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Reference ( family-3801 ) : TCCTTCAGCACCAAA-GGTTTCA----TCCTGTCTGGGCCAGCAGCTTTGTTNGGGTCGAGGTCNCC-TAACAGCTTNAGG-ATCCCGTTAG---TG-GAT--ATG--T--ATGTCAGGCAT----GGTGATATTGTTAC------CTGGTTTTGTTGCTATGCCATCACTATTCA-----TT----GGG----TTTCNAGCTGAAAACACTGACTGGAACTGGCTGTTTAGTATATTTGCCTT-GTC-G-TGGTGTCTG-GTTACCAACTTACC-CTTCAGACTGTAGTGGC--GAGGTACCTTCGCTGTCTT-TCCT-A-GCGCTCTTTAGGTAGGTAAGAA--GA--C---GCTTA--GTGTTTACCTTTTTATTCTCAGNGTCTTCAGTGGTAT--TCATAC-C-C-AG-TAATGTCCTCAAAGTA--CTNACTN--TATGCT--ANTTGTATNTTG-----CTT-CTGGCG----ACGTGCCT--CCATCT-GATGTGTTNACTTCTG---GT-TC----TGGGGC-A-TTTGGT--ATGCTTG----A----AACGGCCGTAGAGTTTGTTTCTCTTTCTTATNGAGCGTCTNATGTCCTGTGNTATCCAAGGGAGTGATNNCCTACCTCTTATGGTAATTTGGATGGGACACACTCAG--AT-TGGAATTTNTCCA-GGTGTTCTGTAAACTCATCCCATAGGTCTTGTACCGACTTGCCNTGACAAC-TTNGT--A--------GGAACATA-TC-CCT--AAAGGTTCCCATCTTACTTCTGAANAGCTCCCAGTTTGCCTTCCTGTACATGTATACCTGATG-GGG--TTTGATCTTCATCAGTCTTGGT-TTAAG--GTT--AGCCTC-----------AACGCTTACAATGTCATGGTCACTAANACCAGGTAAAATGGAGACAT--TCT-CAACC----AGTGTTTCATTCGTTGTGAGAAAAAGATCAAGGACGTTGTCGAAGCGAGTAGGTTCTTTGACTACTTGTANGAGGTTGAAATCATCGAGTATTTCTATGAAATTTTCATACTGACCT--CTATGTTGGCACGATGGCAGTA---AAG-----TAGGTGTGTCTGGTTTCC--AGTCTATTTTGGGTAGGTTCATGTCACCTATTAATA------ATATGGT--ACCAGGATGCTCGCTTACCTTCTCGAGAGATTTCCGAAGTTCAAGGAGGCTACGTTCATCACGTTCATGAGGTCGATAGTANGCGCCTATGTGGNGTGGCTNGGNCCCNGCTACCTNCAGCTTNGTCCATATNATCTCACAATCGCTTTTAAATTGTGGTTCTTGGGAGCATATAAGTGTGTTACTCACCATG----ATGAANACACCACCGCTGCGCTT--CTGTGTAC--CCTTTCGGTCCTCTC--TGAANAGCTTGAAGCCATTTGGNAGAAACTCTGATGAGCATA-----TAT--CAGGGGAGAGCCATGTCTCNGTCCCGATAACAACGTCTGGTTTTTCATG-GTCGACCAGTGTNTGAAATTCNCCAATTTTATTCATAATAGAGCGGAGGTTTATATTAAGTAATTTCAACTTACGTGG-----------TTTGTTTTCTG--NACGTTTTCTATTTGT---N-TTTT-TTGGTGTTGAAGTTAAG-GTAA---ATCCA-GCATCTGATACATCCAGAGCGCTGTAAATAT-TTGGGTCAGATAGGAGAGACATTGAATTACTTGNATCAAAAAAGCTTGAATTAAAATTCGGCAACCCACAATTAAGACACGGCCATGAATA--TGAATTGTGTTC--TATGTGTAC-TGGTAGTTTGCCTGATT---NATNCCAGTGCATACTCGGTGGAACCATGTGTCACACGAGTCGCACTGGATGGCTTCCC--GT-TTCCGTCCGACAGCTTTACCGCAGTGGCCACA--------TNGAT--------GGTCTTGGNCCGGGGTTNATTTGNACGTCATGGGATAGGGTCGCCAGTAATAAACTCAAGTA--TANATTGCTTC--TGTTCGTAC--------CTTTACGGCTGGGC-GTATGTACCATTTAGAGAGTTTGAACAACGTTTGCTTGTGCATGGACTCGGGGCCNGTTGNGAGCGATGTAAACACGGTGCTTNGGGAATCNNGATGTTGGCCACTANTCNCTGTAGTACACTGGTACCATGGTGGCTTGAATGTGTGNACAACNNAANTNAGCNAAACTATGCC-AAAAAACAGACATGGGANCATCCTTTGTGACAGAACAAACATGGCTGACATAAAGTAAACAAAGAATTCCGTCAAANACGGCGGGTGTGTGATGTCACAACCCAGTACTTGATCTATCG--AAAATCAATTAGATTGAGACTCAAACTTCCTAAAAATGTATNGAGANNANCTCCAGCACTGAACNCAGTGTTCATAGACAAACCAGTATACNAATATGATACACA-ATAAGCACGCTGATGTTTTTGTTTTTCGAAGATTTCAAGACGAGCTCAGTGAGTCTGAAGTAGCGAAATCGACGC
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gi|20 : ttctcgtagttcttgtagaacaagaggttttatcttgtcatgtccagcggctttgtttgggttctggtcctttaacagtttacgaatacctggggttgagatgttaatgtctgacatgatagaggggctgtgggtctcaccgctagtgggaaatagagggcgtgatcttggatacttatctggcatagctgtttgaggtttagagGACAAACC--TATACTAATATGATACACA-ATAAGCACGCTGATATTTTTGTTTTTCGAAGATTTCAAGACGAGCTCAGTGAGTCTGAAGTAGCGAAATCGACGC
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gi|22 : gctcatccaaaccgctGCCT--CCATTT-GAGGTGTATACTTCTA---GA-TA----TGGTGC-A-TTAGGT--TTGC-------A----TACAG-CATAGATCCTGTTGCGCTT
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gi|4 : taagattggtgcaatctccaatcttaatTTTCTTATTGCCTGCCTTATGTCCTATGTGATCCAGGGTAGCGATTTCTTACCTCTTA--GTAACTTGGATGGCACACATTCAG----AT-TGGAATTTGTCTA-AGTGTTCTGTAAACTGTTTTCAGAGGTCTTGTACCGACTTACCATGACAAC-TTAGT--------AAGAACGTA-TC-CCT--AAAGGTTCTCATCTTATTTCTAAAGAGCTCCCAGTTTGCCTTTCTGTACATGTATACCTGATG-GGG--TTTGATCTTCATCAGTCTTGGT-TTAAG--GTT--AGCCTC-----------AAAACTTACAATGTCATGGTCACTAAGACCAGGTAAAATGGAGTCTT--TCT-TAACC----AGTGTTTCATTCGTTGTGAAGAAAAGATCAAAGACGTTGTCGAAGCGAGTAGGTTCTTTGAC--TACTTGTATAA-GGTTAAAATCATTGAGTATTTCTATG---AAATTTTCATACTGACCT--CTATGTTGGCACGATGGCAGTA---AAG-----TAGGTGTGTCTGGTTTCC--AGTCTATTTTAGGTAGGTTCAAGTCACCTATTAATACCGGTAATATGGT--ACCAGGATGCTCGCTTACCTTCTCGAGAGATTTCCGAAGTTCAAGGAGGCTATGTTCATCACATTCATGAGGTTGATAATATGCACCTATGTAGTGTGGCTGGGTTCCAGTTACCTGCAGCTTAGTCCATATTATCTCACAATCACTTTTAAATTGTGGTTCTTAGGAGCATATAAGTGTG-------------------AATACACCACTGCTGCGCTT--CTGTGTAC--CTTTTCAGTCCTCTC--TGAAAAGCTTGAAGCCATTTGGAAGAAACTCTGATGAGCATA-----TAT--CAGGGGAGAGCCATGTCTCTGTCACGATAACAACATTTGGTTTTTCAAG-GTCGACCAGTGTATGAAATTCCCCAATTTTATTCATAATAGAGCGGAGGTTTATATCAAGTAATTTCAACTTACGTTG------TTTGTTTTTTGAACGTTTTCTATTT--GTC-T------TTT--TTGGTGTTGAAGTTAAG-GTAA---ATTCA-GCATCTGATACATCCAGAGTGCTGTAAATAT-TTGGGTCAGATAGGAGAGACATTAAATTACTTGTATCAAAAAAGCTTGAATTAAAATTCAGCAACCCACAATTAAGACATGGCCATGAATA--TGAATTGTGTTC--TATGTGTACTTGGTAGTTTGCCTGATT---CATCCCAGTGCATACTCGGTGGAACCATGTGTAACAGGAGTCGCACTGGATGGCTTCCT--GT-TTCCACCCAACAGCTTTACCACAGTGGCCGCACGGGTATTTTGGT--------GGTCTGGGACCGGGGTTAATTTGTACATCATGGGACAAGGTCACCAGTAATAAACTAAAGTA--TAAATTGTTTC--TATT--CATAC--------CTTTACGGCTAGGCAGTATGTACCATTTAGAGAGTTTAAACAATGTTTGTTTGTGCATGGACTTGGGGCCAGTTGTAAATGATGTAAACATGATGTTTGGGGAATCATGATGTTGGCCACTACTCTCTGTAGTACACTGATACCATGGTGGCTTAAATGTGTGTACAACAGAACTAAGCAAAACTATGCC-AAAAAACAGACATGGAACCATCCTTTGTGACAG----AACATGGTTGACATAAAGTAAACAAAGAATTCCGTCAAATATGGCGGGTGTGTG
gi|5 : gtTTCTTGGGAGCATATAAGGGTATTTCTCACCATGCTTGATGAAGACCCCGCCGCTACGCTT--TTGGTTCC--CCTTTTAGACCTTTT--TGAATAGATTGAAGCCATTTGGTAGAAACGTTGATGAGCATAAATTATAT--AAGGGGAGAGCCATGTCTCAGTCCCAATAACAATGTCTGGGTTTTCATG-GTCAGCCAGTGTTTGAAATTCGTCAATTTTGTACATAATAGAGCGGAGGTTTATATTAAGTAATTTTAACCTACGTGG------TTTGTTCCCAAAACGTTTTCTGTTT--GTCAT------TTT--TTGGTATGGAAATTAAAAGAAA---ATCCATGC-TCAGATACATCCAGGGTG-TGTAAATAT-TTGGGTCAGATAGGAGAGACATTAAATTACTTGAATCAAAA-----TGCAT---AATATAGCAACCT-------------GGCCATGT-TA--GGAGTTGTGTTCCATATGTGTA--TGGTAGTTTGCCTGATC---AATGCCAGTGCATGGCCGTTGGAACCATGTGTCACACGAATCACACTGGATGGTTTCCT--GT-TTCCGTCCGACAGCGTTACCGCAGTGGT-ACT--------TTAAT--------GGTCTTGGGCCAGGGTTGATTTGCACATCAAAGGATT-GGCCACCAGTAATAATCTCAAGAA--TATATTGCTTC--TGTT--CATACATAAAAGGCTTTTCGACTGGGCCGTATATACAATTTAGAAAGCCTGAACAACGTTTGCTTGTACATGGACTCTGGGCCCGTTGGGAGCGATGTAAACACGGTGCTTTGGAAATCCAAATGTTAGCCACTAGTCACTGTAGTACACTGGTACCATGGTGGCTTGAATGTGTGAACAATCTAAGTT-GTTAAACTATGCC--AAAAATAGACATGGGAACATCTTTTGTGACAGAACAAACATGACTAA----AAGTAAACAAAGAATTCTGTCAAAAACGGCGGGTATGTGATGTCACAACCCAGTACTTGATCTATCG--AAAATCAATTAGATTGAGACTCAAACTTCCTAAAAATGTATAGAAAATATTTCCAGCACTGAACACAGTGTTCATAGGCAGATCAGTAC-CAAAAAT-ATACACATTTAAGCACTTTGATGt
gi|6 : gcTCCTTCAGTACCAAA-GGTTTCATCCTGTCTGGGCCAGCAGCTTTGGTGGGGTCGAGAGT-GAATAATAGCTTCAGG-AT-TTCACTAG---TG-GAT--ATG--T----GTCAGGCAT----GGTGATATTGTTAC------CTGGTTTTGTTGCTATGTCATCACTATTCA--C--T----------GGG---TTTATAGCTGAAAACACTGACTGAAACTGTCTATTTAGTATGTATGCTTTGTCAATGGTGTCTGAGTGA--AGCTTGTC-TT-CAGATTGTAGTGGTGCGACGCCCTCACTGTCCT-TCCT-A-GCACTCTTTAGGTA-GGTAAAAA--GA---CGCTTA--GT----GTTTACCTTTTTATTTTCAGAGTCTTCAGTGGTATTCATAC-C-TAG-CAA-GTCCTCAAAATA--CTTACTTTATGG-CAGTTGTATTT-TGCTTCTG----ACAACATGCCTCCATCT-GATGTGTT---GACTACTGGT-TCTGGGGC-A-TGTAGTATGCTTGAAACG-GCCATAGAGCCCGTTACGTTTTCTTATTGCCCGCCTTTTGTCCTGTGTGATTCAGGGTAGCGACCTCTTACCTCTTA--GTAACTTGGATGGCATACATTCAG----AT-TGGAATTTGTCTA-AGTGTTCTGTAACCTCACTCCAGAGGGTTTGTACCGACTTACCATGACAAC-TTTAT--------AAGAATGTA-TC-CCT--AAAGGTCCCCATCTTATTTCTAAAGAGCTCCCAGTTTGCCTTTCTGTACATGTATACCTGATG-GGG--TTTGATCTTCATCAGTCTTGGT-TTACG--GTA--AGCCTT-----------AACACTTACAATGTCATGGTCACTAATACCAGGTAAAATGGAGACAT--TCT-CAACC----AGTGTTTCATTCGTTGTGAGAAAAAGATCAAGGACGTTGTCGAAGCGAGTAGGTTCTTTGAC--TACTTGTA
gi|7 : ttaagattggtgcaatctccagtcttaat-GGTTTTATCCTGTCAGGTCCAGCAGCTTTGTTTGGGTTCAGGTC-CTTTAACAG-TTAAGGAAT-ACCTGGAG---TT-GAG--ATG--TAAATGTCTGGCAT----GAT
gi|7 : ctcctagttcttgtagagcaagtTGCCATAGCTGTTTACGA--TTTTGA--G--GGGA--TTTTGGGGTGAAAACAAGG---GGAACTGGTTGTTTAGTATATTTACCTT---------TTCTG--TTACCAACTTACCGTTTCA--CTGTAG-GGGGAGGTACCTTGGTTATCTTGTCTT-AAGTGTT--TTAGGTA---TGAGAA-------CAATTA--TTTTTAATTTATTGTTCCATCCTCA---TTATCACC---ATC--TACTC-CAA-TAATGTCTTCAAGGTAGGCTT----CATGC-TTTTTTTATTT--GTT---GGCGTACTATGTACCTT-ACCTTGATGTATTTTTGTCTGTCAGT--ATGAAG--A-CTTGTTTTATTTTGG-CG-GCAGTAGAGTTTGTTTCTCTTTCTTATAAAGCGTCTGATATTCTGTGATATCCAAGGAAGTGATGCCCTACCTTTAATGGT--TTTGGATGGGACACACTCTG-CCAAG-TG---TTTCTCCATAGT-TGAGGTAAATTCGTCCCATAGATATAAGACTGTTTTGCCTTTGTAATGTTTG---------AGGAA-ATAGTC-TTT--GAAACATTCTATTTTACTTTTGAATAGCTCCAAGTTAGCTTTCCTGagtggggctgttggtcgcactgctagtggggaatagtggggcgtgatcttggatacttatctgccatagctgtttacgattttgaggggattttggggtgaaaacaaggggaactggttgtttagtatatttaccttttctgttaccaacttaccgtttcactgtagggggaggtaccttggttatcttgtcttaagtgttttaggtatgagaacaattatttttaatttattgttccatcctcattatcaccatctactccaataatgtcttcaaggtaggcttcatgctttttttatttgttggcgtactatgtaccttaccttgatgtatttttgtctgtcagtatgaagacttgttttattttggcggcagtagagtttgtttctctttcttataaagcgtctgatattctgtgatatccaaggaagtgatgccctacctttaatggttttggatgggacacactctgccaagtgtttctccatagttgaggtaaattcgtcccatagatataagactgttttgcctttgtaatgtttgaggaaatagtctttgaaacattctattttacttttgaatagctccaagttagctttcctg
gi|8 : ctcctagttcttgtagagcaagtggttttatcctgtcaggtccagcagctttgtttgggttcaggtcctttaacagttaaggaatacctggagttgagatgtaaatgtctggcatgatagtggggctgttggtcgcactgctagtggggaatagtggggcgtgatcttggatacttatcCAAATGGTTTTATCTTGTC-----CAGCAGCTTTGTTTGGGTTCAGGTC-CTTTAACAGTTTAAGA-AT---TAATAGGGTTGAGAT--ATA--A--ATGTCTGGCA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): TCGTAGTTCCAGGAGAACTAGAAGTTTAAATAGTCCTGTGTGGCCCGGCTTCCTTGTTTGGGTTAAGGTTTTTAAGGAATTGAAGTATACCTGTACATATGTCTATGTCTGCCATAAT
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