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Reference ( family-3563 ) : NCAATTATTTGTGCCCCCCNCTCCCCCGA-----------GCATGNAGTAATCGCAGTGTCCGTCCGTTCTTTCTGTCCGGCATTTCGTGTCTGGCCCGTAACTTTGTCATNCAT--AGAT------GGATTTTGTTAAT-ACTTGCCACAAATGATCAACA-TAACATGACGATGTGTCGCGNGTAAGACCCAGANTCNTACCTCAAAGGTCAAGGTCGCACTTTNANTTTGTTTGACGACACTTTNAGTCT-T--T-TGAGATTTCGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATNCATGGATGGATTTCAAAAACACTTGGCT------A-CAATTGATCANCATGACGTNACGAAGTGTCGCGTGTAAGACCCGGACGTTTATTTCAAAGGTCGAGGTCA------GANTT-------CAAC---------CTG-T-TGA-GATTTCGTGT-CGG-TCTATNACTTTGTCACCTA-T-GATGNATTT-----TAAAAACACCCGGC--------TC--------AACATGACATGACGAAGTGTCGC------GACCTA-----A--TTCCTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTCAGTCT-------GTTTGANATTNNGTGTCCGGTCTGT-AACTT------TGT-----CAT-------------TT-----ATA----CTTGGCTCAATTTATCAANATGACATGACGACGTGTCGCGCGTAAGACCTAGACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTGAGTTTGT--NTGACGACACTTTGAGTCTGTTTGAGATTTCGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATACATGGATGAA-TTTCAAAAACACTTGGCTCAATCTATCAAATGATCAACATGACATGACGACAGTGTCG--CGT-TAANACCCAGAACC-TAACCTCAAAGGTCAAGGT--CAC--TTT-----------CANTTT-----GTTTGATATTTCGTGTCCGGTCTGTTACTTTGTCTCACATGGAGGGATTTTAAAATAACTTGACGCGAG-TGATCAACATGTCATGATGATG-TGTCACCTGCATTTACCTGTAGAAATACCCAGACCTTTACATCA------GATGTCA------AGGTT-ACACGAAGGTCAA-GTCACATTTTAATGTAAAAAAA---------CGCGTGTCTAGTATGAAACGTNTG-CCATTAGTCTTGATATTAATGGAT-C-ATCGCTACCTATTATAAAATATATCGTTATTTTCACAGACCATTTGGGGGGCATGCGACACTTACCAGTGACATTTCTTGTTTTAAA
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Unaligned ( gi|11 ): CTCGAGAAATTTTGTGAAACCGGGGCCAGGAATATTACTTAAGGGTCAAGGTGATATTTTCC
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