGA-ATGTTCTCTTTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTT-CCTAGG-----------------TTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cAAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGA-ATGTTCTCTTTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTT-CCTAGG-----------------TTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A  T  AA       T A      AGAG   T TG  ACGC    G          G            G     A  TC  TGTGTGATTTAT               T  G  AAT                     T GGGAATGAGTGC      AA    ACC   CG  TGAGAGC    CC   CATGTGGTAACATGTC                       T       TTAA          T  A              GC        TTC   CCTAC                       AT  C      T                    G      G      TAT                                  G            CAAACT                        G                                                            GTTATCTCA     TGAC  A             CA       G                  G                          A  T                                                 TC   T  T                      GTTCAGTACTAATGT                   G             T      C               CG                     GA    AC    A  C                     T T                 GGG                      .                                                                                                                       .                         A                       .    A            A   .                                 T                             T  T                   T                            A     TC    .             T                      GG  G        CGA     TG         T  A                     A       CT                      C  TAGG                                          CAATTT
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G  .  .        . T      .      . G   GTA     .          A            C     G  .   GTGTAGAT                   C  C  .                       C ATATGA            .     .     .   .          .    TAGGTACAAACATCTC                       .       .             .  G              A         T     .                           .   .      C                    .      G      .                                    A            CAAACT                        .                                                            GTTATCTCA     TGAA  A             .        .                  G                          .  T                                                 .    T  T                      GTTCTGAACTATCG                    .             .      C               .                      .     .     A  C                     T T                 TAG                      .                                                                                                                       .                         A                       .    G            A   .                                 .                             T  T                   T                            A     TC    .             T                      GG  G        CGA     TG         .  T                     T       AC                      C  TAGG                                          .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A  .  .        . T      .      . T   TA      .          C            C     T  .   TCCATGAG                   T  A  .                       T GTGA              .     .     .   .          .    TAGCTTCGAGTATATC                       .       .             .  C              .         C     .                           .   .      T                    .      T      .                                    T            AT                            .                                                            ATTTTG        TGAA  G             .        .                  G                          .  .                                                 .    T  A                      GTTCTGAACTAACG                    .             .      T               .                      .     .     G  A                     T .                 TAG                                                                                                                                                                                                                                                                                      A  A                   A                            T     CC    .             A                      GG  G        CGA     TG         .  T                     T       AC                      C  TGG                                           .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T  .  .        . T      .      . T   TG      .          G            A     A  .   GCTTGGAA                   A  T  .                       A CTGA              .     .     .   .          .    TAGCTTCGAGTATATC                       .       .             .  G              .         T     .                           .   .      G                    .      T      .                                    T            A                             .                                                            .             .     T             .        .                  .                          .  .                                                 .    T  A                      .                                 .             .      T               .                      .     .     T  T                     G .                 .                                                                                                                                                                                                                                                                                        A  A                   A                            T     CC    .             A                      .   .        .       .          .  G                     A       CT                      .  TGA                                           .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T  .  .        . .      .      . T   AA      .          T            T     G  .   GTTTCGTA                   A  A  .                       A CCTA              .     .     .   .          .    TAGCTTTTAAC                            .       .             .  G              .         T     .                           .   .      T                    .      T      .                                    T            A                             .                                                            .             .     T             .        .                  .                          .  .                                                 .    .  A                      .                                 .             .      .               .                      .     .     T  T                     G .                 .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .   .        .       .          .  G                     A       CT                      .  TGA                                           .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .      . .   AA      .          T            A     T  .   GTTTCGTA                   A  T  .                       T CCTA              .     .     .   .          .    CGAACATATC                             .       .             .  G              .         T     .                           .   .      T                    .      C      .                                    A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .            A     T  .   ATTTTA                     A  T  .                       T CTGA              .     .     .   .          .    CTT                                    .       .             .  .              .         .     .                           .   .      G                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  A  .                       A AA                .     .     .   .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGNTNCGAGCATATC**********************                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTTCG***                                                                                                                                                                    GTTCGACTACG****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CC*                                                                                                                                    TGA******************
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTT-------T-AGC-T---------T----C---------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTC-TTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAACTAACG-AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ATNTTTTCTTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGGG--------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--CCGA--------GTTT--GATC---TTT--GT-------ATAA--CTTTAGNTNCGAGCATATC----------------------A-CTAATTG----CTTTATCTAT-ATGTTTCCTATTGTTTA--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTTCG---TTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCGACTACG----AATCCTGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACC-TTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ATNTTTTCTTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCCTGA------------------TTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111         111111                                       1111111111111111                                           22222222                                                                                              111   11111                                                                     111                                               444444                                                                                     555555555                                                    11                                                                                                              6666666666666666   1111                                                                                                                    1                 111                      222                                                                                                                     11                                                1    1                1                                 1                                                                                                                                              111                                                                            444444444444444444                            111111                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1  6  99       6 3      2222   5 77  000000  5          5            1     1  66  6666666666666666           4  1  777                     1 11111111      66       66      66      1 888 1   9999        0          5   1   0 0       8888        111   22222       0     0         66  5      1             7      5      4      000                                  1            333333                        6                                                            000000000     7777  1             99       6                 00                      7   6  7                                                 99   3  1                      8888888888888888   4444  6              6             6      3               99                     99    99    1  2                0    1 3                 333                      333                                                                                                                     88          0             7                       3    2            7   3                                 3                         0   1  1     0             1  0                         1     6    8             1                      77  1        000     99         6  7                     1       11                         222222222222222222                            444444                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .  ..       . .      ....   . ..  ......  .          .            .     .  ..  ................           .  .  ...                     . ........      ..       ..      ..      . ... .   ....        .          .   .   . .       ....        ...   .....       .     .         ..  .      .             .      .      .      ...                                  .            ......                        .                                                            .........     ....  .             ..       .                 ..                      .   .  .                                                 ..   .  .                      ................   ....  .              .             .      .               ..                     ..    ..    .  .                .    . .                 ...                      ...                                                                                                                     ..          .             .                       .    .            .   .                                 .                         .   .  .     .             .  .                         .     .    .             .                      ..  .        ...     ..         .  .                     .       ..                         ..................                            ......                                          
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       0  7  22       7 5      1111   7 11  777777  7          9            0     0  99  4444444444444444           9  0  888                     3 11111111      11       11      11      0 666 1   5555        1          0   4   2 4       0000        111   55555       8     2         99  0      0             3      7      0      000                                  0            222222                        7                                                            222222222     7777  0             22       7                 33                      3   7  3                                                 22   2  0                      2222222222222222   2222  7              7             7      7               22                     22    22    0  2                7    0 3                 888                      333                                                                                                                     33          7             3                       3    0            3   3                                 3                         7   4  4     6             4  6                         4     4    0             4                      77  0        777     88         7  5                     0       33                         111111111111111111                            444444                                          
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--C----CGAGTTT--GATCTTT--GTATAA--CTTTAGCTTCGAGCAT---ATCACTAATTGCTTTATCTA-TATGTTTCCTATTGTTT-A--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTTATCTC-TTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCT-AAC-T-A-CGAAT----CC-TGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ATNTTTTCTTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCC------------------TGGTTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
Reference ( family-692 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATNAA-CG--GAATTGG-ATAAGCCA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAANCTTTCTATAATCNACACANAA--TC---GT--TTCGTA---CCGTCTTTCTTATCNAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--C----CGAGTTT--GATCTTT--GTATAA--CTTTAGNTNCGAGCAT---ATCACTAATTGCTTTATCTA-TATGTTTCCTATTGTTT-A--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCNGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAGTCGCTCTA---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGNATTTTCCTGTAA---A-TAAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTCCGACTGACATGTT---TCGTTTAATGAAGTNAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTTCTTAGCCTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTACNGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTC--GAC-T-A-CGAAT----CC-TGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACGA--CATTNACCGTTTGTGGTTTTAAAACGGTGNT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAGGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTACGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGCGAAAAGAGTGATAAATTCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCTTA-TTCTTATTCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ATNTTTTCTTTATCTCTCTTCGTANCGGCCTGNTTATACGAAGAGAACACTAGTTTCCC------------------TGATTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGTGTTCCCTAACAACGACATTATATCATCTATAAA-CG--GAATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-TA---AT-ATTTTATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---TT--TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATG--C----CGAGTTT--GATCTTT--GTATAA--CTTTGGCT------------TCACTAATTGCTTTATCTA-TATGTTTCCTATTGTTT-A--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGGA--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATTTTCGA-GCCAATCGCTGTT---CCTAAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAA---A--AAGCTGTGTATGTCATCAAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTGTCACCTCTGACTAACATGTTATCTCTTTTACTGAAGTAAATTTTGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTATCCAATCACACATCCTTTTCTTAGCTTAAGAGTTTT-TTTGTGAATTATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATTATGATTTAATTG--AAGGACTGAATTTGAAACTACTAAACCTAGTTCTTAACTT-A-CAAAT----CC-TGTTTCCAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGGCAAATCTGGG--TTATATTTTAATTTTCTATTT--ACGA--CATTTATTGTTTGTGGTTTTAAAATGGTGGT-AGATTTAAGTCTTACTATAAAGGAGATATGGATATCCTTATTGGAGAGTTTTATATATGTTCCTTCAATTCTTAACAAATTTAAGTCAAAATAAACTCTAACCCTTTTCCCAGTCAAAAAATCTCTACCTAATATCATTCTTCGATTCATGTTTGGTACCGCTAAAAAAAAGTACGACTAAATTTTTC-CCTCCCAATTCAAAATCTAATTCGAAAC-ACCCATCTACTG-TAAGTGCTCCTCCATTTACAGATTGTAATGCGATTGA-TTTCTTGCTAAGTTTCGATACATTGCGCAAAGATTGATAAAGTCTTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCCCCGGAATCCACTAAAGA-TTTATTTCTTTTTCAATTAGTTTTCAAAATACATGAACATGGACTACCTGCGATTGCAATATTTTATGTAGGA-AT------TTTATCACTCTTCACATCGGCTCGAACAGATGAAGAGCATACTAGTTTTCCTGAAGCCTTATTCTATTTTGATTGAATCCAGTTTTTGCCATGCATT------GTCTCTTAAAATGACCTTTCTTCCTACATTTCCAGCATGTGA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCATCAACAAATCGAAGAATTGG-AAAAATCA----CTG-G------ACGCGT-ATTTTATTTAGCTTTCTATAGTCGACACAAAATCTC---AT--TT--TA---ACATTTTTCTTTTTGAC---TAAAACTATTGGAGA--TGCATAATA----TGATTGT--GATTCTT--CTATAA--TGTCATGTGGTAACAT---GTCAC--GT--CTTTGCCTT-TGTATTCTC---TGTTT-GGCTTTGGGTG--TTGTCCTACATGGTCTAGAT---ATTAGAGGAATTGCATTGCCTGTTTC-AATAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCGTCTATG---CG------TGGTATGAGCCAAGAGTTG-GG-TG-TA---ATGATTTTGTTTAACTTCCTGTAATCCACACAGAA--TCTGTGTGATTTAT----CCG-CTTTCTG---CAC---TAGGACAACCGGCGAAGCCCACG--GGGAATGAGTGC--G---TTT--G-ATCA--CCTTTGCTGAGAGCAT---ATCTTCTTTTGCTTGATCAATTAT-TTTCCTGTCATTTAA--TCGCTGTG---GGT-----ATGGTCTAGATTTCACGGGAGGA--TG-GTCACCCGTGTCT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTAGGA-ACATTTTCTTTATCTCTCTCCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTTCCC------------------TGGTTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTAACTCTTCGGTAATCCACATATGG--TC---GT-----GTAGATCCATTTTTCTTCCAAAC---TATAACAATGGGTGAAGCCCATG--G----TGAGGT----ACTTTTCGGTATAACCCTTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agacaatcttgtacgcgtggtagcggaaaatcgtctggtttaacaagtgc------------------TGATTTATCCAATATTTTGATGTGCATTCAATTTGTCTCTTAAAATGCTCATTTTCCCTACATTACAAACATGTGActcaaaatatct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggattctaggtttcctgaagccgtgttctatttA----TAG-GTGTTGTA---AT-TTGTT-TTAA-CTTTCTGCAATCAATAGCAAA--TC-------TCCATGAG-TTGTCTTTCTTTTTTAC---GAGGACAACAGGAGAATTCCg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggttgaaagTTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGGCCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACTATCGGAAAACTCCAAG--C----TGAGTTT--GATCTTT--CTATAA--TTTTAGGTACAAACAT---CTCACTAATTGTTTTATCTT-TATGTTTCCTATTGTTT-T--TCTGGGTG--CGGT-----ACGGTCTTGATTTAATCGGAGAA--TT-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-TCCAGTGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGGATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTAAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTAATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA----------------AAT----CC-TGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAGATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAACAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACCTAATATAGTTCTTCAATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTGCTCGTAATCTAATTC-AAACAAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGATTTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCCAAAATCAACAAACGATCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAATATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGGG-TTTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATCGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGC-TCCAGCGGCTCTA---TCTTAATCTAAATCTGTTTTAGCAAATAAATCTGAATTTTCCTGTAACAAACTAAACTATGTATGTCGTCTAACTGT-TCGCTAGGTGCCGCAATATTCTCACGATTAAACTTTTCAGTTATCAGCTCCGACTGACAT---------TTTAA----GTAAATTTAGCATCTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGCAATCACGCAACCCTTGCTTAGCCTAAGAGTTTT-TT-GTGAATTATTTATTAACATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATAA--AAGTACTGAATTTGAAACTACTAAACTTA----------------AAT----CC-TGTTTCTAACGGTC-TTATTTCATAATC-ACAACGCGTTGACAAATCTGGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--AAGA--CATTAATCGTTTGTGGTTTTAGAACGGTGTTTAGATTTAAGTCTTACTA----AGAAATATGAAGGTCCTCTTC---CATTTTTACGTAAATTCCTTCAATTCTTAAGAAAATTAGATCAAAATAAACTTTAACCTTTTTCTCAGTCAAAAATTCTCTACATAATATAGTTCTTCGATTCATGTTTAATACCCC--ATAAAAAGTATGACTAAATTTTTTACCTCCTTACTCGTAATCTAATTC-AAACGAACCATCCACTGATAA-TTTTCACCCATTGATATATTGTAATGCGATTGA-TTTTTTGCTTAGTTTCGGTACATTGTGAATAGTGTGGTCAATTCGTCTATGTTATCATGAAATTTCTGCTCATAAATCAACAAACGATCTTA-TCCTCATTCCATTTGTTTTCAAAATGCATGAACATA------TTGCAAT----ATTT--TATGTAGGATTTTTTTTCCTTATCTCTCTTCATATTGGCCTGACTATATGAAGAGAATACTAGTTTCCC------------------TGACTGACCTCAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACAGTGCCAACAAGTCATCAATAAG-CG--GAAGAGG-A-AATGCA----TAATAT-TT-TG---TT-ATCGCATTGAGTTTTCTAAAGTCTACACAGAA--AC---GC--TTGGAA---CCGTCTTTCTTATCAACAATTACAACT---GGAAAGCTACAAA--------AAGATTAAGATCTAG--TTATTA--TTCTAGCTTTTAACATCTCGTCGTTAA---CTTTGCCTA-TAACCTTTAAATTG-TT-A---CGAAGTGTTCTGT-----AAGGCCTAAACTTTATCGGTGCA--TT-GTTTCCGGTGTCCAATGTCA----TACGGACAGTTTCTGTGTATCCGAGCTCAGAATCCTTATTAGCAAATATATTTATATTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taacaTGACATATT---TTGCTTACTGACGCGA---TGCTATCTTCATGAATTCGTTCTATTCTAGCAAGTATGCAGCCCCGTTTTGA--TAATAGTTTTATCTGTTATTTAC-AGCTAAAATTA--GGATATGT-TG-CCGTTTTTTCATTTTCATG-ACAGAATTTGAAACCATCAGTCCTGGTTC---AG-T-A-CTAATGTAACCACGTTCACAAC--TCGTTAATTAATAAACTGCAGCA-ATTGG--AATGTCAACGTTAT-TTTTAACCTT--ACTGGAACAAACCATTG-CAGTTTGAGGTTTTAAGATTGTGTC-ATATTTAATTCTTACAAGGGAGCAGATATAAAtggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgttgacatattttgcttactgacgcgatgctatcttcatgaattcgttctattctagcaagtatgcagccccgttttgataatagttttatctgttatttacagctaaaattaggatatgttgccgttttttcattttcatgacagaatttgaaaccatcagtcctggttcagtactaatgtaaccacgttcacaactcgttaattaataaactgcagcaattggaatgtcaacgttatttttaaccttactggaacaaaccattgcagtttgaggttttaagattgtgtcatatttaattcttacaagggagcagatataaatg
gi|5                          : taacaacagtgccaacaagtcatcaataagcggaagaggaaatgcataatattttgttatcgcattgagttttctaaagtctacacagaaacgcttggaaccgtctttcttatcaacaattacaactggaaagctacaaaaagattaagatctagttattattctagcttttaacatctcgtcgttaactttgcctataacctttaaattgttacgaagtgttctgtaaggcctaaactttatcggtgcattgtttccggtgtccaatgtcatacggacagtttctgtgtatccgagctcagaatccttattagcaaatatatttatatttttggctacgagtgatgaaattcgttctttatgctccaatggcactttaatatcatcagctatttcttgattctccgtcctagatgtagctctttccttattttgtTTGCTTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTATTAA-CT--GGATTTG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---GT--TTCGTA---CCATCTTTCTTATCTAC---TAGAACTATCGGAGAACTCCATT--C----CTAGTTT--GATCTTT--GTATAA--CTTTAGCTTCGAGTAT---ATCACTAATTGGTTTATCTA-TATGTTTGCTATTGTTT-A--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGATTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCATTTTTGC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGATTAAACTTTTCAGTTATCACCTTTGACTCACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGTAATCA--TAACCTTTTCTTAGCCTAAGAG-TTT-TTTGTTAATAATTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAAGTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAAC-T-ATCGAAT----CT-TGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGCTGGCAAATTTAGA--TTATATTTTAATTTTCCATTC--ACAA--CATTTACTGTTGGTGGTTTTAAAATGGTGGT-AGATTTAAGTCTTACTATAGAAAAGATATGAAGtg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTGCGTTCCCTTACAACGACAATATATCATCTACTAA-CT--GGATTGG-ATAAGCTA----TAG-GT-TT-AA---AT-ATTTGATTAATCTTTCTATAATCAACACATAA--TC---GT--TTCGTA---CCATCTTT---ATCTAC---TAAAACTATCGGAGAACTCCGTG--C----CTAGTTT--GATCTTT--GTATAA--CTTTAGCTTCGAGTAT---ATCACTAATTGGTTTATCTA-TATGTTTGTTATTGTTT-A--TCTGGGTG--TGAT-----ACGGTCTTGCTTTAATCGTAGGA--CG-ATTTCCTGTATCTAATGTCA-TTTTGC-GCCAATTGTCCTA---CCTAAAACTAAAGCTGGTTTAGCAAATAAATCTGTATTTTCCTGTAA---A--AAGCTATGTATGTCGTCTAAATGT-TCGCTAGGTGCCGTAATATCCTTACGACTAAACTTTTCAGTTATTACCTTTGACTGACATGTTATCTCATTTAATGAATTTAATTTAGCATGTT--TTAGTTT-TTCAACTTTTGTAATCA--TAACCTTTTCTTAGCCTAAGAG-TTT-TTTGTGAATAACTAATTAGCATTACCGGAAATGTATGATCATGATTTAATTG--AAGTGCAGAATTTGAAACTACTAAACCTGGTTCTGAAC-TAA-CGAAA----CT-TGTTTCTAACGGTC-TTATTTCAAAATC-ACAACATGTTGGCAAATTTAGA--TTATATTTTAATTTTCCATTT--ACAA--CATTTACTGTTTTTGGTTTTAAAATGGTGGT-AAATTTAAGTCTTACTATAGAGAAGATATGAAG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTTTTTATCAAC---TAGAACTGTCGCAGAACTCCAAG--C----TGAGTTT--GATCTTT--GTATG--------GTTTCGAACAT---ATCACTAATTGCTTAATCCA-TATGTTTCCTTTTGTTT-A--TTTGGGTG--TGAT-----ACAGTCTTGATTTAATCGGAGGT--TG-ATTTCCGGTATCTAATGTCATCGTTGT-GCCAATCGCTTTG---CTTAAATCTATATCTGTTTTAGTAAATAAATCTGAATTTTCCTGT-A---A-TAGGCTTTATATGTCGTCTTAATGTGCCGTAAGGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCTTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGA-ATGTTCTCTTTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTTCCT------------------AGGTTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cAAAGAGTGATAAATCCGTCTATGTAATAATGAAATTTCCGCTCCAGAATCAACTAACGACCTTA-TTCTTATCCCATTAGTTTTCAAAATGCATGAACATGGGCTGCCTGCAATCGAAATTTTGTACGTTGGA-ATGTTCTCTTTATCTCTCTTCGTAACGGCCTGCTTATACGAAGAGAACACTAATTTCCT------------------AGGTTGGCCTTAGATTTTGATCTGCATT------GTCGCTTAAAATGACCCTTCTTCCTACATTTCCAACATGTGA