lowQualScore : 111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 111 2222222222222 11111111111111 555555555555555555555555 1 1 2222222222 2222222222 1 444444444444444444444 2 1111 666666666666666 1 1 4444444444444444 22 77777777777777777777777777777777777777777777777 222 33333333333333333 1 111 11 9999999999999999999999999999999 1111111111 1 22222222222222 111 11 111 222222 1 111111 11 1 33333 1 111 3333 22 11 222222 1 22222222222 1 2222222 55555555555555555555555555555 11 1111111 1 1 1 444444444444444 1111 4444444444444444444444444 11 1 1 1 11111111 888888888888888888888888888 11111111111 111 11 111 1111111 111 1 1
lowQualScore : 2 2 2 444 333 2 33 2 888 2 7 4 3 9 3 4 6666666666666 4 55555555555555 888888888888888888888888 2 1 6 9 3 5555555555 5 7777777777 77 1 1 444444444444444444444 6 3 0000 2 222222222222222 3 3 8 3 1 5 9 5 4 4 2 6666666666666666 4 88 55 1 11111111111111111111111111111111111111111111111 444 44 55555555555555555 44 9999 2 0 1 666 2 11 8 2 666 0 11 99 55 4 0 3 1111111111111111111111111111111 1 8888888888 99 1 2 5 5 5 5 3 5 99999999999999 111 4 6 22 88 8 8 222 444444 1 999999 88 7 9 9 4 1 44444 3 3 2 2 5 0 333 3333 3 5 11 3 3 888 8 8 8 33 555555 0 1 5 5 22222222222 0 2 0000000 33333333333333333333333333333 5 33 4 6666666 0 4 1 2 3 0 777777777777777 7777 0 3333 3 4444444444444444444444444 3 55 3 3 1 6 3 44444444 8888 999999999999999999999999999 66666666666 666 44 555 33 66666 2 7 33 111 6666666 33 333 33 3 2 3 8 66
lowQualScore : . . . ... ... . .. . ... . . . . . . . ............. . .............. ........................ . . . . . .......... . .......... .. . . ..................... . . .... . ............... . . . . . . . . . . . ................ . .. .. . ............................................... ... .. ................. .. .... . . . ... . .. . . ... . .. .. .. . . . ............................... . .......... .. . . . . . . . . .............. ... . . .. .. . . ... ...... . ...... .. . . . . . ..... . . . . . . ... .... . . .. . . ... . . . .. ...... . . . . ........... . . ....... ............................. . .. . ....... . . . . . . ............... .... . .... . ......................... . .. . . . . . ........ .... ........................... ........... ... .. ... .. ..... . . .. ... ....... .. ... .. . . . . ..
lowQualScore : 4 4 4 111 555 4 22 4 333 4 9 0 6 6 6 6 0000000000000 4 11111111111111 999999999999999999999999 7 2 6 6 9 0000000000 4 0000000000 99 6 7 666666666666666666666 0 3 6666 5 333333333333333 9 0 7 3 4 0 0 2 1 0 4 8888888888888888 8 22 44 0 00000000000000000000000000000000000000000000000 666 66 33333333333333333 88 4444 9 0 0 777 0 44 8 5 555 4 66 66 55 5 4 4 4444444444444444444444444444444 4 4444444444 22 0 2 0 0 0 0 0 0 44444444444444 999 1 9 33 33 4 1 777 777777 6 444444 00 2 0 6 0 9 77777 9 3 5 7 0 7 777 5555 0 0 88 0 0 444 0 0 0 22 000000 6 0 7 7 33333333333 2 2 8888888 88888888888888888888888888888 4 11 4 1111111 0 2 2 7 0 7 555555555555555 7777 5 8888 6 0000000000000000000000000 6 99 2 2 9 5 9 55555555 5555 333333333333333333333333333 77777777777 000 88 444 99 77777 7 5 77 999 0000000 77 111 77 5 7 4 5 55
consensus : GAGGG-GTG-TT-CAAAAAGTTC---G-N-G-A--A-AATGCTTAT-A-AAT-CTTTATCTGTCATTTGTATGATTTGA-AATTTA-ATTC--NA-AT------AAAGGTCTATAT-ATTC-------T--TT--ATTGATTC---AGA--A--ATCAGC----ACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G---GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---T---TAAT--T--A---TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N-ATCCCGTCCACCTACAGCTCCGGTAC-TTTCATACTGTGACGTCAGTAGAACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTTCACTGTACGCACTGTAT-A-AA--CTAAATCAGAAACTGTNACCACTTCACAATGTCTT-A--AAACATAN-GGTA---A--A--AAA---A---A------GTTTTGC--AA--GAAAACTA----------------CAAT-TTAT----ANATGGTACAACAGATTC--GGCGAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGAAAAAGGCGGACGTCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACGCGTAAGT---A-A-AT---------T-------TA--GCAACTAAACTG-----GAC-GTTTTAACGG-GAA-G-TGNC-TAT--------------TCT-ANTATTACGGATTATTTGAANAN-GCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA------AAGAGATGAGAATGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-ATGGTAAATGTGGTACGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTAAAANCAAACAAATGTCATCAGTTT-G-GAAAAAANCGGCATCCCCATCANCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTNGTGTC-G-TTTT-TACGACGTGNGAAGTGT-TTNTCGAATCATGCCGTACC-TA-TAGGAACTACAATCAAANCT--AACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCTT--TATTATTC--------GTACATTTTTTTGTTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGTAATTTGAGAATGAC-T-ACG-----A--ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTG-AT---------------CC--------G-GTCACGCTTGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAG--------T----TTTAAAGATA-ATTGGTGAAAT----TTA-TAGTACAA--GTTGTCGA-N-ATATGTATTT-ATAT---CA--ATAT-----GAAATAT-TATGATTAAAA--CTG-AAAT------GATAAA--AAAG--TTATA--AATACTT-TCCGCGAACTTTTTGAA-CN-CCCTC
Reference ( gi|1 ) : GAGGG-GTG-TT-CAAAAAGTTC---GAC-G-A--A-AATGCTTAT-ACAAT-CTTTATCTATCATCTGTATGATTTGA-AATGTA-ACTC--TA-GT------AAAGGTCTATAT-ATTC-------T--TC--ATTGATT------A--A--ATAAAT----ACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G---ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A-ATCCCGTCCATCAACAGTTTCGGTAC-TTTCATAATGTGACGTCAGCAGAACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTTCACAGTACGCACTGTATCAGAA--CTAAATCAGAAACCGTGATCAC--CATAATG-----A--AAACATAG-GGTA---A--A--AAA---A---A------GTTTTG---AA--GAAAACTA----------------TAAT-TTAT----ACATGGAACAACAGATTC--AGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGAAAAAGACAGACGGCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATGCATAAG---------T---------T-------TA--GCAACTATACTG-----GAC-GTTTTAACAG-G-A-G-TGAC-TAT--------------TCT-GTTATTACGGATTATTTAAATAG-GCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA------AAGAGAACAGTATTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTATAATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTT-GAAAAAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTC-G-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-TA-TAGGAACTACAATCAAAACT--AATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTATG--TATTATTT--------GTA-ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGTCATTTGAGAATGACTTTATG-----A--ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTG-AT---------------AC--------G-GTCAAACTTGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAG--------T----TTT------------------T----TTT-TAGTTCAA--GTTATCGA-A-ATATGTATTA-ATAT---CA--ATAT-----GAAATAT-TATAATTAAAA--CTA-AAAG------GATAAA--AAAA--TTATA--AATATTT-TCCGCGATCTTTTTGAATCA-CCCTC
gi|2 : GAGGG-GTG-TT-CAAAAAGTTC---GAC-G-A--A-AATGCTTAT-ACAAT-CTTTATCTATCATCTGTATGATTTGA-AATGTA-ACTC--TA-GT------AAAGGTCTATAT-ATTC-------T--TC--ATTGATT------A--A--ATAAAT----ACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G---ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A-ATCCCGTCCATCAACAGTTTCGGTAC-TTTCATAATGTGACGTCAGCAGAACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTTCACAGTACGCACTGTATCAGAA--CTAAATCAGAAACCGTGATCAC--CATAATG-----A--AAACATAG-GGTA---A--A--AAA---A---A------GTTTTG---AA--GAAAACTA----------------TAAT-TTAT----ACATGGAACAACAGATTC--AGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGAAAAAGACAGACGGCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATGCATAAG---------T---------T-------TA--GCAACTATACTG-----GAC-GTTTTAACAG-G-A-G-TGAC-TAT--------------TCT-GTTATTACGGATTATTTAAATAG-GCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA------AAGAGAACAGTATTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTATAATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTT-GAAAAAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTC-G-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-TA-TAGGAACTACAATCAAAACT--AATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTATG--TATTATTT--------GTA-ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGTCATTTGAGAATGACTTTATG-----A--ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTG-AT---------------AC--------G-GTCAAACTTGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAG--------T----TTT------------------T----TTT-TAGTTCAA--GTTATCGA-A-ATATGTATTA-ATAT---CA--ATAT-----GAAATAT-TATAATTAAAA--CTA-AAAG------GATAAA--AAAA--TTATA--AATATTT-TCCGCGATCTTTTTGAATCA-CCCT
gi|5 : GAGGG-GGG-TT-CAAAATGTTC---G-C-G-G--A-AACAATT-T-ATAAC-TTTTTTTTATCATTT
gi|3 : aattgcatcctgtccacccacagctcaagtactttcatgctgtgacgtcagtcgaacattatgacgtcatttgtgacgtcagtacttcttcacggtacgcaatatatattattaagctgtttttacttcacaatgtctttagaacagcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaatatatatcagaaactgtgactaatataatgaaaacatattgtgaaaaatgctttgcagaaaaatactctctttaactagtacaaaagattttaagaagacgtcaattaatcaacgaatatggaaaaaggcggacgtcctgcaacgtaaataaagctagaatcatttctagggcttaaacgattctagatggggatagacgcataagtgacagagataaagcaactaaatttcaaaggagagtgcctattctagtatgacggagtatttgaataagcatcgcattgcagataagtgggggccatggttattttcaaccgaatacacaagaaaagggaatggtggcagcagctacacgatttctaaagaagtatcatggttaatgtggtacgggatatttcaataaaatagtaaaattttgtgagaaatggatatcaaggttagatcctaaaatcaaacatgtgtcatcagtttaaaaaaacggcatcccaatcagcaaagaagctcagcgaagaagcagactagtgtcgctttttacgacgtgtgaagtgtgttgatgaatcatgtcgtaccataataggaactacaaccaactcagactactattcacaggcttgctcagcacaatctttatcatttaaacaaaaaaaatctgctttttttgttttaccaattatttgccggttgttttaatgtaactttgaagtagcgtaatttgagaatgacacgacgttaagcgttttttgacgttgaaccggtcacgctttgaagacgttactaaaataactgtaacattttcagttttaaagattcattgatgaaatttataataaccgttatcgataaatgtatttatagcaatatgaactattatgattaaaactgGAGGG-GTG-TT-CAAAATGTTC---GTG-G-A--A-AATGCTTAT-AAATT-TTTTATCTGTCATCTGTATGATTTTA-AATTTA-A-TC--CATAT------AAAGGCCTATAT-ATTC-------T--TT--ATTGATT------C--ACCAGAAATGGGGATTGTAGTCATACCAGTATTATTTTTACCATAACTACAGTAACGTACAT----------TGACCGTTACTGGATCAGGTTTCATTATTTGC-T-A---GTATT--TTCAAAAATTACTACTATTTTTCCTA---T---TCATAAT--A---TTTTA-ATGCACCA----ATGGATTTTT-G-AAAAAA-TTGC-ATTCCATCCACCTACAGCTCCAGTAT-TTTCATACTGTGACGTCAGTAGAACATTATGACGTTA-TTGTGACATCAATACGTCTTCACTGTACACACTATATC---A--CC-------AAGCTGTTTTCACTTCACAATGTCTTTA--GAACAT-C-GGTACGGA--A--TAA---A---ATTTTGTGTTTTGCAAAA--GAAAATTA----------------g
gi|3 : tGAGGGAGT--TT-CAAAAAGTTT---GCA-G-A--A-AGTATTTAT-A-A---CTTT-TTTATCATTTGTatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaacttattatttgcgggctgttttataattgaaattcaatgtgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaacaaatgataaaaaagttataaatactttctgcaaactttttgaaactccctcgt
gi|15 : tgaggggtgttcaaaatgttcgtggaaaatgcttataaattttttatctgtcatctgtatgattttaaatttaatccatataaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaaaattaatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaacttattatttgcgggctgttttataattgaaattcaatgtgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaGAGGG-ATG-TT-CAAAAAGTTT---GCG-G-A--A-AATGCTTAT-ATAAT-CTTTATCTGTCATTTGTAGGATTTGA-AATGT--ATTCCATA-G-------AATGGTCTATAT-ATTC-------T--TT--ATTGATTCACCAGA--A--ATCAGC----ACT-TAGTGATACTAGTAATATTTTTATCGTTATTGCAGTAACGTACAT----------CGACTGTCACCGGATCACTTTTAATTATTTGG-CAG---GTATT--TTCGAAAACTTCTGCTACTTTACATA---TACATAAC--T------TTTTA-ATGCGCTGTCAAATAGATTTgt
gi|20 : cGAGGG-GTG-TT-CAAACAGTTC---G-C-GAA--A-AATGCTTATAAAAAT-CTTTATCTGTCAATTGTAGGATTTGG-AATTTATTCTT--TA-ATCCAAAAAAAAGTCTACAT-ATTC-------T--AT--ATTGATTCACTAGA--A--ATCAGC----ACTGTAATCGTAGCAGTAACATTT
gi|21 : acGAGGG-GTG-TT-CAAAA---------------------TGCTTAT-AAAAT-CTGTATATGTCATGTGTATGATTTGT-AATTTA-ATCC--TA-AC------AGCGCTCTATAT-ATTC-------T--TT--ATTGAAC------A--ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCCAACTAGTAATATTT-TATCGTTttcgt
gi|23 : cGAGGG-GGG-TT-CAAAAAGTTC---G-C-G-G--A-AAGATTTA----AAA-CTTT-TTTATCATTTatcaca
gi|24 : tttggaaaacaagatatatatcaatatgaaatattatgattaaaactgGAGGG-GTG-TT-GAAAAAGTTC----ACGG-A--A-AATGTTTAT-AAAAT-CTTTATCCATCATATTTACGATTTCATACTGTG-ACAT--CA-GT------Aata
gi|25 : acGAGGG-TTG-TT-CAAAAAGTTTGTAGAC-A-A--ATAATGT--------AT-CTTTGTTTTTCA
gi|9 : ataaAGGG-TTG-TT-CAAAATGTTC---GTG-G-G--A-AATGCTTAT-A-GATACTTTAACTGCCATTTGTATGATTTAA-AATTTA-ATCC--AA-AC------ATAGGTCTATAT-ATTCATTATTTT--TC--ACTAA--------A--A--ATCAAC----ACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGCATCTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCTCAGGGTCACTTTTCGTTATTTGGAA-G---GTATT--TTTGAAAATCGCTACCTCTTTACATATTCT---TAAC--T------TTTTA-ATGTGCTG----ATG------C---------------ATCCCGTCCACCTAAAG-CTCAGTAC-TTTAATTCTGTGAAGTCAGTAGAACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAGTACGTCTTCACTGTACACACGGTAT----A--TT--ACC--AAGCTGTTTTCACATCACAATGTCTTTA--GAAC--AGCGGTA---AGGA--ATA---A---A------ATTTTG---gtttttaatcaatttg
gi|4 : GGG-GTG-TT-CAAAATGTTC---GAG-G-A--A-AATGCTTTT-AAAAT-CTTTATCTGTAATTTGTTTGATTTGA-AATTTA-ATTC--AA-AC------AAAGATCTATACCAGTC-------TAATCTAATTTACA------AGTA--ATAAGC----ACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTTTCGTTACCTCAGTAACGTACAT----------TGACCGTCGCCGGATCACTTTTCGTTATTTGGCT-G---GTATTATTTGGAAGTTTGCTACTACTTTACATA---C---TCAT--A--ACT-TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATCCTT-GTAAAAAA-T--GCACCCCATCTACCTACTGCTCCAGTAC-TTTCATAATGTGACGTCAGTAGAACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTTCTTTGTAAACATTGTAT----A--TTA---CA-AAGCTGTTTTCACTTCACAATGTCTTTA--GAAC-TGC-GGTA---A--G--GAATACA---ATTTTTTGTTTTGCAAAA--GAAAACTA-----------------AAT----------CA-GAAACTGC-GACT---AACAA---CAT-AA--AAACAA-----ATGGCAAA--ACA---GGTCTGCAG----AAAAC-TGC--AACTGATAAATGGTACAAAA--GATTC-----GGCGA-AG--GCGTCAG---------T---------T-------------AACTA-ACCGATTTAGAC-TTTTAAACGG-GAA-G-TTCC-TGC--------------CTT-AGTATTAT-GATTATTTGAA-AGTGTGTCG-GTTGCAGCTTGGCGGGATGCCATGGTTACGTTCAAGCGAATACA------AAGAGATAGGAATGGCGGCTGCTAGACGATTTCTAAAGAA--AT-ATGGTAAATGTGGTATGAGATATTAAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCGGTATCAACATTCCATCCCAAT----AACAAATGTTATCAATTTCG--AAAATACCGG------------CAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGATTTTTGTCGG-TTTC-TAAGACGTGGGAAGTGTCTT---GACTTATGCCGTACC-TA-TAGGAACTACAATT--AACTTCAACAACCATTCAAAGACATGC---ACACAATCTT--AATTATTC--------ATACATTT-----TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCGGGCTGTTTTATATTTATAATACAATGTGACTTTAAAGTAACGTAATTTGAGAATGAC---ATG-----AC-GTTGATAAATTAAGCGTATTTTGACGTTG-AT---------------CC--------G-GTCACGCTTGGTAGGCGTTACTTAAATTACCGTAATATTTTGAG--------T----TTTAAAGATAAATTTGTGAA-T----TTTGTAGTACAT--GTTGTCGA-T-ATATGTATTT-ATGT---CA--ATAT-----GAAAAAT-TATGATTAAAA--CTG-AAAT------GA-AAA--AAA-------A--AATACTT-TCCGCGAGCTTTTTGAAACC-CCCTtgtttgcataagaatgcttaatcagaaactgtcaagagcgttatggaaacatatggcgaaaaagctttacagaaaactgcaatttataaatggtacacgaattcggcgaaggcgtca
gi|10 : acgtGGG-GT--TT-CAAAAAGTTC---G-C-G-G--A-AATTATT-T-ATAA--CTTT-TTTATCATTT
gi|12 : gtacctattgtaactacaagcaattccaactacttttcaaaggcatacacaacacaattttcattatccatacatttttttctgtttgtgtaactatttatttgcgggttgttttataattgtaatacaatgtgacattgaagtaacgtaatttgaaaatgacatgacgttaattaattaagcgtattttgacgttgatccagtcatgcttggaaggcattactaaaattacggcaactttttttgttttaaagatacattggtcacatttatagtacaagttgcaaatatatgtacttatatcaatatgaaatattatgattaaaactgGGG-AT--TT-CAAAAAGTTC---GCG-G-A--A-AGTATTTAT-A-A---CTTT-TTTATCATTTct
gi|7 : ttatgccttacctataggaactacagtcagcttcagctactattcaaaggcatgcacgatacaatctttattattctaacatttttttctgtgtgtttgtttaactaattatttgtgggctaatacaatgtaactttgaagcaacgttatttgaaaatgacatgatgttaactgattaagttgatcaggttatgcttggaaggcattactaaaattactgtaacattttcagttttaaaaataaattggtgaaatttgtagtacatgttgtcgatatatatgtatttatatgaatatgaaatattatgataaaaactgGGG-ATG-TT-CAAAAAGTTC---GCG-G-A--A-AATACTCAT-AAAAT-CTTTATCTGTTGTCTATACGTTTTAA-AAT-----TTC--------------AAGGTCTCTAT-ACTC-------A--TT--ATTGATTTTACAGA--C--ATCAGT----AGTGTAGTCATGCTAATAATAGTTTTATCAATATTACAGTAACGTACATCGACCTTCACCGACCGTCACCGGATCACTTTTCGT--TTTAT-T-GCATATATT--TTCGAAAATTGCTACAACTTTACATG---G---TCAT--TTCA---TTTT-TACTTGCTG----ATGGATTTTC-TT-ACAAATT--ATATCCCGTCC
gi|2 : GG-GTGATT-CAAAAAGATC---GCG-G-A--A-AATATTTAT---AAT-TTT--TTTATCCTTT---TAGTTTTA-ATTATA-Agcgtctgaagaaccctatagcataatttgtcacatcgatacgtcttcactaaacgcaccgtatattatcaagctgtttttacttcacagtgtcttaagaacagtggtacgcaatgaaaattgagttttgcaaataaaaactaaaccagaaactttgactaccattatgaaaacatatggtgaaaatatatggctttaaggaaaggtgataaatgataaaacagattcagcaaaggtgtcaattaaccaacatacataggagaaaacgtacgttatacaacatcaaaaattgctagaatcatttccagggcttaaaaaattgtatacgcataagtaatagagatttagcagctaaactggacatttgaacgggaagtgactattctattattacggatcatctgaat
gi|17 : gaggggtgttcaaaaagttcgacgaaaatgcttatacaatctttatctatcatctgtatgatttgaaatgtaactctagtaaaggtctatatattcttcattgattaaataaatactgtagtcataccaatactatttatatcgtttctacagtaacatacatcgaccgtcaccggatcactttttgttatttagtgatattttcgaaaattgctaatattttacatgctaattattttatatgcactgatggattttcgtaacaaataatcccgtccatcaacagtttcggtactttcataatgtgacgtcagcagaacattatgacattatttgtgacgttaacacgtcttcacagtacgcactgtatcagaactaaatcagaaaccgtgatcaccataatgaaaacatagggtaaaaaaaagttttgaagaaaactataatttatacatggaacaacagattcagcaaaggcgtcaattaaccaacggacatggaaaaagacagacggcctgcaacgtcaaaagcgctagaatcatttctaggaccaaagcgattccagatagagatagatgcataagtttagcaactatactggacgttttaacaggagtgactattctgttattacggattatttaaataggcgtcatgtttcatcttaatggtttcgatatttactttcaagcgaatacaaagagaacagtattgcggcggctacacgactgctaaagaactataatggtaaatgtggtatgaaatatctagataaaatagtgacagttgatgagacatgggtaacaatgttcgatcctgacaccaaacaaatgttatcagtttgaaaaaaaaacggcatccccatcaccaaagtcgcttagcaaagaagcaaactagtgtcgtttttacgacgtgcgaagtgtattatcgaatcattccgtacctataggaactacaatcaaaactaattacttttcaaaggcatgcacaacacactatgtattatttgtaatttttttgttttctctttgtttatttaaacaactatttgcgggttgttttataattttaataccatgtagcattgaaataatgtcatttgagaatgactttatgaattgattaagcctaatttgacgttgatacggtcaaacttggtatgctttactcaaattacggtaacatttttagtttttttttagttcaagttatcgaaatatgtattaatatcaatatgaaataGG-GTG-TTTCAAAAAGTTC---G-T-G-AACA-AATATTTAT---AAC-TTTTTTTTATTAt
gi|16 : tctgtttgtttaacaaattattcgcgttttttttataactgttatacgatgtgacttttaagtaacgtaatttaagaatgacattacgtttattaattaaacatattttgacgttgatccgcttggtaagcattattaaaatcgcagtaacattttcagtttaaaatatacatttatatcaatatgaactattatgattacaactgaacATTTGA-AATTTA-ATCC--AA-AT------AAAGGTCTATAT-ATCT-------T--TT--ATTGAGTCACTAGA--A--ATCAGC----ACTGTAGTCGTACCAGTTATATTTTTATCGTTACTACAGTAATGTACAT----------TGACCGTCACCAGATCACTTTTCGTTATTTGA-CAG---GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTATATA-------TAAA--T--AACTCTTTA-ATGCTCTG----ATG------C---------------ACCCTGTCTACCTGCAGCTACGGTACTTTTCATACTGTGATGTCGGTAGAACATTATGATGTTATt
gi|11 : a----ATGGATTTTTTGTAA-AAA-TTGC-ATCTCACCCACCTACAGCTCCAGAAC-TTTCATACTGTGACCCCAGTAGAATGTTATGACATTATTTGTGACGTCAATACATCTTCACTGTGCACACTGTAT----A--TT--GCC--AAACTTT--TCACTTTACAATGTCTT-A--AGA-ACAGCGGTATGGA--A--TAA---A---ATTTTGTGTTTTGCAAAA--GAATACTAAATCAGAAACTGTGACTAACATTATGAAAACATATGGCGAAACATCC--GGCGAAGGTGTCAGTTAGCCAACAGACATGGAAAAAGGCAGATG
gi|5 : -ATCCTGTCCACCCACAGCTCAAGTAC-TTTCATGCTGTGACGTCAGTCGAACATTATGACGTCATTTGTGACGTCAGTACTTCTTCACGGTACGCAATATATtcgtgtgctttggttactttcaagcgaatacaaagagatgagaatggagatgctagaagatttctaaagaaacat
gi|8 : aattgc-TTTCATACTGTGACATCAGTAAAACATTATGACAATATTTGTGACATCAATACGACTTCACTGTACACACTGTAT-ATGA--CT-------AAGCTGTTTTCACTTTACAATGTATTTA--GAAC--AGCGGTACGGA--A--TAA---A---ATTTTGTGTTTTGCAAAA--GAAAACTA-----------------AAT-attattaagctgtttttacttcacaatgtctttagaacagcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaatatatatcagaaactgtgactaatataatgaaaacatattgtgaaaaatgctttgcagaaaaatactctctttaactagtacaaaagattttaagaagacgtcaattaatcaacgaatatggaaaaaggcggacgtcctgcaacgtaaataaagctagaatcatttctagggcttaaacgattctagatggggatagacgcataagtgacagagataaagcaactaaatttcaaaggagagtgcctattctagtatgacggagtatttgaataagcatcgcattgcagataagtgggggccatggttattttcaaccgaatacacaagaaaagggaatggtggcagcagctacacgatttctaaagaagtatcatggttaatgtggtacgggatatttcaataaaatagtaaaattttgtgagaaatggatatcaaggttagatcctaaaatcaaacatgtgtcatcagtttaaaaaaacggcatcccaatcagcaaagaagctcagcgaagaagcagactagtgtcgctttttacgacgtgtgaagtgtgttgatgaatcatgtcgtaccataataggaactacaaccaactcagactactattcacaggcttgctcagcacaatctttatcatttaaacaaaaaaaatctgctttttttgttttaccaattatttgccggttgttttaatgtaactttgaagtagcgtaatttgagaatgacacgacgttaagcgttttttgacgttgaaccggtcacgctttgaagacgttactaaaataactgtaacattttcagttttaaagattcattgatgaaatttataataaccgttatcgataaatgtatttatagcaatatgaactattatgattaaaactgaaatgataaaaaaaagttataaattgtttccgcgaacattttgaacccccctcg
gi|7 : CGTCTGAAGAACCCTATAGCATAATTTGTCACATCGATACGTCTTCACTAAACGCACCGTAT----A--TT--ATC--AAGCTGTTTTTACTTCACAGTGTCTT-A--AGA-ACAGTGGTACGCA--ATGAAA---ATTGA------GTTTTGC--AAATAAAAACTA----------------cagaaactgtgactaacattatgaaaacatatgacggaaaagctttgcagaaaactgcaatttataaatagtacaacagattcggtgaaggcatcagttaaccaacagacatggaaaaaggcagacgtcctgcaacgtcaaaaacgtcagaatcatttctagggccaaactgactctagatggggattgacgcctaagtgtgacatatttagcaactaaactgaacagttttacaggaagtgcattttctagtattacggattatttgaaaatgcatcgcatatcagctaggtgggtgccatggttactttcaagcaaatacaaagagatgagaatggcagcagctacacaatttctaaagaaatatggtaaatgtggtacgagatatctaaataaaatggtgacagttggtgagacatgggtatcaacgttcgatcctaaaaacaaacaaatgtcatcagtttggaaaataccggcatcccc
gi|9 : gggatgttcaaaaagttcgcggaaaatactcataaaatctttatctgttgtctatacgttttaaaatttcaaggtctctatactcattattgattttacagacatcagtagtgtagtcatgctaataatagttttatcaatattacagtaacgtacatcgaccttcaccgaccgtcaccggatcacttttcgttttattgcatatattttcgaaaattgctacaactttacatggtcatttcatttttacttgctgatggattttcttacaaattatatcccgtccgTGCATAAGAATGCTTAATCAGAAACTGTCAAGAG--CGTTATG-----G--AAACATAT-GGCG---A--A--AAA--------------GCTTTA---CA--GAAAACTG----------------CAAT-TTAT----AAATGGTAC-ACGAATTC--GGCGAAGGCGTCAaaccagaaactttgactaccattatgaaaacatatggtgaaaatatatggctttaaggaaaggtgataaatgataaaacagattcagcaaaggtgtcaattaaccaacatacataggagaaaacgtacgttatacaacatcaaaaattgctagaatcatttccagggcttaaaaaattgtatacgcataagtaatagagatttagcagctaaactggacatttgaacgggaagtgactattctattattacggatcatctgaat
gi|7 : agggttgttcaaaatgttcgtgggaaatgcttatagatactttaactgccatttgtatgatttaaaatttaatccaaacataggtctatatattcattatttttcactaaaaatcaacactgtagtcataccagtaatatttttatcgcatctacagtaacgtacatcgaccgtctcagggtcacttttcgttatttggaaggtatttttgaaaatcgctacctctttacatattcttaactttttaatgtgctgatgcatcccgtccacctaaagctcagtactttaattctgtgaagtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcagtacgtcttcactgtacacacggtatattaccaagctgttttcacatcacaatgtctttagaacagcggtaaggaataaaattttgtgttATAAAAA--CTAAACCAGAAACTTTGACTAC--CATTATG-----A--AAACATAT-GGTG---A--A--AAT---ATATG------GCTTTA---AG--GAAAGGTG-----------------------AT----AAATGATAAAACAGATTC--AGCAAAGGTGTCAATTAACCAACATACATAGGAGAAAACGTACGTTATACAACATCAAAAATTGCTAGAATCATTTCCAGGGCTTAAAAAATT----------GTATACGCATAAGTAATAGAGAT---------T-------TA--GCAGCTAAACTG-----GAC-ATTTGAACGG-GAA-G-TGAC-TAT--------------TCT-ATTATTACGGATCATCTGAAT
gi|6 : gggatgttcaaaaagttcgcggaaaatactcataaaatctttatctgttgtctatacgttttaaaatttcaaggtctctatactcattattgattttacagacatcagtagtgtagtcatgctaataatagttttatcaatattacagtaacgtacatcgaccttcaccgaccgtcaccggatcacttttcgttttattgcatatattttcgaaaattgctacaactttacatggtcatttcatttttacttgctgatggattttcttacaaattatatcccgtccgcgtctgaagaaccctatagcataatttgtcacatcgatacgtcttcactaaacgcaccgtatattatcaagctgtttttacttcacagtgtcttaagaacagtggtacgcaatgaaaattgagttttgcaaAAAA--CTTAACCAGAAACTGTGACTAA--CATTATG-----A--AAACATAT-GGTG---G--A--AAA---G------------CTTG---AC--GAAAACTG----------------CAAT-TTAT----ACATGGTACAACAGATTC--GGCGAGGGCGTCAATTTACCAACGGGTATGGGAAAAGACGGACGTCTTGCAACGTCAAAAG-TGTTAAAATCATTTCTAGGACCAAAATGATTCTTGATGGGGATAGATGCATAAG----------------------------A--G-----ATA--GA----GAC-ATAACAACGG-G-AAG-TGAC-TATATACGAGTTTATATTCT-ACAATTACGGATTATTTGAATAC-GTGTCATGTTACGTCTTGCTGGG-TGCCATAGTTACTTTTAATGGAATACA------GAGAGAAGAGTACTACGGC---TACGTGCTTTATAAAGAACTA--A-GGTAAATGTGGTATGAGATATTTAACTAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGTGTATCGACATTCGATCCCGAAACCAAACAAATGCCATCATTTT-GGGGGAAAAACGACATCTCCATCACCAGAGAAGCTCAGCAAAGAAGCAGATTTGTGTC-G-TTTTCTACGAAGT----AATG---TCTCAAATCATGCCGTACC-TG-TATGAACTACAATCAAATCC--AACTACTATTCAAAGACATGCGCAACAAAATATACTTATTATTT--------GTA-CAGTTTTTGTTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGTAGGTTGTTTTATAATTGTAATACCATGTGACTTTGAAATAACGTAATTTGAGAATGCC---ATGCCCTTA--ATTA----ATTCCGCGTGTTTTGACATTGTCC---------------GC--------G-GTCACGCCTGCTAAGC
gi|8 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagAAAA--CTAAATCAGAAACTGTGACTAA--CATTATG-----A--AAACATAT-G--A---C--G--GAA---A---A------GCTTTG---CA--GAAAACTG----------------CAAT-TTAT----AAATAGTACAACAGATTC--GGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATGGAAAAAGGCAGACGTCCTGCAACGTCAAAAA-CGTCAGAATCATTTCTAGGGCCAAACTGACTCTAGATGGGGATTGACGCCTAAGTGTGACATAT---------T-------TA--GCAACTAAACTG-----AACAGTTTT-ACAG-GAA-G-TGCA-TTT--------------TCT-AGTATTACGGATTATTTGAAAAT-GCATCGCATATCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCAAATACA------AAGAGATGAGAATGGCAGCAGCTACACAATTTCTAAAGAA--AT-ATGGTAAATGTGGTACGAGATATCTAAATAAAATGGTGACAGTTGGTGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTAAAAACAAACAAATGTCATCAGTTT-G-GAAAATACCGGCATCCCCgtgtatttatatcgctaataaatagtatgactaaaactgaaaggacaaaaaagttataaatagtatccgaacttttttcaaatcctcctcg
gi|5 : tttcatactgtgacatcagtaaaacattatgacaatatttgtgacatcaatacgacttcactgtacacactgtatatgactaagctgttttcactttacaatgtatttagaacagcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagTATATCAGAAACTGTGACTAA--TATAATG-----A--AAACATAT-TGTG---A--A--AAA---T----------GCTTTG---CA--GAAAAATA----------------CTCT-CTTT----AACTAGTACAAAAGATTTTAAG--AAGACGTCAATTAATCAACGAATATGGAAAAAGGCGGACGTCCTGCAACGTAAATAA-AGCTAGAATCATTTCTAGGGCTTAAACGATTCTAGATGGGGATAGACGCATAAG---------T---------GACAGAGATAAAGCAACTAAA-------------TTTCAAAGGAG-A-G-TGCC-TAT--------------TCT-AGTATGACGGAGTATTTGAATAA-GCATCGCATTGCAGATAAGTGGG-GGCCATGGTTATTTTCAACCGAATACACAAGAAAAGGGAATGGTG--GCAGCAGCTACACGATTTCTAAAGAAGTATCATGGTTAATGTGGTACGGGATATTTCAATAAAATAGTAAAATTTTGTGAGAAATGGATATCAAGGTTAGATCCTAAAATCAAACATGTGTCATCAGTTT----AAAAAAACGGCATCCCAATCAGCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTC-GCTTTT-TACGACGTGTGAAGTGTGTTGATGAATCATGTCGTACCATAATAGGAACTACAACCAACTCA--GACTACTATTCACAGGCTTGCTCAGCACAATCTT--TATCATTTAAACAAAAAAA-A----TCTG------CTTTTTTTGTTTTACCAATTATTTGCCGGTTGTTTTA-------------ATGTAACTTTGAAGTAGCGTAATTTGAGAATGAC---ACG-----A----CG-----TTAAGCGTTTTTTGACGTTG-AA---------------CC--------G-GTCACGCTTTGAAGACGTTACTAAAATAACTGTAACATTTTCAG--------T----TTTAAAGATTCATTGATGAAAT----TTA-TAAT--AACCGTTATCGA-T-AAATGTATTT-ATAG---CA--ATAT-----GAACTAT-TATGATTAAAA--CTG-AAAT------GATAAA--AAAAAGTTATA--AATTGTT-TCCGCGAACATTTTGAACCC-CCCTC
gi|3 : aattgcatcctgtccacccacagctcaagtactttcatgctgtgacgtcagtcgaacattatgacgtcatttgtgacgtcagtacttcttcacggtacgcaatatatattattaagctgtttttacttcacaatgtctttagaacagcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaataAATCAGAAACTGTGACTAA--CATTATG-----ACCACACATAG-C---------A--AAA---A---A------TCTTTG---CA--GAACACTG----------------CAAT-TTAT----ATATGGTACAAAAGATTC--TGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATAGAAAAAGA-------------ATAT--------GCTAGAACCATTTCTAGGGCCAAAATGATTCTAGAAGGGGAAAGACGCATAAG---------TGTTACAGATT-------TA--GCAACTGAACTG-----GAC-AGTTTAATGG-G-A-AACGCC-TAT--------------TCTAGTT-TTACGGATGTTTTGAAAAT-GCGTCGCTTTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGTTAATGCA------AAGAGATGAGAATGGTGGCGGCT-CACGATTTCTAAAGAA--ATA-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACAT-CATATCAACGTTAGATCATAAAAACAAACAAATGTTATCAGTTT-G-GAATAAACCAGCATCCCCATCAACAAAGAAGCTCAGAGAAGAAGCAGA-------T-G-TTTC-TACGATGTTGGAAGTG---TCTCGACTTATGCCATACC-TA-TAGTAACTAC-ATC--AACT--------------------TGCACAACACAATCTT--TATTATTC--------ATACATTTTTTT--------TCTGTTTCTTTAACTTATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGAAATTCAATGTg
gi|14 : tgaggggtgttcaaaatgttcgtggaaaatgcttataaattttttatctgtcatctgtatgattttaaatttaatccatataaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaaaattCAATGGACATGGAAAAAGGCGGACGTCCTGCAACATCAAAAAACGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGAGATAGACGCGTACGTGTTACATAT---------T-------TA--GTAACTAAATTG-----GAC-AGTTTGACGG-G-A-A-GAACATAT--------------TCT-AGTATTACAGATTATTTGAAAAT-GCGTCGCGCTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATAGATTCTTTCAAGCAAATACAC-----GAGCGATGAGAATGGCGGCGGCCACACGATTTCTAAAGAA--AT-ATGGTAAATGTGGTATGAGATATgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaacaaatgataaaaaagttataaatactttctgcaaactttttgaaactccctcgt
gi|11 : TTACTTTCAAGCGAATACA------AAGAGATGAGAATGGAGAT-GCTAGAAGATTTCTAAAGAA
gi|12 : atggattttttgtaaaaattgcatctcacccacctacagctccagaactttcatactgtgaccccagtagaatgttatgacattatttgtgacgtcaatacatcttcactgtgcacactgtatattgccaaacttttcactttacaatgtcttaagaacagcggtatggaataaaattttgtgttttgcaaaagaatactaaatcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggcgaaacatccggcgaaggtgtcagttagccaacagacatggaaaaaggcagatgtcgtgtgctttggTTATGCCTTACC-TA-TAGGAACTACAGTCAG--CTTCAGCTACTATTCAAAGGCATGCACGATACAATCTT--TATTATTC---------TA-ACATTTTT---TTCTGTGTGTTTGTTTAACTAATTATTTGTGGGCT-------------AATACAATGTAACTTTGAAGCAACGTTATTTGAAAATGAC---ATG-----A----TG-----TTAA--CTGATT--AAGTTG-AT---------------CA--------G-GTTATGCTTGGAAGGCATTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAG--------T----TTTAAAAATAAATTGGTGAAAT----TTG-TAGTACAT--GTTGTCGATATATATGTATTT-ATAT---GA--ATAT-----GAAATAT-TATGATAAAAA--CTG-AAAT------GATAAA--AAAG--TTATA--AATACTT-TCCGCGAACTTTTTGAAacat
gi|10 : GTACC-TA-TTGTAACTACAAGCAATTCC--AACTACTTTTCAAAGGCATACACAACACAATTTT--CATTATCC--------ATACATTTTTTT---------CTGTTTGTGTAACTATTTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACATTGAAGTAACGTAATTTGAAAATGACATGACGTT---A--ATTA----ATTAAGCGTATTTTGACGTTG-AT---------------CC--------A-GTCATGCTTGGAAGGCATTACTAAAATTACGGCAACTTTTTTTG--------T----TTTAAAGATACATTGGTCACAT----TTA-TAGTACAA--GTTG-CAA-ATATATGTACTT-ATAT---CA--ATAT-----GAAATAT-TATGATTAAAA--CTG-AAAT------GATAAA--AAAG--TTATA--AATAATT-TCCGCGAACTTTTTGAAACC-CCCTatccc
gi|13 : TACTATTCAAAGACATGCACA---CAATCTT--TATTGTTC--------ATACACTTTTTT-----CTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCAGGCTGTTTTATAATGGTAATACAAGCTGACTTTGAAGTAACTTAATTTGAGAATGACATGACGTT---A--ATAA----ATTAAGCATATTTTGACATTG-ATCTGTTCACACTTTTGACAATGTTCTG-TTCACACTTGGTAGGCGTTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAG--------T----TTT------------------A----A----AGAT-AA--ATTAGTAA-A-ATTTGTAATACATGTTGTCG--ATACATGTCGATACATGTAT--TTATAT--C----AAT------GATGAA--AAAG--TTATA--AATACTT-TCCGCAAACCTTTTGAA
gi|17 : cTCTGTTTGTTTAACAAATTATTCGCGTTTT-TTTTATAACTGTTATACGATGTGACTTTTAAGTAACGTAATTTAAGAATGACATTACG-----TTTATTA----ATTAAACATATTTTGACGTTG-AT---------------CC--------G-------CTTGGTAAGCATTATTAAAATCGCAGTAACATTTTCAG--------T----TT--------------------------------------------AA-A-ATATACATTT-ATAT---CA--ATAT-----GAACTAT-TATGATTACAA--CTG-AACT------AATAAA--AAAAAGTTATA--AATATTTGTTCACGAACTTTTTGAAACA-CCCTa
gi|22 : TTGTTTGTTTAACCAATTATTTACTGGCTGTTCTA-------------ATGTAACTTTGAAGTAACGTAATTTGAGAATGAATT---G-----AC-ATTA----ATT---------TTGATGTTG-AT---------------CA--------G-GTCACGCTTGGTAGACGTTACTAAAACTACGGTAACATTTT
gi|3 : TATTATTTGCGGGCTGTTTTAT------A--ATTG----A--AATTC-AATGTGAGGTTA-ATT--------------AA--------GCGT---ATTTAGTAGGCGTTATTGAAATCACTGCAACATTTTCAG--------T----ATTAAAGATAAATTGGTGAAAT----TTG-TAGTACAC--GT---CGA-T-ATATGTATTT-ATAT---CA--ATAT-----GAAATAT-TATGATTAAAA--C---AAAT------GATAAA--AAAG--TTATA--AATACTT-TCTGCAAACTTTTTGAAACT-CCCTCcgag
gi|18 : tgaggggtgttcaaaatgttcgtggaaaatgcttataaattttttatctgtcatctgtatgattttaaatttaatccatataaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaaaattaatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaactTGAGTATGGC---ATG-----A--CTAT----ATTAGGCGTATTTTTACCATG-AT---------------CC--------G-GTCACGCTTGGTAGGCGTTACAACAATTGCTGTAACATTCTCAGGATAAAAATACAATGG------------------TAAAGTTA-TAGTACAA--GTTGTTAA-T-ATATGTACTT-ATAT---TA--ATAT-----GAAATAG-TATGATTAAAA--CTG-AAAT------GATAAA--ACAG--TTACA--AATACTT-TCCGTGAACTTgt
gi|19 : TACTAAAATTATAGTAACATTTTCAG--------T----TTTAAAGATACATTGGTGAAAT----TTA-TAGTAGAA--GT---CGA-T-ATATGTATTT-ATAT---TA--ATAT-----GAAGTAT-CATGATTAAAA--CTG-AAAT------GATAAA--AAAG--TTATG--AATAGTT-CCCGCAAACTTTTTAAA--A-CCCcgtaa
gi|6 : tttctgaatataacttcagcgtaaaataattcagagtattttgatgttgaTGTATTT-ATAT---CG--CTAA-----TAAATAG-TATGACTAAAA--CTG-AAAG------GACAAA--AAAG--TTATA--AATAGTA-TCCGAACTTTTTTCAAATCC-TCCTCacctgt
gi|24 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaaaacttaaccagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggtggaaaagcttgacgaaaactgcaatttatacatggtacaacagattcggcgagggcgtcaatttaccaacgggtatgggaaaagacggacgtcttgcaacgtcaaaagtgttaaaatcatttctaggaccaaaatgattcttgatggggatagatgcataagagatagagacataacaacgggaagtgactatatacgagtttatattctacaattacggattatttgaatacgtgtcatgttacgtcttgctgggtgccatagttacttttaatggaatacagagagaagagtactacggctacgtgctttataaagaactaaggtaaatgtggtatgagatatttaactaaaatagtgacagttgatgagacatgtgtatcgacattcgatcccgaaaccaaacaaatgccatcattttgggggaaaaacgacatctccatcaccagagaagctcagcaaagaagcagatttgtgtcgttttctacgaagtaatgtctcaaatcatgccgtacctgtatgaactacaatcaaatccaactactattcaaagacatgcgcaacaaaatatacttattatttgtacagtttttgttttctgtttgtttgtttaaccaattatttgtaggttgttttataattgtaataccatgtgactttgaaataacgtaatttgagaatgccatgcccttaattaattccgcgtgttttgacattgtccgcggtcacgcctgctaagcgTACTG-ATGT---CACAGTAT-----GAAAT---CGTAAATATGA--T------G------GATAAA--GATT--TTATA--AACATTT-TCCGTGAACTTTTTCAA-CA-CCCg
gi|23 : acgag-ATAT---CA--ATAT-----GAAATAT-TATGATTAAAA--CTG-AAAT------GATAAA--AAAG--TTTTA--AAT-CTT-TCCGCGAACTTTTTGAACCC-CCCTC
gi|3 : tttggaaaacaagatat--ATAT-----GGA---T-TAAATTTAAAA--TCATACAGATGACAGATAAA--AAAT--TTATA--AGCATTT-TCCACGAACATTTTGAA-CA-CCCata
gi|15 : tgagTAT-----GGAATAC--AT--TTCAAATCCTACAAAT------GACAGATAAAGA--TTATATAAGCATTT-TCCGCAAACTTTTTGAA-CATCCCTCaaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaaaattaatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaacttattatttgcgggctgttttataattgaaattcaatgtgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaacaaatgataaaaaagttataaatactttctgcaaactttttgaaactccctcgt
Alignments
lowQualScore : 22222 1 11 1111111 44444444444 2222222222 111 1111111 22222222 1 33333333333333333 222222222222 11111111 11111 222222222222222222 222222222222222 2222 11 444444 111 44444444444 2222 222222222222222222 111111 11111 1 6666666666666 33333 111 1 22 1111 444444444444 5555555555555555555555 22222222222222222222222 22222 1
lowQualScore : 3 22222 4 4 4 2 77 4 4 2 3333333 0 4 4 2 4 4 8888 44444444444 777 1111111111 999 5 66 7777777 88888888 0 9999 1 22222222222222222 222222222222 4 1 3 55 666 44444444 11111 4 999999999999999999 111111111111111 44 666 6666 11 444444 2 4 1 555 33 555 99999999999 2 3333 7 444444444444444444 111111 1 00000 6 4 0 3 2 0 3 9999999999999 4 66 999999 4 6 1 1 1 1 2 1 1 4 8 55 777 1 1 33333 2 1 6 777 1 3 3 3 6 55 55 44 5 5 4444 5 3 0 66 1 1 3 444444444444 4 8888888 1 0 3 0 3333333333333333333333 777 0 88888888888888888888888 1 3 55555 0 5 1 6 55 1 2 77 2 1 5 3 6 44
lowQualScore : . ..... . . . . .. . . . ....... . . . . . . .... ........... ... .......... ... . .. ....... ........ . .... . ................. ............ . . . .. ... ........ ..... . .................. ............... .. ... .... .. ...... . . . ... .. ... ........... . .... . .................. ...... . ..... . . . . . . . ............. . .. ...... . . . . . . . . . . . .. ... . . ..... . . . ... . . . . . .. .. .. . . .... . . . .. . . . ............ . ....... . . . . ...................... ... . ....................... . . ..... . . . . .. . . .. . . . . . ..
lowQualScore : 7 99999 0 0 0 0 55 0 0 0 0000000 9 9 0 9 0 0 5555 44444444444 000 9999999999 111 0 99 1111111 22222222 0 4444 1 22222222222222222 888888888888 7 7 6 00 444 55555555 11111 4 555555555555555555 555555555555555 11 444 4444 00 111111 7 4 0 000 99 000 00000000000 9 4444 2 666666666666666666 555555 0 00000 4 0 0 7 4 9 4 2222222222222 4 11 444444 4 2 0 0 0 0 2 4 0 4 9 22 888 1 9 88888 0 6 6 999 0 3 3 3 7 88 77 55 0 0 0000 1 6 1 11 7 1 6 111111111111 0 7777777 1 3 6 3 5555555555555555555555 000 2 55555555555555555555555 0 6 00000 5 1 2 9 00 0 9 99 9 7 7 3 7 66
consensus : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCG-N-GGA-AAA-TGCTTAT-A-AAA-T-CTTT-ATCTGTCATCTGTATGATTTGAAA-------TTTAATCCNA-ACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TG----ATT---C---AC-AGAA---ATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---C---TAAT--T--A--TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGTGACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACGCATAAGTG--A-AG-----ATTTAGCAAC-TA--AACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-ATGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTT-G-GAAAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAANTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTACATTTTTTT-TTT-------TCTG-TTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTTG-AA-C-CCCCTC
Reference ( family-4598 ) : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCG-N-G-A-AAA-TGCTTAT-A-AA--T-CTTT-ATCTGTCATTTGTATGATTTGAAA-------TTTAATTCNA-ATAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TG----ATT---C---A---GAA---ATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---T---TAAT--T--A--TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGTNACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATANGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACGCGTAAGT-----AA-----ATTTAGCAAC-TA--AACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGNCTATTCTANTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-ATGGTAAATGTGGTACGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTAAAANCAAACAAATGTCATCAGTTT-G-GAAAAAANCGGCATCCCCATCANCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTNGTGTCG-TTTT-TACGACGTGNGAAGTGT-TTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAANCTAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTACATTTTTTTGTTT-------TCTG-TTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTATAGTACAAGTTGTCG--ANATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTTG-AA-C-NCCCTC
gi|1 : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCG-ACG-A-AAA-TGCTTAT-ACAA--T-CTTT-ATCTATCATCTGTATGATTTGAAA-------TGTAACTCTA-GTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TG----ATT------------AA---ATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G-ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A--TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A--ATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGTGATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATGCATAAG--------------TTTAGCAAC-TA--TACTGGAC-GT---TTTA-ACAGG-AGTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTATAATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTT-GAAAAAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA-ATTTTTTTGTTT-------TCTC-TTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGT-CATTTGAGAATGACTTT-ATG-----A-ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT---------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTTG-AATC-ACCCTC
gi|10 : GTACC-T-ATTGTAACTACAAGCAATTCCAACTACTTTTCAAAGGCATACACAACACAATTT--TCATTATCCATACATTTTTTT------------CTG-TTTGT--GT--AACTATTTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACATTGAAGTAACGT-AATTTGAAAATGACA-TGACGTT---A-ATTA----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CAGTCATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACGGCAACTTTTTTTGTTTTAAAGA-T-ACA-TTGGTCACATTTATAGTACAAGTTGCAA--ATATATGTACTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-AATT-TCCGCGAACTTTTTGAAA-C-CCCCT
gi|11 : ----ATGGATTTTTTGTAA-AAA-T--TGCATCTCACCCA------------CCTACAGCTCCAGAAC-TT--TCATACTGTGACC---CCAGTAGA--------ATGTTATGACATTATTTGTGACGTCAATACATCTT-----CACT-GTGCACACTG------------------TAT--A-------TTG--CCA--AACTTTT--CACTTTACA--ATGT-C-TTAAGAACA-GCGGTATGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAATACTA-AATCAGAAACTGTGACTAACATTATGAAAACATATGGCGAAAC--ATCCGGCGAAGGTGTCAGTTAGCCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGATG-TCGTG
gi|11 : G-TGCTTTGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGAGAT-GCTAGAAGATTTCTAAAGAA-tgctttggttactttcaagcgaatacaaagagatgagaatggagatgctagaagatttctaaagaaacat
gi|12 : atggattttttgtaaaaattgcatctcacccacctacagctccagaactttcatactgtgaccccagtagaatgttatgacattatttgtgacgtcaatacatcttcactgtgcacactgtatattgccaaacttttcactttacaatgtcttaagaacagcggtatggaataaaattttgtgttttgcaaaagaatactaaatcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggcgaaacatccggcgaaggtgtcagttagccaacagacatggaaaaaggcagatgtcgtTTATGCCTTACC-T-ATAGGAACTACAGTCAGCTTCAGCTACTATTCAAAGGCATGCACGATACAATCT--TTATTATTCTAACATTT-----TTT-------TCTG-TGTGTTTGTTTAACTAATTATTTGTGGGC-------------TAATACAATGTAACTTTGAAGCAACGT-TATTTGAAAATGAC----ATG-----A---TG-----TTAACTG-ATT---AAGTTGATC--AGGTTATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAAA-TAA-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACATGTTGTCGATATATATGTATTTATATGAATATGAAATATTATGATAAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTTG-AA-A-TCCCacat
gi|13 : CTACTATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TTATTGTTCATACACTTTTTT------------CTG-TTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCAGGCTGTTTTATAATGGTAATACAAGCTGACTTTGAAGTAACTT-AATTTGAGAATGACA-TGACGTT---A-ATAA----ATTAAGCATATTTTGACATTGATC--TGTTCACACTTTTGACAATGTTCTGTTCACACTTGGTAGGCGTTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-TAA-A-TTAGTAAAATTTGTAATACATGTTGTCG--ATACATG--------TCGATAC---ATG-TAT--TTATAT-C---AATGAT--GAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCAAACCTTTTG-AA-
gi|14 : CAATGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACATCAAAAAACGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGAGATAGACGCGTACGTGTTACAT-----ATTTAGTAAC-TA--AATTGGAC-AG---TTTG-ACGGGAAGAACATATTCTAGTATTACAGATTATTTGAAAATGCGTCGCGCTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATAGATTCTTTCAAGCAAATACACGAGCGATGAGAA---TGGCGGCGGCCACACGATTTCTAAAGAA--AT-ATGGTAAATGTGGTATGAGATATa
gi|15 : GAGGGATGTTCAAAAAGTTTG-C-GGA-AAA-TGCTTAT-ATAA--T-CTTT-ATCTGTCATTTGTAGGATTTGAAA-------TGTA-TTCCATAGAATGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TG----ATT---C---ACCAGAA---ATCAGCACT-TAGTGATACTAGTAATATTTTTATCGTTATTGCAGTAACGTACAT----------CGACTGTCACCGGATCACTTTTAATTATTTGG-CAG-GTATT--TTCGAAAACTTCTGCTACTTTACATA---TACATAAC--T-----TTTTA-ATGCGCTGTCAAATAGATTT
gi|16 : cATTTGAAA-------TTTAATCCAA-ATAAAGGTCTATAT-ATCTTTTAT-TG----AGT---C---ACTAGAA---ATCAGCACTGTAGTCGTACCAGTTATATTTTTATCGTTACTACAGTAATGTACAT----------TGACCGTCACCAGATCACTTTTCGTTATTTGA-CAG-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTATATA---T---AAAT--A--ACTCTTTA-ATGCTCTG----ATG--------------------C--ACCCTGTCTA------------CCTGCAGCTACGGTACTTT--TCATACTGTGATG---TCGGTAGA--------ACATTATGATGTTAT
gi|17 : a-TCTGTTTGTTTAACAAATTATTCGCGTTTT-TTTTATAACTGTTATACGATGTGACTTTTAAGTAACGT-AATTTAAGAATGACATT-ACGTT---T-ATTA----ATTAAACATATTTTGACGTTGATC--------CGCT-----------------------TGGTAAGCATTATTAAAATCGCAGTAACATTTTCAGTTTAAAATA-T-----------ACATTTATA----------TC----AATATG----------------AACTATTATGATTACAA-CTGAACTAATAAAAAAAAGTTATAAAT-ATTTGTTCACGAACTTTTTGAAA-C-ACCCT
gi|18 : TGAGTATGGC----ATG-----A-CTAT----ATTAGGCGTATTTTTACCATGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACAACAATTGCTGTAACATTCTCAGGAT-AAAAA-T-ACA-ATGGT-AAAGTTATAGTACAAGTTGTTA--ATATATGTACTTATATTAATATGAAATAGTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAACAGTTACAAAT-ACTT-TCCGTGAACTT
gi|19 : -----A-AATA----ATTCAGAGTATTTTGATGTTGAT-----------------------------------------------ACTAAAATTATAGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-ACA-TTGGTGAAATTTATAGTAGAAGT---CG--ATATATGTATTTATATTAATATGAAGTATCATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATGAAT-AGTT-CCCGCAAACTTTTTA-AA-A-CCCcgtaa
gi|2 : tttctgaatataacttcagcgtaGAGGGGTGTTCAAAAAGTTCG-ACG-A-AAA-TGCTTAT-ACAA--T-CTTT-ATCTATCATCTGTATGATTTGAAA-------TGTAACTCTA-GTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TG----ATT------------AA---ATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G-ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A--TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A--ATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGTGATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATGCATAAG--------------TTTAGCAAC-TA--TACTGGAC-GT---TTTA-ACAGG-AGTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTATAATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTT-GAAAAAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA-ATTTTTTTGTTT-------TCTC-TTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGT-CATTTGAGAATGACTTT-ATG-----A-ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT---------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTTG-AATC-ACCCTacctgt
gi|20 : GAGGGGTGTTCAAACAGTTCG-C-G-A-AAAATGCTTAT-A-AAAAT-CTTT-ATCTGTCAATTGTAGGATTTGGAATTTATTCTTTAATCCAA-AAAAAAGTCTACAT-ATTCTATAT-TG----ATT---CACTA---GAA---ATCAGCACTGTAATCGTAGCAGTAACATTTTT
gi|21 : acGAGGGGTGTTCAAAA-----------------TGCTTAT-A-AAA-T-CTGT-ATATGTCATGTGTATGATTTGTAA-------TTTAATCCTA-ACAGCGCTCTATAT-ATTCTTTAT-TGAACAACT-------A---GAA---ATCAGCACTGTAGTCCAACTAGTAATA-TTTTATCGTTATCACAcgt
gi|22 : cTTGTTTGTTTAACCAATTATTTACTGGCTGTTCT-------------AATGTAACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAAT---------G-----A-ATTGAC--ATTA-----ATTTTGATGTTGATC--AGGTCACGCT-----------------------TGGTAGACGTTACTAAAACTACGGTAACATTTTC
gi|23 : ATATATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTTTAAAT--CTT-TCCGCGAACTTTTTG-AA-C-CCCCgag
gi|24 : tttggaaaacaagGAGGGGTGTTGAAAAAGTTCACG-G-A-AAA-TGTTTATAA-AA--T-CTTT-ATCCATCATATTTACGATTTctcata
gi|24 : ac-TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAcatactgtgacatcagta
gi|25 : acgaggggtgttgaaaaagttcacggaaaatgtttataaaatctttatccatcatatttacgaTGATTAAAAACTGAAA------AACAAAG--ATACATTATTTGTCTACAAACTTTTTG-AA-CAACCCTC
gi|3 : ataaGAGGGGTGTTCAAAATGTTCG-T-GGA-AAA-TGCTTAT-A-AA--T-TTTTTATCTGTCATCTGTATGATTTTAAA-------TTTAATCCAT-ATAAAGGCCTATAT-ATTCTTTAT-TG----ATT---C---ACCAGAA---ATGGGGATTGTAGTCATACCAGTATTATTTTTACCATAACTACAGTAACGTACAT----------TGACCGTTACTGGATCAGGTTTCATTATTTGC-T-A-GTATT--TTCAAAAATTACTACTATTTTTCCTA---T---TCATAAT--A--TTTTA-ATGCACCA----ATGGATTTTT-GAAA-AAA-TTGC--ATTCCATCCA------------CCTACAGCTCCAGTAT-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTA-TTGTGACATCAATACGTCTT-----CACT-GTACACACTA------------------TAT--C-AC----C--------AAGCTGTTTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACAT-CGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAATTAatttg
gi|3 : t--A-AA----TTAA-TCAGAAACTGTGACTA----ACATTATGA-C-C-----ACACATAGCA---A--AAA---A------------TCTTTGC--A-GAACACTGCAAT------------------TTAT------ATATGGTACAAAAGATTCTGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATAGA-----AAAAG---------------------AATA-TGCTAGAACCATTTCTAGGGCCAAAATGATTCTAGAAGGGGAAAGACGCATAAGTGTTACAG-----ATTTAGCAAC-TG--AACTGGAC-AG---TTTA-ATGGGAAACGCCTATTCTAGTTTTACGGATGTTTTGAAAATGCGTCGCTTTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGTTAATGCA-AAGAGATGAGAA---TGGTGGCGGCT-CACGATTTCTAAAGAA--AT-ATGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCA-TATCAACGTTAGATCATAAAAACAAACAAATGTTATCAGTTT-G-GAATAAACCAGCATCCCCATCAACAAAGAAGCTCAGAGAAGAAGCAGAT-------G-TTTC-TACGATGTTGGAAGTGT---CTCGACTTATGCCATACC-T-ATAGTAACTACA-TCAA---------CT-----------TGCACAACACAATCT--TTATTATTCATACATTTTTTT----------------TCTGTTTCTTTAACTTATTATTTGCGGGCTGTT------TTATAAT------------TGAAAT----TCAATGTGAGG--------------------TTA----ATTAAGCGTATTT-----------------------------------------------AGTAGGCGTTATTGAAATCACTGCAACATTTTCAGTATTAAAGA-T-A-AATTGGTGAAATTTGTAGTACA---CGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-C--AAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCTGCAAACTTTTTGAAA-C-TCCCTCatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaacttattatttgcgggctgttttataattgaaattcaatgtgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaacaaatgataaaaaagttataaatactttctgcaaactttttgaaactccctcgt
gi|4 : tgaggggtgttcaaaatgttcgtggaaaatgcttataaattttttatctgtcatctgtatgattttaaatttaatccatataaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaGGGGTGTTCAAAATGTTCG-A-GGA-AAA-TGCTTTT-A-AAA-T-CTTT-ATCTGTAATTTGTTTGATTTGAAA-------TTTAATTCAA-ACAAAGATCTATACCAGTCTA-ATCTA----ATT---T---A---CAAGTAATAAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTTTCGTTACCTCAGTAACGTACAT----------TGACCGTCGCCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-CTG-GTATTATTTGGAAGTTTGCTACTACTTTACATA---C---TCAT--A--ACTTTTTA-ATGCGCTG----ATGGATCCTT-GTAA-AAAAT--GC-ACCCCATCTA------------CCTACTGCTCCAGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CTTT-GTAAACATTG------------------TAT-----A----TTA---CA-AAGCTGTTTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AAC-TGCGGTA---A--GGA---ATACAATTTTTTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------gt
gi|4 : acgt--A-AA----CTAAATCAGAAACTGCGACTA----ACA--ACAT-A---AA-AACAAATGGCA---A--AAC---A-----------GG-TCTGC--A-GAAAACTGCAAC------------------TGAT------AAATGGTACAAAAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACTAACCGATTTAGACTTTTAAACG--GGAAGTTCCTGCcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggtacaaaagattcggcgaaggcgtcagttaactaaccgatttagacttttaaacgggaagttcctgccttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|4 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaCAAAA-GATTC-----GGCGA-AG--GCGTCAGT-----TA-----ACT----AAC-CG--ATTTAGAC-TT---TTAA-ACGGGAAGTTCCTGCCTTAGTATTATG-ATTATTTGAAAGTGTGTCG-GTTGCAGCTTGGCGGGATGCCATGGTTACGTTCAAGCGAATACA-AAGAGATAGGAA---TGGCGGCTGCTAGACGATTTCTAAAGAA--AT-ATGGTAAATGTGGTATGAGATATTAAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCGGTATCAACATTCCATCCCAATA----ACAAATGTTATCAATTT-C-GAAAATACCGGCA------------AAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGATTTTTGTCGGTTTC-TAAGACGTGGGAAGTGT-CTT--GACTTATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATTAACTTCAACAACCATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TAATTATTCATACATTTTTTT------------CTG-TTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCGGGCTGTTTTATATTTATAATACAATGTGACTTTAAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC----ATG-----ACGTTGATAAATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTTAAATTACCGTAATATTTTGAGTTTTAAAGA-TAA-A-TTTGTGAATTTTGTAGTACATGTTGTCG--ATATATGTATTTATGTCAATATGAAAAATTATGATTAAAA-CTGAAATGA---AAAAAA-----AAAT-ACTT-TCCGCGAGCTTTTTGAAA-C-CCCCTcttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|5 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaaaactaaatcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggta--ATCCTGTCCA------------CCCACAGCTCAAGTAC-TT--TCATGCTGTGACG---TCAGTCGA--------ACATTATGACGTCATTTGTGACGTCAGTACTTCTT-----CACG-GTACGCAATA------------------TAT-----A----TT--ATT--AAGCTGTTTTTACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACA
gi|5 : aattgcTATATCAGAAACTGTGACTAAT--ATA--ATG------AA-AACATATTGTG---A--AAA---A---T-------GC-TTTGC--A-GAAAAATACTCT------------------CTTT------AACTAGTACAAAAGATTTTAAGAAGACGTCAATTAATCAACGAATATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTAAATAA-AGCTAGAATCATTTCTAGGGCTTAAACGATTCTAGATGGGGATAGACGCATAAGTGACAGAG-----ATAAAGCAAC-TA--AA--------T---TTCA-AAGGAGAGTGCCTATTCTAGTATGACGGAGTATTTGAATAAGCATCGCATTGCAGATAAGTGGG-GGCCATGGTTATTTTCAACCGAATACACAAGAAAAGGGAATGGTGGCAGCAGCTACACGATTTCTAAAGAAGTATCATGGTTAATGTGGTACGGGATATTTCAATAAAATAGTAAAATTTTGTGAGAAATGGATATCAAGGTTAGATCCTAAAATCAAACATGTGTCATCAGTTT----AAAAAAACGGCATCCCAATCAGCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCGCTTTT-TACGACGTGTGAAGTGTGTTGATGAATCATGTCGTACCATAATAGGAACTACAACCAACTCAGACTACTATTCACAGGCTTGCTCAGCACAATCT--TTATCATTTAAACA-----------AAAAAAATCTGCTTTTTTTGTTTTACCAATTATTTGCCGGTTGTTTT-------------AATGTAACTTTGAAGTAGCGT-AATTTGAGAATGAC----ACG-----A---CG-----TTAAGCGTTTTTTGACGTTGAAC--CGGTCACGCT-----------------------TTGAAGACGTTACTAAAATAACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATT-C-A-TTGATGAAATTTATAATAACCGTTATCG--ATAAATGTATTTATAGCAATATGAACTATTATGATTAAAA-CTGAAATGATAAAAAAAAGTTATAAAT-TGTT-TCCGCGAACATTTTG-AA-C-CCCCgcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaatatatatcagaaactgtgactaatataatgaaaacatattgtgaaaaatgctttgcagaaaaatactctctttaactagtacaaaagattttaagaagacgtcaattaatcaacgaatatggaaaaaggcggacgtcctgcaacgtaaataaagctagaatcatttctagggcttaaacgattctagatggggatagacgcataagtgacagagataaagcaactaaatttcaaaggagagtgcctattctagtatgacggagtatttgaataagcatcgcattgcagataagtgggggccatggttattttcaaccgaatacacaagaaaagggaatggtggcagcagctacacgatttctaaagaagtatcatggttaatgtggtacgggatatttcaataaaatagtaaaattttgtgagaaatggatatcaaggttagatcctaaaatcaaacatgtgtcatcagtttaaaaaaacggcatcccaatcagcaaagaagctcagcgaagaagcagactagtgtcgctttttacgacgtgtgaagtgtgttgatgaatcatgtcgtaccataataggaactacaaccaactcagactactattcacaggcttgctcagcacaatctttatcatttaaacaaaaaaaatctgctttttttgttttaccaattatttgccggttgttttaatgtaactttgaagtagcgtaatttgagaatgacacgacgttaagcgttttttgacgttgaaccggtcacgctttgaagacgttactaaaataactgtaacattttcagttttaaagattcattgatgaaatttataataaccgttatcgataaatgtatttatagcaatatgaactattatgattaaaactgaaatgataaaaaaaagttataaattgtttccgcgaacattttgaacccccctcg
gi|6 : aattgcatcctgtccacccacagctcaagtactttcatgctgtgacgtcagtcgaacattatgacgtcatttgtgacgtcagtacttcttcacggtacgcaatatatattattaagctgtttttacttcacaatgtctttagaacagcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaata--A-AA----CTTAACCAGAAACTGTGACTA----ACATTATG------AA-AACATATGGTG---G--AAA---A-----------GC-TTGAC----GAAAACTGCAAT------------------TTAT------ACATGGTACAACAGATTCGGCGAGGGCGTCAATTTACCAACGGGTATGGG-----AAAAGACGGACG-TCTTGCAACGTCAAAAG-TGTTAAAATCATTTCTAGGACCAAAATGATTCTTGATGGGGATAGATGCATAAG------AG-----A--TAGAGACATAACAACGGGAA-GTGACTATATACG---AGTTTATATTCTACAATTACGGATTATTTGAATACGTGTCATGTTACGTCTTGCTGGG-TGCCATAGTTACTTTTAATGGAATACA-GAGAGA--AGAG---T-ACTACGGCTACGTGCTTTATAAAGAA-C-T-AAGGTAAATGTGGTATGAGATATTTAACTAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGTGTATCGACATTCGATCCCGAAACCAAACAAATGCCATCATTTTGG-GGGAAAAACGACATCTCCATCACCAGAGAAGCTCAGCAAAGAAGCAGATTTGTGTCG-TTTTCTACGAAGT----AATG---TCTCAAATCATGCCGTACC-T-GTATGAACTACAATCAAATCCAACTACTATTCAAAGACATGCGCAACAAAATATACTTATTATTTGTACA-GTTTTTGTTT-------TCTG-TTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGTAGGTTGTTTTATAATTGTAATACCATGTGACTTTGAAATAACGT-AATTTGAGAATG-C--C-ATGCCCTTA-ATTA----ATTCCGCGTGTTTTGACATTG-TCCGCGGTCACGCC-----------------------TGCTAAGCGTctcg
gi|6 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaTGTATTTATATCGCTAATAAATAGTATGACTAAAA-CTGAAAGGAC--AAAAAAGTTATAAAT-AGTA-TC--CGAACTTTTTgtatttatatcgctaataaatagtatgactaaaactgaaaggacaaaaaagttataaatagtatccgaacttttttcaaatcctcctcg
gi|7 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaaaacttaaccagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggtggaaaagcttgacgaaaactgcaatttatacatggtacaacagattcggcgagggcgtcaatttaccaacgggtatgggaaaagacggacgtcttgcaacgtcaaaagtgttaaaatcatttctaggaccaaaatgattcttgatggggatagatgcataagagatagagacataacaacgggaagtgactatatacgagtttatattctacaattacggattatttgaatacgtgtcatgttacgtcttgctgggtgccatagttacttttaatggaatacagagagaagagtactacggctacgtgctttataaagaactaaggtaaatgtggtatgagatatttaactaaaatagtgacagttgatgagacatgtgtatcgacattcgatcccgaaaccaaacaaatgccatcattttgggggaaaaacgacatctccatcaccagagaagctcagcaaagaagcagatttgtgtcgttttctacgaagtaatgtctcaaatcatgccgtacctgtatgaactacaatcaaatccaactactattcaaagacatgcgcaacaaaatatacttattatttgtacagtttttgttttctgtttgtttgtttaaccaattatttgtaggttgttttataattgtaataccatgtgactttgaaataacgtaatttgagaatgccatgcccttaattaattccgcgtgttttgacattgtccgcggtcacgcctgctaagcgGGGATGTTCAAAAAGTTCG-C-GGA-AAA-TACTCAT-A-AAA-T-CTTT-ATCTGTTGTCTATACGTTTTAAAA-------TTT----C------AAGGTCTCTAT-ACTCATTAT-TG----ATTTTAC---A---GAC---ATCAGTAGTGTAGTCATGCTAATAATAGTTTTATCAATATTACAGTAACGTACATCGACCTTCACCGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTTTATTG-C-ATATATT--TTCGAAAATTGCTACAACTTTACATG---G---TCAT--TTCA--TTTTT-ACTTGCTG----ATGGATTTTC-TTAC-AAA-TTAT--ATCCCGTCCGCGTCTGAAGAACCCTATAGC----ATAA-TTTGTCACATCGATACGTCTTCACTAAACGCACCGTATATTATCAAGCTGTTT-TTACTTCACAGTGTCTTAAGAACAGTGGTACGCAATGAAAATTGAGTTTTGCAAATAA--A-AA----CTAAACCAGAAACTTTGACTAC--CATT--ATG------AA-AACATATGGTG---A--AAATATA---TG------GC-TTT----AAGGAA-----AGG------------------TGAT------AAATGATAAAACAGATTCAGCAAAGGTGTCAATTAACCAACATACATAGG-----AGAAAACGTACG-TTATACAACATCAAAAATTGCTAGAATCATTTCCAGGGCTTAAAAAATT----------GTATACGCATAAGT-----AATAGAGATTTAGCAGC-TA--AACTGGAC-AT---TTGA-ACGGGAAGTGACTATTCTATTATTACGGATCATCTGAAtcaaatcctcctcg
gi|8 : -TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAAA--------ACATTATGACAATATTTGTGACATCAATACGACTT-----CACT-GTACACACTG------------------TAT--ATGA----CT-------AAGCTGTTTTCACTTTACA--ATGTAT-TTAG-AACA-GCGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------t
gi|8 : --A-AA----CTAAATCAGAAACTGTGACTA----ACATTATG------AA-AACATATG--A---C--GGA---A---AA------GC-TTTGC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATAGTACAACAGATTCGGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGTCAGAATCATTTCTAGGGCCAAACTGACTCTAGATGGGGATTGACGCCTAAGTGTGACAT-----ATTTAGCAAC-TA--AACTGAACAGT---TTT--ACAGGAAGTGCATTTTCTAGTATTACGGATTATTTGAAAATGCATCGCATATCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCAAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCAGCAGCTACACAATTTCTAAAGAA--AT-ATGGTAAATGTGGTACGAGATATCTAAATAAAATGGTGACAGTTGGTGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTAAAAACAAACAAATGTCATCAGTTT-G-GAAAATACCGGCATCCCCcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatgacggaaaagctttgcagaaaactgcaatttataaatagtacaacagattcggtgaaggcatcagttaaccaacagacatggaaaaaggcagacgtcctgcaacgtcaaaaacgtcagaatcatttctagggccaaactgactctagatggggattgacgcctaagtgtgacatatttagcaactaaactgaacagttttacaggaagtgcattttctagtattacggattatttgaaaatgcatcgcatatcagctaggtgggtgccatggttactttcaagcaaatacaaagagatgagaatggcagcagctacacaatttctaaagaaatatggtaaatgtggtacgagatatctaaataaaatggtgacagttggtgagacatgggtatcaacgttcgatcctaaaaacaaacaaatgtcatcagtttggaaaataccggcatcccc
gi|9 : tttcatactgtgacatcagtaaaacattatgacaatatttgtgacatcaatacgacttcactgtacacactgtatatgactaagctgttttcactttacaatgtatttagaacagcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaAGGGTTGTTCAAAATGTTCG-T-G-GGAAA-TGCTTAT-A-GA--TACTTT-AACTGCCATTTGTATGATTTAAAA-------TTTAATCCAA-ACATAGGTCTATAT-ATTCATTAT-TT-----TT---C---ACTAAAA---ATCAACACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGCATCTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCTCAGGGTCACTTTTCGTTATTTGGAA-G-GTATT--TTTGAAAATCGCTACCTCTTTACATATTCT---TAAC--T-----TTTTA-ATGTGCTG----ATG--------------------C--ATCCCGTCCA------------CCTAAAGCT-CAGTAC-TT--TAATTCTGTGAAG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAGTACGTCTT-----CACT-GTACACACGG------------------TAT-----A----TT--ACC--AAGCTGTTTTCACATCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGTA---AGGAAT---A---AA------AT-TTTG
gi|9 : TG------------------CAT--A-AGAATGCTTAATCAGAAACTGTCA-------AGA--GCGT-TATGGA-AACATATGGCG---A--AAA---A-----------GC-TTTAC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATGGTAC-ACGAATTCGGCGAAGGCGTCAtgtttgcataagaatgcttaatcagaaactgtcaagagcgttatggaaacatatggcgaaaaagctttacagaaaactgcaatttataaatggtacacgaattcggcgaaggcgtca
Alignments
lowQualScore : 1111111 22222 2222222222 111 22222222222222222222 1 33333333333333333 222222222222 11111111 11111 222222222222222222 222222222222222 2222 11 444444 111 44444444444 2222 222222222222222222 111111 11111 1 5555555 33 1 1 1 1111 11111111 11 5555555555555555555555 22222222222222222222222 22222 1
lowQualScore : 3 2 4 1 3333333 2 3 4 4 4 00000 4 1111111111 999 5 66 99999999999999999999 0 9999 1 22222222222222222 222222222222 4 1 3 55 666 44444444 11111 4 999999999999999999 111111111111111 44 777777 5555 11 666666 2 888 444 33 555 99999999999 2 3333 7 444444444444444444 111111 1 00000 6 4 0 66 3333333 2 0 4 66 9999 999999 4 1 0 1 1 1 2 1 1 4 8 55 777 1 00 5 0 4 1 0 5 1 1 2 3 3 6 77 9999 5 5 1 00 2 3 0 66 1 55555555 0 00 1 1 8888888 1 0 3 0 3333333333333333333333 777 0 88888888888888888888888 1 3 55555 0 5 1 2 33 55 0 2 77 2 1 5 44 2 3 666
lowQualScore : . . . . ....... . . . . . ..... . .......... ... . .. .................... . .... . ................. ............ . . . .. ... ........ ..... . .................. ............... .. ...... .... .. ...... . ... ... .. ... ........... . .... . .................. ...... . ..... . . . .. ....... . . . .. .... ...... . . . . . . . . . . . .. ... . .. . . . . . . . . . . . . .. .... . . . .. . . . .. . ........ . .. . . ....... . . . . ...................... ... . ....................... . . ..... . . . . .. .. . . .. . . . .. . . ...
lowQualScore : 7 4 0 4 0000000 4 9 0 0 0 55555 0 9999999999 111 0 99 88888888888888888888 0 4444 1 22222222222222222 888888888888 7 7 6 00 444 55555555 11111 4 555555555555555555 555555555555555 11 888888 9999 00 999999 7 111 000 99 000 00000000000 9 4444 2 666666666666666666 555555 0 00000 4 0 0 99 9999999 5 4 4 11 4444 444444 4 9 1 1 0 0 2 4 0 4 9 22 888 9 77 0 0 0 7 7 7 4 3 5 7 3 7 77 3333 0 0 0 55 3 6 1 11 7 66666666 8 77 8 1 7777777 1 3 6 3 5555555555555555555555 000 2 55555555555555555555555 0 6 00000 5 1 8 3 33 00 3 9 99 9 7 7 22 3 1 888
consensus : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTAT-AAAATCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAA-------TTTAATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGA-TTCA-CTA-GAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---C---TAAT--T--A---TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACGCATAA--GTG--AC--AGATTTAGCAAC-TAA--AC----TGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
Reference ( family-4598 ) : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGNGGAAAATGCTTAT-AAAATCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAA-------TTTAATCCNAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGA-TTCA-C-A-GAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---C---TAAT--T--A---TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACGCATAA--GTG--A---AGATTTAGCAAC-TAA--AC----TGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAANTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
gi|1 : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGACGAAAATGCTTAT-ACAATCTTTATCTATCATCTGTATGATTTGAAA-------TGTAACTCTAGTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TGA-TT--------AAATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G-ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A--ATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGT---GATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATGCATAA--GT-----------TTAGCAAC-TAT--AC----TGGAC-GT---TTTA-ACAGGA-GTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTAT-AATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTTGAAA-AAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA--------ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGT-CATTTGAGAATGACTTT-ATG-----A-ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT---------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTT--G-AA-T-CACCCTC
gi|10 : GTACC-T-ATTGTAACTACAAGCAATTCCAACTACTTTTCAAAGGCATACACAACACAATTT--TCATTATCCATAC-------ATTTTTTT-----CTGTTTGT--GT--AACTATTTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACATTGAAGTAACGT-AATTTGAAAATGACA-TGACGTT---A-ATTA----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CAGTCATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACGGCAACTTTTTTTGTTTTAAAGA-T-ACA-TTGGTCACATTTATAGTACAAGTTGCAA--ATATATGTACTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-AATT-TCCGCGAACTTTTT--GAAA-C-C-CCCT
gi|11 : ----ATGGATTTTTTGTAA-AAA-T--TGCATCTCACCCA------------CCTACAGCTCCAGAAC-TT--TCATACTGTGACC---CCAGTAGA--------ATGTTATGACATTATTTGTGACGTCAATACATCTT-----CACT-GTGCACACTG------------------TAT--A-------TTG--CCA--AACTTT-----TCACTTTACA--ATGT-C-TTAAGAACA-GCGGTATGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAATACTA-AATCAGAAACTGTGACTAACATTATGAAAACATATGGCGAAAC--ATCCGGCGAAGGTGTCAGTTAGCCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGATG-TCGTG
gi|11 : G-TGCTTTGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGAGAT-GCTAGAAGATTTCTAAAGAA-tgctttggttactttcaagcgaatacaaagagatgagaatggagatgctagaagatttctaaagaaacat
gi|12 : atggattttttgtaaaaattgcatctcacccacctacagctccagaactttcatactgtgaccccagtagaatgttatgacattatttgtgacgtcaatacatcttcactgtgcacactgtatattgccaaacttttcactttacaatgtcttaagaacagcggtatggaataaaattttgtgttttgcaaaagaatactaaatcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggcgaaacatccggcgaaggtgtcagttagccaacagacatggaaaaaggcagatgtcgtTTATGCCTTACC-T-ATAGGAACTACAGTCAGCTTCAGCTACTATTCAAAGGCATGCACGATACAATCT--TTATTATTCTAAC-------A----TTT-TTTTCTGTGTGTTTGTTTAACTAATTATTTGTGGGC-------------TAATACAATGTAACTTTGAAGCAACGT-TATTTGAAAATGAC----ATG-----A---TG-----TTAACTG-ATT---AAGTTGATC--AGGTTATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAAA-TAA-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACATGTTGTCGATATATATGTATTTATATGAATATGAAATATTATGATAAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-A-T-CCCacat
gi|13 : CTACTATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TTATTGTTCATAC-------ACTTTT-----TTCTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCAGGCTGTTTTATAATGGTAATACAAGCTGACTTTGAAGTAACTT-AATTTGAGAATGACA-TGACGTT---A-ATAA----ATTAAGCATATTTTGACATTGATC--TGTTCACACTTTTGACAATGTTCTGTTCACACTTGGTAGGCGTTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-TAA-A-TTAGTAAAATTTGTAATACATGTTGTCG--ATACATG--------TCGATAC---ATG-TAT--TTATAT-C---AATGAT--GAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCAAACCTTTT--G-AA-
gi|14 : CAATGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACATCAAAAAACGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGAGATAGACGCGTAC--GTGTTAC--ATATTTAGTAAC-TAA--AT----TGGAC-AG---TTTG-ACGGGAAGAACATATTCTAGTATTACAGATTATTTGAAAATGCGTCGCGCTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATAGATTCTTTCAAGCAAATACACGAGCGATGAGAA---TGGCGGCGGCCACACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATa
gi|15 : GAGGGATGTTCAAAAAGTTTGCGGAAAATGCTTAT-ATAATCTTTATCTGTCATTTGTAGGATTTGAAA-------TGTATTCCATAGAATGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGA-TTCACC-A-GAAATCAGCACT-TAGTGATACTAGTAATATTTTTATCGTTATTGCAGTAACGTACAT----------CGACTGTCACCGGATCACTTTTAATTATTTGG-CAG-GTATT--TTCGAAAACTTCTGCTACTTTACATA---TACATAAC--T------TTTTA-ATGCGCTGTCAAATAGATTT
gi|16 : cATTTGAAA-------TTTAATCCAAATAAAGGTCTATAT-ATCTTTTAT-TGA-GTCA-CTA-GAAATCAGCACTGTAGTCGTACCAGTTATATTTTTATCGTTACTACAGTAATGTACAT----------TGACCGTCACCAGATCACTTTTCGTTATTTGA-CAG-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTATATA-------TAAA--T--AACTCTTTA-ATGCTCTG----ATG--------------------C--ACCCTGTCTA------------CCTGCAGCTACGGTACTTT--TCATACTGTGATG---TCGGTAGA--------ACATTATGATGTTAT
gi|17 : aTCTGTTTGTTTAACAAATTATTCGCGTTTT-TTTTATAACTGTTATACGATGTGACTTTTAAGTAACGT-AATTTAAGAATGACATT-ACGTT---T-ATTA----ATTAAACATATTTTGACGTTGATC--------CGCT-----------------------TGGTAAGCATTATTAAAATCGCAGTAACATTTTCAGTTTAAAATA-T-----------ACATTTATA----------TCA--ATATG---AACTAT-----TATGA----------TTACAA-CTGAACTAATAAAAAAAAGTTATAAAT-ATTTGTTCACGAACTTTTT--GAAA-C-A-CCCT
gi|18 : TGAGTATGGC----ATG-----A-CTAT----ATTAGGCGTATTTTTACCATGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACAACAATTGCTGTAACATTCTCAGGAT-AAAAA-T-ACA-ATGGT-AAAGTTATAGTACAAGTTGTTA--ATATATGTACTTATATTAATATGAAATAGTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAACAGTTACAAAT-ACTT-TCCGTGAACTT
gi|19 : -----A-AATA----ATTCAGAGTATTTTGATGTTGAT-----------------------------------------------ACTAAAATTATAGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-ACA-TTGGTGAAATTTATAGTAGAAGT---CG--ATATATGTATTTATATTAATATGAAGTATCATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATGAAT-AGTT-CCCGCAAACTTTTT--A-AA-A-C-CCcgtaa
gi|2 : tttctgaatataacttcagcgtaGAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGACGAAAATGCTTAT-ACAATCTTTATCTATCATCTGTATGATTTGAAA-------TGTAACTCTAGTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TGA-TT--------AAATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G-ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A--ATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGT---GATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATGCATAA--GT-----------TTAGCAAC-TAT--AC----TGGAC-GT---TTTA-ACAGGA-GTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTAT-AATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTTGAAA-AAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA--------ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGT-CATTTGAGAATGACTTT-ATG-----A-ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT---------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTT--G-AA-T-CACCCTacctgt
gi|20 : GAGGGGTGTTCAAACAGTTCGCGAAAAATGCTTATAAAAATCTTTATCTGTCAATTGTAGGATTTGGAATTTATTCTTTAATCCAAAAAAAAGTCTACAT-ATTCTATAT-TGA-TTCA-CTA-GAAATCAGCACTGTAATCGTAGCAGTAACATTTTT
gi|21 : acGAGGGGTGTTCAAAA-------------TGCTTAT-AAAATCTGTATATGTCATGTGTATGATTTGTAA-------TTTAATCCTAACAGCGCTCTATAT-ATTCTTTAT-TGA-ACAA-CTA-GAAATCAGCACTGTAGTCCAACTAGTAATA-TTTTATCGTTATCACAcgt
gi|22 : cTTGTTTGTTTAACCAATTATTTACTGGCTGTTCT-------------AATGTAACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAAT---------G-----A-ATTGAC--ATTA-----ATTTTGATGTTGATC--AGGTCACGCT-----------------------TGGTAGACGTTACTAAAACTACGGTAACATTTTC
gi|23 : ATATATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTTTAAAT--CTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCgag
gi|24 : tttggaaaacaagGAGGGGTGTTGAAAAAGTTCACGGAAAATGTTTAT-AAAATCTTTATCCATCATATTTACGATTTctcata
gi|24 : ac-TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAcatactgtgacatcagta
gi|25 : acgaggggtgttgaaaaagttcacggaaaatgtttataaaatctttatccatcatatttacgaTGATTAAAAACTGAAA------AACAAAG--ATACATTATTTGTCTACAAACTTTTT--G-AA-CAA-CCCTC
gi|3 : ataaGAGGGGTGTTCAAAATGTTCGTGGAAAATGCTTAT-AAATTTTTTATCTGTCATCTGTATGATTTTAAA-------TTTAATCCATATAAAGGCCTATAT-ATTCTTTAT-TGA-TTCACC-A-GAAATGGGGATTGTAGTCATACCAGTATTATTTTTACCATAACTACAGTAACGTACAT----------TGACCGTTACTGGATCAGGTTTCATTATTTGC-T-A-GTATT--TTCAAAAATTACTACTATTTTTCCTA---T---TCATAAT--A---TTTTA-ATGCACCA----ATGGATTTTT-GAAA-AAA-TTGC--ATTCCATCCA------------CCTACAGCTCCAGTAT-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTA-TTGTGACATCAATACGTCTT-----CACT-GTACACACTA------------------TAT--C-AC----C--------AAGCTGT---TTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACAT-CGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAATTAatttg
gi|3 : t--A-AA----TTAA-TCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATGA-C-C--A-CACATA--GCA---A--AAA---A------------TCTTTGC--A-GAACACTGCAAT------------------TTAT------ATATGGTACAAAAGATTCTGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATAGA-----AAAAG---------------------AATA-TGCTAGAACCATTTCTAGGGCCAAAATGATTCTAGAAGGGGAAAGACGCATAA--GTGTTAC--AGATTTAGCAAC-TGA--AC----TGGAC-AG---TTTA-ATGGGAAACGCCTATTCTAGTTTTACGGATGTTTTGAAAATGCGTCGCTTTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGTTAATGCA-AAGAGATGAGAA---TGGTGGCGGCT-CACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCA-TATCAACGTTAGATCATAAAAACAAACAAATGTTATCAGTTTGGAA-TA-AACCAGCATCCCCATCAACAAAGAAGCTCAGAGAAGAAGCAGAT-------G-TTTC-TACGATGTTGGAAGTGT---CTCGACTTATGCCATACC-T-ATAGTAACTACA-TCAACT--------------------TGCACAACACAATCT--TTATTATTCATAC-------ATTTTTTT-TCT-------GTTTCTTTAACTTATTATTTGCGGGCTGTT------TTATAAT------------TGAAAT----TCAATGTGAGG--------------------TTA----ATTAAGCGTATTT-----------------------------------------------AGTAGGCGTTATTGAAATCACTGCAACATTTTCAGTATTAAAGA-T-A-AATTGGTGAAATTTGTAGTACACGT---CG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-C--AAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCTGCAAACTTTTT--GAAA-C-T-CCCTCatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaacttattatttgcgggctgttttataattgaaattcaatgtgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaacaaatgataaaaaagttataaatactttctgcaaactttttgaaactccctcgt
gi|4 : tgaggggtgttcaaaatgttcgtggaaaatgcttataaattttttatctgtcatctgtatgattttaaatttaatccatataaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaGGGGTGTTCAAAATGTTCGAGGAAAATGCTTTT-AAAATCTTTATCTGTAATTTGTTTGATTTGAAA-------TTTAATTCAAACAAAGATCTATACCAGTCTA-ATCTAA-TTTA-C-AAGTAATAAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTTTCGTTACCTCAGTAACGTACAT----------TGACCGTCGCCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-CTG-GTATTATTTGGAAGTTTGCTACTACTTTACATA---C---TCAT--A--ACT-TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATCCTT-GTAA-AAAAT--GC-ACCCCATCTA------------CCTACTGCTCCAGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CTTT-GTAAACATTG------------------TAT-----A----TTA---CA-AAGCTGT---TTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AAC-TGCGGTA---A--GGA---ATACAATTTTTTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------gt
gi|4 : acgt--A-AA----CTAAATCAGAAACTGC---GACTA----ACA--ACAT-A---AA-AACAAATGGCA---A--AAC---A-----------GG-TCTGC--A-GAAAACTGCAAC------------------TGAT------AAATGGTACAAAAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACTAACCGATTTAGACTTTTAAACG--GGAAGTTCCTGCcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggtacaaaagattcggcgaaggcgtcagttaactaaccgatttagacttttaaacgggaagttcctgccttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|4 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaAAC-TAA--CCGATTTAGAC-TT---TTAA-ACGGGAAGTTCCTGCCTTAGTATTATG-ATTATTTGAAAGTGTGTCG-GTTGCAGCTTGGCGGGATGCCATGGTTACGTTCAAGCGAATACA-AAGAGATAGGAA---TGGCGGCTGCTAGACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATTAAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCGGTATCAACATTCCATCCC--AAT--AACAAATGTTATCAATTTCGAA-AA-TACCGGCA------------AAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGATTTTTGTCGGTTTC-TAAGACGTGGGAAGTGTCTT---GACTTATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATTAACTTCAACAACCATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TAATTATTCATAC-------ATTTT-----TTTCTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCGGGCTGTTTTATATTTATAATACAATGTGACTTTAAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC----ATG-----ACGTTGATAAATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTTAAATTACCGTAATATTTTGAGTTTTAAAGA-TAA-A-TTTGTGAATTTTGTAGTACATGTTGTCG--ATATATGTATTTATGTCAATATGAAAAATTATGATTAAAA-CTGAAATGA---AAAAAA-----AAAT-ACTT-TCCGCGAGCTTTTT--GAAA-C-C-CCCTcttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|5 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaaaactaaatcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggtacaaaagattcggcgaaggcgtcagtt--ATCCTGTCCA------------CCCACAGCTCAAGTAC-TT--TCATGCTGTGACG---TCAGTCGA--------ACATTATGACGTCATTTGTGACGTCAGTACTTCTT-----CACG-GTACGCAATA------------------TAT-----A----TT--ATT--AAGCTGT---TTTTACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGCA---
gi|5 : aattgcTATATCAGAAACTGT---GACTAAT--ATA--ATG------AA-AACATATTGTG---A--AAA---A---T-------GC-TTTGC--A-GAAAAATACTCT------------------CTTT------AACTAGTACAAAAGATTTTAAGAAGACGTCAATTAATCAACGAATATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTAAATAA-AGCTAGAATCATTTCTAGGGCTTAAACGATTCTAGATGGGGATAGACGCATAA--GTG--ACAGAGATAAAGCAAC-TAA--A------------T---TTCA-AAGGAGAGTGCCTATTCTAGTATGACGGAGTATTTGAATAAGCATCGCATTGCAGATAAGTGGG-GGCCATGGTTATTTTCAACCGAATACACAAGAAAAGGGAATGGTGGCAGCAGCTACACGATTTCTAAAGAAGTATCA-TGGTTAATGTGGTACGGGATATTTCAATAAAATAGTAAAATTTTGTGAGAAATGGATATCAAGGTTAGATCCTAAAATCAAACATGTGTCATCAGTTT--AA-AA-AAACGGCATCCCAATCAGCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCGCTTTT-TACGACGTGTGAAGTGTGTTGATGAATCATGTCGTACCATAATAGGAACTACAACCAACTCAGACTACTATTCACAGGCTTGCTCAGCACAATCT--TTATCATTTAAACAAAAAAAATCTGCTT-TT---------TTTGTTTTACCAATTATTTGCCGGTTGTTTT-------------AATGTAACTTTGAAGTAGCGT-AATTTGAGAATGAC----ACG-----A---CG-----TTAAGCGTTTTTTGACGTTGAAC--CGGTCACGCT-----------------------TTGAAGACGTTACTAAAATAACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATT-C-A-TTGATGAAATTTATAATAACCGTTATCG--ATAAATGTATTTATAGCAATATGAACTATTATGATTAAAA-CTGAAATGATAAAAAAAAGTTATAAAT-TGTT-TCCGCGAACATTTT--G-AA-C-C-CCCcggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaatatatatcagaaactgtgactaatataatgaaaacatattgtgaaaaatgctttgcagaaaaatactctctttaactagtacaaaagattttaagaagacgtcaattaatcaacgaatatggaaaaaggcggacgtcctgcaacgtaaataaagctagaatcatttctagggcttaaacgattctagatggggatagacgcataagtgacagagataaagcaactaaatttcaaaggagagtgcctattctagtatgacggagtatttgaataagcatcgcattgcagataagtgggggccatggttattttcaaccgaatacacaagaaaagggaatggtggcagcagctacacgatttctaaagaagtatcatggttaatgtggtacgggatatttcaataaaatagtaaaattttgtgagaaatggatatcaaggttagatcctaaaatcaaacatgtgtcatcagtttaaaaaaacggcatcccaatcagcaaagaagctcagcgaagaagcagactagtgtcgctttttacgacgtgtgaagtgtgttgatgaatcatgtcgtaccataataggaactacaaccaactcagactactattcacaggcttgctcagcacaatctttatcatttaaacaaaaaaaatctgctttttttgttttaccaattatttgccggttgttttaatgtaactttgaagtagcgtaatttgagaatgacacgacgttaagcgttttttgacgttgaaccggtcacgctttgaagacgttactaaaataactgtaacattttcagttttaaagattcattgatgaaatttataataaccgttatcgataaatgtatttatagcaatatgaactattatgattaaaactgaaatgataaaaaaaagttataaattgtttccgcgaacattttgaacccccctcg
gi|6 : aattgcatcctgtccacccacagctcaagtactttcatgctgtgacgtcagtcgaacattatgacgtcatttgtgacgtcagtacttcttcacggtacgcaatatatattattaagctgtttttacttcacaatgtctttagaacagcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaata--A-AA----CTTAACCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATG------AA-AACATATGGTG---G--AAA---A-----------GC-TTGAC----GAAAACTGCAAT------------------TTAT------ACATGGTACAACAGATTCGGCGAGGGCGTCAATTTACCAACGGGTATGGG-----AAAAGACGGACG-TCTTGCAACGTCAAAAG-TGTTAAAATCATTTCTAGGACCAAAATGATTCTTGATGGGGATAGATGCATAA--G--------AGAT--AGAGACATAACAAC----GGGAA-GTGACTATATACG---AGTTTATATTCTACAATTACGGATTATTTGAATACGTGTCATGTTACGTCTTGCTGGG-TGCCATAGTTACTTTTAATGGAATACA-GAGAGA--AGAG---TA-CTACGGCTACGTGCTTTATAAAGAA-C-T-A-AGGTAAATGTGGTATGAGATATTTAACTAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGTGTATCGACATTCGATCCCGAAACCAAACAAATGCCATCATTTTGGGGGAA-AAACGACATCTCCATCACCAGAGAAGCTCAGCAAAGAAGCAGATTTGTGTCG-TTTTCTACGAAGT----AATGT---CTCAAATCATGCCGTACC-T-GTATGAACTACAATCAAATCCAACTACTATTCAAAGACATGCGCAACAAAATATACTTATTATTTGTAC-------AGTTTTTG-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGTAGGTTGTTTTATAATTGTAATACCATGTGACTTTGAAATAACGT-AATTTGAGAATG-C--C-ATGCCCTTA-ATTA----ATTCCGCGTGTTTTGACATTG-TCCGCGGTCACGCC-----------------------TGCTAAGCGTctcg
gi|6 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaTGTATTTATATCGCTAATAAATAGTATGACTAAAA-CTGAAAGGAC--AAAAAAGTTATAAAT-AGTA-TC--CGAACTTTTTTCA-AATC-C-TCCTCgtatttatatcgctaataaatagtatgactaaaactgaaaggacaaaaaagttataaatagtatccgaacttttttcaaatcctcctcg
gi|7 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaaaacttaaccagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggtggaaaagcttgacgaaaactgcaatttatacatggtacaacagattcggcgagggcgtcaatttaccaacgggtatgggaaaagacggacgtcttgcaacgtcaaaagtgttaaaatcatttctaggaccaaaatgattcttgatggggatagatgcataagagatagagacataacaacgggaagtgactatatacgagtttatattctacaattacggattatttgaatacgtgtcatgttacgtcttgctgggtgccatagttacttttaatggaatacagagagaagagtactacggctacgtgctttataaagaactaaggtaaatgtggtatgagatatttaactaaaatagtgacagttgatgagacatgtgtatcgacattcgatcccgaaaccaaacaaatgccatcattttgggggaaaaacgacatctccatcaccagagaagctcagcaaagaagcagatttgtgtcgttttctacgaagtaatgtctcaaatcatgccgtacctgtatgaactacaatcaaatccaactactattcaaagacatgcgcaacaaaatatacttattatttgtacagtttttgttttctgtttgtttgtttaaccaattatttgtaggttgttttataattgtaataccatgtgactttgaaataacgtaatttgagaatgccatgcccttaattaattccgcgtgttttgacattgtccgcggtcacgcctgctaagcgGGGATGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATACTCAT-AAAATCTTTATCTGTTGTCTATACGTTTTAAAA-------TT---TC------AAGGTCTCTAT-ACTCATTAT-TGATTTTA-C-A-GACATCAGTAGTGTAGTCATGCTAATAATAGTTTTATCAATATTACAGTAACGTACATCGACCTTCACCGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTTTATTG-C-ATATATT--TTCGAAAATTGCTACAACTTTACATG---G---TCAT--TTCA---TTTTT-ACTTGCTG----ATGGATTTTC-TTAC-AAA-TTAT--ATCCCGTCCGCGTCTGAAGAACCCTATAGC----ATAA-TTTGTCACATCGATACGTCTTCACTAAACGCACCGTATATTATCAAGCTGTTT-TTACTTCACAGTGTCTTAAGAACAGTGGTACGCAATGAAAATTGAGTTTTGCAAATAA--A-AA----CTAAACCAGAAACTTT---GACTAC--CATT--ATG------AA-AACATATGGTG---A--AAATATA---TG------GC-TTT----AAGGAA-----AGG------------------TGAT------AAATGATAAAACAGATTCAGCAAAGGTGTCAATTAACCAACATACATAGG-----AGAAAACGTACG-TTATACAACATCAAAAATTGCTAGAATCATTTCCAGGGCTTAAAAAATT----------GTATACGCATAA--GTA--ATAGAGATTTAGCAGC-TAA--AC----TGGAC-AT---TTGA-ACGGGAAGTGACTATTCTATTATTACGGATCATCTGAAg
gi|8 : -TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAAA--------ACATTATGACAATATTTGTGACATCAATACGACTT-----CACT-GTACACACTG------------------TAT--ATGA----CT-------AAGCTGT---TTTCACTTTACA--ATGTAT-TTAG-AACA-GCGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------t
gi|8 : --A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATG------AA-AACATATG--A---C--GGA---A---AA------GC-TTTGC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATAGTACAACAGATTCGGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGTCAGAATCATTTCTAGGGCCAAACTGACTCTAGATGGGGATTGACGCCTAAGTGTG--AC--ATATTTAGCAAC-TAA--AC----TGAACAGT---TTT--ACAGGAAGTGCATTTTCTAGTATTACGGATTATTTGAAAATGCATCGCATATCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCAAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCAGCAGCTACACAATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTACGAGATATCTAAATAAAATGGTGACAGTTGGTGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTAAAAACAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-TACCGGCATCCCCcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatgacggaaaagctttgcagaaaactgcaatttataaatagtacaacagattcggtgaaggcatcagttaaccaacagacatggaaaaaggcagacgtcctgcaacgtcaaaaacgtcagaatcatttctagggccaaactgactctagatggggattgacgcctaagtgtgacatatttagcaactaaactgaacagttttacaggaagtgcattttctagtattacggattatttgaaaatgcatcgcatatcagctaggtgggtgccatggttactttcaagcaaatacaaagagatgagaatggcagcagctacacaatttctaaagaaatatggtaaatgtggtacgagatatctaaataaaatggtgacagttggtgagacatgggtatcaacgttcgatcctaaaaacaaacaaatgtcatcagtttggaaaataccggcatcccc
gi|9 : tttcatactgtgacatcagtaaaacattatgacaatatttgtgacatcaatacgacttcactgtacacactgtatatgactaagctgttttcactttacaatgtatttagaacagcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaAGGGTTGTTCAAAATGTTCGTGGGAAATGCTTAT-AGATACTTTAACTGCCATTTGTATGATTTAAAA-------TTTAATCCAAACATAGGTCTATAT-ATTCATTAT-TT--TTCA-CTA-AAAATCAACACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGCATCTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCTCAGGGTCACTTTTCGTTATTTGGAA-G-GTATT--TTTGAAAATCGCTACCTCTTTACATATTCT---TAAC--T------TTTTA-ATGTGCTG----ATG--------------------C--ATCCCGTCCA------------CCTAAAGCT-CAGTAC-TT--TAATTCTGTGAAG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAGTACGTCTT-----CACT-GTACACACGG------------------TAT-----A----TT--ACC--AAGCTGT---TTTCACATCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGTA---AGGAAT---A---AA------AT-TTTG
gi|9 : TG------------------CAT--A-AGAATGCTTAATCAGAAACTGTCAAGAGCGTT-------ATG------GA-AACATATGGCG---A--AAA---A-----------GC-TTTAC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATGGTAC-ACGAATTCGGCGAAGGCGTCAtgtttgcataagaatgcttaatcagaaactgtcaagagcgttatggaaacatatggcgaaaaagctttacagaaaactgcaatttataaatggtacacgaattcggcgaaggcgtca
Alignments
lowQualScore : 1111111 2222222222 111 22222222222222222222 1 33333333333333333 222222222222 11111111 11111 222222222222222222 222222222222222 2222 11 444444 111 44444444444 2222 222222222222222222 111111 11111 1 111111111 33 1 1 1 1111 11111111 11 5555555555555555555555 22222222222222222222222 22222 1
lowQualScore : 3 3 4 1 3333333 1 1 0 4 4 99 6 1111111111 999 5 66 99999999999999999999 0 9999 1 22222222222222222 222222222222 4 1 3 55 666 44444444 11111 4 999999999999999999 111111111111111 44 777777 5555 11 666666 2 888 444 33 555 99999999999 2 3333 7 444444444444444444 111111 1 00000 6 4 0 3 2 0 4 66 66 888888888 1 66 999999 4 1 0 1 1 1 2 1 1 4 8 55 777 1 00 5 0 4 1 0 5 1 1 2 3 3 6 77 9999 5 5 1 00 2 3 0 66 1 55555555 0 00 1 1 8888888 1 0 3 0 3333333333333333333333 777 0 88888888888888888888888 1 3 55555 0 5 1 2 33 55 0 2 77 2 1 5 44 2 3 666
lowQualScore : . . . . ....... . . . . . .. . .......... ... . .. .................... . .... . ................. ............ . . . .. ... ........ ..... . .................. ............... .. ...... .... .. ...... . ... ... .. ... ........... . .... . .................. ...... . ..... . . . . . . . .. .. ......... . .. ...... . . . . . . . . . . . .. ... . .. . . . . . . . . . . . . .. .... . . . .. . . . .. . ........ . .. . . ....... . . . . ...................... ... . ....................... . . ..... . . . . .. .. . . .. . . . .. . . ...
lowQualScore : 7 2 0 4 0000000 2 4 9 0 0 77 3 9999999999 111 0 99 88888888888888888888 0 4444 1 22222222222222222 888888888888 7 7 6 00 444 55555555 11111 4 555555555555555555 555555555555555 11 888888 9999 00 999999 7 111 000 99 000 00000000000 9 4444 2 666666666666666666 555555 0 00000 4 0 0 7 4 9 4 11 11 666666666 7 11 444444 4 9 1 1 0 0 2 4 0 4 9 22 888 9 77 0 0 0 7 7 7 4 3 5 7 3 7 77 3333 0 0 4 55 3 6 1 11 7 66666666 8 77 8 1 7777777 1 3 6 3 5555555555555555555555 000 2 55555555555555555555555 0 6 00000 5 1 8 3 33 00 3 9 99 9 7 7 22 3 1 888
consensus : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTATAAAA-TCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAATTTA-------ATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---C---TAAT--T--A---TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAA--GTG--AC--AGATTT--AGCAACTAAACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
Reference ( family-4598 ) : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTATAAAA-TCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAATTTA-------ATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---C---TAAT--T--A---TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAA--GTG--AC--AGATTT--AGCAACTAAACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
gi|1 : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGACGAAAATGCTTATACAA-TCTTTATCTATCATCTGTATGATTTGAAATGTA-------ACTCTAGTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TGATT-------AAATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G-ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A--ATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGT---GATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATG-CA--TAA--GT-----------TT--AGCAACTATACTGGAC-GT---TTTA-ACAGGA-GTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTAT-AATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTTGAAA-AAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA--------ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGT-CATTTGAGAATGACTTT-ATG-----A-ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT---------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTT--G-AA-T-CACCCTC
gi|10 : GTACC-T-ATTGTAACTACAAGCAATTCCAACTACTTTTCAAAGGCATACACAACACAATTT--TCATTATCCATAC-------ATTTTTTT-----CTGTTTGT--GT--AACTATTTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACATTGAAGTAACGT-AATTTGAAAATGACA-TGACGTT---A-ATTA----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CAGTCATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACGGCAACTTTTTTTGTTTTAAAGA-T-ACA-TTGGTCACATTTATAGTACAAGTTGCAA--ATATATGTACTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-AATT-TCCGCGAACTTTTT--GAAA-C-C-CCCT
gi|11 : ----ATGGATTTTTTGTAA-AAA-T--TGCATCTCACCCA------------CCTACAGCTCCAGAAC-TT--TCATACTGTGACC---CCAGTAGA--------ATGTTATGACATTATTTGTGACGTCAATACATCTT-----CACT-GTGCACACTG------------------TAT--A-------TTG--CCA--AACTTT-----TCACTTTACA--ATGT-C-TTAAGAACA-GCGGTATGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAATACTA-AATCAGAAACTGTGACTAACATTATGAAAACATATGGCGAAAC--ATCCGGCGAAGGTGTCAGTTAGCCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGATG-TCGTG
gi|11 : G-TGCTTTGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGAGAT-GCTAGAAGATTTCTAAAGAA-tgctttggttactttcaagcgaatacaaagagatgagaatggagatgctagaagatttctaaagaaacat
gi|12 : atggattttttgtaaaaattgcatctcacccacctacagctccagaactttcatactgtgaccccagtagaatgttatgacattatttgtgacgtcaatacatcttcactgtgcacactgtatattgccaaacttttcactttacaatgtcttaagaacagcggtatggaataaaattttgtgttttgcaaaagaatactaaatcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggcgaaacatccggcgaaggtgtcagttagccaacagacatggaaaaaggcagatgtcgtTTATGCCTTACC-T-ATAGGAACTACAGTCAGCTTCAGCTACTATTCAAAGGCATGCACGATACAATCT--TTATTATTCTAAC-------A----TTT-TTTTCTGTGTGTTTGTTTAACTAATTATTTGTGGGC-------------TAATACAATGTAACTTTGAAGCAACGT-TATTTGAAAATGAC----ATG-----A---TG-----TTAACTG-ATT---AAGTTGATC--AGGTTATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAAA-TAA-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACATGTTGTCGATATATATGTATTTATATGAATATGAAATATTATGATAAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-A-T-CCCacat
gi|13 : CTACTATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TTATTGTTCATAC-------ACTTTT-----TTCTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCAGGCTGTTTTATAATGGTAATACAAGCTGACTTTGAAGTAACTT-AATTTGAGAATGACA-TGACGTT---A-ATAA----ATTAAGCATATTTTGACATTGATC--TGTTCACACTTTTGACAATGTTCTGTTCACACTTGGTAGGCGTTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-TAA-A-TTAGTAAAATTTGTAATACATGTTGTCG--ATACATG--------TCGATAC---ATG-TAT--TTATAT-C---AATGAT--GAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCAAACCTTTT--G-AA-
gi|14 : CAATGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACATCAAAAAACGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGAGATAGACG-CG--TAC--GTGTTAC--ATATTT--AGTAACTAAATTGGAC-AG---TTTG-ACGGGAAGAACATATTCTAGTATTACAGATTATTTGAAAATGCGTCGCGCTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATAGATTCTTTCAAGCAAATACACGAGCGATGAGAA---TGGCGGCGGCCACACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATa
gi|15 : GAGGGATGTTCAAAAAGTTTGCGGAAAATGCTTATATAA-TCTTTATCTGTCATTTGTAGGATTTGAAATGTA-------TTCCATAGAATGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACCAGAAATCAGCACT-TAGTGATACTAGTAATATTTTTATCGTTATTGCAGTAACGTACAT----------CGACTGTCACCGGATCACTTTTAATTATTTGG-CAG-GTATT--TTCGAAAACTTCTGCTACTTTACATA---TACATAAC--T------TTTTA-ATGCGCTGTCAAATAGATTT
gi|16 : cATTTGAAATTTA-------ATCCAAATAAAGGTCTATAT-ATCTTTTAT-TGAGTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCGTACCAGTTATATTTTTATCGTTACTACAGTAATGTACAT----------TGACCGTCACCAGATCACTTTTCGTTATTTGA-CAG-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTATATA-------TAAA--T--AACTCTTTA-ATGCTCTG----ATG--------------------C--ACCCTGTCTA------------CCTGCAGCTACGGTACTTT--TCATACTGTGATG---TCGGTAGA--------ACATTATGATGTTAT
gi|17 : aTCTGTTTGTTTAACAAATTATTCGCGTTTT-TTTTATAACTGTTATACGATGTGACTTTTAAGTAACGT-AATTTAAGAATGACATT-ACGTT---T-ATTA----ATTAAACATATTTTGACGTTGATC--------CGCT-----------------------TGGTAAGCATTATTAAAATCGCAGTAACATTTTCAGTTTAAAATA-T-----------ACATTTATA----------TCA--ATATG---AACTAT-----TATGA----------TTACAA-CTGAACTAATAAAAAAAAGTTATAAAT-ATTTGTTCACGAACTTTTT--GAAA-C-A-CCCT
gi|18 : TGAGTATGGC----ATG-----A-CTAT----ATTAGGCGTATTTTTACCATGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACAACAATTGCTGTAACATTCTCAGGAT-AAAAA-T-ACA-ATGGT-AAAGTTATAGTACAAGTTGTTA--ATATATGTACTTATATTAATATGAAATAGTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAACAGTTACAAAT-ACTT-TCCGTGAACTT
gi|19 : -----A-AATA----ATTCAGAGTATTTTGATGTTGAT-----------------------------------------------ACTAAAATTATAGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-ACA-TTGGTGAAATTTATAGTAGAAGT---CG--ATATATGTATTTATATTAATATGAAGTATCATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATGAAT-AGTT-CCCGCAAACTTTTT--A-AA-A-C-CCcgtaa
gi|2 : tttctgaatataacttcagcgtaGAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGACGAAAATGCTTATACAA-TCTTTATCTATCATCTGTATGATTTGAAATGTA-------ACTCTAGTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TGATT-------AAATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G-ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A--ATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGT---GATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATG-CA--TAA--GT-----------TT--AGCAACTATACTGGAC-GT---TTTA-ACAGGA-GTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTAT-AATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTTGAAA-AAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA--------ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGT-CATTTGAGAATGACTTT-ATG-----A-ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT---------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTT--G-AA-T-CACCCTacctgt
gi|20 : GAGGGGTGTTCAAACAGTTCGCGAAAAATGCTTATAAAAATCTTTATCTGTCAATTGTAGGATTTGGAATTTATTCTTTAATCCAAAAAAAAGTCTACAT-ATTCTATAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAATCGTAGCAGTAACATTTTT
gi|21 : acGAGGGGTGTTCAAAA-------------TGCTTATAAAA-TCTGTATATGTCATGTGTATGATTTGTAATTTA-------ATCCTAACAGCGCTCTATAT-ATTCTTTAT-TGAACA-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCCAACTAGTAATA-TTTTATCGTTATCACAcgt
gi|22 : cTTGTTTGTTTAACCAATTATTTACTGGCTGTTCT-------------AATGTAACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAAT---------G-----A-ATTGAC--ATTA-----ATTTTGATGTTGATC--AGGTCACGCT-----------------------TGGTAGACGTTACTAAAACTACGGTAACATTTTC
gi|23 : ATATATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTTTAAAT--CTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCgag
gi|24 : tttggaaaacaagGAGGGGTGTTGAAAAAGTTCACGGAAAATGTTTATAAAA-TCTTTATCCATCATATTTACGATTTctcata
gi|24 : ac-TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAcatactgtgacatcagta
gi|25 : acgaggggtgttgaaaaagttcacggaaaatgtttataaaatctttatccatcatatttacgaTGATTAAAAACTGAAA------AACAAAG--ATACATTATTTGTCTACAAACTTTTT--G-AA-CAA-CCCTC
gi|3 : ataaGAGGGGTGTTCAAAATGTTCGTGGAAAATGCTTATAAAT-TTTTTATCTGTCATCTGTATGATTTTAAATTTA-------ATCCATATAAAGGCCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACCAGAAATGGGGATTGTAGTCATACCAGTATTATTTTTACCATAACTACAGTAACGTACAT----------TGACCGTTACTGGATCAGGTTTCATTATTTGC-T-A-GTATT--TTCAAAAATTACTACTATTTTTCCTA---T---TCATAAT--A---TTTTA-ATGCACCA----ATGGATTTTT-GAAA-AAA-TTGC--ATTCCATCCA------------CCTACAGCTCCAGTAT-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTA-TTGTGACATCAATACGTCTT-----CACT-GTACACACTA------------------TAT--C-AC----C--------AAGCTGT---TTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACAT-CGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAATTAatttg
gi|3 : t--A-AA----TTAA-TCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATGA-C-C--A-CACATA--GCA---A--AAA---A------------TCTTTGC--A-GAACACTGCAAT------------------TTAT------ATATGGTACAAAAGATTCTGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATAGA-----AAAAG---------------------AATA-TGCTAGAACCATTTCTAGGGCCAAAATGATTCTAGAAGGGGAAAGACG-CA--TAA--GTGTTAC--AGATTT--AGCAACTGAACTGGAC-AG---TTTA-ATGGGAAACGCCTATTCTAGTTTTACGGATGTTTTGAAAATGCGTCGCTTTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGTTAATGCA-AAGAGATGAGAA---TGGTGGCGGCT-CACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCA-TATCAACGTTAGATCATAAAAACAAACAAATGTTATCAGTTTGGAA-TA-AACCAGCATCCCCATCAACAAAGAAGCTCAGAGAAGAAGCAGAT-------G-TTTC-TACGATGTTGGAAGTGT---CTCGACTTATGCCATACC-T-ATAGTAACTACA-TCAACT--------------------TGCACAACACAATCT--TTATTATTCATAC-------ATTTTTTT-TCT-------GTTTCTTTAACTTATTATTTGCGGGCTGTT------TTATAAT------------TGAAAT----TCAATGTGAGG--------------------TTA----ATTAAGCGTATTT-----------------------------------------------AGTAGGCGTTATTGAAATCACTGCAACATTTTCAGTATTAAAGA-T-A-AATTGGTGAAATTTGTAGTACACGT---CG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-C--AAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCTGCAAACTTTTT--GAAA-C-T-CCCTCatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaacttattatttgcgggctgttttataattgaaattcaatgtgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaacaaatgataaaaaagttataaatactttctgcaaactttttgaaactccctcgt
gi|4 : tgaggggtgttcaaaatgttcgtggaaaatgcttataaattttttatctgtcatctgtatgattttaaatttaatccatataaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaGGGGTGTTCAAAATGTTCGAGGAAAATGCTTTTAAAA-TCTTTATCTGTAATTTGTTTGATTTGAAATTTA-------ATTCAAACAAAGATCTATACCAGTCTA-ATCTAATTT-ACAAGTAATAAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTTTCGTTACCTCAGTAACGTACAT----------TGACCGTCGCCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-CTG-GTATTATTTGGAAGTTTGCTACTACTTTACATA---C---TCAT--A--ACT-TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATCCTT-GTAA-AAAAT--GC-ACCCCATCTA------------CCTACTGCTCCAGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CTTT-GTAAACATTG------------------TAT-----A----TTA---CA-AAGCTGT---TTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AAC-TGCGGTA---A--GGA---ATACAATTTTTTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------gt
gi|4 : acgt--A-AA----CTAAATCAGAAACTGC---GACTA----ACA--ACAT-A---AA-AACAAATGGCA---A--AAC---A-----------GG-TCTGC--A-GAAAACTGCAAC------------------TGAT------AAATGGTACAAAAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACTAACCGATTTAGACTTTTAAACG--GGAAGTTCCTGCcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggtacaaaagattcggcgaaggcgtcagttaactaaccgatttagacttttaaacgggaagttcctgccttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|4 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaCAAAA-GATTC-----GGCGA-AGGCGTCAGTTAA--CTA--AC--CGATTT--AG-------ACT------T---TTAA-ACGGGAAGTTCCTGCCTTAGTATTATG-ATTATTTGAAAGTGTGTCG-GTTGCAGCTTGGCGGGATGCCATGGTTACGTTCAAGCGAATACA-AAGAGATAGGAA---TGGCGGCTGCTAGACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATTAAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCGGTATCAACATTCCATCCC--AAT--AACAAATGTTATCAATTTCGAA-AA-TACCGGCA------------AAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGATTTTTGTCGGTTTC-TAAGACGTGGGAAGTGTCTT---GACTTATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATTAACTTCAACAACCATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TAATTATTCATAC-------ATTTT-----TTTCTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCGGGCTGTTTTATATTTATAATACAATGTGACTTTAAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC----ATG-----ACGTTGATAAATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTTAAATTACCGTAATATTTTGAGTTTTAAAGA-TAA-A-TTTGTGAATTTTGTAGTACATGTTGTCG--ATATATGTATTTATGTCAATATGAAAAATTATGATTAAAA-CTGAAATGA---AAAAAA-----AAAT-ACTT-TCCGCGAGCTTTTT--GAAA-C-C-CCCTcttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|5 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaaaactaaatcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggta--ATCCTGTCCA------------CCCACAGCTCAAGTAC-TT--TCATGCTGTGACG---TCAGTCGA--------ACATTATGACGTCATTTGTGACGTCAGTACTTCTT-----CACG-GTACGCAATA------------------TAT-----A----TT--ATT--AAGCTGT---TTTTACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGCA---
gi|5 : aattgcTATATCAGAAACTGT---GACTAAT--ATA--ATG------AA-AACATATTGTG---A--AAA---A---T-------GC-TTTGC--A-GAAAAATACTCT------------------CTTT------AACTAGTACAAAAGATTTTAAGAAGACGTCAATTAATCAACGAATATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTAAATAA-AGCTAGAATCATTTCTAGGGCTTAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAA--GTG--AC--AGAGATAAAGCAACTAAA--------T---TTCA-AAGGAGAGTGCCTATTCTAGTATGACGGAGTATTTGAATAAGCATCGCATTGCAGATAAGTGGG-GGCCATGGTTATTTTCAACCGAATACACAAGAAAAGGGAATGGTGGCAGCAGCTACACGATTTCTAAAGAAGTATCA-TGGTTAATGTGGTACGGGATATTTCAATAAAATAGTAAAATTTTGTGAGAAATGGATATCAAGGTTAGATCCTAAAATCAAACATGTGTCATCAGTTT--AA-AA-AAACGGCATCCCAATCAGCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCGCTTTT-TACGACGTGTGAAGTGTGTTGATGAATCATGTCGTACCATAATAGGAACTACAACCAACTCAGACTACTATTCACAGGCTTGCTCAGCACAATCT--TTATCATTTAAACAAAAAAAATCTGCTT-TT---------TTTGTTTTACCAATTATTTGCCGGTTGTTTT-------------AATGTAACTTTGAAGTAGCGT-AATTTGAGAATGAC----ACG-----A---CG-----TTAAGCGTTTTTTGACGTTGAAC--CGGTCACGCT-----------------------TTGAAGACGTTACTAAAATAACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATT-C-A-TTGATGAAATTTATAATAACCGTTATCG--ATAAATGTATTTATAGCAATATGAACTATTATGATTAAAA-CTGAAATGATAAAAAAAAGTTATAAAT-TGTT-TCCGCGAACATTTT--G-AA-C-C-CCCcggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaatatatatcagaaactgtgactaatataatgaaaacatattgtgaaaaatgctttgcagaaaaatactctctttaactagtacaaaagattttaagaagacgtcaattaatcaacgaatatggaaaaaggcggacgtcctgcaacgtaaataaagctagaatcatttctagggcttaaacgattctagatggggatagacgcataagtgacagagataaagcaactaaatttcaaaggagagtgcctattctagtatgacggagtatttgaataagcatcgcattgcagataagtgggggccatggttattttcaaccgaatacacaagaaaagggaatggtggcagcagctacacgatttctaaagaagtatcatggttaatgtggtacgggatatttcaataaaatagtaaaattttgtgagaaatggatatcaaggttagatcctaaaatcaaacatgtgtcatcagtttaaaaaaacggcatcccaatcagcaaagaagctcagcgaagaagcagactagtgtcgctttttacgacgtgtgaagtgtgttgatgaatcatgtcgtaccataataggaactacaaccaactcagactactattcacaggcttgctcagcacaatctttatcatttaaacaaaaaaaatctgctttttttgttttaccaattatttgccggttgttttaatgtaactttgaagtagcgtaatttgagaatgacacgacgttaagcgttttttgacgttgaaccggtcacgctttgaagacgttactaaaataactgtaacattttcagttttaaagattcattgatgaaatttataataaccgttatcgataaatgtatttatagcaatatgaactattatgattaaaactgaaatgataaaaaaaagttataaattgtttccgcgaacattttgaacccccctcg
gi|6 : aattgcatcctgtccacccacagctcaagtactttcatgctgtgacgtcagtcgaacattatgacgtcatttgtgacgtcagtacttcttcacggtacgcaatatatattattaagctgtttttacttcacaatgtctttagaacagcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaata--A-AA----CTTAACCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATG------AA-AACATATGGTG---G--AAA---A-----------GC-TTGAC----GAAAACTGCAAT------------------TTAT------ACATGGTACAACAGATTCGGCGAGGGCGTCAATTTACCAACGGGTATGGG-----AAAAGACGGACG-TCTTGCAACGTCAAAAG-TGTTAAAATCATTTCTAGGACCAAAATGATTCTTGATGGGGATAGATG-CA--TAA--GAG--AT--AGAGAC--A-TAAC--AACGGGAA-GTGACTATATACG---AGTTTATATTCTACAATTACGGATTATTTGAATACGTGTCATGTTACGTCTTGCTGGG-TGCCATAGTTACTTTTAATGGAATACA-GAGAGA--AGAG---TA-CTACGGCTACGTGCTTTATAAAGAA-C-T-A-AGGTAAATGTGGTATGAGATATTTAACTAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGTGTATCGACATTCGATCCCGAAACCAAACAAATGCCATCATTTTGGGGGAA-AAACGACATCTCCATCACCAGAGAAGCTCAGCAAAGAAGCAGATTTGTGTCG-TTTTCTACGAAGT----AATGT---CTCAAATCATGCCGTACC-T-GTATGAACTACAATCAAATCCAACTACTATTCAAAGACATGCGCAACAAAATATACTTATTATTTGTAC-------AGTTTTTG-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGTAGGTTGTTTTATAATTGTAATACCATGTGACTTTGAAATAACGT-AATTTGAGAATG-C--C-ATGCCCTTA-ATTA----ATTCCGCGTGTTTTGACATTG-TCCGCGGTCACGCC-----------------------TGCTAAGCGTctcg
gi|6 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaTGTATTTATATCGCTAATAAATAGTATGACTAAAA-CTGAAAGGAC--AAAAAAGTTATAAAT-AGTA-TC--CGAACTTTTTTCA-AATC-C-TCCTCgtatttatatcgctaataaatagtatgactaaaactgaaaggacaaaaaagttataaatagtatccgaacttttttcaaatcctcctcg
gi|7 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaaaacttaaccagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggtggaaaagcttgacgaaaactgcaatttatacatggtacaacagattcggcgagggcgtcaatttaccaacgggtatgggaaaagacggacgtcttgcaacgtcaaaagtgttaaaatcatttctaggaccaaaatgattcttgatggggatagatgcataagagatagagacataacaacgggaagtgactatatacgagtttatattctacaattacggattatttgaatacgtgtcatgttacgtcttgctgggtgccatagttacttttaatggaatacagagagaagagtactacggctacgtgctttataaagaactaaggtaaatgtggtatgagatatttaactaaaatagtgacagttgatgagacatgtgtatcgacattcgatcccgaaaccaaacaaatgccatcattttgggggaaaaacgacatctccatcaccagagaagctcagcaaagaagcagatttgtgtcgttttctacgaagtaatgtctcaaatcatgccgtacctgtatgaactacaatcaaatccaactactattcaaagacatgcgcaacaaaatatacttattatttgtacagtttttgttttctgtttgtttgtttaaccaattatttgtaggttgttttataattgtaataccatgtgactttgaaataacgtaatttgagaatgccatgcccttaattaattccgcgtgttttgacattgtccgcggtcacgcctgctaagcgGGGATGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATACTCATAAAA-TCTTTATCTGTTGTCTATACGTTTTAAAATTT---------------CAA-GGTCTCTAT-ACTCATTAT-TGATTTTAC-AGACATCAGTAGTGTAGTCATGCTAATAATAGTTTTATCAATATTACAGTAACGTACATCGACCTTCACCGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTTTATTG-C-ATATATT--TTCGAAAATTGCTACAACTTTACATG---G---TCAT--TTCA---TTTTT-ACTTGCTG----ATGGATTTTC-TTAC-AAA-TTAT--ATCCCGTCCGCGTCTGAAGAACCCTATAGC----ATAA-TTTGTCACATCGATACGTCTTCACTAAACGCACCGTATATTATCAAGCTGTTT-TTACTTCACAGTGTCTTAAGAACAGTGGTACGCAATGAAAATTGAGTTTTGCAAATAA--A-AA----CTAAACCAGAAACTTT---GACTAC--CATT--ATG------AA-AACATATGGTG---A--AAATATA---TG------GC-TTT----AAGGAA-----AGG------------------TGAT------AAATGATAAAACAGATTCAGCAAAGGTGTCAATTAACCAACATACATAGG-----AGAAAACGTACG-TTATACAACATCAAAAATTGCTAGAATCATTTCCAGGGCTTAAAAAATT----------GTATACG-CA--TAA--GTA--ATAGAGATTT--AGCAGCTAAACTGGAC-AT---TTGA-ACGGGAAGTGACTATTCTATTATTACGGATCATCTGAAg
gi|8 : -TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAAA--------ACATTATGACAATATTTGTGACATCAATACGACTT-----CACT-GTACACACTG------------------TAT--ATGA----CT-------AAGCTGT---TTTCACTTTACA--ATGTAT-TTAG-AACA-GCGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------t
gi|8 : --A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATG------AA-AACATATG--A---C--GGA---A---AA------GC-TTTGC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATAGTACAACAGATTCGGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGTCAGAATCATTTCTAGGGCCAAACTGACTCTAGATGGGGATTGACG-CC--TAAGTGTG--AC--ATATTT--AGCAACTAAACTGAACAGT---TTT--ACAGGAAGTGCATTTTCTAGTATTACGGATTATTTGAAAATGCATCGCATATCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCAAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCAGCAGCTACACAATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTACGAGATATCTAAATAAAATGGTGACAGTTGGTGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTAAAAACAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-TACCGGCATCCCCcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatgacggaaaagctttgcagaaaactgcaatttataaatagtacaacagattcggtgaaggcatcagttaaccaacagacatggaaaaaggcagacgtcctgcaacgtcaaaaacgtcagaatcatttctagggccaaactgactctagatggggattgacgcctaagtgtgacatatttagcaactaaactgaacagttttacaggaagtgcattttctagtattacggattatttgaaaatgcatcgcatatcagctaggtgggtgccatggttactttcaagcaaatacaaagagatgagaatggcagcagctacacaatttctaaagaaatatggtaaatgtggtacgagatatctaaataaaatggtgacagttggtgagacatgggtatcaacgttcgatcctaaaaacaaacaaatgtcatcagtttggaaaataccggcatcccc
gi|9 : tttcatactgtgacatcagtaaaacattatgacaatatttgtgacatcaatacgacttcactgtacacactgtatatgactaagctgttttcactttacaatgtatttagaacagcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaAGGGTTGTTCAAAATGTTCGTGGGAAATGCTTATAGAT-ACTTTAACTGCCATTTGTATGATTTAAAATTTA-------ATCCAAACATAGGTCTATAT-ATTCATTAT-TT-TTC-ACTAAAAATCAACACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGCATCTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCTCAGGGTCACTTTTCGTTATTTGGAA-G-GTATT--TTTGAAAATCGCTACCTCTTTACATATTCT---TAAC--T------TTTTA-ATGTGCTG----ATG--------------------C--ATCCCGTCCA------------CCTAAAGCT-CAGTAC-TT--TAATTCTGTGAAG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAGTACGTCTT-----CACT-GTACACACGG------------------TAT-----A----TT--ACC--AAGCTGT---TTTCACATCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGTA---AGGAAT---A---AA------AT-TTTG
gi|9 : TG------------------CAT--A-AGAATGCTTAATCAGAAACTGTCAAGAGCGTT-------ATG------GA-AACATATGGCG---A--AAA---A-----------GC-TTTAC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATGGTAC-ACGAATTCGGCGAAGGCGTCAtgtttgcataagaatgcttaatcagaaactgtcaagagcgttatggaaacatatggcgaaaaagctttacagaaaactgcaatttataaatggtacacgaattcggcgaaggcgtca
Alignments
lowQualScore : 1111111 2222222222 111 22222222222222222222 1 33333333333333333 222222222222 11111111 11111 222222222222222222 222222222222222 2222 11 444444 111 44444444444 2222 222222222222222222 111111 11111 1 111111111 33 1 1 1 1111 11111111 11 5555555555555555555555 22222222222222222222222 22222 1
lowQualScore : 3 3 4 1 3333333 1 1 0 4 4 99 6 1111111111 999 5 66 99999999999999999999 0 9999 1 22222222222222222 222222222222 4 1 3 55 666 44444444 11111 4 999999999999999999 111111111111111 44 777777 5555 11 666666 2 888 444 33 555 99999999999 2 3333 7 444444444444444444 111111 1 00000 6 4 0 3 2 0 4 66 66 888888888 1 66 999999 4 1 0 1 1 1 2 1 1 4 8 55 777 1 00 5 0 4 1 0 5 1 1 2 3 3 6 77 9999 5 5 1 00 2 3 0 66 1 55555555 0 00 1 1 8888888 1 0 3 0 3333333333333333333333 777 0 88888888888888888888888 1 3 55555 0 5 1 2 33 55 0 2 77 2 1 5 44 2 3 666
lowQualScore : . . . . ....... . . . . . .. . .......... ... . .. .................... . .... . ................. ............ . . . .. ... ........ ..... . .................. ............... .. ...... .... .. ...... . ... ... .. ... ........... . .... . .................. ...... . ..... . . . . . . . .. .. ......... . .. ...... . . . . . . . . . . . .. ... . .. . . . . . . . . . . . . .. .... . . . .. . . . .. . ........ . .. . . ....... . . . . ...................... ... . ....................... . . ..... . . . . .. .. . . .. . . . .. . . ...
lowQualScore : 7 2 0 4 0000000 2 4 9 0 0 77 3 9999999999 111 0 99 88888888888888888888 0 4444 1 22222222222222222 888888888888 7 7 6 00 444 55555555 11111 4 555555555555555555 555555555555555 11 888888 9999 00 999999 7 111 000 99 000 00000000000 9 4444 2 666666666666666666 555555 0 00000 4 0 0 7 4 9 4 11 11 666666666 7 11 444444 4 9 1 1 0 0 2 4 0 4 9 22 888 9 77 0 0 0 7 7 7 4 3 5 7 3 7 77 3333 0 0 4 55 3 6 1 11 7 66666666 8 77 8 1 7777777 1 3 6 3 5555555555555555555555 000 2 55555555555555555555555 0 6 00000 5 1 8 3 33 00 3 9 99 9 7 7 22 3 1 888
consensus : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTATAAAA-TCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAATTTA-------ATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---C---TAAT--T--A---TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAA--GTG--AC--AGATTT--AGCAACTAAACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
Reference ( family-4598 ) : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTATAAAA-TCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAATTTA-------ATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---C---TAAT--T--A---TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAA--GTG--AC--AGATTT--AGCAACTAAACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
gi|1 : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGACGAAAATGCTTATACAA-TCTTTATCTATCATCTGTATGATTTGAAATGTA-------ACTCTAGTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TGATT-------AAATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G-ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A--ATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGT---GATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATG-CA--TAA--GT-----------TT--AGCAACTATACTGGAC-GT---TTTA-ACAGGA-GTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTAT-AATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTTGAAA-AAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA--------ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGT-CATTTGAGAATGACTTT-ATG-----A-ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT---------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTT--G-AA-T-CACCCTC
gi|10 : GTACC-T-ATTGTAACTACAAGCAATTCCAACTACTTTTCAAAGGCATACACAACACAATTT--TCATTATCCATAC-------ATTTTTTT-----CTGTTTGT--GT--AACTATTTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACATTGAAGTAACGT-AATTTGAAAATGACA-TGACGTT---A-ATTA----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CAGTCATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACGGCAACTTTTTTTGTTTTAAAGA-T-ACA-TTGGTCACATTTATAGTACAAGTTGCAA--ATATATGTACTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-AATT-TCCGCGAACTTTTT--GAAA-C-C-CCCT
gi|11 : ----ATGGATTTTTTGTAA-AAA-T--TGCATCTCACCCA------------CCTACAGCTCCAGAAC-TT--TCATACTGTGACC---CCAGTAGA--------ATGTTATGACATTATTTGTGACGTCAATACATCTT-----CACT-GTGCACACTG------------------TAT--A-------TTG--CCA--AACTTT-----TCACTTTACA--ATGT-C-TTAAGAACA-GCGGTATGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAATACTA-AATCAGAAACTGTGACTAACATTATGAAAACATATGGCGAAAC--ATCCGGCGAAGGTGTCAGTTAGCCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGATG-TCGTG
gi|11 : G-TGCTTTGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGAGAT-GCTAGAAGATTTCTAAAGAA-tgctttggttactttcaagcgaatacaaagagatgagaatggagatgctagaagatttctaaagaaacat
gi|12 : atggattttttgtaaaaattgcatctcacccacctacagctccagaactttcatactgtgaccccagtagaatgttatgacattatttgtgacgtcaatacatcttcactgtgcacactgtatattgccaaacttttcactttacaatgtcttaagaacagcggtatggaataaaattttgtgttttgcaaaagaatactaaatcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggcgaaacatccggcgaaggtgtcagttagccaacagacatggaaaaaggcagatgtcgtTTATGCCTTACC-T-ATAGGAACTACAGTCAGCTTCAGCTACTATTCAAAGGCATGCACGATACAATCT--TTATTATTCTAAC-------A----TTT-TTTTCTGTGTGTTTGTTTAACTAATTATTTGTGGGC-------------TAATACAATGTAACTTTGAAGCAACGT-TATTTGAAAATGAC----ATG-----A---TG-----TTAACTG-ATT---AAGTTGATC--AGGTTATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAAA-TAA-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACATGTTGTCGATATATATGTATTTATATGAATATGAAATATTATGATAAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-A-T-CCCacat
gi|13 : CTACTATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TTATTGTTCATAC-------ACTTTT-----TTCTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCAGGCTGTTTTATAATGGTAATACAAGCTGACTTTGAAGTAACTT-AATTTGAGAATGACA-TGACGTT---A-ATAA----ATTAAGCATATTTTGACATTGATC--TGTTCACACTTTTGACAATGTTCTGTTCACACTTGGTAGGCGTTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-TAA-A-TTAGTAAAATTTGTAATACATGTTGTCG--ATACATG--------TCGATAC---ATG-TAT--TTATAT-C---AATGAT--GAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCAAACCTTTT--G-AA-
gi|14 : CAATGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACATCAAAAAACGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGAGATAGACG-CG--TAC--GTGTTAC--ATATTT--AGTAACTAAATTGGAC-AG---TTTG-ACGGGAAGAACATATTCTAGTATTACAGATTATTTGAAAATGCGTCGCGCTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATAGATTCTTTCAAGCAAATACACGAGCGATGAGAA---TGGCGGCGGCCACACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATa
gi|15 : GAGGGATGTTCAAAAAGTTTGCGGAAAATGCTTATATAA-TCTTTATCTGTCATTTGTAGGATTTGAAATGTA-------TTCCATAGAATGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACCAGAAATCAGCACT-TAGTGATACTAGTAATATTTTTATCGTTATTGCAGTAACGTACAT----------CGACTGTCACCGGATCACTTTTAATTATTTGG-CAG-GTATT--TTCGAAAACTTCTGCTACTTTACATA---TACATAAC--T------TTTTA-ATGCGCTGTCAAATAGATTT
gi|16 : cATTTGAAATTTA-------ATCCAAATAAAGGTCTATAT-ATCTTTTAT-TGAGTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCGTACCAGTTATATTTTTATCGTTACTACAGTAATGTACAT----------TGACCGTCACCAGATCACTTTTCGTTATTTGA-CAG-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTATATA-------TAAA--T--AACTCTTTA-ATGCTCTG----ATG--------------------C--ACCCTGTCTA------------CCTGCAGCTACGGTACTTT--TCATACTGTGATG---TCGGTAGA--------ACATTATGATGTTAT
gi|17 : aTCTGTTTGTTTAACAAATTATTCGCGTTTT-TTTTATAACTGTTATACGATGTGACTTTTAAGTAACGT-AATTTAAGAATGACATT-ACGTT---T-ATTA----ATTAAACATATTTTGACGTTGATC--------CGCT-----------------------TGGTAAGCATTATTAAAATCGCAGTAACATTTTCAGTTTAAAATA-T-----------ACATTTATA----------TCA--ATATG---AACTAT-----TATGA----------TTACAA-CTGAACTAATAAAAAAAAGTTATAAAT-ATTTGTTCACGAACTTTTT--GAAA-C-A-CCCT
gi|18 : TGAGTATGGC----ATG-----A-CTAT----ATTAGGCGTATTTTTACCATGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACAACAATTGCTGTAACATTCTCAGGAT-AAAAA-T-ACA-ATGGT-AAAGTTATAGTACAAGTTGTTA--ATATATGTACTTATATTAATATGAAATAGTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAACAGTTACAAAT-ACTT-TCCGTGAACTT
gi|19 : -----A-AATA----ATTCAGAGTATTTTGATGTTGAT-----------------------------------------------ACTAAAATTATAGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-ACA-TTGGTGAAATTTATAGTAGAAGT---CG--ATATATGTATTTATATTAATATGAAGTATCATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATGAAT-AGTT-CCCGCAAACTTTTT--A-AA-A-C-CCcgtaa
gi|2 : tttctgaatataacttcagcgtaGAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGACGAAAATGCTTATACAA-TCTTTATCTATCATCTGTATGATTTGAAATGTA-------ACTCTAGTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TGATT-------AAATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAG-T-G-ATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATG---C---TAAT--T--A---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAA-T--A--ATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGT---GATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATG-CA--TAA--GT-----------TT--AGCAACTATACTGGAC-GT---TTTA-ACAGGA-GTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTAT-AATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTTGAAA-AAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA--------ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGT-CATTTGAGAATGACTTT-ATG-----A-ATTG----ATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT---------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTT--G-AA-T-CACCCTacctgt
gi|20 : GAGGGGTGTTCAAACAGTTCGCGAAAAATGCTTATAAAAATCTTTATCTGTCAATTGTAGGATTTGGAATTTATTCTTTAATCCAAAAAAAAGTCTACAT-ATTCTATAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAATCGTAGCAGTAACATTTTT
gi|21 : acGAGGGGTGTTCAAAA-------------TGCTTATAAAA-TCTGTATATGTCATGTGTATGATTTGTAATTTA-------ATCCTAACAGCGCTCTATAT-ATTCTTTAT-TGAACA-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCCAACTAGTAATA-TTTTATCGTTATCACAcgt
gi|22 : cTTGTTTGTTTAACCAATTATTTACTGGCTGTTCT-------------AATGTAACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAAT---------G-----A-ATTGAC--ATTA-----ATTTTGATGTTGATC--AGGTCACGCT-----------------------TGGTAGACGTTACTAAAACTACGGTAACATTTTC
gi|23 : ATATATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTTTAAAT--CTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCgag
gi|24 : tttggaaaacaagGAGGGGTGTTGAAAAAGTTCACGGAAAATGTTTATAAAA-TCTTTATCCATCATATTTACGATTTctcata
gi|24 : ac-TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAcatactgtgacatcagta
gi|25 : acgaggggtgttgaaaaagttcacggaaaatgtttataaaatctttatccatcatatttacgaTGATTAAAAACTGAAA------AACAAAG--ATACATTATTTGTCTACAAACTTTTT--G-AA-CAA-CCCTC
gi|3 : ataaGAGGGGTGTTCAAAATGTTCGTGGAAAATGCTTATAAAT-TTTTTATCTGTCATCTGTATGATTTTAAATTTA-------ATCCATATAAAGGCCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACCAGAAATGGGGATTGTAGTCATACCAGTATTATTTTTACCATAACTACAGTAACGTACAT----------TGACCGTTACTGGATCAGGTTTCATTATTTGC-T-A-GTATT--TTCAAAAATTACTACTATTTTTCCTA---T---TCATAAT--A---TTTTA-ATGCACCA----ATGGATTTTT-GAAA-AAA-TTGC--ATTCCATCCA------------CCTACAGCTCCAGTAT-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTA-TTGTGACATCAATACGTCTT-----CACT-GTACACACTA------------------TAT--C-AC----C--------AAGCTGT---TTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACAT-CGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAATTAatttg
gi|3 : t--A-AA----TTAA-TCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATGA-C-C--A-CACATA--GCA---A--AAA---A------------TCTTTGC--A-GAACACTGCAAT------------------TTAT------ATATGGTACAAAAGATTCTGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATAGA-----AAAAG---------------------AATA-TGCTAGAACCATTTCTAGGGCCAAAATGATTCTAGAAGGGGAAAGACG-CA--TAA--GTGTTAC--AGATTT--AGCAACTGAACTGGAC-AG---TTTA-ATGGGAAACGCCTATTCTAGTTTTACGGATGTTTTGAAAATGCGTCGCTTTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGTTAATGCA-AAGAGATGAGAA---TGGTGGCGGCT-CACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCA-TATCAACGTTAGATCATAAAAACAAACAAATGTTATCAGTTTGGAA-TA-AACCAGCATCCCCATCAACAAAGAAGCTCAGAGAAGAAGCAGAT-------G-TTTC-TACGATGTTGGAAGTGT---CTCGACTTATGCCATACC-T-ATAGTAACTACA-TCAACT--------------------TGCACAACACAATCT--TTATTATTCATAC-------ATTTTTTT-TCT-------GTTTCTTTAACTTATTATTTGCGGGCTGTT------TTATAAT------------TGAAAT----TCAATGTGAGG--------------------TTA----ATTAAGCGTATTT-----------------------------------------------AGTAGGCGTTATTGAAATCACTGCAACATTTTCAGTATTAAAGA-T-A-AATTGGTGAAATTTGTAGTACACGT---CG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-C--AAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCTGCAAACTTTTT--GAAA-C-T-CCCTCatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaacttattatttgcgggctgttttataattgaaattcaatgtgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaacaaatgataaaaaagttataaatactttctgcaaactttttgaaactccctcgt
gi|4 : tgaggggtgttcaaaatgttcgtggaaaatgcttataaattttttatctgtcatctgtatgattttaaatttaatccatataaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaGGGGTGTTCAAAATGTTCGAGGAAAATGCTTTTAAAA-TCTTTATCTGTAATTTGTTTGATTTGAAATTTA-------ATTCAAACAAAGATCTATACCAGTCTA-ATCTAATTT-ACAAGTAATAAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTTTCGTTACCTCAGTAACGTACAT----------TGACCGTCGCCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-CTG-GTATTATTTGGAAGTTTGCTACTACTTTACATA---C---TCAT--A--ACT-TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATCCTT-GTAA-AAAAT--GC-ACCCCATCTA------------CCTACTGCTCCAGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CTTT-GTAAACATTG------------------TAT-----A----TTA---CA-AAGCTGT---TTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AAC-TGCGGTA---A--GGA---ATACAATTTTTTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------gt
gi|4 : acgt--A-AA----CTAAATCAGAAACTGC---GACTA----ACA--ACAT-A---AA-AACAAATGGCA---A--AAC---A-----------GG-TCTGC--A-GAAAACTGCAAC------------------TGAT------AAATGGTACAAAAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACTAACCGATTTAGACTTTTAAACG--GGAAGTTCCTGCcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggtacaaaagattcggcgaaggcgtcagttaactaaccgatttagacttttaaacgggaagttcctgccttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|4 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaCAAAA-GATTC-----GGCGA-AGGCGTCAGTTAA--CTA--AC--CGATTT--AG-------ACT------T---TTAA-ACGGGAAGTTCCTGCCTTAGTATTATG-ATTATTTGAAAGTGTGTCG-GTTGCAGCTTGGCGGGATGCCATGGTTACGTTCAAGCGAATACA-AAGAGATAGGAA---TGGCGGCTGCTAGACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATTAAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCGGTATCAACATTCCATCCC--AAT--AACAAATGTTATCAATTTCGAA-AA-TACCGGCA------------AAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGATTTTTGTCGGTTTC-TAAGACGTGGGAAGTGTCTT---GACTTATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATTAACTTCAACAACCATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TAATTATTCATAC-------ATTTT-----TTTCTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCGGGCTGTTTTATATTTATAATACAATGTGACTTTAAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC----ATG-----ACGTTGATAAATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTTAAATTACCGTAATATTTTGAGTTTTAAAGA-TAA-A-TTTGTGAATTTTGTAGTACATGTTGTCG--ATATATGTATTTATGTCAATATGAAAAATTATGATTAAAA-CTGAAATGA---AAAAAA-----AAAT-ACTT-TCCGCGAGCTTTTT--GAAA-C-C-CCCTcttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|5 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaaaactaaatcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggta--ATCCTGTCCA------------CCCACAGCTCAAGTAC-TT--TCATGCTGTGACG---TCAGTCGA--------ACATTATGACGTCATTTGTGACGTCAGTACTTCTT-----CACG-GTACGCAATA------------------TAT-----A----TT--ATT--AAGCTGT---TTTTACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGCA---
gi|5 : aattgcTATATCAGAAACTGT---GACTAAT--ATA--ATG------AA-AACATATTGTG---A--AAA---A---T-------GC-TTTGC--A-GAAAAATACTCT------------------CTTT------AACTAGTACAAAAGATTTTAAGAAGACGTCAATTAATCAACGAATATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTAAATAA-AGCTAGAATCATTTCTAGGGCTTAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAA--GTG--AC--AGAGATAAAGCAACTAAA--------T---TTCA-AAGGAGAGTGCCTATTCTAGTATGACGGAGTATTTGAATAAGCATCGCATTGCAGATAAGTGGG-GGCCATGGTTATTTTCAACCGAATACACAAGAAAAGGGAATGGTGGCAGCAGCTACACGATTTCTAAAGAAGTATCA-TGGTTAATGTGGTACGGGATATTTCAATAAAATAGTAAAATTTTGTGAGAAATGGATATCAAGGTTAGATCCTAAAATCAAACATGTGTCATCAGTTT--AA-AA-AAACGGCATCCCAATCAGCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCGCTTTT-TACGACGTGTGAAGTGTGTTGATGAATCATGTCGTACCATAATAGGAACTACAACCAACTCAGACTACTATTCACAGGCTTGCTCAGCACAATCT--TTATCATTTAAACAAAAAAAATCTGCTT-TT---------TTTGTTTTACCAATTATTTGCCGGTTGTTTT-------------AATGTAACTTTGAAGTAGCGT-AATTTGAGAATGAC----ACG-----A---CG-----TTAAGCGTTTTTTGACGTTGAAC--CGGTCACGCT-----------------------TTGAAGACGTTACTAAAATAACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATT-C-A-TTGATGAAATTTATAATAACCGTTATCG--ATAAATGTATTTATAGCAATATGAACTATTATGATTAAAA-CTGAAATGATAAAAAAAAGTTATAAAT-TGTT-TCCGCGAACATTTT--G-AA-C-C-CCCcggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaatatatatcagaaactgtgactaatataatgaaaacatattgtgaaaaatgctttgcagaaaaatactctctttaactagtacaaaagattttaagaagacgtcaattaatcaacgaatatggaaaaaggcggacgtcctgcaacgtaaataaagctagaatcatttctagggcttaaacgattctagatggggatagacgcataagtgacagagataaagcaactaaatttcaaaggagagtgcctattctagtatgacggagtatttgaataagcatcgcattgcagataagtgggggccatggttattttcaaccgaatacacaagaaaagggaatggtggcagcagctacacgatttctaaagaagtatcatggttaatgtggtacgggatatttcaataaaatagtaaaattttgtgagaaatggatatcaaggttagatcctaaaatcaaacatgtgtcatcagtttaaaaaaacggcatcccaatcagcaaagaagctcagcgaagaagcagactagtgtcgctttttacgacgtgtgaagtgtgttgatgaatcatgtcgtaccataataggaactacaaccaactcagactactattcacaggcttgctcagcacaatctttatcatttaaacaaaaaaaatctgctttttttgttttaccaattatttgccggttgttttaatgtaactttgaagtagcgtaatttgagaatgacacgacgttaagcgttttttgacgttgaaccggtcacgctttgaagacgttactaaaataactgtaacattttcagttttaaagattcattgatgaaatttataataaccgttatcgataaatgtatttatagcaatatgaactattatgattaaaactgaaatgataaaaaaaagttataaattgtttccgcgaacattttgaacccccctcg
gi|6 : aattgcatcctgtccacccacagctcaagtactttcatgctgtgacgtcagtcgaacattatgacgtcatttgtgacgtcagtacttcttcacggtacgcaatatatattattaagctgtttttacttcacaatgtctttagaacagcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaata--A-AA----CTTAACCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATG------AA-AACATATGGTG---G--AAA---A-----------GC-TTGAC----GAAAACTGCAAT------------------TTAT------ACATGGTACAACAGATTCGGCGAGGGCGTCAATTTACCAACGGGTATGGG-----AAAAGACGGACG-TCTTGCAACGTCAAAAG-TGTTAAAATCATTTCTAGGACCAAAATGATTCTTGATGGGGATAGATG-CA--TAA--GAG--AT--AGAGAC--A-TAAC--AACGGGAA-GTGACTATATACG---AGTTTATATTCTACAATTACGGATTATTTGAATACGTGTCATGTTACGTCTTGCTGGG-TGCCATAGTTACTTTTAATGGAATACA-GAGAGA--AGAG---TA-CTACGGCTACGTGCTTTATAAAGAA-C-T-A-AGGTAAATGTGGTATGAGATATTTAACTAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGTGTATCGACATTCGATCCCGAAACCAAACAAATGCCATCATTTTGGGGGAA-AAACGACATCTCCATCACCAGAGAAGCTCAGCAAAGAAGCAGATTTGTGTCG-TTTTCTACGAAGT----AATGT---CTCAAATCATGCCGTACC-T-GTATGAACTACAATCAAATCCAACTACTATTCAAAGACATGCGCAACAAAATATACTTATTATTTGTAC-------AGTTTTTG-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGTAGGTTGTTTTATAATTGTAATACCATGTGACTTTGAAATAACGT-AATTTGAGAATG-C--C-ATGCCCTTA-ATTA----ATTCCGCGTGTTTTGACATTG-TCCGCGGTCACGCC-----------------------TGCTAAGCGTctcg
gi|6 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaTGTATTTATATCGCTAATAAATAGTATGACTAAAA-CTGAAAGGAC--AAAAAAGTTATAAAT-AGTA-TC--CGAACTTTTTTCA-AATC-C-TCCTCgtatttatatcgctaataaatagtatgactaaaactgaaaggacaaaaaagttataaatagtatccgaacttttttcaaatcctcctcg
gi|7 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaaaacttaaccagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggtggaaaagcttgacgaaaactgcaatttatacatggtacaacagattcggcgagggcgtcaatttaccaacgggtatgggaaaagacggacgtcttgcaacgtcaaaagtgttaaaatcatttctaggaccaaaatgattcttgatggggatagatgcataagagatagagacataacaacgggaagtgactatatacgagtttatattctacaattacggattatttgaatacgtgtcatgttacgtcttgctgggtgccatagttacttttaatggaatacagagagaagagtactacggctacgtgctttataaagaactaaggtaaatgtggtatgagatatttaactaaaatagtgacagttgatgagacatgtgtatcgacattcgatcccgaaaccaaacaaatgccatcattttgggggaaaaacgacatctccatcaccagagaagctcagcaaagaagcagatttgtgtcgttttctacgaagtaatgtctcaaatcatgccgtacctgtatgaactacaatcaaatccaactactattcaaagacatgcgcaacaaaatatacttattatttgtacagtttttgttttctgtttgtttgtttaaccaattatttgtaggttgttttataattgtaataccatgtgactttgaaataacgtaatttgagaatgccatgcccttaattaattccgcgtgttttgacattgtccgcggtcacgcctgctaagcgGGGATGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATACTCATAAAA-TCTTTATCTGTTGTCTATACGTTTTAAAATTT---------------CAA-GGTCTCTAT-ACTCATTAT-TGATTTTAC-AGACATCAGTAGTGTAGTCATGCTAATAATAGTTTTATCAATATTACAGTAACGTACATCGACCTTCACCGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTTTATTG-C-ATATATT--TTCGAAAATTGCTACAACTTTACATG---G---TCAT--TTCA---TTTTT-ACTTGCTG----ATGGATTTTC-TTAC-AAA-TTAT--ATCCCGTCCGCGTCTGAAGAACCCTATAGC----ATAA-TTTGTCACATCGATACGTCTTCACTAAACGCACCGTATATTATCAAGCTGTTT-TTACTTCACAGTGTCTTAAGAACAGTGGTACGCAATGAAAATTGAGTTTTGCAAATAA--A-AA----CTAAACCAGAAACTTT---GACTAC--CATT--ATG------AA-AACATATGGTG---A--AAATATA---TG------GC-TTT----AAGGAA-----AGG------------------TGAT------AAATGATAAAACAGATTCAGCAAAGGTGTCAATTAACCAACATACATAGG-----AGAAAACGTACG-TTATACAACATCAAAAATTGCTAGAATCATTTCCAGGGCTTAAAAAATT----------GTATACG-CA--TAA--GTA--ATAGAGATTT--AGCAGCTAAACTGGAC-AT---TTGA-ACGGGAAGTGACTATTCTATTATTACGGATCATCTGAAg
gi|8 : -TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAAA--------ACATTATGACAATATTTGTGACATCAATACGACTT-----CACT-GTACACACTG------------------TAT--ATGA----CT-------AAGCTGT---TTTCACTTTACA--ATGTAT-TTAG-AACA-GCGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------t
gi|8 : --A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATG------AA-AACATATG--A---C--GGA---A---AA------GC-TTTGC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATAGTACAACAGATTCGGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGTCAGAATCATTTCTAGGGCCAAACTGACTCTAGATGGGGATTGACG-CC--TAAGTGTG--AC--ATATTT--AGCAACTAAACTGAACAGT---TTT--ACAGGAAGTGCATTTTCTAGTATTACGGATTATTTGAAAATGCATCGCATATCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCAAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCAGCAGCTACACAATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTACGAGATATCTAAATAAAATGGTGACAGTTGGTGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTAAAAACAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-TACCGGCATCCCCcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatgacggaaaagctttgcagaaaactgcaatttataaatagtacaacagattcggtgaaggcatcagttaaccaacagacatggaaaaaggcagacgtcctgcaacgtcaaaaacgtcagaatcatttctagggccaaactgactctagatggggattgacgcctaagtgtgacatatttagcaactaaactgaacagttttacaggaagtgcattttctagtattacggattatttgaaaatgcatcgcatatcagctaggtgggtgccatggttactttcaagcaaatacaaagagatgagaatggcagcagctacacaatttctaaagaaatatggtaaatgtggtacgagatatctaaataaaatggtgacagttggtgagacatgggtatcaacgttcgatcctaaaaacaaacaaatgtcatcagtttggaaaataccggcatcccc
gi|9 : tttcatactgtgacatcagtaaaacattatgacaatatttgtgacatcaatacgacttcactgtacacactgtatatgactaagctgttttcactttacaatgtatttagaacagcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaAGGGTTGTTCAAAATGTTCGTGGGAAATGCTTATAGAT-ACTTTAACTGCCATTTGTATGATTTAAAATTTA-------ATCCAAACATAGGTCTATAT-ATTCATTAT-TT-TTC-ACTAAAAATCAACACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGCATCTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCTCAGGGTCACTTTTCGTTATTTGGAA-G-GTATT--TTTGAAAATCGCTACCTCTTTACATATTCT---TAAC--T------TTTTA-ATGTGCTG----ATG--------------------C--ATCCCGTCCA------------CCTAAAGCT-CAGTAC-TT--TAATTCTGTGAAG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAGTACGTCTT-----CACT-GTACACACGG------------------TAT-----A----TT--ACC--AAGCTGT---TTTCACATCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGTA---AGGAAT---A---AA------AT-TTTG
gi|9 : TG------------------CAT--A-AGAATGCTTAATCAGAAACTGTCAAGAGCGTT-------ATG------GA-AACATATGGCG---A--AAA---A-----------GC-TTTAC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATGGTAC-ACGAATTCGGCGAAGGCGTCAtgtttgcataagaatgcttaatcagaaactgtcaagagcgttatggaaacatatggcgaaaaagctttacagaaaactgcaatttataaatggtacacgaattcggcgaaggcgtca
blockSeqs : A C A T TTCTTTA A G C C TT C CGACCTTCAC CA T AT TACATAACT T TCAA G TTGTAAAAATTGC CGTCTGAAGAAC C A T TG TCT CGCACCGT AAGAA G AAAATTGAGTTTTGCAAA AAGAATGCTTAA AG CAAGAG CTTT TT TCTTT G TAG TGG GG TAT TACAATTTTTT C AAAA T CAGAAACTGTGACTAACA GAAAAC T CTTTT G T A C T T GT GT GTTACAT T AA GTGAC T A G A T C G A A C TG TGG G CT C A G C G A A C A G C GC ATTA A A T T A AC A CAAAAAAA GT T G ATAATTG A C CATGCCCTTAATTA CGC TTTGACAATGTTCTGTTCACACT G T ACA C A A TG AT A AA T A G TC A T CA
blockSeqs : A A . C . A T . . C T . CA . . TAAATAACT . . G TGAAAAAATTGC . A G . . . . . . . CAGAACTAAA AG GAT CTTC TT TCTTT . TGC CGG . . AATTTTGT . AAAA C . . C . G . T C C . . . GTTACAG T . AGT . A T T G T T T . C TG . G GT . . A A . . C A T C . TG GTTG . . C A A . T C T T G ATAATGG A . ATGACGTTAATTA C . T . AAA G G T TG . . AA . C G . A . AA
blockSeqs : A C . T . T T . . C T . CT . . TTCATAATA . . G TGTAAAAAATGC . T G . . . . . . . AAACTAAA AG TTT CTTC TT TCTTT . AAT CGG . . AATTTTGT . AAAA C . . T . A . . T T . . . AATAGAG T . AG . A G A T C G A . . AC . G C . . A T . . C G A . . GG CTT . . A A A . A C T T G ATAACTG A . ATGACGTTAATAA A . T . AAA A G T TG . . . . C . . A . C
blockSeqs : A C . G . A A . . C T . AA . . CTCATAACT . . G CTTACAAATTAT . C A . . . . . . . AAACTTAA AG GAC CTTC . TATTT . TAT . . . AATTTTGT . AAAA C . . A . G . . C T . . . AACCG G . GT . A G A T C G T . . TG . T . . . G T . . A C T . . GT C . . C T A . G C T T C ATAATTT G . ATTACGTTTATTA T . A . ACA G A A TG . . . . T . . A . T
blockSeqs : T T . A . T C . . A C . T . . GTCATTTCA . . G CGTAACAAATA . C A . . . . . . . AAACTAAA AG TTT CTTT . TCTTT . TAT . . . AA . AA C . . A . A . . T T . . . GACAG G . AG . A G T A T G A . . TA . A . . . A C . . A . . . . . C . . C A G . A C T T G ATATTTA C . ATGACGTTGATAA C . T . ACA G A A TA . . . . C . . . . A
blockSeqs : T A . C . A T . . C A . T . . TTCTTAACT . . G C . C A . . . . . . . AAACTAAA AG GAC CATC . TCTT . TAT . . . TG . AA C . . C . A . . A T . . . GATAG T . AT . A C T C C A T . . AG . G . . . . A . . C . . C A A . A C . . G ATAATTG A . TTTATGAATTG C . A . AAA G A A TG . . . . G . . . . C
blockSeqs : A C . T . A C . . T T . C . . CTAATTA . . . C . . A . . . . . . . AAATTAA AG TTT CC . ACC . TAT . . . AA . A C . . A . G . . T . . . . GACAT T . T . A T A T . T A . . TG . A . . . . . A A . . A C . . . TTA A . ATGACTAT A . G . AAA G T C TA . . . . T . . . . C
blockSeqs : T T . C . A C . . C . . . . . . . . . . . . . ATGACT AG GAC AT . TA . TAT . . . AA . A . . . A . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . G . . . . . A . GAATTGAC C . G . CA . G T . . . . . C . . . . T
blockSeqs : . . . T . . C . . . . . . . . . ATTG A GAC CC . . . GC . . . T . A . . . A . . . . C . ATGATG C . T . . . G C . . . . . T . . . . C
blockSeqs : . . . CACC A GAC TT . . . TC . . . . . A . . . . . ACGACG . . C . . . A . . . . . . C . . . . C
blockSeqs : ATTA . TTT . . . . TA . . . . . A . . TTA . . T . . . C . . . . C
blockSeqs : ATTA . GAC . . . . GC . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : ATTA . TTT . . . . GC . . . . . . . . G .
blockSeqs : . T . . . . GC .
blockSeqCons : C* CA* TTCATAACT*********** CGTAAAAATTGC***** AAACTTAA******* CTTC AA** GACAG**** ** NTTG C******* T* ATGACGTTATTA********** AAA** C**
originalCons : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTATAAAA-TCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAATTTA-------ATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGG-C-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATA---C---TAAT--T--A---TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAA-T--N--ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAA--GTG--AC--AGATTT--AGCAACTAAACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA-TAT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTNTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGAC--T-ACG-----A-ATTG----ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-T-A-A-TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
finalCons : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTATAAAA-TCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAATTTA-------ATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACAT----------CGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGGCA-G-GTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATATTCATAACT-----------TTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTCGTAAAAATTGC-----ATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TATAAACTTAA-------TCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGCAA--GAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAA--GTGACAG----ATTT--AGCAACTAAACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA--AT-A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTTGGAA-AA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTNTTGTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTTT-TTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGT-AATTTGAGAATGACATGACGTTATTA----------ATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGA-TAAA--TTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-CC--CCCTC
Alignments
lowQualScore : 1111111 2222222222 1 1111111 222222222222 11111111 11111 222222222222222222 1111111111111111111 2222 11 444444 111 44444444444 2222 222222222222222222 111111 11111 1 222222222 11 1 1 11111 11111111 22222 111 111 22222222222 22222222222222222222222 1
lowQualScore : 3 3 4 1 3333333 1 1 0 4 4 99 6 1111111111 6 66 0 999 0 9999 1 3333333 1 222222222222 4 1 3 55 666 44444444 11111 4 999999999999999999 9999999999999999999 777777 5555 11 666666 2 888 444 33 555 99999999999 2 3333 7 444444444444444444 111111 1 00000 6 4 0 3 2 0 4 66 444444444 1 66 999999 4 1 0 1 1 1 2 1 1 4 8 55 777 1 22 777 8 4 1 66 1 1 2 3 3 6 77 44444 5 5 1 00 2 3 0 66 1 55555555 0 00000 1 2 000 1 0 111 33333333333 0 777 0 88888888888888888888888 1 6 2 5 2 2 55 2 444 2 1 5 44 2 3 666
lowQualScore : . . . . ....... . . . . . .. . .......... . .. . ... . .... . ....... . ............ . . . .. ... ........ ..... . .................. ................... ...... .... .. ...... . ... ... .. ... ........... . .... . .................. ...... . ..... . . . . . . . .. ......... . .. ...... . . . . . . . . . . . .. ... . .. ... . . . .. . . . . . . .. ..... . . . .. . . . .. . ........ . ..... . . ... . . ... ........... . ... . ....................... . . . . . . .. . ... . . . .. . . ...
lowQualScore : 7 2 0 4 0000000 2 4 9 0 0 77 3 9999999999 5 99 8 888 0 4444 9 9999999 9 888888888888 7 7 6 00 444 55555555 11111 4 555555555555555555 4444444444444444444 888888 9999 00 999999 7 111 000 99 000 00000000000 9 4444 2 666666666666666666 555555 0 00000 4 0 0 7 4 9 4 11 777777777 7 11 444444 4 9 1 1 0 0 2 4 0 4 9 22 888 9 22 888 9 0 7 44 4 3 5 7 3 7 77 55555 0 0 4 55 3 6 1 11 7 66666666 8 33333 1 1 444 1 3 777 22222222222 2 000 2 55555555555555555555555 0 3 8 1 6 3 00 9 777 9 7 7 22 3 1 888
consensus : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTATAAAA-TCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAATTTA-------ATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACATCGAC----------CGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGGCAGGTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATACTCATAAC-TTTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAATTGCATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTTAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAAGTG--AC--AGATTT--AGCAACTAAACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA--AT---A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTT-GGAAAA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTNTTGTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGTAATTTGAGAATGAC---ATGACG-TT-A-TTAATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATACATTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
Reference ( family-4598 ) : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATGCTTATAAAA-TCTTTATCTGTCATCTGTATGATTTGAAATTTA-------ATCCAAACAAAGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGTTACTACAGTAACGTACATCGAC----------CGTCACCGGATCACTTTTCGTTATTTGGCAGGTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTACATATTCATAAC-TTTTTA-ATGCGCTG----ATGGATTTTC-GTAA-AAATTGCATCCCGTCCA------------CCTACAGCTCCGGTAC-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CACT-GTACGCACTG------------------TAT--A-AA----CTTAATCAGAAACTGT---GACCACTTCACA--ATGT-C-TTAA-AACATACGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTGC--AAGAAAACTACAAT------------------TTAT------ANATGGTACAACAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAAGTG--AC--AGATTT--AGCAACTAAACTGGAC-GT---TTTA-ACGGGAAGTGCCTATTCTAGTATTACGGATTATTTGAANANGCGTCGCGTTGCAGCTNGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCGGCGGCTACACGATTTCTAAAGAA--AT---A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTGAAACCAAACAAATGTCATCAGTTT-GGAAAA-AAACGGCATCCCCATCACCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTNTTGTCGAATCATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAACTCCAACTACTATTCAAAGGCATGCACAACACAATCT--TTATTATTCGTAC-------ATTTTTTT-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGCGGGCTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACTTTGAAGTAACGTAATTTGAGAATGAC---ATGACG-TT-A-TTAATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTAAAATTACNGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATAAATTGGTGAAATTTGTAGTACANGTTGTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCTC
gi|1 : GAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGACGAAAATGCTTATACAA-TCTTTATCTATCATCTGTATGATTTGAAATGTA-------ACTCTAGTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TGATT-------AAATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACATCGAC----------CGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAGT-GATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATGCTAATTA---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAAT--AATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGT---GATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATG-CA--TAAGT-----------TT--AGCAACTATACTGGAC-GT---TTTA-ACAGGA-GTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTAT---AATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTT-GAAAAAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA--------ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGTCATTTGAGAATGACTTTATGA------A-TTGATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTT--G-AA-T-CACCCTC
gi|10 : GTACC-T-ATTGTAACTACAAGCAATTCCAACTACTTTTCAAAGGCATACACAACACAATTT--TCATTATCCATAC-------ATTTTTTT-----CTGTTTGT--GT--AACTATTTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTGTAATACAATGTGACATTGAAGTAACGTAATTTGAAAATGAC---ATGACG-TT-AATTAATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CAGTCATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACGGCAACTTTTTTTGTTTTAAAGATACATTGGTCACATTTATAGTACAAGTTGCAA--ATATATGTACTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-AATT-TCCGCGAACTTTTT--GAAA-C-C-CCCT
gi|11 : ----ATGGATTTTTTGTAA-AAATTGCATCTCACCCA------------CCTACAGCTCCAGAAC-TT--TCATACTGTGACC---CCAGTAGA--------ATGTTATGACATTATTTGTGACGTCAATACATCTT-----CACT-GTGCACACTG------------------TAT--A--------TT-GCC--AAACTTT-----TCACTTTACA--ATGT-C-TTAAGAACA-GCGGTATGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAATACTA-AATCAGAAACTGTGACTAACATTATGAAAACATATGGCGAAAC--ATCCGGCGAAGGTGTCAGTTAGCCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGATG-TCGTG
gi|11 : G-TGCTTTGGTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGAGAT-GCTAGAAGATTTCTAAAGAA--AC---A-Ttgctttggttactttcaagcgaatacaaagagatgagaatggagatgctagaagatttctaaagaaacat
gi|12 : atggattttttgtaaaaattgcatctcacccacctacagctccagaactttcatactgtgaccccagtagaatgttatgacattatttgtgacgtcaatacatcttcactgtgcacactgtatattgccaaacttttcactttacaatgtcttaagaacagcggtatggaataaaattttgtgttttgcaaaagaatactaaatcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggcgaaacatccggcgaaggtgtcagttagccaacagacatggaaaaaggcagatgtcgtTTATGCCTTACC-T-ATAGGAACTACAGTCAGCTTCAGCTACTATTCAAAGGCATGCACGATACAATCT--TTATTATTCTAAC-------A----TTT-TTTTCTGTGTGTTTGTTTAACTAATTATTTGTGGGC-------------TAATACAATGTAACTTTGAAGCAACGTTATTTGAAAATGAC---ATGATG-TTAA-CTGATTAA------------GTTGATC--AGGTTATGCT-----------------------TGGAAGGCATTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAAATAAATTGGTGAAATTTGTAGTACATGTTGTCGATATATATGTATTTATATGAATATGAAATATTATGATAAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-A-T-CCC
gi|13 : CTACTATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TTATTGTTCATAC-------ACTTTT-----TTCTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCAGGCTGTTTTATAATGGTAATACAAGCTGACTTTGAAGTAACTTAATTTGAGAATGAC---ATGACG-TTAA-TAAATTAAGCATATTTTGACATTGATC--TGTTCACACTTTTGACAATGTTCTGTTCACACTTGGTAGGCGTTACTAAAATTACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATAAATTAGTAAAATTTGTAATACATGTTGTCG--ATACATG--------TCGATAC---ATG-TAT--TTATAT-C---AATGAT--GAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCCGCAAACCTTTT--G-AA-
gi|14 : CAATGGACATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACATCAAAAAACGCTAGAATCATTTCTAGGGCCAAAACGATTCTAGATGGAGATAGACG-CG--TACGTGTTAC--ATATTT--AGTAACTAAATTGGAC-AG---TTTG-ACGGGAAGAACATATTCTAGTATTACAGATTATTTGAAAATGCGTCGCGCTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATAGATTCTTTCAAGCAAATACACGAGCGATGAGAA---TGGCGGCGGCCACACGATTTCTAAAGAA--AT---A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATa
gi|15 : GAGGGATGTTCAAAAAGTTTGCGGAAAATGCTTATATAA-TCTTTATCTGTCATTTGTAGGATTTGAAATGTA-------TTCCATAGAATGGTCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACCAGAAATCAGCACT-TAGTGATACTAGTAATATTTTTATCGTTATTGCAGTAACGTACATCGAC----------TGTCACCGGATCACTTTTAATTATTTGGCAGGTATT--TTCGAAAACTTCTGCTACTTTACATATACATAAC-TTTTTA-ATGCGCTGTCAAATAGATTT
gi|16 : cATTTGAAATTTA-------ATCCAAATAAAGGTCTATAT-ATCTTTTAT-TGAGTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCGTACCAGTTATATTTTTATCGTTACTACAGTAATGTACATTGAC----------CGTCACCAGATCACTTTTCGTTATTTGACAGGTATT--TTCGAAAATTGCTACTACTTTATATATAAATAAC-TCTTTA-ATGCTCTG----A-------------------TGCACCCTGTCTA------------CCTGCAGCTACGGTACTTT--TCATACTGTGATG---TCGGTAGA--------ACATTATGATGTTAT
gi|17 : aTCTGTTTGTTTAACAAATTATTCGCGTTTT-TTTTATAACTGTTATACGATGTGACTTTTAAGTAACGTAATTTAAGAATGAC---ATTACGTTT-A-TTAATTAAACATATTTTGACGTTGATC--------CGCT-----------------------TGGTAAGCATTATTAAAATCGCAGTAACATTTTCAGTTTAAAATATACATT-----------TA--------TATCA--ATATG---AACTAT-----TATG----ATTACAACT-GAA-CT--AATAA---AAAAAAGTTATAAAT-ATTTGTTCACGAACTTTTT--GAAA-C-A-CCCT
gi|18 : TGAGTATGGC---ATGAC---T-A-T--ATTAGGCGTATTTTTACCATGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACAACAATTGCTGTAACATTCTCAGGAT-AAAAATACAATGGT-AAAGTTATAGTACAAGTTGTTA--ATATATGTACTTATATTAATATGAAATAGTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAACAGTTACAAAT-ACTT-TCCGTGAACTT
gi|19 : TAATTCAGAGTATTTTGATGTTGAT-----------------------------------------------ACTAAAATTATAGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATACATTGGTGAAATTTATAGTAGAAGT---CG--ATATATGTATTTATATTAATATGAAGTATCATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTATGAAT-AGTT-CCCGCAAACTTTTT--A-AA-A-C-CCcgtaa
gi|2 : tttctgaatataacttcagcgtaaaaGAGGGGTGTTCAAAAAGTTCGACGAAAATGCTTATACAA-TCTTTATCTATCATCTGTATGATTTGAAATGTA-------ACTCTAGTAAAGGTCTATAT-ATTCTTCAT-TGATT-------AAATAAATACTGTAGTCATACCAATACTATTTATATCGTTTCTACAGTAACATACATCGAC----------CGTCACCGGATCACTTTTTGTTATTTAGT-GATATT--TTCGAAAATTGCTAATATTTTACATGCTAATTA---TTTTATATGCACTG----ATGGATTTTC-GTAACAAAT--AATCCCGTCCA------------TCAACAGTTTCGGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGCAGA--------ACATTATGACATTATTTGTGACGTTAACACGTCTT-----CACA-GTACGCACTG------------------TATCAG-AA----CTAAATCAGAAACCGT---GATCAC--CATA--ATG------AA-AACATAGGGTA---A--AAA---A---AA------GT-TTTG---AAGAAAACTATAAT------------------TTAT------ACATGGAACAACAGATTCAGCAAAGGCGTCAATTAACCAACGGACATGGA-----AAAAGACAGACG-GCCTGCAACGTCAAAAG-CGCTAGAATCATTTCTAGGACCAAAGCGATTCCAGATAGAGATAGATG-CA--TAAGT-----------TT--AGCAACTATACTGGAC-GT---TTTA-ACAGGA-GTGACTATTCTGTTATTACGGATTATTTAAATAGGCGTCATGTTTCATCTTAATGGT-TTCGATATTTACTTTCAAGCGAATACA-AAGAGAACAGTA---TTGCGGCGGCTACACGACTGCTAAAGAACTAT---AATGGTAAATGTGGTATGAAATATCTAGATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGGGTAACAATGTTCGATCCTGACACCAAACAAATGTTATCAGTTT-GAAAAAAAAACGGCATCCCCATCACCAAAGTCGCTTAGCAAAGAAGCAAACTAGTGTCG-TTTT-TACGACGTGCGAAGTGTATTATCGAATCATTCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATCAAAACTAATTACTTTTCAAAGGCATGCACAACACACTAT--GTATTATTTGTA--------ATTTTTTTGTTTTCTCTTTGTTTATTTAAACAACTATTTGCGGGTTGTTTTATAATTTTAATACCATGTAGCATTGAAATAATGTCATTTGAGAATGACTTTATGA------A-TTGATTAAGCCTAATTTGACGTTGATA--CGGTCAAACT-----------------------TGGTATGCTTTACTCAAATTACGGTAACATTTTTAGTTTT------------------TTTTTAGTTCAAGTTATCG--AAATATGTATTAATATCAATATGAAATATTATAATTAAAA-CTAAAAGGAT--AAAAAAATTATAAAT-ATTT-TCCGCGATCTTTTT--G-AA-T-CACCCTacctgt
gi|20 : GAGGGGTGTTCAAACAGTTCGCGAAAAATGCTTATAAAAATCTTTATCTGTCAATTGTAGGATTTGGAATTTATTCTTTAATCCAAAAAAAAGTCTACAT-ATTCTATAT-TGATTC-ACTAGAAATCAGCACTGTAATCGTAGCAGTAACATTTTT
gi|21 : acGAGGGGTGTTCAAAA-------------TGCTTATAAAA-TCTGTATATGTCATGTGTATGATTTGTAATTTA-------ATCCTAACAGCGCTCTATAT-ATTCTTTAT-TGAACA-ACTAGAAATCAGCACTGTAGTCCAACTAGTAATA-TTTTATCGTTATCACAcgt
gi|22 : cTTGTTTGTTTAACCAATTATTTACTGGCTGTTCT-------------AATGTAACTTTGAAGTAACGTAATTTGAGAATGAA---TTGACA-TT-A-------------ATTTTGATGTTGATC--AGGTCACGCT-----------------------TGGTAGACGTTACTAAAACTACGGTAACATTTTC
gi|23 : ATATATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-CTGAAATGAT--AAAAAAGTTTTAAAT--CTT-TCCGCGAACTTTTT--G-AA-C-C-CCCgag
gi|24 : tttggaaaacaagGAGGGGTGTTGAAAAAGTTCACGGAAAATGTTTATAAAA-TCTTTATCCATCATATTTACGATTTctcata
gi|24 : ac-TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAcatactgtgacatcagta
gi|25 : acgaggggtgttgaaaaagttcacggaaaatgtttataaaatctttatccatcatatttacgaTGATTAAAAACTGAAA------AACAAAG--ATACATTATTTGTCTACAAACTTTTT--G-AA-CAA-CCCTC
gi|3 : ataaGAGGGGTGTTCAAAATGTTCGTGGAAAATGCTTATAAAT-TTTTTATCTGTCATCTGTATGATTTTAAATTTA-------ATCCATATAAAGGCCTATAT-ATTCTTTAT-TGATTC-ACCAGAAATGGGGATTGTAGTCATACCAGTATTATTTTTACCATAACTACAGTAACGTACATTGAC----------CGTTACTGGATCAGGTTTCATTATTTGCTA-GTATT--TTCAAAAATTACTACTATTTTTCCTATTCATAAT-ATTTTA-ATGCACCA----ATGGATTTTT-GAAA-AAATTGCATTCCATCCA------------CCTACAGCTCCAGTAT-TT--TCATACTGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTA-TTGTGACATCAATACGTCTT-----CACT-GTACACACTA------------------TAT--C-AC----C--------AAGCTGT---TTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACAT-CGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAATTAatttg
gi|3 : t--A-AA----ATTAATCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATGA-C-C--A-CACATA--GCA---A--AAA---A------------TCTTTGC--A-GAACACTGCAAT------------------TTAT------ATATGGTACAAAAGATTCTGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATAGA-----AAAAG---------------------AATA-TGCTAGAACCATTTCTAGGGCCAAAATGATTCTAGAAGGGGAAAGACG-CA--TAAGTGTTAC--AGATTT--AGCAACTGAACTGGAC-AG---TTTA-ATGGGAAACGCCTATTCTAGTTTTACGGATGTTTTGAAAATGCGTCGCTTTGCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGTTAATGCA-AAGAGATGAGAA---TGGTGGCGGCT-CACGATTTCTAAAGAA--AT---A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATCTAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCA-TATCAACGTTAGATCATAAAAACAAACAAATGTTATCAGTTT-GGAATA-AACCAGCATCCCCATCAACAAAGAAGCTCAGAGAAGAAGCAGAT-------G-TTTC-TACGATGTTGGAAGTGTCT---CGACTTATGCCATACC-T-ATAGTAACTACA-TCAACT--------------------TGCACAACACAATCT--TTATTATTCATAC-------ATTTTTTT-TCT-------GTTTCTTTAACTTATTATTTGCGGGCTGTTTTATAA------------------TTGAA--------ATTC---AATG------TGAGG-TT-A----ATTAAGCGTATTT-----------------------------------------------AGTAGGCGTTATTGAAATCACTGCAACATTTTCAGTATTAAAGATAAATTGGTGAAATTTGTAGTACAC---GTCG--ATATATGTATTTATATCAATATGAAATATTATGATTAAAA-C--AAATGAT--AAAAAAGTTATAAAT-ACTT-TCTGCAAACTTTTT--GAAA-C-T-CCCTCatcagaaactgtgactaacattatgaccacacatagcaaaaaatctttgcagaacactgcaatttatatatggtacaaaagattctgtgaaggcatcagttaaccaacagacatagaaaaagaatatgctagaaccatttctagggccaaaatgattctagaaggggaaagacgcataagtgttacagatttagcaactgaactggacagtttaatgggaaacgcctattctagttttacggatgttttgaaaatgcgtcgctttgcagctaggtgggtgccatggttactttcaagttaatgcaaagagatgagaatggtggcggctcacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatatctaaataaaatagtgacagttgatgagacatcatatcaacgttagatcataaaaacaaacaaatgttatcagtttggaataaaccagcatccccatcaacaaagaagctcagagaagaagcagatgtttctacgatgttggaagtgtctcgacttatgccatacctatagtaactacatcaacttgcacaacacaatctttattattcatacattttttttctgtttctttaacttattatttgcgggctgttttataattgaaattcaatgtgaggttaattaagcgtatttagtaggcgttattgaaatcactgcaacattttcagtattaaagataaattggtgaaatttgtagtacacgtcgatatatgtatttatatcaatatgaaatattatgattaaaacaaatgataaaaaagttataaatactttctgcaaactttttgaaactccctcgt
gi|4 : tgaggggtgttcaaaatgttcgtggaaaatgcttataaattttttatctgtcatctgtatgattttaaatttaatccatataaaggcctatatattctttattgattcaccagaaatggggattgtagtcataccagtattatttttaccataactacagtaacgtacattgaccgttactggatcaggtttcattatttgctagtattttcaaaaattactactatttttcctattcataatattttaatgcaccaatggatttttgaaaaaattgcattccatccacctacagctccagtattttcatactgtgacgtcagtagaacattatgacgttattgtgacatcaatacgtcttcactgtacacactatatcaccaagctgttttcacttcacaatgtctttagaacatcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagGGGGTGTTCAAAATGTTCGAGGAAAATGCTTTTAAAA-TCTTTATCTGTAATTTGTTTGATTTGAAATTTA-------ATTCAAACAAAGATCTATACCAGTCTA-ATCTAATTT-ACAAGTAATAAGCACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTTTCGTTACCTCAGTAACGTACATTGAC----------CGTCGCCGGATCACTTTTCGTTATTTGGCTGGTATTATTTGGAAGTTTGCTACTACTTTACATACTCATAAC-TTTTTA-ATGCGCTG----ATGGATCCTT-GTAA-AAAATGCACCCCATCTA------------CCTACTGCTCCAGTAC-TT--TCATAATGTGACG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAATACGTCTT-----CTTT-GTAAACATTG------------------TAT--A--------TTA--CA-AAGCTGT---TTTCACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AAC-TGCGGTA---A--GGA---ATACAATTTTTTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------gt
gi|4 : acgt--A-AA----CTAAATCAGAAACTGC---GACTA----ACA--ACAT-A---AA-AACAAATGGCA---A--AAC---A-----------GG-TCTGC--A-GAAAACTGCAAC------------------TGAT------AAATGGTACAAAAGATTCGGCGAAGGCGTCAGTTAACTAACCGATTTAGACTTTTAAACG--GGAAGTTCCTGCcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggtacaaaagattcggcgaaggcgtcagttaactaaccgatttagacttttaaacgggaagttcctgccttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|4 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaCAAAA-GATTC-----GGCGA-AGGCGTCAGTTAACTA--AC--CGATTT--AG-------ACT------T---TTAA-ACGGGAAGTTCCTGCCTTAGTATTATG-ATTATTTGAAAGTGTGTCG-GTTGCAGCTTGGCGGGATGCCATGGTTACGTTCAAGCGAATACA-AAGAGATAGGAA---TGGCGGCTGCTAGACGATTTCTAAAGAA--AT---A-TGGTAAATGTGGTATGAGATATTAAAATAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATCGGTATCAACATTCCATCCC--AAT--AACAAATGTTATCAATTT-CGAAAA-TACCGGCA------------AAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGATTTTTGTCGGTTTC-TAAGACGTGGGAAGTGTCTTG---ACTTATGCCGTACC-T-ATAGGAACTACAATTAACTTCAACAACCATTCAAAGACATGCACA---CAATCT--TAATTATTCATAC-------ATTTTTTT-----CTGTTTGTTTGTTTAACTAATTATTTGCGGGCTGTTTTATATTTATAATACAATGTGACTTTAAAGTAACGTAATTTGAGAATGAC---ATGACG-TTGA-TAAATTAAGCGTATTTTGACGTTGATC--CGGTCACGCT-----------------------TGGTAGGCGTTACTTAAATTACCGTAATATTTTGAGTTTTAAAGATAAATTTGTGAATTTTGTAGTACATGTTGTCG--ATATATGTATTTATGTCAATATGAAAAATTATGATTAAAA-CTGAAATGA---AAAAAA-----AAAT-ACTT-TCCGCGAGCTTTTT--GAAA-C-C-CCCTcttagtattatgattatttgaaagtgtgtcggttgcagcttggcgggatgccatggttacgttcaagcgaatacaaagagataggaatggcggctgctagacgatttctaaagaaatatggtaaatgtggtatgagatattaaaataaaatagtgacagttgatgagacatcggtatcaacattccatcccaataacaaatgttatcaatttcgaaaataccggcaaagaagctcagcgaagaagcagatttttgtcggtttctaagacgtgggaagtgtcttgacttatgccgtacctataggaactacaattaacttcaacaaccattcaaagacatgcacacaatcttaattattcatacatttttttctgtttgtttgtttaactaattatttgcgggctgttttatatttataatacaatgtgactttaaagtaacgtaatttgagaatgacatgacgttgataaattaagcgtattttgacgttgatccggtcacgcttggtaggcgttacttaaattaccgtaatattttgagttttaaagataaatttgtgaattttgtagtacatgttgtcgatatatgtatttatgtcaatatgaaaaattatgattaaaactgaaatgaaaaaaaaaatactttccgcgagctttttgaaaccccct
gi|5 : acgtggggtgttcaaaatgttcgaggaaaatgcttttaaaatctttatctgtaatttgtttgatttgaaatttaattcaaacaaagatctataccagtctaatctaatttacaagtaataagcactgtagtcataccagtaatatttttttcgttacctcagtaacgtacattgaccgtcgccggatcacttttcgttatttggctggtattatttggaagtttgctactactttacatactcataactttttaatgcgctgatggatccttgtaaaaaatgcaccccatctacctactgctccagtactttcataatgtgacgtcagtagaacattatgacgttatttgtgacgtcaatacgtcttctttgtaaacattgtatattacaaagctgttttcacttcacaatgtctttagaactgcggtaaggaatacaattttttgttttgcaaaagaaaactaaatcagaaactgcgactaacaacataaaaacaaatggcaaaacaggtctgcagaaaactgcaactgataaatggtaAATTGCATCCTGTCCA------------CCCACAGCTCAAGTAC-TT--TCATGCTGTGACG---TCAGTCGA--------ACATTATGACGTCATTTGTGACGTCAGTACTTCTT-----CACG-GTACGCAATA------------------TAT--A--------TTATT---AAGCTGT---TTTTACTTCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGCA---
gi|5 : ATCAGAAACTGT---GACTAAT--ATA--ATG------AA-AACATATTGTG---A--AAA---A---T-------GC-TTTGC--A-GAAAAATACTCT------------------CTTT------AACTAGTACAAAAGATTTTAAGAAGACGTCAATTAATCAACGAATATGGA-----AAAAGGCGGACG-TCCTGCAACGTAAATAA-AGCTAGAATCATTTCTAGGGCTTAAACGATTCTAGATGGGGATAGACG-CA--TAAGTG--AC--AGAGATAAAGCAACTAAA--------T---TTCA-AAGGAGAGTGCCTATTCTAGTATGACGGAGTATTTGAATAAGCATCGCATTGCAGATAAGTGGG-GGCCATGGTTATTTTCAACCGAATACACAAGAAAAGGGAATGGTGGCAGCAGCTACACGATTTCTAAAGAA--GTATCA-TGGTTAATGTGGTACGGGATATTTCAATAAAATAGTAAAATTTTGTGAGAAATGGATATCAAGGTTAGATCCTAAAATCAAACATGTGTCATCAGTTT---AAAA-AAACGGCATCCCAATCAGCAAAGAAGCTCAGCGAAGAAGCAGACTAGTGTCGCTTTT-TACGACGTGTGAAGTGTGTTGATGAATCATGTCGTACCATAATAGGAACTACAACCAACTCAGACTACTATTCACAGGCTTGCTCAGCACAATCT--TTATCATTTAAACAAAAAAAATCTGCTT-TT---------TTTGTTTTACCAATTATTTGCCGGTTGTTTT-------------AATGTAACTTTGAAGTAGCGTAATTTGAGAATGAC---ACGACG----------TTAAGCGTTTTTTGACGTTGAAC--CGGTCACGCT-----------------------TTGAAGACGTTACTAAAATAACTGTAACATTTTCAGTTTTAAAGATTCATTGATGAAATTTATAATAACCGTTATCG--ATAAATGTATTTATAGCAATATGAACTATTATGATTAAAA-CTGAAATGATAAAAAAAAGTTATAAAT-TGTT-TCCGCGAACATTTT--G-AA-C-C-CCCcggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaatatatatcagaaactgtgactaatataatgaaaacatattgtgaaaaatgctttgcagaaaaatactctctttaactagtacaaaagattttaagaagacgtcaattaatcaacgaatatggaaaaaggcggacgtcctgcaacgtaaataaagctagaatcatttctagggcttaaacgattctagatggggatagacgcataagtgacagagataaagcaactaaatttcaaaggagagtgcctattctagtatgacggagtatttgaataagcatcgcattgcagataagtgggggccatggttattttcaaccgaatacacaagaaaagggaatggtggcagcagctacacgatttctaaagaagtatcatggttaatgtggtacgggatatttcaataaaatagtaaaattttgtgagaaatggatatcaaggttagatcctaaaatcaaacatgtgtcatcagtttaaaaaaacggcatcccaatcagcaaagaagctcagcgaagaagcagactagtgtcgctttttacgacgtgtgaagtgtgttgatgaatcatgtcgtaccataataggaactacaaccaactcagactactattcacaggcttgctcagcacaatctttatcatttaaacaaaaaaaatctgctttttttgttttaccaattatttgccggttgttttaatgtaactttgaagtagcgtaatttgagaatgacacgacgttaagcgttttttgacgttgaaccggtcacgctttgaagacgttactaaaataactgtaacattttcagttttaaagattcattgatgaaatttataataaccgttatcgataaatgtatttatagcaatatgaactattatgattaaaactgaaatgataaaaaaaagttataaattgtttccgcgaacattttgaacccccctcg
gi|6 : aattgcatcctgtccacccacagctcaagtactttcatgctgtgacgtcagtcgaacattatgacgtcatttgtgacgtcagtacttcttcacggtacgcaatatatattattaagctgtttttacttcacaatgtctttagaacagcggcacggactaatgtgttgtgttttgcataaaaaaatatat--A-AA----CTTAACCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATG------AA-AACATATGGTG---G--AAA---A-----------GC-TTGAC----GAAAACTGCAAT------------------TTAT------ACATGGTACAACAGATTCGGCGAGGGCGTCAATTTACCAACGGGTATGGG-----AAAAGACGGACG-TCTTGCAACGTCAAAAG-TGTTAAAATCATTTCTAGGACCAAAATGATTCTTGATGGGGATAGATG-CA--TAAGAG--AT--AGAGAC--A-TAAC--AACGGGAA-GTGACTATATACG---AGTTTATATTCTACAATTACGGATTATTTGAATACGTGTCATGTTACGTCTTGCTGGG-TGCCATAGTTACTTTTAATGGAATACA-GAGAGA--AGAG---TA-CTACGGCTACGTGCTTTATAAAGAA--CT---A-AGGTAAATGTGGTATGAGATATTTAACTAAAATAGTGACAGTTGATGAGACATGTGTATCGACATTCGATCCCGAAACCAAACAAATGCCATCATTTTGGGGGAA-AAACGACATCTCCATCACCAGAGAAGCTCAGCAAAGAAGCAGATTTGTGTCG-TTTTCTACGAAGT----AATGTC---TCAAATCATGCCGTACC-T-GTATGAACTACAATCAAATCCAACTACTATTCAAAGACATGCGCAACAAAATATACTTATTATTTGTAC-------AGTTTTTG-TTTTCTGTTTGTTTGTTTAACCAATTATTTGTAGGTTGTTTTATAATTGTAATACCATGTGACTTTGAAATAACGTAATTTGAGAATGCC---ATGCCC-TTAA-TTAATTCCGCGTGTTTTGACATTG-TCCGCGGTCACGCC-----------------------TGCTAAGCGTctcg
gi|6 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaTGTATTTATATCGCTAATAAATAGTATGACTAAAA-CTGAAAGGAC--AAAAAAGTTATAAAT-AGTA-TC--CGAACTTTTTTCA-AATC-C-TCCTCgtatttatatcgctaataaatagtatgactaaaactgaaaggacaaaaaagttataaatagtatccgaacttttttcaaatcctcctcg
gi|7 : atatattatagaacaccggtacgcaataaaattttgaatttttgctaaagaaaacttaaccagaaactgtgactaacattatgaaaacatatggtggaaaagcttgacgaaaactgcaatttatacatggtacaacagattcggcgagggcgtcaatttaccaacgggtatgggaaaagacggacgtcttgcaacgtcaaaagtgttaaaatcatttctaggaccaaaatgattcttgatggggatagatgcataagagatagagacataacaacgggaagtgactatatacgagtttatattctacaattacggattatttgaatacgtgtcatgttacgtcttgctgggtgccatagttacttttaatggaatacagagagaagagtactacggctacgtgctttataaagaactaaggtaaatgtggtatgagatatttaactaaaatagtgacagttgatgagacatgtgtatcgacattcgatcccgaaaccaaacaaatgccatcattttgggggaaaaacgacatctccatcaccagagaagctcagcaaagaagcagatttgtgtcgttttctacgaagtaatgtctcaaatcatgccgtacctgtatgaactacaatcaaatccaactactattcaaagacatgcgcaacaaaatatacttattatttgtacagtttttgttttctgtttgtttgtttaaccaattatttgtaggttgttttataattgtaataccatgtgactttgaaataacgtaatttgagaatgccatgcccttaattaattccgcgtgttttgacattgtccgcggtcacgcctgctaagcgGGGATGTTCAAAAAGTTCGCGGAAAATACTCATAAAA-TCTTTATCTGTTGTCTATACGTTTTAAAATTT---------------CAA-GGTCTCTAT-ACTCATTAT-TGATTTTAC-AGACATCAGTAGTGTAGTCATGCTAATAATAGTTTTATCAATATTACAGTAACGTACATCGACCTTCACCGACCGTCACCGGATCACTTTTCGTTTTATTGCATATATT--TTCGAAAATTGCTACAACTTTACATGGTCATTTCATTTTTA-CT-TGCTG----ATGGATTTTC-TTAC-AAATTATATCCCGTCCGCGTCTGAAGAACCCTATAGC----ATAA-TTTGTCACATCGATACGTCTTCACTAAACGCACCGTATATTATCAAGCTGTTT-TTACTTCACAGTGTCTTAAGAACAGTGGTACGCAATGAAAATTGAGTTTTGCAAATAA--A-AA----CTAAACCAGAAACTTT---GACTAC--CATT--ATG------AA-AACATATGGTG---A--AAATATA---TG------GC-TTT----AAGGAA-----AGG------------------TGAT------AAATGATAAAACAGATTCAGCAAAGGTGTCAATTAACCAACATACATAGG-----AGAAAACGTACG-TTATACAACATCAAAAATTGCTAGAATCATTTCCAGGGCTTAAAAAATT----------GTATACG-CA--TAAGTA--ATAGAGATTT--AGCAGCTAAACTGGAC-AT---TTGA-ACGGGAAGTGACTATTCTATTATTACGGATCATCTGAAg
gi|8 : -TT--TCATACTGTGACA---TCAGTAAA--------ACATTATGACAATATTTGTGACATCAATACGACTT-----CACT-GTACACACTG------------------TAT--ATGA----CT-------AAGCTGT---TTTCACTTTACA--ATGTAT-TTAG-AACA-GCGGTACGGA--ATA---A---AATTTTGTGT-TTTGCAAAAGAAAACTA-AAT------------------t
gi|8 : --A-AA----CTAAATCAGAAACTGT---GACTA----ACATTATG------AA-AACATATG--A---C--GGA---A---AA------GC-TTTGC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATAGTACAACAGATTCGGTGAAGGCATCAGTTAACCAACAGACATGGA-----AAAAGGCAGACG-TCCTGCAACGTCAAAAA-CGTCAGAATCATTTCTAGGGCCAAACTGACTCTAGATGGGGATTGACG-CC--TAAGTGTGAC--ATATTT--AGCAACTAAACTGAACAGT---TTT--ACAGGAAGTGCATTTTCTAGTATTACGGATTATTTGAAAATGCATCGCATATCAGCTAGGTGGG-TGCCATGGTTACTTTCAAGCAAATACA-AAGAGATGAGAA---TGGCAGCAGCTACACAATTTCTAAAGAA--AT---A-TGGTAAATGTGGTACGAGATATCTAAATAAAATGGTGACAGTTGGTGAGACATGGGTATCAACGTTCGATCCTAAAAACAAACAAATGTCATCAGTTT-GGAAAA-TACCGGCATCCCCcagaaactgtgactaacattatgaaaacatatgacggaaaagctttgcagaaaactgcaatttataaatagtacaacagattcggtgaaggcatcagttaaccaacagacatggaaaaaggcagacgtcctgcaacgtcaaaaacgtcagaatcatttctagggccaaactgactctagatggggattgacgcctaagtgtgacatatttagcaactaaactgaacagttttacaggaagtgcattttctagtattacggattatttgaaaatgcatcgcatatcagctaggtgggtgccatggttactttcaagcaaatacaaagagatgagaatggcagcagctacacaatttctaaagaaatatggtaaatgtggtacgagatatctaaataaaatggtgacagttggtgagacatgggtatcaacgttcgatcctaaaaacaaacaaatgtcatcagtttggaaaataccggcatcccc
gi|9 : tttcatactgtgacatcagtaaaacattatgacaatatttgtgacatcaatacgacttcactgtacacactgtatatgactaagctgttttcactttacaatgtatttagaacagcggtacggaataaaattttgtgttttgcaaaagaAGGGTTGTTCAAAATGTTCGTGGGAAATGCTTATAGAT-ACTTTAACTGCCATTTGTATGATTTAAAATTTA-------ATCCAAACATAGGTCTATAT-ATTCATTAT-TT-TTC-ACTAAAAATCAACACTGTAGTCATACCAGTAATATTTTTATCGCATCTACAGTAACGTACATCGAC----------CGTCTCAGGGTCACTTTTCGTTATTTGGAAGGTATT--TTTGAAAATCGCTACCTCTTTACATATTCTTAAC-TTTTTA-ATGTGCTG----A-------------------TGCATCCCGTCCA------------CCTAAAGCT-CAGTAC-TT--TAATTCTGTGAAG---TCAGTAGA--------ACATTATGACGTTATTTGTGACGTCAGTACGTCTT-----CACT-GTACACACGG------------------TAT--A--------TT-ACC--AAGCTGT---TTTCACATCACA--ATGT-CTTTAG-AACA-GCGGTA---AGGAAT---A---AA------AT-TTTG
gi|9 : TG------------------CAT--A-AGAATGCTTAATCAGAAACTGTCAAGAGCGTT-------ATG------GA-AACATATGGCG---A--AAA---A-----------GC-TTTAC--A-GAAAACTGCAAT------------------TTAT------AAATGGTAC-ACGAATTCGGCGAAGGCGTCAtgtttgcataagaatgcttaatcagaaactgtcaagagcgttatggaaacatatggcgaaaaagctttacagaaaactgcaatttataaatggtacacgaattcggcgaaggcgtca