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Reference ( gi|6 )            :                                                                                                                                                                                            AATCAAGTTAAAATAAAATTACTATTTACTAACCAAATGTAT-ACAGTAGTAACAATATATTT-----CT---ACTATCACCTTAAACATAAAGACTTGA--TTTTGTTA-GCTAT---CATTTAAA--CA-AGCCATTTCA---AA-------T-T-----TT-------AA-------CTTT-------GTGA----T-TGT--GTC----AGGT----T----ATT--A---A------CAACGTGT--CT-ATGTGA-AACATTTTGC---ATG-G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCA--CGTGCACT--TCATGTGGAAAC---AA-T-----GCCT-GTCAGAGGTA--A---AGGCATT------T-GTGTTAC--------TGT-CAAGG-A-AT-GGA-AA--CACTTGCTAAT--TGTTAGTA----TACC-ATT-CTAC-AGTAA-ATA-TTCAGTCTATATTTTTTCCC-TCCAT-G-A-ACT--T-G-GT-A--T-G-C----TTTTATGACCTTT--AGAAA----T-CTGTTG--A--TGTTG----T-TTTTGTCATTCAG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATATTCGA--GTTCGTCG-GTTAA---CTTTTAA---CG-AGCCATTTCA---AAATTTAACT-T-----TT-------AA-------CTTT-------ATGA----AATGT--GCC----GGGC----T----ATT--A---A------CAACGTGT--CC-GTGTTA-AACGTTTTGT---A-A-T-A----TT-TCT-TT---TCT---GCTT-AATCGGTGCA--CGTGCACT--TTGTGTTAAAAT----A-T-----ACCT-GTCAGAGGTA--C---AGACGTG------T-GTGTTCT--------CAT-TAAGT-A-AT-GGA-AA--TACTTATTTAT--TACATGTA----TGCA-GTT-CTAT-CATAA-ATA-ATCGATCTAAAGTATTTCCC-TCCAT-G-A-------------------------TTTTATGACCCAT--AGAAA----T-ATGT-------TGTTG----T-TTTtttcagcctaaatggtacatgtgctcttcatgcgtaaacataacctgtctgaggtacaggcattttgtgtaacggtcaaaatgttaagcaatggaaacatttgtaaattacaagtataccgtcagtaaataatcagttaatatcatttccctccatggacttggtatggtataatgacccttagaaatatgttggttttgtttctgttgttcagtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAGTTTTGA--TTTCTTTG-GTGAA---CATTTAAA--CA-AGCCATTTCA---AA-------T-T-----TT-------AACTTCTACCTTT-------GTGA----T-TGT--GTG----AGGTCACAT----ATT--A---AT-----TTATGTGT--CT-GTGTGA-AACATTGTGC---ACA-G-A-----T-T-T-TT---TCACCTGCCA-GAGAGGTACA--AGTGaagtcaggttattattgtcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          gtggttacacaaaAAGTTTTGA--TTTCTTTG-GTGAA---CATTTAAA--CA-AGCCATTTCA---AA-------T-T-----TT-------AACTTCTATCTTT-------GTGA----T-TGT--GTG----AGGTCACAT----ATT--A---AT-----TTATGTGT--CT-GTGTGA-AACATTGTGC---Agtaactttgtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                  tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttataaagttttATTTGACATTTTGGTAAGCTTT---C--TCAAA--CA-AGTCATC--------------------------------AG-------CTTT-------A--A----T-TGT--GTC----AGG-----T----ATT--cagccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatggttgatcaTGA--TTTCGTTC-GTGAA---CATTTAA---CA-AGTCATTTCA---AA-------T-T-----TT-------AA-------CTTTT------ATGC----T-TGT--AGC----AGGT----T----ATT--A---A------CAACACGT--TT-ATTTTTTAACATTTTGC---ACG-G-A----CT-C-T-T-----CA---GCCT-AATCGGTACA--CGTGCACT--TCAtagcatgaattttttcagcttaatcggtgcatgtgcataacgcagaaacaatacttgtcagaggtacaggaatctgtgcaaccattaaggaatgttaacatttgcttattattagtatactgttctacattaatttattggtcaatattatttccctccgtgaacttggtctggtttgtgaccctcagaaatataggtttttttgtcattcagtaaatcggtaaaatagattaagtttctaaccagatggcaacgtacttgacatttttttcacatttatcgaccataaagaaatatcattaacttatattgatattgagaat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                          taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagtA--TTTTG----ACTGTGAACATTTAAA--CA-AGGGATTTCA---AA-------T-T-----TT-------AA-------CTTT-------GTGA----T-TGT--GTCTGACAGGT----T----ATT--T---A------T---GCGT--CT-ATGTGA-AACATTTTGC---ACA-G-A----TT-T-T-TA----CA---GCCT-AATACGTGCA--TGTGCACT--ACACGTGAAAAC---AA-T-----GCCT-GTCAGAGGTA--C---AGGTATT------T-GTGTAAC---------GCATAAGG-A-ATAAAA-AA--CACTTGCAAAT--TATGTGTT----TG-C-ATTCCTAC-AGTAA-ATA-ATCGATCAATATTATTTCCT-TCCAT-G-G-ACT--T-G-GT-A----G------TTTTATGTCCCTT--AGAAA----T-ATGTTATTA--TAATT----T-TTTTGTTATTCAtcacgtgacttcataaatgcgtcagattattaacttcttgtctatgtgaacattttgtacggatttgttcaacctaatcggagcacatgcacttgatgcagaaacaaaacttgtcaaacataatggcacttttgtaaccgtcaaggaatggaaacacttgctaattaccagtaaaccgtccactagttaataattggccgatatcatttccttccatagacttggtatatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatatTA-GCT-----CGTTTAAAAGCA-AGT-AT--------A-------T-T---------------G-------CTTT-------GTGG----T-TGT--GAC----AGAT----T----ATT--A---AGATTAACAACGTGT--CT-ATGTGA-ACCATTTTGC---ACA-A-A----TT-------------------T-AATCGGTGTA--CGTGCATT--TCATGTGGAATC---AA-T-----ACCT---------------------ATT------T-GTGTAAC--------CG--CAAGG-A-AT-ACATAA--AA-----TAAT--CGGTCG-A----TATT-ATC------------ACA-CCCACCCTCTATT--------------G-A-AAT--T-G-G--A--T-G-G----TTTTATGACCCTT--AGAAA----T-GTGTTG--T--TGTT-----T-TTTGGTCGTTCAG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcataattatgtaaatataTAA---CATTTAAC--TATAACCATATCACTAAAC------T-T-----TT-------AA-------CTAT-------TTAAACCTT-TGTATGTT----TTGT----A----GTT--G---G------CAGTGTGT--CT-GTGTGA-ATCATTTCGC---ATG-G-------C-T-T-TTAAGTCC---GTCT-GGTCGGTGCA--GGTGAACT--TCGTGTAGAGGT---AG-T-----GCCT-GTCAGAGttttaacttttaacttttca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AC---CATGTACG--CG-AGCCATTTCA---AA-------T-TAACTTTT-------AA-------CTTC-------GTGA----T-TGT--GTC----GGGT----a
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tTTTAAA--CG-AGCTATTTTA---AC-------T-T-----TT-------AA-------CTTT-------cacgaatggtatagtcataaacatttgtttcgggttattcccacttgtcttatgtaatatattgtgcacggatttcttcagcctactcggtgctcgtggacttcatgcgggcacgtgaacttcatgtggatacaatacaggcattttgtgtaagaactaattaatggaaacgcttgctaattattagtataccgtcctacagtaaataatcggtcgatatcatttccctccattaacttagaaatattattttggtcgttcagtatatagaagtgtctctaactttcttcaatttatttatgtttacttgtttctcgcatctacatgtcttctgaactataaacaatgaatttccctacattagca
gi|8                          :                                                           gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtattccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaaatttgtgcaaaatggttcacatagacacgttgttaatcttaataatctgtcacaaccacaaagcaatatacttgctAAA--TA-AGCCATTTCA---AA-------T-T-----TT-------AA-------CTTT-------ATGA----T-TGT--GTC----AGGT----T----ATT--A---C------CAAAGTGT--C--ATGTGC-AGCATTTTGA---ATGTGTG----TT-T-G-TT---CCA---GCCT-AATAGGTGAA--TATGTGCT--T-AC---GAAAC---AA-T-----ACCT-GTCAGAAGTA--T---AGGAATT------T-GTGCAAC--------TAT-TAGTG-A-AT-AAA-AAAGAACCTGTTAGT--TATAAGTA--------------TAC-AGTAA-ATA-ATTGGTCAATATTATTTCCC-TCCAA-G-T-ACT--T-G-GT-A--T-G------GTTAATGACCTTT--ATAAACATTT-TTTTTG--T--TGTTG----T-Ttca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     aaaaaaacaacatattttgaaaggtcattagccataccaagtcgattgaaggtaataacattgtttaaatggtcacgaacaaTCA---AG-------TAT-----TT-------AA-------CTTT-------GAGA----T-TGT--GTC----AGca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCA---AG-------T-C-----TT-------AAA------TTTT-------GTGA----T-TGT--GGC----AGGT----TGTTAATT--A---A------CAACGTGT--CT-ATGTGA-AACATTTTGC--------------------------------GC--------GTG--------CACT--TCATGCGGAAAC---AT-T-----------------GTA--C---AGGTATT------T-GTGTTAT--------CGT-TGAGG-A-AT-AGA-AA--CA----CTAAA--TATTAGAG----TACC-GTttttcgtcgtgaacatttaaacaagccatttaaaattttaagttttaactttgtgattgtgccaggttattaacaacgtgtctatgtaaaacattctatatggatttttttaccctaatcggtgcacgtgtacatcgtgcggaaacaataccgtcagaggtaccagcatctttgtagaatagaaacacttgcttttcatgtgcatacagtcctacagtaaataacaattttatgacccttagaaatacatgacatttgtaggtttttgccgtttaacatattt
gi|10                         : gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactatactgaacgacaaaaacatattactaagggtcataaaactaaacccaaaaccatggcgggaaaacatgacgacagattatatattgtaggacggtattctaatcatcagcaagtgtttcctttccttaaaggttacacaaatgcatgatgcacacgtgcaccgattaggctaaaacaatccgtgcaaaatgtttcacatagacacgtcgttaatagccttacacaatcacaaagttaaaagttaaaatttgaaatggctcttttaaatgttcacgaacgaaa-T-----TT-------AA-------CTTT-------GTGA----T-TGT--GTC----AGGT----A----ATA--A---A------CA---TAT--CT-ATGTGA-AACATTTTGT---ACA-G-ACTAGTT-T-T-TT---CCA---GCCT-TATTGGTGCA--TGTGCACT--TCATGTG-AAAC---AC-T-----ACAT-GTCAGAGGTA--C---AGGTATT------T-GTGTAAC--------TGT-TAA------T-G---AA--CACTTGCTAAT--TTTTAGTA----TAGC-ATC-CTAC-AGTAA-ATA-ACCAGTCAATATTGTT-----------------------------------------TTATGACCCTT--AGAAA----T---------A--CGTTG----T-TTTTGTc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgaattactatataatctaatatactgaacaataacT-------GA-------CTTC-------ATAA----A-TGC--GTC----AGAT----T----ATT--A---A------CTTCTTGT--CT-ATGTGA-A-CATTTTGT---ACG-G-A----TT-T-G-TT----CA---ACCT-AATCGGAGCA--CATGCACT--TGATGCAGAAAC---AA-A-----ACTT-GTCAAACATA--A---TGGCACT------T-TTGTAAC--------CGT-CAAGG-A-AT-GGA-AA--CACTTGCTAAT--TACCAGTA----AACC-G-T-CCACTAGTTA-ATA-ATTGGCCGATATCATTTCCT-TCCAT-A-G-ACT--T-G-GT-A--T-gacaagattttgtcaatgaacatttaaacaagccatttcaaatttaaacttttaactttgtgattgt
gi|16                         :                                                                                                                                                   taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagttgaagtgcacgtgtaccgattaggctgaagagtccgtgcaaaatgttaaaaaataaacgtgttgttaataacctgctacaagcataaaagttaaaatttgaaatgacttgttaaatgttcacgaacgaaatcatcacgTT-------GTGA----C-TGT--GTC----AGAT----T----ATT--ATTTA------GGACGTGT--CT-ATGTGA-AACATACTGC---ACG-G-G----TT-T-A-TT---C-----GCCTTAACCGGTGCA--CGTGCACT--TCACGTGAAATC---AA-A-----ACCT-GTAAGAGGTA--C---ATACATT------T-GTGTAAC--------CGT-TAATG-A-AT-GGA-AA--T-CTTGCTCA------TAACAATCTTACCTATT--TAC-AGTAA-AT-----AG---ATATTATTTCCC-TCCAT-G-A-AAC--C-G-GT-T--T-G-G----CTTTATGTTATTT---GAAA----C-ATGT----A--TA----------TTTGTCGTTatt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----T-TGT--TTC----GGGT----T----ATT--C---C------CA-CTTGT--CTTATGTAA-TATATTGTGC---ACG-G-A----TT-T-C-TT----CA---GCCT-ACTCGGTGCT--CGTGGACT--TCATGCGGGCACGTGAACT-----TCAT-GT-GGATACA--ATACAGGCATT------TTGTGTAAG--------AAC-TAATT-A-AT-GGA-AA--CGCTTGCTAAT--TATTAGTA----TACC-GTC-CTAC-AGTAA-ATA-ATCGGTCGATATCATTTCCC-TCCAT-T-A-ACT--T-A-G
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacccgacacaatcacgaagttaaaagttaatttgaaatggctcgcgtacatggtcacgaatggtatagtcataaacat-TGT--GAC----AGGTAA--T----ATTTTA---A-------AGCATCT--CC-ACA--A-AATGTTTCAC---ATT-G-AAAC-TTAT-TATT---TCA---GCCT-AATCGATACA--CCTGCACT--TCATACGGAACC---AT-A-----ACCT-GTCAGATGTA---------CACT------T-GT---------------T-TAAG-----------------CTT--T--T--TGTTAGTA----TACC-ATC-CAAC-AGTAA-ACA-ATCAGTCAACATCATTTCCA--CCAA-A-ACACT--T-G-GTAA--A-G-T----TTTTATGATCTTT--AAACA----T-GTGTTG-----TTTTG----T-Taaatattattttggtcgttcagtatatagaagtgtctctaactttcttcaatttatttatgtttacttgtttctcgcatctacatgtcttctgaactataaacaatgaatttccctacattagca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gagtacttggaaataggcgcaaaatatcgtcaatatatagggaactat----ATC--A---A-------AACTTGTAACT-TTGTAA-AACATTTTGC---ATG-G-A----TT-T-gaaaaggcaagtgtgtatccgttaaggaatggaaaattttgctaagtataagtatacagttctacagtaaataaccggtcgatataatttctctacacggagatggtattgtattttagctctaagaaatatgttactcttttgtcgttcagtgtttatatctgaaataatgattgtttcgtctgttcttattcgtatgatattatgattacttttaaagtgatttgca
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaAACGTAT--CT-ATGTGA-AACATTGTGT---ACG-T-A----TT-T-T-AT---TTT---GCCT-TATCGGTGCA--TGTGTACC--T----TTGAAA--------------CCT-GTCAGAGACA--C---AGACATgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --CT-TTATAA-AACATTTTGC---ATG-G-A----TT-T-tt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcT-GTGTCA-GGTATTTAGC---ATG-A-A----TT-T-T-TT----CA---GCTT-AATCGGTGCA--TGTGCA----TAACGCAGAAAC---AA-T-----ACTT-GTCAGAGGTA--C---AGGAATC------T-GTGCAAC--------CAT-TAAGG-A-AT-GTT-AA--CATTTGCTTAT--TATTAGTA----TACT-GTT-CTAC-ATTAATTTA-TT-GGTCAATATTATTTCCC-TCCGT-G-A-ACT--T-G-GT-C--T-G------GTTTGTGACCCTC--AGAAA----T-AT------A--GGTT-----T-TTTTGTCATTCAGttttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatggttgatcaatttgacattttggtaagctttctcaaacaagtcatcagctttaatT-T-T-TT---TCA---GCCT-AAATGGTACA--TGTGCTCT--TCATGCGTAAAC---AT-A-----ACCT-GTCTGAGGTA--C---AGGCATT------TTGTGTAACGGTCAAAATGT-TAAGC-A-AT-GGA-AA--CATTTGTAAAT--TACAAGTA----TACC-GT-----C-AGTAA-ATA-ATCAGTTAATATCATTTCCC-TCCAT-G-G-ACT--T-G-GT-A--T-G-G----TATAATGACCCTT--AGAAA----T-ATGTTG--G--TTTTG----T-TTCTGTTGTTCAGtaaatcggtaaaatagattaagtttctaaccagatggcaacgtacttgacatttttttcacatttatcgaccataaagaaatatcattaacttatattgatattgagaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttgaaatggcttgtttaaaaattcacaaacaaaatcaagtcT-T-T-TT---TCA---GCAT-AAGCAGTGCA--CATGCACT--TCATATAGAACC---AA-T-----ACCT-GTCAGAGGTA--C---AGGCATT------T-GTGTAAC--------CAT-TAAGG----------AA--CACTTGTTAAT--Ttatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                    aatatattagggtcgtgaatcttctgtttcagaatgaatgtttctattgctgggtttggcttcttagatatattgaaaaaacaaaaaagacaacaacataattctaagggtaattaaaccaattatacaagtccatggagggaaataatatctactggtttaatgtaggtgggtctactaataattagcaagtgtttccattcctcaacagattcaaaaatgcctgtacctgggactatgtcacaaaT-T-T-TT---CCA---GCTT-TATTGGTGCA--TGT-------TCA---GAAAAC---AA-T-----GCCT-GTCAGAGGTA--C---AGGCATTTGTTTGT-GTGTAAC--------CAT-TATGGTATAT-GGA-AA--CACTT----AT--CATAAGTA----TACC-ATT-CT---------ATA-TCC-GTCAATATTATTTCCC-TCCAT-G-G-------------------------TTTTATGACCCT-----------------TTG--G--GGTTT----TATTTTGTCGTTCAGctacagt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T---TC----GCCA-AATAGTTGCA--CATGCACT--TCATACAGAAAC---AT-A-----ACCT-GTAAGAGGTATTA---A--CATT------T-G
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gGTGCA--TGTGCACTGCTTATGCTGAAAA---AA-TTTGTGACATAGTCCCAGGTA--C---AGGCATT------T-TTGAATC--------TGT-TGAGG-A-AT-GGA-AA--CACTTGCTAAT--TATTAGTA----GACC-CAC-CTAC-ATTAA-A----CCAGTAGATATTATTTCCC-TCCAT-G-G-ACT--T-GTAT-AATT-G-G----TTTAATTACCCTT--AGAAT----T-ATGTTG--T--TGTCT----T-TTTTGT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aatatattagggtcgtgaatcttctgtttcagaatgaatgtttctattgctgggtttggcttcttagatatattgaaaaaAAAT---AT-T-----ACCT-GTCACAGA-A--A---AGGCAAG------T-GTGTATC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGA-AA--ATTTTGCTAAG--TATAAGTA----TACA-GTT-CTAC-AGTAA-ATA-ACCGGTCGATATAATTTCTC-TACAC-G-G-AGA--T-G-GT-AT-T-G-TA---TTTTA--GCTCTA--AGAAA----T-ATGTTA--C--T--------C-TTTTGTCGTTCAGttcatatagaaccaatacctgtcagaggtacaggcatttgtgtaaccattaaggaacacttgttaattctacagt
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|29 ): TGAATAAAAACAATTTATTTTTGTCATTATTTTTGTTTTCAATACTTAATTGGCATGTACATTGAAAGTAGAAATCACA






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Reference ( family-597 )      :                                                                                                                                                                     AATAAGGCTGGAA-AAAACTAGTCTGTAC--A--AAATGTTTCACA-TAGTAACAACNT-GTT--T---------ATT------A----CCCGACA-C--AATC-ACC--AAAGTTA-AA----G------AC-TTGA---------TTT---C-----GT--TNGCGAACATTTA--AAC-A-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGCGGAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATTAGTATACCG---TCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATATGTTG--NTGT--TG----T-TTTTGTCGTTCAG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     ttgaaatggcttgtttaaaaattcacaaacaaaatcaagtcA---------TTT---T-----GA--CTGTGAACATTTA--AAC-A-AGG-G-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GTCTGACAGGT----T----ATT------------TATGCGT--CT-ATGTGAAACATTTTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---ACA---GCCT-AATACGTGCATG--TGCACT--ACACGTGAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGTA-TT------T-GTGTAA---------CGCATAAGG-A-ATAAAAAA--CACTTGCAAATTATGTGTTTGCAT---TCCTAC-AGTAAATAATCGATCAATATTATTTC------CTTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA-----G-TTTT-ATGTCCCTTA---GAAATATGTTA--TTATAATT----T-TTTTGTTATTCAtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                          tatatCTGACA-C--AATC--TC--AAAGTTA-AA----T------AC-TTGA---------TTTT--C-----GT---CGTGAACATTTA--AAC-A-AGC-C-------ATTT-AA---AA-------T--TTTAAGTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GC----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGT--CT-ATGTAAAACATTCTATATG---G-A----TT-T-T-TT---T-A---CCCT-AATCGGTGCACG--TGTACA--TCGTGCGGAAACAAT-----ACC--GTCA-GAG--G------TACCAGCA-TC------T-TTGTA------------------G-A-AT-AGAAA--CACTTGCTTTTCATGTGCATACAG---TCCTAC-AGTAAATAA-----CAATTTTATGAC------CCTTAGAAATACAT--GACATT-T----G---TA----GG-TTTT-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAC-ATAAAATAATCGGTCGATATTATCACACCCACCCTC-------TATTGAAA-TT-G----G----A---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATGTGTTG--TTGT--T-----T-TTTGGTCGTTCAGtgccgtttaacatattt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gcataattatgtaaatata-------CTTTGTGG----T-TGT--GA----CAGAT----T----ATT--AAGATTAA-CAACGTGT--CT-ATGTGAACCATTTTGCACA---A-A----TT-------------------T-AATCGGTGTACG--TGCATT--TCATGTGGAATCAAT-----ACCT-------------------------A-TT------T-GTGTAAC--------CG--CAAGG-A-AT-ttccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaaatttgtgcaaaatggttcacatagacacgttgttaatcttaataatctgtcacaaccacaaagcaatatacttgcttttaaacgagctattttaacttttaacttttca
gi|15                         :                                                                    gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtAATTTGTGC--A--AAATGGTTCACA-TAG--ACACGTT-GTT--A---------ATCTTAATAA----TCTGTCA-C--AACC-A-C--AAAGCAA-TA----T------AC-TTGC---------T------------------------TTTA--AAC-G-AGC-T-------ATTT-TA---AC-------T--TTT-------AA-------CTTTcaatatacttgcttttaaacgagctattttaacttttaacttttca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                    gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtattccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaTTGTGA----C-TGT--GT----CAGAT----T----ATT--ATTT---A-GGACGTGT--CT-ATGTGAAACATACTGCACG---G-G----TT-T-A-TT---C-----GCCTTAACCGGTGCACG--TGCACT--TCACGTGAAATCAAA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TACATACA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAATG-A-AT-GGAAA--T-CTTGCTCATAACAATCTTACCT---ATTTAC-AGTAAATA-------GATATTATTTC------CCTC-------CAT-GAAA-CC-G----G---TT---TGG-CTTT-ATG----TTATTTGAAACATG-----------TA----T-ATTTGTCGTTtca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -----ACCT-GCCA-GAGAGG------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              gtC--AAAGTTACAA----G------TT-TTGA---------TTT---C-----TT--TGGTGAACATTTA--AAC-A-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AACTTCTACCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGT--CT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---TCACCTGCCA-GAGAGGTACAAG--TGgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaatcaaaacttgtaactttgtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtggttacacaaa----ATC--A------A--AACTTGTAACT-TTGTAAAACATTTTGCATG---G-A----TT-T-taaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaTAAT--------CTG-TAAAA-A-AT-AGAAA--CAATTAATAGTT----GTATACTG---TCCTAC-AGTAAATAATCA----ATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GGTATG---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAA-----TG--CTTT--TGGGC-T-TTTTGTCACTCGGgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  cagaagttttcagca--AAAGTTTTAA----G------TT-TTGA---------TTT---C-----TT--TGGTGAACATTTA--AAC-A-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AACTTCTATCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGT--CT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-tatattattcagattcatgtacatagactactggaataataaaaatagatcctatgctgccattttct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttatA-GAG--G------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------Cccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|2                          :                                                                  tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttataaagttttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagCA-C--AA-C-AC---AAAGTTA-AA----T------AC-TTGA---------TTTG--C-----AT--T------CATTTA--AGC-G-AGG-T-------ATTT-CA---AC-------T--TTT-------AA-------CTGTGTGA----T-AGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAAATTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGTACGACGG-A----TT-T-G-TT---TCA---GCTT-AGTCGGTGCACGCGTGCACT--TTATGTAGAAACAAT-----ACCT-G-CA-GAG--G------------CA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-TAAGG-A-AT-ATAAA--CACTTGCTTATTGTTAGAAAATCG---TCATAC-AGTAAATACTTGGTCGGTATTATTTC------CCTT-------CTT-TGAA-AT----------TA---TGG--TTT-ATGACTCTTA---GAATTATGTAGGATTGG--CA----T-TTTCGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gT-T-T-TT---CCA---GCTT-TATTGGTGCATG--T-------TCA---GAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TTTGTTTGT-GTGTAAC--------CAT-TATGGTATAT-GGAAA--CACTT----ATCATAAGTATACCA---TTCTAT---------ATCCGTCAATATTATTTC------CCTC-------C---------------------A---TGG-TTTT-ATGACCCT-------------TTG--GGGT--TT----TATTTTGTCGTTCAGtaatgcacaggcatttgctcttgtttatgccatctaccatattctatttcaatttttaaaaaaaataaatttcttttaattatcagtgtatcaggatatgttttaaaacaaaatctgcaaataatgcttacgtatcggctgttgaagattattttttttaatttttcattccatctttgattaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ACA-T--AATC-AT---AAAGTTA-TA----G------AC-TTGG---------TTT---C-----TT--TCATGAATATTTA--AAC-A-AGC-TTTTTTGAATTT-TG---AT-------T--TTT-------AA-------ATTTGTGA----T-TGT--GT----CAATT----T----ATT--A------A-TA---TGT--TT-GTGTAAAATAATTTGTATA---G-A----TT-T-T-TT---GTA---GC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtatgattttcagtttatattatactgaacgacaattAACATTTA--ACT-ATAAC-C-------ATAT-CACTAAAC------T--TTT-------AA-------CTATTTAAACCTT-TGTATGT----TTTGT----A----GTT--G------G-CAGTGTGT--CT-GTGTGAATCATTTCGCATG---G-------C-T-T-TTAAGTCC---GTCT-GGTCGGTGCAGG--TGAACT--TCGTGTAGAGGTAGT-----GCCT-GTCA-GAG--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tAATAATTTGTATA--GATTTTTTGT-AGCTAATAATTCGCCAATGTAATTAC------CTTC-------CAT-GGAA-TT-A----G---TAGTATGG-TTTT-ATGACTGTAA---GAATTATG------CGT--TA----T-TTTTGTCGTTCAGa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aTCATTTT------CCTG-------CAT-GGAC-TC-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATATGTTG---TGT--TGATTTT-TTTTGCCTTTCAGtatataattgaaaataat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttcaaacTAC-AGTAAA--GT-GGTCAATATTATTTT------CGTC-------TGT-TGAA-TT-G----G---TA---TAG-TTTTTATGACTCTTA---AAAAAATGTTT--TGGG--GG----T-TTTTGTCGTTCAGtattgatgttacggtaataactgtacaaattatataaataaaata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACGTAT--CT-ATGTGAAACATTGTGTACG---T-A----TT-T-T-AT---TTT---GCCT-TATCGGTGCATG--TGTACC--TT-T---GAA----------ACCT-GTCA-GAG--A------CACAGACA-Ttatatatatatatacctgttacgcatgac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C-TT-G----G---TG---TAG-TTTT-ATGACTCTAA---GAAATATGTTG--TTGT--T-----T-TTTTGTCGTTCAGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                 C--A--AAATGTTTCACA-TAG--ACACGTT-GTT--A---------ATT------AACAACCTGCCA-C--AATC-AC---AAAATTT-AA----G------AC-TTGA---------TTT---C-----GT--TCGTGAACATTTA--AAA-G-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTTAACTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----AAGGC----T----ATT--A------A-CGACGTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-G-T-TT---T-A---GCCT-AATCGGTGCACG--TGTGCA--TCATGC--------------ATTT-GT--------G------TA----------------------AC--------CTT-TAAGG-A-AA-GGAAA--CACTTGCTGATGATTAGAATACCG---TCCTAC-AATATATAATCTGTCGTCATGTTTTC------CCGC-------CAT-GGTT-TTGG----G---TT---TAG-TTTT-ATGACCCTTA---GTAATA-------------TG----T-TTTTGTCGTTCAGtctacatccgacgtgaaaacgttgac
gi|3                          :                                                                                                        gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactataATTAGGCT-----AAAAC-AATCCGTGC--A--AAATGTTTCACA-TAG--ACA-CGTCGTT--A---------ATA------G----CCTTACA-C--AATC-AC---AAAGTTA-AA----AGTTAAAAT-TTGAAATGGCTCTTTTAAAT-----GT--TCACGAACG---A--AA-------------------T-CA---AG-------T--CTT-------AAA------TTTTGTGA----T-TGT--GG----CAGGT----TGTTAATT--A------A-CAACGTGT--CT-ATGTGAAACA--------------------------TT---T----------------TGCGCG--TGCACT--TCATGCGGAAACATT--------------------G------TACAGGTA-TT------T-GTGTTAT--------CGT-TGAGG-A-AT-AGAAA--CA----CTAAATATTAGAGTACCG---TCcgcgtgcacttcatgcggaaacattgtacaggtatttgtgttatcgttgaggaatagaaacactaaatattagagtaccgtc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactatactgaacgacaaaaacatattactaagggtcataaaactaaacccaaaaccatggcgggaaaacatgacgacagattatatattgtaggacggtattctaatcatcagcaagtgtttcctttccttaaaggttacacaaatgcatgatgcacacgtgcaccgT---TC----GCCA-AATAGTTGCACA--TGCACT--TCATACAGAAACATA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TATTAACA-TT------T-G
gi|4                          :                                                                                                                                                                     gATTAGGCTGAAG-A------GTCCGTGC--A--AAATGTT--AAA-AAATAA--ACGT-GTTGTT---------AAT------AA---CCTGCTA-C--AAGC-ATA--AAAGTTA-AAATTTG------AA-ATGA---------CTT---------GT--TA---AATGTTCACGAACGA-AAT-C-------ATCA-CG-----------------T-------GA-------CTTCATAA----A-TGC--GT----CAGAT----T----ATT--A------A-CTTCTTGT--CT-ATGTGAA-CATTTTGTACG---G-A----TT-T-G-TT----CA---ACCT-AATCGGAGCACA--TGCACT--TGATGCAGAAACAAA-----ACTT-GTCA-AAC--A------TAATGGCA-CT------T-TTGTAAC--------CGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTACCAGTAAACCG---TCC-ACTAGTTAATAATTGGCCGATATCATTTC------CTTC-------CAT-AGAC-TT-G----G---TA---T
gi|5                          :                                                                                                                                           taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagttgaagtgcacgtgtaccgT------A----CCCGACA-C--AATC-AC---GAAGTTA-AA-----------AG-TTAA---------TTT---GAAATGGC--TCGCGTACAT-----------GGT-C-------A----CG---AA-------TGGTAT-------AG---------TCATAAACATT-TGT--TT----CGGGT----T----ATT--C------C-CA-CTTGT--CTTATGTAATATATTGTGCACG---G-A----TT-T-C-TT----CA---GCCT-ACTCGGTGCTCG--TGGACT--TCATGCGGGCACGTG-----AACT--TCATGTG--GATACAATACAGGCATTT------T-GTGTAAG--------AAC-TAATT-A-AT-GGAAA--CGCTTGCTAATTATTAGTATACCG---TCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATCATTTC------CCTC-------CAT-TAAC-TT-A----GAAATA---TTA-TTTT-att
gi|6                          :                                                                                                                                                                     AATCAAGTTAAAATAAAATTACTATTTACTAACCAAATGTAT-ACAGTAGTAACAATAT-ATT--T---------CT------------------A-C--TATC-ACCTTAAACATA-AA----G------AC-TTGA---------TTT---T-----GT--TAGCTATCATTTA--AAC-A-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGCATG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGTGGAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TAAAGGCA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTGTTAGTATACCA---TTCTAC-AGTAAATATTCAGTCTATATTTTTTC------CCTC-------CAT-GAAC-TT-G----G---TA---TGC-TTTT-ATGACCTTTA---GAAATCTGTTG--ATGT--TG----T-TTTTGTCATTCAGggtcgttcagtatatagaagtgtctctaactttcttcaatttatttatgtttacttgtttctcgcatctacatgtcttctgaactataaacaatgaatttccctacattagca
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Reference ( family-597 )      :                                                                                                                                                                                         AATTAGGCTGAAGAAAACAATCCGTGCAAAATGTTTCACA-TAGTAACAACGT-GTTN---ATTA----CCCGACACAATCACC--AAAGTTA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-CG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGCGGAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATNAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--TTGT--TG----TTTTTGTCGTTCAG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -TGT--GA----CAGGTAA--T----ATTTTA------A--AGCATCTCC-ACA--AAATGTTTCACATT---G-AAAC-TTAT-TATT---TCA---GCCT-AATCGATACACC--TGCACT--TCATACGGAACCATA-----ACCT-GTCA-GAT--G------TACA-----CT------T-GT---------------T-TAAG----------------CTT--T--TTGTTAGTATACCATCCAAC-AGTAAACAATCAGTCAACATCATTTC------CACC-------AAA-ACAC-TT-G----G---TA---AAGTTTTT-ATGATCTTTA---AACATG----TGTTG--TT-T--TG----TT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gagtacttggaaataggcgcaaaatatcgtcaatatatagggaactatAAATATT-----ACCT-GTCA-CAG--A-------AAAGGCA-AG------T-GTGTATC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--ATTTTGCTAAGTATAAGTATACAGTTCTAC-AGTAAATAACCGGTCGATATAATTTC------TCTA-------CAC-GGAG-AT-G----G---TA---TTG-TATT-TTAGCTCTAA---GAAATA----TGTTA--CT----------CTTTTGTCGTTCAGgaaaaggcaagtgtgtatccgttaaggaatggaaaattttgctaagtataagtatacagttctacagtaaataaccggtcgatataatttctctacacggagatggtattgtattttagctctaagaaatatgttactcttttgtcgttcagtgtttatatctgaaataatgattgtttcgtctgttcttattcgtatgatattatgattacttttaaagtgatttgca
gi|10                         : gagtacttggaaataggcgcaaaatatcgtcaatatatagggaactataacaaaacaacacatgtttaaagatcataaaaactttaccaagtgttttggtggaaatgatgttgactgattgtttactgttggatggtatactaacaaaaagcttaaacaagtgtacatctgacaggttatggttccgtatgaagtgcaggtgtatcgattaggctgaaataataagtttcaatgtgaaacattttgtggagatgctttaACAATCAC---AAAGTTA-AA---------A------GTTTAA---------A-TT---T-----G--AAATGG-CT-----TGTTTAAA--T---GTTC-------ATTGACA---AAATCTTGTC--TTT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----A----ATA--A------A-CA---TATCT-ATGTGAAACATTTTGTACA---G-ACTAGTT-T-T-TT---CCA---GCCT-TATTGGTGCATG--TGCACT--TCATGTG-AAACACT-----ACAT-GTCA-GAG--G------TACAGGTA-TT------T-GTGTAAC--------TGT-TAA------T-G--AA--CACTTGCTAATTTTTAGTATAGCATCCTAC-AGTAAATAACCAGTCAATATT--------------------------------------------------G-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----CGTTG--TTTT--TG-----TGTTATTGTTCAGtgtttatatctgaaataatgattgtttcgtctgttcttattcgtatgatattatgattacttttaaagtgatttgca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                atgaattactatataatctaatata---------G------ACTTAA---------TATT---C-----GAGT--TCGTCGGTTAACTTTTAA---CG-AGC-C-------ATTT-CA---AAATTTAACT--TTT-------AA-------CTTTATGA----AATGT--GC----CGGGC----T----ATT--A------A-CAACGTGTCC-GTGTTAAACGTTTTGTA-A---T-A----TT-TCT-TT---TCT---GCTT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TTGTGTTAAAATA-T-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGACG-TG------T-GTGTTCT--------CAT-TAAGT-A-AT-GGAAA--TACTTATTTATTACATGTATGCAGTTCTAT-CATAAATAATCGATCTAAAGTATTTC------CCTC-------CAT-GA------------------------TTTT-ATGACCCATA---GAAATA----TGTT-----GT--TG----TTTT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---T-----G--T--TTG-TG---AATTTTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---Aaggttattattgtcc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-T-T-TT---TCA---GCCT-AAATGGTACATG--TGCTCT--TCATGCGTAAACATA-----ACCT-GTCT-GAG--G------TACAGGCA-TT------TTGTGTAACGGTCAAAATGT-TAAGC-A-AT-GGAAA--CATTTGTAAATTACAAGTATACCGTC-----AGTAAATAATCAGTTAATATCATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TATA-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--GTTT--TG----TTTCTGTTGTTCAGtttcagcctaaatggtacatgtgctcttcatgcgtaaacataacctgtctgaggtacaggcattttgtgtaacggtcaaaatgttaagcaatggaaacatttgtaaattacaagtataccgtcagtaaataatcagttaatatcatttccctccatggacttggtatggtataatgacccttagaaatatgttggttttgtttctgttgttcagtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     ttgaaatggcttgtttaaaaattcacaaacaaaatcaagtcA---------T-TT---T-----G--A--CTG-TG---AACATTTAAA--CA-AGG-G-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GTCTGACAGGT----T----ATT------------TATGCGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---ACA---GCCT-AATACGTGCATG--TGCACT--ACACGTGAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGTA-TT------T-GTGTAA---------CGCATAAGG-A-ATAAAAAA--CACTTGCAAATTATGTGTTTGCATTCCTAC-AGTAAATAATCGATCAATATTATTTC------CTTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA-----G-TTTT-ATGTCCCTTA---GAAATA----TGTTA--TTATAATT----TTTTTGTTATTCAtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                          tatatCTGACACAATC-TC--AAAGTTA-AA---------T------ACTTGA---------T-TTT--C-----G--T---CG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-AA---AA-------T--TTTAAGTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GC----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTAAAACATTCTATATG---G-A----TT-T-T-TT---T-A---CCCT-AATCGGTGCACG--TGTACA--TCGTGCGGAAACAAT-----ACC--GTCA-GAG--G------TACCAGCA-TC------T-TTGTA------------------G-A-AT-AGAAA--CACTTGCTTTTCATGTGCATACAGTCCTAC-AGTAAATAA-----CAATTTTATGAC------CCTTAGAAATACAT--GACATT-T----G---TA----GG-TTTT-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAC-ATAAAATAATCGGTCGATATTATCACACCCACCCTC-------TATTGAAA-TT-G----G----A---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATG----TGTTG--TTGT--T-----TTTTGGTCGTTCAGtgccgtttaacatattt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                          gcataattatgtaaatata--AAAGTTA-AA----------------AGTTAA---------A-AT---A-----G--C--TCG----------TTTAAAAGCA-AGT---------AT---------A-------T--T----------G-------CTTTGTGG----T-TGT--GA----CAGAT----T----ATT--AAGATTAA-CAACGTGTCT-ATGTGAACCATTTTGCACA---A-A----TT-------------------T-AATCGGTGTACG--TGCATT--TCATGTGGAATCAAT-----ACCT-------------------------A-TT------T-GTGTAAC--------CG--CAAGG-A-AT-ttccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaaatttgtgcaaaatggttcacatagacacgttgttaatcttaataatctgtcacaaccacaaagcaatatacttgcttttaaacgagctattttaacttttaacttttca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtTTGTGA----C-TGT--GT----CAGAT----T----ATT--ATTT---A-GGACGTGTCT-ATGTGAAACATACTGCACG---G-G----TT-T-A-TT---C-----GCCTTAACCGGTGCACG--TGCACT--TCACGTGAAATCAAA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TACATACA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAATG-A-AT-GGAAA--T-CTTGCTCATAACAATCTTACCTATTTAC-AGTAAATA-------GATATTATTTC------CCTC-------CAT-GAAA-CC-G----G---TT---TGG-CTTT-ATG----TTATTTGAAACA----TG-----------TA----TATTTGTCGTTtca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -----ACCT-GCCA-GAGAGG------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          gtC--AAAGTTACAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AACTTCTACCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---TCACCTGCCA-GAGAGGTACAAG--TGgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaatcaaaacttgtaactttgtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                              gtggttacacaaaAATCCATGCAAAATGTTTTACA-AAGTTACAA-GT-TTTG---ATTtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaTAAT--------CTG-TAAAA-A-AT-AGAAA--CAATTAATAGTT----GTATACTGTCCTAC-AGTAAATAATCA----ATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GGTATG---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAA--A----TGCTT--TTGG--GC----TTTTTGTCACTCGGtgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                              cagaagttttcagca--AAAGTTTTAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AACTTCTATCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-tatattattcagattcatgtacatagactactggaataataaaaatagatcctatgctgccattttct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttatA-GAG--G------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------Cccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|2                          :                                                                  tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttataaagttttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagCACAA-CAC---AAAGTTA-AA---------T------ACTTGA---------T-TTG--C-----A--T--TC----------ATTTAAG--CG-AGG-T-------ATTT-CA---AC-------T--TTT-------AA-------CTGTGTGA----T-AGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAAATTGTCT-ATGTGAAACATTTTGTACGACGG-A----TT-T-G-TT---TCA---GCTT-AGTCGGTGCACGCGTGCACT--TTATGTAGAAACAAT-----ACCT-G-CA-GAG--G------------CA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-TAAGG-A-AT-ATAAA--CACTTGCTTATTGTTAGAAAATCGTCATAC-AGTAAATACTTGGTCGGTATTATTTC------CCTT-------CTT-TGAA-AT----------TA---TGG--TTT-ATGACTCTTA---GAATTA----TGTAGGATTGG--CA----TTTTCGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gT-T-T-TT---CCA---GCTT-TATTGGTGCATG--T-------TCA---GAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TTTGTTTGT-GTGTAAC--------CAT-TATGGTATAT-GGAAA--CACTT----ATCATAAGTATACCATTCTAT---------ATCCGTCAATATTATTTC------CCTC-------C---------------------A---TGG-TTTT-ATGACCCTT--------------TGGGG--TT-T--TA-----TTTTGTCGTTCAGtaatgcacaggcatttgctcttgtttatgccatctaccatattctatttcaatttttaaaaaaaataaatttcttttaattatcagtgtatcaggatatgttttaaaacaaaatctgcaaataatgcttacgtatcggctgttgaagattattttttttaatttttcattccatctttgattaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATCAT---AAAGTTA-TA---------G------ACTTGG---------T-TT---C-----T--T--TCA-TG---AATATTTAAA--CA-AGC-TTTTTTGAATTT-TG---AT-------T--TTT-------AA-------ATTTGTGA----T-TGT--GT----CAATT----T----ATT--A------A-TA---TGTTT-GTGTAAAATAATTTGTATA---G-A----TT-T-T-TT---GTA---GC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtatgattttcagtttatattatactgaacgacaatt---AACATTTAAC--TATAAC-C-------ATAT-CACTAAAC------T--TTT-------AA-------CTATTTAAACCTT-TGTATGT----TTTGT----A----GTT--G------G-CAGTGTGTCT-GTGTGAATCATTTCGCATG---G-------C-T-T-TTAAGTCC---GTCT-GGTCGGTGCAGG--TGAACT--TCGTGTAGAGGTAGT-----GCCT-GTCA-GAG--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tAATAATTCGCCAATGTAATTAC------CTTC-------CAT-GGAA-TT-A----G---TAGTATGG-TTTT-ATGACTGTAA---GAATTA----TG------CGT--TA----TTTTTGTCGTTCAGa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaataatttgtatagattttttgtagctTCATTTT------CCTG-------CAT-GGAC-TC-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG---TGT--TGATTTTTTTTGCCTTTCAGtatataattgaaaataat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcaaacTAC-AGTAAA--GT-GGTCAATATTATTTT------CGTC-------TGT-TGAA-TT-G----G---TA---TAG-TTTTTATGACTCTTA---AAAAAA----TGTTT--TGGG--GG----TTTTTGTCGTTCAGtattgatgttacggtaataactgtacaaattatataaataaaata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACGTATCT-ATGTGAAACATTGTGTACG---T-A----TT-T-T-AT---TTT---GCCT-TATCGGTGCATG--TGTACC--TT-T---GAA----------ACCT-GTCA-GAG--A------CACAGACA-Ttatatatatatatacctgttacgcatgac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-TT-G----G---TG---TAG-TTTT-ATGACTCTAA---GAAATA----TGTTG--TTGT--T-----TTTTTGTCGTTCAGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                               CGCGCAAAATGTTTCACA-TAG--ACA-CGTTGTTA---ATTAACAACCTGCCACAATCAC---AAAATTT-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-TG---AACATTTAAA--AG-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTTAACTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----AAGGC----T----ATT--A------A-CGACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-G-T-TT---T-A---GCCT-AATCGGTGCACG--TGTGCA--TCATGC--------------ATTT-GT--------G------TA----------------------AC--------CTT-TAAGG-A-AA-GGAAA--CACTTGCTGATGATTAGAATACCGTCCTAC-AATATATAATCTGTCGTCATGTTTTC------CCGC-------CAT-GGTT-TTGG----G---TT---TAG-TTTT-ATGACCCTTA---GTAATA-----------------TG----TTTTTGTCGTTCAGtctacatccgacgtgaaaacgttgac
gi|3                          :                                                                                                                            gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactataATTAGGCT----AAAACAATCCGTGCAAAATGTTTCACA-TAG--ACA-CGTCGTTA---ATAG----CCTTACACAATCAC---AAAGTTA-AA---------AGTTAAAATTTGAAATGGCTCTT-TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---AAA--------------------T-CA---AG-------T--CTT-------AAA------TTTTGTGA----T-TGT--GG----CAGGT----TGTTAATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACA--------------------------TT---T----------------TGCGCG--TGCACT--TCATGCGGAAACATT--------------------G------TACAGGTA-TT------T-GTGTTAT--------CGT-TGAGG-A-AT-AGAAA--CA----CTAAATATTAGAGTACCGTCtgcacttcatgcggaaacattgtacaggtatttgtgttatcgttgaggaatagaaacactaaatattagagtaccgtc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactatactgaacgacaaaaacatattactaagggtcataaaactaaacccaaaaccatggcgggaaaacatgacgacagattatatattgtaggacggtattctaatcatcagcaagtgtttcctttccttaaaggttacacaaatgcatgatgcacacgtgcaccgT---TC----GCCA-AATAGTTGCACA--TGCACT--TCATACAGAAACATA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TATTAACA-TT------T-G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                         gATTAGGCTGAAGAG-----TCCGTGCAAAATGTT--AAA-AAATAA--ACGT-GTTGTTAATAA----CCTGCTACAAGCATA--AAAGTTA-AAATTTGAAATG------ACTTG------------TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---------A-AAT-C-------ATCA-CG-----------------T-------GA-------CTTCATAA----A-TGC--GT----CAGAT----T----ATT--A------A-CTTCTTGTCT-ATGTGAA-CATTTTGTACG---G-A----TT-T-G-TT----CA---ACCT-AATCGGAGCACA--TGCACT--TGATGCAGAAACAAA-----ACTT-GTCA-AAC--A------TAATGGCA-CT------T-TTGTAAC--------CGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTACCAGTAAACCGTCC-ACTAGTTAATAATTGGCCGATATCATTTC------CTTC-------CAT-AGAC-TT-G----G---TA---T
gi|5                          :                                                                                                                                                 taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagttgaagtgcacgtgtaccgTA----CCCGACACAATCAC---GAAGTTA-AA----------------AGTTAA---------T-TT---GAAATGG--C--TCG-CG---TACAT----------GGT-C-------A----CG---AA-------TGGTAT-------AG---------TCATAAACATT-TGT--TT----CGGGT----T----ATT--C------C-CA-CTTGTCTTATGTAATATATTGTGCACG---G-A----TT-T-C-TT----CA---GCCT-ACTCGGTGCTCG--TGGACT--TCATGCGGGCACGTG-----AACT--TCATGTG--GATACAATACAGGCATTT------T-GTGTAAG--------AAC-TAATT-A-AT-GGAAA--CGCTTGCTAATTATTAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATCATTTC------CCTC-------CAT-TAAC-TT-A----GAAATA---TTA-TTTT-att
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                     AAATGTAT-ACAGTAGTAACAATAT-ATTT---CT------------ACTATCACCTTAAACATA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---T-----G--T--TAG-CT---ATCATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCATG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGTGGAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TAAAGGCA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTGTTAGTATACCATTCTAC-AGTAAATATTCAGTCTATATTTTTTC------CCTC-------CAT-GAAC-TT-G----G---TA---TGC-TTTT-ATGACCTTTA---GAAATC----TGTTG--ATGT--TG----TTTTTGTCATTCAGggtcgttcagtatatagaagtgtctctaactttcttcaatttatttatgtttacttgtttctcgcatctacatgtcttctgaactataaacaatgaatttccctacattagca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatcaagttaaaataaaattactatttactaaccT-GTGTCAGGTATTTAGCATG---A-A----TT-T-T-TT----CA---GCTT-AATCGGTGCATG--TGCA----TAACGCAGAAACAAT-----ACTT-GTCA-GAG--G------TACAGGAA-TC------T-GTGCAAC--------CAT-TAAGG-A-AT-GTTAA--CATTTGCTTATTATTAGTATACTGTTCTAC-ATTAATTTATTGGTCAATATTATTTC------CCTC-------CGT-GAAC-TT-G----G---TC---TGG--TTT-GTGACCCTCA---GAAATA----TA--G----GT--T-----TTTTTGTCATTCAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatggttgatcaatttgacattttggtaagctttctcaaacaagtcatcagctttaatCAATGTTATTAC------CTTC-------AAT-CGAC-TT-G----G---TA---TGG--CTA-ATGACCTTTC---AAAATA----TGTTG--TT----------TTTTTtaaatcggtaaaatagattaagtttctaaccagatggcaacgtacttgacatttttttcacatttatcgaccataaagaaatatcattaacttatattgatattgagaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --TCA-CG---AACAA--AAA--TA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--TTT-------AA-------CTTTATGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------C-CAAAGTGTC--ATGTGCAGCATTTTGAATGT--GTG----TT-T-G-TT---CCA---GCCT-AATAGGTGAATA--TGTGCT-----TAC-GAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAA--G------TATAGGAA-TT------T-GTGCAAC--------TAT-TAGTG-A-AT-AAAAAAGAACCTGTTAGTTATAAGTA--------TAC-AGTAAATAATTGGTCAATATTATTTC------CCTC-------CAA-GTAC-TT-G----G---TA---TGG--TTA-ATGACCTTTA---TAAACATTTTTTTTG--TTGT--TG----TTtttaaatggtcacgaacaaaaataagccatttcaaattttaactttatgattgtgtcaggttattaccaaagtgtcatgtgcagcattttgaatgtgtgtttgttccagcctaataggtgaatatgtgcttacgaaacaatacctgtcagaagtataggaatttgtgcaactattagtgaataaaaaagaacctgttagttataagtatacagtaaataattggtcaatattatttccctccaagtacttggtatggttaatgacctttataaacattttttttgttgttgttca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaaaaacaacatattttgaaaggtcattagccataccaagtcgattgaaggtaataacattgtttaaatggGTGCATG--TGCACTGCTTATGCTGAAAAAATTTGTGACATAGTCC-CAG--G------TACAGGCA-TT------T-TTGAATC--------TGT-TGAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATTAGTAGACCCACCTAC-ATTA---AACCAGTAGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GT---A---TAAT-TGG-TTTA-ATTACCCTTA---GAATTA----TGTTG--TTGT--CT----TTTTTGTca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatatattagggtcgtgaatcttctgtttcagaatgaatgtttctattgctgggtttggcttcttagatatattgaaaaaCACA---A-A----TT-T-T-TT----CA---GCAT-AAGCAGTGCACA--TGCACT--TCATATAGAACCAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CAT-TAAGG---------AA--CACTTGTTAATTttcatatagaaccaatacctgtcagaggtacaggcatttgtgtaaccattaaggaacacttgttaattctacagt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TATAAATTTATTAGCAATACTTCTGACTATCCTGAAACCAGCATATTAACGTATATGTTCTTGCAATTTCATCCCTGCAAGTGTTTCACTAGTTTATTTTGGTCGCATATTCAGCA
Unaligned ( gi|29 ): TGAATAAAAACAATTTATTTTTGTCATTATTTTTGTTTTCAATACTTAATTGGCATGTACATTGAAAGTAGAAATCACA






Alignments
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Reference ( family-597 )      :                                                                                                                                                                                         NATTAGGCTGAAGAGAACAATCCGTGCAAAATGTTTCACA-TAGTAACAACGT-GTTG---ATTA----CCTGACACAATCAC---AAA-GTTA------AA---------GACTTGA--------T-TT----C-----G--T--TCG-CG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGCGGAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATNAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--TTGT--TG----TTTTTGTCGTTCAG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T-T-T-TT---TCA---GCCT-AAATGGTACATG--TGCTCT--TCATGCGTAAACATA-----ACCT-GTCT-GAG--G------TACAGGCA-TT------TTGTGTAACGGTCAAAATGT-TAAGC-A-AT-GGAAA--CATTTGTAAATTACAAGTATACCGTC-----AGTAAATAATCAGTTAATATCATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TATA-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--GTTT--TG----TTTCTGTTGTTCAGtttcagcctaaatggtacatgtgctcttcatgcgtaaacataacctgtctgaggtacaggcattttgtgtaacggtcaaaatgttaagcaatggaaacatttgtaaattacaagtataccgtcagtaaataatcagttaatatcatttccctccatggacttggtatggtataatgacccttagaaatatgttggttttgtttctgttgttcagtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     ttgaaatggcttgtttaaaaattcacaaacaaaatcaagtcA--------T-TT----T-----G--A--CTG-TG---AACATTTAAA--CA-AGG-G-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GTCTGACAGGT----T----ATT------------TATGCGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---ACA---GCCT-AATACGTGCATG--TGCACT--ACACGTGAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGTA-TT------T-GTGTAA---------CGCATAAGG-A-ATAAAAAA--CACTTGCAAATTATGTGTTTGCATTCCTAC-AGTAAATAATCGATCAATATTATTTC------CTTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA-----G-TTTT-ATGTCCCTTA---GAAATA----TGTTA--TTATAATT----TTTTTGTTATTCAtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                          tatatCTGACACAATCTC---AAA-GTTA------AA---------TACTTGA--------T-TTT---C-----G--T---CG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-AA---AA-------T--T--TTAAGTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GC----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTAAAACATTCTATATG---G-A----TT-T-T-TT---T-A---CCCT-AATCGGTGCACG--TGTACA--TCGTGCGGAAACAAT-----ACC--GTCA-GAG--G------TACCAGCA-TC------T-TTGTA------------------G-A-AT-AGAAA--CACTTGCTTTTCATGTGCATACAGTCCTAC-AGTAAATAA-----CAATTTTATGAC------CCTTAGAAATACAT--GACATT-T----G---TA----GG-TTTT-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAC-ATAAAATAATCGGTCGATATTATCACACCCACCCTC-------TATTGAAA-TT-G----G----A---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATG----TGTTG--TTGT--T-----TTTTGGTCGTTCAGtgccgtttaacatattt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                         gcataattatgtaaatata---AAA-GTTA------AA----------AGTTAA--------A-AT----A-----G--C--TCG----------TTTAAAAGCA-AGT---------AT---------A-------T--T------------G-------CTTTGTGG----T-TGT--GA----CAGAT----T----ATT--AAGATTAA-CAACGTGTCT-ATGTGAACCATTTTGCACA---A-A----TT-------------------T-AATCGGTGTACG--TGCATT--TCATGTGGAATCAAT-----ACCT-------------------------A-TT------T-GTGTAAC--------CG--CAAGG-A-AT-ttccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaaatttgtgcaaaatggttcacatagacacgttgttaatcttaataatctgtcacaaccacaaagcaatatacttgcttttaaacgagctattttaacttttaacttttca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtTTGTGA----C-TGT--GT----CAGAT----T----ATT--ATTT---A-GGACGTGTCT-ATGTGAAACATACTGCACG---G-G----TT-T-A-TT---C-----GCCTTAACCGGTGCACG--TGCACT--TCACGTGAAATCAAA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TACATACA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAATG-A-AT-GGAAA--T-CTTGCTCATAACAATCTTACCTATTTAC-AGTAAATA-------GATATTATTTC------CCTC-------CAT-GAAA-CC-G----G---TT---TGG-CTTT-ATG----TTATTTGAAACA----TG-----------TA----TATTTGTCGTTtca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -----ACCT-GCCA-GAGAGG------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      gtTTAC---AAA-GTTAC-----AA---------GTTTTGA--------T-TT----C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTACCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---TCACCTGCCA-GAGAGGTACAAG--TGgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaatcaaaacttgtaactttgtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                              gtggttacacaaaAATCCATGCAAAATGTTTTACA-AAGTTACAA-GT-TTTG---ATTaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaTAAT--------CTG-TAAAA-A-AT-AGAAA--CAATTAATAGTT----GTATACTGTCCTAC-AGTAAATAATCA----ATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GGTATG---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAA--A----TGCTT--TTGG--GC----TTTTTGTCACTCGGtgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                            cagaagttttcagcaAATCCATGCAAAATGTTTTATA-AAGTTTTAA-GT-TTTG---ATTtatattattcagattcatgtacatagactactggaataataaaaatagatcctatgctgccattttct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaTTAT---AAA-GTTTT-----AA---------GTTTTGA--------T-TT----C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTATCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-tctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttA-GAG--G------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------Cccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|2                          :                                                                  tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttataaagttttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagCACAA-CAC---AAA-GTTA------AA---------TACTTGA--------T-TTG---C-----A--T--TC----------ATTTAAG--CG-AGG-T-------ATTT-CA---AC-------T--T--TT-------AA-------CTGTGTGA----T-AGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAAATTGTCT-ATGTGAAACATTTTGTACGACGG-A----TT-T-G-TT---TCA---GCTT-AGTCGGTGCACGCGTGCACT--TTATGTAGAAACAAT-----ACCT-G-CA-GAG--G------------CA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-TAAGG-A-AT-ATAAA--CACTTGCTTATTGTTAGAAAATCGTCATAC-AGTAAATACTTGGTCGGTATTATTTC------CCTT-------CTT-TGAA-AT----------TA---TGG--TTT-ATGACTCTTA---GAATTA----TGTAGGATTGG--CA----TTTTCGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gT-T-T-TT---CCA---GCTT-TATTGGTGCATG--T-------TCA---GAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TTTGTTTGT-GTGTAAC--------CAT-TATGGTATAT-GGAAA--CACTT----ATCATAAGTATACCATTCTAT---------ATCCGTCAATATTATTTC------CCTC-------C---------------------A---TGG-TTTT-ATGACCCTT--------------TGGGG--TT-T--TA-----TTTTGTCGTTCAGtaatgcacaggcatttgctcttgtttatgccatctaccatattctatttcaatttttaaaaaaaataaatttcttttaattatcagtgtatcaggatatgttttaaaacaaaatctgcaaataatgcttacgtatcggctgttgaagattattttttttaatttttcattccatctttgattaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATCAT---AAA-GTTA------TA---------GACTTGG--------T-TT----C-----T--T--TCA-TG---AATATTTAAA--CA-AGC-TTTTTTGAATTT-TG---AT-------T--T--TT-------AA-------ATTTGTGA----T-TGT--GT----CAATT----T----ATT--A------A-TA---TGTTT-GTGTAAAATAATTTGTATA---G-A----TT-T-T-TT---GTA---GC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtatgattttcagtttatattatactgaacgacaatt---AACATTTAAC--TATAAC-C-------ATAT-CACTAAAC------T--T--TT-------AA-------CTATTTAAACCTT-TGTATGT----TTTGT----A----GTT--G------G-CAGTGTGTCT-GTGTGAATCATTTCGCATG---G-------C-T-T-TTAAGTCC---GTCT-GGTCGGTGCAGG--TGAACT--TCGTGTAGAGGTAGT-----GCCT-GTCA-GAG--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tAATAATTCGCCAATGTAATTAC------CTTC-------CAT-GGAA-TT-A----G---TAGTATGG-TTTT-ATGACTGTAA---GAATTA----TG------CGT--TA----TTTTTGTCGTTCAGa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaataatttgtatagattttttgtagctTCATTTT------CCTG-------CAT-GGAC-TC-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG---TGT--TGATTTTTTTTGCCTTTCAGtatataattgaaaataat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttcaaacTAC-AGTAAA--GT-GGTCAATATTATTTT------CGTC-------TGT-TGAA-TT-G----G---TA---TAG-TTTTTATGACTCTTA---AAAAAA----TGTTT--TGGG--GG----TTTTTGTCGTTCAGtattgatgttacggtaataactgtacaaattatataaataaaata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACGTATCT-ATGTGAAACATTGTGTACG---T-A----TT-T-T-AT---TTT---GCCT-TATCGGTGCATG--TGTACC--TT-T---GAA----------ACCT-GTCA-GAG--A------CACAGACA-Ttatatatatatatacctgttacgcatgac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       C-TT-G----G---TG---TAG-TTTT-ATGACTCTAA---GAAATA----TGTTG--TTGT--T-----TTTTTGTCGTTCAGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                               CGCGCAAAATGTTTCACA-TAG--ACA-CGTTGTTA---ATTAACAACCTGCCACAATCAC---AAA-ATTT------AA---------GACTTGA--------T-TT----C-----G--T--TCG-TG---AACATTTAAA--AG-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TTAACTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----AAGGC----T----ATT--A------A-CGACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-G-T-TT---T-A---GCCT-AATCGGTGCACG--TGTGCA--TCATGC--------------ATTT-GT--------G------TA----------------------AC--------CTT-TAAGG-A-AA-GGAAA--CACTTGCTGATGATTAGAATACCGTCCTAC-AATATATAATCTGTCGTCATGTTTTC------CCGC-------CAT-GGTT-TTGG----G---TT---TAG-TTTT-ATGACCCTTA---GTAATA-----------------TG----TTTTTGTCGTTCAGtctacatccgacgtgaaaacgttgac
gi|3                          :                                                                                                                            gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactataATTAGGCTAAA----ACAATCCGTGCAAAATGTTTCACA-TAG--AC-ACGTCGTTA---ATAG----CCTTACACAATCAC---AAA-GTTAAAAGTTAA---------AATTTGAAATGGCTCT-TTTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---AAA--------------------T-CA---AG-------T--C--TTA------AA-------TTTTGTGA----T-TGT--GG----CAGGT----TGTTAATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCGC---------------------------------------GTGC--------ACT--TCATGCGGAAACATT--------------------G------TACAGGTA-TT------T-GTGTTAT--------CGT-TGAGG-A-AT-AGAAA--CA----CTAAATATTAGAGTACCGTCtgcacttcatgcggaaacattgtacaggtatttgtgttatcgttgaggaatagaaacactaaatattagagtaccgtc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactatactgaacgacaaaaacatattactaagggtcataaaactaaacccaaaaccatggcgggaaaacatgacgacagattatatattgtaggacggtattctaatcatcagcaagtgtttcctttccttaaaggttacacaaatgcatgatgcacacgtgcaccgT---TC----GCCA-AATAGTTGCACA--TGCACT--TCATACAGAAACATA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TATTAACA-TT------T-G
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gi|5                          :                                                                                                                                                 taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagttgaagtgcacgtgtaccgTA----CCCGACACAATCAC---GAA-GTTA------AA----------AGTTAA--------T-TT----GAAATGG--C--TCG-CG---TACAT----------GGT-C-------A----CG---AA-------TGGT--AT-------AG---------TCATAAACATT-TGT--TT----CGGGT----T----ATT--C------C-CA-CTTGTCTTATGTAATATATTGTGCACG---G-A----TT-T-C-TT----CA---GCCT-ACTCGGTGCTCG--TGGACT--TCATGCGGGCACGTG-----AACT--TCATGTG--GATACAATACAGGCATTT------T-GTGTAAG--------AAC-TAATT-A-AT-GGAAA--CGCTTGCTAATTATTAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATCATTTC------CCTC-------CAT-TAAC-TT-A----GAAATA---TTA-TTTT-att
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-597 )      :                                                                                                                                                                                         NATTAGGCTGAAGAGACAATCCGTGCAAAATGTTTCACAN-AG-TA-CAACGT-GTTG---ATTA----CCTGACACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-CG---AACGTTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGCGGAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATNAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--TTGT--TG----TTTTTGTCGTTCAG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      ttgaaatggcttgtttaaaaattcacaaacaaaatcaagtcA---------T-TT---T-----G--A--CTG-TG---AACATTTAAA--CA-AGG-G-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GTCTGACAGGT----T----ATT------------TATGCGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---ACA---GCCT-AATACGTGCATG--TGCACT--ACACGTGAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGTA-TT------T-GTGTAA---------CGCATAAGG-A-ATAAAAAA--CACTTGCAAATTATGTGTTTGCATTCCTAC-AGTAAATAATCGATCAATATTATTTC------CTTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA-----G-TTTT-ATGTCCCTTA---GAAATA----TGTTA--TTATAATT----TTTTTGTTATTCAtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                          tatatCTGACACAATCTC---AAA-GTTA-AA---------T------ACTTGA---------T-TTT--C-----G--T---CG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-AA---AA-------T--T--TTAAGTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GC----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTAAAACATTCTATATG---G-A----TT-T-T-TT---T-A---CCCT-AATCGGTGCACG--TGTACA--TCGTGCGGAAACAAT-----ACC--GTCA-GAG--G------TACCAGCA-TC------T-TTGTA------------------G-A-AT-AGAAA--CACTTGCTTTTCATGTGCATACAGTCCTAC-AGTAAATAA-----CAATTTTATGAC------CCTTAGAAATACAT--GACATT-T----G---TA----GG-TTTT-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAC-ATAAAATAATCGGTCGATATTATCACACCCACCCTC-------TATTGAAA-TT-G----G----A---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATG----TGTTG--TTGT--T-----TTTTGGTCGTTCAGtgccgtttaacatattt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcataattatgtaaatataCGTTTAAAAGCA-AGT---------AT---------A-------T--T------------G-------CTTTGTGG----T-TGT--GA----CAGAT----T----ATT--AAGATTAA-CAACGTGTCT-ATGTGAACCATTTTGCACA---A-A----TT-------------------T-AATCGGTGTACG--TGCATT--TCATGTGGAATCAAT-----ACCT-------------------------A-TT------T-GTGTAAC--------CG--CAAGG-A-AT-ttccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaaatttgtgcaaaatggttcacatagacacgttgttaatcttaataatctgtcacaaccacaaagcaatatacttgcttttaaacgagctattttaacttttaacttttca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtTTGTGA----C-TGT--GT----CAGAT----T----ATT--ATTT---A-GGACGTGTCT-ATGTGAAACATACTGCACG---G-G----TT-T-A-TT---C-----GCCTTAACCGGTGCACG--TGCACT--TCACGTGAAATCAAA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TACATACA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAATG-A-AT-GGAAA--T-CTTGCTCATAACAATCTTACCTATTTAC-AGTAAATA-------GATATTATTTC------CCTC-------CAT-GAAA-CC-G----G---TT---TGG-CTTT-ATG----TTATTTGAAACA----TG-----------TA----TATTTGTCGTTagctattttaacttttaacttttca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----ACCT-GCCA-GAGAGG------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      gtTTAC---AAA-GTTACAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTACCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---TCACCTGCCA-GAGAGGTACAAG--TGgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaatcaaaacttgtaactttgtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                             gtggttacacaaaAATCCATGCAAAATGTTTTACAA-AGTTA-CAA-GT-TTTG---ATTaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaTAAT--------CTG-TAAAA-A-AT-AGAAA--CAATTAATAGTT----GTATACTGTCCTAC-AGTAAATAATCA----ATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GGTATG---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAA--A----TGCTT--TTGG--GC----TTTTTGTCACTCGGtgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                         cagaagttttcagcaTTAT---AAA-GTTTTAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTATCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-tatattattcagattcatgtacatagactactggaataataaaaatagatcctatgctgccattttct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttA-GAG--G------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------Cccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|2                          :                                                                  tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttataaagttttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagCACAA-CAC---AAA-GTTA-AA---------T------ACTTGA---------T-TTG--C-----A--T--TCA----------TTTAAG--CG-AGG-T-------ATTT-CA---AC-------T--T--TT-------AA-------CTGTGTGA----T-AGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAAATTGTCT-ATGTGAAACATTTTGTACGACGG-A----TT-T-G-TT---TCA---GCTT-AGTCGGTGCACGCGTGCACT--TTATGTAGAAACAAT-----ACCT-G-CA-GAG--G------------CA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-TAAGG-A-AT-ATAAA--CACTTGCTTATTGTTAGAAAATCGTCATAC-AGTAAATACTTGGTCGGTATTATTTC------CCTT-------CTT-TGAA-AT----------TA---TGG--TTT-ATGACTCTTA---GAATTA----TGTAGGATTGG--CA----TTTTCGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gT-T-T-TT---CCA---GCTT-TATTGGTGCATG--T-------TCA---GAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TTTGTTTGT-GTGTAAC--------CAT-TATGGTATAT-GGAAA--CACTT----ATCATAAGTATACCATTCTAT---------ATCCGTCAATATTATTTC------CCTC-------C---------------------A---TGG-TTTT-ATGACCCTT--------------TGGGG--TT-T--TA-----TTTTGTCGTTCAGtaatgcacaggcatttgctcttgtttatgccatctaccatattctatttcaatttttaaaaaaaataaatttcttttaattatcagtgtatcaggatatgttttaaaacaaaatctgcaaataatgcttacgtatcggctgttgaagattattttttttaatttttcattccatctttgattaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATCAT---AAA-GTTA-TA---------G------ACTTGG---------T-TT---C-----T--T--TCA-TG---AATATTTAAA--CA-AGC-TTTTTTGAATTT-TG---AT-------T--T--TT-------AA-------ATTTGTGA----T-TGT--GT----CAATT----T----ATT--A------A-TA---TGTTT-GTGTAAAATAATTTGTATA---G-A----TT-T-T-TT---GTA---GC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtatgattttcagtttatattatactgaacgacaatt---AACATTTAAC--TATAAC-C-------ATAT-CACTAAAC------T--T--TT-------AA-------CTATTTAAACCTT-TGTATGT----TTTGT----A----GTT--G------G-CAGTGTGTCT-GTGTGAATCATTTCGCATG---G-------C-T-T-TTAAGTCC---GTCT-GGTCGGTGCAGG--TGAACT--TCGTGTAGAGGTAGT-----GCCT-GTCA-GAG--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tAATAATTCGCCAATGTAATTAC------CTTC-------CAT-GGAA-TT-A----G---TAGTATGG-TTTT-ATGACTGTAA---GAATTA----TG------CGT--TA----TTTTTGTCGTTCAGa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaataatttgtatagattttttgtagctTCATTTT------CCTG-------CAT-GGAC-TC-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG---TGT--TGATTTTTTTTGCCTTTCAGtatataattgaaaataat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcaaacTAC-AGTAAA--GT-GGTCAATATTATTTT------CGTC-------TGT-TGAA-TT-G----G---TA---TAG-TTTTTATGACTCTTA---AAAAAA----TGTTT--TGGG--GG----TTTTTGTCGTTCAGtattgatgttacggtaataactgtacaaattatataaataaaata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACGTATCT-ATGTGAAACATTGTGTACG---T-A----TT-T-T-AT---TTT---GCCT-TATCGGTGCATG--TGTACC--TT-T---GAA----------ACCT-GTCA-GAG--A------CACAGACA-Ttatatatatatatacctgttacgcatgac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C-TT-G----G---TG---TAG-TTTT-ATGACTCTAA---GAAATA----TGTTG--TTGT--T-----TTTTTGTCGTTCAGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              CGCGCAAAATGTTTCACAT-AG--A-CA-CGTTGTTA---ATTAACAACCTGCCACAATCAC---AAA-ATTT-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-TG---AACATTTAAA--AG-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TTAACTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----AAGGC----T----ATT--A------A-CGACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-G-T-TT---T-A---GCCT-AATCGGTGCACG--TGTGCA--TCATGC--------------ATTT-GT--------G------TA----------------------AC--------CTT-TAAGG-A-AA-GGAAA--CACTTGCTGATGATTAGAATACCGTCCTAC-AATATATAATCTGTCGTCATGTTTTC------CCGC-------CAT-GGTT-TTGG----G---TT---TAG-TTTT-ATGACCCTTA---GTAATA-----------------TG----TTTTTGTCGTTCAGtctacatccgacgtgaaaacgttgac
gi|3                          :                                                                                                                            gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactataATTAGGCTAAA---ACAATCCGTGCAAAATGTTTCACAT-AG--A-CA-CGTCGTTA---ATAG----CCTTACACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------AGTTAAAATTTGAAATGGCTCTT-TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---AAA--------------------T-CA---AG-------T--C--TT-------AAA------TTTTGTGA----T-TGT--GG----CAGGT----TGTTAATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCGC---------------------------------------GTGC--------ACT--TCATGCGGAAACATT--------------------G------TACAGGTA-TT------T-GTGTTAT--------CGT-TGAGG-A-AT-AGAAA--CA----CTAAATATTAGAGTACCGTCtgcacttcatgcggaaacattgtacaggtatttgtgttatcgttgaggaatagaaacactaaatattagagtaccgtc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactatactgaacgacaaaaacatattactaagggtcataaaactaaacccaaaaccatggcgggaaaacatgacgacagattatatattgtaggacggtattctaatcatcagcaagtgtttcctttccttaaaggttacacaaatgcatgatgcacacgtgcaccgT---TC----GCCA-AATAGTTGCACA--TGCACT--TCATACAGAAACATA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TATTAACA-TT------T-G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                         gATTAGGCTGAAGAG----TCCGTGCAAAATGTT--AAAA-AA-TA--AACGT-GTTGTTAATAA----CCTGCTACAAGCAT---AAAAGTTA-AAATTTGAAATG------ACTTG------------TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---------A-AAT-C-------ATCA-CG-------------------T-------GA-------CTTCATAA----A-TGC--GT----CAGAT----T----ATT--A------A-CTTCTTGTCT-ATGTGAA-CATTTTGTACG---G-A----TT-T-G-TT----CA---ACCT-AATCGGAGCACA--TGCACT--TGATGCAGAAACAAA-----ACTT-GTCA-AAC--A------TAATGGCA-CT------T-TTGTAAC--------CGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTACCAGTAAACCGTCC-ACTAGTTAATAATTGGCCGATATCATTTC------CTTC-------CAT-AGAC-TT-G----G---TA---T
gi|5                          :                                                                                                                                                 taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagttgaagtgcacgtgtaccgTA----CCCGACACAATCAC---GAA-GTTA-AA----------------AGTTAA---------T-TT---GAAATGG--C--TCG-CG---TACAT----------GGT-C-------A----CG---AA-------TGGT--AT-------AG---------TCATAAACATT-TGT--TT----CGGGT----T----ATT--C------C-CA-CTTGTCTTATGTAATATATTGTGCACG---G-A----TT-T-C-TT----CA---GCCT-ACTCGGTGCTCG--TGGACT--TCATGCGGGCACGTG-----AACT--TCATGTG--GATACAATACAGGCATTT------T-GTGTAAG--------AAC-TAATT-A-AT-GGAAA--CGCTTGCTAATTATTAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATCATTTC------CCTC-------CAT-TAAC-TT-A----GAAATA---TTA-TTTT-att
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-597 )      :                                                                                                                                                                                         NATTAGGCTGAAGAGACAATCCGTGCAAAATGTTTCACAN-AG-TA-CAACGT-GTT---AATTA----CCTGACACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-CG---AACGTTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGCGGAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATNAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--TTGT--TG----TTTTTGTCGTTCAG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-T-T-TT---TCA---GCCT-AAATGGTACATG--TGCTCT--TCATGCGTAAACATA-----ACCT-GTCT-GAG--G------TACAGGCA-TT------TTGTGTAACGGTCAAAATGT-TAAGC-A-AT-GGAAA--CATTTGTAAATTACAAGTATACCGTC-----AGTAAATAATCAGTTAATATCATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TATA-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--GTTT--TG----TTTCTGTTGTTCAGtttcagcctaaatggtacatgtgctcttcatgcgtaaacataacctgtctgaggtacaggcattttgtgtaacggtcaaaatgttaagcaatggaaacatttgtaaattacaagtataccgtcagtaaataatcagttaatatcatttccctccatggacttggtatggtataatgacccttagaaatatgttggttttgtttctgttgttcagtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAC-ATAAAATAATCGGTCGATATTATCACACCCACCCTC-------TATTGAAA-TT-G----G----A---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATG----TGTTG--TTGT--T-----TTTTGGTCGTTCAGtgccgtttaacatattt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcataattatgtaaatataCGTTTAAAAGCA-AGT---------AT---------A-------T--T------------G-------CTTTGTGG----T-TGT--GA----CAGAT----T----ATT--AAGATTAA-CAACGTGTCT-ATGTGAACCATTTTGCACA---A-A----TT-------------------T-AATCGGTGTACG--TGCATT--TCATGTGGAATCAAT-----ACCT-------------------------A-TT------T-GTGTAAC--------CG--CAAGG-A-AT-ttccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaaatttgtgcaaaatggttcacatagacacgttgttaatcttaataatctgtcacaaccacaaagcaatatacttgcttttaaacgagctattttaacttttaacttttca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtTTGTGA----C-TGT--GT----CAGAT----T----ATT--ATTT---A-GGACGTGTCT-ATGTGAAACATACTGCACG---G-G----TT-T-A-TT---C-----GCCTTAACCGGTGCACG--TGCACT--TCACGTGAAATCAAA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TACATACA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAATG-A-AT-GGAAA--T-CTTGCTCATAACAATCTTACCTATTTAC-AGTAAATA-------GATATTATTTC------CCTC-------CAT-GAAA-CC-G----G---TT---TGG-CTTT-ATG----TTATTTGAAACA----TG-----------TA----TATTTGTCGTTagctattttaacttttaacttttca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----ACCT-GCCA-GAGAGG------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      gtTTAC---AAA-GTTACAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTACCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---TCACCTGCCA-GAGAGGTACAAG--TGgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaatcaaaacttgtaactttgtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                             gtggttacacaaaAATCCATGCAAAATGTTTTACAA-AGTTA-CAA-GT-TTT---GATTaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaTAAT--------CTG-TAAAA-A-AT-AGAAA--CAATTAATAGTT----GTATACTGTCCTAC-AGTAAATAATCA----ATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GGTATG---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAA--A----TGCTT--TTGG--GC----TTTTTGTCACTCGGtgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           cagaagttttcagcaAATCCATGCAAAATGTTTTATAA-AG-Ttatattattcagattcatgtacatagactactggaataataaaaatagatcctatgctgccattttct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaTTAT---AAA-GTTTTAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTATCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-tttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttA-GAG--G------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------Cccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|2                          :                                                                  tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttataaagttttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagCACAA-CAC---AAA-GTTA-AA---------T------ACTTGA---------T-TTG--C-----A--T--TCA----------TTTAAG--CG-AGG-T-------ATTT-CA---AC-------T--T--TT-------AA-------CTGTGTGA----T-AGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAAATTGTCT-ATGTGAAACATTTTGTACGACGG-A----TT-T-G-TT---TCA---GCTT-AGTCGGTGCACGCGTGCACT--TTATGTAGAAACAAT-----ACCT-G-CA-GAG--G------------CA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-TAAGG-A-AT-ATAAA--CACTTGCTTATTGTTAGAAAATCGTCATAC-AGTAAATACTTGGTCGGTATTATTTC------CCTT-------CTT-TGAA-AT----------TA---TGG--TTT-ATGACTCTTA---GAATTA----TGTAGGATTGG--CA----TTTTCGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gT-T-T-TT---CCA---GCTT-TATTGGTGCATG--T-------TCA---GAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TTTGTTTGT-GTGTAAC--------CAT-TATGGTATAT-GGAAA--CACTT----ATCATAAGTATACCATTCTAT---------ATCCGTCAATATTATTTC------CCTC-------C---------------------A---TGG-TTTT-ATGACCCTT--------------TGGGG--TT-T--TA-----TTTTGTCGTTCAGtaatgcacaggcatttgctcttgtttatgccatctaccatattctatttcaatttttaaaaaaaataaatttcttttaattatcagtgtatcaggatatgttttaaaacaaaatctgcaaataatgcttacgtatcggctgttgaagattattttttttaatttttcattccatctttgattaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATCAT---AAA-GTTA-TA---------G------ACTTGG---------T-TT---C-----T--T--TCA-TG---AATATTTAAA--CA-AGC-TTTTTTGAATTT-TG---AT-------T--T--TT-------AA-------ATTTGTGA----T-TGT--GT----CAATT----T----ATT--A------A-TA---TGTTT-GTGTAAAATAATTTGTATA---G-A----TT-T-T-TT---GTA---GC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtatgattttcagtttatattatactgaacgacaatt---AACATTTAAC--TATAAC-C-------ATAT-CACTAAAC------T--T--TT-------AA-------CTATTTAAACCTT-TGTATGT----TTTGT----A----GTT--G------G-CAGTGTGTCT-GTGTGAATCATTTCGCATG---G-------C-T-T-TTAAGTCC---GTCT-GGTCGGTGCAGG--TGAACT--TCGTGTAGAGGTAGT-----GCCT-GTCA-GAG--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tAATAATTCGCCAATGTAATTAC------CTTC-------CAT-GGAA-TT-A----G---TAGTATGG-TTTT-ATGACTGTAA---GAATTA----TG------CGT--TA----TTTTTGTCGTTCAGa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaataatttgtatagattttttgtagctTCATTTT------CCTG-------CAT-GGAC-TC-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG---TGT--TGATTTTTTTTGCCTTTCAGtatataattgaaaataat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcaaacTAC-AGTAAA--GT-GGTCAATATTATTTT------CGTC-------TGT-TGAA-TT-G----G---TA---TAG-TTTTTATGACTCTTA---AAAAAA----TGTTT--TGGG--GG----TTTTTGTCGTTCAGtattgatgttacggtaataactgtacaaattatataaataaaata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACGTATCT-ATGTGAAACATTGTGTACG---T-A----TT-T-T-AT---TTT---GCCT-TATCGGTGCATG--TGTACC--TT-T---GAA----------ACCT-GTCA-GAG--A------CACAGACA-Ttatatatatatatacctgttacgcatgac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C-TT-G----G---TG---TAG-TTTT-ATGACTCTAA---GAAATA----TGTTG--TTGT--T-----TTTTTGTCGTTCAGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              CGCGCAAAATGTTTCACAT-AG--A-CA-CGTTGTT---AATTAACAACCTGCCACAATCAC---AAA-ATTT-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-TG---AACATTTAAA--AG-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TTAACTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----AAGGC----T----ATT--A------A-CGACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-G-T-TT---T-A---GCCT-AATCGGTGCACG--TGTGCA--TCATGC--------------ATTT-GT--------G------TA----------------------AC--------CTT-TAAGG-A-AA-GGAAA--CACTTGCTGATGATTAGAATACCGTCCTAC-AATATATAATCTGTCGTCATGTTTTC------CCGC-------CAT-GGTT-TTGG----G---TT---TAG-TTTT-ATGACCCTTA---GTAATA-----------------TG----TTTTTGTCGTTCAGtctacatccgacgtgaaaacgttgac
gi|3                          :                                                                                                                            gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactataATTAGGCTAAA---ACAATCCGTGCAAAATGTTTCACAT-AG--A-CA-CGTCGTT---AATAG----CCTTACACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------AGTTAAAATTTGAAATGGCTCTT-TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---AAA--------------------T-CA---AG-------T--C--TT-------AAA------TTTTGTGA----T-TGT--GG----CAGGT----TGTTAATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCGC---------------------------------------GTGC--------ACT--TCATGCGGAAACATT--------------------G------TACAGGTA-TT------T-GTGTTAT--------CGT-TGAGG-A-AT-AGAAA--CA----CTAAATATTAGAGTACCGTCtgcacttcatgcggaaacattgtacaggtatttgtgttatcgttgaggaatagaaacactaaatattagagtaccgtc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactatactgaacgacaaaaacatattactaagggtcataaaactaaacccaaaaccatggcgggaaaacatgacgacagattatatattgtaggacggtattctaatcatcagcaagtgtttcctttccttaaaggttacacaaatgcatgatgcacacgtgcaccgT---TC----GCCA-AATAGTTGCACA--TGCACT--TCATACAGAAACATA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TATTAACA-TT------T-G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                         gATTAGGCTGAAGAG----TCCGTGCAAAATGTT--AAAA-AA-TA--AACGT-GTTGTTAATAA----CCTGCTACAAGCAT---AAAAGTTA-AAATTTGAAATG------ACTTG------------TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---------A-AAT-C-------ATCA-CG-------------------T-------GA-------CTTCATAA----A-TGC--GT----CAGAT----T----ATT--A------A-CTTCTTGTCT-ATGTGAA-CATTTTGTACG---G-A----TT-T-G-TT----CA---ACCT-AATCGGAGCACA--TGCACT--TGATGCAGAAACAAA-----ACTT-GTCA-AAC--A------TAATGGCA-CT------T-TTGTAAC--------CGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTACCAGTAAACCGTCC-ACTAGTTAATAATTGGCCGATATCATTTC------CTTC-------CAT-AGAC-TT-G----G---TA---T
gi|5                          :                                                                                                                                                 taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagttgaagtgcacgtgtaccgTA----CCCGACACAATCAC---GAA-GTTA-AA----------------AGTTAA---------T-TT---GAAATGG--C--TCG-CG---TACAT----------GGT-C-------A----CG---AA-------TGGT--AT-------AG---------TCATAAACATT-TGT--TT----CGGGT----T----ATT--C------C-CA-CTTGTCTTATGTAATATATTGTGCACG---G-A----TT-T-C-TT----CA---GCCT-ACTCGGTGCTCG--TGGACT--TCATGCGGGCACGTG-----AACT--TCATGTG--GATACAATACAGGCATTT------T-GTGTAAG--------AAC-TAATT-A-AT-GGAAA--CGCTTGCTAATTATTAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATCATTTC------CCTC-------CAT-TAAC-TT-A----GAAATA---TTA-TTTT-att
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                    AAATGTAT-ACAGTAG-TAACAATAT-ATT------------TCT---ACTATCACCTTAAA-CATA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---T-----G--T--TAG-CT---ATCATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCATG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGTGGAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TAAAGGCA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTGTTAGTATACCATTCTAC-AGTAAATATTCAGTCTATATTTTTTC------CCTC-------CAT-GAAC-TT-G----G---TA---TGC-TTTT-ATGACCTTTA---GAAATC----TGTTG--ATGT--TG----TTTTTGTCATTCAGggtcgttcagtatatagaagtgtctctaactttcttcaatttatttatgtttacttgtttctcgcatctacatgtcttctgaactataaacaatgaatttccctacattagca
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatgT-GTGTCAGGTATTTAGCATG---A-A----TT-T-T-TT----CA---GCTT-AATCGGTGCATG--TGCA----TAACGCAGAAACAAT-----ACTT-GTCA-GAG--G------TACAGGAA-TC------T-GTGCAAC--------CAT-TAAGG-A-AT-GTTAA--CATTTGCTTATTATTAGTATACTGTTCTAC-ATTAATTTATTGGTCAATATTATTTC------CCTC-------CGT-GAAC-TT-G----G---TC---TGG--TTT-GTGACCCTCA---GAAATA----TA--G----GT--T-----TTTTTGTCATTCAGaattttttcagcttaatcggtgcatgtgcataacgcagaaacaatacttgtcagaggtacaggaatctgtgcaaccattaaggaatgttaacatttgcttattattagtatactgttctacattaatttattggtcaatattatttccctccgtgaacttggtctggtttgtgaccctcagaaatataggtttttttgtcattcagtaaatcggtaaaatagattaagtttctaaccagatggcaacgtacttgacatttttttcacatttatcgaccataaagaaatatcattaacttatattgatattgagaat
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-597 )      :                                                                                                                                                                                         NATTAGGCTGAAGAGACAATCCGTGCAAAATGTTTCACAN-AG-TA-CAACGT-GTT---AATTA----CCTGACACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-CG---AACGTTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGCGGAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATNAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--TTGT--TG----TTTTTGTCGTTCAG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TGT--GA----CAGGTAA--T----ATTTTA------A--AGCATCTCC-ACA--AAATGTTTCACATT---G-AAAC-TTAT-TATT---TCA---GCCT-AATCGATACACC--TGCACT--TCATACGGAACCATA-----ACCT-GTCA-GAT--G------TACA-----CT------T-GT---------------T-TAAG----------------CTT--T--TTGTTAGTATACCATCCAAC-AGTAAACAATCAGTCAACATCATTTC------CACC-------AAA-ACAC-TT-G----G---TA---AAGTTTTT-ATGATCTTTA---AACATG----TGTTG--TT-T--TG----TT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gagtacttggaaataggcgcaaaatatcgtcaatatatagggaactatAAATATT-----ACCT-GTCA-CAG--A-------AAAGGCA-AG------T-GTGTATC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--ATTTTGCTAAGTATAAGTATACAGTTCTAC-AGTAAATAACCGGTCGATATAATTTC------TCTA-------CAC-GGAG-AT-G----G---TA---TTG-TATT-TTAGCTCTAA---GAAATA----TGTTA--CT----------CTTTTGTCGTTCAGgaaaaggcaagtgtgtatccgttaaggaatggaaaattttgctaagtataagtatacagttctacagtaaataaccggtcgatataatttctctacacggagatggtattgtattttagctctaagaaatatgttactcttttgtcgttcagtgtttatatctgaaataatgattgtttcgtctgttcttattcgtatgatattatgattacttttaaagtgatttgca
gi|10                         : gagtacttggaaataggcgcaaaatatcgtcaatatatagggaactataacaaaacaacacatgtttaaagatcataaaaactttaccaagtgttttggtggaaatgatgttgactgattgtttactgttggatggtatactaacaaaaagcttaaacaagtgtacatctgacaggttatggttccgtatgaagtgcaggtgtatcgattaggctgaaataataagtttcaatgtgaaacattttgtggagatgctttaACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------A------GTTTAA---------A-TT---T-----G--AAATGG-CT-----TGTTTAAA--T---GTTC-------ATTGACA---AAATCTTGTC--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----A----ATA--A------A-CA---TATCT-ATGTGAAACATTTTGTACA---G-ACTAGTT-T-T-TT---CCA---GCCT-TATTGGTGCATG--TGCACT--TCATGTG-AAACACT-----ACAT-GTCA-GAG--G------TACAGGTA-TT------T-GTGTAAC--------TGT-TAA------T-G--AA--CACTTGCTAATTTTTAGTATAGCATCCTAC-AGTAAATAACCAGTCAATATT--------------------------------------------------G-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----CGTTG--TTTT--TG-----TGTTATTGTTCAGtgtttatatctgaaataatgattgtttcgtctgttcttattcgtatgatattatgattacttttaaagtgatttgca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 atgaattactatataatctaatata---------G------ACTTAA---------TATT---C-----GAGT--TCGTCGGTTAACTTTTAA---CG-AGC-C-------ATTT-CA---AAATTTAACT--T--TT-------AA-------CTTTATGA----AATGT--GC----CGGGC----T----ATT--A------A-CAACGTGTCC-GTGTTAAACGTTTTGTA-A---T-A----TT-TCT-TT---TCT---GCTT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TTGTGTTAAAATA-T-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGACG-TG------T-GTGTTCT--------CAT-TAAGT-A-AT-GGAAA--TACTTATTTATTACATGTATGCAGTTCTAT-CATAAATAATCGATCTAAAGTATTTC------CCTC-------CAT-GA------------------------TTTT-ATGACCCATA---GAAATA----TGTT-----GT--TG----TTTT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---T-----G--T--TTG-TG---AATTTTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---Aaggttattattgtcc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-T-T-TT---TCA---GCCT-AAATGGTACATG--TGCTCT--TCATGCGTAAACATA-----ACCT-GTCT-GAG--G------TACAGGCA-TT------TTGTGTAACGGTCAAAATGT-TAAGC-A-AT-GGAAA--CATTTGTAAATTACAAGTATACCGTC-----AGTAAATAATCAGTTAATATCATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TATA-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--GTTT--TG----TTTCTGTTGTTCAGtttcagcctaaatggtacatgtgctcttcatgcgtaaacataacctgtctgaggtacaggcattttgtgtaacggtcaaaatgttaagcaatggaaacatttgtaaattacaagtataccgtcagtaaataatcagttaatatcatttccctccatggacttggtatggtataatgacccttagaaatatgttggttttgtttctgttgttcagtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      ttgaaatggcttgtttaaaaattcacaaacaaaatcaagtcA---------T-TT---T-----G--A--CTG-TG---AACATTTAAA--CA-AGG-G-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GTCTGACAGGT----T----ATT------------TATGCGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---ACA---GCCT-AATACGTGCATG--TGCACT--ACACGTGAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGTA-TT------T-GTGTAA---------CGCATAAGG-A-ATAAAAAA--CACTTGCAAATTATGTGTTTGCATTCCTAC-AGTAAATAATCGATCAATATTATTTC------CTTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA-----G-TTTT-ATGTCCCTTA---GAAATA----TGTTA--TTATAATT----TTTTTGTTATTCAtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                          tatatCTGACACAATCTC---AAA-GTTA-AA---------T------ACTTGA---------T-TTT--C-----G--T---CG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-AA---AA-------T--T--TTAAGTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GC----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTAAAACATTCTATATG---G-A----TT-T-T-TT---T-A---CCCT-AATCGGTGCACG--TGTACA--TCGTGCGGAAACAAT-----ACC--GTCA-GAG--G------TACCAGCA-TC------T-TTGTA------------------G-A-AT-AGAAA--CACTTGCTTTTCATGTGCATACAGTCCTAC-AGTAAATAA-----CAATTTTATGAC------CCTTAGAAATACAT--GACATT-T----G---TA----GG-TTTT-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAC-ATAAAATAATCGGTCGATATTATCACACCCACCCTC-------TATTGAAA-TT-G----G----A---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATG----TGTTG--TTGT--T-----TTTTGGTCGTTCAGtgccgtttaacatattt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcataattatgtaaatataCGTTTAAAAGCA-AGT---------AT---------A-------T--T------------G-------CTTTGTGG----T-TGT--GA----CAGAT----T----ATT--AAGATTAA-CAACGTGTCT-ATGTGAACCATTTTGCACA---A-A----TT-------------------T-AATCGGTGTACG--TGCATT--TCATGTGGAATCAAT-----ACCT-------------------------A-TT------T-GTGTAAC--------CG--CAAGG-A-AT-ttccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaaatttgtgcaaaatggttcacatagacacgttgttaatcttaataatctgtcacaaccacaaagcaatatacttgcttttaaacgagctattttaacttttaacttttca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtTTGTGA----C-TGT--GT----CAGAT----T----ATT--ATTT---A-GGACGTGTCT-ATGTGAAACATACTGCACG---G-G----TT-T-A-TT---C-----GCCTTAACCGGTGCACG--TGCACT--TCACGTGAAATCAAA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TACATACA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAATG-A-AT-GGAAA--T-CTTGCTCATAACAATCTTACCTATTTAC-AGTAAATA-------GATATTATTTC------CCTC-------CAT-GAAA-CC-G----G---TT---TGG-CTTT-ATG----TTATTTGAAACA----TG-----------TA----TATTTGTCGTTagctattttaacttttaacttttca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----ACCT-GCCA-GAGAGG------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      gtTTAC---AAA-GTTACAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTACCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---TCACCTGCCA-GAGAGGTACAAG--TGgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaatcaaaacttgtaactttgtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                             gtggttacacaaaAATCCATGCAAAATGTTTTACAA-AGTTA-CAA-GT-TTT---GATTaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaTAAT--------CTG-TAAAA-A-AT-AGAAA--CAATTAATAGTT----GTATACTGTCCTAC-AGTAAATAATCA----ATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GGTATG---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAA--A----TGCTT--TTGG--GC----TTTTTGTCACTCGGtgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           cagaagttttcagcaAATCCATGCAAAATGTTTTATAA-AG-Ttatattattcagattcatgtacatagactactggaataataaaaatagatcctatgctgccattttct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaTTAT---AAA-GTTTTAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTATCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGTCT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-tttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttA-GAG--G------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------Cccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|2                          :                                                                  tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttataaagttttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagCACAA-CAC---AAA-GTTA-AA---------T------ACTTGA---------T-TTG--C-----A--T--TCA----------TTTAAG--CG-AGG-T-------ATTT-CA---AC-------T--T--TT-------AA-------CTGTGTGA----T-AGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAAATTGTCT-ATGTGAAACATTTTGTACGACGG-A----TT-T-G-TT---TCA---GCTT-AGTCGGTGCACGCGTGCACT--TTATGTAGAAACAAT-----ACCT-G-CA-GAG--G------------CA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-TAAGG-A-AT-ATAAA--CACTTGCTTATTGTTAGAAAATCGTCATAC-AGTAAATACTTGGTCGGTATTATTTC------CCTT-------CTT-TGAA-AT----------TA---TGG--TTT-ATGACTCTTA---GAATTA----TGTAGGATTGG--CA----TTTTCGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gT-T-T-TT---CCA---GCTT-TATTGGTGCATG--T-------TCA---GAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TTTGTTTGT-GTGTAAC--------CAT-TATGGTATAT-GGAAA--CACTT----ATCATAAGTATACCATTCTAT---------ATCCGTCAATATTATTTC------CCTC-------C---------------------A---TGG-TTTT-ATGACCCTT--------------TGGGG--TT-T--TA-----TTTTGTCGTTCAGtaatgcacaggcatttgctcttgtttatgccatctaccatattctatttcaatttttaaaaaaaataaatttcttttaattatcagtgtatcaggatatgttttaaaacaaaatctgcaaataatgcttacgtatcggctgttgaagattattttttttaatttttcattccatctttgattaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATCAT---AAA-GTTA-TA---------G------ACTTGG---------T-TT---C-----T--T--TCA-TG---AATATTTAAA--CA-AGC-TTTTTTGAATTT-TG---AT-------T--T--TT-------AA-------ATTTGTGA----T-TGT--GT----CAATT----T----ATT--A------A-TA---TGTTT-GTGTAAAATAATTTGTATA---G-A----TT-T-T-TT---GTA---GC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtatgattttcagtttatattatactgaacgacaatt---AACATTTAAC--TATAAC-C-------ATAT-CACTAAAC------T--T--TT-------AA-------CTATTTAAACCTT-TGTATGT----TTTGT----A----GTT--G------G-CAGTGTGTCT-GTGTGAATCATTTCGCATG---G-------C-T-T-TTAAGTCC---GTCT-GGTCGGTGCAGG--TGAACT--TCGTGTAGAGGTAGT-----GCCT-GTCA-GAG--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tAATAATTCGCCAATGTAATTAC------CTTC-------CAT-GGAA-TT-A----G---TAGTATGG-TTTT-ATGACTGTAA---GAATTA----TG------CGT--TA----TTTTTGTCGTTCAGa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaataatttgtatagattttttgtagctTCATTTT------CCTG-------CAT-GGAC-TC-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG---TGT--TGATTTTTTTTGCCTTTCAGtatataattgaaaataat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcaaacTAC-AGTAAA--GT-GGTCAATATTATTTT------CGTC-------TGT-TGAA-TT-G----G---TA---TAG-TTTTTATGACTCTTA---AAAAAA----TGTTT--TGGG--GG----TTTTTGTCGTTCAGtattgatgttacggtaataactgtacaaattatataaataaaata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACGTATCT-ATGTGAAACATTGTGTACG---T-A----TT-T-T-AT---TTT---GCCT-TATCGGTGCATG--TGTACC--TT-T---GAA----------ACCT-GTCA-GAG--A------CACAGACA-Ttatatatatatatacctgttacgcatgac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C-TT-G----G---TG---TAG-TTTT-ATGACTCTAA---GAAATA----TGTTG--TTGT--T-----TTTTTGTCGTTCAGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                              CGCGCAAAATGTTTCACAT-AG--A-CA-CGTTGTT---AATTAACAACCTGCCACAATCAC---AAA-ATTT-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-TG---AACATTTAAA--AG-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TTAACTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----AAGGC----T----ATT--A------A-CGACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-G-T-TT---T-A---GCCT-AATCGGTGCACG--TGTGCA--TCATGC--------------ATTT-GT--------G------TA----------------------AC--------CTT-TAAGG-A-AA-GGAAA--CACTTGCTGATGATTAGAATACCGTCCTAC-AATATATAATCTGTCGTCATGTTTTC------CCGC-------CAT-GGTT-TTGG----G---TT---TAG-TTTT-ATGACCCTTA---GTAATA-----------------TG----TTTTTGTCGTTCAGtctacatccgacgtgaaaacgttgac
gi|3                          :                                                                                                                            gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactataATTAGGCTAAA---ACAATCCGTGCAAAATGTTTCACAT-AG--A-CA-CGTCGTT---AATAG----CCTTACACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------AGTTAAAATTTGAAATGGCTCTT-TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---AAA--------------------T-CA---AG-------T--C--TT-------AAA------TTTTGTGA----T-TGT--GG----CAGGT----TGTTAATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCGC---------------------------------------GTGC--------ACT--TCATGCGGAAACATT--------------------G------TACAGGTA-TT------T-GTGTTAT--------CGT-TGAGG-A-AT-AGAAA--CA----CTAAATATTAGAGTACCGTCtgcacttcatgcggaaacattgtacaggtatttgtgttatcgttgaggaatagaaacactaaatattagagtaccgtc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactatactgaacgacaaaaacatattactaagggtcataaaactaaacccaaaaccatggcgggaaaacatgacgacagattatatattgtaggacggtattctaatcatcagcaagtgtttcctttccttaaaggttacacaaatgcatgatgcacacgtgcaccgT---TC----GCCA-AATAGTTGCACA--TGCACT--TCATACAGAAACATA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TATTAACA-TT------T-G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                         gATTAGGCTGAAGAG----TCCGTGCAAAATGTT--AAAA-AA-TA--AACGT-GTTGTTAATAA----CCTGCTACAAGCAT---AAAAGTTA-AAATTTGAAATG------ACTTG------------TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---------A-AAT-C-------ATCA-CG-------------------T-------GA-------CTTCATAA----A-TGC--GT----CAGAT----T----ATT--A------A-CTTCTTGTCT-ATGTGAA-CATTTTGTACG---G-A----TT-T-G-TT----CA---ACCT-AATCGGAGCACA--TGCACT--TGATGCAGAAACAAA-----ACTT-GTCA-AAC--A------TAATGGCA-CT------T-TTGTAAC--------CGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTACCAGTAAACCGTCC-ACTAGTTAATAATTGGCCGATATCATTTC------CTTC-------CAT-AGAC-TT-G----G---TA---T
gi|5                          :                                                                                                                                                 taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagttgaagtgcacgtgtaccgTA----CCCGACACAATCAC---GAA-GTTA-AA----------------AGTTAA---------T-TT---GAAATGG--C--TCG-CG---TACAT----------GGT-C-------A----CG---AA-------TGGT--AT-------AG---------TCATAAACATT-TGT--TT----CGGGT----T----ATT--C------C-CA-CTTGTCTTATGTAATATATTGTGCACG---G-A----TT-T-C-TT----CA---GCCT-ACTCGGTGCTCG--TGGACT--TCATGCGGGCACGTG-----AACT--TCATGTG--GATACAATACAGGCATTT------T-GTGTAAG--------AAC-TAATT-A-AT-GGAAA--CGCTTGCTAATTATTAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATCATTTC------CCTC-------CAT-TAAC-TT-A----GAAATA---TTA-TTTT-att
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                    AAATGTAT-ACAGTAG-TAACAATAT-ATT------------TCT---ACTATCACCTTAAA-CATA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---T-----G--T--TAG-CT---ATCATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGTCT-ATGTGAAACATTTTGCATG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGTGGAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TAAAGGCA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTGTTAGTATACCATTCTAC-AGTAAATATTCAGTCTATATTTTTTC------CCTC-------CAT-GAAC-TT-G----G---TA---TGC-TTTT-ATGACCTTTA---GAAATC----TGTTG--ATGT--TG----TTTTTGTCATTCAGggtcgttcagtatatagaagtgtctctaactttcttcaatttatttatgtttacttgtttctcgcatctacatgtcttctgaactataaacaatgaatttccctacattagca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                         aatcaagttaaaataaaattactatttactaaccCAT-GCT---AAATA----CCTGACACAAT--T---AAA-GCTG-AT---------G------ACTT------------------------G--T--TTG-AG---AAAGCTT-AC--CA-AA----------ATGT-CA---AA-------T--TGATC-------AA-------C
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatgT-GTGTCAGGTATTTAGCATG---A-A----TT-T-T-TT----CA---GCTT-AATCGGTGCATG--TGCA----TAACGCAGAAACAAT-----ACTT-GTCA-GAG--G------TACAGGAA-TC------T-GTGCAAC--------CAT-TAAGG-A-AT-GTTAA--CATTTGCTTATTATTAGTATACTGTTCTAC-ATTAATTTATTGGTCAATATTATTTC------CCTC-------CGT-GAAC-TT-G----G---TC---TGG--TTT-GTGACCCTCA---GAAATA----TA--G----GT--T-----TTTTTGTCATTCAGaattttttcagcttaatcggtgcatgtgcataacgcagaaacaatacttgtcagaggtacaggaatctgtgcaaccattaaggaatgttaacatttgcttattattagtatactgttctacattaatttattggtcaatattatttccctccgtgaacttggtctggtttgtgaccctcagaaatataggtttttttgtcattcagtaaatcggtaaaatagattaagtttctaaccagatggcaacgtacttgacatttttttcacatttatcgaccataaagaaatatcattaacttatattgatattgagaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aatggttgatcaatttgacattttggtaagctttctcaaacaagtcatcagctttaatCAATGTTATTAC------CTTC-------AAT-CGAC-TT-G----G---TA---TGG--CTA-ATGACCTTTC---AAAATA----TGTTG--TT----------TTTTTtaaatcggtaaaatagattaagtttctaaccagatggcaacgtacttgacatttttttcacatttatcgaccataaagaaatatcattaacttatattgatattgagaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TCA-CG---AACAA--AAA--TA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTATGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------C-CAAAGTGTC--ATGTGCAGCATTTTGAATGT--GTG----TT-T-G-TT---CCA---GCCT-AATAGGTGAATA--TGTGCT-----TAC-GAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAA--G------TATAGGAA-TT------T-GTGCAAC--------TAT-TAGTG-A-AT-AAAAAAGAACCTGTTAGTTATAAGTA--------TAC-AGTAAATAATTGGTCAATATTATTTC------CCTC-------CAA-GTAC-TT-G----G---TA---TGG--TTA-ATGACCTTTA---TAAACATTTTTTTTG--TTGT--TG----TTtttaaatggtcacgaacaaaaataagccatttcaaattttaactttatgattgtgtcaggttattaccaaagtgtcatgtgcagcattttgaatgtgtgtttgttccagcctaataggtgaatatgtgcttacgaaacaatacctgtcagaagtataggaatttgtgcaactattagtgaataaaaaagaacctgttagttataagtatacagtaaataattggtcaatattatttccctccaagtacttggtatggttaatgacctttataaacattttttttgttgttgttca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaaaaacaacatattttgaaaggtcattagccataccaagtcgattgaaggtaataacattgtttaaatggGTGCATG--TGCACTGCTTATGCTGAAAAAATTTGTGACATAGTCC-CAG--G------TACAGGCA-TT------T-TTGAATC--------TGT-TGAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATTAGTAGACCCACCTAC-ATTA---AACCAGTAGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GT---A---TAAT-TGG-TTTA-ATTACCCTTA---GAATTA----TGTTG--TTGT--CT----TTTTTGTca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aatatattagggtcgtgaatcttctgtttcagaatgaatgtttctattgctgggtttggcttcttagatatattgaaaaaCACA---A-A----TT-T-T-TT----CA---GCAT-AAGCAGTGCACA--TGCACT--TCATATAGAACCAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CAT-TAAGG---------AA--CACTTGTTAATTttcatatagaaccaatacctgtcagaggtacaggcatttgtgtaaccattaaggaacacttgttaattctacagt


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                     GAG                    T   GT  TAACAAT   T   GTTAATAA                  CTT   A    C  ATTTGAAATG            AATGGCTCT A  GAAATG    AG .    TC GTT   T      AGCA   CTTTTTTGA     .  CTA  ATTTAACTTTTAA                          ACCT A   AT  CTGA     CACA GTTA   .  AGATTAA   A       T                   ACG T CTAG  . CT   TCACCT       T            CG      GC      G      ATTTGTG    A    T   AG ATACAA        T  TGTTTG T       GGTCAAAA   A     T T  A     AG        A     A               T               G          ACCCAC    AGAAATA   TG  CA  G GTAT AAA  GTA   T    T          TTT      TTTT  T  TGTTGATTT     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            C   A   TAAAC     C   AATAG                     .     .    T  AGTTAAA               .         .  AAAT      .  .    T  .     T      TAT    CC            .  .    TTTTAAGTTTTAA                          ACAT .   .   .        CACA .      .  TTTA      A       .                   T   . .     . T    AAGTCC       .            .       .       T      TT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     T               .               A          .         .         G   G   . T    .    AT    T    .          .        .     T  TTATAATT      
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .   T   ACAC      .   .                         .     .    .  G                     .         .  TC        .  .    T  .     A      CA     GG            .  .    TTTTAACTTCTAT                          .    .   .   .        .    .      .  AT        A       .                   .   . .     . T    TCT          .            .       .       G      TA         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     A               .               A          .         .         G   C   . .    .    .     T    .          .        .     T  TTTTTG        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                            .   A             .                             .     .    .  T                     .         .  GC        .  .    T  .     G      CA     CC            .  .    TTTTAACTTTTAA                          .    .   .   .        .    .      .  A         A       .                   .   . .     . T    TCA          .            .       .       G      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     G               .               A          .         .         G   A   . .    .    .     T    .          .        .     T  GTTTTG        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .     .    .  G                     .         .  C         .  .    T  .     A      CA     CC            .  .    TGGTATAG                               .    .   .   .        .    .      .  A         A       .                   .   . .     . A    ACA          .            .       .       G      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         T     G               .               A          .         .         G   A   . .    .    .     T    .          .        .     T  TTGGGC        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .     .    .  G                     .         .  T         .  .    T  .     A      CA     CC            .  .    TTGATCAA                               .    .   .   .        .    .      .  A         A       .                   .   . .     . T    TCA          .            .       .       G      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         C     A               .               G          .         .         G   C   . .    .    .     T    .          .        .     C  TGGGGG        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .     .    .  T                     .         .  T         .  .    T  .     A      CA     GT            .  .    CTTTTAA                                .    .   .   .        .    .      .  A         A       .                   .   . .     . G    CCA          .            .       .       A      AA         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     T               .               G          .         .         T   A   . .    .    .     C    .          .        .     T  ATGTTG        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .     .    .  G                     .         .  C         .  .    C  .     A      CG     CC            .  .    TCTTAAA                                .    .   .   .        .    .      .  A         G       .                   .   . .     . T    GTA          .            .       .       G      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         T     A               .               G          .         .         G   A   . .    .    .     T    .          .        .     G  TTGTTG        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .     .    .  G                     .         .  C         .  .    C  .     A      CA     CC            .  .    TTTTAA                                 .    .   .   .        .    .      .  G         A       .                   .   . .     . T    TTT          .            .       .       A      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         G     T               .               A          .         .         G   C   . .    .    .     T    .          .        .     T  TTGTCT        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                            .     .    .  G                     .         .  C         .  .    C  .     G      AG     TC            .  .    TTTTAA                                 .    .   .   .        .    .      .  A         A       .                   .   . .     . T    TCA          .            .       .       G      GT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     T               .               A          .         .         T   A   . .    .    .     T    .          .        .     T  TTGTT         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  G                     .         .  C         .  .    C  .     G      CA     TC            .  .    TTTTAA                                 .    .   .   .        .    .      .  A         A       .                   .   . .     . T    CCA          .            .       .       A      TT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     C               .               A          .         .         G   C   . .    .    .     T    .          .        .     T  TTTTA         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                          .                     .         .  T         .  .    A  .     A      CA     CC            .  .    TTTTAA                                 .    .   .   .        .    .      .  A         T       .                   .   . .     . T    TA           .            .       .       A      TA         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     T               .               G          .         .         A   T   . .    .    .     T    .          .        .     T  CGTTA         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .         .  .         .  .    C  .     A      TA     CC            .  .    TTTTAA                                 .    .   .   .        .    .      .  C         A       .                   .   . .     . G    TA           .            .       .       G      AA         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     T               .               G          .         .         T   C   . .    .    .     T    .          .        .     T  TTGTT         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .    .  .     G      A      T             .  .    TTG                                    .    .   .   .        .    .      .  A         A       .                   .   . .     . C    TC           .            .       .       G      TG         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         T     T               .               G          .         .         G   C   . .    .    .     T    .          .        .     T  GTTG          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .     A      .      .             .  .    TGA                                    .    .   .   .        .    .      .  C         .       .                   .   . .     . T    CA           .            .       .       A      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     A               .               T          .         .         G   C   . .    .    .     T    .          .        .     T  GTT           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .      .      .             .  .                                                .   .   .        .    .      .  .         .       .                   .   . .     . T    CA           .            .       .       T      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     T               .               A          .         .         C   C   . .    .    .     T    .          .        .     .  CT            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .       .                   .   . .     . G    CA           .            .       .       A      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         A     .               .               A          .         .         G   C   . .    .    .     T    .          .        .     .  TA            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .                   .   . .     . T    CA           .            .       .       .      AT         .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .     .         .                     .               A          .         .         G   C   . .    .    .     .    .          .        .     .  TG            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .       . .    C            .            .       .       .      T          .    .   .  .             .  .      .       .          .     . .  .                                                     G          .         .         .   C   . .    .    .     .    .          .        .     .  TT            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          . .    .            .            .       .       .      .          .    .   .  .             .  .      .       .                                                                           .          .         .         .   .   . .    .    .     .    .                                          
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Reference ( family-597 )      :                                                                                                                                                                                           NATTAGGCTGAAGAGACAATCCGTGCAAAATGTTTCACANAGTACACGT-GTT---AA-T-----A-CCTGACACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-CG---AACGTTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGCGGAAACAAT-----ACCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTATNAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--TTGT--TG----TTTTTGTCGTTCAG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-T-T-TT---TCA---GCCT-AAATGGTACATG--TGCTCT--TCATGCGTAAACATA-----ACCT-GTCT-GAG--G------TACAGGCA-TT------TTGTGTAACGGTCAAAATGT-TAAGC-A-AT-GGAAA--CATTTGTAAATTACAAGTATACCGTC-----AGTAAATAATCAGTTAATATCATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-G----G---TA---TGG-TATA-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG--GTTT--TG----TTTCTGTTGTTCAGtttcagcctaaatggtacatgtgctcttcatgcgtaaacataacctgtctgaggtacaggcattttgtgtaacggtcaaaatgttaagcaatggaaacatttgtaaattacaagtataccgtcagtaaataatcagttaatatcatttccctccatggacttggtatggtataatgacccttagaaatatgttggttttgtttctgttgttcagtatatacagagtgtactggttagccaaacatgactaaggtgactatattacacaggcgt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAC-ATAAAATAATCGGTCGATATTATCACACCCACCCTC-------TATTGAAA-TT-G----G----A---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATG----TGTTG--TTGT--T-----TTTTGGTCGTTCAGtgccgtttaacatattt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcataattatgtaaatataCGTTTAAAAGCA-AGT---------AT---------A-------T--T------------G-------CTTTGTGG----T-TGT--GA----CAGAT----T----ATT--AAGATTAA-CAACGTGT--CT-ATGTGAACCATTTTGCACA---A-A----TT-------------------T-AATCGGTGTACG--TGCATT--TCATGTGGAATCAAT-----ACCT-------------------------A-TT------T-GTGTAAC--------CG--CAAGG-A-AT-ttccttgcggttacacaaataggtattgattccacatgaaatgcacgtacaccgattaaatttgtgcaaaatggttcacatagacacgttgttaatcttaataatctgtcacaaccacaaagcaatatacttgcttttaaacgagctattttaacttttaacttttca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gcataattatgtaaatatactgaacgaccaaaaaacaacaacacatttctaagggtcataaaaccatccaatttcaatagagggtgggtgtgataatatcgaccgattattttatgtTTGTGA----C-TGT--GT----CAGAT----T----ATT--ATTT---A-GGACGTGT--CT-ATGTGAAACATACTGCACG---G-G----TT-T-A-TT---C-----GCCTTAACCGGTGCACG--TGCACT--TCACGTGAAATCAAA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TACATACA-TT------T-GTGTAAC--------CGT-TAATG-A-AT-GGAAA--T-CTTGCTCATAACAATCTTACCTATTTAC-AGTAAATA-------GATATTATTTC------CCTC-------CAT-GAAA-CC-G----G---TT---TGG-CTTT-ATG----TTATTTGAAACA----TG-----------TA----TATTTGTCGTTagctattttaacttttaacttttca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -----ACCT-GCCA-GAGAGG------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      gtTTAC---AAA-GTTACAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTACCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGT--CT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-A-----T-T-T-TT---TCACCTGCCA-GAGAGGTACAAG--TGgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaatcaaaacttgtaactttgtaaaacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtggttacacaaa----ATC--A------A--AACTTGTAACT-TTGTAAAACATTTTGCATG---G-A----TT-T-aacattttgcatggatttgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|17                         :                                                      gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaAATCCATGCAAAATGTTTTACAAAGTgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtggttacacaaacacttgtacctctctggcaggtgaaaaaatctgtgcacaatgtttcacacagacacataaattaatatgtgacctcacacaatcacaaaggtagaagttaaaatttgaaatggcttgtttaaatgttcaccaaagaaatcaaaacttgtaTAAT--------CTG-TAAAA-A-AT-AGAAA--CAATTAATAGTT----GTATACTGTCCTAC-AGTAAATAATCA----ATATTATTTC------CCTC-------CAT-GGAC-TT-GGTATG---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAA--A----TGCTT--TTGG--GC----TTTTTGTCACTCGGtgagtgtatggtgaggagcacacatttttagctctactggcca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                             cagaagttttcagcaAATCCATGCAAAATGTTTTATAAAGTtatattattcagattcatgtacatagactactggaataataaaaatagatcctatgctgccattttct
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                             tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaTTAT---AAA-GTTTTAA---------G------TTTTGA---------T-TT---C-----T--T--TGG-TG---AACATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AACTTCTATCTTTGTGA----T-TGT--GT----GAGGTCACAT----ATT--A------ATTTATGTGT--CT-GTGTGAAACATTGTGCACA---G-tttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttA-GAG--G------TACAAGTG-TT------T-GTGTAAC--------Cccagagaggtacaagtgtttgtgtaacc
gi|2                          :                                                                  tggccagtagagctaaaaatgtgtgctcttcaccatacactcaaatccatgcaaaatgttttataaagttttaagttttgatttctttggtgaacatttaaacaagccatttcaaattttaacttctatctttgtgattgtgtgaggtcacatattaatttatgtgtctgtgtgaaacattgtgcacagccagCACAA-CAC---AAA-GTTA-AA---------T------ACTTGA---------T-TTG--C-----A--T--TCA----------TTTAAG--CG-AGG-T-------ATTT-CA---AC-------T--T--TT-------AA-------CTGTGTGA----T-AGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAAATTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGTACGACGG-A----TT-T-G-TT---TCA---GCTT-AGTCGGTGCACGCGTGCACT--TTATGTAGAAACAAT-----ACCT-G-CA-GAG--G------------CA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-TAAGG-A-AT-ATAAA--CACTTGCTTATTGTTAGAAAATCGTCATAC-AGTAAATACTTGGTCGGTATTATTTC------CCTT-------CTT-TGAA-AT----------TA---TGG--TTT-ATGACTCTTA---GAATTA----TGTAGGATTGG--CA----TTTTCGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-T-T-TT---CCA---GCTT-TATTGGTGCATG--T-------TCA---GAAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TACAGGCA-TTTGTTTGT-GTGTAAC--------CAT-TATGGTATAT-GGAAA--CACTT----ATCATAAGTATACCATTCTAT---------ATCCGTCAATATTATTTC------CCTC-------C---------------------A---TGG-TTTT-ATGACCCTT--------------TGGGG--TT-T--TA-----TTTTGTCGTTCAGtaatgcacaggcatttgctcttgtttatgccatctaccatattctatttcaatttttaaaaaaaataaatttcttttaattatcagtgtatcaggatatgttttaaaacaaaatctgcaaataatgcttacgtatcggctgttgaagattattttttttaatttttcattccatctttgattaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  ACATAATCAT---AAA-GTTA-TA---------G------ACTTGG---------T-TT---C-----T--T--TCA-TG---AATATTTAAA--CA-AGC-TTTTTTGAATTT-TG---AT-------T--T--TT-------AA-------ATTTGTGA----T-TGT--GT----CAATT----T----ATT--A------A-TA---TGT--TT-GTGTAAAATAATTTGTATA---G-A----TT-T-T-TT---GTA---GC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtatgattttcagtttatattatactgaacgacaatt---AACATTTAAC--TATAAC-C-------ATAT-CACTAAAC------T--T--TT-------AA-------CTATTTAAACCTT-TGTATGT----TTTGT----A----GTT--G------G-CAGTGTGT--CT-GTGTGAATCATTTCGCATG---G-------C-T-T-TTAAGTCC---GTCT-GGTCGGTGCAGG--TGAACT--TCGTGTAGAGGTAGT-----GCCT-GTCA-GAG--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tAATAATTCGCCAATGTAATTAC------CTTC-------CAT-GGAA-TT-A----G---TAGTATGG-TTTT-ATGACTGTAA---GAATTA----TG------CGT--TA----TTTTTGTCGTTCAGa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaataatttgtatagattttttgtagctTCATTTT------CCTG-------CAT-GGAC-TC-G----G---TA---TGG-TTTT-ATGACCCTTA---GAAATA----TGTTG---TGT--TGATTTTTTTTGCCTTTCAGtatataattgaaaataat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttcaaacTAC-AGTAAA--GT-GGTCAATATTATTTT------CGTC-------TGT-TGAA-TT-G----G---TA---TAG-TTTTTATGACTCTTA---AAAAAA----TGTTT--TGGG--GG----TTTTTGTCGTTCAGtattgatgttacggtaataactgtacaaattatataaataaaata
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACGTAT--CT-ATGTGAAACATTGTGTACG---T-A----TT-T-T-AT---TTT---GCCT-TATCGGTGCATG--TGTACC--TT-T---GAA----------ACCT-GTCA-GAG--A------CACAGACA-Ttatatatatatatacctgttacgcatgac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-TT-G----G---TG---TAG-TTTT-ATGACTCTAA---GAAATA----TGTTG--TTGT--T-----TTTTTGTCGTTCAGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                CGCGCAAAATGTTTCACATAG-ACACGTTGTT---AA-TTAACAA-CCTGCCACAATCAC---AAA-ATTT-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---C-----G--T--TCG-TG---AACATTTAAA--AG-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TTAACTTTTAA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----AAGGC----T----ATT--A------A-CGACGTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGCACG---G-A----TT-G-T-TT---T-A---GCCT-AATCGGTGCACG--TGTGCA--TCATGC--------------ATTT-GT--------G------TA----------------------AC--------CTT-TAAGG-A-AA-GGAAA--CACTTGCTGATGATTAGAATACCGTCCTAC-AATATATAATCTGTCGTCATGTTTTC------CCGC-------CAT-GGTT-TTGG----G---TT---TAG-TTTT-ATGACCCTTA---GTAATA-----------------TG----TTTTTGTCGTTCAGtctacatccgacgtgaaaacgttgac
gi|3                          :                                                                                                                              gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactataATTAGGCTAAA---ACAATCCGTGCAAAATGTTTCACATAG-ACACGTCGTT---AA-T-----AGCCTTACACAATCAC---AAA-GTTA-AA---------AGTTAAAATTTGAAATGGCTCTT-TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---AAA--------------------T-CA---AG-------T--C--TT-------AAA------TTTTGTGA----T-TGT--GG----CAGGT----TGTTAATT--A------A-CAACGTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGCGC---------------------------------------GTGC--------ACT--TCATGCGGAAACATT--------------------G------TACAGGTA-TT------T-GTGTTAT--------CGT-TGAGG-A-AT-AGAAA--CA----CTAAATATTAGAGTACCGTCtgcacttcatgcggaaacattgtacaggtatttgtgttatcgttgaggaatagaaacactaaatattagagtaccgtc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gagaactggaagtaaggcgccgaaacatctgtaatacgaagattaagttattacaaactatactgaacgacaaaaacatattactaagggtcataaaactaaacccaaaaccatggcgggaaaacatgacgacagattatatattgtaggacggtattctaatcatcagcaagtgtttcctttccttaaaggttacacaaatgcatgatgcacacgtgcaccgT---TC----GCCA-AATAGTTGCACA--TGCACT--TCATACAGAAACATA-----ACCT-GTAA-GAG--G------TATTAACA-TT------T-G
gi|4                          :                                                                                                                                                                                           gATTAGGCTGAAGAG----TCCGTGCAAAATGTT--AAAAAATAAACGT-GTTGTTAA-T-----AACCTGCTACAAGCAT---AAAAGTTA-AAATTTGAAATG------ACTTG------------TTAAAT-----G--T--TCA-CG---AACG---------A-AAT-C-------ATCA-CG-------------------T-------GA-------CTTCATAA----A-TGC--GT----CAGAT----T----ATT--A------A-CTTCTTGT--CT-ATGTGAA-CATTTTGTACG---G-A----TT-T-G-TT----CA---ACCT-AATCGGAGCACA--TGCACT--TGATGCAGAAACAAA-----ACTT-GTCA-AAC--A------TAATGGCA-CT------T-TTGTAAC--------CGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTACCAGTAAACCGTCC-ACTAGTTAATAATTGGCCGATATCATTTC------CTTC-------CAT-AGAC-TT-G----G---TA---T
gi|5                          :                                                                                                                                              taagatttatttagtgattaaattaggtatgattgttttaccatagacaatgttgttcgccctatgatgttacgtgtatgtcagttgaagtgcacgtgtaccg-T-----A-CCCGACACAATCAC---GAA-GTTA-AA----------------AGTTAA---------T-TT---GAAATGG--C--TCG-CG---TACAT----------GGT-C-------A----CG---AA-------TGGT--AT-------AG---------TCATAAACATT-TGT--TT----CGGGT----T----ATT--C------C-CA-CTTGT--CTTATGTAATATATTGTGCACG---G-A----TT-T-C-TT----CA---GCCT-ACTCGGTGCTCG--TGGACT--TCATGCGGGCACGTG-----AACT--TCATGTG--GATACAATACAGGCATTT------T-GTGTAAG--------AAC-TAATT-A-AT-GGAAA--CGCTTGCTAATTATTAGTATACCGTCCTAC-AGTAAATAATCGGTCGATATCATTTC------CCTC-------CAT-TAAC-TT-A----GAAATA---TTA-TTTT-att
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    ACTATCACCTTAAA-CATA-AA---------G------ACTTGA---------T-TT---T-----G--T--TAG-CT---ATCATTTAAA--CA-AGC-C-------ATTT-CA---AA-------T--T--TT-------AA-------CTTTGTGA----T-TGT--GT----CAGGT----T----ATT--A------A-CAACGTGT--CT-ATGTGAAACATTTTGCATG---G-A----TT-T-T-TT---TCA---GCCT-AATCGGTGCACG--TGCACT--TCATGTGGAAACAAT-----GCCT-GTCA-GAG--G------TAAAGGCA-TT------T-GTGTTAC--------TGT-CAAGG-A-AT-GGAAA--CACTTGCTAATTGTTAGTATACCATTCTAC-AGTAAATATTCAGTCTATATTTTTTC------CCTC-------CAT-GAAC-TT-G----G---TA---TGC-TTTT-ATGACCTTTA---GAAATC----TGTTG--ATGT--TG----TTTTTGTCATTCAGggtcgttcagtatatagaagtgtctctaactttcttcaatttatttatgtttacttgtttctcgcatctacatgtcttctgaactataaacaatgaatttccctacattagca
gi|7                          :                                                                                                                                                                         aatcaagttaaaataaaattactatttactaaccaaatgtatacagtagtaacaatatatttctCAT-GCT---AAAT-----A-CCTGACACAAT--T---AAA-GCTG-AT---------G------ACTT------------------------G--T--TTG-AG---AAAGCTT-AC--CA-AA----------ATGT-CA---AA-------T--TGATC-------AA-------C
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatgT-GTGTCAGGTATTTAGCATG---A-A----TT-T-T-TT----CA---GCTT-AATCGGTGCATG--TGCA----TAACGCAGAAACAAT-----ACTT-GTCA-GAG--G------TACAGGAA-TC------T-GTGCAAC--------CAT-TAAGG-A-AT-GTTAA--CATTTGCTTATTATTAGTATACTGTTCTAC-ATTAATTTATTGGTCAATATTATTTC------CCTC-------CGT-GAAC-TT-G----G---TC---TGG--TTT-GTGACCCTCA---GAAATA----TA--G----GT--T-----TTTTTGTCATTCAGaattttttcagcttaatcggtgcatgtgcataacgcagaaacaatacttgtcagaggtacaggaatctgtgcaaccattaaggaatgttaacatttgcttattattagtatactgttctacattaatttattggtcaatattatttccctccgtgaacttggtctggtttgtgaccctcagaaatataggtttttttgtcattcagtaaatcggtaaaatagattaagtttctaaccagatggcaacgtacttgacatttttttcacatttatcgaccataaagaaatatcattaacttatattgatattgagaat
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Unaligned ( gi|29 ): TGAATAAAAACAATTTATTTTTGTCATTATTTTTGTTTTCAATACTTAATTGGCATGTACATTGAAAGTAGAAATCACA