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Reference ( gi|1 ) : TATGTATTTCTTGTATAATATCATT-TTACATTAAGTTCCATTTGACCATATAT------TACCATATCATTTATGTCCACTATTCCGCTTGCCAGTTACCTTTCGTCTTACA-T--TTTCGA------T-TT-CGGTAAGACA-AACGTA---TAAAACGGTCGAA---TGCTATAACAT-ATGTTAAATAATATTTCAC--C-CATTAGTT---AC--TTGTCTTGCATTGTTT-CGATTTT--ATTTTATTTTCGGTAAGGC--ATAT----------AT-TACATTT---------GAGGT-GTT--ATAACATTATCTAGATAAATACGTTTGGTCTGAAAATTATTGCAATGTATTA-----CAATC--------AAAATTATG-ATA-------------A---AATACTGTCATGCTTTTTCTATTGT-----A----ATT---AT--------GT----ACAATCTATTGT-AATTCTACAATAATTATATTCTG----TTTTTGCACTATTTTGCTGACTTTTAAAGTGTTGTTTGCACTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTGTGTG--TTCGTATGTATTTCTTGTATAATAT--C--TT--TACATTGAGTTCCATTTGACCATATA------GTACCATATCATTTATGTCCACTATCCCGCTTGCCAGTGACCTTTCGTCTTGCAT--TTTCGA-----T-TTTCGGTAAGAC-TAACGTATAAAACGGTCGAATGCTATAAAATA-TGTTAAATAATATTTCACCCATTAGTTACTTGTCTTGCACTGTTTCGATTT--GATTTTATTTTCGGTAAGGC--ATAT----------AT-TACATTTCA---------GGTGTTATAACATAATCTAGATAAACATGTTTG------GT-----CTGAAAATTATTGC----AATGTAT-----CACAATCAAAAGTGTG------ATA-AA--A--CTGT--CATGCTTTTTCTAC-----------TAT--A-------AT-TCTG------TACAATCTATTGT-AATTCTACAATTATTATATTCTG----TTTTTGTACTATTTTGCTGACTTTTATCATGT--TTCTTGA
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gi|6 : tatttcacttatcagttacctgtcttgcattgtttcgatttttttttcgataaggcataacgcagcatcgcttatcgaatcagtgtttagaaaatgtgtaaagttcagtagctcaaatttgaactttaacaagtgcaggtatgggagccatgcacaatccagcctcaaagcaCAGCAAGGC--AAAC----------ATATACATTTCATTCCATTGGGAT-GTT--AGAACATAGGCTAAATAAA--CCTCT--TTTTAAAAT----GTAATAACTTA-----GAATTGTTTTCCTAAATTTATA-ATATAAGGATGTCCTTA---AATGCTTGCATGGTTCTCCTACTGT-----ACTAAATT---AT--------CTTTTTATAATGTATTAT-AACTCTATAATTATTATATTCCG----ATTTTGCACTATTTTGACGACTcttatatgactgtctgtttaaatgcttgtattttaccgtatgctcttgtgaatggaggaataaaatatctatctacctcttgt
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-373 ) : TATGTATTTCTTGTATAATATCATTTTACATTAAGTTCCATTTGACCATATATTACCATATCATTTATGTCCACTATCCCGCTTGCCA-GTTACCTTTCGTCTTGC-ATTTTCGATTTCGGTAAGACAAACGTA---TAAA--ACGGTCGAATGCTATAACATATGTTAAATAATATTTCAC--CCATTAGTT---ACTTGTCTTGCATTGTTT-CGATTTT--ATTTTATTTTCGGTAAGGC--ATAT--AT-TACATTT---------GAGGTGTTATAACATAATCTAGATAAA-----------TACGTTTGGTCTGAAAATTATTGCAATGTA--A---C--ACAATC--------AAAATTA-TG-A----TA-------------A---AATACTGTCATG-CT----TTTTCTAC-----------TA-------T--A-------AT-TCTGTACAATCTATTGT-AATTCTACAATTATTATATTCTGTTTTTGCACTATTTTGCTGACTTTTATCA-TGT-TGTTTTCA--AATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCGTGTGGCTTCGTATGTATTTCTTGTATAATATATT--TACATTGAGTTCCATTTGACCATATA------GTACCATATCATTTATGTCCACTATCCCGNTTGCCAGTNACCTTTCGTCTTGCATTTTCGATTTTCGGTAAGACAAACGTATAAAACGGTCGAATGCTATAAAATATGTTAAATAATATTTCACCCATTAGTTACTTGTCTTGCACTGTTTCGATTTNATTTTATTTTCGGTAAGGC--ATAT----------ATTACATTTNAGGTGTTATAACATAATCTAGATAAACATGTTTGGTCTGAAAATCATTGCAATGTNTCACAATCAAANNTGTGATAAGAATCTGTCATGCTTTTTCTACTATAATTCTGTACAATCTATTGTAATTCTACAATTATTATATTCTGTTTTTTTTTGCACTATTTTGCTNACTTTTATCATGCTTCT
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