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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                    CTTTGTATATAACACACTATGACACTTGCATTCATCACAAATTCATCAGTTTG-ATACTGTTAGTTTAATCA-GTTTT-AAA---CTT----------TGATCTAAGACTGT--A---AT--A--T---TG----GTTG---AGAGGTCA---TT-------A----G--T-TA-TTC-------A----------G--GCTC--A------AT-------TTT--------TATTT--------------T----GTTGGTCTA-TT--T--AT-----AG---AC----------TTTGA---AGT-CTTATCTATGCACATAATTGATGTTGTTTATTA--CAGTTATTC--------TAATAC--AGTCT-TTATTTATGCTTAAAAGTCATCACCTTCATTATAG--TTCTTCTTACACAGTCTGTCAGTAAT-------ACTAGATTTCCTATTA------TCATATTACAAGTCAAATT-AACTAAAAAACAA-CAT-TTTCAAT-TATAATCGATTATTCAATTTCAGAATCGATAATCAAATTAGATGAGTATTTTC-TG-T-AAGTTATCTATTTTAATC-AATTA-CGG-TAATCA---ATACATCACTAC
gi|8                          :                                                                                                                         ATACTGACATTCATCACAATTTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGTTTGAACA-GTTTT-ACA---ATT----------TGATCTAAGATTGT--A---TA--A--T---TG----GTTG---AGAAGTCA---TT-------A----G--T-
gi|1                          : atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattggatgtatgaaattgattcaaataatcgattataatcgaaaacaattttttcaatgaagaaagttaaaaCTGGCATCAATCACAAATTCATCAGTTTG-ATACT-TTGATCTAA--G-ATTGT-ATA---ATT----------TGTGCTAGAA--GT--C---ATTAA--T---TA----GTTATTTAG-GGTCACTTTT-------ATTTTG--T-TG-TTCTATTTATA----------G--ACTTTAA------AG-------TCT--------TATCTATGCGCATACTTCAT----GTTG-TTTA-TT-----AT-----AGTT-AT----------TCTAATACAGTATTTATTTACGCTTAAAGTTCATGGCCTTTATTATTTAGATATTT--------TAATA
gi|2                          :                  tatatgaaaatcgattattggatataatcgaatgtatgaaatcaattaataatcaattataacaggaaataaaattttacgatggagatctttattaaaaatgttaaaatgATTCATCGGAAATTCATTTTTTTTTATATTGCTAGTT--ATCATATTTTCAAA---CTT----------T-----AAGACTGTGTA---AC--T--C---TG----TTTA---AA--GTCA---TT-------A----G--T-TA-TTT-------A----------G--AC---------------------------------------------------------TGGTCTA-TT--T--ATGCATGAGTTTAC----------TTTAA---AGT-CTAATTTATGCTCAAAATTTATGTTTTTTATAA--TGGTTATTC--------TAATAT--AGTCT-TTATTTATACTCAGTGTTCATGTCCTTTATTATAG--TTC-TCCAATAGAGGCTGTTAGTAATGCCACTAACTATGTTTCCTATTA------TCACGTTATAAGCCAAATC-AAGT-TCAAACGA-TAA-TTTCAGT-TATAATCGCTTATTCAATTTCATAATCGGTAGTAGAATCGGATGGGTATTTTC-GA-TCAAG-TATCGATTATAATttactagtcaattaaagtaaataacaacactttcgatataaatcaattatttaatttaacaatcgataattgaatcatatgagtatttttgattagttagggattttaatcgattaatcgttacagcacacacagaaggatgatggttcatgtatcaagatc
gi|16                         :                                   tcaattaactagtactacaaccagtcgctgtaccatattacaatgcagaacttaataataaaaagtatgccttacacagttgcaatgcttatatATTCACCAAAAATTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGATTGAACA-GTTTT-ACA---CTT----------TTATCTAAGATTGT--AT--AT-----T---TG----GTTG---AGAAGGCA---TT-------A----G--T-TA-
gi|9                          :                                                                                                            ttccatgcaagatacaaacaatggactgaatAATTCATCA-TTTA-ATATTTTTA----AACCA----TC-AAAACCCTCCGTGATCGAATGATCTAGTGTTGT--A----T--A--T---TGATGTGTTG---ATAAGTCA---TT-------A----G--T--A-TTT-------ATTAGTTATATG--TCTC--A------CT-------TTTCATTCTTATATTT--------------T----GCTGGTCTA-TT--C--AT-----
gi|1                          :                                                                                                       agtgtttaggaatcagaggaaaattaaaaatgattatcaaattcaatcggcaaggaccttttTTCATCA-GTTTG-ATA---CTT----------TGATCTAAGATTGT--A----T--AATT---TGT---GCT----AGAAGTCA---TT-------AATTAG--T-TA-TTT-------A----------G--GGTC--A-------C-------TTT--------TATTT--------------T----GTTGTTCTA-TT--T--AT-----AG---AC----------TTTAA---AGT-CTTATCTATGCGCATACTTCATGTTGTTTATTA--TAGTTATTC--------TAATAC--AGTAT-TTATTTACGCTTAAAGTTCATGGCCTTTATTAT----------TTAGATA---TTTTAATATT-------ACTAG-----------------TCA-ATTA-AAGT-AAAT----------AACAA-CAC-TTTCGATATA-AATCAATTATTTAATTTAACAATCGATAATTGAATCATATGAGTATTTTT-GA-T-TAGTTAGGGATTTTAATC-GAT-------TAATCG---TTACAGCAC
gi|4                          :                                                            tatatgaaaatcgattattggatataatcgaatgtatgaaatcaattaataatcaattataacaggaaataaaattttacgatggagatctttattaaaaatgttaaaatgctggcatcaatcacaaa----------TGATCTGAGAGTGT--A----T--A--C---TCT---GTTG---ATAAGTTA---TT-------A----G--T-TA-TTT-------A----------C--CCTC--A------CT-------TTT--------TATTT--------------TTTACATTG--CTA-TTGATGGAT-----AG---AC----------TTTAA---AAT-CTTACTTGTGCTGAAAATTCATGTTATTTTTTA--TACTTATTCTTACATTCTAATAC--AATCT-CTATTTATGCTCAAAATTCATGTTCTTGATTCCAGTATTGTTCAAAAACAGTCTG---GTAGT-------A-------TC----------------ATTACAAGACAAATG-GACTTAAAAATAA-CGT-TTTCGAT-TTTAATCCATTAGACAATTTCATCACCAATAGTAGAATGGGATGAATAGTT---TGAT-CAGTTATCGATTATAATCGAAT---CGATTAATCacacagaaggatgatggttcatgtatcaagatc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                 ccgcggcagag----------TGATCTAAGATTGT--A---CA--A--T---CA----GTCT---ATAAGTCA---TT-------A----G--T-TT-TTggaacaactttagttgtacctatggatgtcattata
gi|6                          :                                                                             gtgtttaggaatcagatgaaaaattagaatcaattatcaaatagaactgataaggaccattcgatccataatcagaaaataattgaagattgattaaaaacaaccattgtcctccgtgtctaagTCTAAGATTGT--ATAAAA--A--T---CA----GTTG---ATAAGTCG---TT-------A----A--T-TG-TTT-------A----------G--GCTC--A------CA-------TTA--------TATTT--------------T----GCTGATCTA-TT--T--ATGC---AT---ACATGTATATAGTTCAA---AAT--TTGTTTATGCTCAAAATTCATGTTATTTATTT--TAGTTATTC--------TAATACAAAGTCT-TTATTACTGCTCAAAATTCATattagcttgtcttttt
gi|7                          :                                                                        agtggttaggaattggaggaaaattataattgattatcaaatcaaatcagcatggacctttcattacacaattggaatgtaattgaagatattttaaagacaacaagggtcctccgtggtcaagtgaccTCCAAGGCCG---A---GT--A--TAACTG----GTTG---ATAAGTTG---TTTGAATTTA----GACT-TACTTT-------G----------GATGTTC--A------AT-------TTT--------AACTT--------------T----ACTGGTCTATTT--T--AT-----AT---A-------------TGAAC-AGT-CT--TTGATGCTCAAAATTCA---TGTTTATTA--CAGGT-TTC--------TAAT----AGTCT-TT-TTTATGTTgttattt
gi|12                         :                                                                                                                                          aaatttggaatcgattcacatccggaaaataatggaagagtttctacaaaaaagctaaggcctTCTATGATTGT--A---TA--A--T---CG----GTTG---ATATGTTT---TA-------A----G--C-TA-TTT-------A----------G--GCTC--ACTTTAGATTTTCGTCTTT--------TATTT--------------T----GCTGGTCTA-Tatgccctaaattccaatatttttt
gi|5                          :                                                                                                                                                                    agtgtttaggaatcggaggaaaattagaatcgattcacaatatgaaaataatcaaatattttttaaaagcaacaagagtcAGGTCA---TT-------A----G--TGTA-TT--------------------------------------------TTT--------TATTT--------------T----GTTGGTCTA-TT--T--GT-----GT---AT--------------A---AAT-CTTATCAATGCACGTAATGCATGTCCTTTTGTA--TAGGTTTTC--------TAATAC--AGTCTGTTA
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            agtgtttaggaatcggaggaaaattagaatcgattcacaatatgaaaataatcaaatattttttaaaagcaacaagagtcTTTCTTATTT------TCACATTATAAGCCAAACG-AAC-T-A---AAAAACAAACATTTTCTATTAT-GATCGATTAT-----TCAATTTCGT-CATCGATAAAACAATCGGTTGAGTATTTTCG-ATCAATAATTGATTAT-----
gi|16                         :                                                                                                       tgtaACTGAATATTCACCAAAAATTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGATTGAACA-GTTTT-ACA---CTT----------TTATCTAAGATTGTATAT---TTG----GTTG--AGAAGGCATT-------A----G--TTA-cggcacttatgtatacatatat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttccatgcaagatacaaacaatggATTAT-AGTCGAT-AT-----CCAATTTCAT-CATCTATAGTAGAACTGAATAAGTAATTTCG-ATCAATTATCGATTAT-----TATCGAA-----T-ATCGGCACATCACT
gi|2                          :                                                                                                                  ATTCATCGGAAATTCATTTTTTTTTATATTGCTAGTT--ATCATATTTTCAAA---CTT----------T-----AAGACTGTGTAAC--TCT----GTTT--A-AAGTCATT-------A----G--TTA-TTTA----------G----------------------------------------------ACTGGTCTATT--T--ATGCATGAGTTTAC----------TTTAA-AGTCTAATTTATGCTCAAAATTTATGTTTTTTATAATGGTT--------ATTCTA-------ATAT--AGTC---TTTAT-TTATACTCAGTGTTC--ATGTCCTTTATTATAG--TTC-TCCAATAGAGGCTGTTAGTAATGCCACTAACTATGTTTCCTATTA------TCACGTTATAAGCCAAATC-AAG-T-T---CAAA-CGA-TAATTTCAGTTAT-AATCGCTTAT-----TCAATTTCAT-AATCGGTAGTAGAATCGGATGGGTATTTTCG-ATCAAGTATCGATTAT-----AATtcaagt
gi|3                          :           tcaattaactagtactacaaccagtcgctgtaccatattacaatgcagaacttaataataaaaagtatgccttacacagttgcaatgcttatatACACTTG-CATTCATCACAAATTCATCAGTTTG-ATACTGTTAGTTTAATCA-GTTTT-AAA---CTT----------TGATCTAAGACTGTAATA---TTG----GTTG--AGAGGTCATT-------A----G--TTA-TTCA----------G--GCTCAA-------------TTTT-T---------A-TTTT----GTTGGTCTATT--T--AT-----AG---AC----------TTTGA-AGTCTTATCTATGCACATAATTGATGTTGTTTATTACAGTT--------ATTCTA-------ATAC--AGTC---TTTAT-TTATGCTTAAAAGTC--ATCACCTTCATTATAG--TTCTTCTTACACAGTCTGTCAGTAAT-------ACTAGATTTCCTATTA------TCATATTACAAGTCAAATT-AAC-TAA---AAAA-CAA-CATTTTCAATTAT-AATCGATTAT-----TCAATTTCAG-AATCGATAATCAAATTAGATGAGTATTTTCT-GTAAGTTATCTATTTT-----AATCAATTACGGTAATCAATACATCACTAC
gi|4                          :                                                                                                                                                        ctttgtatataacacactatg----------TGATCTGAGAGTGTATAC---TCT----GTTG--ATAAGTTATT-------A----G--TTA-TTTA----------C--CCTCAC-------------TTTT-T---------A-TTTTTTACATTG--CTATTGATGGAT-----AG---AC----------TTTAA-AATCTTACTTGTGCTGAAAATTCATGTTATTTTTTATACTTATTCTTACATTCTA-------ATAC--AATC---TCTAT-TTATGCTCAAAATTC--ATGTTCTTGATTCCAGTATTGTTCAAAAACAGTCTGGTAGT-AT--------------------------------CATTACAAGACAAATG-GACTT-A---AAAA-TAA-CGTTTTCGATTTT-AATCCATTAG-----ACAATTTCAT-CACCAATAGTAGAATGGGATGAATAGTTT-G-ATCAGTTATCGATTATAATCGAATCGAT-----TAATCGGAACA
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gi|6                          :                                                                                                                                                aaaaaaacatttaacatgtcagccagtaacaggtcattagtgTCTAAGATTGTATAAAAATCA----GTTG--ATAAGTCGTT-------A----A--TTG-TTTA----------G--GCTCA--------------CATTAT---------A-TTTT----GCTGATCTATT--T--ATGC---AT---ACATGTATATAGTTCAA-AAT-TTGTTTATGCTCAAAATTCATGTTATTTATTTTAGTT--------ATTCTA-------ATACAAAGTC---TTTAT-TACTGCTCAAAATTC--ATGTTATTTcggacactacactgaagtaaacatgaagtcacctattaagaccc
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gi|8                          :                                                  atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattgATACTGA-CATTCATCACAATTTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGTTTGAACA-GTTTT-ACA---ATT----------TGATCTAAGATTGTATAA---TTG----GTTG--AGAAGTCATT-------A----G--Tgaagaaagttaaaaatactgacattcatcacaatttcatcagtttgatacttctagtttgaacagttttacaatttgatctaagattgtataattggttgagaagtcattagt
gi|9                          : atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattggatgtatgaaattgattcaaataatcgattataatcgaaaacaattttttcaatgaagaaagttaaaaAATTCATCA-TTTA-ATATTTTTAA----ACCA----TC-AAAACCCTCCGTGATCGAATGATCTAGTGTTGTAT-A---TTGATGTGTTG--ATAAGTCATT-------A----G--T-A-TTTATTAGTTATATG--TCTCA--------------CTTT-TCATTCTTATA-TTTT----GCTGGTCTATT--C--AT-----
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-3835 )     :                                                                                    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATACTGG-CATTCATCACAAATTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGTTTGANCA-GTTTT-AAA--CTT-----------TGATCTAAGATTGTATA---A---TCGGTTGATA--AGTCATT-------A----G--TTA-TTTA----------G--GCTCA--------------CTTT---------T-A-TTTT----GCTGGTCTATT--T--AT-----AG---AC----------TTTAA-AGTCTTATTTATGCTCAAAATTCATGTTNTTTATTATAGTT--------ATTCTA-------ATAC--AGTC---TTTAT-TTATGCTCAAAATTC--ATGTCCTTTATTATAG--TTCTTCTAANACAGTCTGTTAGTAAT-------ACTAGGTTTCCTATTA------TCACATTACAAGCCAAATG-AAC-T-A---AAAA-CAA-CATTTTCGATTAT-AATCGATTAT-----TCAATTTCAT-CATCGATAGTAGAATCGGATGAGTATTTTCG-ATCAGTTATCGATTAT-----AATCGAT-----TAATCGGTACATCACTAC
gi|1                          :                                                                                                         ATGCTGG-CATCAATCACAAATTCATCAGTTTG-ATACTT--------------------------------------TGATCTAAGATTGTATA---A---TTTGT-GCTAGAAGTCATT-------AATTAG--TTA-TTTA----------G--GGTCA--------------CTTT---------T-A-TTTT----GTTGTTCTATT--T--AT-----AG---AC----------TTTAA-AGTCTTATCTATGCGCATACTTCATGTTGTTTATTATAGTT--------ATTCTA-------ATAC--AGTA---TTTAT-TTACGCTTAAAGTTC--ATGGCCTTTATTAT----TT------AGATA---TTTTAATATT-------ACTAG-----------------TCA-ATTA-AAG-TAAAT--------------AA-CAA-CACTTTCGA-TATAAATCAATTAT-----TTAATTTAAC-AATCGATAATTGAATCATATGAGTATTTTTG-ATTAGTTAGGGATTTT-----AATCGAT-----TAATCGTTACAGCAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatatgaaaatcgattattggatataatcgaatgtatgaaatcaattaataatcaattataacaggaaataaaattttacgatggagatctttattaaaaatgttaaaCTAGATTTATTTTTA------TCACATTATAAACCAAATGAAAT-T-AAAGAAAA-AAA-TATTTT-GATTAT-ATTTAGTTAT-----CCAATTTCAT-CATCGA---TAGAATTGGACAAGCAATTTCG-TTCAGTTATCGATTAT-----AATTGAT-----T-ATTGGCACATCACTacacagaaggatgatggttcatgtatcaagatc
gi|11                         :                                                                                                                                                                           t-----------TGATCTAAGATTGTACA---A---TCAGTCTATA--AGTCATT-------A----G--TT--TTTATT--------A--GCTTGT-------------CTTT---------T-tctattaacacatgatacatatttattttattctctttcgttt
gi|12                         :                                                              gtgtttaggaatcagatgaaaaattagaatcaattatcaaatagaactgataaggaccattcgatccataatcagaaaataattgaagattgattaaaaacaaccattgtcctccgtgtctaagTCTATGATTGTATA---A---TCGGTTGATA--TGTTTTA-------A----G--CTA-TTTA----------G--GCTCACTTTAGATTTTCGTCTTT---------T-A-TTTT----GCTGGTCTATt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtgtttaggaatcggaggaaaattagaatcgattcacaatatgaaaataatcaaatattttttaaaagcaacaagagtcTTTCTTATTT------TCACATTATAAGCCAAACG-AAC-T-A---AAAAACAAACATTTTCTATTAT-GATCGATTAT-----TCAATTTCGT-CATCGATAAAACAATCGGTTGAGTATTTTCG-ATCAATAATTGATTAT-----
gi|16                         :                                                                                                       tgtaACTGAATATTCACCAAAAATTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGATTGAACA-GTTTT-ACA--CTT-----------TTATCTAAGATTGTATA---T---TTGGTTGAGA--AGGCATT-------A----G--TTA-cggcacttatgtatacatatat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttccatgcaagatacaaacaatggATTAT-AGTCGAT-AT-----CCAATTTCAT-CATCTATAGTAGAACTGAATAAGTAATTTCG-ATCAATTATCGATTAT-----TATCGAA-----T-ATCGGCACATCACT
gi|2                          :                                                                                                                  ATTCATCGGAAATTCATTTTTTTTTATATTGCTAGTT--ATCATATTTTCAAA--CTT-----------T-----AAGACTGTGTA---AC--TCTGTTTA-A--AGTCATT-------A----G--TTA-TTTA----------G--ACT--------------------------------------------GGTCTATT--T--ATGCATGAGTTTAC----------TTTAA-AGTCTAATTTATGCTCAAAATTTATGTTTTTTATAATGGTT--------ATTCTA-------ATAT--AGTC---TTTAT-TTATACTCAGTGTTC--ATGTCCTTTATTATAG--TTCTCC-AATAGAGGCTGTTAGTAATGCCACTAACTATGTTTCCTATTA------TCACGTTATAAGCCAAATC-AAG-T-T---CAAA-CGA-TAATTTCAGTTAT-AATCGCTTAT-----TCAATTTCAT-AATCGGTAGTAGAATCGGATGGGTATTTTCG-ATCAAGTATCGATTAT-----AATtcaagt
gi|3                          :           tcaattaactagtactacaaccagtcgctgtaccatattacaatgcagaacttaataataaaaagtatgccttacacagttgcaatgcttatatACACTTG-CATTCATCACAAATTCATCAGTTTG-ATACTGTTAGTTTAATCA-GTTTT-AAA--CTT-----------TGATCTAAGACTGTAAT---A---TTGGTTGAGA--GGTCATT-------A----G--TTA-TTCA----------G--GCTCAA-------------TTTT---------T-A-TTTT----GTTGGTCTATT--T--AT-----AG---AC----------TTTGA-AGTCTTATCTATGCACATAATTGATGTTGTTTATTACAGTT--------ATTCTA-------ATAC--AGTC---TTTAT-TTATGCTTAAAAGTC--ATCACCTTCATTATAG--TTCTTCTTACACAGTCTGTCAGTAAT-------ACTAGATTTCCTATTA------TCATATTACAAGTCAAATT-AAC-TAA---AAAA-CAA-CATTTTCAATTAT-AATCGATTAT-----TCAATTTCAG-AATCGATAATCAAATTAGATGAGTATTTTCT-GTAAGTTATCTATTTT-----AATCAATTACGGTAATCAATACATCACTAC
gi|4                          :                                                                                                                                                       ctttgtatataacacactatg-----------TGATCTGAGAGTGTATA---C---TCTGTTGATA--AGTTATT-------A----G--TTA-TTTA----------C--CCTCA--------------CTTT---------TTA-TTTTTTACATTG--CTATTGATGGAT-----AG---AC----------TTTAA-AATCTTACTTGTGCTGAAAATTCATGTTATTTTTTATACTTATTCTTACATTCTA-------ATAC--AATC---TCTAT-TTATGCTCAAAATTC--ATGTTCTTGATTCCAGTATTGTTCAAAAACAGTCTGGTAGT-AT--------------------------------CATTACAAGACAAATG-GACTT-A---AAAA-TAA-CGTTTTCGATTTT-AATCCATTAG-----ACAATTTCAT-CACCAATAGTAGAATGGGATGAATAGTTT-G-ATCAGTTATCGATTATAATCGAATCGAT-----TAATCGGAACA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccgcggcagagTATTTTTTATTTT-GTT--------GGTCTATTTGTGTATA---AATC---TT-AT-CAATGCACGTAATGC--ATGTCCTTTTGTATAG--GTTTTCTAATACAGTCTGTTAG-AAT-------ACTAGGTTTTCTATTACATGTATCACATTACAA-CCAAAAG-AAC-TGA---AAAA-CAA-CATTTTCGATTAT-GGTCGATTAT-----TCAATTTCAC-AATTGATAATCGAATCGGAAGAGTATTTTTATATCAATTATCGACTAT-----AATCAAT-----TAATCGCTACATCACTACactttagttgtacctatggatgtcattata
gi|6                          :                                                                                                                                                aaaaaaacatttaacatgtcagccagtaacaggtcattagtgTCTAAGATTGTATA---AAAATCAGTTGATA--AGTCGTT-------A----A--TTG-TTTA----------G--GCTCA--------------CATTA--------T-A-TTTT----GCTGATCTATT--T--ATGC---AT---ACATGTATATAGTTCAA-AAT-TTGTTTATGCTCAAAATTCATGTTATTTATTTTAGTT--------ATTCTA-------ATACAAAGTC---TTTAT-TACTGCTCAAAATTC--ATGTTATTTcggacactacactgaagtaaacatgaagtcacctattaagaccc
gi|7                          :                                                                  agtggttaggaattggaggaaaattataattgattatcaaatcaaatcagcatggacctttcattacacaattggaatgtaattgaagatattttaaagacaacaagggtcctccgtggtcaagtgaccGTATA---A---CTGGTTGATA--AGTTGTTTGAATTTA----GACTTACTTTG----------GATGTTCA--------------ATTT---------T-AACTTT----ACTGGTCTATT--TT-AT-----AT---A------------TGAACAGTCTT--TGATGCTCAAAATTCATG---TTTATTACAGGT---------TTCTA-------AT----AGTCTTTTTTATGTTATGCCCTAAATTCCAATATTTTTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaatttggaatcgattcacatccggaaaataatggaagagtttctacaaaaaagctaaggccttccaaggccgaAT-T-G---AAAA-AAT-TGTTTTCGATTAT-AATCGATTATTTGAATCAATTTCATACATC
gi|8                          :                                                  atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattgATACTGA-CATTCATCACAATTTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGTTTGAACA-GTTTT-ACA--ATT-----------TGATCTAAGATTGTATA---A---TTGGTTGAGA--AGTCATT-------A----G--Tgaagaaagttaaaaatactgacattcatcacaatttcatcagtttgatacttctagtttgaacagttttacaatttgatctaagattgtataattggttgagaagtcattagt
gi|9                          : atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattggatgtatgaaattgattcaaataatcgattataatcgaaaacaattttttcaatgaagaaagttaaaaAATTCATCA-TTTA-ATATTTTTA----AACCA----TC-AAAACCCTCCGTGATCGAATGATCTAGTGTTGTATATTGA---TGTGTTGATA--AGTCATT-------A----G---TA-TTTATTAGTTATATG--TCTCA--------------CTTTTCATTCTTAT-A-TTTT----GCTGGTCTATT--C--AT-----
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): TATGATTATAATTAGTGAGGGCTATCAGAAATATTTGGAAATTGATTATATGATATAATCAGATGTATGAAATCTTTTAATAATCGATTATAATTAGAAAAATAGAAATTAAAATTTTACAATGAAGAGT
Unaligned ( gi|17 ): TAATGTTTAGGAATCGGAGTGAAATAAGAATCGATTATCGAATCGAATCGAATCGATAGGAAGCATTCGATTCATAATCAGATCGGAAAATAATTGAAGATCTTCTTAAAATAAA
Unaligned ( gi|19 ): AGTGGTGGTGAAATGGGAATATTTCAAAATCGAATATCGGATATACATGTAATCGGATGTTTGAAATTGGTTAATAACCGATTATAATAGGAATTT
Unaligned ( gi|20 ): TAAATTATAATTTGTGATGGGCAACGGAAACATCTGGAAATAGATGAGTGGATATGATTGGATGCATGAAATCAATTATTATATTTGGAAAC






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gi|7                          :                                                                  agtggttaggaattggaggaaaattataattgattatcaaatcaaatcagcatggacctttcattacacaattggaatgtaattgaagatattttaaagacaacaagggtcctccgtggtcaagtgaccGTATA---A---CTGGTTGATA--AGTTGTTTGAATTTA----GACTTACTTTG----------GATGTTCA--------------ATTT---------T-AACTTT----ACTGGTCTATT--TT-AT-----AT---A------------TGAACAGTCTT--TGATGCTCAAAATTCATG---TTTATTACAGGT---------TTCTA-------AT----AGTCTTTTTTATGTTATGCCCTAAATTCCAATATTTTTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaatttggaatcgattcacatccggaaaataatggaagagtttctacaaaaaagctaaggccttccaaggccgaAT-T-G---AAAA-AAT-TGTTTTCGATTAT-AATCGATTATTTGAATCAATTTCATACATC
gi|8                          :                                                  atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattgATACTGA-CATTCATCACAATTTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGTTTGAACA-GTTTT-ACA--ATT-----------TGATCTAAGATTGTATA---A---TTGGTTGAGA--AGTCATT-------A----G--Tgaagaaagttaaaaatactgacattcatcacaatttcatcagtttgatacttctagtttgaacagttttacaatttgatctaagattgtataattggttgagaagtcattagt
gi|9                          : atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattggatgtatgaaattgattcaaataatcgattataatcgaaaacaattttttcaatgaagaaagttaaaaAATTCATCA-TTTA-ATATTTTTA----AACCA----TC-AAAACCCTCCGTGATCGAATGATCTAGTGTTGTATATTGA---TGTGTTGATA--AGTCATT-------A----G---TA-TTTATTAGTTATATG--TCTCA--------------CTTTTCATTCTTAT-A-TTTT----GCTGGTCTATT--C--AT-----


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blockSeqs                     :                                                                                                                .                    T    .      C  GATTGAACAGTTTTACACTT                                TTGA     G     T .        .       .    .    .    GGCTCACTTTAGATTTTCGTCTTT                      . .    .       G      TT     GCATGAGTTTAC               .      A                     G            A             .         T      .       .               .                 .   C   AA C            TA  ACTAGGTTTTCTATTACATGTA               T   C     G   T  AA       .   .             .          .              C        G                      .                .           .     A    GC
blockSeqs                     :                                                                                                                .                    G    .      T  GTTATCATATTTTCAAACTT                                AC       G     G .        .       .    .    .    TTAGCTTGTCTTT                                 . .    .       G      T      AGAC                       .      A                     A            A             .         C      .       .               .                 .   G   TA A            T   ACTAGATTTCCTATTA                     T   C     C   C  GA       .   .             .          .              C        G                      .                .           .     A    AT
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gi|11                         :                                                                                                                                                             tTGATCTAAGATTGTACA---A---TCAGTCTATA--AGTCATT-------A----G--TT--TTTATT--------A--GCTTGTC-------------TTT--------Ttctattaacacatgatacatatttattttattctctttcgttt
gi|12                         :                                     gtgtttaggaatcagatgaaaaattagaatcaattatcaaatagaactgataaggaccattcgatccataatcagaaaataattgaagattgattaaaaacaaccattgtcctccgtgtctaagTCTATGATTGTATA---A---TCGGTTGATA--TGTTTTA-------A----G--CTA-TTTA----------G--GCTCACTTTAGATTTTCGTCTTT--------TATTTT----GCTGGTCTATt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agtgtttaggaatcggaggaaaattagaatcgattcacaatatgaaaataatcaaatattttttaaaagcaacaagagtc-TTTCTTATTT------TCACATTATAAGCCAAACG-AAC-T-A---AAAAACAAACATTTTCTATTAT-GATCGATTAT-----TCAATTTCGT-CATCGATAAAACAATCGGTTGAGTATTTTCG-ATCAATAATTGATTAT-----
gi|16                         :                                                                                             tgtaACTGAATATTCACCAAAAATTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGATTGAACAGTTTTACACTTTTATCTAAGATTGTATA---T---TTGGTTGAGA--AGGCATT-------A----G--TTA-cggcacttatgtatacatatat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttccatgcaagatacaaacaatggATTAT-AGTCGAT-AT-----CCAATTTCAT-CATCTATAGTAGAACTGAATAAGTAATTTCG-ATCAATTATCGATTAT-----TATCGAA-----T-ATCGGCACATCACT
gi|2                          :                                                                                                        ATTCATCGGAAATTCATTTTTTTTTATATTGCTAGTTATCATATTTTCAAACTTT-----AAGACTGTGTA---AC--TCTGTTTA-A--AGTCATT-------A----G--TTA-TTTA----------G-------------------------------------------ACTGGTCTATT--T--ATGCATGAGTTTAC----------TTTAA-AGTCTAATTTATGCTCAAAATTTATGTTTTTTATAATGGTT--------ATTCTA-------ATAT--AGTC---TTTAT-TTATACTCAGTGTTC--ATGTCCTTTATTATAG--TTC-TCCAATAGAGGCTGTTAGTAATGCCACTAACTATG-TTTCCTATTA------TCACGTTATAAGCCAAATC-AAG-T-T---CAAA-CGA-TAATTTCAGTTAT-AATCGCTTAT-----TCAATTTCAT-AATCGGTAGTAGAATCGGATGGGTATTTTCG-ATCAAGTATCGATTAT-----AATtcaagt
gi|3                          : tcaattaactagtactacaaccagtcgctgtaccatattacaatgcagaacttaataataaaaagtatgccttacacagttgcaatgcttatatACACTTG-CATTCATCACAAATTCATCAGTTTG-ATACTGTTAGTTTAATCAGTTTTAAACTTTGATCTAAGACTGTAAT---A---TTGGTTGAGA--GGTCATT-------A----G--TTA-TTCA----------G--GCTCAAT-------------TTT--------TATTTT----GTTGGTCTATT--T--AT-----AG---AC----------TTTGA-AGTCTTATCTATGCACATAATTGATGTTGTTTATTACAGTT--------ATTCTA-------ATAC--AGTC---TTTAT-TTATGCTTAAAAGTC--ATCACCTTCATTATAG--TTCTTCTTACACAGTCTGTCAGTAAT---ACTA-----GATTTCCTATTA------TCATATTACAAGTCAAATT-AAC-TAA---AAAA-CAA-CATTTTCAATTAT-AATCGATTAT-----TCAATTTCAG-AATCGATAATCAAATTAGATGAGTATTTTCT-GTAAGTTATCTATTTT-----AATCAATTACGGTAATCAATACATCACTAC
gi|4                          :                                                                                                                                         ctttgtatataacacactatgTGATCTGAGAGTGTATA---C---TCTGTTGATA--AGTTATT-------A----G--TTA-TTTA----------C--CCTCACT-------------TTT--------TATTTTTTACATTG--CTATTGATGGAT-----AG---AC----------TTTAA-AATCTTACTTGTGCTGAAAATTCATGTTATTTTTTATACTTATTCTTACATTCTA-------ATAC--AATC---TCTAT-TTATGCTCAAAATTC--ATGTTCTTGATTCCAGTATTGTTCAAAAACAGTCTGGTAGT-AT---------------------------------CATTACAAGACAAATG-GACTT-A---AAAA-TAA-CGTTTTCGATTTT-AATCCATTAG-----ACAATTTCAT-CACCAATAGTAGAATGGGATGAATAGTTT-G-ATCAGTTATCGATTATAATCGAATCGAT-----TAATCGGAACA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ccgcggcagagTATTTTTTATTTT-GTT--------GGTCTATTTGTGTATA---AATC---TT-AT-CAATGCACGTAATGC--ATGTCCTTTTGTATAG--GTTTTCTAATACAGTCTGTTAG-AAT---ACTA-----GGTTTTCTATTACATGTATCACATTACAA-CCAAAAG-AAC-TGA---AAAA-CAA-CATTTTCGATTAT-GGTCGATTAT-----TCAATTTCAC-AATTGATAATCGAATCGGAAGAGTATTTTTATATCAATTATCGACTAT-----AATCAAT-----TAATCGCTACATCACTACactttagttgtacctatggatgtcattata
gi|6                          :                                                                                                                       aaaaaaacatttaacatgtcagccagtaacaggtcattagtgTCTAAGATTGTATA---AAAATCAGTTGATA--AGTCGTT-------A----A--TTG-TTTA----------G--GCTCACA-------------TTA--------TATTTT----GCTGATCTATT--T--ATGC---AT---ACATGTATATAGTTCAA-AAT-TTGTTTATGCTCAAAATTCATGTTATTTATTTTAGTT--------ATTCTA-------ATACAAAGTC---TTTAT-TACTGCTCAAAATTC--ATGTTATTTcggacactacactgaagtaaacatgaagtcacctattaagaccc
gi|7                          :                                         agtggttaggaattggaggaaaattataattgattatcaaatcaaatcagcatggacctttcattacacaattggaatgtaattgaagatattttaaagacaacaagggtcctccgtggtcaagtgaccGTATA---A---CTGGTTGATA--AGTTGTTTGAATTTA----GACTTACTTTG----------GATGTTCAAT-------------TTT--------AACTTT----ACTGGTCTATT--TT-AT-----AT---A------------TGAACAGTCTT--TGATGCTCAAAATTCATG---TTTATTACAGGT---------TTCTA-------AT----AGTCTTTTTTATGTTATGCCCTAAATTCCAATATTTTTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaatttggaatcgattcacatccggaaaataatggaagagtttctacaaaaaagctaaggccttccaaggccgaAT-T-G---AAAA-AAT-TGTTTTCGATTAT-AATCGATTATTTGAATCAATTTCATACATC
gi|8                          :                                        atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattgATACTGA-CATTCATCACAATTTCATCAGTTTG-ATACTTCTAGTTTGAACAGTTTTACAATTTGATCTAAGATTGTATA---A---TTGGTTGAGA--AGTCATT-------A----G--Tgaagaaagttaaaaatactgacattcatcacaatttcatcagtttgatacttctagtttgaacagttttacaatttgatctaagattgtataattggttgagaagtcattagt
gi|9                          :                                   atcattagtgatgggcattcggagatatttggaaatcgattatctgataaaattggatgtatgaaattgattcaaataatcgattataatcgaaaacaattttttcaatgaagaaagttaaaaTGATCTAGTGTTGTATATTGA---TGTGTTGATA--AGTCATT-------A----G--T-A-TTTATTAGTTATATG--TCTCACT-------------TTTCATTCTTATATTTT----GCTGGTCTATT--C--AT-----
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): AGTGCTAAGGAATAGAAGGGAAATTATAAGAATCGATTATCAACTGTGCAAGGACCTTTTGATTCACAATCGGAAAATTATTGAAGATATTTTAAAGGTCAACAAGGATTCTCCATGGCTGAATGATCTAAGATAGTATAAATA
Unaligned ( gi|15 ): TATGATTATAATTAGTGAGGGCTATCAGAAATATTTGGAAATTGATTATATGATATAATCAGATGTATGAAATCTTTTAATAATCGATTATAATTAGAAAAATAGAAATTAAAATTTTACAATGAAGAGT
Unaligned ( gi|17 ): TAATGTTTAGGAATCGGAGTGAAATAAGAATCGATTATCGAATCGAATCGAATCGATAGGAAGCATTCGATTCATAATCAGATCGGAAAATAATTGAAGATCTTCTTAAAATAAA
Unaligned ( gi|19 ): AGTGGTGGTGAAATGGGAATATTTCAAAATCGAATATCGGATATACATGTAATCGGATGTTTGAAATTGGTTAATAACCGATTATAATAGGAATTT
Unaligned ( gi|20 ): TAAATTATAATTTGTGATGGGCAACGGAAACATCTGGAAATAGATGAGTGGATATGATTGGATGCATGAAATCAATTATTATATTTGGAAAC