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gi|8                          : taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataatacatatattgaataaaaaaagaaacgtttgctagttttgaatgtgaatattttgttaacatttaactaactttggctgtaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagctggtttatgtcagcctgtgggataaaaaaatgataatatcccacaggatgacataaacaagcttgtgctcttaatacgacgtcgctgtcaagcagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacgctactgataagccgattttgaaatccatcttcctgttttaaattaaaatcaaacaataaaattgataatttGCTGAAATCTT-CTGTTTGCTGTATAATTATGTCT-TATCATTC-----------------T--------------AC---------TGA----AATAcaaatttagtaaaatgttaacaaaaaattcacattcaaactgatccaaagttttttttgattcagtatagcatataataatattacaaacttacaaacaaaagaaatcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caactcaaacaataaaattgataatttctgtcctatttagcGCTGAAATCTT-TCGTTTGTTGTATAATTATGTCT-TATCAATC-----------------T--------------AC---------TGA----AATAcaaatttagttaaatgttaacaaaatattcacatccaaacttagcaaaaatttcttttttggttaagtttatatttattcaaacattgattttcacggtactacttaaacttgtcttagttaagcaggaaggaaatgttctatgtccaaactgctgtgacagttatccatcgtttagtt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taaattggCTGAAATCTT-CTGTTTATTGTATAGTTATGTCT-TATCGATC-----------------TATTGCAATAGCTAAAT---------TGG----GATAA--ATCAA----------T--GAT---AATATCCAACA-----GGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGTCAATCAGTCATCACCGCACACGGCGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAAGCCATCCTTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA-----GA------CT--------------T------AA-TTATACAAC--------AT--ACAGAAA---AATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TTAAAT---GTT-------AACAAACTATTCACATTC-AAACTAAGCGAAAG--TAT-TAGTTT-T-GGTTCAGTATA-TATAACCT--GAAAATAACGT-T-TAACCCCAAAAACAAAATAAAATGTTACTGGTGAATCTATTCTTAACTCTTACGATTGATAGGTTCAAGTACTGGTAAGTTTACGGTGAGGGATGTGTCAACCGCATGATATTCAAGCAACGATAAGAAGTCTGTCGCAAGTAAACTCTACCGGTGAGATATCAAACAGTAATCTCATAAACTACTTTCATTGAACAACATATATCACAATACTCCGATATATTCACAAAGAAAAATATTCAATATTTGGATTAAAAAAAAATATACAAGCAAAATAGCATCATTTTATATTCGTATTTAACAACAACATAAACACTTTTAGCCATCTTTCCTGAGCTGCAACTTTTTGTGTTTTCAACCATTTCCGTTTCACCCGTAATAGATAAAAGTGCAAATATGTCGATTTTGTAAAAAAAGAAAAGAAAAATCCAATAAGACTTAAATAATCTCAACATTACAAACGTGTCTTTAAAATAAATGATGTGGACTTACTAAATATATTGCATTAATGTATAAATTCAATTAAGGGATCGTCTATTTTTTCAGCACACTCTAGGCAATAGATTACTTTTGATAATGGAGCTGATATTTCAAATGAAGGATAATAGTGCTACAATCTAATAAGGTTTATCAGCGTTATCAATTTAATCTGCTTTCTAGAAAAATGGGACAACATGTCCTTTTTACAATTCAAACACCAGATATAGAAACTGTTATGGGAGTGCCAGTTAAAATCATCTCGTTTGATAGAGTAAAAAAATTGCACAAATAATAACATTACATTAATATCTTGGCAAATATGGACAAATAGACGCATACAATCAATTTCATTCCAAACTGGGCGAATATACTAAACCTGGGTATG-TTTTTTGTCGTGTGTGCTCTCTGTGCTTCCGAATGTTCATTTTATAATTCGTATTGACTAGCATATTCACCACCCTGTGTTTTCTTGGATCTTATGGAATGTTGGTCGTCACTAAAATACCCTGTGTTATTTTAGACCTCATAAAGTGTGGGTCGgctaaattggacagaaattatcgattttattgtttgatttgatgga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATGTC---ATC---C-----------------T--------------GT----------GG----GATATT-ATCAT----------T--TTT---T-TATCCCACA-----GGCTGACATAAACCAGCTt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                 taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataatacatatattgaataaaaaaagaaacgtttgctagttttgaatgtgaatattttgttaacatttaactaactttggctgtaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatTTATGTC-----CG-CC-----------------T--------------GT----------GG----GATAA--AAAAA----------G--GAT---AATATCCTACA-----GGCTGACATAAACATGTTTGTATTCTCAATGCAACGTCGCTGTCAGACAGTCATCATCGCACGCAGCGGCCACACACACTACTGATAACCCGATTTTTAAATCCATCCCTTTCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--------------T--------------T------GA-TCATacaagcttgtgctcttaatacgacgtcgctgtcaagcagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacgctactgataagccgattttgaaatccatcttcctgttttaaattaaaatcaaacaataaaattgataatttttgtccaattaagctatttcagtagattaataagtcattattatacagcaaatagaagatttcagccaaatttagtaaaatgttaacaaaaaattcacattcaaactgatccaaagttttttttgattcagtatagcatataataatattacaaacttacaaacaaaagaaatcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtTGTTTATGTCAGTC-----------------T--------------GT----------GG----GATAA--AAAAA----------T--GAA---AATATCCCACT-----GGCCGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCCCTATCAAACAGTCATCATCGCACACGGCAGCCACACACGCTACTGATAACTCGATTTttctgtttaatttagctatttcagtagaatgataagacataattatacagcaaacagaagatttcagccaaatttagtttaacttaaatgttaacaaaatattcacattcaaactttgcgaaagtttcttttttttggttcagtttatgattttagaaaaaaatgtgttatatatttatgaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctgaactaagatagaaacttttgttaagtttgaatgtgaatattttgttaacttaatttggcag---------TGG----GATAA--AACAA----------T--GAG---AATATACCACA-----GGCTGACATAAACAA-----CGCTCTCAATGCGACATCGCTGTCAAGCAGTCATCGTTGCACGCGACGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCACCCCTTCCCGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ATAATAA-AATT---GA----------------------T------AA-TTagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                           atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttggctgaaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagtaaattggacaga---------TGG----GATAA--AAACA----------T--GAT---AATATCCTACA-----GGCTGACATAAACAAGCTcaggctgacataaacaagcttgtagtctcaacg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaaaaataagttaaaatcaatttgcttttcaatttccattttctcgaaataatatatatactgaaccaaaaaaagaaacttttgctaagtttgaatgtgaatatttaactaaatttggctgaaatcttc----------T--GAT---AATATCCCACA-----GGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTTGCTGTCAAGCTGTCGTCACTGCACATGGCGGCCACACAGGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCTATCCCTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATTA-AA--------------T--------------T------GA-T------------------------------AATT-T-CTGTTCAATTT-AG------TTAcatgctgtcaaatacaagtttatgctctcaatgcaaggtcgctgtcaagcagtcaacttggcacgctgcagccacacacgctattgataacccaattttgaaatccatcccttcctgttttaaattcagatcaaacaataaaattgataatttctgtccaatttatcaatttcagtagattgataggacataattatacaacaagatttcagccaaatttagttaaatattaacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttctttttgggttcagtatata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATCCCACA-----GGCGGACATAAACtttcagtagattaataagacataattgtaaaataaaccgaagatttcagccaaatttagttaaatgtgaacaaaatattcacattcaaacttggcaaaattttcttttatggttcagtatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATCCCACA-----GGCTGACATAAACAAGCTTGTAGTCTCAACGaaaaaaggataatatcctacaggctgacataaacatgtttgtattctcaatgcaacgtcgctgtcagacagtcatcatcgcacgcagcggccacacacactactgataacccgatttttaaatccatccctttctgttttaaattcaaatcaaacaataaaattgatcatttctgtttaatttagctatttcagtagaatgataagacataattatacagcaaacagaagatttcagccaaatttagtttaacttaaatgttaacaaaatattcacattcaaactttgcgaaagtttcttttttttggttcagtttatgattttagaaaaaaatgtgttatatatttatgaa
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttgattaataggcccctgccattcaaagaatggtgattgggcTAAAATTGATCATTTC-TGTTT--AATTTAGCTATTTCAGTAGAATGATAA-----GA------CA--------------T------AA-TTATACAGC--------AA--ACAG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AGTTTAACTTAAAT---GTT-------AACAAAATATTCACATTC-AAACTTTGCGAAAGTTTCT-TTTTTT-T-GGTTCAGT-T--TATGATTTTAGAAAAAAATGTGT-TA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtttatgtccgcctgtgggataaaaaaaggataatatcctacaggctgacataaacatgtttgtattctcaatgcaacgtcgctgtcagacagtcatcatcgcacgcagcggccacacacactactgataacccgatttttaaatccatccctttctgttttaaattcaaatcaaacaaCCAGCCCTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-GCAATAA-AATT---GATAATTTCTGTCCAATTCCAAGAT------AA-TTATACAAC--------AA--ACAG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TTAAAT---GTT-------AACAAAATATTCACATTC-AGACTTAGCGAAAG--TTT-CTATTT-T-GGTTCAGTATA-Ttatatttatgaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tctgcttatttatacaattgtatgttaaaatgacacgcggcaatgttgaagcacgatgtttatttatatgtcaatctttccacctatggacgtacatgtataactaaacgagcTAATAA-----GA------CA--------------T------AA-TTGTAAAAT--------AA--ACCG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TTAAAT---GTG-------AACAAAATATTCACATTC-AAACTTGGCAAAAT--T-T-TCTTTTAT-GGTTCAGTATA-Tcataaacaagcctgtgctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccgattttgaaatccaacccttcctg
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AA-----GA------CA--------------T------AA-TTATACAAC--------AA--ACAG-AA---GATT-A-CAGCCAAAGTT-AG------TTAAAT---GTT-------AACAAAATATTCACATTCAAAACT-AGCAAACG--TTT-CTTTTT-T-TATTCAATATA-TGTAatcgatctattgcaatagctaaattgggataaatcaatgataatatccaacaggctgacataaacaagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctgtcaatcagtcatcaccgcacacggcggccacacacgctactgataacccgattttgaaagccatcctttcctgttttaaattcaaatcaaacaataaaagacttaattatacaacatacagaaaaatttcagccaaatttagttaaatgttaacaaactattcacattcaaactaagcgaaagtattagttttggttcagtatatataacctgaaaataacgtttaaccccaaaaacaaaataaaatgttactggtgaatctattcttaactcttacgattgataggttcaagtactggtaagtttacggtgagggatgtgtcaaccgcatgatattcaagcaacgataagaagtctgtcgcaagtaaactctaccggtgagatatcaaacagtaatctcataaactactttcattgaacaacatatatcacaatactccgatatattcacaaagaaaaatattcaatatttggattaaaaaaaaatatacaagcaaaatagcatcattttatattcgtatttaacaacaacataaacacttttagccatctttcctgagctgcaactttttgtgttttcaaccatttccgtttcacccgtaatagataaaagtgcaaatatgtcgattttgtaaaaaaagaaaagaaaaatccaataagacttaaataatctcaacattacaaacgtgtctttaaaataaatgatgtggacttactaaatatattgcattaatgtataaattcaattaagggatcgtctattttttcagcacactctaggcaatagattacttttgataatggagctgatatttcaaatgaaggataatagtgctacaatctaataaggtttatcagcgttatcaatttaatctgctttctagaaaaatgggacaacatgtcctttttacaattcaaacaccagatatagaaactgttatgggagtgccagttaaaatcatctcgtttgatagagtaaaaaaattgcacaaataataacattacattaatatcttggcaaatatggacaaatagacgcatacaatcaatttcattccaaactgggcgaatatactaaacctgggtatgttttttgtcgtgtgtgctctctgtgcttccgaatgttcattttataattcgtattgactagcatattcaccaccctgtgttttcttggatcttatggaatgttggtcgtcactaaaataccctgtgttattttagacctcataaagtgtgggtcgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataa-AA-----GA------CA--------------T------AA-TTATACAAC--------AA--ACAG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TTAAAT---GTT-------AATAAAATATTCACATTC-GAACTTAGTGAAAATTTCT-TA--TT-A-AGTTCCATATA-TATAAatcaatctactgaaatagctggtttatgtcagcctgtgggataaaaaaatgataatatcccacaggatgacataaacaagcttgtgctcttaatacgacgtcgctgtcaagcagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacgctactgataagccgattttgaaatccatcttcctgttttaaattaaaatcaaacaataaaattgataatttttgtccaattaagctatttcagtagattaataagtcattattatacagcaaatagaagatttcagccaaatttagtaaaatgttaacaaaaaattcacattcaaactgatccaaagttttttttgattcagtatagcatataataatattacaaacttacaaacaaaagaaatcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttat-AA-----GA------CA--------------T------AA-TTATACAAC--------AA--ACGA-AA---GATT-T-CAGCCCAATTT-Aatcaatctactgaaatagtaaattggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgttttatcccacaggctgacataaacaagcttgtagtctcaacg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-----GA------CA--------------T------AA-TTATACAAC--------AA--ACAG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TTAAAT---GTT-------AACAAAATATTCACATCC-AAACTTAGCGAAAA--TTT-CTTTTT-T-GGTTAAGTTTA-TATatcaatctactgaaatagctaaattggacagaaattatcgattttattgtttgatttgatgga
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caactcaaacaataaaattgataatttctgtcctatttagctattttagtagattgatcA-----GA------CA--------------T------AA-TTATACAAC--------AA--ATAG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TTAAAT---GTT-------AGCACAATATTCACATTC-AAACTTAGCGAAAG--TTT-CTTTTT-T-GGTTCAGTttattcaaacattgattttcacggtactacttaaacttgtcttagttaagcaggaaggaaatgttctatgtccaaactgctgtgacagttatccatcgtttagtt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-----GA------CA--------------T------AA-TTATACAAC--------AA--ACAG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TTAAAT---GTT-------AACAAAATATTCACATCC-AAACTTAGCAAAAA--TTT-CTTTTT-T-GGTTAAGTTTA-TATaagcaacgtcgcaacttaaatattttagtatattgatacgacataattatacaacaaacagaagatttcagccaaattaagttaaatgataacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttcttttttggttcag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caactcaaacaataaaattgataatttctgtcctatttagctatttcagtagattgatc-----GA------CA--------------T------AA-TTATACAAC--------AA--ACAG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTA-AG------TTAAAT---GAT-------AACAAAATATTCACATTC-AAACTTAGCGAAAG--TTT-CTTTTT-T-GGTTCAGttattcaaacattgattttcacggtactacttaaacttgtcttagttaagcaggaaggaaatgttctatgtccaaactgctgtgacagttatccatcgtttagtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actgaaccaaaaaagaaactttcgctaagtttgaatgtgaatattgtgctaacatttaactaaatttggctgaaatcttctatttgttgtataattatgtctaagcaacgtcgcaacttaaatattttagtatattgatacA-TTATACAGC--------AA--ATAG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TAAAAT---GTT-------AACAAAAAATTCACATTC-AAACTGATCCAAAG--TTT-T--TTT-T-GATTCAGTATAGCATA---T-----AATAATAT-TACAAACTTACAAACAAAAGAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataatacatatattgaataaaaaaagaaacgtttgctagttttgaatgtgaatattttgttaacatttaactaactttggctgtaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagctggtttatgtcagcctgtgggataaaaaaatgataatatcccacaggatgacataaacaagcttgtgctcttaatacgacgtcgctgtcaagcagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacgctactgataagccgattttgaaatccatcttcctgttttaaattaaaatcaaacaataaaattgataatttttgtccaattaagctatttcagtagattaataagtcattATA-AAC--------AA--GCTG-AA---GATT-T-CAGCCAAATTT-AG------TTAAA---------------------TATTCACATTC-AAACTTAGCAAAAG--TTTCTTTTTT-T-GGTTCAGTATA-TATAtcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaaaaataagttaaaatcaatttgcttttcaatttccattttctcgaaataaATT-T-CTGCCAAATT-------------AA----GTT-------AACAAAATATTCACATTC-AAACTTAACAAAAG--TTT-CTATCT-T-AGTTCAGgtcagcctgtaggatattatcatgtttttatcccacatgctgtcaaatacaagtttatgctctcaatgcaaggtcgctgtcaagcagtcaacttggcacgctgcagccacacacgctattgataacccaattttgaaatccatcccttcctgttttaaattcagatcaaacaataaaattgataatttctgtccaatttatcaatttcagtagattgataggacataattatacaacaagatttcagccaaatttagttaaatattaacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttctttttgggttcagtatata
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): CACATAATTATGATGTTTATGATTCCTTAATTAATTATATCGTATAATATACCGAACAATTTAATGCAAGCTGTTGTATTGTAAACGTTATATATTGTTT
Unaligned ( gi|15 ): TAAATATTAATATCTGCACAATACTAACGTAAATTGGCAAAGACAGTTGTGTATATATGATCGCGGTTAAATAAGAATAATCAGCGAACTTAA
Unaligned ( gi|17 ): TTAAACGCCCTCGTCATTCGAAGAATGGTGATTGGACAATTTGAAAA
Unaligned ( gi|18 ): AACCAAAAAAGAAACTTTCCCTAAGTTTGAATTT






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gi|13                         :                                                                                           actgaaccaaaaaagaaactttcgctaagtttgaatgtgaatattgtgctaacatttaactaaatttggctgaaatcttctatttgttgtataattatgtctaagcaacgtcgcaacttaaatattttagtatattgatacGCTGAAATCTTTCGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------AAATAGCTAA--AT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taaattggCATATGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATGCCtggacagaaattatcgattttattgtttgatttgatgga
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttgattaataggcccctgccattcaaagaatggtgattgATTCAAACTTAGGGAAAGTTTC--TTTTTTGGTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                        GCTGAAATCTTCTGTTTATTGTATAGTTATG---------TC---------------T------------------TATCGA-TCTATTG--------------GGATAAATCA--ATGATAATATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGTCAATCAGTCATCATCGCACACGGCGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATCCTTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--GACT--------------------TAA---T---TATACAA-----CAT--A-------CAGAAAA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAACT-----------ATTCACATTCAAACTAAGCGAAAGTATT--AGTTTTGGTTCAGTATA-TATAACCT--GAAAATAACGT-T-TAACCCCAAAAACAAAATAAAATGTTACTGGTGAATCTATTCTTAACTCTTACGATTGATAGGTTCAAGTACTGGTAAGTTTACAGTGAGGGATGTGTCAACCGCATGATATTCAAGCAACGATAAGAAGTCTGTCGCAAGTAAACTCTACCGGTGAGATATCAAACAATAATCTCATAAACTACTTTCATTGAACAACATATATCACAATACTCCGATATATTCACAAAGAAAAATATTCAATAATTGGATTAAAAAAAAATATACAAGCAAAATAGTATCATTTTATATTCGTATTTAACAACAACATAAACACTTTGAGCCATCTTTCCTGAGCTGCAAC-TTTAGTGTTTTCAACCATTTCCGTTTCACCCGTAATAGATAAAAGTACAAATATGTCGATTTTGCGAGAAAAAAAAAGAAAAATCGAATAAGACTAAAATAATCTCAACATTACAAACGTGTCTTTAAAATAAATGATGTGGACTTACTAAATATATTGCATTAAGGTATAAATTCAATTAAGGGATCGTCTATTTTTTCAGCACACTCTAGGCAAAAGATTACTTTTGATAATGGAGCTGATATTTCAAATGAAGGATAATAGTGCTACAATCTAATAAGGTTTATCAGCGTTATCAATTTAATCTGCTTTCTAGAAAAATGGGACAACATGTCCTTTTTACAATTCAAACACCAGATATAGAAACTGTTATGGGAGTGCCAGTTAAAATCATCTCGTTTGATAGAGTAAAGAAATTGCACAAA-AAAAACATTACATTAATATCTTGGCAAATATGGACAAATAAACGCATACAATCAATTTCATTCCAAACTGGGCGAATATACTAAACCAGGGTATGTTTTTTTGTCGTGTGTGCTCTCTGTGCTTCCGAATGTTCATTTTATAAATCGTATTGACTAGCATATTCACCACCCTGTGTTATCTTGGACCTTATGAAATGTTGGTCGTCACTAAAATACCCTGTGTTATTTTGGACCTCATAAAGTGTGGGTCGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--A--------------CAGCCAA------AGTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAAACTAGCAAACGTTTC--TTTTTTTATTCAATATA-TGTA
gi|3                          :                                                                            taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataaGCTGTAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTCTTATCAATC---------------TACTGAAATAGCTGGTTTATGTCAG-CCTG-TG--------------GGATAAAAAA--ATGATAATATCCCACAGGATGACATAAACAAGCTTGTGCTCTTAATACGACGTCGCTGTCAAGCAGTCATCATCGCACGCGGCGGTCACACACGCTACTGATAAGCCGATTTTGAAATCCAT--CTTCCTGTTTTAAATTAAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--TTGA--------------------TAATTTT---TGTCCAA-----TTA--AGCTATTTCAGTAGA-TTAATAAGTCATTATTATACAGCAAATAGAAGATTTCAGCC------AAA----------T-TTAGTAAAATGTTAACAAAAAATTCACATTCAAACTGATCCAAAGTT----TTTTTTGATTCAGTATAGCATA---T-----AATAATAT-TACAAACTTACAAACAAAAGAAAatcaatctactgaaatagctggtttatgtcagcctgtgggataaaaaaatgataatatcccacaggatgacataaacaagcttgtgctcttaatacgacgtcgctgtcaagcagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacgctactgataagccgattttgaaatccatcttcctgttttaaattaaaatcaaacaataaaattgataatttttgtccaattaagctatttcagtagattaataagtcattattatacagcaaatagaagatttcagccaaatttagtaaaatgttaacaaaaaattcacattcaaactgatccaaagttttttttgattcagtatagcatataataatattacaaacttacaaacaaaagaaatcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                     taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataatacatatattgaataaaaaaagaaacgtttgctagttttgaatgtgaatattttgttaacatttaactaactttg-AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAATAAAAT-----------ATTCACATTCGAACTTAGTGAAAATTTC--TTATTAAGTTCCATATA-TATAAtcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|4                          :                                                                   atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatGCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------AAAT-AGTAA--ATatcaatctactgaaatagtaaattggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgttttatcccacaggctgacataaacaagcttgtagtctcaacg
gi|4                          :                    atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttgTG---------TT---------------TA-----------------TGTCAG-CCTG-TG--------------GGATAAAACA--ATGAGAATATACCACAGGCTGACATAAACAA-----CGCTCTCAATGCGACATCGCTGTCAAGCAGTCATCGTTGCACGCGACGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCACCCCTTCCCGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ATAATAA-AA--TTGA--------------------TAA---T---Ttggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgttttatcccacaggctgacataaacaagcttgtagtctcaacg
gi|4                          :                                                atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttggctgaaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagtaaattggacagaTATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTAGTCTCAACGagcttgtagtctcaacg
gi|5                          :                                                                           atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttggctgaaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagtaaattggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgtttATA-AA-----CAA--G-------CTGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------T----------------------ATTCACATTCAAACTTAGCAAAAGTTTCT-TTTTTTGGTTCAGTATA-TATA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                   agaaaaataagttaaaatcaatttgcttttcaatttccattttctcgaaataaGCTGAAATCTTCAGCTTGTT-------TATG---------TC--------------------------------------AG-CCTG-TA--------------GGATA--TTATCATGTTTTTATCCCACATGCTGTCAAATACAAGTTTATGCTCTCAATGCAAGGTCGCTGTCAAGCAGTCAACTTGGCACGCTGCAGCCACACACGCTATTGATAACCCAATTTTGAAATCCATCCCTTCCTGTTTTAAATTCAG--AT--CAA-ACAATAA-AA--TTGA--------------------TAA---TTTCTGTCCAATTTATCAATTT-------CAGTAGA-TTGATAGGACATAATTATACAACAAG------ATTTCAGCC------AAATTTAGTTAAATATTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTGGGTTCAGTATA-TAgtcagcctgtaggatattatcatgtttttatcccacatgctgtcaaatacaagtttatgctctcaatgcaaggtcgctgtcaagcagtcaacttggcacgctgcagccacacacgctattgataacccaattttgaaatccatcccttcctgttttaaattcagatcaaacaataaaattgataatttctgtccaatttatcaatttcagtagattgataggacataattatacaacaagatttcagccaaatttagttaaatattaacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttctttttgggttcagtatata
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gi|6                          :                                                                                                                       tctgcttatttatacaattgtatgttaaaatgacacgcggcaatgttgaagcacgatgtttatttatatgtcaatctttccacctatggacgtacatgtataactaaacgagcGCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATC---------TTGGAATTGGACAGAAAT------------------TATCAATTTTATTGCT------------TGAT--TTGA--ATT-TAAAACAGGAAGGGCTGGCATAAACAAGCCTGTGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCGATTTTGAAATCCAACCCTTCCTGcataaacaagcctgtgctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccgattttgaaatccaacccttcctg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                     TG---------TT---------------TA-----------------TGTCAG-TCTG-TG--------------GGATAAAAAA--ATGAAAATATCCCACTGGCCGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCCCTATCAAACAGTCATCATCGCACACGGCAGCCACACACGCTACTGATAACTCGATTTgagttatcagtagcgtgtgtggctgccgtgtgcgatgatgactgtttgatagggacgtcgcattgagagcacaagcttgtttatgtcggccagtgggatattttcatttttttatcccacagactgacataaacaagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5228 )     :                                                                                                                                                                                                                                   GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------GGATAANTA-AATGATAATATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGTCAAGCAGTCATCATCGCACGCGGCGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATCCCTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTTGGTTCAGTATA-TATAACCT--GAAAATAACGT-T-TAACCCCAAAAACAAAATAAAATGTTACTGGTGAATCTATTCTTAACTCTTACGATTGATAGGTTCAAGTACTGGTAAGTTTACGGTGAGGGATGTGTCAACCGCATGATATTCAAGCAACGATAAGAAGTCTGTCGCAAGTAAACTCTACCGGTGAGATATCAAACAGTAATCTCATAAACTACTTTCATTGAACAACATATATCACAATACTCCGATATATTCACAAAGAAAAATATTCAATANTTGGATTAAAAAAAAATATACAAGCAAAATAGCATCATTTTATATTCGTATTTAACAACAACATAAACACTTTNAGCCATCTTTCCTGAGCTGCAACTTTTNGTGTTTTCAACCATTTCCGTTTCACCCGTAATAGATAAAAGTGCAAATATGTCGATTTTGCGAGAAAAGAAAAGAAAAATCNAATAAGACTNAAATAATCTCAACATTACAAACGTGTCTTTAAAATAAATGATGTGGACTTACTAAATATATTGCATTAANGTATAAATTCAATTAAGGGATCGTCTATTTTTTCAGCACACTCTAGGCAANAGATTACTTTTGATAATGGAGCTGATATTTCAAATGAAGGATAATAGTGCTACAATCTAATAAGGTTTATCAGCGTTATCAATTTAATCTGCTTTCTAGAAAAATGGGACAACATGTCCTTTTTACAATTCAAACACCAGATATAGAAACTGTTATGGGAGTGCCAGTTAAAATCATCTCGTTTGATAGAGTAAAGAAATTGCACAAATAANAACATTACATTAATATCTTGGCAAATATGGACAAATAGACGCATACAATCAATTTCATTCCAAACTGGGCGAATATACTAAACCNGGGTATGTTTTTTTGTCGTGTGTGCTCTCTGTGCTTCCGAATGTTCATTTTATAANTCGTATTGACTAGCATATTCACCACCCTGTGTTNTCTTGGACCTTATGGAATGTTGGTCGTCACTAAAATACCCTGTGTTATTTTGGACCTCATAAAGTGTGGGTCG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actgaaccaaaaaagaaactttcgctaagtttgaatgtgaatattgtgctaacatttaactaaatttggctgaaatcttctatttgttgtataattatgtctaagcaacgtcgca--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTA-AGTT------AAA----------TGATAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTTGGTTCAGcaaattaagttaaatgataacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttcttttttggttcag
gi|13                         :                                                                                      actgaaccaaaaaagaaactttcgctaagtttgaatgtgaatattgtgctaacatttaactaaatttggctgaaatcttctatttgttgtataattatgtctaagcaacgtcgcaacttaaatattttagtatattgatacGCTGAAATCTTTCGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------AAATAGCTA-AAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaattggCATATGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATGCCtggacagaaattatcgattttattgtttgatttgatgga
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgattaataggcccctgccattcaaagaatggtgattgATTCAAACTTAGGGAAAGTTTC--TTTTTTGGTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                   GCTGAAATCTTCTGTTTATTGTATAGTTATG---------TC---------------T------------------TATCGA-TCTATTG--------------GGATAAATC-AATGATAATATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGTCAATCAGTCATCATCGCACACGGCGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATCCTTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--GACT--------------------TAA---T---TATACAA-----CAT--A-------CAGAAAA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAACT-----------ATTCACATTCAAACTAAGCGAAAGTATT--AGTTTTGGTTCAGTATA-TATAACCT--GAAAATAACGT-T-TAACCCCAAAAACAAAATAAAATGTTACTGGTGAATCTATTCTTAACTCTTACGATTGATAGGTTCAAGTACTGGTAAGTTTACAGTGAGGGATGTGTCAACCGCATGATATTCAAGCAACGATAAGAAGTCTGTCGCAAGTAAACTCTACCGGTGAGATATCAAACAATAATCTCATAAACTACTTTCATTGAACAACATATATCACAATACTCCGATATATTCACAAAGAAAAATATTCAATAATTGGATTAAAAAAAAATATACAAGCAAAATAGTATCATTTTATATTCGTATTTAACAACAACATAAACACTTTGAGCCATCTTTCCTGAGCTGCAAC-TTTAGTGTTTTCAACCATTTCCGTTTCACCCGTAATAGATAAAAGTACAAATATGTCGATTTTGCGAGAAAAAAAAAGAAAAATCGAATAAGACTAAAATAATCTCAACATTACAAACGTGTCTTTAAAATAAATGATGTGGACTTACTAAATATATTGCATTAAGGTATAAATTCAATTAAGGGATCGTCTATTTTTTCAGCACACTCTAGGCAAAAGATTACTTTTGATAATGGAGCTGATATTTCAAATGAAGGATAATAGTGCTACAATCTAATAAGGTTTATCAGCGTTATCAATTTAATCTGCTTTCTAGAAAAATGGGACAACATGTCCTTTTTACAATTCAAACACCAGATATAGAAACTGTTATGGGAGTGCCAGTTAAAATCATCTCGTTTGATAGAGTAAAGAAATTGCACAAA-AAAAACATTACATTAATATCTTGGCAAATATGGACAAATAAACGCATACAATCAATTTCATTCCAAACTGGGCGAATATACTAAACCAGGGTATGTTTTTTTGTCGTGTGTGCTCTCTGTGCTTCCGAATGTTCATTTTATAAATCGTATTGACTAGCATATTCACCACCCTGTGTTATCTTGGACCTTATGAAATGTTGGTCGTCACTAAAATACCCTGTGTTATTTTGGACCTCATAAAGTGTGGGTCGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--A--------------CAGCCAA------AGTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAAACTAGCAAACGTTTC--TTTTTTTATTCAATATA-TGTA
gi|3                          :                                                                       taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataaGCTGTAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTCTTATCAATC---------------TACTGAAATAGCTGGTTTATGTCAG-CCTG-TG--------------GGATAAAAA-AATGATAATATCCCACAGGATGACATAAACAAGCTTGTGCTCTTAATACGACGTCGCTGTCAAGCAGTCATCATCGCACGCGGCGGTCACACACGCTACTGATAAGCCGATTTTGAAATCCAT--CTTCCTGTTTTAAATTAAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--TTGA--------------------TAATTTT---TGTCCAA-----TTA--AGCTATTTCAGTAGA-TTAATAAGTCATTATTATACAGCAAATAGAAGATTTCAGCC------AAA----------T-TTAGTAAAATGTTAACAAAAAATTCACATTCAAACTGATCCAAAGTT----TTTTTTGATTCAGTATAGCATA---T-----AATAATAT-TACAAACTTACAAACAAAAGAAAatcaatctactgaaatagctggtttatgtcagcctgtgggataaaaaaatgataatatcccacaggatgacataaacaagcttgtgctcttaatacgacgtcgctgtcaagcagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacgctactgataagccgattttgaaatccatcttcctgttttaaattaaaatcaaacaataaaattgataatttttgtccaattaagctatttcagtagattaataagtcattattatacagcaaatagaagatttcagccaaatttagtaaaatgttaacaaaaaattcacattcaaactgatccaaagttttttttgattcagtatagcatataataatattacaaacttacaaacaaaagaaatcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataatacatatattgaataaaaaaagaaacgtttgctagttttgaatgtgaatattttgttaacatttaactaactttg-AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAATAAAAT-----------ATTCACATTCGAACTTAGTGAAAATTTC--TTATTAAGTTCCATATA-TATAAtcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|4                          :                                                              atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatGCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------AAAT-AGTA-AATatcaatctactgaaatagtaaattggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgttttatcccacaggctgacataaacaagcttgtagtctcaacg
gi|4                          :               atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttgTG---------TT---------------TA-----------------TGTCAG-CCTG-TG--------------GGATAAAAC-AATGAGAATATACCACAGGCTGACATAAACAA-----CGCTCTCAATGCGACATCGCTGTCAAGCAGTCATCGTTGCACGCGACGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCACCCCTTCCCGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ATAATAA-AA--TTGA--------------------TAA---T---Ttggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgttttatcccacaggctgacataaacaagcttgtagtctcaacg
gi|4                          :                                          atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttggctgaaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagtaaattggacagaTATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTAGTCTCAACGagcttgtagtctcaacg
gi|5                          :                                                                     atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttggctgaaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagtaaattggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgtttATA-AA-----CAA--G-------CTGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------T----------------------ATTCACATTCAAACTTAGCAAAAGTTTCT-TTTTTTGGTTCAGTATA-TATA
gi|5                          :                                                                                                                                                                              agaaaaataagttaaaatcaatttgcttttcaatttccattttctcgaaataaGCTGAAATCTTCAGCTTGTT-------TATG---------TC--------------------------------------AG-CCTG-TA--------------GGATA-TTATCATGTTTTTATCCCACATGCTGTCAAATACAAGTTTATGCTCTCAATGCAAGGTCGCTGTCAAGCAGTCAACTTGGCACGCTGCAGCCACACACGCTATTGATAACCCAATTTTGAAATCCATCCCTTCCTGTTTTAAATTCAG--AT--CAA-ACAATAA-AA--TTGA--------------------TAA---TTTCTGTCCAATTTATCAATTT-------CAGTAGA-TTGATAGGACATAATTATACAACAAG------ATTTCAGCC------AAATTTAGTTAAATATTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTGGGTTCAGTATA-TAgtcagcctgtaggatattatcatgtttttatcccacatgctgtcaaatacaagtttatgctctcaatgcaaggtcgctgtcaagcagtcaacttggcacgctgcagccacacacgctattgataacccaattttgaaatccatcccttcctgttttaaattcagatcaaacaataaaattgataatttctgtccaatttatcaatttcagtagattgataggacataattatacaacaagatttcagccaaatttagttaaatattaacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttctttttgggttcagtatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agaaaaataagttaaaatcaatttgcttttcaatttccattttctcgaaataatatatatactgaaccaaaaaaagaaacttttgctaagtttgaatgtgaatatttaactaaatttgCCAGCCCTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-GCAATAA-AATTGATAATTTCTGTCCAATTCCAAGATAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAGACTTAGCGAAAGTTTC--TATTTTGGTTCAGTATA-T
gi|6                          :                                                                                                                  tctgcttatttatacaattgtatgttaaaatgacacgcggcaatgttgaagcacgatgtttatttatatgtcaatctttccacctatggacgtacatgtataactaaacgagcGCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATC---------TTGGAATTGGACAGAAAT------------------TATCAATTTTATTGCT------------TGAT--TTG-AATT-TAAAACAGGAAGGGCTGGCATAAACAAGCCTGTGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCGATTTTGAAATCCAACCCTTCCTGcataaacaagcctgtgctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccgattttgaaatccaacccttcctg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                TG---------TT---------------TA-----------------TGTCAG-TCTG-TG--------------GGATAAAAA-AATGAAAATATCCCACTGGCCGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCCCTATCAAACAGTCATCATCGCACACGGCAGCCACACACGCTACTGATAACTCGATTTgagttatcagtagcgtgtgtggctgccgtgtgcgatgatgactgtttgatagggacgtcgcattgagagcacaagcttgtttatgtcggccagtgggatattttcatttttttatcccacagactgacataaacaagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctgaactaagatagaaacttttgttaagtttgaatgtgaatattttgttaacttaatttggcagTATCCCACAGACTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGGCAAACAGTCATCATCGCACGCGGCGGTCACACACACTCTTGATTACCCGATTTTGAAATCTATCCCTTCCTGTTTTTAATTCAA--AG--CAA-ACAATAA-AA--TAGA--------------------TAA---T---Tagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
gi|7                          :                                                                         ctgaactaagatagaaacttttgttaagtttgaatgtgaatattttgttaacttaatttggcagaaatcgagttatcagtagcgtgtgtggctgccgtgtgcgatgatgactgtttgatagggacgtcgcattgagagcacaagcttgtttatgtcggccagtgggatattttcattttttTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTATTG--------------AAAT-AGCA-AATtctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtttatgtccgcctgTAAAATTGATCATTTC-TGTTT--AATTTAGCTATTTCAGTAGAATGATAA--GACA--------------------TAA---T---TATACAG-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTTTAACTTAAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTTGCGAAAGTTTCTTTTTTTTGGTTCAGT-T--TATGATTTTAGAAAAAAATGTGT-TAttgatcatttctgtttaatttagctatttcagtagaatgataagacataattatacagcaaacagaagatttcagccaaatttagtttaacttaaatgttaacaaaatattcacattcaaactttgcgaaagtttcttttttttggttcagtttatgattttagaaaaaaatgtgttatatatttatgaa
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgataatatcccacaggctgacataaacaagcttgtgctctcaatgcgacgttgctgtcaagctgtcgtcactgcacatggcggccacacaggctactgataacccgattttgaaatctatcccttcctgttttaaattcaaatcaaacaattaaattgataatttctgttcaTAATAA--GACA--------------------TAA---T---TGTAAAA-----TAA--A-------CCGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTGAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTGGCAAAATTTTC--TTTTATGGTTCAGTATA-Tcaaatttagttaaatgtgaacaaaatattcacattcaaacttggcaaaattttcttttatggttcagtatat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-5228 )     :                                                                                                                                                                                                                                   GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------GGATAANTA-AATGATAATATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGTCAAGCAGTCATCATCGCACGCGGCGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATCCCTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTTGGTTCAGTATA-TATAACCT--GAAAATAACGT-T-TAACCCCAAAAACAAAATAAAATGTTACTGGTGAATCTATTCTTAACTCTTACGATTGATAGGTTCAAGTACTGGTAAGTTTACGGTGAGGGATGTGTCAACCGCATGATATTCAAGCAACGATAAGAAGTCTGTCGCAAGTAAACTCTACCGGTGAGATATCAAACAGTAATCTCATAAACTACTTTCATTGAACAACATATATCACAATACTCCGATATATTCACAAAGAAAAATATTCAATANTTGGATTAAAAAAAAATATACAAGCAAAATAGCATCATTTTATATTCGTATTTAACAACAACATAAACACTTTNAGCCATCTTTCCTGAGCTGCAACTTTTNGTGTTTTCAACCATTTCCGTTTCACCCGTAATAGATAAAAGTGCAAATATGTCGATTTTGCGAGAAAAGAAAAGAAAAATCNAATAAGACTNAAATAATCTCAACATTACAAACGTGTCTTTAAAATAAATGATGTGGACTTACTAAATATATTGCATTAANGTATAAATTCAATTAAGGGATCGTCTATTTTTTCAGCACACTCTAGGCAANAGATTACTTTTGATAATGGAGCTGATATTTCAAATGAAGGATAATAGTGCTACAATCTAATAAGGTTTATCAGCGTTATCAATTTAATCTGCTTTCTAGAAAAATGGGACAACATGTCCTTTTTACAATTCAAACACCAGATATAGAAACTGTTATGGGAGTGCCAGTTAAAATCATCTCGTTTGATAGAGTAAAGAAATTGCACAAATAANAACATTACATTAATATCTTGGCAAATATGGACAAATAGACGCATACAATCAATTTCATTCCAAACTGGGCGAATATACTAAACCNGGGTATGTTTTTTTGTCGTGTGTGCTCTCTGTGCTTCCGAATGTTCATTTTATAANTCGTATTGACTAGCATATTCACCACCCTGTGTTNTCTTGGACCTTATGGAATGTTGGTCGTCACTAAAATACCCTGTGTTATTTTGGACCTCATAAAGTGTGGGTCG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actgaaccaaaaaagaaactttcgctaagtttgaatgtgaatattgtgctaacatttaactaaatttggctgaaatcttctatttgttgtataattatgtctaagcaacgtcgca--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTA-AGTT------AAA----------TGATAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTTGGTTCAGcaaattaagttaaatgataacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttcttttttggttcag
gi|13                         :                                                                                      actgaaccaaaaaagaaactttcgctaagtttgaatgtgaatattgtgctaacatttaactaaatttggctgaaatcttctatttgttgtataattatgtctaagcaacgtcgcaacttaaatattttagtatattgatacGCTGAAATCTTTCGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------AAATAGCTA-AAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaattggCATATGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATGCCtggacagaaattatcgattttattgtttgatttgatgga
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgattaataggcccctgccattcaaagaatggtgattgATTCAAACTTAGGGAAAGTTTC--TTTTTTGGTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                   GCTGAAATCTTCTGTTTATTGTATAGTTATG---------TC---------------T------------------TATCGA-TCTATTG--------------GGATAAATC-AATGATAATATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGTCAATCAGTCATCATCGCACACGGCGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATCCTTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--GACT--------------------TAA---T---TATACAA-----CAT--A-------CAGAAAA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAACT-----------ATTCACATTCAAACTAAGCGAAAGTATT--AGTTTTGGTTCAGTATA-TATAACCT--GAAAATAACGT-T-TAACCCCAAAAACAAAATAAAATGTTACTGGTGAATCTATTCTTAACTCTTACGATTGATAGGTTCAAGTACTGGTAAGTTTACAGTGAGGGATGTGTCAACCGCATGATATTCAAGCAACGATAAGAAGTCTGTCGCAAGTAAACTCTACCGGTGAGATATCAAACAATAATCTCATAAACTACTTTCATTGAACAACATATATCACAATACTCCGATATATTCACAAAGAAAAATATTCAATAATTGGATTAAAAAAAAATATACAAGCAAAATAGTATCATTTTATATTCGTATTTAACAACAACATAAACACTTTGAGCCATCTTTCCTGAGCTGCAAC-TTTAGTGTTTTCAACCATTTCCGTTTCACCCGTAATAGATAAAAGTACAAATATGTCGATTTTGCGAGAAAAAAAAAGAAAAATCGAATAAGACTAAAATAATCTCAACATTACAAACGTGTCTTTAAAATAAATGATGTGGACTTACTAAATATATTGCATTAAGGTATAAATTCAATTAAGGGATCGTCTATTTTTTCAGCACACTCTAGGCAAAAGATTACTTTTGATAATGGAGCTGATATTTCAAATGAAGGATAATAGTGCTACAATCTAATAAGGTTTATCAGCGTTATCAATTTAATCTGCTTTCTAGAAAAATGGGACAACATGTCCTTTTTACAATTCAAACACCAGATATAGAAACTGTTATGGGAGTGCCAGTTAAAATCATCTCGTTTGATAGAGTAAAGAAATTGCACAAA-AAAAACATTACATTAATATCTTGGCAAATATGGACAAATAAACGCATACAATCAATTTCATTCCAAACTGGGCGAATATACTAAACCAGGGTATGTTTTTTTGTCGTGTGTGCTCTCTGTGCTTCCGAATGTTCATTTTATAAATCGTATTGACTAGCATATTCACCACCCTGTGTTATCTTGGACCTTATGAAATGTTGGTCGTCACTAAAATACCCTGTGTTATTTTGGACCTCATAAAGTGTGGGTCGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--A--------------CAGCCAA------AGTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAAACTAGCAAACGTTTC--TTTTTTTATTCAATATA-TGTA
gi|3                          :                                                                       taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataaGCTGTAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTCTTATCAATC---------------TACTGAAATAGCTGGTTTATGTCAG-CCTG-TG--------------GGATAAAAA-AATGATAATATCCCACAGGATGACATAAACAAGCTTGTGCTCTTAATACGACGTCGCTGTCAAGCAGTCATCATCGCACGCGGCGGTCACACACGCTACTGATAAGCCGATTTTGAAATCCAT--CTTCCTGTTTTAAATTAAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--TTGA--------------------TAATTTT---TGTCCAA-----TTA--AGCTATTTCAGTAGA-TTAATAAGTCATTATTATACAGCAAATAGAAGATTTCAGCC------AAA----------T-TTAGTAAAATGTTAACAAAAAATTCACATTCAAACTGATCCAAAGTT----TTTTTTGATTCAGTATAGCATA---T-----AATAATAT-TACAAACTTACAAACAAAAGAAAatcaatctactgaaatagctggtttatgtcagcctgtgggataaaaaaatgataatatcccacaggatgacataaacaagcttgtgctcttaatacgacgtcgctgtcaagcagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacgctactgataagccgattttgaaatccatcttcctgttttaaattaaaatcaaacaataaaattgataatttttgtccaattaagctatttcagtagattaataagtcattattatacagcaaatagaagatttcagccaaatttagtaaaatgttaacaaaaaattcacattcaaactgatccaaagttttttttgattcagtatagcatataataatattacaaacttacaaacaaaagaaatcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataatacatatattgaataaaaaaagaaacgtttgctagttttgaatgtgaatattttgttaacatttaactaactttg-AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAATAAAAT-----------ATTCACATTCGAACTTAGTGAAAATTTC--TTATTAAGTTCCATATA-TATAAtcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
gi|4                          :                                                              atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatGCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------AAAT-AGTA-AATatcaatctactgaaatagtaaattggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgttttatcccacaggctgacataaacaagcttgtagtctcaacg
gi|4                          :               atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttgTG---------TT---------------TA-----------------TGTCAG-CCTG-TG--------------GGATAAAAC-AATGAGAATATACCACAGGCTGACATAAACAA-----CGCTCTCAATGCGACATCGCTGTCAAGCAGTCATCGTTGCACGCGACGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCACCCCTTCCCGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ATAATAA-AA--TTGA--------------------TAA---T---Ttggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgttttatcccacaggctgacataaacaagcttgtagtctcaacg
gi|4                          :                                          atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttggctgaaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagtaaattggacagaTATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTAGTCTCAACGagcttgtagtctcaacg
gi|5                          :                                                                     atatcgaacacacataaaatgagtttaatggaaccagtccacgtcagtattggaaacttgctcacgttatgcttctatgtaaaatacatcacgtcaaattataaactggtttatttaattaattgtgttggcaaatcattgagcacattgtctttaaatatttatttatatatatggaacttaataagaaattttcactaagttcgaatgtgaatattttattaacatttaactaaatttggctgaaatcttctgtttgttgtataattatgtcttatcaatctactgaaatagtaaattggacagaaattatcaattttattatttgatttgaatttaaaacgggaaggggtggatttcaaaatcgggttatcagtagcgtgtgtggccgtcgcgtgcaacgatgactgcttgacagcgatgtcgcattgagagcgttgtttatgtcagcctgtggtatattctcattgtttATA-AA-----CAA--G-------CTGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------T----------------------ATTCACATTCAAACTTAGCAAAAGTTTCT-TTTTTTGGTTCAGTATA-TATA
gi|5                          :                                                                                                                                                                              agaaaaataagttaaaatcaatttgcttttcaatttccattttctcgaaataaGCTGAAATCTTCAGCTTGTT-------TATG---------TC--------------------------------------AG-CCTG-TA--------------GGATA-TTATCATGTTTTTATCCCACATGCTGTCAAATACAAGTTTATGCTCTCAATGCAAGGTCGCTGTCAAGCAGTCAACTTGGCACGCTGCAGCCACACACGCTATTGATAACCCAATTTTGAAATCCATCCCTTCCTGTTTTAAATTCAG--AT--CAA-ACAATAA-AA--TTGA--------------------TAA---TTTCTGTCCAATTTATCAATTT-------CAGTAGA-TTGATAGGACATAATTATACAACAAG------ATTTCAGCC------AAATTTAGTTAAATATTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTGGGTTCAGTATA-TAgtcagcctgtaggatattatcatgtttttatcccacatgctgtcaaatacaagtttatgctctcaatgcaaggtcgctgtcaagcagtcaacttggcacgctgcagccacacacgctattgataacccaattttgaaatccatcccttcctgttttaaattcagatcaaacaataaaattgataatttctgtccaatttatcaatttcagtagattgataggacataattatacaacaagatttcagccaaatttagttaaatattaacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttctttttgggttcagtatata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agaaaaataagttaaaatcaatttgcttttcaatttccattttctcgaaataatatatatactgaaccaaaaaaagaaacttttgctaagtttgaatgtgaatatttaactaaatttgCCAGCCCTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-GCAATAA-AATTGATAATTTCTGTCCAATTCCAAGATAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAGACTTAGCGAAAGTTTC--TATTTTGGTTCAGTATA-T
gi|6                          :                                                                                                                  tctgcttatttatacaattgtatgttaaaatgacacgcggcaatgttgaagcacgatgtttatttatatgtcaatctttccacctatggacgtacatgtataactaaacgagcGCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATC---------TTGGAATTGGACAGAAAT------------------TATCAATTTTATTGCT------------TGAT--TTG-AATT-TAAAACAGGAAGGGCTGGCATAAACAAGCCTGTGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCGATTTTGAAATCCAACCCTTCCTGcataaacaagcctgtgctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccgattttgaaatccaacccttcctg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tctgcttatttatacaattgtatgttaaaatgacacgcggcaatgttgaagcacgatgtttatttatatgtcaatctttccacctatggacgtacatgtataactaaacgagcatatactgaaccaaaatagaaactttcgctaagtctgaatgtgaatattttgttaacatttaactaaatttgGA-TT--T--------------CTGCCAA------ATT-------------AA-----------GTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAACAAAAGTTTC--TATCTTAGTTCAG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                TG---------TT---------------TA-----------------TGTCAG-TCTG-TG--------------GGATAAAAA-AATGAAAATATCCCACTGGCCGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCCCTATCAAACAGTCATCATCGCACACGGCAGCCACACACGCTACTGATAACTCGATTTgagttatcagtagcgtgtgtggctgccgtgtgcgatgatgactgtttgatagggacgtcgcattgagagcacaagcttgtttatgtcggccagtgggatattttcatttttttatcccacagactgacataaacaagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctgaactaagatagaaacttttgttaagtttgaatgtgaatattttgttaacttaatttggcagTATCCCACAGACTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGGCAAACAGTCATCATCGCACGCGGCGGTCACACACACTCTTGATTACCCGATTTTGAAATCTATCCCTTCCTGTTTTTAATTCAA--AG--CAA-ACAATAA-AA--TAGA--------------------TAA---T---Tagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
gi|7                          :                                                                         ctgaactaagatagaaacttttgttaagtttgaatgtgaatattttgttaacttaatttggcagaaatcgagttatcagtagcgtgtgtggctgccgtgtgcgatgatgactgtttgatagggacgtcgcattgagagcacaagcttgtttatgtcggccagtgggatattttcattttttTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTATTG--------------AAAT-AGCA-AATtctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
gi|8                          : ctgaactaagatagaaacttttgttaagtttgaatgtgaatattttgttaacttaatttggcagaaatcgagttatcagtagcgtgtgtggctgccgtgtgcgatgatgactgtttgatagggacgtcgcattgagagcacaagcttgtttatgtcggccagtgggatattttcatttttttatcccacagactgacataaacaagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaTATCCCACAGGCGGACATAAAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TG--------------GGATAAAAA-AAGGATAATATCCTACAGGCTGACATAAACATGTTTGTATTCTCAATGCAACGTCGCTGTCAGACAGTCATCATCGCACGCAGCGGCCACACACACTACTGATAACCCGATTTTTAAATCCATCCCTTTCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--aaaaaaggataatatcctacaggctgacataaacatgtttgtattctcaatgcaacgtcgctgtcagacagtcatcatcgcacgcagcggccacacacactactgataacccgatttttaaatccatccctttctgttttaaattcaaatcaaacaataaaattgatcatttctgtttaatttagctatttcagtagaatgataagacataattatacagcaaacagaagatttcagccaaatttagtttaacttaaatgttaacaaaatattcacattcaaactttgcgaaagtttcttttttttggttcagtttatgattttagaaaaaaatgtgttatatatttatgaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtttatgtccgcctgTAAAATTGATCATTTC-TGTTT--AATTTAGCTATTTCAGTAGAATGATAA--GACA--------------------TAA---T---TATACAG-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTTTAACTTAAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTTGCGAAAGTTTCTTTTTTTTGGTTCAGT-T--TATGATTTTAGAAAAAAATGTGT-TAttgatcatttctgtttaatttagctatttcagtagaatgataagacataattatacagcaaacagaagatttcagccaaatttagtttaacttaaatgttaacaaaatattcacattcaaactttgcgaaagtttcttttttttggttcagtttatgattttagaaaaaaatgtgttatatatttatgaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                    gtttatgtccgcctgtgggataaaaaaaggataatatcctacaggctgacataaacatgtttgtattctcaatgcaacgtcgctgtcagacagtcatcatcgcacgcagcggccacacacactactgataacccgatttttaaatccatccctttctgttttaaattcaaatcaaacaaTGATAATATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTTGCTGTCAAGCTGTCGTCACTGCACATGGCGGCCACACAGGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCTATCCCTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATTA-AA--TTGA--------------------TAA---T---Ttatatttatgaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                   GCTGAAATCTTCGGTTTATTTTACAATTATG---------TC---------------T------------------TATTAA-TCTACTG--------------AAATAACTA-AATtctgttcaatttagttatttcagtagattaataagacataattgtaaaataaaccgaagatttcagccaaatttagttaaatgtgaacaaaatattcacattcaaacttggcaaaattttcttttatggttcagtatat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgataatatcccacaggctgacataaacaagcttgtgctctcaatgcgacgttgctgtcaagctgtcgtcactgcacatggcggccacacaggctactgataacccgattttgaaatctatcccttcctgttttaaattcaaatcaaacaattaaattgataatttctgttcaTAATAA--GACA--------------------TAA---T---TGTAAAA-----TAA--A-------CCGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTGAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTGGCAAAATTTTC--TTTTATGGTTCAGTATA-Tcaaatttagttaaatgtgaacaaaatattcacattcaaacttggcaaaattttcttttatggttcagtatat


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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caactcaaacaataaaattgataatttctgtcctA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATCCAAACTTAGCAAAAATTTC--TTTTTTGGTTAAGTTTA-TATcaaatttagttaaatgttaacaaaatattcacatccaaacttagcaaaaatttcttttttggttaagtttatatttattcaaacattgattttcacggtactacttaaacttgtcttagttaagcaggaaggaaatgttctatgtccaaactgctgtgacagttatccatcgtttagtt
gi|11                         :                                                                                                                                                                        caactcaaacaataaaattgataatttctgtcctatttagctatttcagtagattgatcGCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------GATCAA-TCTACTA--------------AAATAGCTA-AATttattcaaacattgattttcacggtactacttaaacttgtcttagttaagcaggaaggaaatgttctatgtccaaactgctgtgacagttatccatcgtttagtt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caactcaaacaataaaattgataatttctgtcctA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATCCAAACTTAGCGAAAATTTC--TTTTTTGGTTAAGTTTA-TATcaaatttagttaaatgttaacaaaatattcacatccaaacttagcgaaaatttcttttttggttaagtttatatttattcaaacattgattttcacggtactacttaaacttgtcttagttaagcaggaaggaaatgttctatgtccaaactgctgtgacagttatccatcgtttagtt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caactcaaacaataaaattgataatttctgtcctatttagctattttagtagattgatcA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------TAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAGCACAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTTGGTTCAGTttattcaaacattgattttcacggtactacttaaacttgtcttagttaagcaggaaggaaatgttctatgtccaaactgctgtgacagttatccatcgtttagtt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                   GCTGAAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------G------------------TATCAA-TATACTA--------------AAATATTTA-AGTaagcaacgtcgcaacttaaatattttagtatattgatacgacataattatacaacaaacagaagatttcagccaaattaagttaaatgataacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttcttttttggttcag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actgaaccaaaaaagaaactttcgctaagtttgaatgtgaatattgtgctaacatttaactaaatttggctgaaatcttctatttgttgtataattatgtctaagcaacgtcgca--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTA-AGTT------AAA----------TGATAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAACTTAGCGAAAGTTTC--TTTTTTGGTTCAGcaaattaagttaaatgataacaaaatattcacattcaaacttagcgaaagtttcttttttggttcag
gi|13                         :                                                                                      actgaaccaaaaaagaaactttcgctaagtttgaatgtgaatattgtgctaacatttaactaaatttggctgaaatcttctatttgttgtataattatgtctaagcaacgtcgcaacttaaatattttagtatattgatacGCTGAAATCTTTCGTTTGTTGTATAATTATG---------TC---------------T------------------TATCAA-TCTACTG--------------AAATAGCTA-AAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaattggCATATGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATGCCtggacagaaattatcgattttattgtttgatttgatgga
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgattaataggcccctgccattcaaagaatggtgattgATTCAAACTTAGGGAAAGTTTC--TTTTTTGGTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                   GCTGAAATCTTCTGTTTATTGTATAGTTATG---------TC---------------T------------------TATCGA-TCTATTG--------------GGATAAATC-AATGATAATATCCCACAGGCTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGTCAATCAGTCATCATCGCACACGGCGGCCACACACGCTACTGATAACCCGATTTTGAAATCCATCCTTTCCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--GACT--------------------TAA---T---TATACAA-----CAT--A-------CAGAAAA-TT--T--------------CAGCCAA------ATTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAACT-----------ATTCACATTCAAACTAAGCGAAAGTATT--AGTTTTGGTTCAGTATA-TATAACCT--GAAAATAACGT-T-TAACCCCAAAAACAAAATAAAATGTTACTGGTGAATCTATTCTTAACTCTTACGATTGATAGGTTCAAGTACTGGTAAGTTTACAGTGAGGGATGTGTCAACCGCATGATATTCAAGCAACGATAAGAAGTCTGTCGCAAGTAAACTCTACCGGTGAGATATCAAACAATAATCTCATAAACTACTTTCATTGAACAACATATATCACAATACTCCGATATATTCACAAAGAAAAATATTCAATAATTGGATTAAAAAAAAATATACAAGCAAAATAGTATCATTTTATATTCGTATTTAACAACAACATAAACACTTTGAGCCATCTTTCCTGAGCTGCAAC-TTTAGTGTTTTCAACCATTTCCGTTTCACCCGTAATAGATAAAAGTACAAATATGTCGATTTTGCGAGAAAAAAAAAGAAAAATCGAATAAGACTAAAATAATCTCAACATTACAAACGTGTCTTTAAAATAAATGATGTGGACTTACTAAATATATTGCATTAAGGTATAAATTCAATTAAGGGATCGTCTATTTTTTCAGCACACTCTAGGCAAAAGATTACTTTTGATAATGGAGCTGATATTTCAAATGAAGGATAATAGTGCTACAATCTAATAAGGTTTATCAGCGTTATCAATTTAATCTGCTTTCTAGAAAAATGGGACAACATGTCCTTTTTACAATTCAAACACCAGATATAGAAACTGTTATGGGAGTGCCAGTTAAAATCATCTCGTTTGATAGAGTAAAGAAATTGCACAAA-AAAAACATTACATTAATATCTTGGCAAATATGGACAAATAAACGCATACAATCAATTTCATTCCAAACTGGGCGAATATACTAAACCAGGGTATGTTTTTTTGTCGTGTGTGCTCTCTGTGCTTCCGAATGTTCATTTTATAAATCGTATTGACTAGCATATTCACCACCCTGTGTTATCTTGGACCTTATGAAATGTTGGTCGTCACTAAAATACCCTGTGTTATTTTGGACCTCATAAAGTGTGGGTCGtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AA--GACA--------------------TAA---T---TATACAA-----CAA--A-------CAGAAGA-TT--A--------------CAGCCAA------AGTT-AGTT------AAA----------TGTTAACAAAAT-----------ATTCACATTCAAAACTAGCAAACGTTTC--TTTTTTTATTCAATATA-TGTA
gi|3                          :                                                                       taatttatgatgtatatacaattacacgataggacaatttaatgcaaagttgttgtattgtaaacattatatatttttaaggtaaagtaaatatatagctgaatttaattggtataatcaatagatagtattatttgaaatgtttggtgtgcataaGCTGTAATCTTCTGTTTGTTGTATAATTATGTCTTATCAATC---------------TACTGAAATAGCTGGTTTATGTCAG-CCTG-TG--------------GGATAAAAA-AATGATAATATCCCACAGGATGACATAAACAAGCTTGTGCTCTTAATACGACGTCGCTGTCAAGCAGTCATCATCGCACGCGGCGGTCACACACGCTACTGATAAGCCGATTTTGAAATCCAT--CTTCCTGTTTTAAATTAAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--TTGA--------------------TAATTTT---TGTCCAA-----TTA--AGCTATTTCAGTAGA-TTAATAAGTCATTATTATACAGCAAATAGAAGATTTCAGCC------AAA----------T-TTAGTAAAATGTTAACAAAAAATTCACATTCAAACTGATCCAAAGTT----TTTTTTGATTCAGTATAGCATA---T-----AATAATAT-TACAAACTTACAAACAAAAGAAAatcaatctactgaaatagctggtttatgtcagcctgtgggataaaaaaatgataatatcccacaggatgacataaacaagcttgtgctcttaatacgacgtcgctgtcaagcagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacgctactgataagccgattttgaaatccatcttcctgttttaaattaaaatcaaacaataaaattgataatttttgtccaattaagctatttcagtagattaataagtcattattatacagcaaatagaagatttcagccaaatttagtaaaatgttaacaaaaaattcacattcaaactgatccaaagttttttttgattcagtatagcatataataatattacaaacttacaaacaaaagaaatcatggctttaaaacggttggtagcataacgtacgggtatggtatacg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctgaactaagatagaaacttttgttaagtttgaatgtgaatattttgttaacttaatttggcagTATCCCACAGACTGACATAAACAAGCTTGTGCTCTCAATGCGACGTCGCTGGCAAACAGTCATCATCGCACGCGGCGGTCACACACACTCTTGATTACCCGATTTTGAAATCTATCCCTTCCTGTTTTTAATTCAA--AG--CAA-ACAATAA-AA--TAGA--------------------TAA---T---Tagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaatttgctatttcaatagattgataagacata
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gi|8                          : ctgaactaagatagaaacttttgttaagtttgaatgtgaatattttgttaacttaatttggcagaaatcgagttatcagtagcgtgtgtggctgccgtgtgcgatgatgactgtttgatagggacgtcgcattgagagcacaagcttgtttatgtcggccagtgggatattttcatttttttatcccacagactgacataaacaagcttgtgctctcaatgcgacgtcgctggcaaacagtcatcatcgcacgcggcggtcacacacactcttgattacccgattttgaaatctatcccttcctgtttttaattcaaagcaaacaataaaatagataatttctgtccaTATCCCACAGGCGGACATAAAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TG--------------GGATAAAAA-AAGGATAATATCCTACAGGCTGACATAAACATGTTTGTATTCTCAATGCAACGTCGCTGTCAGACAGTCATCATCGCACGCAGCGGCCACACACACTACTGATAACCCGATTTTTAAATCCATCCCTTTCTGTTTTAAATTCAA--AT--CAA-ACAATAA-AA--aaaaaaggataatatcctacaggctgacataaacatgtttgtattctcaatgcaacgtcgctgtcagacagtcatcatcgcacgcagcggccacacacactactgataacccgatttttaaatccatccctttctgttttaaattcaaatcaaacaataaaattgatcatttctgtttaatttagctatttcagtagaatgataagacataattatacagcaaacagaagatttcagccaaatttagtttaacttaaatgttaacaaaatattcacattcaaactttgcgaaagtttcttttttttggttcagtttatgattttagaaaaaaatgtgttatatatttatgaa
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                   GCTGAAATCTTCGGTTTATTTTACAATTATG---------TC---------------T------------------TATTAA-TCTACTG--------------AAATAACTA-AATtctgttcaatttagttatttcagtagattaataagacataattgtaaaataaaccgaagatttcagccaaatttagttaaatgtgaacaaaatattcacattcaaacttggcaaaattttcttttatggttcagtatat
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Unaligned ( gi|15 ): TAAATATTAATATCTGCACAATACTAACGTAAATTGGCAAAGACAGTTGTGTATATATGATCGCGGTTAAATAAGAATAATCAGCGAACTTAA
Unaligned ( gi|17 ): TTAAACGCCCTCGTCATTCGAAGAATGGTGATTGGACAATTTGAAAA