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gi|10                         :                   TTTATTCAATTAACGCCGTATATAATT----------TA----CA-----GATTAATTAGAAAAACAAACGATAGAGTGTGTAACAATTAACAATAATTACTATTTAATA-A-T--A----TTTTAAATG------GGTTCTTTA---T------CA-ATGTTAAGTACTCAAGGAACG------A-------AT--------------TAA-TATAGTACTT--ATTTAGACATGTCTTTTG--GCACCTTTTTTTCTA--A-TAAGTTCTAC--TTATCTAGAAGTGATTTTC---CATGTATTCACAGACCATCTATGTAATTTTGAACTCGTCTTTCAAAATTATTAGATTTTTTTCCATTGTAC
gi|2                          :                            ttAA-----TATACA--TAAAT------CA----CA-----GATTAATTAGAAATACAAACGATAGATTGTGTAACAATTAACAATTATTA----TTAATGTA-G--A----TTTTAAA-T------ATTT-TTTT---T------CA-TAGTCAAGTTCT--AGGAGTA------T-------ATTAATATAGTAAAAACAA-GAT--TA--T--ATATAGGAA-GGTCTTTTG-GCATATTATTTTCTG--AATAAGTTATATACTTATCAAAAGATGATTTTTC--CTTGTATTTACAGGCTGTTTTTGTAATTTTGAATTCGTCTTTCCAAA-----AGATT------------------AGA-CTTA--TA-----TCTATAT------CAGATTATTGAAAAAAAATT-ACATGCTTAGTTCTAGATTCGCTTATAAAATACGTCTT--ATATATTGAAAATCATATTAGTGCGAATATTCTGTTTATATTAGTATATTCCGGATGATCTACTTTGTAGCCGATTATTATATTTTATAGCGATTTTACGTTTTTGTTTTTTCTGCAGTGTTTTTAAACAAGGTGTTTATTTTC--TTCCAAAATCCA--------TTTGCAGTCTATGAACAAATGTTTGTAAATTTCATGTTCATTGCAGATGTTACACAA-CGGAGTTGAGCTTATTTTCCAAAGGAA-TCTTATTTCTTTC----------------GAATTAATTTAAATCTAAATTGCTTTATACGATTGTCTTCTAA--TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTCTCCAGT---TTATTATATTATCAAAATATGTATTCCAGT-ATGTATGTACATAAGGAATAGAAAAG-TTACGACTTATAAGTTGGTTAAAGATTATTTTGTTGTT-----TGTGTTTACAAATTCTAGAAC-TTTTCCG--------------------------GGTTTGTTTTGACTTTTGATTGTATAGAACAATGTGATTTTAAAATAGTTTTCCATGAGGTAGGTGTTGCTTGTTTCTGTTTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGC--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATTTTTACTTATTTCGCCGTTGTTA-TCGATAATGTCATTTAT-AAGAGA-ATTCAGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACAAAGCATTTTTT-AAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCAT-ATGATTAGTTTTCGAATTTCTTCAAGTAT-TTTCCTTTTTCGATA-TTTCCT-CTTTTTATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTTTGTAAAAATTCGGTATTGAAAGACTATCATATTA-T----TTTT----TTTTTCAAATGACCTAA----AT----TTATATTAAATATAAGGAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTTT-AAAAAATAGTAAGGCAGTATTTTCGAGTTTGCTTCATCTTTTTTTTTTAACCATTTTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                           CA-GGTCTTTTG-GCACCTT-TTTTCTG--AATAAGTTCTAC--TTATCTAGAAGTGATTTTTC--CATGTTTTCACAGACCATCTATGTAATTTTGAACTCGTCTTTCAAAATTATTAGATTTTTTTCCATTGTACTCCGAGctttaagggattttaagaatgatgcggggactagcatatctagcccaccttgatttgttggtcctatcatcattgtgcgttttatttttttcgcgtttcccatgccataagaatttataaataagcgaatcgattatttttactttatcgagtggtgttttagaggattgttccaagaatacaaattttggcataattaatgttttaataacttctatctttccgaaaaatagtaaatttcgtttaagtcatttgtttagtaagttttcactttcaattattttctttcccagtttagtgcattgcattcagttttgttgcggcaaaaataaataccttaagctttgataggtttttgagcccaattaatatttccatttttttctacacaaaatctcaatttacccacatatattccttctgtttttccatgattaagaactactcccgattgtttgccaatatttcatatgatatataaagctgttatgatttcagtttttgatccaagaaaaatagttgtatcgtctgctaattgcgttgtttgaattgtttaatacagttgttgtattgaatttttatgccttgagctgcatcattg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aTGTACGATTGTCTTCTAA--TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAAT---TTATTATATTATCAAAATATGTA-TTCAATCATGTATTTATAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatataaaactttattcaattaatatacataaaaattaagattaattagaaatacaaacgatagattgtgtaacaattaacaatagttaataaTACGATTGTCTTCTAA--TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAAT---TTATTATATTATCAAAATATGTA-TTCAATCATGTATTTATATTAGGAATAGACAAT-TTACGACTTATAAGTTGGTTATAGAATATTTTGTTGTTTGTACTGTGTTTACAAGTTCTAGAACTTTTTCTGTTCGCTAAACGT-AATTTTAAAGTAAGGTTTGTTTTGACTTTTGATCGTATAGAACAATGTGATTTCAAAATAGTTTTCCGTGAGGTTGGTATTGCTAGTTTCGCTTTACTTAATTTCGTAATCCAGTTATGT--TTG-TTGTTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTGTAAATTATATTTTCACTTATTTCGCCGTTGTTA-TCGATAATGTCATTTATAAAGAGA-ATTCCGGATTTAATCCATACTTTGAAGACCAAGCTTTCGTT-AAAAAAAACAACAACATAATTTCTTGATTACCCCAT-ATGATTTGCTTTCGAATTTGTTCAAACGT-TTTGAATTTTCGATATTCTCCTATTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATCATGTCTATGTAAAAATCCGGTATTGAAAGACTATCATA--A-TTATGTTTTTATGTTTTTCAGATGACCTGA----AT----TTATATCAAATATAAGGAAGTT--GT---T---TCCGAAt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gATAGCTTTATATACATTTTCTCAGTATATTATCATATTTTT----TATGTTTTTCA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aTCTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGT--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATCTTCACTGATTTCGCCGTTATTA-TCGATAATGTCATTTATAAAGAGA-ATTCCGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACCAAGCATTTTTT-AAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCAT-ATGATTTGTTTTCGAATTTGTTCAAACGT-TTTGCTTTTTATATTTTCTCCT-CTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTATATAAAAATCAGGTATCGAAAGATTATCGTA--A-T----TTTTTATGTTTTTCAGATTACCTAA----AT----TCATATTGAATATAAGAAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTTgatgacctaaatccattcatactaaatataagaaagttaagttacttccgaattcctttaaaaaattgttaggcagtattttccattttttttcatctttctctgttagtttatttatccattttactttaaggaatttaaagaatgatgtggtgtctagcatatctagtccaccatgatttttttgtcctatcagtgttgttcataagaatttataaataagcgaatcgattatttttattttatcaagaggtgttgtagagaattgtaccaagtatacagattttgacataattaatgttttaataacttttatctttccaaacaaatttaaatttcttttaagccatttgtttattaagttttcactatcaattaaggccaatgggcctgttgttctttcccagtttagtgcgttgtattctgttttgttgctgccaaaataagtacctaaagttttgatagatttttcagccaaattaatatttccaattttgtctacacaatttattaataaacccacaattacatcccttctgtttttccatgattaagaactaatccttattgtttgccaaaattttctatgatatttaaagctaatttaattcattttttgatctaagaaaagtagttgtatcatctgctaattgcgttattttaattttttttaatacaattgctgtgtgaatttttatgccttgtattgcatcattg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCCAATTGTTT--TCA-T--ATTTTA----------ATTTTTTGAGGATGATTTTTTCATTGATGTTTCCGAT-TTAGTCAATTATGTCATTAACAAAAATATATT--AGATTTTATCAAATTTTTAAAATTTAAACATTTTTT-ATTG--------AGAATTATGTGTTTATT-CCCAATAAAAATTTGCTTTCGAACATTTTCAAAATTGTTTGTTT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atttatttctgctgATTATCATA----T----TTTTTATGTTTTTCAGATGACCTAAATCCAT----TCATACTAAATATAAGAAAGTTAAGTTACT---TCCGAATTCCTTTAAAAAA
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Reference ( family-4494 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTTTTATA--AAACTTTATTCAATTAA-TA---TACAT-A-A--C--A-------C---AGATTAATTAGAAATACAAACGATAGATTGTGTAACAATTAACAATAATTA----TTAATG-TA-GATTTTAAA-T----AG-TTGTTTTT------CC-TTGTCAAGTTCT--AGGA----ACGAAT-------GTAN-------AAGATA-TA--T--ATATAGGCAGGTNTTTTGGCATATTATTTTCTA--AATAAGTTATATACTTATCTAGAGGTGA-TTTTTCT-CTTGTATTTACAGGCCGTCTATGTAGTTTTGAACTCGTCTTTCAAAATTATTAGATTTNTNTCTATTGTACTCGGAGAGCTTAGATAATTTTTT-ATATTCTTGACAGAATATTGAAAAACAATTTACATGCTTAGTTCTAGATTCGCTTATAAAATACGTTTTA--TATATTGAAAATCNTGTTAGTGCGAATATTCTGTTTATATTAATATATTCCTGATGATCTACTTTGTAGCCNATTATTATATTATATAGCGATTTTACGTTTTTATTTATTCCGCAGTG--TTTAAACAAGGTGTTTATTTTC--TTCCAAAATCCATTTACTTCTTTGCAGTCTATGAGCAAATGTTTGTAAGTTTCGGGTTCATTGCAGATGTTACAAAAC-GGAGTTGAGCTTATTTTCCAAAGGAA-TCTTATTTCTTTCGATGGAATGATCTTATGAATTAATTTAAATTTAAATTGCTTTATACGATTGTCTTCTAA-TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAGT---TTATCATATTATCAAAATATGTATTCCAGTCATGTATGTATATAAGGAATAGAAAAT-TTACGACTTATAAGTTGGTTATAGATTATTTTGTTGTTTGT-----GTTTACAAGTTCTAGAACTTTTCC-GTTCGCTAAACGT-AATTTTAAAGTAAGGTTTGTTTTGACTTTTGATCGTATAGAACAATGTGATTTTAAAATAGTTTTCCATGAGGTAGGTATTGCTTGTTTCGATTTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGT--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATCTTCACTTATTTCGCCGTTGTTATCGATAATGTCATTTATAAAGAGAATTCCGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACCAAGCATTTTTTAAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCATATGATTTGTTTTCGAATTTGTTCAAACGTTTTGCTTTTTCTATATTCTCCT-CTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTATATAAAAATCCGGTATTGAAAGACTATCATA--A-T----TTTTTATGTTTTTCAGATGACCTAA----AT----TCATATTGAATATAAGAAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTTTAAAAAAATAGTTAGGCAGTATTTTCCAGTTTGCTTCATCTTTCTCTGTTA---GTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGTTNTAGAGGATTGTNCCAAGNATACAGATTTTGGCATAATTAATGTTTTAATAACTTCTATCTTTCCGAACAAATANTAAATTTCGTTTAAGCCATTTGTTTATTAAGTTTTCACTNTCAATTA---------------TTTTTCTTTCCCAGTTTAGTGCGTTGCATTCAGTTTTGTTGCGGCCAAAATAAGTNCCTAAA-G--TT--GATAGGTTTTTGAGCCCAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTNTTAATTTACCCACA--TATATCCCTTCTGTTTTTCCATGATTAAGAACTANTCCCGATTGTTTGCCAANATTTCNTATGATATNTAAAGCTGNTNTGATTTCANTTTTTGATCCAAGAAAAGT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttTTTTTTTATA--AAACTTTATTCAATTAAATA---CACAT-A-AT-C--A-------C---AGGTTAACTAGAAATACAAACGATAAACTGTATAACAATAAACAATAATTA----CTAATG-TA-GTTTTTAAA-T-----G-TTTTTTAA------CCATCGTAAAGTTCT--AGGA----ACGAATAAATAAAGTAA-------AATATA-TA--TTGATATAGGCAGGTCTTTTGGCATAT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ataTGTACGATTGTCTTCTAA-TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAAT---TTATTATATTATCAAAATATGTATT-CAATCATGTATTTATATgtcttctaatttgtgtatagctttatatacattttcccaatttattatattatcaaaatatgtattcaatcatgtatttatatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atatataaaactttattcaattaatatacataaaaattaagattaattagaaatacaaacgatagattgtgtaacaattaacaatagttaataaGTTTAAGCCATTTGTTTATTAAATTTTCACTGTCAATTA---------------TTTTTCTTTCCCAGTTAAGTGCGTTGCATTCAGTTTTGTTGCGGCCAAAATAAGTGCCTAAA-GCTTT--GAAAGGTTTTTGAGCCCAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTTTTAATTTACCTACT--TATATCCTTTt
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aATTATCATA----T----TTTTTATGTTTTTCAGATGACCTAA----ATCCATTCATACTAAATATAAGAAAGTTAAGT---TACTTCCGAATTCCTTTAAAAAATT-GTTAGGCAGTATTTTCCATTTTTTTTCATCTTTCTCTGTTA---GTTTatgacctaaatccattcatactaaatataagaaagttaagttacttccgaattcctttaaaaaattgttaggcagtattttccattttttttcatctttctctgttagtttatttatccattttactttaaggaatttaaagaatgatgtggtgtctagcatatctagtccaccatgatttttttgtcctatcagtgttgttcataagaatttataaataagcgaatcgattatttttattttatcaagaggtgttgtagagaattgtaccaagtatacagattttgacataattaatgttttaataacttttatctttccaaacaaatttaaatttcttttaagccatttgtttattaagttttcactatcaattaaggccaatgggcctgttgttctttcccagtttagtgcgttgtattctgttttgttgctgccaaaataagtacctaaagttttgatagatttttcagccaaattaatatttccaattttgtctacacaatttattaataaacccacaattacatcccttctgtttttccatgattaagaactaatccttattgtttgccaaaattttctatgatatttaaagctaatttaattcattttttgatctaagaaaagtagttgtatcatctgctaattgcgttattttaattttttttaatacaattgctgtgtgaatttttatgccttgtattgcatcattg
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGT--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATCTTCACTGATTTCGCCGTTATTATCGATAATGTCATTTATAAAGAGAATTCCGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACCAAGCATTTTTTAAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCATATGATTTGTTTTCGAATTTGTTCAAACGTTTTGCTTTTTATATTTTCTCCT-CTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTATATAAAAATCAGGTATCGAAAGATTATCGTA--A-T----TTTTTATGTTTTTCAGATTACCTAA----AT----TCATATTGAATATAAGAAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4494 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTTTTATA--AAACTTTATTCAATTAA-TA---TACAT-A-A--C--A-------C---AGATTAATTAGAAATACAAACGATAGATTGTGTAACAATTAACAATAATTA----TTAATG-TA-GATTTTA-------AA-TAG-TT-TTTT----T----CCTTGTCAAGTTCT--AGGA----ACGAAT-------GTAN-------AAGATA-TA--T--ATATAGGCAGGTCTTTTGGCATATTATTTTCTA--AATAAGNTATATACTTATCTAGAGGTGATTTTTCT-CTTGTATTTACAGGCCGTCTATGTAGTTTTGAACTCGTCTTTCAAAATTATTAGATTTNTNTCTATTGTACTCGGAGAGCTTAGATAATTTTTT-ANATTCTTGACAGAATATTGAAAAACAATTTACATGCTTAGTTCTAGATTCGCTTATAAAATACGTTTTA--TATATCGAAAATCCTATTAGTGCGAATATTCTGTTTATATTAATATATTCCTGATGATCTACTTTGTAGCCTATTATTATATTATATAGCGATTTTACGTTTTTATTTATTCCGCAGTG--TTTAAACAAGGTGTTTATTTTCT--TCCAAAATCCATTTACTTCTTTGCAGTCTATGAACAAATGTTTGTAAGTTTCGGGTTCATTGCAGATGTTACAAAAC-GGAGTTGAGCTTATTTTCCAAAGGAA-TCTTATTTCTTTCGATGGAATGATCTTATGAATTAATTTAAATTTAAATTGCTTTATACGATTGTCTTCTAA-TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAGT---TTATTATATTATCAAAATATGTATTCCAGTATGTATGTATATAAGGAATAGAAAAT-TTACGACTTATAAGTTGGTTATAAATTATTTTGTTGTTTGT-----GTTTACAAGTTCTAGAACTTTTCC-GTTCGCTAAACGTAATT-TTAAAGTNAGGTTTGTTTTGACTTTTGATCGTATAGAACAATGTGATTTTAAAATAGTTTTCCATGAGGTAGGTATTGCTTGTTTCAATTTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGT--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATCTTCACTTATTTCGCCGTTGTTATCGATAATGTCATTTATAAAGAGAATTCCGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACCAAGCATTTTTT-AAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCATATGATTTGTTTTCGAATTTGTTCAAACGTTTTGCTTTTTCTATATTCTCCT-CTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTATATAAAAATCCGGTATTGAAAGACTATCGTA--A-T----TTTTTATGTTTTTCAGATNACCTAA----AT----TCATATTGAATATAAGAAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTTTAAAAAAATAGTTAGGCAGTATTTTCCAGTTTGCTTCATCTTTCTCTGTTA---GTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGTTTTAGAGGATTGTACCAAGTATACAAATTTTGGCATAATTAATGTTTTAATAACTTTTATCTTTCCGAA-AAATGTTAAATTTCGTTTAAGCCATTTGTTTATTAAGTTTTCACTGTCAATTA---------------TTTTTCTTTCCCAGTTNAGTGCGTTGCATTCAGTTTTGTTGCGGCCAAAATAAGTGCCTAAA-GCTTTGATAGGTTTTTGAGCCCAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTTTTAATTTACCCACA--TATATCCCTTCTGTTTTTCCATGATTAAGAACTAATCCCGATTGTTTGCCAAAATTTTCTATGATATTTAAAGCTGTTATGATTTCATTTTTTGATCNAAGAAAAAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttTTTTTTTATA--AAACTTTATTCAATTAAATA---CACAT-A-AT-C--A-------C---AGGTTAACTAGAAATACAAACGATAAACTGTATAACAATAAACAATAATTA----CTAATG-TA-GTTTTTA-------AA-T-G-TT-TTTTAA--C----CATCGTAAAGTTCT--AGGA----ACGAATAAATAAAGTAA-------AATATA-TA--TTGATATAGGCAGGTCTTTTGGCATAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TA--AAACTTTATTCAGTTAA-TA---TATAT-A-A--TTTG-------C---AGACTAATTAGACATACAAACGATAGATTGTGT---AATT----GTAACTA----CACATG-TA-GTTTTTT-------AA-T-G-TT-TTTA----T----CA-TGTCAAGTTTT--AGGA----ACGAATTAAAATAGTAA-------AACAAA-TA--C--ATATAGGCATAT-TTTTGGCATGTT-TTTTCTATCAATAAGTTATATAaca
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataTGTACGATTGTCTTCTAA-TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAAT---TTATTATATTATCAAAATATGTATTCAATCATGTATTTATATgtcttctaatttgtgtatagctttatatacattttcccaatttattatattatcaaaatatgtattcaatcatgtatttatatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatataaaactttattcaattaatatacataaaaattaagattaattagaaatacaaacgatagattgtgtaacaattaacaatagttaataaGTTTAAGCCATTTGTTTATTAAATTTTCACTGTCAATTA---------------TTTTTCTTTCCCAGTTAAGTGCGTTGCATTCAGTTTTGTTGCGGCCAAAATAAGTGCCTAAA-GCTTTGAAAGGTTTTTGAGCCCAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTTTTAATTTACCTACT--TATATCCTTTt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGT--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATCTTCACTGATTTCGCCGTTATTATCGATAATGTCATTTATAAAGAGAATTCCGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACCAAGCATTTTTT-AAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCATATGATTTGTTTTCGAATTTGTTCAAACGTTTTGCTTTTTATATTTTCTCCT-CTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTATATAAAAATCAGGTATCGAAAGATTATCGTA--A-T----TTTTTATGTTTTTCAGATTACCTAA----AT----TCATATTGAATATAAGAAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-4494 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTTTTATA--AAACTTTATTCAATTAA-TA---TACAT-A-A--C--A-------C---AGATTAATTAGAAATACAAACGATAGATTGTGTAACAATTAACAATAATTA----TTAATG-TA-GATTTTA-------AA-TAG-TT-TTTT----T----CATTGTCAAGTTCT--AGGA----ACGAAT-------GTAN-------AAGATA-TA--T--ATATAGGCAGGTCTTTTGGCATATTATTTTCTA--AATAAGNTATATACTTATCTAGAGGTGATTTTTCT-CTTGTATTTACAGGCCGTCTATGTAGTTTTGAACTCGTCTTTCAAAATTATTAGATTTNTNTCTATTGTACTCGGAGAGCTTAGATAATTTTTT-ANATTCTTGACAGAATATTGAAAAACAATTTACATGCTTAGTTCTAGATTCGCTTATAAAATACGTTTTA--TATATCGAAAATCCTATTAGTGCGAATATTCTGTTTATATTAATATATTCCTGATGATCTACTTTGTAGCCTATTATTATATTATATAGCGATTTTACGTTTTTATTTATTCCGCAGTG--TTTAAACAAGGTGTTTATTTTCT--TCCAAAATCCATTTACTTCTTTGCAGTCTATGAACAAATGTTTGTAAGTTTCGGGTTCATTGCAGATGTTACAAAAC-GGAGTTGAGCTTATTTTCCAAAGGAA-TCTTATTTCTTTCGATGGAATGATCTTATGAATTAATTTAAATTTAAATTGCTTTATACGATTGTCTTCTAA-TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAGT---TTATTATATTATCAAAATATGTATTCCAGTATGTATGTATATAAGGAATAGAAAAT-TTACGACTTATAAGTTGGTTATAAATTATTTTGTTGTTTGT-----GTTTACAAGTTCTAGAACTTTTCC-GTTCGCTAAACGTAATT-TTAAAGTNAGGTTTGTTTTGACTTTTGATCGTATAGAACAATGTGATTTTAAAATAGTTTTCCATGAGGTAGGTATTGCTTGTTTCAATTTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGT--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATCTTCACTTATTTCGCCGTTGTTATCGATAATGTCATTTATAAAGAGAATTCCGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACCAAGCATTTTTT-AAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCATATGATTTGTTTTCGAATTTGTTCAAACGTTTTGCTTTTTCTATATTCTCCT-CTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTATATAAAAATCCGGTATTGAAAGACTATCGTA--A-T----TTTTTATGTTTTTCAGATNACCTAA----AT----TCATATTGAATATAAGAAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTTTAAAAAAATAGTTAGGCAGTATTTTCCAGTTTGCTTCATCTTTCTCTGTTA---GTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGTTTTAGAGGATTGTACCAAGTATACAAATTTTGGCATAATTAATGTTTTAATAACTTTTATCTTTCCGAA-AAATGTTAAATTTCGTTTAAGCCATTTGTTTATTAAGTTTTCACTGTCAATTA---------------TTTTTCTTTCCCAGTTNAGTGCGTTGCATTCAGTTTTGTTGCGGCCAAAATAAGTGCCTAAA-GCTTTGATAGGTTTTTGAGCCCAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTTTTAATTTACCCACA--TATATCCCTTCTGTTTTTCCATGATTAAGAACTAATCCCGATTGTTTGCCAAAATTTTCTATGATATTTAAAGCTGTTATGATTTCATTTTTTGATCNAAGAAAAAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttTTTTTTTATA--AAACTTTATTCAATTAAATA---CACAT-A-AT-C--A-------C---AGGTTAACTAGAAATACAAACGATAAACTGTATAACAATAAACAATAATTA----CTAATG-TA-GTTTTTA-------AA-T-G-TT-TTTTAA--C----CATCGTAAAGTTCT--AGGA----ACGAATAAATAAAGTAA-------AATATA-TA--TTGATATAGGCAGGTCTTTTGGCATAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TA--AAACTTTATTCAGTTAA-TA---TATAT-A-A--TTTG-------C---AGACTAATTAGACATACAAACGATAGATTGTGT---AATT----GTAACTA----CACATG-TA-GTTTTTT-------AA-T-G-TT-TTTA----T----CA-TGTCAAGTTTT--AGGA----ACGAATTAAAATAGTAA-------AACAAA-TA--C--ATATAGGCATAT-TTTTGGCATGTT-TTTTCTATCAATAAGTTATATAaca
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataTGTACGATTGTCTTCTAA-TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAAT---TTATTATATTATCAAAATATGTATTCAATCATGTATTTATATgtcttctaatttgtgtatagctttatatacattttcccaatttattatattatcaaaatatgtattcaatcatgtatttatatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatataaaactttattcaattaatatacataaaaattaagattaattagaaatacaaacgatagattgtgtaacaattaacaatagttaataaGTTTAAGCCATTTGTTTATTAAATTTTCACTGTCAATTA---------------TTTTTCTTTCCCAGTTAAGTGCGTTGCATTCAGTTTTGTTGCGGCCAAAATAAGTGCCTAAA-GCTTTGAAAGGTTTTTGAGCCCAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTTTTAATTTACCTACT--TATATCCTTTt
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Reference ( family-4494 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTTTTATA--AAACTTTATTCAATT-AATA---TACAT------AAT--TTACAGATTAATTAGAAATACAAACGATAGATTGTGTAACAATTAACAATAATTA----TTAATG-TA-GATTTT-A-------AA-T-AGTT-TTTT----T----CATTGTCAAGT--TCTAGGAACGAAT---T---A---T-GTAAAA----GATATAT--ATATAGGCAGGTCTTTTGGCATATTATTTTCTA--AATAAGNTATATACTTATCTAGAGGTGATTTTTC--CTTGTATTTACAGGCCGTCTATGTAGTTTTGAACTCGTCTTTCAAAATTATTAGATTTNTNTCTATTGTACTCGGAGAGCTTAGATAA-TTTTTTANATTCTTGACAGAATATTGAAAAACAATTTACATGCTTAGTTCTAGATTCGCTTATAAAATACGTTTTA--TATATCGAAAATCCTATTAGTGCGAATATTCTGTTTATATTAATATATTCCTGATGATCTACTTTGTAGCCTATTATTATATTATATAGCGATTTTACGTTTTTATTTATTCCGCAGTG--TTTAAACAAGGTGTTTATTTTCT--TCCAAAATCCATTTACTTCTTTGCAGTCTATGAACAAATGTTTGTAAGTTTCGGGTTCATTGCAGATGTTACAAAAC-GGAGTTGAGCTTATTTTCCAAAGGAA-TCTTATTTCTTTCGATGGAATGATCTTATGAATTAATTTAAATTTAAATTGCTTTATACGATTGTCTTCTAA-TTTGTGTATAGCTTTATATACATTTTCCCAGT---TTATTATATTATCAAAATATGTATTCCAGTATGTATGTATATAAGGAATAGAAAAT-TTACGACTTATAAGTTGGTTATAAATTATTTTGTTGTTTGT-----GTTTACAAGTTCTAGAACTTTTCC-GTTCGCTAAACGTAATT-TTAAAGTNAGGTTTGTTTTGACTTTTGATCGTATAGAACAATGTGATTTTAAAATAGTTTTCCATGAGGTAGGTATTGCTTGTTTCAATTTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGT--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATCTTCACTTATTTCGCCGTTGTTATCGATAATGTCATTTATAAAGAGAATTCCGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACCAAGCATTTTTT-AAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCATATGATTTGTTTTCGAATTTGTTCAAACGTTTTGCTTTTTCTATATTCTCCT-CTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTATATAAAAATCCGGTATTGAAAGACTATCGTA--A-T----TTTTTATGTTTTTCAGATNACCTAA----AT----TCATATTGAATATAAGAAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTTTAAAAAAATAGTTAGGCAGTATTTTCCAGTTTGCTTCATCTTTCTCTGTTA---GTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGTTTTAGAGGATTGTACCAAGTATACAAATTTTGGCATAATTAATGTTTTAATAACTTTTATCTTTCCGAA-AAATGTTAAATTTCGTTTAAGCCATTTGTTTATTAAGTTTTCACTGTCAATTA---------------TTTTTCTTTCCCAGTTNAGTGCGTTGCATTCAGTTTTGTTGCGGCCAAAATAAGTGCCTAAA-GCTTTGATAGGTTTTTGAGCCCAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTTTTAATTTACCCACA--TATATCCCTTCTGTTTTTCCATGATTAAGAACTAATCCCGATTGTTTGCCAAAATTTTCTATGATATTTAAAGCTGTTATGATTTCATTTTTTGATCNAAGAAAAAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttTTTTTTTATA--AAACTTTATTCAATTAAATA---CACAT------AA---TCACAGGTTAACTAGAAATACAAACGATAAACTGTATAACAATAAACAATAATTA----CTAATG-TA-GTTTTT-A-------AA-T--GTT-TTTTAA--C----CATCGTAAAGT--TCTAGGAACGAATAAATA--A---A-GTAAAA----TATATATTGATATAGGCAGGTCTTTTGGCATAT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atatataaaactttattcaattaatatacataaaaattaagattaattagaaatacaaacgatagattgtgtaacaattaacaatagttaataaGTTTAAGCCATTTGTTTATTAAATTTTCACTGTCAATTA---------------TTTTTCTTTCCCAGTTAAGTGCGTTGCATTCAGTTTTGTTGCGGCCAAAATAAGTGCCTAAA-GCTTTGAAAGGTTTTTGAGCCCAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTTTTAATTTACCTACT--TATATCCTTTt
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aATTATCATA----T----TTTTTATGTTTTTCAGATGACCTAA----ATCCATTCATACTAAATATAAGAAAGTTAAGT---TACTTCCGAATTCCTTTAAAAAATT-GTTAGGCAGTATTTTCCATTTTTTTTCATCTTTCTCTGTTA---GTTTacctaaatccattcatactaaatataagaaagttaagttacttccgaattcctttaaaaaattgttaggcagtattttccattttttttcatctttctctgttagtttatttatccattttactttaaggaatttaaagaatgatgtggtgtctagcatatctagtccaccatgatttttttgtcctatcagtgttgttcataagaatttataaataagcgaatcgattatttttattttatcaagaggtgttgtagagaattgtaccaagtatacagattttgacataattaatgttttaataacttttatctttccaaacaaatttaaatttcttttaagccatttgtttattaagttttcactatcaattaaggccaatgggcctgttgttctttcccagtttagtgcgttgtattctgttttgttgctgccaaaataagtacctaaagttttgatagatttttcagccaaattaatatttccaattttgtctacacaatttattaataaacccacaattacatcccttctgtttttccatgattaagaactaatccttattgtttgccaaaattttctatgatatttaaagctaatttaattcattttttgatctaagaaaagtagttgtatcatctgctaattgcgttattttaattttttttaatacaattgctgtgtgaatttttatgccttgtattgcatcattg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatagctttatatacattttctcagtatGGTGTTGTAGAGAATTGTACCAAGTATACAGATTTTGACATAATTAATGTTTTAATAACTTTTATCTTTCCAAACAAAT-TTAAATTTCTTTTAAGCCATTTGTTTATTAAGTTTTCACTATCAATTAAGGCCAATGGGCCTGTTGTTCTTTCCCAGTTTAGTGCGTTGTATTCTGTTTTGTTGCTGCCAAAATAAGTACCTAAA-GTTTTGATAGATTTTTCAGCCAAATTAATATTTCCAATTTTGTCTACACAATTTATTAATAAACCCACAATTACATCCCTTCTGTTTTTCCATGATTAAGAACTAATCCTTATTGTTTGCCAAAATTTTCTATGATATTTAAAGCTAATTTAA-TTCATTTTTTGATCTAAGAAAAGTatttatccattttactttaaggaatttaaagaatgatgtggtgtctagcatatctagtccaccatgatttttttgtcctatcagtgttgttcataagaatttataaataagcgaatcgattatttttattttatcaagaggtgttgtagagaattgtaccaagtatacagattttgacataattaatgttttaataacttttatctttccaaacaaatttaaatttcttttaagccatttgtttattaagttttcactatcaattaaggccaatgggcctgttgttctttcccagtttagtgcgttgtattctgttttgttgctgccaaaataagtacctaaagttttgatagatttttcagccaaattaatatttccaattttgtctacacaatttattaataaacccacaattacatcccttctgtttttccatgattaagaactaatccttattgtttgccaaaattttctatgatatttaaagctaatttaattcattttttgatctaagaaaagtagttgtatcatctgctaattgcgttattttaattttttttaatacaattgctgtgtgaatttttatgccttgtattgcatcattg
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCTACTTAATTCCGTAATCCAGTTATGT--TTG-T--TTTTTA----------ATTTTTTGTAAATTATATCTTCACTGATTTCGCCGTTATTATCGATAATGTCATTTATAAAGAGAATTCCGGATTTAATCCATTCTTTGAAGACCAAGCATTTTTT-AAAA--------AACATAATTTCTTGATTACCCCATATGATTTGTTTTCGAATTTGTTCAAACGTTTTGCTTTTTATATTTTCTCCT-CTTTTAATATCTAACCACGTTTCAATAATGTCTATATAAAAATCAGGTATCGAAAGATTATCGTA--A-T----TTTTTATGTTTTTCAGATTACCTAA----AT----TCATATTGAATATAAGAAAGTT--GT---T---TCCGAAATCTTT
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