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gi|28 : -TAAA--TGT--G--ATGTGTAGTGT--T-TTATG-----AA-TATGCG-AT----GTT--TAATAATGTAAAT-TTTGATGTtaatattgaataatgtatgtataaaaaaatacattttccaaaataaaaacgaatttatagtctgt
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Reference ( family-6309 ) : AAAAACAAAGTTCTTTTAATTGTTTTTACCAANANTTGTTTATGCTGTTCAGTCATTAGTTGTACTTCAAAATATT-TCAAATAGATTAAACANAATGNTTNTAAATTTTCTATGGAGGCGTGAAAAAAAACCCCACAAACCCTGAGGAACNATATTGATTGGTGATAAATTGAANCGCGGAATAGANATGTGTGATCCAGCATCCTTCTT--TAAATCACTCAAAATGAAATGGATTAAAGTTTNGACTAAT---AGTGACGAAGCGAATTGGAAAAT---T----CAAGATACC--TT-A-ATACATTTGGAGANAATTACTTAATTTTTTGAAATGAATATAGACAGTTTTAAAANCATTCCTTGTCGCCA-ACCATTACCTGACTTTTTATATCGATCTTATAAANTGTTGGATTCAAGTGAAAA-AA-CAAA-CAAATAATANACCGTGTAAGGACTTTCAATCTATCAGAAAACAAATAATATGGGGAAACAAAGAACTAAAATAAACGGTAANTGTTTAATATTCAACAATTGGATAAAATNTAAACTNTATATTTGTNAACGATATNATTAAACAATAAATGGGGAGATATTATTATCAGGAGGGAATTTTAGATAAATTAATTGATAAACCCAATTGNATATCTCAATTAGGCACAGTTACATTAGCAATACCAAAACGATGGAAAATTATATTAAAATCGGAAGAAGCAAAACAATCACTAGT-TAAAACTGAACACAATNTTAATATTAATACTCAAGATGGAAAAGTAATTGACTTGAAAACATCAAATAATAAACATTTATACAACTATTTAATTAACNTTAAATTTACAAAACCA--ATTCGTTCATAATTATTGGAATACGCACCTAAACGCAATATTTAATTTGGGAAAATATATA-T-GTTTCATTCACACTTTACATGACAATAGAATTAAACAGTTTAAATATAAACTNATT-TTTAGAATAGTTCCTT--TCCAAGGAAATGCAACATATGTGGAAAATAAGTCAAACTCCTT-TTTGTAATGTATGTGGTGAAANAG-AAACATACACACATCTTTTCATTGATTGCCAAGAAGTAGAAACTCTCTGGACTAATATAACAGATATTTT-TAAACATTGTGGCGTATCAGCAGTAATGAAAA---C-GTTGAAAA--ATATA-GTTA--TTGGATACAAA--ATTAGCTACCCAGAA------TATAATAATATAAATACTATTTTAGCCCT--TGCAGGATTCTGTA-TTT-TAAA-GCATATTTCGTAAGTAATTGCAGAAGCACGAGGGTTGATGTATTTGCATTATTTAAATACGAATATATTTTATTCTTTCGATATTTAGAAA-GGAGCGAA------A-A-A-T----G-TCAAACATGCGCATATTTA-AATTGTTTA---ACAATTCATTAAAAGATTACTAACATACTTGGAATT-------A--T-------ATGTTTAT-ATG-TA-----TATT--T--A-TGAGTTG-ATTAAA--TGT--A--ATGTGTAATGT--T-TTAT-G-----A-ATATGTG-AT----GTTTTATAATGTAAAT-TATGATGTAA
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gi|8 : GAA------A-A-A-TA---G-TCAAATGCGCACATACTTA-AATTGTTTT---ACAATTTATTAAATGATAACTAATATAATTGGAATTAATCATGA--T-------ATGTTTAT-ATG-TATTGTGTTTT--T--C-TCAATTT-ATTAAG--AGT--ATTATGTGTtgaaaaatagtcaaatgcgcacatacttaaattgttttacaatttattaaatgataactaatataattggaattaatcatgatatgtttatatgtattgtgtttttctcaatttattaagagtattatgtgtt
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15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CTCTCCTGACAGAATCTAATTTTTTTTTTGAAAGCCAGACAAAAATAGGCAAACAATATTTGTTAATTACTATTAGTAAATTACCTTAAATGCAACATTTTTTTTTTCAAATAATTCTAATTATGATTATAACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATAAAGGGAAACAAATCTGATGAAATATGAAAACTGAGTTATTTCCCTTCTGTTATAATGCTGCCTTTTATTTTAATTGCGGATCTATCATCTCAGATTTTTAACTGTGGTTGTCATTTTGTTATCCGAATTTTCATAAAGACCAACTAGACATTAAATGCATCATTCCTATAAAGATTGAGGAAAATCCAGTCAGTAGTAGTTGAGGAGTAGTCGTTACAATGTA
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Unaligned ( gi|39 ): TTTTAAGCTGTCACAGCCATCTTGGATTTCAGACTGACCTTAACTTTCT
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Reference ( family-6309 ) : AAAAACAAAGTTCTTTTAATTGTTTTTACCAANANTTGTTTATGCTGTTCAGTCATTAGTTGTACTTCAAAATATT-TCAAATAGATTAAACANAATGNTTNTAAATTTTCTATGGAGGCGTGAAAAAAAACCCCACAAACCCTGAGGAACNATATTGATTGGTGATAAATTGAANCGCGGAATAGANATGTGTGATCCAGCATCCTTCTT--TAAATCACTCAAAATGAAATGGATTAAAGTTTNGACTAAT---AGTGACGAAGCGAATTGGAAAAT---T----CAAGATACC--TT-A-ATACAT-T-GGAGANAATTACTTAATTTTTTGAAATGAATATAGACAGTTTTAAAANCATTCCTTGTCGCCA-ACCATTACCTGACTTTTTATATCGATCTTATAAANTGTTGGATTCAAGTGAAAA-AA-CAAA-CAAATAATANACCGTGTAAGGACTTTCAATCTATCAGAAAACAAATAATATGGGGAAACAAAGAACTAAAATAAACGGTAANTGTTTAATATTCAACAATTGGATAAAATNTAAACTNTATATTTGTNAACGATATNATTAAACAATAAATGGGGAGATATTATTATCAGGAGGGAATTTTAGATAAATTAATTGATAAACCCAATTGNATATCTCAATTAGGCACAGTTACATTAGCAATACCAAAACGATGGAAAATTATATTAAAATCGGAAGAAGCAAAACAATCACTAGT-TAAAACTGAACACAATNTTAATATTAATACTCAAGATGGAAAAGTAATTGACTTGAAAACATCAAATAATAAACATTTATACAACTATTTAATTAACNTTAAATTTACAAAACCA--ATTCGTTCATAATTATTGGAATACGCACCTAAACGCAATATTTAATTTGGGAAAATATATA-T-GTTTCATTCACACTTTACATGACAATAGAATTAAACAGTTTAAATATAAACTNATT-TTTAGAATAGTTCCTT--TCCAAGGAAATGCAACATATGTGGAAAATAAGTCAAACTCCTT-TTTGTAATGTATGTGGTGAAANAG-AAACATACACACATCTTTTCATTGATTGCCAAGAAGTAGAAACTCTCTGGACTAATATAACAGATATTTT-TAAACATTGTGGCGTATCAGCAGTAATGAAAA---C-GTTGAAAA--ATATA-GTTA--TTGGATACAAA--ATTAGCTACCCAGAA------TATAATAATATAAATACTATTTTAGCCCT--TGCAGGATTCTGTA-TTT-TAAA-GCATATTTCGTAAGTAATTGCAGAAGCACGAGGGTTGATGTATTTGCATTATTTAAATACGAATATATTTTATTCTTTCGATATTTAGAAA-GGAGCGA-AA-----A--ANTG-TCAAACATGCGCATATTTA-AATTGTTTA---ACAATTCATTAAAAGATTACTAACATACTTGGAATT-A-T--CA--AT---ATGTTTAT-ATG-TA-----TATT--T--A-TGAGTTGATTA--AATGTG----ATG---TGTAATGT--T--TTAT-G-----A-ATATGTG-AT----GTTTTATAATGTAAAT-TATGATGTAA
gi|1 : AAAAACA-----CTTTTA-------TTACCAACATTTGTTTATGCTGTTCAGTCATTAGTTGTACCTCAAAATAAT-TTAAATAGATTAAACAAAATGATTTTAAATTTTCTATGGAGGGATGAAAAAA----TTA-AAA-------GAACAACATTGATTGGTGATAAGTTGAAAGGTGGAATAGAAATGTGTGATCCTGTTTCCTTTTT--CAAATCACTCAAAATGAAATGGATAAGAGTTTTGACGAAT---GATGATGAAGCAAATTGGAAAAT---T-----------------------------GGAGAAAATTACTTAATTTTTT-AAATGAATATAGACAGTTTTAAAAACATTCCGGGTCACCA-ACCATTACCTGAATTTT-ATATTGATCATATAAATTGTTGGATTTAAGTGAAAA-AAACAAAACAAATAATAAACCGTGTAAAGACTTTCAATCTATCAGAAAACAAATAATATGGGGAAACAAAGAACTAAAATAAACGGTAAATGTTTAATATTCAACAATTGGATAAAATCTAAACTA-ATATTTATCAACGATATAATTAA-TAA-AAATGGGGAGATA--A--ATCAAGAGGGAATTTTAAATAAATTAATTGATAAATCCAATTGGATATCTCAATTAAGCACAGTTA-------AATACCAAAACGATGGAAAATTATTTTAAAATCGGAAGAAGCAAAACAATCACTTGTATAAAAC-GAACACAATTTTGATATTAATACTCAAGATGGAAAAGTAATTGACTTGAGAACATCAACTAATAAACATATATACAACTATTTAATTAACATTAAATTTACAAAACCA---TTTGTTCATGATTATTGGAATATGCACCTAAATGCAATATTTAATT-GGAAAAATGTATA-TAGCTTCATTCACACTTTATATGACAATAGGATTAAACAGTTTAAATATAAACTGATT-TTTAGAATAGTTCCTT---CCAAGGAAATGTAACATATGTGGAAAATAAGTCAAACTCCTT-TTTGTAATGTATGTGGTGAAATAG-AAACATACACACATCTTTTTATTGATTGCCAAGAAGTAAAATCTCTTTGGACAAATATAACAGATATTTT-TAAAAATTGAGGCGTATCAACAGTAATGAAAA---C-TTTGAAAA--ACATA-GTTA--TTGGATACAAA--ATTAGCTACCCAGAA------TATAATAATATAAATACTATTTTAGCCCT--TACAGGATTCTGTA-TTTATAAA-GCATATTTCGTAAGTAATTGCAGAAGCACGAGTGTTGATGTATTTGCATTATTTAAATACGAATATATCTTATTTTTTCGATATTTAGAAA-GGAGC-A-AA-----A--AATGTTCAAACATGCGCATATTTA-GATTGTTTA---ACAATTCATTGAAGGATTACTAACATACTTGAAATT----------AT---ATGTTTAT-AGG-TA-----TATT--TAAA-TGAGTTGATTA--AAAGTGTAAAATA---TGTAATGT--T--TTGT-G-----A-ATATGTG-AT----GTTTTATAATGAAAAT-TATATTGTAA
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gi|28 : TA--AATGTG----ATG---TGTAGTGT--T--TTAT-G-----A-ATATGCG-AT----GTTTAATAATGTAAAT-TTTGATGTtaatattgaataatgtatgtataaaaaaatacattttccaaaataaaaacgaatttatagtctgt
gi|29 : A--AATGTG----ATG---TGTAGTGT--T--TTAT-G-----A-ATATGCG-AT----GTTTAATAATGTAAAT-TTTGATGTtaatattgaataatgtatgtataaaaaaatacattttccaaaataaaaacgaatttatagtctgt
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gi|8 : AAGAAATGCATCATATGTGGATAATAAGTC-------CT-TTTGTAATGTATATGGTGAAAAAG-AAACCGACATACAATTTTTCATTAATTGCCAAG---TTGAAACCGTCTGGATTAATATGACAGATATTTT-TAAACATTGCGGCGTATCAGTAGTTATTAAAA---T-GCTGAACA--ATATA-GTTA--TTGGATACAAA--ATTAGTTAACCAGAA------AATAATAATATAAATTCTATTTTAGCTCT--TGTAGGATTCTGTATTTT-TAAA-GCATATTTTGTAAATAATTGCAGAAACACAAGGGTTGATGTATTTGCATTATTTAAatattgaataaaagttttatacgaaaacacgcttttattttctgaaattggaattgataatcatgta
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15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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