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gi|22 : ttATATATTAACTGTATATATACACAAAACACAATGTCATGTTGTAGTT-AACAAACATCTT--AACCG-A-TTTTAAAGGGACAATAATTATTTTCTTCATACGCCGTaaaatgtattaattgtatggtacccaaaattgatgaatgcatcgtatgttcatgtgtggttattggttgttgttatgttacatat
gi|23 : TGGCTA-TAT-AAATCCTTGGCTATATCAAGTTGAACAAAGCATGC--A--T---T---T----GTATA-ATACCTAAGCATGG-TTTGTTGAATTCGACAAGTCAAACCGTAAC--T--C--TTTGTTTCTT-----------TTttccctccaaacctcactgt
gi|25 : TTTGATCCA--GATATATACATGATCCTTTATTTAGTGTAT---------ATAAACTAATAGAATAAAATGCATACATAATTTGTCATGCACAta
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gi|29 : CAGGC--AT-TCTCAGATACTA-T-tcaggcattctcagatactatca
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gi|31 : CAGGC--AT-TCTCAGGTATCA-T-A-ACTTTGTG------T-----TTGG-A-CAGG----GC
gi|32 : gAGGC--AT-TCTCAGATACTA-TCA-C-TTTGTG------T-----TTGG-A-CAGG----
gi|4 : GACAGGC--ATATCTCAGATCGTA-T-A-C-TTTATAT-----T-----TTAG-A-CAGG----ACACACTAGCACACAGATGATAGCACATCTT------CAATATA-GTATA-A-TTTTGATATATTTAAAG-GCAATACGTCCAT---ATACAGC-AATTGTTTCGGTG----GTATATA-CA---TATCT--ATCTGAGAAGGCAT-ATAAA-A-ATA-------TA-TGATATTATA----------A---TA-ATTTGGCTA-TAT-AATTACTTGGCTATATTAAGTTGAACAAAGCACTC--A--TA------T----GTATA-ATACCTATGAATGG-TTTGTTCAACTCGACTATTCAAACCGTAAC--T--A--GTTGTT--TT-----------GTGTTTTTTCTT----TCATT-T--GTTTT--TTCA----TAG--TTA-TACCAAT---------ATATATGCGTGTCTTCAGCATCAACATTAc
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finalCons : GACAGGC--AT-TCTCAGATATTA-T-A-A-TTTGTGT-----T-----TTGG-A-CAGG----ACACACTAGCACACAGATGNGTGCATATTTT------CAATCTA-ATATAAT-----AATATATTTAAAG-GCAANACGTTCAT---ATACAC--AATTGTTTCGGTG----GTATATA-AA---TATCT--ATTTGAGNAGGCGT-A-AAA-A-ATA-------TA-TG-TATTACAATAT-------------ATTTGGCTA-TAT-AATNNCTTGGCTATGTCAAGTTGAACAAAGCACGCATATAATTT---------GTATA-ATACCTNTGCATAG-TTTGTTCAGCTCGACTAATCAAACCGTAAC--T--T--TTTGTTTCTT-----------TTATTTTTTCTT----TAATTTGTTTGTAG---------------ATA-TTANAGTA---------TNTATGCGTGTCTTTA--AT-AAAATTATG----AACATAGTCCACACAATGTACGTGTCATAA-AAATGGAAGTGTTTA-AGTTCGACCCG--AATATGTACACTATATTTTATTTAGTGTATT-TTTGTATATAAAATATTATGATAAAATGCACACATAACTTGACATACACAGAGATTCTTATTCTTTATTTACAACTATAGGTCACCTATCAAACTATTTGATTGACACGTGTCAATTCCACTCTGNNGGTAATCACACCACAGGT-G-T-GCCCGTATTACTGACTTACACGATGGNACGAGAGACGACAGTTATTGGCGTAGTAATTTACCTGGTTATTCGTTAGCGTAAACGA--ATATTT---TAA-T---A-TTTTTTGCACTCTT-TTCTCT--ATTTAATTAAAATAAAT--ATCATATATATTAACTNTATATATACACAAAACA------CATATTGCAGCT-AACAACGATCTTTAAAACGTATTTTTAAAGGGAC--TA-----TTTCTTCATACGCCATGGAGTTTCAGCGGTATGTTTTCATGGGGGAGGGCTGTAC
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15 : aTAT-AATT-TTATTTCAGCATA-ATACCTATGCATAG-TTTGTatgcatagtttgtgaggttatttaaattggtaaacacagctattcccgccattgttgttatgttcaatatttattgcatgtttat
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