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blockSeqs : . . . G AA GGTTAT . . GT TT . . . . . . . . . TATAATTGA . . . . . AT C .
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consensus : GATTTTGTTCGGTCTCATC----TGAACAATCCTCCAGT-------AACA-----CTCGGTNGTTTTC---GGTTATCTCCGAT-AACAAAAAGTCGCGAAGCTG-------ATCGGATGCACGGAAAATTCCGAACC--G----T--------------TACGT---------TATATATATA----CGTACTCCGTCTGCGACA--ACAGCGTCCACATAGGTTCAGATTCATT--------TCTTGTGGTTCTGTTGTA-----------------CTAG--------------GGAATGCT--AT-AGTAA---TACAGT--AT----TAT-------A-------ATTTATT--TAG-TTTTAAAATGCAA-----------CAAGG-------A--TATTAA--ATATAGTGCCTCAA-ATTTTTTTCGTACCTAGCCCGAAAAACAG-GTA
Reference ( family-5957 ) : GATTTTGTTCGGTCTCATC----TGAACAATCCTCCAGT-------AACA-----CTCGGTNGTTTTC---GGTTATCTCCGAT-AACAAAAAGTCGCGAAGCTG-------ATCGGATGCACGGAAAATTCCGAACC--G----T--------------TACGT---------TATATATATA----CGTACTCCGTCTGCGACA--ACAGCGTCCACATAGGTTCAGATTCATT--------TCTTGTGGTTCTGTTGTA-----------------CTAG--------------GGAATGCT--AT-AGTAA---TACAGT--AT----TAT-------A-------ATTTATT--TAG-TTTTAAAATGCAA-----------CAAGG-------A--TATTAA--ATATAGTGCCTCAA-ATTTTTTTCGTACCTAGCCCGAAAAACAG-GTA
gi|1 : ATTTTGTTCGGTCTCATC----TAAACAATACTCCAGT-------AGAA-----CTTATTAGTTTTC---GGTTATCTCCGAT-AACAAAAAGTCGCGAAGCCG-------ATCGGATGCACGGACAATTCCAAAAC--G----TAACTTATATAGATATATGTATATAAATATATACATATA----CGAACTCCGTCTGCTACA--A-AGCGTCCATATAGGTTCAGATTCATT--------TCTTGTGGTTCTGTTGTA-----------------CTAG--------------GGAATGCT--AT-AGTAA---TACAGT--AT-----------------------TTTA-----------TAAAATGCAT-----------CAACG-------C--TATTTA--ATATAGTGCCTCAA-CTTTTGTTCGTACTTTGTCCG-AAAACAG-
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gi|15 : ATTTTGTTAGGTCTCATC----TGAACAATCCTCCAGT-------AACA-----CTTGGTAATTT----------TCTCCGAT-ATCAAAAAGTCACGAAGCTG-------ATTGGATGCACGGgaggc
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gi|18 : ATTCTGTTTGGTCTCATC----TGAACAATCCTCCAGT-------AACA-----CTTGGTTATTTTC---GGTTATCTCCGAT-AACAAAAAGTCGTGAAGCTG-------ATTGGATGCACGGAA
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