lowQualScore                  :                                                  5            
lowQualScore                  :                                                  .            
lowQualScore                  :                                                  5            
consensus                     :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTNCATCAACATCAA
Reference ( gi|5 )            :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAA
gi|9                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTAGATCTGTACATCAACATCAA
gi|7                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAATATCAA
gi|2                          :  AAATTATGAATGTATATTCAAGTCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAA
gi|10                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAGTTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|1                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCGTCAACATCAA
gi|12                         : gAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCAGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|11                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATTAACATCAA
gi|8                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCTGTGGATCTGTACATCAACATTA
gi|15                         : gAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGATGGACCTGTACATCAGCATCA
gi|6                          :  AAATTACGAATGTATATTTAAATCAATTACTTCGAGCGGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|13                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTAGTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATCAGCATCAA
gi|3                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGCGGATCTGTTCATTAACACCAA
gi|14                         :  AAATTATGAACGTATATTTAAATTAATTACTTTGAGCGGTGAATCTGTCCATTAACATCAA
gi|4                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTCTGAGCAGTGGATTTGTTCATTAACATCAA
gi|18                         :  AAATTATAAATGTATATTTAAATCTATTACTTTGAGCGGTGGATCTGT
gi|16                         :   AATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTCAGCGGTGGATCTGTACATAAACATCt
gi|17                         :           ATGTATATTTAAATAAATAACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAA

lowQualScore                  :                                                  1            
lowQualScore                  :                                                  .            
lowQualScore                  :                                                  0            
consensus                     :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTNCATCAACATCAA
Reference ( family-480 )      :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTNCATCAACATCAA
gi|1                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCGTCAACATCAA
gi|10                         : gAAATTATGAATGTATATTTAAATCAGTTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|11                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATTAACATCAA
gi|12                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCAGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|13                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTAGTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATCAGCATCAA
gi|14                         :  AAATTATGAACGTATATTTAAATTAATTACTTTGAGCGGTGAATCTGTCCATTAACATCAA
gi|15                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGATGGACCTGTACATCAGCATCA
gi|16                         :   AATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTCAGCGGTGGATCTGTACATAAACATC
gi|17                         :           ATGTATATTTAAATAAATAACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAA
gi|18                         :  AAATTATAAATGTATATTTAAATCTATTACTTTGAGCGGTGGATCTGT
gi|2                          :  AAATTATGAATGTATATTCAAGTCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAAt
gi|3                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGCGGATCTGTTCATTAACACCAA
gi|4                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTCTGAGCAGTGGATTTGTTCATTAACATCAA
gi|5                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAA
gi|6                          :  AAATTACGAATGTATATTTAAATCAATTACTTCGAGCGGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|7                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAATATCAA
gi|8                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCTGTGGATCTGTACATCAACATTA
gi|9                          : gAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTAGATCTGTACATCAACATCAA


blockSeqs                     :                                                  T
blockSeqs                     :                                                  T
blockSeqs                     :                                                  T
blockSeqs                     :                                                  T
blockSeqs                     :                                                  C
blockSeqs                     :                                                  A
blockSeqs                     :                                                  A
blockSeqs                     :                                                  A
blockSeqs                     :                                                  A
blockSeqs                     :                                                  T
blockSeqs                     :                                                  T
blockSeqs                     :                                                  A
blockSeqs                     :                                                  T
blockSeqs                     :                                                  A
blockSeqs                     :                                                  A
blockSeqs                     :                                                  A


blockSeqCons                  :  
originalCons                  :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTNCATCAACATCAA
finalCons                     :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTNCATCAACATCAA

lowQualScore                  :                                                  1            
lowQualScore                  :                                                  .            
lowQualScore                  :                                                  0            
consensus                     :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTNCATCAACATCAA
Reference ( family-480 )      :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTNCATCAACATCAA
gi|1                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCGTCAACATCAA
gi|10                         : gAAATTATGAATGTATATTTAAATCAGTTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|11                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATTAACATCAA
gi|12                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCAGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|13                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTAGTTTGAGCGGTGGATCTGTTCATCAGCATCAA
gi|14                         :  AAATTATGAACGTATATTTAAATTAATTACTTTGAGCGGTGAATCTGTCCATTAACATCAA
gi|15                         :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGATGGACCTGTACATCAGCATCA
gi|16                         :   AATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTCAGCGGTGGATCTGTACATAAACATC
gi|17                         :           ATGTATATTTAAATAAATAACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAA
gi|18                         :  AAATTATAAATGTATATTTAAATCTATTACTTTGAGCGGTGGATCTGT
gi|2                          :  AAATTATGAATGTATATTCAAGTCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAAt
gi|3                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGCGGATCTGTTCATTAACACCAA
gi|4                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTCTGAGCAGTGGATTTGTTCATTAACATCAA
gi|5                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAACATCAA
gi|6                          :  AAATTACGAATGTATATTTAAATCAATTACTTCGAGCGGTGGATCTGTTCATCAACATCAA
gi|7                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTGGATCTGTACATCAATATCAA
gi|8                          :  AAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCTGTGGATCTGTACATCAACATTA
gi|9                          : gAAATTATGAATGTATATTTAAATCAATTACTTTGAGCGGTAGATCTGTACATCAACATCAA