lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11111111111111111111111                                                                                                                                 
lowQualScore                  :                                                                                                              11111     1111                                     22            1   22222     11                                      11                                                        111                                   3                  1                                 111                            333333        22                                                55555555555555                                               1        1     1                                      222   1                    33333333333333               222                                           333333333                  1111                                1                 1               111       11       1                                   222                       111111       11111           44444444444444444444444         1111111                                 11111                       11                                1      11111111                                      1                 111              1                                    1                         1                                                                 1                          11                                                        11  1     11                                77777777    1                11      22    222     2      33333333333       22222222222222222222222                   7777777                  6666666666666666666666666          1                           1     22              
lowQualScore                  :                                                      2                                              5        88888   2 0000   2    77        2    0        8    00       0    5   55555  0  00       0 8888   66 5  5    5 3        22                                   5     888     5   0  000            6        7             4   5   1          5      4 4    66      3       4   111      88    2     4   2     111111        77        4  6                 2                  00000000000000                                      9        5        0     6        1             0 3    0        888   0     0 9            33333333333333               000        3             0  1        3        222222222              8   7777  4        2        0           0      3      3   0      8      9 777  3    33   4   3             7                7    333                       999999       88888 0 3   2   88888888888888888888888   0     6666666    4               3  9999      88888             3    8  0 11  8    6                6  1    0   8  99999999 8          0   44      6   8 3   6   3              2  777    6     9   0     3                          3   6                         7                    4                                            6           6        4     22    3          6      0                  0      3       33  0     33 3   7 0       4    6     6     33333333    7  4       4     77      77    111   3 8      44444444444  4    22222222222222222222222 4                 7777777      6     6     9999999999999999999999999          5       1       6  0        7     33  4 2  4      
lowQualScore                  :                                                      .                                              .        .....   . ....   .    ..        .    .        .    ..       .    .   .....  .  ..       . ....   .. .  .    . .        ..                                   .     ...     .   .  ...            .        .             .   .   .          .      . .    ..      .       .   ...      ..    .     .   .     ......        ..        .  .                 .                  ..............                                      .        .        .     .        .             . .    .        ...   .     . .            ..............               ...        .             .  .        .        .........              .   ....  .        .        .           .      .      .   .      .      . ...  .    ..   .   .             .                .    ...                       ......       ..... . .   .   .......................   .     .......    .               .  ....      .....             .    .  . ..  .    .                .  .    .   .  ........ .          .   ..      .   . .   .   .              .  ...    .     .   .     .                          .   .                         .                    .                                            .           .        .     ..    .          .      .                  .      .       ..  .     .. .   . .       .    .     .     ........    .  .       .     ..      ..    ...   . .      ...........  .    ....................... .                 .......      .     .     .........................          .       .       .  .        .     ..  . .  .      
lowQualScore                  :                                                      8                                              7        00000   5 6666   6    22        2    5        8    66       8    5   00000  2  99       5 0000   99 6  1    0 1        22                                   0     888     6   2  000            0        3             3   7   4          0      0 0    55      0       5   555      00    5     0   5     000000        55        0  0                 5                  55555555555555                                      0        0        6     0        4             8 2    8        000   6     6 6            00000000000000               888        2             8  0        8        000000000              0   0000  6        5        2           0      2      2   0      2      0 555  2    88   0   3             3                3    333                       888888       55555 8 2   5   22222222222222222222222   2     0000000    0               2  4444      44444             2    0  8 00  0    4                4  0    8   0  22222222 0          8   88      0   0 8   0   2              0  555    0     8   0     2                          2   6                         0                    0                                            0           0        7     55    2          0      2                  2      2       88  0     88 2   0 2       0    0     0     00000000    0  0       0     55      55    000   0 5      55555555555  0    55555555555555555555555 0                 5555555      7     7     3333333333333333333333333          0       0       0  7        0     00  0 5  0      
consensus                     :                     ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAA--CT-TTGGC----TCANAGTTNNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTTAGTAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA-NTGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACAC-GATTT---TTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAG-GGATTCGTCAACTTCGCGGTTNANTAACNNTAAATANTCTTCAACAGCNNNCCTATGNNCCCTNCGAAANTCTNTTTTTGNT---TTTTTATAGTTGAGATATNTGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGCTCTAAATTTAGCCTTCGGGATATATGTATGTGACGAACTTTCAATTAACGATGATACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTC-C-ATTCGTATCGACAATATCACCTTGTAATAAACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCA---AAACTATTAGCGNTTA-ACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACGG-ANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATT-GACAAGATCANNTCGCTCTTG-TGAA--ATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCNCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----G-CGTACGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAACGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTNAGATGTGCATTTACGTCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTNACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGCAAGTAAACTTGTAAGATATACATNAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGGACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTANCATTCCATAAAATAGCAATATATTCCTTTCGNGCGTTGCNCACACCGGGGACGTTCGCAAGTCATNGACACATANGGCNTNGCAATTNACATATAANATC-ATACATTGTTNATTANAAATGTAAATCGATCCCGCGTAA-CCAGTGGTCAGATATACCACAGAAGTC---AACGCTCTC----TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTAGACATGATACCAGTTGCANTNCANGTTAAA
Reference ( gi|2 )            :                     ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAA--TT-TTGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACACCA-----GTGCA-ATGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACAC-GATTT---TTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTTCAAAATGTTATACTATCAAGTT-AAG-GGACTCGTCAACTTGGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT---TTTTTATA--TGAGATATATGCATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTAACCAGTATTGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACAAACT---AATTAACGATGGTACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTC-T-ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCCCTGTATAA---AAACTATAAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAG-ATCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AACATT-GATAAGATCAGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----G-CGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACGTCTGTCACCAATGTCCT---TGGACTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATATCTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATAAAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAATTAAATTTGTAAAATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAGATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTTCATAAGATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGACA-TTTATATTTGCTATCGATACA--GTAAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-TGTAAGCCAGTGCTCAGAGATACCGTAGAAATC---AATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTAACATTCCATGTTAAAATGG
gi|1                          :                     ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAA--TT-TTGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTACA-TTGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CACCAAATGTCATTTCATTACCTACAGAATTACAC-GAGTT---TTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAG-GGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAAGAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT---TTTTTATA--TGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATTGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTCACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGATACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTT-C-ATTCGTTTCAACAATATCACCTTGTAATAAATAAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCA---AAACTATTAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAG-AGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGCATT-GATAAGATCAGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCACCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----G-CGTATGGTTATTGATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTCCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAGTAAATTTGTAAGATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAAC
gi|10                         :                    gACACCTCAACTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAA--CT-TTGGC----TCATAGTTTAAATGATCA-ATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGC--ATGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-C-AAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTTCAGAATTACAC-GATTT---TTGCCTACGGCT---GTTTATAACCTTCCAAACTGTCATACTATTATGTTCAAG-GGATTCGTCAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|9                          :                    gACACCTCAGCTA-TGATACAGTCGAAGAGTTATTAACAAATAACTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAA--CT-TTGGC----ACATAGTTATACTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAATTAATTACCCAA-----GGACA-TTGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTGCAGAATTACAC-GATTT---TTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTGCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAG-GGATTCGTCAACTT
gi|20                         :                    gACACCCGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTc
gi|12                         :                     gCACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTTTCAATGTCT-GTTTTAAA--CT-TTGGC----TCATAGTTTAATTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACTCCA-----GTGCA-TTGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCAAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATTACAC-GATTT---TTGCTGCCGG
gi|4                          :                                                                                              AATATCT-TCCTTGAAGGTA-CTG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATTCATATGCA-ATGCTATTAG--AATCC--G-AT---------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTAAATT--AT-TATAT---TTGCT-TTTTCTCAAATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTT-CAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTGATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTCTTTTT--TCCATTTTTATAGTTAAGA
gi|8                          : tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaAATATCT-TCCTTAAA-------GGCACTATCAAAATTGTGATTATTGGATGGCGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCTCCATTCTTATGCG-GTGCTATTAGAAT-CCC--G-AT---------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTAaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattccagtagggttttaaaaactttctaaactttgccttcgggatactcatatcagaagctttcaataaagagattacaagtgtgtcatataaattgccaatttgtgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcgttatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcggtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttacttcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtctaaatgttcttcacatataataatatgatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatacacccaaggtattatcagaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagcgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          :  ttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaatacgcgactatgcaattgaataagcttttcagaAATATCTTACTTTAAG--GTACTG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCA-----TT-CATATACAAT--G--C-TATAAGAATCCCGATCAACGATAC---CACCAAACTT-ATTTCATTACCTATTAAATTATTA-GATTTGCTTTTTC-TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAAC-AGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTACGAACTCTTCAAAATTCTCTGTTTACA---TTTTTATAGTTAAGAtttatttattagatatgccttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcagcagcc
gi|3                          :                     ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaT-TTGGC----TCACAATTTAAATGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA-TTGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACAAT--CGCCAAATTTCATTCCATTACCTACAGAATTACAC-G---T---TTGCCGTCGACT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACCATCAAGTTCAAG-GGATTCGTCAACTTCACGGTTTAATAGCAGTAAATATTCTTCAATAGCACGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGTT---TTTTTATA--TGAGATATTTGTATCTAAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGAC--------------AATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTGGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACA---AATTAACGATGATACTAGTGTCTTTTATAGTGTCTTTTATAGAACACCAATTC-C-ATTCGTATCAACAATATCACCTTGTAATAAGTGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAAAGTGTACGGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTTTGTATCA---AAACTATTAGTGGTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACCACAGAACACA---GGCCTATGTAAAGACACATTAACAG-AGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGC-----------TC---TTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAACTTTTAGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AT-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----G-CATATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTTAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACCCTACCCCAGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTAACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGCAAATAAACTTGTAAGATATACATTAAGCA-GTGTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAaaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattccagtacgatttttaaaactttctaaactttgtcttcgggatacacatatcagaagctttcaataaagagattacaaatgtgtcatataaattatcaatttgtgattgaaatacaatgttaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaacatagtttactaaattctgagtagtcgacttctcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcattatagagactgcacatacaattggtctatgagtttaaacatttactgcatcgtcatc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                             AAAACATT--TGTCAAATTTCATTTCATTACCTACAGAATAACACAGATTT---TTGCCGTCGCCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTGAAACTATCAAGTTCAAG-GGATTCGT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCCTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGATACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTC-C-ATTCGTATCAATAATATCACCTTGTAATAAACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-AGA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAAACTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAGT-CTAGGCTCTGTATCA---AAACTATTAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCAGTAGGGTTTTAAA-AACTTTCTAAACTTTGCCTTCGGGATAC-T-CATATCAGAAGCTTTCAAT-AAAGAGATTACAAGTGTGTC-------AT-----ATAAATTGCCAATTTGTGATTGAAAT--ACAATGTCAACT--------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCGTTATCTAACATATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGTAGTCGACTTTTC-CCATTT-AGTTCTTGGTACTGAATAATGTGA--TATA--CACTCAGACTCAACATGCGG--TATAGAGACTGCACA-TACAATTGGTCTATGAGTTGAAACATTTAC----TTCATCGTC-ATCTAGAATTTCACATCTTAACAC-----AAGGTCTAAATGTTCTTC-ACAT--ATAATAATATGATCTATCAAAGA----TTCATTAACAAGATCATATGACAC--ATA-GGTCGAAT-TAGCACCAGTACATACACCCAAGGTATTATCAG-AAAGTAAATTG-TGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAAT-TACCTCTTACGTCAACATTCTTAGTGAATTTTCT---A-GAGTTAATATGAGCGTTAATGTCTCCCATAATCATAATTCGACCTTTGaagtctgagtatgaggtggtgattttcatgagcataaaccccccagtgatacagctctatataaa
gi|5                          :                                      tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttccttgaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccgataaacgttaccaccaaacttcatttcattacctattaaattattatatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattgattttaaatagttttcaacagctatcctatgaactcttcgaaattctcttttttccatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattCCAGTACGATTTTTAA-AACTTTCTAAACTTTGTCTTCGGGATACACATATC--AGAAGCTTTCAAT-AAAGAGATTACAAATGTGTC-------AT-----ATAAATTATCAATTtgcatatacatgtttgtaat
gi|17                         :                                                                                                                       ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttactttaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatacaatgctataagaatcccgatcaacgataccaccaaacttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcaacagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagctatcctacgaactcttcaaaattctctgtttacatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattTAGTGTCTT--------T-----AAAAAACACTGATTC-G-ATTTGTATTGACATTATCAATTTGTTATGAATAAGGAAAATCA---------ACATGTTGATTTAA-AGA----CAACGAGCACTtgtgattgaaatacaatgttaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaacatagtttactaaattctgagtagtcgacttctcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcattatagagactgcacatacaattggtctatgagtttaaacatttactgcatcgtcatc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACACGTTAAAGGCAT-TGTCGTCTA---ACA-TTT--------AACATTTAACAACATAATCTCAATCTTGATACAGCATAATGATATGATCTATTAA---------TAAT--T--CATTATAGGAAACAAAGGTAG----ACTTTGCTCCTGTACATATATCAAAG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attgtacatataaatgacgaatgatttaGAGCTTTCTGTT--T--CATTATATGAAAAGAACT-AGTT--AC-TAGCTCCAGTGCACATGTCAA----------TGCAT--------G-CGTGTGGTTGTTTATTTAGGTCAGCA-ATAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TTGATTGTTTTGAAAGAGTTGAGTTGTACATTTACATCTCCCATTAATATAACTATGCCCCTCGTAGAGTAGTAATA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAGCTA-CTG-ATAC-A----GTCGAACAGTTATTAACAAATATC-TCA-G-AATTCACATTTGTCAt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cacctGTTTAGGTGTACATTTACTTCTTCCATTAA-----CTTTGCGCCTAGTTGAGTAGTAAttttattttcaatgtctgttttaaactttggctcatagtttaattgatcaaatggagtgtataactgtttaaagtaattactccagtgcattgtaatttgttttgcatttctacaaaaacattcgcaaaatttcatttcattacctacagaattacacgatttttgctgccgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gatattttgaggtgtATACACGAAGCAAGATTT--GAACACTCAAATTTGATTCCAGTTATTCTATCATCATCTATT-----GACGATGTAGCCATTCTATTGGAATGTCTATCATTCCATAAAATAGCAATATATTCCTTTCGAACATTGCTTATAC--AAGATGTTCGCA---CATCG-CACATATGG-GTGATAATTTACAT--AAAATC--TACATTGTTAA--ATAAATGTAAATCGATTCCGCGTAA-CCAATGCTCAGAGATGCCACAGAAGCC---AACATTTTCGTTTTTTAAACTATAACATAAGCAAGAAAAACTAGATATAATACCTGTTGCAATCCAAGTTAAAatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aattgagaaatacatgacttgaatgaaAAATA--TTGTTTCAATATTTCAATTGGAAACCTGTTATTCTATCGTCTTCTATTTGAAGGCC--TG-AAAAA--C-GTT-GTGTGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTGTGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGACACATAAAACTTTGCA-TTAATATATA-TAT--ATATA--ATTCATTAAAAATGTAAATCGATCTC-C-----CCAGTGGTCAGATATACCAC---AATCTTTATTGCTC------TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGACACTAGTgcacacaccggggacgcgcaagtcatagacacataaaactttgcattaatatatatatatataattcattaaaaatgtaaatcgatctccccagtggtcagatataccacaatctttattgctctttaatatatgacataaacatgtgcaactggacatgacactagttg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaatattgtttcaatatttcaattggaaacctgttattctatcgtcttctatttgaaggcctgaaaaacgttCAGTGGCCAGATATACCACAAACGTT---AATGCTCTT------TAATATATGACATTAATATGTGCAACTAGACATGATACCAGTTGCATTGCATtg
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGTAATTATCTCTTACGTCAATATTCTTAGTGAATTTTCTAGAATTAAAGTGAGCGTTAATGTCACCCATGATCGTAATTCGACCTTTGTGCATATACATGTTTACAATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             33                22222                                             11                                                                                                                                                                                                  22                                                                                                                            2                                      333                          22222222222222               111                                              444444444              111111  1111                                1                                1        1         1                                   222                       1111          111           3333333333333      111111            11                                 11111                                                                    1111                                                       111                                                                                                                                                                          1                                                         11        11                                                                     33            1               11        444444444    11     33                   3333333                                   44444                                                     1      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 5        888888  1 9999   1    22       4     2        3    00                22222     99         66 4   66 3  3    4 1        11                            777   55    4    777      2   33 777                  0                                         1 1    22      1       1   333      22    1     1   1      888        55        1                   0                   6                    0                              0                 7     3              0                 77    333         7  6 6           55555555555555               000      5  44         4     5    77    0        555555555              444444  2222  2       33                    3     55         6 6      2      0        3  6  1   6       1     11      0      5 0    888        1  1           5555        6 111   0       1111111111111      777777       8    11    1                  9     6   33333             1    6    99  6    1                3  1    1   8  0   7777     2     0   0           8     0               2     444          6   8     1              4                                       0                      1                                         0  3                    1     0     0                                           0       11  8     11 0   3         1                4  8888        11      1     6       00    7     1 6      11 77 11 44  1 0   666666666    55   1 00 1               0 5555555      2     3          33    2 6   99999          0                                     1 1  4      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        ......  . ....   .    ..       .     .        .    ..                .....     ..         .. .   .. .  .    . .        ..                            ...   ..    .    ...      .   .. ...                  .                                         . .    ..      .       .   ...      ..    .     .   .      ...        ..        .                   .                   .                    .                              .                 .     .              .                 ..    ...         .  . .           ..............               ...      .  ..         .     .    ..    .        .........              ......  ....  .       ..                    .     ..         . .      .      .        .  .  .   .       .     ..      .      . .    ...        .  .           ....        . ...   .       .............      ......       .    ..    .                  .     .   .....             .    .    ..  .    .                .  .    .   .  .   ....     .     .   .           .     .               .     ...          .   .     .              .                                       .                      .                                         .  .                    .     .     .                                           .       ..  .     .. .   .         .                .  ....        ..      .     .       ..    .     . .      .. .. .. ..  . .   .........    ..   . .. .               . .......      .     .          ..    . .   .....          .                                     . .  .      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 0        777777  1 4444   0    00       4     0        9    33                22222     88         11 4   11 9  6    4 8        00                            000   55    0    000      5   44 888                  7                                         0 0    00      0       4   000      00    0     0   0      222        44        0                   7                   7                    7                              2                 3     7              7                 77    222         3  7 7           66666666666666               999      7  44         3     1    99    1        777777777              666666  1111  7       99                    3     77         7 7      2      8        3  7  0   0       4     88      6      0 8    000        4  4           2222        7 777   8       6666666666666      000000       0    00    0                  3     3   77777             0    7    22  7    0                7  0    0   0  8   0000     8     8   8           0     8               8     000          0   0     0              8                                       8                      0                                         7  7                    0     0     8                                           8       00  0     00 8   8         0                0  5555        77      0     7       77    3     0 0      77 77 77 77  0 7   333333333    00   0 77 0               7 7777777      5     0          22    0 5   00000          2                                     0 0  0      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA-NTGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC-AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAANTAAACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-GTTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTCG-C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCCA-GTTAAA
Reference ( family-3624 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCANAGTTNNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTTAGTAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA-NTGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTNANTAACNNTAAATANTCTTCAACAGCNNNCCTATGNNCCCTNCGAAANTCTNTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATNTGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGCTCTAAATTTAGCCTTCGGGATATATGTATGTGACGAACTTTCAATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGCGNTTA-ACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACGGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC-ANNTCGCTCTTG-TGAA--ATAANAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCNCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTACGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAACGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTNAGATGTGCATTTACGTCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTNACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGCAAGTAAACTTGTAAGATATACATNAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGGACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTANCATTCCATAAAATAGCAATATATTCCTTTCGNGCGTTGCNCACACCGGGGACGTTCGCAAGTCATNGACACATANGGCNTNGCAATTNACATATAANATC-ATACATTGTTNATTANAAATGTAAATCGATCCCGCGTAA-CCAGTGGTCAGATATACCACAGAAGTCAACGCTCTC----TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTAGACATGATACCAGTTGCANTNCANGTTAAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTACA-TTGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CACCAAATGTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GAGT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAAGAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATTGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTCACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTTC--ATTCGT-TTCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATAAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATC-AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCACCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTGATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTCCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAGTAAATTTGTAAGATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACACCTCAACTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATC-AATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA--TGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-C-AAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTTCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCTACGGCT---GTTTATAACCTTCCAAACTGTCATACTATTATGTTCAAGGGATTCGTCAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gTTGTTTCAATATTTCAATTGGAAACCTGTTATTCTATCGTCTTCTATTTGAAGGCC--TG-AAAAA--C-GTT-GTGTGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaataTTGTGTGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGACACATAAAACTTTGCA-TTAATATATA----T-ATATATAATTCATTAAAAATGTAAATCGATCTC-C-----CCAGTGGTCAGATATACCACAATCTTTATTG--CTC----TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGACACTAGTTGgcacacaccggggacgcgcaagtcatagacacataaaactttgcattaatatatatatatataattcattaaaaatgtaaatcgatctccccagtggtcagatataccacaatctttattgctctttaatatatgacataaacatgtgcaactggacatgacactagttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatattgtttcaatatttcaattggaaacctgttattctatcgtcttctatttgaaggcctgaaaaacgCACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTTTCAATGTCT-GTTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAATTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACTCCA-----GTGCA-TTGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCAAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCTGCCGG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAGCTTTCTGTT--T--CATTATATGAAAAGAACT-AGTT--AC-TAGCTCCAGTGCACATGTCAA----------TGCAT--------GCGTGTGGTTGTTTATTTAGGTCAGCA-ATAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TTGATTGTTTTGAAAGAGTTGAGTTGTACATTTACATCTCCCATTAATATAACTATGCCCCTCGTAGAGTAGTAATAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACACGTTAAAGGCATTGTCGTCTA---ACA-TTTAACA----T---TTAACAACATA-ATCTCAATCTTGATACAGCATAATGATATGATCTATTAATAA---------T--T--CATTATAGGAAACAAAGGTAG----ACTTTGCTCCTGTACATATATCAAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attgtacatataaatgacgaatgatttaAAAACATT--TGTCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATA--ACACAGATT---TTTGCCGTCGCCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTGAAACTATCAAGTTCAAGGGATTCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAGTGTCTT--------T-----AAAAAACACTGATTCG--ATTTGT-ATTGACATTATCAATTTGTTATGA--ATAAGGAAAATCA---------ACATGTTGATTTAA-A----GA----CAACGAGCACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGTGGCCAGATATACCACAAACGTTAATGCTCT------TTAATATATGACATTAATATGTGCAACTAGACATGATACCAGTTGCATTGCA---TAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTTAGGTGTACATTTACTTCTTCCATT-----AACTTTGCGCCTAGTTGAGTAGTAA-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatattttgaggtgtACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACACCA-----GTGCA-ATGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTTCAAAATGTTATACTATCAAGTT-AAGGGACTCGTCAACTTGGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGCATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTAACCAGTATTGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACAAACT---AATTAACGATGG-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCT--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCCCTGTATAAAAACTAT-AAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGATCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AACATTGATAAGATC-AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACGTCTGTCACCAATGTCCT---TGGACTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATATCTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATAAAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAATTAAATTTGTAAAATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAGATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTTCATAAGATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGAC-ATTTATATTTGCTATCGATACA--GTAAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-TGTAAGCCAGTGCTCAGAGATACCGTAGAAATCAATGCTCTTGGCATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTAACATTCCATGTTAAAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCCGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTatgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-T--TGGC----TCACAATTTAAATGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA-TTGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACAAT--CGCCAAATTTCATTCCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-G------TTTGCCGTCGACT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACCATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCACGGTTTAATAGCAGTAAATATTCTTCAATAGCACGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGTT-TTTTTATA--TGAGATATTTGTATCTAAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGAC--------------AATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTGGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAAC---AAATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTTTTATAGTGTCTTTTATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--GTGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACGGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTTTGTATCAAAACTAT-TAGTGGTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACCACAGAACACA---GGCCTATGTAAAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGC----------TC----TTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAACTTTTAGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AT-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCATATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTTAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACCCTACCCCAGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTAACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGCAAATAAACTTGTAAGATATACATTAAGCA-GTGTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTGAAGG-TACTG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATTCATATGCA-ATGCTATTAG--AATCC--G-AT---------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTAA---ATT--AT---TATA---TTTGCTTTTT-CTCAAATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTGATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTCTTTTTTCCATTTTTATAGTTAAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTAGGGTTTTAAA-AACTTTCTAAACTTTGCCTTCGGGATACTCATATCAGA--AGCTTTCAAT-AAAGA-GA-TTACAAGTGTGTC-------AT-----ATAAATTGCCAATTTGTGATTGAA-AT--ACAATGTCAACT----------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCGTTATCTAACA----TATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGTAGTCGACTTTTC-CCATTT-AG-TTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGCGG--TATAGAGACTGCACA-TACAATTGGTCTATGAGTTGAAACATTTAC---TTCATCGTC-ATCTAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGTCTAAAT-GTTCTTC-ACAT--ATAATAATATGATCTATCAAAGA----TTCATTAACAAGATCATATGACAC--ATA-GGTCGAAT-TAGCACCAGTACATACACCCAAGGTATTATCAG-AAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAAT-TACCTCTTACGTCAACATTCTTAGTGAATTTTCT---A-GAGTTAATATGAGCGTTAATGTCTCCCATAATCATAATTCGACCTTTGaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattccagtagggttttaaaaactttctaaactttgccttcgggatactcatatcagaagctttcaataaagagattacaagtgtgtcatataaattgccaatttgtgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcgttatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcggtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttacttcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtctaaatgttcttcacatataataatatgatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatacacccaaggtattatcagaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagcgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          : tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttccttgaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccgataaacgttaccaccaaacttcatttcattacctattaaattattatatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattgattttaaatagttttcaacagctatcctatgaactcttcgaaattctcttttttccatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattAATATCTTACTTTAAGGTAC--TG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGG--TGTATACAAGTCAGCAAAGTATTTGCCCCA------TTCATATACAA--TG--C-TATAAGAATCCCGATCAACGATA-C--CACCAAACTT-ATTTCATTACCTATTAA---ATT--ATTA-GATTTGCTTTTTC-TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAACAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTACGAACTCTTCAAAATTCTCTGTTTACA-TTTTTATAGTTAAGAtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTACGATTTTTAA-AACTTTCTAAACTTTGTCTTCGGGATACACATATCAGA--AGCTTTCAA-TAAAGA-GATT-ACAAATGTGTC-------AT-----ATAAATTATCA-------ATTTGTGATTGA-AATACAA---TGT--TAACTACG-AGCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTAA----CATAGTTTAC-----TAAATTCTGAGTAGTCGACTTCT-CCCA-TTTAGTT-CTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGC--ATTATAGAGACTGCA-CATACAATTGGTCTATGAGTTTAAACATTTACTG---CATCGTC-A---aaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattccagtacgatttttaaaactttctaaactttgtcttcgggatacacatatcagaagctttcaataaagagattacaaatgtgtcatataaattatcaatttgtgattgaaatacaatgttaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaacatagtttactaaattctgagtagtcgacttctcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcattatagagactgcacatacaattggtctatgagtttaaacatttactgcatcgtcatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttactttaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatacaatgctataagaatcccgatcaacgataccaccaaacttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcaacagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagctatcctacgaactcttcaaaattctctgtttacatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattACTTGAATGAAATACACGAAGCAAGATTT--GAACACTCAAATTTGATTCCAGTTATTCTATCATCATCTATT-----GACGATGTAGCCATTCTATTGGAATGTCTATCATTCCATAAAATAGCAATATATTCCTTTCGAACATTGCTTATAC--AAGATGTTCGCA---CATCG-CACATATGG-GTGATAATTTACATA--AAATC--TACATTGTTAA--ATAAATGTAAATCGATTCCGCGTAA-CCAATGCTCAGAGATGCCACAGAAGCCAACATTTTCGTTTTTTAAACTATAACATAAGCAAGAAAAACTAGATATAATACCTGTTGCAATCCAAGTTAAAtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aattgagaaatacatgTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCCTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCC--ATTCGT-ATCAATAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAAACTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTAAA-------GGCACTATCAAAATTGTGATTATTGGATGGCGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCTCCATTCTTATGCG-GTGCTATTAGAAT-CCC--G-AT---------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTTATTTATTAGATAT-GCCT---TTT-C--TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAaagtctgagtatgaggtggtgattttcatgagcataaaccccccagtgatacagctctatataaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaatacgcgactatgcaattgaataagcttttcagaACACCTCAGCTA-TGATACAGTCGAAGAGTTATTAACAAATAACTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----ACATAGTTATACTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAATTAATTACCCAA-----GGACA-TTGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTGCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTGCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCgcagcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGTAATTATCTCTTACGTCAATATTCTTAGTGAATTTTCTAGAATTAAAGTGAGCGTTAATGTCACCCATGATCGTAATTCGACCTTTGTGCATATACATGTTTACAATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                22222                                             11                                                                                                                                                                                                  22                                                                                                                            1                                      222                          22222222222222               111                                              444444444              111111  1111                                1                                1        1         2                                   333                       1111          111           3333333333333      1111111            11                                 11111                                                                    1111                                                       111                                                                                                                                                  111                        1                                                         11        11                                                                     11            2         11    11         33333333    2222    11                   2222222                                   66666666                                                   2222     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 5        888888  1 9999   1    22       4              6    88                22222     99         66 4   66 3  3    4 1        11                            777   55    4    777      2   33 777                  0                                         1 1    1       0       1   3        22          1          888        55                            0                   6                    0                              0                 7     3              0        0        77    333         7  6 6           55555555555555               000      5  44         4     5    77    0        555555555              444444  2222  1       33                    3     55         6 6      1      0        3  6  1   0       1     11      0      5 0    111        1  1           0000        6 111   0       1111111111111      9999999       8    11    1                  9     6   33333             1    6    99  6    3                3  1    1   8  0   7777           0   0           8     0                     444          6   8     1                                                      0                                                                7  1  777                  1     0     0                                           0       11  8     11 0   3                          1  1 22                      6       88    7       6      44 00    44         99999999    9999    88                   5555555      1     1          22    2     44444444         0                                         4444     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        ......  . ....   .    ..       .              .    ..                .....     ..         .. .   .. .  .    . .        ..                            ...   ..    .    ...      .   .. ...                  .                                         . .    .       .       .   .        ..          .          ...        ..                            .                   .                    .                              .                 .     .              .        .        ..    ...         .  . .           ..............               ...      .  ..         .     .    ..    .        .........              ......  ....  .       ..                    .     ..         . .      .      .        .  .  .   .       .     ..      .      . .    ...        .  .           ....        . ...   .       .............      .......       .    ..    .                  .     .   .....             .    .    ..  .    .                .  .    .   .  .   ....           .   .           .     .                     ...          .   .     .                                                      .                                                                .  .  ...                  .     .     .                                           .       ..  .     .. .   .                          .  . ..                      .       ..    .       .      .. ..    ..         ........    ....    ..                   .......      .     .          ..    .     ........         .                                         ....     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 0        777777  1 4444   3    99       4              7    33                22222     88         11 4   11 9  6    4 8        00                            000   55    0    000      5   44 888                  7                                         4 4    4       6       4   2        88          4          222        44                            7                   7                    7                              2                 3     3              7        7        77    333         3  7 7           66666666666666               999      7  44         3     1    99    1        777777777              666666  1111  0       99                    3     77         7 7      0      8        3  7  4   0       4     88      6      0 8    222        4  4           7777        7 777   8       6666666666666      2222222       0    00    4                  3     3   77777             0    7    22  7    7                7  0    0   0  8   0000           8   8           0     8                     000          0   0     0                                                      8                                                                0  0  555                  2     0     8                                           8       00  0     00 8   8                          0  0 00                      7       33    3       7      33 33    77         77777777    3333    33                   7777777      0     0          88    0     88888888         2                                         3333     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
Reference ( family-3624 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAN-TGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAANTA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTACAT-TGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CACCAAATGTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GAGT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAAGAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATTGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTCACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTTC--ATTCGT-TTCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATAAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATC--AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCACCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTGATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTCCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAGTA---AATTTGTAAGATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACACCTCAACTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATC-AATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA--TGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-C-AAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTTCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCTACGGCT---GTTTATAACCTTCCAAACTGTCATACTATTATGTTCAAGGGATTCGTCAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTTGTTTCAATATTTCAATTGGAAACCTGTTATTCTATCGTCTTCTATTTGAAGGCC--TG-AAAAA--C-GTT-GTGTGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaataTTGTGTGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGACACATAAAACTTTGCA-TTAATATAT---AT--ATATAT-AATTCATTAAAAATGTAAATCGATCTC-C-----CCAGTGGTCAGATATACCACAATCTTTATTGCTCT--------TTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGACACTAGTTGgcacacaccggggacgcgcaagtcatagacacataaaactttgcattaatatatatatatataattcattaaaaatgtaaatcgatctccccagtggtcagatataccacaatctttattgctctttaatatatgacataaacatgtgcaactggacatgacactagttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatattgtttcaatatttcaattggaaacctgttattctatcgtcttctatttgaaggcctgaaaaacgCACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTTTCAATGTCT-GTTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAATTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACTCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--T-TTT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCAAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCTGCCGG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAGCTTTCTGTT--T--CATTATATGAAAAGAACT-AGTT--AC-TAGCTCCAGTGCACATGTCAA----------TGCAT--------GCGTGTGGTTGTTTATTTAGGTCAGCA-ATAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TTGATTGTTTTGAAAGAGTTGAGTTGTACATTTACATCTCCCATTAATATAACTATGCCCCTCGTAGAGTAGTAATAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACACGTTAAAGGCATTGTCGTCTA---ACA-TTTAACA----T---TTAACAACATA--ATCTCAATCTTGATACAGCATAATGATATGATCTATTAATAA---------T--T--CATTATAGGAAACAAAGGTAG----ACTTTGCTCCTGTACATATATCAAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attgtacatataaatgacgaatgatttaAAAACATT--TGTCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATA--ACACAGATT---TTTGCCGTCGCCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTGAAACTATCAAGTTCAAGGGATTCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAGTGTCTT--------T-----AAAAAACACTGATTCG--ATTTGT-ATTGACATTATCAATTTGTTATGA--ATAAGGAAAATCA---------ACATGTTGATTTAA-A----GA----CAACGAGCACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAGTGGCCAGATATACCACAAACGTTAATGCTCT--------TTAATATATGACATTAATATGTGCAACTAGACATGATACCAGTTGCATTGC-A---TAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTTTAGGTGTACATTTACTTCTTCCATT-----AACTTTGCGCCTAGTTGAGTAGTAA-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatattttgaggtgtACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACACCA-----GTGCAA-TGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTTCAAAATGTTATACTATCAAGTT-AAGGGACTCGTCAACTTGGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGCATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTAACCAGTATTGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACAAACT---AATTAACGATGG-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCT--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCCCTGTATAAAAACTAT-AAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGATCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AACATTGATAAGATC--AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACGTCTGTCACCAATGTCCT---TGGACTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATATCTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATAAAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAATTA---AATTTGTAAAATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAGATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTTCATAAGATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGAC-ATTTATATTTGCTATCGATACA--G-TAAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-TGTAAGCCAGTGCTCAGAGATACCGTAGAAATCAATGCTCTTGG--CATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTAACATTCC-ATGTTAAAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCCGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTatgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-T--TGGC----TCACAATTTAAATGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACAAT--CGCCAAATTTCATTCCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-G------TTTGCCGTCGACT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACCATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCACGGTTTAATAGCAGTAAATATTCTTCAATAGCACGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGTT-TTTTTATA--TGAGATATTTGTATCTAAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGAC--------------AATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTGGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACA---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTTTTATAGTGTCTTTTATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--GTGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACGGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTTTGTATCAAAACTAT-TAGTGGTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACCACAGAACACA---GGCCTATGTAAAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGC----------TC-----TTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAACTTTTAGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AT-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCATATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTTAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACCCTACCCCAGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTAACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGCAAATA---AACTTGTAAGATATACATTAAGCA-GTGTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTGAAGG-TACTG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCATTCATATGCAA-TGCTATTAG--AATCC--G-AT---------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTAA---ATT--AT---TATA---TTTGCTTTTT-CTCAAATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTGATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTCTTTTTTCCATTTTTATAGTTAAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTAGGGTTTTAAA-AACTTTCTAAACTTTGCCTTCGGGATACTCATATCAGA--AGCTTTCAAT-AAAGA-GA-TTACAAGTGTGTC-------AT-----ATAAATTGCCAATTTGTGATTGAA-AT--ACAATGTCAACT----------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCGTTATCTAACA----TATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGTAGTCGACTTTTC-CCATTT-AG-TTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGCGG--TATAGAGACTGCACA-TACAATTGGTCTATGAGTTGAAACATTTAC---TTCATCGTC-ATCTAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGTCTAAAT--GTTCTTC-ACAT--ATAATAATATGATCTATCAAAGA----TTCATTAACAAGATCATATGACAC--ATA-GGTCGAAT-TAGCACCAGTACATACACCCAAGGTATTATCAG-AAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAAT-TACCTCTTACGTCAACATTCTTAGTGAATTTTCT---A-GAGTTAATATGAGCGTTAATGTCTCCCATAATCATAATTCGACCTTTGaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattccagtagggttttaaaaactttctaaactttgccttcgggatactcatatcagaagctttcaataaagagattacaagtgtgtcatataaattgccaatttgtgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcgttatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcggtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttacttcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtctaaatgttcttcacatataataatatgatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatacacccaaggtattatcagaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagcgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          : tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttccttgaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccgataaacgttaccaccaaacttcatttcattacctattaaattattatatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattgattttaaatagttttcaacagctatcctatgaactcttcgaaattctcttttttccatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattAATATCTTACTTTAAGGTAC--TG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCA-----TT-CATATACAAT--G--C-TATAAGAATCCCGATCAACGATAC---CACCAAACTT-ATTTCATTACCTATTAA---ATT--ATTA-GATTTGCTTTTTC-TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAACAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTACGAACTCTTCAAAATTCTCTGTTTACA-TTTTTATAGTTAAGAtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTACGATTTTTAA-AACTTTCTAAACTTTGTCTTCGGGATACACATATCAGA--AGCTTTCAA-TAAAGA-GATT-ACAAATGTGTC-------AT-----ATAAATTATCA-------ATTTGTGATTGA-AATACAA---TGT--TAACTACG-AGCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTAA----CATAGTTTAC-----TAAATTCTGAGTAGTCGACTTCT-CCCA-TTTAGTT-CTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGC--ATTATAGAGACTGCA-CATACAATTGGTCTATGAGTTTAAACATTTACTG---CATCGTC-A---aaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattccagtacgatttttaaaactttctaaactttgtcttcgggatacacatatcagaagctttcaataaagagattacaaatgtgtcatataaattatcaatttgtgattgaaatacaatgttaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaacatagtttactaaattctgagtagtcgacttctcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcattatagagactgcacatacaattggtctatgagtttaaacatttactgcatcgtcatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttactttaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatacaatgctataagaatcccgatcaacgataccaccaaacttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcaacagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagctatcctacgaactcttcaaaattctctgtttacatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattAATTGAG-AAATACATGACTTGAATGAAATACACGAAGCAAGATTT--GAACACTCAAATTTGATTCCAGTTATTCTATCATCATCTATT-----GACGATGTAGCCATTCTATTGGAATGTCTATCATTCCATAAAATAGCAATATATTCCTTTCGAACATTGCTTATAC--AAGATGTTCGCA---CATCG-CACATATGG-GTGATAATTTACATAAA--ATC--TACATTG-TTAA--ATAAATGTAAATCGATTCCGCGTAA-CCAATGCTCAGAGATGCCACAGAAGCCAACATTTTC-GTTT-TTTAAACTATAACATAAGCAAGAAAAACTAGATATAATACCTGTTGCAATCCAA-GTTAAAtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCCTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCC--ATTCGT-ATCAATAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAAACTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTAAA-------GGCACTATCAAAATTGTGATTATTGGATGGCGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCTCCATTCTTATGCGG-TGCTATTAGAAT-CCC--G-AT---------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTTATTTATTAGATAT-GCCT---TTT-C--TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAaagtctgagtatgaggtggtgattttcatgagcataaaccccccagtgatacagctctatataaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaatacgcgactatgcaattgaataagcttttcagaACACCTCAGCTA-TGATACAGTCGAAGAGTTATTAACAAATAACTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----ACATAGTTATACTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAATTAATTACCCAA-----GGACAT-TGTAATTTG--T-TCT--GCATTTCTA-CAAAAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTGCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTGCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCgcagcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGTAATTATCTCTTACGTCAATATTCTTAGTGAATTTTCTAGAATTAAAGTGAGCGTTAATGTCACCCATGATCGTAATTCGACCTTTGTGCATATACATGTTTACAATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                11111     11                                          11                                                                                                                                                                                                  22                                                                                                                            1                                      222                          22222222222222               111                                              444444444              111111  1111                                1                                1        1         2                                   333                       1111          111           3333333333333      1111111            11                                 11111                                                                    1111                                                       111                                                                                                                                                  111                        1                                                         11        11                                                                     11            2         11    11         33333333    2222    11                   2222222                                   66666666                                                   2222     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 5        888888  1 9999   1    22       4              6    88                11111  4  00      1  66  3 66 1   9999  1 4 0 4       11                            777   55    4    777      2   33 777                  0                                         1 1    1       0       1   3        22          1          888        55                            0                   6                    0                              0                 7     3              0        0        77    333         7  6 6           55555555555555               000      5  44         4     5    77    0        555555555              444444  2222  1       33                    3     55         6 6      1      0        3  6  1   0       1     11      0      5 0    111        1  1           0000        6 111   0       1111111111111      9999999       8    11    1                  9     6   33333             1    6    99  6    3                3  1    1   8  0   7777           0   0           8     0                     444          6   8     1                                                      0                                                                7  1  777                  1     0     0                                           0       11  8     11 0   3                          1  1 22                      6       88    7       6      44 00    44         99999999    9999    88                   5555555      1     1          22    2     44444444         0                                         4444     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        ......  . ....   .    ..       .              .    ..                .....  .  ..      .  ..  . .. .   ....  . . . .       ..                            ...   ..    .    ...      .   .. ...                  .                                         . .    .       .       .   .        ..          .          ...        ..                            .                   .                    .                              .                 .     .              .        .        ..    ...         .  . .           ..............               ...      .  ..         .     .    ..    .        .........              ......  ....  .       ..                    .     ..         . .      .      .        .  .  .   .       .     ..      .      . .    ...        .  .           ....        . ...   .       .............      .......       .    ..    .                  .     .   .....             .    .    ..  .    .                .  .    .   .  .   ....           .   .           .     .                     ...          .   .     .                                                      .                                                                .  .  ...                  .     .     .                                           .       ..  .     .. .   .                          .  . ..                      .       ..    .       .      .. ..    ..         ........    ....    ..                   .......      .     .          ..    .     ........         .                                         ....     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 0        777777  1 4444   3    99       4              7    33                11111  7  99      9  11  7 11 1   4444  8 4 8 0       00                            000   55    0    000      5   44 888                  7                                         4 4    4       6       4   2        88          4          222        44                            7                   7                    7                              2                 3     3              7        7        77    333         3  7 7           66666666666666               999      7  44         3     1    99    1        777777777              666666  1111  0       99                    3     77         7 7      0      8        3  7  4   0       4     88      6      0 8    222        4  4           7777        7 777   8       6666666666666      2222222       0    00    4                  3     3   77777             0    7    22  7    7                7  0    0   0  8   0000           8   8           0     8                     000          0   0     0                                                      8                                                                0  2  555                  2     0     8                                           8       00  0     00 8   8                          0  0 00                      7       33    3       7      33 33    77         77777777    3333    33                   7777777      0     0          88    0     88888888         2                                         3333     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
Reference ( family-3624 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTACAT-TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CACCAAATGTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GAGT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAAGAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATTGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTCACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTTC--ATTCGT-TTCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATAAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATC--AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCACCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTGATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTCCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAGTA---AATTTGTAAGATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACACCTCAACTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATC-AATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA--TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-C-A-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTTCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCTACGGCT---GTTTATAACCTTCCAAACTGTCATACTATTATGTTCAAGGGATTCGTCAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gTTGTTTCAATATTTCAATTGGAAACCTGTTATTCTATCGTCTTCTATTTGAAGGCC--TG-AAAAA--C-GTT-GTGTGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaataTTGTGTGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGACACATAAAACTTTGCA-TTAATATAT---AT--ATATAT-AATTCATTAAAAATGTAAATCGATCTC-C-----CCAGTGGTCAGATATACCACAATCTTTATTGCTCT--------TTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGACACTAGTTGgcacacaccggggacgcgcaagtcatagacacataaaactttgcattaatatatatatatataattcattaaaaatgtaaatcgatctccccagtggtcagatataccacaatctttattgctctttaatatatgacataaacatgtgcaactggacatgacactagttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatattgtttcaatatttcaattggaaacctgttattctatcgtcttctatttgaaggcctgaaaaacgCACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTTTCAATGTCT-GTTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAATTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACTCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCAAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCTGCCGG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAGCTTTCTGTT--T--CATTATATGAAAAGAACT-AGTT--AC-TAGCTCCAGTGCACATGTCAA----------TGCAT--------GCGTGTGGTTGTTTATTTAGGTCAGCA-ATAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TTGATTGTTTTGAAAGAGTTGAGTTGTACATTTACATCTCCCATTAATATAACTATGCCCCTCGTAGAGTAGTAATAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACACGTTAAAGGCATTGTCGTCTA---ACA-TTTAACA----T---TTAACAACATA--ATCTCAATCTTGATACAGCATAATGATATGATCTATTAATAA---------T--T--CATTATAGGAAACAAAGGTAG----ACTTTGCTCCTGTACATATATCAAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attgtacatataaatgacgaatgatttaA-AAACATT--TGTCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATA--ACACAGATT---TTTGCCGTCGCCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTGAAACTATCAAGTTCAAGGGATTCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGTGTCTT--------T-----AAAAAACACTGATTCG--ATTTGT-ATTGACATTATCAATTTGTTATGA--ATAAGGAAAATCA---------ACATGTTGATTTAA-A----GA----CAACGAGCACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGTGGCCAGATATACCACAAACGTTAATGCTCT--------TTAATATATGACATTAATATGTGCAACTAGACATGATACCAGTTGCATTGC-A---TAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTTAGGTGTACATTTACTTCTTCCATT-----AACTTTGCGCCTAGTTGAGTAGTAA-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatattttgaggtgtACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACACCA-----GTGCAA-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTTCAAAATGTTATACTATCAAGTT-AAGGGACTCGTCAACTTGGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGCATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTAACCAGTATTGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACAAACT---AATTAACGATGG-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCT--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCCCTGTATAAAAACTAT-AAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGATCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AACATTGATAAGATC--AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACGTCTGTCACCAATGTCCT---TGGACTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATATCTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATAAAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAATTA---AATTTGTAAAATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAGATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTTCATAAGATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGAC-ATTTATATTTGCTATCGATACA--G-TAAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-TGTAAGCCAGTGCTCAGAGATACCGTAGAAATCAATGCTCTTGG--CATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTAACATTCC-ATGTTAAAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCCGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTatgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-T--TGGC----TCACAATTTAAATGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACAAT--CGCCAAATTTCATTCCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-G------TTTGCCGTCGACT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACCATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCACGGTTTAATAGCAGTAAATATTCTTCAATAGCACGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGTT-TTTTTATA--TGAGATATTTGTATCTAAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGAC--------------AATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTGGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACA---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTTTTATAGTGTCTTTTATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--GTGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACGGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTTTGTATCAAAACTAT-TAGTGGTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACCACAGAACACA---GGCCTATGTAAAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGC----------TC-----TTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAACTTTTAGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AT-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCATATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTTAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACCCTACCCCAGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTAACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGCAAATA---AACTTGTAAGATATACATTAAGCA-GTGTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTGAAGG-TACTG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCA-----TT-CATATGCAAT--G--CT------ATTAGAATC---CGATAAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTAA---ATT--AT---TATA---TTTGCTTTTT-CTCAAATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTGATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTCTTTTTTCCATTTTTATAGTTAAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTAGGGTTTTAAA-AACTTTCTAAACTTTGCCTTCGGGATACTCATATCAGA--AGCTTTCAAT-AAAGA-GA-TTACAAGTGTGTC-------AT-----ATAAATTGCCAATTTGTGATTGAA-AT--ACAATGTCAACT----------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCGTTATCTAACA----TATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGTAGTCGACTTTTC-CCATTT-AG-TTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGCGG--TATAGAGACTGCACA-TACAATTGGTCTATGAGTTGAAACATTTAC---TTCATCGTC-ATCTAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGTCTAAAT--GTTCTTC-ACAT--ATAATAATATGATCTATCAAAGA----TTCATTAACAAGATCATATGACAC--ATA-GGTCGAAT-TAGCACCAGTACATACACCCAAGGTATTATCAG-AAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAAT-TACCTCTTACGTCAACATTCTTAGTGAATTTTCT---A-GAGTTAATATGAGCGTTAATGTCTCCCATAATCATAATTCGACCTTTGaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattccagtagggttttaaaaactttctaaactttgccttcgggatactcatatcagaagctttcaataaagagattacaagtgtgtcatataaattgccaatttgtgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcgttatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcggtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttacttcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtctaaatgttcttcacatataataatatgatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatacacccaaggtattatcagaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagcgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          : tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttccttgaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccgataaacgttaccaccaaacttcatttcattacctattaaattattatatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattgattttaaatagttttcaacagctatcctatgaactcttcgaaattctcttttttccatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattAATATCTTACTTTAAGGTAC--TG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCA-----TT-CATATACAAT--G--CTATAAGAATC----CCGATCAA-CGATAC---CACCAAACTT-ATTTCATTACCTATTAA---ATT--ATTA-GATTTGCTTTTTC-TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAACAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTACGAACTCTTCAAAATTCTCTGTTTACA-TTTTTATAGTTAAGAtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTACGATTTTTAA-AACTTTCTAAACTTTGTCTTCGGGATACACATATCAGA--AGCTTTCAA-TAAAGA-GATT-ACAAATGTGTC-------AT-----ATAAATTATCA-------ATTTGTGATTGA-AATACAA---TGT--TAACTACG-AGCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTAA----CATAGTTTAC-----TAAATTCTGAGTAGTCGACTTCT-CCCA-TTTAGTT-CTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGC--ATTATAGAGACTGCA-CATACAATTGGTCTATGAGTTTAAACATTTACTG---CATCGTC-A---aaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattccagtacgatttttaaaactttctaaactttgtcttcgggatacacatatcagaagctttcaataaagagattacaaatgtgtcatataaattatcaatttgtgattgaaatacaatgttaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaacatagtttactaaattctgagtagtcgacttctcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcattatagagactgcacatacaattggtctatgagtttaaacatttactgcatcgtcatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttactttaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatacaatgctataagaatcccgatcaacgataccaccaaacttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcaacagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagctatcctacgaactcttcaaaattctctgtttacatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattAATTGAG-AAATACATGACTTGAATGAAATACACGAAGCAAGATTT--GAACACTCAAATTTGATTCCAGTTATTCTATCATCATCTATT-----GACGATGTAGCCATTCTATTGGAATGTCTATCATTCCATAAAATAGCAATATATTCCTTTCGAACATTGCTTATAC--AAGATGTTCGCA---CATCG-CACATATGG-GTGATAATTTACATAAA--ATC--TACATTG-TTAA--ATAAATGTAAATCGATTCCGCGTAA-CCAATGCTCAGAGATGCCACAGAAGCCAACATTTTC-GTTT-TTTAAACTATAACATAAGCAAGAAAAACTAGATATAATACCTGTTGCAATCCAA-GTTAAAtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCCTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCC--ATTCGT-ATCAATAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAAACTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTAAA-------GGCACTATCAAAATTGTGATTATTGGATGGCGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCTCCATTCTTATGCGG-TGCTATTAGAATCCC--G-AT--------------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTTATTTATTAGATAT-GCCT---TTT-C--TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAaagtctgagtatgaggtggtgattttcatgagcataaaccccccagtgatacagctctatataaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaatacgcgactatgcaattgaataagcttttcagaACACCTCAGCTA-TGATACAGTCGAAGAGTTATTAACAAATAACTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----ACATAGTTATACTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAATTAATTACCCAA-----GGACAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTGCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTGCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCgcagcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGTAATTATCTCTTACGTCAATATTCTTAGTGAATTTTCTAGAATTAAAGTGAGCGTTAATGTCACCCATGATCGTAATTCGACCTTTGTGCATATACATGTTTACAATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                11111     11                                          11                                                                                                                                                                                                  22                                                                                                                            1                                      222                          22222222222222               111                                              444444444              111111  1111                                1                                1        1         2                                   333                       1111          111           3333333333333      1111111            11                                 11111                                                                    1111                                                       111                                                                                                                                                  111                        1                                                         11        11                                                                     11            2         11    11         33333333    2222    11                   2222222                                   66666666                                                   2222     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 5        888888  1 9999   1    22       4              6    88                11111  4  00      1  66  3 66 1   9999  1 4 0 4       11                            777   55    4    777      2   33 777                  0                                         1 1    1       0       1   3        22          1          888        55                            0                   6                    0                              0                 7     3              0        0        77    333         7  6 6           55555555555555               000      5  44         4     5    77    0        555555555              444444  2222  1       33                    3     55         6 6      1      0        3  6  1   0       1     11      0      5 0    111        1  1           0000        6 111   0       1111111111111      9999999       8    11    1                  9     6   33333             1    6    99  6    3                3  1    1   8  0   7777           0   0           8     0                     444          6   8     1                                                      0                                                                7  1  777                  1     0     0                                           0       11  8     11 0   3                          1  1 22                      6       88    7       6      44 00    44         99999999    9999    88                   5555555      1     1          22    2     44444444         0                                         4444     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        ......  . ....   .    ..       .              .    ..                .....  .  ..      .  ..  . .. .   ....  . . . .       ..                            ...   ..    .    ...      .   .. ...                  .                                         . .    .       .       .   .        ..          .          ...        ..                            .                   .                    .                              .                 .     .              .        .        ..    ...         .  . .           ..............               ...      .  ..         .     .    ..    .        .........              ......  ....  .       ..                    .     ..         . .      .      .        .  .  .   .       .     ..      .      . .    ...        .  .           ....        . ...   .       .............      .......       .    ..    .                  .     .   .....             .    .    ..  .    .                .  .    .   .  .   ....           .   .           .     .                     ...          .   .     .                                                      .                                                                .  .  ...                  .     .     .                                           .       ..  .     .. .   .                          .  . ..                      .       ..    .       .      .. ..    ..         ........    ....    ..                   .......      .     .          ..    .     ........         .                                         ....     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 0        777777  1 4444   3    99       4              7    33                11111  7  99      9  11  7 11 1   4444  8 4 8 0       00                            000   55    0    000      5   44 888                  7                                         4 4    4       6       4   2        88          4          222        44                            7                   7                    7                              2                 3     3              7        7        77    333         3  7 7           66666666666666               999      7  44         3     1    99    1        777777777              666666  1111  0       99                    3     77         7 7      0      8        3  7  4   0       4     88      6      0 8    222        4  4           7777        7 777   8       6666666666666      2222222       0    00    4                  3     3   77777             0    7    22  7    7                7  0    0   0  8   0000           8   8           0     8                     000          0   0     0                                                      8                                                                0  2  555                  2     0     8                                           8       00  0     00 8   8                          0  0 00                      7       33    3       7      33 33    77         77777777    3333    33                   7777777      0     0          88    0     88888888         2                                         3333     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
Reference ( family-3624 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTACAT-TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CACCAAATGTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GAGT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAAGAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATTGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTCACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTTC--ATTCGT-TTCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATAAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATC--AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCACCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTGATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTCCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAGTA---AATTTGTAAGATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACACCTCAACTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATC-AATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA--TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-C-A-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTTCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCTACGGCT---GTTTATAACCTTCCAAACTGTCATACTATTATGTTCAAGGGATTCGTCAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gTTGTTTCAATATTTCAATTGGAAACCTGTTATTCTATCGTCTTCTATTTGAAGGCC--TG-AAAAA--C-GTT-GTGTGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaataTTGTGTGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGACACATAAAACTTTGCA-TTAATATAT---AT--ATATAT-AATTCATTAAAAATGTAAATCGATCTC-C-----CCAGTGGTCAGATATACCACAATCTTTATTGCTCT--------TTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGACACTAGTTGgcacacaccggggacgcgcaagtcatagacacataaaactttgcattaatatatatatatataattcattaaaaatgtaaatcgatctccccagtggtcagatataccacaatctttattgctctttaatatatgacataaacatgtgcaactggacatgacactagttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatattgtttcaatatttcaattggaaacctgttattctatcgtcttctatttgaaggcctgaaaaacgCACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTTTCAATGTCT-GTTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAATTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACTCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCAAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCTGCCGG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAGCTTTCTGTT--T--CATTATATGAAAAGAACT-AGTT--AC-TAGCTCCAGTGCACATGTCAA----------TGCAT--------GCGTGTGGTTGTTTATTTAGGTCAGCA-ATAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TTGATTGTTTTGAAAGAGTTGAGTTGTACATTTACATCTCCCATTAATATAACTATGCCCCTCGTAGAGTAGTAATAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACACGTTAAAGGCATTGTCGTCTA---ACA-TTTAACA----T---TTAACAACATA--ATCTCAATCTTGATACAGCATAATGATATGATCTATTAATAA---------T--T--CATTATAGGAAACAAAGGTAG----ACTTTGCTCCTGTACATATATCAAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attgtacatataaatgacgaatgatttaA-AAACATT--TGTCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATA--ACACAGATT---TTTGCCGTCGCCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTGAAACTATCAAGTTCAAGGGATTCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGTGTCTT--------T-----AAAAAACACTGATTCG--ATTTGT-ATTGACATTATCAATTTGTTATGA--ATAAGGAAAATCA---------ACATGTTGATTTAA-A----GA----CAACGAGCACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGTGGCCAGATATACCACAAACGTTAATGCTCT--------TTAATATATGACATTAATATGTGCAACTAGACATGATACCAGTTGCATTGC-A---TAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTTAGGTGTACATTTACTTCTTCCATT-----AACTTTGCGCCTAGTTGAGTAGTAA-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatattttgaggtgtACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACACCA-----GTGCAA-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTTCAAAATGTTATACTATCAAGTT-AAGGGACTCGTCAACTTGGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGCATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTAACCAGTATTGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACAAACT---AATTAACGATGG-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCT--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCCCTGTATAAAAACTAT-AAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGATCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AACATTGATAAGATC--AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACGTCTGTCACCAATGTCCT---TGGACTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATATCTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATAAAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAATTA---AATTTGTAAAATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAGATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTTCATAAGATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGAC-ATTTATATTTGCTATCGATACA--G-TAAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-TGTAAGCCAGTGCTCAGAGATACCGTAGAAATCAATGCTCTTGG--CATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTAACATTCC-ATGTTAAAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCCGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTatgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-T--TGGC----TCACAATTTAAATGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACAAT--CGCCAAATTTCATTCCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-G------TTTGCCGTCGACT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACCATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCACGGTTTAATAGCAGTAAATATTCTTCAATAGCACGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGTT-TTTTTATA--TGAGATATTTGTATCTAAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGAC--------------AATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTGGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACA---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTTTTATAGTGTCTTTTATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--GTGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACGGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTTTGTATCAAAACTAT-TAGTGGTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACCACAGAACACA---GGCCTATGTAAAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGC----------TC-----TTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAACTTTTAGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AT-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCATATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTTAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACCCTACCCCAGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTAACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGCAAATA---AACTTGTAAGATATACATTAAGCA-GTGTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTGAAGG-TACTG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCA-----TT-CATATGCAAT--G--CT------ATTAGAATC---CGATAAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTAA---ATT--AT---TATA---TTTGCTTTTT-CTCAAATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTGATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTCTTTTTTCCATTTTTATAGTTAAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTAGGGTTTTAAA-AACTTTCTAAACTTTGCCTTCGGGATACTCATATCAGA--AGCTTTCAAT-AAAGA-GA-TTACAAGTGTGTC-------AT-----ATAAATTGCCAATTTGTGATTGAA-AT--ACAATGTCAACT----------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCGTTATCTAACA----TATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGTAGTCGACTTTTC-CCATTT-AG-TTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGCGG--TATAGAGACTGCACA-TACAATTGGTCTATGAGTTGAAACATTTAC---TTCATCGTC-ATCTAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGTCTAAAT--GTTCTTC-ACAT--ATAATAATATGATCTATCAAAGA----TTCATTAACAAGATCATATGACAC--ATA-GGTCGAAT-TAGCACCAGTACATACACCCAAGGTATTATCAG-AAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAAT-TACCTCTTACGTCAACATTCTTAGTGAATTTTCT---A-GAGTTAATATGAGCGTTAATGTCTCCCATAATCATAATTCGACCTTTGaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattccagtagggttttaaaaactttctaaactttgccttcgggatactcatatcagaagctttcaataaagagattacaagtgtgtcatataaattgccaatttgtgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcgttatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcggtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttacttcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtctaaatgttcttcacatataataatatgatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatacacccaaggtattatcagaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagcgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          : tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttccttgaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccgataaacgttaccaccaaacttcatttcattacctattaaattattatatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattgattttaaatagttttcaacagctatcctatgaactcttcgaaattctcttttttccatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattAATATCTTACTTTAAGGTAC--TG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCA-----TT-CATATACAAT--G--CTATAAGAATC----CCGATCAA-CGATAC---CACCAAACTT-ATTTCATTACCTATTAA---ATT--ATTA-GATTTGCTTTTTC-TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAACAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTACGAACTCTTCAAAATTCTCTGTTTACA-TTTTTATAGTTAAGAtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTACGATTTTTAA-AACTTTCTAAACTTTGTCTTCGGGATACACATATCAGA--AGCTTTCAA-TAAAGA-GATT-ACAAATGTGTC-------AT-----ATAAATTATCA-------ATTTGTGATTGA-AATACAA---TGT--TAACTACG-AGCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTAA----CATAGTTTAC-----TAAATTCTGAGTAGTCGACTTCT-CCCA-TTTAGTT-CTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGC--ATTATAGAGACTGCA-CATACAATTGGTCTATGAGTTTAAACATTTACTG---CATCGTC-A---aaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattccagtacgatttttaaaactttctaaactttgtcttcgggatacacatatcagaagctttcaataaagagattacaaatgtgtcatataaattatcaatttgtgattgaaatacaatgttaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaacatagtttactaaattctgagtagtcgacttctcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcattatagagactgcacatacaattggtctatgagtttaaacatttactgcatcgtcatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttactttaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatacaatgctataagaatcccgatcaacgataccaccaaacttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcaacagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagctatcctacgaactcttcaaaattctctgtttacatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattAATTGAG-AAATACATGACTTGAATGAAATACACGAAGCAAGATTT--GAACACTCAAATTTGATTCCAGTTATTCTATCATCATCTATT-----GACGATGTAGCCATTCTATTGGAATGTCTATCATTCCATAAAATAGCAATATATTCCTTTCGAACATTGCTTATAC--AAGATGTTCGCA---CATCG-CACATATGG-GTGATAATTTACATAAA--ATC--TACATTG-TTAA--ATAAATGTAAATCGATTCCGCGTAA-CCAATGCTCAGAGATGCCACAGAAGCCAACATTTTC-GTTT-TTTAAACTATAACATAAGCAAGAAAAACTAGATATAATACCTGTTGCAATCCAA-GTTAAAtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCCTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCC--ATTCGT-ATCAATAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAAACTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTAAA-------GGCACTATCAAAATTGTGATTATTGGATGGCGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCTCCATTCTTATGCGG-TGCTATTAGAATCCC--G-AT--------------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTTATTTATTAGATAT-GCCT---TTT-C--TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAaagtctgagtatgaggtggtgattttcatgagcataaaccccccagtgatacagctctatataaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaatacgcgactatgcaattgaataagcttttcagaACACCTCAGCTA-TGATACAGTCGAAGAGTTATTAACAAATAACTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----ACATAGTTATACTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAATTAATTACCCAA-----GGACAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTGCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTGCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCgcagcc


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T        GGTAC   G ACTA   T    TA       A              C    AG                TTCTT  G  TA      T  AA  T AA C   AGAA  T T   T       AC                            TTT   AG    A    TGC      T   GC CAA                                                            T A    A               T   G        TT          A          CCA        GT                                                C                                                                     T     T                                CA    TTC         T  T T           TTATAGTGTCTTTT               GTG      G  TG         A     T    CT             CTGAGCATG              CATATT  TTAC  A       TG                    A     GA         T T      C      A        A  G  T   G       T     AA             G      ATT        T  A           GGCA        T TCT           AACATTGAT          ATCTC         A    GC    T                  G     T   AACAA             G    T    GA  T    T                A  A    A   C      AATT                           T                           TAG          T   A     G                                                                                                                       T  T  CAT                  A     A                                                         GA  T     TT     A                          A  A AT                      C       TT    A       T      CA CA    AA         GCTATCGA    TTG     .                    TGTAAG       G     T          CG    T     TGGCAT                                                     ATG 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        GTAC    G .      T    TA       A              C    AG                .      G  TA      T  .   T .  C   .     T .   .       AC                            .     .     .    .        G   CC .                                                              T A    A               T   A        TT          A          AT         GT                                                .                                                                     T     T                                CG    TTC         T  . .           GT                           G        .  CA         C     A    .              CTGAGCATG              CA      .     G       GG                    A     GA         . .      T      C        A  G  G   G       T     AA             G      ATT        T  A           AGAT        . .             TCTTAACAC          AGTTT         .    .     A                  G     T   T                 A    .    .   .    T                G  A    A   .      .                              .                           .            A   .     T                                                                                                                       C  A  .                    T     .                                                         .   .     .      A                                                       .       .     .       .      TG G     A          AATC        G       .                    GCGTAA       C     G          AA    T     CGTTTT                                                     AAG 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        CTT     G .      T    TA       A              C    AG                .      G  T       T  .   C .  C   .     T .   .       .                             .     .     .    .        G   GC .                                                              A T    T               C   T        AA          T          TT         .                                                                                                                       T     .                                CG    .           T  . .           AT                           T        .  CA         C     A    .              .                      A       .     A       TG                    .     GA         . .      A      C        .  G  C   .       A     AT             C      .          A  T           AGAG        . .             TTTAAC             TAAAT         .    .     A                  A     A   T                 G    .    .   .    G                G  T    T   .      .                              .                           .            A   .     G                                                                                                                       .  A  .                    G     .                                                         .   .     .      G                                                                                                                                                              C     G          AG    C     .                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        CTT     G .      C    TA       G              C    .                 .      G  A       T  .   C .  C   .     T .   .       .                             .     .     .    .        G   AC .                                                              A T    T               C   T        AA          T          CA         .                                                                                                                       .     .                                .     .           .  . .           AT                           C        .  TG         A     A    .              .                      A       .     T       T                     .     C          . .      A      .        .  .  C   .       A     .              .      .          A  T           TG          . .             AGC                TT            .    .     T                  .     C   C                 G    .    .   .    G                A  .    .   .      .                              .                           .            .   .     T                                                                                                                                                                                                                  .   .     .      .                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        TTT     G .      A    GT       G              C    .                 .      G  T       T  .   A .  A   .     G .   .       .                             .     .     .    .        G   GC .                                                                                                                                                                                                                                                            .     .                                .     .           .  . .           GT                           C        .  CA         C     .    .              .                      A       .     T       .                     .     C          . .      T      .        .  .                                                                    T           . .                                                                            .     .   C                 .    .    .   .    A                .                                                                                                    A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        CTT     G .      A    GT       G              .    .                 .      A  G       T  .   C .  C   .     T .   .       .                             .     .     .    .        T   C  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T                            .        .  .          .     .    .              .                      A       .     G                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        .       . .      A    GT       A              .    .                 .      .  T       .  .   C .  .   .     . .   .       .                             .     .     .    .        G   A  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  . .      T    AT       .              .    .                 .      .  .       .  .   . .  .   .     . .   .       .                             .     .     .    .        .   A  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .       .                             .     .     .    .        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ***
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATA--TGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGTAATTATCTCTTACGTCAATATTCTTAGTGAATTTTCTAGAATTAAAGTGAGCGTTAATGTCACCCATGATCGTAATTCGACCTTTGTGCATATACATGTTTACAATA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                11111     11                                          11                                                                                                                                                                                                  22                                                                                                                            1                                      222                          22222222222222               111                                              444444444              111111  1111                                1                                1        1         2                                   222                       1111          111           3333333333333      1111111            11                                 11111                                                                    1111                                                       111                                                                                                                                                  111                        1                                                         11        11                                                                     11            2         11    11         33333333    2222    11                   2222222                                   66666666                                                   2222     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 5        888888  1 9999   1    22       4              6    88                11111  4  00      1  66  3 66 1   9999  1 4 0 4       11                            777   55    4    777      2   33 777                  0                                         1 1    1       0       1   3        22          1          888        22                            0                   6                    0                              0                 7     3              0        0        77    333         7  6 6           55555555555555               000      5  44         4     5    77    0        555555555              444444  2222  1       33                    3     55         6 6      1      0        3  6  1   0       1     11      0      5 0    888        1  1           0000        6 111   0       1111111111111      9999999       8    11    1                  9     6   33333             1    6    99  6    3                3  1    1   8  0   7777           0   0           8     0                     444          6   8     1                                                      0                                                                7  1  777                  1     0     0                                           0       11  8     11 0   3                          1  1 22                      6       88    7       6      44 00    44         99999999    9999    88                   5555555      1     1          22    2     44444444         0                                         4444     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .        ......  . ....   .    ..       .              .    ..                .....  .  ..      .  ..  . .. .   ....  . . . .       ..                            ...   ..    .    ...      .   .. ...                  .                                         . .    .       .       .   .        ..          .          ...        ..                            .                   .                    .                              .                 .     .              .        .        ..    ...         .  . .           ..............               ...      .  ..         .     .    ..    .        .........              ......  ....  .       ..                    .     ..         . .      .      .        .  .  .   .       .     ..      .      . .    ...        .  .           ....        . ...   .       .............      .......       .    ..    .                  .     .   .....             .    .    ..  .    .                .  .    .   .  .   ....           .   .           .     .                     ...          .   .     .                                                      .                                                                .  .  ...                  .     .     .                                           .       ..  .     .. .   .                          .  . ..                      .       ..    .       .      .. ..    ..         ........    ....    ..                   .......      .     .          ..    .     ........         .                                         ....     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 0        777777  1 4444   3    99       4              7    33                11111  7  99      9  11  7 11 1   4444  8 4 8 0       00                            000   55    0    000      5   44 888                  7                                         4 4    4       6       4   2        88          4          222        00                            7                   7                    7                              2                 3     3              7        7        77    333         3  7 7           66666666666666               999      7  44         3     1    99    1        777777777              666666  1111  0       99                    3     77         7 7      0      8        3  7  4   0       4     88      6      0 8    000        4  4           7777        7 777   8       6666666666666      2222222       0    00    4                  3     3   77777             0    7    22  7    7                7  0    0   0  8   0000           8   8           0     8                     000          0   0     0                                                      8                                                                0  2  555                  2     0     8                                           8       00  0     00 8   8                          0  0 00                      7       33    3       7      33 33    77         77777777    3333    33                   7777777      0     0          88    0     88888888         2                                         3333     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATAGTTGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACAATTGGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
Reference ( family-3624 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTNAATGATCGGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAACGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAACAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGNT-TTTTTATA--TGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCCTTCGGGATATACGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCGACAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CANAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCNCTGTATCAAAACTAT-TAGCGCTTAGACTCAAGTTGCGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGANCTATCGTC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGACAAGATC--AGTTCGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTCGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAATA---AACTTGTAAGATATACATAAAGCA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTCCATAAGATAGCNACNCNNCCCTTTCGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAG-CACATACGGCGTGACAATTTATATATG--ATC-ATACAT-G-TTAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-CGTAA-CCAGTGNTCAGANATACCACAGACGTCAACGCTCTC-G--C-TTTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGATACCAGTTGCATTCC-A-GTTAAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTACAT-TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CACCAAATGTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GAGT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAAGAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGTATCTGAATTAGTATCATTGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTCACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTTC--ATTCGT-TTCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATAAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGCATTGATAAGATC--AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCACCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTGATTAATGTCAGCA-GTAATAGACTTCTGTCACCAATGTCCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAAGTA---AATTTGTAAGATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAAC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gACACCTCAACTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATC-AATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCA--TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-C-A-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTTCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCTACGGCT---GTTTATAACCTTCCAAACTGTCATACTATTATGTTCAAGGGATTCGTCAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gTTGTTTCAATATTTCAATTGGAAACCTGTTATTCTATCGTCTTCTATTTGAAGGCC--TG-AAAAA--C-GTT-GTGTGTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaataTTGTGTGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGACACATAAAACTTTGCA-TTAATATAT---AT--ATATAT-AATTCATTAAAAATGTAAATCGATCTC-C-----CCAGTGGTCAGATATACCACAATCTTTATTGCTCT--------TTAATATATGACATAAACATGTGCAACTGGACATGACACTAGTTGgcacacaccggggacgcgcaagtcatagacacataaaactttgcattaatatatatatatataattcattaaaaatgtaaatcgatctccccagtggtcagatataccacaatctttattgctctttaatatatgacataaacatgtgcaactggacatgacactagttg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaatattgtttcaatatttcaattggaaacctgttattctatcgtcttctatttgaaggcctgaaaaacgCACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTTTCAATGTCT-GTTTTAAACT-T--TGGC----TCATAGTTTAATTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACTCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTTT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCAAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCTGCCGG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAGCTTTCTGTT--T--CATTATATGAAAAGAACT-AGTT--AC-TAGCTCCAGTGCACATGTCAA----------TGCAT--------GCGTGTGGTTGTTTATTTAGGTCAGCA-ATAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TTGATTGTTTTGAAAGAGTTGAGTTGTACATTTACATCTCCCATTAATATAACTATGCCCCTCGTAGAGTAGTAATAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACACGTTAAAGGCATTGTCGTCTA---ACA-TTTAACA----T---TTAACAACATA--ATCTCAATCTTGATACAGCATAATGATATGATCTATTAATAA---------T--T--CATTATAGGAAACAAAGGTAG----ACTTTGCTCCTGTACATATATCAAAG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attgtacatataaatgacgaatgatttaA-AAACATT--TGTCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATA--ACACAGATT---TTTGCCGTCGCCT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTGAAACTATCAAGTTCAAGGGATTCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGTGTCTT--------T-----AAAAAACACTGATTCG--ATTTGT-ATTGACATTATCAATTTGTTATGA--ATAAGGAAAATCA---------ACATGTTGATTTAA-A----GA----CAACGAGCACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGTGGCCAGATATACCACAAACGTTAATGCTCT--------TTAATATATGACATTAATATGTGCAACTAGACATGATACCAGTTGCATTGC-A---TAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTTTAGGTGTACATTTACTTCTTCCATT-----AACTTTGCGCCTAGTTGAGTAGTAA-ATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatattttgaggtgtACACCTGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATCAACAAATATCTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAATT-T--TGGC----TCATAGTTTAAATGATCAGATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACACCA-----GTGCAA-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CACCAAATTTCATTTCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTTTCAAAATGTTATACTATCAAGTT-AAGGGACTCGTCAACTTGGCGGTTTAATAACAGTAAATATTCTTCAATAGCGCGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGAT-TTTTTATA--TGAGATATATGCATCTGAATTAGTATCATGGGGTCTACCATTTGCGACCCAGGCTTTACGACAATCATCAACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTTGCTAACCAGTATTGCTTTAAATAACGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACAAACT---AATTAACGATGG-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCT--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--ATGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCCCTGTATAAAAACTAT-AAGTGTTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACTACAGAACACA---GGCCTATGTGTAGACACATTAACAGATCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AACATTGATAAGATC--AGTTTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAGCTTTTTGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AC-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCGTATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAATAGACGTCTGTCACCAATGTCCT---TGGACTGTTTAGAA-GAGTTGAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATATCTCTACCCCTGGTTGAGTAGTAATAAAGAAGTTCTGATAATTTATTTACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGTAATTA---AATTTGTAAAATATACATAAAACA-GTTTTTTGAATATTCAGATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTAACATTTCATAAGATAGCTACCCCACCCTTACGTACGTTGCACACACCGGGGACG--CGCAAGTCATAGTCACATACAGCATGAC-ATTTATATTTGCTATCGATACA--G-TAAA--AAAAATGTAAATCGATCTC-TGTAAGCCAGTGCTCAGAGATACCGTAGAAATCAATGCTCTTGG--CATTTAATATATCACATAAATATGTGCAGCTGGACATGATTCCAGTAACATTCC-ATGTTAAAt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACACCCGAGCTACTGATACAGTCGAACAGTTATTAACAAATATCTCAGAATTCACATTTatgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gT-T--TGGC----TCACAATTTAAATGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAAGTAATTACCCCA-----GTGCAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACAAT--CGCCAAATTTCATTCCATTACCTACAGA---ATT--ACAC-G------TTTGCCGTCGACT---GTTTATAACCTTCCAAAATGTCATACCATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCACGGTTTAATAGCAGTAAATATTCTTCAATAGCACGTCTATGTTCCCTGCGAAAATTTGTTTTTGTT-TTTTTATA--TGAGATATTTGTATCTAAATTAGTATCACGGGGTCTACCATTTGCGAC--------------AATCATCGACTTTACGACGGTAATTGGTCAATTTGGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCTTTTGGGATATATGTATGTGACGAACA---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTTTTATAGTGTCTTTTATAGAACACCAATTCC--ATTCGT-ATCAACAATATCACCTTGTAATAA--GTGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAAAGTGTACGGTAGTAGAACCTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTTTGTATCAAAACTAT-TAGTGGTTA-ACTCAAGTTGTGGAACACACATACCACAGAACACA---GGCCTATGTAAAGACACATTAACAGAGCTATCATC-A---ATAATTTCACA----AGC----------TC-----TTGCTCTTG-TGAA--ATAAAAATATGATCTATTAAAGAACTTTTAGTT--C--CATCATATGAAACGAATG-AGTT--AT-TAGCGCCAGTACACATGTCAAGGGAGTTAACTG-ATACTA----GCATATGGTTATTAATTAATGTCAGCA-GTAACAGACTTCTGTCACCAATGTTCT---TGGATTGTTTAGAA-GAGTTTAGATGTGCATTTACATCTCCCATTAACATAACCCTACCCCAGGTTGAGTAGTAATATAGAAGTTCTGATAATTTATTAACCGATTCCTGAAATCTTTTTAAAGAATGGTTACAACTGGGCAAATA---AACTTGTAAGATATACATTAAGCA-GTGTTTTGAATATTCAAATTGAACACCTGTTATTCTATCGTCCTCTATTTGAAGGAC--TG-AAACA--CTGCTAGCGTGTTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTGAAGG-TACTG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCA-----TT-CATATGCAAT--G--CT------ATTAGAATC---CGATAAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTAA---ATT--AT---TATA---TTTGCTTTTT-CTCAAATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAGCAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTGATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTATGAACTCTTCGAAATTCTCTTTTTTCCATTTTTATAGTTAAGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTAGGGTTTTAAA-AACTTTCTAAACTTTGCCTTCGGGATACTCATATCAGA--AGCTTTCAAT-AAAGA-GA-TTACAAGTGTGTC-------AT-----ATAAATTGCCAATTTGTGATTGAA-AT--ACAATGTCAACT----------ACGA-GCAAGTTCCTGAGCATGATATCGTTATCTAACA----TATTACCATAGTCTACT-----AAATTCTGAGTAGTCGACTTTTC-CCATTT-AG-TTCTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGCGG--TATAGAGACTGCACA-TACAATTGGTCTATGAGTTGAAACATTTAC---TTCATCGTC-ATCTAGAATTTCACATCTTAACA----CAAGGTCTAAAT--GTTCTTC-ACAT--ATAATAATATGATCTATCAAAGA----TTCATTAACAAGATCATATGACAC--ATA-GGTCGAAT-TAGCACCAGTACATACACCCAAGGTATTATCAG-AAAGTAAATTGTGTACATTTA--AA--AACGACTGAATGCAAT-TACCTCTTACGTCAACATTCTTAGTGAATTTTCT---A-GAGTTAATATGAGCGTTAATGTCTCCCATAATCATAATTCGACCTTTGaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattccagtagggttttaaaaactttctaaactttgccttcgggatactcatatcagaagctttcaataaagagattacaagtgtgtcatataaattgccaatttgtgattgaaatacaatgtcaactacgagcaagttcctgagcatgatatcgttatctaacatattaccatagtctactaaattctgagtagtcgacttttcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcggtatagagactgcacatacaattggtctatgagttgaaacatttacttcatcgtcatctagaatttcacatcttaacacaaggtctaaatgttcttcacatataataatatgatctatcaaagattcattaacaagatcatatgacacataggtcgaattagcaccagtacatacacccaaggtattatcagaaagtaaattgtgtacatttaaaaacgactgaatgcaattacctcttacgtcaacattcttagtgaattttctagagttaatatgagcgttaatgtctcccataatcataattcgacctttgtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          : tttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaataagcgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttccttgaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatgcaatgctattagaatccgataaacgttaccaccaaacttcatttcattacctattaaattattatatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcagcagcctggtctagttcgtgattaattgattttaaatagttttcaacagctatcctatgaactcttcgaaattctcttttttccatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttggcctaccgttatttatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttatgtaacgaggataagtcgttattAATATCTTACTTTAAGGTAC--TG------TCAAAATTGTGATTATTGGATGGTGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCCCCA-----TT-CATATACAAT--G--CTATAAGAATC----CCGATCAA-CGATAC---CACCAAACTT-ATTTCATTACCTATTAA---ATT--ATTA-GATTTGCTTTTTC-TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAACAGCCTGGTCTAGTTCGTGATTAATTAATTTTAAATAGTTTTCAACAGCTATCCTACGAACTCTTCAAAATTCTCTGTTTACA-TTTTTATAGTTAAGAtgcatatacatgtttgtaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaCCAGTACGATTTTTAA-AACTTTCTAAACTTTGTCTTCGGGATACACATATCAGA--AGCTTTCAA-TAAAGA-GATT-ACAAATGTGTC-------AT-----ATAAATTATCA-------ATTTGTGATTGA-AATACAA---TGT--TAACTACG-AGCAAGTTCCTGAGCATGATATCATTATCTAACATATTAA----CATAGTTTAC-----TAAATTCTGAGTAGTCGACTTCT-CCCA-TTTAGTT-CTTGGTACTGAAT-AATGTGATATA-CACTCAGACTCAACATGC--ATTATAGAGACTGCA-CATACAATTGGTCTATGAGTTTAAACATTTACTG---CATCGTC-A---aaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattccagtacgatttttaaaactttctaaactttgtcttcgggatacacatatcagaagctttcaataaagagattacaaatgtgtcatataaattatcaatttgtgattgaaatacaatgttaactacgagcaagttcctgagcatgatatcattatctaacatattaacatagtttactaaattctgagtagtcgacttctcccatttagttcttggtactgaataatgtgatatacactcagactcaacatgcattatagagactgcacatacaattggtctatgagtttaaacatttactgcatcgtcatc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcgttatatcatcatttgagaatatgaaacaactgcgtccacttatgttctcttgaaataagtgactatacaattgaataaccttttcagaaatatcttactttaaggtactgtcaaaattgtgattattggatggtgtatacaagtcagcaaagtatttgccccattcatatacaatgctataagaatcccgatcaacgataccaccaaacttatttcattacctattaaattattagatttgctttttctcaaattaataattttccaaaacaacttactgttcatttcaacagcctggtctagttcgtgattaattaattttaaatagttttcaacagctatcctacgaactcttcaaaattctctgtttacatttttatagttaagaaaacaggacgaagtcgagattcttgacctaccgttattaatccaagtagtacgagcttgtttcattttgttacgtaacgaggataagtcgttattAATTGAG-AAATACATGACTTGAATGAAATACACGAAGCAAGATTT--GAACACTCAAATTTGATTCCAGTTATTCTATCATCATCTATT-----GACGATGTAGCCATTCTATTGGAATGTCTATCATTCCATAAAATAGCAATATATTCCTTTCGAACATTGCTTATAC--AAGATGTTCGCA---CATCG-CACATATGG-GTGATAATTTACATAAA--ATC--TACATTG-TTAA--ATAAATGTAAATCGATTCCGCGTAA-CCAATGCTCAGAGATGCCACAGAAGCCAACATTTTC-GTTT-TTTAAACTATAACATAAGCAAGAAAAACTAGATATAATACCTGTTGCAATCCAA-GTTAAAtc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCAATTTTGCTGACCAGTATGGCTTTAAATAATGC-CTAAATTTAGCCTTTGGGATATATGTATGTGACGAACT---AATTAACGATGA-T-ACTAGTGTCTC-------GT-----ATAGAACATCAATTCC--ATTCGT-ATCAATAATATCACCTTGTAATAA--ACGAAGCAAATCC---------ACATTTTGATCTAA-A----GA----CAGAGTGTACTGTAGTAGAAACTCGGGAGTCG-CTTTTGACCATTTTAG-T-CTAGGCTCTGTATCAAAACTAT-TAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATCT-TCCTTAAA-------GGCACTATCAAAATTGTGATTATTGGATGGCGTATACAA--GTCAGCAAAGTATTTGCTCCATTCTTATGCGG-TGCTATTAGAATCCC--G-AT--------------AAACGTTACCACCAAACTTCATTTCATTACCTATTTATTTATTAGATAT-GCCT---TTT-C--TCAA-----ATTAATAATTTTCCAAAACAACTTACTGTTCATTTCAaagtctgagtatgaggtggtgattttcatgagcataaaccccccagtgatacagctctatataaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcgttatatcgtcatttgagaatatgaaacaactgcgcccactaatgttctcttgaaatacgcgactatgcaattgaataagcttttcagaACACCTCAGCTA-TGATACAGTCGAAGAGTTATTAACAAATAACTCAGAATTCACATTTGTCATTTTATTCTCAATGTCT-GCTTTAAACT-T--TGGC----ACATAGTTATACTGATCAAATGGAGTGTATAACTGTT--TAAATTAATTACCCAA-----GGACAT-TGTAATTTG--TTCT--GCATT----TCTA-CAA-AAACATT--CGCCAAATTTCATTTCATTACCTGCAGA---ATT--ACAC-GATT---TTTGCCGTCGGCT---GTTTATAACCTGCCAAAATGTCATACTATCAAGTTCAAGGGATTCGTCAACTTCgcagcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGTAATTATCTCTTACGTCAATATTCTTAGTGAATTTTCTAGAATTAAAGTGAGCGTTAATGTCACCCATGATCGTAATTCGACCTTTGTGCATATACATGTTTACAATA