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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGGGTTTGTGTACACGTTTACAGAAA--TCTGTAAA------TG------TGc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gggctggTAGGGCT---GT-CATGTTTACTGATT--TCTGTAAA------CG------TGT-TCACGAAC-ACTAATTAAAG-ATATG--CTT-CC-A-TTTACA-------C---------------A--------TTGTTCAAACCTGGGTG------------T-------------TT--------------T---GTTTGTGCATTATCT----AAGCTGTA----CAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGAT-ATTGGAGATTTGA-------------------ATCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCA-ATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAataaatgacacacctccgtttacatgatgttcaaacctgagtgttttgtatgtgcattatctaagtttacagctaattactagtaagttttgaaattactctggctccgtgaatctaactccacagtcataatgattattaatgccgtgaaacacacaagatggttggaaaatattcaataacagactgttacttcgtcaaacaatctatatactaatttaccaagtttattggggtttagagtcaagatagtgtacactgattttaaattagtaaatgtgtattgcatttaaacgacacagatctgttaacacgtttaaacgtgacagccc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGGGCT---GT-CATGTTTACTGATT--TCTGTAAA------CG------TGT-TCACGAAC-ACTAATTAAAG-ATATG--CTT-CC-A-TTTACA-------C---------------A--------TTGTTCAAACCTGGGTG------------T-------------TT--------------T---GTTTGTGCATTATCT----AAGCTGTA----CAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGAT-ATTGGAGATTTGA-------------------ATCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCA-ATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAttatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGGGCT---GT-CATGGTTACTGATT--TCTGTAAA------CG------TGT-ACATGAAT-GCTAATAAAAA-AAACAAGCCT-CC-A-TTTATA-------C---------------A--------T-------------TA-------------T-------------TTAAACCTGGATGTTGT---GTATGTGCATTATCTTTTAAAGTTGTATTTACAGCTAATTACTTGT------AGAT---------ACCATAAATGTTTAAATAACTCCCCAAACAAATGGCTGACA----TGT--CACTCATGAC-ATTGCAATTTTGAAATttatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttagc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAGGACT---GT-CATGTTTACATATT--TCTGTAAA------CA------TGT-ACACGGAC-ACTAATAAACA-ACACG--CCT-AT-GATCTATA-------T---------------A--------tttgtgaaattttctttgaaaaaacacacctgttatatagtacttctgttctgtgaata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cTAGGGCT---GT-CACGCTAACACA------TGTAAA------TG-------G--ACCCATGTCGTTTAAAAGCA-ATACA--C------G-TTTACA-------A---------------A--------T--------------T-------------TAATA---------TC--------------C---GTGTA--CACTACCT----AAGTTActaatttaacaaatttactggggtttaggttgtgaacacaggtattaaattattataacgtatattgcttttaaatgacacagacccatttacacgggtaaatgtgacagccct
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                         tgacattgcggatagtttcaaattatatcattaagctgaacgtcatagcttatgatgttttagaattattacatatttttaaactatacaaacgatctttcataggatgtcacAGTGCT---GT-CACGTTTACAGATT--TCTGTAAA------TG------TTT-ACTCGAAC-GCTCATAAACG-ACACG--CCT-CA-G-TTTACA-------CCAAGTTCAAAGCTGGG--------T-------------GT-------------T-------------TTAGT-----------T---GTATGTGCATTTTTTT---AAATTGTTTTTACAGCTAATTAATAGT------ATAC---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCAACAAACAAATGGCTGACA----TGT--TGCTCATGAC-ATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCCTGAATCTAACTCGACAGACATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAGGATGGTTGGA--AAATATTAGATATTAGCCTGTTACTTTGTCAAACGATCTTTGTACTAATTTACCAAATTTACTTGGGTCTAGGGTCAAGATAATGTACACGGATAT---TAAATTA--GT-AA--ATGTGTATTGCTTTTAAACGACACAG--ATC-CGTTTACAG-A----TG--TAAACATGACAGCattgaaaggtaatatatttgattcatttaaaaaacttcatat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGGGCT---GT-CATGTTTACAGATT--TCTGTAAA------CG------TGT-ACACGAAG-GCTAGTTAACG-ACACG--CAT-CC-G-TTTACA--------------------------------T-------------GA-------------T-------------TT--------------TCAAATCTAGGTGTTATGT----G--CTGTTTTTACAGCTAATTACTAAT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTCGCCAAACAAATGGCTGACA----TGT--CACTCATAAC-ATTGCTGTTTTGAAATTACTCTTACTCAGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATAATTATT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTCA-GTAACAGCCATTTACTTCGTCAAATGATCTATATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCTAAGGTCAAGGTAGTGTACACAGATAT---TAAATTA--GT-AA--ATGTGTATTGCTTTTAAACGACACGG--ATC-CATTTACAC-G----TG--TAAACGTGACAGCC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGGGCT---GT-CACATTTACACA------TGTAAA------TGGATCCATGTCATTTAAAA-GC-AATACATGTATA-A--TAT-CC-G-TGTACA-------C---------------c
gi|17                         :                               tagggctgtcacagatttctgtaaacgtgtacacaaacgctaataaacaacatgcctctgtttacatgttgttcaaacctgggtgttttgtatgtgcattatcaaagttgtatttacagctaataactcgtatataccgtaaatgtttaaataacttgccaaactaatggttgacatgtccctcatgacattgcagttttgaaataatggttctgtggatcagtcataatgattattaatgctgtggatggttagaaaatattatataacagcctgttacttcgtcaaacgagctatatactaatttaccaaattaactgcggtctaggtaAGGGCT---GT-CACGTTTACCGCTT--TCTGTAAA------CG------TGT-ACACAACC-ACTTATAAACG-GCACG--CCT-CT-G-TTTACA-------C---------------C--------TGG-----------GTG------------T-------------TT--------------T---GCATGTGCATTATCC----AAGTTGTATTTTCAGCTAATTAACAGT------ATAC---------ACCATAAATGTTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGGCCT---GT-CACGTTTACAGATT--TCTGTAAA------CA------TGT-ACATGAAC-ACAAATAAATG-ACACG--CCT-CC-G-TTTACA-------TG--------------A--------T-------------GTTTAAACCTGGATGT-------------TT--------------T---ATATGTGCATTTTCT----AAGTTTTATTTACAACTAATTACTAGT------ATAC---------A
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGCT---GT-CACATTTACA------TGTGTTAA------TGGATCCATGTCATTTAAAA-GC-AATACACGTATA-A--TAT-CT-G-TGTACA-------C---------------
gi|9                          :                tagggctgtcacagatttctgtaaacgtgtacacgaacgctaataaacaacatgcctctgtttacatgttgttcaaacctgggtgttttgtatgtgcattatcaaagttgtatttacagctaacaacttgtatatatcgtaaatgtttaaataacttgccaacttaatggttaacatgtcgctcatgacattgcagttttaaaataatggttctgtggatctaaatacgcagtcataatgattatttatgctgtggatgattagaaaatattcaataacagcctgttacttcgtcaaacgatctatatactaatttaccaaattaactgcggtctagggcctaggtaGGGCT---GG-CACATTTACAGATT--TCTGTAAA------CG------TGT-ACACAAAC-CCTAATAAATG-ACACA--CCT-CC-G-TTTACA-------TG--------------A--------T-------------GT-------------TCAAACCTGAGTGTTT--------------T---GTATGTGCATTATCT----AA-----GTTTACAGCTAATTACTAGT------A
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCT---GT-CATGTTTACA------TCTGTAAACGGATCTG------TGTCGTTTAAAA-GC-AAT------ACACA--TTTACTAA-TTTA-------------------------A--------T-------------AT-------------C-------------CG--------------T---GTA----CATTATCT----agttttgaaattactctggctccgtgaatctaactccacagtcataatgattattaatgccgtgaaacacacaagatggttggaaaatattcaataacagactgttacttcgtcaaacaatctatatactaatttaccaagtttattggggtttagagtcaagatagtgtacactgattttaaattagtaaatgtgtattgcatttaaacgacacagatctgttaacacgtttaaacgtgacagccc
gi|18                         : agtgctgtcacgtttacagatttctgtaaatgtttactcgaacgctcataaacgacacgcctcagtttacaccaagttcaaagctgggtgttttagttgtatgtgcatttttttaaattgtttttacagctaattaatagtatacactgtaaatgtttaaataactcaacaaacaaatggctgacatgttgctcatgacattgcagttttgaaataactctggctccctgaatctaactcgacagacataatgattattaatgccgtgaaacacacaaggatggttggaaaatattagatattagcctgttactttgtcaaacgatctttgtactaatttaccaaatttacttgggtctagggtcaT---GTACATGTTTACAGAAA--TCTGTAAA------CG------TG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aggcctgtTTTACATGTTGTTATGTAAA------CG---------------AAC-TCTAATAA-CG-ACACG--CCT-CA-G-TTTACAAGTTGTTC---------------AAACCTGAGT-------------GT-------------T-------------TT------------------GTATATGCATTATCT----AAATTGTATTTACAGCTAATTACTTGA------ATAT---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCACCAAA-AATTGGCTGACAAAAGTAT--CGCTCATGAC-ATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCTACAGTCATAATGATTAAT-AATGCCGTGAAACACACAAGAATGGTTGGAA-AATATTCA-ATAACAGCCTGTAACTTCGTCAAACGATAGTTTCACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTTTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TAtgaacacaaataaatgacacgcctccgtttacatgatgtttaaacctggatgttttatatgtgcattttctaagttttatttacaactaattactagtataca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aTTTACATGTTGTTATGTAAA------CG---------------AAC-TCTAATAA-CG-ACACG--CCT-CA-G-TTTACAAGTTGTTC---------------AAACCTGAGT-------------GT-------------T-------------TT------------------GTATATGCATTATCT----AAATTGTATTTACAGCTAATTACTTGA------ATAT---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCACCAAA-AATTGGCTGACAAAAGTAT--CGCTCATGAC-ATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCTACAGTCATAATGATTAAT-AATGCCGTGAAACACACAAGAATGGTTGGAA-AATATTCA-ATAACAGCCTGTAACTTCGTCAAACGATAGTTTCACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTTTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a--TCTGTAAA------CA------TGT-ACACGAAT-GCTAATAAACA-ACATG--CCT-CC-G-TTTACA-------T---------------G--------TTTAATCCTTG---GTG------------T-------------TT--------------T---GTATGTGCATTATCT----AAGTTGTATTTACATCTTATTACCAGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTCAATAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----TGT--CGTTCATGAC-ATTGCAATTTTGAAATAACTCTGGTTTGGTTAATCTAACTACACAGTCATGATGATTATT-AATGTCGTGAAACATACAAGGAAGGTTGGAA-AATATTCA-ATAACAGCCTGTTACTCCGTCAAATGATTTATA---CAATTTACCAAATTTACGGAGGTTTAGGGTCATGGTAGTGTATACGGATAT---TAAATTA--GT-AA--A--CGTGT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TTTGTAAA------CG------TGT-ATT------GCTTTTAAACG-ACATG--GGT-CC-A-TTTACA-------T---------------G--------T-------------GT-------------T-------------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                            tgacattgcggatagtttcaaattatatcattaagctgaacgtcatagcttatgatgttttagaattattacatatttttaaactatacaaacgatctttcataggatgtcactaacttaggtagtgtacacggatattaaaTAAA------CG------TGT-ACATGAAC-ACTAATAAACA-ACACG--CCT-CC-A-TTTATA-------CG--------------A--------T-------------GT-------------TCAAACCTGGGTGTTT--------------T---GTATATGCATTATCT----CAGTTGTATTTACAGATACTTACTAGT------ATAC---------ACCATACATGTTTAAATAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----TGT--CACTCATGAC-ATTGCAGTTTTGAAATAAATCTGGCTCTGTGAATCTAACTTCAAAGTCATAATGATTATTAAATGCGGTGAAATACACAAGGATGATTAGAA-AATATTCA-ATAACAGCCAGTTCCTTCTTCAAACAATCTATA-A------TACCAAATTTACTTGGGTCTAAGGTCATGGAAGTGTACACAGATATTAGTAAATTA--GT-AAACA--TGTATTACTTTTAAACGACTCGA--ATC-CATTTACAC-G----TG--TAAATGCGACAGCCagcgtgacagccctaattgaaaggtaatatatttgattcatttaaaaaacttcatat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ------TGT-ACATGAGC-GCTAATAAACG-ACACA--CCT-Ct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtcactTTAATTAACTCCTCAAACAAATGGCTGACA----TGT--CGCTCATGAC-AATGCAATTTTGAAAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAATAACTCCCCAAACAAATGGCTGACA----TGT--CACTCATGAC-ATTGCAATTTTGAAATtttgtgaaattttctttgaataa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----TGT--CGCTGATGAC-ATTGCAATTTTGAAATAACTCTTGCTCTGTGAATCTAACTACACAGTCATAGCGATTATT-AATGCCATGAAAC--ACACGGATGGTTGGAA-AATATTCA-ATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACAATCTTTAAACTAATTTACCAAATTAACAAGt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCTAATTACTAGTA-AGTTTTGAAATTACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAG-ATGGTTGGAA-AATATTCA-ATAACAGACTGTTACTTCGTCAAACAATCTATATACTAATTTACCAAGTTTATTGGGGTTTAGAGTCAAGATAGTGTACACTGATTT---TAAATTA--GT-AA--ATGTGTATTGCATTTAAACGACACAG--ATC-TGTTAACAC-G----TT--TAAACGTGACAGCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gggctggcacatttacagatttctgtaaacgtgtacacaaaccctaataaatgacacacctccgtttacatgatgttcaaacctgagtgttttgtatgtgcattatctaagtttacaATGATCTATATACTAATTTAACAAATTTACTGGGGTTTAGGTT-------GTGAACACAGGTAT---TAAATTATTAT-AAC-G--TATATTGCTTTTAAATGACACAG--ACC-CATTTACAC-G----GG--TAAATGTGACAGCCc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctaggactgtcatgtttacatatttctgtaaacatgtacacggacactaataaacaacacgcctAGGTAGTGTACACGGATAT---TAAATTT--GT-AA--ACGTGTATTGCTTTTAAACGACATGG--GTC-CATTTACAT-G----TG--TTAGCGTGACAGCCct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgacattgcggatagtttcaaattatatcattaagctgaacgtcatagcttatgatgttttagaattattacatatttttaaactatacaaacgatctttcataggatgtcactaacttT---TAAATGA--ATCAA--A--TATATTACCTTTCAAT--TAGGGCTGTCACGCTAACAC-A----TG--TAAATG-GACctaattgaaaggtaatatatttgattcatttaaaaaacttcatat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgacattgcggatagtttcaaattatatcattaagctgaacgtcatagcttatgatgttttagaattattacatatttttaaactatacaaacgatctttcataggatgtcactaacttaggtagtgtacacggatattaaatttgtaaacgtgtattgcttttaaacgacatggTAAATGACACGC--CTC-CGTTTACATGA----TGTTTAAACCTGaaaacttcatat
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aggcctgtcacgtttacagatttctgtaaacatgtacatgaacacaaa-CATTTACAG-AAATCTG--TAAACGTGACAGCgatgttttatatgtgcattttctaagttttatttacaactaattactagtataca
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agt-CGTTTACAG-AAATCTG--TAAACATGACAGCCtttactcgaacgctcataaacgacacgcctcagtttacaccaagttcaaagctgggtgttttagttgtatgtgcatttttttaaattgtttttacagctaattaatagtatacactgtaaatgtttaaataactcaacaaacaaatggctgacatgttgctcatgacattgcagttttgaaataactctggctccctgaatctaactcgacagacataatgattattaatgccgtgaaacacacaaggatggttggaaaatattagatattagcctgttactttgtcaaacgatctttgtactaatttaccaaatttacttgggtctagggtcaagataatgtacacggatattaaattagtaaatgtgtattgcttttaaacgacacagatccgtttacagatgtaaacatgacagc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ag-CGTTTACAG-AAAGCGG--TAAACGTGACAGCCtgtacacgaaggctagttaacgacacgcatccgtttacatgattttcaaatctaggtgttatgtgctgtttttacagctaattactaatatataccgtaaatgtttaaataactcgccaaacaaatggctgacatgtcactcataacattgctgttttgaaattactcttactcagtgaatctaactccacagtcataataattattaatgccatgaaacacacaaggatggttggaaaatattcagtaacagccatttacttcgtcaaatgatctatatactaatttaccaaatttactggggtctaaggtcaaggtagtgtacacagatattaaattagtaaatgtgtattgcttttaaacgacacggatccatttacacgtgtaaacgtgacagccc
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TAGACAGGAACATACATATTAAAGTATCATA






Alignments
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Reference ( family-6457 )     :                                                                TAGGGCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAAT--AAACGACACGCCTCCGTTTACAC---------------G-T-------------GT-------------T-------------TT--------------TGTATGTGCATTATCT----AAGTTGTATTTACAGCTAATTACTAGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTCGCCAAACAAATGGCTGACA----TGT--CGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTNTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TAAATTA--GTAAA-GTGTATTGCTTTTAAACGACACGGATCCGTTTACACGTGTAAACGTGACAGCC
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gi|21                         :                                                                                              ACTTGTACATGAGCGCTAAT--AAACGACACACCTCt
gi|3                          :                                                             gtcTAGGGCTGTCATGTTTACAGATTTCTGTAAATGTGTACTCAAATGCTAAT--AAACGACACACCTCTGTTTACAC---------------A-T-------------GT-------------T-------------TT--------------TGTATATGCATTATCT----AAATTATATTTACAGCTAATTACTCGT------ATAT---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCACCAAACAATTGGCTGACA----TGT--CGCTCATGACAGTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCTATAGTCATAATGATTAAT-AATGCCGTGAAACAAACAAGGATGGTTGAAATAAAAATCAATAACAGCCTGTTACTTAGTCAAACGATCTATATACTAATTTACCAAATTTACAGGGGTCTAGGGTCAAGATAGTGTACAAGGATAT---TAAATTA--ATAAA--TGTATTGCTTTTAAATGACACGGATCCGTTTACACATGTAAACGTGACAGCC
gi|4                          :                                                                TAGGGCTGTCAC------AGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAAT--AAACAACATGCCTCTGTTTACAT---------------G-TTGTTCAAACCTGGGTG------------T-------------TT--------------TGTATGTGCATTATCA----AAGTTGTATTTACAGCTAACAACTTGT------ATAT---------ATCGTAAATGTTTAAATAACTTGCCAACTTAATGGTTAACA----TGT--CGCTCATGACATTGCAGTTTTAAAATAA---TGGTTCTGTGGATCTAAATACGCAGTCATAATGATTATT-TATGCTGT-----------GGATGATTAGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTATATACTAATTTACCAAATTAACTGCGGTCTAGGGCCTAGGTAGTGTACACAGATAT---TATAC----------GTGTATTGCTTTTAAATGACATGGATCCATTAACACATGTAAATGTGACAGCC
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gi|6                          :                                                                TAGGGCTGTCAC------AGATTTCTGTAAACGTGTACACAAACGCTAAT--AAACAACATGCCTCTGTTTACAT---------------G-TTGTTCAAACCTGGGTG------------T-------------TT--------------TGTATGTGCATTATCA----AAGTTGTATTTACAGCTAATAACTCGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTTGCCAAACTAATGGTTGACA----TGT--CCCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAA---TGGTTCTGTGGAT---------CAGTCATAATGATTATT-AATGCTGT-----------GGATGGTTAGAA-AATATTATATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGAGCTATATACTAATTTACCAAATTAACTGCGGTCT-------AGGTAGTGTACACGGATAT---TA--------TACA--TGTATTGCTTTTAAATGACATGGATCCATTTACATGTGTAAATGTGACAGCCt
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gi|8                          :                                                                TAGGGCTGTCATGTTTACTGATTTCTGTAAACGTGTTCACGAACACTAAT--TAAAGATATGCTTCCATTTACAC---------------A-TTGTTCAAACCTGGGTG------------T-------------TT--------------TGTTTGTGCATTATCT----AAGCTGTA----CAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGATATTGGAGATTTGAA-------------------TCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCAATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAttatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttagc
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGTTTTGAAATTACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAG-ATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGACTGTTACTTCGTCAAACAATCTATATACTAATTTACCAAGTTTATTGGGGTTTAGAGTCAAGATAGTGTACACTGATTT---TAAATTA--GTAAATGTGTATTGCATTTAAACGACACAGATCTGTTAACACGTTTAAACGTGACAGCCagttttgaaattactctggctccgtgaatctaactccacagtcataatgattattaatgccgtgaaacacacaagatggttggaaaatattcaataacagactgttacttcgtcaaacaatctatatactaatttaccaagtttattggggtttagagtcaagatagtgtacactgattttaaattagtaaatgtgtattgcatttaaacgacacagatctgttaacacgtttaaacgtgacagccc
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Reference ( family-6457 )     :                                                                TAGGGCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAATAAACGACAC--GCCTCCGTTTACACGTTGTTCAAACCT-G-G-TGTTTT----GTATGTGCATTATCT----AAGTTGTATTTACAGCTAATTACTAGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTCGCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTNTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TAAATTAGTA-AACGTGTATTGCTTTTAAACGACACGGATCCGTTTACACGTGTAAACGTGACAGCC
gi|1                          :                                                                 AGTGCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAATGTTTACTCGAACGCTCATAAACGACAC--GCCTCAGTTTACACCAAGTTCAAAGCT-G-GGTGTTTTAGTTGTATGTGCATTTTTTT---AAATTGTTTTTACAGCTAATTAATAGT------ATAC---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCAACAAACAAATGGCTGACA----T--GTTGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCCTGAATCTAACTCGACAGACATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTAGATATTAGCCTGTTACTTTGTCAAACGATCTTTGTACTAATTTACCAAATTTACTTGGGTCTAGGGTCAAGATAATGTACACGGATAT---TAAATTAGTA-AATGTGTATTGCTTTTAAACGACACAGATCCGTTTACAGATGTAAACATGACAGC
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gi|15                         :                                                                                                                                 tgacattgcggatagtttcaaattatatcattaagctgaacgtcatagcttatgatgttttagaattattacatatttttaaactatacaaacgatctttcataggatgtcactaacttTAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGCTGATGACATTGCAATTTTGAAATAACTCTTGCTCTGTGAATCTAACTACACAGTCATAGCGATTATT-AATGCCATGAAACACAC--GGATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACAATCTTTAAACTAATTTACCAAATTAACctaattgaaaggtaatatatttgattcatttaaaaaacttcatat
gi|16                         :                                                                TAGGACTGTCATGTTTACATATTTCTGTAAACATGTACACGGACACTAATAAACAACAC--GCCTaag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cATGATCTATATACTAATTTAACAAATTTACTGGGGTTTAGGTT-------GTGAACACAGGTAT---TAAATTATTATAACGTATATTGCTTTTAAATGACACAGACCCATTTACACGGGTAAATGTGACAGCCatgatctatatactaatttaacaaatttactggggtttaggttgtgaacacaggtattaaattattataacgtatattgcttttaaatgacacagacccatttacacgggtaaatgtgacagccct
gi|17                         : ctaggactgtcatgtttacatatttctgtaaacatgtacacggacactaataaacaacacgcctAGGGCTGTCACGTTTACCGCTTTCTGTAAACGTGTACACAACCACTTATAAACGGCAC--GCCTCTGTTTACAC-CTG----------G-G-TGTTTT----GCATGTGCATTATCC----AAGTTGTATTTTCAGCTAATTAACAGT------ATAC---------ACCATAAATGTTTct
gi|18                         :                                                                 AGGCCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAACATGTACATGAACACAAATAAATGACAC--GCCTCCGTTTACATGATGTTTAAACCT-G-GATGTTTT----ATATGTGCATTTTCT----AAGTTTTATTTACAACTAATTACTAGT------ATAC---------A
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TTAATTAACTCCTCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACAATGCAATTTTGAAAT
gi|2                          :                                                                 AGGGCTGTCATGTTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACGAAGGCTAGTTAACGACAC--GCATCCGTTTACATGATTTTCAAATCTAG-G-TGTT--------ATGTGC---------------TGTTTTTACAGCTAATTACTAAT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTCGCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCACTCATAACATTGCTGTTTTGAAATTACTCTTACTCAGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATAATTATT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTCAGTAACAGCCATTTACTTCGTCAAATGATCTATATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCTAAGGTCAAGGTAGTGTACACAGATAT---TAAATTAGTA-AATGTGTATTGCTTTTAAACGACACGGATCCATTTACACGTGTAAACGTGACAGCCtttgtgaaattttctttgaataa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                    TAAATAACTCCCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCACTCATGACATTGCAATTTTGAAATc
gi|21                         :                                                                                              ACTTGTACATGAGCGCTAATAAACGACAC--ACCTCt
gi|3                          :                                                             gtcTAGGGCTGTCATGTTTACAGATTTCTGTAAATGTGTACTCAAATGCTAATAAACGACAC--ACCTCTGTTTACACA-TGT---------------TTTT----GTATATGCATTATCT----AAATTATATTTACAGCTAATTACTCGT------ATAT---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCACCAAACAATTGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACAGTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCTATAGTCATAATGATTAAT-AATGCCGTGAAACAAACAAGGATGGTTGAAATAAAAATCAATAACAGCCTGTTACTTAGTCAAACGATCTATATACTAATTTACCAAATTTACAGGGGTCTAGGGTCAAGATAGTGTACAAGGATAT---TAAATTAATA-AA--TGTATTGCTTTTAAATGACACGGATCCGTTTACACATGTAAACGTGACAGCC
gi|4                          :                                                                TAGGGCTGTCAC------AGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAATAAACAACAT--GCCTCTGTTTACATGTTGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATGTGCATTATCA----AAGTTGTATTTACAGCTAACAACTTGT------ATAT---------ATCGTAAATGTTTAAATAACTTGCCAACTTAATGGTTAACA----T--GTCGCTCATGACATTGCAGTTTTAAAATAA---TGGTTCTGTGGATCTAAATACGCAGTCATAATGATTATT-TATGCTGT-----------GGATGATTAGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTATATACTAATTTACCAAATTAACTGCGGTCTAGGGCCTAGGTAGTGTACACAGATAT---T--AT-------ACGTGTATTGCTTTTAAATGACATGGATCCATTAACACATGTAAATGTGACAGCC
gi|5                          :                                                                                           TAAACGTGTACATGAACACTAATAAACAACAC--GCCTCCATTTATACGATGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATATGCATTATCT----CAGTTGTATTTACAGATACTTACTAGT------ATAC---------ACCATACATGTTTAAATAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCACTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAAATCTGGCTCTGTGAATCTAACTTCAAAGTCATAATGATTATTAAATGCGGTGAAATACACAAGGATGATTAGAA-AATATTCAATAACAGCCAGTTCCTTCTTCAAACAATCTATA-A------TACCAAATTTACTTGGGTCTAAGGTCATGGAAGTGTACACAGATATTAGTAAATTAGTA-AACATGTATTACTTTTAAACGACTCGAATCCATTTACACGTGTAAATGCGACAGCCc
gi|6                          :                                                                TAGGGCTGTCAC------AGATTTCTGTAAACGTGTACACAAACGCTAATAAACAACAT--GCCTCTGTTTACATGTTGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATGTGCATTATCA----AAGTTGTATTTACAGCTAATAACTCGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTTGCCAAACTAATGGTTGACA----T--GTCCCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAA---TGGTTCTGTGGAT---------CAGTCATAATGATTATT-AATGCTGT-----------GGATGGTTAGAA-AATATTATATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGAGCTATATACTAATTTACCAAATTAACTGCGGTCT-------AGGTAGTGTACACGGATAT---T--AT-------ACATGTATTGCTTTTAAATGACATGGATCCATTTACATGTGTAAATGTGACAGCCt
gi|7                          :                                                                TAGGGCTGTCATGTTTACTGATTTCTGTAAACGTGTTCACGAACACTAATTAAAGATAT--GCTTCCATTTACACATTGTTCAAACCTGG-G-TGTTTT----GTTTGTGCATTATCT----AAGCTG----TACAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGATATTGGAGATT-------------------TGAATCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCAATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAct
gi|8                          :                                                                TAGGGCTGTCATGTTTACTGATTTCTGTAAACGTGTTCACGAACACTAATTAAAGATAT--GCTTCCATTTACACATTGTTCAAACCTGG-G-TGTTTT----GTTTGTGCATTATCT----AAGCTG----TACAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGATATTGGAGATT-------------------TGAATCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCAATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAttatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttagc
gi|9                          :                                                                  GGGCTGGCACATTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACAAACCCTAATAAATGACAC--ACCTCCGTTTACATGATGTTCAAACCT-GAG-TGTTTT----GTATGTGCATTATCT----AAG-----TTTACAGCTAATTACTAGT------Attatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGTTTTGAAATTACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAG-ATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGACTGTTACTTCGTCAAACAATCTATATACTAATTTACCAAGTTTATTGGGGTTTAGAGTCAAGATAGTGTACACTGATTT---TAAATTAGTA-AATGTGTATTGCATTTAAACGACACAGATCTGTTAACACGTTTAAACGTGACAGCCagttttgaaattactctggctccgtgaatctaactccacagtcataatgattattaatgccgtgaaacacacaagatggttggaaaatattcaataacagactgttacttcgtcaaacaatctatatactaatttaccaagtttattggggtttagagtcaagatagtgtacactgattttaaattagtaaatgtgtattgcatttaaacgacacagatctgttaacacgtttaaacgtgacagccc
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consensus                     :                                                                TAGGGCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAATAAACGACAC--GCCTCCGTTTACACGNTGTTCAAACCT-G-G-TGTTTT----GTATGTGCATTATCT----AAGTTGTATTTACAGCTAATTACTAGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTCGCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTNTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TAAATTAGTA-AACGTGTATTGCTTTTAAACGACACGGATCCGTTTACACGTGTAAACGTGACAGCC
Reference ( family-6457 )     :                                                                TAGGGCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAATAAACGACAC--GCCTCCGTTTACACGNTGTTCAAACCT-G-G-TGTTTT----GTATGTGCATTATCT----AAGTTGTATTTACAGCTAATTACTAGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTCGCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTNTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TAAATTAGTA-AACGTGTATTGCTTTTAAACGACACGGATCCGTTTACACGTGTAAACGTGACAGCC
gi|1                          :                                                                 AGTGCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAATGTTTACTCGAACGCTCATAAACGACAC--GCCTCAGTTTACACCAAGTTCAAAGCT-G-GGTGTTTTAGTTGTATGTGCATTTTTTT---AAATTGTTTTTACAGCTAATTAATAGT------ATAC---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCAACAAACAAATGGCTGACA----T--GTTGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCCTGAATCTAACTCGACAGACATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTAGATATTAGCCTGTTACTTTGTCAAACGATCTTTGTACTAATTTACCAAATTTACTTGGGTCTAGGGTCAAGATAATGTACACGGATAT---TAAATTAGTA-AATGTGTATTGCTTTTAAACGACACAGATCCGTTTACAGATGTAAACATGACAGC
gi|10                         :                                                                                       TCTGTAAACATGTACACGAATGCTAATAAACAACAT--GCCTCCGTTTACA---TGTTTAATCCTTG-G-TGTTTT----GTATGTGCATTATCT----AAGTTGTATTTACATCTTATTACCAGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTCAATAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGTTCATGACATTGCAATTTTGAAATAACTCTGGTTTGGTTAATCTAACTACACAGTCATGATGATTATT-AATGTCGTGAAACATACAAGGAAGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTCCGTCAAATGA--TTTATAC-AATTTACCAAATTTACGGAGGTTTAGGGTCATGGTAGTGTATACGGATAT---TAAATTAGTA-AACGTGT
gi|11                         :                                                                                                 TGTAAACGAACTCTAATAA-CGACAC--GCCTCAGTTTACAAGTTGTTCAAACCT-GAG-TGTTTT----GTATATGCATTATCT----AAATTGTATTTACAGCTAATTACTTGA------ATAT---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCACCAAA-AATTGGCTGACAAAAGT--ATCGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCTACAGTCATAATGATTAAT-AATGCCGTGAAACACACAAGAATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTAACTTCGTCAAACGATAGTTTCACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTTTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TA
gi|12                         :                                                                                  atttacatgttgttaTGTAAACGAACTCTAATAA-CGACAC--GCCTCAGTTTACAAGTTGTTCAAACCT-GAG-TGTTTT----GTATATGCATTATCT----AAATTGTATTTACAGCTAATTACTTGA------ATAT---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCACCAAA-AATTGGCTGACAAAAGT--ATCGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCTACAGTCATAATGATTAAT-AATGCCGTGAAACACACAAGAATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTAACTTCGTCAAACGATAGTTTCACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTTTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TA
gi|13                         :                                                 atttacatgttgttaTAGGGCTGTCATGGTTACTGATTTCTGTAAACGTGTACATGAATGCTAATAAAAAAAACAAGCCTCCATTTATACATTATTTAAACCT-G-GATGTTGT----GTATGTGCATTATCTTTTAAAGTTGTATTTACAGCTAATTACTTGT------AGAT---------ACCATAAATGTTTAAATAACTCCCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCACTCATGACATTGCAATTTTGAAAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGGTAGTGTACACGGATAT---TAAATTTGTA-AACGTGTATTGCTTTTAAACGACATGGGTCCATTTACATGTGTTAGCGTGACAGCCtttgtgaaattttctttgaaaaaacacacctgttatatagtacttctgttctgtgaata
gi|15                         :                                                                                                                                 tgacattgcggatagtttcaaattatatcattaagctgaacgtcatagcttatgatgttttagaattattacatatttttaaactatacaaacgatctttcataggatgtcactaacttTAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGCTGATGACATTGCAATTTTGAAATAACTCTTGCTCTGTGAATCTAACTACACAGTCATAGCGATTATT-AATGCCATGAAACACAC--GGATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACAATCTTTAAACTAATTTACCAAATTAACctaattgaaaggtaatatatttgattcatttaaaaaacttcatat
gi|16                         :                                                                TAGGACTGTCATGTTTACATATTTCTGTAAACATGTACACGGACACTAATAAACAACAC--GCCTaag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cATGATCTATATACTAATTTAACAAATTTACTGGGGTTTAGGTT-------GTGAACACAGGTAT---TAAATTATTATAACGTATATTGCTTTTAAATGACACAGACCCATTTACACGGGTAAATGTGACAGCCatgatctatatactaatttaacaaatttactggggtttaggttgtgaacacaggtattaaattattataacgtatattgcttttaaatgacacagacccatttacacgggtaaatgtgacagccct
gi|17                         : ctaggactgtcatgtttacatatttctgtaaacatgtacacggacactaataaacaacacgcctAGGGCTGTCACGTTTACCGCTTTCTGTAAACGTGTACACAACCACTTATAAACGGCAC--GCCTCTGTTTACAC-CTG----------G-G-TGTTTT----GCATGTGCATTATCC----AAGTTGTATTTTCAGCTAATTAACAGT------ATAC---------ACCATAAATGTTTct
gi|18                         :                                                                 AGGCCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAACATGTACATGAACACAAATAAATGACAC--GCCTCCGTTTACATGATGTTTAAACCT-G-GATGTTTT----ATATGTGCATTTTCT----AAGTTTTATTTACAACTAATTACTAGT------ATAC---------A
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TTAATTAACTCCTCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACAATGCAATTTTGAAAT
gi|2                          :                                                                 AGGGCTGTCATGTTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACGAAGGCTAGTTAACGACAC--GCATCCGTTTACATGATTTTCAAATCTAG-G-TGTT--------ATGTGC---------------TGTTTTTACAGCTAATTACTAAT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTCGCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCACTCATAACATTGCTGTTTTGAAATTACTCTTACTCAGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATAATTATT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTCAGTAACAGCCATTTACTTCGTCAAATGATCTATATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCTAAGGTCAAGGTAGTGTACACAGATAT---TAAATTAGTA-AATGTGTATTGCTTTTAAACGACACGGATCCATTTACACGTGTAAACGTGACAGCCtttgtgaaattttctttgaataa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                    TAAATAACTCCCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCACTCATGACATTGCAATTTTGAAATc
gi|21                         :                                                                                              ACTTGTACATGAGCGCTAATAAACGACAC--ACCTCt
gi|3                          :                                                             gtcTAGGGCTGTCATGTTTACAGATTTCTGTAAATGTGTACTCAAATGCTAATAAACGACAC--ACCTCTGTTTACAC-ATGTT---------------TTT----GTATATGCATTATCT----AAATTATATTTACAGCTAATTACTCGT------ATAT---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCACCAAACAATTGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACAGTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCTATAGTCATAATGATTAAT-AATGCCGTGAAACAAACAAGGATGGTTGAAATAAAAATCAATAACAGCCTGTTACTTAGTCAAACGATCTATATACTAATTTACCAAATTTACAGGGGTCTAGGGTCAAGATAGTGTACAAGGATAT---TAAATTAATA-AA--TGTATTGCTTTTAAATGACACGGATCCGTTTACACATGTAAACGTGACAGCC
gi|4                          :                                                                TAGGGCTGTCAC------AGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAATAAACAACAT--GCCTCTGTTTACATGTTGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATGTGCATTATCA----AAGTTGTATTTACAGCTAACAACTTGT------ATAT---------ATCGTAAATGTTTAAATAACTTGCCAACTTAATGGTTAACA----T--GTCGCTCATGACATTGCAGTTTTAAAATAA---TGGTTCTGTGGATCTAAATACGCAGTCATAATGATTATT-TATGCTGT-----------GGATGATTAGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTATATACTAATTTACCAAATTAACTGCGGTCTAGGGCCTAGGTAGTGTACACAGATAT---T--AT-------ACGTGTATTGCTTTTAAATGACATGGATCCATTAACACATGTAAATGTGACAGCC
gi|5                          :                                                                                           TAAACGTGTACATGAACACTAATAAACAACAC--GCCTCCATTTATACGATGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATATGCATTATCT----CAGTTGTATTTACAGATACTTACTAGT------ATAC---------ACCATACATGTTTAAATAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCACTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAAATCTGGCTCTGTGAATCTAACTTCAAAGTCATAATGATTATTAAATGCGGTGAAATACACAAGGATGATTAGAA-AATATTCAATAACAGCCAGTTCCTTCTTCAAACAATCTATA-A------TACCAAATTTACTTGGGTCTAAGGTCATGGAAGTGTACACAGATATTAGTAAATTAGTA-AACATGTATTACTTTTAAACGACTCGAATCCATTTACACGTGTAAATGCGACAGCCc
gi|6                          :                                                                TAGGGCTGTCAC------AGATTTCTGTAAACGTGTACACAAACGCTAATAAACAACAT--GCCTCTGTTTACATGTTGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATGTGCATTATCA----AAGTTGTATTTACAGCTAATAACTCGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTTGCCAAACTAATGGTTGACA----T--GTCCCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAA---TGGTTCTGTGGAT---------CAGTCATAATGATTATT-AATGCTGT-----------GGATGGTTAGAA-AATATTATATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGAGCTATATACTAATTTACCAAATTAACTGCGGTCT-------AGGTAGTGTACACGGATAT---T--AT-------ACATGTATTGCTTTTAAATGACATGGATCCATTTACATGTGTAAATGTGACAGCCt
gi|7                          :                                                                TAGGGCTGTCATGTTTACTGATTTCTGTAAACGTGTTCACGAACACTAATTAAAGATAT--GCTTCCATTTACACATTGTTCAAACCTGG-G-TGTTTT----GTTTGTGCATTATCT----AAGCTG----TACAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGATATTGGAGATT-------------------TGAATCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCAATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAct
gi|8                          :                                                                TAGGGCTGTCATGTTTACTGATTTCTGTAAACGTGTTCACGAACACTAATTAAAGATAT--GCTTCCATTTACACATTGTTCAAACCTGG-G-TGTTTT----GTTTGTGCATTATCT----AAGCTG----TACAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGATATTGGAGATT-------------------TGAATCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCAATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAttatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttagc
gi|9                          :                                                                  GGGCTGGCACATTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACAAACCCTAATAAATGACAC--ACCTCCGTTTACATGATGTTCAAACCT-GAG-TGTTTT----GTATGTGCATTATCT----AAG-----TTTACAGCTAATTACTAGT------Attatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGTTTTGAAATTACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAG-ATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGACTGTTACTTCGTCAAACAATCTATATACTAATTTACCAAGTTTATTGGGGTTTAGAGTCAAGATAGTGTACACTGATTT---TAAATTAGTA-AATGTGTATTGCATTTAAACGACACAGATCTGTTAACACGTTTAAACGTGACAGCCagttttgaaattactctggctccgtgaatctaactccacagtcataatgattattaatgccgtgaaacacacaagatggttggaaaatattcaataacagactgttacttcgtcaaacaatctatatactaatttaccaagtttattggggtttagagtcaagatagtgtacactgattttaaattagtaaatgtgtattgcatttaaacgacacagatctgttaacacgtttaaacgtgacagccc


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blockSeqs                     :                                                                                                                           .              AGT           GAG        .                  .                           T  GTAAAA    TATACAGTA                      A                  AAAG GC                              C        C                              A .                               .                                      T                                                        .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              CAT           GAG        .                  .                           T  .         .                              A                  .    .                               C        C                              A .                               .                                      T                                                        .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              TGA           GGA        .                  .                           T  .         .                              C                  .    .                               C        T                              T .                               .                                      T                                                        .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              TGA           GGA        .                  .                           A  .         .                              A                  .    .                               C        A                              T .                               .                                      A                                                        .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              TGT           AGG        .                  .                           A  .         .                              C                  .    .                               C        C                              A .                               .                                      A                                                        .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              CGA           GGG        .                  .                           A  .         .                              G                  .    .                               A        T                              T .                               .                                      A                                                        .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              TGT           GGG        .                  .                           C  .         .                              C                  .    .                               C        T                              T .                               .                                      A                                                        .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              CAT           GGG        .                  .                           T  .         .                              A                  .    .                               .        T                              T .                               .                                      A                                                        .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              CAT           GGG        .                  .                           A  .         .                              G                  .    .                               .        C                              A .                               .                                      A                                                        .             
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              TGA           GGG        .                  .                           C  .         .                              A                  .    .                               .        .                              A .                               .                                      T                                                        .             
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              CC            GAG        .                  .                           A  .         .                              G                  .    .                               .        .                              T .                               .                                      T                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              CA            GG         .                  .                           A  .         .                              A                  .    .                                                                                                                                                A                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                           .              .             .          .                  .                           A  .                                        A                  .    .                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                           .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                           .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  


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Reference ( family-6457 )     :                                                                TAGGGCTGTCACGTTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAATAAACGACAC--GCCTCCGTTTACACGNTGTTCAAACCT-G-G-TGTTTT----GTATGTGCATTATCT----AAGTTGTATTTACAGCTAATTACTAGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTCGCCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTNTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCTAGGGTCAAGGTAGTGTACACGGATAT---TAAATTAGTA-AACGTGTATTGCTTTTAAACGACACGGATCCGTTTACACGTGTAAACGTGACAGCC
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gi|21                         :                                                                                              ACTTGTACATGAGCGCTAATAAACGACAC--ACCTCt
gi|3                          :                                                             gtcTAGGGCTGTCATGTTTACAGATTTCTGTAAATGTGTACTCAAATGCTAATAAACGACAC--ACCTCTGTTTACAC-ATGTT---------------TTT----GTATATGCATTATCT----AAATTATATTTACAGCTAATTACTCGT------ATAT---------ACTGTAAATGTTTAAATAACTCACCAAACAATTGGCTGACA----T--GTCGCTCATGACAGTGCAGTTTTGAAATAACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCTATAGTCATAATGATTAAT-AATGCCGTGAAACAAACAAGGATGGTTGAAATAAAAATCAATAACAGCCTGTTACTTAGTCAAACGATCTATATACTAATTTACCAAATTTACAGGGGTCTAGGGTCAAGATAGTGTACAAGGATAT---TAAATTAATA-AA--TGTATTGCTTTTAAATGACACGGATCCGTTTACACATGTAAACGTGACAGCC
gi|4                          :                                                                TAGGGCTGTCAC------AGATTTCTGTAAACGTGTACACGAACGCTAATAAACAACAT--GCCTCTGTTTACATGTTGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATGTGCATTATCA----AAGTTGTATTTACAGCTAACAACTTGT------ATAT---------ATCGTAAATGTTTAAATAACTTGCCAACTTAATGGTTAACA----T--GTCGCTCATGACATTGCAGTTTTAAAATAA---TGGTTCTGTGGATCTAAATACGCAGTCATAATGATTATT-TATGCTGT-----------GGATGATTAGAA-AATATTCAATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGATCTATATACTAATTTACCAAATTAACTGCGGTCTAGGGCCTAGGTAGTGTACACAGATAT---T--AT-------ACGTGTATTGCTTTTAAATGACATGGATCCATTAACACATGTAAATGTGACAGCC
gi|5                          :                                                                                           TAAACGTGTACATGAACACTAATAAACAACAC--GCCTCCATTTATACGATGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATATGCATTATCT----CAGTTGTATTTACAGATACTTACTAGT------ATAC---------ACCATACATGTTTAAATAACTCACCAAACAAATGGCTGACA----T--GTCACTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAAATCTGGCTCTGTGAATCTAACTTCAAAGTCATAATGATTATTAAATGCGGTGAAATACACAAGGATGATTAGAA-AATATTCAATAACAGCCAGTTCCTTCTTCAAACAATCTATA-A------TACCAAATTTACTTGGGTCTAAGGTCATGGAAGTGTACACAGATATTAGTAAATTAGTA-AACATGTATTACTTTTAAACGACTCGAATCCATTTACACGTGTAAATGCGACAGCCc
gi|6                          :                                                                TAGGGCTGTCAC------AGATTTCTGTAAACGTGTACACAAACGCTAATAAACAACAT--GCCTCTGTTTACATGTTGTTCAAACCT-G-GGTGTTTT----GTATGTGCATTATCA----AAGTTGTATTTACAGCTAATAACTCGT------ATAT---------ACCGTAAATGTTTAAATAACTTGCCAAACTAATGGTTGACA----T--GTCCCTCATGACATTGCAGTTTTGAAATAA---TGGTTCTGTGGAT---------CAGTCATAATGATTATT-AATGCTGT-----------GGATGGTTAGAA-AATATTATATAACAGCCTGTTACTTCGTCAAACGAGCTATATACTAATTTACCAAATTAACTGCGGTCT-------AGGTAGTGTACACGGATAT---T--AT-------ACATGTATTGCTTTTAAATGACATGGATCCATTTACATGTGTAAATGTGACAGCCt
gi|7                          :                                                                TAGGGCTGTCATGTTTACTGATTTCTGTAAACGTGTTCACGAACACTAATTAAAGATAT--GCTTCCATTTACACATTGTTCAAACCTGG-G-TGTTTT----GTTTGTGCATTATCT----AAGCTG----TACAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGATATTGGAGATT-------------------TGAATCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCAATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAct
gi|8                          :                                                                TAGGGCTGTCATGTTTACTGATTTCTGTAAACGTGTTCACGAACACTAATTAAAGATAT--GCTTCCATTTACACATTGTTCAAACCTGG-G-TGTTTT----GTTTGTGCATTATCT----AAGCTG----TACAGCTAATTACTAGTGTAAAAATATTATACAGTAACTGTAAATGTTTAAATAAATCACCAAACAAATGGCTGACA----TGCGCCGCTCATGATATTGGAGATT-------------------TGAATCTAATGCCACATTCGTAATGATTAAT-AATGCCATGAAACACACAAGGATGGTTGGAA-AGTATTCAATAATAGCCTGTTGCTTCGTCAAACAATCTTTATACTAATTTACCAAATTTACTGGGGTCGAGGGTCAttatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttagc
gi|9                          :                                                                  GGGCTGGCACATTTACAGATTTCTGTAAACGTGTACACAAACCCTAATAAATGACAC--ACCTCCGTTTACATGATGTTCAAACCT-GAG-TGTTTT----GTATGTGCATTATCT----AAG-----TTTACAGCTAATTACTAGT------Attatttgaaatcattaatctgcaattaattgacaatgtgttag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGTTTTGAAATTACTCTGGCTCCGTGAATCTAACTCCACAGTCATAATGATTATT-AATGCCGTGAAACACACAAG-ATGGTTGGAA-AATATTCAATAACAGACTGTTACTTCGTCAAACAATCTATATACTAATTTACCAAGTTTATTGGGGTTTAGAGTCAAGATAGTGTACACTGATTT---TAAATTAGTA-AATGTGTATTGCATTTAAACGACACAGATCTGTTAACACGTTTAAACGTGACAGCCagttttgaaattactctggctccgtgaatctaactccacagtcataatgattattaatgccgtgaaacacacaagatggttggaaaatattcaataacagactgttacttcgtcaaacaatctatatactaatttaccaagtttattggggtttagagtcaagatagtgtacactgattttaaattagtaaatgtgtattgcatttaaacgacacagatctgttaacacgtttaaacgtgacagccc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TAGACAGGAACATACATATTAAAGTATCATA