lowQualScore                  :                                    
lowQualScore                  :                                    
lowQualScore                  :                                    
consensus                     : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
Reference ( gi|9 )            : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|8                          : ATGGCAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|6                          : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAACTCA
gi|2                          : ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|15                         : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|3                          : ATGACAAAAATGGCCTCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|7                          : ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTTA
gi|14                         : ATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|10                         : ATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTa
gi|5                          : ATGACAAAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|4                          : ATGACAAAAATGGCCGCATGTATTTGTAAAGCTaa
gi|12                         : ATGACATAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|11                         : ATGACAAAA-TGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|1                          : ATGATAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCTaaa
gi|13                         : aTGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|18                         :    ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|17                         :    ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|16                         :    ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|20                         :    ACAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCTCaa
gi|19                         :     CAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|22                         :     CAAAAATGGCTGTATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|21                         :     CAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCT

lowQualScore                  :                                     
lowQualScore                  :                                     
lowQualScore                  :                                     
consensus                     :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
Reference ( family-551 )      :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|1                          :  ATGATAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCT
gi|10                         : aATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|11                         :  ATGACAAAA-TGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|12                         :  ATGACATAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaaa
gi|13                         :   TGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|14                         :  ATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|15                         :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTa
gi|16                         :     ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|17                         :     ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|18                         :     ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|19                         :      CAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|2                          :  ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|20                         :     ACAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCTC
gi|21                         :      CAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|22                         :      CAAAAATGGCTGTATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|3                          :  ATGACAAAAATGGCCTCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|4                          :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATTTGTAAAGCT
gi|5                          :  ATGACAAAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|6                          :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAACTCAaa
gi|7                          :  ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTTA
gi|8                          :  ATGGCAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|9                          :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA




blockSeqCons                  :  
originalCons                  :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
finalCons                     :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA

lowQualScore                  :                                     
lowQualScore                  :                                     
lowQualScore                  :                                     
consensus                     :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
Reference ( family-551 )      :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|1                          :  ATGATAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCT
gi|10                         : aATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|11                         :  ATGACAAAA-TGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|12                         :  ATGACATAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaaa
gi|13                         :   TGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|14                         :  ATGACAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|15                         :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTa
gi|16                         :     ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|17                         :     ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|18                         :     ACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|19                         :      CAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|2                          :  ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|20                         :     ACAAAAATGGCCACATGTATCTGTAAAGCTC
gi|21                         :      CAAAAATGGCTGCATGTATCTGTAAAGCT
gi|22                         :      CAAAAATGGCTGTATGTATCTGTAAAGCTCAaa
gi|3                          :  ATGACAAAAATGGCCTCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|4                          :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATTTGTAAAGCT
gi|5                          :  ATGACAAAAATGGTCGCATGTATCTGTAAAGCTaa
gi|6                          :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAACTCAaa
gi|7                          :  ATGATAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTTA
gi|8                          :  ATGGCAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA
gi|9                          :  ATGACAAAAATGGCCGCATGTATCTGTAAAGCTCA