lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 111111111 333333333333333333 111111 22222 1 11 1 2222 1 5555555555555555 1111 1 1 2222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111 11111111 4444444444444444444444444444444444444 11 1111111111111 666666666666666666666666666666666666 11 1111 1111111 2222 1111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6 77777 2 666666666 1 888888 4 3 888888888888888888 1 7 666666 2 66666 3 0 3 33 4 3 2 2222 0 3 3 999 8888888888888888 6666 8 6 0 9999999 5 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 8 8 333333 0 9 3 77777 00000000 555 7777777777777777777777777777777777777 00 3 88888 6666666666666 4 777 55 999999999999999999999999999999999999 55 8888 33 3 7 2222 0000000 2222 77 8 4444
lowQualScore : ........................................................................... . ..... . ......... . ...... . . .................. . . ...... . ..... . . . .. . . . .... . . . ... ................ .... . . . ....... . ..................................................................... . . . ...... . . . ..... ........ ... ..................................... .. . ..... ............. . ... .. .................................... .. .... .. . . .... ....... .... .. . ....
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 11111 9 333333333 0 222222 7 8 999999999999999999 4 6 555555 5 00000 0 7 3 33 0 7 3 0000 7 3 0 555 0000000000000000 0000 3 0 0 0000000 7 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 5 8 000000 8 2 1 22222 44444444 000 8888888888888888888888888888888888888 22 3 33333 4444444444444 3 666 55 999999999999999999999999999999999999 55 5555 88 2 5 2222 1111111 0000 66 0 8888
consensus : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATAGGCCTCAGAAAATGGATAT-----G-A----A--A-TTTTGCTATA------TATTTGTATGTTNTTATAT----GTGCACATGCNT-TTCTCATTATATGCTAAGTGACCGNTCAGGATCAGTTNTTAAACGT-TTAACC-GAGCCAATTTTNCGATATTGTTAT-CTCAATAACATACTAG-ATTTGACGTTTTACNANNNTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTGCGGG-GAACATAC-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA-T---ATTAATA--T----------------TTACATGAGATGTGAAA----ATA-AT--GGAGAAATANGCCTCAGAAAATGGATATG--ACT-TGAAATGTT-GCT----ATAT--NT---TTGTA---TG---AT---A--------T---AT---GCCA-T-T-TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACA--T-------T----G-------TG-----TT-------TGC--TGAATA----AAATAATTGAATTG---AATT--G----AATTATAAC-ACAATAT-TA---AAATAC
Reference ( gi|2 ) : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATAT-----G-A----A--G-TTTTGCTATA------TATTTGCATGTTATTATAA----GTGCATATGCAT-TTCTCACTGTATGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGT-TTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAACTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA-T---ATTAATA--T-------A--------TTACATGAGATGTGAAA----ATGAAT--GGGGATTTATCCCTCATAAAATGGAAATG--AAT-TGAAATGTT-GCT----ATAT--TT---TTGTA---TG---AC---A--------T---AT---GCCC-T-T-TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACA--T-------T----G-------TG-----TC-------TGC--TGAATA----AAATTATTGCATTG---GATT--G----AATTATCAC-ACAATAT-TA---AAATAC
gi|1 : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTT
gi|1 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATAT-----G-A----A--G-TTTTGCTATA------TATTTGCATGTTATTATAA----GTGCATATGCAT-TTCTCACTGTATGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGT-TTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAACTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA-T---A-----------------TTAATATATTACATGAGATGTGAAA----ATGAAT--GGGGATTTATCCCTCATAAAATGGAAATG--AAT-TGAAATGTT-GCT----ATAT--TT---TTGTA---TG---AC---A--------T---AT---GCCC-T-T-TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACA--T-------T----G-------TG-----TC-------TGC--TGAATA----AAATTATTGCATTG---GATT--G----AATTATCAC-ACAATAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|9 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAAATAGGCCTTAGATAATGGATAT-----G-A----A--A-ATTTGCTTTA------TATTTGTATGTTTTTATA------TGC-CATG-ATCTTCTTATTATAT
gi|24 : gaaaatagaGAAATAGGTCTCAGAAAATGGATAT-----G-A----A--A-TGTTATTTTA------TATTTGTATGT--TTATAaaccgcctaaattgtttaggcgttgaacattgttgtttgtgcttaataaaataattgaattgttgatgcaatttatgctg
gi|12 : GACATAGGCCTCAGAAAATGG--AT-----G-A----CTTG-TTTTTTTATA------AAT
gi|22 : atatccgaacatgttaaaatgtcataaaatgatagttcaattaatatgtattacattgtgcaatcatatagaACAT--GCCTCGTATAATGGATAT-----G-A----C--A-ATTTGCTATA------TATTTGTTTGTTATTATAatcacattg
gi|16 : tctaaaaGGCCTCAGATAATTGATAT-----G-A----A--C-TTTTGCTATA------TATTTTTATGTTTATATAATGATGTGCATAAGCAT-TTc
gi|3 : attatatgcgaagtaGGCTTAAAAAAA--GAAAT-----G-A----A--A-TTGCTCTGTA------TATTTGTGTGTTATGATAT----GT-CATGTTC---TTCTCATT-TAT
gi|15 : caggcgaacctacacaaacatgacattctgtaaatatcataaaatgatataatatgtgaaaaatcatatgagtaaaaaGCCTCGGAAAATGGATATAACTTG-A----A--A-TGTTGCTATA------TATTTGTTTGTTTTTATAT----GT-CATACTC---CTCTCACTATATaacagcctttattgaactgttagggcgatgaacattgaatgacgtatttgctgcataaaataaacgaatttaattatagaacattaaatacaaatgcatcaaaattgaattaattgtactaatactttatatgtcttggatattttcgtcagaaatatcaaattgttaatgaaatatatgtcaccatctcagcacaaatgataaaataattatgaaacattgttctgatgatataagactaaagatacgaaaacaataatttgataattgtgtgtgcgtgcgtgtgt
gi|6 : tgaaaaaatatggagaaatacGCCTCAGAAAATTGATAT-----G-A--------------CT-TG------TGTTTGTATGTTCTTGTAaaccaccta
gi|23 : ttataaaatacattttgcctgagccaatatttcaatattgatatgcatactagtatttaatgttttaccatgatgtatgcgagatattgcgaacataccaacatgttataaattcttcagagtatttattaatattttttacaagtgaaaatatatgaagaaataaGTCTCAGAAAGTGGCTAT-----G-A----A--A-TTTTGCTATA------TATTttatat
gi|10 : tgtgaatacatatggggaaatatCCTCAGGAAATGGATAT-----G-ACTTGA--GATTTTGCCCTA------TGTTCGTAagt
gi|7 : atggggaaatagcCTCAGAAAATGGATAT-----GTA----A--G--TTTGCTATT------TGTGTGTACGTTGTTATGT----GTCC---TGCTG-TTCTCATTGCATctctactcattatataacccccgaaagtgttaaggcgataaacattgcattgtttaatgtttatgcagaatgtattgtaataacaatttaaccgagacatcatat
gi|19 : tttcataaaatgatatatttatttacatgtgaaaacatatgaagaaaaaatatGAAAATGGA--------A-A----ATTG-TTTTACCATAATATTATATTTGTATGTTATAATAT----GT---CATGCTC-TTCTCATTTTATaaccgcctgaattgttaaggtgatgtacattttgtggtatttgtgctgagtgaaagaattaaatttaaatcctattaatgcacatg
gi|11 : tT-----G-A----A--A-TTTTGCTATA------TATTTGTATGTTATTATAT----GT---CATTCTT-TTCTCATTATA-------TAACCGCTTA-----AGTTGTTAAGTATGTTAAC--------ATTGTATGATGTT-TTATGCTTAATAAAATAATTG-AATTGAaa
gi|6 : ACAT-TTTGCCTGAGCCAATATTTCAATATTGATAT--------GCATACTAGTATTTAATGTTTTACCATGATGTATGCGAGATAT----------------TGCG----AACATAC-CAACATGTTAT-------AAATTCTTCAGAGT-ATT-T---ATTAATA--T-------T--------TTTTACAAG---TGAAA----ATATAT--GAAGAAATAAGCCTCAGAAAATTGATATG--ACT-TG---TGTT-TGT----ATGT--TC---TTGTA---TT---AT---A--------T---tttgttatttattataaac
gi|3 : ttataaaatCAGGCGAACCTACACAA-ACATGACATTCTGTAAATATCATAAAATGATA-T---A---ATA--TGTGAAAAA--------TCATATGAG---TAAAA----A---------GG--------CT--TAAAA---AAA-G--AAA-TGAAAT--T-GCTCTGTATAT--TT---GTGTG---TT---ATG--A--------T---AT---GTCA-TGT-TCTTCTCATT-TATAACAGC-----CTTTATTG-------AACTGTTAGGGCGATG--AACA--T-------T----GAATGACGTA-----TT-------TGC--TGCATA----AAATAA--AC---G---AATT--T----AATTAT----AGAACAT-T----AAATAC
gi|12 : CGA-ACATGTT------AAAATGTCATAAAATGATAGTTCAATTAATATGT-------A--------TTACAT----TGTGCAATC--AT--AT--AGAGACATAGGCCTCAGAAAATGG--ATG--ACT-TGaaatgcatcaaaattgaattaattgtactaatactttatatgtcttggatattttcgtcagaaatatcaaattgttaatgaaatatatgtcaccatctcagcacaaatgataaaataattatgaaacattgttctgatgatataagactaaagatacgaaaacaataatttgataattgtgtgtgcgtgcgtgtgt
gi|17 : atatcT------TAAATTTCATAAAATG-TA-T---A---------------------------AC-----ATGTGAAA----ACATAT--GGAGAAATAGACC---TAAAATGGATATG--ACT-TGGAA-GTT-tttttttataaatatcacattg
gi|7 : accTTTCATAAAATGATA-T---ATT--TA--T----------------TTACATG-----TGAAAACATATGAA---GAAAAAATAT--CTCAGAAAATGGATATG----T---AAGT-TT-GCT----ATTT--GT---GTGTACGTTG---TT---A--------T---GT---GTCC-TGC-TGTTCTCATTGCATAACCGC-----CT-----G-------AATTGTTAAGGTGATG--TACATTT-------T----G-------TGGTATTTG-------TGC--TGAGTG----AAAGAATTAAATTt
gi|4 : ATGATA-T---ATTAATA--T-----------------TA-ATTAAATGTAAAA----ACATATCAGAAAATCTG--CCTGAGAAAGCGTAAAT---------AAACGTTTGCT----------TT---TTAT----TG---AT---AGGTTATGTT---AT---GCCAAT-C-GTTTGTTATTGCATAACCACATGAATT-----G-------AATTGTTAAGGCGATG--GAAA--T-------TTATGA-------TG-----CC-------TGTGATAAATAAGATAAACAATTGAATTG---AATT--G----AATTATtaaatcctattaatgcacatg
gi|15 : ataacatgcgcatatatatcAAA----AT--AT--GGAGAAATACGCCTCGGAAAATGGATATA--ACT-TGAAATGTT-GCT----ATAT--AT---TTGTT---TGTTTTT---A--------T---AT---GTCA-TAC-TCCTCTCACTATATAACCAC-----CT-----A-------atagcaacttctgaatctgtta
gi|10 : tgaaAT--GGGGAAATAGCCCTCAGGAAATGGATATG--ACT-TGAGATTTT-GCC----CTAT--GT---TCGTA---C------------------------------------TCTACTCATTATATAACCCC-----CG-----A-------AAGTGTTAAGGCGATA--AACA--T-------T----G-------CA-----T--------TGT--TTAAT------GTTTA-TGCA------GAAT--G----TATTGTAATAACAAT-T-TA---
gi|9 : CCTTAGATAATGGATATG--AA-----AAT-TT-GCT----TTAT--AT---TTGTA---TG---TTTTTA--------T---AT---GCCA-T-GATCTTCTTATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTTAGGCGTTG--AACA--T-------T----GT------TG-----TTTG-----TGC--TTAATA----AAATAATTGAATTG-----TT--G----Accgagacatcatat
gi|24 : gaaaatagagaaataggCTCAGAAAATGGATATG--AA------ATGTT-ATT----TTAT--AT---TTGTA---TG---tgcaatttatgctg
gi|8 : gaaataggtAACATGGATATG--ACT-TGAAAGTTT-GGT----ATATATTTGTATTGTA---TG---AT---A--------T---AT---GTCA-TGT-TCTTCCCATCATATAACCGC-----CT-----A-------TTGTGTTACGGCAATG--AACA--T-------T----GTATGA--TG-----TTTG-----TGC--TGAGTA----AAGGAATTGAATTG---AATT--GTTATAATGATAAA-ACAA-AT-TAATCAAATAtttata
gi|14 : gaggggaaaagccaaaaGGAAATACAGATATGGAATTTT-GAT----ATAT--GT-----GTA---TG---GT---A--------TTATAT---GACT-T-GATCTTCCCAT-AT-C-GCCGC-----CT-----G-------AAATGTTAAGGCGA
gi|11 : aattacatgtggaaacatgtgg-TGAAATTTT-GCT----ATAT--AT---TTGTA---TGTT-ATT--A--------T---AT---GTCA-T-TCTTTTCTCATTATATAACCGC-----TT-----A-------AGTTGTT-AAGT-ATGTTAACA--T-------T----GTATGA--TG-----TTTTA----TGC--TTAATA----AAATAATTGAATTG---ATTT--G------TTATa
gi|5 : CT----ATAT--T------GTA---TA---AT---A--------T---GTCACGCCA-T-T-----CTCATTATAAAACCGT-----CT-----GTGGGTTGAATTGATAATGCAATG--GACA--T-------T----G-------TA-----TTGCGTATGTGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAGTGGTTAAA----AATGGTGAC-AAAATGTATA---AAttattataaac
gi|13 : ttaatatgaataaatagcataatttggtttgcatgtgaaagcatacatgagtaggttgaaaaaaaat---TG---AC---A--------T--------GCTC-T-T-----CTCATTATGTAACCGC-----CT-----A-------AATTATTAAGGCGATA--AACA--CTGTATGAT----G-------TG-----TG-------TGC--TGAATA----AAA-----GAATCG---AATT--G----AATTATgagttggcttaatcggtac
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ACATACCAAATCATAAAATGATACATTAATATGTGAAAACATATGCGAAAATAGATCTCTTAAAAGGGATATGACT
Unaligned ( gi|20 ): TATGAAATTTTGTTAAATATGTGTATGTTGTAATATGTAATTCCCTTCTCATCGAACTGTTAAGG
Unaligned ( gi|21 ): AAATGATATATCAATATATCACTACATGTGAAAACACATGGAGGAAATAGGTCTCAGAAATTG
Alignments
lowQualScore : 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 111 111111 1111 1111 1 333 444 1 1 2 2222222 555555555555555 2222 22222222222222222222222222222222222222 1111111111111 55555555555555555555555555555555 333333333 11111 1111 111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 1 000 666666 3 2222 1 3333 1 8 0 6 1 1 000 0 1 6 0 333 1 3 1 333 7 0 999 6 6 0 6 6 1111111 0 4 777 0 0 555555555555555 33 6666 2 2 2 55 88 6 2 3 77777777777777777777777777777777777777 77777 4444444444444 55 99999999999999999999999999999999 55 0 8888 777 111111111 44444 3333 8 444
lowQualScore : ........................................................................... .. . ... ...... . .... . .... . . . . . . ... . . . . ... . . . ... . . ... . . . . . ....... . . ... . . ............... .. .... . . . .. .. . . . ...................................... ..... ............. .. ................................ .. . .... ... ......... ..... .... . ...
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 2 000 444444 0 1111 4 4444 0 8 0 0 0 0 000 7 0 0 7 000 0 3 0 000 3 7 222 0 7 0 7 3 6666666 2 0 000 8 7 777777777777777 99 3333 5 5 5 99 99 1 9 8 88888888888888888888888888888888888888 77777 5555555555555 00 33333333333333333333333333333333 55 7 5555 888 666666666 33333 3333 0 000
consensus : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATG--ACATNGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGTTATTAT----ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACC-GGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACGGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA-T---ATTAATAT---TT---ACATGA-ATGTGAAA--AC-ATATG-GG-G-AAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATGTT-GCTATATATTTGTA---T-----G---AT---AT---AT---GCCA-T-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATAAAATAA----TTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
Reference ( family-367 ) : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATG--ACATAGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGTTNTTAT----ATGTGCACATGCNTTTCTCATTATA-TGCTAAGTGACCGNTCAGGATCAGTTNTTAAACGTTTAACC-G-AGCCAATTTTNCGATATTGTTATCT-CAATAACATACTAG-ATTTGACGTTTTACNANNNTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTGCGGGGAA-CATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA-T---ATTAATAT---TT---ACATGAGATGTGAAA--AT-A-ATG-GA-G-AAATAN-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATGTT-GCTATATNTTTGTA---T-----G---AT---AT---AT---GCCA-T-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATAAAATAA----TTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
gi|1 : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTT
gi|1 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATG--ACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGTTATTAT----AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACC-GGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA-T---ATTAATATA--TT---ACATGAGATGTGAAA--ATGA-ATG-GG-G-ATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATGTT-GCTATATTTTTGTA---T-----G---AC---AT---AT---GCCC-T-T--TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACAT-------T-----G-------TGTC-------TGC--TGAATAAAATTA----TTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|10 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-ATG-GG-G-AAATAG-CCCTCAGGAAATGGATATGACTTGAGATTTT-GCCCTATGTTCGTA-----------------------------------C--TCTACTCATTATATAACCCC-----CG-----A-------AAGTGTTAAGGCGATA--AACAT-------T-----GCAT----TGTT-------T
gi|11 : TGAAATTTT-GCTATATATTTGTA---T-----GTT-ATT--AT---AT---GTCA-T-TC-TTTTCTCATTATATAACCGC-----TT-----A-------AGTTGTTAAG--TATGTTAACAT-------T-----GTATGA--TGTTTTA----TGC--TTAATAAAATAA----TTGAATTGATTT---GTT---ATTTATTATAA-----aatgtttatgcagaatgtattgtaataacaatttaaccgagacatcatat
gi|12 : ATATC-CGA-ACATGTT------AAAATGTCATAAAATGATAGTTCAATTAATATGTATT---ACAT----TGTGCAATCAT---ATA-GA-G-ACATAG-GCCTCAGAAAATGG--ATGACTTGac
gi|13 : ---AC---AT---GC--------TCTTCTCATTATGTAACCGC-----CT-----A-------AATTATTAAGGCGATA--AACACTGTATGAT-----G-------TGTG-------TGC--TGAATAAAA---------GAATCGAATT---G-----A---ATTATAAAGGAGCATAA---TAtttttttataaatatcacattg
gi|14 : ttgATGTGGAA--AC-ATGTG-GG-G-AAATA------CAGA-------TATGG-----AATTTT-GATATATGT--GTA---T-----G---GT---ATTATAT---GAC--T-TGATCTTCCCAT---ATCGCCGC-----CT-----G-------AAATGTTAAGGCGAcc
gi|15 : aattacTGAAA--AA-ATATG-GA-G-AAATAC-GCCTCGGAAAATGGATATAACTTGAAATGTT-GCTATATATTTGTT---T-----GTTTTT---AT---AT---GTCA-TAC--TCCTCTCACTATATAACCAC-----CT-----A-------a
gi|16 : ATTATATGCGAAGTAGGCCTCAGATAATTGATATGAACTT---TTGCTATA------TATTTTTATGTTTATATAATGATGTGCATAAGCATTT
gi|17 : T------TAAATTTCATAAAATG-TA-T---A---------------AC-----ATGTGAAA--AC-ATATG-GA-G-AAATAG-ACCT---AAAATGGATATGACTTGGAA-GTT-
gi|18 : accA-CATA-C-CAA-A------------------TCATAAAATGATA-C---ATTAAT-----------------ATGTGAAA--AC-ATATG-CG-A-AAATAG-ATCTCTTAAAAGGGATATGACTt
gi|19 : GAAAATGGA----AAATTGTTTTACCATAATATTATATTTGTATGTTATAAT----ATGT---CATGCTCTTCTCATTTTA-T
gi|2 : tAAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTaa
gi|2 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATG--ACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGTTATTAT----AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACC-GGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA-T---ATTAATATA--TT---ACATGAGATGTGAAA--ATGA-ATG-GG-G-ATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATGTT-GCTATATTTTTGTA---T-----G---AC---AT---AT---GCCC-T-T--TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACAT-------T-----G-------TGTC-------TGC--TGAATAAAATTA----TTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|20 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGAAATT---TTGTTAAA------TATGTGTATGTTGTAAT----ATGTA---ATTCCCTTCTCATCGAACTGTTAAG
gi|21 : AAATGATA-T---ATCAATAT---AT----CACTACATGTGAAA--AC-ACATG-GAGG-AAATAG-GTCTCAGAAATTGg
gi|22 : --ACAT--GCCTCGTATAATGGATATGACAAT---TTGCTATA------TATTTGTTTGTTATTAT----A
gi|23 : tctaaaaTGTGAAT--AC-ATATG-GG-G-AAATAT-GTCTCAGAAAGTGGCTA-----TGAAATTTT-GCTATATATTAGTc
gi|24 : G--AAATAGGTCTCAGAAAATGGATATGAAATG---TTATTTTA------TATTTGTATGT--TTAT----A
gi|3 : GGCGAA-CCTA-CACAA-ACATGACATTCTGTAAATATCATAAAATGATA-T---A---ATAT----------GTGA------AAA--AT-C-ATATGA-GTAAAAAG-GCTTAAAAAAA--GAAATGA----AATTGCT--CTGTATATTTGTG---T-----GTT-ATG--AT---AT---GTCA-TGT--TCTTCTCATT-TATAACAGC-----CTTTATTG-------AACTGTTAGGGCGATG--AACAT-------T-----GAATGACGTATT-------TGC--TGCATAAAATAA----ACGAATTTAATTATAG-----AAC-ATTA-AA-----TACAAATGCAT-CA---AAAT
gi|4 : caATGATA-T---ATTAATAT---T----A-ATTAAATGTAAAA--AC-ATATC-AG-A-AAATCT-GCCTGAGAAAGCGTAAAT------AAACGTTTGCTTTTTATTGATA---G-----G---TT---ATGTTAT---GCCAAT-C--GTTTGTTATTGCATAACCACATGAATT-----G-------AATTGTTAAGGCGATG--GAAAT-------TTATG-A-------TGCC-------TGTGATAAATAAGATAAACAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAtgaattaattgtactaatactttatatgtcttggatattttcgtcagaaatatcaaattgttaatgaaatatatgtcaccatctcagcacaaatgataaaataattatgaaacattgttctgatgatataagactaaagatacgaaaacaataatttgataattgtgtgtgcgtgcgtgtgt
gi|5 : ataacatgcgcatatatatcCTATAT---TGTA---T-----A---AT---AT---GTCACGCCA-T-T------CTCATTATAAAACCGT-----CT-----GTGGGTTGAATTGATAATGCAATG--GACAT-------T-----G-------TATTGCGTATGTGC--TGAATAAAATAA----TTGAATTGAGTG---GTTAAAA---ATGGTGA-----CAAAA---TGTATA---AAtagcaacttctgaatctgtta
gi|6 : ttaatatgaataaatagcataatttggtttgcatgtgaaagcatacatgagtaggttgaaaaaaaatACATTTTGCCTG-AGCCAATATTTCAATATTGATAT--------GCATACTAGTATTTAATGTTTTACCATGATGTATGCGAGATAT----------------TGCG---AA-CATA-C-CAACATGTTAT-------AAATTCTTCAGAGT-ATT-T---ATTAATAT---TTTTTACA----A-GTGAAA--AT-ATATG-AA-G-AAATAA-GCCTCAGAAAATTGATATGACTTG---TGTT-TGTATGTTCTTGTA---T-----T---AT---AT---gagttggcttaatcggtac
gi|7 : ttataaaatTTTCATAAAATGATA-T---ATT--TAT---TT---ACATG-----TGAAA--AC-ATATG-AA-G-AAAAAATATCTCAGAAAATGGATATG---T-AAGT-TT-GCTATTTGTGTGTACGTT-----G---TT---AT---GT---GTCC-TGC--TGTTCTCATTGCATAACCGC-----CT-----G-------AATTGTTAAGGTGATG--TACAT-------TTTGTGG-------TATTTG-----TGC--TGAGTGAAAGAA----TTAAATTTAA
gi|8 : G-GG-G-AAA--A-GCCAAAAAACATGGATATGACTTGAAAGTTT-GGTATATATTTGTA---TTGTATG---AT---AT---AT---GTCA-TGT--TCTTCCCATCATATAACCGC-----CT-----A-------TTGTGTTACGGCAATG--AACAT-------T-----GTATGA--TGTTTG-----TGC--TGAGTAAAGGAA----TTGAATTGAATT---GTTAT-A---ATGATAA-----AACAA----AT-TAATCAAATAatcctattaatgcacatg
gi|9 : gaGAAA--AT-A-----GA-G-AAATAG-GCCTTAGATAATGGATATGA----AAAT-TT-GCTTTATATTTGTA---T-----G---TTTTTAT---AT---GCCA-T-GA-TCTTCTTATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTTAGGCGTTG--AACAT-------T-----GT------TGTTTG-----TGC--TTAATAAAATAA----TTGAATTG--TT---G-----A---
Alignments
lowQualScore : 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 111 111111 111 1 1 2 2222222 555555555555555 11111 222222222222222222222 2222222 1111111111111 55555555555555555555555555555555 333333333 11111 1111 111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33 0 1 111 999999 111 4 6 1 888 1 0 7 3 7 44 33 6 0 6 6 1111111 0 55 55 0 0 555555555555555 33 2 44 0 00000 7 2 1 999999999999999999999 555 555 3333333 77777 4444444444444 55 99999999999999999999999999999999 55 0 8888 777 111111111 44444 3333 8 444
lowQualScore : ........................................................................... .. . . ... ...... ... . . . ... . . . . . .. .. . . . . ....... . .. .. . . ............... .. . .. . ..... . . . ..................... ... ... ....... ..... ............. .. ................................ .. . .... ... ......... ..... .... . ...
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 88 8 4 777 222222 777 0 7 4 888 0 0 3 3 3 55 88 7 0 7 3 6666666 2 55 55 8 7 555555555555555 99 4 66 1 33333 2 5 5 222222222222222222222 000 444 8888888 77777 5555555555555 00 33333333333333333333333333333333 55 7 5555 888 666666666 33333 3333 0 000
consensus : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATG--ACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATNAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATAT---TT---ACATG--ATGTGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATGTT-GCTATATATTTGTA---T-----G---A---T---AT---AT---GCCA-T-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATAAAATAA----TTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
Reference ( family-367 ) : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATG--ACATNGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATTAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACGGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATAT---TT---ACATGA-ATGTGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATGTT-GCTATATATTTGTA---T-----G---A---T---AT---AT---GCCA-T-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATAAAATAA----TTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
gi|1 : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTT
gi|1 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATG--ACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGT---TATTAT-AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATATA--TT---ACATGAGATGTGAAAA--TGAATGG-GGATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATGTT-GCTATATTTTTGTA---T-----G---A---C---AT---AT---GCCC-T-T--TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACAT-------T-----G-------TGTC-------TGC--TGAATAAAATTA----TTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|10 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGG-GGAAATAG-CCCTCAGGAAATGGATATGACTTGAGATTTT-GCCCTATGTTCGTA--------------------------------------C--TCTACTCATTATATAACCCC-----CG-----A-------AAGTGTTAAGGCGATA--AACAT-------T-----GCAT----TGTT-------T
gi|11 : TGAAATTTT-GCTATATATTTGTA---T-----GTT-A---TT--AT---AT---GTCA-T-TC-TTTTCTCATTATATAACCGC-----TT-----A-------AGTTGTTAAG--TATGTTAACAT-------T-----GTATGA--TGTTTTA----TGC--TTAATAAAATAA----TTGAATTGATTT---GTT---ATTTATTATAA-----aatgtttatgcagaatgtattgtaataacaatttaaccgagacatcatat
gi|12 : ATATC-CGA-ACATGTT------AAAATGTCATAAAATGATAGTTCAATTAATATGTATT---ACAT----TGTGCAAT--CATATAG-AGACATAG-GCCTCAGAAAATGG--ATGACTTGac
gi|13 : ---AC---AT---GC--------TCTTCTCATTATGTAACCGC-----CT-----A-------AATTATTAAGGCGATA--AACACTGTATGAT-----G-------TGTG-------TGC--TGAATAAAA---------GAATCGAATT---G-----A---ATTATAAAGGAGCATAA---TAtttttttataaatatcacattg
gi|14 : ttg-ATGTGGAAA--CATGTGG-GGAAATA------CA-------GATA-----TGGAATTTT-G--ATATATGTGTA---T-----G---GTATT---AT---AT---GAC--T-TGATCTTCCC---ATATCGCCGC-----CT-----G-------AAATGTTAAGGCGAcc
gi|15 : aattacTGAAAA--AATATGG-AGAAATAC-GCCTCGGAAAATGGATATAACTTGAAATGTT-GCTATATATTTGTT---T-----GTTTT---T---AT---AT---GTCA-TAC--TCCTCTCACTATATAACCAC-----CT-----A-------a
gi|16 : ATTATATGCGAAGTAGGCCTCAGATAATTGATATGAACTT---TTGCTATA------TATTTTTATGTTTATATAATGATGTGCATAAGCATTT
gi|17 : T------TAAATTTCATAAAATG-TA--T--A---------------AC-----ATGTGAAAA--CATATGG-AGAAATAG-ACCT---AAAATGGATATGACTTGGAA-GTT-
gi|18 : accACATA-C-CAA-A------------------TCATAAAATGATA--C--ATTAATAT-----------------GTGAAAA--CATATGC-GAAAATAG-ATCTCTTAAAAGGGATATGACTt
gi|19 : GAAAATGGA----AAATTGTTTTACCATAATATTATATTTGTATGT---TATAAT-ATGT---CATGCTCTTCTCATTTTA-T
gi|2 : tAAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTaa
gi|2 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATG--ACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGT---TATTAT-AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATATA--TT---ACATGAGATGTGAAAA--TGAATGG-GGATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATGTT-GCTATATTTTTGTA---T-----G---A---C---AT---AT---GCCC-T-T--TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACAT-------T-----G-------TGTC-------TGC--TGAATAAAATTA----TTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|20 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGAAATT---TTGTTAAA------TATGTGTATGT---TGTAAT-ATGTA---ATTCCCTTCTCATCGAACTGTTAAG
gi|21 : AAATGATA--T--ATCAATATA--TC---AC-TAC-ATGTGAAAA--CACATGGAGGAAATAG-GTCTCAGAAATTGg
gi|22 : --ACAT--GCCTCGTATAATGGATATGACAAT---TTGCTATA------TATTTGTTTGT---TATTAT-A
gi|23 : tctaaaaTGTGAATA--CATATGG-GGAAATAT-GTCTCAGAAAGTGGCTA-----TGAAATTTT-GCTATATATTAGTc
gi|24 : GAAATAG-GTCTCAGAAAATGGATA-----TGAAATGTT-ATTTTATATTTGTA---T-----G---
gi|3 : CAGGCGAACCTA-CACAA-ACATGACATTCTGTAAATATCATAAAATGATA--T--A-----------------AT---ATGTGAAAAATCATATGA-GTAAAAAG-GCTTAAAAAAA--GAAATGA----AATTGCT--CTGTATATTTGTG---T-----GTT-A---TG--AT---AT---GTCA-TGT--TCTTCTCATT-TATAACAGC-----CTTTATTG-------AACTGTTAGGGCGATG--AACAT-------T-----GAATGACGTATT-------TGC--TGCATAAAATAA----ACGAATTTAATTATAG-----AAC-ATTA-AA-----TACAAATGCAT-CA---AAATtttata
gi|4 : ATGATA--T--ATTAATAT---TA---AT-TAA-ATGTAAAAA--CATATCA-GAAAATCT-GCCTGAGAAAGCGTAAAT------AAACGTTTGCTTTTTATTGATA---G-----G---T---T---ATGTTAT---GCCAAT-C--GTTTGTTATTGCATAACCACATGAATT-----G-------AATTGTTAAGGCGATG--GAAAT-------TTATG-A-------TGCC-------TGTGATAAATAAGATAAACAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAtgaattaattgtactaatactttatatgtcttggatattttcgtcagaaatatcaaattgttaatgaaatatatgtcaccatctcagcacaaatgataaaataattatgaaacattgttctgatgatataagactaaagatacgaaaacaataatttgataattgtgtgtgcgtgcgtgtgt
gi|5 : ataacatgcgcatatatatcTGC-ATGTGAAAG--CATACAT-G--AGTAG-GTT---GAAAA------------AAAAT-----CTATAT---TGTA---T-----A---A---T---AT---GTCACGCCA-T-T------CTCATTATAAAACCGT-----CT-----GTGGGTTGAATTGATAATGCAATG--GACAT-------T-----G-------TATTGCGTATGTGC--TGAATAAAATAA----TTGAATTGAGTG---GTTAAAA---ATGGTGA-----CAAAA---TGTATA---AAtagcaacttctgaatctgtta
gi|6 : ttaatatgaataaatagcataatttggttACATTTTGCCTGAGCCAATATTTCAATATTGATAT--------GCATACTAGTATTTAATGTTTTACCATGATGTATGCGAGATAT----------------TGCG----AACATA-C-CAACATGTTAT-------AAATTCTTCAGAGT-ATT--T--ATTAATAT---TTTTTACA----A-GTGAAAA--TATATGA-AGAAATAA-GCCTCAGAAAATTGATATGACTTG---TGTT-TGTATGTTCTTGTA---T-----T---A---T---AT---gagttggcttaatcggtac
gi|7 : ttataaaatTTTCATAAAATGATA--T--ATT--TAT---TT---ACATG-----TGAAAA--CATATGA-AGAAAAAATATCTCAGAAAATGGATATG--T--AAGT-TT-GCTATTTGTGTGTACGTT-----G---T---T---AT---GT---GTCC-TGC--TGTTCTCATTGCATAACCGC-----CT-----G-------AATTGTTAAGGTGATG--TACAT-------TTTGTGG-------TATTTG-----TGC--TGAGTGAAAGAA----TTAAATTTAA
gi|8 : GG-GGAAA--A-GCCAAAAAACATGGATATGACTTGAAAGTTT-GGTATATATTTGTA---TTGTATG---A---T---AT---AT---GTCA-TGT--TCTTCCCATCATATAACCGC-----CT-----A-------TTGTGTTACGGCAATG--AACAT-------T-----GTATGA--TGTTTG-----TGC--TGAGTAAAGGAA----TTGAATTGAATT---GTTAT-A---ATGATAA-----AACAA----AT-TAATCAAATAatcctattaatgcacatg
gi|9 : gaATAG-AGAAATAG-GCCTTAGATAATGGATATGA----AAAT-TT-GCTTTATATTTGTA---T-----G---T---TTTTAT---AT---GCCA-T-GA-TCTTCTTATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTTAGGCGTTG--AACAT-------T-----GT------TGTTTG-----TGC--TTAATAAAATAA----TTGAATTG--TT---G-----A---
Alignments
lowQualScore : 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111 111 1 1 2 2222222 4444444444444444444 11111 222222222222222222222 2222222 1111111111111 55555555555555555555555555555555 333333333 11111 1111 111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1 111 999999 111 1 6 1 888 1 0 7 3 7 2 33 6 0 6 6 1111111 0 55 55 0 0 0000000000000000000 33 2 44 0 00000 99 1 999999999999999999999 555 555 3333333 77777 4444444444444 55 99999999999999999999999999999999 55 8888 2 777 111111111 44444 3333 8 444
lowQualScore : ........................................................................... . . ... ...... ... . . . ... . . . . . . .. . . . . ....... . .. .. . . ................... .. . .. . ..... .. . ..................... ... ... ....... ..... ............. .. ................................ .. .... . ... ......... ..... .... . ...
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 4 777 222222 777 0 7 4 888 0 0 3 3 3 5 88 7 0 7 3 6666666 2 55 55 8 7 6666666666666666666 99 4 66 1 33333 77 5 222222222222222222222 000 444 8888888 77777 5555555555555 00 33333333333333333333333333333333 55 5555 2 888 666666666 33333 3333 0 000
consensus : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATNAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---T---TTAC-ATGA--TGTGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATG-TTGCTATATATTTGTA---T-----G---A---T---A---TAT---GCC-AT-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
Reference ( family-367 ) : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATNAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---T---TTAC-ATGA--TGTGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATG-TTGCTATATATTTGTA---T-----G---A---T---A---TAT---GCC-AT-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
gi|1 : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTT
gi|1 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGT---TATTAT-AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---TA--TTAC-ATGAGATGTGAAAA--TGAATGG-GGATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATG-TTGCTATATTTTTGTA---T-----G---A---C---A---TAT---GCC-CT-T--TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACAT-------T-----G-------TGTC-------TGC--TGAATA----AAATTATTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|10 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGG-GGAAATAG-CCCTCAGGAAATGGATATGACTTGAGATT-TTGCCCTATGTTCGTA--------------------------------------C--TCTACTCATTATATAACCCC-----CG-----A-------AAGTGTTAAGGCGATA--AACAT-------T-----GCAT----TGTT-------T
gi|11 : TGAAATT-TTGCTATATATTTGTA---T-----GTT-A---TT--A---TAT---GTC-AT-TC-TTTTCTCATTATATAACCGC-----TT-----A-------AGTTGTTAAG--TATGTTAACAT-------T-----GTATGA--TGTTTTA----TGC--TTAATA----AAATAATTGAATTGATTT---GTT---ATTTATTATAA-----aatgtttatgcagaatgtattgtaataacaatttaaccgagacatcatat
gi|12 : ATATC-CGA-ACATGTT------AAAATGTCATAAAATGATAGTTCAATTAATA---TGTATTAC-AT----TGTGCAAT--CATATAG-AGACATAG-GCCTCAGAAAATGG--ATGACTTGac
gi|13 : ---A---CAT---GC--------TCTTCTCATTATGTAACCGC-----CT-----A-------AATTATTAAGGCGATA--AACACTGTATGAT-----G-------TGTG-------TGC--TGAATA----AAA-----GAATCGAATT---G-----A---ATTATAAAGGAGCATAA---TAtttttttataaatatcacattg
gi|14 : ttg---TTAC-ATG-----TGGAAA--CATGTGG-GGAAATA------CA-------GATA-----TGGAATT-TTG--ATATATGTGTA---T-----G---GTATT---A---TAT---GAC--T-TGATCTTCCC---ATATCGCCGC-----CT-----G-------AAATGTTAAGGCGAcc
gi|15 : aaTGAAAA--AATATGG-AGAAATAC-GCCTCGGAAAATGGATATAACTTGAAATG-TTGCTATATATTTGTT---T-----GTTTT---T---A---TAT---GTC-ATAC--TCCTCTCACTATATAACCAC-----CT-----A-------a
gi|16 : GGCCTCAGATAATTGATATGAACTT---TTGCTATA------TATTTTTATGTTTATATAATGATGTGCATAAGCATTT
gi|17 : attatatgcgaagtaT------TAAATTTCATAAAATG-TA--T--A---------------AC-ATG-----TGAAAA--CATATGG-AGAAATAG-ACCT---AAAATGGATATGACTTGGAA-G-TT
gi|18 : accACATA-C-CAA-A------------------TCATAAAATGATA--C--ATTAATA---T---------------GTGAAAA--CATATGC-GAAAATAG-ATCTCTTAAAAGGGATATGACTt
gi|19 : GAAAATGGA----AAATTGTTTTACCATAATATTATATTTGTATGT---TATAAT-ATGT---CATGCTCTTCTCATTTTA-T
gi|2 : tAAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTaa
gi|2 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGT---TATTAT-AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---TA--TTAC-ATGAGATGTGAAAA--TGAATGG-GGATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATG-TTGCTATATTTTTGTA---T-----G---A---C---A---TAT---GCC-CT-T--TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACAT-------T-----G-------TGTC-------TGC--TGAATA----AAATTATTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|20 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGAAATT---TTGTTAAA------TATGTGTATGT---TGTAAT-ATGTA---ATTCCCTTCTCATCGAACTGTTAAG
gi|21 : AAATGATA--T--ATCAATA---TA--TCACTAC-A--TGTGAAAA--CACATGGAGGAAATAG-GTCTCAGAAATTGg
gi|22 : ACAT--GCCTCGTATAATGGATATGACAAT---TTGCTATA------TATTTGTTTGT---TATTAT-A
gi|23 : tctaaaa--TGTGAATA--CATATGG-GGAAATAT-GTCTCAGAAAGTGGCTA-----TGAAATT-TTGCTATATATTAGTc
gi|24 : GAAATAG-GTCTCAGAAAATGGATA-----TGAAATG-TTATTTTATATTTGTA---T-----G---
gi|3 : CAGGCGAACCTA-CACAA-ACATGACATTCTGTAAATATCATAAAATGATA--T--A------------------AT-A--TGTGAAAAATCATATGA-GTAAAAAG-GCTTAAAAAAA--GAAATGA----AATTG-CT-CTGTATATTTGTG---T-----GTT-A---TG--A---TAT---GTC-ATGT--TCTTCTCATT-TATAACAGC-----CTTTATTG-------AACTGTTAGGGCGATG--AACAT-------T-----GAATGACGTATT-------TGC--TGCATA----AAATAAACGAATTTAATTATAG-----AAC-ATTA-AA-----TACAAATGCAT-CA---AAATtttata
gi|4 : ATGATA--T--ATTAATA---T---TAAT-TAAA--TGTAAAAA--CATATCA-GAAAATCT-GCCTGAGAAAGCGTAAAT------AAACGTTTGCTTTTTATTGATA---G-----G---T---T---ATGTTAT---GCCAAT-C--GTTTGTTATTGCATAACCACATGAATT-----G-------AATTGTTAAGGCGATG--GAAAT-------TTATG-A-------TGCC-------TGTGATAAATAAGATAAACAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAtgaattaattgtactaatactttatatgtcttggatattttcgtcagaaatatcaaattgttaatgaaatatatgtcaccatctcagcacaaatgataaaataattatgaaacattgttctgatgatataagactaaagatacgaaaacaataatttgataattgtgtgtgcgtgcgtgtgt
gi|5 : ataacatgcgcatatatatcA--TGTGAAAG--CATACAT-G--AGTAG-GTT---GAAAA------------AAAAT-----CTATAT---TGTA---T-----A---A---T---A---TGTCACGCC-AT-T------CTCATTATAAAACCGT-----CT-----GTGGGTTGAATTGATAATGCAATG--GACAT-------T-----G-------TATTGCGTATGTGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAGTG---GTTAAAA---ATGGTGA-----CAAAA---TGTATA---AAtagcaacttctgaatctgtta
gi|6 : ttaatatgaataaatagcataatttggtttgcACATTTTGCCTGAGCCAATATTTCAATATTGATAT--------GCATACTAGTATTTAATGTTTTACCATGATGTATGCGAGATAT----------------TGCG----AACATA-C-CAACATGTTAT-------AAATTCTTCAGAGT-ATT--T--ATTAATATTTT---TTAC-A--A---GTGAAAA--TATATGA-AGAAATAA-GCCTCAGAAAATTGATATGACTTG---TG-TTTGTATGTTCTTGTA---T-----T---A---T---A---Tgagttggcttaatcggtac
gi|7 : ttataaaatTTTCATAAAATGATA--T--ATT--TA---T---TTAC-ATG-----TGAAAA--CATATGA-AGAAAAAATATCTCAGAAAATGGATATG--T--AAGT--TTGCTATTTGTGTGTACGTT-----G---T---T---A---TGT---GTC-CTGC--TGTTCTCATTGCATAACCGC-----CT-----G-------AATTGTTAAGGTGATG--TACAT-------TTTGTGG-------TATTTG-----TGC--TGAGTG----AAAGAATTAAATTTAA
gi|8 : GG-GGAAA--A-GCCAAAAAACATGGATATGACTTGAAAGT-TTGGTATATATTTGTA---TTGTATG---A---T---A---TAT---GTC-ATGT--TCTTCCCATCATATAACCGC-----CT-----A-------TTGTGTTACGGCAATG--AACAT-------T-----GTATGA--TGTTTG-----TGC--TGAGTA----AAGGAATTGAATTGAATT---GTTAT-A---ATGATAA-----AACAA----AT-TAATCAAATAatcctattaatgcacatg
gi|9 : gaATAG-AGAAATAG-GCCTTAGATAATGGATATGA----AAAT--TTGCTTTATATTTGTA---T-----G---T---TTTTA---TAT---GCC-AT-GA-TCTTCTTATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTTAGGCGTTG--AACAT-------T-----GT------TGTTTG-----TGC--TTAATA----AAATAATTGAATTG--TT---G-----A---
Alignments
lowQualScore : 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111 111 1 1 2 2222222 4444444444444444444 11111 222222222222222222222 2222222 1111111111111 55555555555555555555555555555555 333333333 11111 1111 111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1 111 999999 111 1 6 1 888 1 0 7 3 7 2 33 6 0 6 6 1111111 0 55 55 0 0 0000000000000000000 33 2 44 0 00000 99 1 999999999999999999999 555 555 3333333 77777 4444444444444 55 99999999999999999999999999999999 55 8888 2 777 111111111 44444 3333 8 444
lowQualScore : ........................................................................... . . ... ...... ... . . . ... . . . . . . .. . . . . ....... . .. .. . . ................... .. . .. . ..... .. . ..................... ... ... ....... ..... ............. .. ................................ .. .... . ... ......... ..... .... . ...
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 4 777 222222 777 0 7 4 888 0 0 3 3 3 5 88 7 0 7 3 6666666 2 55 55 8 7 6666666666666666666 99 4 66 1 33333 77 5 222222222222222222222 000 444 8888888 77777 5555555555555 00 33333333333333333333333333333333 55 5555 2 888 666666666 33333 3333 0 000
consensus : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATNAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---T---TTAC-ATGA--TGTGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATG-TTGCTATATATTTGTA---T-----G---A---T---A---TAT---GCC-AT-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
Reference ( family-367 ) : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATNAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---T---TTAC-ATGA--TGTGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATG-TTGCTATATATTTGTA---T-----G---A---T---A---TAT---GCC-AT-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
gi|1 : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTT
gi|1 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGT---TATTAT-AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---TA--TTAC-ATGAGATGTGAAAA--TGAATGG-GGATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATG-TTGCTATATTTTTGTA---T-----G---A---C---A---TAT---GCC-CT-T--TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACAT-------T-----G-------TGTC-------TGC--TGAATA----AAATTATTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|10 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGG-GGAAATAG-CCCTCAGGAAATGGATATGACTTGAGATT-TTGCCCTATGTTCGTA--------------------------------------C--TCTACTCATTATATAACCCC-----CG-----A-------AAGTGTTAAGGCGATA--AACAT-------T-----GCAT----TGTT-------T
gi|11 : TGAAATT-TTGCTATATATTTGTA---T-----GTT-A---TT--A---TAT---GTC-AT-TC-TTTTCTCATTATATAACCGC-----TT-----A-------AGTTGTTAAG--TATGTTAACAT-------T-----GTATGA--TGTTTTA----TGC--TTAATA----AAATAATTGAATTGATTT---GTT---ATTTATTATAA-----aatgtttatgcagaatgtattgtaataacaatttaaccgagacatcatat
gi|12 : ATATC-CGA-ACATGTT------AAAATGTCATAAAATGATAGTTCAATTAATA---TGTATTAC-AT----TGTGCAAT--CATATAG-AGACATAG-GCCTCAGAAAATGG--ATGACTTGac
gi|13 : ---A---CAT---GC--------TCTTCTCATTATGTAACCGC-----CT-----A-------AATTATTAAGGCGATA--AACACTGTATGAT-----G-------TGTG-------TGC--TGAATA----AAA-----GAATCGAATT---G-----A---ATTATAAAGGAGCATAA---TAtttttttataaatatcacattg
gi|14 : ttg---TTAC-ATG-----TGGAAA--CATGTGG-GGAAATA------CA-------GATA-----TGGAATT-TTG--ATATATGTGTA---T-----G---GTATT---A---TAT---GAC--T-TGATCTTCCC---ATATCGCCGC-----CT-----G-------AAATGTTAAGGCGAcc
gi|15 : aaTGAAAA--AATATGG-AGAAATAC-GCCTCGGAAAATGGATATAACTTGAAATG-TTGCTATATATTTGTT---T-----GTTTT---T---A---TAT---GTC-ATAC--TCCTCTCACTATATAACCAC-----CT-----A-------a
gi|16 : GGCCTCAGATAATTGATATGAACTT---TTGCTATA------TATTTTTATGTTTATATAATGATGTGCATAAGCATTT
gi|17 : attatatgcgaagtaT------TAAATTTCATAAAATG-TA--T--A---------------AC-ATG-----TGAAAA--CATATGG-AGAAATAG-ACCT---AAAATGGATATGACTTGGAA-G-TT
gi|18 : accACATA-C-CAA-A------------------TCATAAAATGATA--C--ATTAATA---T---------------GTGAAAA--CATATGC-GAAAATAG-ATCTCTTAAAAGGGATATGACTt
gi|19 : GAAAATGGA----AAATTGTTTTACCATAATATTATATTTGTATGT---TATAAT-ATGT---CATGCTCTTCTCATTTTA-T
gi|2 : tAAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTaa
gi|2 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGT---TATTAT-AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---TA--TTAC-ATGAGATGTGAAAA--TGAATGG-GGATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATG-TTGCTATATTTTTGTA---T-----G---A---C---A---TAT---GCC-CT-T--TTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACAT-------T-----G-------TGTC-------TGC--TGAATA----AAATTATTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|20 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGAAATT---TTGTTAAA------TATGTGTATGT---TGTAAT-ATGTA---ATTCCCTTCTCATCGAACTGTTAAG
gi|21 : AAATGATA--T--ATCAATA---TA--TCACTAC-A--TGTGAAAA--CACATGGAGGAAATAG-GTCTCAGAAATTGg
gi|22 : ACAT--GCCTCGTATAATGGATATGACAAT---TTGCTATA------TATTTGTTTGT---TATTAT-A
gi|23 : tctaaaa--TGTGAATA--CATATGG-GGAAATAT-GTCTCAGAAAGTGGCTA-----TGAAATT-TTGCTATATATTAGTc
gi|24 : GAAATAG-GTCTCAGAAAATGGATA-----TGAAATG-TTATTTTATATTTGTA---T-----G---
gi|3 : CAGGCGAACCTA-CACAA-ACATGACATTCTGTAAATATCATAAAATGATA--T--A------------------AT-A--TGTGAAAAATCATATGA-GTAAAAAG-GCTTAAAAAAA--GAAATGA----AATTG-CT-CTGTATATTTGTG---T-----GTT-A---TG--A---TAT---GTC-ATGT--TCTTCTCATT-TATAACAGC-----CTTTATTG-------AACTGTTAGGGCGATG--AACAT-------T-----GAATGACGTATT-------TGC--TGCATA----AAATAAACGAATTTAATTATAG-----AAC-ATTA-AA-----TACAAATGCAT-CA---AAATtttata
gi|4 : ATGATA--T--ATTAATA---T---TAAT-TAAA--TGTAAAAA--CATATCA-GAAAATCT-GCCTGAGAAAGCGTAAAT------AAACGTTTGCTTTTTATTGATA---G-----G---T---T---ATGTTAT---GCCAAT-C--GTTTGTTATTGCATAACCACATGAATT-----G-------AATTGTTAAGGCGATG--GAAAT-------TTATG-A-------TGCC-------TGTGATAAATAAGATAAACAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAtgaattaattgtactaatactttatatgtcttggatattttcgtcagaaatatcaaattgttaatgaaatatatgtcaccatctcagcacaaatgataaaataattatgaaacattgttctgatgatataagactaaagatacgaaaacaataatttgataattgtgtgtgcgtgcgtgtgt
gi|5 : ataacatgcgcatatatatcA--TGTGAAAG--CATACAT-G--AGTAG-GTT---GAAAA------------AAAAT-----CTATAT---TGTA---T-----A---A---T---A---TGTCACGCC-AT-T------CTCATTATAAAACCGT-----CT-----GTGGGTTGAATTGATAATGCAATG--GACAT-------T-----G-------TATTGCGTATGTGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAGTG---GTTAAAA---ATGGTGA-----CAAAA---TGTATA---AAtagcaacttctgaatctgtta
gi|6 : ttaatatgaataaatagcataatttggtttgcACATTTTGCCTGAGCCAATATTTCAATATTGATAT--------GCATACTAGTATTTAATGTTTTACCATGATGTATGCGAGATAT----------------TGCG----AACATA-C-CAACATGTTAT-------AAATTCTTCAGAGT-ATT--T--ATTAATATTTT---TTAC-A--A---GTGAAAA--TATATGA-AGAAATAA-GCCTCAGAAAATTGATATGACTTG---TG-TTTGTATGTTCTTGTA---T-----T---A---T---A---Tgagttggcttaatcggtac
gi|7 : ttataaaatTTTCATAAAATGATA--T--ATT--TA---T---TTAC-ATG-----TGAAAA--CATATGA-AGAAAAAATATCTCAGAAAATGGATATG--T--AAGT--TTGCTATTTGTGTGTACGTT-----G---T---T---A---TGT---GTC-CTGC--TGTTCTCATTGCATAACCGC-----CT-----G-------AATTGTTAAGGTGATG--TACAT-------TTTGTGG-------TATTTG-----TGC--TGAGTG----AAAGAATTAAATTTAA
gi|8 : GG-GGAAA--A-GCCAAAAAACATGGATATGACTTGAAAGT-TTGGTATATATTTGTA---TTGTATG---A---T---A---TAT---GTC-ATGT--TCTTCCCATCATATAACCGC-----CT-----A-------TTGTGTTACGGCAATG--AACAT-------T-----GTATGA--TGTTTG-----TGC--TGAGTA----AAGGAATTGAATTGAATT---GTTAT-A---ATGATAA-----AACAA----AT-TAATCAAATAatcctattaatgcacatg
gi|9 : gaATAG-AGAAATAG-GCCTTAGATAATGGATATGA----AAAT--TTGCTTTATATTTGTA---T-----G---T---TTTTA---TAT---GCC-AT-GA-TCTTCTTATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTTAGGCGTTG--AACAT-------T-----GT------TGTTTG-----TGC--TTAATA----AAATAATTGAATTG--TT---G-----A---
blockSeqs : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T T GTT ATATTA TTA A G T GCA A C T T A G AA T T C C ATTCTGT GT CA TATTACATGAGAT AT A AT TGACT GT G TTGTATGAT TGT CAC ATTC ATGAA GTGGGTTG TT TGTATGATGTTTTA GA AGAT T ATA TTATTT AGGAG ATGC A ATC
blockSeqs : . A . . . A . T GCA T . . . . G CG . A . T A . . TGTATTACATT . . G TGACT T A TGTTATT . . TTGA . TTATTG . TGTATGATGTGTG . . T . TTAAAA . T . .
blockSeqs : A . . . T . A A A . . . . . . C T . . TATCACTACAT . . G TAACT T A TGGTATT . . ATAC . A . TGAATGACGTATT . . T . TTATA . T . .
blockSeqs : T . . . A . T . C . . . T T . . TTAATTAAAT . . C TGACT T A TGTTTTT . . ATGT . A . TGTATTGCGTATG . . C . AAC . T . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . TTTTTTACAA . . G TGACT G T TGTTATG . . AATC . A . TTTGTGGTATTTG . . T . A . .
blockSeqs : . . . TTTACATG . . G TGAAT G A CGTTGTT . . CTGC . G . TGTATGATGTTTG . . G . A .
blockSeqs : . . ACATG . . T TGACT G A TGTTTTT . . ATGT . A . TTATGATGCC . . G . A
blockSeqs : . . ATAT . . G TGACT T A TGAC . . ATGA . A . TGCATTGTT . . T . A
blockSeqs : . . T . . T TGA G A GGTT . . CTT . G . TGTTGTTTG . . .
blockSeqs : . . G TGT G T TAAT . . ATT . G . TGTGTC
blockSeqs : . . G TGA G G TTAT . . C . A
blockSeqs : . . T T T A . . . . . A
blockSeqs : . . G . . A .
blockSeqs : . A . . .
blockSeqs : . A . .
blockSeqs : . G .
blockSeqs : .
blockSeqCons : TTTACAT************ TGTTATT************** ATGC*** TGTATGATGTNTG*******************
originalCons : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATNAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATA---T---TTAC-ATGA--TGTGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATG-TTGCTATATATTTGTA---T-----G---A---T---A---TAT---GCC-AT-T--TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACAT-------T-----G-------TGTT-------TGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
finalCons : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATNAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATATTTACAT------------GTGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATG-TTGCTATATATTTGTATGTTATT--------------A---TAT---GCCATGC---TCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACATTGTATGATGTNTG-------------------TGC--TGAATA----AAATAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
Alignments
lowQualScore : 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 222222 111 1 1 2 2222222 222222222222 11111 111 1111111111111 1111111 333333333 11111 1111 111
lowQualScore : 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 1 444 333333 444 1 8 1 888 1 0 7 3 7 2 33 6 0 6 6 1111111 0 55 55 0 0 888888888888 3 44444 33 2 55 0 0 111 9 2 9999999 3 3 77777 4444444444444 55 3333333 00 3 1 0 8888 777 111111111 44444 3333 8 444
lowQualScore : ........................................................................... . . ... ...... ... . . . ... . . . . . . .. . . . . ....... . .. .. . . ............ . ..... .. . .. . . ... . . ....... . . ..... ............. .. ....... .. . . . .... ... ......... ..... .... . ...
lowQualScore : 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 8 000 000000 000 0 0 4 888 0 0 3 3 3 5 88 7 0 7 3 6666666 2 55 55 8 7 666666666666 1 33333 99 4 22 9 5 444 1 4 1111111 4 6 77777 5555555555555 00 9999999 88 6 0 7 5555 888 666666666 33333 3333 0 000
consensus : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATAAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATAT----T---T---ACAT-G-----TGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATGTT-GCTATATATTTGTATGTTAT--TATATGTCATGCTCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACATTGTA-----TGATG-TNTGTGCTGAATAAAATAA----TTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
Reference ( family-367 ) : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAATT---TTGCTATA------TATTTGTATGT---TATNAT-ATGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACATA-C-CAA-ACGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATAT----T---T---ACAT-G-----TGAAAA--CATATGG-GGAAATAG-GCCTCAGAAAATGGATATGACTTGAAATGTT-GCTATATATTTGTATGTTAT--TATATGCCATGCTCTTCTCATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAGGCGATG--AACATTGTA-----TGATG-TNTGTGCTGAATAAAATAA----TTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAA-----CACAA---TAT-TA---AAATAC
gi|1 : AAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTT
gi|1 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGT---TATTAT-AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATATA---T---T---ACAT-GAGATGTGAAAA--TGAATGG-GGATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATGTT-GCTATATTTTTGTATG--A---CATATGCCCT-TTTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACATTG----------TG-TC--TGCTGAATAAAATTA----TTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|10 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGG-GGAAATAG-CCCTCAGGAAATGGATATGACTTGAGATTTT-GCCCTATGTTCGTA-------------------CTCTACTCATTATATAACCCC-----CG-----A-------AAGTGTTAAGGCGATA--AACATTGCATTGTTTAATG-TTTATGCAGAAT
gi|11 : TGAAATTTT-GCTATATATTTGTATGTTAT--TATATGTCATTCTTTTCTCATTATATAACCGC-----TT-----A-------AGTTGTTAAG--TATGTTAACATTGTA-----TGATGTTTTATGCTTAATAAAATAA----TTGAATTGATTT---GTT---ATTTATTATAA-----gtattgtaataacaatttaaccgagacatcatat
gi|12 : ATATC-CGA-ACATGTT------AAAATGTCATAAAATGATAGTTCAATTAATATGTA-T---T---ACATTG-----TGCAAT--CATATAG-AGACATAG-GCCTCAGAAAATGG--ATGACTTGac
gi|13 : TGACATGCTCTTCTCATTATGTAACCGC-----CT-----A-------AATTATTAAGGCGATA--AACACTGTA-----TGATG-TGTGTGCTGAATAAAA---------GAATCGAATT---G-----A---ATTATAAAGGAGCATAA---TAtttttttataaatatcacattg
gi|14 : t----T---T---ACAT-G-----TGGAAA--CATGTGG-GGAAATA------CA-------GATA-----TGGAATTTT-G--ATATATGTGTATGGTAT--TATATGACTTGATCTTCCC---ATATCGCCGC-----CT-----G-------AAATGTTAAGGCGAcc
gi|15 : aa-----TGAAAA--AATATGG-AGAAATAC-GCCTCGGAAAATGGATATAACTTGAAATGTT-GCTATATATTTGTTTGTTTT--TATATGTCATACTCCTCTCACTATATAACCAC-----CT-----A-------a
gi|16 : GGCCTCAGATAATTGATATGAACTT---TTGCTATA------TATTTTTATGTTTATATAATGATGTGCATAAGCATTT
gi|17 : attatatgcgaagtaT------TAAATTTCATAAAATG-TA--T--A-------------------ACAT-G-----TGAAAA--CATATGG-AGAAATAG-ACCT---AAAATGGATATGACTTGGAA-GTT-
gi|18 : accACATA-C-CAA-A------------------TCATAAAATGATA--C--ATTAATAT-----------------G-----TGAAAA--CATATGC-GAAAATAG-ATCTCTTAAAAGGGATATGACTt
gi|19 : GAAAATGGA----AAATTGTTTTACCATAATATTATATTTGTATGT---TATAAT-ATGT---CATGCTCTTCTCATTTTA-T
gi|19 : tTATATTTGTATGTTAT--AATATGTCATGCTCTTCTCATTTTATAAaa
gi|2 : tgaaaatggaaaattgttttaccataatatAAAGGTAAGTTTTACTGTTCGATTGAAACAACTTATTTCGAACATTCACATGGAAGGTAATATGGAAACAAGGCCCGTTAAATGTTCAGGATTCCTTGTGTTGTAGTTTTATCAAATGTTGCAAATTCATCTTATTAAGATATAAAACTAGATTTGAGAGAAGCTTTTCATTACATGGGGCTAATAATATAAGAATTCATACTGTAATAGTTTAATATGTTTATTGTGTTAAGATCTCAAAGTGCTGTGTTCATCGGCGAAAACGAGTGTAAGATGTTAGCAAAATATGTTGGGTTGAAGATTTGGGATAGAGCAAATATACATTCAAAACGTATATTTGGAATTGTTTGTTTGGTTTAGTTTGGGATAGGTGTGAACACAACATTTCTTATTCAGCATGTATGTTAGTTATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGGTGGCATTTTATGTTATTACTATTGAATGACAAGAAACGCAAATATATGGAAGATTT
gi|2 : ATATGGTAATGTATAAACATAGAAATCACATATTCCAGACACCTTAAATCTTGCATCTCGTCACATCTTGGCAAACTGTTTGATAAAGATACATATGTGACAGCTGCATGAATGAAACATGTCAGAATGAAATCATGCATGGACGTGTTCCTAAAGTTTGGAAAACAGTGTATGATATATATTTCATAGGCTAAAATAACAATATCAATAAATGTATCTATTATCACCTGAATATTTGTTAACTGTTGAAAGTCATACAAGTATATATTGACGCGAAAAAGAATAAAAGCAACCAACAAATACACCACTTATTTTTACCCTGAAACATCTCCCTTCTGTGTTGAAATGAAATGTTAATCGATATATATATTATTGCCGCAAAGTCTCATTATTATTAAATATGTTTGCTGTAGATAACATTATGCCCCTCACTAACTGCGTTATAAAACAGTGTGGATTTACAATGCATGTTAGTTGAATACATGCAACTAACCCGAAAAGCATGCATATTGCATGACATTGGCCTCAGAAAATGGATATGAAGTT---TTGCTATA------TATTTGCATGT---TATTAT-AAGTGCATATGCATTTCTCACTGTA-TGCTAAGTGATCGGTCAGGATCAGTTTTTAAACGTTTAACCGGAGTCAATTTTGCAATATTATTATTTTCAATAACATGCTAG-ATTTGACGTTTTACAAATCTGTATGCGAGATATAATTTCTTACAGTCTGTACAGGAAAACAAA-CTCAA-ATGTGAT------TAAATTTCATAAAATGATA--T--ATTAATATA---T---T---ACAT-GAGATGTGAAAA--TGAATGG-GGATTTAT-CCCTCATAAAATGGAAATGAATTGAAATGTT-GCTATATTTTTGTATG--A---CATATGCCCT-TTTTTCTCATTATGCAGCCGC-----CT-----A-------AATTGTTAAAGCGATG--GACATTG----------TG-TC--TGCTGAATAAAATTA----TTGCATTGGATT---G-----A---ATTATCA-----CACAA---TAT-TA---AAATACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatggtaatgtataaacatagaaatcacatattccagacaccttaaatcttgcatctcgtcacatcttggcaaactgtttgataaagatacatatgtgacagctgcatgaatgaaacatgtcagaatgaaatcatgcatggacgtgttcctaaagtttggaaaacagtgtatgatatatatttcataggctaaaataacaatatcaataaatgtatctattatcacctgaatatttgttaactgttgaaagtcatacaagtatatattgacgcgaaaaagaataaaagcaaccaacaaatacaccacttatttttaccctgaaacatctcccttctgtgttgaaatgaaatgttaatcgatatatatattattgccgcaaagtctcattattattaaatatgtttgctgtagataacattatgcccctcactaactgcgttataaaacagtgtggatttacaatgcatgttagttgaatacatgcaactaacccgaaaagcatgcatattgcatgacattggcctcagaaaatggatatgaagttttgctatatatttgcatgttattataagtgcatatgcatttctcactgtatgctaagtgatcggtcaggatcagtttttaaacgtttaaccggagtcaattttgcaatattattattttcaataacatgctagatttgacgttttacaaatctgtatgcgagatataatttcttacagtctgtacaggaaaacaaactcaaatgtgattaaatttcataaaatgatatattaatatattacatgagatgtgaaaatgaatggggatttatccctcataaaatggaaatgaattgaaatgttgctatatttttgtatgacatatgcccttttttctcattatgcagccgcctaaattgttaaagcgatggacattgtgtctgctgaataaaattattgcattggattgaattatcacacaatattaaaatac
gi|20 : aaaggtaagttttactgttcgattgaaacaacttatttcgaacattcacatggaaggtaatatggaaacaaggcccgttaaatgttcaggattccttgtgttgtagttttatcaaatgttgcaaattcatcttattaagatataaaactagatttgagagaagcttttcattacatggggctaataatataagaattcatactgtaatagtttaatatgtttattgtgttaagatctcaaagtgctgtgttcatcggcgaaaacgagtgtaagatgttagcaaaatatgttgggttgaagatttgggatagagcaaatatacattcaaaacgtatatttggaattgtttgtttggtttagtttgggataggtgtgaacacaacatttcttattcagcatgtatgttagttatatatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttggtggcattttatgttattactattgaatgacaagaaacgcaaatatatggaagatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATGAAATT---TTGTTAAA------TATGTGTATGT---TGTAAT-ATGTA---ATTCCCTTCTCATCGAACTGTTAAG
gi|21 : AAATGATA--T--ATCAATATATCAC---T---ACAT-G-----TGAAAA--CACATGGAGGAAATAG-GTCTCAGAAATTGg
gi|22 : AAACAT-GCCTCGTATAATGGATATGAC----AAT-TT-GCTATATATTTGTTTGTTAT--TATA
gi|23 : tctaaT-G-----TGAATA--CATATGG-GGAAATAT-GTCTCAGAAAGTGGCTA-----TGAAATTTT-GCTATATATTAGTc
gi|24 : GAAATAG-GTCTCAGAAAATGGATA-----TGAAATGTT-ATTTTATATTTGTATGT--T--TATA
gi|3 : CAGGCGAACCTA-CACAA-ACATGACATTCTGTAAATATCATAAAATGATA--T--A-------------------ATAT-G-----TGAAAAATCATATGA-GTAAAAAG-GCTTAAAAAAA--GAAATGA----AATTGCT--CTGTATATTTGTGTGTTAT--GATATGTCATGTTCTTCTCATT-TATAACAGC-----CTTTATTG-------AACTGTTAGGGCGATG--AACATTGAA-----TGACG-TATTTGCTGCATAAAATAA----ACGAATTTAATTATAG-----AAC-ATTA-AA-----TACAAATGCAT-CA---AAAT
gi|4 : ATGATA--T--ATTAATAT----TAATT---AAAT-G-----TAAAAA--CATATCA-GAAAATCT-GCCTGAGAAAGCGTAAAT------AAACGTTTGCTTTTTATTGATAGGTTAT--GTTATGCCAATCGTTTGTTATTGCATAACCACATGAATT-----G-------AATTGTTAAGGCGATG--GAAATT-TA-----TGATG-CCTGTGATAAATAAGATAAACAATTGAATTGAATT---G-----A---ATTATAtgaattaattgtactaatactttatatgtcttggatattttcgtcagaaatatcaaattgttaatgaaatatatgtcaccatctcagcacaaatgataaaataattatgaaacattgttctgatgatataagactaaagatacgaaaacaataatttgataattgtgtgtgcgtgcgtgtgt
gi|5 : ataacatgcgcatatatatcT----T---T---GCAT-G-----TGAAAG--CATACAT-G--AGTAG-GTT---GAAAA------------AAAAT-----CTATAT---TGTATA-------ATATGTCACGCCATTCTCATTATAAAACCGT-----CT-----GTGGGTTGAATTGATAATGCAATG--GACATTGTA-----TTGCG-TATGTGCTGAATAAAATAA----TTGAATTGAGTG---GTTAAAA---ATGGTGA-----CAAAA---TGTATA---AAtagcaacttctgaatctgtta
gi|6 : ttaatatgaataaatagcataatttggACATTTTGCCTGAGCCAATATTTCAATATTGATAT--------GCATACTAGTATTTAATGTTTTACCATGATGTATGCGAGATAT----------------TGCG----AACATA-C-CAACATGTTAT-------AAATTCTTCAGAGT-ATT--T--ATTAATAT----T---TTTTACAA-G-----TGAAAA--TATATGA-AGAAATAA-GCCTCAGAAAATTGATATGACTTG---TGTT---TGTATGTTCTTGTATTAT--gagttggcttaatcggtac
gi|7 : ttataaaatTTTCATAAAATGATA--T--ATT--TAT----T---T---ACAT-G-----TGAAAA--CATATGA-AGAAAAAATATCTCAGAAAATGGATATG---T-AAGT-TT-GCTATTTGTGTGTACGTTGT--TATGTGTCCTGCTGTTCTCATTGCATAACCGC-----CT-----G-------AATTGTTAAGGTGATG--TACATTTTG-----TGGTA-TTTGTGCTGAGTGAAAGAA----TTAAATTTAAat
gi|8 : GG-GGAAA--A-GCCAAAAAACATGGATATGACTTGAAAGTTT-GGTATATATTTGTATTGTATGATATATGTCATGTTCTTCCCATCATATAACCGC-----CT-----A-------TTGTGTTACGGCAATG--AACATTGTA-----TGATG-TTTGTGCTGAGTAAAGGAA----TTGAATTGAATT---GTTAT-A---ATGATAA-----AACAA----AT-TAATCAAATAatcctattaatgcacatg
gi|9 : gaATAG-AGAAATAG-GCCTTAGATAATGGATATGA----AAAT-TT-GCTTTATATTTGTATGTTTT--TATATGCCATGATCTTCTTATTATATAACCGC-----CT-----A-------AATTGTTTAGGCGTTG--AACATTGT---------TG-TTTGTGCTTAATAAAATAA----TTGAATTG--TT---G-----A---