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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                     CACATGATGTA--GATTTGC-----TGTGAAGTGCTTT---TATTATTATATGATGTACATTAACCATTGT-TA-TGTAGATTATG-CATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTT-TAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACT--ATATTACGC-GACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGT-AAGAAAGTAT--ATCATATA---ATGAC--ACATCT---TT--AT--C--ATGAT----------TATTA-TAAT-GA--CTACATAA-TATAA--TGGTTAATGTACATCATATAATG-TTAC-A---T------CTATATAATATAATAATAAA-----A--GCAC---ATAACATA--ATGA------CA----C----ACAA--GATATAA-AGATAAA-ACTACATAATATAATGA---A-A---ACAGTC--CATCATATA---ATGAC----ACGTCTTCATGATAATTATAATGGTAAATAA--ATGTAAT-ACA-A--A---C-AT--TG-----TATACAT---CATAATAATGATAAA---TGTACAT---A---TTATC-AT--AAAGAA--C--A-CATA--ATATAAT--AGT-T-AA-TTT---ACA-TAA-TA---TAATG---AAAAAAGT-CT-----TAA-----TATA-ATG--ACAAATCTACGGATTAT--AATGACAATTCTACATAATATCTTAGTAAA---TT-TACA-ATGT---ATGATAAAGAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTA----CATCATATACCAA-GAA---TGAAGGACAGAA--GACAGCTTCCATT
gi|1                          :                                                                                                                                                      ACATGATGTA--GATTTGC-----TGTGAAGTGCTTT---TATTATTATATGATGTACATTAACCATTGT-TA-TGTAGATTATG-CATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTT-TAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACT--ATATTACGC-GACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTACTTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGGTTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACATGGCGCTGTTTTGACTACATAACACAAGT-AAGAAAGTAT--ATCATATA---ATGAC--ACATCT---AC--AT--C--ATGAT----------TATTA-TAAT-GA--CTACATCA-TATAA--TGGTTAATGTACATCATATAATG-TTAC-A---T------CTATATAATATAATAATAAA-----A--GCAC---ATAATGAA--ATGA------CA----C----ACAA--GATATAA-AGATAAA-ACTACATAATATAATGA---A-A---ACAGTC--CATCATATA---ATGAC----ACGTCTTCATGATAATTATAATGGTAAATAA--ATGTAAT-ACA-A--A---C-AT--TG-----TATACAT---CATAATAATGATAAA---TGTACAT---A---TTATA-AT--AAAGAA--C--A-CATA--ATATAAT--AGT-T-AA-TTT---ACA-TAA-TA---TAATG---AAAAAAGT-CT-----TAA-----TATA-ATG--ACAAATCTACGGATTAT--AATGACAATTCTACATAATATCTTAGTAAA---TT-TACA-ATGT---ATGATAAAGAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTA----CATCATATACGAA-GAA---TGAAGGACAGAA--GACAGCTTCCATT
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gi|7                          :                                                                                                                                                 taactATATGATGTA--AATTTGTCTTTATATGATTTGCTTT---TATTATTATTTTATGTATATT------TGT-CA-T------TAT------------TTTATGTACATCCTTCATTATGTT-ATGTAGTCAAT------CATTAACAT-ATATCATGAACACATTTTCGT-TATTACTATATGA--TAGATACTTAAT-TTATGC-GACCTATCATTATTTTGGTCA-TTTA---GGTGGGTTGAaacggttaatgtacatcatataatgttacatctacatactataataataaaatcacataatataatgacaaatatatataatataaagataaaactataataaagaatgcacagtatacaattataaaagcacatcatataatgaaaaagcacatcatataatgaaattaacacatcattttaatggcacatctgcatattataatggaacaaaacacatcataaaatggcatatctgcataatataaaggtttatgtatataaaataataaagaatgtacagcatataacgata
gi|4                          :                                                                                                                                                        ATGATGTGTTAATTT-CATTA-TATGATGTGCTTT---T-TCATTATATGATGTGCTTTTATAATTGTATACTGTGCATTCTT-TATTATAGT-TTTAT---CTTTAT--ATT------ATATA---TATTTGT--------CATTATATTATGTG----ATTT----TATTATTATAGTATGTAGATGTA--ACATTATAT-GATGTA-CATTaa
gi|8                          : taactaaattgtgtacaggatataatgttgatgttttgctacataacgcaatgaaggatataaatgatataatgacaagtttatatttatatttattctatattataataaaggcaaaacatataatggcaacctacatcatataacggttATGATGTA--GATTTGTCATAATATAATGTGC-TT---TATTATTATATGtttaatggcacatctgcatattataatggaacaaaacacatcataaaatggcatatctgcataatataaaggtttatgtatataaaataataaagaatgtacagcatataacgata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                    GTTCTTT---AACTATTATATTATGTACA------------TG-TGT---------CATTA---TA-TGATGTGCTTTTTTCA-T-TG-TAATATG---TGCTT-TAAT-----CATTATATTCTGTACAT--TTT------TTATTATATTATGCAGTTTTTTAATATTATGTAGACG--TCATTctaatgacgtctacataatattaaaaaactgcataatataataaaaaatgtacagaatataatgattaaagcacatattacaatgaaaaaagcacatcatataatgacacatgtacataatataatagttaaagaacataatataacaaaga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      catataataataaagcacattatattatgacaaatctacatcatctTGTTTTG-CTACATAACGCAATG-AAGGATATAA--ATGATATA---ATGAC--AAGTTT---AT--AT--TT-ATATT----------TATT-----------CTATAT---TATAA--TA---AAGGCAAAACATATAATG-GCA--A---C------CTACATCATATAACGGTTAA-----T--GTAC---ATCATATA--ATGT------TA----C----AT---------------------CTACATACTATAATAA---T-A---A-AATCA-CATAATATA---ATGAC----AAATAT--AT-ATAA-TATAAAGATAA--AA--CTATAAT-AAA-G--AATGC-AC--AG-----TATAC-----------AATTATAAA---AGCACAT---C---ATATA-ATG-AAAAAG--C--A-CATC--ATATAATGAAAT-T-AA---C---ACA-TCATTT---TAATG---GCACA--T-CTGCA--TAT-----TATA-ATGGAACAAA---ACACATCATAAAATGGCATATCTGCATAATA------TAAAGG-TT-TATGTATATAAAATAATAAAGAATGTACAGCATATAA-ataatataacaaaga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taactaaattgtgtacaggatataatgttgaTTGACTACATAACATAATG-AAGGATGTAC--ATAAAATA---ATGAC--AAATAT---AC--AT--A--A-AAT----------AATAA-TAA--AA--GCAAATCA-TATAA--AGACAAATTTACATCATATAAcgata
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcaacccacctaaatgaccaaaataatgataggtcgcataaattaagtatctatcatatagtaataacgaaaatgtgttcatgatatatgttaatgaGACTATATCA-ACAAATGAACAAAGTA-----CATA-A---ATAA--------T---CT--A------ATG---------------CA-TAAT-----CTACATAA-CA--A--TGGTTAATGTACATCATATAAT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acatgatgtagatttgctgtgaagtgcttttattAAT-AATAAAGCAC--ATTATATT---ATGAC--AAATCTACATC--AT--CTAATGACGTCTACATAATATTA-AAA--AA--CTGCATAA-TATAA--TAAAAAATGTACAGAATATAATGATTAA-A---G------C-ACATATTACAATGAAAAA-----A--GCAC---ATCATATA--ATGA------CA----CATGTACAT--AATATAATAGTTAAAGA--ACATAATATAACAA---A-G---Atattttaacctgaacattatatcctgtacacaatttgtatattagtatatgatgtagatactatattacgcgacgtatcattgtgtggaccagtttaacgggcgggctaattttaaaagtggaagaagatgcggatattttcaacctataacaaacttcaggattaaatgcatgcagacaaagtccacggcagatactctttaagtacttgaaaagcctgacgacacggaaaaccttggtgtgactacgatagggcagagtgaggttgcgagaagggttgttgaaggcactggcggactcagcacatggcgctgttttgactacataacacaagtaagaaagtatatcatataatgacacatctacatcatgattattataatgactacatcatataatggttaatgtacatcatataatgttacatctatataatataataataaaagcacataatgaaatgacacacaagatataaagataaaactacataatataatgaaaacagtccatcatataatgacacgtcttcatgataattataatggtaaataaatgtaatacaaacattgtatacatcataataatgataaatgtacatattataataaagaacacataatataatagttaatttacataatataatgaaaaaagtcttaatataatgacaaatctacggattataatgacaattctacataatatcttagtaaatttacaatgtatgataaagaacgcacaacatataaaaacataagtctacatacaacatgtataatgaataaagtaaatgatataaaggaacatgtacatcatatacgaagaatgaaggacagaagacagcttccattctc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           catatAAGTATCTATCATATAGTAATAACGAAAATGT---GT---T--C--ATGATATA-------TGTTAATGATTGA--CTACATAA-CATAA--TGAAGGATGTACATAAAATAATG-ACAA-A---T------ATACATAAAATAATAATAAA-----A--GCA-----------A--AT--------CA-----------------TATAA-AGACAAA-TTTACATCATATAA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcaacccacctaaatgaccaaaataatgataggtcgcataaattATATA---ATGAC--AAATCT---AC--AC--A--ATG------------TA--A-AAGT-AAATCTTCATCG-TATAA--TAAAGAATACACAGCATATAAAA-TTAA-G---T------CTACATAATATAATGAAGAA-----A--GTAC---ATAATATA--
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acctaATATA---ATGAC--AAATGT---AT--AAAAC--ATGAT----------TA--A-TAAC-G----TGCATGA-TATAA--TGACGAATGTTCATAATATAA-A-TAAC-AATGTG-----TTACGTGATATGAT--TAAAC----AC-GCAC---GTAATATA--ATAAAGACTGCA----C----ATAACCGATA-----GAGAAT-GC-ACATAATATAGTGACGTA-ATTTACAGT-------A-ATA---ATAAA----A-ATGTACATGATA----TACTGAAAAATGT--ACATAGT-ATA-ATGA---CGAT--TG-----TA--------CATAATTGTGATAAA---CGTTCCTCAGA---ATATA-AT--AAAGGA--TGTA-CATA--ATATAAT--GAA-C-AA-TGT---ACA-GCA-TA---TAATA---AAGAAcaggaaaatgtacgtcatatgccaaaactgaagcacagaagacagcgcttgctttc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gATATA---ATGAC--AAATGT---ATAAAA--C--ATGAT----------TA--A-TAAC-G----TGCATGATTAT-A--TGACGAATGTACATAATATAA-A-TAACAA---TGTG---CTACGTGATATGAT--TAAAC----AT-GCAC---GTAATATA--ATAAAGACTGCA----C----ATAACCGAT-----AGAGAAT-GC-ACATAATATAGTGA---gagacaaactgttattaggtatggacatatatctgtagcataaatcaatgaaccgtatatgacagcactggccttccat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tg----------TATAA-TAAT-AAAGC-ACATTA-TATTA--TGACAAATCTACATCATCTAATG---AC-G---T------CTACATAATAT--TAA-AAA-----A--CTGC---ATAATATA--ATAA------AAAATGT----ACAG--AATATAA-TGATTAA-AGCACATATTACAATGA---A-A---AAAGCA--CATCATATA---ATGAC----ACATGTACATAA----TATAATAGTTAAAGA--ACATAAT-ATA-A--cgtaatttacagtaataataaaaatgtacatgatatactgaaaaatg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caTA-TAGT-AAAACTGCATCG-TATAAAATAG--AATGCATAGCATATAAAG-ATAA-G---T------CTACATAATATAACGAAGAA-----A--GCAT---ATAATATA--Acaaaga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aTGTTCATGATATA-TG-TTA--A---TGATTGACTACATAACATAATGAAGGA-----T--GTAC---ATAAAATA--ATGA------CA---------------AATATAC-A--TAAA-A-----TAATA--ATAA---A-A---GCAA-----ATCATATA---AAGAC----AAATTTACATCATAaggaaagtgcatgtatataccaaacatgaagcacagaagacagctccaggt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcaacccacctaaatgaccaaaataatgataggtcgcataaattaagtatctatcatatagtaataacgaaaatgATATAATG-ACAA-A---T------CTACACAATGTAAAAGTAAATCTTCA--TCGT---ATAATA-A--AGAA------TA----C----ACAG--CATATAA-AATTAAG-TCTACATAATATAATGA---A-G---AAAGTA--CATAATATA---taa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acctaATAGTAAA-----ACTGCATCGTATAAAATAGAATG-------------C----ATAG--CATATAA-AGATAAG-TCTACATAATATAACGA---A-G---AAAGCA--TATAATATA---Acaggaaaatgtacgtcatatgccaaaactgaagcacagaagacagcgcttgctttc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        at--GATATAA-TGACAAA-TGTATAAAACATGATTA---ATA---AC-GTG--CATGATATA---ATGAC----GAATGTTCATAATA----------TAAATAACAATGTGTT-ACGTG--A---T-AT---GAT---TAAACACGCACGTAATA-TAATAAAGACTGCACAT---A-----ACCGAT--AGAGAATGC--A-CATA--ATATAGT--GACGT-AA-TTT---ACAGTA---A---TAAT----AAAAATGTACA-----TGA-----TATA-CTG--AAAAATGTACATAGTAT--AATGACGATTGTACATAAT-TGTGA-TAAACGTTC-CTCA-GAAT---ATAATAAAGGATGTACATAATATAATGAACA-------ATGTACAGCA--TATAATAAAGAAGAGACA-AACTGTTATTAGGTATGGACATATATCTGTAGCATAAATCAATGAACCGTATATGACAGCACTGGC--CTTCCATaggaaagtgcatgtatataccaaacatgaagcacagaagacagctccaggt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATATAA-TAATAAA-GC-ACATTATATTATGA---C-A---A--ATCTACATCATCTA---ATG------ACGTCTACATAAT-ATTAAAAAACTGCAT-A--ATATAAT-AAA-A--A----------A-----TGTACAG---AAT-ATAATGATTAA---AGCACAT---A---TTACA-ATGAAAAAAG--C--A-CATC--ATATAAT--GAC-A-CA-TGT---ACA-TAA-TA---TAATAGTTAAAGAA---CA-----TAA-----TATA------ACAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cTC--TATCATATAGTAATAACGAAAATGTGTTCATGATA--TAT----GTTAATGA--TTG-ACT-ACATA--A---C-ATAATGAAGGATGTACAT---AA-AATAATGACAAA---TATACAT---AAAATAATA-AT--AAA-AG--C--A-AATC--ATATAAA--GAC-A-AA-TTT---ACA-TCA-TA---TAAga
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcaacccacctaaatgaccaaaataatgataggtcgcataaattaagtaA--ATATAATGACA-A--A---------TC-----TACACAA---TGTAA-AA--GTAAA---TCTTCAT---C---GTATA-AT--AAAGAA--T--A-CACAGCATATAA---AAT-T-AAGTCT---ACA-TAA-TA---TAATG---AAGAAAGTACA-----TAA-----TATACAGG--A-AAATGTACG--TCAT---ATGCCAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acctACAT---A---ATGTA-AT--GAAGAATGC--A-CATA--ATATAAT--A-----AA-CTTTCGACA-AGA-TA---TAAT-------AAAGT-TTCGACATAA-----TGTA-ATG--AAGTATCTACAGAATAT--Aaactgaagcacagaagacagcgcttgctttc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttgA--C--AGCATA--AAATGAT--AAT-TTAA-CTG---ATA-TAA-TAGCATAATA---CTAAA-----T-----TAACATTGTATA-ATA--AAGAATGTACAGCATAG--AAAGATAATTCTAACTGATAT-------AA---TTCTACA-TTGT---ATAATAAAGAATGTACA--GTATAG-AAAGATAAGTCTACATA------ATATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAAAG---GAAAATATA----CGTCA------AA-AAA---TGAAGAACAGAG--GACA
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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): ACATAGTATAATGACGATTGTACATAATTGTGATAAACGTTCCTCAGAATATAATAAAGGATGTACATAATATAATGAACAATGTACAGCATATAATAAAGAAGAGACAAACTGTTATTAGGTATGGACATATATCTGTATCATAAATCAATGAACCGTATATGACAGCACTGGCCTTCCAT
Unaligned ( gi|13 ): ATATAATGAACATTGCACAGCATGCCATGACAGGTATACATAATATTATGGTAGCACACAATATAATGAACACTGCACAGCATGCCATGACAGGTATACATAACATACCGGTAGCACACAATAAAA
Unaligned ( gi|15 ): TTTCCACATAATGAAATAAAGAATGCACATAATATAATAAACTTTCGAAACGATATAATTAAGTTTCG
Unaligned ( gi|16 ): TTTCGACATAATATAAAAAAGAATGCACATAATATAATAAACTTTCGACAAGATATAATAAAGTTCC
Unaligned ( gi|17 ): GTTTCGACATTATATAATGAAAAAATGCACATAATATAATAAACTTTCGACAAGA






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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATAGTATAATGACGATTGTACAT----A----------ATTGT---------------GATAAACGTTCC----T-CAGAATATAATAAAGGATGTACATAATATAATGAACAA---TGTACAGCATATAATAAAGAAG-AG----ACAAACTGTTAT----------------TAGG-TATGGACATATATCTGTATCATA-AAT-------CAATGAACCG--T-AT-ATGACAgagacaaactgttattaggtatggacatatatctgtatcataaatcaatgaaccgtatatgacagcactggccttccat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAT--AATGACAAATCTACACAATG--TAAAAGTAAA---TCTTCATCGTATAATAAAGAATACACAGCATATAA------AA--T--TA-------------AGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATAC-AG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------gcactggccttccat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acctaaATA--T-A--GTAAA---ACTGCATCGTATAAAATAGAATGCATAGCATATAA------AG--A--TA-------------AGTCTACATA-A-----TATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAA-AG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATATAATGAACATTGCACAGCATGCCATGACAGG---TATACATAATATTATGGT---A-GC----ACACAATATAATGAA--C----ACTGCACAGCATGCCATGACAGGTATACATAACATAaggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACATAATGTAATGAAGAATGCACATAATATAA---TAAACTTTCGACAAGATATAAT----AAA-GTTTCGACATAATGTAATG-AAGT----ATC-TACAGAATATAccggtagcacacaataaaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttg---TCGACATTATATAATGAAAAAATGC----ACATAATATAATA-A--
gi|2                          : gttACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATT-TTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACT--ATATTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTTTATC-ATG----------ATTAT---------------TATAA---TGAC----TACATAATATAATGGTTAATGTACATCATATAATGTTACA---TCTATATAATATAATAATAAAA-GC----ACATAACATAATG-A--C----A---CACAAGATATAAAGATAAAACTACATAATATAATGAA--AACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--AC-ATTGTATACATCATAATAATGATAAA---TG---TACATATTATCAT--AA-AGAA--C--A-CATAATATAATAGT-TAATTTACA-TAATATAATGA---AA----AAAGT--CTTAATATAATGACAAATCTACGGATTAT--AATGACAATTCTACATAATATCTTA--GTAAA---TTTACAATGTATGATAAAGAACGCACAACATATAA------AA--ACATA-------------AGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAA-AG---GAACATGTACATCATATACCAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATTactttcgacaaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    c--A-CATAATATAATGGT-TAATCTACA-TATTTAAATGA---AA----AATGCA-CATGATATAAAGACAAATTTACAGCATAT--AATGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A--C--AGCATAA---AATGA--TAATTTAAC-TGATATAATAGCATAATACTAAATTAACATTGTATAATAAAGAATGTACAGCATAG--AAAGATAATTCTAACTGATA--T------AAT---TCTACATTGTATAATAAAGAATGTACAG--TATAG------AA--AGATA-------------AGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAA-AG---GAAAATATACGTCA------AAAAATGAA-GAACAG---AGGACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacagcataaaatgataatttaactgatataatagcataatactaaattaacattgtataataaagaatgtacagcatagaaagataattctaactgatataattctacattgtataataaagaatgtacagtatagaaagataagtctacataatataatgaagagagcacaacaaataaaggaaaatatacgtcaaaaaatgaagaacagaggacatcaccggctttcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                  acataatataatggttaatctacatatttaaatgaaaaatgcacatgatataaagacaaatttacagcatataatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtATGTTGATGTTTTG-CTACATAACGCAATGAAGGATATAAATGATATAATGACAAGTTTATATTTATATTTATTCTATATTATAATAAAGGCAAAACATATAA---TGGCAACCTACATCATATAACGGTTAATGTACATCATATAATGTTACA---TCTACATACTATAATAATAAAA-TC----ACATAATATAATG-A--CAAATA---TATATAATATAAAGATAAAACT--ATAATA-AA-GAATGCACAGTATA-CAATT-ATAAAAGCAC---------ATC-A-TATAA-----TGA-AAAAGCACATCATATAATGAA-ATTA-ACACATCATTTTAATGGCACA---TC---TGCATATTATAATGGAACAAAA--C--A-CATCATAAAATGGC-ATATCTGCA-TAATATAAAGG---TT----TATGTA-TATAAAATAATAAAGAATGTACAGCATAT--AACGATAtcaccggctttcc
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gi|7                          :   tATATGATGTAAATTTGTCTTTATATGATTTGCTTTTATTATTATTTTATGTATATT-----------TGT--------CATTAT----TTTATGTACATCCTTCATTATGTT-ATGTAGTCAATCATTAACAT-A------TATCATGAACACATTTTCGT-TATTACTATATGAT--AGATACTTAAT-TTATGCGACCTATCATTATTTTGGTCA-TTTA---GGTGGGTTGAg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATAAT-A---AT----AAAGCA-CATTATATTATGACAAATCTAC--ATCATCTAATGACG--TCTACATAATA--TTA--AAAAA----CTGCATAATATAATAAAAAATGTACAGAATATAATGATTAAAGCACATATTACAATGAAAAAAGC--ACAT-CA-----TATAATGACACA-TG-TA-CA-TAATATAATAGTT-AAAGA---ACATAATATAACAAAGAaa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): TTTCCACATAATGAAATAAAGAATGCACATAATATAATAAACTTTCGAAACGATATAATTAAGTTTCG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acatAATATAATGACAAATCTACACAATG--TAAAAGTAAA---TCTTCATCGTATAATAAAGAATACACAGCATATAA-AAT--TAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATACAG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acctATA--T-A--GTAAA---ACTGCATCGTATAAAATAGAATGCATAGCATATAA-AG--ATAAGTCTACATA-A-----TATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAAAG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATATAATGAACATTGCACAGCATGCCATG-ACAGGTATACATAATATTATGGT---AGCACACAATATAATGAAC----ACTGCACAGCATGCCATGACAG-GTATACATAACATAaggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATAATGTAAT--GA-AGAATGCACATAAT-ATAATA----AACTTTCGACA-AGATA---TAAT----AAAGTTTCGACATAATGTAATGAAGTATCTACAGAATATAccggtagcacacaataaaa
gi|2                          : tttgACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTTTATC-----ATG----------AT----------TAT---------------TATAATGAC----TACATAATATAATGGTTAATGTACATCATATAATG-TTACATCTATATAATATAATAATAAAAGCACATAACATAATG-AC----A---CACAAGATATAAAGATAA-AACTACATAATATAATGAA-A-ACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--ACATTGTATACATCATAATAATGATAAA---TGTACATATTATCAT--AA-AGAA--CACATAAT-ATAATAGT-TAATTT---ACA-TAATA---TAATGAAAAAAGT-----CTTAATATAATGACAAATCTACGGATTATAATGACAATTCTACATAATATCTTA--GTAAA---TTTACAATGTATGATAAAGAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTACATCATATACCAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cACATAAT-ATAATGGT-TAATCT---ACA-TATTT---AAATGAAAAATGC----ACATGATATAAAGACAAATTTACAGCATATAATGA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AG--CATAAAATGATAAT--T-TAACTG---ATA-TAATAGCATAATACTAAATTA----ACATTGTATAATAAAGAATGTACAGCATAGAAAGATAATTCTAACTGATA--T------AAT---TCTACATTGTATAATAAAGAATGTACAG--TATAG-AAAGATAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAAAG---GAAAATATACGTCA------AAAAATGAA-GAACAG---AGGACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacagcataaaatgataatttaactgatataatagcataatactaaattaacattgtataataaagaatgtacagcatagaaagataattctaactgatataattctacattgtataataaagaatgtacagtatagaaagataagtctacataatataatgaagagagcacaacaaataaaggaaaatatacgtcaaaaaatgaagaacagaggacatcaccggctttcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                       acataatataatggttaatctacatatttaaatgaaaaatgcacatgatataaagacaaatttacagcatataatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacTGTTTTG-CTACATAACGCAATGAAGGATATAAATGATATAATGACAAGTTTATATTT----ATATTTATTCTATAT----------TATAATAAAGGCAAAACATATAATGGCAACCTACATCATATAACGGTTAATGTACATCATATAATG-TTACATCTACATACTATAATAATAAAATCACATAATATAATG-ACAAATA---TATATAATATAAAGATAA-AACTATA----ATAAAGAATGCACAGTATA-CAATT-ATAA--AAGCA----CATCATATA--ATGA---------AAAAGCACATCATATAATGAAATTA-ACACATCATTTTAATGGCACA---TCTGCATATTATAATGGAACAAAA--CACATCAT-AAAATGGC-ATATCT---GCA-TAATA---TAAAGGTTTATGT----ATATAAAATAATAAAGAATGTACAGCATATAACGATAtcaccggctttcc
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gi|7                          :    tATATGATGTAAATTTGTCTTTATATGATTTGCTTTTATTATTATTTTATGTATATT------TGTCAT------TAT-----------TTTATGTACATCCTTCATTATGTT-ATGTAGTCAAT-----CATTAACAT-ATATCATGAACACATTTTCGT-TATTACTATATGA--TAGATACT-TAATTTATGCGACCTATCATTATTTTGGTCA-TTTA---GGTGGGTTGAg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATAATAAAGCACATTATATTATGACAAATCTACATCATCTAATG----------ACGTCTACATAATAT---------------TAAAA-AAC----TGCATAATATAATAAAAAATGTACAGAATATAATGATTAAAGC-ACATATTACAATGAAAAAAGCACATCATATAATG-AC----A---CAT-GTACATAAT-ATAATAGTTAAAGAACATAAT--ATA-ACAaa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): TTTCCACATAATGAAATAAAGAATGCACATAATATAATAAACTTTCGAAACGATATAATTAAGTTTCG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACATAGTATAAT-GACGATTGTACATAATTGTGATAAACGT-TCCT------CA-GAATATAATA----AA----GGATGT--ACATAATATAATGAACAATGTACAGCATATAATAAAGAAGAGACAA----AC-TGTTA--TTA--GGTATGGA---CATATATCTGTATCATAAATCAATGAACCGTATATGA-CAGCActc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATATAAT--------GACAAATCTACACAATG--TAAAAG---TAAA---TCTTCATC-GTATAATAAA-GAATACACAGCATATAA-AAT--TAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATACAG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------ctggccttccat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acctATA--T-A--G---TAAA---ACTGCATC-GTATAAAATA-GAATGCATAGCATATAA-AG--ATAAGTCTACATA-A-----TATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAAAG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATATAATGAACATTGCACAGCATGCCATG---ACAGGTATACATAATATTATGGT---AGCACACAATATAATGAAC----ACTGCACAGCATGCCATGACAG-GTATACATAACATAaggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACATAATGTAAT-GAAGAATGCACATAAT----ATAATA----AACTTTCGACA-AGATATAAT------A----AAGTTTCGACATAATGTAATGAAGTATCTACAGAATATAccggtagcacacaataaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttgACATAATATAAA-AAAGAATGCACATAAT----ATAATA----AACTTTCGACA-AGATATAATA----AA----
gi|2                          : tttcgACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTTTATC-AT-----G----------AT----------TAT---------------TATAATGAC----TACATAATATAATGGTTAATGTACATCATATAATG-TTACA--TCTATATAATATAATAATAAAAGCACATAACATAATG-AC----A---CACAAGATATAAAGATAA-AACTACATAATATAATGAA-A-ACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--ACATTGTATACATCATAATAATGATAAA---TGTACATATTATCAT-AAAGAA--CACATAAT----ATAATAGT-TAATTT---ACA-TAATATAATG----AA----AAAAGT---CTTAATATAATGACAAATCTACGGATTATAAT--------GACAATTCTACATAATATCTTA--G---TAAA---TTTACAAT-GTATGATAAA-GAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTACATCATATACCAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATTgttcc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cACATAAT----ATAATGGT-TAATCT---ACA-TATTTAAATG----AA----AAATGC--ACATGATATAAAGACAAATTTACAGCATATAAT--------GA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATGTACAGCAT----AAAATGA--TAATTT---AAC-TGATATAATAGCATAATACTAAATTA--ACATTGTATAATAAAGAATGTACAGCATAGAAA--------GATAATTCTAACTGATA-----------TAAT---TCTACATT-GTATAATAAA-GAATGTACAG--TATAG-AAAGATAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAAAG---GAAAATATACGTCA------AAAAATGAA-GAACAG---AGGACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacagcataaaatgataatttaactgatataatagcataatactaaattaacattgtataataaagaatgtacagcatagaaagataattctaactgatataattctacattgtataataaagaatgtacagtatagaaagataagtctacataatataatgaagagagcacaacaaataaaggaaaatatacgtcaaaaaatgaagaacagaggacatcaccggctttcc
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gi|7                          :     tATATGATGTAAATTTGTCTTTATATGATTTGCTTTTATTATTATTTTATGTATATT------TGTCAT------TAT-----------TTTATGTACATCCTTCATTATGTT-ATGTAGTCAAT-----CATTAACAT-ATATCATGAACACATTTTCGT-TATTACTATATGA--TAGATACT-TAATTTATGCGACCTATCATTATTTTGGTCA-TTTA---GGTGGGTTGAg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATAATAAAGCACATTATATTATGACAAATCTACATC-ATCTAATG----------ACGTCTACATAATAT---------------TAAAA-AAC----TGCATAATATAATAAAAAATGTACAGAATATAATGATTAAA--GC-ACATATTACAATGAAAAAAGCACATCATATAATG-AC----A---CAT-GTACATAAT-ATAATAGTTAAAGAACATAAT--ATA-ACAaa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTTAATGTGAAAGTCTGCATGGAAACATGGTTGTATAGATATGGAAAAAATGTAGAACATGATAACAGTACATGTGCATCGTGACAATAATATTACTTACAGTATACAGACGACACTACGACAAACGGTATCAGGAACCACGGTGACATGACTGCAATAAAACATATATAAAAAAGTAACAT
Unaligned ( gi|15 ): TTTCCACATAATGAAATAAAGAATGCACATAATATAATAAACTTTCGAAACGATATAATTAAGTTTCG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACATAGTATAAT-GACGATTGTACATAATTGTGATAAACGT-TCCT------CA-GAATATAATA----AA----GGA-TGT--ACATAATATAATGAACAATGT--ACAGCATATAATAAAGAAGAGACAA----AC-TGTTA--TTA--GGTATGGA---CATATATCTGTATCATAAATCAATGAACCGTATATGA-CAGCActc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATATAAT--------GACAAATCTACACAATG--TAAAAG---TAAA---TCTTCATC-GTATAATAAA-GAATACACAGCATATAA-AAT--TAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATACAG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------ctggccttccat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acctATA--T-A--G---TAAA---ACTGCATC-GTATAAAATA-GAATGCATAGCATATAA-AG--ATAAGTCTACATA-A-----TATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAAAG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATATAATGAACATTGCACAGCATGCCATG---ACAGGTATACATAATATTATGGT---AGCACACAATATAATGAAC----ACTGCACAGCATGCCATGACAG-GTATACATAACATAaggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACATAATGTAAT-GAAGAATGCACATAAT----ATAATA----AACTTTCGACA-AGATATAAT------A----AAG-TTTCGACATAATGTAATGAAGTATCT--ACAGAATATAccggtagcacacaataaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttg---ACA-TAATATAAAA----AA----GAA-TGC--ACATAATATAAT--AAACTTTCGACAAGATATAAT--------AA-AGTTC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttcg---ACA-TTATATAATG----AA----AAAATGC--ACATAATATAATAAAc
gi|2                          : gtttcgACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTTTATC-AT-----G----------AT----------TAT---------------TATAATGAC----TACATAATATAATGGTTAATGTACATCATATAATG-TTACA--TCTATATAATATAATAATAAAAGCACATAACATAATG-AC----A---CACAAGATATAAAGATAA-AACTACATAATATAATGAA-A-ACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--ACATTGTATACATCATAATAATGATAAA---TGTACATATTATCAT-AAAGAA--CACATAAT----ATAATAGT-TAATTT---ACA-TAATATAATG----AA----AAA-AGT---CTTAATATAATGACAAATCT--ACGGATTATAAT--------GACAATTCTACATAATATCTTA--G---TAAA---TTTACAAT-GTATGATAAA-GAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTACATCATATACCAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATTctttcgacaaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cACATAAT----ATAATGGT-TAATCT---ACA-TATTTAAATG----AA----AAA-TGC--ACATGATATAAAGACAAATTT--ACAGCATATAAT--------GA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATGTACAGCAT----AAAATGA--TAATTT---AAC-TGATATAATAGCATAATACTAAA-TTA--ACATTGTATAATAAAGAATGT--ACAGCATAGAAA--------GATAATTCTAACTGATA--T---------AAT---TCTACATT-GTATAATAAA-GAATGTACAG--TATAG-AAAGATAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAAAG---GAAAATATACGTCA------AAAAATGAA-GAACAG---AGGACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacagcataaaatgataatttaactgatataatagcataatactaaattaacattgtataataaagaatgtacagcatagaaagataattctaactgatataattctacattgtataataaagaatgtacagtatagaaagataagtctacataatataatgaagagagcacaacaaataaaggaaaatatacgtcaaaaaatgaagaacagaggacatcaccggctttcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                acataatataatggttaatctacatatttaaatgaaaaatgcacatgatataaagacaaatttacagcatataatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTTTG-CTACATAACGCAATGAAGGATATAAATGATATAATGACAAGTTTATATTTAT-----ATTTATTCTATAT----------TATAATAAAGGCAAAACATATAATGGCAACCTACATCATATAACGGTTAATGTACATCATATAATG-TTACA--TCTACATACTATAATAATAAAATCACATAATATAATG-ACAAATA---TATATAATATAAAGATAA-AACTATA----ATAAAGAATGCACAGTATA-CAATT-ATAA--AAGCA----CATCATATA--ATGA---------AAAAGCACATCATATAATGAAATTA-ACACATCATTTTAATGGCACA---TCTGCATATTATAATGGAACAAAACACATCAT----AAAATGGC-ATATCT---GCA-TAATATAAAG----GT----TTA-TGT--ATATAAAATAATAAAGAATGT--ACAGCATATAAC--------GATAtcaccggctttcc
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gi|7                          :      tATATGATGTAAATTTGTCTTTATATGATTTGCTTTTATTATTATTTTATGTATATT------TGTCAT------TAT-----------TTTATGTACATCCTTCATTATGTT-ATGTAGTCAAT-----CATTAACAT-ATATCATGAACACATTTTCGT-TATTACTATATGA--TAGATACT-TAATTTATGCGACCTATCATTATTTTGGTCA-TTTA---GGTGGGTTGAg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATAATAAAGCACATTATATTATGACAAATCTACATC-ATCTAATG----------ACGTCTACATAATAT---------------TAAAA-AAC----TGCATAATATAATAAAAAATGTACAGAATATAATGATTAAA--GC-ACATATTACAATGAAAAAAGCACATCATATAATG-AC----A---CAT-GTACATAAT-ATAATAGTTAAAGAACATAAT--ATA-ACAaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTTAATGTGAAAGTCTGCATGGAAACATGGTTGTATAGATATGGAAAAAATGTAGAACATGATAACAGTACATGTGCATCGTGACAATAATATTACTTACAGTATACAGACGACACTACGACAAACGGTATCAGGAACCACGGTGACATGACTGCAATAAAACATATATAAAAAAGTAACAT
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Reference ( family-4955 )     :      NACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTCGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTNNTTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGGTTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCGCTGTTTTGACTACATAACGCAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACANATCTACATC-AT-----G----------AT----------TAT---------------TATAATGAC----TACATNATATAATGGTTAATGTACATCATATAATG-TTACATCTACATAATATAATAATAAAAGCACATAATATAATGAC----ACACAGGATATAANGACAA-ANNTACANAACATAATGAATA-ACAGTNCATCA--T-ATAATGACGCGTNTTCATGATATANTATAACAATGTGNTAAATGAATATGATATAA--ACATTGTACGCATCGTAATAATGATAAAGACTGTACATANTATAAT-GAAGAATGCACATAAT----ATAATGGC-TAATTT---ACA-TAATATAATG----AA----AAA-TGT--ACATAATATAATGAAAAATNT--ACAGNATATAAT--------GACAATTCTACATAATA--TTA--G---TAAA---TCTACATC-GTATAATAAA-GAATGCACAGCATATAA-AAACATAAGTCTACATACA-----TATAATGAAGAA-AG-CA-AA-TGATATAAAG---GAANATGTACGTCATATACCAAAAATGAA-GNACAG---AAGACAG-------CTTCCATT
gi|1                          :       ACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTACTTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGGTTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACATGGCGCTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTACATC-AT-----G----------AT----------TAT---------------TATAATGAC----TACATCATATAATGGTTAATGTACATCATATAATG-TTACATCTATATAATATAATAATAAAAGCACATAATGAAATGAC----ACACAAGATATAAAGATAA-AACTACATAATATAATGAA-A-ACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--ACATTGTATACATCATAATAATGATAAA---TGTACATATTATAAT-AAAGAA--CACATAAT----ATAATAGT-TAATTT---ACA-TAATATAATG----AA----AAA-AGT---CTTAATATAATGACAAATCT--ACGGATTATAAT--------GACAATTCTACATAATATCTTA--G---TAAA---TTTACAAT-GTATGATAAA-GAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTACATCATATACGAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACATAGTATAAT-GACGATTGTACATAATTGTGATAAACGT-TCCT------CA-GAATATAATA----AA----GGA-TGT--ACATAATATAATGAACAATGT--ACAGCATATAATAAAGAAGAGACAA----AC-TGTTA--TTA--GGTATGGA---CATATATCTGTATCATAAATCAATGAACCGTATATGA-CAGCActc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATATAAT--------GACAAATCTACACAATG--TAAAAG---TAAA---TCTTCATC-GTATAATAAA-GAATACACAGCATATAA-AAT--TAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATACAG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------ctggccttccat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acctaATA--T-A--G---TAAA---ACTGCATC-GTATAAAATA-GAATGCATAGCATATAA-AG--ATAAGTCTACATA-A-----TATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAAAG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATAAT-GAACATTGCACAGCAT----GCCATGAC-AGGTAT---ACA-TAATATTATG----GT----A----GC--ACACAATATAATGAACACTGC--ACAGCATGCCAT--------GACAGGTATACATAACA--Taggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aACATAATGTAAT-GAAGAATGCACATAAT----ATAATA----AACTTTCGACA-AGATATAAT------A----AAG-TTTCGACATAATGTAATGAAGTATCT--ACAGAATATAaccggtagcacacaataaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttg---ACA-TAATATAAAA----AA----GAA-TGC--ACATAATATAAT--AAACTTTCGACAAGATATAAT--------AA-AGTTC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttcg---ACA-TTATATAATG----AA----AAAATGC--ACATAATATAATAAAc
gi|2                          : gtttcgACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTTTATC-AT-----G----------AT----------TAT---------------TATAATGAC----TACATAATATAATGGTTAATGTACATCATATAATG-TTACATCTATATAATATAATAATAAAAGCACATAACATAATGAC----ACACAAGATATAAAGATAA-AACTACATAATATAATGAA-A-ACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--ACATTGTATACATCATAATAATGATAAA---TGTACATATTATCAT-AAAGAA--CACATAAT----ATAATAGT-TAATTT---ACA-TAATATAATG----AA----AAA-AGT---CTTAATATAATGACAAATCT--ACGGATTATAAT--------GACAATTCTACATAATATCTTA--G---TAAA---TTTACAAT-GTATGATAAA-GAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTACATCATATACCAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATTctttcgacaaga
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATGTACAGCAT----AAAATGA--TAATTT---AAC-TGATATAATAGCATAATACTAAA-TTA--ACATTGTATAATAAAGAATGT--ACAGCATAGAAA--------GATAATTCTAACTGATA--T---------AAT---TCTACATT-GTATAATAAA-GAATGTACAG--TATAG-AAAGATAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAAAG---GAAAATATACGTCA------AAAAATGAA-GAACAG---AGGACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacagcataaaatgataatttaactgatataatagcataatactaaattaacattgtataataaagaatgtacagcatagaaagataattctaactgatataattctacattgtataataaagaatgtacagtatagaaagataagtctacataatataatgaagagagcacaacaaataaaggaaaatatacgtcaaaaaatgaagaacagaggacatcaccggctttcc
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACATAGTATAAT-GACGATTGTACATAATTGTGATAAACGT-TCCT------CA-GAATATAATA----AA----GGA-TGT--ACATAATATAATGAACAATGT--ACAGCATATAATAAAGAAGAGACAA----AC-TGTTA--TTA--GGTATGGA---CATATATCTGTATCATAAATCAATGAACCGTATATGA-CAGCActc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATATAAT--------GACAAATCTACACAATG--TAAAAG---TAAA---TCTTCATC-GTATAATAAA-GAATACACAGCATATAA-AAT--TAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATACAG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------ctggccttccat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acctaATA--T-A--G---TAAA---ACTGCATC-GTATAAAATA-GAATGCATAGCATATAA-AG--ATAAGTCTACATA-A-----TATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAAAG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATAAT-GAACATTGCACAGCAT----GCCATGAC-AGGTAT---ACA-TAATATTATG----GT----A----GC--ACACAATATAATGAACACTGC--ACAGCATGCCAT--------GACAGGTATACATAACA--Taggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aACATAATGTAAT-GAAGAATGCACATAAT----ATAATA----AACTTTCGACA-AGATATAAT------A----AAG-TTTCGACATAATGTAATGAAGTATCT--ACAGAATATAaccggtagcacacaataaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttg---ACA-TAATATAAAA----AA----GAA-TGC--ACATAATATAAT--AAACTTTCGACAAGATATAAT--------AA-AGTTC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttcg---ACA-TTATATAATG----AA----AAAATGC--ACATAATATAATAAAc
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cACATAAT----ATAATGGT-TAATCT---ACA-TATTTAAATG----AA----AAA-TGC--ACATGATATAAAGACAAATTT--ACAGCATATAAT--------GA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACATAGTATAAT-GACGATTGTACATAATTGTGATAAACGT-TCCT------CA-GAATATAATA----AA----GG-ATGT-ACATAATATAATGAACAATGT--ACAGCATATAATAAAGAAGAGACAA----AC-TGTTA--TTA--GGTATGGA---CATATATCTGTATCATAAATCAATGAACCGTATATGA-CAGCActc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATATAAT--------GACAAATCTACACAATG--TAAAAG---TAAA---TCTTCATC-GTATAATAAA-GAATACACAGCATATAA-AAT--TAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATACAG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------ctggccttccat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acctaATA--T-A--G---TAAA---ACTGCATC-GTATAAAATA-GAATGCATAGCATATAA-AG--ATAAGTCTACATA-A-----TATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAAAG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATAAT-GAACATTGCACAGCAT----GCCATGAC-AGGTAT---ACA-TAATATTATG----GT----A----GC-ACACAATATAATGAACACTGC--ACAGCATGCCAT--------GACAGGTATACATAACA--Taggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aACATAATGTAAT-GAAGAATGCACATAAT----ATAATA----AACTTTCGACA-AGATATAAT-----AA----AG-TTTCGACATAATGTAATGAAGTATCT--ACAGAATATAaccggtagcacacaataaaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttg---ACA-TAATGAAATA----AA----GA-ATGC-ACATAATATAATAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttcc---ACA-TAATATAAAA----AA----GA-ATGC-ACATAATATAAT--AAACTTTCGACAAGATATAAT--------AA-AGTTCctttcgaaacgatataattaagtttcg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttcg---ACA-TTATATAATG----AA----AAAATGC-ACATAATATAATAAAc
gi|2                          : gtttcgACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTTTATC-ATG----------ATTAT---------------TATAATGAC----TACATAATATAATGGTTAATGTACATCATATAATGTTACATCTATATAATATAATAATAAAAGCACATAACATAATGAC----ACACAAGATATAAAGATAAAACTACATAATATAATGAA-A-ACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--ACATTGTATACATCATAATAATGATAAA---TGTACATATTATCAT-AAAGAA--CACATAAT----ATAATAGT-TAATTT---ACA-TAATATAATG----AA----AA-AAGT--CTTAATATAATGACAAATCT--ACGGATTATAAT--------GACAATTCTACATAATATCTTA--G---TAAA---TTTACAAT-GTATGATAAA-GAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTACATCATATACCAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATTctttcgacaaga
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATGTACAGCAT----AAAATGA--TAATTT---AAC-TGATATAATAGCATAATACTAA-ATTA-ACATTGTATAATAAAGAATGT--ACAGCATAGAAA--------GATAATTCTAACTGATA-----------TAAT---TCTACATT-GTATAATAAA-GAATGTACAG--TATAG-AAAGATAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAAAG---GAAAATATACGTCA------AAAAATGAA-GAACAG---AGGACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacagcataaaatgataatttaactgatataatagcataatactaaattaacattgtataataaagaatgtacagcatagaaagataattctaactgatataattctacattgtataataaagaatgtacagtatagaaagataagtctacataatataatgaagagagcacaacaaataaaggaaaatatacgtcaaaaaatgaagaacagaggacatcaccggctttcc
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACATAGTATAAT-GACGATTGTACATAATTGTGATAAACGT-TCCT------CA-GAATATAATA----AA----GG-ATGT-ACATAATATAATGAACAATGT--ACAGCATATAATAAAGAAGAGACAA----AC-TGTTA--TTA--GGTATGGA---CATATATCTGTATCATAAATCAATGAACCGTATATGA-CAGCActc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATATAAT--------GACAAATCTACACAATG--TAAAAG---TAAA---TCTTCATC-GTATAATAAA-GAATACACAGCATATAA-AAT--TAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATACAG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------ctggccttccat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acctaATA--T-A--G---TAAA---ACTGCATC-GTATAAAATA-GAATGCATAGCATATAA-AG--ATAAGTCTACATA-A-----TATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAAAG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATAAT-GAACATTGCACAGCAT----GCCATGAC-AGGTAT---ACA-TAATATTATG----GT----A----GC-ACACAATATAATGAACACTGC--ACAGCATGCCAT--------GACAGGTATACATAACA--Taggt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aACATAATGTAAT-GAAGAATGCACATAAT----ATAATA----AACTTTCGACA-AGATATAAT-----AA----AG-TTTCGACATAATGTAATGAAGTATCT--ACAGAATATAaccggtagcacacaataaaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttg---ACA-TAATGAAATA----AA----GA-ATGC-ACATAATATAATAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttcc---ACA-TAATATAAAA----AA----GA-ATGC-ACATAATATAAT--AAACTTTCGACAAGATATAAT--------AA-AGTTCctttcgaaacgatataattaagtttcg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttcg---ACA-TTATATAATG----AA----AAAATGC-ACATAATATAATAAAc
gi|2                          : gtttcgACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTTTATC-ATG----------ATTAT---------------TATAATGAC----TACATAATATAATGGTTAATGTACATCATATAATGTTACATCTATATAATATAATAATAAAAGCACATAACATAATGAC----ACACAAGATATAAAGATAAAACTACATAATATAATGAA-A-ACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--ACATTGTATACATCATAATAATGATAAA---TGTACATATTATCAT-AAAGAA--CACATAAT----ATAATAGT-TAATTT---ACA-TAATATAATG----AA----AA-AAGT--CTTAATATAATGACAAATCT--ACGGATTATAAT--------GACAATTCTACATAATATCTTA--G---TAAA---TTTACAAT-GTATGATAAA-GAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTACATCATATACCAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATTctttcgacaaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cACATAAT----ATAATGGT-TAATCT---ACA-TATTTAAATG----AA----AA-ATGC-ACATGATATAAAGACAAATTT--ACAGCATATAAT--------GA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATGTACAGCAT----AAAATGA--TAATTT---AAC-TGATATAATAGCATAATACTAA-ATTA-ACATTGTATAATAAAGAATGT--ACAGCATAGAAA--------GATAATTCTAACTGATA-----------TAAT---TCTACATT-GTATAATAAA-GAATGTACAG--TATAG-AAAGATAAGTCTACATA-A-----TATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAAAG---GAAAATATACGTCA------AAAAATGAA-GAACAG---AGGACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacagcataaaatgataatttaactgatataatagcataatactaaattaacattgtataataaagaatgtacagcatagaaagataattctaactgatataattctacattgtataataaagaatgtacagtatagaaagataagtctacataatataatgaagagagcacaacaaataaaggaaaatatacgtcaaaaaatgaagaacagaggacatcaccggctttcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                acataatataatggttaatctacatatttaaatgaaaaatgcacatgatataaagacaaatttacagcatataatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTTTG-CTACATAACGCAATGAAGGATATAAATGATATAATGACAAGTTTATATTTATATTTATTCTATATTATAATAAAGGCAAAACATATAATGGCAACCTACATCATATAACGGTTAATGTACATCATATAATGTTACATCTACATACTATAATAATAAAATCACATAATATAATGACAAATATATATAATATAAAGATAAAACTATA----ATAAAGAATGCACAGTATA-CAATT-ATAA--AAGCA----CATCATATA--ATGA---------AAAAGCACATCATATAATGAAATTA-ACACATCATTTTAATGGCACA---TCTGCATATTATAATGGAACAAAACACATCAT----AAAATGGC-ATATCT---GCA-TAATATAAAG----GT----TT-ATGT-ATATAAAATAATAAAGAATGT--ACAGCATATAAC--------GATAtcaccggctttcc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taactaaattgtgtacaggatataatgttgaGATATAATGACAAATGTATAAAACATGATTAATA-AC-GTGCATGA--T-ATAATGACGAATGTTCATAATATAA-ATAACAATGTGTTACGTGA-TATGAT-TAA--ACA-----CGCA-CGTAATA-TAATAAAGACTGCACATAAC-CGAT-AGAGAATGCACATAAT----ATAGTGACGTAATTT---ACAGTAATA--AT-----AA----AA-ATGT-ACATGATATACTGAAAAATGT--ACATAGTATAAT--------GACGATTGTACATAATT--GTG--A---TAAACGTTCCTCAGA-ATATAATAAA-GGATGTACATAATATAATGAAC---AATGTACA-GCA-----TATAATAAAGAAGAGACA-AACTGTTATTAGGTATGGACATATA--TC-TGTAGCATAAATCAATGAACCGTATATGACAGCACTGGCCTTCCAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GATATAATGACAAATGTATAAAACATGATTAATA-AC-GTGCATGA--TTATA-TGACGAATGTACATAATATAA-ATAACAATGTGCTACGTGA-TATGAT-TAA--ACAT-----GCA-CGTAATA-TAATAAAGACTGCACATAAC-CGAT-AGAGAATGCACATAAT----ATAGTGACGTAATTT---ACAGTAATA--AT-----AA----AA-ATGT-ACATGATATACTGAAAAAT
gi|7                          :      tATATGATGTAAATTTGTCTTTATATGATTTGCTTTTATTATTATTTTATGTATATT------TGTCAT------TAT-----------TTTATGTACATCCTTCATTATGTT-ATGTAGTCAAT-----CATTAACAT-ATATCATGAACACATTTTCGT-TATTACTATATGA--TAGATACT-TAATTTATGCGACCTATCATTATTTTGGTCA-TTTA---GGTGGGTTGAg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATATAATA----AT----AA-A-GC-ACATTATATTATGACAAATCT--ACATCATCTAAT--------GACG--TCTACATAATA--TTA--A---AAAA----CTGCATA-ATATAATAAA-AAATGTACAGAATATAA-TGAT-TAAAGC-ACATAT------TACAATGAAAAA-AG-CA-CA-TCATATAATG---ACACATGTACATAATATA--ATAGTTAAA-GAACAT---AATATAA-------aa


blockSeqs                     :                        CTTTA                                  A           G        G                             A    G           T             T                  C  A             T         A  AT                           G    A                                                                                                            CA                                                                                                               A                                                 T   TTTATTCTATATTATAATAAAGGCAAAACA         AACC                                                                               AAAT             A      A     T  T        TGC  A  C     AT T   AT      TC T   G   ATT     CAATG  G       A   A  A   TG   TTGTAT   T       A       GAC        G A    G      T         TGTG      ACG    A TCG   G     T   AGCAT  TACT  A    G                   G CG    C       AAAGAAGA     A           TTAGGTA        CGTT  A  TCT          T          T      T  GCA            CAACATG            G  A  CA C          TAT                  CC         T C    TAT       CACTGGC
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACATAGTATAAT-GACGATTGTACATAATTGTGATAAACGT-TCCT-------------------------CA-GAATATAATAAAGG-ATGT-ACATAATATAATGAACAATGT--ACAGCATATAATAAAGAAGAGACAA----AC-TGTTA--T--TAGGTATGGA---CATATATCTGTATCATAAATCAATGAACCGTATATGA-CAGCActc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ACCTAATATAATGACAAATCT--ACActggccttccat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATATAAT--------GACAAATCTACACAATG--TAAAAG---TAAA---TCTTCATC-GTATAATAAA-GAATACACAGCATATAA-AA--TTAAGTCTACATA------ATATAATGAAGAA-AG-TA-CA-TAATATACAG---GAAAATGTACGTCATATGCCAAAACTGAA-GCACAG---AAGACAG-------caatgtaaaagtaaatcttcatcgtataataaagaatacacagcatataaaattaagtctacataatataatgaagaaagtacataatatacaggaaaatgtacgtcatatgccaaaactgaagcacagaagacagcgcttgctttc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acctaATA--T---AG---TAAA---ACTGCATC-GTATAAAATA-GAATGCATAGCATATAA-AGA--TAAGTCTACATA------ATATAACGAAGAA-AG-CA-TA-TAATATAAAG---GAAAGTGCATGT-ATATACCAAACATGAA-GCACAG---AAGACAG-------CTCCgcttgctttc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATAAT-GAACATTGCACAGCAT----GCCATGAC-AGGTAT---A-------------------CA-TAATATTATGGTA----GC-ACACAATATAATGAACACTGC--ACAGCATGCCAT--------GACAGGTATACATAACA--T--aggt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aCATAATATTATGGTA------GCACACAATATAAT-GAACACTGCACAGCAT----GCCATGAC-AGGTAT---A-------------------CA-TAACATACCGGTA----GC-ACACAATAAAAaccggtagcacacaataaaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atataatgaacattgcacagcatgccatgacaggtataACATAATGTAAT-GAAGAATGCACATAAT----ATAATA----AACTTTCGA-------------------CA-AGATATAAT-AAAG-TTTCGACATAATGTAATGAAGTATCT--ACAGAATATA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttg---A-------------------CA-TAATGAAATAAAGA-ATGC-ACATAATATAATAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcc---A-------------------CA-TAATATAAAAAAGA-ATGC-ACATAATATAAT--AAACTTTCGACAAGATATAAT--------AA-AGTTCctttcgaaacgatataattaagtttcg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcg---A-------------------CA-TTATATAATGAAAAAATGC-ACATAATATAATAAAc
gi|2                          : gtttcgACATGATGTAGATTTGC-----TGTGAAGTGCTTTTATTATTATATGATGTACATTAACCATTGTTATGTAGATTATGCATTAGATTATTTATGTACTTTGTTCATT-TGTTGATATAGTCTATTTTAACCTGAACATTATATCCTGTACACAATTT-GTATATTAGTATATGATGTAGATACTATA--TTACGCGACGTATCATTGTGTGGACCAGTTTAACGGGCGGGCTAATTTTAAAAGTGGAAGAAGATGCGGATATTTTCAACCTATAACAAACTTCAGGATTAAATGCATGCAGACAAAGTCCACGGCAGATACTCTTTAAGTCATTGAAAAGCCTGACGACACGGAAAACCTTGGTGTGACTACGATAGGGCAGAGTGAGGTTGCGAGAAGGATTGTTGAAGGCACTGGCGGACTCAGCACACGGCACTGTTTTGACTACATAACACAAGTAAGAAAGTATATCATATAATGACACATCTTTATC-ATG----------ATTAT---------------TATAATGAC----TACATAATATAATGGTTAATGTACATCATATAATGTT-ACAT----CTATATAATATAATAATAAAAGCACATAACATAATGAC----ACACAAGATATAAAGATAAAACTACATAATATAATGAA-A-ACAGTCCATCA--T-ATAATGACACGTCTTCATGATA-ATTATAA-----TGGTAAATAAATGTAATACAA--ACAT---TGTATACATCATAATA--ATGATAAA---TGTACATATTATCAT-AAAGAA--CACATAAT----ATAATAGT-TAATTT---A-------------------CA-TAATATAATGAAAA-AAGT--CTTAATATAATGACAAATCT--ACGGATTATAAT--------GACAATTCTACATAATATCT--TAG---TAAA---TTTACAAT-GTATGATAAA-GAACGCACAACATATAA-AAACATAAGTCTACATACAACATGTATAATGAATAA-AG-TA-AA-TGATATAAAG---GAACATGTACATCATATACCAAGAATGAA-GGACAG---AAGACAG-------CTTCCATTctttcgacaaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cACATAAT----ATAATGGT-TAATCT---A-------------------CA-TATTTAAATGAAAA-ATGC-ACATGATATAAAGACAAATTT--ACAGCATATAAT--------GA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AA---TGTACA--GCATAA------AATG---ATAAT----TTAA---C-TGATAT---A--------------------A-TAGCATAATACTAA-ATTA-ACATTGTATAATAAAGAATGT--ACAGCATAGAAA--------GATAATTCTAACTGATA--T---------AAT---TCTACATT-GTATAATAAA-GAATGTACAG--TATAG-AAAGATAAGTCTACATA------ATATAATGAAGAG-AG-CACAA-CAA-ATAAAG---GAAAATATACGTCA------AAAAATGAA-GAACAG---AGGACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtacagcataaaatgataatttaactgatataatagcataatactaaattaacattgtataataaagaatgtacagcatagaaagataattctaactgatataattctacattgtataataaagaatgtacagtatagaaagataagtctacataatataatgaagagagcacaacaaataaaggaaaatatacgtcaaaaaatgaagaacagaggacatcaccggctttcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           acataatataatggttaatctacatatttaaatgaaaaatgcacatgatataaagacaaatttacagcatataatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTACAGGATATAATGTTGATGTTTTGCTACATAACGCAATGAAGGATATAAATGATATAATGAC----Atcaccggctttcc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taactaaattgTGTTTTG-CTACATAACGCAATGAAGGATATAAATGATATAATGACAAGTTTATATTTATATTTATTCTATATTATAATAAAGGCAAAACATATAATGGCAACCTACATCATATAACGGTTAATGTACATCATATAATGTT-ACAT----CTACATACTATAATAATAAAATCACATAATATAATGACAAATATATATAATATAAAGATAAAACTATA----ATAAAGAATGCACAGTATA-CAATT-ATAA--AAGC---------ACATCATATAA-----TGA-AAAAGCACATCATATAATGAAATTAACA----CATCATTTTA--ATGGCACA---TCTGCATATTATAATGGAACAAAACACATCAT----AAAATGGC-ATATCT---G-------------------CA-TAATATAAAGGTTT-ATGT-ATATAAAATAATAAAGAATGT--ACAGCATATAAC--------GATAagtttatatttatatttattctatattataataaaggcaaaacatataatggcaacctacatcatataacggttaatgtacatcatataatgttacatctacatactataataataaaatcacataatataatgacaaatatatataatataaagataaaactataataaagaatgcacagtatacaattataaaagcacatcatataatgaaaaagcacatcatataatgaaattaacacatcattttaatggcacatctgcatattataatggaacaaaacacatcataaaatggcatatctgcataatataaaggtttatgtatataaaataataaagaatgtacagcatataacgata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taactaaattgtgtacaggatataatgttgaGATATAATGACAAATGTATAAAACATGATTAATA-AC-GTGCATGA--T-ATAATGACGAATGTTCATAATATAA-ATAACAATGTGTTACGTG-ATATGAT-TAA--ACA----CG----CA-CGTAAT---ATAATAAAGACTGCACATAAC-CGAT-AGAGAATGCACATAAT----ATAGTGACGTAATTT---A-------------------CAGTA--ATAAT-AAAA-ATGT-ACATGATATACTGAAAAATGT--ACATAGTATAAT--------GACGATTGTACATAATT--G--TGA---TAAACGTTCCTCAGA-ATATAATAAA-GGATGTACATAATATAATGAAC---AATGTACAGC------ATATAATAAAGAAGAGACA-AACTGTTATTAGGTATGGACATATA--TC-TGTAGCATAAATCAATGAACCGTATATGACAGCACTGGCCTTCCAT
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