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gi|10                         :  TGTGGTAGAGTGTAATT-TGGCTGTTTTTAAATATTTT--------AACGTA---------------CTAA----CACATAAGCAT-GTTTC-------T-AATA---TTAAC---ATACACAGATTTACTAGCTTTAAAGTTATACTTGTTGAAGCTGAGTATTTTTGATG--AGAAAATATTGTCACCTGACAACCTTATGCATTCTCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAATTGTGTTA-TG----AGCTGTCAGTTTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGAAAGCTGCAAGTCTCACAGTAGTTATAAA-TTAACTGTCTTGTATGTAGTT-----ATT-------AGACATTTGGGCAA----TGTATAGTTTATGGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAATGGTCCTTGATATTTGGAATCTGGAGGACTGAA
gi|19                         :  TGTGGTAGAGTGTAATT-TTACCGTTTT-AAATATTTTAAAGTTTTAACATAATATTTTATGCATTTCCTATTAACACATTAGC-TTAATTC-------T-AATA---TTAAC---ATACATATATTTACTAGCTT-AAAATTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGGT
gi|22                         : aTGTAGTAGAGTGCAACT-TTACTG-TTTTAAATATTTT--------AA
gi|11                         :   GTGGTAGAGTGTAATT-TGGCTGTTTTTAAATATTTT--------AACGTA---------------CTAA----CACATAAGCAT-GTTTC-------T-AATA---TTAAC---ATACACAGATTTACTAGCTTTAAAGTTATACTTGTTGAAGCTGAGTATTTTTGATG--AGAAAATATTGTCACCTGACAACCTTATGCATTCTCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAATTGTGTTA-TG----AGCTGTCAGTTTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGAAAGCTGCAAGTCTCACAGTAGTTATAAA-TTAACTGTCTTGTATGTAGTT-----ATT-------AGACATTTGGGCAA----TGTATAGTTTATGGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAATGGTCCTTGATATTTGGAATCTGGAGGACTGAagctagcagacccttgtatgttgacgttaattacactttaccac
gi|6                          :   GTGTTAGAGTGTAATT-TTACAGTTTT-AAGTATTTT--------AACATA---------------TTAA----CATATTAGCAT-GTTTC-------C-AATA---GTAGT---ATACACAGATTTACTGGCTTTAAAATTATACTGGTCAATGTTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGCCACCTGACAGTCAGGTGAATTCTCATTGGTCGCTATCTATTCTAAATTAGTCTTGGAAAGAAATC-TGCAGTGTGAAATTGTGTTA-------ATCTGTCAGTTT-TAT----CCTTCAATAAGT---------TGTTTTATTTGCAAG-------TTTCACAGTAATT-CAAA-GTAA--AC--TGTATGTAGTTCTAAGATCTTTTCTGAGATATATGGACAA----CGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTGAAGTTGTTATTTTACCGCTTGGACGTAGTGGTCTTTAATATTTGGAATCTGGAGGATTGAAGGTAGACACTGTTTTTTCTTTCATTTATATTTTAAGTGTCTATAAGTATATATTGACTGTATTATTATTAATCAAATGGGTTGATCATTGACAAATTTT--------ATCTAGAACTGATATGGAGTATTGGTTATGTGTTACTGTTTATATAATAAATACCAAAATGTA--TGTCTGTAATGATATAGATAAAAAACACTACGTGCGCCCGCATGTCTGCTGG-AACATTTTA
gi|3                          :    TGGTAGAGTGTAATT-TGACTGTTTTAAAATATTTT--------AACGTA---------------CTCA----CACATAAGCAT-GTTTC-------C-AATA---TTAAA---ATACAGAGAATTACTTGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTAGGCATTTTCATTGGTCAACATCTATCCTAAATCAGTATTGAAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAGTTGTATTA-TA----AGCTGTCAGTTTATATATTTCCTTCAATACAT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATAGTAGTTATAAA-CTAACTACCTTGCATGTAGTT-----ATT-------AGATATTTGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTGGAATATTGAAGGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATTTTAAGTCTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTATTAATCACATGGATTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAAACTAGAACTAATATGGAGAATTAGCTATGTTTTATTGTGTATACCGGAAATGCCCAAATTCGCCAGTCTGTGTTGATGTAGAT---------T-----CGTCCGCATGTCGGCGGGGAATAGTTT--GT-TTTA--ATCCT-TTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAATACAATTATCATTATTGTTATAAAGTAAATATGCTAGATGCTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGTGTATTTTTGTTACTTTAATTGTTAAATGTACTTCTTCTTATATATGTACATACATTATAAAAACAGGAAATATTTAGTGCTAGAG---A-GATA-GAGATAAGATGA-----TGGTGGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGTTGGAAGAAATTAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATAAATAACTATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAATACAtattatgaaatgaagtaatctgtgatattataattattattttagtata
gi|14                         :    TGGTAGAGTGTAATT-TGACTGTTTTTAAATATTTT--------AACGTA---------------CTAA----CACATAAGCATTGTTTC-------A-AATA---TTAAC---ATACACAGAATTACTAGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTCGTTTTGGTG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTATGCATTCCCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAGTTGTGTTA-TG----AGCTGTCAGTTTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGCATGCTGCAAGTca
gi|9                          :     GGTAGAGTGTAATT-TTACTGTTTTTAAATATTTA--------AACGTA---------------CTAA----CACATAAGCAT-GTGTC-------C-AATA---TTAAC---TTTTTCAGAATAACTAGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGGTG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTATGAACTCCCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTTTAAAGTTGTTTTA-TG----AGCTGTCAGTCTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCACAGTAGTTATAAA-TTAACTGCCTTGTATGTAGTT-----ATA-------AGATATTCGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAAGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTAGAGGATTGAAGGTAGGAACTGTTATTCAATTCA
gi|13                         :     ggTAGATTGTAATTGTG-TTGTTTTAAAAT----------------GTA---------------TTT-----CTGATAAATGTTGTGTA-------ATAATACCATTAACGTAATATATGGAAGTATTTGCTTTAACCGTATACATGTCAAGAATCATTAGTTTTTCTTTTGAAAAAGAGAGCCATTTGACAATCGTATGAAATCTCACTTTTCAATATCTGCCTCAAATC-TTATTGGAAAACAGTTATGGTTCTT----TTGTGTTT-TGTTGAAATTG--ACTTAATA-TCTTCCTGCAATAATTGTTTACAAGTGTTTAATTTGTAATCTACACGTGTAAGAGTAAT
gi|24                         :                                                                                ATTAGCAT-GTTTCCGATATTA-AACA---TTAAA---ATATAAGGATTTACTAGCTTTAAAATTATATTGG
gi|12                         :                                                                                  AAGCAT-GTTTC-------C-AATA---TAAAC---ATGGACAGATTTACTAGCTTTAAAGCAATACTGGTCAAGGCTGAGTCGTTTTGGTG--GGAAAATAT---CACGTGACAATCTTTTGCATTCTCATTGGTCAACATCTATTCAAAATCAGTGTTGAAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAGTCGTGTTA-TG----AGCTGTCAGTTTATACATTTCCTTCGATAATT---------TATTCAATTTGCAAGCTGTAAATTTCACAGAAGTTATATA-TAAACTTTC-TGTATGCAGTT-----ATT-------AGATATATGGACAA----TATATAGTTGATTGTGCCATTTATGGTAAAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAGTGGTCCTTGATATTTGGGACATAGAGGACTGAaac
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaTTATATGTAGTC-----ATT-------AGATATTTGGACAA----TGTACAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAAAGTTATTGTTTTACCACTTGGAGGTAGTc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtgATTTGTTTCATTTATATTTTACGTGTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTTTTAATCAAATTGATTGGCAATTGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTTATATGGAGAATTGGCTATGTGTTATTGTGTATAGTGGAAATGCCCAAATGCGCCAGTCTGTTTTGATATAGAA---------T-----CGTCCGTAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttGACATAGAGGACTGAC-ATGTGTTACTGTGT-TA----AAA---------GCGTCTGTCTGTATTGATATAAAT---------G-----TATCCGCATGTCGGCTGGAAACAATTTATAT-CTTTTAATCCT-TTTAACCAATAGAAAGTTGAACAACGAAT-TAAATACTATTATCAATATTATTATTAAGTAAATTTGCTAGATGTTTGAAACAAATGT-----TAAAGGACCGA--GGTGCT-TTTTC-T-----AAGACAAGTC----AATACGT-TATA-ACTTTTTATAAACAGGAGACATGTAGAGCCGG-------GATA-A-----AGATGC-----AGGTGGAATA-----GAGATGTGGTGGGACGATGACAAAGGAAATTAGACTATTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAGTATTCATTTTGTATAACGTGTTTACTATGGAAATAATGATATCAATATTAGAATATTGTATATTTTACATTTGCTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAACATATGACTTTGAT-----AAAACAAAATGCATTATTAGTATAAGGCCTATTTTATCTT-ATTATGATTGAATAAGTTAAGATAAGA---ATAAGAAATGGAAAATAAATGTTTAATT----TAAAGCATGAAAT----TAATCTGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTATTTTATATG---TTTTAAA--AGCTGTAT-ATGT-----------ATATTTCAGAGATGT---TTGTTTCTGTTAT---ATACCATCTAATCAGTGG-AATACACAGTATACATAGAGAGCA-TG------TTTTA-TTTACTAACAAACCTTTTTT---ATTGGGTGTG-G--GTT--TACAGCTAACCAGGATC-ACCCTATAATA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCAAATATAAATGCAATTATCATTAT------AAGGTAAATATGCTAGATGTTCGAAACAACTGTCTGTATAGAAAGTGTATTGTT---ATTTTAATTGTTAAAGGTACTTGGTCTAATATATGTACATACCTTCAATAAACAGGTAATATGTAGTGCTGGAG---A-GATA-G-----AGATGAGATGATGGTGGAACAGA-----GATGTGATGTGACGATGGTGGAAGA---CAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAATATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAGTACATCAGTTAACATTGATTGGT-AAAAATATGACT---AT-----AA------------TATTA-TCTAAGGC-------------ATTATGCTTGAACAAGTTGA-ATAATATC-AT-GGAAATGGAAACTAAA-GT----TTAATATAAAAAATGACATTAAGTAATCGGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATACGTT-TTTTGAG--AGCTGAAT-TTGT-----------ATATTTCAGAGATGT---TTGTTTCTGTTAT---TGACCATCTATTCAGTGG-AATAAACAGTGTACATAGAGAGCAGTG-----TTTTTATTTTACTGACAACCC-TTGTT---A-------TG-G--G-C--AACAGCTAGCCGGGATC-ACCCAATAACAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAGGTACATATGTTAGACGTTTTAAACAAATTTTCGCGTGAAAATTGTATTGTTGTTATTATAA-TGTTAAAAGTACTT-TTATGATAaatatga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaACAGGAAATATGTAGTGCTAGAG---A-GATA-G-----AGATGA-----CGTTGGAATAG---TGA--TGTGATGATATGGTGGTAGATGAAATTAGACTCTTTGTACAATATACATGTATGTATCCAAATGAATAAGTATTAATTTTATATAGTGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATACTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTCGTAAAAAATATGACTG--ATATTGCAA------------AATTAGTATTAGGCCTACTATATCTTAATTATGATTGAATAAATTGA-GTAATATCAAT-GAA-ATGGAAAATAAT-GT----TGAATATAAAGCATGAAATTAAGCAATCTGTGATATTATAAATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATATG---TGTTGAA--AGCTGTAT-TTGT-----------ATATTTC--AGATGT---TTGTTTCTGTTAT---TTACTGTCTGATCAGCG---------------------GAGCAGTGTTTTTATTTAATGTTAC---------------------GTGTGTGCG--T-T--AACAGCTAGCCAGAATCAG-CCTATAACAtata
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CATCAGTTAACATTGATTAGT-AAAAATATGACT---AT-----AA------------TATTA-CCTAATGC-------------ATTATGATTGGATAAGTTGA-ATAATATC-AT-GGAAATGGAAAATAAA-GT----TTAATATAAAGCATGACATTAAGTAATCTGTGATATTATAAATATGATT-GTAGTACATGTGTTTTATATG-ATTTTTGAG--AGCTGAAT-TTGT-----------ATATTTCAGAGATGT---TTGTTTCTGTTAT---CTACCATCTAATCAGTGA-AATAAACAGTGTACATAGAGAGCAGTG----TTTTTTATTTTACTGACAgttat
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gtgttagagtgtaattttacagttttaagtattttaacatattaacatattagcatgtttccaatagtagtatacacagatttactggctttaaaattatactggtcaatgttgagtagttttgatgggaaaatattgccacctgacagtcaggtgaattctcattggtcgctatctattctaaattagtcttggaaagaaatctgcagtgtgaaattgtgttaatctgtcagttttatccttcaataagttgttttatttgcaagtttcacagtaattcaaagtaaactgtatgtagttctaagatcttttctgagatatatggacaacgtatagtttattgtgccatttgtggtgaagttgttattttaccgcttggacgtagtggtctttaatatttggaatctggaggattgaaggtagacactgttttttctttcatttatattttaagtgtctataagtatatattgactgtattattattaatcaaatgggttgatcattgacaaattttatctagaactgatatggagtattggttatgtgttactgtttatataataaataccaaaatgtatgtctgtaatgatatagataaaaaacactacgtgcgcccgcatgtctgctggaacattttatattATGAAATGAAGTAATCTGTGATATTATAATTATTATT-TTAGTATATTTCTTTAATATG-T-TTTTAAG--A--TGTGT-TTGT-----------ATATTTCATAGATGTTGGTTAA--ACATTAT---TTACCGTCTGATCAGGGA-AATAAACTTTGTACATGGAGAGCAGTA-----TTCTCA-TTTACTGACAACCC-TTGTG---GTTGGGTGAG-ACTG-T--AACA-CCAGC
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-622 )      :     TGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTTTAAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----TAAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ACACA--GATTTACTAGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGGTG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTATGCATTCTCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAGTTGTGTTA-TG----AGCTGTCAGTTTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCACAGTAGTTATAAATTAACTGCCTTGTATGTAGTT-----ATT-------AGATATTTGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTGGAGGACTGAAGGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATTTTAAGTGTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTANTATTAATCAAATGGATTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTGATATGGAGAATTGGCTATGTGTTACTGTGTATATCGTAAATGCCCAAATGCGCCTGTCTGTATTGATATAGAT-------------T-CGTCCGCATGTCGGCTGGGAACATTTTATATTTTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAATACTATTATCATTATTGTTATAAGGTAAATATGCTAGATGTTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGTGTATTGTTGTTATTTTAATTGTTAAAGGTACTTCTTCTAATATATGTACATACNTTNTATAAACAGGAAATATGTAGTGCTGGAGAGATA-----G-----AGATGA-----CGGTGGAATAG----GAGATGTGATGTGACGATGGTAGAAGAAATTAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCCGTATGAATAAGTATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTACATATGCTAATGCATCAGTTAACATTGATTAGT-AAAAATATGACT---AT-----AA------------TATT---------------AGTATAAGGCCTA--T--TATCTT-ATTATGATTGAATAAGTTGA-ATAATATCAT-GGAAATGGAAAATAAA-GT----TTAATATAAAGCATGAAATTAAGTAATCTGTGATATTATAAATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATATG--TTTTGAG--AGCTGTAT-TTGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TTACCGTCTGATCAGTGG-AATAAACAGTGTACATAGAGAGCAGTG-----TTTTTATTTTACTGAC-AACCCTT--NTTATTGNGTGTG-G--G-T--AACAGCTAGCCGGGATCAACCCTATAACA
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gi|19                         :     TGTGGTAGAGTGTAATTTTACCGTTTT-AAATATTTTAAAGTTTTAACATAATATTTTATGCATTTCCTATTAACACA----TTAGCTT-AAT-TCTAATA------TTAA-C---AT----ACATA--TATTTACTAGC-TTAAAATTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGGT
gi|2                          :    aTGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTC-AAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----AAATCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ACACA--GCTTTACTAGCTTAAAAGTTATCCTGGTCAAGGTTGGGTAGTTTTGGTG--GGAACATATTGTCACCTGACAATCTTATGCATTCTCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAG-ATTGGAAAGAAATT-TGGAGCGTAAATTTGTGTTA-TG----TGCTGTCAGTTTATATCTTTCCTGCTATAATT---------TATTTAATT-------TGCAAG----------------------CTGC-----AAGTAGTT-----ATT-------AGTTATTTGTACAA----TGTATAGTTTATTATGCCATTTGTAGTAAAGATATTATTTTATCGCTTGGAGGTAGCGGTCCTTGATATTTAGAATCTGGAGGATTGAAGGAAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATCTTAAGTGTCTATAAGTATTTATTTAATGTTTAAATGTTAATGAAATGGACTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAATTTAGAACTGATATCGAAAATTGACTATGTGTTAGTGTGCATATTGTAAATGCCCAAATGCGTCTGTCTGTATTGATATGGAT-------------T-CGTCCGTATGCCGGCTGGGAACATTTTATATCTTTTAATTATTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATAT-AATACTATT---ATTATTGTTATAAGTTAAATATGCTAGATGTTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGGGTATTGTTGTTATTTTAAATGTTAAAGGTTCTTCTTCAAATATATGCTCATACATTATATAAACAGGAAATATGTAGTGCTGGAGAAATAGAGATG-----AGATGA-----CGGTAGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGGTAGAAGAAATTACACTCTTTGCACCATATACATGTATGTATCCGTATGAATAAGTAT-TATTTTGTATATTGTATTTTCTGTGCAAAGAATTATATCAGTGCTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAAAATATGACT---AT-----GA------------TATTACATATTGCATTATAAGTATTAGGTCTA--TTATATCTTAATTATG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGGTACATATGTTAGACGTTTTAAACAAATTTTCGCGTGAAAATTGTATTGTTGTTATTATAA-TGTTAAAAGTACTT-TTATGATATAT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaTTATATGTAGTC-----ATT-------AGATATTTGGACAA----TGTACAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAAAGTTATTGTTTTACCACTTGGAGGTAGTa
gi|22                         : tgtgTGTAGTAGAGTGCAACTTTACTG-TTTTAAATAT--------TTTAAAG---------------------CTAGCAGACCCTT--GTAT-GTT----GACG------TTAA-T----T----ACAC-----TTTACCA
gi|24                         :                                                                                  A----TTAGCAT-GTT-TCCGATA------TTAAAC---ATTAAAATATAAGGATTTACTAGCTTTAAAATTATATTGGc
gi|3                          :       TGGTAGAGTGTAATTTGACTGTTTTAAAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTCACACA----TAAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-A---AT----ACAGA--GAATTACTTGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTAGGCATTTTCATTGGTCAACATCTATCCTAAATCAGTATTGAAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAGTTGTATTA-TA----AGCTGTCAGTTTATATATTTCCTTCAATACAT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATAGTAGTTATAAACTAACTACCTTGCATGTAGTT-----ATT-------AGATATTTGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTGGAATATTGAAGGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATTTTAAGTCTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTATTAATCACATGGATTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAAACTAGAACTAATATGGAGAATTAGCTATGTTTTATTGTGTATACCGGAAATGCCCAAATTCGCCAGTCTGTGTTGATGTAGAT-------------T-CGTCCGCATGTCGGCGGGGAATAGTTTG----TTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAATACAATTATCATTATTGTTATAAAGTAAATATGCTAGATGCTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGTGTATTTTTGTTACTTTAATTGTTAAATGTACTTCTTCTTATATATGTACATACATTATAAAAACAGGAAATATTTAGTGCTAGAGAGATA-----GAGATAAGATGA-----TGGTGGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGTTGGAAGAAATTAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATAAATAACTATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAATACAaac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GACATAGAGGACTGAC-ATGTGTTACTGTGT-TA----AAA---------GCGTCTGTCTGTATTGATATAAAT-------------G-TATCCGCATGTCGGCTGGAAACAATTTATATCTTTTAATCCTTTTAACCAATAGAAAGTTGAACAACGAAT-TAAATACTATTATCAATATTATTATTAAGTAAATTTGCTAGATGTTTGAAACAAATGTT------AAAGG---ACCGAGGTGCTTTT-----TCTAAGACAAGTC----AATACGT-TATA-ACTTTTTATAAACAGGAGACATGTAGAGCCGG---GATA-----A-----AGATGC-----AGGTGGAATA-----GAGATGTGGTGGGACGATGACAAAGGAAATTAGACTATTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAGTATTCATTTTGTATAACGTGTTTACTATGGAAATAATGATATCAATATTAGAATATTGTATATTTTACATTTGCTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAACATATGACTTTGAT-----AAAACAAAATGCATTATT---------------AGTATAAGGCCTATTT--TATCTT-ATTATGATTGAATAAGTTAAGATAAGA--ATAAGAAATGGAAAATAAATGT----TTAATTTAAAGCATGAAAT----TAATCTGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTATTTTATATG--TTTTAAA--AGCTGTAT-ATGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-ATACCATCTAATCAGTGG-AATACACAGTATACATAGAGAGCA-TG------TTTTA-TTTACTAACAAACCTTT--TTTATTGGGTGTG-G--GTT--TACAGCTAACCAGGATC-ACCCTATAATAca
gi|5                          :     TGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTT-AAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----TTAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ATACA--GATTTACTACTTTTAAAGTCATACTGGTCAAGGCTGAATAGTTTTTTCG--GGAAAATATTGTCACCTAACAATCTTATGCATTCTCATTGGTTAACATCTATTCTAAATTAATCTTGGAAAGAAATT-AGGTGTGTGAAGTTGTGTTAAGG----AGCTGTCAGTTTATATCTTTCATTCAATAAGT---------TATTTTATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATATTAATTATAAGTGTACTGTCT-GTATGTAGTTC----ATTTTTG---AGATATTTGGACAAGGTATATATAGTTTAATGTGCCATTTGTTGTAAAGATATAATTTTACCATTTGGAGGTAGTAGTCTTTCATATTTGGAATC------------GGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTCTATTTTAAGTGTTTATAACTATCTATTTACTGTATCATTATTAATCAAATGGATTGATAATCGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTGATATAGAGAATTGGCTATGTGTTACTGTGTATATTATAAATGCCCAAATGTGCCTGTCTGTATTGATATAGAT-------------G-CATCCGCATGTCGGCTGGGAACATTTTAAATTTTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAGTACTATTATCATTATTGTTATATGGTTAATATGCTAGATGTTTAAAACAACTATCTGTATGAGAAGTGTATTCTTGTTAt
gi|6                          :      GTGTTAGAGTGTAATTTTACAGTTTT-AAGTAT--------TTTAACATA-------------------TTAACATA----TTAGCAT-GTT-TCCAATA------GTAG-T---AT----ACACA--GATTTACTGGCTTTAAAATTATACTGGTCAATGTTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGCCACCTGACAGTCAGGTGAATTCTCATTGGTCGCTATCTATTCTAAATTAGTCTTGGAAAGAAATC-TGCAGTGTGAAATTGTGTTA-------ATCTGTCAGTTT-TATC----CTTCAATAAGT---------TGTTTTATTTGCAAG-------TTTCACAGTAATTCAAAGTAAACTG-----TATGTAGTTCTAAGATCTTTTCTGAGATATATGGACAA----CGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTGAAGTTGTTATTTTACCGCTTGGACGTAGTGGTCTTTAATATTTGGAATCTGGAGGATTGAAGGTAGACACTGTTTTTTCTTTCATTTATATTTTAAGTGTCTATAAGTATATATTGACTGTATTATTATTAATCAAATGGGTTGATCATTGACAAA-------TTTTA-TCTAGAACTGATATGGAGTATTGGTTATGTGTTACTGTTTATATAATAAATACCAAAATGTA--TGTCTGTAATGATATAGATAAAAAACACTACGTGCGCCCGCATGTCTGCT-GGAACATTTTATATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGAACAT-----T----TTA-TAT----TATGAAATGAAGTAATCTGTGATATTATAATTATTATT-TTAGTATAatgaaatgaagtaatctgtgatattataattattattttagtata
gi|7                          :                                                                                                                                       gtgttagagtgtaattttacagttttaagtattttaacatattaacatattagcatgtttccaatagtagtatacacagatttactggctttaaaattatactggtcaatgttgagtagttttgatgggaaaatattgccacctgacagtcaggtgaattctcattggtcgctatctattctaaattagtcttggaaagaaatctgcagtgtgaaattgtgttaatctgtcagttttatccttcaataagttgttttatttgcaagtttcacagtaattcaaagtaaactgtatgtagttctaagatcttttctgagatatatggacaacgtatagtttattgtgccatttgtggtgaagttgttattttaccgcttggacgtagtggtctttaatatttggaatctggaggattgaaggtagacactgttttttctttcatttatattttaagtgtctataagtatatattgactgtattattattaatcaaatgggttgatcattgacaaattttatctagaactgatatggagtattggttatgtgttactgtttatataataaataccaaaatgtatgtctgtaatgatatagataaaaaacactacgtgcgcccgcatgtctgcTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCAAATATAAATGCAATTATCATTAT------AAGGTAAATATGCTAGATGTTCGAAACAACTGTCTGTATAGAAAGTGTATTGTT---ATTTTAATTGTTAAAGGTACTTGGTCTAATATATGTACATACCTTCAATAAACAGGTAATATGTAGTGCTGGAGAGATA-----G-----AGATGAGATGATGGTGGAACAG-----AGATGTGATGTGACGATGGTGGAAGA---CAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAATATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAGTACATCAGTTAACATTGATTGGT-AAAAATATGACT---AT-----AA------------TATT---------------A-TCTAAGGC---------------ATTATGCTTGAACAAGTTGA-ATAATATCAT-GGAAATGGAAACTAAA-GT----TTAATATAAAAAATGACATTAAGTAATCGGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATACGTTTTTTGAG--AGCTGAAT-TTGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TGACCATCTATTCAGTGG-AATAAACAGTGTACATAGAGAGCAGTG-----TTTTTATTTTACTGAC-AACCCTT--GTTA-------TG-G--G-C--AACAGCTAGCCGGGATC-ACCCAATAACA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACAGGAAATATGTAGTGCTAGAGAGATA-----G-----AGATGA-----CGTTGGAATAG----T-GATGTGATGATATGGTGGTAGATGAAATTAGACTCTTTGTACAATATACATGTATGTATCCAAATGAATAAGTATTAATTTTATATAGTGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATACTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTCGTAAAAAATATGACTG--ATATTGCAA------------AATT---------------AGTATTAGGCCTA--CTATATCTTAATTATGATTGAATAAATTGA-GTAATATCAA-TGAAATGGAAAATAAT-GT----TGAATATAAAGCATGAAATTAAGCAATCTGTGATATTATAAATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATATG--TGTTGAA--AGCTGTAT-TTGT-----------ATATTTC--AGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TTACTGTCTGATCAGCG---------------------GAGCAGTG-----TTTTTATTT--------AA----T--GTTA-CGTGTGTGCG--T-T--AACAGCTAGCCAGAATCAG-CCTATAACAaatatga
gi|9                          :        GGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTTTAAATAT--------TTAAACGTA-------------------CTAACACA----TAAGCAT-GTG-TCCAATA------TTAA-C---TT----TTTCA--GAATAACTAGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGGTG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTATGAACTCCCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTTTAAAGTTGTTTTA-TG----AGCTGTCAGTCTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCACAGTAGTTATAAATTAACTGCCTTGTATGTAGTT-----ATA-------AGATATTCGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAAGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTAGAGGATTGAAGGTAGGAACTGTTATTCAATTCAgttat
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Unaligned ( gi|25 ): GTATATTAAAGGCCATAGAATATATTTAAACTACACTA






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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGATGTTGTCAATATAATTATGAATGTGTGTGTTT---ATG--CTATAAGCTATTCGTATCTTGTTAATTAGATTGATGTTTCAGAGATGTGTGTT--T----TATATTACCGTCTGACCA-TGGTAATACACGTTATATATGGTGAGAAGTG------CTTCA-TTTACTGAC-AATTCCTGAAATATT--GTGTG-G--C-TTAAAC-CCTAGCCGGGATCA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aacatcgatattcaatatcATGAAATGAAGTAATCTGTGATATTATAATTATTATT-TTAGTATATTTCTTTAATATG--TTTTTA---AGATGTGT-TTGT-----------ATATTTCATAGATGTTGGTTAAAC-ATTAT-TTACCGTCTGATCAGGGA-AATAAACTTTGTACATGGAGAGCAGTA-----TTCTCA-TTTACTGAC-AACCCTTG--TGGTTGGGTGAG-ACTG-T--AACA-CCAGCtcatg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatattTTATTTGTTTCATTTATATTTTACGTGTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTTTTAATCAAATTGATTGGCAATTGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTTATATGGAGAATTGGCTATGTGTTATTGTGTATAGTGGAAATGCCCAAATGCGCCAGTCTGTTTTGATATAGAA-------------T-CGTCCGTAT
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gi|2                          : aTGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTC-AAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----AAATCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ACACA--GCTTTACTAGCTTAAAAGTTATCCTGGTCAAGGTTGGGTAGTTTTGGTG--GGAACATATTGTCACCTGACAATCTTATGCATTCTCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAG-ATTGGAAAGAAATT-TGGAGCGTAAATTTGTGTTA-TG----TGCTGTCAGTTTATATCTTTCCTGCTATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCA--------AGTAGTTAT-------------------TAGT-------------------TATTTGTACAA----TGTATAGTTTATTATGCCATTTGTAGTAAAGATATTATTTTATCGCTTGGAGGTAGCGGTCCTTGATATTTAGAATCTGGAGGATTGAAGGAAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATCTTAAGTGTCTATAAGTATTTATTTAATGTTTAAATGTTAATGAAATGGACTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAATTTAGAACTGATATCGAAAATTGACTATGTGTTAGTGTGCATATTGTAAATGCCCAAATGCGTCTGTCTGTATTGATATGGAT-------------T-CGTCCGTATGCCGGCTGGGAACATTTTATATCTTTTAATTATTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATAT-AATACTATT---ATTATTGTTATAAGTTAAATATGCTAGATGTTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGGGTATTGTTGTTATTTTAAATGTTAAAGGTTCTTCTTCAAATATATGCTCATACATTATATAAACAGGAAATATGTAGTGCTGGAGAAATAGAGATG-----AGATGA-----CGGTAGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGGTAGAAGAAATTACACTCTTTGCACCATATACATGTATGTATCCGTATGAATAAGTAT-TATTTTGTATATTGTATTTTCTGTGCAAAGAATTATATCAGTGCTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAAAATATGACT---AT-----GA------------TATTACATATTGCATTATAAGTATTAGGT---CTATTA---TAT-CTTAATTATG
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gi|22                         :  TGTAGTAGAGTGCAACTTTACTG-TTTTAAATAT--------TTTAAAG---------------------CTAGCAGACCCTT--GTAT-GTT----GACG------TTAA-T----T----ACAC-----TTTACCA
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gi|3                          :    TGGTAGAGTGTAATTTGACTGTTTTAAAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTCACACA----TAAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-A---AT----ACAGA--GAATTACTTGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTAGGCATTTTCATTGGTCAACATCTATCCTAAATCAGTATTGAAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAGTTGTATTA-TA----AGCTGTCAGTTTATATATTTCCTTCAATACAT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATAGTAGTTATAAACTAACTACCTTGCATGTAGTT-----ATT-------AGATATTTGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTGGAATATTGAAGGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATTTTAAGTCTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTATTAATCACATGGATTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAAACTAGAACTAATATGGAGAATTAGCTATGTTTTATTGTGTATACCGGAAATGCCCAAATTCGCCAGTCTGTGTTGATGTAGAT-------------T-CGTCCGCATGTCGGCGGGGAATAGTTTG----TTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAATACAATTATCATTATTGTTATAAAGTAAATATGCTAGATGCTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGTGTATTTTTGTTACTTTAATTGTTAAATGTACTTCTTCTTATATATGTACATACATTATAAAAACAGGAAATATTTAGTGCTAGAGAGATA-----GAGATAAGATGA-----TGGTGGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGTTGGAAGAAATTAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATAAATAACTATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAATACAaac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GACATAGAGGACTGAC-ATGTGTTACTGTGT-TA----AAA---------GCGTCTGTCTGTATTGATATAAAT-------------G-TATCCGCATGTCGGCTGGAAACAATTTATATCTTTTAATCCTTTTAACCAATAGAAAGTTGAACAACGAAT-TAAATACTATTATCAATATTATTATTAAGTAAATTTGCTAGATGTTTGAAACAAATGTT------AAAGG---ACCGAGGTGCTTTT-----TCTAAGACAAGTC----AATACGT-TATA-ACTTTTTATAAACAGGAGACATGTAGAGCCGG---GATA-----A-----AGATGC-----AGGTGGAATA-----GAGATGTGGTGGGACGATGACAAAGGAAATTAGACTATTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAGTATTCATTTTGTATAACGTGTTTACTATGGAAATAATGATATCAATATTAGAATATTGTATATTTTACATTTGCTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAACATATGACTTTGAT-----AAAACAAAATGCATTATT---------------AGTATAAGGC---C---TATTTTAT-CTT-ATTATGATTGAATAAGTTAAGATAAGA--ATAAGAAATGGAAAATAAATGT----TTAATTTAAAGCATGAAAT----TAATCTGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTATTTTATATG--TTTTAAA--AGCTGTAT-ATGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-ATACCATCTAATCAGTGG-AATACACAGTATACATAGAGAGCA-TG------TTTTA-TTTACTAACAAACCTTTT--TTATTGGGTGTG-G--GTT--TACAGCTAACCAGGATC-ACCCTATAATAca
gi|5                          :  TGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTT-AAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----TTAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ATACA--GATTTACTACTTTTAAAGTCATACTGGTCAAGGCTGAATAGTTTTTTCG--GGAAAATATTGTCACCTAACAATCTTATGCATTCTCATTGGTTAACATCTATTCTAAATTAATCTTGGAAAGAAATT-AGGTGTGTGAAGTTGTGTTAAGG----AGCTGTCAGTTTATATCTTTCATTCAATAAGT---------TATTTTATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATATTAATTATAAGTGTACTGTCT-GTATGTAGTTC----ATTTTTG---AGATATTTGGACAAGGTATATATAGTTTAATGTGCCATTTGTTGTAAAGATATAATTTTACCATTTGGAGGTAGTAGTCTTTCATATTTGGAATC------------GGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTCTATTTTAAGTGTTTATAACTATCTATTTACTGTATCATTATTAATCAAATGGATTGATAATCGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTGATATAGAGAATTGGCTATGTGTTACTGTGTATATTATAAATGCCCAAATGTGCCTGTCTGTATTGATATAGAT-------------G-CATCCGCATGTCGGCTGGGAACATTTTAAATTTTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAGTACTATTATCATTATTGTTATATGGTTAATATGCTAGATGTTTAAAACAACTATCTGTATGAGAAGTGTATTCTTGTTAt
gi|6                          :   GTGTTAGAGTGTAATTTTACAGTTTT-AAGTAT--------TTTAACATA-------------------TTAACATA----TTAGCAT-GTT-TCCAATA------GTAG-T---AT----ACACA--GATTTACTGGCTTTAAAATTATACTGGTCAATGTTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGCCACCTGACAGTCAGGTGAATTCTCATTGGTCGCTATCTATTCTAAATTAGTCTTGGAAAGAAATC-TGCAGTGTGAAATTGTGTTA-------ATCTGTCAGTTT-TATC----CTTCAATAAGT---------TGTTTTATTTGCAAG-------TTTCACAGTAATTCAAAGTAAACTGT-----ATGTAGTTCTAAGATCTTTTCTGAGATATATGGACAA----CGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTGAAGTTGTTATTTTACCGCTTGGACGTAGTGGTCTTTAATATTTGGAATCTGGAGGATTGAAGGTAGACACTGTTTTTTCTTTCATTTATATTTTAAGTGTCTATAAGTATATATTGACTGTATTATTATTAATCAAATGGGTTGATCATTGACAAA-------TTTTA-TCTAGAACTGATATGGAGTATTGGTTATGTGTTACTGTTTATATAATAAATACCAAAATGTA--TGTCTGTAATGATATAGATAAAAAACACTACGTGCGCCCGCATGTCTGCT-GGAACATTTTATATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGAACAT-----T----TTA-TAT----TATGAAATGAAGTAATCTGTGATATTATAATTATTATT-TTAGTATAatgaaatgaagtaatctgtgatattataattattattttagtata
gi|7                          :                                                                                                                                    gtgttagagtgtaattttacagttttaagtattttaacatattaacatattagcatgtttccaatagtagtatacacagatttactggctttaaaattatactggtcaatgttgagtagttttgatgggaaaatattgccacctgacagtcaggtgaattctcattggtcgctatctattctaaattagtcttggaaagaaatctgcagtgtgaaattgtgttaatctgtcagttttatccttcaataagttgttttatttgcaagtttcacagtaattcaaagtaaactgtatgtagttctaagatcttttctgagatatatggacaacgtatagtttattgtgccatttgtggtgaagttgttattttaccgcttggacgtagtggtctttaatatttggaatctggaggattgaaggtagacactgttttttctttcatttatattttaagtgtctataagtatatattgactgtattattattaatcaaatgggttgatcattgacaaattttatctagaactgatatggagtattggttatgtgttactgtttatataataaataccaaaatgtatgtctgtaatgatatagataaaaaacactacgtgcgcccgcatgtctgcTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCAAATATAAATGCAATTATCATTAT------AAGGTAAATATGCTAGATGTTCGAAACAACTGTCTGTATAGAAAGTGTATTGTT---ATTTTAATTGTTAAAGGTACTTGGTCTAATATATGTACATACCTTCAATAAACAGGTAATATGTAGTGCTGGAGAGATA-----G-----AGATGAGATGATGGTGGAACAG-----AGATGTGATGTGACGATGGTGGAAGA---CAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAATATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAGTACATCAGTTAACATTGATTGGT-AAAAATATGACT---AT-----AA------------TATT---------------A-TCTAAGGC--------------------ATTATGCTTGAACAAGTTGA-ATAATATCAT-GGAAATGGAAACTAAA-GT----TTAATATAAAAAATGACATTAAGTAATCGGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATACGTTTTTTGAG--AGCTGAAT-TTGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TGACCATCTATTCAGTGG-AATAAACAGTGTACATAGAGAGCAGTG-----TTTTTATTTTACTGAC-AACCCTTG--TTA-------TG-G--G-C--AACAGCTAGCCGGGATC-ACCCAATAACA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACAGGAAATATGTAGTGCTAGAGAGATA-----G-----AGATGA-----CGTTGGAATAG----T-GATGTGATGATATGGTGGTAGATGAAATTAGACTCTTTGTACAATATACATGTATGTATCCAAATGAATAAGTATTAATTTTATATAGTGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATACTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTCGTAAAAAATATGACTG--ATATTGCAA------------AATT---------------AGTATTAGGCCTAC---TA---TAT-CTTAATTATGATTGAATAAATTGA-GTAATATCAA-TGAAATGGAAAATAAT-GT----TGAATATAAAGCATGAAATTAAGCAATCTGTGATATTATAAATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATATG--TGTTGAA--AGCTGTAT-TTGT-----------ATATTTC--AGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TTACTGTCTGATCAGCG---------------------GAGCAGTG-----TTTTTATTT--------AA----TG--TTA-CGTGTGTGCG--T-T--AACAGCTAGCCAGAATCAG-CCTATAACAaatatga
gi|9                          :     GGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTTTAAATAT--------TTAAACGTA-------------------CTAACACA----TAAGCAT-GTG-TCCAATA------TTAA-C---TT----TTTCA--GAATAACTAGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGGTG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTATGAACTCCCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTTTAAAGTTGTTTTA-TG----AGCTGTCAGTCTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCACAGTAGTTATAAATTAACTGCCTTGTATGTAGTT-----ATA-------AGATATTCGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAAGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTAGAGGATTGAAGGTAGGAACTGTTATTCAATTCAgttat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGATGTTGTCAATATAATTATGAATGTGTGTGTTT---ATG--CTATAAGCTATTCGTATCTTGTTAATTAGATTGATGTTTCAGAGATGTGTGTT--T----TATATTACCGTCTGACCA-TGGTAATACACGTTATATATGGTGAGAAGTG------CTTCA-TTTACTGAC-AATTCCTGAAATATT--GTGTG-G--C-TTAAAC-CCTAGCCGGGATCA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aacatcgatattcaatatcATGAAATGAAGTAATCTGTGATATTATAATTATTATT-TTAGTATATTTCTTTAATATG--TTTTTA---AGATGTGT-TTGT-----------ATATTTCATAGATGTTGGTTAAAC-ATTAT-TTACCGTCTGATCAGGGA-AATAAACTTTGTACATGGAGAGCAGTA-----TTCTCA-TTTACTGAC-AACCCTTG--TGGTTGGGTGAG-ACTG-T--AACA-CCAGCtcatg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatattTTATTTGTTTCATTTATATTTTACGTGTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTTTTAATCAAATTGATTGGCAATTGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTTATATGGAGAATTGGCTATGTGTTATTGTGTATAGTGGAAATGCCCAAATGCGCCAGTCTGTTTTGATATAGAA-------------T-CGTCCGTAT
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gi|2                          : aTGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTC-AAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----AAATCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ACACA--GCTTTACTAGCTTAAAAGTTATCCTGGTCAAGGTTGGGTAGTTTTGGTG--GGAACATATTGTCACCTGACAATCTTATGCATTCTCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAG-ATTGGAAAGAAATT-TGGAGCGTAAATTTGTGTTA-TG----TGCTGTCAGTTTATATCTTTCCTGCTATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCA--------AGTAGTTAT-------------------TAGT-------------------TATTTGTACAA----TGTATAGTTTATTATGCCATTTGTAGTAAAGATATTATTTTATCGCTTGGAGGTAGCGGTCCTTGATATTTAGAATCTGGAGGATTGAAGGAAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATCTTAAGTGTCTATAAGTATTTATTTAATGTTTAAATGTTAATGAAATGGACTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAATTTAGAACTGATATCGAAAATTGACTATGTGTTAGTGTGCATATTGTAAATGCCCAAATGCGTCTGTCTGTATTGATATGGAT-------------T-CGTCCGTATGCCGGCTGGGAACATTTTATATCTTTTAATTATTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATAT-AATACTATT---ATTATTGTTATAAGTTAAATATGCTAGATGTTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGGGTATTGTTGTTATTTTAAATGTTAAAGGTTCTTCTTCAAATATATGCTCATACATTATATAAACAGGAAATATGTAGTGCTGGAGAAATAGAGATG-----AGATGA-----CGGTAGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGGTAGAAGAAATTACACTCTTTGCACCATATACATGTATGTATCCGTATGAATAAGTAT-TATTTTGTATATTGTATTTTCTGTGCAAAGAATTATATCAGTGCTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAAAATATGACT---AT-----GA------------TATTACATATTGCATTATAAGTATTAGGT---CTATTA---TAT-CTTAATTATG
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gi|22                         :  TGTAGTAGAGTGCAACTTTACTG-TTTTAAATAT--------TTTAAAG---------------------CTAGCAGACCCTT--GTAT-GTT----GACG------TTAA-T----T----ACAC-----TTTACCA
gi|24                         :                                                                               A----TTAGCAT-GTT-TCCGATA------TTAAAC---ATTAAAATATAAGGATTTACTAGCTTTAAAATTATATTGGc
gi|3                          :    TGGTAGAGTGTAATTTGACTGTTTTAAAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTCACACA----TAAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-A---AT----ACAGA--GAATTACTTGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTAGGCATTTTCATTGGTCAACATCTATCCTAAATCAGTATTGAAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAGTTGTATTA-TA----AGCTGTCAGTTTATATATTTCCTTCAATACAT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATAGTAGTTATAAACTAACTACCTTGCATGTAGTT-----ATT-------AGATATTTGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTGGAATATTGAAGGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATTTTAAGTCTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTATTAATCACATGGATTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAAACTAGAACTAATATGGAGAATTAGCTATGTTTTATTGTGTATACCGGAAATGCCCAAATTCGCCAGTCTGTGTTGATGTAGAT-------------T-CGTCCGCATGTCGGCGGGGAATAGTTTG----TTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAATACAATTATCATTATTGTTATAAAGTAAATATGCTAGATGCTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGTGTATTTTTGTTACTTTAATTGTTAAATGTACTTCTTCTTATATATGTACATACATTATAAAAACAGGAAATATTTAGTGCTAGAGAGATA-----GAGATAAGATGA-----TGGTGGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGTTGGAAGAAATTAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATAAATAACTATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAATACAaac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GACATAGAGGACTGAC-ATGTGTTACTGTGT-TA----AAA---------GCGTCTGTCTGTATTGATATAAAT-------------G-TATCCGCATGTCGGCTGGAAACAATTTATATCTTTTAATCCTTTTAACCAATAGAAAGTTGAACAACGAAT-TAAATACTATTATCAATATTATTATTAAGTAAATTTGCTAGATGTTTGAAACAAATGTT------AAAGG---ACCGAGGTGCTTTT-----TCTAAGACAAGTC----AATACGT-TATA-ACTTTTTATAAACAGGAGACATGTAGAGCCGG---GATA-----A-----AGATGC-----AGGTGGAATA-----GAGATGTGGTGGGACGATGACAAAGGAAATTAGACTATTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAGTATTCATTTTGTATAACGTGTTTACTATGGAAATAATGATATCAATATTAGAATATTGTATATTTTACATTTGCTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAACATATGACTTTGAT-----AAAACAAAATGCATTATT---------------AGTATAAGGC---C---TATTTTAT-CTT-ATTATGATTGAATAAGTTAAGATAAGA--ATAAGAAATGGAAAATAAATGT----TTAATTTAAAGCATGAAAT----TAATCTGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTATTTTATATG--TTTTAAA--AGCTGTAT-ATGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-ATACCATCTAATCAGTGG-AATACACAGTATACATAGAGAGCA-TG------TTTTA-TTTACTAACAAACCTTTT--TTATTGGGTGTG-G--GTT--TACAGCTAACCAGGATC-ACCCTATAATAca
gi|5                          :  TGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTT-AAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----TTAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ATACA--GATTTACTACTTTTAAAGTCATACTGGTCAAGGCTGAATAGTTTTTTCG--GGAAAATATTGTCACCTAACAATCTTATGCATTCTCATTGGTTAACATCTATTCTAAATTAATCTTGGAAAGAAATT-AGGTGTGTGAAGTTGTGTTAAGG----AGCTGTCAGTTTATATCTTTCATTCAATAAGT---------TATTTTATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATATTAATTATAAGTGTACTGTCT-GTATGTAGTTC----ATTTTTG---AGATATTTGGACAAGGTATATATAGTTTAATGTGCCATTTGTTGTAAAGATATAATTTTACCATTTGGAGGTAGTAGTCTTTCATATTTGGAATC------------GGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTCTATTTTAAGTGTTTATAACTATCTATTTACTGTATCATTATTAATCAAATGGATTGATAATCGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTGATATAGAGAATTGGCTATGTGTTACTGTGTATATTATAAATGCCCAAATGTGCCTGTCTGTATTGATATAGAT-------------G-CATCCGCATGTCGGCTGGGAACATTTTAAATTTTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAGTACTATTATCATTATTGTTATATGGTTAATATGCTAGATGTTTAAAACAACTATCTGTATGAGAAGTGTATTCTTGTTAt
gi|6                          :   GTGTTAGAGTGTAATTTTACAGTTTT-AAGTAT--------TTTAACATA-------------------TTAACATA----TTAGCAT-GTT-TCCAATA------GTAG-T---AT----ACACA--GATTTACTGGCTTTAAAATTATACTGGTCAATGTTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGCCACCTGACAGTCAGGTGAATTCTCATTGGTCGCTATCTATTCTAAATTAGTCTTGGAAAGAAATC-TGCAGTGTGAAATTGTGTTA-------ATCTGTCAGTTT-TATC----CTTCAATAAGT---------TGTTTTATTTGCAAG-------TTTCACAGTAATTCAAAGTAAACTGT-----ATGTAGTTCTAAGATCTTTTCTGAGATATATGGACAA----CGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTGAAGTTGTTATTTTACCGCTTGGACGTAGTGGTCTTTAATATTTGGAATCTGGAGGATTGAAGGTAGACACTGTTTTTTCTTTCATTTATATTTTAAGTGTCTATAAGTATATATTGACTGTATTATTATTAATCAAATGGGTTGATCATTGACAAA-------TTTTA-TCTAGAACTGATATGGAGTATTGGTTATGTGTTACTGTTTATATAATAAATACCAAAATGTA--TGTCTGTAATGATATAGATAAAAAACACTACGTGCGCCCGCATGTCTGCT-GGAACATTTTATATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGAACAT-----T----TTA-TAT----TATGAAATGAAGTAATCTGTGATATTATAATTATTATT-TTAGTATAatgaaatgaagtaatctgtgatattataattattattttagtata
gi|7                          :                                                                                                                                    gtgttagagtgtaattttacagttttaagtattttaacatattaacatattagcatgtttccaatagtagtatacacagatttactggctttaaaattatactggtcaatgttgagtagttttgatgggaaaatattgccacctgacagtcaggtgaattctcattggtcgctatctattctaaattagtcttggaaagaaatctgcagtgtgaaattgtgttaatctgtcagttttatccttcaataagttgttttatttgcaagtttcacagtaattcaaagtaaactgtatgtagttctaagatcttttctgagatatatggacaacgtatagtttattgtgccatttgtggtgaagttgttattttaccgcttggacgtagtggtctttaatatttggaatctggaggattgaaggtagacactgttttttctttcatttatattttaagtgtctataagtatatattgactgtattattattaatcaaatgggttgatcattgacaaattttatctagaactgatatggagtattggttatgtgttactgtttatataataaataccaaaatgtatgtctgtaatgatatagataaaaaacactacgtgcgcccgcatgtctgcTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCAAATATAAATGCAATTATCATTAT------AAGGTAAATATGCTAGATGTTCGAAACAACTGTCTGTATAGAAAGTGTATTGTT---ATTTTAATTGTTAAAGGTACTTGGTCTAATATATGTACATACCTTCAATAAACAGGTAATATGTAGTGCTGGAGAGATA-----G-----AGATGAGATGATGGTGGAACAG-----AGATGTGATGTGACGATGGTGGAAGA---CAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAATATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAGTACATCAGTTAACATTGATTGGT-AAAAATATGACT---AT-----AA------------TATT---------------A-TCTAAGGC--------------------ATTATGCTTGAACAAGTTGA-ATAATATCAT-GGAAATGGAAACTAAA-GT----TTAATATAAAAAATGACATTAAGTAATCGGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATACGTTTTTTGAG--AGCTGAAT-TTGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TGACCATCTATTCAGTGG-AATAAACAGTGTACATAGAGAGCAGTG-----TTTTTATTTTACTGAC-AACCCTTG--TTA-------TG-G--G-C--AACAGCTAGCCGGGATC-ACCCAATAACA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACAGGAAATATGTAGTGCTAGAGAGATA-----G-----AGATGA-----CGTTGGAATAG----T-GATGTGATGATATGGTGGTAGATGAAATTAGACTCTTTGTACAATATACATGTATGTATCCAAATGAATAAGTATTAATTTTATATAGTGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATACTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTCGTAAAAAATATGACTG--ATATTGCAA------------AATT---------------AGTATTAGGCCTAC---TA---TAT-CTTAATTATGATTGAATAAATTGA-GTAATATCAA-TGAAATGGAAAATAAT-GT----TGAATATAAAGCATGAAATTAAGCAATCTGTGATATTATAAATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATATG--TGTTGAA--AGCTGTAT-TTGT-----------ATATTTC--AGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TTACTGTCTGATCAGCG---------------------GAGCAGTG-----TTTTTATTT--------AA----TG--TTA-CGTGTGTGCG--T-T--AACAGCTAGCCAGAATCAG-CCTATAACAaatatga
gi|9                          :     GGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTTTAAATAT--------TTAAACGTA-------------------CTAACACA----TAAGCAT-GTG-TCCAATA------TTAA-C---TT----TTTCA--GAATAACTAGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGGTG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTATGAACTCCCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTTTAAAGTTGTTTTA-TG----AGCTGTCAGTCTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCACAGTAGTTATAAATTAACTGCCTTGTATGTAGTT-----ATA-------AGATATTCGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAAGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTAGAGGATTGAAGGTAGGAACTGTTATTCAATTCAgttat


blockSeqs                     :                    G        T      TTTAAAGT         ATATTTTATGCATTTCCTA        CCCT A     T   G       ATACCA    A GTA  TAAA     AG                                                 TT                                                                             A                    A  TTGA                                GTTTACAAG                                         T       TT          CTAAG   TTTTCTG              GGTA                                                                                                                                                         G                              G                                                       GT G               C                    AAAAAACACTACGTG                            T                                                                                                                 G                A A              CT                  A  A                                 GAGATG           GATGAT         GT                                                                                C                                                                                                A            ATGATATTACATATTGCATTATAAGTATTAGGTCTATTATATCTTA                                               G          A                T  .                      T                             A               T     AT      GCT        C    TAATTAGATTG                    AA  T     A                 GT    A  AG                  TT         T         A  T     AA   TTGG     C CTTA       C            A C
blockSeqs                     :                    G        T      A                .                          .    A     .   .       .         . .    .        .                                                  .                                                                              .                    .  .                                   .                                                 T       TT          C       TTTG                 .                                                                                                                                                            A                              G                                                       TT T               T                    T                                          T                                                                                                                 T                A T              CT                  A  A                                 GAGATA           C              G                                                                                 T                                                                                                .            TTGATAAAACAAAATGCATTATTAGTATAAGGCCTATTTTATCTT                                                .          .                .  .                      G                             .               A     TT      G          .    .                              .   T     .                 A     C  GT                  T          T         .  C     .    TTGG     . CTGT       G            A C
blockSeqs                     :                    T        A      .                .                          .    A     .   .       .         . .    .        .                                                  .                                                                              .                    .  .                                   .                                                 A       TT          .       .                    .                                                                                                                                                            G                              G                                                       CC G               C                    T                                          A                                                                                                                 T                A T              GG                  T  T                                 A                T              G                                                                                 C                                                                                                .            GATATTGCAAAATTAGTATTAGGCCTACTATATCTTA                                                        .          .                .  .                      G                             .               T     .       A          .    .                              .   T     .                 A     A  TT                  T          T         .  C     .    CGT      . GTT        G            . .
blockSeqs                     :                    G        T      .                .                          .    A     .   .       .         . .    .        .                                                  .                                                                              .                    .  .                                   .                                                 T       TT          .       .                    .                                                                                                                                                            T                              G                                                       TT T               T                    T                                          T                                                                                                                 T                A .              T                   C  C                                 G                A              G                                                                                 T                                                                                                .            ATAATATTACCTAATGC                                                                            .          .                .  .                      T                             .               T     .       G          .    .                              .   T     .                 G     C  AG                  T          .         .  C     .    TT       . GC         G            .  
blockSeqs                     :                    T        T      .                .                          .    A     .   .       .         . .    .        .                                                  .                                                                              .                    .  .                                   .                                                 G       TT          .       .                    .                                                                                                                                                            T                              .                                                       TA T               C                    G                                          .                                                                                                                 T                . .              C                                                        G                C              G                                                                                 .                                                                                                .            ATAATATTATCTAAGGC                                                                                                        .  .                      T                             .               T     .       A          .    .                              .   .     .                 G     A  AG                  .          .         .  .     .    .        . TT         .               
blockSeqs                     :                    T        A      .                .                          .    T     .   .       .         . .    .        .                                                  .                                                                              .                    .  .                                   .                                                 A       T           .       .                    .                                                                                                                                                                                                                                                   .  .               .                    G                                                                                                                                                            .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                             .               .     .       .          .    .                              .   .     .                 .     .  .                   .          .         .                                                   
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aGATGTTGTCAATATAATTATGAATGTGTGTGTTT---ATG--CTATAAGCTATTCGTATCTTGTTAATTAGATTGATGTTTCAGAGATGTGTGTT--T----TATATTACCGTCTGACCA-TGGTAATACACGTTATATATGGTGAGAAGTG------CTTCA-TTTACTGAC-AATTCCTGAAATATT--GTGTG-G--C-TTAAAC-CCTAGCCGGGATCA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aacatcgatattcaatatcATGAAATGAAGTAATCTGTGATATTATAATTATTATT-TTAGTATATTTCTTTAATATG--TTTTTA---AGATGTGT-TTGT-----------ATATTTCATAGATGTTGGTTAAAC-ATTAT-TTACCGTCTGATCAGGGA-AATAAACTTTGTACATGGAGAGCAGTA-----TTCTCA-TTTACTGAC-AACCCTTG--TGGTTGGGTGAG-ACTG-T--AACA-CCAGCtcatg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatattTTATTTGTTTCATTTATATTTTACGTGTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTTTTAATCAAATTGATTGGCAATTGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTTATATGGAGAATTGGCTATGTGTTATTGTGTATAGTGGAAATGCCCAAATGCGCCAGTCTGTTTTGATATAGAA-------------T-CGTCCGTAT
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gi|2                          : aTGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTC-AAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----AAATCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ACACA--GCTTTACTAGCTTAAAAGTTATCCTGGTCAAGGTTGGGTAGTTTTGGTG--GGAACATATTGTCACCTGACAATCTTATGCATTCTCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAG-ATTGGAAAGAAATT-TGGAGCGTAAATTTGTGTTA-TG----TGCTGTCAGTTTATATCTTTCCTGCTATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCA--------AGTAGTTAT-------------------TAGT-------------------TATTTGTACAA----TGTATAGTTTATTATGCCATTTGTAGTAAAGATATTATTTTATCGCTTGGAGGTAGCGGTCCTTGATATTTAGAATCTGGAGGATTGAAGGAAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATCTTAAGTGTCTATAAGTATTTATTTAATGTTTAAATGTTAATGAAATGGACTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAATTTAGAACTGATATCGAAAATTGACTATGTGTTAGTGTGCATATTGTAAATGCCCAAATGCGTCTGTCTGTATTGATATGGAT-------------T-CGTCCGTATGCCGGCTGGGAACATTTTATATCTTTTAATTATTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATAT-AATACTATT---ATTATTGTTATAAGTTAAATATGCTAGATGTTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGGGTATTGTTGTTATTTTAAATGTTAAAGGTTCTTCTTCAAATATATGCTCATACATTATATAAACAGGAAATATGTAGTGCTGGAGAAATAGAGATG-----AGATGA-----CGGTAGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGGTAGAAGAAATTACACTCTTTGCACCATATACATGTATGTATCCGTATGAATAAGTAT-TATTTTGTATATTGTATTTTCTGTGCAAAGAATTATATCAGTGCTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAAAATATGACT---AT-----GA------------TATTACATATTGCATTATAAGTATTAGGT---CTATTA---TAT-CTTAATTATG
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gi|22                         :  TGTAGTAGAGTGCAACTTTACTG-TTTTAAATAT--------TTTAAAG---------------------CTAGCAGACCCTT--GTAT-GTT----GACG------TTAA-T----T----ACAC-----TTTACCA
gi|24                         :                                                                               A----TTAGCAT-GTT-TCCGATA------TTAAAC---ATTAAAATATAAGGATTTACTAGCTTTAAAATTATATTGGc
gi|3                          :    TGGTAGAGTGTAATTTGACTGTTTTAAAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTCACACA----TAAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-A---AT----ACAGA--GAATTACTTGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTAGGCATTTTCATTGGTCAACATCTATCCTAAATCAGTATTGAAAAGAAATT-TGGTGTGTAAAGTTGTATTA-TA----AGCTGTCAGTTTATATATTTCCTTCAATACAT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATAGTAGTTATAAACTAACTACCTTGCATGTAGTT-----ATT-------AGATATTTGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAGGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTGGAATATTGAAGGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTATATTTTAAGTCTCTATAAGTATTTATTTACTGTATTAGTATTAATCACATGGATTGATAATTGACAAAGGATAAATTATAAACTAGAACTAATATGGAGAATTAGCTATGTTTTATTGTGTATACCGGAAATGCCCAAATTCGCCAGTCTGTGTTGATGTAGAT-------------T-CGTCCGCATGTCGGCGGGGAATAGTTTG----TTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAATACAATTATCATTATTGTTATAAAGTAAATATGCTAGATGCTTGAAACAACTGTCTGTATGAAAAGTGTATTTTTGTTACTTTAATTGTTAAATGTACTTCTTCTTATATATGTACATACATTATAAAAACAGGAAATATTTAGTGCTAGAGAGATA-----GAGATAAGATGA-----TGGTGGAATA-----GAGATGTGATGTGACGATGTTGGAAGAAATTAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATAAATAACTATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAATACAaac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GACATAGAGGACTGAC-ATGTGTTACTGTGT-TA----AAA---------GCGTCTGTCTGTATTGATATAAAT-------------G-TATCCGCATGTCGGCTGGAAACAATTTATATCTTTTAATCCTTTTAACCAATAGAAAGTTGAACAACGAAT-TAAATACTATTATCAATATTATTATTAAGTAAATTTGCTAGATGTTTGAAACAAATGTT------AAAGG---ACCGAGGTGCTTTT-----TCTAAGACAAGTC----AATACGT-TATA-ACTTTTTATAAACAGGAGACATGTAGAGCCGG---GATA-----A-----AGATGC-----AGGTGGAATA-----GAGATGTGGTGGGACGATGACAAAGGAAATTAGACTATTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAGTATTCATTTTGTATAACGTGTTTACTATGGAAATAATGATATCAATATTAGAATATTGTATATTTTACATTTGCTAATGTATCAGTTAACATTGATTAGT-AAACATATGACTTTGAT-----AAAACAAAATGCATTATT---------------AGTATAAGGC---C---TATTTTAT-CTT-ATTATGATTGAATAAGTTAAGATAAGA--ATAAGAAATGGAAAATAAATGT----TTAATTTAAAGCATGAAAT----TAATCTGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTATTTTATATG--TTTTAAA--AGCTGTAT-ATGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-ATACCATCTAATCAGTGG-AATACACAGTATACATAGAGAGCA-TG------TTTTA-TTTACTAACAAACCTTTT--TTATTGGGTGTG-G--GTT--TACAGCTAACCAGGATC-ACCCTATAATAca
gi|5                          :  TGTGGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTT-AAATAT--------TTTAACGTA-------------------CTAACACA----TTAGCAT-GTT-TCCAATA------TTAA-C---AT----ATACA--GATTTACTACTTTTAAAGTCATACTGGTCAAGGCTGAATAGTTTTTTCG--GGAAAATATTGTCACCTAACAATCTTATGCATTCTCATTGGTTAACATCTATTCTAAATTAATCTTGGAAAGAAATT-AGGTGTGTGAAGTTGTGTTAAGG----AGCTGTCAGTTTATATCTTTCATTCAATAAGT---------TATTTTATTTGCAAGCTGCAAGTTTCATATTAATTATAAGTGTACTGTCT-GTATGTAGTTC----ATTTTTG---AGATATTTGGACAAGGTATATATAGTTTAATGTGCCATTTGTTGTAAAGATATAATTTTACCATTTGGAGGTAGTAGTCTTTCATATTTGGAATC------------GGTAGGAACTGTTATTTGTTTCATTTCTATTTTAAGTGTTTATAACTATCTATTTACTGTATCATTATTAATCAAATGGATTGATAATCGACAAAGGATAAATTATAATCTAGAACTGATATAGAGAATTGGCTATGTGTTACTGTGTATATTATAAATGCCCAAATGTGCCTGTCTGTATTGATATAGAT-------------G-CATCCGCATGTCGGCTGGGAACATTTTAAATTTTTTAATCCTTTTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCGAATATAAGTACTATTATCATTATTGTTATATGGTTAATATGCTAGATGTTTAAAACAACTATCTGTATGAGAAGTGTATTCTTGTTAt
gi|6                          :   GTGTTAGAGTGTAATTTTACAGTTTT-AAGTAT--------TTTAACATA-------------------TTAACATA----TTAGCAT-GTT-TCCAATA------GTAG-T---AT----ACACA--GATTTACTGGCTTTAAAATTATACTGGTCAATGTTGAGTAGTTTTGATG--GGAAAATATTGCCACCTGACAGTCAGGTGAATTCTCATTGGTCGCTATCTATTCTAAATTAGTCTTGGAAAGAAATC-TGCAGTGTGAAATTGTGTTA-------ATCTGTCAGTTT-TATC----CTTCAATAAGT---------TGTTTTATTTGCAAG-------TTTCACAGTAATTCAAAGTAAACTGT-----ATGTAGTTCTAAGATCTTTTCTGAGATATATGGACAA----CGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTGAAGTTGTTATTTTACCGCTTGGACGTAGTGGTCTTTAATATTTGGAATCTGGAGGATTGAAGGTAGACACTGTTTTTTCTTTCATTTATATTTTAAGTGTCTATAAGTATATATTGACTGTATTATTATTAATCAAATGGGTTGATCATTGACAAA-------TTTTA-TCTAGAACTGATATGGAGTATTGGTTATGTGTTACTGTTTATATAATAAATACCAAAATGTA--TGTCTGTAATGATATAGATAAAAAACACTACGTGCGCCCGCATGTCTGCT-GGAACATTTTATATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGAACAT-----T----TTA-TAT----TATGAAATGAAGTAATCTGTGATATTATAATTATTATT-TTAGTATAatgaaatgaagtaatctgtgatattataattattattttagtata
gi|7                          :                                                                                                                                    gtgttagagtgtaattttacagttttaagtattttaacatattaacatattagcatgtttccaatagtagtatacacagatttactggctttaaaattatactggtcaatgttgagtagttttgatgggaaaatattgccacctgacagtcaggtgaattctcattggtcgctatctattctaaattagtcttggaaagaaatctgcagtgtgaaattgtgttaatctgtcagttttatccttcaataagttgttttatttgcaagtttcacagtaattcaaagtaaactgtatgtagttctaagatcttttctgagatatatggacaacgtatagtttattgtgccatttgtggtgaagttgttattttaccgcttggacgtagtggtctttaatatttggaatctggaggattgaaggtagacactgttttttctttcatttatattttaagtgtctataagtatatattgactgtattattattaatcaaatgggttgatcattgacaaattttatctagaactgatatggagtattggttatgtgttactgtttatataataaataccaaaatgtatgtctgtaatgatatagataaaaaacactacgtgcgcccgcatgtctgcTAAGCAATAGAAAGTTGAACAGCAAATATAAATGCAATTATCATTAT------AAGGTAAATATGCTAGATGTTCGAAACAACTGTCTGTATAGAAAGTGTATTGTT---ATTTTAATTGTTAAAGGTACTTGGTCTAATATATGTACATACCTTCAATAAACAGGTAATATGTAGTGCTGGAGAGATA-----G-----AGATGAGATGATGGTGGAACA-----GAGATGTGATGTGACGATGGTGGAAGA---CAGACTCTTTGTACCATATACATGTATGTATCTGTATGAATAAATATCCATTTTATATAATGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATGCTAGAATATTGTATATTTTGCATATGCTAGTACATCAGTTAACATTGATTGGT-AAAAATATGACT---AT-----AA------------TATT---------------A-TCTAAGGC--------------------ATTATGCTTGAACAAGTTGA-ATAATATCAT-GGAAATGGAAACTAAA-GT----TTAATATAAAAAATGACATTAAGTAATCGGTGATATTATACATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATACGTTTTTTGAG--AGCTGAAT-TTGT-----------ATATTTCAGAGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TGACCATCTATTCAGTGG-AATAAACAGTGTACATAGAGAGCAGTG-----TTTTTATTTTACTGAC-AACCCTTG--TTA-------TG-G--G-C--AACAGCTAGCCGGGATC-ACCCAATAACA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACAGGAAATATGTAGTGCTAGAGAGATA-----G-----AGATGA-----CGTTGGAATA-----GTGATGTGATGATATGGTGGTAGATGAAATTAGACTCTTTGTACAATATACATGTATGTATCCAAATGAATAAGTATTAATTTTATATAGTGTGTTTACTATGCAAATGATGATAGCAATACTAGAATATTGTATATTTTACATATGTTAATGTATCAGTTAACATTGATTCGTAAAAAATATGACTG--ATATTGCAA------------AATT---------------AGTATTAGGCCTAC---TA---TAT-CTTAATTATGATTGAATAAATTGA-GTAATATCAA-TGAAATGGAAAATAAT-GT----TGAATATAAAGCATGAAATTAAGCAATCTGTGATATTATAAATATGATT-TTAGTATATGTGTTTTATATG--TGTTGAA--AGCTGTAT-TTGT-----------ATATTTC--AGATGTTTGTT--TCTGTTAT-TTACTGTCTGATCAGCG---------------------GAGCAGTG-----TTTTTATTT--------AA----TG--TTA-CGTGTGTGCG--T-T--AACAGCTAGCCAGAATCAG-CCTATAACAaatatga
gi|9                          :     GGTAGAGTGTAATTTTACTGTTTTTAAATAT--------TTAAACGTA-------------------CTAACACA----TAAGCAT-GTG-TCCAATA------TTAA-C---TT----TTTCA--GAATAACTAGCTTTAAAGTTATACTGGTCAAGGCTGAGTAGTTTTGGTG--GGAAAATATTGTCACCTGACAATCTTATGAACTCCCATTGGTCAACATCTATTCTAAATCAGTCTTGGAAAGAAATT-TGGTGTTTAAAGTTGTTTTA-TG----AGCTGTCAGTCTATATCTTTCCTTCAATAATT---------TATTTAATTTGCAAGCTGCAAGTTTCACAGTAGTTATAAATTAACTGCCTTGTATGTAGTT-----ATA-------AGATATTCGGACAA----TGTATAGTTTATTGTGCCATTTGTGGTAGAGTTATTATTTTACCGCTTGGAAGTAGTGGTCCTTGATATTTGGAATCTAGAGGATTGAAGGTAGGAACTGTTATTCAATTCAgttat
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Unaligned ( gi|25 ): GTATATTAAAGGCCATAGAATATATTTAAACTACACTA