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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                               TTATTTATGATTATATT-ATCAAGTAATGTTATTTAA-TGTATTAAAA---TACT--GAGAATGAGCTTCAAATTATGAGCG----T-ATCAATCATAAATGTGTAATAAAGTATATCCTTGT---------------CAC------------C-------------------TC-G-T----T-TTTAT----TTGCATGTTTATAGTA----TTA----ATATTGCTTC----GTTTAATAGCAAAAGCTTCC---ATAC-TAAATT----T------GA--TAAC--G--TT--CAAGC-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGA-AAT---ATAA-AC----ATGAATGATATAAA-TTATTTGAAT-ACATTTGTTTT-TATGTCATTATATG---CTGAACAAA-TCAAAATAAAAGTGAAATTCGACTCAAGTACCGCTAGTATTACATATTTTTCAAATACGTTTATATCTCTATAATCGTTTTCTTGCG--TATCT-GGCGTTTTCAATCCTTAAGATATATGATTGTAAACG-TAGCCTAGCAAAAGCAATACAAATACGTCTTGTA
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gi|8                          : cagaatgaagttttgtctgatactaatgatgttatattgcagttactaaacatatatatatacaacagtatcttttgataaataacatataataaatatatgttgacagtgtgttatgaaacatatatacacaacttatgtttacatgtcatttatcaaaaatataacttaatatatataacagtattttatgcttgAAGTATGAGTT----T-ATCAAT-ATAAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGT---------------TAC------------TGGAAAAATATATATGTATATCTG-TTTTTT-TTTATTTTATTGCATGTTTATAGTA----TTA----GAAATGCTTT----GTCTAATAGCGAAAGCTTAC---ACAA-TAAATT----TACTTAAGA--TAAC--AATTT--TGAGT-TTATGCATT-GA-----T--T---GCgtatatattttaagatat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                 ----T-AACAATCATG--TGTATAA--AAATATGTCCTTAT---------------CTC------------CATACACAATA---------TCAG-TA---T-TTTAT----T-ACCTATTTAAACTA----TTA----GTAATGCATCCTACGTCTTATTTCAAAGGCTTCTGCAATGCATGTACT----T------GA--TTGC--A------CAAGT-CTATTTGAT-GGCTATAT--TAGAGCTAGATAATTAAATAT-ACTTGGATGAATGGTATAAAACTATC--AATGATGTTGGCTCT-TATGGCATTTCATGAATTTGA-CAAACTAAAAATAAAA-TGAAATTCGTTTTCTATATTACTAGAATTACATATTTGACAATTGCATTC---TCTCT---ATCGTGTTCTGGTG--TATATCAGC-TTTAC-GTCCTTTAGCTATGTGATGACAACCG-AAGCTTAGTAAATACAATACGAAGACGTGTTGTA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGCTTA----GTTCAATAGCAAAAGCTACC---ACAG-TAAATT----T------AC--TGCA--G--TTAGCAGGT-TTATTTGTT-GA-----T--T---GCaca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aAAT-ATATTT--TGG-TATGTCATTGTATG---CAGANNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATATTCATGTCTGTCTACTCATGTCCTTGTA--TATCT-GCCGGTTTCAATCATTACGCTATGTGGTGCCAACCG-TAGCCTCCCAAATGCAAAACGAAGACGTCTTGTAaacattg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tGCTAGAATTACATATTTTCC---T-CGT----------------GTTTTTTTGCGAATATCT---CAGATTCAATCCTTAAGTTCTGCGATTAC-AGCGATAGTCTAGCAAATGTAATctatttattttagataatttgcgtatccaaactgacatttaacttctttatataaaatctgtactatatttgctattaaggtcagccatccaaaactttagttaattcgtcaaccaaacgttgtctgaacaaaaacgaaaatgcgccgtgttacaatatataaaaccatatatacatataagtgttctgattagtattttttgatcaactatcaaatcagtcaatatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atgtgTATGCAATGATAACCG-CAGCCTAGCAACAGCAATACGAATGCGTCTTGTA
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): GTAGCCGTGCAAATGCAATAAAAAGACGCCTTGCACTATATATATTAAGATAACTTGCATAACCAAAATGAAATTTAACTTCTTTATATTAAATCAATACCCTATTGCTATTAAGGTCAGCAATCCAATGTTTAGTAAATTCGTCAGCAAAACGTTT
Unaligned ( gi|11 ): CATCAAACTTTGAATAAATTTGTCAACGAAACGTTGCCTGAATAAAGACAGAAATGCGTCTTGATTGTTCATATTTAACGACGCATTCCAGCTGTACATAAAACAATATGTGTTAACACATGTTTTATATTTGTCACAGAATTAA
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Reference ( family-5321 )     :                                                                            TTGTTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAAT---ACT--GAGGACGAACTTCAAAGTATG-----AGTGTA-TCAATCATAAATGTGTANTAAAATATTTCCTTGTCGCCAGA-AAAAAAA--AT---CT--GTA-----------TTTTAT----TTGCATGTTTATANTATTAGTAATGCTT------C----GTCTAATAGCAAAAGCTTCCACAATAAAT---------TT------GAT-AC-G--TT--CAAGT-TTATTTATT-GAC---GT--T---GCC--GAATA--TA--AA---------ACGAA-GGTATAAAACTATC--AAT-ATATTTG-CTNNTATGGCATTNTATG---CTGAACAAA-TNAAAATAAAACTGANATTCGTCTNCTATATCGCTAGAATTACGTATTTGAC-AA-T-ACGTTCATGTCT-----T-----TCGTGTTCTTGCG--TATCTGCCGGTTTCA-ATCCTTAAGCTATGCGATGACAACCGCAGCCTAGCAAATGCAATACGAAGACGTNTTGTA
gi|1                          :                                                                                 TATAACAGTATT--TTATGCTTG-TGTTATTTAAATGTATTAAACT---AAT--GAAGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTATA-TCAATCGTAAATGTGTATTAAAATATGTCCTAGTCGTCAGA-AAAAAAA--AT---CT--GTA-----------TTTTAA----TAGAA-GTTTATATTATAAGTAATGCTA------T----GTCTTATAGCAATAACTTCTTCAATAAAT---------TT-----------C-C--TT--CCA-----------T-GAC---G-------------GATA--TA---------------------TA-AAAACTATT--AAT-AAATGTATCTCGTATGGCATTATATG----TAAATAAA-TTAAAATAAA-CTAACATTCGTCTGTTATATCGCTAGAACTGCGTATTTGAC-AAAT-ACGTTCATGTCT------------------CTTGCG--TATCTGCCAGTTTCA-ATCCTAAAGCTATGCAATGACAACTGCAGCCTAACAAATGCAATACGAAAAGGTATTATA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                     TA-TTAATTATAAATGTGTATTCAAATATTTCTTTGTCTCCAGATAAAAAAAATAT---CG--ATG-----------TTTTA-----TTATATGTTTATATCATTG--------------------GTCTAATAGCAAAAGCTT-CACActatatatattaagataacttgcataaccaaaatgaaatttaacttctttatattaaatcaataccctattgctattaaggtcagcaatccaatgtttagtaaattcgtcagcaaaacgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGTGGCTAGAATTACATATTT-------T-CC--TCGTGTTT-----T-----T-------TTGCGAATATCT--CAGATTCA-ATCCTTAAGTTCTGCGATTACAGCGATAGTCTAGCAAATGTAAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGCTT------A----GTTCAATAGCAAAAGCTACCACAGTAAAT---------TT------ACT-GCAG--TTAGCAGGT-TTATTTGTT-GA-----T--T---GC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCTATGCAATGATAACCGCAGCCTAGCAACAGCAATACGAATGCGTCTTGTAaacattg
gi|17                         :                                                                               TTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTCTAAAAAT---ACT--GAGc
gi|2                          :                                                                                                                                                            -----AGTTTA-ACAATCAT----GTGTATAAAAATATGTCCTTATCTCCATA-CACAATA---T---CA--GTA-----------TTTTAT----T-ACCTATTTAAACTATTAGTAATGCAT------CCTACGTCTTATTTCAAAGGCTTCTGCAATGCATGTAC-----TT------GAT--T-G--CA--CAAGT-CTATTTGAT-GGCTATAT--TAGAGCT--AGATAATTA--AATATACTTGGATGAATGGTATAAAACTATC--AATGATGTTGG-CTCTTATGGCATTTCATGAATTTGA-CAAACTAAAAATAAAA-TGAAATTCGTTTTCTATATTACTAGAATTACATATTTGAC-AA-TTGCATTC-TCTCT-----A-----TCGTGTTCTGGTG--TATAT--CAGCTTTACGTCCTTTAGCTATGTGATGACAACCGAAGCTTAGTAAATACAATACGAAGACGTGTTGTAa
gi|3                          : ttaaatgtatatatatatatatatattagtgtattgattatacgctgctttaaacaaaaaaaatattgttgtaacTTATTTATGATTATATT-ATCAAG--TAATGTTATT-TAATGTATTAAAAT---ACT--GAGAATGAGCTTCAAATTATG-----AGCGTA-TCAATCATAAATGTGTAATAAAGTATATCCTTGTCACC--------------T---C---GT------------TTTTAT----TTGCATGTTTATAGTATTAATATTGCTT------C----GTTTAATAGCAAAAGCTTCCATACTAAAT---------TT------GATAAC-G--TT--CAAGC-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGAAATA--TA--AAC--------ATGAATGATAT-AAATTATTTGAAT-ACATTTG-TTTTTATGTCATTATATG---CTGAACAAA-TCAAAATAAAAGTGAAATTCGACTCAAGTACCGCTAGTATTACATATTTTTCAAA-T-ACGTTTATATCT-----CTATAATCGTTTTCTTGCG--TATCTGGCGTTTTCA-ATCCTTAAGATATATGATTGTAAACGTAGCCTAGCAAAAGCAATACAAATACGTCTTGTAttcaatatttaaagatgatttaagtattaaaactgag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --AAT-ATATTT---TGGTATGTCATTGTATG---CAGANNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN-T-ATATTCATGTCTGTCTAC-----TCATGTCCTTGTA--TATCTGCCGGTTTCA-ATCATTACGCTATGTGGTGCCAACCGTAGCCTCCCAAATGCAAAACGAAGACGTCTTGTA
gi|5                          :                                                                           tTTGTTAATGTTTATATTTATCA-G--TA-TCTTATT-AAATGTATTGAA--------------------TTCAA--TATG-----CATGTA-TTAATCATCAATGCGTATTAAAATAGTTCCTTGTCGTCAGA-AAAAAAAT-AT---CT--GTA-----------GTTTGT----TT-CATGCGTATATTACCACTTAT-CTTATATTAC----GTCTACTAGTAAAAACGTCCACAATGCATTGACATAAATT------AAC-AA-G--AT--CAAGCAGTGTTTACTAGGC---GTAAT---GCC--CGATG--TAAGAG---------ACAAA-GATATAActatttattttagataatttgcgtatccaaactgacatttaacttctttatataaaatctgtactatatttgctattaaggtcagccatccaaaactttagttaattcgtcaaccaaacgttgtctgaacaaaaacgaaaatgcgccgtgttacaatatataaaaccatatatacatataagtgttctgattagtattttttgatcaactatcaaatcagtcaatatat
gi|7                          :                                                                 cattcatttgaTTATTTGTAATTATATC-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAATGGTACT--GAGGACGAACCTCAAAGTATA-----AG-GTAATCAGT-ATAAATGTGTAATAAATTATTTTCTTTTGGATAGG-GAAAAAT--ATACATC--GCT-----------TTTTAG----T-GCATGTCTGTAGTATAAGCAATGCTT------C----GTCTAATAACAAAAGCGTCCACAATTAAT-------------------T-AC-----T--TAAGT-TTATTTATT-GA-----T--T---GC
gi|8                          :                                                                                                                                       tatatatcatacaaAAGTATG-----AGTTTA-TCAAT-ATAAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTTACTGGA-AAAATAT--AT---AT--GTATATCTGTTTTTTTTTATTTTATTGCATGTTTATAGTATTAGAAATGCTT------T----GTCTAATAGCGAAAGCTTACACAATAAAT---------TTACTTAAGATAAC-AATTT--TGAGT-TTATGCATT-GA-----T--T---GCaac
gi|9                          :                                                                                    GATTATACT-ATTAAG--TA-TGTTACT-TAATGTATCAAAAT---ACACAGAGGATGAATTT----GTATGTGCAAAAT-TA-TCAATCATTAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTCGCAAG--AAAAAAT--AT---CTCGGTA------------TTTAA----TTGCATGTTTGTAGTATTAATTATGCTC------C----GTCTAAAAGTAAAA-TTTCCACA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5321 )     :                                                                            TTATTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAAT---ACT--GAGGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTGTA-TCAATCATAAATGTGTANTAAAGTATTTCCTTGTCGCCAG---AAAAAAANAT---CT--GTA-----------TTTTAT----TTGCATGTTTATANTATTAGTAATGCTT------C----GTCTAATAGCAAAAGCTTCCACAATAAAT---------TT------GAT-A-C-G--TT--CAAGT-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGA--TA--TAA-ACAC--------GAATGATATAAAACTATT--AAT-ATATTTG-CTCGTATGNCATTATATG---CTGAACAAA-TNAAAATAAAANTGAAATTCGTCTNNTATATCGCTAGAATTACATATTTGACAA-T-ACGTTCATGTCT-----CT-----CGTGTTCTT--GCG--TATCTGCCGGTTTCA-ATCCTTAAGCTATGCGATGACAACCGTAGCCTAGCAAATGCAATACGAAGACGTCTTGTA
gi|1                          :                                                                             TATATATAACAGTATT--TTATGCTTG-TGTTATTTAAATGTATTAAACT---AAT--GAAGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTATA-TCAATCGTAAATGTGTATTAAAATATGTCCTAGTCGTCAG---AAAAAAAAAT---CT--GTA-----------TTTTAA----TAGAA-GTTTATATTATAAGTAATGCTA------T----GTCTTATAGCAATAACTTCTTCAATAAAT---------TT------------C-C--TT--CCA-----------T-GAC---G-----------GA--TA--TA--------------------TA-AAAACTATT--AAT-AAATGTATCTCGTATGGCATTATATG----TAAATAAA-TTAAAATAAA-CTAACATTCGTCTGTTATATCGCTAGAACTGCGTATTTGACAAAT-ACGTTCATGTCT-----CT-------------T--GCG--TATCTGCCAGTTTCA-ATCCTAAAGCTATGCAATGACAACTGCAGCCTAACAAATGCAATACGAAAAGGTATTATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagaatgaagttttgtctgatactaatgatgttatattgcagttactaaacatatatatatacaacagtatcttttgataaataacatataataaatatatgttgacagtgtgttatgaaacatatatacacaacttatgtttacatgtcatttatcaaaaatataacttaaGTAGCCGTGCAAATGCAATAAAAAGACGCCTTGCAgtatatattttaagatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                     TA-TTAATTATAAATGTGTATTCAAATATTTCTTTGTCTCCAGATAAAAAAAATAT---CG--ATG-----------TTTTA-----TTATATGTTTATATCATTG--------------------GTCTAATAGCAAAAGCTT-CACActatatatattaagataacttgcataaccaaaatgaaatttaacttctttatattaaatcaataccctattgctattaaggtcagcaatccaatgtttagtaaattcgtcagcaaaacgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGTGGCTAGAATTACATATTT-----------------TC------CT-----CGTGTTTTTTTGCGAATATCT--CAGATTCA-ATCCTTAAGTTCTGCGATTACAGCGATAGTCTAGCAAATGTAAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGCTT------A----GTTCAATAGCAAAAGCTACCACAGTAAAT---------TT------ACT-G-CAG--TTAGCAGGT-TTATTTGTT-GA-----T--T---GC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCTATGCAATGATAACCGCAGCCTAGCAACAGCAATACGAATGCGTCTTGTAaacattg
gi|17                         :                                                                               TTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTCTAAAAAT---ACT--GAGc
gi|2                          :                                                                                                                                                            -----AGTTTA-ACAATCAT----GTGTATAAAAATATGTCCTTATCTCCAT---ACACAA-TAT---CA--GTA-----------TTTTAT----T-ACCTATTTAAACTATTAGTAATGCAT------CCTACGTCTTATTTCAAAGGCTTCTGCAATGCATGTAC-----TT------GAT---T-G--CA--CAAGT-CTATTTGAT-GGCTATAT--TAGAGCTAGA--TAATTAA-ATATACTTGGATGAATGGTATAAAACTATC--AATGATGTTGG-CTCTTATGGCATTTCATGAATTTGA-CAAACTAAAAATAAAA-TGAAATTCGTTTTCTATATTACTAGAATTACATATTTGACAA-TTGCATTC-TCTCT-----AT-----CGTGTTCTG--GTG--TATAT--CAGCTTTACGTCCTTTAGCTATGTGATGACAACCGAAGCTTAGTAAATACAATACGAAGACGTGTTGTAa
gi|3                          : ttaaatgtatatatatatatatatattagtgtattgattatacgctgctttaaacaaaaaaaatattgttgtaacTTATTTATGATTATATT-ATCAAG--TAATGTTATT-TAATGTATTAAAAT---ACT--GAGAATGAGCTTCAAATTATG-----AGCGTA-TCAATCATAAATGTGTAATAAAGTATATCCTTGTCACC--------------T---C---GT------------TTTTAT----TTGCATGTTTATAGTATTAATATTGCTT------C----GTTTAATAGCAAAAGCTTCCATACTAAAT---------TT------GAT-AAC-G--TT--CAAGC-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGAAATA--TAA-ACAT--------GAATGATATAAA-TTATTTGAAT-ACATTTG-TTTTTATGTCATTATATG---CTGAACAAA-TCAAAATAAAAGTGAAATTCGACTCAAGTACCGCTAGTATTACATATTTTTCAAAT-ACGTTTATATCT-----CTATAATCGTTTTCTT--GCG--TATCTGGCGTTTTCA-ATCCTTAAGATATATGATTGTAAACGTAGCCTAGCAAAAGCAATACAAATACGTCTTGTAttcaatatttaaagatgatttaagtattaaaactgag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--AAT-ATATTT---TGGTATGTCATTGTATG---CAGANNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-T-ATATTCATGTCTGTCTACT-----CATGTCCTT--GTA--TATCTGCCGGTTTCA-ATCATTACGCTATGTGGTGCCAACCGTAGCCTCCCAAATGCAAAACGAAGACGTCTTGTA
gi|5                          :                                                                            TTGTTAATGTTTATATTTATCA-G--TA-TCTTATT-AAATGTATTGAA--------------------TTCAA--TATG-----CATGTA-TTAATCATCAATGCGTATTAAAATAGTTCCTTGTCGTCAGA--AAAAAAATAT---CT--GTA-----------GTTTGT----TT-CATGCGTATATTACCACTTAT-CTTATATTAC----GTCTACTAGTAAAAACGTCCACAATGCATTGACATAAATT------AAC-A-A-G--AT--CAAGCAGTGTTTACTAGGC---GTAAT---GCCCGA--TG--TAAGAGAC--------AAA-GATATAActatttattttagataatttgcgtatccaaactgacatttaacttctttatataaaatctgtactatatttgctattaaggtcagccatccaaaactttagttaattcgtcaaccaaacgttgtctgaacaaaaacgaaaatgcgccgtgttacaatatataaaaccatatatacatataagtgttctgattagtattttttgatcaactatcaaatcagtcaatatat
gi|7                          :                                                                 cattcatttgaTTATTTGTAATTATATC-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAATGGTACT--GAGGACGAACCTCAAAGTATA-----AG-GTAATCAGT-ATAAATGTGTAATAAATTATTTTCTTTTGGATAG---GGAAAAATATACATC--GCT-----------TTTTAG----T-GCATGTCTGTAGTATAAGCAATGCTT------C----GTCTAATAACAAAAGCGTCCACAATTAAT-------------------T-A-C-----T--TAAGT-TTATTTATT-GA-----T--T---GC
gi|8                          :                                                                                                                                       tatatatcatacaaAAGTATG-----AGTTTA-TCAAT-ATAAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTTACTGG---AAAAATATAT---AT--GTATATCTGTTTTTTTTTATTTTATTGCATGTTTATAGTATTAGAAATGCTT------T----GTCTAATAGCGAAAGCTTACACAATAAAT---------TTACTTAAGATAA-C-AATTT--TGAGT-TTATGCATT-GA-----T--T---GCaac
gi|9                          :                                                                                    GATTATACT-ATTAAG--TA-TGTTACT-TAATGTATCAAAAT---ACACAGAGGATGAATTT----GTATGTGCAAAAT-TA-TCAATCATTAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTCGCAAG----AAAAAATAT---CTCGGTA------------TTTAA----TTGCATGTTTGTAGTATTAATTATGCTC------C----GTCTAAAAGTAAAA-TTTCCACA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5321 )     :                                                                            TTATTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAAT---ACT--GAGGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTGTA-TCAATCATAAATGTGTANTAAAGTATTTCCTTGTCGCCAG---AAAAAAATAT---CT--GTAT-----------TTTATTT----GCATGTTTATANTATTAGTAATGCTT------C----GTCTAATAGCAAAAGCTTCCACAATAAAT---------TT------GAT-A-C-G--TT--CAAGT-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGA--TA--TAA-ANAC--------GAATGATATAAAACTATT--AAT-ATATTTG-CTCGTATGNCATTATATG---CTGAACAAA-TNAAAATAAAANTGAAATTCGTCTNNTATATCGCTAGAATTACATATTTGACAAATACGTTCATGTCT-----C-----TCGTGTTCTT--GCG--TATCTGCCGGTTTCA-ATCCTTAAGCTATGCGATGACAACCGTAGCCTAGCAAATGCAATACGAAGACGTCTTGTA
gi|1                          :                                                                             TATATATAACAGTATT--TTATGCTTG-TGTTATTTAAATGTATTAAACT---AAT--GAAGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTATA-TCAATCGTAAATGTGTATTAAAATATGTCCTAGTCGTCAG---AAAAAAAAAT---CT--GTAT-----------TTTAATA----GAA-GTTTATATTATAAGTAATGCTA------T----GTCTTATAGCAATAACTTCTTCAATAAAT---------TT------------C-C--TT--CCA-----------T-GAC---G-----------GA--TA--TA--------------------TA-AAAACTATT--AAT-AAATGTATCTCGTATGGCATTATATG----TAAATAAA-TTAAAATAAA-CTAACATTCGTCTGTTATATCGCTAGAACTGCGTATTTGACAAATACGTTCATGTCT-----C-----T--------T--GCG--TATCTGCCAGTTTCA-ATCCTAAAGCTATGCAATGACAACTGCAGCCTAACAAATGCAATACGAAAAGGTATTATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagaatgaagttttgtctgatactaatgatgttatattgcagttactaaacatatatatatacaacagtatcttttgataaataacatataataaatatatgttgacagtgtgttatgaaacatatatacacaacttatgtttacatgtcatttatcaaaaatataacttaaGTAGCCGTGCAAATGCAATAAAAAGACGCCTTGCAgtatatattttaagatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                     TA-TTAATTATAAATGTGTATTCAAATATTTCTTTGTCTCCAGATAAAAAAAATAT---CG--ATGT-----------TTTA-TT----ATATGTTTATATCATTG--------------------GTCTAATAGCAAAAGCTT-CACActatatatattaagataacttgcataaccaaaatgaaatttaacttctttatattaaatcaataccctattgctattaaggtcagcaatccaatgtttagtaaattcgtcagcaaaacgttt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGCTT------A----GTTCAATAGCAAAAGCTACCACAGTAAAT---------TT------ACT-G-CAG--TTAGCAGGT-TTATTTGTT-GA-----T--T---GC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCTATGCAATGATAACCGCAGCCTAGCAACAGCAATACGAATGCGTCTTGTAaacattg
gi|17                         :                                                                               TTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTCTAAAAAT---ACT--GAGc
gi|2                          :                                                                                                                                                            -----AGTTTA-ACAATCAT----GTGTATAAAAATATGTCCTTATCTCCAT---ACACAA-TAT---CA--GTAT-----------TTTATT-----ACCTATTTAAACTATTAGTAATGCAT------CCTACGTCTTATTTCAAAGGCTTCTGCAATGCATGTAC-----TT------GAT---T-G--CA--CAAGT-CTATTTGAT-GGCTATAT--TAGAGCTAGA--TAATTAA-ATATACTTGGATGAATGGTATAAAACTATC--AATGATGTTGG-CTCTTATGGCATTTCATGAATTTGA-CAAACTAAAAATAAAA-TGAAATTCGTTTTCTATATTACTAGAATTACATATTTGACAATTGCATTC-TCTCT-----A-----TCGTGTTCTG--GTG--TATAT--CAGCTTTACGTCCTTTAGCTATGTGATGACAACCGAAGCTTAGTAAATACAATACGAAGACGTGTTGTAa
gi|3                          : ttaaatgtatatatatatatatatattagtgtattgattatacgctgctttaaacaaaaaaaatattgttgtaacTTATTTATGATTATATT-ATCAAG--TAATGTTATT-TAATGTATTAAAAT---ACT--GAGAATGAGCTTCAAATTATG-----AGCGTA-TCAATCATAAATGTGTAATAAAGTATATCCTTGTCACC--------------T---C---GT-T-----------TTTATTT----GCATGTTTATAGTATTAATATTGCTT------C----GTTTAATAGCAAAAGCTTCCATACTAAAT---------TT------GAT-AAC-G--TT--CAAGC-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGAAATA--TAA-ACAT--------GAATGATATAAA-TTATTTGAAT-ACATTTG-TTTTTATGTCATTATATG---CTGAACAAA-TCAAAATAAAAGTGAAATTCGACTCAAGTACCGCTAGTATTACATATTTTTCAAATACGTTTATATCT-----CTATAATCGTTTTCTT--GCG--TATCTGGCGTTTTCA-ATCCTTAAGATATATGATTGTAAACGTAGCCTAGCAAAAGCAATACAAATACGTCTTGTAttcaatatttaaagatgatttaagtattaaaactgag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--AAT-ATATTT---TGGTATGTCATTGTATG---CAGANNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATATTCATGTCTGTCTAC-----TCATGTCCTT--GTA--TATCTGCCGGTTTCA-ATCATTACGCTATGTGGTGCCAACCGTAGCCTCCCAAATGCAAAACGAAGACGTCTTGTA
gi|5                          :                                                                            TTGTTAATGTTTATATTTATCA-G--TA-TCTTATT-AAATGTATTGAA--------------------TTCAA--TATG-----CATGTA-TTAATCATCAATGCGTATTAAAATAGTTCCTTGTCGTCAGA--AAAAAAATAT---CT--GTAG-----------TTTGTTT-----CATGCGTATATTACCACTTAT-CTTATATTAC----GTCTACTAGTAAAAACGTCCACAATGCATTGACATAAATT------AAC-A-A-G--AT--CAAGCAGTGTTTACTAGGC---GTAAT---GCCCGA--TG--TAAGAGAC--------AAA-GATATAActatttattttagataatttgcgtatccaaactgacatttaacttctttatataaaatctgtactatatttgctattaaggtcagccatccaaaactttagttaattcgtcaaccaaacgttgtctgaacaaaaacgaaaatgcgccgtgttacaatatataaaaccatatatacatataagtgttctgattagtattttttgatcaactatcaaatcagtcaatatat
gi|7                          :                                                                 cattcatttgaTTATTTGTAATTATATC-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAATGGTACT--GAGGACGAACCTCAAAGTATA-----AG-GTAATCAGT-ATAAATGTGTAATAAATTATTTTCTTTTGGATAG---GGAAAAATATACATC--GCTT-----------TTTAGT-----GCATGTCTGTAGTATAAGCAATGCTT------C----GTCTAATAACAAAAGCGTCCACAATTAAT-------------------T-A-C-----T--TAAGT-TTATTTATT-GA-----T--T---GC
gi|8                          :                                                                                                                                       tatatatcatacaaAAGTATG-----AGTTTA-TCAAT-ATAAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTTACTGG---AAAAATATAT---AT--GTATATCTGTTTTTTTTTATTTTATTGCATGTTTATAGTATTAGAAATGCTT------T----GTCTAATAGCGAAAGCTTACACAATAAAT---------TTACTTAAGATAA-C-AATTT--TGAGT-TTATGCATT-GA-----T--T---GCaac
gi|9                          :                                                                                    GATTATACT-ATTAAG--TA-TGTTACT-TAATGTATCAAAAT---ACACAGAGGATGAATTT----GTATGTGCAAAAT-TA-TCAATCATTAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTCGCAAG----AAAAAATAT---CTCGGTA------------TTTAATT----GCATGTTTGTAGTATTAATTATGCTC------C----GTCTAAAAGTAAAA-TTTCCACA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5321 )     :                                                                            TTATTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAAT---ACT--GAGGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTGTA-TCAATCATAAATGTGTANTAAAGTATTTCCTTGTCGCCAG---AAAAAAATAT---CT--GTAT-----------TTTATTT----GCATGTTTATANTATTAGTAATGCTT------C----GTCTAATAGCAAAAGCTTCCACAATAAAT---------TT------GAT-A-C-G--TT--CAAGT-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGA--TA--TAA-ANAC--------GAATGATATAAAACTATT--AAT-ATATTTG-CTCGTATGNCATTATATG---CTGAACAAA-TNAAAATAAAANTGAAATTCGTCTNNTATATCGCTAGAATTACATATTTGACAAATACGTTCATGTCT-----C-----TCGTGTTCTT--GCG--TATCTGCCGGTTTCA-ATCCTTAAGCTATGCGATGACAACCGTAGCCTAGCAAATGCAATACGAAGACGTCTTGTA
gi|1                          :                                                                             TATATATAACAGTATT--TTATGCTTG-TGTTATTTAAATGTATTAAACT---AAT--GAAGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTATA-TCAATCGTAAATGTGTATTAAAATATGTCCTAGTCGTCAG---AAAAAAAAAT---CT--GTAT-----------TTTAATA----GAA-GTTTATATTATAAGTAATGCTA------T----GTCTTATAGCAATAACTTCTTCAATAAAT---------TT------------C-C--TT--CCA-----------T-GAC---G-----------GA--TA--TA--------------------TA-AAAACTATT--AAT-AAATGTATCTCGTATGGCATTATATG----TAAATAAA-TTAAAATAAA-CTAACATTCGTCTGTTATATCGCTAGAACTGCGTATTTGACAAATACGTTCATGTCT-----C-----T--------T--GCG--TATCTGCCAGTTTCA-ATCCTAAAGCTATGCAATGACAACTGCAGCCTAACAAATGCAATACGAAAAGGTATTATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagaatgaagttttgtctgatactaatgatgttatattgcagttactaaacatatatatatacaacagtatcttttgataaataacatataataaatatatgttgacagtgtgttatgaaacatatatacacaacttatgtttacatgtcatttatcaaaaatataacttaaGTAGCCGTGCAAATGCAATAAAAAGACGCCTTGCAgtatatattttaagatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                     TA-TTAATTATAAATGTGTATTCAAATATTTCTTTGTCTCCAGATAAAAAAAATAT---CG--ATGT-----------TTTA-TT----ATATGTTTATATCATTG--------------------GTCTAATAGCAAAAGCTT-CACActatatatattaagataacttgcataaccaaaatgaaatttaacttctttatattaaatcaataccctattgctattaaggtcagcaatccaatgtttagtaaattcgtcagcaaaacgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGTGGCTAGAATTACATATTT----------------TC------C-----TCGTGTTTTTTTGCGAATATCT--CAGATTCA-ATCCTTAAGTTCTGCGATTACAGCGATAGTCTAGCAAATGTAAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGCTT------A----GTTCAATAGCAAAAGCTACCACAGTAAAT---------TT------ACT-G-CAG--TTAGCAGGT-TTATTTGTT-GA-----T--T---GC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCTATGCAATGATAACCGCAGCCTAGCAACAGCAATACGAATGCGTCTTGTAaacattg
gi|17                         :                                                                               TTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTCTAAAAAT---ACT--GAGc
gi|2                          :                                                                                                                                                            -----AGTTTA-ACAATCAT----GTGTATAAAAATATGTCCTTATCTCCAT---ACACAA-TAT---CA--GTAT-----------TTTATT-----ACCTATTTAAACTATTAGTAATGCAT------CCTACGTCTTATTTCAAAGGCTTCTGCAATGCATGTAC-----TT------GAT---T-G--CA--CAAGT-CTATTTGAT-GGCTATAT--TAGAGCTAGA--TAATTAA-ATATACTTGGATGAATGGTATAAAACTATC--AATGATGTTGG-CTCTTATGGCATTTCATGAATTTGA-CAAACTAAAAATAAAA-TGAAATTCGTTTTCTATATTACTAGAATTACATATTTGACAATTGCATTC-TCTCT-----A-----TCGTGTTCTG--GTG--TATAT--CAGCTTTACGTCCTTTAGCTATGTGATGACAACCGAAGCTTAGTAAATACAATACGAAGACGTGTTGTAa
gi|3                          : ttaaatgtatatatatatatatatattagtgtattgattatacgctgctttaaacaaaaaaaatattgttgtaacTTATTTATGATTATATT-ATCAAG--TAATGTTATT-TAATGTATTAAAAT---ACT--GAGAATGAGCTTCAAATTATG-----AGCGTA-TCAATCATAAATGTGTAATAAAGTATATCCTTGTCACC--------------T---C---GT-T-----------TTTATTT----GCATGTTTATAGTATTAATATTGCTT------C----GTTTAATAGCAAAAGCTTCCATACTAAAT---------TT------GAT-AAC-G--TT--CAAGC-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGAAATA--TAA-ACAT--------GAATGATATAAA-TTATTTGAAT-ACATTTG-TTTTTATGTCATTATATG---CTGAACAAA-TCAAAATAAAAGTGAAATTCGACTCAAGTACCGCTAGTATTACATATTTTTCAAATACGTTTATATCT-----CTATAATCGTTTTCTT--GCG--TATCTGGCGTTTTCA-ATCCTTAAGATATATGATTGTAAACGTAGCCTAGCAAAAGCAATACAAATACGTCTTGTAttcaatatttaaagatgatttaagtattaaaactgag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--AAT-ATATTT---TGGTATGTCATTGTATG---CAGANNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATATTCATGTCTGTCTAC-----TCATGTCCTT--GTA--TATCTGCCGGTTTCA-ATCATTACGCTATGTGGTGCCAACCGTAGCCTCCCAAATGCAAAACGAAGACGTCTTGTA
gi|5                          :                                                                            TTGTTAATGTTTATATTTATCA-G--TA-TCTTATT-AAATGTATTGAA--------------------TTCAA--TATG-----CATGTA-TTAATCATCAATGCGTATTAAAATAGTTCCTTGTCGTCAGA--AAAAAAATAT---CT--GTAG-----------TTTGTTT-----CATGCGTATATTACCACTTAT-CTTATATTAC----GTCTACTAGTAAAAACGTCCACAATGCATTGACATAAATT------AAC-A-A-G--AT--CAAGCAGTGTTTACTAGGC---GTAAT---GCCCGA--TG--TAAGAGAC--------AAA-GATATAActatttattttagataatttgcgtatccaaactgacatttaacttctttatataaaatctgtactatatttgctattaaggtcagccatccaaaactttagttaattcgtcaaccaaacgttgtctgaacaaaaacgaaaatgcgccgtgttacaatatataaaaccatatatacatataagtgttctgattagtattttttgatcaactatcaaatcagtcaatatat
gi|7                          :                                                                 cattcatttgaTTATTTGTAATTATATC-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAATGGTACT--GAGGACGAACCTCAAAGTATA-----AG-GTAATCAGT-ATAAATGTGTAATAAATTATTTTCTTTTGGATAG---GGAAAAATATACATC--GCTT-----------TTTAGT-----GCATGTCTGTAGTATAAGCAATGCTT------C----GTCTAATAACAAAAGCGTCCACAATTAAT-------------------T-A-C-----T--TAAGT-TTATTTATT-GA-----T--T---GC
gi|8                          :                                                                                                                                       tatatatcatacaaAAGTATG-----AGTTTA-TCAAT-ATAAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTTACTGG---AAAAATATAT---AT--GTATATCTGTTTTTTTTTATTTTATTGCATGTTTATAGTATTAGAAATGCTT------T----GTCTAATAGCGAAAGCTTACACAATAAAT---------TTACTTAAGATAA-C-AATTT--TGAGT-TTATGCATT-GA-----T--T---GCaac
gi|9                          :                                                                                    GATTATACT-ATTAAG--TA-TGTTACT-TAATGTATCAAAAT---ACACAGAGGATGAATTT----GTATGTGCAAAAT-TA-TCAATCATTAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTCGCAAG----AAAAAATAT---CTCGGTA------------TTTAATT----GCATGTTTGTAGTATTAATTATGCTC------C----GTCTAAAAGTAAAA-TTTCCACA


blockSeqs                     :                                                                                             T    A .   A       .            A GGTACT                 A     TGCAA  TT  A     T  A        T    A                 ATAA         ATGTATATCTGTTTTTT         T TTATTG          T     G        ATATTAC                                 GTACTTGATTGCACAAGTCTATTTGATGGCTATATTAGAGCTAGATAATTAAATATACTTGGATGAAT                              T   A     TG   G T    GC  CT    G    T    AATT   A    C A        AG            TC                       GACAAT   A   A C  TCTATAA               TT   AA     GG        C                                                 G
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blockSeqs                     :                                                                                             .    A .   .       .            A ACT                    A     .      TG  .     C  C        A    G                 A            CTCGGTA                   T TG              G     C        A                                       TTGATAACGTTCAAGCTTATTTGTTGACGTTGCTAGAAATATAAACATGAAT                                              T         .    . T    .   GG    T    G    C      .    . N        A             NN                       NNNNN    A   . G  TA                    .    .      .         .                                                 G
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5321 )     :                                                                            TTATTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAAT---ACT--GAGGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTGTA-TCAATCATAAATGTGTANTAAAGTATTTCCTTGTCGCCAG---AAAAAAATAT---CT--GTAT-----------TTTATTT----GCATGTTTATANTATTAGTAATGCTT------C----GTCTAATAGCAAAAGCTTCCACAATAAAT---------TT------GAT-A-C-G--TT--CAAGT-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGA--TA--TAA-ANAC--------GAATGATATAAAACTATT--AAT-ATATTTG-CTCGTATGNCATTATATG---CTGAACAAA-TNAAAATAAAANTGAAATTCGTCTNNTATATCGCTAGAATTACATATTTGACAAATACGTTCATGTCT------TCGTGTTCTT--GCG--TATCT-GC-GGTTTCA-ATCCTTAAGCTATGCGATGACAACCGTAGCCTAGCAAATGCAATACGAAGACGTCTTGTA
gi|1                          :                                                                             TATATATAACAGTATT--TTATGCTTG-TGTTATTTAAATGTATTAAACT---AAT--GAAGATGAACTTCAAAGTATG-----AGTATA-TCAATCGTAAATGTGTATTAAAATATGTCCTAGTCGTCAG---AAAAAAAAAT---CT--GTAT-----------TTTAATA----GAA-GTTTATATTATAAGTAATGCTA------T----GTCTTATAGCAATAACTTCTTCAATAAAT---------TT------------C-C--TT--CCA-----------T-GAC---G-----------GA--TA--TA--------------------TA-AAAACTATT--AAT-AAATGTATCTCGTATGGCATTATATG----TAAATAAA-TTAAAATAAA-CTAACATTCGTCTGTTATATCGCTAGAACTGCGTATTTGACAAATACGTTCATGTCT-------------CTT--GCG--TATCT-GCCAGTTTCA-ATCCTAAAGCTATGCAATGACAACTGCAGCCTAACAAATGCAATACGAAAAGGTATTATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cagaatgaagttttgtctgatactaatgatgttatattgcagttactaaacatatatatatacaacagtatcttttgataaataacatataataaatatatgttgacagtgtgttatgaaacatatatacacaacttatgtttacatgtcatttatcaaaaatataacttaaGTAGCCGTGCAAATGCAATAAAAAGACGCCTTGCAgtatatattttaagatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                     TA-TTAATTATAAATGTGTATTCAAATATTTCTTTGTCTCCAGATAAAAAAAATAT---CG--ATGT-----------TTTA-TT----ATATGTTTATATCATTG--------------------GTCTAATAGCAAAAGCTT-CACActatatatattaagataacttgcataaccaaaatgaaatttaacttctttatattaaatcaataccctattgctattaaggtcagcaatccaatgtttagtaaattcgtcagcaaaacgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGTGGCTAGAATTACATATTT----------------TCC------TCGTGTTTTTTTGCGAATATCT--C-AGATTCA-ATCCTTAAGTTCTGCGATTACAGCGATAGTCTAGCAAATGTAAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCTATGCAATGATAACCGCAGCCTAGCAACAGCAATACGAATGCGTCTTGTAaacattg
gi|17                         :                                                                               TTTATGATTATATT-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTCTAAAAAT---ACT--GAGc
gi|2                          :                                                                                                                                                            -----AGTTTA-ACAATCAT----GTGTATAAAAATATGTCCTTATCTCCAT---ACACAA-TAT---CA--GTAT-----------TTTATT-----ACCTATTTAAACTATTAGTAATGCAT------CCTACGTCTTATTTCAAAGGCTTCTGCAATGCATGTAC-----TT------GAT---T-G--CA--CAAGT-CTATTTGAT-GGCTATAT--TAGAGCTAGA--TAATTAA-ATATACTTGGATGAATGGTATAAAACTATC--AATGATGTTGG-CTCTTATGGCATTTCATGAATTTGA-CAAACTAAAAATAAAA-TGAAATTCGTTTTCTATATTACTAGAATTACATATTTGACAATTGCATTC-TCTCTA-----TCGTGTTCTG--GTG--TATAT--C-AGCTTTACGTCCTTTAGCTATGTGATGACAACCGAAGCTTAGTAAATACAATACGAAGACGTGTTGTAa
gi|3                          : ttaaatgtatatatatatatatatattagtgtattgattatacgctgctttaaacaaaaaaaatattgttgtaacTTATTTATGATTATATT-ATCAAG--TAATGTTATT-TAATGTATTAAAAT---ACT--GAGAATGAGCTTCAAATTATG-----AGCGTA-TCAATCATAAATGTGTAATAAAGTATATCCTTGTCACC--------------T---C---GT-T-----------TTTATTT----GCATGTTTATAGTATTAATATTGCTT------C----GTTTAATAGCAAAAGCTTCCATACTAAAT---------TT------GAT-AAC-G--TT--CAAGC-TTATTTGTT-GAC---GT--T---GCTAGAAATA--TAA-ACAT--------GAATGATATAAA-TTATTTGAAT-ACATTTG-TTTTTATGTCATTATATG---CTGAACAAA-TCAAAATAAAAGTGAAATTCGACTCAAGTACCGCTAGTATTACATATTTTTCAAATACGTTTATATCTCTATAATCGTTTTCTT--GCG--TATCTGGC-GTTTTCA-ATCCTTAAGATATATGATTGTAAACGTAGCCTAGCAAAAGCAATACAAATACGTCTTGTAttcaatatttaaagatgatttaagtattaaaactgag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--AAT-ATATTT---TGGTATGTCATTGTATG---CAGANNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TATATTCATGTCTGTCTACTCATGTCCTT--GTA--TATCT-GCCGGTTTCA-ATCATTACGCTATGTGGTGCCAACCGTAGCCTCCCAAATGCAAAACGAAGACGTCTTGTA
gi|5                          :                                                                            TTGTTAATGTTTATATTTATCA-G--TA-TCTTATT-AAATGTATTGAA--------------------TTCAA--TATG-----CATGTA-TTAATCATCAATGCGTATTAAAATAGTTCCTTGTCGTCAGA--AAAAAAATAT---CT--GTAG-----------TTTGTTT-----CATGCGTATATTACCACTTAT-CTTATATTAC----GTCTACTAGTAAAAACGTCCACAATGCATTGACATAAATT------AAC-A-A-G--AT--CAAGCAGTGTTTACTAGGC---GTAAT---GCCCGA--TG--TAAGAGAC--------AAA-GATATAActatttattttagataatttgcgtatccaaactgacatttaacttctttatataaaatctgtactatatttgctattaaggtcagccatccaaaactttagttaattcgtcaaccaaacgttgtctgaacaaaaacgaaaatgcgccgtgttacaatatataaaaccatatatacatataagtgttctgattagtattttttgatcaactatcaaatcagtcaatatat
gi|7                          :                                                                 cattcatttgaTTATTTGTAATTATATC-ATTAAG--TA-TGTTATT-AAATGTATTAAAATGGTACT--GAGGACGAACCTCAAAGTATA-----AG-GTAATCAGT-ATAAATGTGTAATAAATTATTTTCTTTTGGATAG---GGAAAAATATACATC--GCTT-----------TTTAGT-----GCATGTCTGTAGTATAAGCAATGCTT------C----GTCTAATAACAAAAGCGTCCACAATTAAT-------------------T-A-C-----T--TAAGT-TTATTTATT-GA-----T--T---GC
gi|8                          :                                                                                                                                       tatatatcatacaaAAGTATG-----AGTTTA-TCAAT-ATAAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTTACTGG---AAAAATATAT---AT--GTATATCTGTTTTTTTTTATTTTATTGCATGTTTATAGTATTAGAAATGCTT------T----GTCTAATAGCGAAAGCTTACACAATAAAT---------TTACTTAAGATAA-C-AATTT--TGAGT-TTATGCATT-GA-----T--T---GCaac
gi|9                          :                                                                                    GATTATACT-ATTAAG--TA-TGTTACT-TAATGTATCAAAAT---ACACAGAGGATGAATTT----GTATGTGCAAAAT-TA-TCAATCATTAATGTGTGATAAAGTATTTCCTTGTCGCAAG----AAAAAATAT---CTCGGTA------------TTTAATT----GCATGTTTGTAGTATTAATTATGCTC------C----GTCTAAAAGTAAAA-TTTCCACA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CAAATACGAATACGTCTTATACTAAATATACTAGATAGTTTGCATATTCACACTGAAATTTAACTTCTTTATACTCTGTCGCTATTAAGGTCAGGCATCAAATTAGGAATAAATTCGTCAACCAAATGTTGTTTAAAAAAAGACAATAATGCACCGAGGTTGGTGATATAAAATGGTTAATTCCAGATGTACCATCAAACTATATGTGTTCAAAAAATAGTTTACATTAGTCACCTAAATTAATAATA
Unaligned ( gi|11 ): CATCAAACTTTGAATAAATTTGTCAACGAAACGTTGCCTGAATAAAGACAGAAATGCGTCTTGATTGTTCATATTTAACGACGCATTCCAGCTGTACATAAAACAATATGTGTTAACACATGTTTTATATTTGTCACAGAATTAA
Unaligned ( gi|13 ): CCCCTCGTGCTACTATATATACATAATTTGAGTAACCAATTAACTTCTTTATATGAAATCAATACTCTATTGCTATAAAGGTCAGCCATCAAGTTTGAGTAAATT